There are 2083 alignments in the test set.
Mean pairwise ID: 29.18%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** * * * *** ** * **
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATG--CGAAAGTTGGGC--CTCACGGTCCATAATGTGGCA
** * * **** * ** *** *** * * *** ***** * *
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* * * * * * * ***** * ** **** * **** *
CAE.EL_B GACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCAC
** ** * ** * * * * * * ** * ** * **
CAE.EL_B TTTTT
TRI.AE_C CATC-
*
Mean pairwise ID: 29.84%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** * * * *** ** * **
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATG--CGAAAGTTGGGC--CTCACGGTCCATAATGTGGCA
** * * **** * ** *** *** * * *** ***** * *
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* * * * * * * ***** * ** **** * **** *
CAE.EL_C GACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACC-A
** * ** * ** * * * * * * ** * ** * **
CAE.EL_C TCACT
TRI.AE_C CCATC
**
Mean pairwise ID: 30.42%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA
* ** * * *** * **
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGT-GAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGG
* * * * * * * ** * * * * ** * * * *** * **
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * **
GAL.GAL. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTC
TRI.AE_C AGGATAACGG--GCCGCTG--CACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG
**** ** * * **** * * ** ***** * **** ** *
GAL.GAL. TCC------
TRI.AE_C ACCACCATC
**
Mean pairwise ID: 31.05%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** * * * *** ** * **
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGC---CTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGG-TCCATAATGTGGCA
* * * **** ** * *** * * ** *** * ***** * * *
CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* * * * * * * ***** * ** * **** * * **** *
CAE.EL_D GAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAG--CGACCA
** ** ** * * * * **** * * ** *** * *
CAE.EL_D TCATTT
TRI.AE_C CCATC-
***
Mean pairwise ID: 31.13%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** * * * *** * * *
DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGAT
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT---TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* * * **** * *** *** *** *** * * *** * ** *
DRO.MEL. GAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG
TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* **** * *** ** * ****** * * * **** * ** * **
DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTA-TCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCT
TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCA
*** ** *** * * * * * ** * * * ** * *
DRO.MEL. TT
TRI.AE_C TC
*
Mean pairwise ID: 31.37%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** * * * *** ** * **
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGC---CTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGG-TCCATAATGTGGCA
* * * **** ** * *** * * ** *** * ***** * * *
CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* * * * * * * ***** * ** * **** * * **** *
CAE.EL_A GAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAG--CGACCA
** ** ** ** * * * **** * * ** *** * *
CAE.EL_A TCATTT
TRI.AE_C CCATC-
***
Mean pairwise ID: 31.80%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* * * ** *** * ***
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG
** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * **
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * ** *
ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTG
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA
**** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** *
ORI.CUN. TCTCC
TRI.AE_C CCATC
* *
Mean pairwise ID: 31.91%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT
* * * ** *** * *****
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGT--GTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGT--CCATAATGTGGC
*** * * * *** * ** * ** * * *** * *** * **
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG
TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * * ** *
XEN.LAE. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT
TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCAC
**** ** *** ** * * * * **** * * ** **
XEN.LAE. TCT-
TRI.AE_C CATC
*
Mean pairwise ID: 31.94%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
LYC.ES_D -----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ** ** * ***
FUG.RUB. TCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG
LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGCGGG
* * * * * * ** * * * *** * * ***** * ***
FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** *
FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGAC
LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAAC
**** * * * *** * * * *** * ** ** * * * * **
FUG.RUB. TCAGTCTTT-
LYC.ES_D CACCACTTTT
****
Mean pairwise ID: 32.03%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
LYC.ES_D -----------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAG
** * * ** * *** * ** * * * *
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC
LYC.ES_D GCCCAAATGAAA--------ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG--GACCGCA
** ** * * * * ** * ** * * * * **
LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTCA
LYC.ES_D TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCT--GTGCAGTGGAAGGATAATG
* ** ** * * ** ** * ** *** * * * ** ****
LEP.COL. GGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG-AACCACACCGCGGA
LYC.ES_D GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG--GTTGCTCCAACTAAACCACCAC
** *** * * ** * *** * ***** *** * *** *
LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
LYC.ES_D TTTT-------------------------------------
*
Mean pairwise ID: 32.03%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* * * ** *** * ***
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCC-TCACGGTCCATAATGTGG
** * * * * * * * ** * ** ** ** * * * *** * **
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * ** *
RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCG
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCG-TAGCCTACTCCAGCGACC
**** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * *
RAT.RAT. TCTCTT
TRI.AE_C ACCATC
* *
Mean pairwise ID: 32.03%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* * * ** *** * ***
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCC-TCACGGTCCATAATGTGG
** * * * * * * * ** * ** ** ** * * * *** * **
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * ** *
HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCG
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCT-CGTAGCCTACTCCAGCGACC
**** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * *
HOM.SA_A TCTCTT
TRI.AE_C ACCATC
* *
Mean pairwise ID: 32.26%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
TRI.AE_C ---------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGT
* * * ** **** * ****
FUG.RUB. TCGGTATCGA----TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
TRI.AE_C TGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCAC--GGTC-CATAATGTG
* *** * *** ** ** * ** ** **** **** * *** * *
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
* ** *** *** ** ** ***** ** **** * * ** *
FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGT
TRI.AE_C AAGGATAACGG--GCCGCTGCACTCC-TAGGCCG-CTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC
**** ** * * ** * *** * * ** * * *** ***
FUG.RUB. CTTT------
TRI.AE_C GACCACCATC
Mean pairwise ID: 32.35%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCG--TCCGTGCCAA
TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA
** * * * *** * *
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCT---ATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGGC
* ** *** **** ** * *** * *** ** *** * ***** * *
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
**** ** *** * * ***** * ** **** * ****
CAE.BRI. GGATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTT
TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAG--CGACC
***** ** * ** * * * ***** * ** *** *
CAE.BRI. GTCATT
TRI.AE_C ACCATC
***
Mean pairwise ID: 32.47%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* * * ** *** * ***
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG
** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * **
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * ** *
RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGG----CAACATAGCGAGAC
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA
**** ** *** ** * * * * ** **** * * *****
RAT.NOR. CCGTCTCT
TRI.AE_C CCATC---
** **
Mean pairwise ID: 32.47%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_D ----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCC--TGTCCAAGCACAGA
* ** * * ** **** ** **
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
* **** *** ** *** * * * * * *** * * *
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * ***** ** *** **** ********* **
CAE.EL_D AC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA
* * * ** ** ** * * **** * * * ** ** * *
CAE.EL_D TCATTT--
LYC.ES_D CCACTTTT
** **
Mean pairwise ID: 32.68%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* * * ** *** * ***
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG
** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * **
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * ** *
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAG-CGAGACCCC
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCT-CGTAGCCTACTCCAGCGACC
**** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * ** **
CAN.SPE. GTCTCT
TRI.AE_C ACCATC
*
Mean pairwise ID: 32.74%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
TRI.AE_C ---------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGT--GG
** * ** * * * *** ** **
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC
TRI.AE_C ACC-GCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTG---GGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACC
*** ** * *** **** * ** * * **** * * **
LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTT-GCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC
TRI.AE_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAAC
* * ** *** **** * * * * * ** * * **** *
LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGGA
TRI.AE_C GGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGAC-CACCATC--
***** ** ** * * * * *** * * *** * ****
LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
TRI.AE_C -----------------------------------------
Mean pairwise ID: 32.79%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_D ----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCC--TGTCCAAGCACAGA
* ** * * ** **** ** **
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
* **** *** ** *** * * * * * *** * * *
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * ***** ** *** **** ********* **
CAE.EL_A AC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA
* * * *** ** ** * * **** * * * ** ** * *
CAE.EL_A TCATTT--
LYC.ES_D CCACTTTT
** **
Mean pairwise ID: 32.79%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
LYC.ES_D -----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * ** * ** * ****
DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGAT
LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
* * * * * ** *** *** * * **** * ***
DRO.MEL. GAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** * **
DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT-ATCA--GCCCAACCGATA----TGGTTGGACCA
LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA
*** * *** ** * *** * * *** ** * * * ****
DRO.MEL. CAATCTTT
LYC.ES_D CCACTTTT
* * ***
Mean pairwise ID: 33.01%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
LYC.ES_D ----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
* * * ** ** * ***
XEN.LAE. CGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGCGGGG
* * * ** * * ** * * ** * * ** **** * ****
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG
LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** * *
XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCG-GTGCAGAACAGCCTGAACAACA----CAGCGAGAC-
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
*** * * * *** * * ** *** * **** * ** * * **
XEN.LAE. ACAGTTCT-
LYC.ES_D ACCACTTTT
** * *
Mean pairwise ID: 33.01%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* *** ** *** * ***
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG
** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * **
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* **** *** ** ** ****** ** **** * * ** *
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAG-CGAGACCCC
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTC-GTAGCCTACTCCAGCGACC
**** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * ** **
HOM.SA_B GTCTCT
TRI.AE_C ACCATC
*
Mean pairwise ID: 33.12%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAGC
* * ** * ** ******
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
* * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* **
CAE.EL_C ACAGCGCTT--GTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG
LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA
* * * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** *
CAE.EL_C TCACT---
LYC.ES_D CCACTTTT
****
Mean pairwise ID: 33.12%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGT-CCGCGCTAA
LYC.ES_D --------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * *** * ** * *
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG-GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_D AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG
** * * ** *** *** ** * * * * * * ***** * **
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
LYC.ES_D GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
** * **** *** ** ** ****** * * ****** * * ****
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCAGCGTAGCCT----GGGCAACATAGCGAGA
LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA
**** * * * *** * ** * *** **** ** * * * *
GAL.GAL. CCCTGTCTCC-
LYC.ES_D CCACCACTTTT
** **
Mean pairwise ID: 33.45%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGC
TRI.AE_C -----------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCT
* * *** * * * * ** ** ** *
LEI.MAJ. TTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGGCC
TRI.AE_C TGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCT
* * ** *** * * *** * ** * * ** **** ** ****
LEI.MAJ. GGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA-GAATCACACCGCGGAGC
TRI.AE_C GGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGC
** ** ******* * * * * *** ** ** * * ** ** ** **
LEI.MAJ. ATGTCCG---CACTTGAGCCCCAC-GCTTCGTCGCGAAGCCTT----
TRI.AE_C ACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC
* * * **** *** * ** * ** * **
Mean pairwise ID: 33.59%
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCA-ATAGTGCATGTTCGGTGGTCTC
LYC.ES_D -------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCC
* ** * * * * * ** * * * ** * * *
SCH.POM. GGGTTCGAGTCTCGCTTTC--GATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTT
LYC.ES_D AAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCA
* * * * * *** *** *** * * * * * * ** * *
SCH.POM. CGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCAC
LYC.ES_D CAGAGCAGTGAACAGCTC--CCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT--AATGGGTCGGTGTC-T
* *** *** * *** ** * * * *** * ** * **
SCH.POM. TACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAG
LYC.ES_D TATCAAG--TTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT-------
** * * ** * * ** * * * * ** ** * *
SCH.POM. TATAAACACAACGGTCGTT
LYC.ES_D -------------------
Mean pairwise ID: 33.70%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC
TRI.AE_C -------------------------------------------GGTGGTCTGCCCG--TT
** ** * ** *
YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT
TRI.AE_C CCAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGG-----------GGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCA
* * * * * * ** **** * * **** * ***** **
YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA
TRI.AE_C CGGTCC--ATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGC
***** **** * * * * ** ** * * * * ** *
YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT
TRI.AE_C CCGCTTC--CAACGGTGGAAGGATAACGGGC----CGCTGCACTCCTAGGCCGCT--TGG
* * * ** * * * *** ** ** ** * * * *
YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT
TRI.AE_C GCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC
* * * * *** *** **
Mean pairwise ID: 34.08%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_D -----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ** ******
CAE.BRI. GCTGCGTCG--CCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* * ** * ** * * * * * ** *** * * * * *** * * *
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ** *** * * ***** ** *** **** * *********
CAE.BRI. GGATAGCGCTT--GTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCAC
LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA
***** * * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** *
CAE.BRI. TTGTCATT---
LYC.ES_D CCACCACTTTT
** *
Mean pairwise ID: 34.19%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_D ------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
* *** ** ** * ***
HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
LYC.ES_D CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCGGG
* * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * ***
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGAC
LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAAC
**** * * * *** * ** * ** * **** * * * * **
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
LYC.ES_D CACCACTTTT
* * ** *
Mean pairwise ID: 34.29%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
TRI.AE_C -----------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA-GTAGTG
** * * **** * * ** ** **
TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGG----TG
TRI.AE_C GACCGCTTGGGGCCTA--TGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCG
*** **** **** * ** * * * * *** * * *
TRY.BR_A T-TGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCG-TTAAAGTGGGGGGAACGGGTCA
TRI.AE_C CGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACG
***** * * **** *** * *** ** * ** ** * *
TRY.BR_A GGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTT-CCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAG
TRI.AE_C GGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGAC-CACCATC---
***** ** ** ** * * * * *** ** ** ** * ****
TRY.BR_A CATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
TRI.AE_C ----------------------------------------
Mean pairwise ID: 34.30%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAGC
* * ** * ** ******
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
* * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* **
CAE.EL_B AC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG----ACCA
LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA
* ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** ****
CAE.EL_B CTTGTTTTT
LYC.ES_D CCACTTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 34.68%
COL.BLU. CCGAACCTCATTACCTTGGCCTGTTACCCCA---AGTTGGGGGTCTTTAA-GGTTATTTG
MUS.MU_A ------------------GCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGATC
****** *** * * *** * ** * * *
COL.BLU. ATKTTKGGCCTATGCTACCKGCCKGGCTCTGGTCCTGCTTATTCTGGCCCGCCCGTTCCA
MUS.MU_A GCTTGAGTCCAAGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG---TGTCCGCACTA
* * ** * * * * * * * *** ** * * *** * *
COL.BLU. AGCCGGGAGTTGGCCCATGTGGTTTATGCGAAGGTATAGGCTTCGGTGGTTCC
MUS.MU_A AGTTCGGCAACAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAAGTTGC-
** ** *** * * ** * * * * * *
Mean pairwise ID: 34.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* *** * ** **** **
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG
* * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * ****
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * *
RAT.NOR. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGACCC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
*** * * * *** * ** * ** * **** *** * * **
RAT.NOR. GTCTCT---
LYC.ES_D ACCACTTTT
* **
Mean pairwise ID: 35.14%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
LYC.ES_D ------------TAGTTCTG--GCCTGCCCTGTCCAAGCACA--GAGTAGGATCACGAGG
* * **** *** * * * * * * ** ** * *
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA
LYC.ES_D CCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC-CGCAT-GAGGCTGG
*** * * * **** * * * ** ** * * * **
TRY.BR_B GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG
LYC.ES_D CTTCAC-AGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGAAGGATAA---TGGGTCGG
** * * * ** ** * ** *** * ** ***** *** ** ***
TRY.BR_B TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA
LYC.ES_D TGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG-GTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT---
** * * ** * *** * ***** * * * * * * *
TRY.BR_B GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
LYC.ES_D ------------------------------------
Mean pairwise ID: 35.18%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A
* * *** * *** ******
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA
LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
* *** ** * ** *** **** * * * * * ****** ** *
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ************** ******* ** * * ***** ** *********
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT-------------------------------
LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCAC
***** **** * * *** * * ** *
ZEA.MA_H -------
LYC.ES_D CACTTTT
Mean pairwise ID: 35.23%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT
LYC.ES_D ------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGG-
* * * ***** ***** ** **** *
TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-GAACCGCCTC
LYC.ES_D ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATG
** * ** * * * * * * * * *** * * * ***** *
TET.ROS. AGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT
LYC.ES_D AGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTC
******** ***** *** *** * * ***** ** ************
TET.ROS. CATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGAC-ACT------
LYC.ES_D GGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT
* * ***** * * * * * ** * * ** **
Mean pairwise ID: 35.28%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* *** * ** **** **
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG
* * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * ****
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * *
CAN.SPE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GTGCAACATAGCGAGACC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
*** * * * *** * ** * ** * **** * * * * ***
CAN.SPE. CCGTCTCT-
LYC.ES_D ACCACTTTT
* ** *
Mean pairwise ID: 35.53%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
LYC.ES_D ------------TAGTTCTG--GCCTGCCCTGTCCAAGCACA--GAGTAGGATCACGAGG
* * **** *** * * * * * * ** ** * *
TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA
LYC.ES_D CCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC-CGCATGAG-GCTGG
*** * * * **** * * * ** ** * * * **
TRY.BR_A GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG
LYC.ES_D CTTCAC-AGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGAAGGAT---AATGGGTCGG
** * * * ** ** * ** *** * ** ***** *** ** ***
TRY.BR_A TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA
LYC.ES_D TGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC----ACCACTTTT
** * * ** * *** * * * ** * *** * ** *
TRY.BR_A GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
LYC.ES_D ---------------------------------
Mean pairwise ID: 35.60%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA-CACT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* ** **** *** *
ARA.TH_G GGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGT-GCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCT
* **** ** * ** * ** * * *** * * * ** * *
ARA.TH_G TGAGTGAAC-CGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG
** * *** ** * *** * ** ** * ** * * ** *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCG--GGTCTTGGGCAGTGCGATAG
** * *** *** ** * ** * ****** * * ******
ARA.TH_G CAACGG--TTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC
SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCGCA-GGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT-----
* * ** *** * * ** ** * * * * ** *
ARA.TH_G CACCATTTT
SCH.POM. ---------
Mean pairwise ID: 35.60%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* *** * ** **** **
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG
* * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * ****
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * *
HOM.SA_A GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GTGCAACATAGCGAGACC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
*** * * * *** * ** * ** * **** * * * * ***
HOM.SA_A CCGTCTCTT
LYC.ES_D ACCACTTTT
* ** **
Mean pairwise ID: 35.76%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCT--GCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
TRI.AE_C --------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCT--T
** * ** **** * * ** * * ** * *
TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCC
TRI.AE_C GGGGCCTATGCGAAAGTTGGGC-CTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCT
* ** * * ** *** ** ** ** * * * ** * ** ** ****
TRY.BR_B GG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA-
TRI.AE_C GGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTG
** * ** ******* *** * * **** * **** * * ** * **
TRY.BR_B ---TCTCAGGAC-TTTGCGCCCCA-AGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
TRI.AE_C CACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC
** *** * *** *** * ** * ** * * *
Mean pairwise ID: 35.76%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
*** **** *** * *
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * * ** * * ** * * * * *** * *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** * * * * * * ** * ** ** * * ** * ** ** * *
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGG-------AAACAATGCACATCACTACCGG--GTCTTGGGCAGTGC
* * *** *** * * * * * * ***** * ** ** **
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCAT
SCH.POM. GATAG--CGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
* * ** * * * * ** * * ** *** **** ** * *
CIN.HYB. TT
SCH.POM. T-
*
Mean pairwise ID: 35.77%
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCG
TRI.AE_C -----------GGTGGTCTGCCCGTTC--CAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCT-A
***** *** * * ***** * * ** **
SCH.POM. GGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGT
TRI.AE_C TGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCA-GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCAC
* *** ** * ** ** ** ** * * ** * * ****
SCH.POM. GGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGA-AACAATGCACATCACTA
TRI.AE_C AG--AGCAGCGAC--AACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACTC
* * ** *** * * ** * ** ** *** *** * * ****
SCH.POM. CCGGGTC--TTGGGCAGTGCGATA-GCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAA
TRI.AE_C CTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC-----------------
* ** * ****** * * * **** **
SCH.POM. GTATAAACACAACGGTCGTT
TRI.AE_C --------------------
Mean pairwise ID: 35.92%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
YAR.LI_B ----AGC--TGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
*** ***** * * **** * ***** *** * **
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTC--TGGACTGCCCAATCCAAGCT
YAR.LI_B TGC--GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
* * * *** * *** ** * ** ** ** * **
ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGA--AGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
** ** * * * ** * * ***** * ** * * *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
YAR.LI_B GATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT-----ATGGCGGTGG
* ** * * * * ***** * * ** * * ** *
ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC
YAR.LI_B GATAGCAA--CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------
** * * * * * * * * * *** ** ** * *
ARA.TH_G CACCATTTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 35.92%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* *** * ** **** **
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG
* * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * ****
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * *
RAT.RAT. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GGGCAACATAGCGAGACC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
*** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * ***
RAT.RAT. CCGTCTCTT
LYC.ES_D ACCACTTTT
* ** **
Mean pairwise ID: 35.93%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG
LYC.ES_D ------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTG--TCCA
* ** * * * * **
YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG
LYC.ES_D AGCACAGAGTAGGATCAC---GAGGCCCAAATGAAAATATG-GGCTTCTTGATTCCTAAA
* * * ** ** * * ** ** * ** ** * * * **
YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA
LYC.ES_D GCGGGGCGGACCGCAT-GAGGCTGGC-TTCACAGAGCAGT--GAACAGCTC--CCGCTCT
* * * * ** * *** * * *** *** * * * * ** * *
YAR.LI_B ATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATG
LYC.ES_D GTGCAGTGGAAGGATAATGG--GTCGGTGTCTTATCAAGTT--CAGTAACGCCTAATGGG
* *** ** * * * ** *** * * * ** ** * ** *
YAR.LI_B TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
LYC.ES_D TTGCTCCAACTA-----AACCACCACTTTT
** * ** ** *** *** *
Mean pairwise ID: 36.10%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
LYC.ES_D ----TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCA-CGAGGCCCAAATGAA-
** **** *** * * * * * *** * * ** ** * ** *
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT
LYC.ES_D -AATATGGGCTTCTTGATTC-CTAAAGCGGGGCG------GACCGCATG--AGGCTGGCT
* *** *** * * * * * ** ** * * * ** * *****
LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAG-GCC
LYC.ES_D T--CACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG-AAGGATAATGGGTCGGTGTC
* * * **** * ** * * * * * * *** * ***** * * *
LEI.MAJ. GGAAACGGAGCAGCC-CACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCAT
LYC.ES_D TTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT--------
* * *** * ** * * * * * * * ***
LEI.MAJ. GTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
LYC.ES_D -------------------------------------
Mean pairwise ID: 36.30%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC
LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCT---GTC
* * ** *** * ***
YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT
LYC.ES_D C-AAGCACAGAGTAGGATCACGAGG---CCCAAATGAAAATATG-GGCTTCTTGATTCCT
** * * * ** ** ** ** * ** ** * * * **
YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA
LYC.ES_D AAAGCGGGGCGGACCGCAT-GAGGCTGGC-TTCACAGAGCAG-TGAACAGCTCCCGC---
* * * * ** * *** * * *** *** * ** * ** * *
YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT
LYC.ES_D TCTGTGCAGTGGAAGGATAATGG--GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA--AT
* * *** ** * * * ** *** * * ** * * * **
YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT
LYC.ES_D GGGTTGCTCCAACTA--AACCACCACTTTT
*** * ** ** * *** **
Mean pairwise ID: 36.33%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC
* * ** * * *** * * * **
ZEA.MA_D TTGCGATG---GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG--C
** * * *** * **** *** ** ** * * * * * *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
SCH.POM. CACGTCTGT----TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACT---GGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** ** * * * ** * ** * ** * * * * * ** ***
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
SCH.POM. ACCG---ATGG----AGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGT
* **** *** *** *** *** ****** * * * * **
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
SCH.POM. GCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
* ** * ** * * * * * * * * * ** *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
SCH.POM. T----------
Mean pairwise ID: 36.36%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAA--GTG
* *** **** *** ***
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGAT--GCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
SCH.POM. -TTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCC
** * * * * * * * ** * * * * * *** * * ** * *
ARA.TH_D TGTGAGTAATC-TGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG
SCH.POM. CTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGT
** * ** ** * * * ** *** * * * ** **
ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG
SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCGGG-TCTTG-GGCAGTGCGAT
*** * **** *** ** * ** * ***** **** ******
ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
SCH.POM. AGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT----
** * * ** *** **** * * * ** *
ARA.TH_D ACCACTTT
SCH.POM. --------
Mean pairwise ID: 36.49%
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTA-GTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTC
** * ** * ** * ** ** ** * ** * *** * *
TET.THE. GGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTG
SCH.POM. GGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCG------ATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAG
** * *** * * ** * * * **** ** * * **** *
TET.THE. CTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCCT
SCH.POM. TCTTCGTGGCAAC-TGGCAGTTAAACCGTGT---AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATG
* **** *** * * * * ** * * * * ******
TET.THE. CAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG-ATAACATACT
SCH.POM. CACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTG
** * * * * ** * * * * * * **
TET.THE. CATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
SCH.POM. CATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT------------------
*** * **** * **** *
Mean pairwise ID: 36.49%
LEP.COL. ----------GCCGGAGCCTTG--CTCTGTAACCTTCGGG---GGCTTTCACCAGCTGAA
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG
** ** *** ** *** *** * *** * * * * *
LEP.COL. CAGGGAGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGC
LYC.ES_L CATGGAG----TTGGATCA-CGTGGCTTAGTCGAAAGACC--TGGGTTGCT-TGATTCCT
** **** **** ** * * * * * * * * **** ** **
LEP.COL. TGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAA-G
LYC.ES_L AAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTG
*** * * * * * ** ** ** ** * * **** * *
LEP.COL. TAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
LYC.ES_L CAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTC
** **** * ** * * ** *** * *** * ** *
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
LYC.ES_L CAACTAAACCACCACTTT--------------------------------------
*** * *** *
Mean pairwise ID: 36.65%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGAT-G
YAR.LI_A -----------------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG
* * * * ** * * *** * ** *
ORY.SA_B CCTGGTCGTT-TGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTC
YAR.LI_A TCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-GCCATTTGGTT-GTCCTTTC
** * *** **** * * * ** ** *** * ** ** * ** ***
ORY.SA_B CAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGC---GCCTGGGCGAA-GGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
YAR.LI_A CGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTA
* * ** * * ** * * * * *** * * **** * * * *
ORY.SA_B AGAGTGGC--GGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCC
YAR.LI_A AGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG--TGGGTAT
*** * * ** * * * * * ***** * * *** * *
ORY.SA_B AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCA-GCCCTGGCC--CGCTTCCGGCCCAAGTGCCT
YAR.LI_A GGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---
****** * *** * * * * *** ** ** * *
ORY.SA_B TCCATGGCAGACCACCACCTTT
YAR.LI_A ----------------------
Mean pairwise ID: 36.69%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
SCH.POM. -------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGT--CGAAGTGTTT
* * *** *** * * * **
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCG
* ***** * * * ***** ** * * * ** ** * *
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
SCH.POM. ATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTA
* ** * * ** ** ** * * * * * * * **** * * * *
LYC.ES_E CCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
SCH.POM. CCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA---CCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCG
** ** *** *** ** * ** * * * *** ****** *
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC--CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
SCH.POM. ATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAA-ACACAACGGTCGTT-------
* ** * * ** * * *** * * * * * * ***
LYC.ES_E CACATTTT
SCH.POM. --------
Mean pairwise ID: 36.76%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCC--GTTCCA
** ** * * ****
YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG
TRI.AE_C AGTTGAGTAGTGGACCGCTTGG-----------GGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGG
* * * *** * *** * * * **** * ***** ** ***
YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA
TRI.AE_C TCCA--TAAT-----GTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCT------TCACAGAGCAGCG
** **** ** * * * ** * ** *** * ***
YAR.LI_B ATC-CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATA-GCAACAAAGTGGTATA
TRI.AE_C ACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG-ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG
* * ** **** * * ** ** *** * * * * * * * *
YAR.LI_B TGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
TRI.AE_C GGCCTCGTAGCCTACTC-CAGCGACCACCATC
* * * ** * ** ** ** **
Mean pairwise ID: 36.82%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
LYC.ES_M ---------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCC
* **** * *** * * ** *
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT
LYC.ES_M CAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGAT
*** * * *** ** * * * * ** * ** * * * *** *
LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG----TTGAAGCGAGG-GAACCGGGTCA
LYC.ES_M CACGAGGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGA
* * ** * * *** * * *** * ** * **** * *
LEI.MAJ. GGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATCACACCGCG
LYC.ES_M GGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCG
*** ** ** ****** ** * * * * ** ** * ** ** * **
LEI.MAJ. GAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---------
LYC.ES_M GTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
* * * * * *** * * * * * *
Mean pairwise ID: 36.86%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC
* * ** * * *** * * * **
ZEA.MA_E TTGCGATG---GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG--C
** * * *** * **** *** ** ** * * * * * *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
SCH.POM. CACGTCTGT----TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACT---GGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** ** * * * ** * ** * ** * * * * * ** ***
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
SCH.POM. ACCG---ATGG----AGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGT
* **** *** *** *** *** ****** * ** * * **
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
SCH.POM. GCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
* ** * *** * * * * * * * * * ** *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
SCH.POM. T-----------
Mean pairwise ID: 37.06%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTG--GTCGAAGTGTTTAGTACTCC-CAATAGTGCATGT
* * ******* * ** * * * ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
SCH.POM. TCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCC-CTCGATCTGCCACGTCTGTTCGA
*** ** * * ** * **** *** * * * * * ** * * ** * **** *
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
SCH.POM. AG---AGTAGTCTTCGTG--GCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCG-ATGGAGGTTG
** **** * *** ** **** * ** * * * * ** **
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACA-GAGCAGCGAG-TACCGCCCGCTTCCAACGGT
SCH.POM. G-AAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTC
* * *** ** * * **** * * ** ** * * ** *
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
SCH.POM. GCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT-----------------------
* * * * * * * * * * *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
SCH.POM. -------------
Mean pairwise ID: 37.10%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGG--TGGGACAC
SCH.POM. ---------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAA
* * **** *** *
ARA.TH_F TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGAT--GTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
SCH.POM. GTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGAT
*** ** * * ** * ** * **** * * * *** * * ** *
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGC--TTGCAGGTTCTAGAGTCGG
SCH.POM. CCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGT
* ** * ** ** * ** *** * * ** * * **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
SCH.POM. GTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTAC--CGGGTCTTGGGCAGTGCG
*** * **** *** ** * ** * ***** * * * ******
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
SCH.POM. ATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGG-----AAGTATAAACACA-----A
* ** * * *** * **** ** * * ** *
ARA.TH_F CCACCATTTT
SCH.POM. CGGTCGTT--
* * **
Mean pairwise ID: 37.10%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGG--TGGGACAC
SCH.POM. ---------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAA
* * **** *** *
ARA.TH_A TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGAT--GTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
SCH.POM. GTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGAT
*** ** * * ** * ** * **** * * * *** * * ** *
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
SCH.POM. CCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGT
* ** * ** ** * ** *** * * ** * * **
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
SCH.POM. GTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTAC--CGGGTCTTGGGCAGTGCG
*** * **** *** ** * ** * ***** * * * ******
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
SCH.POM. ATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGA-----AGTATAAACACA-----A
* ** * * *** * **** ** * * ** *
ARA.TH_A CCACCATTTT
SCH.POM. CGGTCGTT--
* * **
Mean pairwise ID: 37.22%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
****** * * * **** **** * * *
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAG-CTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
* * * * * ** ** * * * * ** *** * *** *
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAA-GGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
*** * ***** * *** * * **** * * *** * *
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
YAR.LI_B GGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG
* ** * * ** *** * ***** ** * * * * ** **
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---------
*** * *** ** ** ** * ******
HUM.LU_D ATTTCTTTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 37.22%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_D -------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGT-CCAAGC--ACAGAGTAGGATCACGAGG
******** *** * ** * * ** * * ** *** * *
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
LYC.ES_D CCCAA-ATGAAAATATGGGCTTCTTGA-------------------TTCCTAAAGCGGGG
* ** ** ** * * ** * * ***** * ****
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * *
ORI.CUN. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GGGCAACATAGCGAGACC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
*** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * ***
ORI.CUN. CTGTCTCC-
LYC.ES_D ACCACTTTT
**
Mean pairwise ID: 37.25%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
**** * ** * ** * ** *
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCT--GGACTCTGC--ACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT
** * **** ** ** ** * * **** * ** *
CAE.BRI. GCTGCG-TCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGC-----GGTCCCGGGCGCATAAGG
YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
***** * * ** ***** * * *** * * * * * *
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
YAR.LI_B AACTGGG-ATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG
* * * * **** * * ** ****** * ** *** * *** * **
CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTT
YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-----
******* * * * * * * * * * ** * * *
CAE.BRI. GTCATT
YAR.LI_B ------
Mean pairwise ID: 37.28%
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGG--CAATAAGGTAGTGTGGATG
* * * ** * * * *** ** * * **** *
YAR.LI_B CGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG
ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
* ** *** ** * ** * ** * * * * * * * *
YAR.LI_B -GCGTCTCGG--TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC-TGG--GA
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGA
**** ** * * * * ** *** * * * ** * *** *** **
YAR.LI_B TACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA--TGGCGGTGGGATAG
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* * * * **** * * *** * ******* *
YAR.LI_B CAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTA--TGCTATAGGCCCAAT-----------------
** * * ** ** *** * **
Mean pairwise ID: 37.28%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTC---GAAGTGTTTAG
*** * * ** * ** *** * *
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC
SCH.POM. TACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT
* * * **** ** ** * * ** * * *** * ** *
LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGC---GCGCCCCCT--CCGTTAAAGTA-GAGGAACT
SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACC
* * * * *** * * * * * ** * ****** * * **
LEP.COL. GGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACC
SCH.POM. GATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGG
* *** ** *** *** *** * * * * ** ** * * * *
LEP.COL. GCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAG-GCGATCCTGTGAAGCTTT
SCH.POM. ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
* * * ** * *** ** * * * **
Mean pairwise ID: 37.33%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC
LYC.ES_D -------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGG
* * * ***** ***** ** **** *
TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCC
LYC.ES_D -ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG-GGCGGACCGCA
** * ** * * * * * * * * ***** * * * ***
TET.THE. TCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATA
LYC.ES_D TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGG
* ******** ***** *** *** * * ***** ** ************
TET.THE. CTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAG-ACATT-
LYC.ES_D TCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT
* * **** ***** **** * * * ** *** ** **
Mean pairwise ID: 37.37%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC-----AATGA
TRI.AE_C -----------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGG
** ****** ***** * **
TET.THE. GTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAAC
TRI.AE_C ACCGCT-TGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCAC--GGTCCATAATGTGGCA-GGCACC
*** *** * * * * ** * *** ** * *** * * * ** * *
TET.THE. GCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAAC
TRI.AE_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAAC
** * ******** ***** *** ** **** ****** **************
TET.THE. ATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA-TCAAAGCCAGACATT------
TRI.AE_C GGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC
* * *** * * * ** ** ** * * **** *
Mean pairwise ID: 37.41%
LEI.MAJ. ----GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC--CAGGCTTAGCGGGGAGGAC
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC
** * * * *** * * * * * * *** * *
LEI.MAJ. GTGGACCA---GCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTG-TGTGT
YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT
*** * * ** ** * ** * * * ** * *** * ** *
LEI.MAJ. CGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCG
YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGAT-----TTCCGTTCTAAGATTAA--CTGGGAAACTT
**** ** * * * * *** * * ** ** * * ** ***
LEI.MAJ. GGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACA-CC
YAR.LI_A CAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCG--GTGGGATCGCAACC
* * * ** *** ** ** * ** * * *** ** **
LEI.MAJ. GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
YAR.LI_A AAGTGGTATATGT---TATGGAAGATATTTACGATCACGATT----
* * ** * ** * ** ***
Mean pairwise ID: 37.46%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
*** * ** * ** * ** *
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG----GCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT
** * * **** *** * ** * **** * ** *
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGG-----TGCATAAGGA
YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAG--TAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA
***** *** * * *** ** * ** * * * * * **
CAE.EL_B GTGGT--GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTG
YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG
* **** ***** * ** ****** * ** *** * *** * *
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACT
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----
* *** ** * * * *** * * ** **** * * *
CAE.EL_B TGTTTTT
YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 37.50%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC
* * ** * * *** * * * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGT--GGTCTCGGGTTCGAGTC---TCGCTTTCGATCCCTCGATC
** * * ** * *** *** * * * ** * * * *
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG-GCA
SCH.POM. TGCCACGTCTGTTCGAAG------AGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA
* * * *** **** **** * * * ** * * ** * * * *
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAA-CGGTGGAA
SCH.POM. GTACCGATG-GAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA
* * ** * **** ** *** *** ****** **** * ** * *** *
ZEA.MA_C GGATAACAGG--CCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
SCH.POM. TAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT---
* ** *** *** * * * * * ** ** * *
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
SCH.POM. ------------
Mean pairwise ID: 37.62%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
SCH.POM. -------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGT--CGAAGTGTTT
* * *** *** * * * **
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCG
* ***** * * * ***** ** * * * ** ** * * *
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
SCH.POM. ATCTG--CCACGT----CTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCA---GTTAAAC
* ** ** ** * ** **** * * ** * * ** * * **
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
SCH.POM. CGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAG-TGC
** ** * * * * *** * ** ** * * *** * *
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
SCH.POM. GATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATG--TGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
* ** ** * ** *** *** ** ** * ** *** *
LYC.ES_O TTT
SCH.POM. T--
*
Mean pairwise ID: 37.70%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAA-TGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * * * **** *** ****
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** * * * ***** ** * * * ** ** * *
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
SCH.POM. GATCTG--CCACGT----CTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGG---CAGTTAAA
** ** ** ** * ** **** * * ** * * ** * * *
LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
SCH.POM. CCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAG-TG
*** ** * * * * *** * ** ** * * *** * *
LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA
SCH.POM. CGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATG--TGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCG
* ** ** * ** *** *** ** ** * ** *** *
LYC.ES_G CTTTT
SCH.POM. TT---
*
Mean pairwise ID: 37.86%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGCCTTCTTGTTGTGC--
** *** ** * * * **** * ** * ** *
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
YAR.LI_B GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTG----GGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG
***** * ** * ** * *** ** * ** ** ** ** ** *
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG--AG
YAR.LI_B TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* * ** * * **** * * * ** ****** * *
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
YAR.LI_B GATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCGGTGGGAT
* ** * * * ***** * * * * * ** ** ****
ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAAC
YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGACTCTC--------
** * * * * * *** *** *** ****
ARA.TH_A CACCATTTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 37.99%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
*** * ** * ** * ** **
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCA----CTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT
** * * ***** ** * * ** * * * **** * ** *
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAGG
YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * *
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
YAR.LI_A AACTG-GGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG
* * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** * **
CAE.EL_A CCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCACT
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------
*** *** * * * ** ** **** ** *
CAE.EL_A TATCATTT
YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 38.04%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGG-GGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT
LYC.ES_L -GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTAT--AGTCTGGCCTGCCCTCTCC
* ** * ** ***** **** ** * * ** * *
TRY.BR_A GGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGT
LYC.ES_L AAGCATGGAGTTGGATCACGTGGC-TTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAG
** * * ** * ** ** ** * *** * * * * *
TRY.BR_A TGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGC
LYC.ES_L TGGGGTGG--ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGC--AACGAACAGCTTCCGCTCTGTG
** *** * **** * * * ** * * ** * * * ** *
TRY.BR_A CGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATC
LYC.ES_L CAGTGGAAGGATAACGGGTCA-GTGCTCAG-CGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGC
* *** * * * * * ** * * ** * * * * * ** * ** *
TRY.BR_A TCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
LYC.ES_L TCCAA---CTAAACCACCACTTT-------------
** * ** * * * *
Mean pairwise ID: 38.11%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
SCH.POM. --------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGC--ATGTTC
* ** ***** *** * * *** *** *
TRI.AE_B GGTGCGGTTTG--TTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
SCH.POM. GGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT-CTGCCACGTCTGTTCGAAG-
**** * * * * **** *** * * *** * * * **** ***
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCA---GGCCTTAAGTGGCA
SCH.POM. -AGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAA
***** * ** **** ** * * * * * ** *
TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
SCH.POM. TGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGT-GCGATAGCGATGGGATTCACCT-TCGCAGG
**** * ** * *** * ** **** * * * * ** * * * ***
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
SCH.POM. AT----GTGCATGGAAGTATAAACACAAC--GGTCGTT----------------------
** * * * ** ** * * ** * *
TRI.AE_B CATCTTT
SCH.POM. -------
Mean pairwise ID: 38.11%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
**** * ** * ** * ** **
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTT--GGGCTCTGC--ACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT
** * ***** * *** ** * * * * **** * ** *
CAE.BRI. GCTGCG-TCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGC-----GGTCCCGGGCGCATAAGG
YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
***** * * ** ***** * * *** * * * * * *
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
YAR.LI_A AACTGGGAA-ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG
* * * * **** * * ** ****** * ** *** * *** * **
CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT-ACCTTCAGACCACT
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------
**** ** * * * * * * * * *** ** *
CAE.BRI. TGTCATT
YAR.LI_A -------
Mean pairwise ID: 38.13%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** ** * ** *** * ** **** ** *** ** *** *
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTA--GTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG
* ** ** * * ** ** **** * * * * * ** * ***
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG
** * * * ** * ** * ** * * *** * ** *
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA
* * *** ** * ** * * * * ** * *** **** *
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------
* * ** * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 38.16%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * **** *** * **
LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** ** * * ***** ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** * * * ** * * * * * ** **** * * *
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCG
**** **** *** *** *** ** * * ** ****** *
LYC.ES_A ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
SCH.POM. ATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACA--CAACGGT
***** ** * * * * * ** * ** * ****
LYC.ES_A CTTT
SCH.POM. CGTT
* **
Mean pairwise ID: 38.19%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
*** * ** * ** * * **
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
** * * ***** ** * * ** *** * * * **** * ** *
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGG-----TGCATAAGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAG--TAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG
***** *** * * *** ** * ** * * * * * *
CAE.EL_C AGTGGT--GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGT
YAR.LI_A ATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGC
* * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** *
CAE.EL_C GGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGACCA
YAR.LI_A GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------
** *** ** * * * *** * ** * ** ** *
CAE.EL_C CTTGTCACT
YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 38.19%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGCCTTCTTGTTGTGC--
** *** ** * * * **** * ** * ** *
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
YAR.LI_B GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTG----GGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG
***** * ** * ** * *** ** * ** ** ** ** ** *
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGA--AGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGG--AG
YAR.LI_B TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* * ** * * **** * * *** * ****** * *
ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
YAR.LI_B GATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCGGTGGGAT
* ** * * * ***** * * * * * ** ** ****
ARA.TH_F GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAAC
YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGACTCTC--------
** * * * * * *** *** *** ****
ARA.TH_F CACCATTTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 38.19%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
****** * * * **** **** * * *
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAG-CTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
* * * * * ** ** * * * * ** *** * *** *
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG
YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
*** * ***** * *** * * **** * *** *** * *
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
YAR.LI_B GGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG
* ** * * ** *** * ***** ** * * * * ** **
HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC
YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---------
*** * *** ** ** ** * * ******
HUM.LU_A ATTTCTTTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 38.20%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGG-TGGCTGCGGAT
SCH.POM. -------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGT
** *** ** * * * *
ORY.SA_A GTTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTG---CCC
SCH.POM. GTTTAGTAC---TCCCAATAGTG-----CATGTT-CGGTGGTCTCG--GGTTCGAGTCTC
**** ** * * ** ** ****** ** *** * ** * * * *
ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG
SCH.POM. GCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAG
* * * * * *** * * * *** * * * *
ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCT
SCH.POM. ---TTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCAC--ATCACTACCGGGT
**** * * ** * **** *** *** *** ****** ** * *
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
SCH.POM. CTTG--GGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCG--CAGGATGTGCATGGAAGTATA
** * **** * * * ****** * * * * ** ***
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
SCH.POM. AACACAACGGTCGTT-------
***** * *
Mean pairwise ID: 38.20%
ZEA.MA_A ------NCCGAGCTCTGTAGC----GAGAGCTTGT-AACCCGAGCGGGGGCATTAAGG--
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
* ******** * * * *** * * ******* **
ZEA.MA_A TGGTGTGAATGCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCT
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT
* * * ** ***** * *** * * * * **** * * ****
ZEA.MA_A TGCCCATCCCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCA
LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGGCCG
***** * ** *** * * * * * * ***** * ***** *
ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACT
LEI.MAJ. GAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCAC-ACCGCGGAGCATG
** ***** ** ** * * * * * * **** * * * * * *
ZEA.MA_A CCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT
LEI.MAJ. TCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------------------------
** ** * * * *** * **
ZEA.MA_A CACTAAGCAAACCACCATCTTT
LEI.MAJ. ----------------------
Mean pairwise ID: 38.24%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** * *** * * * * *** *** * *****
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** ******* * * * *** *** *** * * *
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * ** *** * ** **** * * *
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAG---AGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA
** * * ** ** **** *** ** * * ** ** ***
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
YAR.LI_A TCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------------
* * * *** * * ** ** * * *
LYC.ES_B ACTTTT
YAR.LI_A ------
Mean pairwise ID: 38.31%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT
TRI.AE_C ----------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGA
** ************ * * **
TET.ROS. ATGGTGGAAACCTA----GTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGC
TRI.AE_C CCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCAC--GGTCCATAATGTGGC-AGGCACCGC
* * * **** * * ** * **** ** * *** * * *** *****
TET.ROS. CTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACAT
TRI.AE_C GTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGG
* ******** ***** *** ** **** ****** **************
TET.ROS. ACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-------
TRI.AE_C GCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC
* * *** * ** * ** ** ** ** ** *
Mean pairwise ID: 38.31%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
*** * ** * ** * ** **
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGC---TCTGCACTTG-GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT
** * * ***** ** * ** * * * * * **** * ** *
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAGG
YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * *
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
YAR.LI_A AACTG-GGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG
* * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** * **
CAE.EL_D CCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCACT
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------
*** *** * * ** * ** **** ** *
CAE.EL_D TATCATTT
YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 38.36%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * **** *** * **
LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** ** * * ***** ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** * * * * ** * * * * * ** **** ** * *
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC
**** **** *** *** *** ** * * * ** ****** *
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
SCH.POM. GATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACA--CAACGG
***** ** * * * * * ** * ** * ****
LYC.ES_K CCTTT
SCH.POM. TCGTT
* **
Mean pairwise ID: 38.36%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * **** *** * **
LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** ** * * ***** ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** * * * ** * * * * * ** **** * * *
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC
**** **** *** *** *** ** * * * ** ****** *
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
SCH.POM. GATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACA--CAACGG
***** ** * * * * * ** * ** * ****
LYC.ES_J CCTTT
SCH.POM. TCGTT
* **
Mean pairwise ID: 38.44%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGAT-G
YAR.LI_B --------------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG
* * * ** * * *** * ** *
ORY.SA_B CCTGGTCGTT-TGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTC
YAR.LI_B CCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG-GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTT-GTCCTTTC
*** * *** **** * * * **** * ** ** ** *** * * ** ***
ORY.SA_B CAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGC---GCCTGGGCGAA-GGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
YAR.LI_B CGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTA
* * ** * * ** * * * * *** * * **** * * * *
ORY.SA_B AGAGTGGC--GGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCC
YAR.LI_B AGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG--TGGGTAT
*** * * ** ** * * * * ***** * * *** * *
ORY.SA_B AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCA-GCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTC
YAR.LI_B GGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
****** * *** * * * * *** * * * * * **
ORY.SA_B CATGGCAGACCACCACCTTT
YAR.LI_B --------------------
Mean pairwise ID: 38.46%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_D -------------------------------------TAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * * **** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LYC.ES_D AGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCG
** * ** * * *** *** * ** ** **** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_D GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * * ** ********* ************ ** * * ****** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGC-CCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_D AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAA
******** *** ** ** * * * * ** * * * * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_D ACCACCACTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 38.51%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
YAR.LI_B --------------AGCTGTAATGGCATTTT-GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG
*** * * * ** * ** *** * * ***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
YAR.LI_B TGC---GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGC-TACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** * * * * * **** * * ** * * * ** * * ** **
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTC---CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG--
YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
** * * ** ** ***** * * * *** * * * ** **
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGA
YAR.LI_B GGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT--GGCGGTGGG
*** * * * * * * ***** * * ** * * ****
CIN.HYB. AGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTA-GGCTCATATAACCAGCC-TGGCTAGCCCAACAGGA
YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---------
* **** ** * * *** ** *** ** * * ** *
CIN.HYB. CACCCATTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 38.51%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
*** * ** * ** * ** **
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
** * * ***** ** * * ** *** * * * **** * ** *
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGG-----TGCATAAGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAG--TAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG
***** *** * * *** ** * ** * * * * * *
CAE.EL_B AGTGGT--GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGT
YAR.LI_A ATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGC
* * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** *
CAE.EL_B GGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGACCA
YAR.LI_A GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------
** *** ** * * * *** * ** * ** ** *
CAE.EL_B CTTGTTTTT
YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 38.52%
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC--CAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG
** * * * *** * * * * * * *** * **
LEI.MAJ. GACCA---GCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTG-TGTGTCGG
YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG
*** * ** * **** ** * * * ** * *** * ** ****
LEI.MAJ. TGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGT
YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGAT-----TTCCGTTCTAAGATTAA--CTGGGATACTTCAG
* ** * * * * *** * * ** ** * * ** **
LEI.MAJ. CAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCA-CACCGCG
YAR.LI_B TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTG
* * * ** *** ** ** * ** ** * ** ** * *
LEI.MAJ. GAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
YAR.LI_B GTATATGTTA-----TGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-
* **** ** * ** *** *
Mean pairwise ID: 38.64%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA
** ** **
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA
** * ** * ** * * **** * ** *** ** *
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
* * **** * ** * * **** *** * * * * * * *** * * **
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * **** ** *** **** ********* **
CAE.EL_A ACCGCGCTTGTGAGTT----GACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
* ** * * * * ** * * * *** * * ** ** *
CAE.EL_A ATCATTT-
LYC.ES_L ACCACTTT
* ** **
Mean pairwise ID: 38.64%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA
** ** **
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA
** * ** * ** * * **** * ** *** ** *
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
* * **** * ** * * **** *** * * * * * * *** * * **
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * **** ** *** **** ********* **
CAE.EL_D ACCGCGCTTGTAAGTT----GACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
* ** * * * ** * * ** *** * * ** ** *
CAE.EL_D ATCATTT-
LYC.ES_L ACCACTTT
* ** **
Mean pairwise ID: 38.67%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** ** * ** *** ** **** ** *** ** ** *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGC-CTGGG-TCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG
* ** ** * * ***** * ****** * * * * * ** * ***
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG
** * * * ** * ** * ** * * *** * ** *
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA
* * *** ** * ** * * * * ** * *** **** *
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------
* * ** * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 38.76%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
YAR.LI_B ----AGCT--GTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGTA--AATCGCCTTCTTGTTGTGCG
**** **** * * **** * ****** *** * * * * *
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
YAR.LI_B -TTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG-GCTACTTTGT---TGTCCTTTCCGAATTCTGCGG
*** * * ** * ** * *** *** * * ** ** ** ** *
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG--AGG
YAR.LI_B TTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGG
* * * ** * * * * * ****** * **
ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG
YAR.LI_B ATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCGGTGGGATA
** * * * * ***** * * * * ** ** ****
ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
YAR.LI_B GCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGA-CTCTC--------
* * * * * * * *** ** *** *****
ARA.TH_D CCACTTT
YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 38.77%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
LYC.ES_L ------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTA-TAGTCTGGCCTGCCCT
* * * * * * *** * ******* * ** *
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT
LYC.ES_L CTCCAAGCATGG--AGTTG-GATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCT--TGAT
* * ** ** * ** * * ****** * * ** ** * * * *
LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGGGAACCGGGTCAGGCC
LYC.ES_L TCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTC
* * ** * ** *** * * * * * ** * * **** * ** * *
LEI.MAJ. GGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCATG
LYC.ES_L TGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCT
* * * ** * * * * ** * * ** ** * *
LEI.MAJ. TCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
LYC.ES_L GCTCCAACTAAACCAC-CACTTT-------------
* ** * * ** * * ***
Mean pairwise ID: 38.89%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * **** *** * **
LYC.ES_H GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * *
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGA--AACAATGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC
* * **** *** *** *** ** * * * ** ****** *
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
SCH.POM. GATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAAC--ACAACGG
***** ** * * * * * ** * ** *****
LYC.ES_H CCTTTT
SCH.POM. TCGTT-
* **
Mean pairwise ID: 38.89%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC
LYC.ES_L ----GTTGGGTTGAC-CCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCT
* ** ** * * * * * * * * *** * ** ** * *
YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT
LYC.ES_L CCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCT---TAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCT
** * * * ** *** * ** ** * ***** * * **
YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA
LYC.ES_L AAAGTGGGGTGGACTGCGT-GAGGCTGGT-TTCACAGAGCAAC-GAACAGCTTCCGCTCT
* ** * ** * *** * *** *** *** * * **** *
YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT
LYC.ES_L GTGCAGTGGAAGGATAACGGGT-CAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCT
* * ** * * * * *** * * * * * * ** *** *
YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT
LYC.ES_L GCTCCAACTAAACCACC-ACTTT-------
* ** * ** *
Mean pairwise ID: 38.92%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
YAR.LI_B ------------------AGCTGTAATGGCATTTTG-----TCGGAGTGGTAAATCGCCT
**** * *** * * * **** * * *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCAT---GTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAG
YAR.LI_B TCTTGT-TGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
* * * ** * ****** * *** * * ** * ** ** *** *
ARA.TH_E CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAG-GCTTGGCTCAAACGGCT----TCTAAAGT
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
* ** * ** * * ** ** * ** * **** * * ***** *
ARA.TH_E TGG--AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCA
YAR.LI_B TAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCG
* ** ** * * * * ***** * * * * * ** **
ARA.TH_E GTGGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCA
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGACTCTC-
**** *** * * * * * *** *** *** ****
ARA.TH_E TATGAACCACCATTTT
YAR.LI_B ----------------
Mean pairwise ID: 38.96%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA-CGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* *** * * * * ***
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
SCH.POM. TAGT-ACTCCCAATAGTGCATGTTCGG--TGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCC
** ** ** * * * ****** *** ** * * * * * *** *
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCT-CGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
SCH.POM. CTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGT
** ** * * * * ** * ** ** ** * * ** * ** * * *
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGA-CGGTGGAA
SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACA----TCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA
**** **** *** ** * ** *** ** * ***** * *** *
ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
SCH.POM. TAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAAC-ACAACGGTCGTT--
* *** * * * * *** **** * * ** * *
ARA.TH_C ATCACTTT
SCH.POM. --------
Mean pairwise ID: 39.02%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTG-GTAAATCGCCTTCTTGTTGTGC-G
** * *** * * **** * *** * ** ** *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
YAR.LI_B TTCGAGTTCTGGACTCTGCACT---GGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTT
* * * * * * ** * * * ** ** *** ** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
YAR.LI_B GAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGA
* *** * ** * ** * * * * * * **** * ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_B TACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAG
