RNAlib-2.2.0-RC2
Main Page
Related Pages
Modules
Data Structures
Files
File List
Globals
All
Functions
Variables
Enumerations
Enumerator
Macros
a
b
c
d
e
f
g
h
i
j
k
l
m
n
o
p
r
s
t
u
v
w
x
z
Here is a list of all documented functions, variables, defines, enums, and typedefs with links to the documentation:
- v -
vrna_ali_fold() :
alifold.h
vrna_ali_get_pair_info() :
alifold.h
vrna_ali_pbacktrack() :
alifold.h
vrna_ali_pf_fold() :
alifold.h
vrna_alloc() :
utils.h
vrna_bp_distance() :
structure_utils.h
vrna_bpp_symbol() :
structure_utils.h
vrna_co_pf_dimer_probs() :
part_func_co.h
vrna_co_pf_fold() :
part_func_co.h
vrna_co_pf_get_concentrations() :
part_func_co.h
vrna_cofold() :
cofold.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_ALL :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_BULGE :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_DANGLE3 :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_DANGLE5 :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_DUMP :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_HP :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT_11 :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT_21 :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT_22 :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MISC :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_ML :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_EXT :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_HP :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_INT :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_INT_1N :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_INT_23 :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_MULTI :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_NINIO :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_SPECIAL_HP :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_STACK :
convert_epars.h
VRNA_CONVERT_OUTPUT_VANILLA :
convert_epars.h
vrna_cut_point_insert() :
cofold.h
vrna_cut_point_remove() :
cofold.h
vrna_db_get_from_pr() :
structure_utils.h
vrna_db_pack() :
structure_utils.h
vrna_db_unpack() :
structure_utils.h
vrna_E_ext_hp_loop() :
hairpin_loops.h
vrna_E_hp_loop() :
hairpin_loops.h
vrna_eval_covar_structure() :
eval.h
vrna_eval_ext_hp_loop() :
hairpin_loops.h
vrna_eval_hp_loop() :
hairpin_loops.h
vrna_eval_loop_pt() :
eval.h
vrna_eval_move() :
eval.h
vrna_eval_move_pt() :
eval.h
vrna_eval_structure() :
eval.h
vrna_eval_structure_pt() :
eval.h
vrna_eval_structure_pt_simple() :
eval.h
vrna_eval_structure_pt_simple_verbose() :
eval.h
vrna_eval_structure_pt_verbose() :
eval.h
vrna_eval_structure_simple() :
eval.h
vrna_eval_structure_simple_verbose() :
eval.h
vrna_eval_structure_verbose() :
eval.h
vrna_exp_E_hp_loop() :
hairpin_loops.h
vrna_exp_params_ali_get() :
params.h
vrna_exp_params_copy() :
params.h
vrna_exp_params_get() :
params.h
vrna_extract_record_rest_constraint() :
file_formats.h
vrna_file_copy() :
utils.h
vrna_fold() :
fold.h
vrna_free_fold_compound() :
data_structures.h
vrna_free_mfe_matrices() :
data_structures.h
vrna_free_pf_matrices() :
data_structures.h
vrna_get_centroid_struct() :
centroid.h
vrna_get_centroid_struct_pl() :
centroid.h
vrna_get_centroid_struct_pr() :
centroid.h
vrna_get_fold_compound() :
data_structures.h
vrna_get_fold_compound_ali() :
data_structures.h
vrna_get_iindx() :
utils.h
vrna_get_indx() :
utils.h
vrna_get_loop_index() :
structure_utils.h
vrna_get_ptypes() :
utils.h
vrna_hamming_distance() :
utils.h
vrna_hamming_distance_bound() :
utils.h
vrna_init_rand() :
utils.h
VRNA_INPUT_BLANK_LINE :
utils.h
VRNA_INPUT_COMMENT :
utils.h
VRNA_INPUT_CONSTRAINT :
utils.h
VRNA_INPUT_ERROR :
utils.h
VRNA_INPUT_FASTA_HEADER :
utils.h
VRNA_INPUT_MISC :
utils.h
VRNA_INPUT_NO_REST :
utils.h
VRNA_INPUT_NO_SPAN :
utils.h
VRNA_INPUT_NO_TRUNCATION :
utils.h