* * * ** *** * **** ** * * * ** * ** *****
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAA-GTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
YAR.LI_B CAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACTCTC------------
* * **** **** * ** * ** * ** * ***
LYC.ES_C CATTT
YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 39.02%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
SCH.POM. ------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG----TTTAGTAC
* ** *** ** *** ** ****** *
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
SCH.POM. T-CCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT--CGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT
**** * * * * * *** * * * ** * * * * *** * ** **
HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCT-TGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT
SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACC
** ** ** * * ** * * ** **** ** * *
HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
SCH.POM. GATGGAGGTTGGAA--ACAATGCA-CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGAT
* **** *** *** *** * ** * * * ******* * *
HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGC-TGACTCTTAATAGGACCATTT
SCH.POM. GGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT----------
*** ** * * ***** * * * ** * *
HUM.JA_B CTTTT
SCH.POM. -----
Mean pairwise ID: 39.02%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
SCH.POM. --------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTC
* * ** * * ** * ***
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
SCH.POM. CCAATAGTGCATGT-TCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTC---GCTTTCGATCCCTCGATC
** ** * **** * * * * ** ** *** * * ** * *
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT
SCH.POM. TGCC----ACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** **** *** *** * ** *** * *** * * ** * **
ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTAC--CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC
* * **** *** ** * ** * ***** * * * ******
ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACC
SCH.POM. GATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGA-----AGTATAAACACA-----ACGGTC
* * * * *** * **** ** * * ** ** *
ARA.TH_E ATTTT
SCH.POM. GTT--
**
Mean pairwise ID: 39.02%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTAC
*** ***** * * * * **
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTG---ATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG
SCH.POM. TCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG
* * *** ** * ** * ** *** * * * *** * **
LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGG----TGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG-GGAACCGGG
SCH.POM. CCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGAT
* * * * **** * * * ** *** ** ** * * ****
LEI.MAJ. TCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCG
SCH.POM. GGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTAC---CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGG
*** ****** *** *** * * *** * * ** * * *
LEI.MAJ. GAGCATGTCCGCACT-TGAGCCCC-ACGCTTCGTCGCGA-AGCCTT-
SCH.POM. ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
** * **** ** ** * * * * * * * * *
Mean pairwise ID: 39.05%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
YAR.LI_B ----------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAG-TGGTAAATCGCCT
* * * *** *** *** *** * ** * *
HUM.LU_B CAGCCCAGTG-GATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCT----TACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
YAR.LI_B TCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT
*** * *** ** * * * ** **** ** ** **** *
HUM.LU_B ----CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAA-GGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT
YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
*** * ***** * *** * * *** * * * * ** *** *
HUM.LU_B GG--AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAG
YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGT--GGGTATGGCGG
** * * * * * ***** * * ** * *** *
HUM.LU_B TGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAAT
YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTA-TATGTTATGGAAGGTATTTGC-AATCACGACTCTC---
*** * *** *** ** * * * * ** * ** ******
HUM.LU_B CGGACCATTTCCTTT
YAR.LI_B ---------------
Mean pairwise ID: 39.07%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * * *
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** ** * *** *** * ** * *** *
CAE.EL_D GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
*** * * * * * * * ** ** ** * *** * * *
CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTCGAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** * *
CAE.EL_D CGCGCTTGTAAGT-TGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT
TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------
* * * ** * ** * * ** * * ** *
CAE.EL_D TT
TRY.BR_A --
Mean pairwise ID: 39.10%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
YAR.LI_A --------------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
* * * ****** * * * **** **** * * *
HUM.LU_A GGTCAAC-CTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC-
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT---TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATT
* * * * * * * *** * * * ** * * * ** ** **** *
HUM.LU_A ---CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGG
YAR.LI_A CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTA
*** * ***** * *** * * **** * *** *** *
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
YAR.LI_A ACTGGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGT
* * * * * ** *** * ***** ** * * * * **
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
YAR.LI_A GGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------
**** * * *** ** ** ** ** * ** *
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT
YAR.LI_A ------------
Mean pairwise ID: 39.12%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
LYC.ES_L --------------------------------GTTGGGTTGACCCAG-ATGGTTGGGTTC
* ** * ** ** * **
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTG--TTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
LYC.ES_L GGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTC
* * ** **** *** * * * * * * * * **** * **
TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGG-GTCAGGC
LYC.ES_L GAA-----------AGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGC
** *** * *** ********** * ** * ** ****
TRY.BR_B CGGTG--ACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAG
LYC.ES_L TGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTG
*** ** ***** * ** *** *** * * * ** * ** * ** * *
TRY.BR_B CATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--------
LYC.ES_L CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT
* * * * ** ***** * * * * * *
Mean pairwise ID: 39.14%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAA-TGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * * **** *** ****
LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * *
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * *
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGC---GATA
* * **** *** ** * ** * ** * * ** *** ****
LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
SCH.POM. GCGA--TGGGATTCACC----TTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
*** ** *** * * * ** ** * ** *** * *
LYC.ES_N TTTT
SCH.POM. T---
*
Mean pairwise ID: 39.14%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G
* * * * ***** * * ** * ** * * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
* ***** * * *** ** * * * * ** * ** * * *
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LEI.MAJ. GTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG----TTGAAGCGAGG-GAA
*** * * * ** * * *** * * *** * ** * *
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACG-TCCGCCGTTGCAGAATC
*** * **** ** ** ****** ** * * * * * ** ** * ** **
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-----
* *** * * * * *** * * * * * *
LYC.ES_J CTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 39.22%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGG--CATTGAGGCGGTGTGGATGC
YAR.LI_B --------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTC
** ** ** * * * **** * * **** * *
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
YAR.LI_B GAGTTCTGGACT-CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG
* * ** * ** ******* * * **** * * * ** * * *
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC
YAR.LI_B GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTC-CGTTCTAAGA--TTAACTGG--GAT
** ** *** ** ** * *** * **** ** **** *** *
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
YAR.LI_B ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGGTGGGATAGCA
** * * * * ***** * * * * * ****** * *
TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAG--CATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC
YAR.LI_B ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---------------
*** * * * **** * ** * ** *
TRI.AE_B ATCTTT
YAR.LI_B ------
Mean pairwise ID: 39.22%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA----ATCGTCTTCTTGTTGTG
** ** * ** * * * ****** * * ** * ***
ARA.TH_D -GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
YAR.LI_A CGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
**** * ** * ** ** * ** * *** * ** ** ** **
ARA.TH_D GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
YAR.LI_A GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
** * * ** * * * * * ****** * **
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
YAR.LI_A GAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA
** * * ** *** * ***** ** * * * * ** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
YAR.LI_A TCGCAACC--AAGTGGT----ATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------
** * **** ** ***** * ***** * *
ARA.TH_D CACTTT
YAR.LI_A ------
Mean pairwise ID: 39.27%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** ** * ** *** ** **** ** *** ** * *
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCT--AGTGCTACAAACTGTG-GACCACCCATTCCAAG
* * ** * * ** ** ***** * * * * * * ** * ***
GAL.GAL. GCCGGCA-TCAATATGGTGAGCCCCGG-GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAAAGTGG
* * * * * * *** ** * * * *** *** **** * **
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA
* * * *** ** * ****** * * **** * * **
GAL.GAL. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTC
ZEA.MA_H AGGATAATG---------AGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------
**** * ** * ** *** *
GAL.GAL. TCC
ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 39.29%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA
** ** **
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA
** * ** * ** * * *** * ** *** ** *
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
* ** **** * ** * * **** **** * * * * * *** * * ***
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * **** ** *** **** * ********* **
CAE.EL_C ACAGCGCTTGTGAGTT----GACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
* * ** * * * * ** * * ** *** * ** ** *
CAE.EL_C GTCACT--
LYC.ES_L ACCACTTT
****
Mean pairwise ID: 39.29%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
YAR.LI_A --------------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
* * * ****** * * * **** **** * * *
HUM.LU_D GGTCAAC-CTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT---TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATT
* * * * * * * *** * * * ** * * * ** ** **** *
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG-GCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
YAR.LI_A CTGCGGTTGA-TGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * * ** * * * ** * ** * ** * * * * *
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAG--AGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG
* ** * * * ** **** * *** * * ** ** *
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
YAR.LI_A TG--GGATCGCAACCAAGTGG------TATATGTTATGGAA--GATATTTACGATCACGA
* ** ** * * *** ** * * * ** *** * ** *
HUM.LU_D TTTCTTTT
YAR.LI_A TT------
**
Mean pairwise ID: 39.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA--ATCGCCTTC
***** * ** * **** * * * * *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACT---CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
*** * ********* ** *** ** ** * * ***** * *
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATT-TCCGTTCTAAGA
*** ** ** * * *** * * ** ** * *
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC
* * * * * * * * *** ** * * * ** ****
Mean pairwise ID: 39.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC-GCCTTCT
***** * ** * **** * * * * *** *
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
YAR.LI_B TG-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTC---TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
* *** ** ********* ** *** ** ** * **** * *
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTG-ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA
* ** **** * * * * * * * * *
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * ** *** * *
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
YAR.LI_B TGGGA--TAGCAACAA--AGTGGTATATGTTATGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC
* * * ** * * ** * *** ** * * * * ***
Mean pairwise ID: 39.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA--ATCGTCTTC
* ***** * ** * **** * * * * *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCT---CTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
*** * **** ****** *** ** *** * ** ***** * *
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATT-TCCGTTCTAAGA
*** ** ** * * *** * * ** ** * *
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_A TTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATT-TACGATCACGATT---
* * * * * * * * *** * ** ** * ** *
Mean pairwise ID: 39.40%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G
* * * * ***** * * ** * ** * * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
* ***** * * *** ** * * * * ** * ** * * *
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LEI.MAJ. GTGTGG--CTTGCCCCCCTGCAGAGGGTG-GCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GAAC
*** ** * *** ** * * ** * * *** * ** * **
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCAC
** * **** ** ** ****** ** * * * ** ** * ** ** *
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCT
LEI.MAJ. ACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-------
*** * * * * *** * * * * * *
LYC.ES_A TT
LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 39.44%
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGG--CAATAAGGTAGTGTGGATG
** * * * ** * * * *** ** * * **** *
YAR.LI_A CGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG
ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
* * *** ** * *** * * * * * * * * * *
YAR.LI_A -GCGTCTCGG--TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC-TGGGAAA
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGA
**** ** * * * * ** *** * * * ** * *** *** *
YAR.LI_A CTTCA-GTGGAGC-AATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA--TGGCGGTGGGATCG
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* * *** ** **** * * *** * ******* *
YAR.LI_A CAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT
ZEA.MA_H TAAT-GAGTCGC-TATGCTATAGGCCCAAT--------------
** *** * **** *** * **
Mean pairwise ID: 39.46%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCG
* ** * ***** * ** * * * * ** *
TRI.AE_A GTTGTAGCGC-TGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
SCH.POM. GTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAG---
** ** ** * ** * ** * * * ** *** * ** * **** ***
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
SCH.POM. ---AGTAGTCTTCGTGGCAACT----GGCAGTTAAACCGTGTAGTAC-CGATG-------
*** * * * *** * * ** * * ** * ***
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
SCH.POM. --------GAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGG---GTCTTGGGCAGTGCGATAG
**** *** ** * ** * * * * * * * *** *
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
SCH.POM. CGATGGG-----ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
***** * *** ** ** ** * * ** ** * * *
Mean pairwise ID: 39.47%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAA-TGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * * * **** *** ****
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * *
LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * *
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGC---GATA
* * **** *** ** * ** * ** * * ** *** ****
LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
SCH.POM. GCGA--TGGGATTCACC----TTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
*** ** *** * * * ** ** * ** *** * *
LYC.ES_I TTTT
SCH.POM. T---
*
Mean pairwise ID: 39.47%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G
* * * * ***** * * ** * ** * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * * *
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAAC
*** * ** *** * * *** * *** * * * * *
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATCA
* ** **** ** ** ****** ** * * * * ** ** * ** ** *
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LEI.MAJ. CACCGCGGAGCATGTCCG----CACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------
*** * * * ** * *** * * * * * *
LYC.ES_H TTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 39.48%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAA-TGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * * **** *** ****
LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAG-GTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT
* * **** ** * * * *** ** * ** * ** ** * *
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGG-GCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG
SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG
** ** * * ** * *** * ** *** * * *** **** * * *
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAG
** * **** *** ** * ** * * ** * * ** ****** *
LYC.ES_C TAACGAG--CCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACT
SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAA-ACACAACGGTCGTT-----
* * * ** ** * * * * * * ** * * * * ***
LYC.ES_C ACCACATTT
SCH.POM. ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
*** * ** * ** * ** *
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTT-----GTCCTTTCCGAA
** * * **** *** * ** * * **** * * **** * ** *
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * *
CAE.EL_D GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTG
YAR.LI_B TAACTG-GGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG
* * **** ***** * ** ****** * ** *** * *** * *
CAE.EL_D GCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACAT-ACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCAC
YAR.LI_B GTGGGATAGCA---ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-
* *** ** ** ** * * * * * * * * * * * *
CAE.EL_D TTATCATTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
*** * ** * ** * ** *
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTT-----GTCCTTTCCGAA
** * * **** *** * ** * * **** * * **** * ** *
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * *
CAE.EL_A GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTG
YAR.LI_B TAACTG-GGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG
* * **** ***** * ** ****** * ** *** * *** * *
CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACAT-ACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCAC
YAR.LI_B GTGGGATAGCA---ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-
* *** ** * ** * * * * * * * * * * * * *
CAE.EL_A TTATCATTT
YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTT------GTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTG
*** * * * * * ** * ** *** * * ***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
YAR.LI_A TGC---GTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGC-CATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** * * * * ** **** * * ** *** * ** * * ** **
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTC---CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG--
YAR.LI_A CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
** * * ** ** ***** * * * *** * * * ** **
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGA
YAR.LI_A GGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT--GGCGGTGGG
*** * * * * * * ***** * * ** * * ****
CIN.HYB. AGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTA-GGCTCATATA-ACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGA
YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------
* ** * ** * * *** ** **** ** * * * *
CIN.HYB. CACCCATTT
YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTT
* ** *** ** *** ** **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT
** ** * * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * **
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCG--CAGCTCCTAGAGTGGAGGG
SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG
** ** * ** * * * ** ** ** ** ** ** * * *
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCGG--GTCTTGGGCAGTGCGATAG
* * **** *** ** * ** * ****** * * ******* *
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTAC-CTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT------
* *** ** * * **** * * * ** * *
HUM.LU_D ATTTCTTTT
SCH.POM. ---------
Mean pairwise ID: 39.52%
LYC.ES_M -----------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGA
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGC-GTTCGAGT
** ** ** *** * * *** ** ** * **
LYC.ES_M TGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACG
YAR.LI_A C--TTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGAT-GGG
****** * * * * ** *** *** * * * * * *** *
LYC.ES_M AGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG
YAR.LI_A CGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCA
* * * * ** ***** **** * * * ** * *
LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTC
YAR.LI_A GTGGAGCAATCCAGCAGAGA--TCCAGTT----GCCGTGG--GTATGGCGG-TGGGATCG
* ** *** * * *** * * ** **** * ** ** * **
LYC.ES_M TTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
YAR.LI_A CAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT------
* ***** ** * * * * * ** * * *
Mean pairwise ID: 39.55%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT
***** * * **** * *** ** * * ** ** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTT-GTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
**** * * * ** ** ** * * *** * * * * * ** *
ZEA.MA_B GGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAGG
YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* * ** * * ** ** * * ** * * * * * * * * **
ZEA.MA_B AATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CACTTCCAACGGTGGGA
YAR.LI_B GATACTTCAG---TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA
** * *** * ***** **** * * *** * ********
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACA---GACCCAGATCCTCTCTTAGCAAA
YAR.LI_B TAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----------
***** * * * ** * * * * ** ***
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
YAR.LI_B -----------
Mean pairwise ID: 39.56%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT
** * * * ** * * * *** ** * * ** * ** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-------GCCATTTGG-TTGTCCTTTCCGAA
**** * * * ***** *** ** * * ** *** ** * ** *
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
YAR.LI_A TT--CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG
** * * ** **** * * ** * ** * * * *
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAG---AGCAGCGATC--ACTGCCG-ACTCCCAACG
YAR.LI_A ATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCG
* ** * * ** * ** ***** **** ***** **
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGC-TGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAA
YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------
****** *** *** * * * ** * * * * *** *
ZEA.MA_A GCAAACCACCATCTTT
YAR.LI_A ----------------
Mean pairwise ID: 39.60%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GTCTTC
* ***** * ** * **** * * * * *
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
*** * **** ****** * ** ** *** * ** ***** * *
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_A T-AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATTTACGATCACGATT--
* * * * * * * * *** * ** * ** *
Mean pairwise ID: 39.60%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
SCH.POM. ----------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGA
** * * * *** *
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGA--CCGAGCGTCCGTGCCAA
SCH.POM. AGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGA
**** * * * * * **** ** **** ** * * *
CAE.BRI. GCGCTGCGTC-GCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTG-GCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG
SCH.POM. TCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCG
* ** ** **** * * * ** * ** ** * ** * *** *** *
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
SCH.POM. TGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAA-CAATGCACATCA-CTACCGGGTCTTG-GGCAGTGC
** * ** * * ** * ** ** ** * * **** * ** * *
CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTC
SCH.POM. GATAGCG---ATGGGAT-TCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTC
******* ** * * ** * * ** * ** * * * ** ***
CAE.BRI. ATT
SCH.POM. GTT
**
Mean pairwise ID: 39.61%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA
** ** **
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA
* ** * ** * ** ** ** * * * * ** *** ** *
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
LYC.ES_L GTTGGATCACGTGG----CTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
* ** ** * ** **** *** * * * * * * * *** * * ***
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* ** ** *** * * **** ** *** **** * ********* **
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTT----GTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTT
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
*** ** * * * * * * * ** *** * ** ** *
CAE.BRI. GTCATT--
LYC.ES_L ACCACTTT
** *
Mean pairwise ID: 39.67%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
ZEA.MA_H ---NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGAT
** * * *** ** * * * ** * ** * ***
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAG--CTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
ZEA.MA_H GTCAATTGTGGTGCA-TGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA
** * * * ** * ** * ** ** *** * ** * **
DRO.MEL. GCT-TGCCATCAATAT-GGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCT-TTGCATCCCAAC--ACTAAAGTG
* * * * * * ** **** *** * * * * **** * **** * *
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGG
* * * * *** ** * ****** * * **** ** ** *
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTAT--------GCTATAGGCCCAAT-------------------
***** * ** * * *** ******
DRO.MEL. TCTTT
ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 39.67%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAA-TGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * * * **** *** ****
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC
* * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * *
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * *
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA---CCGGGTCTTGGGCAGTGC---GAT
* * **** *** ** * ** * ** * * ** *** ***
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA
SCH.POM. AGCGA--TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATA----AACACAACGGTCG
* *** ** *** * * * *** ** * * ** *** *
LYC.ES_B CTTTT
SCH.POM. TT---
*
Mean pairwise ID: 39.67%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTG-GTAAATCGTCTTCTTGTTGTGC-G
** ** * *** * * **** * *** * ** ** *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
YAR.LI_A TTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG---GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTT
* * * * * **** * ** ** ** *** ** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
YAR.LI_A GAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGA
* *** * ** * ** * * * * * * **** * ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_A AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCG
* * ** *** * **** ** * * * ** * ** ****
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGA-ATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
YAR.LI_A CAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT---------------
* * * **** **** * * ** ** * *** * **
LYC.ES_C CATTT
YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 39.68%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTT
* ** *** ** *** ** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT
** ** * * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * **
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTC--CTAGAGTGGAGG
SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGT-CTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA
** ** * ** * * * ** ** ** ** * * ** * *
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
SCH.POM. GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCGG--GTCTTGGGCAGTGCGATA
* * * **** *** ** * ** * ****** * * ******* *
HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGC-TGACTCTTAATAGGAC
SCH.POM. GCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT-----
* *** ** * ** **** ** * ** * *
HUM.LU_A CATTTCTTTT
SCH.POM. ----------
Mean pairwise ID: 39.68%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGG-GCATTAAGGTGGTGTGGATGT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGA
***** * * **** * ** ** ** *** * *
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
YAR.LI_B GTTCTG---GACTCTGCAC-TGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATG
* *** ** **** * ****** * *** ** *** * ** * * *
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
YAR.LI_B GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTT---CCGTTCTAAGATT-AACTGGGAT
** ** * * * ** * ** * ** * ** ** *
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
YAR.LI_B ACTTCA-GTGGAGC-AATCCAGCAGAGATCCAGTTGC---CGTGGGTATGGCGGTGGGAT
* * *** ** ***** * * * * * * ********
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCAT----TGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-----------
**** * * ** ** *** * ** ** ***
ZEA.MA_F CACCATCTTT
YAR.LI_B ----------
Mean pairwise ID: 39.68%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA
** ** **
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA
** * ** * ** * * *** * ** *** ** *
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
* ** **** * ** * * **** **** * * * * * *** * * ***
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** * * * * * **** ** *** **** * ********* **
CAE.EL_B ACTGCGCTTGTGAGTTGA-CACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTC-------AGACC
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
* ** * * * * * * ** * * * ** * ** * * ***
CAE.EL_B ACTTGTTTTT
LYC.ES_L ACCACTTT--
** ***
Mean pairwise ID: 39.72%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
YAR.LI_B -----AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAG
*** * * **** * * * * ** * ** ** *
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTG-CGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGC
YAR.LI_B TTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGT
* * * * ** * * * *** ** * * ** * ** ** *
LEP.COL. CTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC
YAR.LI_B CTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTG
*** * ** * * * * * ** * * ** * * * * **
LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG-AACCACACCGCGG
YAR.LI_B GAGCAATCCA-GCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGG
** * * * ** *** * ** ** ** ** ** * * *** * **
LEP.COL. AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
YAR.LI_B TATATGTTATGGAAGGTATTT---GCAATC--ACGACTCTC-
*** ** * ** *** ** **
Mean pairwise ID: 39.73%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
YAR.LI_A ---------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTG
** * * ** *** * * * * *** *
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG----TCGGA
YAR.LI_A TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGC
** * * **** * * ** *** * ** *** * * ** *
LEP.COL. GGCCTCCGGGTGCCCC--CTTGCAGAAGGGGCGC-GCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAAC
YAR.LI_A GGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTA--AGATTAAC
** *** * * * ** ** *** * ****** * *** ***
LEP.COL. TGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACAC
YAR.LI_A TGGGAAA---CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG--GTATGGCGG
**** * * ** ****** *** * * ****** * * * *
LEP.COL. CGCGGAGCCTGTCA--TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT---
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT
* * * ** * * * * *** * * *
Mean pairwise ID: 39.74%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGTCTTCTTGTTGTGC--
** ** *** ** * * * **** * ** * ** *
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
YAR.LI_A GTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT----TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG
***** ** * ** ** * ** *** *** * ** ** ** ** *
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
YAR.LI_A TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* * ** * * **** * * * ** ****** * **
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
YAR.LI_A GAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCGGTGGG
** * * ** *** * ***** ** * * ** *** * * ** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------
*** * ** * * * * ****
ARA.TH_A CCATTTT
YAR.LI_A -------
Mean pairwise ID: 39.74%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
YAR.LI_A -----------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTT
*** * ****** * * * **** **** * * * * *
HUM.LU_C CAAC-CCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC----
YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT---TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
* * * *** * * ** ** * ** ** ** **** *
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAA-GGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG
YAR.LI_A CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
*** * ***** * *** * * **** * * * *** * *
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACCTCCCGCT--CTCGGCAGTGGA
YAR.LI_A GGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG
* * * * ** *** * ***** ** * * * *** *** ****
HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG
YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------
* *** *** ** * * * * * * * *
HUM.LU_C ACCATTTCTTTT
YAR.LI_A ------------
Mean pairwise ID: 39.74%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG---GAG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCAATAAGGTAGTGTGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** ** *
CAN.SPE. GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGT-GCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCC
** *** * ** * ** * ***** * * * * * ** *
CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
ZEA.MA_H AAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTG
***** * * * ** * ** * ** * * *** * *
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTG
* * * * *** ** * ** * * * * ** * *** ***
CAN.SPE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
ZEA.MA_H GAAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------
* * * * ** * ** ** ** *
CAN.SPE. CT
ZEA.MA_H --
Mean pairwise ID: 39.80%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GCCTTC
***** * ** * **** * * * * *
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
*** * ********* ** * ** ** ** * * ***** * *
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT-
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
* * * * * * * * *** ** * * ** ****
Mean pairwise ID: 39.80%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G
* * * * ***** * * ** * ** * * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
* ***** * * *** ** * * * ** ** **** * *
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
LEI.MAJ. GTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG----TTGAAGCGAGG-GAA
* ** * * * ** * * *** * * ***** ** * *
LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACG-TCCGCCGTTGCAGAATC
*** * **** ** ** ****** ** * * * * * ** ** * ** **
LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-----
* *** * * * * *** * * * * * *
LYC.ES_K CTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 39.80%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGG--CATTGAGGCGGTGTGGATGC
YAR.LI_A -----CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTC
*** ** ** * * * **** * * * **** * *
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
YAR.LI_A GAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGT-TGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG
* ** * * * *** * * ** * * **** * * * ** * * *
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC
YAR.LI_A GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTC-CGTTCTAAGA--TTAACTGG--GAA
** ** *** ** ** * *** * **** ** **** *** *
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
YAR.LI_A ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT----ATGGCGGTGGGATC
** * * * * ***** * * * * * * ** ** ****
TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCAT
YAR.LI_A GCAACCAAGTGGTATATG------TTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------
** * ** *** * *** * * **
TRI.AE_B CTTT
YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 39.87%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
SCH.POM. --------------------------------CGCTGTAATGGCT--TGGTCGAAGTGTT
**** * * ** * ** * * *
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
SCH.POM. TAGTACTCCCAA-TAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCT
* ** * ** *** * * *** *** * ** * *
DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTC--CGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG
SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGT-TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGG--CAGTTAAACCGTG
* * * * ** * *** **** ******* * * *** * *
DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG
SCH.POM. TAGTACCGA--TGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCG
* **** * *** ** ** ** * * ** * * ** * **** *
DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCTT
SCH.POM. ATAGCG--ATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCA-TGGAAGTATAAACACAACGGTCGT
****** ** * ** ** * ** ** * ** ** ** *
DRO.MEL. T
SCH.POM. T
*
Mean pairwise ID: 39.87%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
**** * *** **********
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCGGA
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
******* * * **** ******* * ** ** * * *** ***** *
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
TRI.AE_C CACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** ***************** ********** ** ****** *** ***********
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------
TRI.AE_C TAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCAT
*** * * **** ** * ** *
ZEA.MA_H -
TRI.AE_C C
Mean pairwise ID: 39.87%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
SCH.POM. ----------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGA
** * * * *** *
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGA--CCGAGCGTCCGTGCCAA
SCH.POM. AGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGA
**** * * ** * * * *** **** ** * * *
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG
SCH.POM. TCCCTCGATCTGCC----ACGTCTGTTCGAAGAG---TAGTCTTCGTGGCAACTGGCA-G
* ** ** * * * **** ***** **** * *** ** *
CAE.EL_C GTGGATGGTTCAGGACCGA--AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-GCGGTGCAGTGGCC
SCH.POM. TTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGC
* * ** ** ***** **** * * **** ** * * * * * *** *
CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCA-ATACCTTCAGAC-CACTT
SCH.POM. AG--TGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG
* *** * * ** ** * * * *** * ** * * * ** **
CAE.EL_C GTCACT
SCH.POM. GTCGTT
*** *
Mean pairwise ID: 39.94%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA----ATCGTCTTCTTGTTGTG
** * * * ** * * * ** ** * ** * * * ***
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGC-CTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
YAR.LI_A CGTT--CGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCAT----TTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
* ** * ***** *** **** * *** * *** *** *
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
YAR.LI_A CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
* * *** * ** * * * * ** * ** * ** *
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CGCTTCCAACGGTGGG
YAR.LI_A GGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG
* * * ** *** * ***** **** * * *** * * *******
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCA
YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGG--AAGATATTTACGATCACGATT----------
* *** * * ** * * ** * ** * ***
ZEA.MA_F CCATCTTT
YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 39.94%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
LYC.ES_D ----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
* ********** ******
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
*** * ** ** * * ******** * **** ** **
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * ********
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA
LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA
**** ** * ** ** * *** ***** ** * ****
ZEA.MA_C CCATTTTT
LYC.ES_D CCACTTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 40.00%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
YAR.LI_A -------------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAG-TGGTAAATCGTCT
** * * *** *** *** *** * ** * *
HUM.LU_B CAGCCCAGTG-GATCGGGTCCAGTGTT----AGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
YAR.LI_A TCTTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT
*** * *** *** * * * * ** * * * ** ** **** *
HUM.LU_B ----CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAA-GGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT
YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
*** * ***** * *** * * *** * * * * ** *** *
HUM.LU_B GGAGGGCAA--TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAG
YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGT--GGGTATGGCGG
** ** * * * * ***** * * ** * *** *
HUM.LU_B TGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAAT
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTA-TATGTTATGGAAGATATTTAC-GATCACGATT------
*** * *** *** ** * * * ** ** ** * ** ** *
HUM.LU_B CGGACCATTTCCTTT
YAR.LI_A ---------------
Mean pairwise ID: 40.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTG---GTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGT
** * ***** *** * ** * ** *** ***
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGA--GCGTCCGTGCCAA
SCH.POM. TCGGTGGTCTCGGGTTC-GAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAA
* * * ** * * ** * * ** * * **** * **** ** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGG-GTGCATAAGGAGT
SCH.POM. GAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTT--AAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAAC
* * * * * * ** ** ** **** *** * * * *
CAE.EL_A CGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAG-CAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC
SCH.POM. AATGCACA--TCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCA
** * *** **** * * *** * * ***** * * * * **
CAE.EL_A GGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTAT
SCH.POM. GGAT-GTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT-------------------------
*** * ** ** *** * ***** * *
CAE.EL_A CATTT
SCH.POM. -----
Mean pairwise ID: 40.00%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** ** * ** *** **** **** ** *** ** **** *
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGC-CTGGG-TCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG
* ** ** * * ***** * ****** * * * * * ** * ***
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG
** * * * ** * ** * ** * * *** * ** *
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA
* * *** ** * ** * * * * ** * *** **** *
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------
* * ** * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 40.00%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGCCTTCT
***** * ** * **** * * * ** *
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_B TG-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
* *** * ********* ** * ** ** ** * * ***** * *
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC
* * * * * * * * *** ** * * * * ***
Mean pairwise ID: 40.00%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_D ----------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTC
* * ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_D CAAGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC
**** * *** ** * *** *** * * ***** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_D TAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT
***** ** * ** ** ********************** ** ** ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACC-TTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTC
LYC.ES_D GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC
* ************ ** * ** * * * * * * * * ** ***
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_D CA-ACTAAACCACCACTTTT
* * * ******* ***
Mean pairwise ID: 40.07%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGTCTTCTTGTTGTGC--
** ** *** ** * * * **** * ** * ** *
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
YAR.LI_A GTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT----TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG
***** ** * ** ** * ** *** *** * ** ** ** ** *
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGA--AGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
YAR.LI_A TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* * ** * * **** * * *** * ****** * **
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
YAR.LI_A GAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCGGTGGG
** * * ** *** * ***** ** * * ** *** * * ** **
ARA.TH_F ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------
*** * ** * * * * ****
ARA.TH_F CCATTTT
YAR.LI_A -------
Mean pairwise ID: 40.07%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * * *
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGT-TGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** *** * *** *** * ** * *** *
CAE.EL_A GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
*** * * * * * * * ** ** ** * *** * * *
CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTCGAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** * *
CAE.EL_A CGCGCTTGTGAGT-TGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT
TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------
* * * *** * ** * ** ** * * ** *
CAE.EL_A TT
TRY.BR_A --
Mean pairwise ID: 40.13%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGG-GGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTT
*** * *** * * * ****** * * ** * ***
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
YAR.LI_A CGA---GTCTTGGGCTCTGCACTTG----GCCA----TTTGGT-TGTCCTTTCCGAATTC
* ***** ** **** ** * * *** ** *** *** * *
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
YAR.LI_A TGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * * * * ** * ** ** * * * *** *
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAG---AGCAACGA-CTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGG
*** * * ** ** **** ** * *** *** * ** * ** *
LYC.ES_F GATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACC
YAR.LI_A GATCGCAACCAAGTGGTATAT--GTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------
**** * * **** * * * ** * * * * * * * *
LYC.ES_F ATCACTTTT
YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 40.13%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
**
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGT-GCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTT
LYC.ES_L GGGT-TGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC-
* ** ** ** ***** ** * * * * *** * *** ******
ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC---AACACTAAAGTGGCG
LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* *** ** * * ** * * ****** ** * * * ********* *
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* ************* **** ****** *** * * **** ** *******
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC
***** * *** * * * *** *
ZEA.MA_H ---------
LYC.ES_L CACCACTTT
Mean pairwise ID: 40.13%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATC-CAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
******* ** * * **** * * * *
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
YAR.LI_B G-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACT---CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT
* *** * ********* ** *** ** * * * ***** * * *
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA--
** * ** ** * * *** * ** ** * * **
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * ** ** * * *** ***
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
* * * * * *** * * ** * * * *** ***
Mean pairwise ID: 40.19%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_D -----------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAG
* * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
LYC.ES_D CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
*** * *** * * **** * **** *** * *** *****
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** * ******************** ** ** ** *** * **** *
ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAAA
LYC.ES_D GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA
****** * * ** ** * * * * * * * ** * * * * ** ***
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
LYC.ES_D CCACCACTTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 40.20%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
SCH.POM. ----------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGA
** * * * *** *
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGA--CCGAGCGTCCGTGCCAA
SCH.POM. AGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGA
**** * * ** * * * *** **** ** * * *
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG
SCH.POM. TCCCTCGATCTGCC----ACGTCTGTTCGAAGAG---TAGTCTTCGTGGCAACTGGCA-G
* ** ** * * * **** ***** **** * *** ** *
CAE.EL_B GTGGATGGTTCAGGACCGA--AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-GCGGTGCAGTGGCC
SCH.POM. TTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGC
* * ** ** ***** **** * * **** ** * * * * * *** *
CAE.EL_B GGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCA-ATACCTTCAGAC-CACTT
SCH.POM. AG--TGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG
* **** * * ** ** * * * *** * ** * * * ** **
CAE.EL_B GTTTTT
SCH.POM. GTCGTT
** **
Mean pairwise ID: 40.20%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG
LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* *********** ******
TRI.AE_B GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGGC
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
*** ** * * *** **** * * ***** * *** * ** *
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
*** * * ******* ************ ** ** ** ***** * **********
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCACC
LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACC
** ** ** ** ** **** * ** * * * ******
TRI.AE_B ATCTTT
LYC.ES_D ACTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 40.20%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GCCTTC
***** * ** * **** * * * * *
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACT---CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
*** * ********* ** *** ** ** * * ***** * *
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATT-TCCGTTCTAAGA
*** ** ** * * *** * * ** ** * *
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGC-GAGACCCCGTCTCT
YAR.LI_B GTGGGATAGCAA-----CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCT
* * * * ** * * * * ** ** ** * * * ** ****
HOM.SA_A T
YAR.LI_B C
Mean pairwise ID: 40.26%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT
** * * * ** * * * *** ** * * ** * *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTG---CACT-TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
**** * * * ***** * * * ** ** * ***** * *** ***
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * * *** * * * ** ****** * *** * * * *
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCTTCCAACGGTG
YAR.LI_A TGGGA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG
** * * * ** *** * ***** **** **** * * *****
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAAC--TCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
YAR.LI_A GGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT----------
*** *** * * * * * * * * * **
ZEA.MA_G GACCACCATCTTT
YAR.LI_A -------------
Mean pairwise ID: 40.26%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT
** * * * ** * * * *** ** * * * ** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATT-TGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
**** * * *** ** ** ** * * * * * * * * * * ** *
ZEA.MA_B GGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAGG
YAR.LI_A GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* * ** * * ** ** * * ** * * * * * * * * **
ZEA.MA_B AATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CACTTCCAACGGTGGGA
YAR.LI_A GA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA
* * * ** *** * ***** **** * * *** * ********
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
YAR.LI_A TCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTAC---GATCACGATT----------
*** * * * * ** * * * ** **** *
ZEA.MA_B CCATCTTT
YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 40.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC-GTCTTCT
* ***** * ** * **** * * * * * * *
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
YAR.LI_A TG-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTC---TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
* *** ** **** ****** *** ** *** ** **** * *
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTG-ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA
* ** **** * * * * * * * * *
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
YAR.LI_A TTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * ** *** * *
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGA-GACCCTGTCTCC
YAR.LI_A TGGGATC-----GCAACCAA-GTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--
* * * * *** * * ** * * ** *** * ** * * *
Mean pairwise ID: 40.33%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
YAR.LI_B ---------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG
****** * * * **** * ** * * * * *
HUM.JA_A AGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAG-CTGCTT-GCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGA
YAR.LI_B TGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGC-GG
** * ** ** * * * * ** *** * ** ** ** ** *
HUM.JA_A GAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAA-GGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
YAR.LI_B TTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC-TAAGATTAACTGG
* ***** * **** * * **** * * * ** *** * *
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
YAR.LI_B GATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGAT
** * * ** *** * ***** ** * * * * * ** ****
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT
YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATG-----TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------
* * *** ** ** **** * **** ** *
HUM.JA_A CTTTT
YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 40.37%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG
LYC.ES_L -GTTGGGTTGAC-CCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCA
* ** ** * * * * * * * * *** * ** ** * * **
YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG
LYC.ES_L AGCATGGAGTTGGATCAC---GTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAA
* * *** ** ** * ** ** * ***** * * **
YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA
LYC.ES_L GTGGGGTGGACTGCGT-GAGGCTGGT-TTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCT----CT
* ** * ** * *** * *** *** *** * * * * *
YAR.LI_B ATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATG
LYC.ES_L GTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGA-GTCCAGTTAACGCCCTG--ATGGG
* *** ** * * * * *** * *** ** ** *
YAR.LI_B TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
LYC.ES_L CTGCTCCAACTA-----AACCACCACTTT-
* * ** ** *** *** *
Mean pairwise ID: 40.38%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
YAR.LI_B ----------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTT
****** * * * **** **** * * * * *
HUM.LU_C CAAC-CCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC----
YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGC---TACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
* * * * ** * * ** * *** * ** ** **** *
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAA-GGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG
YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT
*** * ***** * *** * * **** * * * *** * *
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACCTCCCGCT--CTCGGCAGTGGA
YAR.LI_B GGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG
* ** * * ** *** * ***** ** * * * *** *** ****
HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG
YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA---CGACTCTC------
* *** *** ** * * * * *** ******
HUM.LU_C ACCATTTCTTTT
YAR.LI_B ------------
Mean pairwise ID: 40.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAAC--CTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG
SCH.POM. -------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAG-TACTCCCAATA
***** ** * * * ** ** * * **
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
SCH.POM. GTGCATGTTCGGT---GGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCAC
* * ** * * ** * *** * * * * * * * * * * * ***
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
SCH.POM. GTCTGTT-CGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAA---CTGG---CAGTTAAACC--GTGTAGTA
** *** * ** * *** * ** **** *** *** * * *
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
SCH.POM. CCGATGG----AGGTTGGA--AACAATGCAC--ATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA
**** *** *** *** *** ****** * * * * *** **
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
SCH.POM. TAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGG----AAGTATAAACACAACGGTCGT
* ** * * * *** * * ** ** * * * * * *
ZEA.MA_F CATCTTT
SCH.POM. T------
Mean pairwise ID: 40.40%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * * *
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** ** * *** *** * ** * *** *
CAE.EL_D GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
*** * * * * * * * ** ** ** * *** * * *
CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTGCAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** ** * *
CAE.EL_D CGCGCTTGTAAGT-TGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT
TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-----
* * * ** * ** * * ** * * ** * **
CAE.EL_D TT
TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 40.45%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
YAR.LI_A ----------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTG
* * * ****** * * * **** **** * * * ***
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAG-A
YAR.LI_A TGCGT-TCGAGTCTTGGGCTCTGC-ACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
** * * ** * ** * ** * ** ** ** **** * *
HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAG-GTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA
YAR.LI_A GTTGA--TGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTG--AGATTTCCGTTCTAAGATTAA
***** ** * * *** * ** ***** * ** * * ** **
HUM.JA_B -TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACCTCCCGCTCTCGGCA--GTGGAAGG
YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG
** * * ** ** **** ** * ** ** * ** * * ** **
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC
YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------
** * * *** * ** ** ** ** *
HUM.JA_B ATTTCTTTT
YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 40.47%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGTCTTCT
* ***** * ** * **** * * * ** *
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_A TG-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
* *** * **** ****** * ** ** *** * ** ***** * *
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_A T-AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATT-TACGATCACGATT--
* * * * * * * * *** * ** ** * * *
Mean pairwise ID: 40.47%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGG-GCAATAAGGTAGTGTGGATGT
*** ** * ** *** **** **** ** *** * * * *** * *
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
ZEA.MA_H CAATTGTGGT-GCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG
* *** * ** * ** * ****** * * * *** ** * ***
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG
** * * * ** * ** * ** * * *** * ** *
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA
* * *** ** * ** * * * * ** * *** **** *
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------
* * ** * ** ** ** * *
Mean pairwise ID: 40.51%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
* *
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGG-TGTCCGTACTAAG
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTT---GGGTTCGGTAGGCT-TATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG
* **** * *** ** *** * * ** * * * ** ** ** * ***
FUG.RUB. TTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * * * * *** * ** ** ** * * * * ***** * **
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** * * *** ** ** **** * *** *** * * **** *
FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTT--CAACCTGAGTAACA----CAGCGGG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** ** * **** * ***** * ** *
FUG.RUB. ACTCAGTCTTT
LYC.ES_L ACCACCACTTT
** ****
Mean pairwise ID: 40.52%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** *** * * ** ***** *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
YAR.LI_B TG-CGTTCGAGTTCTG--GACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
* ** ** ** * * * * ******* ** * * ** **** * **
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
YAR.LI_B CTGCGGTT-GATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * * * * *** * ** ** * * *** * *
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
YAR.LI_B AACTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAA--TCCAGCAGA-GATCCAGTTGCCGTGGGTA
** * ** * ** ***** **** * * ** * * * * *
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTG-GACCAT
YAR.LI_B TGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCT
* *** * * * ** **** * * * * ** *** *
ARA.TH_C CACTTT
YAR.LI_B C-----
*
Mean pairwise ID: 40.58%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC
* * ** * * *** * * *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG-T
SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGG--TGGTCTCG----GGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT
** * * ** *** **** * ** ** * * * ***** * *
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG-GCA
SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGA-----AGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA
* ***** * ** * * *** * * * * ** * ** * *
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
SCH.POM. GTACCGATG-GAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA
* * * * *** *** *** *** ****** * * * *** **
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
SCH.POM. ---TAGCGATGGGATTCACCTT---CGCAGGATGTGCATGGAAG---TATAAACA--CAA
** * * * * *** ** * ** * * ** * * * ** * *
ZEA.MA_B CCATCTTT
SCH.POM. CGGTCGTT
* ** **
Mean pairwise ID: 40.59%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
YAR.LI_B TGCGTTC---GAGTTCTGGACTC--TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT
** ** ** *** ** ** ** * * ** ** *** *** * *
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
YAR.LI_B GCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * * *** * * * * * ** ***** **** * * * *
LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_B CTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG----GGTATGGCGG
* * * * ** *** * * * *** ** * *
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
YAR.LI_B TGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACTCTC
**** * * **** ** * *** * **** * * ** *
LYC.ES_A TTT
YAR.LI_B ---
Mean pairwise ID: 40.66%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAA-TGTGGTGGAATGTT
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG--
* * * ******* *** * * * * ** *
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LEI.MAJ. GACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC
* ** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LEI.MAJ. GGTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAA
* *** * ** *** * * *** * *** * * * * *
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTC-TAAGCGGTGGAAGGAT
LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAAT
* ** **** ** ** ***** * * *** * * ** ** * ** **
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA
LEI.MAJ. CACACCGCGGAGCA---TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCG---TCGCGAAGCCTT--
** *** * ** ** * *** * * * * ** **
LYC.ES_B CTTTT
LEI.MAJ. -----
Mean pairwise ID: 40.67%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGCCTTCT
***** * ** * **** * * * * * *
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_B TG-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
* *** ** ********* ** * ** ** ** * * ***** * *
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT-
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC
* * * * * * * * ** ** * * * ** ****
Mean pairwise ID: 40.71%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** **
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAG
LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAA
******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * * * ** *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT-
LYC.ES_D ACCACCACTTTT
******* **
Mean pairwise ID: 40.71%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC
* * ** * * *** * * * *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGG--GCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGA---------GTCTCGCTTTCGATCCCTC
** * * ** * * *** *** * * **** * **
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGA------AGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCG
* * ***** * * ** * * *** * * * * * * **
ZEA.MA_A -GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
SCH.POM. TGTAGTACCGATG-GAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTG--GGCA
* ** * * * *** *** *** *** ****** *** ** **
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA
SCH.POM. GTGCGATAGCGATGG-GATTCACCTT--------CGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAAC
* **** *** * * * *** ** * **** * * * * ** *
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
SCH.POM. ACAACGGTCGTT
** ** ** **
Mean pairwise ID: 40.71%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT
** * * * ** * * * *** ** * * ** * *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTG---CACT-TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
**** * * * ***** * * * ** ** * ***** * *** ***
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * * *** * * * ** ****** * *** * * * *
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CGCTTCCAACGGTG
YAR.LI_A TGGGA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG
** * * * ** *** * ***** **** * * *** * * *****
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAAC--TCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
YAR.LI_A GGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT----------
*** *** * * * * * * * * * **
ZEA.MA_D GACCACCATCTT
YAR.LI_A ------------
Mean pairwise ID: 40.73%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** * *** * * * * *** *** * *****
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** ******* * * * *** *** *** * * *
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * ** *** * ** **** * * *
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
YAR.LI_A TGGGAAAC-----TTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGC
** * * ** ****** ** * ** * * * * ** *
LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT
YAR.LI_A -----GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-
**** ** * * *** ** * * * * *** ***
LYC.ES_I TT
YAR.LI_A --
Mean pairwise ID: 40.73%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * * ***** *** * *****
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** ******* * * * *** *** *** * * *
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * ** *** * ** **** * * *
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
YAR.LI_A TGGGAAAC-----TTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGC
** * * ** ****** ** * ** * * * * ** *
LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT
YAR.LI_A -----GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-
**** ** * * *** ** * * * * *** ***
LYC.ES_N TT
YAR.LI_A --
Mean pairwise ID: 40.79%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGG--CATGTGGGAGATGGGACTTTGGG
YAR.LI_A --CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAG
* **** *** * * * ***** * * * * ** * ** * *
HUM.JA_A TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAG
YAR.LI_A TC------TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCC-TTTCCGAATTCTG---CGGT
** **** * * * * ** *** * * * **** **
HUM.JA_A AGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAA-GGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCA
YAR.LI_A TGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC-TAAGATTAACTGGG
* ***** * **** * * **** * * * ** *** * *
HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
YAR.LI_A AAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATC
* * * ** *** * ***** ** * * * * * ** ****
HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
YAR.LI_A GCAACCAAGTGGTATATG-----TTATGGAAGATATTTACGATCACGATT----------
* *** ** ** **** * * * ** **
HUM.JA_A TTTT
YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 40.80%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
SCH.POM. -------------------CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
***** * * * *** * * ** **
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* * * * ** *** * *** * * * **** * * * * *
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA--------
* * * * ** ** * * ** * * * * **
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** *** ** *** * * * **** **
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT
* *** ** ** * ** *** * * * *** * * * *** *
Mean pairwise ID: 40.84%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC
* * ** * * *** * * * **
ZEA.MA_G TTGCGATG---GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG--C
** * * *** * **** *** ** ** * * * * * *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
SCH.POM. CACGTCTGT----TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACT---GGCAGTTAAACCGTGTAGT
** ** ** * * * ** * ** * ** * * * * * ** ***
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
SCH.POM. ACCG---ATGG----AGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTG--GGCA
* **** *** *** *** *** ****** ** * * **
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
SCH.POM. GTGCGATAGCGATGGGATTCACCTT---CGCAGGATGTGCATGGA-----AGTATAAACA
* **** ** * * *** * * ** ** ** * ** * *
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
SCH.POM. CAACGGTCGTT
* ** ** **
Mean pairwise ID: 40.85%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
** ****** ****** **
ARA.TH_F TG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* *** * * * * * ***** * * *** * *** * * ** **
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
TRI.AE_C CACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* ***************************** *** ******* ** * ***** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
TRI.AE_C TAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG---ACCAC
* **** * * ** ** ***** * * * ** *****
ARA.TH_F CATTTT
TRI.AE_C CATC--
***
Mean pairwise ID: 40.89%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT
** * * * ** * * * *** ** * * ** * *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTG---CACT-TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
**** * * * ***** * * * ** ** * ***** * *** ***
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * * *** * * * ** ****** * *** * * * *
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCCG-GCTTCCAACGGTG
YAR.LI_A TGGGA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG
** * * * ** *** * ***** **** * * **** * * *****
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAAC--TCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
YAR.LI_A GGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT----------
*** *** * * * * * * * * * **
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
YAR.LI_A -------------
Mean pairwise ID: 40.91%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
** ****** ****** **
ARA.TH_A TG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCA
* *** * * * * * ***** * **** * * * ** ** **
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
** * ***************************** *** ******* ** * ***** *
ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG---ACC
*** **** * * ** ** ***** * * * ** ***
ARA.TH_A ACCATTTT
TRI.AE_C ACCATC--
*****
Mean pairwise ID: 40.93%
TRY.BR_B AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCT-TCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCT
*** * * * **** * * * ** ** * * *** ** *
TRY.BR_B GGAC---AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCT-TGGTTGCGTGTCGGT
YAR.LI_B GGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCG
**** * *** * ** * ** * * ****** * * ** * ***
TRY.BR_B GTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAG
YAR.LI_B GTCTGAGTAATCGGCTTTGAGA------TTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAG
** ** * * **** * ** * * * * ** * ****
TRY.BR_B GCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA
YAR.LI_B TGGAGCAATCCAGCAGAG-ATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGT
* * ***** * * * *** * ** * * * * * * *
TRY.BR_B TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
YAR.LI_B GGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---
* * ** * ** ** *** *
Mean pairwise ID: 40.97%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
LYC.ES_L -----------------------------------------------------GTTGGGT
* ***
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
LYC.ES_L TGA--CCCAGATG-GTTGGGT--TCGGTAGGCTTATAGTC-TGGCCTGCCCTCTCCAAGC
*** * *** ** ** * *** ** * ** * ** * * ****
DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGA-GGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG
** * *** * * * * * * *** * * * * **** * ***
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
** ** * * *** *** * **** * ** ** * *** * ***** * *
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTG----GACTGCCGTTATCAGCCCAA----CCGATATGGTTGGAC
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC
**** ** * * * ** * * **** * ** * * * * * **
DRO.MEL. CACAATCTTT
LYC.ES_L CACCACTTT-
*** * **
Mean pairwise ID: 40.98%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
** ** *** * * ** ***** *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
YAR.LI_A TG-CGTTCGAGTCTTG--GGCTCTGCACTTGGCCAT---TTGGTTGTCCTTTCCGAATTC
* ** ** * * ** * * * *** ** *** ** * * ** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
YAR.LI_A TGCGGTTGATG--GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* ***** * * * *** * ** ** * * *** * *
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATC-----CAGTTGCCGTGGGTATGG
** * * * ** ** **** * * * *** ** ** * *
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC
YAR.LI_A CGGTGGG--ATCGCAA-CCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATC--ACGATT
*** ** ** ** ** **** * * **** ** **
ARA.TH_C ACTTT
YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 40.98%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
TRY.BR_A ---------------AGC--CGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTG-ATCCCG
*** * * ** ***** * * * * * ** *
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTA---GCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
TRY.BR_A CTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG
** **** * ** * * ** * ****** ** * *
DRO.MEL. A--GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGT-TGGCTAAGG
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG----AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG
** ** * * ** **** * *** *** *** * * *** *
DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
TRY.BR_A TGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA----CCTTGCGCACGTTCCCGT
*** **** *** **** * * ******* * * * * *
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA
TRY.BR_A TCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
* * *** **** * * * * * * ** * * * * ** * *
DRO.MEL. TCTTT
TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 40.98%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTG---GTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGT
** * ***** *** * ** * ** *** ***
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGA--GCGTCCGTGCCAA
SCH.POM. TCGGTGGTCTCGGGTTC-GAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAA
* * * ** * * ** * * * * * **** * **** ** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGG-GTGCATAAGGAGT
SCH.POM. GAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTT--AAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAAC
* * * * * * ** ** ** **** *** * * * *
CAE.EL_D CGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAG-CAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC
SCH.POM. AATGCACA--TCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCA
** * *** **** * * *** * * ***** * * * * **
CAE.EL_D GGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTAT
SCH.POM. GGAT-GTGCATGGAAGTATAAACACA---ACGGTCGTT----------------------
*** * ** ** **** * ***** ** * * *
CAE.EL_D CATTT
SCH.POM. -----
Mean pairwise ID: 40.98%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** ***** ****** * **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * *
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************ ************ ** * ****** * ***********
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCAT
* *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** ***
LYC.ES_H CTTTT
TRI.AE_C C----
*
Mean pairwise ID: 41.00%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * * *
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** *
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * **
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** * *
CAE.EL_B TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT
TRY.BR_A CACACCGAGGAGC--ATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
* * *** * ** ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 41.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** **
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAG
LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAA
******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * * * ** *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
LYC.ES_D ACCACCACTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 41.03%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
YAR.LI_B ---------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG
****** * * * **** **** * * * ***
HUM.JA_B GGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAG-
YAR.LI_B TGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGC---TACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGC
** * ** *** * * * * * ** * ** ** **** * *
HUM.JA_B AGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAG-GTCTGGCTTGGTCAGCTCC----TAAAGCGGAG
YAR.LI_B GGTTGA--TGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
***** ** * * *** * ** ***** * * *** *** *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCA--GTGGA
YAR.LI_B TGGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGAT--CCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGT
* ** * * ** *** * ***** ** ** ** * ** * * **
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
YAR.LI_B GGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------
***** * *** * ** ** * ******
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
YAR.LI_B ------------
Mean pairwise ID: 41.04%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAA-TGTT
SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT
* * ** **** *** ****
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT
** * * * * * * ** ** **** * ** * ** ** * *
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC--CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG
** ** * ** ** * * * * * ** **** *** * * * *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAG
** * **** *** ** * ** * **** ** * ** ****** *
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
SCH.POM. CGATGGG---ATTCACCTT----CGCAGGATGTGCATGGAAGTATA---AACACAACGGT
* *** * * * ** * * * * ** ** * ** *** *
LYC.ES_F CACTTTT
SCH.POM. CGTT---
* *
Mean pairwise ID: 41.06%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG---GAG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCAATAAGGTAGTGTGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** ** *
RAT.NOR. GATCGATTG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGC-CTGGGTC-TAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTC
** **** ** ** * * ***** ****** * * * * * ** *
RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
ZEA.MA_H CAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGT
***** * * * ** * ** * ** * * *** *
RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
ZEA.MA_H GGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGT
** * * * *** ** * ** * * * * ** * *** **
RAT.NOR. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCT
ZEA.MA_H GGAAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------
** * * * ** * ** ** ** *
RAT.NOR. CT
ZEA.MA_H --
Mean pairwise ID: 41.08%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGTAA-ATCGCCTTCTTGTTG-TGCG
***** * * **** * *** ** ** * *** * ***
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
YAR.LI_B T----TCGAGTTCTGGACT--CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
* ** ** * * ** * ** * * ******** *** *** *
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCC-GTTCTAAGATTAACTG
* * *** *** ** * * *** ** * ** * * * * * * * *
ZEA.MA_C GAACGGC---GTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
YAR.LI_B GGATACTTCAGTGGAGCAATCCA-GCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT--ATGGCGGTGGG
* * *** ** ** ***** * * * * ** * ******
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAG--CATGGGCT-CGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---------
* **** * * **** ** * ****
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 41.14%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGTCTTCT
* * ***** * ** * **** * * * * * *
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_A TG-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
* *** ** **** ****** * ** ** *** * ** ***** * *
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_A T-AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATT-TACGATCACGATT--
* * * * * * * * ** * ** ** * ** *
Mean pairwise ID: 41.16%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG
* **** * *** * * **** ** * * * ** ** * * ***
RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * **
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** *
RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGGGCAACATAGCGAGA
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** * * ** * * *** ***** * *
RAT.NOR. CCCGTCTCT--
LYC.ES_L ACCACCACTTT
** * **
Mean pairwise ID: 41.16%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
LYC.ES_M -------------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG
** *** * * ***
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCT---CATGTTGACGGAACGTCCGCACT
LYC.ES_M GAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCC
* **** * * * * ** ** * * * * ** ** * ** *
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
LYC.ES_M AAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG
**** * * * * * ** *** *** * * **** * *
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
** * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** *
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA
LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * *
DRO.MEL. CCACAATCTTT
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* ** * ****
Mean pairwise ID: 41.18%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
***** ***** ****** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
LYC.ES_D GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTA-AAGCGGGGCGG
**** ** *** * ** * *** *** *** ** ** ***** *
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** * ******* ********** * *** * *** **** * **********
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACC
* * *** ** * * * * *** ** ** ** * ***** ** **
CIN.HYB. ATTT--
LYC.ES_D ACTTTT
* **
Mean pairwise ID: 41.20%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GCCTTC
***** * ** * **** * * * * *
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTC---TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA
*** ** ********* ** *** ** ** * * ***** * *
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** * *
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG
* *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** ***
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGC-GAGACCCCGTCTCT
YAR.LI_B GTGGGATAGCAA-----CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCT
* * * * ** * * * * ** ** ** * * * ** ****
CAN.SPE. -
YAR.LI_B C
Mean pairwise ID: 41.23%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
** ****** ****** **
ARA.TH_D TG-AGTAATCTGTGTGGGTC--AGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCA
* *** * * **** * * ***** * *** * *** *** ** **
ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
** * ************ **************** *** *** *** ** * ***** *
ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC---GACC
*** * * ** * * ** ** **** * * ** * ****
ARA.TH_D ACCACTTT
TRI.AE_C ACCATC--
****
Mean pairwise ID: 41.25%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
YAR.LI_A TGCGTTC---GAGTCTTGGGCTC--TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
** ** ** ******* ** *** * * * ** *** *** * *
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
YAR.LI_A GCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * * *** * * * * * ** ***** **** * * * *
LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG----GGTATGGCGG
* * * * ** *** * * * *** ** * *
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
YAR.LI_A TGGGATCGCA----ACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT---
**** * * ***** ** * * * * * ** * * *
LYC.ES_A TTT
YAR.LI_A ---
Mean pairwise ID: 41.26%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
ZEA.MA_H ------NCCGAGCTCTGTAGC----GAGTGCTTGT-AACCCGAGCGGGGGCAATAAGG--
* ******** * * * *** * * ******* * **
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT
ZEA.MA_H TAGTGTGGATG-TCAATTGTGGTG-CATG-TGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGAC
** * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** *****
LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGG-GTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGGCC
ZEA.MA_H CACCCATTCCAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATC---CC
*** ** * ** * * * ** * * **** * * ** **
LEI.MAJ. GGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCATG
ZEA.MA_H AACACTAAAGTGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGA-GTACCGCCCG
* ** ** ** ** * * * * * *** * * ** *
LEI.MAJ. TCCGCACTTG-AGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---------
ZEA.MA_H CCACCAGCGGTGGAAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT
* ** * * * * ***** * ** *
Mean pairwise ID: 41.30%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGG--CTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCT
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTC-GAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCAT-GTTCGGTGGTCT
** * * * *** ** * * ** * * ** ** * * ** ****
TRY.BR_A TGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
SCH.POM. CGGGT---TCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTC
** * * ** ** ** * ** * * * * * * * ** * **
TRY.BR_A GAGGTCGCCACTG-TAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGC
SCH.POM. TTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAG-GTTGGAAACAATGCACAT
** ** **** ** * * * * * *** * ** * ** *** **
TRY.BR_A CGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATC
SCH.POM. CACTACCGGG-----TCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTG
* * *** * * ** * ** * * * ** * *
TRY.BR_A TCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
SCH.POM. CATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT---------
*** * * *** *****
Mean pairwise ID: 41.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
* * * * ******* * **** * *** * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
** **** * * *** ** * * * * ** * * * ** *
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAAC
*** * ** ** * * ** *** ** * * *** * **
LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATCA
* ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** ** *
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LEI.MAJ. CACCGCGGAGCATGTCCG----CACTTGAGCCCCACGCTTCGTC---GCGAAGCCTT---
* *** ** * * ** * *** * * ** * ** *
LYC.ES_E ATTTT
LEI.MAJ. -----
Mean pairwise ID: 41.31%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GTCTTC
* * ***** * ** * **** * * * * *
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCT---CTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
*** * **** ****** *** ** *** * ** ***** * *
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCC----TAAGGA
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** ****
HOM.SA_A GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
YAR.LI_A TAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGG
** *** * ** ***** * * * ***** ** * *
HOM.SA_A TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGT
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCA--AGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------
********* * * * * ** * * * * * ** ***
HOM.SA_A CTCTT
YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 41.33%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * *** * * *
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** *
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * **
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGT--TCGAGA
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** **
CAE.EL_C AGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
*** * * * ** ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 41.35%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG--GAT
*** * ** ** * ******** ** * *** ** ** * * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * * * ** ** * * ** * ** ** ** * ***
ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAG
CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTT--AGTCCCGGGTGCA-TAAGG
** ** ** ** *** * ** * *** * ** ** *
ARA.TH_C TGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGT
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA---AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * ** * * * * * ***** * * **** * **
ARA.TH_C GGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTG
CAE.EL_A GGCCGGACCGCGC-TTGTGAGTTGACACACATAC-GCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
** *** ** * * * * ** ** * ** *
ARA.TH_C GACCATCACTTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT-
**** **
Mean pairwise ID: 41.37%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * * * * *
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** * * * * ** ** ** * * * * * ** * ******
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
** * * * *** ****** * * * * *** *** *
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
* * * * * * * ***** * * * **** ******* **
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
CAE.EL_D ACCGCGCTTGTAAGTTGAC-ACACATACACAGCCTTCTCG-ATACCTTCAGACCACTTAT
* ** * * * * ** * * * ** * * * **
HUM.JA_A CTCTTTT
CAE.EL_D CATTT--
* **
Mean pairwise ID: 41.39%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * * *
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGT-TGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** *** * *** *** * ** * *** *
CAE.EL_A GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
*** * * * * * * * ** ** ** * *** * * *
CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTGCAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** ** * *
CAE.EL_A CGCGCTTGTGAGT-TGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT
TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-----
* * * *** * ** * ** ** * * ** * **
CAE.EL_A TT
TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 41.40%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT
***** * * **** * *** ** * * * * *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTG---CACTGGGCTACTTTG-TTGTCCTTTCCGAATTCT
**** * * ****** * * * * ** * ***** * *** ***
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * * *** * * * ** ****** * *** * * * *
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCTTCCAACGGTG
YAR.LI_B TGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG
** ** * * ** *** * ***** **** **** * * *****
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTC---GAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC
YAR.LI_B GGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-------
*** *** * * * * ** * * * ** ***
ZEA.MA_G AGACCACCATCTTT
YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 41.42%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
LYC.ES_L --------------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGA
* ** * **
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
LYC.ES_L TGGTTGGGTTCGGTAG-----GCTTATAGTCTGGCCTGCCC------TCTCCAAGCATGG
* *** * * * ** * * *** * **** *** ** *
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
LYC.ES_L AGTTGGATCACGTGGCTTAGTC---GAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGGGG
* **** * * ** * * ** * ** * * ** ***** * ****
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
** ** * *** ** ** ***** * * ** *** * * **** *
GAL.GAL. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTA-GCC----TGGGCAACAT-AGCGAGAC
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC
*** ** * * *** *** * * *** * *** ***** * * * * **
GAL.GAL. CCTGTCTCC
LYC.ES_L CACCACTTT
* **
Mean pairwise ID: 41.45%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GTCTTC
* ***** * ** * **** * * * * *
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTC---TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA
*** ** **** ****** *** ** *** * ** ***** * *
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCC----TAAGGA
YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
*** ** ** * * *** * * ** ** ** ****
CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
YAR.LI_A TAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGG
** *** * ** ***** * * * ***** ** * *
CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGT
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCA--AGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------
********* * * * * ** * * * * * ** ***
CAN.SPE. CTCT
YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 41.46%
TRY.BR_B ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG-TCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGT
*** * * * **** * * * * * ** * * *** **
TRY.BR_B CTTGGAC-----AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTG-CGTG
YAR.LI_A CTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTC
***** * * ** ** **** * * * * * *** * * ***
TRY.BR_B TCGGTGTTGA-GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACG
YAR.LI_A TCGGTCTGAGTAATCGGCTTTG-AGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTG
***** * *** * ** *** ****** * * *
TRY.BR_B GGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGA
YAR.LI_A GAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTT-GCCGTGGGTATGG---CGGTGGGATCGCA-ACCAA
* ** ** * * *** ** ** * * * ** ** *** *** *
TRY.BR_B GGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
YAR.LI_A GTGGTATAT----GTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------
* * ** * * ** * * ** ***
Mean pairwise ID: 41.46%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT
***** * * **** * *** ** * * * * ** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG--GCTACTTTG------TTGTCCTTTCCGAA
**** * * ****** * *** ** * * ** ** *** ** * ** *
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
YAR.LI_B TT--CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG
** * * ** **** * * ** * ** * * * *
ZEA.MA_A AGGAA-TGGCGTAAGGC--TGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCCG-ACTCCCAACG
YAR.LI_B ATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCG
* ** *** ** * *** * ***** **** ***** **
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGC-TGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAA
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----
****** *** *** * * * ** * * *** **
ZEA.MA_A GCAAACCACCATCTTT
YAR.LI_B ----------------
Mean pairwise ID: 41.46%
PER.AME. GATCCGTAACGCGAGCTTATAACTCGAGCGGGGGCTATAAAGGTGGTGTGGAACGAGCTG
MUS.MU_A -GCCTGTAGTTCCAGCT----ACTCG---GGAGGCTGAGACAGGAGGATCGCTTGAGTCC
* *** * **** ***** ** **** * * * * * ***
PER.AME. ACTCGACCTGCCGGGTTGGGCCAGGGACTGCGGTGCTGGCTCGCCCGTTCCAAGTCGGGT
MUS.MU_A AAGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-----GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTCGGC
* * *** ** * ** ** * * * * * *** * **** **
PER.AME. AGTGGGCCATGTGGCTTGGGCGAAGGCCTGGGTTTCTTGGCC--
MUS.MU_A AACAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAAGTTGC
* *** * * * ** ** * *
Mean pairwise ID: 41.48%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGTCTTCTTGTTGTGC--
** ** * ** * * * **** * ** * ** *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
YAR.LI_A GTTCGAGTCT-----TGGGCTCTGCACTTGGC-CATTT---GGTTGTCCTTTCCGAATTC
***** *** ** **** ***** *** ** ** ** *** * *
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAG-GCTTGGCTCAAACGGCT----TCTAAAGTTGG
YAR.LI_A TGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
** * ** * * ** ** * ** * **** * * ***** **
ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
YAR.LI_A CTGGGAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCGG
** ** * * ** *** * ***** ** * * ** *** * * **
ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------
***** ** ** * * * * ****
ARA.TH_E ACCACCATTTT
YAR.LI_A -----------
Mean pairwise ID: 41.48%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG
* **** * *** * * ** * ** * * * ** ** * * ***
ORI.CUN. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * **
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** *
ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGGGCAACAT-AGCGAG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** * * ** * * *** ***** * * * *
ORI.CUN. ACCCTGTCTCC
LYC.ES_L ACCACCACTTT
*** **
Mean pairwise ID: 41.48%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** **
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ********************** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA
****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * * * ** * *
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
LYC.ES_D CCACCACTTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 41.58%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
* * * * ******* * **** * * * * * *
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * * *
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAAC
*** * ** *** * * *** * *** * * * * *
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTC-TAAGCGGTGGAAGGATAA
LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCC-CACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCA
* ** **** ** ** ***** * * *** * * ** ** * ** ** *
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
LEI.MAJ. CACCGCGGAGCA---TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT----
* *** * ** ** * *** * * * * * * * **
LYC.ES_N TTT
LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 41.61%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACA-ATAAGGTGGTGGAACAGT
LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * * *** *** * *** * ** ** **
ARA.TH_D GGTTCAATTC--CTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGG---TGCTCTGCTTGGCTGTGT
** * * ** * * * **** * ** **** *
ARA.TH_D CTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGC-CCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* *** ** * *** * * ** * * * * * ** ***
ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTA-CAGCAGTGGAT
LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** ** **** ** ** ******* * ** ** * * * ** ** *
ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCC-GCTGGTTCGATCTCTCCTGGA
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCA--TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
* * ** * ** ** ** *** ** ** * *** * * * * * * *
ARA.TH_D CCACCACTTT
LEP.COL. ----------
Mean pairwise ID: 41.64%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT
******* * * * **** * * * *
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
YAR.LI_B G-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT
* *** ** ********* ** * *** * * * ***** * * * *
FUG.RUB. TCGGTA-TCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCC----TAAGGA
YAR.LI_B TCTGCGGTTGATG-GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
** * * *** ** * * * *** * ** * ** ****
FUG.RUB. GGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
YAR.LI_B TAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCGG
** *** * ** ***** * ** ***** * * *
FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTG-AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAG
YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGG---AAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--
****** ** * * ** * * * * * ** * * * ** ***
FUG.RUB. TCTTT
YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 41.64%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGG-GCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT
SCH.POM. ----------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTG-CATGTT
* ** ** *** * * * * * * * * * * * **
TRY.BR_B GGACAAGCGGGGGTTCT-GTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
SCH.POM. CGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCT--TTCGATCCCTCGATCTGCCACGT-CTGTTCGA
* * ****** ** ** * * * * * * * *** * *
TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTC-AGGC
SCH.POM. AGAGTAGTCTTCGTGGCAA--------CTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGT
** * * ** * * * ** ****** * * * ** * * ***
TRY.BR_B CGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATC
SCH.POM. TGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGA--TGGGATTCACC
** ** *** *** * * * * *** *** * * ** *
TRY.BR_B TCAGGACTTTGCGCCCC-AAGTGTCGTCGCGA-GGCGGTTT
SCH.POM. TTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT-
* * * ** ** **** * * * * ** ***
Mean pairwise ID: 41.67%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG--GAT
*** * ** ** * ******** ** * *** ** ** * * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * * * ** ** * * ** * ** ** ** * ***
ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAG
CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTT--AGTCCCGGGTGCA-TAAGG
** ** ** ** *** * ** * *** * ** ** *
ARA.TH_C TGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGT
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA---AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * ** * * * * * ***** * * **** * **
ARA.TH_C GGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTG
CAE.EL_D GGCCGGACCGCGC-TTGTAAGTTGACACACATAC-ACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
** *** ** * * * * ** * ** * ** *
ARA.TH_C GACCATCACTTT
CAE.EL_D ACTTATCATTT-
**** **
Mean pairwise ID: 41.67%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTG-CCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
LEP.COL. GCCGGA-GCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG--AGCTGTC
***** * ** ** *** ** * * ** ** *
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTG-GGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG
* *** *** ** *** * ** * * * ** *** ** *
FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG
LEP.COL. GCC-----TCCGGGTGCC-CCCTTGCAGAAG---GGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGA
* ** ** * * ** * ** *** * ** ** *** * *
FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG
LEP.COL. G-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGA
* * * ** **** *** **** ***** ** * * * * * * ** * *
FUG.RUB. ATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT------
* * * ** ** * * * ** * * * * * **
Mean pairwise ID: 41.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
SCH.POM. -------------------CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
***** * * * *** * * ** **
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* ** * * ** *** * *** * * * ***** * * * * *
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA--------
* * * * ** ** * * ** * * * * **
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC---ACTACCG-GGTCTTGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** ** *** *** * * * * **** **
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATA--AACACAACGGTCGTT
* *** ** ** * ** *** * * * *** * ** ** **
Mean pairwise ID: 41.78%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
*** * * * ***** * * ** *** * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGCGT
* *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** *
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
TRY.BR_B GTCGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA
* * * * * * * ** * * * * * * ***** **** ***
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACA
** * **** ** * ** ****** ** * * * * * * **** * *
LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
TRY.BR_B CCGAGG-AGCATCTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT-
* * * *** * * ** **** * * ** * * * *
LYC.ES_K CTTT
TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 41.78%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** ******* * * * *** *** *** * * *
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
YAR.LI_A CGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * ** *** * ** **** * * *
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAG--AGATCCAGTT----GCCGTGG--GTATGG
** * * ** ** *** ** *** * * ** **** * **
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
YAR.LI_A CGG-TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT---
** * ** * ***** ** * * * * * ** * * *
LYC.ES_H TTTT
YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 41.80%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA----ATCGTCTTCTTGTTGTG
** * * * ** * * * *** ** * ** * * * **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
YAR.LI_A CGTT--CGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCC--ATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG
* * ** ***** * ** * * *** ** **** *** *** *
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
YAR.LI_A GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCC-GTTCTAAGATTAACTG
* * *** *** ** * * *** ** * ** * * * * * * * *
ZEA.MA_C GAACGGC---GTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
YAR.LI_A GGAAACTTCAGTGGAGCAATCCA-GCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT-----ATGGCGGT
* * *** ** ** ***** * * * * ** * ** **
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
YAR.LI_A GGGATCGCAACCAAGTGGTATATG-------TTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--
**** ** * * ** *** *** ** * * ** * *
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
YAR.LI_A -----------
Mean pairwise ID: 41.81%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
*** **** * * * *** * * ** **
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* * * * ** *** * *** * * * ***** * * * * *
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA--------
* * * * ** ** * * ** * * * * **
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** *** ** *** * * * **** **
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT
* *** ** ** * ** *** * * * *** * * * *** *
Mean pairwise ID: 41.83%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * ** ***** * * * * **** *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCA-----GGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG--
* ** * ** * * *** * * * * * * * ** *** *
RAT.RAT. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
LEP.COL. ------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGT
**** * **** ** * * **** * ** * ***
RAT.RAT. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
LEP.COL. AGAGG--AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTG
** ** *** ** **** *** ********** ** * * * * * ** *
RAT.RAT. TGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCG
LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
* * * * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** *
RAT.RAT. TCTCTT
LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 41.83%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGAT-GGTGGGACACT
LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * * * ******* * *** * * * * * ***
ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
LEI.MAJ. CGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGTGT
** * ** * ** ** * * ** * ** **** * *
ARA.TH_F GTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LEI.MAJ. CGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGT--CCGCCGTTGAAGC--GAGGGA
* ** * * * *** ** * * * * ** *****
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGACGGA
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA
* * ** **** ** ** ******* * ** * *** * ** ** * * *
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG---TCGCG-AAGCCTT
**** * * ** * **** *** * * ** ** * **
ARA.TH_F CATTTT
LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 41.88%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ***** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG
***** * * *** *** * *** ** *** * *
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********************** ** * ******* ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAC-TAAACCA
* * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** * * *****
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_D CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 41.90%
TRY.BR_A ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG-TCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGT
*** * * * **** * * * * * ** * * *** **
TRY.BR_A CTTGGAC-----AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTG-CGTG
YAR.LI_A CTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTC
***** * * ** ** **** * * * * * *** * * ***
TRY.BR_A TCGGTGTTGA-GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACG
YAR.LI_A TCGGTCTGAGTAATCGGCTTTG-AGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTG
***** * *** * ** *** ****** * * *
TRY.BR_A GGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGA
YAR.LI_A GAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTT-GCCGTGGGTATGG---CGGTGGGATCGCA-ACCAA
* ** ** * * *** ** ** * * * ** * * *** *** *
TRY.BR_A GGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
YAR.LI_A GTGGTATAT----GTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---
* * ** * * ** * * ** ***
Mean pairwise ID: 41.91%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATC-CAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
* ******* ** * * **** * *** *
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
YAR.LI_A G-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCT---CTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT
* *** * **** ****** *** ** * * * ** ***** * * *
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTT---GCTCTAAGGAG
YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
** * ** ** * * *** * ** ** * ******
XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGGT
** *** * ** ***** * * ***** ** * **
XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTG-AATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT
YAR.LI_A GGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------
******** * * ** * * *** * * * * ***
XEN.LAE. TCT
YAR.LI_A ---
Mean pairwise ID: 41.97%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA
*** ************** **
CIN.HYB. G-AGTGGGTT-CATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCAG
* ***** * ** *** ***** * * *** * * ** * ** *
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
*** **** ******* ********** **** *** * ** * ** ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTG-TCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACC
TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCAC
** ** **** * ** ***** * ** * *** *** * *** *
CIN.HYB. CATTT
TRI.AE_C CATC-
***
Mean pairwise ID: 41.97%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTTAGT
* ** *** ** *** ** ** **
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
SCH.POM. ACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT--CGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGA
**** * ** * * * *** * * * ** * * * * *** * ** **
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC--ACTCCTAGACTGGAGGGCAA
SCH.POM. TCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTAC
** * * * * * ** ** * * * ** ** * * *
HUM.LU_C TGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
SCH.POM. CGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCGATAG
* **** *** *** *** * ** ** * *** ** * * ****
HUM.LU_C CGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTT
SCH.POM. CGATGGGATTCACCTT---CGCAGGATGTGCA--TGGA---AGTATAAACACAACGGTCG
** * * * **** * * *** ** *** * * * ** * ** *
HUM.LU_C CTTTT
SCH.POM. TT---
*
Mean pairwise ID: 41.98%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAAT-------CGTCTT
** ** * * ** * * * ** ** **** ** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
YAR.LI_A CTTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT-TGGCCATTT-----GGTTGTCCTTTC
*** **** *** ** ***** * * * * ** * * *** ** ***
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
YAR.LI_A CGAATTCTGCGGTTGAT--GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC
* * ** * ** * * * * ** * * ** * ****** * * * *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCTT
YAR.LI_A TAAGATTAACTGGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT
*** * * * * * ** *** * ***** **** **** * *
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTT---GGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC
YAR.LI_A ATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-
****** * *** ** * * ** * ** * * ** *
ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT
YAR.LI_A ------------------------
Mean pairwise ID: 41.99%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG
* **** * *** * * **** ** * * * ** ** * * ***
HOM.SA_A TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * **
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** *
HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGTGCAACAT-AGCGAG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** * * ** * * *** ** ** * * * *
HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT
LYC.ES_L ACCACCACTTT-
*** * ** *
Mean pairwise ID: 42.02%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGG-GGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
YAR.LI_B ----AGC--TGTAATG---GCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTT
*** ***** * ** * * * ****** * * * ** * ***
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
YAR.LI_B CGA---GTTCTGGACTCTGCACT----GGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG-
* * ** ** ** ****** * * ** *** ** **
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAA-AGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* **** ***** * * * * * ** * ** * ***
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-CTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
YAR.LI_B GATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGA
* * * ** *** * **** ** * *** *** * ** * ** ***
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
YAR.LI_B TAGCAACAAAGTGGTATAT--GTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------
* * **** * * * ** * * * ** * * **
LYC.ES_F CACTTTT
YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 42.04%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT
***** * * **** * *** ** * * * * *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTG---CACTGGGCTACTTTG-TTGTCCTTTCCGAATTCT
**** * * ****** * * * * ** * ***** * *** ***
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * * *** * * * ** ****** * *** * * * *
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCCG-GCTTCCAACGGTG
YAR.LI_B TGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG
** ** * * ** *** * ***** **** * * **** * * *****
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTC---GAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC
YAR.LI_B GGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-------
*** *** * * * * ** * * * ** ***
ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT
YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 42.07%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
* * * **** * * ** * * **
GAL.GAL. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-GCCTGCCCTGTCCAA
* * ** ** ******* *** **** * * * ** * **
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* * * * **** ** * * * * * * ***** * ***
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * **** *** ** ** ****** * * ****** * * ****
GAL.GAL. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCT
LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA
**** * * * *** * ** * *** **** * * * * *
GAL.GAL. GTCTCC---
LYC.ES_M ACCACCTTT
* **
Mean pairwise ID: 42.07%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG
LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT
*** * * ** * *** * * * * **
CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG
* *** * * * ** ** * *** * ** **** ** **
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* * **** *** ** *** * * * * * *** * * *
CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
*** * * * * * ***** ** *** **** ********* *
CAE.EL_D GAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG--ACCAC
LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** * **
CAE.EL_D TTATCATTT
LYC.ES_M CCACCTTT-
* * **
Mean pairwise ID: 42.11%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTTAGT
* ** *** ** *** ** ** **
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
SCH.POM. ACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGA
**** * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * ** **
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAA
SCH.POM. TCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTAC
** * ** * * * ** * * * * ** ** * * * *
HUM.LU_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAA
SCH.POM. CGATGGAGGTTGGA--AACAATGCAC--ATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCGATAG
* **** *** *** *** * ** ** * ** ** * * ****
HUM.LU_B CGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTC
SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCG--CAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAAC--GGTCGTT--
** * * * *** * ** **** ** * * * ** * * **
HUM.LU_B CTTT
SCH.POM. ----
Mean pairwise ID: 42.12%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG
* **** ** *** * * * ** ** * * * ** ** * * ***
CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * **
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** *
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGTGCAACAT-AGCGAG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** * * ** * * *** ** ** * * * *
CAN.SPE. ACCCCGTCTCT
LYC.ES_L ACCACCACTTT
*** * ** *
Mean pairwise ID: 42.14%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
*** **** * * * *** * * ** * **
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* ** * * ** *** * ** * * * ***** * * * * *
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA--------
* * * * ** ** * * ** * * * * **
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** *** ** *** * * * **** **
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT
* *** ** ** * ** *** * ** * *** * * * ***
Mean pairwise ID: 42.16%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
YAR.LI_B TGCGTTC---GAGTTCTGGACTC--TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT
** ** ** *** ** ** ** * * ** ** *** *** * *
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
YAR.LI_B GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * *** * * * * * ** ***** **** * * *
LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGA-AGGA
YAR.LI_B CTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAATC--CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGG
* * ** * * ***** * **** * ** ** **** * *
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
YAR.LI_B CGGTGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACT
**** * * **** ** * *** * **** * * **
LYC.ES_K ACCTTT
YAR.LI_B CTC---
*
Mean pairwise ID: 42.16%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ****** **
LYC.ES_C AGTTGGGTC--TTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
*** * *** ** * * ***** * ****** * ** * *** **** *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
** ************ *********** *** * ****** * **********
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCG-CTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACC
**** *** ** * ** * * * ** * * ** ** ** ** ***
LYC.ES_C ACATTT
TRI.AE_C ATC---
*
Mean pairwise ID: 42.16%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
LYC.ES_D -----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA
* ** * * ****** ******* **
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGCAAT
LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACC
* ** * * ** *** * * * ***** * ** * * *
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
LYC.ES_D GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
** ********************** ** * ********** ***************
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT
LYC.ES_D GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTG--CTCCAACTAAACCACC
*** ***** * * ** * * ** **** ** ** ****
HUM.LU_C TCTTTT
LYC.ES_D ACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 42.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTC----TT
** ** * ** * * * ****** **** * * *
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC
YAR.LI_B GTTGT-GCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT
***** *** * * **** ** * ** ** * ** **** * **
TRI.AE_A GTAGTGGAC---CGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG
YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT-TAA
* ** ** ** ** ** ** * *** * * * ** ** * ** *
TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-CGCTTCCAACGGTGG
YAR.LI_B CTGGGATA-CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGG
* ** * * * * ** ** *** ** ** **** * * ******
TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCA--ATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
YAR.LI_B GATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------
* ** * * * ** *** * ** * * *
TRI.AE_A ACCACC
YAR.LI_B ------
Mean pairwise ID: 42.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTC----TT
** ** ** * ** * * * ****** **** * * *
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC
YAR.LI_A GTTGT-GCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
***** *** * * * *** ** * * * * * ** **** * **
TRI.AE_A GTAGTGGAC---CGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG
YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT-TAA
* ** ** ** ** ** ** * *** * * * ** ** * ** *
TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-CGCTTCCAACGGTGG
YAR.LI_A CTGGGA-AACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGG
* ** * * * * ** ** *** ** ** **** * * ******
TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCAC-TCCTAGGCCA-ATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
YAR.LI_A GATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-----------
* ** * * * * * * * *** ** *
TRI.AE_A ACCACC
YAR.LI_A ------
Mean pairwise ID: 42.16%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA
*** ****** ****** *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGG--TCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
* *** * *** **** ******* *** * ** * ** **** * *
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
** ************ *********** **** * * ****** * **********
LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATC
TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCC--GCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGA-CCACC
****** *** ** ** ** * *** *** * * * * *** *
LYC.ES_F ACTTTT
TRI.AE_C ATC---
*
Mean pairwise ID: 42.17%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT
***** * * **** * *** ** * * * * *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTG---CACTGGGCTACTTTG-TTGTCCTTTCCGAATTCT
**** * * ****** * * * * ** * ***** * *** ***
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * * *** * * * ** ****** * *** * * * *
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CGCTTCCAACGGTG
YAR.LI_B TGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG
** ** * * ** *** * ***** **** * * *** * * *****
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTC---GAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC
YAR.LI_B GGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-------
*** **** * * * * ** * * * ** ***
ZEA.MA_D AGACCACCATCTT
YAR.LI_B -------------
Mean pairwise ID: 42.18%
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCG
LYC.ES_L -----------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTA
*** ** **** * ******* * **
SCH.POM. GGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGATCTG--CCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTT
LYC.ES_L TAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTG
** * ** * ** ** * * * ** ** ***** ** * ** **
SCH.POM. CGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC--
LYC.ES_L GGTTGC--TTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA
** ** ** **** * * * ** * **** *** ** * ** *
SCH.POM. ACTACCGG-GTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGG--------AT
LYC.ES_L ACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAAC
** * * ** ****** * * *** ** ** * *
SCH.POM. GTGC--ATGGAA-GTATAAACACAACGGTCGTT--
LYC.ES_L GCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT
* * **** * *** *** * *
Mean pairwise ID: 42.19%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** * * ** *** **** ***** ** *** * * * * * **
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
ZEA.MA_H AATTGTGGT-GCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAGT
*** * * ** * ** * ** * * * * * ** * * ****
FUG.RUB. TCGGTATCGATAT---GGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA----CTAAAGTGG
* *** * * * *** * * *** * *** * * **** * **
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCAC-CAGCGGTGG
* * * *** ** * ** * * ** * *** * *** ****
FUG.RUB. GATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT
ZEA.MA_H AAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------
* * * ** **** * * * * * *
FUG.RUB. T
ZEA.MA_H -
Mean pairwise ID: 42.19%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * * *
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** *
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * **
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** * *
CAE.EL_B TGCGCTTGTGAGT-TGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTT
TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-----
* * *** * ** * * * ** * ** * **
CAE.EL_B T
TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 42.21%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * * ******* * *** ** * *** * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCT----GGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGT
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
****** ** * ***** * * * * * ** * * * **
LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGG
* * *** ** * * * * ** * ****** * *
LYC.ES_E GGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
LEP.COL. AACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGAA
** **** ** ** ***** * * * * * * *** ** * ** *
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
LEP.COL. CCACACCGCGGAGCCTGTCA----TCACCTGCGCCC--CAGGCGATCCT-GTGAAGCTTT
** *** **** ** ** *** *** * ** ** ** **
LYC.ES_E CACATTTT
LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 42.21%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTG-TGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAG
SCH.POM. ----------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAA
* ** **** * * * ** **** * **
TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGC
SCH.POM. TA-GTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCT-CGATCTGCCAC
** *** * ** * * * * * ** *** * * * *
TET.ROS. -TATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCCT
SCH.POM. GTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTG--GCAACTGGCAGTTAAACCG-TGTAGTACCGATG
* ** * *** **** * * ** * ** ***** * ** * ****
TET.ROS. CAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACTC
SCH.POM. GAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCTTG-GGCAGTGCGATAGCGATGGG
*** *** **** ** * * *** * *** ** * **** *
TET.ROS. ATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCA-GACACT----
SCH.POM. ATTCACCTTC--GCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
*** ** ** ** * ** * * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 42.21%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
*** ****** ****** **
ARA.TH_E TG-AGTAAGACGTGTGTGTC--AAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCA
* *** ** ** * * * ***** * **** * **** *** ** **
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
** * ************ **************** *** ******* ** * ***** *
ARA.TH_E GATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG---ACC
*** ** * * * ** ** ***** * * * ** ***
ARA.TH_E ACCATTTT
TRI.AE_C ACCATC--
*****
Mean pairwise ID: 42.24%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
*** * * * ***** * * ** *** * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGCGT
* *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** *
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
TRY.BR_A GTCGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA
* * * * * * * ** * * * * * * ***** **** ***
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCC--CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA
** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * *
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
TRY.BR_A CACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------
** * * * *** * * **** * * ** * * *
LYC.ES_K TTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 42.30%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_B -------------AGCTGTAATGGCATTTT--GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG
* ** * * * ** ** ** *** * *****
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * *
LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * *** * * * * * ** *** * ** **** * *
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
YAR.LI_B AACTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT
* ** ** * ** ****** ** * ** * * * * **
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA
YAR.LI_B GGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
** * * * *** ** ** *** * **** * * *
LYC.ES_N TTTTT
YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 42.30%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT
* * ******* * * * **** * * * *
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
YAR.LI_A G-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT
* *** ** **** ****** * *** * * * ** ***** * * * *
FUG.RUB. TCGGTA-TCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
YAR.LI_A TCTGCGGTTGATG-GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT
** * * *** ** * * * *** * ** * ** * *
FUG.RUB. TGCCCCGG----CCCAGGTCGGAAACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
YAR.LI_A TAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCGG
* * ** *** * ** ***** * ** ***** * * *
FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTG-AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAG
YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------
********* ** * ** * * * * * * * * * ***
FUG.RUB. TCTTT
YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 42.31%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG
* **** * *** * * **** ** * * * ** ** * * ***
RAT.RAT. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * **
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** *
RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGGGCAACAT-AGCGAG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** * * ** * * *** ***** * * * *
RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT
LYC.ES_L ACCACCACTTT-
*** * ** *
Mean pairwise ID: 42.33%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * *
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCT--GTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * *** *** * * ** *** * ** * *** *
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG
* **** * ** * * ** **** ** ** ** *** * * **
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
TRY.BR_A GAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC
* **** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** * *
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGT-TGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT
TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---------
* * *** * ** * ** ** * ** *
Mean pairwise ID: 42.35%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** * * * * ** *** * * * * * * ** * ******
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
* ** * * *** **** * * * * *** *** *
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
* * * * * * * ***** * * * **** * ******* **
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
CAE.EL_C ACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCA-ATACCTTCAGACCACTTGT
* * ** * * * * * ** * * * ** ** * * * *
HUM.JA_A CTCTTTT
CAE.EL_C CACT---
* **
Mean pairwise ID: 42.39%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_D ------------------------------TAGTTCT----GGCCTGCCCTGTCCAAGCA
* *** *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
*** * * *** *** * * **** * **** *** * **** *****
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
***** * ** ** * * ** ** * * * * * *** * *****
ZEA.MA_B ACCATCTTT
LYC.ES_D ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 42.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_D ----------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ********* ******
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
** ** * * *** * *** ***** **** * *** ******
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** ********************** ** ** ****** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACC
LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC
***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ***
ZEA.MA_F ACCATCTTT
LYC.ES_D ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 42.43%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
LEP.COL. -GCCGGAGCCTTG-----CTCTGTAACC----TTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* *** *** ******* * *** * * * * * * *
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCA---GCATAGGGTGCTTGCG-GCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * *** * ** *** * * ** ******* * * ** **
DRO.MEL. TTGCCATCAA-----TATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA
LEP.COL. TGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAG
* ** * ******* * ** * *** * * * *
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT
LEP.COL. TAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACG-TCTGCCGTTGC
** **** *** **** * ** ******* * * * * * ** ** *
DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAAT
LEP.COL. AGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT---
* * * ***** * * **** **** ** *
DRO.MEL. CTTT
LEP.COL. ----
Mean pairwise ID: 42.43%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
* * * * ******* * **** * *** * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG
** **** * * *** ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GAA
*** * ** ** * * ** *** ** * * *** * ** * *
LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATC
*** ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** **
LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA
LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT--
** *** ** * * ** * *** * * * * * * **
LYC.ES_O CTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 42.43%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
YAR.LI_A TGCGTTC---GAGTCTTGGGCTC--TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
** ** ** ******* ** *** * * * ** *** *** * *
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
YAR.LI_A GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * *** * * * * * ** ***** **** * * *
LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA--TCCAGTT----GCCGTGG--GTATG
* * * * ** *** * * *** * * ** **** * **
LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
YAR.LI_A GCGG-TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT--
** * ** * ***** ** * * * * * ** * * *
LYC.ES_K CTTT
YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 42.44%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
LYC.ES_L -------------------------------------------------------GTTGG
* * *
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGG-TGTCCGCACTAAGT
LYC.ES_L GTTGA-CCCAGATGGT-TGGGTT-CGGTAGGCT-TATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC
**** **** * * **** * * * *** * * * ** ** ** * * ***
XEN.LAE. TCGGTATCAA--TATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT--CCTAAAGTGG
** * * * * * * ** * ** * * * ** **** * **
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * * *** * * **** *
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAG--AACAGCCTGAACAACA----CAGCGAG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** ** *** *** ***** * ** * *
XEN.LAE. AC-ACAGTTCT
LYC.ES_L ACCACCACTTT
** ** * *
Mean pairwise ID: 42.47%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGGAGCTGTCTG
LYC.ES_M --------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTC--
* **** ** * * *** * * ******
LEP.COL. GACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGC
LYC.ES_M --CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTG
**** * ***** * * * * * ** * ** * * *
LEP.COL. CTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-GAACTGGGT
LYC.ES_M GATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCAT
* * * *** * ** * ** * ****** * * * ** * *
LEP.COL. CAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC--CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACC
LYC.ES_M GAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAGGATAATGGG
**** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * ** * *
LEP.COL. GCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT---------
LYC.ES_M TCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
*** * ** *** *** **** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 42.47%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
LYC.ES_M --------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATT--GGGCTGTCCCAGATGGCTGG
* * * *** * * * ** * * * * * ** * ** *
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA
LYC.ES_M GCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTG------GATCACGA
* * *** * ** ** * ** * **** * * **
TRY.BR_B GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAACGGGTCAGGCCG
LYC.ES_M GGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG
** * * * ** * * * * * * ********** *** ** * **** *
TRY.BR_B G--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGG-AGCAT
LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGT
* * ** ****** ** * * * * * * **** * * * * * *
TRY.BR_B CTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT-----
LYC.ES_M CTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
** * * ** **** * * ** * * * *
Mean pairwise ID: 42.52%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * *** * * *
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** *
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * **
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG
* * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** * *
CAE.EL_C AGCGCTTGTGAGT-TGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCAC
TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-----
* * *** * ** * * * ** * ** * **
CAE.EL_C T
TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 42.55%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG
SCH.POM. --CGCTGTAATGGCTTGGT--CGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGT
* * *** *** * * * ** * ***** * * * *****
LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA
SCH.POM. CTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCT
** * * * ** ** * * ** ** * * * ** * *
LYC.ES_M TGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTG
SCH.POM. TCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACAT
* * * ** **** * * * **** **** *** *** ***
LYC.ES_M AACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAA
SCH.POM. CACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGG----------ATTCACCTTCGCAG
** * * * ** ****** * ***** ** * * * *
LYC.ES_M CGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
SCH.POM. GATGTGCATGGAAGTATAAAC--ACAACGGTCGTT
* ** * ** ***** * **
Mean pairwise ID: 42.58%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * *** **** * *** * * * ***** *
CIN.HYB. AGCT--------TGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT--
**** ** *** * * * ** *** * * ***** * **
CIN.HYB. CAAGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAAT
LEP.COL. -GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCT--CCGTTAAAGT
**** * ** *** ***** ** * * * *** * *
CIN.HYB. CGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGT
LEP.COL. AGAGGAAC--TGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGT
* ** * ** ** **** ** ** **** ** * * * ** * **
CIN.HYB. GGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGG
LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCA---TCACCTG--CGCCCCAGGCGATCCTGTGAA
* ** * *** ***** * * * *** * * ** * **
CIN.HYB. ACACCCATTT
LEP.COL. GCTTT-----
*
Mean pairwise ID: 42.62%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * *** *** * **** ** * * *
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG
* **** ** *** *** * * ** **** ** **
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGGG
* ** * * * * * ** * *** ** * ****** * ***
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
TRY.BR_A AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAG
** * ** **** *** ** ******* * ** * * * * ** * *
ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC
TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
** * * ** ****** *** ** ** * ** ** * *
ARA.TH_D ACTTT
TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 42.62%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** * *** * * * * *** *** * *****
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * *
LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * *** * * * * * ** *** * ** **** * *
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
YAR.LI_B AACTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT
* ** ** * ** ****** ** * ** * * * * **
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA
YAR.LI_B GGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
** * * * *** ** ** *** * **** * * *
LYC.ES_I TTTTT
YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 42.63%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA
CAE.EL_D --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-CGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** * **** ** * ** * ** ** * ** * **** ***
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAG-TCCCGGGTGCATAAGGAG
** ** ** *** ** * **** * * * ** * * ** * *
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
CAE.EL_D TCGTGGATGGTTCAGGAC------CGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAG
* * * ** * * * * * *** ** ** * * *
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
CAE.EL_D TGGCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* ** * * ** * * * **** * * * * *
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
CAE.EL_D CTTATCATTT--
* *****
Mean pairwise ID: 42.67%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * * ******* * *** ** * *** * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCT----GGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
****** ** * ***** * * * * * ** * * * *
LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-
* * *** ** * * * * ** * ****** * *
LYC.ES_O GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGA
* ** * ** **** ** ** ***** * * * * * * *** ** * **
LYC.ES_O ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA
LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCTGTCA----TCACCTGCGCCCCA---GGCGATCCTGTGAAGCTT
* ** *** **** ** ** *** * * * *** * ** *
LYC.ES_O CCACTTT
LEP.COL. T------
Mean pairwise ID: 42.67%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ***** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
***** * * *** *** *** * *** * *** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ******* ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAC-TAAACCAC
* ** * * *** *** ** ** **** *** * ** * * ******
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_D CACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 42.67%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC
LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ****** **** ******
TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
LYC.ES_D GAGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
* *** * * * *** * **** **** ** * * * *** * ** *
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
** ** ********************** ** * ****** * *********
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC
LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCAC
******* ** ** * * * ** * **** * * ***** * * *****
TRI.AE_A C------
LYC.ES_D CACTTTT
*
Mean pairwise ID: 42.67%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * * ******* ****** ** * * * *
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGG---CTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** * * ** *** ** * * * * * ** **** **
LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGCGTTCTCGC---GCCGTTAAAGTGGGGGG
* * **** * ** ** * * * * * *** *** ****** *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRY.BR_A AACGG-GTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
** * ** **** *** ** ***** * * * *** * * * ** ** *
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGC----GCCCCAAGTGTCGTC--GCGAGGCGG-
*** * ** * * * * * ** * ** * * * *
LYC.ES_F CACTTTT
TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 42.67%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC
** ** * * * ** ** ****** *****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
TRY.BR_A GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG
* * * * *** * * * * * ** ** ** * *** *
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* ** * * * * * ** * ***** * * *** * ****
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
TRY.BR_A GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
**** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * *
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------
* * ** ** * * ** * * ** * * * ***** *
Mean pairwise ID: 42.72%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG
LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT
*** * * ** * *** * * * * **
CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG
* *** * * * ** ** * * *** * ** **** ** **
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* * **** *** ** *** * * * * * *** * * *
CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
*** * * * * * ***** ** *** **** ********* *
CAE.EL_A GAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAG--ACCAC
LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
** * * *** ** ** * * **** * * * ** ** * **
CAE.EL_A TTATCATTT
LYC.ES_M CCACCTTT-
* * **
Mean pairwise ID: 42.72%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G
* *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * *
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
**** ** * ** * * * * * * ** * * ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
**** ** ** **** ** * ** ******* * * * **** * *
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGC---ATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG
** * * ** * ** * ** * * * **** ** ** * ** *
ZEA.MA_E ACCATCTTT
TRY.BR_B GTTT-----
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** ***** ****** * **
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * *
LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************ *********** *** ** * **** * *************
LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCAT
*** * ** ** *** ** ** * **** * * * ***** ********
LYC.ES_I TTTT
TRI.AE_C C---
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
*** * * * ***** * * ** *** * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G
* *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * *
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
TRY.BR_B TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA
** ** * * * * ** * * * * * * ********** ***
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACA
** * **** ** * ** ****** ** * * * * * * **** * *
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
TRY.BR_B CCGAGG-AGCATCTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT-
* * * *** * * ** **** * * ** * * * *
LYC.ES_J CTTT
TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** ***** ****** * **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * *
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************ *********** *** ** * ***** * *************
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCAT
*** * ** ** *** ** ** * **** * * ** *** * *******
LYC.ES_B TTTT
TRI.AE_C C---
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
** ***** ****** * **
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * *
LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************ *********** *** ** * **** * *************
LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCAT
*** * ** ** *** ** ** * **** * * * ***** ********
LYC.ES_N TTTT
TRI.AE_C C---
Mean pairwise ID: 42.77%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
* * **** * * * *** ***
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * * * ** ******** * ** *** * * * ** ** * **
FUG.RUB. GTTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTG
* * * * * * * ** * * * *** * * ***** * *
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
*** * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** *
FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA
LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
**** * * * *** * * * *** * ** ** * * *
FUG.RUB. CT-CAGTCTTT
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* * ****
Mean pairwise ID: 42.81%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
** * * *** *** * **** ** *** * *
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGG-TGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC
* ** * ** ** *** * * ** **** * *
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
LEI.MAJ. GGTGTGGCTTGCCC---CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC--GAGGGA
* ** ** * ** *** * * * * * * *** *****
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTA-CAGCAGTGGATGGA
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA
* * ** **** ** ** ******* * ** * * * * ** ** * * *
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG-----TCGCGAAGCCT
*** * ** ** * ** * **** **** * **** ** * * *
ARA.TH_D CACTTT
LEI.MAJ. T-----
Mean pairwise ID: 42.81%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
YAR.LI_B TGCGTTC---GAGTTCTGGACTC--TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT
** ** ** *** ** ** ** * * ** ** *** *** * *
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
YAR.LI_B GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * * *** * * * * * ** ***** **** * * * *
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGA-AGGA
YAR.LI_B CTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAATC--CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGG
* * ** * * ***** * **** * ** ** **** * *
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
YAR.LI_B CGGTGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACT
**** * * **** ** * *** * **** * * **
LYC.ES_J ACCTTT
YAR.LI_B CTC---
*
Mean pairwise ID: 42.86%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGG-GGACTATAAGATGGTGGAACACT
YAR.LI_A -CTTAGC--TGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTT
*** ***** * * **** * ***** * * * ** * * *
ARA.TH_G GGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
YAR.LI_A CGA--GTCTTGGGCTCTGCACTTG-----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG
** * * * * * *** * *** * ** ** ** * ** *
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGA--AGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
YAR.LI_A TTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTT---CTAAGATTAACT
* ** * * * ** * * ***** * ** * *** ** *
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
YAR.LI_A GGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGA-----TCCAGTT----GCCGTGGGT--
* * * ** *** * ***** ** *** * * ** ****
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
YAR.LI_A ATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-
* **** ** ** *** * **** * * * * * ** * **
ARA.TH_G ACCATTTT
YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 42.90%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
LYC.ES_M --------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATA
* * * ** ** * ** ***
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
* * **** ** ******* ** **** * * * ** ** * ***
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTGG
* * * ** * * ** * * ** * * ** **** * **
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
LYC.ES_M GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
** * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** *
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCG-GTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC
LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
**** * * * *** * * ** *** * **** * * * * * **
XEN.LAE. AGTTCT----
LYC.ES_M AACCACCTTT
*
Mean pairwise ID: 42.90%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGG-ATC
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** ** **** *** **** ***** ** * * * *** * **
XEN.LAE. GCTTG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCT-GCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACC----ACCCATTCCAA
*** ** ** * * ** ** * ** *** ** * ** * **
XEN.LAE. GTTCGGTATCAATAT---GGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA-----CACTAAAG