VRNA_INPUT_NOSKIP_BLANK_LINES :
utils.h
VRNA_INPUT_NOSKIP_COMMENTS :
utils.h
VRNA_INPUT_QUIT :
utils.h
vrna_int_urn() :
utils.h
vrna_md_set_default() :
model.h
vrna_md_set_globals() :
model.h
vrna_md_update() :
model.h
vrna_mean_bp_distance() :
part_func.h
vrna_mean_bp_distance_pr() :
part_func.h
vrna_message_error() :
utils.h
vrna_message_input_seq() :
utils.h
vrna_message_input_seq_simple() :
utils.h
vrna_message_warning() :
utils.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_ALI_CV_FACT :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_ALI_NC_FACT :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_ALI_OLD_EN :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_ALI_RIBO :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_BACKTRACK :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_BACKTRACK_TYPE :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_BETA_SCALE :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_CIRC :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_COMPUTE_BPP :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_DANGLES :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_ENERGY_SET :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_GQUAD :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_LOG_ML :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_MAX_BP_SPAN :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_NO_GU :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_NO_GU_CLOSURE :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_NO_LP :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_PF_SCALE :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_SPECIAL_HP :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_TEMPERATURE :
model.h
VRNA_MODEL_DEFAULT_UNIQ_ML :
model.h
VRNA_MX_2DFOLD :
data_structures.h
VRNA_MX_DEFAULT :
data_structures.h
VRNA_MX_LFOLD :
data_structures.h
vrna_mx_t :
data_structures.h
vrna_nucleotide_decode() :
utils.h
vrna_nucleotide_encode() :
utils.h
VRNA_OPTION_EVAL_ONLY :
data_structures.h
VRNA_OPTION_MFE :
data_structures.h
VRNA_OPTION_MULTILINE :
utils.h
VRNA_OPTION_PF :
data_structures.h
vrna_params_copy() :
params.h
vrna_params_get() :
params.h
vrna_parenthesis_structure() :
structure_utils.h
vrna_parenthesis_zuker() :
structure_utils.h
vrna_pbacktrack() :
part_func.h
vrna_pbacktrack5() :
part_func.h
vrna_pf_fold() :
part_func.h
vrna_pl_get() :
structure_utils.h
vrna_pl_get_from_pr() :
structure_utils.h
vrna_pl_to_db() :
structure_utils.h
VRNA_PLOT_TYPE_CIRCULAR :
plot_layouts.h
VRNA_PLOT_TYPE_NAVIEW :
plot_layouts.h
VRNA_PLOT_TYPE_SIMPLE :
plot_layouts.h
vrna_pt_ali_get() :
structure_utils.h
vrna_pt_copy() :
structure_utils.h
vrna_pt_get() :
structure_utils.h
vrna_pt_pk_get() :
structure_utils.h
vrna_pt_snoop_get() :
structure_utils.h
vrna_pt_to_db() :
structure_utils.h
vrna_random_string() :
utils.h
vrna_read_constraints_file() :
file_formats.h
vrna_read_fasta_record() :
file_formats.h
vrna_read_SHAPE_file() :
file_formats.h
vrna_realloc() :
utils.h
vrna_refBPcnt_matrix() :
structure_utils.h
vrna_refBPdist_matrix() :
structure_utils.h
vrna_rescale_pf_params() :
part_func.h
vrna_seq_encode() :
utils.h
vrna_seq_encode_simple() :
utils.h
vrna_seq_toRNA() :
utils.h
vrna_seq_toupper() :
utils.h
vrna_structure_print_bpseq() :
file_formats.h
vrna_structure_print_ct() :
file_formats.h
vrna_structure_print_hx() :
file_formats.h
vrna_time_stamp() :
utils.h
vrna_TwoD_backtrack5() :
2Dfold.h
vrna_TwoD_fold() :
2Dfold.h
vrna_TwoD_pbacktrack() :
2Dpfold.h
vrna_TwoD_pbacktrack5() :
2Dpfold.h
vrna_TwoD_pf_fold() :
2Dpfold.h
vrna_update_pf_params() :
part_func.h
vrna_urn() :
utils.h
vrna_vc_t :
data_structures.h
VRNA_VC_TYPE_ALIGNMENT :
data_structures.h
VRNA_VC_TYPE_SINGLE :
data_structures.h
vrna_zukersubopt() :
cofold.h
Generated on Fri Mar 20 2015 11:44:22 for RNAlib-2.2.0-RC2 by
1.8.9.1