*** *** * * ** * * *** * * *** * * * **** *
XEN.LAE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG
ZEA.MA_H TGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGG
** * * * *** ** * ** * * ** * *** * *** *
XEN.LAE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT
ZEA.MA_H TGGAAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------
*** * * * ** ** * * ** * **
XEN.LAE. TCT
ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 42.90%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT----GATCCCGCTTAGCGG
*** * ******* **** ** *** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCC--ACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGG--TGTTCTGCTTG-GTT
* ** * ** * ** ** ***** * * * *** ** * * *
ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAAC-CAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
TRY.BR_B GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG--TGGGG
* * ** * * * * * * ** * * * * ***** ** **
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
* * * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * *
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGC--TCGTAACCCGCTTGAA
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
* ** * ** * ** * * * ** * *** * ** **
ARA.TH_G CCACCATTTT
TRY.BR_B ----------
Mean pairwise ID: 42.91%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
YAR.LI_A -----------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGT
** **** ** * * * * * * * * * *
TET.THE. G-ATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG-AGTT
YAR.LI_A GCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTT
* * *** ** * ** ** ** * * ** ** *** ** ** ***
TET.THE. GCTATG-GTGGTAACCT-AGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG-GAAAC
YAR.LI_A GATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAA
* * * ** ** ****** ** * * * ** * *** * *
TET.THE. GCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACA
YAR.LI_A ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGATCGCA
* **** **** * *** ** * ****** * * * *** ** **** **
TET.THE. TACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
YAR.LI_A ACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------
* * * * * * * *** ****
Mean pairwise ID: 42.95%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ****** **
LYC.ES_K AGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
*** * * * **** * **** * ***** ** * * * *** * ** *
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
***** ********************** ** * ****** * **********
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCA
** *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** ***
LYC.ES_K CCTTT
TRI.AE_C TC---
*
Mean pairwise ID: 42.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
*** **** * * * *** * * ** **
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* ** * * ** *** * *** * * * ***** * * * * *
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA--------
* * * * ** ** * * ** * * * * **
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCG-GGTCTTGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** *** ** *** * * * * **** **
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
* *** ** ** * ** *** * ** * *** * * * *** *
Mean pairwise ID: 42.95%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
TRY.BR_B ---------------AGC--CGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTG-ATCCCG
*** * * ** ***** * * * * * ** *
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTA---GCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
TRY.BR_B CTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG
** **** * ** * * ** * ****** ** * *
DRO.MEL. A--GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGT-TGGCTAAGG
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG----AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG
** ** * * ** **** * *** *** *** * * *** *
DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
TRY.BR_B TGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC--CCGTTG
*** **** *** **** * * ******* * * * * * * * ** *
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA
TRY.BR_B CAGAA--GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
* * ** **** * * * * * * ** * * * * ** * *
DRO.MEL. TCTTT
TRY.BR_B TTT--
* *
Mean pairwise ID: 42.95%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * *** *** * **** ** * * *
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG
* **** ** *** *** * * ** **** ** **
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGGG
* ** * * * * * ** * *** ** * ****** * ***
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
TRY.BR_B AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG
** * ** **** *** ** ******* * ** * * * * ** * * *
ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC
TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
** * * ** ****** *** ** ** * ** ** * *
ARA.TH_D ACTTT
TRY.BR_B -----
Mean pairwise ID: 42.95%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * ** ***** * * * ** **** *
CAN.SPE. TCGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTG-GGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG--
* ** ** ** *** ** *** * * * * * * ** *** *
CAN.SPE. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
LEP.COL. ------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGT
**** * **** ** * * **** * ** * ***
CAN.SPE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
LEP.COL. AGAG--GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTG
** * **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** *
CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCG
LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
* * * * ** ** * ** * ** * ** ** * * ** *
CAN.SPE. TCTCT
LEP.COL. -----
Mean pairwise ID: 42.96%
LYC.ES_M --------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG--GGCTGTCCCAGATGGCTGG
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
* * * *** * * * ** * * * * * ** * ** *
LYC.ES_M GCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTG------GATCACGA
TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA
* * *** * ** ** * ** * **** * * **
LYC.ES_M GGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG
TRY.BR_A GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAACGGGTCAGGCCG
** * * * ** * * * * * * ********** *** ** * **** *
LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTC
TRY.BR_A G--TGACGGAGCAGCC--CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAG-C
* * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * * ** * *
LYC.ES_M TTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
TRY.BR_A ATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----------
* *** * * **** * * ** * * *
Mean pairwise ID: 43.00%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * ******* ****** * ** * * * *
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** *
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TRY.BR_A TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** ***
LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGG
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
**** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** **
LYC.ES_B ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----
* ** ** * * * * *** * * * * *
LYC.ES_B CACTTTT
TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 43.00%
CAE.EL_C ------ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACG-GTAGATGAGTG
YAR.LI_B AGCTGTAATG-GCATTTTGTCGGA--GTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTT
* * ** * ** *** * ** * ** ******* * * ****
CAE.EL_C TGGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGT
YAR.LI_B C---TGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT-TGTCCTTTCCGAATTCTGCGG-------TT
**** * * ** * ** *** **** ** * * ** * * *
CAE.EL_C GCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG
YAR.LI_B GATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTT---GAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG
* *** ** ** * ** * **** * ** * * * *
CAE.EL_C GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTG
YAR.LI_B GA--------TACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG
** * ***** * ** ****** * ** *** * *** * *
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACT
YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----
* *** *** * * * *** * * ** **** * * *
CAE.EL_C TGTCACT
YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 43.01%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGA--TAGAT
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCT
*** * * * **** * * * *** * ** * * * ** * *
TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTT
LEP.COL. GGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGG
* * * ** ** * *** * * * * * *
TET.THE. GCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCC
LEP.COL. CCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-AGTAGAGGAACTGGG
** ** * *** * * *** * ** * * ** ** ***** *
TET.THE. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGT-TGTGGTGGAAGGATAACATAC
LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCC--ACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACAC-C
****** ****** ** *** ** * *** ** ** ** * ** * *** *
TET.THE. TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
LEP.COL. GCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
* ****** ** * * * * **
Mean pairwise ID: 43.04%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * ** ** * ** *** * ** * *** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATT--TGTTGTTGGCATAGGTC-TGGACTGCCCAATCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
* * * *** * ****** **** ** ** * ** ******
ARA.TH_G TGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
** ** * * ** ** * * ** *** ** **** *
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
* * ** *** * * ***** * * * **** * ******* ***
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCA-CACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTG--T
* * ** ** * * * **** * * * ** ****
ARA.TH_G CACCATTTT
CAE.BRI. CATT-----
**
Mean pairwise ID: 43.05%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
LYC.ES_D ----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* ** **** ****** ******* ****
HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAATG
LYC.ES_D TAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCG
* ** * * * *** *** * ******** ** * * * *
HUM.JA_A CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG
LYC.ES_D CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG
* ********* ************ ** ** ********** *************** *
HUM.JA_A GGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATCTCTT
LYC.ES_D GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTT
******** * * * ** * ** * **** * ***
HUM.JA_A TT
LYC.ES_D TT
**
Mean pairwise ID: 43.09%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTC-TGTAACCT--TCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG----GGGA
* * *** *** ** ******* ****** * * * ***
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TRY.BR_A CGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTG--CGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--GGTTGCGT
* * * **** ** * * * ** ** * * * * *
HUM.LU_C GGTGG-GCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT
TRY.BR_A GTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC
* ** * ***** * * * *** * ** * *** *** **
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
TRY.BR_A GGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCAC
* ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** ** * **
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
TRY.BR_A ACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTG--TCGTCGCGAGGCGG---------
** ** ** * * * *** ** * * * *
HUM.LU_C TTTT
TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 43.09%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
* * * * * * * *** * ** * * ** * * * * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * ** ** * * ** * * * * * *** * ** * ******
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG
CAE.EL_C GCTGCGTCA--CCAGGGGA--TGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
* * * **** ** * ** ** * * * * * *
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******* *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAG--TTGA--CACGTATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCAGAC
** * * ** *** * **** ** * ** * * * * * ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT-
CAE.EL_C CACTTGTCACT
** ** *
Mean pairwise ID: 43.09%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
YAR.LI_A TGCGTTC---GAGTCTTGGGCTC--TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT
** ** ** ******* ** *** * * * ** *** *** * *
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
YAR.LI_A GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA
* * * *** * * * * * ** ***** **** * * * *
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA--TCCAGTT----GCCGTGG--GTATG
* * * * ** *** * * *** * * ** **** * **
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
YAR.LI_A GCGG-TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT--
** * ** * ***** ** * * * * * ** * * *
LYC.ES_J CTTT
YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 43.09%
LYC.ES_J ---GTCGAGCTTAGTAACGTGGGC--TTGTAATCCAAGTGGA---GACATCAAAGTGGTT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
** ** * * * * * * * * * ** ***
LYC.ES_J GAATATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCTCATGTTGAC---GGAACGTCCGCACT
* **** * *** * ** * * * ** ** * ** *
LYC.ES_J AAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
**** * * * * * ** *** *** * * **** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
** * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA
***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
DRO.MEL. CCACAATCTTT
* ** * ****
Mean pairwise ID: 43.09%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT--CTGATTGTGGGATGG
YAR.LI_B ------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTG
******* * ** * ** ** * * *
DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
YAR.LI_B TTGTGCGTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT
* * * * *** * ** * * *** * **** * *
DRO.MEL. GC--TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGT-CTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTT--CTAAGATT
** *** * * *** * * * * * ** *** *** *****
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAG-AGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT
YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCGGT
** *** ** * ** ******* * **** ****** * **
DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAAT
YAR.LI_B GGGATAGC--AACAAAGTGGTATAT-GTTATGGAA------GGTATT-TGCAATCACGAC
******** * * ***** * ***** * *** * * *** *
DRO.MEL. CTTT
YAR.LI_B TCTC
*
Mean pairwise ID: 43.09%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
LYC.ES_L GGGTTGA-CCCAGATGGT-TGGGTT-CGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG
* **** ***** * * **** * ** *** *** ** ** * * ***
HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG
** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * **
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
**** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** *
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTC--CAGCCTGAGCAACA----TAGCGAG
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA
**** ** * * *** *** * * ** * * ***** * * * *
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT
LYC.ES_L ACCACCACTTT
*** * ** *
Mean pairwise ID: 43.09%
LYC.ES_A ---GGCGAGCTTAGTAACGTGGGC--TTGTAATCCAAGTGGA---GACATCAAAGTGGTT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* ** ** * * * * * * * * * ** ***
LYC.ES_A GAATATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCTCATGTTGAC---GGAACGTCCGCACT
* **** * *** * ** * * * ** ** * ** *
LYC.ES_A AAGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
**** * * * * * ** *** *** * * **** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
** * **** *** ** * ***** ** * ***** * ***** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA
***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
DRO.MEL. CCACAATCTTT
* ** * ****
Mean pairwise ID: 43.13%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** ****** * * * * ** **** * *
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT---CGTCGTCTACGTCG-ACCGAGCGTCCGTGCC
** * * * * ** ** ** ** * * * * ** **** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
CAE.EL_D AAGCGCTACGTCAC-CAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * *** *** ****** ** * * ** *
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ** * ** * * * * * ***** * * ** **** * * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTG-GCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
CAE.EL_D GCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGA-TACCTTC--AGACC
* *** ** * * * * * ** * * * * ***** * *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
CAE.EL_D ACTTATCATTT--
* ** *
Mean pairwise ID: 43.14%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAG-GCTGAGGCTGGCGGAT
SCH.POM. -------------------CGCTGTAAT--GGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
******* * * * ** * * ** * **
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* * ** * ** *** * ** * * ****** * * * * * *
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTGTT--CGA-AGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCA--GTTAAACCGTGTA--------
* * * *** * ** ** * * ** * ** * * ** **
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTC-TTGGGCAGTGCGA
* *** **** ****** * *** *** * *** * * * * **** **
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
SCH.POM. TAGCGAT-GGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAA-CGGTCGTT
* *** * ** * * * ** * * * * * * * *** **
Mean pairwise ID: 43.14%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TRI.AE_C ----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGT
* ****** ******* * *
HUM.LU_C GGTGGGCTGA--GGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCC-TAGACTGGAGGGCA
TRI.AE_C AGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * * *** *** ***** * * * * * *** ** *** ****
HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
***************************** ** ****** * * ***********
HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGC-TTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC
******** *** * ** * * ** * * ** **** * *****
HUM.LU_C TCTTTT
TRI.AE_C ------
Mean pairwise ID: 43.17%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** ***** ***
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCT---TGCCCATCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
** ** * * * **** * ** ** * ** * * ** * *
ZEA.MA_A CAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGA
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCG-GAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAG
**** * ** * ** * * *** ** * *** * * * * *
ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG
CAE.EL_D GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTG
* * * * **** * * * * * * *** ** **** * *
ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCT-CAGAACCTCACTAAG
CAE.EL_D CAGTGGCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGA
* * ** ** * * * * ** *** ** * * * *
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
CAE.EL_D CCACTTATCATTT--
* * * *** *
Mean pairwise ID: 43.18%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG-TGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** * * ** ***** *** * * * * ** * *** *
ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* ** * ** * * * ** * * * **** * ** ** ** * ***
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGGT
* * * *** * * * ** * ** *** ** * *** ** *
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
FUG.RUB. GCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG
* * *** ** ** ***** * **** **** * **
ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAACC
FUG.RUB. ATCGCGCC-------CGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTC
*** * ** * * * ** * * * * * ** *
ARA.TH_E ACCATTTT
FUG.RUB. AGTCTTT-
* ***
Mean pairwise ID: 43.18%
CIN.HYB. -ACCGG--GCTTGGTAACGCTAGTCTATA-ACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAAC
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGG-TCTGATTGTGGGATGGC
** ** * **** * * ** * ** ****** * * * **** *
CIN.HYB. TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* *** ** * ** * * ** * ** * *** * ***
CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATG-GAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG
* * ** * ** * * ** * ** * * * ***
CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA
DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
* * * * *** *** * *** ** ** * ** * * * ** *
CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTG-----GACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCA
**** * ******** * ** * * ***** * ****
CIN.HYB. CCATTT--
DRO.MEL. CAATCTTT
* ** *
Mean pairwise ID: 43.19%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA
LYC.ES_L ---------------------------------------------GTTGGGTTGACCCAG
*** * * *
TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT
LYC.ES_L ATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCT---GGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGG-
* * *** * * * * ** * ***** ***** ** ******
TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTT----CACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGC
LYC.ES_L ATCACGTGG-CTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG-GGTGGACTGC
** * * **** * *** * * * ***** * * * ** **
TET.ROS. CTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACA-
LYC.ES_L GTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGG
* ******* ***** ** *** * * ***** ** *************
TET.ROS. --TACTCATTAACT-GTCAAGCTAAT---CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT----
LYC.ES_L GTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTT
* * * * * *** ** *** * * * *** ** * * ** **
TET.ROS. -
LYC.ES_L T
Mean pairwise ID: 43.19%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATC-CAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT
* * *** ** * ***** * * * * ** * * * * **
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAG-----TTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * * ***** * *** * ** * * *** *** * **
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * * ******* * * * * ******* * ***
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
* ** * **** ** *** * **** *** *** ** * ***
FUG.RUB. T--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT
TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT-CGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-----
* * * * * ** * * ** * * * ** ** *** ***
FUG.RUB. T
TET.THE. -
Mean pairwise ID: 43.23%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
*** * * * ***** * * ** *** * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G
* *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * *
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
TRY.BR_A TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA
** ** * * * * ** * * * * * * ********** ***
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCC--CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA
** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * *
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
TRY.BR_A CACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------
** * * * *** * * **** * * ** * * *
LYC.ES_J TTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 43.23%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA---TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACA
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGC--TGGCGGA
* ** * ** * ** ***** *** * **** * ** *** *
ARA.TH_F CTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
FUG.RUB. TCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* ** * ** * ** * ** * ** * **** * * ** ** * **
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGGA
FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG
* * * * ** ** ** * ** * * ***** * ** **
ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG
* * * *** ** ** ***** * **** **** *
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAA
FUG.RUB. GGATCGCGCC-------CGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC
***** ** ** * * * ** * * * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
FUG.RUB. TCAGTCTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 43.23%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG-
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT
****** ** *** * ****** * * * * ** **********
CAE.EL_C -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA
* ** * * **** ** * * * *** * ** * ** * ****
CAE.EL_C GCGCTGC-GTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAA-AGT
* * ** ***** ** *** * **** ** * ***
CAE.EL_C GGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
ZEA.MA_H GGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCAC--CAGCGG
** *** * * ** * *** ** ***** ** * ** *
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
ZEA.MA_H TGGAAGGATAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT----------------------
* * * ***** * * * ** * *** *
CAE.EL_C ACT
ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 43.23%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G
* *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * *
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
**** ** * ** * * * * * * ** * * ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCG-ATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCG-AG
**** ** ** **** ** * ** ******* * * *** * * ** * *
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGC---ATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGC
** * * ** * ** * ** * * * **** ** ** * ** *
ZEA.MA_E CACCATCTTT
TRY.BR_A GG--------
Mean pairwise ID: 43.23%
CAE.EL_B -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGT-GGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA
* * * * * * * * * ** ** * * **** * * ***
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
TET.THE. GGATATGAG----AGTTTGATG-AGACAGTT-----TGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * *** *** ** * *** * * * * * *** ****
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* ** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** *
CAE.EL_B TGGA-TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
* * * ***** * ** * *** **** **** * ** **** ***
CAE.EL_B CTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT----
* ** * * ** ** ** * * * * * ***** * *
CAE.EL_B TTT
TET.THE. ---
Mean pairwise ID: 43.23%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG-
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT
****** ** *** * ****** * * * * ** **********
CAE.EL_B -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA
* ** * * **** ** * * * *** * ** * ** * ****
CAE.EL_B GCGCTGC-GTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAA-AGT
* * ** ***** ** *** * **** ** * ***
CAE.EL_B GGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
ZEA.MA_H GGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTG
** *** * * ** * *** ** ***** ** * * *
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
ZEA.MA_H GA--AGGATAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT----------------------
** * * ***** * * * ** * *** *
CAE.EL_B TTT
ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 43.24%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
ZEA.MA_H ------NCCGAGCTCTGTAGC----GAGTGCTTGTA--ACCCGAGCGGGGG---------
** ******** * * * **** * * * ** * ***
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGAC-GTGGTGC-TCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGG
ZEA.MA_H --CA--ATAAGGTAGTGTGGATGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA
** *** *** * * ** * ******* * *** *** * * *
LEP.COL. CCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGT
ZEA.MA_H ACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG
** ** *** ** ** * * ** * * * * * **
LEP.COL. CAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGG
ZEA.MA_H CATCCCAACACTAAAGTGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCG----AG
** ** ** ** ** ** * *** * *** * * *** * * *
LEP.COL. AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--------------
ZEA.MA_H TACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG-GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT
** * **** *** * * *** ** * *** *
Mean pairwise ID: 43.27%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCCGG
****** *** *** * ** ** * ** ** * ** *** *
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
ORI.CUN. AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGC--GCTATGCCGATCGGGTGTCCG
** * **** * * ** * ** * * **** * ***
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTG-AGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG----G
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* * **** * * * ** * **** * * * * * *
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTC---ACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGT
ORI.CUN. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
** * ** * * * * ** **** * *** *** ** * **
CIN.HYB. GGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGG
ORI.CUN. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGGGCAACATAGCGAG
* **** * ** * * ** * ********* * * * * *
CIN.HYB. ACACCCATTT--
ORI.CUN. AC-CCTGTCTCC
** ** * *
Mean pairwise ID: 43.32%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * * ******* ****** ** * * * *
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGG---CTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** * * ** *** ** * * * * * ** **** **
LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGCGTTCTCGC---GCCGTTAAAGTGGGGGG
* * **** * ** ** * * * * * *** *** ****** *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRY.BR_B AACGG-GTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
** * ** **** *** ** ***** * * * *** * * * ** * ** *
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGC----GCCCCAAGTGTCGTC--GCGAGGCGGT
*** * ** * * * * * ** * ** * * * * *
LYC.ES_F CACTTTT
TRY.BR_B TT-----
Mean pairwise ID: 43.32%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * ******* ****** * ** * * * *
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** *
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TRY.BR_B TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** ***
LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGG
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
**** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** * **
LYC.ES_B ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-
* ** ** * * * * *** * * * * *
LYC.ES_B CACTTTT
TRY.BR_B -------
Mean pairwise ID: 43.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
*** **** * * * *** * * ** ** **
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* ** * * ** *** * *** * * * ***** * * * * *
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA--------
* * * * ** ** * * ** * * * * **
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC---ACTACCG-GGTCTTGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** ** *** *** * * * * **** **
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATA--AACACAACGGTCGTT
* *** ** ** * ** *** * ** * *** * ** ** **
Mean pairwise ID: 43.34%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAAT-------CGCCTT
** * * ** * * * ** ** **** ** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
YAR.LI_B CTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG-GCTACTTTG-----TTGTCCTTTC
*** **** *** * **** * * ** * * *** *** ** ***
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
YAR.LI_B CGAATTCTGCGGTTGAT--GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC
* * ** * ** * * * * ** * * ** * ****** * * * *
ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCT
YAR.LI_B TAAGATTAACTGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGG
*** * * ** * * * * ** *** * ***** **** **** *
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTG-GGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC
YAR.LI_B TATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACT
* ****** * **** ** * * ** ** * * ** * *
ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT
YAR.LI_B CTC--------------------
***
Mean pairwise ID: 43.37%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT----GATCCCGCTTAGCGG
*** * ******* **** ** *** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCC--ACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGG--TGTTCTGCTTG-GTT
* ** * ** * ** ** ***** * * * *** ** * * *
ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAAC-CAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
TRY.BR_A GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG--TGGGG
* * ** * * * * * * ** * * * * ***** ** **
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
* * * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** *
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGC-TCGTAACCCGCTTGAAC
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---
* ** * ** * ** *** ** ** * * **** * * *
ARA.TH_G CACCATTTT
TRY.BR_A ---------
Mean pairwise ID: 43.38%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
LYC.ES_L ----------------------------------------------GTTGGGTTGACCCA
**** * *
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC
LYC.ES_L GATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTG---GCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGG
*** * *** * * * * ** * ***** ****** ** ******
TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTC----CACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACG
LYC.ES_L -ATCACG-TGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG-GGTGGACTG
** * * * **** * *** * * ***** * * * *
TET.THE. CCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACA
LYC.ES_L CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACG
* * ******* ***** ** *** * * ***** ** *************
TET.THE. ------TACTCA------TTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAG-ACA
LYC.ES_L GGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACT
* **** * * * ** ** ** * * * * ** *** **
TET.THE. TT
LYC.ES_L TT
**
Mean pairwise ID: 43.41%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA---TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACA
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGC--TGGCGGA
* ** * ** * ** ***** *** * **** * ** *** *
ARA.TH_A CTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
FUG.RUB. TCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* ** * ** * ** * ** * ** * **** * * ** ** * **
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCGATA-TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * * ** * ** *** * * ** **
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
* * * *** ** ** ***** * **** **** *
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGA
FUG.RUB. GGGATCGCGCC-------CGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA
***** ** ** * * * ** * * * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
FUG.RUB. CTCAGTCTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 43.42%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG
** ** *** ** *** *** * * * * * *
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * * * * ** * * ** ** * *** *** * * * *** **
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG
** *** ** ** * * * *** *** * * ***** * * * * *
CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGT-GCAGTGGCC
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCAC--CCCACGCACGTCCGCCGTTGCA
** ** ***** * **** * ***** * * ** *** ** ** ** **
CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----
* * * * *** ** * ** * * * * **
CAE.EL_C CACT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.42%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA--CTCGGGAGGCTGAGACAGGAG-
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * ** ***** * * * ***** ****
RAT.NOR. -GATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG--
* * ** *** ** *** * * * * * * * ** *** *
RAT.NOR. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
LEP.COL. ------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGT
**** * **** ** * * **** * ** * ***
RAT.NOR. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
LEP.COL. AGAG--GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTG
** * **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** *
RAT.NOR. TGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGT
LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
* * * * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** *
RAT.NOR. CTCT
LEP.COL. ----
Mean pairwise ID: 43.42%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** * *** * * * * *** *** * *****
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** ******* * * * * ** *** *** * * *
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
YAR.LI_A CGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * *** **** ***** * * * * **
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTATGG
* * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * **
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
YAR.LI_A CGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT--ATGTTATGGAAGATATT----TACGATCACGAT
*** * * * ****** ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_G TTTT
YAR.LI_A T---
*
Mean pairwise ID: 43.42%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG
** ** *** ** *** *** * *** * * *
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * * * * ** * * ** * ** *** *** * * * *** **
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG
* *** ** * * * * ** *** * * ***** * * * * *
CAE.EL_D TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAG
* ** ***** * **** * ***** * * * * *** ** ** ** *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGC--ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***
CAE.EL_D ATTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.44%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATGAGTGTGGATG
****** ** *** * ** *** * ** * ** ** ** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGT-AATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
CAE.EL_C G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
*** * ***** * **** ***** ** * * * * ****
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTC--ACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAGTCCCGGGTGCA
***** * ** * ** ** ** * * ** * * * **
ORY.SA_A CTAA-AGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
CAE.EL_C TAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGC
* ***** * * ** * **** ** *** ** ** * *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
CAE.EL_C AGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTT---CTCAATACCTTCA
* * *** * * *** * * ** * * ** *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
CAE.EL_C GACCACTTGTCACT------
** ** ***
Mean pairwise ID: 43.45%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** ****** * * * * ** **** * *
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT---CGTTGTCTACGTCG-ACCGAGCGTCCGTGCC
** * * * * ** ** ** ** * * * * ** **** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
CAE.EL_A AAGCGCTACGTCAC-CAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * *** *** ****** ** * * ** *
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ** * ** * * * * * ***** * * ** **** * * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGC-CGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGA-TACCTTC--AGACC
* *** ** * * * *** ** * * * * ***** * *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT--
* ** *
Mean pairwise ID: 43.46%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG-
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT
****** ** *** * ****** * * * * ** **********
CAE.EL_D -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA
* ** * * **** ** * * ** * ** * ** * ****
CAE.EL_D GC-GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA-CAC-TAAAGTGG
* ** ** **** ** *** ** * **** * *** * *
CAE.EL_D CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA
** ** * * * * * ***** * * ** **** ** ****
CAE.EL_D CGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
ZEA.MA_H AGGA------TAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT--------------------
*** * * *** * * * ** * *** *
CAE.EL_D TCATTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 43.46%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ******* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** ** ***** * * * * *** **** * *
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
** *********** *********** *** ** ****** * ***********
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGG-CCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCA
**** *** *** *** ** ** * **** * * ** ** ** ** ****
LYC.ES_E CATTTT
TRI.AE_C TC----
Mean pairwise ID: 43.49%
HUM.LU_C ------GGTCTTAGCAACTTG-GTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAAC
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
** *** *** ** * * *** ** * * * * *
HUM.LU_C TTTGGGTCA-ACCCAGTG-GTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATG----TTGACGGAACGTCCGCACT
* ** * * * * ** ** ** **** * * ** * * * ** *
HUM.LU_C AAGCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAG----TCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAA
**** * ** * * * *** ** * ** * * * **
HUM.LU_C AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC---CTCCCGCTCTCGGCAGT
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT
* * *** *** * * * **** * * ***** * ******
HUM.LU_C GGAAGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAAT
DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACTGCCGTTAT-CAGCCCAACCGATA--TGGT
* ***** ** **** * ** * * * * ** * * ** * *
HUM.LU_C AGGACCATTTCTTTT
DRO.MEL. TGGACCACAATCTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 43.49%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** ***** ***
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCT---TGCCCATCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
** ** * * * **** * ** ** * ** * * ** * *
ZEA.MA_A CAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGA
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCG-GAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAG
**** * ** * ** * * *** ** * *** * * * * *
ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG
CAE.EL_A GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTG
* * * * **** * * * * * * *** ** **** * *
ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCT-CAGAACCTCACTAAG
CAE.EL_A CAGTGGCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGA
* * ** ** ** * * * ** *** ** * * * *
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
CAE.EL_A CCACTTATCATTT--
* * * *** *
Mean pairwise ID: 43.51%
LYC.ES_B ---GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG-GGGGCATTAATGTGGTGGAAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
** ** * * * * * * ** * ** * ** * * *****
LYC.ES_B GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* ***** * * ** * * ** * * ** * ***
LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
*** * *** * ** *** * * * * *** * ***
LYC.ES_B CGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAG
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
* * * * *** *** * **** * * **** *** ** ** ** * *
LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCA
**** ** *** ** * * * * * * * * * ** ****
LYC.ES_B CCACTTTT
DRO.MEL. CAATCTTT
* * ***
Mean pairwise ID: 43.51%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G
* *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * *
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
**** ** * ** * * * * * * ** * * ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC--CCGTTCGA
**** ** ** **** ** * ** ******* * *** * * * * * ** **
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACCA
TRY.BR_A GAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCGG
* * ** * *** ** * * * **** ** ** * ** *
ZEA.MA_G CCATCTTT
TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 43.51%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG
* * * * ******* ****** ** * * *** *
LYC.ES_G GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
***** ***** * ***** * * * * * ** * * * *
LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-
* * *** ** * * * * ** * ****** * *
LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGA
* ** * ** **** ** ** ***** * * * * * * *** ** * **
LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA
LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCTGTCA----TCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTT
* ** *** **** ** ** *** * * * *** * ** *
LYC.ES_G CCACTTTT
LEP.COL. T-------
Mean pairwise ID: 43.51%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * * * * *
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** * * * * ** *** * * * * * * ** * ******
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
* ** * * *** **** * * * * *** *** *
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
* * * * * * * ***** * * * **** * ******* **
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
CAE.EL_B ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCA-ATACCTT----CAGACCAC
* ** * * * * * ** * * * ** ** * *******
HUM.JA_A CTCTTTT-
CAE.EL_B TTGTTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 43.51%
LYC.ES_H -GTTG--AGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATA
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
** ** ** * * * * * * * *** * * ****
LYC.ES_H TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
* ***** * * ** * * ** * * ** * ****
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGAT
** * *** * ** *** * * * * *** * ***
LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
DRO.MEL. GAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG
* * * * *** *** * ***** ** ** ***** * ***** * **
LYC.ES_H ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGACCAC
*** * *** ** * *** * * ** * * ** * * ** **
LYC.ES_H CACCTTTT
DRO.MEL. AATCTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 43.52%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC
** * ** * * * ** ** ****** * *
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRY.BR_A GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG
* * * * *** * * * * * ** ***** * ** *
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG
** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ***
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
TRY.BR_A GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
* **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** *
CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** *
CAN.SPE. T
TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 43.55%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
********** ******* *
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* *** * * ** *** ***** * **** * * * ** **** *
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
*** ***************************** ** ****** * * ********
HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGT--AGCCTACTCCAGCGACCAC
*********** *** *** ** * ** ** ** **** * **
HUM.LU_A CATTTCTTTT
TRI.AE_C CATC------
***
Mean pairwise ID: 43.55%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
**** ** ** * ** **** ** * *** * * * * ***
LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCCA
GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* * * * * ** ****** *** **** * * ** * *
LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * **** ** * * ** * * * * *** * **
LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
** * * * *** ** ** ***** * ** * ** * * **
LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTG----GGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * *** ***** * * * **
LYC.ES_I CACCATTTTT
GAL.GAL. C-CTGTCTCC
* * * *
Mean pairwise ID: 43.56%
CAE.EL_C -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGT-GGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA
* * * * * * * * * ** ** * * **** * * ***
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
TET.THE. GGATATGAG----AGTTTGATG-AGACAGTT-----TGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * *** *** ** * *** * * * * * *** ****
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* ** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** *
CAE.EL_C TGGA-TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
* * * ***** * ** * *** **** **** * ** **** ***
CAE.EL_C CAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT----
* * ** * * ** ** ** * * * * * ***** * *
CAE.EL_C ACT
TET.THE. ---
Mean pairwise ID: 43.59%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA--GGTGGTGCGGATT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
* * *** ******* ******* ** * * * * *
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC-
LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGT-GCTCTGCTTGGCTG
* * * * ** * *** ** ** *** * **** * *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT
** ** * * ** * * ** * * * * * * * * * ****
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGT
* ***** * ** **** *** ** ******* *** ** * * **
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
LEP.COL. TGCAGAACCAC--ACCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAG
* ** * ** **** * * * * ** **** ** ** * **
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
LEP.COL. CTTT--------
Mean pairwise ID: 43.59%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
SCH.POM. ------CGCTGTAATG---GCTTG--GTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTT
* ***** * ***** * ** * * * *** ****
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
SCH.POM. CG--GTGGT-CTCGGGTTCGAGTCTCGC-TTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCG
***** * * * * **** * * * * * * ** * *** * * *
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGA--AAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGA
SCH.POM. AAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCG-ATGGAGGTTGGAAA
*** * **** **** ** * ** * * * * ** * *
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTT-CATAGAGCAGCGAG-TACCGCCCG---CCACCAGCGGTGG
SCH.POM. CAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGG
** *** ** * * * **** * * ** ** * **** ** **
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT
SCH.POM. ATGTGCATGGAAGTA-TAAACACAACGGTCGTT
* * * ** ** * * * * *
Mean pairwise ID: 43.61%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
* * * * ******* * **** *** * * * * *
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCT-TGGCTGTGTGTC
* * * * *** * * * * ** ** **** ** * *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGAC
LEI.MAJ. G-GTGTGGCTTGCCCCCCTGCA-GAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GAAC
* ** ** ** * ** ** ** * *** ** ** * * * **
LYC.ES_F TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAGGATC
LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATC
* ** **** ** ** ***** * * * ** *** * * ** ** * ** ***
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LEI.MAJ. ACACCGCGGAGC-----ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTC--GCGAAGCCTT--
** * ** **** ** * ** * * * * ** ** *
LYC.ES_F CTTTT
LEI.MAJ. -----
Mean pairwise ID: 43.61%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
TRI.AE_C ---------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTA
* *** ****** ******* ***
HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAG--CCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA
TRI.AE_C GTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCA-CGGTCCATAATGTGGCAGGCAC
** * * ** * * **** ** *** * * * * *** * ** ****
HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
TRI.AE_C CGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAA
************ ******************* ****** * * ************
HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTT
TRI.AE_C CGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCT-TGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC-
******* *** ** * *** * * *** **** * *****
HUM.JA_B CTTTT
TRI.AE_C -----
Mean pairwise ID: 43.61%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG-
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT
*** * ** *** * ** *** * * * * ** **********
CAE.BRI. -GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA
* ** * * **** * * ** *** * * ** * ** * ****
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAG----GGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG
ZEA.MA_H GT--TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGT
* ***** * * ** * * * ** *** * ** ** * * ***
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
ZEA.MA_H GGCGG-ACATTGCGTGAGGCTGGCTT-CATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCAC--CAGC
* ** ** ** *** * ** *** ***** ** * **
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTG
ZEA.MA_H GGTGGAAGGATAATGAGT---CGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------
* * * * ***** **** * * ** * * *
CAE.BRI. TCATT
ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 43.61%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ****** **
LYC.ES_J AGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
**** * * * **** * **** * ***** ** * * * *** **** *
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
***** ********************** ** * ****** * **********
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCA
** *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** ***
LYC.ES_J CCTTT
TRI.AE_C TC---
*
Mean pairwise ID: 43.62%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACC-------TTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCG
** * ** ****** * ** * ** * * * * * **
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
LEI.MAJ. GGGAGGACGTGGACCAGCGAGG-GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCT
* * *** * * * * *** ** ** **** * ** * *
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT
LEI.MAJ. GTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG
** ** * *** * ** * * * * * ** * * *
XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGAT
LEI.MAJ. GAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCAGAAT
******* **** ************** ** * * * * * * ** * * **
XEN.LAE. CGCGCCTGTGAATA-GCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT
LEI.MAJ. CACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA-GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-----
* * ** ** * * * * * * ** * * **** *
Mean pairwise ID: 43.67%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC
** ** * * * ** ** ****** *****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
TRY.BR_B GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG
* * * * *** * * * * * ** ** ** * *** *
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* ** * * * * * ** * ***** * * *** * ****
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
TRY.BR_B GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
**** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * *
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----
* * ** ** * * ** * * ** * * * ***** * * *
Mean pairwise ID: 43.67%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG
** ** ** * ** * * * *** * * * * *
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCT--GTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* * * * * * * *** *** * * ** *** * ** * *** *
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG
* **** * ** * * ** **** ** ** ** *** * * **
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
TRY.BR_B GAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC
* **** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** * *
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGT-TGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT
TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT------
* * *** * ** * ** ** * ** * **
Mean pairwise ID: 43.69%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
********** ******* *
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* *** * * ** *** ***** * **** * * * * ** **** **
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_C CACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** ***************************** ** ****** * * *********
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
TRI.AE_C TAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGT--AGCCTACTCCAGCGACCACC
********** *** *** * * ** ** ** **** * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
TRI.AE_C ATC------
**
Mean pairwise ID: 43.69%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G
* *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * *
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
**** ** * ** * * * * * * ** * * ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGG
TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
**** ** ** **** ** * ** ******* * *** * * **** * *
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGC---ATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG
** * * ** * ** * ** * * * **** ** ** * ** *
ZEA.MA_G ACCATCTTT
TRY.BR_B GTTT-----
Mean pairwise ID: 43.69%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
* * * ******* * *** * * * * *
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTG--TTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
LEI.MAJ. CGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGTGT
* * ** ** * ****** ** *** * * * ** **** *
ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LEI.MAJ. CGGTGTGGCTTGCCC---CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAG--CGAGGG
* *** * ** ** *** * * * * * * * * *** *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCAGCAGTGGACGG
LEI.MAJ. AACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGA
* * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * *
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCC-GCTTGAAC
LEI.MAJ. ATCACA---CCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* ** * ** ** **** * ** * **** * ** *
ARA.TH_G CACCATTTT
LEI.MAJ. ---------
Mean pairwise ID: 43.71%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCG-GA
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTG--TCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGA
* * *** ** * ***** * * * * * * * * **
GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAA
* * * * ***** * **** **** ** * * * **** * **
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA
* * ******* ** * * * ******* ***
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** **
GAL.GAL. AT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCT
TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT-CGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----
** * * * ** * ** * * * ** *** **** *
GAL.GAL. CC
TET.THE. --
Mean pairwise ID: 43.71%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTA--CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAG-
** * ** ***** * * * ***** *****
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
LEP.COL. -CTGTCTGGACC--AGCATAGGGTGCT-TGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTG-GCTG
* ** ** * * * *** * *** * * ** ** * **
HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG
** * * * ** ** ** * ** **** * ** * *** * *
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
LEP.COL. AG-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTGCAG
* **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** * *
HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
LEP.COL. AACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT----
* * * ** ** * ** * ** * ** ** * * ** *
HOM.SA_B CT
LEP.COL. --
Mean pairwise ID: 43.71%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
*** * * * ***** * * ** *** * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G
* *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * *
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
TRY.BR_A TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA
** ** * * * * * ** * * * * * * ********** ***
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCAC
** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * *
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCT
TRY.BR_A ACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------
** * * * *** * * **** * * ** * * *
LYC.ES_A TT
TRY.BR_A --
Mean pairwise ID: 43.71%
DRO.MEL. ---------GACTG-GAAGGTTGGCAGCTTCTGTA-----ATCACGCTTCTGTGAGGTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
** ** * * * * * ** ** * * ***** **
DRO.MEL. G--ATTGTGGGATGGCCTGAGGCTGGGAT--CTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGA
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC
* * * * ** * * ***** ******* * * ** ** ****
DRO.MEL. CGGAACGTCCGCACTAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTC
TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
* **** **** ** ***** ** ** * ****** *
DRO.MEL. AGGTTGGCTAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCG
TRI.AE_A ACAGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGC-AGCGACAACTGCCCGCTTCCAA------CGG
* * * *** ** * ** * ** ** * * ** ** **** * *
DRO.MEL. TGGTAGGCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATAT
TRI.AE_A TGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAG--
*** *** * * ** ** * * ** * ***** * * *
DRO.MEL. GGTTGGACCACAATCTTT
TRI.AE_A ---CAGACCACC------
******
Mean pairwise ID: 43.73%
LYC.ES_K -GTTG--AGCTTAGTAACGTGGGC--TTGTAATCCAAGTGGA---GACATCAAAGTGGTT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
** ** ** * * * * * * * * * ** ***
LYC.ES_K GAATATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCTCATGTTGAC---GGAACGTCCGCACT
* **** * *** * ** * * * ** ** * ** *
LYC.ES_K AAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
**** * * * * * ** *** *** * * **** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
** * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA
***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
DRO.MEL. CCACAATCTTT
* ** * ****
Mean pairwise ID: 43.73%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** ***
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-TGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTG--CTTG
* *** * * * *** * *** *** * ** * * * * *
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTC-GCGCCGTTAAAGTGG
**** ** ** ** ** * * * * * * **** ** * ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGAC-TCCCAACGGTGG
TRY.BR_A GGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG
**** ** ** **** ** * ** ******* * *** ** * ** *
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
TRY.BR_A AAGCACACCGAGGA----GCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTC--GCGAG
** * * *** * *** * * ** * ** * * ** ** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRY.BR_A GCGG-------
*
Mean pairwise ID: 43.75%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG
** ** *** ** *** *** * *** * * *
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * * * * ** * * ** ** * *** *** * * * *** **
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG
** *** ** ** * * * *** *** * * ***** * * * * *
CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGT-GCAGTGGCC
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCAC--CCCACGCACGTCCGCCGTTGCA
** ** ***** * **** * ***** * * ** *** ** ** ** **
CAE.EL_B GGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----
* * * * *** ** * ** * * * * **
CAE.EL_B TTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.75%
LYC.ES_I GCCG-AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGC--TTAGCGGGGAGGACG---
**** **** * *** *** * ** ** *** * ** ***
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LEI.MAJ. ----TGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC
** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LEI.MAJ. GGTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAA
* *** * ** *** * * *** * *** * * * * *
LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTC-TAAGCGGTGGAAGGATA
LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCC-CACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATC
* ** **** ** ** ***** * * *** * * ** ** * ** **
LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCA---TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT---
** *** * ** ** * *** * * * * * * * **
LYC.ES_I TTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.75%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
YAR.LI_B --------AGCTGTAATGGCATTT---TGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG--TG
*** ** * * * *** * * ** ** * * * *
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG-AGTTG
YAR.LI_B CGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTG
* *** * ** ** * **** ** ** *** ** ** ****
TET.THE. CTATG-GTGGTAACCT-AGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG-GAAACG
YAR.LI_B ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATA
* * ** ** ****** ** * * * ** * *** * *
TET.THE. CCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACAT
YAR.LI_B CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGATAGCAA
* **** **** * *** ** * ****** * * * *** ** ***** **
TET.THE. ACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
YAR.LI_B CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----
* * * * * * * * * **** *
Mean pairwise ID: 43.77%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
*** * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * ** * ** * ***
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
CAE.EL_D TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA
* * *** ** *** *** ** * ** *** * * *** *
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
CAE.EL_D GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGC--GTGGTGCAG
* **** * ** ** * * * ** ** ****
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCAC---CATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA
CAE.EL_D TGGCCGGACCGCGCT-TGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA
* * ** * * *** * ** ** *** * * ** * * * **
HUM.LU_A CCATTTCTTTT--
CAE.EL_D CCACTTATCATTT
*** ** * *
Mean pairwise ID: 43.79%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG
* * * * * ******* **** ** * * *** *
LYC.ES_N GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
***** ***** * ***** * * * * * ** * * * *
LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
LEP.COL. GTCGGAG-GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* * * ** * **** *** **** ** * * *** ** *
LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC---CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** ** **** ** ** ***** * **** * * * * * *
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTTT-
*** * * * * *** ** **** * * * *** * ** *
LYC.ES_N ATTTTT
LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 43.79%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG-
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT
****** ** *** * ****** * * * * ** **********
CAE.EL_A -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA
* ** * * **** ** * * * ** * ** * ** * ****
CAE.EL_A GC-GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA-CAC-TAAAGTGG
* ** ** **** ** *** ** * **** * *** * *
CAE.EL_A CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA
** ** * * * * * ***** * * ** **** ** ****
CAE.EL_A CGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
ZEA.MA_H AGGA------TAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT--------------------
*** * ***** * * * ** *** *
CAE.EL_A TCATTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 43.81%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAG-GCTTGGGCTGTCGGATC
SCH.POM. -------------------CGCTGTAATG-GCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATA
******* * * * ** * ** * * **
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
SCH.POM. GTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACGT
* ** * * ** *** * * * * * ****** * * * * **
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
SCH.POM. CTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGG-------------CAACTGGCAGT--TAAACCGTGT
* * * * ** *** *** ** * ** * *** * *
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** *** * *** * * * * **** **
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACA-ACGGTCGTT
* *** ** ** * ** **** * * * * * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 43.83%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ****** ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGC-GGGGCG
***** ** * * * *** *** *** * * ****** ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * ******* ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAC-TAAACCA
* * * * * *** *** ** ** **** *** * ** * * *****
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_D CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 43.83%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * * ***** * * * * * * * **** * *
LYC.ES_K GGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
*** * ***** * * ***** * * * * * ** * ** * *
LYC.ES_K ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-
* * * * *** * ** * ** * ***** * *
LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC--CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG
* ** * * **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * **
LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
LEP.COL. AACCACACCGCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
* * *** * ** *** *** **** * * * * ** *
LYC.ES_K CCACCTTT
LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 43.85%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT
* * *** ** ***** * * * ** * * * **
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATG-----AGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * * * ***** * * * *** * * *** **** * **
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * ******* ** * * ** ******** ***
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT--CCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-----
* * * * ** * *** * * * ** *** **** *
ORI.CUN. C
TET.THE. -
Mean pairwise ID: 43.85%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTA--GAAT
* * *** ** * ****** * * * * ** * **
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* *** ***** * **** **** ** * * * *** * **
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * * ******* *** *
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** ***
GAL.GAL. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** ** * * * * **** **
GAL.GAL. C
TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 43.86%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAA---TAGTC
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCT
*** * * * **** **** * *** * ** * * ** *
TET.ROS. AGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTT
LEP.COL. GGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGG
** * * ** ** * *** * * * * * *
TET.ROS. GCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCC
LEP.COL. CCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-AGTAGAGGAACTGGG
** ** * *** * * *** * ** * * ** ** ******* *
TET.ROS. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT
LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACAC-CG
****** ****** ** *** * ** ** ** ** * ** * *** *
TET.ROS. CATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
LEP.COL. CGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
* ****** ** * * ** * * * *
Mean pairwise ID: 43.87%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
** * * * ****** ** ** ** * * * * *** *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * ***
HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * ** * * * **** ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
RAT.NOR. GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGAC
*** ** *** *** ***** * * ** * ** ** ** ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT
RAT.NOR. CCGTCTCT--
* * *
Mean pairwise ID: 43.87%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGA--CATTAAGATGGTGGGACAC
LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * * * ******* * *** ** * ** *
ARA.TH_A TGGTTCGGTTC-CTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT-
** * * * * * ** * ** * * ** * ** *** * **
ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA
LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG---TTAAAGTAGAG
* * * *** *** * ** ** * * * ** *** *
ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGA
LEP.COL. GAAC--TGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC
* ** ** **** *** ** ******* * ** ** *** * ** ** *
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
LEP.COL. AGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC----TGCGCCCCAGG--CGATCC--TGTGAA
* * *** * * * *** *** ** * * ** ***** * ****
ARA.TH_A CCACCATTTT
LEP.COL. GCTTT-----
*
Mean pairwise ID: 43.89%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * * ***** *** * * ***
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
YAR.LI_A TGC-GTTCGAGTC--TTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** * ** ****** * * * * ** *** *** * * *
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * *** **** ***** * * * * **
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTATGG
* * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * **
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
YAR.LI_A CGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT--ATGTTATGGAAGATATT----TACGATCACGAT
*** * * * ****** ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_O TTT
YAR.LI_A T--
*
Mean pairwise ID: 43.93%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT------TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACA
** * ** * ****** * * ** ***** * * ** *
XEN.LAE. CTTGAGT-CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTG-TCCGC---ACT
LEP.COL. GGGAGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTT-GCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCT
* * *** * ** ** ** ** **** ** ** **
XEN.LAE. AAGT-TCGGTATCAATATGGTGTTCC--TGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA
LEP.COL. GTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCC----TCCGTTAA
** **** * **** ** ** * ** ** * ** * * ***
XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGT
LEP.COL. AGTAGAG-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT
* * * **** ** **** *** ********** ** * * * * * * **
XEN.LAE. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACA
LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
* * * * * ** ** * * ** * * * * ** *
XEN.LAE. GTTCT
LEP.COL. -----
Mean pairwise ID: 43.93%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGA-AATGGGACTTTAGTT
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT--CT
*** * * * ******** * *** ** * * *** * *
HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCA-TTCCAAGCCGAG
TRY.BR_A TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT
** * * ** ** * * ** **** ** **** ** * * **
HUM.JA_B AGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA
TRY.BR_A GTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGTGGGGGG-AA
* * * * * * * *** ** ** ***** ** *** **
HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA
* ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** ** * *
HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTT
TRY.BR_A CACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGG--------
* ** ** ** * * * ** * * * * * *
HUM.JA_B CTTTT
TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 43.93%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ****** **
LYC.ES_A AGTTGGATC--TCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
**** * * * **** * **** * ***** ** * * * *** **** *
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
***** ********************** ** ** ****** * **********
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCA
** *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** ***
LYC.ES_A CCTTT
TRI.AE_C TC---
*
Mean pairwise ID: 43.95%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** * *** * * * * *** *** * *****
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * *
LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCG-----TAAAGTG
YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * *** * * * * * ** *** * ** **** *** *
LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATA-AGTTTCCGCTCTAA--GCGG
YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG
** ** * * ** *** * **** *** **** *** * ****
LYC.ES_B TGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATT
YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-----
*** * *** * *** * * * *** * * * ***
LYC.ES_B AAACCACCACTTTT
YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 44.01%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTGT
TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA
*** ****** ****** **
ARA.TH_G G-AGTGAACCGTATGAA--CCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGG-CCTCACGGTCCATAATG-TGGCAG
* **** **** ** * * ***** *** * ** ***** *** * * * *
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* * **** ************************ ** ****** ** * ***** **
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCC-------TCGTAGCCTACTCCAGCG
* ***** ** ** * * ** ** ** * ***** ** ** * *
ARA.TH_G ACCATTTT-
TRI.AE_C ACCACCATC
**** *
Mean pairwise ID: 44.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGACAGGAG
**** ** * ** *** ******* ** *** * * *** * * * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
RAT.NOR. GATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
* * ** * * * * * * * ** * ** * * * ** *** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------CC
***** * * ** * ** ** * ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
RAT.NOR. TAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGA
*** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
RAT.NOR. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-CCAGCCTGGG----CAACA
** ** * **** * ** ** * * ** * *** * * *
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
RAT.NOR. TAGCGAGAC-CCGTCTCT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.03%
LYC.ES_M --------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGG
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGC-GTTCGAGTT--
** ** ** *** * * *** ** ** * ** *
LYC.ES_M CTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACG
YAR.LI_B CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGAT-GGG
**** ** * ******* *** * ** *** *** * * * * * *** *
LYC.ES_M AGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG
YAR.LI_B CGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTG-----GGATA
* * * * ** ***** **** * * * ** * ** *
LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGA-AGGATAATGGGTCGGTG
YAR.LI_B CTTCAGTGGAGCAATC--CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCA
* ***** * **** * ** ** **** * * **** *
LYC.ES_M TCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
YAR.LI_B ----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACTCTC---
* **** ** * *** * **** * * ** *
Mean pairwise ID: 44.05%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA--GGTGGTGCGGATT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
* * *** ******* ******* ** * * * * *
ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC-
LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGT-GCTCTGCTTGGCTG
* * * * ** * *** ** ** *** * **** * *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT
** ** * * ** * * ** * * * * * * * * * ****
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCG-TT
* ***** * ** **** *** ** ******* * ** * * ** ** *
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
LEP.COL. GCAGAACCACA--CCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGC
* ** * ** **** * * * * ** **** ** ** * **
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
LEP.COL. TTT--------
Mean pairwise ID: 44.05%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
* * * * * * * *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * ** ** * * ** * * * * * *** * ** * ******
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG
CAE.EL_B GCTGCGTCA--CCAGGGGA--TGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
* * * **** ** * ** ** * * * * * *
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******* *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAG--TTGA--CACGTATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCAGAC
** * ** *** * **** ** * ** * * * * * ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT-
CAE.EL_B CACTTGTTTTT
** ** ****
Mean pairwise ID: 44.05%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * ** ** * ** ***** * * * * * * *** *
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
**** * ** ** ** ** * ** * **** * ** ****
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
** ** ** * * * * * ** * * ** * *** * *** *
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
* * * ** *** * * ***** * * ** * *******
ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC
CAE.BRI. GGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTC----TCTGATACCTTC-AGAC
**** ** *** * ** * * *** * *** ** * ***
ARA.TH_D CACCACTTT--
CAE.BRI. CACTTGTCATT
*** *
Mean pairwise ID: 44.06%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGCCCGCCG
**** ** * ** *** ******* ** *** * * *** * * * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
GAL.GAL. GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG-CCGAGCGGGC--GTCCGC
* * ** * * * ****** ** * * * * ** *** * ***
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
GAL.GAL. GCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCC----CGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTG--
* *** * * ** * * * ** * * * * *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
GAL.GAL. CCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCC
***** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
GAL.GAL. GGTCAGTAACGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGG---CAA
** ** **** * *** * * * ** * ** * * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
GAL.GAL. CATAGCGAGACCCTGTCTCC
* * * * * ***
Mean pairwise ID: 44.08%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCAATACCTGT------GTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG
* *** * *** **** * * * ** ** * * * * *
DRO.MEL. TGA-GGCTGGGATCT-ACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTT--TGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA
*** * * **** * * * * * *** * ** * * * * **** * **
DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG
TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA
* * ***** * * ** * * * * **** ***
DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG
TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
* *** ** **** * ** * *** ** * ** *** * ** * **
DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCG---TTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAAT
TET.THE. ATAACATACTC--ATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT---
*** * *** * **** * * *** * * ** * * ***
DRO.MEL. CTTT
TET.THE. ----
Mean pairwise ID: 44.08%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG
** ** *** ** *** *** * *** * * *
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * * * * ** * * ** ** ** *** *** * * * *** **
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG
* *** ** * * * * ** *** * * ***** * * * * *
CAE.EL_A TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAG
* ** ***** * **** * ***** * * * * *** ** ** ** *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGC--ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* * * * *** * * ** * * ** * * * ** ***
CAE.EL_A ATTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 44.12%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCT--TAGCGGGGAG
* * *** * ****** * * * * *** * * * * *
LYC.ES_C AACATGC-CCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
LEI.MAJ. GACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCT---GTGT
** ** **** * * *** ** * * ** **** * *
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
LEI.MAJ. GTCGGTGTGGCTTGCCC-CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GA
* ** * **** ** ** *** * * ** * * ** * *** * ** *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAAT
** * ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** **
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LEI.MAJ. CACACCGCGGAG-CATGTCCGC---ACTTGAGCCCCACGCTTCGTC---GCGAAGCCTT-
** * * * *** * * ** * * * * ** * ** *
LYC.ES_C ACATTT
LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 44.12%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG
* * * * ******* ****** ** * * *** *
LYC.ES_I GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
***** ***** * ***** * * * * * ** * * * *
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
LEP.COL. GTCGGAG-GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* * * ** * **** *** **** ** * * *** ** *
LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC---CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** ** **** ** ** ***** * **** * * * * * *
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTTT-
*** * * * * *** ** **** * * * *** * ** *
LYC.ES_I ATTTTT
LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 44.12%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TRI.AE_C ----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGT
********** ******* * *
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCA
TRI.AE_C AGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
*** * * ** *** ***** * **** * * * * ** **** ****
HUM.LU_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************ **************** ** ****** ** * ***********
HUM.LU_B ACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCT-ACTCCAGCGACCACCATC
******** *** * * * ** * * * * *** **** *****
HUM.LU_B TCCTTT
TRI.AE_C ------
Mean pairwise ID: 44.12%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTG-TGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG
LEP.COL. ------------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGC-TGAACA
* *** **** * ** * **** * * * ** ** *
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LEP.COL. GGG--AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGG
* * ** * * ** * ** * * * * *** *** * * * *** *
CAE.EL_C CGCTGCGTCA----CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
LEP.COL. CTGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-A
* ** *** ** ** ** * * *** ** * ** * * * * *
CAE.EL_C GTGGTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
LEP.COL. GTAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTG
** * *** *** ***** * * ** * ***** * * * * ** *** ** *
CAE.EL_C CCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT
LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
* * ** * * *** * * ** * ** * * * *
CAE.EL_C GTCACT
LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 44.12%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
LYC.ES_D -----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA
* ** **** ****** ******* **
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACC
** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * *
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
LYC.ES_D GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
** ********* ************ ** * ********* ***************
HUM.LU_B GGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
LYC.ES_D GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG--GTTGCTCC-AACTAAACCACC
*** ***** ** ** ** * * * *** * *** ** ****
HUM.LU_B TCCTTT
LYC.ES_D ACTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 44.12%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * ******* ****** * ** * * * *
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** *
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TRY.BR_A TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** ***
LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
**** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** ** *
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
** ** * * * * **** * * ** * * *
LYC.ES_I ATTTTT
TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 44.12%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTG-TGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
LEP.COL. ------------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGC-TGAACA
* *** **** * ** * **** * * * ** ** *
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LEP.COL. GGG--AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGG
* * ** * * ** * ** * * * * *** *** * * * *** *
CAE.EL_B CGCTGCGTCA----CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
LEP.COL. CTGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-A
* ** *** ** ** ** * * *** ** * ** * * * * *
CAE.EL_B GTGGTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
LEP.COL. GTAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTG
** * *** *** ***** * * ** * ***** * * * * ** *** ** *
CAE.EL_B CCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT
LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
* * ** * * *** * * ** * ** * * * *
CAE.EL_B GTTTTT
LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 44.13%
TRY.BR_A AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCT-TCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCT
*** * * * **** * * * ** ** * * *** ** *
TRY.BR_A GGAC---AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGC--TTGGTTG-CGTGTCG
YAR.LI_B GGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCG
**** * *** * ** * ** * * ****** *** * * *** ***
TRY.BR_A GTGTTGA-GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGT
YAR.LI_B GTCTGAGTAATCGGCTTTG-AGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAG
** * *** * ** *** ****** * * **
TRY.BR_A CAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGA
YAR.LI_B CAATCCAGCAGAGATCCAGTT-GCCGTGGGTATGG---CGGTGGGATAGCA-ACAAAGTG
** ** * * *** ** ** * * * ** * * **** ** **
TRY.BR_A GCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
YAR.LI_B GTATAT----GTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
* ** * * ** * ** ** *** *
Mean pairwise ID: 44.16%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_D --------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
**** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCC--AACTAAACCA
** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * ** ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_D CCACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 44.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G
* *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * *
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
**** ** * ** * * * * * * ** * * ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTCG
**** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** *
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
TRY.BR_A AGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG
** * *** * *** ** * * * **** ** ** * ** *
ZEA.MA_D ACCATCTT
TRY.BR_A G-------
Mean pairwise ID: 44.16%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** *** * * ** ***** *** * * * ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * *
LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
YAR.LI_B CTGCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * *** * * * * * ** *** * ** **** * *
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA-AGG
YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAG--AGATCCAGTT----GCCGTGGGTATG
* ** * * ** ** *** ** *** * * ** **** * *
LYC.ES_H ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
YAR.LI_B GCGGTGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGAC
**** * * **** ** * *** * **** * * **
LYC.ES_H CACCTTTT
YAR.LI_B TCTC----
*
Mean pairwise ID: 44.16%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G
** * * * ******* * *** * * * * ** * *
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCG------TTGACGTGGTGCTCTGCTTG-GCTG
** * ** * * ** ** * ** * * *** * * ****
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAG-GCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LEI.MAJ. TGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGG
** ** * * * * ** * **** * * * * ** ** ***
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGACG
LEI.MAJ. GAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAG
* * * ** **** ** ** ******* * ** * *** * ** ** * *
ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG-TCGCG---AAGCC
***** * * ** * **** *** * * ** ** * * **
ARA.TH_A ACCATTTT
LEI.MAJ. TT------
Mean pairwise ID: 44.16%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGG--CAACAATGTGGTGGAATGT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * * * * ******* * *** ** ** * *
LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGG-GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCT-TGGCTGTGTG
** * * * ** * * ***** * * * * ** ** **** ** * *
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTAT-ACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
LEP.COL. TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-G
* * *** * * * *** ** * ** *** *** * *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAGG
LEP.COL. AACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA
**** ** **** ** ** ***** * * * * *** * * *** ** * **
LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA
LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCT-----GTCATCACCTGCGCCC--CAGGCGATCCTGTGAAGCTT
* *** * ** *** * ** ** *** * * ** *
LYC.ES_F TCACTTTT
LEP.COL. T-------
*
Mean pairwise ID: 44.16%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * * ***** * * * * * * * **** * *
LYC.ES_J GGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
*** * ***** * * ***** * * * * * ** * ** * *
LYC.ES_J ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-
* * * * *** * ** * ** * ****** * *
LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC--CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG
* ** * * **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * **
LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
LEP.COL. AACCACACCGCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
* * *** * ** *** *** **** * * * * ** *
LYC.ES_J CCACCTTT
LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 44.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G
* *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * *
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
**** ** * ** * * * * * * ** * * ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTGC
**** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** *
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
TRY.BR_B AGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG
** * *** * *** ** * * * **** ** ** * ** *
ZEA.MA_D ACCATCTT
TRY.BR_B GTTT----
Mean pairwise ID: 44.16%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGTAATCT-GTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG
***** * * ** ** *** ** * * ****** *** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * **** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC-CAACTAAACCA
* ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * ** * ** ****
ARA.TH_D CCACTTT-
LYC.ES_D CCACTTTT
*******
Mean pairwise ID: 44.19%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG-
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC
* ** * * *** * ** * ** * * * * *** * * **** **
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG-ACCTGAAGCG
CAE.EL_D AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
*** ** * * ** * * ** * * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
CAE.EL_D TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGC-AGTGGCC
* * **** * * * ** * * *** * * * * **
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
CAE.EL_D GGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCA---GACCACT
*** * * ** ** * ** * ** * * * *** **
ZEA.MA_F CACCATCTTT
CAE.EL_D TATCATTT--
* *** *
Mean pairwise ID: 44.19%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** *********
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
* * * * * ***** * * * * * **** *****
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAG-GGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
** *** ** ** ** * * * * * * ** * * ** * *
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTT-CACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTG----CAGTGGCC
* ***** *** * ** *** *** ** * * * ****
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
CAE.BRI. GGATAGC--GCTTGTG-AGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT
***** * ** ** ** ****** * **** * * * *
ZEA.MA_C CACCATTTTT
CAE.BRI. TGTCATT---
****
Mean pairwise ID: 44.19%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC
** * ** * * * ** ** ****** * *
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRY.BR_B GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG
* * * * *** * * * * * ** ***** * ** *
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG
** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ***
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
TRY.BR_B GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
* **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * *
CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT---
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * *
CAN.SPE. T
TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 44.19%
CAE.EL_A -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCT-TTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTG
* **** * * * *** * * * * * * * * ** **
CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LEP.COL. GACCAGCATAGGG-----TGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT---G
** * ** ** * * ***** * ** * * * * *** *
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
LEP.COL. TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGG
* * * ** ** * ** * ***** ** * *** * *** ** *
CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC
LEP.COL. -AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGAAC
*** ***** * * ** * ***** * * ** * *** *** ** ** * **
CAE.EL_A CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATT
LEP.COL. CACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--------
* * * *** ** ** ** **** * * * *
CAE.EL_A T
LEP.COL. -
Mean pairwise ID: 44.19%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAA-TGTGGTGGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* * ** ** ** ** **** ** ** * **** * * * * ***
LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCCA
GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* * * * * ** ****** *** **** * * ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * **** ** * * ** * * * * *** * **
LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
** * * * *** ** ** ***** * ** * ** * * **
LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTG----GGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * *** ***** * * * **
LYC.ES_N CACCATTTTT
GAL.GAL. C-CTGTCTCC
* * * *
Mean pairwise ID: 44.19%
CAE.EL_D -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCT-TTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTG
* **** * * * *** * * * * * * * * ** **
CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LEP.COL. GA-CCAGCATAGGGTGCTTGCG-GCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGC-TGTGTGTCGGA
** ** *** * ** * ** * *** ** * ** * *** *
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
LEP.COL. GGC-----CTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGG
** * ** ** * ** * ***** ** * *** * *** ** *
CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC
LEP.COL. -AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGAAC
*** ***** * * ** * ***** * * ** * *** *** ** ** * **
CAE.EL_D CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATT
LEP.COL. CACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--------
* * * ** ** * ** **** * * * *
CAE.EL_D T
LEP.COL. -
Mean pairwise ID: 44.19%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCA----TGTGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * ** * * ** *** * ** ** * * * ** *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
* ** * * * * *** *** * * * * * ** * ** ****
ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
** ** ** * * * ** * * **** *** * *** *
ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
* * * ** *** * * ***** * * **** ******* *
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAA
CAE.BRI. GGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATAC--CTTCAGACCAC
**** * ** * ** * * * * * **** *** * * *** * *
ARA.TH_E CCACCATTTT
CAE.BRI. TTGTCATT--
****
Mean pairwise ID: 44.19%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATC-CAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTA--GAAT
* * *** ** ******* * * * * * * ** * * * **
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAG-----TTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* *** ***** * *** * ** * * *** **** * **
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * * ******* * * * ******** * *** *
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
* *** * **** ** *** * **** *** *** ** * ***
FUG.RUB. T--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT-----
* * * * * ** * * ** * *** ** *** *
FUG.RUB. T
TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 44.19%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
* * * **** * * *** * * **
CAN.SPE. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * ** ** ******* *** **** * * ** ** * **
CAN.SPE. GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTGG
* * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * **
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_M GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACCC
LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
**** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * *
CAN.SPE. CGTCTCT---
LYC.ES_M AACCACCTTT
* *
Mean pairwise ID: 44.19%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** ** ** * ** **** ** * *** * * * * ***
LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCCA
GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* * * * * ** ****** *** **** * * ** * *
LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * **** ** * * ** * * * * *** * **
LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
** * * * *** ** ** ***** ** * *** * * **
LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCC---TGGGCAACA-TAGCGAGAC
**** ** * * *** * * *** *** ***** * ** * **
LYC.ES_B CACCACTTTT
GAL.GAL. CCTGTCTCC-
* **
Mean pairwise ID: 44.19%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
** * * * * ****** ** ** ** * * * *** *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * * ***** ** * ** * * *** ** ** ** * ***
HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * ** * * * **** ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
HOM.SA_B GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA--TAGCGAGAC
*** ** *** *** ***** * * ** * * ** ** ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
* *** *
Mean pairwise ID: 44.20%
ARA.TH_G ------------GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCAC-GCTTCTG---TGAGGTCTGATTGTGGGAT
* * * ***** * **** * ** ** * * ***
ARA.TH_G GGTGGAACACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCC
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCT-----CATGTTGACGGAACGTCC
** * **** * ** **** * * *** *** * **
ARA.TH_G AATCCAAGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTAC-GGTTGCTA
DRO.MEL. GCACTAAGCTTGCCATCAAT-ATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCT
* ***** * ** * * *** * ** * * * * *****
ARA.TH_G AAGGTTGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAG
DRO.MEL. AAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGG
**** * * * * * *** ** * ****** * * ***** * *
ARA.TH_G CAGTGGACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACC
DRO.MEL. CAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCG--ATA
**** * *** * ** ** * * * * ** ** ** *
ARA.TH_G CGCTTGAACCACCATTTT-
DRO.MEL. TGGTTGGACCACAATCTTT
* *** ***** ** **
Mean pairwise ID: 44.20%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGCTGGAG
**** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
HOM.SA_A GATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
* * ** * * * * * * * ** * ** * * * ** *** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
HOM.SA_A TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------CC
***** * * ** * ** ** * ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
HOM.SA_A TAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGA
*** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
HOM.SA_A TCAGTAGTGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG---CAACA
** ** * **** * *** * * * ** ** * * * *
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT-
HOM.SA_A TAGCGAGACCCCGTCTCTT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.22%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
** * * * *** **** * * * *** * *
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTG-CGTTG-ACTTGGTGTTC---TGCTTGGTTGC
***** *** * ** ***** * * * ** *** * * * * ** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
TRY.BR_A GTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG--
* ** *** ** * * ** * ** * * *** * * *****
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
TRY.BR_A AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAG
** * ** **** *** ** **** ** **** * * * ** ** *
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGC-TAGCCCAACAGGACACCCA
TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------
*** **** *** *** * ** ** * * ** * *
CIN.HYB. TTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 44.22%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTC-TGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGT
* *** * *** **** * * ** * * * ** * * ** *
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
TET.ROS. CAGAGTATGAGAGTT------TGATGAGACAGTT--TGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* *** ** ** * * * *** * ** * * * * *** * **
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ***** * * ** * * * **** *** **
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** **** * ** * *** ** * ** *** * ** * ***
DRO.MEL. TAGCGTACCGGAGTGGACTGCCG---TTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
TET.ROS. TAACATACTC--ATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----
** * *** * **** * * *** * * * * ** * ***
DRO.MEL. TTT
TET.ROS. ---
Mean pairwise ID: 44.23%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
**** ** * * *** * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * * **** * * * * ***** * * * **** * * ***
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCAG
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** ** * * * * ** *** * * * * *
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
CAE.EL_D CTTATCATTT--
* *** *
Mean pairwise ID: 44.23%
ARA.TH_C --GTCGAAC-TCAGTAACGCGGGC--TTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* *** * * * * * * * * * * ** *******
ARA.TH_C CGTTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTC
DRO.MEL. TGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAG----CGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC
* ** * * * ** * * *** * ** ** ** ** ** *
ARA.TH_C CAAGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGT
DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** * ** *** ** *** *
ARA.TH_C GGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTG
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA
*** **** * *** *** * ****** * ***** * * * **
ARA.TH_C GAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG
DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGG
* **** ** ** * * * * * * * * *** * * ****
ARA.TH_C ACCATCACTTT-
DRO.MEL. ACCACAATCTTT
**** * **
Mean pairwise ID: 44.23%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
**** ** * * *** * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAG-CGACCGCGTGGTGCAGT
* * * **** * * * * ***** * * ** **** * * **
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCA
CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
** *** * ** * * * * ** *** * * * * *
ZEA.MA_D GACCACCATCTT
CAE.EL_D ACTTATCATTT-
* *** *
Mean pairwise ID: 44.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ****** **
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** ** ***** * * * * *** **** * *
LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************** *********** *** ** ****** * ***********
LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGG-CCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCA
**** *** *** *** ** ** * **** * * ** ***** *******
LYC.ES_G CTTTT
TRI.AE_C TC---
Mean pairwise ID: 44.26%
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAA-TACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG--TGA
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGT
** * ***** * * * *** * * ** ** ** **** ** **
TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGT-TTGCTAAGAGTG---TGCCCGCTCCAAA
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTG--GGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAG
* * * * * * ** * *** * * ** *** *** *****
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCG-
* ** * * * * * * * ** * ** * ** ***** *
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
* * ** * ******** * *** *** ** ** **** * ********
TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------
***** * ** * * ***
Mean pairwise ID: 44.27%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT-----GGGGGCAACAATGTGGTGGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
**** ** ** ** ** **** ** ** *** * * * ***
LYC.ES_F TGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGC-CCTGTCCA
GAL.GAL. CGCTTGAGCC--CAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-CGAGCGGGCGTCCGCGCT
* * * ** * ** ****** * * *** * ** ** * * *
LYC.ES_F AGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCC-TTTAGAGTG
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG
* * * * * *** * * * ** *** ** ** * *
LYC.ES_F GGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGG
GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA
** ** ** * *** ** ** ***** * **** * * ****
LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGA--TAGGTTGCCTAATT
GAL.GAL. CGGGATCGCG---------CCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCG
***** ** ** *** * ** * * * * ** * **
LYC.ES_F AAACCATCACTTTT
GAL.GAL. AGACCCTGTCTCC-
* *** * **
Mean pairwise ID: 44.30%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT
*** * **** *********
ARA.TH_C GGGAGTTGAG--GCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTT-GGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCA
* * ** ** **** ***** * * *** **** * ** ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* *************** ************** * ** ****** **********
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCA
*** ******* *** *** ** ** ** * ** ** * **** *****
ARA.TH_C TCACTTT
TRI.AE_C CCATC--
**
Mean pairwise ID: 44.30%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA
LYC.ES_M ---------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATAT---TGGGCTGTCCCAG
* *** ** * *** * * * * *
TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT
LYC.ES_M ATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCT----GGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGG-
* * * *** ** * * *** * ***** ***** ** ******
TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCCT
LYC.ES_M ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGG-GGCGGACCGCAT
** * ** * * * * * * * ***** * * * ***** *
TET.ROS. CAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATAC
LYC.ES_M GAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGT
******** ***** *** *** * * ***** ** ************
TET.ROS. TCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACACT------
LYC.ES_M CGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
* * ***** * * * * * ** ** * **
Mean pairwise ID: 44.30%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
* * * * * * *** * * * ** * ** *** * * * *
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCT-ATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTT---GCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG
* * ** * ** * ** * * * * ** * **
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
LEI.MAJ. TCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGT----TGAAGCGAGGG
* ** ** * ** * * *** ****** ** * ** * ***
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTC-TTGACGGTGGAAG
LEI.MAJ. A-ACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAG
* **** ** **** ** ** ******* ***** * *** * * * ** * **
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTC---CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCT
** ** * ** * * * **** *** * ** *** **
ARA.TH_C TCACTTT
LEI.MAJ. T------
*
Mean pairwise ID: 44.34%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * * * * *
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** * * * * ** *** ** * * * * * ** * ******
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
** * * * *** ****** * * * * *** *** *
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
* * * * * * * ***** * * * **** ******* **
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
CAE.EL_A AC--CGCGCTTGTG--AGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGACCAC
* ** * *** * *** *** * * * * * * ********
HUM.JA_A CTCTTTT--
CAE.EL_A TTATCATTT
* * *
Mean pairwise ID: 44.34%
LYC.ES_E ---GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG-GGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
** ** * * * * * * * ** * ** * * * * * ****
LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* ***** * ** ** * * ** ** * ** * ***
LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
* *** ** *** * * * * **** * ***
LYC.ES_E TGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
DRO.MEL. TGAACC-GGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG
** *** * * *** * **** * ** * * *** * ***** * **
LYC.ES_E ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA
DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTG----GACTGCCGTTA---TCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCA
*** ** ***** * * * ** *** * * * * * * *** ** *
LYC.ES_E CCACATTTT
DRO.MEL. CAATCTTT-
* * ***
Mean pairwise ID: 44.34%
ZEA.MA_B -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATG
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG
* * ** * ** ***** * ** * * * * * * * * *
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGAC-TCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
* * * *** *** * ** * * * * *** * ** * **
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG
* * * * * ** ** * * * * * *** ** * *** * **
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTT-CCCGTGGTAGGCAGTAGT
* *** * * *** ** * ****** * * * *** * ** *
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACC
DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAA--CCGATATGGTTGGACC
***** * *** * ** ** * **** ** * * ***
ZEA.MA_B ACCATCTTT
DRO.MEL. ACAATCTTT
** ******
Mean pairwise ID: 44.37%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT
* * *** ** * ***** * * * ** * * * **
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * * * ***** * *** **** * * *** **** * **
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * ******* ** * * ** ******** ***
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT--CCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-----
* * * * ** * *** * * * ** *** ****
RAT.RAT. TT
TET.THE. --
Mean pairwise ID: 44.37%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
** * * * *** **** * * * *** * *
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTG-CGTTG-ACTTGGTGTTC---TGCTTGGTTGC
***** *** * ** ***** * * * ** *** * * * * ** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
TRY.BR_B GTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG--
* ** *** ** * * ** * ** * * *** * * *****
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
TRY.BR_B AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG
** * ** **** *** ** **** ** **** * * * ** * ** *
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCAT
TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT----
*** **** *** *** * ** ** * * * * *
CIN.HYB. TT
TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 44.37%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC--
*** * * * ***** * * ** *** * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G
* *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * *
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
TRY.BR_B TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA
** ** * * * * * ** * * * * * * ********** ***
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC
** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** * ** * *
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCT
TRY.BR_B ACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT---
** * * * *** * * **** * * ** * * * *
LYC.ES_A TT
TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 44.37%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA----TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * ** * ** *** * ** ** * * * ** *
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
* ** * ** * *** ** * * * * **** * ** ****
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCT-CCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT
** ** ** ** * * * ** * * **** * ** * ** *
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
* * * ** *** * * ***** * * **** *******
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGA
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATAC--CTTCAGACCA
***** ** ** * ** * * * * * **** *** * * *** * *
ARA.TH_A ACCACCATTTT
CAE.BRI. CTTGTCATT--
****
Mean pairwise ID: 44.37%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT
*** **** * * * * * ** ** * ** ***
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-TGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTG--CTTG
* *** * * * *** * *** *** * ** * * * * *
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTC-GCGCCGTTAAAGTGG
**** ** ** ** ** * * * * * * **** ** * ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGAC-TCCCAACGGTGG
TRY.BR_B GGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG
**** ** ** **** ** * ** ******* * *** ** * ** * *
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
TRY.BR_B AAGCACACCGAGGA----GCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTC--GCGAG
** * * *** * *** * * ** * ** * * ** ** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRY.BR_B GCGGTTT----
* *
Mean pairwise ID: 44.41%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
*** * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * * ** * ** * ***
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
CAE.EL_A TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA
* * *** ** *** *** ** * ** *** * * *** *
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
CAE.EL_A GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGC--GTGGTGCAG
* **** * ** ** * * * ** ** ****
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCAC---CATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA
CAE.EL_A TGGCCGGACCGCGCT-TGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA
* * ** * * *** ** ** ** *** * * ** * * * **
HUM.LU_A CCATTTCTTTT--
CAE.EL_A CCACTTATCATTT
*** ** * *
Mean pairwise ID: 44.41%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTG--GAT
*** * ** ** * ******** ** * *** ** * ** * * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * * * ** ** * * * * ** ** ** * ***
ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGT-CTTCTAGA
CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTC--AGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** ** *** *** ** ** *** * ** * * **
ARA.TH_C GTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAG
**** *** * ** * **** ** ***** * ** * * *
ARA.TH_C TGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATT
CAE.EL_C TGGCCGGACAGCGC-TTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC
*** *** ** * * * * ** * ** * * ** *
ARA.TH_C GGACCATCACTTT
CAE.EL_C CACTTGTCACT--
*****
Mean pairwise ID: 44.41%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG
*** ****** ****** **
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA
**** * *** ** ** ** ***** * * * * *** **** * *
LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
************** *********** *** ** ****** * ***********
LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA
TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGG-CCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCA
**** *** *** *** ** ** * **** * * ** ***** *******
LYC.ES_O CTTT
TRI.AE_C TC--
Mean pairwise ID: 44.44%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * ******* ****** * ** * * * *
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** *
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TRY.BR_B TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
* * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** ***
LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
**** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** * ** *
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
** ** * * * * **** * * ** * * *
LYC.ES_I ATTTTT
TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 44.44%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--CGGAGG
* ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * *** ***
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * *
ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** *
ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_D ATGGATCATA---GTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGC-TGGTTCGATCTCTC
ORI.CUN. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGT
***** ** ** * ** **** *** * * * * ** *
ARA.TH_D CTGGACCACCACTTT
ORI.CUN. CTCC-----------
**
Mean pairwise ID: 44.48%
HOM.SA_A ------GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTC-CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCT
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGT--CT
*** ** * ** * * * ** ****** * ** **** **
HOM.SA_A GGAGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
LEP.COL. GGACCAGCATA-------GGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG
*** * * ** * * *** * * * * * * * ** *** *
HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
LEP.COL. --------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAA
**** * **** ** * * **** * ** * **
HOM.SA_A GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
LEP.COL. GTAGAGG--AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT
* ** ** *** ** **** *** ********** ** * * * * * **
HOM.SA_A AGTGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCC
LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTT
* * * * * ** ** * ** * ** * ** ** * * ** *
HOM.SA_A CGTCTCTT
LEP.COL. T-------
Mean pairwise ID: 44.48%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG
* * * * ******* ****** ** * * *** *
LYC.ES_B GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
***** ***** * ***** * * * * * ** * * * *
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
LEP.COL. GTCGGAG-GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* * * ** * **** *** **** ** * * *** ** *
LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTC-TAAGCGGTGGAAG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG
* * ** ** **** ** ** ***** * * * *** * * ** ** * **
LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA
LEP.COL. AACCACACCGCGGAGC---CTGTCATCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTT
* ** *** * *** ** *** * * * ** * ** *
LYC.ES_B CCACTTTT
LEP.COL. T-------
Mean pairwise ID: 44.52%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
** * * * * ****** ** ** ** * * * *** *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * ***
HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * ** * * * **** ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
ORI.CUN. GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGAC
*** ** *** *** ***** * * ** * ** ** ** ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT
ORI.CUN. CCTGTCTCC-
* * ***
Mean pairwise ID: 44.52%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT
* * *** ** ****** * * * * ** * ** **
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATG-----AGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* **** ***** * * * *** * * *** *** * **
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * ** ******* *** *
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
ORI.CUN. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** ** * * * * * **** **
ORI.CUN. C
TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 44.52%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAG-GTTGTGAT
* * *** ** * ***** * * * ** * * ***
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * * ***** * *** **** * * *** **** * **
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * ******* ** * * ** ******** ***
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-----
* * * * ** * *** * * * * ** *** ****
HOM.SA_B T
TET.THE. -
Mean pairwise ID: 44.52%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
** * * * ****** ** ** ** * * * * ** *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * ***
HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * ** * * * **** ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
RAT.RAT. GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGAC
*** ** *** *** ***** * * ** * ** ** ** ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT
RAT.RAT. CCCGTCTCTT
* *** **
Mean pairwise ID: 44.52%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG-
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC
* ** * * *** * ** **** * * * * *** * * **** **
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG-ACCTGAAGCG
CAE.EL_A AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
*** ** * * ** * * ** * * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
CAE.EL_A TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGC-AGTGGCC
* * **** * * * ** * * *** * * * * **
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
CAE.EL_A GGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCA---GACCACT
*** * * ** ** * ** * ** * * * *** **
ZEA.MA_F CACCATCTTT
CAE.EL_A TATCATTT--
* *** *
Mean pairwise ID: 44.52%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * * ** * * ** *** * ** * ** * * ***** ***
LYC.ES_B AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
* ** *** * * *** ** * ** * ** * ** ***
LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT
*** * ** * ** ** **** * * * * * *** * *
LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA
CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
** * * ** *** * * **** * *** **** * ** ****
LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT
***** ** * * *** ** ** * **** * ** * *
LYC.ES_B CACCACTTTT
CAE.BRI. TGTCATT---
** *
Mean pairwise ID: 44.59%
TRI.AE_B -NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
LEP.COL. GCCGGAGCC--TTGC-----TCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* **** **** *** *** * *** ** * *
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
LEP.COL. TG-TCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT
** * ** * ***** * ** * ** ** **** * *
TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGG-GCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC
LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG-AGGA
* ** * ***** * ** *** *** * * * **** * ***
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTT-CCAACGGTGGAAGGAT
LEP.COL. ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC-CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAAC
** ** **** ** ** ******* ** ** *** * * ** * ** *
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA
LEP.COL. CACA--CCGCGG-AGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT----
*** **** * *** ** * * *** *** * * * *
TRI.AE_B TCTTT
LEP.COL. -----
Mean pairwise ID: 44.62%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATAAGTGTGGATG
****** ** *** * ** *** * ** * ** ** * ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGT-AATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
CAE.EL_B G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
*** * ***** * **** ***** ** * * * * ****
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTC--ACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAG--TCCCGGGTG
***** * ** * ** ** ** * * ** * * ** * **
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAG-GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
CAE.EL_B CATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC
* *** * * * * * * * * * * *** ** ** * *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
CAE.EL_B -----GCGGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCT
* ** * * ** **** * * * * * ** ** *
ORY.SA_A TACAAC----AGACCACCATCTTT-
CAE.EL_B CAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT
* ** ******* ***
Mean pairwise ID: 44.63%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCA-GTGTGGTGGAATGTT
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGG------
*** ** * * ****** * * * *** * * * **
LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG--TGTTCTG-CTTGGTTGC
* ** * * * *** ** *** * * *** ** *** * *
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGC-CAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
TRY.BR_A GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA
* ** ** * *** ** * * * * ** * * * * ** ********** *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRY.BR_A ACGG-GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCC-CGTTCGAGAAGCAC
** * ** **** *** * ** * * ** * ** ** * **** *
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTAC
TRY.BR_A ACCGAGG-AGCATCTCAGGACTTTG-----CGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
* **** ** ** * * ** * * * * * ** * **
LYC.ES_C CACATTT
TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 44.65%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAG
**** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * * ** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
HOM.SA_B GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATGGGGTGTCCGCAC
* * ** * * * * * * ** * ** * *** ** *** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------CC
***** * * ** * ** ** * ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
HOM.SA_B TAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGA
*** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
HOM.SA_B TCAGTAGTGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAG---CAACA
** ** * **** * *** * * * ** ** *** * *
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
HOM.SA_B TAGCGAGACCCCGTCTCT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.66%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTG---GGGACAATAAGGTGGTGGAACA
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGC--TGGCGGA
* ** * ** ** * ** *** * ** ** **** * *** *** *
ARA.TH_D GTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGAC-ATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
FUG.RUB. TCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* ** * ** * ** * ** ** *** ** * * * ** ** * **
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG
* * * * *** * ** * ** * * *** ** * *** **
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT
FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG
* * * *** ** ** ***** * *** **** *
ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC
FUG.RUB. GGATCGCGCCCGTGAAT-----AGA--CGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC
***** * * *** * ** * * * * * * * ****
ARA.TH_D CACCACTTT
FUG.RUB. TCAGTCTTT
****
Mean pairwise ID: 44.69%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT-
TET.THE. ----------GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG
** * ** * *** ****** * * * * ***
HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAG--CTGCTTGCTGGGC---TGCCCATTCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* ** **** ** ** * * * ***** * ***** ***** *
HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG--A
TET.THE. AATGAGTT--GCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA
***** *** ** * * * ** *** * * ** * *
HUM.JA_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA
** ** ** * ******* ***** *** ** *** * ***** * ******
HUM.JA_B GGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGA
TET.THE. GGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA--TCAAAGCCAGACATT-
******* * * * * * * * * *** * * * *
HUM.JA_B CCATTTCTTTT
TET.THE. -----------
Mean pairwise ID: 44.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGG-TGGCTGCGGAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGACAGAG
**** ** * ** *** ******* ** *** * * *** ** * **
ORY.SA_A GTTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
RAT.RAT. GATCGCT-TGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
* * * * ** * * * * * * * ** * ** * * * ** ***
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
RAT.RAT. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------C
* ***** * * ** * ** ** * ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
RAT.RAT. CTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTG
**** * ** * ** * *** ** ** ****** * ****
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
RAT.RAT. ATCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-CCAGCCTGGG----CAAC
*** ** * **** * ** ** * * ** * *** * *
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT-
RAT.RAT. ATAGCGAGACCCCGTCTCTT
* * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG
**** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
CAN.SPE. GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG---CCGATCGGGTGTCCGC
* * ** * * * ****** ** * * * * * * ** ***
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
CAN.SPE. ACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------
* ***** * * ** * ** ** * **
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
CAN.SPE. CCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCT
***** * ** * ** * *** ** ** ****** * ****
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
CAN.SPE. GATCAGTAGTGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG---CAA
*** ** * **** * *** * * * ** ** * * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
CAN.SPE. CATAGCGAGACCCCGTCTCT
* * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.70%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT--
* ** ** ** ***** * * * *** * **
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTT----GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC
*** **** * *** * * * * * * * * * * * **** **** *
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** **
CAE.EL_B GGATGGT-TCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGAT
* * * ***** * ** * *** **** **** ** **** ***
CAE.EL_B TGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTT
TET.ROS. AACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT-----
* ** * * ** ** * ** * * * * * ****** ***
CAE.EL_B TT
TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 44.70%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
TET.ROS. GCCAGG----GTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** ** ** ** ******** * * * *** * ** *
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGA-----GTGTGCCCGTTCCAAAC
** **** ** * ** ** * * * * * **** **** *
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
** ** ** * ** * * ** ** **** *** **
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGA-AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAT
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGAT
* ** ** *** * ** * **** **** **** ** **** ****
CAE.BRI. AGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
TET.ROS. AACATACTCATTAACTGTCAA--GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* * ** * * **** ** * * *** ** * ****
CAE.BRI. TT
TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 44.72%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGG
*** * * * **** **** * *** * *** * * *
TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT
LEI.MAJ. ACCAGCGAG---GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTGTGTCGGT
* *** * *** * * * * **** * * * * *** ** * *
TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGG-AACCGCCTC
LEI.MAJ. GTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTC
*** ** * *** * * * * ** **** ***** **
TET.ROS. AGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACTCA
LEI.MAJ. AGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGT-CCGCCGTTGCAGAATCACAC-CGCG
**** ** *** ** *** * * * * * * ** * ** ** *** * *
TET.ROS. TTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-
LEI.MAJ. GAGCATGTCC-GCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
**** ** * * * * *** * * **
Mean pairwise ID: 44.73%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
**** ** * * *** * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAG-CGACCGCGTGGTGCAGT
* * * **** * * * * ***** * * ** * ** * * **
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCA
CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
** *** ** ** ** * * * ** *** * * * * *
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT--
* *** *
Mean pairwise ID: 44.73%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAAC--TCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * *** * * ****** ** * * ** *** * *
LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
LEP.COL. TGTCTGGACC---AGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGG--TGCTCTGCTTGGCTGT
** ** * ***** ** * * * *** *** ***
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGG-----CCAAGC-GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTG
LEP.COL. GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCT--CCGTTAAAGTA
* * * * *** ** ** ***** * ** * * ******
LYC.ES_C GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTG
LEP.COL. GAG-GAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTT
* * * **** ** **** ** ** ***** * * *** *** * * *** **
LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA
LEP.COL. GCAGAACCACACCGCGGAGCCTG------TCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCT-GTGA
* ** * ** * * * * *** * ** *** * ** ** *
LYC.ES_C AACTACCACATTT
LEP.COL. AGCTTT-------
* **
Mean pairwise ID: 44.74%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTC-TGTAACCT--TCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG----GGGA
* * *** *** ** ******* ****** * * * ***
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TRY.BR_B CGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTG--CGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--GGTTGCGT
* * * **** ** * * * ** ** * * * * *
HUM.LU_C GGTGG-GCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT
TRY.BR_B GTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC
* ** * ***** * * * *** * ** * *** *** **
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
TRY.BR_B GGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC
* ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * ** * **
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
TRY.BR_B ACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTG-------TCGTCGCGAGGCGGTTT-
** ** ** * * * *** ** ** * * * ***
HUM.LU_C TTTT
TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 44.76%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGT--------GGAGACAATAAGGGGATG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAA-GTGTGGATG
** ** ** * ** ***** ** * * ****** * *****
ARA.TH_C GGACGTTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCAT
CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGT-GTTGTCGGCAACGGCGACC-----GAGCGTCCGT
* * *** ** * **** * **** *** * * ** ** *
ARA.TH_C TCCAAGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGC--GAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTA
CAE.BRI. GCCAAGCGCTGCGTCG--CCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA
***** * ** * ** *** ** * ******* * * * * * **
ARA.TH_C GAGTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGAC
CAE.BRI. AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGA---AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGC
* * ** ** ** *** * * ***** * * **** * *
ARA.TH_C GGTGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGA
CAE.BRI. AGTGGCCGGATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG
**** **** ** * ** ** * * * ** ** *
ARA.TH_C TTGGACCATCACTTT
CAE.BRI. ACCACTTGTCATT--
*** *
Mean pairwise ID: 44.77%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** * * * ***** * * ** *** * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG
** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRY.BR_B GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA
* **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC
* * ** **** *** ** ****** ** * * * * * * **** *
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TRY.BR_B ACCGAGG-AGCATCTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCG--AGGCGGTTT
* * * * *** * * ** **** * * ** * * * *
LYC.ES_H CCTTTT
TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 44.77%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
YAR.LI_B -------------AGCTGTAATGGCATTTT--GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG
* ** * * * ** ** ** *** * * ***
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * **** ** * ******* *** * ** *** *** *
LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * * *** * * * * * *** **** ***** * * * *
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTA
** * * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * *
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
YAR.LI_B TGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGT-TATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTC
* *** * * * * **** ** * ** ** * **** * * *
LYC.ES_O CACTTT
YAR.LI_B TC----
Mean pairwise ID: 44.77%
LYC.ES_G GCCG-AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGG--CTTAGCGGGGAGGACG---
**** **** * *** *** * ** ** *** * ** ***
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
LEI.MAJ. ----TGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC
** ***** * * *** ** * * * * ** * * * *
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
LEI.MAJ. GGTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GA
* *** * ** ** * * ** *** ** * * *** * ** *
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAAT
**** ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** **
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
LEI.MAJ. CACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT-
** *** ** * * ** * *** * * * * * * **
LYC.ES_G ACTTTT
LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 44.81%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** * * ** *** ** *** *** ** * * * * * * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTG-GCCCGCCCATTCCAAG
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
* * ** * ** * * ** * ** ***** * * ** ** * ***
ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCA-TGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGG
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG-GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * * ** ** ** * ** * ** ** *** * ***
ARA.TH_C GGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAA
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG
* **** *** ** ** ****** * ****** * * * **
ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
GAL.GAL. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTG----GGCAACATAGCGAGACC
**** ** ** ** * * * ** * ** * * ****
ARA.TH_C ATCACTTT
GAL.GAL. CTGTCTCC
* **
Mean pairwise ID: 44.81%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACA-GGG
* * *** ******* ******* ** * * ** * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
* * * * * **** * ** * * ** * ** * * * *
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG-AG
* * **** ** ** * ** * ** ** ** *** * **
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA
**** * ** **** * * ** ******* * ** ** * * ** * **
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA
LEP.COL. ACCACA--CCGCGG-AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT---
* *** ** * * *** ** ** * * * ** ** * * ****
ZEA.MA_C CCATTTTT
LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 44.81%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
** * * ******* * **** * ** * *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTG--TTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGG--CTGTG
** * ** * * * ** ** *** * ** * ** **** * *
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
LEI.MAJ. TGTCGGTGTGGCTTGC-CCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC--GAGG
*** ** * * ** * ** *** * * * ** * *** ****
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGACG
LEI.MAJ. GAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAG
* * * ** **** ** ** ******* * ** * *** * ** ** * *
ARA.TH_E GATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG-TCGCG---AAGCC
****** * * ** * **** *** * * ** ** * * **
ARA.TH_E ACCATTTT
LEI.MAJ. TT------
Mean pairwise ID: 44.81%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
** * * * ******** * *** ** * * ***** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
TRY.BR_A C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
* * ** ** **** * ** *** ** ***** *
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
TRY.BR_A TCGGTGTTGAG----GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG
** **** * ** ** * ** * * *** ** ** ***** ***
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TRY.BR_A -AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** ** *
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGC-ATCTCAGGACTTTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGG-----
** ** ** * ** * ** ** * * * * * *
HUM.LU_D TTTCTTTT
TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 44.81%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * ******* ****** * ** * * * *
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTG
** ** ** *** ** ** * * * * *** ** **
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
TRY.BR_A C-GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-
* * ** ** * ** **** * * ** * * * * * **********
LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
*** ** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** **
LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---
* ** ** ** * ** * ** *** * * * * * *
LYC.ES_G CCACTTTT
TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 44.82%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT
*** **** * * * *** * * ** * ** **
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG
* * * * ** *** * *** * * * *** * ** * ** * *
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTCGTGG----------CAACTGGCAGT-TAAACCGTGT
* * * * ** * ** ** ** * ** * *** * *
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA
* **** **** ****** *** *** ** *** * * * * * * **
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT
* *** ** ** * ** **** * * ** * *** * * * ***
Mean pairwise ID: 44.82%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
TRY.BR_A ------AGCCGGAGCGCAT---TGCTCTGTAAC--CTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG
** * *** * ** * * * *** * ** ** * * * **
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
TRY.BR_A GGGACGTCTTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGTT
*** *** ** * * * * ** ** ***** * ** ***
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTC-CTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
TRY.BR_A GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTT--AAAGTGGGG
** ** * * * * ** * * ** * * * * * * ** * ****
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
TRY.BR_A GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
**** ** **** *** ********* ** * ** * * ** * *
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGC-CGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
* * ** ** * * * * * * ** * * ***** *
Mean pairwise ID: 44.84%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
* * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * ** *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** ** * * * ** ** ** * * * * ** * ******
HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
** * * * *** ****** * * * * ** * * *
HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGG
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
* * * * * * * ***** * * * **** ******* **
HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
CAE.EL_D AC--CGCGCTTGTA--AGTTGACACAC-ATACACAGCCTTCTCGATACCT--TCAGACCA
* ** ** ** * *** *** ** ** ** ** * * ** *****
HUM.LU_B TTTCCTTT--
CAE.EL_D CTTATCATTT
** *
Mean pairwise ID: 44.84%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
** * * * ** ******* *** * * * * * ** * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* * **** ** * ** * **** * *** ** ** * ***
HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGC
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT
** ** * ****** ** * * ** * * ***
HUM.LU_C AATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
* ** *** ** ** ****** * * **** * **** * **
HUM.LU_C ATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC-
XEN.LAE. AT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACAC--AGCGAGACA
** ** *** *** **** * * ** * * ** * * ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT
XEN.LAE. CAGTTCT---
** ****
Mean pairwise ID: 44.85%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT
* * *** ** ***** * * * ** * * * **
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * * ***** * **** **** * * *** **** * **
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * ******* ** * * ** ******** ***
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
CAN.SPE. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT-----
* * * * ** * ** * ** ** * ** *** ****
CAN.SPE. T
TET.THE. -
Mean pairwise ID: 44.85%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG-
** ** * * * ** ** ****** * *
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG
** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * **
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG
*** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * **
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
TRY.BR_A GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG
** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** *
RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTC
TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** *
RAT.NOR. T
TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 44.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATAAGTGTGGATG
****** ** *** * ** *** * ** * ** ** * ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTA-ATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
CAE.EL_A G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
*** * ***** * **** ***** * * * * * ****
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCA--CCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC----GGTTAGTCCCGGGTGC
***** ** * ** ** ** * * * ** * * * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
CAE.EL_A ATAAGGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGG
*** * * * * * * * * * * ***** * * * **** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCC--CAGAGTCCCT
CAE.EL_A TGCAGTGGCCGGAC--CGCGCTTGTG-AGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCT
* **** *** * *** ** * * * * *** * * ***
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
CAE.EL_A TCA-GACCACTTATCATTT--
* ** * *** *
Mean pairwise ID: 44.87%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
**** ** * * *** * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * * **** * * * * ***** * * * **** * * ***
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCAG
CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** ** ** * * * ** *** * * * * *
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
CAE.EL_A CTTATCATTT--
* *** *
Mean pairwise ID: 44.87%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATAAGTGTG
**** * ** ** * ****** * ** * * ** * * ** **
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** **
LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * **** * *** *** ** ***
LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** * ** * * * * **** * * * ** ** *
LYC.ES_N ACCACCATTTTT
CAE.EL_D CTTATCATTT--
* *****
Mean pairwise ID: 44.87%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** **
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * **** * *** **** ** ***
LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** * ** * * * * **** * * ** * *
LYC.ES_B ACCACCACTTTT
CAE.EL_D CTTATCATTT--
* ** **
Mean pairwise ID: 44.87%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA---GGTGGTGTGAAT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
* * *** ******* ******* ** * * ** *
ZEA.MA_A GCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCC
LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT-
*** * * *** ** * ***** ** * ***** * *
ZEA.MA_A AAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGC
LEP.COL. --GTCGGAGGCCTCCGG-GTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT
** ** * ** ** * * * ** ** *** * * * * * * * **
ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTG
* ***** * ** **** *** ** ******* * ** ** * ** **
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA
LEP.COL. CAG----AACCACACCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTG-AA
*** * **** * * * * * ** ** * * ** * **
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
LEP.COL. GCTTT-------
*
Mean pairwise ID: 44.87%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** ** ** ** ** *** ** ** * **** * ** * * *
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATC---TGAGCTGCCCAGTC
GAL.GAL. CGC--TTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTG-CAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
* ** * * * ** * *** ** *** * * ** ** *
ARA.TH_D CAAGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTC
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
* ** * * *** ** *** * * * * ** * * * ** ** * * ***
ARA.TH_D GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTG
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * **** ****
ARA.TH_D GATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTG
GAL.GAL. ACGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCAGCGTAGCCTG--GGC---AACATAGCGA
***** * * * * * ** * *** * ** * * *
ARA.TH_D GACCACCACTTT
GAL.GAL. GACCCTGTCTCC
**** **
Mean pairwise ID: 44.87%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
**** ** * * *** * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAG-CGACCGCGTGGTGCAGT
* * * **** * * * * ***** * * ** **** * * **
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCA
CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
** *** * ** ** * * * ** *** * * * * *
ZEA.MA_D GACCACCATCTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT-
* *** *
Mean pairwise ID: 44.88%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCC-GCTTAG
** ** * * * ** ** ****** * * *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG
** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * **
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG
*** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * **
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
TRY.BR_A GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG
** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** *
RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** *
RAT.RAT. CTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 44.88%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * * * ******* * **** ** * * * * *
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG
** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * *
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRY.BR_A GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA
* **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** ***
LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA
* * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** ** * *
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
TRY.BR_A CACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------
* ** * * * * **** * * ** * * *
LYC.ES_N TTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 44.90%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA
CAE.EL_A --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-TGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** * **** ** * ** ** ** ** * ** * **** ***
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAG-TCCCGGGTGCATAAGGAG
** ** ** *** ** * **** * * * ** * * ** * *
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
CAE.EL_A TCGTGGATGGTTCAGGAC------CGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGC--GTGGTGC
* * * ** * * * * * *** ** ** * ****
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAG--GCCTAGACTTCATACTAAAGC
CAE.EL_A AGTGGCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC
* * * * ** * * * * * * ** * **** * * * * *
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
CAE.EL_A CACTTATCATTT--
* *****
Mean pairwise ID: 44.97%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** ***** ***
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGC---TCGTTGT-GACACTGGCCGGCTTGCCCATC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC-GTCCGTG
** ** * * * **** * ******* ** * *** * ** *
ZEA.MA_A CCAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGG
CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGG
***** * * ** * * ** * * * * * * * * * **
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
CAE.EL_C AGTGGTGG--ATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCG
** ** * **** * * * * * * *** ** * ** * **
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGA-GCCTA-ACTCAGGCT-CAGAACCTCACT
CAE.EL_C GTGCAGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTC
*** * *** ** **** * ** ** *** ** * ** *
ZEA.MA_A AAGCAAACCACCATCTTT
CAE.EL_C AGACCACTTGTCACT---
* * * **
Mean pairwise ID: 44.98%
ZEA.MA_F -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-TAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG
* * ** * ** ***** * * * * * * *** * *
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
* * ** *** * ** * * * * *** * *** * **
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCAT--TCAGGT-TGGCTAAGGA
* * * * * ** ** ** * ** ** *** * * ** ** * *
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCG--CCCGCTTCCAACGGTGG
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGA-AAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
** *** * * * ** * * * * **** ** * **** * ** *
ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCG--GAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAA--CCGATATGGTTGGACC
***** * *** * * * *** ** * *** ** * ****
ZEA.MA_F ACCATCTTT
DRO.MEL. ACAATCTTT
** ******
Mean pairwise ID: 44.98%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGA--CATTAAGATGGTGGGACAC
LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * * * ******* * *** ** * ** *
ARA.TH_F TGGTTCGGTTC-CTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT-
** * * * * * ** * ** * * ** * ** *** * **
ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTG-AGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTT--AAAGTAG--A
* * * *** *** ** *** * * *** * *** *
ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGAC
LEP.COL. GGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
** * ** ** **** *** ** ******* * ** ** *** * ** ** *
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC----TGCGCCCCAGG--CGATCC--TGTGAAG
* * *** * * * *** *** ** * * ** ***** * ****
ARA.TH_F CACCATTTT
LEP.COL. CTTT-----
*
Mean pairwise ID: 44.98%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * * ***** * * * * * * * **** * *
LYC.ES_H GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
***** ***** * ***** * * * * * ** * * * *
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTG-CCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* * * *** *** *** **** ** * * *** ** *
LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAG
LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG
* * ** ** **** ** ** ****** ** *** *** * * *** ** * **
LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
LEP.COL. AACCACACCGCGGAG-CCTGTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
* * *** * * * *** *** **** * * * * ** *
LYC.ES_H CCACCTTTT
LEP.COL. ---------
Mean pairwise ID: 45.00%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT
* * *** ** * ****** * * * * ** ** **
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* **** ***** * *** **** * * *** *** * **
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * ** ******* *** *
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
RAT.NOR. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** ** * * * * * **** *
Mean pairwise ID: 45.02%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG
* ** ** ** ** ** *** ** ** * **** * ** * **
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * *
ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** *
ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
RAT.NOR. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA
***** * * * * * **** *** * ** * * * * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT
RAT.NOR. CCCGTCTCT--
** * **
Mean pairwise ID: 45.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATAAGTGTGGATG
****** ** *** * ** *** * ** * ** ** * ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTA-ATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
CAE.EL_D G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
*** * ***** * **** ** ** * * * * * ****
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCA--CCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC----GGTTAGTCCCGGGTGC
***** ** * ** ** ** * * * ** * * * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
CAE.EL_D ATAAGGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGG
*** * * * * * * * * * * ***** * * * **** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGG-GCCCGCTTCTGGCC--CAGAGTCCC
CAE.EL_D TGCAGTGGCCGGAC--CGCGCT--TGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACC
* **** *** * *** ** * *** * * *** * * **
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
CAE.EL_D TTCA-GACCACTTATCATTT--
* * ** * *** *
Mean pairwise ID: 45.03%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
LEI.MAJ. ------------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGG
* *** *** * * * * * ** ** * * * **
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
LEI.MAJ. ----GAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
*** * * ** * * * ** * ** ** *** * * * *** **
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGG--AAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG
** **** ** * ** * * *** ***** ** * * * * *
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGT-GCAGTGGCCGG
LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCAC--CCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGA
* *** ***** * **** * ***** * * ** *** ** ** ** ** *
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
LEI.MAJ. ATCACACCGCGGAGCA--TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----
** * * *** * *** * * * * * * * ** ***
CAE.BRI. TT
LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 45.03%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT--
* ** ** ** ***** * * * *** * **
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTT----GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC
*** **** * *** * * * * * * * * * * * **** **** *
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** **
CAE.EL_C GGATGGT-TCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGAT
* * * ***** * ** * *** **** **** ** **** ***
CAE.EL_C AGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCA
TET.ROS. AACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT-----
* * ** * * ** ** * ** * * * * * ****** ***
CAE.EL_C CT
TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 45.05%
ZEA.MA_D -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
* * ** * ** ***** * ** * * * * * *** ****
ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCA-GCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** * * *** * ** * * * * * * * *** * *** *
ZEA.MA_D AAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATT--CAGGT-TGGCTAA
*** * * * * ** ** * * *** * *** * *** **
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCG--CCCGCTTCCAACGG
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGA-AAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAG
* *** *** * * * ** * * * * **** ** * **** * *
ZEA.MA_D TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
DRO.MEL. TAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCA--ACCGATATGGTTG
* * ***** * *** * * ** ***** ** *
ZEA.MA_D GACCACCATCTT-
DRO.MEL. GACCACAATCTTT
****** *****
Mean pairwise ID: 45.06%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGC--CCGTTC
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTT---CTGGGCT-GCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC
***** ** * ** ***** * *** ** * ** ** *** *
ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG--ACCTAT
GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG---GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA
*** * * * * *** ** * ** *** * ** ****
ZEA.MA_C AGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCA---CAGAGCAGCGATCAC-TGCCGGCTATT
GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT
* ** **** * *** * * *** ** ** * ****** * *
ZEA.MA_C AACGGTGGAAGG---ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTA-AGGCCTAGACTTC
GAL.GAL. AACGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCT
***** * * * *********** * * ** * * * * ****
ZEA.MA_C ATACTAAAGCAGACCACCATTTTT
GAL.GAL. GTCTCC------------------
*
Mean pairwise ID: 45.07%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
LYC.ES_D ----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* ** **** ****** ******* ****
HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAATG
LYC.ES_D TAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCG
* * * * ** * *** * *** * * *********** * * * *
HUM.JA_B CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG
LYC.ES_D CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG
* ********* ************ ** * ********** *************** *
HUM.JA_B GGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
LYC.ES_D GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAACTAAACCACCAC
** ***** ** * ** * * * ** * ** ** **** *
HUM.JA_B TTTT
LYC.ES_D TTTT
****
Mean pairwise ID: 45.07%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** ** * ******* * *** ** * * ** ** *
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG
* ** *** ******* ** * * ** ** **** ** **
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGTA
TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGC-GCCGTTAAAGT--GGGGGGA
* ** * ** ** **** * ** ** * ** *** * *** *
ARA.TH_F ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGATC
TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC
* * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * *
ARA.TH_F ACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACCA
TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGG-------
** * * ***** ** * * ** *** * * *
ARA.TH_F TTTT
TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 45.07%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * * * ******* * **** ** * * * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTT--GG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G
** * ** ** ** ** ** * * * ** ** ** ** * *
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRY.BR_A TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGA
** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** ***
LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC
** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** ** *
LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA
TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
** ** ** * ** * ** *** * * * * * *
LYC.ES_O CTTT
TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 45.07%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
TRI.AE_C ---------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTA
* ********** ******* ***
HUM.JA_A TTGGGCTG--TGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAA
TRI.AE_C GTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGG-CCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCAC
*** * * ** * ** ***** * **** * *** * * *** * ** ****
HUM.JA_A TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
TRI.AE_C CGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAA
************ **************** ** ****** * * ************
HUM.JA_A CGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
TRI.AE_C CGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC--
**** ** *** * * **** * ** * * **** ******
HUM.JA_A TTTT
TRI.AE_C ----
Mean pairwise ID: 45.08%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG--GAT
*** * ** ** * ******** ** * *** ** ** * * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * * * ** ** * * * * ** ** ** * ***
ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGT-CTTCTAGA
CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTC--AGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** ** *** *** ** ** *** * ** * * **
ARA.TH_C GTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAG
**** *** * ** * **** ** ***** * ** * * *
ARA.TH_C TGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATT
CAE.EL_B TGGCCGGACTGCGC-TTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCT----TC
*** *** * ** * * * * ** * ** * * ** *
ARA.TH_C GGACCATCACTTT--
CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 45.10%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** ** * ******* * *** ** * * ** ** *
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTT--GCGTG
* ** *** ******* ** * * ** ** **** ** **
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGG
* ** * ** ** **** * *** ** * ** *** * ***
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
TRY.BR_A GAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
** * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * *
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGG-----
*** * * ***** ** * * ** *** * * *
ARA.TH_A CATTTT
TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 45.10%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAA----AGTGGTTGAAC
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
* * * ** *** **** * * * * ** ** **
CIN.HYB. TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG
LEI.MAJ. CGTGGACC-AGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT---GTG
** * ** * * ** * * ** *** * * ***** * ** *
CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG
LEI.MAJ. TCG-GTGTGGCTTG----CCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGG-GTCCGCCGTTGAAGCGAG
*** * **** ** ** ** *** * * * * ** ** * *** ** *
CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA
LEI.MAJ. GGA-ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCGTTGCA
** * * ** **** ** ** **** ** * ** * ** * ** * *
CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCGTC--GCGAAGCCT
* ** *** ***** * * * ** * * * * * * * * * *
CIN.HYB. CCATTT
LEI.MAJ. T-----
Mean pairwise ID: 45.10%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * * * ******* * **** ** * * * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G
** * ** ** ** ** ** * * * * *** ** ** * * *
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRY.BR_A TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAA
** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** * *
LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA
* ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** ** * *
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTACCA
TRY.BR_A CACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------
* ** ** * ** * ** *** * * * ** * **
LYC.ES_E CATTTT
TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 45.10%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
TRY.BR_A -------------------AGCCGGAGCGC--ATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATC
* * ** * * *** * * ** ** ** *
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGG----GCTGTAGTGC-GCTATGCCGATGGGGTGTCCGCA
TRY.BR_A CCGCTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TG
* * *** * ** *** ** * ** * * * * ** ***** *
HOM.SA_B CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
TRY.BR_A CTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAA
** *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * ***
HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
TRY.BR_A GTGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTT
* **** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * **
HOM.SA_B GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCC
TRY.BR_A CGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
* * * * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***** *
HOM.SA_B GTCTCT
TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 45.11%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
* * * * *** * *** **** * * ** * * ** *** *
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG
CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA
** ** * * * * * ** * *** *** ** ** ** *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCT--GGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_D GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
** * * ** * ** * ** ***** * ** * **** ******
HUM.JA_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCAC-CATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAAT
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAA-GTTGACACACATACACAGCCTTCT----CGATACCT--T
* *** ** ** ** * * ** ** ** * ** ** * * *
HUM.JA_B AGGACCATTTCTTTT--
CAE.EL_D CAGACCACTTATCATTT
***** ** * *
Mean pairwise ID: 45.13%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGT-GGATG
LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT
*** * * ** * *** * ** * * **
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG
* *** * * * ** ** * * ** * ** **** ** **
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAA---TGAAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* ** **** *** * * ** **** * * * * * * *** * * **
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* *
CAE.EL_C GACAGCGCTT--GTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
** * * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
CAE.EL_C TTGTCACT
LYC.ES_M CCACCTTT
* *
Mean pairwise ID: 45.13%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTGT
LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
*** ***** ****** *******
ARA.TH_G GAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT
LYC.ES_D GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCGG
**** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * *
ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC
LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** * ******************** ** * ********** ******** ***
ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGC--TCCAACTAAACCA
** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * ** * *****
ARA.TH_G CCATTTT-
LYC.ES_D CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 45.13%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG
LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT
*** * * ** * *** * * * * **
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG
* *** * * * ** ** * * ** * ** **** ** **
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAA---TGAAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* ** **** *** * * ** **** * * * * * * *** * * **
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* *
CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
CAE.EL_B TTGTTTTT
LYC.ES_M CCACCTTT
***
Mean pairwise ID: 45.13%
LYC.ES_I -GCCG--AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG-GGGGCATTAATGTGGTGGAAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
* * ** ** * * * * * * ** * ** * ** * * *****
LYC.ES_I GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* ***** * * ** * * ** * * ** * ***
LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
*** * *** * ** *** * * * * *** * ***
LYC.ES_I CGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAG
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
* * * * *** *** * **** * * **** * * ** ** ** * *
LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCA---ACCGATATGGTTGGACCA
**** ** *** ** *** ** ** * * * * * ** ****
LYC.ES_I CCATTTTT
DRO.MEL. CAATCTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 45.13%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G
*** * * ******* ****** * ** * * * *
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTG
** ** ** *** ** ** * * * * *** ** **
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
TRY.BR_B C-GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-
* * ** ** * ** **** * * ** * * * * * **********
LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
*** ** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** * **
LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
* ** ** ** * ** * ** *** * * * * * *
LYC.ES_G CCACTTTT
TRY.BR_B --------
Mean pairwise ID: 45.14%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** ** ******** * **** * * * * *** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRY.BR_A TCT----TGGA---CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGA---CTTGGTGTTCTGCTTG---
* * **** * * *** * * **** **** ** *** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGG-GCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TRY.BR_A ---GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-------GTTCTCGCGCCG
******* ** * * * ** * ** * * ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TRY.BR_A TTAAAGTGGGGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC
******** ** ** * ** **** ** * ** ******* * *** * * * *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
TRY.BR_A --CCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTC
* ** ** * *** * *** ** ** *** **** *** *
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
TRY.BR_A GCGAGGCGG----------
* *
Mean pairwise ID: 45.14%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA--GGGCATCAGTGTGGTGGAATGT
DRO.MEL. ----------GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTG
* * ** * * * ** ** * ** ** *** *** **
LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA----
DRO.MEL. TGGG-ATGGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGT
** *** ** ** * * ** * * * ** ** * *
LYC.ES_C --GCAAAGAGTTGGGTCT-----TGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTC--C
DRO.MEL. CCGCACTAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGC
*** ** * * * ** * **** * * * * * * * *
LYC.ES_C TAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGT
DRO.MEL. TAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAG
*** * *** ** ** * * *** *** * **** * ** ** ***** *
LYC.ES_C GCAGTGGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTC
DRO.MEL. GCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGT-------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATA
***** * ***** ** ** * ** * * * * ** * * * *
LYC.ES_C TAGTTAAACTACCACATTT
DRO.MEL. TGGTTGGACCACAATCTTT
* *** ** ** * ***
Mean pairwise ID: 45.14%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA-GTCAG
YAR.LI_A --CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG--TAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCG
* * * **** * * * **** **** * * ** * ** *
TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTG-AGTTG
YAR.LI_A AGTCTTGGGCTCTG------CACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTG
*** * * * ** ** ** ** * * ** ** **** ** ** ****
TET.ROS. CTATG-GTGGAAACCT-AGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-GAACCG
YAR.LI_A ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAA
* * ** ** ****** ** ** * * ** * * * *
TET.ROS. CCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACAT
YAR.LI_A CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGATCGCAA
* **** **** * *** ** * ****** * * *** ** **** **
TET.ROS. ACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
YAR.LI_A CCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------
* * * * * * * * ** ***
Mean pairwise ID: 45.16%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
** * * * * ****** ** ** ** * * * **** *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * ***
HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * ** * * * **** ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
HOM.SA_A GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTG--TGCAACATAGCGAGAC
*** ** *** *** ***** * * ** * * ** * ** ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT
HOM.SA_A CCCGTCTCTT
* *** **
Mean pairwise ID: 45.16%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG------GGGATGTTAATGTGG-TGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
* * * ** ** * ** *** * ** * ** * * ***** ***
LYC.ES_N AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
* ** *** * * *** ** * ** * ** * ** ***
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT
*** * ** * ** ** **** * * * * * *** * *
LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGA
CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
** * * ** *** * * **** * *** *** * ** ****
LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT
***** ** * * *** ** ** * **** * * ** ** *
LYC.ES_N CACCATTTTT
CAE.BRI. TGTCATT---
****
Mean pairwise ID: 45.16%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA----TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * ** * ** *** * ** ** * * * ** *
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
* ** * ** * *** ** * * * * **** * ** ****
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTG-GCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGA
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
** ** ** ** * * * ******* * * * * ** * ** *
ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
* * * ** *** * * ***** * * **** ******* *
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAA
CAE.BRI. GGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATAC--CTTCAGACCAC
**** ** ** * ** * * * * * **** *** * * *** * *
ARA.TH_F CCACCATTTT
CAE.BRI. TTGTCATT--
****
Mean pairwise ID: 45.18%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG-
** * ** * * * ** ** ****** ***
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC---TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG
** *** *** *** ** * * * ** ***** * ** *
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG
** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ***
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
TRY.BR_A GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
* **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** *
ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** *
ORI.CUN. C
TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 45.18%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
TRY.BR_A --------AGCCGGAGCGCAT-TGCTCTGTAACCTTC--GGGGGCTGATCCCGCTTAGCG
* ** *** ** * ** ** * ** ****** * *
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
TRY.BR_A GGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTG----TTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* ** * * *** *** * * ** ** ***** * * ** **
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTC-CTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG
* ** *** * * * * ** * * ** ** * * * ** *** ****
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
TRY.BR_A GAAC--GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA
* ** **** *** *** ***** ** * ** * * ** * *
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTT--CAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT
TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCAT-CTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
* * ** ** * * * * * ** * ** *** * *** * *
FUG.RUB. T
TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 45.18%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT
* * *** ** ****** * * * * ** * ** **
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* *** ***** * **** **** * * *** *** * **
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * ** ******* *** *
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
CAN.SPE. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** * ** *** * * **** *
CAN.SPE. T
TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 45.19%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG--ACAGAGG
* ** ** ** ** ** *** ** ** * **** * *** **
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * *
ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** *
ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
RAT.RAT. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GGC---AACATAGCGAG
***** * * * * * **** *** * ** * * * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT-
RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT
*** * ** *
Mean pairwise ID: 45.19%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG-
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC
* ** * * *** * ** **** * * * *** * * **** **
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
*** ** * * ** * * ** * * * ** * * *** *
ZEA.MA_F CAG-GCATGGCGTGAGGCTGGCT--TCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG
CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCAC-CGCGCGGTGC-AGTGG
* * **** * * * * **** ** *** *** ** * * * **
ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG
CAE.EL_C CCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT
*** * * ** * * * ** * ** * * * *** **
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
CAE.EL_C GTCACT------
***
Mean pairwise ID: 45.19%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
*** * *** ** *** *** * **** ** *** * ** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTG------GTGCTCTGCTTG-----
* *** * * * *** * ** ** * * * ** *
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LEI.MAJ. -GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* ** ** ** **** ** ** ** *** * * *** * ** * **
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTG
* *** * * ** **** ** ** ******* ** * * * *** ** **
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LEI.MAJ. CAGAATCA------CACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTT--CGTCGCGA
* * * * ** * * * **** * ** ** * * * **
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LEI.MAJ. AGCCTT------
* *
Mean pairwise ID: 45.19%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_H A--TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCC
GAL.GAL. CGCTTGAGCC---CAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
*** ** * ** ****** *** **** * * ** *
LYC.ES_H AAGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTG
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * **** ** * * ** * * * * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** * * ****
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
GAL.GAL. CGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * *** **** * * * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
GAL.GAL. CTGTCTCC----
* * **
Mean pairwise ID: 45.19%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** * * *****
ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCT---TGCCCATCCCA
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGG---AGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * **** * ** ** * ** * * ** * ***
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
** ** * ** ** ** *** * * * ** * *
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
CAE.EL_A CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAA-AAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
* * **** * * * * * ***** * * ** ** * * * ****
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
CAE.EL_A CCGGACC----GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTT-CAGAC
*** ** ** **** * * ** * ** ** * * ** **
ZEA.MA_B CACC-ATCTTT-
CAE.EL_A CACTTATCATTT
*** *** **
Mean pairwise ID: 45.21%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTT-AG
** * ** * * * ** ** ****** * * *
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG
** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * **
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG
*** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * **
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
TRY.BR_A GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG
** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** *
HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** *
HOM.SA_A CTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 45.21%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * * * ******* * **** ** * * * * *
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG
** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * *
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRY.BR_B GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA
* **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** ***
LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCA
* * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** * ** * *
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
TRY.BR_B CACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-----
* ** * * * * **** * * ** * * *
LYC.ES_N TTT
TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 45.25%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** * * * ***** * * ** *** * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG
** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
TRY.BR_A GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA
* **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC
* * ** **** *** ** ****** ** ** *** * * * ** ** *
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC
TRY.BR_A ACACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------
* ** * * * *** * * **** * * ** * * *
LYC.ES_H CTTTT
TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 45.28%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTG-TGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG
LEP.COL. ------------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGC-TGAACA
* *** * ** * ** * **** * * ** ** ** *
CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
LEP.COL. GGGAGCTGTCTGGA--CCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGG
* * * * *** ** * * ** ** ** *** * * * *** *
CAE.BRI. CGCTGCGTCG-------CCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAA
LEP.COL. CTGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCG-CCCCCTCCGTTAAA
* ** **** ** ** * * ** * ***** *** *** ** **
CAE.BRI. GGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
LEP.COL. GTAGAGGAAC-TGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTT
* ** ** * ** ***** * * ** * ***** * * * * ** *** **
CAE.BRI. GCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT
LEP.COL. GCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-
** * * * * *** ** ** * ** *** * * * *
CAE.BRI. TGTCATT
LEP.COL. -------
Mean pairwise ID: 45.28%
ORI.CUN. ------GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTC-CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCC
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTG--TCT
*** ** * ** * ** * ** ****** * ** **** *
ORI.CUN. GGAGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
LEP.COL. GGACCAGCATA-------GGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG
*** * * ** * * *** * * * * * * * ** *** *
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
LEP.COL. --------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAA
**** * **** ** * * **** * ** * **
ORI.CUN. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
LEP.COL. GTAGAG--GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT
* ** * **** ** **** *** ********** ** * * * * * **
ORI.CUN. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC
LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTT
* * * * * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** *
ORI.CUN. TGTCTCC
LEP.COL. T------
*
Mean pairwise ID: 45.28%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCA-GTGTGGTGGAATGTT
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGG------
*** ** * * ****** * * * *** * * * **
LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG--TGTTCTG-CTTGGTTGC
* ** * * * *** ** *** * * *** ** *** * *
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGC-CAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
TRY.BR_B GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA
* ** ** * *** ** * * * * ** * * * * ** ********** *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRY.BR_B ACGG-GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCC-CGTTGCAGAAGCAC
** * ** **** *** * ** * * ** * ** ** * * **** *
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTAC
TRY.BR_B ACCGAGG-AGCATCTCAGGACTTTG-----CGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
* **** ** ** * * ** * * * * * ** * ** *
LYC.ES_C CACATTT
TRY.BR_B -------
Mean pairwise ID: 45.31%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_D --------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
**** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCC--AACTAAACC
** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * ** ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_D ACCACTTTT
* *****
Mean pairwise ID: 45.34%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGT-GGTGGAA
* * * **** * * *** ** ***
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
LYC.ES_M TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
LYC.ES_M AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC
LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
**** * * * *** * ** * ** * **** * * * *
ORI.CUN. CTGTCTCC---
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* * **
Mean pairwise ID: 45.34%
LYC.ES_F -GCCG--AGCTTTGTAACGTGGGCTTGTA-ACCCGAGTGGGGGC-AACAATGTGGTGGAA
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* * ** ** * * * * * * * *** ** * * ** * ***
LYC.ES_F TGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA
DRO.MEL. TGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAG--CGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
** ** * * ** * * ** *** ***** ** * ** * *
LYC.ES_F AGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCT-TTAGAGTGG
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
*** * *** * * ** * ** ** ** * **
LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGA
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT
**** ** * * *** *** * **** * * *** **** * ***** *
LYC.ES_F AGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAA
DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAG----TGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATA---TGGTTGGA
**** ** * * * * ** * * * * ** * * * * ** *
LYC.ES_F CCATCACTTTT
DRO.MEL. CCACAATCTTT
*** * ***
Mean pairwise ID: 45.34%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA--GGTGGTGCGGATT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
* * *** ******* ******* ** * * * * *
ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC-
LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGT-GCTCTGCTTGGCTG
* * * * ** * *** ** ** *** * **** * *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT
** ** * * ** * * ** * * * * * * * * * ****
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTT
* ***** * ** **** *** ** ******* * ***** * * ** ** *
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
LEP.COL. GC-AGAACCACA--CCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAG
* ** * *** **** * * * * ** **** ** ** * **
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
LEP.COL. CTTT-------
Mean pairwise ID: 45.36%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
SCH.POM. ------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTTAGTA
* ** *** ** ** ** ** **
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
SCH.POM. CTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGAT
**** * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * ** **
HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGG-GTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT
SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACC
** ** ** ** * * ** ** * * * ** **** * * *
HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
SCH.POM. GATGGAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCGATAGC
* **** *** *** *** * *** ** * *** ** * * **** *
HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCTT
SCH.POM. GATGGGATTCACCTTCG--CAGGATG-----TGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
* * * * *** * ** *** ****** * *** ** * * **
HUM.JA_A TT
SCH.POM. --
Mean pairwise ID: 45.36%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT
* * *** ** * ****** * * * * ** * *** **
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* **** ***** * *** **** * * *** *** * **
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * ** ******* *** *
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
RAT.RAT. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** ** * * * * * **** *
RAT.RAT. TT
TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 45.36%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGG
** * ** * ** ** * ** ** * * *
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC
LEI.MAJ. GGAGGACGTGGACCA--GCGAGGGTGATTTGCT-GCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
**** * * * * *** * ** *** ******* * * ** **
DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGT-GCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG--
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCG--CGGGTCCGCCGTTGAAGCG
* ** * *** * *** * ** ***** * *** ** ** *
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACG-TCCGCCGTTGCAG
******** **** **** ******* * * * * * ** ** * *
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCT
LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACT-TGAGCCCCAC--GCTTCGTCG---CGAAGCCT
** * ***** * * * ***** ** * ** * * * **
DRO.MEL. TT
LEI.MAJ. T-
*
Mean pairwise ID: 45.36%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT
* * *** ** * ***** * * * ** * * * * **
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* * * * ***** * *** **** * * *** **** * **
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * ******* ** * * ** ******** ***
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
HOM.SA_A T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT-----
* * * * ** * ** * ** ** * ** *** ****
HOM.SA_A TT
TET.THE. --
Mean pairwise ID: 45.37%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
* * * * * * * *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * ** ** * * ** * ** * * *** * ** * ******
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGG-ACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG
CAE.EL_D -GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT----GCATAAGGA
* * ** * * ** * *** ****** * * * * * *
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC
* ** ** * ** * ** ***** * * * **** *******
HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
CAE.EL_D GGAC--CGCGCTTGTAAG--TTGACACA-CA-TACACAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA
*** ** ** ** * **** ** ** * ** * ** * * * **
HUM.LU_C CCATTTCTTTT--
CAE.EL_D CCACTTATCATTT
*** ** * *
Mean pairwise ID: 45.37%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** **
ARA.TH_F ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC
* * ** * * * ** * *** * * * **** * ** **
ARA.TH_F AAGCTGTGAGTAATTAGTGT-TGA--GTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGT
CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
**** ** ** * ** * *** ** * ** ** * * * * **
ARA.TH_F CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT
CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAGT
** ** * * * ** * **** ** * ** * ** * *****
ARA.TH_F GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
CAE.EL_C GGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA--CACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGAC
** **** ** ** * ** * * * * **** ** *** *
ARA.TH_F GAACCACCATTTT
CAE.EL_C CACTTGTCACT--
* ** *
Mean pairwise ID: 45.39%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * * * ******* * **** ** * * * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTT--GG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G
** * ** ** ** ** ** * * * ** ** ** ** * *
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRY.BR_B TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGA
** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** ***
LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC
** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** * ** *
LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA
TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT---
** ** ** * ** * ** *** * * * * * *
LYC.ES_O CTTT
TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 45.39%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT--
* ** ** ** ***** * * * *** * **
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTT----GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC
*** **** * *** * * * * * * * * * * * **** **** *
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCAT-TAAAGAGCTGA
* ** * * ** ** * * ** * * ** *** *** *** *
CAE.EL_A GGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
*** * ***** * ** * *** **** **** * ** **** ***
CAE.EL_A C--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT----
* ** * * ** ** * ** * * * * ****** ***
CAE.EL_A ATTT
TET.ROS. ----
Mean pairwise ID: 45.39%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** ** * ******* * *** ** * * ** ** *
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG
* ** *** ******* ** * * ** ** **** ** **
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGTA
TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGC-GCCGTTAAAGT--GGGGGGA
* ** * ** ** **** * ** ** * ** *** * *** *
ARA.TH_F ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGATC
TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC
* * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * * *
ARA.TH_F ACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACCA
TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT----
** * * ***** ** * * ** *** * * *
ARA.TH_F TTTT
TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 45.42%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** ** * ******* * *** ** * * ** ** *
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTT--GCGTG
* ** *** ******* ** * * ** ** **** ** **
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGG
* ** * ** ** **** * *** ** * ** *** * ***
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
TRY.BR_B GAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
** * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * *
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT--
*** * * ***** ** * * ** *** * * *
ARA.TH_A CATTTT
TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 45.42%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTT--CTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT--CTGATTGTGGGAT
YAR.LI_A -----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCT
*** ******* * ** * ** ** ** *
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
YAR.LI_A TGTTGTGCGTTCGAGTCT--TGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATT
* * * * *** ** * * ** * *** * * * **** * *
DRO.MEL. AAGC--TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGG
YAR.LI_A CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGT-CTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTT--CTAAGA
** *** * * *** * * * * * ** *** *** *****
DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAG-AGTTCCCGTGGTAGGCAGTA
YAR.LI_A TTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCG
** *** ** * ** ******* * **** ****** *
DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA
YAR.LI_A GTGGGAT--CGCAACCAAGTGGTATAT-GTTATGGAA------GATATT-TACGATCACG
******* ** * * ***** * ***** ***** * ** ***
DRO.MEL. ATCTTT
YAR.LI_A ATT---
**
Mean pairwise ID: 45.42%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG
***** *** * * * ***** *** * * ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
YAR.LI_A TGC-GTTCGAGTC--TTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG
** ** * ** ****** * * * * ** *** *** * * * *
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
YAR.LI_A CGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC
* * *** * * * * * *** **** ***** * * * * **
LYC.ES_E CCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA--CGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
YAR.LI_A T-GGGAAACT---TCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGT---TGCCGTGG--GTATG
* ** ** * ****** * * * *** * *** **** * **
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
YAR.LI_A GCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT--ATGTTATGGAAGATATTT-------ACGATCA
*** * * * ****** ** *** * * ** ** * **
LYC.ES_E CATTTT
YAR.LI_A CGATT-
* **
Mean pairwise ID: 45.45%
LYC.ES_N -GTTG--AGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG-GGGATGTTAATGTGGTGGAAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
** ** ** * * * * * * * ** * ** * * * * * *****
LYC.ES_N GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* ***** * * ** * * ** * * ** * ***
LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
*** * *** * ** *** * * * * *** * ***
LYC.ES_N CGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAG
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
* * * * *** *** * **** * * **** * * ** ** ** * *
LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCA---ACCGATATGGTTGGACCA
**** ** *** ** *** ** ** * * * * * ** ****
LYC.ES_N CCATTTTT
DRO.MEL. CAATCTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 45.45%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGCGCGGATGC
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******* * *** ** * * *** *** *
ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TRY.BR_A CTTGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG---GTTGCGTGT
*** * *** * ***** * * ***** * * **
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
TRY.BR_A CGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG
*** ** * ** ** *** ** * ** ** ** ** ** *
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
TRY.BR_A GAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTCGAG
*** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** *** * * * ** ***
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG-ATCCTCTCTTAGCAAACCA
TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTT-TGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----
* *** * *** * * * * ** ** ** ** * **
ZEA.MA_B CCATCTTT
TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 45.45%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
LEP.COL. ----GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * * * * ******** * **** * * * ***** * *
HUM.LU_B CAGCCCAGT--GGATCGGGT-CCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCA-TTCCAAGCC
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC
* * ** **** * * * * * ** ***** * * *
HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
LEP.COL. GGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGC--CCCCTCCGTTAAAGTAGAGGA
** * * * *** * ***** * * * * * ** *** ****
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-CCGGCAGTGGAAGG
LEP.COL. -ACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA
* ** ** **** ** ** ******* * ***** *** * * ** ** * **
HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
LEP.COL. ACCACACCGCGG--------AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCT
* ** *** * * *** * * ** * * * * * *
HUM.LU_B TTTCCTTT
LEP.COL. TT------
**
Mean pairwise ID: 45.45%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** ** ******** * **** * * * * *** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRY.BR_B TCT----TGGA---CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGA---CTTGGTGTTCTGCTTG---
* * **** * * *** * * **** **** ** *** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGG-GCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TRY.BR_B ---GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-------GTTCTCGCGCCG
******* ** * * * ** * ** * * ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TRY.BR_B TTAAAGTGGGGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC
******** ** ** * ** **** ** * ** ******* * *** * * * *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
TRY.BR_B --CCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTC
* ** * ** * *** * *** ** ** *** **** *** *
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
TRY.BR_B GCGAGGCGGTTT-------
* *
Mean pairwise ID: 45.45%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
**** ** * * *** * * * ** * * * * * *
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGC-GACCGC-----GT
* * * **** * * * * * *** ** ** * * * **
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG---
CAE.EL_D GGTGCAGTGGCCGG--ACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACC
** * * ** * ** *** * ** ** ** ***** *
ZEA.MA_E --CAGACCACC-ATCTTT-
CAE.EL_D TTCAGACCACTTATCATTT
******** *** **
Mean pairwise ID: 45.45%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTTTAGT
LEP.COL. -GCC--GGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
*** * * * * * ******** * *** * ** ** *
HUM.JA_B TCGGCCCAT-TGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGA
LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCT--TGGCTGTGTGTCGG
* * ** * * * * * * *** * **** *** * * **
HUM.JA_B GAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTC-CTAAAGCGGAGGGC
LEP.COL. AGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG---GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGA-
* *** * * ***** *** * * * ***** ****
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGGA
LEP.COL. ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAA
* ** ** **** ** ** ******* * ***** *** * ** ** ** * ** *
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
LEP.COL. CCACA---CCGCGGAGCCTG---TCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCT--GTGAAGCTT
** * * * ** ** ** ** * ** ** ** * *
HUM.JA_B TTTCTTTT
LEP.COL. T-------
*
Mean pairwise ID: 45.48%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
* * * **** * * ****** * **
HOM.SA_B CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * ** ** ******* * *** **** *** ** ** * **
HOM.SA_B GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTGG
* * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * **
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
LYC.ES_M GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGA
LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
**** * * * *** * ** * ** * **** * * *
HOM.SA_B CCCCGTCTCT
LYC.ES_M AACCACCTTT
** ** *
Mean pairwise ID: 45.48%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGT--GGAT
LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT
*** * * ** * *** * * * * ** *
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGC-TAATTTCTGGC--CTGCCC--TGTCCAAGCACA
* * ** * * ***** * * * * ** **** ** *
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
LYC.ES_M GAGTTGGATCACGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* * ** ** * *** ** * ** *** * * * * * *** * * *
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ** *** * * ***** ** *** **** * *********
CAE.BRI. GGATAGCGCTT--GTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG--ACC
LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
***** * * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** * *
CAE.BRI. ACTTGTCATT
LYC.ES_M AACCACCTTT
* * **
Mean pairwise ID: 45.48%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * * ** * * ** *** * ** * ** * * ***** ***
LYC.ES_I AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
* ** *** * * *** ** * ** * ** * ** ***
LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT
*** * ** * ** ** **** * * * * * *** * *
LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGA
CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
** * * ** *** * * **** * *** *** * ** ****
LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT
***** ** * * *** ** ** * **** * * ** ** *
LYC.ES_I CACCATTTTT
CAE.BRI. TGTCATT---
****
Mean pairwise ID: 45.48%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGCCGGAG
**** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGT-TGTAATCTTGCTGGCTTGCCCG
ORI.CUN. GATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC----TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
* * ** * * * * ****** *** ** * ** * * * ** ***
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG-----
* ***** * * ** * ** ** * **
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT
ORI.CUN. -CCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGC
***** * ** * ** * *** ** ** ****** * ****
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ORI.CUN. TGATCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-CCAGCCTGGG----CA
*** ** * **** * ** ** * * ** * *** * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ORI.CUN. ACATAGCGAGACCCTGTCTCC
* * * * * ***
Mean pairwise ID: 45.48%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACT-ATAAGATGG-TGGAACAC
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * * ******* * *** * * ** ** * *
ARA.TH_G TGGATCGGCC--CACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAG
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGT
** * * ** ** ** * * * **** * * * ** ****
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGC-CCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* *** *** ** ** * ** * ** * * * ** ** ***
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCAGCAGTGGAC
LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** *
ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCA--TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
* ** ** ** *** ** ** ** * ** * ** * ****
ARA.TH_G CCACCATTTT
LEP.COL. ----------
Mean pairwise ID: 45.48%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
* * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * ** *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** ** * * * ** *** ** * * * * ** * ******
HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
** * * * *** ****** * * * * ** * * *
HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGG
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
* * * * * * * ***** * * * **** ******* **
HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
CAE.EL_A AC--CGCGCTTGTG--AGTTGACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGACCA
* ** ** *** * *** *** ** ** ** ** * * ** *****
HUM.LU_B TTTCCTTT--
CAE.EL_A CTTATCATTT
** *
Mean pairwise ID: 45.51%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** * ** ******* ** ** ** * * * * ** *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * ***
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * ** *** * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** *
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** * **** * ** * * * **
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
RAT.NOR. CCCGTCTCT---
** * ***
Mean pairwise ID: 45.51%
CAE.BRI. -ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGG---CATAAACAAT--GTAGGTTGTGATA
* **** * * * * ** * ** * ** * * ** ***
CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGA-----GTGTGCCCGCTCCAAA
** * * **** ** * ** ** * * * * * *** ****
CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* ** ** ** * ** * * * ** ** **** *** *
CAE.BRI. TGCA-CGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
* * ** ****** * ** * **** **** **** * ** **** ***
CAE.BRI. TAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCAT
TET.THE. TAACAT-----ACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAA--GCCAGACAT
** * * * * * * * ** * *** *** * * * ***
CAE.BRI. T
TET.THE. T
*
Mean pairwise ID: 45.51%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT-
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* * * * ** ** * * * * * * *** ******
ARA.TH_F ---GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
** * ** ** * * ** * ** * ****** * * ** * **
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTT----GGCTAAGG
*** * * ** * ** ** ** * **** * ****** * *
ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC---TTCCCGCTTACAGCAGTGG
DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
* *** *** * * * **** * * ****** ***** *
ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT-TGG
**** ** * ** * ** * * * ** ***** * * **
ARA.TH_F ACCACCATTTT-
DRO.MEL. ACCACAATCTTT
***** ** **
Mean pairwise ID: 45.51%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGC
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******* * *** ** * * * * *** *
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTC-ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRY.BR_A CTTGGACAA-------GCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG------G
* * ** ** ****** * * ** *** ** **** * *
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACC--TATAGTG
TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG---AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG
*** ** * **** * **** *** * ** * ** ** ****
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
TRY.BR_A GGGGGAACGG-GTCAGGCCG--GTGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTC
* ******* ** **** * * ** ******* *** ** * * **
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TRY.BR_A GAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
** * *** *** * ** ** * ** * ** * * ** *
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
TRY.BR_A ------------
Mean pairwise ID: 45.51%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT
* * *** ** ******* * * * * ** ** ** **
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* *** ***** * *** **** * * *** *** * **
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * ** ******* *** *
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
HOM.SA_B T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** * ** *** * * **** *
HOM.SA_B T
TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 45.51%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * ***
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
GAL.GAL. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATA-TGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** ** **** * * ** * *** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA
* * * * * *** ** ** ****** * ***** ****
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCT-GCTGGTCCGATCTCATATG
GAL.GAL. CGGGATCGCGCCT-------GTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAG
***** ** * * * * ***** ** * ** * * * * *
ARA.TH_A AACCACCATTTT
GAL.GAL. ACCCTGTCTCC-
* ** *
Mean pairwise ID: 45.54%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAG-TGCGCTATGCCG--AGCGGGC--GTCCGCG
**** ** ** ******** * ** * ** * ** *** * **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGA
GAL.GAL. CTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG-GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAG
* *** * * * * * ** * * * * * * * * ***
ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG
GAL.GAL. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAG
* ** *** * *** ** ** ****** * ** ** * *
ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC
GAL.GAL. TAACGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCA----ACATAGC
* **** * *** ** * * * * ** ** * * ** ***
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
GAL.GAL. GAGACCCTGTCTCC
* * * ***
Mean pairwise ID: 45.54%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT-
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* * * * ** ** * * * * * * *** ******
ARA.TH_A ---GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
** * ** ** * * ** * ** * ****** * * ** * **
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGC--ATTCAGGTT----GGCTAA
*** * * ** * ** ** ** * **** ** ****** *
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC---TTCCCGCTTACAGCAGT
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT
* * *** *** * * * **** * * ****** *****
ARA.TH_A GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT-T
* **** ** * ** * ** * * * ** ***** * * *
ARA.TH_A GAACCACCATTTT-
DRO.MEL. GGACCACAATCTTT
* ***** ** **
Mean pairwise ID: 45.54%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** **
ARA.TH_A ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC
* * ** * * * ** * *** * * * **** * ** **
ARA.TH_A AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTC
CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCGGGTGCATAA--
**** ** ** * ** * ** **** *** * * ** * * *
ARA.TH_A GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAG
CAE.EL_C --GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG
* ** ** ** * ** * ** ***** * * **** ****
ARA.TH_A TGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA
CAE.EL_C TGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA--CACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGA
*** **** ** ** * ** * * * * **** ** *** *
ARA.TH_A TGAACCACCATTTT
CAE.EL_C CCACTTGTCACT--
* ** *
Mean pairwise ID: 45.54%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCC-GCTTAG
** ** * * * ** ** ****** * * *
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG
** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * **
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG
*** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * **
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
TRY.BR_B GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG
** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * *
RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
TRY.BR_B AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * *
RAT.RAT. CTT
TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 45.57%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
* * * * *** * *** **** * * * ** * * ** *** *
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG
CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA
** ** * * * * * ** * *** *** ** ** ** *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCT--GGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_A GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
** * * ** * ** * ** ***** * ** * **** ******
HUM.JA_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA
CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAG---TTGACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TC
* *** ** ** *** * *** *** ** * ** * * *
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT--
CAE.EL_A AGACCACTTATCATTT
***** ** * *
Mean pairwise ID: 45.57%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTT--GTGACC-CGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACA
DRO.MEL. ---GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATG
** * * ***** ** * * ** * * * * * **** *
ARA.TH_D GT----GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTC
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC
* ** * ** * * ** * * ** *** * * * ** *
ARA.TH_D CAAGCT-GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGAC--TCAGGCGGATTCTAAA
DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCT---AA
***** * * *** ** *** * ** * ** * ***** * * **
ARA.TH_D GTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCA
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCA
* ** * * * * *** *** * ****** * * ***** ***
ARA.TH_D GTGGATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTC
DRO.MEL. GTAGTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT
** * **** ** *** * * * * * ** **** *
ARA.TH_D CTGGACCACCACTTT-
DRO.MEL. -TGGACCACAATCTTT
******** * **
Mean pairwise ID: 45.60%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** *** ******* * *** ** * * * ** *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGT--CCAAGC
TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTC
* ** **** ********** * ** ** **** ** * *
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
TRY.BR_A GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGT--GGGG
*** * * ** *** ** * * * ** ** ****** * **
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
* ** * ** **** *** ** ******* * ** * *** * ** *
ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGG----
* **** * * ***** ** * * ** *** * * *
ARA.TH_E CCATTTT
TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 45.60%
GAL.GAL. ------GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTC-CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCC
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGT----
*** ** * ** * ** * ** ****** * ** ****
GAL.GAL. GCCGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCG
LEP.COL. -CTGGACCAGCATAG----GGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG
* *** * ** ** * * *** * * * * * ** ** *
GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA
LEP.COL. T-CGGAGGCC--------TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA
* ***** * ** **** * ** * *** * ** * ***
GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT
LEP.COL. AGTAGAG-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT
* * * **** ** **** *** ********** ** * * * * * * * **
GAL.GAL. AACGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC
LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC-TGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTT
* * * * * ** ** * ** * * ** *** * * ** *
GAL.GAL. TGTCTCC
LEP.COL. T------
*
Mean pairwise ID: 45.63%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACAT-TTAGATGGTGGAACACT
LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
** * * * ******* * *** ** ** *
ARA.TH_E GGTTCGGGTC--CACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAG
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGT
** ** * ** ** * ** * **** * ** * ** **** *
ARA.TH_E CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGC-CCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
* *** ** *** * * ** *** * * * ** * ***
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGAC
LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** ** **** ** ** ******* * ** ** *** * ** ** *
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC----TGCGCCCCAGG--CGATCC--TGTGAAG
* * **** * * * *** *** ** * * ** ***** * ****
ARA.TH_E CACCATTTT
LEP.COL. CTTT-----
*
Mean pairwise ID: 45.63%
LYC.ES_O -GCCG--AGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG-GGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
* * ** ** * * * * * * * ** * ** * * * * * ****
LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* ***** * ** ** * * ** ** * ** * ***
LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
* * *** ** *** * * * * **** * ***
LYC.ES_O TGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
** **** * *** *** * **** * ** * * *** * ***** * *
LYC.ES_O GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGT----GGACTGCCGTTA---TCAGCCCAACCGATATGGTTGGACC
**** ** ***** * * * ** *** * * * * * ** ***
LYC.ES_O ACCACTTT-
DRO.MEL. ACAATCTTT
** * **
Mean pairwise ID: 45.63%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
***** ** * * ****** * ** * ****** * * *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGCA-TGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
* * * ** ** * *** **** ** ** * * ** ******
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA
** ** * * * ** * ** * * * * * *** * * *** *
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
** ** ** * ** * ** ***** * * **** ******* *
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA--CACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGACCACT
*** * ** * ** * * * * **** ** *** * *
ARA.TH_E CACCATTTT
CAE.EL_C TGTCACT--
** *
Mean pairwise ID: 45.63%
LYC.ES_G -GCCG--AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG-GGGGCATTAATGTGGTGGAAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
* * ** ** * * * * * * ** * ** * ** * * *****
LYC.ES_G GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG
* ***** * * ** * * ** ** * ** * ***
LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG
DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA
* * *** ** *** * * * * **** * ***
LYC.ES_G TGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
** **** * *** *** * **** * ** * * *** * ***** * *
LYC.ES_G GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTG----GACTGCCGTTATCAGCCCA---ACCGATATGGTTGGACC
**** ** ***** * * * ** *** * * * * * ** ***
LYC.ES_G ACCACTTTT
DRO.MEL. ACAATCTTT
** * ***
Mean pairwise ID: 45.66%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
** * * * ****** ** ** ** * * * * *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNC--CAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
* * * ***** ** * ** * ****** *** * * *** * ** * **
HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGA
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** ** * ** ** ** * * **** **
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * * ****
HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
GAL.GAL. GGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGA
**** ** *** *** ***** * * * * ** ** ** **
HUM.LU_C CCATTTCTTTT
GAL.GAL. CCCTGTCTCC-
** * ***
Mean pairwise ID: 45.67%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
TET.ROS. GCCAGG----GTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
*** ** ** ** ******* * * * * * * * * ** *
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
**** ***** * ** * **** * * *** *** * **
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG-GG
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGG--GCATTAAAGAGCTGA
* * ******* * * ******** ** *** *** *
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** *** ** * ***
XEN.LAE. T--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * * ** * * * * ******
Mean pairwise ID: 45.69%
ZEA.MA_E -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
* * ** * ** ***** * ** * * * * * *** ****
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCA-GCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** * * *** * ** * * * * * * * *** * *** *
ZEA.MA_E AAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATT--CAGGT-TGGCTAA
*** * * * * ** ** * * *** * *** * *** **
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCG--CCGGCTTCCAACGG
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGA-AAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAG
* *** *** * * * ** * * * * **** ** * ** * * *
ZEA.MA_E TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
DRO.MEL. TAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTA--TCAGCCC---AACCGATATGGTTG
* * ***** ** *** * * * **** ** * ** *
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
DRO.MEL. GACCACAATCTTT
****** ******
Mean pairwise ID: 45.69%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
***** ** ** * ******** * * * * * *** *
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
**** * ** ** * ** ** * * **** * ** ****
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG-----
** ** ** * * * * * * * ** * * * * * *** * * ***
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
CAE.EL_C GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
* ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * *******
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
CAE.EL_C CCGGACAGCGCTTGTGAGTT-----GACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTC-AG
*** ** *** ** * *** * ** ** ** ** * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT--
CAE.EL_C ACCACTTGTCACT
***** *
Mean pairwise ID: 45.70%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT
* * *** ** ******* * * * * ** * * ** **
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* **** ***** * *** **** * * *** *** * **
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
* * ******* ** * * ** ******* *** *
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
HOM.SA_A T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT-----
* * * * ** * ** * ** *** * * **** *
HOM.SA_A TT
TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 45.71%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA
CAE.EL_C --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-TGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** * **** ** * ** ** * ** * ** * **** ***
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAGTCCCGGGTGCATA---
** ** ** *** * ** * ** *** * * ** ***
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCT-GTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG
CAE.EL_C --AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTG
**** ** * ** * * * * *** ** * * *****
ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG-C
CAE.EL_C CAGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA---CACAGCCTTCTCAATACCTTC
* * * * ** * * * * ** ** * ** **** * ** *
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT-
CAE.EL_C AGACCACTTGTCACT
******* *
Mean pairwise ID: 45.72%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT--
* ** ** ** ***** * * * *** * **
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA--GTTT--GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC
*** **** * *** * * * * ** * * * * * * **** **** *
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCAT-TAAAGAGCTGA
* ** * * ** ** * * ** * * ** *** *** *** *
CAE.EL_D GGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
*** * ***** * ** * *** **** **** * ** **** ***
CAE.EL_D C--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT----
* ** * * ** ** * ** * * * * ****** ***
CAE.EL_D ATTT
TET.ROS. ----
Mean pairwise ID: 45.75%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TET.THE. -------GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGG--CATAAACAA-TGTAGGTTG
* * ** * ** *** * * * ** * ** *** * * *
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
TET.THE. TGATAGAT-AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* *** **** * ** ** * * * * * * * *** ****
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGG-GATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCAT-TAAAGAGCT
* * ** * * ** * **** * * ** * * ** *** *** ***
CAE.EL_A GTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
*** * ***** * ** * *** **** **** ** ** **** *
CAE.EL_A GAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT--
** * ** * * ** ** ** ** * * * * ***** * *
CAE.EL_A TCATTT
TET.THE. ------
Mean pairwise ID: 45.75%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
*** * * * ******* * **** ** * * * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G
** * ** ** ** ** ** * * * * *** ** ** * * *
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
TRY.BR_B TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAA
** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** * *
LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCA
* ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** * ** * *
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTACCA
TRY.BR_B CACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----
* ** ** * ** * ** *** * * * ** * ** *
LYC.ES_E CATTTT
TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 45.75%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
TET.THE. -------GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGG--CATAAACAA-TGTAGGTTG
* * ** * ** *** * * * ** * ** *** * * *
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
TET.THE. TGATAGAT-AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA
* *** **** * ** ** * * * * * * * *** ****
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGG-GATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCAT-TAAAGAGCT
* * ** * * ** * **** * * ** * * ** *** *** ***
CAE.EL_D GTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
*** * ***** * ** * *** **** **** ** ** **** *
CAE.EL_D GAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA
TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT--
** * ** * * ** ** ** ** * * * * ***** * *
CAE.EL_D TCATTT
TET.THE. ------
Mean pairwise ID: 45.75%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
TRY.BR_B -------------------AGCCGGAGCGC--ATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATC
* * ** * * *** * * ** ** ** *
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGG----GCTGTAGTGC-GCTATGCCGATGGGGTGTCCGCA
TRY.BR_B CCGCTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TG
* * *** * ** *** ** * ** * * * * ** ***** *
HOM.SA_B CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
TRY.BR_B CTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAA
** *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * ***
HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
TRY.BR_B GTGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTT
* **** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * **
HOM.SA_B GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCC
TRY.BR_B GCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGT
* * * * * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***** *
HOM.SA_B GTCTCT
TRY.BR_B TT----
*
Mean pairwise ID: 45.78%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
**** ** *** **** ** ***** ** * * * ** * ** * *
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAA--GGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* ** * * ** ** * * **** * * ** ** * ***
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGC--CTTTAGAGTGGGAT
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT
* * * ** ** * *** ** ** ** * *** *
LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
* ** * *** ** ** ***** * ***** * * **** * **
LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA
XEN.LAE. ATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGC--AGAACAGCCTGA---ACAACACAGCGAGAC--
*** ** * *** ** * * ** * ***** * * * **
LYC.ES_F TCACTTTT
XEN.LAE. ACAGTTCT
** ** *
Mean pairwise ID: 45.79%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** ***** ***
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGC---TCGTTGT-GACACTGGCCGGCTTGCCCATC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC-GTCCGTG
** ** * * * **** * ******* ** * *** * ** *
ZEA.MA_A CCAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGG
CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGG
***** * * ** * * ** * * * * * * * * * **
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
CAE.EL_B AGTGGTGG--ATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCG
** ** * **** * * * * * * *** ** * ** * **
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
CAE.EL_B GTGCAGTGGC--CGGA----CTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT
*** * ** * **** *** * ** * ** * *** **
ZEA.MA_A -----CAAACCACCATCTTT-
CAE.EL_B ACCTTCAGACCACTTGTTTTT
** ***** ***
Mean pairwise ID: 45.80%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGC-TAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG
*** * * * **** * * * *** *** ** * * * ** *
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC
LEI.MAJ. GACCAGCGAG---GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTGTGTCGG
** * *** * *** * * * * **** * * * ** ** *
TET.THE. TATGG-TGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGA-GCTAAGGAAACGCC
LEI.MAJ. TGTGGCTTGCCCCCCTGCAG-AGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGG
* *** * * ** * * *** * * * * ** ** * **** **
TET.THE. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATACT
LEI.MAJ. TCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGT-CCGCCGTTGCAGAATCACACCGC
****** ** *** ** *** * * * * * * ** * ** ** ***
TET.THE. CATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT
LEI.MAJ. GGAGCATGTCCGCACT--TGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
* * *** * * * ** ** ** * * **
Mean pairwise ID: 45.81%
ZEA.MA_A -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
* * * * * * * ** * ** * ** * **
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGAC---AGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAAT--GA
* ** * ** ** * * * * * * ** ** *** ** *
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
TET.THE. GTTGCTA-----TGGTGGTAAC-CTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCAT-TAAAGAGCTA
**** ** ****** * **** * ** * * *** ****
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
TET.THE. -AGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA
***** ** * ******** ***** *** ** *** * ** *****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAAC
TET.THE. AGGATAACATACTCATTA-ACTGTCAAACTAATC--GGTTCTA---CTATCAAAGCCAGA
******** * * * *** * * **** ** ** ** * **** *
ZEA.MA_A CACCATCTTT
TET.THE. CATT------
**
Mean pairwise ID: 45.81%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGA--CAATAAGGGGATGGGACGT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * * * * *** * * * ** ** * * * ** *
ARA.TH_C TGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGG-GTTGG-GCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGC----TGTG
** * ** * * ** * * *** **** * * **** ** *
ARA.TH_C AGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG
LEP.COL. TGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCC--TCCGTTAAAGTAG
** ** * * ** * ***** ** * * * ** ** *** *
ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTC-TTGACGGTGG
LEP.COL. AGGA-ACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTG
*** ** * ** **** ** ** ******* ******* *** * * * ** *
ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA
LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTC--ATCACCTGCGCCCCA----GGCGATCCTGTGAAG
** * ** * **** * * ** * **** * ** *** *
ARA.TH_C CCATCACTTT
LEP.COL. CTTT------
* *
Mean pairwise ID: 45.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGACAAGTGTGGATG
*** * ** *** * ****** * ** * ** ** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
CAE.BRI. G--AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCG--GCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGC
*** * ***** * *** * * ** * * * **** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
CAE.BRI. CAAG---CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGC---GGTCCCGGGCGCA
**** ** * * * *** ** ** * ** * * * * *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
CAE.BRI. TAAGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGA------AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGC--
*** * * **** ** *** * * ***** ** ** * *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
CAE.BRI. ---GCGGTGCAGTGGCCGGATA--GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTG
* ** * * ** * ** * * * * ** ***** ** * ****
ORY.SA_A CAAC----AGACCACC-ATCTTT
CAE.BRI. ATACCTTCAGACCACTTGTCATT
** ******* ** **
Mean pairwise ID: 45.83%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGC
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******* * *** ** * * * * *** *
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTC-ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRY.BR_B CTTGGACAA-------GCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG------G
* * ** ** ****** * * ** *** ** **** * *
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACC--TATAGTG
TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG---AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG
*** ** * **** * **** *** * ** * ** ** ****
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
TRY.BR_B GGGGGAACGG-GTCAGGCCG--GTGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTG
* ******* ** **** * * ** ******* *** ** * * ** *
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TRY.BR_B CAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
** * *** *** * ** ** * ** * ** * * ** *
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
TRY.BR_B TTT---------
Mean pairwise ID: 45.83%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG
* ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * *** * **
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA
CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** * * * ** * *** * * ** * * ** ** * *
ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** *
ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCC-GCTGGTTCGATCTCTCCTG
CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAAT-------AGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAA-CATAGCGA
***** * * * * ***** ** ** ** * * * *
ARA.TH_D GACCACCACTTT
CAN.SPE. GACCCCGTCTCT
**** * ** *
Mean pairwise ID: 45.83%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** * * *****
ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCT---TGCCCATCCCA
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGG---AGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * **** * ** ** * ** * * ** * ***
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
** ** * ** ** ** *** * * * ** * *
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
CAE.EL_D CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAA-AAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
* * **** * * * * * ***** * * ** ** * * * ****
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
CAE.EL_D CCGGACC----GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTT-CAGAC
*** ** ** * **** * * *** * ** ** * * ** **
ZEA.MA_B CACC-ATCTTT-
CAE.EL_D CACTTATCATTT
*** *** **
Mean pairwise ID: 45.83%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** ** *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG--CCGAGCGGGCGTCCGCG-CT
**** * * * ******** * ** * ** * *** *** * * * *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGC
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG-GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
* * ** * * ** * * * * * * * * **** *
ZEA.MA_B GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGT
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * **
ZEA.MA_B GGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAA
GAL.GAL. AACGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGG----CAACATAGCGA
**** * *** ** * * ** * ** * * * **** *
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
GAL.GAL. GACCCTGTCTCC
* * ***
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** **
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * **** * *** **** ** ***
LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA
CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA--GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** * * *** * * * * **** * * ** * *
LYC.ES_B ACCACCACTTTT
CAE.EL_A CTTATCATTT--
* ** **
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATAAGTGTG
**** * ** ** * ****** * ** * * ** * * ** **
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** **
LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * **** * *** *** ** ***
LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA--GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** * * *** * * * * **** * * * ** ** *
LYC.ES_N ACCACCATTTTT
CAE.EL_A CTTATCATTT--
* *****
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGT----GGGGATGTTAAGGTG---GTGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * * ** ** * ** *** * ** * * * * * *** ***
LYC.ES_E AATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
* * *** * * *** ** * ** * * * * ** ***
LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTG
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTC-TCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG
** * * ** * ** *** * * *** *** * * * * * *** * *
LYC.ES_E GGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGG--GCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
**** ** * *** * * **** **** * **** *********
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCAC
***** ** * * ** * ** * **** * * ** *
LYC.ES_E CTACCACATTTT
CAE.BRI. TTGTCATT----
* **
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** **
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * **** * *** *** ** ***
LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** * ** * * * * **** * * * ** ** *
LYC.ES_I ACCACCATTTTT
CAE.EL_D CTTATCATTT--
* *****
Mean pairwise ID: 45.86%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** ** * ******** * * * * * * *** *
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
**** * ** ** * ** ** * * **** * ** ****
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG-----
** * ** * * * * * * ** * * * *** * * ***
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
CAE.EL_A GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
* ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * * *******
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
CAE.EL_A CCGGACCGCGCTTGTGAGTT-----GACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCTTC-AG
*** * ** *** ** *** ** * ** ***** ** * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT---
CAE.EL_A ACCACTTATCATTT
***** *
Mean pairwise ID: 45.86%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** ** * ******** * * * * * * *** *
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
**** * ** ** * * ** * * **** * ** ****
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG-----
** * ** * * * * * * ** * * * *** * * ***
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
CAE.EL_D GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
* ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * * *******
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
CAE.EL_D CCGGACCGCGCTTGTAAGTT-----GACACAC-ATACACAGCCTTCTCGATACCTTC-AG
*** * ** **** ** *** ** * ** ***** ** * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT---
CAE.EL_D ACCACTTATCATTT
***** *
Mean pairwise ID: 45.86%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** ** *** * ****** **** * ** * * * * * *
CAE.EL_D GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCG---TTCCAAG
* ** ** * * ** * *** ** ** * ** ** *** *** *
CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGGGT--CTCACGGTCCATAATG
* * * ** **** * * ** *** ** * * *** ***** *
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
* * * * * * * * * ***** * ** * **** * * **
CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCG---ATACCTTCAG
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
** *** * ** * * * * * **** * * ** ***
CAE.EL_D ACCACTTATCATTT
TRI.AE_A ACCACC--------
*****
Mean pairwise ID: 45.87%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTT-AG
** * ** * * * ** ** ****** * * *
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG
** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * **
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG
*** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * **
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
TRY.BR_B GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG
** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * *
HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
TRY.BR_B AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * *
HOM.SA_A CTT
TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 45.90%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGA-AATGGGACTTTAGTT
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT--CT
*** * * * ******** * *** ** * * *** * *
HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCA-TTCCAAGCCGAG
TRY.BR_B TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT
** * * ** ** * * ** **** ** **** ** * * **
HUM.JA_B AGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA
TRY.BR_B GTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGTGGGGGG-AA
* * * * * * * *** ** ** ***** ** *** **
HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCA
* ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** * ** * *
HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTT
TRY.BR_B CACCGAGGAGCATCTCAGGACT----TTGCGCCCCAAGTG---TCGTCGCGAGGCGGTTT
* ** ** ** * * * * * * ** ** * * * ***
HUM.JA_B CTTTT
TRY.BR_B -----
Mean pairwise ID: 45.90%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
TET.THE. -GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT
*** * * * ***** * * ** * * * * * *
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGAT---GAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGA
* * * * * * * * ** * ** ** ***** ***** * **
HUM.LU_B GTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCA
TET.THE. GTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCAC--CAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAA
**** ** ** **** * *** ** * ** * * ** *
HUM.LU_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATA
TET.THE. ACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATA
* ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * ***********
HUM.LU_B ACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTT
TET.THE. AC------ATACTCATTAA-CTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-
** * ** ** * ** * * *** ** ** * ****
HUM.LU_B CCTTT
TET.THE. -----
Mean pairwise ID: 45.91%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_G TTTGC--GATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGC----GACCGAGC-GTCCGTGC
** * ** * *** * * *** * ** * *** * * **** *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.BRI. CAAGCGCTGCGTCGCCA--GGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA--
**** ** ** ** * ** * * * *** ** * * *
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT
CAE.BRI. ---AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGC-----GC
**** *** * **** * * * ***** ** ** * * *
ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG---
CAE.BRI. GGTGCAGTGGCCGGATA--GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACC
** * * ** ** *** * * ***** ****** ** *
ZEA.MA_G --CAGACCACC-ATCTTT
CAE.BRI. TTCAGACCACTTGTCATT
******** ** **
Mean pairwise ID: 45.93%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G
*** *** ******* * *** ** * * * ** *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGT--CCAAGC
TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTC
* ** **** ********** * ** ** **** ** * *
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
TRY.BR_B GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGT--GGGG
*** * * ** *** ** * * * ** ** ****** * **
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
* ** * ** **** *** ** ******* * ** * *** * ** * *
ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT-
* **** * * ***** ** * * ** *** * * *
ARA.TH_E CCATTTT
TRY.BR_B -------
Mean pairwise ID: 45.93%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** **** ** *** ******* * * * ** * *
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * ** **** * * ** ** **** * * * * ** * * ****
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTC-TCATGTCTTCTAGAGTGGGG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* ** * ** * *** * * * ** * ** ** ** *** *** * ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
*** *** ** ** ***** * * **** * * ** * *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
FUG.RUB. GATCGCGC-CCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCT
*** ** ** * ** * * * *** * ** * *
ARA.TH_C TCACTTT
FUG.RUB. TT-----
*
Mean pairwise ID: 45.95%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGA-ACACT
TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTG-TCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGAT
** * * * * * *** * * ** ** ** * *** ** *
ARA.TH_G GGATCGGCC-CACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGCTCCAAACA
*** ** * ** *** * * ** * ** ***** ***** *
ARA.TH_G GTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
TET.THE. ATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAG--GACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
***** * ** **** ** * * *** ** ***** *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
** * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ***** *
ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC
TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA--TCAAAGCCAGACATT--
** *** * ** * * * * ** ** ** * ** *
ARA.TH_G CACCATTTT
TET.THE. ---------
Mean pairwise ID: 45.95%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAA----TGGGGGCATTAATGTGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
**** * ** * * ** ***** **** **** * * * *** ***
LYC.ES_I GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * **
LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * **
LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAA-AGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG
** * * *** ** * ** * * * ** * * ** *
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTC
**** ** * * *** * * *** * ** ** * * * *
LYC.ES_I ACCATTTTT
FUG.RUB. AGTCTTT--
* ***
Mean pairwise ID: 45.95%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
** * * **** ******** *** * * * * * ** ** *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* ** **** * ** ** * * **** * * * ** ** * ***
HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
** * ** *** * ** * ** * ** * * * * ** * * ***
HUM.LU_B CAATGCG--TGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG
* ** *** ** ** ****** * * **** ** **** * *
HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTG------AATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGAC
*** ** *** *** * * ** * * * ** * ** *
HUM.LU_B ATTTCCTTT
XEN.LAE. ACAGTTCT-
* *
Mean pairwise ID: 45.97%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT
* * *** ** * ***** * * * ** * * **
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA
*** * * ***** * *** **** * * *** **** * **
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* * ******* ** * * ** ******** ***
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
*** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * ***
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACT--AATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT
* * * * ** * *** * * * * ** ** * * ** * * *
Mean pairwise ID: 45.98%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** ** * ** ***** ***** **** * * *** *** *
ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTC--TGGACTGCCCAATCCA
FUG.RUB. GCTTGA---GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA
** ** ** ** * ** * ** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
FUG.RUB. AGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * *** ** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
* * * *** ** ** ***** * * **** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA
FUG.RUB. GGGA-------TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACC-TGAGTAACACAGCGGG
*** *** ** * * * ** * ** * ***** * *
ARA.TH_G ACCACCATTTT
FUG.RUB. ACTCAGTCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 45.98%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA
* * * **** * * *** *** ***
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
LYC.ES_M TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
LYC.ES_M AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
**** * * * *** * ** * ** * **** ** * * *
HOM.SA_A CCGTCTCTT--
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* * * *
Mean pairwise ID: 45.98%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA
* * * **** * * *** * ***
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
LYC.ES_M TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
LYC.ES_M AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
**** * * * *** * ** * ** * **** *** * * *
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* * * **
Mean pairwise ID: 46.00%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGA-TGTGAACGC
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******* * *** ** * * * * ***
TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
TRY.BR_A CTTGGACAAGCGGGGGTTCTG--TTGCGTTGACT--TGGTGTTCTGCTTG------GTTG
* * ** * ** *** ** ** ** ** ** * ** * ****
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
TRY.BR_A CGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCG-CCGTTAAAGTGGGGGG
*** ** * ** ** * * **** ** * *** **** **
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGAAGG
TRY.BR_A AACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC
** * ** **** ** * ** ******* *** * * **** ****
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
TRY.BR_A ACACCGAGGAGCA----TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-----
* * * * ** ** *** * * * ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 46.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGG-TAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATG
TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAG-GTTG--TG
****** **** * ** * ** ** ** ** * **** **
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
TET.THE. ATAGATAGGATATG---AGAGTTTGATGAGACAGTTTGC--TAAG-AGTGTGCCCGCTCC
* * * * * * ** ** ****** ** * * ***** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAG
TET.THE. AAACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTC--CACCAGGGCATTAAAGA
** * * * ** ** *** * *** * * *** *
ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT
TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGT
** * ** * ******* ***** *** ** ** ****** ***
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
TET.THE. GGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT--CGGTTC---TACTATCAAAGCCA
*********** * * * * * *** * * * ** * * **
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
TET.THE. GACATT-------
***
Mean pairwise ID: 46.01%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
* * * * * * * *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * ** ** * * ** * * ** * * *** * ** * ******
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGG-ACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG
CAE.EL_A -GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT----GCATAAGGA
* * ** * * ** * *** ****** * * * * * *
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC
* ** ** * ** * ** ***** * * * **** *******
HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
CAE.EL_A GGAC--CGCGCTTGTGAG--TTGACACA-CA-TACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA
*** ** ** *** * **** ** ** * ** * ** * * * **
HUM.LU_C CCATTTCTTTT--
CAE.EL_A CCACTTATCATTT
*** ** * *
Mean pairwise ID: 46.01%
ZEA.MA_C -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG
* * ** * ** ***** * ** * * * * * *** * *
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCC
DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTA--CTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
* ** * * * * *** ** * ** ***** * * *** *
ZEA.MA_C AAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATAT-GGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA
*** * * * * ** ** ** * ** ** *** *** *** *
ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA
** * **** * * *** * * ****** * * * ** * * * **
ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA
DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT----TG
* ***** * ** * * ** ** * *** * * ** *
ZEA.MA_C GACCACCATTTTT
DRO.MEL. GACCACAATCTTT
****** ** ***
Mean pairwise ID: 46.03%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATGAG--TGTG
*** * * * ** * ** *** * ** * * ** * *** * * **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * * * * ** * ***
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA---
CAE.EL_C TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
* * **** ** *** *** * * ** * * * * *** *
HUM.LU_A -GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******
HUM.LU_A GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATA
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATACACAGCCTTCTCAA---TACCTTCA---
* *** * ** * * * * ** ** ** * * ** * *
HUM.LU_A GGACCATTTCTTTT-
CAE.EL_C -GACCACTTGTCACT
***** ** *
Mean pairwise ID: 46.08%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TET.THE. GCCAGGGT-AGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA
*** * * ** * * * ** ** ** * **** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TET.THE. GGATATG-AGAGTTTGAT-----GAGACAGTTTGCTAAGA--------GTGTGCCCGCTC
** ** * **** * ** *** * * * ****** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
TET.THE. CAAACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT-------CCACCAGGGCAT
*** * ** ** ** * * * * * * * ***
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACA-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TET.THE. TAAAGAGCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGT
***** * * * * * ** * ******** ***** *** ** *** ******
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
TET.THE. TGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATC---------GGTTCTACT
*************** ** * ** * * * ** * **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
TET.THE. ATCAAAGCCAGACATT---
* * ** * ***
Mean pairwise ID: 46.10%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGA-GTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGT
TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAG-GTTGTGAT
** * * * * * **** * * **** ** ** ** * * *
ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGCTCCAAACA
* * * * ** ** ** * ** ** ***** ***** *
ARA.TH_D GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGC-GGATTCTAAAGTCGGAGG
TET.THE. ATGAGTTG-CTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
***** ** ** *** * ***** * ** ***** * *
ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG
TET.THE. GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
* ** ** * ******* ***** *** ** **** ** *** * ***** **
ARA.TH_D ATCATA-GTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCAAA-CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----
** * * ** ** *** * * * * * * ** * * *
ARA.TH_D ACCACTTT
TET.THE. --------
Mean pairwise ID: 46.10%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
**** * ** ** * ** ***** ** ** * * ** ** * * *
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTGAAGGGCTAATGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * * ** * * ****** * ** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGGAT
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGGT
* * * * ** ** *** ** * ** * *** *
LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
FUG.RUB. GCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG
* * * *** ** ** **** ** ***** * * **** * **
LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA
FUG.RUB. ATCGCG--CCCGTGA--ATAGACGCTGTAGTTCAACCTGA---GTAACACAGCGGGACTC
*** ** * *** * ** * * ******* ** * * **
LYC.ES_F TCACTTTT
FUG.RUB. AGTCTTT-
****
Mean pairwise ID: 46.13%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
**** ** ** ** ** **** ** ** * * * ** * * * * *
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * * ***** * * **** * * ** ** * ***
LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * * *** ** * * * **** ** ** * ***
LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** *
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
RAT.NOR. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGAGAC
***** ** * *** * * * ** * **** ** * ** * **
LYC.ES_F CATCACTTTT
RAT.NOR. C--CGTCTCT
* * * *
Mean pairwise ID: 46.13%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGG--GGACAATAAGGTGGTGGAACAG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ** ** ** ** * ** *** * ** * *** * ** ** * * *
ARA.TH_D TGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATC--TGAGCTGCCCAGTCCAA
XEN.LAE. C--TTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTG-CACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** * * * * ** * *** **** *** ** * * ** ** * **
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTA-AAGTCGG
XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * * * *** * ** * ** ** * *** ** * ** *** **
ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * *** * **** *
ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA
XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGC------GAG
***** * * * * * * ** * *** * * * *
ARA.TH_D CCACCACTTT
XEN.LAE. ACACAGTTCT
*** * *
Mean pairwise ID: 46.13%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** ** * ****** * ** * **** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCA-ACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * * *** * * *** **** ** * *** ** * ** *****
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* ** ** * * * * ** * * * * *** *** **** *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
* ** * * * * * ***** * * * **** * ******* **
ARA.TH_G GACAACGGTT-CGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
*** ** ** ** **** ** *** ** * * ** ****
ARA.TH_G CCACCATTTT
CAE.EL_B TTT-------
Mean pairwise ID: 46.13%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * * ****** * ** * ***** * * *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGCA-TGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
* * * ** ** * *** **** ** ** * * ** ******
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA
** ** * * * ** * ** * * * * * *** * * *** *
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
** ** ** * ** * ** ***** * * **** ******* *
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
CAE.EL_B GGACTGCGCTTGTGAGTTG------ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC
*** * ** * ** * ** *** * ** * ** * * ** *
ARA.TH_E CACCATTTT-
CAE.EL_B ACTTGTTTTT
****
Mean pairwise ID: 46.13%
TRY.BR_B ------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGA
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCG-AGTGCT-TGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGG--TAGTGTGGA
* * **** * **** ******* * **** ** * *** * ***
TRY.BR_B CGTC-----TTGGACAAGCGGG-GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-----TGCTTG
ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA
*** * * ** * * ** *** *** * ** * * * *
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGG-GTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGC
******* ** *** ** *** * * ** * * ********
TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-CACCAGCGGTGGA
** * * ** **** ** * * ******* ** * * ** * * **
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
ZEA.MA_H AGGATAATGAG-----TCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------
** * * *** ** * ** * **** *
Mean pairwise ID: 46.15%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
**** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** **
CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA
* * *** * * * ** ** ** ** *** ** * **** ***
CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG
CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** ** * * *** ****** ** * * * * * **
CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTG-CAGTGG
* * *** * *** * ** * *** * * * * * * ****
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA
CAE.EL_D CCGGACCGC--GCTTGTAAGTT---GACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC
*** * ** * ** * * ** *** ****** ** ***
CIN.HYB. CACCCATTT---
CAE.EL_D CACTTATCATTT
*** **
Mean pairwise ID: 46.15%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * ***
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
GAL.GAL. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC-AGGTT-CTAGAGTCG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATA-TGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** ** **** * * ** * *** * ***** * ** *
ARA.TH_F GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA
* * * * * *** ** ** ****** * ***** ****
ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCT-GCTGGTCCGATCTCATATG
GAL.GAL. CGGGATCGCGCCTGTGAAT-------AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAG
***** ** * * * * ***** ** * ** * * * * *
ARA.TH_F AACCACCATTTT
GAL.GAL. ACCCTGTCTCC-
* ** *
Mean pairwise ID: 46.15%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** * *
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTT--CTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
**** ** * ** * ** * ** * * * * * * ** *** * ***
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTG--GACCTATAGTG
XEN.LAE. TTCG--GTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAG
** * ** * * * * * * * *** ** ** * * *** * *
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG
* **** * *** * ** ****** * ** * * * ** *
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
XEN.LAE. TGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCGGTGCAGA-ACAGCCTGAACAACACAGCGAGACAC
**** * *** ** * ** * * **** ** ** * * **
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
XEN.LAE. AGTTCT------
* *
Mean pairwise ID: 46.15%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
TRY.BR_B ------AGCCGGAGCGCAT---TGCTCTGTAAC--CTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG
** * *** * ** * * * *** * ** ** * * * **
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
TRY.BR_B GGGACGTCTTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGTT
*** *** ** * * * * ** ** ***** * ** ***
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTC-CTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
TRY.BR_B GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTT--AAAGTGGGG
** ** * * * * ** * * ** * * * * * * ** * ****
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
TRY.BR_B GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
**** ** **** *** ********* ** * ** * * ** * * *
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGC-CGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCG--GTTT-
* * ** ** * * * * * * ** * * ***** * ***
Mean pairwise ID: 46.18%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT--
**** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCC---TGTCCAAG
CAE.EL_A GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * *** * * *** * *** ** * ** **** *
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * **** *** ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * *** * * * * * ***** ** *** **** *******
LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCAG--
** *** * * *** ** ** * **** * * * ** **
LYC.ES_K AACAACCACCTTT-
CAE.EL_A ACCACTTATCATTT
* ** * * **
Mean pairwise ID: 46.18%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG-
** ** * * * ** ** ****** * *
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG
** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * **
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG
*** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * **
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
TRY.BR_B GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG
** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * *
RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTC
TRY.BR_B AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCG-GTTT-
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * ** *
RAT.NOR. T
TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 46.18%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG-
** * ** * * * ** ** ****** ***
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC---TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG
** *** *** *** ** * * * ** ***** * ** *
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG
** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ***
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
TRY.BR_B GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
* **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * *
ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT---
* * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * * *
ORI.CUN. C
TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 46.18%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** **
ARA.TH_F ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC
* * ** * * * ** * *** * * * **** * ** **
ARA.TH_F AAGCTGTGAGTAATTAGTGT-TGA--GTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGT
CAE.EL_B AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
**** ** ** * ** * *** ** * ** ** * * * * **
ARA.TH_F CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT
CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAGT
** ** * * * ** * **** ** * ** * ** * *****
ARA.TH_F GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
CAE.EL_B GGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG------ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCA
** **** ** ** * ** * ** *** * ** * ** * *
ARA.TH_F GAACCACCATTTT-
CAE.EL_B GACCACTTGTTTTT
** * ****
Mean pairwise ID: 46.18%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT--
**** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT--TCTGGCCTGCCC---TGTCCAAG
CAE.EL_D GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * *** * * *** * ** *** * ** **** *
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * **** *** ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * *** * * * * * ***** ** *** **** *******
LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG--
** *** * * ** ** ** * * **** * * * ** **
LYC.ES_K AACAACCACCTTT-
CAE.EL_D ACCACTTATCATTT
* ** * * **
Mean pairwise ID: 46.20%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGG--GGGCATGTGGGAAATGGAACATTGG
DRO.MEL. -------GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGG
* * ** * * * ** ** * ** ** * * ***
HUM.LU_B GTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGT-TAGCTGC----------TTACTGGTCTGCCCA
DRO.MEL. GATGGCCT-GAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCG
* *** * ** * ** ** * ** **** * ** ** * **
HUM.LU_B TTCCAAGCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAG
DRO.MEL. CACTAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAA
* **** * * ** *** * *** ** * *** * * ***
HUM.LU_B AGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCA
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCA
* ** * * * * *** *** * ****** * * ***** ****
HUM.LU_B GTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAA
DRO.MEL. GTAGTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATA--TGG
** * ***** ** **** * *** * ** * *** * ** *
HUM.LU_B TCGGACCATTTCCTTT
DRO.MEL. TTGGACCACAATCTTT
* ****** ****
Mean pairwise ID: 46.20%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA----GGGTATCAAAGTGGTTGAAC
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
****** *** *** * ** ** * ** * ** * * * *
CIN.HYB. TTTGAGCTTG-GCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA
GAL.GAL. C----GCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCG---TCCG
***** ** ** * ** *** ** * * ** ** ** ***
CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGC---GAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAA
GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCA-ATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTA
* ** ** *** * * ***** * * ** * * ** ** *
CIN.HYB. TCGGGGGGCAATGCG--TTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGAC
GAL.GAL. AGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTC
* **** * ** *** ** ** **** * *** *** * * *
CIN.HYB. TGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAAC-CAGCCTGGCTAGCCCAA
GAL.GAL. AGTAACGGGATCGC--GCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAG
** **** * *** * * * ** * * * ******* * * *
CIN.HYB. CAGGACACCCATTT--
GAL.GAL. CGAGAC-CCTGTCTCC
* *** ** * *
Mean pairwise ID: 46.21%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA-GTCAG
YAR.LI_B -----AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG--TAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCG
* * **** * * * **** **** * ** * ** *
TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTG-AGTTG
YAR.LI_B AGTTCTGGACTCTG------CACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTG
*** ** * ** ** * **** ** ** **** ** ** ****
TET.ROS. CTATG-GTGGAAACCT-AGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-GAACCG
YAR.LI_B ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATA
* * ** ** ****** ** ** * * ** * * * *
TET.ROS. CCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCT--TATTGTGGTGGAAGGATAAC
YAR.LI_B CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAAC
* **** **** * *** ** * ****** *** * ***** * ***
TET.ROS. ATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
YAR.LI_B AAAGTGGT-ATATGTTATGGAAG--GTATTTGCAATCACGACTCTC----
* * * * * *** * * * * * *** ** **
Mean pairwise ID: 46.25%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_D ---------------------------------TA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
** ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
**** * ** * * * * *** *** ** ** * *** ** ****
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
****** ********* ************ * ** ********** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCAC
* * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** * * ****
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_D CACTTTT
******
Mean pairwise ID: 46.25%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * *** * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * ***
ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
ORI.CUN. GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGACCC
*** ** ** ** * * * **** ** * * ****
ARA.TH_C TCACTTT
ORI.CUN. TGTCTCC
* **
Mean pairwise ID: 46.25%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGC-AGCTTCTGTAATC---ACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGG--G
* * * * ** ** ****** * ** * ** ** ** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTG-TAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
DRO.MEL. ATGGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCA
* * * * **** ** * * * ** *** ** * ***
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
DRO.MEL. CTAAGCTTGCCATCAATATG--GGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTT--GGC-
* *** * * * ** ** *** * ** ** * ** ** * ***
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
DRO.MEL. -TAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTA
*** * ** * * ** * * *** ** * ****** * * * ****
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
DRO.MEL. GGCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAA----CCGAT
* ** * ***** * * * * ** *** * ***** ** *
ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT
DRO.MEL. ATGGTTGGACCACAATCTTT
* ****** ******
Mean pairwise ID: 46.25%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG
** * *** * * * * *** *** * *****
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** *
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
YAR.LI_B CTGCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * * *** * * * * * *** **** ***** * * * *
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTA
** * * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * *
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
YAR.LI_B TGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGT-TATGGAAGGTATTTGCAAT-----CAC
* *** * * * * **** ** * ** ** * **** ***
LYC.ES_G CACTTTT
YAR.LI_B GACTCTC
*** *
Mean pairwise ID: 46.26%
TRY.BR_A ------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGA
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCG-AGTGCT-TGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGG--TAGTGTGGA
* * **** * **** ******* * **** ** * *** * ***
TRY.BR_A CGTC-----TTGGACAAGCGGG-GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-----TGCTTG
ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA
*** * * ** * * ** *** *** * ** * * * *
TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGG-GTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGC
******* ** *** ** *** * * ** * * ********
TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-CACCAGCGGTGGA
** * * ** **** ** * * ******* ** * * ** * **
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG
ZEA.MA_H AGGATAATGAG-----TCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------
** * * *** ** * ** * **** *
Mean pairwise ID: 46.28%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAATG-TGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* * * ** ** * ** ***** ***** **** * * * * *** ***
LYC.ES_N GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * **
LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * **
LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAA-AGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG
** * * *** ** * ** * * * ** * * ** *
LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTC
**** ** * * *** * * *** * ** ** * * * *
LYC.ES_N ACCATTTTT
FUG.RUB. AGTCTTT--
* ***
Mean pairwise ID: 46.28%
ZEA.MA_B -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
* * * * * * * ** * ** * ** ***
ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTC-TGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAGAGTGTGCCCG--CTCCAAACAATGAG
* ** **** ** * * * * * * ** * * *** * * * **
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
TET.THE. TTGCTA-----TGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT---CCACCAGGGCATTAAAGAGCTA
*** ** ** ** **** * ** * * * * ** ** * *
ZEA.MA_B -GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTGTTGTGGTGGA
**** ** * ******** ***** *** ** *** *** *** *****
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACC
TET.THE. AGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT-CGGTTCTA----CTATCAAAGCCAGAC
********* * * *** * * * ** * * * * ** ** *** * *
ZEA.MA_B ACCATCTTT
TET.THE. ATT------
*
Mean pairwise ID: 46.28%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** * *** ** *** *
ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * * * * ** ** * * * ** * ** ******
ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCT-TGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA
* ** * ** * * ** ****** * * * *** * ** *
ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC
** ** ** * ** * ** ***** * * **** * ******* *
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
CAE.EL_A GGACCGCGCTTGTGAGTTGA-CACACATACGCAGCCTTCTCGATAC--CTTCAGACCACT
*** * ** ** * ** * ** * ** * * * * * * *** * *
ARA.TH_F CACCATTTT
CAE.EL_A TATCATTT-
* *****
Mean pairwise ID: 46.30%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAG---CTGAACAG
*** * *** *** *** *** ******* * * * ** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LEP.COL. GGAGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT
* ** ** * * * ** ** ** * ** * * * ** *
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LEP.COL. GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCG--CGCCCCCTCCGTTAAAGTA
* * ** * * * * * *** * ***** ** ** *** * ** ***
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LEP.COL. G-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC
* ** * ** ** **** ** ** ******* *** * * ** ** **
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
LEP.COL. AGA---ACCACACCGC-GGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGA-TCCTGTGAAGCT
* * * **** * **** * * * ** **** * * * * **
ORY.SA_B CCACCACCTTT
LEP.COL. TT---------
Mean pairwise ID: 46.30%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
***** * * ** ******* ** ** ** * * * * *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
* * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** * * ** * **
HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** * ** ** ** ** * * * **** * **
HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * * ****
HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA
GAL.GAL. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGC---CTGGGCAA---CATAGCGAGA
**** ** *** *** * ** * * ** *** * ** **
HUM.LU_A CCATTTCTTTT
GAL.GAL. CCCTGTCTCC-
** * ***
Mean pairwise ID: 46.30%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG
* ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * ****** **
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
* * ** * * * ** * *** * * ** ** * ** ** * *
ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** *
ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
HOM.SA_B TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--AGC---AACATAGCGAG
***** * * * * * **** *** * * * * * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT
*** * ** *
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_A -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATG
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG
* * ** * ** ***** * ** * * * * * *** ** *
ZEA.MA_A CTTTGCGATGG--CTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCC
DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCT--CATGTTGAC-GGAACGTCCGCAC
* * * *** * *** * ** * * * * ** * ** * ** *
ZEA.MA_A CAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAG
DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGG
*** * * * * **** ** * * * * * *** ** * ** *
ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGT
DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT
** * *** * * *** ** * ****** * * * ** * **
ZEA.MA_A GGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCA
DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTA-CCGGAGTGGACTGCCGTTA--TCAGCCC---AACCGATATGGTTG
* ***** ** * *** * ** ** **** * **** *
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
DRO.MEL. GACCACAATCTTT
***** ******
Mean pairwise ID: 46.33%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** ** ** *** ** *** ** * * *** **** * * *
TRI.AE_B TGCTTGGTGC--GGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGT-GCGCTATG-CCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
***** * ** * *** *** * * * * * ** ** *** * * ** *
TRI.AE_B CAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAG
GAL.GAL. -AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCG--GGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGG
* * ** * *** ** * * *** * * **** *** * *
TRI.AE_B TGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGT
GAL.GAL. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT
** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * **
TRI.AE_B GGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA
GAL.GAL. AACGGGAT-------CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCG
**** *** * * ** ** * * * ******
TRI.AE_B GACCACCATCTTT
GAL.GAL. AGACCCTGTCTCC
* * ***
Mean pairwise ID: 46.33%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG
* ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * *** ****
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * *
ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** *
ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCC-GCTGGTTCGATCTCTCCTG
HOM.SA_A TGGGATCGCGCCTGTGAAT-------AGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAA-CATAGCGA
***** * * * * ***** ** ** ** * * * *
ARA.TH_D GACCACCACTTT-
HOM.SA_A GACCCCGTCTCTT
**** * ** *
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG-
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC
* ** * * *** * ** **** * * * *** * * **** **
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
CAE.EL_B AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
*** ** * * ** * * ** * * * ** * * *** *
ZEA.MA_F CAG-GCATGGCGTGAGGCTGGCT--TCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG
CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCAC-CGCGCGGTGC-AGTGG
* * **** * * * * **** ** *** *** ** * * * **
ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG
CAE.EL_B CCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCA-------G
*** * * ** * * * ** * ** * * * *** *
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT-
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCC-GGCTTGCCCATCCCAA
LYC.ES_L TTGGGTTGAC--CCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA
*** * ** * * * **** *** * * * * * *** ***** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG
* * *** * **** ****** ***** ** * *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * **** ******* *********** *** ** * *** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA---ACCTCACTAAGCA
LYC.ES_L AGGATAACGG-GTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA
********* * * *** * *** * * * * ** * ** * * * ** *
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
LYC.ES_L AACCACCACTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTT--CTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
***** ** * ** * ** * ** * * * * * ** *** * *
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATAGT
CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
**** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** *
ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG
CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** **** * *** * ** ****** * ** * * * * **
ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA
CAN.SPE. GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACT------CCAGCCTGTGCAACATAGCG
* **** * *** ** * * ** * ** ** * * ***
ZEA.MA_C GACCACCATTTTT
CAN.SPE. AGACCCCGTCTCT
* ** * * *
Mean pairwise ID: 46.33%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGA-TGTGAACGC
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******* * *** ** * * * * ***
TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
TRY.BR_B CTTGGACAAGCGGGGGTTCTG--TTGCGTTGACT--TGGTGTTCTGCTTG------GTTG
* * ** * ** *** ** ** ** ** ** * ** * ****
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
TRY.BR_B CGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCG-CCGTTAAAGTGGGGGG
*** ** * ** ** * * **** ** * *** **** **
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGAAGG
TRY.BR_B AACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC
** * ** **** ** * ** ******* *** * * **** * ****
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
TRY.BR_B ACACCGAGGAGCA----TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--
* * * * ** ** *** * * * ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 46.35%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
*** * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * * * * ** * ***
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA---
CAE.EL_B TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
* * **** ** *** *** * * ** * * * * *** *
HUM.LU_A -GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******
HUM.LU_A GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATA
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATACACAGCCTTCTCAA---TACCTTCA---
* *** ** * * * * ** ** ** * * ** * *
HUM.LU_A GGACCATTTCTTTT-
CAE.EL_B -GACCACTTGTTTTT
***** ** ****
Mean pairwise ID: 46.35%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** ***** ***
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGT-GACACTGGC--CGGCTTGCCCATCC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAG-----GAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGC
** * * * **** * ***** * ** *** * * * ** * *
ZEA.MA_A CAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAG
CAE.BRI. CAAGC--GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTC------CCGGGCG
**** * * *** **** *** * * *** ** ** ** *
ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG
CAE.BRI. CATAAGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGC--GCGG
* **** *** * * **** * * * ***** ** * ** * ***
ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC
CAE.BRI. TGCAGTGGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTT-C
** * *** ** *** ** * ** * ** *
ZEA.MA_A AAACCACC-ATCTTT
CAE.BRI. AGACCACTTGTCATT
* ***** ** **
Mean pairwise ID: 46.35%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** **
ARA.TH_A ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC
* * ** * * * ** * *** * * * **** * ** **
ARA.TH_A AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTC
CAE.EL_B AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCGGGTGCATAA--
**** ** ** * ** * ** **** *** * * ** * * *
ARA.TH_A GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAG
CAE.EL_B --GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG
* ** ** ** * ** * ** ***** * * **** ****
ARA.TH_A TGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA
CAE.EL_B TGGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG------ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTC
*** **** ** ** * ** * ** *** * ** * ** * *
ARA.TH_A TGAACCACCATTTT-
CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT
** * ****
Mean pairwise ID: 46.35%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
* *** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** *
ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA
RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
***** * * * * * ** ** ** ** * ** * ****
ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG
RAT.NOR. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * *
ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG
RAT.NOR. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGGGCAACATAGCGAGA
* * **** * *** ** * * ** ** *** * * **** *
ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT
RAT.NOR. CCCGTCTCT------
* * *
Mean pairwise ID: 46.35%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC
**** ** * * *** * * ****** ***** *** * * *
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC--CGCTTCCAAC
CAE.EL_C ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGC
**** *** * ** * * * * * *** ** *** *** *
ZEA.MA_D GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAA
CAE.EL_C AGTGGCCGGACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAG
**** *** * * ** ** * * ** *** * * * * *
ZEA.MA_D GCAGACCACCATCTT
CAE.EL_C ACCACTTGTCACT--
* **
Mean pairwise ID: 46.41%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCC-----CGCTTAGCGG
* * * * *** * * * ** * ** * * *
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT
TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** ** * ** *** * **** * * ** ** * ** *
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
TRY.BR_A TCGGTGTTGAGG--TCGCCACTGTAGAGAGGC---GTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGGGG
* ** ******* * * * * **** * **** * * * ** ********
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
TRY.BR_A -GAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
** ** ** **** *** ** ******* ****** *** * * * ** **
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
TRY.BR_A AGCACAC-CGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGG----
* ** * * * ** ** * * * ***** * ** *** *
ARA.TH_C CACTTT
TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 46.43%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
TET.THE. -GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTG-TCTATATGTGG---CATAAACAATGTAGGTTGTGAT
* * * * * ***** * * ** ** * **** * ** * *
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGC--TAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGG
TET.THE. AGATAGGATA-TGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAAT
* * * * * ** ** * ** * ***** ***** *
HUM.LU_C GAGGTGGGCTGAGGG--ACCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG
TET.THE. GAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCT--AAGG
*** ** ** ** **** * *** ** * *** * ** * **
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TET.THE. AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
** ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * *********
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA--TCAAAGCCAGACATT----
**** * * * * * * * * **** *** * * * *
HUM.LU_C TTTCTTTT
TET.THE. --------
Mean pairwise ID: 46.43%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGCGCGGATGC
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******* * *** ** * * *** *** *
ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TRY.BR_B CTTGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG---GTTGCGTGT
*** * *** * ***** * * ***** * * **
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
TRY.BR_B CGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG
*** ** * ** ** *** ** * ** ** ** ** ** *
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCAC-TTCCAACGGTGGGA
TRY.BR_B GAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
*** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** *** **** * * *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATC--TCAGGACTTTGCGC---CCCAAGTG---TCGTCGCGAGGCG
* * * * ** ** * * * * * * **** * ** * ** * *
ZEA.MA_B CCATCTTT
TRY.BR_B GTTT----
*
Mean pairwise ID: 46.45%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ***** * **** ******** *** * * * * * ** * *
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* * * ** * ** ** * * **** * * * ** ** * ***
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT
** * ** ****** ** ** * * * * ** * * ***
HUM.LU_D AATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
* ** *** ** ** ****** * * **** * **** * **
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC-
XEN.LAE. AT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACA----GCCTGAACAACAC--AGCGAGACA
** ** *** *** * * ** * * * ** * * ***
HUM.LU_D CATTTCTTTT
XEN.LAE. CAGTTCT---
** ****
Mean pairwise ID: 46.45%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** * *** ** *** *
ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * * * * ** ** * * * ** * ** ******
ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA----GG
* ** * ** * * ** ****** ** * * * ** * * * *
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC
** ** ** * ** * ** ***** * * **** * *******
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
CAE.EL_A CGGACCGCGCTTGTGAGTTGA-CACACATACGCAGCCTTCTCGATAC--CTTCAGACCAC
**** * ** ** * ** * ** * ** * * * * * * *** * *
ARA.TH_A CCACCATTTT
CAE.EL_A TTATCATTT-
* *****
Mean pairwise ID: 46.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ** * * * *
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTGAAGGGCTAATGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * * * ***** * * *** * * ** ** * ***
LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * * *** ** * * * **** ** ** * ***
LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** *
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
CAN.SPE. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTGT---GCAACATAGCGAGAC
***** ** * *** * * * ** * **** * * ** * **
LYC.ES_F CATCACTTTT
CAN.SPE. CCCGTCTCT-
* ** *
Mean pairwise ID: 46.47%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * * * * ******** * *** * ** **
HUM.LU_D TGGGTCAACCTA-GTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCA-TTCCAA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGAC---GTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
** * *** * * * * * * *** * * ** ***** *
HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGG-GCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
LEP.COL. GTCGGAGGCC--TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGA
* *** * * * *** ** ** * * * * * * * ** *** **
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGA
LEP.COL. GGA-ACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC
** * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** *
HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG
LEP.COL. AGAACCACA---CCGCGGAGCCTGTCATCACC-TGCGCCCCAGG--CGATCCT--GTGAA
** * ** * * * **** **** *** * * ** ** ** *
HUM.LU_D ACCATTTCTTTT
LEP.COL. GCTTT-------
* *
Mean pairwise ID: 46.47%
HUM.LU_D ---GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTA-ACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGAC
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* ** *** * * * * * *** ** * * * ** *
HUM.LU_D TTTGGGTCA-ACCTAGTGGATCG-GGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGC-TCA--TGTTGACGGAAC-GTCCGCACT
* ** * * *** ** * * ** **** * * ** * ** * * * ** *
HUM.LU_D AAGCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGA-GGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA
**** * * ** *** * *** * ** * * * *** * * *
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT
** * ** * ** * ****** * * ***** * ****** *
HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG
DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCA-GCCCAACCGATATGGTT-------GG
***** ** **** * *** * ** ** ** * ** * **
HUM.LU_D ACCATTTCTTTT
DRO.MEL. ACCACAATCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 46.47%
ZEA.MA_E -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGCGGAT
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
* ******** * * *** * * * * ** * ** ** * ***
ZEA.MA_E TCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTT--GACGTG----GTGCTCT------GCTTGGCTGT--
* ** ** *** * * * * **** * ** ** * **
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
LEI.MAJ. -GTGTCGGT-GTGGCTTGCC----CCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC
** *** ****** ** * ** ** * * * *** *****
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGT
* **** * ** **** ** ** ******* *** * ** * * **
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
LEI.MAJ. TGCAGAATCACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAG
* ** ** ** ** *** ** * *** **** ** ** * **
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
LEI.MAJ. CCTT--------
*
Mean pairwise ID: 46.47%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G
***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * ** *** *
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * **** * *** **** * ** ***
LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCA
* *** * ** * * *** * ** * * **** * ** * *
LYC.ES_B ACCACCACTTTT
CAE.EL_C CTTGTCACT---
****
Mean pairwise ID: 46.47%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
* * * **** * * ** * * **
RAT.NOR. CGATTGAG---TCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
LYC.ES_M --ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCC
**** * *** ** ******* * *** **** * * ** ** *
RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
LYC.ES_M AAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGT
*** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** *
RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
LYC.ES_M GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
**** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** ****
RAT.NOR. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAG
LYC.ES_M GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
* **** * * * *** * ** * ** * **** *** * *
RAT.NOR. AC--CCGTCTCT
LYC.ES_M ACAACCACCTTT
** ** ** *
Mean pairwise ID: 46.47%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA---GGGTATCAAAGTGGTTGAACT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA--GACAGGAGG
****** *** *** * ** ** * ** * *** * * * * *
CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * * ** * * ** *** * *
CIN.HYB. AGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGA
RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAAGG
*** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * **
CIN.HYB. ATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACT
RAT.NOR. A--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** *
CIN.HYB. GTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA
RAT.NOR. GTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGGGCAACATAGCG
** * **** * ** * * ** * ********* * * * *
CIN.HYB. GGACACCCATTT
RAT.NOR. AGACCCGTCTCT
*** * * *
Mean pairwise ID: 46.47%
ZEA.MA_G -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT
DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
* * ** * ** ***** * ** * * * * * *** ****
ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCA-GCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** * * *** * ** * * * * * * * *** * *** *
ZEA.MA_G AAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATT--CAGGT-TGGCTAA
*** * * * * ** ** * * *** * *** * *** **
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT
DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT
* *** *** * * * ** * * * ****** * * * **** * **
ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTA--TCAGCCC---AACCGATATGGTTGG
* ***** ** *** * * * **** ** * ** * *
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
DRO.MEL. ACCACAATCTTT
***** ******
Mean pairwise ID: 46.50%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** ***
LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGT----CTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCC
* ** ** * ** *** *** *** * * ** **
LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTA--TAGCCACTTGGCCTTTAGAGT
CAE.EL_A AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTC-CCGGGTGCATAAGGA
**** * ** * ** * *** * *** * * ** ** *
LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* **** * * * * * **** * ** **** ********
LYC.ES_F GAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCT-AATT
CAE.EL_A GCCGGACCGCG--CTTGTGA--GTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC
* *** * ** ** *** **** * * * *** * * * * * *
LYC.ES_F AAACCATCACTTTT
CAE.EL_A CACTTATCATTT--
* **** **
Mean pairwise ID: 46.50%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGT-----GGGGACTATAAGATGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
* ** ** ** ** ** **** ** ** *** * ** * ***
ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** ** * ** * ** * *** ** ** ** * * ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACG---GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
RAT.RAT. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTC
*** ** ** ***** * **** *** * * * ****
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT
RAT.RAT. TCTT----------
*
Mean pairwise ID: 46.50%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGT-----GGGGACTATAAGATGGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* ** ** ** ** * ** **** ** ** *** * * ** ***
ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** ** * ** * ** * *** ** ** ** * * ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACG---GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
ORI.CUN. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTC
*** ** ** ***** * **** *** * * * ** *
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT
ORI.CUN. TCC-----------
*
Mean pairwise ID: 46.50%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** ** *** * ****** **** * ** * * * * * *
CAE.EL_A GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCG---TTCCAAG
* ** ** * * ** * *** ** ** ** ** ** *** *** *
CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGGGT--CTCACGGTCCATAATG
* * * ** **** * * ** *** ** * * *** ***** *
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
* * * * * * * * * ***** * ** * **** * * **
CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCG---ATACCTTCAG
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
** *** * ** ** * * * * **** * * ** ***
CAE.EL_A ACCACTTATCATTT
TRI.AE_A ACCACC--------
*****
Mean pairwise ID: 46.50%
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATAC-CTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT
TRY.BR_A AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGC-TGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCT
*** * * *** * * **** * * * *** * * * * * * ** *
TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTT
TRY.BR_A TGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTC
*** * * * * * ** * *** ** * ** * *** * **
TET.THE. GCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGC
TRY.BR_A GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGG
* * * * *** ** *** * * * * * ****** * ** ****
TET.THE. CTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATAC
TRY.BR_A GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCG
****** ** ** ** *** ** * *** *** ** ** * ***
TET.THE. TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
TRY.BR_A AGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
* *** ** * * * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 46.51%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
TRY.BR_B --------AGCCGGAGCGCAT-TGCTCTGTAACCTTC--GGGGGCTGATCCCGCTTAGCG
* ** *** ** * ** ** * ** ****** * *
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
TRY.BR_B GGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTG----TTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT
* ** * * *** *** * * ** ** ***** * * ** **
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTC-CTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG
* ** *** * * * * ** * * ** ** * * * ** *** ****
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
TRY.BR_B GAAC--GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
* ** **** *** *** ***** ** * ** * * ** * * *
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTT--CAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCAT-CTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGG--CGGTTT-
* * ** ** * * * * * ** * ** *** * *** * * ** *
FUG.RUB. T
TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 46.51%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
LEP.COL. GCCGGAGCC--TTGC-----TCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
*** * **** ******* ****** ** * * ** * *
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT-TG
LEP.COL. GCTGTCTGG--ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTG
* *** * * ** * * ** ** * ** * ** * * **
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTA--TGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA
LEP.COL. TGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG-A
** * * ** ** ** ** *** *** * * * * * *** ** * *
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
LEP.COL. GGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA
** ** * ** **** *** ** ******* ** * * ** ** ** *
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC
LEP.COL. ACCAC---ACCGCGGAGCCTGTCA-TCACCTGCGCCC--CAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
* **** * * * ** ** *** *** * * * * *
TRI.AE_A C
LEP.COL. -
Mean pairwise ID: 46.52%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** ****** * * * ** ** ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTAT--GCGGCCCGCCCGTTC
CAE.EL_C A-----GTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
** * * * * *** * *** *** ** * * * ** **** *
ORY.SA_B CAAGT--TGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGG-TCAGTCCCGGGTGCATAAGG
**** ***** * * * * * ** ** ** ** * **** *
ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG
CAE.EL_C AGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCA
***** ** * * * ** * **** ** ***** ** * *
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTG-GCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATG
CAE.EL_C GTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAA-TACCTTC--AG
**** *** * ** * * * * * * ** * *** * ***** *
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT
CAE.EL_C ACCACTTGTCACT---
* ***
Mean pairwise ID: 46.53%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
TRY.BR_A AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-GTCT
*** *** * * * ******** * *** ** * * * * * *
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TRY.BR_A TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT
* * ** ** **** * ** *** ** ***** * **
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
TRY.BR_A GTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC
**** * * *** **** * * *** ** ** ***** *** **
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
TRY.BR_A GGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCAC
* ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** ** * **
HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTCC
TRY.BR_A ACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---------
** ** ** * ** ** * * * * ***
HUM.LU_B TTT
TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 46.56%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTAC-----TTGGAGGCTTGGGCTGTCG
**** ** * ** *** * ******** *** * *** ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
XEN.LAE. GATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATG---TCGATCGGGTGTCCGC
* * ** * * * * ****** ** * * * * * * * ** ***
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
XEN.LAE. ACTAAGTTCGGTATCAATATGGT---GTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTT--GC
* ***** *** ** * * * * **** * * * * **
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
XEN.LAE. TCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCC
**** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
XEN.LAE. GATCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAAC-AGCCTGAA----CAA
*** ** * **** * ** ** * ** * * *** * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
XEN.LAE. CACAGCGAGACACAGTTCT-
*** * *** * *
Mean pairwise ID: 46.58%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGT
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******** * *** ** * * * * *** **
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRY.BR_A CTTG-GACAAGCGGGGGTTCTG---TTGCGT---TGACTTGGTGTTCTGCTTG------G
* *** ** *** *** * *** * * **** * *
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGAC-CTGAAGCGGCA
TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
*** *** * ** ** ** * * ** *** * * * *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
TRY.BR_A GGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTCGA
** * ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** **
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
TRY.BR_A GAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCGG-
* * *** * **** ** * * * * ** ** ** * ** *
ZEA.MA_F CATCTTT
TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 46.58%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGT
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
*** ** ******** * *** ** * * * * *** **
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRY.BR_B CTTG-GACAAGCGGGGGTTCTG---TTGCGT---TGACTTGGTGTTCTGCTTG------G
* *** ** *** *** * *** * * **** * *
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGAC-CTGAAGCGGCA
TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG
*** *** * ** ** ** * * ** *** * * * *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
TRY.BR_B GGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTGCA
** * ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** * *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
TRY.BR_B GAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCGGT
* * *** * **** ** * * * * ** ** ** * ** *
ZEA.MA_F CATCTTT
TRY.BR_B TT-----
Mean pairwise ID: 46.60%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** * *** ** *** *
ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * * * * ** ** * * * ** * ** ******
ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCT-TGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA
* ** * ** * * ** ****** * * * *** * ** *
ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC
** ** ** * ** * ** ***** * * **** * ******* *
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
CAE.EL_D GGACCGCGCTTGTAAGTTGA-CACACATAC-ACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCACT
*** * ** ** ** * ** * ** * **** ** * *** * *
ARA.TH_F CACCATTTT
CAE.EL_D TATCATTT-
* *****
Mean pairwise ID: 46.60%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT
* ** ***** * *******
ZEA.MA_B G-GTAGTGTCTGAC--GGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG--TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC
* ****** * ***** ******* ***** *** * ** * ***
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA
*** * **** *********************** *** **** *************
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACC
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGA-CC
******** *********** ** ** * * * * *** *** * **
ZEA.MA_B ACCATCTTT
TRI.AE_C ACCATC---
******
Mean pairwise ID: 46.60%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG
* * * * * ***** * * * * * * * **** * *
LYC.ES_A GGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
*** * ***** * * ***** * * * * ** ** **** *
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
LEP.COL. GTCGGAG--GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGA
* *** * ** * **** ** * * ** ** * ****** *
LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAA
LEP.COL. G-GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** * * **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * *
LYC.ES_A GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
* * * *** * ** *** *** **** * * * * ** *
LYC.ES_A ACCACCTTT
LEP.COL. ---------
Mean pairwise ID: 46.62%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTG---GGGACTATAAGATGGTGGAACA
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ** ** *** ** * ** ***** *** * ** * * ** *** *
ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTC--TGGACTGCCCAATCCAA
XEN.LAE. CTTGA---GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** ** * *** * ** ** ** *** * * ** ** * **
ARA.TH_G GCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTA-AAGGTTG
XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * * ** * * * ******* **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * * **** * * **** *
ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA
XEN.LAE. GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGA------ACAACACAGC-GA
*** ** * * * * ** * * * * *** * **
ARA.TH_G ACCACCATTTT
XEN.LAE. GACACAGTTCT
*** ** *
Mean pairwise ID: 46.62%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
**** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** **
CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA
* * *** * * * ** *** ** ** *** ** * **** ***
CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG
CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT--GGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** * * *** **** ** * * * * **
CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCCACCGCGCGGTG-CAGTGG
* ** *** * *** * ** * *** ** * * * * ****
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA
CAE.EL_C CCGGACAGC--GCTTGTGAGTT---GACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC
*** * ** * * ** * * * **** ****** * ** ***
CIN.HYB. CACCCATTT--
CAE.EL_C CACTTGTCACT
*** *
Mean pairwise ID: 46.62%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
* ** ***** * *****
ZEA.MA_A TTG-GTAGTGT-CTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG--TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG
*** ****** * * * ***** ******* ***** *** * * * *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
***** * **** *********************** ****** ** **********
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
TRI.AE_C AAGGATAACGG-GCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGA-
********* *********** ** * * * *** * *** *** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRI.AE_C CCACCATC---
********
Mean pairwise ID: 46.62%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** * **** ******** *** * * * * * ** *
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
** * *** * ** * * * **** * * * ** ** ** * ***
HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGGAG
XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* * * ** *** ** * * ** ** * * * **** * ** *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** ** * **** * **** * *
HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGC---CTGAACAA---CACAGCGAGAC
*** ** *** *** * ** * * **** * * * ***
HUM.JA_B -CATTTCTTTT
XEN.LAE. ACAGTTCT---
** ****
Mean pairwise ID: 46.62%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--CGGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** **
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
ORI.CUN. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA
***** ** * * * ** **** ***** ** * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
ORI.CUN. CCCTGTCTCC-
** *
Mean pairwise ID: 46.62%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
** * * * * ****** ** ** ** * * * *** *
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNC--CAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATC-GGGTGTCCGCACTAA
* * * ***** ** * ** * ****** *** * * ** ** ** * **
HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGA
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* ** ** * * * ** * * * **** **
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTG--TGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** ***** * * ** * * ** * ** **
HUM.LU_C CCATTTCTTTT
CAN.SPE. CCCCGTCTCT-
** *** *
Mean pairwise ID: 46.62%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * ***
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
CAN.SPE. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA
***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
CAN.SPE. CCCCGTCTCT-
** * *
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTC-GTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA
** * * * * ** *** *** *** ** ** * *** * * * *
ARA.TH_G GATCG-GCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
TET.ROS. GTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGTTCCAAACAG
* * * * ** *** * * ** * ** ***** ***** * *
ARA.TH_G TGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAG--GACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
***** * ** **** ** * * * * ** ***** *
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
* * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ***** **
ARA.TH_G ACAACG-----GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTT
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
* *** ** * ** * **** * ** * *** * **
ARA.TH_G GAACCACCATTTT
TET.ROS. -------------
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * * ****** * ** * ***** * * *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
* * * ** ** * *** **** * * ** * * ** ******
ARA.TH_E ----TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTG
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAGGAGTCG
** * * * * **** * ** * * * * * * * *** *
ARA.TH_E GAGGGTAATGCGTGA--GGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT
CAE.EL_A T-GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGA-------CCGCGTGGTGCAGT
** * * * ** * *** ** * * ***** **** * *****
ARA.TH_E GGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
CAE.EL_A GGCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGA-CACACATACGCAGCCTTCTCGATAC--CTTCAGAC
** **** * * ** * ** * ** * ** * * * * * * *** *
ARA.TH_E GAACCACCATTTT
CAE.EL_A CACTTATCATTT-
* * *****
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * * *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
GAL.GAL. --TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
* * * * * *** * * * * *** ** ** *** ** * ** *
ARA.TH_E AAG-CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTT
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * ** * * *** * * * * ** * *** ** ** * * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCT-GCTGGTCCGATCTCATAT
GAL.GAL. ACGGGATCGCGCCT-------GTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGA
***** * * * * * ***** ** * ** * * * *
ARA.TH_E GAACCACCATTTT
GAL.GAL. GACCCTGTCTCC-
** ** *
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** ** * ******** * * * * * * *** *
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA
**** * ** ** * ** ** * * **** * ** ****
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG-----
** ** ** * * * * * * * ** * * * * * *** * * ***
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG
CAE.EL_B GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
* ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * *******
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
CAE.EL_B CCGGACTGCGCTTGTGAGTT-----GACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTC-AG
*** ** *** ** * *** * ** ** ** ** * *
ARA.TH_D ACCACCACTTT--
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * * ****** * ** * ***** * * *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
* * * ** ** * *** ** * * * ** * * ** ******
ARA.TH_E ----TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTG
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAGGAGTCG
** * * * * **** * ** * * * * * * * *** *
ARA.TH_E GAGGGTAATGCGTGA--GGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT
CAE.EL_D T-GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGA-------CCGCGTGGTGCAGT
** * * * ** * *** ** * * ***** **** * *****
ARA.TH_E GGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
CAE.EL_D GGCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGA-CACACATAC-ACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGAC
** **** * * ** ** * ** * ** * **** ** * *** *
ARA.TH_E GAACCACCATTTT
CAE.EL_D CACTTATCATTT-
* * *****
Mean pairwise ID: 46.65%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATAAGTGTG
**** * ** ** * ****** * ** * * ** * * ** **
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * **** * *** *** * ** ***
LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG----
* *** ** * * *** * ** * * **** * * ** **
LYC.ES_N ACCACCATTTTT-
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
***** ****
Mean pairwise ID: 46.65%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATG-TGGTGGAATGTT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-
**** * ** ** * ****** * ** * * ** * * * * ** ***
LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAG
CAE.EL_C GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** *
LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAG
CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_N TGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGT
CAE.EL_C AGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
* ** *** * * * * * **** * *** *** * ** **
LYC.ES_N GGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTA
CAE.EL_C GGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC
** *** * ** * * *** * ** * * **** * * ** **
LYC.ES_N AACCACCATTTTT
CAE.EL_C ACTTGTCACT---
* ** *
Mean pairwise ID: 46.67%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG----ACAGA
*** ** ** *** ** *** ** * * *** ***** **
TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCC---TGCCCGTT
RAT.RAT. GGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCG-CTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
* * * * ** * ** *** ** * *** * * ** ***
TRI.AE_B CCAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAA
RAT.RAT. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
* ***** * * **** * ** *** * **** *** *
TRI.AE_B GTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGG
RAT.RAT. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * *
TRI.AE_B TGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC
RAT.RAT. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGGGC-AACATAGC
* * **** * *** ** * * *** * *** * ******
TRI.AE_B AGACCACCATCTTT-
RAT.RAT. GAGACCCCGTCTCTT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 46.67%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *********
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA
CAE.EL_B --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-TGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** * **** ** * ** ** * ** * ** * **** ***
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAGTCCCGGGTGCATA---
** ** ** *** * ** * ** *** * * ** ***
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCT-GTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG
CAE.EL_B --AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTG
**** ** * ** * * * * *** ** * * *****
ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG-C
CAE.EL_B CAGTGGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA---CACAGCCTTCTCAATACCTTC
* * * * ** * * * * ** ** * ** **** * ** *
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT-
CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 46.71%
TRI.AE_B -NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
LEI.MAJ. GCCGGAGCT--CTGC-----TCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGG--GGA
* ***** *** *** *** * **** * **** * ** *
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCG-TTCCAAGT
LEI.MAJ. GGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT
* * ** * * *** ** * ** ** **** * * **
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC
LEI.MAJ. CGGT-GTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGC---CGTTGAAGCGAGGGA
*** **** ** *** * * * ** * * * * ** * * **
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATC
*** ** **** ** ** ******* * * * * ** * ** **
TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCAT
LEI.MAJ. ACA--CCGCGG-AGCATGTCCGCACT-TGAGCCCCACGCTTCGTCGCG--AAGCCTT---
*** **** * ****** * * ** ** *** * * ** * * **
TRI.AE_B CTTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 46.73%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_E TTTGC--GATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGC----GACCGAGC-GTCCGTGC
** * ** * *** * * *** * ** * *** * * **** *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.BRI. CAAGCGCTGCGTCGCCA--GGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA--
**** ** ** ** * ** * * * *** ** * * *
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACG-
CAE.BRI. ---AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGC
**** *** * **** * * * ***** ** *** * * *
ZEA.MA_E -GTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG
CAE.BRI. AGTGGCCGGATAGCG----------CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT
**** ***** ** *** * * ***** ****** ** *
ZEA.MA_E -----CAGACCACC-ATCTTT
CAE.BRI. ACCTTCAGACCACTTGTCATT
******** ** **
Mean pairwise ID: 46.73%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_D TTTGC--GATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGC----GACCGAGC-GTCCGTGC
** * ** * *** * * *** * ** * *** * * **** *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.BRI. CAAGCGCTGCGTCGCCA--GGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA--
**** ** ** ** * ** * * * *** ** * * *
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC--CGCTTCCAAC
CAE.BRI. ---AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGC
**** *** * **** * * * ***** ** *** *** *
ZEA.MA_D GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG
CAE.BRI. AGTGGCCGGATA----------GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT
**** ***** ** *** * * ***** ****** ** *
ZEA.MA_D -----CAGACCACC-ATCTT-
CAE.BRI. ACCTTCAGACCACTTGTCATT
******** ** *
Mean pairwise ID: 46.73%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGA--
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * *** ******** * *** * ** ** ***
ORY.SA_A TGTTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCT-GCTTGGCTGTGTGT
*** *** * * * * ** * * ** ** ** *** *** * ** **
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCC--------CTTGCAGAAGGGGCGCGC----CCCCTCCG--
* * * *** ** *** ***** ** * *****
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
LEP.COL. -TTAAAGTAG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC
****** * *** ** * ** **** *** ** ******* * ** * * **
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGA-GTCCCT
LEP.COL. TGCCGTTGCAGA---ACCACACCGCGG-AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCT
** ** * * ** * ** * * * ** * * * * ***** * ***
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
LEP.COL. GTGAAGCTTT-----------
* * *
Mean pairwise ID: 46.73%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCC-----CGCTTAGCGG
* * * * *** * * * ** * ** * * *
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT
TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
** ** * ** *** * **** * * ** ** * ** *
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
TRY.BR_B TCGGTGTTGAGG--TCGCCACTGTAGAGAGGC---GTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGGGG
* ** ******* * * * * **** * **** * * * ** ********
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
TRY.BR_B -GAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
** ** ** **** *** ** ******* ****** *** * * * ** * **
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
TRY.BR_B AGCACAC-CGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-
* ** * * * ** ** * * * ***** * ** *** *
ARA.TH_C CACTTT
TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 46.77%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * ***
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
CAN.SPE. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
CAN.SPE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC
***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
CAN.SPE. CCCGTCTCT-
** * *
Mean pairwise ID: 46.77%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA---GGTGGTGTGGAT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
* * *** ******** ******* ** * * ** **
ZEA.MA_F GTTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCG-TTCC
LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT
* * *** * * ** * ***** ** * * **** * *
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGC-GAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
LEP.COL. GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGTA
** ** * * ** * * * ** ***** * *** * * * * ***
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
LEP.COL. G-AGGAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTG
* *** * * ** **** *** ** ******* * ***** * * ** ** **
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
LEP.COL. C-AGAACCACACCGCGGAGCCTGTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCT
** * *** ** ** * ** ** ** * ** ** * **
ZEA.MA_F CACCATCTTT
LEP.COL. TT--------
Mean pairwise ID: 46.77%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ** * * * *
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * * ***** * * **** * * ** ** * ***
LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * * *** ** * * * **** ** ** * ***
LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** *
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
ORI.CUN. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGAGAC
***** ** * *** * * * ** * **** ** * ** * **
LYC.ES_F CATCACTTTT
ORI.CUN. CCTGTCTCC-
* * **
Mean pairwise ID: 46.77%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** * ****** * ** * *** ** *** *
ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * * * * ** ** * * * ** * ** ******
ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA----GG
* ** * ** * * ** ****** ** * * * ** * * * *
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC
** ** ** * ** * ** ***** * * **** * *******
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
CAE.EL_D CGGACCGCGCTTGTAAGTTGA-CACACATAC-ACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCAC
**** * ** ** ** * ** * ** * **** ** * *** * *
ARA.TH_A CCACCATTTT
CAE.EL_D TTATCATTT-
* *****
Mean pairwise ID: 46.77%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--CGGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** **
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
ORI.CUN. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGAC
***** ** * * * ** **** ***** ** * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
ORI.CUN. CCTGTCTCC-
** *
Mean pairwise ID: 46.79%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGTGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_C GCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTT--CTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
***** * * ** * ** **** * * * * * ** **** * **
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATAGTG
FUG.RUB. GTTCG--GTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
*** * ** * * * *** * * **** ** ** * **** * *
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCT--CAGTAG
* * * * *** * * ** * * * * ** * * ** *
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
FUG.RUB. TGGGATCGC--GCCCGTGAA---TAGACGC---TGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGG
**** * *** ** * * * * * * * * ** ** * *** *
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
FUG.RUB. GACTCAGTCTTT
* * * ***
Mean pairwise ID: 46.79%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** **
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * **** * *** *** ** ***
LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA--GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
* *** ** * * *** * * * * **** * * * ** ** *
LYC.ES_I ACCACCATTTTT
CAE.EL_A CTTATCATTT--
* *****
Mean pairwise ID: 46.79%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** * ** * * ** *** * * ** ** ** * ***
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG
CAN.SPE. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * ** *** * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** *
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG
**** ** *** *** * **** * ** * ** * ** *
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
CAN.SPE. ACCCCGTCTCT-
*** *** *
Mean pairwise ID: 46.79%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
**** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** **
CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA
* * *** * * * ** *** ** ** *** ** * **** ***
CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG
CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** ** * * *** ****** ** * * * * * **
CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTG-CAGTGG
* * *** * *** * ** * *** * * * * * * ****
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA
CAE.EL_A CCGGACCGC--GCTTGTGAGTT---GACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC
*** * ** * * ** * * ** *** ****** ** ***
CIN.HYB. CACCCATTT---
CAE.EL_A CACTTATCATTT
*** **
Mean pairwise ID: 46.79%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * ** *** *
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * **** * *** *** * ** ***
LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCA
* *** * ** * * *** * ** * * **** * * ** ** *
LYC.ES_I ACCACCATTTTT
CAE.EL_C CTTGTCACT---
** *
Mean pairwise ID: 46.79%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_J A--TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTC
GAL.GAL. CGCTTGAGC----CCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC
*** ** **** ** * ** ** * ** * * * * * ** *
LYC.ES_J CAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT
GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * **** ** * * * * * * ***** *
LYC.ES_J GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA
**** * **** *** ** ** ****** * * ****** * * ****
LYC.ES_J GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
GAL.GAL. ACGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGAC
**** * * * *** * * * * * *** **** * * * *
LYC.ES_J ACAACCACCTTT
GAL.GAL. CCTGTCTCC---
* * **
Mean pairwise ID: 46.79%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC
* * * * ** * ***** * * * * * *** **** *
ARA.TH_E ----GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCA
DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCT--CATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
** * ** ** ** * * * * ****** ** * ** * *
ARA.TH_E AGCT-GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTG
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
**** * * ** * * *** ** * **** * * **** * *
ARA.TH_E GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
DRO.MEL. GATGA-ACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
** * * * * *** *** * ****** * * ****** ***** *
ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT-TGG
**** * * ** * ** * * * ** ***** * * **
ARA.TH_E ACCACCATTTT-
DRO.MEL. ACCACAATCTTT
***** ** **
Mean pairwise ID: 46.82%
TRI.AE_A -NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGC
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCT--------CTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-
* ****** * * ******* * *** * * * * * *
TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
LEI.MAJ. -GACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGC-TGCGTTGACG-TGGTGCTCTGCTT---GGCTG
* ** * * *** * ** * ** ** * * * *** * * ** * **
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
LEI.MAJ. TGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGG
** ** * ** * * *** * * *** * ** * * **
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
LEI.MAJ. AACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA-GAA
** * ** **** ** ** ******* * * * * *** ** ** * * *
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCAC-GCTTCGTCGCGAAGCCTT--
* * ** *** * ** *** *** * * ** * ** * ** *
Mean pairwise ID: 46.82%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * ***
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * ** *** * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** *
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATA
ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCG
**** ** *** *** * **** * ** *** ** * **
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
ORI.CUN. AGACCCTGTCTCC-
**** * ***
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT--
***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCC---TGTCCAAG
CAE.EL_A GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * *** * * *** * *** ** * ** **** *
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATC-TCGAGGCCCAAATG--AAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAG
CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * * ** * ** ** ** ** ** * * * * * *** *
LYC.ES_A TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * *** * * * * * ***** ** ** **** *******
LYC.ES_A GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCAG--
** *** * * *** ** ** * **** * * * ** **
LYC.ES_A AACAACCACCTTT-
CAE.EL_A ACCACTTATCATTT
* ** * * **
Mean pairwise ID: 46.82%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
LEI.MAJ. ------------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTC--GGGGGCTAAC-CAGGCTTAGC
* ** *** * ** ** * ** **** * * *** * *
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
LEI.MAJ. GGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTG-CTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * *** * * * * * ** ** ** **** * * ** *
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG-GGG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG
* ** *** * *** ** * ** * * * **** * ** * *
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAA
* **** **** ******** ***** ** * * * * * * * ** * * *
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGT-CCGCACTTGAGCCCCA----CGCTTCGTCGCGAAGCCTT-
** * ** ** * * * * ** * ** * * * ** * ** ***
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT--
***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT--TCTGGCCTGCCC---TGTCCAAG
CAE.EL_D GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * *** * * *** * ** *** * ** **** *
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * * **** *** ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_J TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * *** * * * * * ***** ** *** **** *******
LYC.ES_J GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG--
** *** * * ** ** ** * * **** * * * ** **
LYC.ES_J AACAACCACCTTT-
CAE.EL_D ACCACTTATCATTT
* ** * * **
Mean pairwise ID: 46.82%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** ** *** * ****** **** * ** * * * *** *
CAE.EL_C GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGC-CCGCCCGT---TCCAAG
* ** ** * * ** * *** ** ** ** * ** *** *** *
CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCG-GGTGCATAAG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGG---GTCTCACGGTCCATAAT
* ** * ** **** * * ** *** *** *** * *** *****
CAE.EL_C GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG
TRI.AE_A GTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGG
* * * * * * * * * ***** * ** **** * *
CAE.EL_C TGGCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCT---CAATACCTTCA
TRI.AE_A TGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCA
*** *** * * * ** * * * * **** * * ** **
CAE.EL_C GACCACTTGTCACT
TRI.AE_A GACCACC-------
******
Mean pairwise ID: 46.82%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG-
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** *********
ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTG---GGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCC
* ** * * *** * ** **** * * * *** * * **** **
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
CAE.BRI. AAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG
*** ** ** * ** *** ** * * **** ** * * *** *
ZEA.MA_F CAG-GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC--CGCTTCCAACGG
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGA------AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG
* *** *** *** * * ***** ** *** *** * *
ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGC-CGCTGCATTGCAAGCCCA-ACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAAC
CAE.BRI. TGGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCT--TCAGAC
*** ***** * * * ** ***** * * ** *** * * **
ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT
CAE.BRI. CACTTGTCATT---
***
Mean pairwise ID: 46.82%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** * ** ******* ** ** ** * * * * * *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * ***
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG
RAT.RAT. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * ** *** * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** *
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATA
RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCG
**** ** *** *** * **** * ** *** ** * **
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
RAT.RAT. AGACCCCGTCTCTT
**** *** **
Mean pairwise ID: 46.82%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** ** *** * ****** **** * ** * * * * * *
CAE.EL_B GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGC-CCGCCCGT---TCCAAG
* ** ** * * ** * *** ** ** ** * ** *** *** *
CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCG-GGTGCATAAG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGG---GTCTCACGGTCCATAAT
* ** * ** **** * * ** *** *** *** * *** *****
CAE.EL_B GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG
TRI.AE_A GTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGG
* * * * * * * * * ***** * ** **** * *
CAE.EL_B TGGCCGGAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCT---CAATACCTTCA
TRI.AE_A TGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCA
*** *** ** ** ** * * * * **** * * ** **
CAE.EL_B GACCACTTGTTTTT
TRI.AE_A GACCACC-------
******
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT--
***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCC---TGTCCAAG
CAE.EL_A GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * *** * * *** * *** ** * ** **** *
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * * **** *** ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_J TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * *** * * * * * ***** ** *** **** *******
LYC.ES_J GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCAG--
** *** * * *** ** ** * **** * * * ** **
LYC.ES_J AACAACCACCTTT-
CAE.EL_A ACCACTTATCATTT
* ** * * **
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** ***
LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG-CC
* ** ** * ** *** * * * * * * * ** ** **
LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTA--TAGCCACTTGGCCTTTAGAGT
CAE.EL_D AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTC-CCGGGTGCATAAGGA
**** * ** * ** * *** * *** * * ** ** *
LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* **** * * * * * **** * ** **** ********
LYC.ES_F GAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCT-AATT
CAE.EL_D GCCGGACCGCG--CTTGTAA--GTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC
* *** * ** ** ** **** * * * * *** * * * * * *
LYC.ES_F AAACCATCACTTTT
CAE.EL_D CACTTATCATTT--
* **** **
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT--
***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT--TCTGGCCTGCCC---TGTCCAAG
CAE.EL_D GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * *** * * *** * ** *** * ** **** *
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATC-TCGAGGCCCAAATG--AAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAG
CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG
* ** * * ** * ** ** ** ** ** * * * * * *** *
LYC.ES_A TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT
* * *** * * * * * ***** ** ** **** *******
LYC.ES_A GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG--
** *** * * ** ** ** * * **** * * * ** **
LYC.ES_A AACAACCACCTTT-
CAE.EL_D ACCACTTATCATTT
* ** * * **
Mean pairwise ID: 46.84%
XEN.LAE. GCC-GGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATA-TGTGGCA--TAAACAATGTAGGTTGT--GATA
*** *** * **** ** ** * ** * * ** *** ***
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-----AGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * * ***** * ** * **** * * *** **** * **
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG-G
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGG--GCATTAAAGAGCTA
* * ******* * * * ******* ** *** ***
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
*** ** * **** ** *** ** **** *** *** ** * **
XEN.LAE. AT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTC
TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCAA-ACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----
** * * * ** * * * * * * * * ** *** *****
XEN.LAE. T
TET.THE. -
Mean pairwise ID: 46.84%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA----GGGTATCAAAGTGGTTGAAC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
****** *** *** * ** ** * ** * ** * * * * *
CIN.HYB. TTTGAGCTTG-GCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTC
CAN.SPE. C----GCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
***** ** ** * ** *** ** * * ** * * ** *** *
CIN.HYB. CAAGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTA
CAN.SPE. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAA
**** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * *
CIN.HYB. GAATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGA
CAN.SPE. GGA--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * **** * * * *** ** ** **** * *** *** **
CIN.HYB. CTGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAA
CAN.SPE. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGTGCAACATAG
* ** * **** * ** * * ** * ******** * * *
CIN.HYB. CAGGACACCCATTT--
CAN.SPE. CGAGAC-CCCGTCTCT
* *** *** * *
Mean pairwise ID: 46.84%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * ** * ** * ***
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG--GCTGGGTTGCG--CAGCTCCTAGAGTGGAG
CAE.EL_D TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA
* * *** ** *** *** * * ** *** ** ** * * *
HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCT--GGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_D GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
** * * ** * ** * ** ***** * * * **** ******
HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTG---TAAGTTGACACAC-ATACACAGCCTTCTCGATACCT--TC
* *** ** ** * ** * ** *** ** * * ** * * *
HUM.LU_D GGACCATTTCTTTT--
CAE.EL_D AGACCACTTATCATTT
***** ** * *
Mean pairwise ID: 46.84%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC-------TAACCAGGCTTAG
* * * * ******** ****** ** * *** *
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * ***** * * *** ** ***** ** * *** * * * **
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG-GGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG
* * ** ** ** * ** * ** ** *** * * ** * * ** ***
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAA
LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA
** * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * *
HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGGTCCA----CCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAA
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----
* ** ** *** ** * * * *** ***** * * **
HUM.LU_A TAGGACCATTTCTTTT
LEI.MAJ. ----------------
Mean pairwise ID: 46.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG--
* * *** ******** * *** ** * * ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LEI.MAJ. ---GACGTGGACC---AGCGAGGGTGATTTGCTGC-GTTGACGTGGTGCTCTGCTTG---
* ***** * * *** ** ** ** * ** ** *** *
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LEI.MAJ. ---GCTGTGT-GTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC---GCGGGTCCGCCGT
* ** ** ** ** * ** * ** * ** ** **** *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LEI.MAJ. TGAAGCGA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCG
* *** * ** ** * ** **** ** ** ******* * * * * * ***
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LEI.MAJ. CCGTTGCA-GAATCACA--CCGCGG-AGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTC-G
** ** * * ** *** * ** * * * ** * * *** * **** * * **
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
LEI.MAJ. CGA-AGCCTT--------
* * ** *
Mean pairwise ID: 46.86%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
TRY.BR_B AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-GTCT
*** *** * * * ******** * *** ** * * * * * *
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
TRY.BR_B TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT
* * ** ** **** * ** *** ** ***** * **
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
TRY.BR_B GTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC
**** * * *** **** * * *** ** ** ***** *** **
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
TRY.BR_B GGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC
* ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** * ** * **
HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTCC
TRY.BR_B ACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT------
** ** ** * ** ** * * * * ***
HUM.LU_B TTT
TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 46.88%
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATAC-CTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT
TRY.BR_B AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGC-TGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCT
*** * * *** * * **** * * * *** * * * * * * ** *
TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTT
TRY.BR_B TGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTC
*** * * * * * ** * *** ** * ** * *** * **
TET.THE. GCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGC
TRY.BR_B GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGG
* * * * *** ** *** * * * * * ****** * ** ****
TET.THE. CTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATAC
TRY.BR_B GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCG
****** ** ** ** *** ** * *** *** ** * ** * ***
TET.THE. TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT--
TRY.BR_B AGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
* *** ** * * * ** ** ** * *
Mean pairwise ID: 46.93%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
YAR.LI_B -------------AGCTGTAATGGCATTTT--GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG
* ** * * * ** ** ** *** * * ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA
YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT
** ** * ** * **** ** * ******* *** * ** *** *** * *
LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
YAR.LI_B CTGCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT
* * * * *** * * * * * *** **** ***** * * * *
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA--CGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
YAR.LI_B AACT----GGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGT---TGCCGTGG--GT
** ** * ** ****** * * * *** * *** **** *
LYC.ES_E ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA
YAR.LI_B ATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTAT--ATGTT--ATGGAAGGTATTTGC--AATCA
** *** * * * * **** ** *** **** ** * * ** *
LYC.ES_E CCACATTTT
YAR.LI_B CGACTCTC-
* ** *
Mean pairwise ID: 46.95%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * * * * ***** * ** * * ** * ** * * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGG-GNCCAGTGCTAGCTGCT-TACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** ** ** ** * * * ** ** * *** * ** * ******
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCG-AAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAG
CAE.BRI. -GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
* ** * * * ** * ** ** ****** ** * * * * ** * *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** ** *** * * ***** * * * **** * ******* *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
CAE.BRI. GATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCC----CACAGCCTCTCTGATACCT--TCAGAC
**** ** * *** * * * * ** * **** * * * ***
HUM.LU_C CATTTCTTTT-
CAE.BRI. CACTTGTCATT
** ** * *
Mean pairwise ID: 46.95%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG-AAATGGGACTTT
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * * ** * ****** * ** * * ** * ** ** * *
HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCT-TGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
*** * * * *** ** * * * * ** * ******
HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAG-CTCCTAAAGCGGAG
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCT-CCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
* ** * * ** **** ** * * ***** * * * * *** * * *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** ** *** * * ***** * ** * **** * ******* *
HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCT---CTGATACCT--TCAGAC
**** ** * * ** * * ** * ** **** * * * ***
HUM.JA_B CATTTCTTTT-
CAE.BRI. CACTTGTCATT
** ** * *
Mean pairwise ID: 46.95%
ZEA.MA_G -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGCGGAT
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
* ******** * * *** * * * * ** * ** ** * ***
ZEA.MA_G TCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTT--GACGTG----GTGCTCT------GCTTGGCTGT--
* ** ** *** * * * * **** * ** ** * **
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
LEI.MAJ. -GTGTCGGT-GTGGCTTGCC----CCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC
** *** ****** ** * ** ** * * * *** *****
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCG-TT
* **** * ** **** ** ** ******* * * * * * *** ** *
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
LEI.MAJ. GCAGAATCACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGC
* ** ** ** ** *** ** * *** **** ** ** * **
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
LEI.MAJ. CTT--------
*
Mean pairwise ID: 46.95%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
***** * * **** ******** *** * * * * * ** * *
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* * * ** * ** ** * * **** * * * ** ** * ***
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGC--GCACGTCCTAGAGTGGAG
XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
** * ** *** * ** * ** ** * * * * *** * ** *
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * * **** * **** * *
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACA----GCCTGAACAACAC--AGCGAGAC
*** ** *** *** *** ** * * * ** * * ***
HUM.LU_A -CATTTCTTTT
XEN.LAE. ACAGTTCT---
** ****
Mean pairwise ID: 46.96%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * ** * *** *
LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** *
LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
* ***** * *** * * **** **** * **** * *********
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
CAE.EL_D CCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTG-ACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
*** ** * ** ** * * * **** * * * ** *
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
CAE.EL_D CTTATCATTT---
** ** *
Mean pairwise ID: 46.98%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA---GGGTATCAAAGTGGTTGAACT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA--GGCTGGAGG
****** *** *** * ** ** * ** * *** * * ** ** *
CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * * ** * * ** *** * *
CIN.HYB. AGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGA
HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAAGG
*** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * **
CIN.HYB. ATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACT
HOM.SA_A A--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** *
CIN.HYB. GTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA
HOM.SA_A GTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGTGCAACATAGCG
** * **** * ** * * ** * ******** * * * *
CIN.HYB. GGACACCCATTT---
HOM.SA_A AGAC-CCCGTCTCTT
*** *** * *
Mean pairwise ID: 47.00%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATGAG--TGTG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * *** * * *
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
* * * * *** * *** **** * * * * * * ** *** *
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCT-TGGTCAGCTCCTAAAGCGGA
CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGG---GGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATA
** ** * ** * * *** ** *** * ******* ** ** *
HUM.JA_B GGG--CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGT
CAE.EL_C AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
** ** ** * ** * ** ***** * ** * **** * *****
HUM.JA_B GGAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCAC-CATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAA
CAE.EL_C GGCCGGACAGC--GCTTGTGA-GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT--ACCTTCA-
** *** * * ** *** * * ** * ** * ** * ** * *
HUM.JA_B TAGGACCATTTCTTTT-
CAE.EL_C ---GACCACTTGTCACT
***** ** *
Mean pairwise ID: 47.04%
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGC-CTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCA
TRY.BR_A AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT
*** * * *** *** **** **** * *** * * *** * *
TET.ROS. GAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTG
TRY.BR_A GGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTCG
* * * * * * ** * *** ** * ** * * * * * ** *
TET.ROS. CTATGGTGGAAACC-TAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCC
TRY.BR_A GTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGGG
* * * ** ** *** * * * * * * ****** * * ** * **
TET.ROS. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT
TRY.BR_A TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA--GCACACC
****** ** ** ** *** ** * *** ** ** ** * ** **
TET.ROS. CATTAAC-TGTCAAG-CTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
TRY.BR_A GAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
* * * * *** * ** ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 47.08%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
LEI.MAJ. ----GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCT-------AACCAGGCTTAGCGG
* * ** * ******** ****** ** *** * *
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTG-CTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGG
LEI.MAJ. GGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGT
* **** * * *** * ***** ** * * *** * * * ** *
HUM.LU_C GAGGTGGGCTGAG--GGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGC
LEI.MAJ. GTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGA
* * ** ** * ** ** *** * * * * * * ** *****
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGGA
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA
* * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * ** *
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCAT-----GTCCGCACT--TGAGCCCCAC-GCTTCGTCGCGAAGCCT
* ** *** ** * * **** * * * * * ** * **
HUM.LU_C TTTCTTTT
LEI.MAJ. T-------
*
Mean pairwise ID: 47.08%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG-CCTGTGACCTC-GTGTGG---CATAAACAATGTAG--TTAGAA
* * * * * * ***** *** *** ** * **** * ** *
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGC--TAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGG
TET.ROS. TAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGT
* * * * * ** ** * ** * ***** ****** * *
HUM.LU_C GAGGTGGGCTGAGGGA--CCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG
TET.ROS. GAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAA
*** ** ** *** *** * *** ** * *** * *** *
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TET.ROS. C--CGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
* ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * *********
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT------
**** * * * * * * * * **** ** **** *
HUM.LU_C TTTCTTTT
TET.ROS. --------
Mean pairwise ID: 47.08%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
** * * * ******** * *** ** * * ***** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
TRY.BR_B C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
* * ** ** **** * ** *** ** ***** *
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
TRY.BR_B TCGGTGTTGAG----GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG
** **** * ** ** * ** * * *** ** ** ***** ***
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TRY.BR_B -AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA
** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * ** *
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAG--TG--TCGTCGCGAGGCGG
** ** ** * * ** *** * * * ** ** * * *
HUM.LU_D TTTCTTTT
TRY.BR_B TTT-----
***
Mean pairwise ID: 47.10%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGT--
* *** * * **** ** * ** * ** ** * ** **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTG---GCCCGCCCATTCCAA
TET.THE. GATAGATAGGATATGA--GAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA
* * *** ** * * *** * * * * * * ** * **** *****
ARA.TH_C GTTGGGAGTTGAGGCA-TGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG
TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA
****** *** * ** * * * * * ** ****
ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGA
TET.THE. AGGAAAC-GCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA
*** ** ** * ******* ***** *** * ** * ***** * ******
ARA.TH_C AGGATTACGGGC-CATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA
TET.THE. AGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCG-GTTCTACTA------TCAAAGCCAG
***** ** * **** ** * * * * * * * ** ** *
ARA.TH_C CCATCACTTT
TET.THE. ACATT-----
***
Mean pairwise ID: 47.10%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAA----TGGGGGCATTAATGTGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** * * ** ***** **** **** * * * *** ***
LYC.ES_B GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * **
LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * **
LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
** * * *** ** ** **** *** *** * * ** *
LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGAC
**** ** * * *** * * *** * * ** * * * * **
LYC.ES_B CACCACTTTT
FUG.RUB. TCAGTCTTT-
****
Mean pairwise ID: 47.12%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA-
* ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** * * *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
CAN.SPE. --TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* * * * * *** * * * * *** ** ** *** * ** ** ** *
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT
CAN.SPE. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** * ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
CAN.SPE. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAG
* ***** * * * * ** ** * * ** ** ** * * * *
ARA.TH_E AACCACCATTTT
CAN.SPE. ACCCCGTCTCT-
* ** * *
Mean pairwise ID: 47.12%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_A A--TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTC
GAL.GAL. CGCTTGAGC----CCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC
*** ** **** ** * ** ** * ** * * * * * ** *
LYC.ES_A CAAGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT
GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * **** ** * * * * * * ***** *
LYC.ES_A GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA
**** * **** *** ** ** ****** * ** ****** * * ****
LYC.ES_A GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
GAL.GAL. ACGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGAC
**** * * * *** * * * * * *** **** * * * *
LYC.ES_A ACAACCACCTTT
GAL.GAL. CCTGTCTCC---
* * **
Mean pairwise ID: 47.12%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * *** *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * ***
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG
HOM.SA_A TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * ** *** * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** *
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG
**** ** *** *** * **** * ** * ** * ** *
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT
*** *** **
Mean pairwise ID: 47.13%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G
* * * * ** * ** *** * ** * * ** ** * ** * *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * ** *** * **** **** * * * * * ** * ***
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG
CAE.EL_C TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
* * **** ** *** *** ** * * * * ** *** ** * * *
HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTG
CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******
HUM.LU_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCG
CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTG--AGTTGACACGT-ATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCA
* *** * ** * *** * *** * ** ** ** * * * **
HUM.LU_B GACCATTTCCTTT-
CAE.EL_C GACCACTTGTCACT
***** **
Mean pairwise ID: 47.13%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG----GA
*** ** ** *** ** *** ** * * *** **** * * **
TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCC---TGCCCGTT
RAT.NOR. GGATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCG-CTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
* * * * ** * ** *** ** * *** * * ** ***
TRI.AE_B CCAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAA
RAT.NOR. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
* ***** * * **** * ** *** * **** *** *
TRI.AE_B GTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGG
RAT.NOR. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * *
TRI.AE_B TGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC
RAT.NOR. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGGGC-AACATAGC
* * **** * *** ** * * *** * *** * ******
TRI.AE_B AGACCACCATCTTT
RAT.NOR. GAGAC-CCGTCTCT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 47.13%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGT-GGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * ** * ***
ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGG--ACTGCCCAATC
GAL.GAL. CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGC-TATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC
* ** ** ***** * ** * * ** ** ** ** * * * * ** *
ARA.TH_G CAAGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGT
GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * ** *** ** * * ** * * ****** ****
ARA.TH_G TGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTG
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA
* * * * * *** ** ** ****** * ****** * ****
ARA.TH_G GACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTT
GAL.GAL. ACGGGA-------TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAG--CGTAGCCTGGGCAACATAGC
*** *** * * * ***** * ** * ** * * *
ARA.TH_G GAACCACCATTTT-
GAL.GAL. GAGACCCTGTCTCC
** * * * *
Mean pairwise ID: 47.15%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * * ** * ** * ***
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG--GCTGGGTTGCG--CAGCTCCTAGAGTGGAG
CAE.EL_A TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA
* * *** ** *** *** * * ** *** ** ** * * *
HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCT--GGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_A GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
** * * ** * ** * ** ***** * * * **** ******
HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATA
CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAG---TTGACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TC
* *** ** ** *** * ** *** ** * * ** * * *
HUM.LU_D GGACCATTTCTTTT--
CAE.EL_A AGACCACTTATCATTT
***** ** * *
Mean pairwise ID: 47.21%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
TET.THE. GCCAGGGTAG---CAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG--TGATA
** * *** * * ** ****** * * * * ** ** *
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG
TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA---TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAA
* * * * ** * ** ** ** * * ****** *****
TRI.AE_B GTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC--AGGC
TET.THE. TGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA
*** * ***** * ** * * *** **** ** ***
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT
* * * * ******* ***** *** ** **** ******* ***********
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA
TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGG----TTCTACT--ATCAAAGCCAGACATT-
**** * * * * * ** * * **** ** *** **
TRI.AE_B TCTTT
TET.THE. -----
Mean pairwise ID: 47.23%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
* ** * * ** *** ** *** *** ** * * * ** *** * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * ***
ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
RAT.NOR. GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGACCCG
*** ** ** ** * * * **** ** * ** * * * **
ARA.TH_C TCACTTT
RAT.NOR. TCTCT--
** **
Mean pairwise ID: 47.23%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
* ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * *** * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * ***
ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
HOM.SA_A GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG-ACCCCG
*** ** ** ** * * * **** ** * * *** **
ARA.TH_C TCACTTT
HOM.SA_A TCTCTT-
** ***
Mean pairwise ID: 47.23%
TRI.AE_B --NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGC-GGTGTGGATG
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGC-----TCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
* **** **** *** *** * *** ** * * * *** *
TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCG-TTCCAA
TRY.BR_A TCTTGGACAA---GCGGG---GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGT
* * * * ** ** *** ** **** ** **** * ** *
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCC-TTAAGTGGCA
TRY.BR_A GTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
** *** ** * * * *** * ** ** ***** *** **** *
TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
TRY.BR_A GGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
** * * ** **** *** ** ******* ** ** *** * ** **
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG--AGGCGG-
* *** * *** * ** ** ** *** * ** * ** *
TRI.AE_B CATCTTT
TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 47.25%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
* ** ** ** * ** **** **** * * ** * * * * *
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** * *** ***** * *** **** * ** ** * ***
LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * ***
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** *
LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC
RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGACCC
**** ** * * *** * * ** * *** ***** * * **
LYC.ES_B ACCACTTTT
RAT.NOR. GTCTCT---
* **
Mean pairwise ID: 47.25%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT
TRY.BR_A ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
* * *** * * * ******** * *** ** * * ***** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
TRY.BR_A C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
* * ** ** **** * ** *** ** ***** *
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG
TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGT---CGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGC-CGT--TAAAGTGGGGG
** **** * * * * * ** *** * **** *** ** ***** **
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TRY.BR_A G-AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA
* ** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** **
HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC
TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---
* ** ** ** * ** ** *** * * ** * * **
HUM.LU_A ATTTCTTTT
TRY.BR_A ---------
Mean pairwise ID: 47.25%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** ***** ****** * ** * * * * *********
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATG--TAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
CAE.EL_D --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
*** * * * **** * *** * ** * * * * **** ****
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC-CTTAAGTGGCA
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC
* ** * *** * ** *** ** * ** * **** *
TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
CAE.EL_D GTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCA-GACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
* * *** * ** * * * * **** * * **** **
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
CAE.EL_D ACCGC--GCTTGTA-AGTTGACACACATACACAGCCTTCT-CGATACCTT--CAGACCAC
* * ** * ** * * * **** ** * ** * ********
TRI.AE_B C-ATCTTT-
CAE.EL_D TTATCATTT
*** **
Mean pairwise ID: 47.27%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGG-TGGAATGT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ** **** *
LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * ** * * ** ** ** ** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_F GCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGG
HOM.SA_A GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * *** ** * * * **** ** ** * **
LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGA
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** *
LYC.ES_F AGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAA
HOM.SA_A GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTGT---GCAACATAGCGAGA
***** ** * *** * * * ** * **** * * ** * *
LYC.ES_F CCATCACTTTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
** ** **
Mean pairwise ID: 47.27%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** *** ***
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
HOM.SA_B -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
* ** * * * ** * *** *** ** *** ** * ** ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
HOM.SA_B TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAGA
***** ** * * * ** ** * * ** ** * * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
HOM.SA_B CCCCGTCTCT-
** * *
Mean pairwise ID: 47.27%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** ***
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
HOM.SA_A TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA
***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
** * **
Mean pairwise ID: 47.27%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * *
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
RAT.RAT. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA
***** ** * * * ** **** ***** ** * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
** * **
Mean pairwise ID: 47.27%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGT----GGGGATGTTAAGGTG---GTGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * * ** ** * ** *** * ** * * * * * *** ***
LYC.ES_O AATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
* * *** * * *** ** * ** * * * * ** ***
LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTG
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTC-TCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG
*** * * ** * ** *** * * *** *** * * * * * *** * *
LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
**** ** ** *** * * **** **** * **** *********
LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCA
***** ** * * ** * ** * **** * ** ** *
LYC.ES_O ACCACCACTTT
CAE.BRI. CTTGTCATT--
** *
Mean pairwise ID: 47.28%
HUM.LU_A -GCCGGTC--TTAGCAACGTGGGCCTGTA-ACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGAC
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* ** ** *** * * * * * *** ** * * * ** *
HUM.LU_A TTTGGGTCA-ACCTAGTGGATCG-GGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCC
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGC-TCA--TGTTGACGGAAC-GTCCGCACT
* ** * * *** ** * * ** **** * * ** * ** * * * ** *
HUM.LU_A AAGCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
**** * * ** *** * *** ** *** * * *** * *
HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG
* * * * * *** ** * ****** * * ***** * ****** *
HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG
DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGAT--ATGGTTG
***** ** **** * ** * ** * * * * ** * * *
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
DRO.MEL. GACCACAATCTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 47.28%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * **** * *** **** * ** ***
LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCT----TCAG
* *** ** * * *** * ** * * **** * ** * *
LYC.ES_B ACCACCACTTTT-
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
***** ****
Mean pairwise ID: 47.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G
***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * ** * * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** *
LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
* ****** * *** * * **** **** * **** *********
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
CAE.EL_C CCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCA
*** * ** * *** ** * * * * **** * * ** *
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
CAE.EL_C CTTGTCACT----
* ***
Mean pairwise ID: 47.30%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGACAAGTGT--
* * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGC-TAATTTCTGACT-TGCCCTA---TCCAAG
CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG
** ** * * ** * * ***** * * ** * ** * *** *
LYC.ES_H CTTAGAGTTGGATCATGTGG----CCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAG
CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG
* ** * ** ** ** ** * * * *** * * * * *** *
LYC.ES_H TGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
* ** * * ** *** * * ***** ** *** **** * *******
LYC.ES_H GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT
CAE.BRI. GGCCGGATAGCG--CTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCA--
** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** **
LYC.ES_H AAACAACCACCTTTT
CAE.BRI. GACCACTTGTCATT-
* ** * **
Mean pairwise ID: 47.30%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA---GGGTATCAAAGTGGTTGAACT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GACAGAGGA
****** *** *** * ** ** * ** * *** * ** * **
CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTCCA
RAT.RAT. TCGC-TTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * * ** * ** ****** * * ** * * ** *** * *
CIN.HYB. AGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGA
RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAAGG
*** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * **
CIN.HYB. ATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACT
RAT.RAT. A--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** *
CIN.HYB. GTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA
RAT.RAT. GTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGGGCAACATAGCG
** * **** * ** * * ** * ********* * * * *
CIN.HYB. GGACACCCATTT---
RAT.RAT. AGAC-CCCGTCTCTT
*** *** * *
Mean pairwise ID: 47.30%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * ** *** * ** *** * * * * ** * * *****
ZEA.MA_B TTTGC---GATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCG--GCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
** ** * * *** * ** *** * ** *** * ** * ***
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTC-TGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
CAE.BRI. AGC--GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCC-CGGGCGCATA---
** * * *** * *** *** * * *** ** * * * * *
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACG--
CAE.BRI. --AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCA
**** *** * * **** * * * ***** ** *** * * *
ZEA.MA_B GTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGC
CAE.BRI. GTGGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTC---TCTGATACCTTC
**** ***** * ** ** * * * ***** * * ** * *
ZEA.MA_B AAACCACC-ATCTTT
CAE.BRI. AGACCACTTGTCATT
* ***** ** **
Mean pairwise ID: 47.32%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * *
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
* * * * *** * *** **** * * * * * * ** *** *
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCT-TGGTCAGCTCCTAAAGCGGA
CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGG---GGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATA
** ** * ** * * *** ** *** * ******* ** ** *
HUM.JA_B GGG--CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGT
CAE.EL_B AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
** ** ** * ** * ** ***** * ** * **** * *****
HUM.JA_B GGAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCAC-CATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAA
CAE.EL_B GGCCGGAC--TGCGCTTGTGA-GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT--ACCTTCA-
** *** * ** *** * * ** * ** * ** * ** * *
HUM.JA_B TAGGACCATTTCTTTT-
CAE.EL_B ---GACCACTTGTTTTT
***** ** ****
Mean pairwise ID: 47.34%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC
**** ** * * *** * * ****** ***** *** * * *
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG
CAE.EL_B ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC------G
**** *** * ** * * * * * *** ** *** * *
ZEA.MA_D TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG--
CAE.EL_B CGGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATAC
** * * ** **** *** ** * ** ***** **
ZEA.MA_D ---CAGACCACCATCTT--
CAE.EL_B CTTCAGACCACTTGTTTTT
******** **
Mean pairwise ID: 47.37%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGC
*** ** * ** *** ** **** ** ** * * * ** **
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAG
* * ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** * ***
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATGTGG
** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** * **
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA
* ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** *
RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGT
TRI.AE_A AGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAGAC
**** * *** ** * * * ** * **** * ** * ** *
RAT.NOR. CTCT
TRI.AE_A CACC
* *
Mean pairwise ID: 47.39%
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
* ** **** ****** *** * ** *
LYC.ES_M GGGC-TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** ***** * *** ** * *** * *** ******
LYC.ES_M CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * ** *** **** * * * * * ********* *
LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* ** ************** ******* ** * * ***** ** *********
LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT-------------------------------
***** **** * * *** * * ** *
LYC.ES_M ACCTTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 47.40%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * * ** * ****** * ** * * ** * * * * *
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGCT-TGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
** * * * * * * *** ** * * * * ** * ******
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
* ** * * ** * * ********* * * ** * *** *** *
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
*** ** *** * * ***** * * * **** * ******* **
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTG-TCGCTCGCCCACAGCCTCT-CTGATACCTT----CAGACCAC
*** ** * * * * * * * *** * * ** * ** * *******
HUM.JA_A CTCTTTT-
CAE.BRI. TTGTCATT
* * *
Mean pairwise ID: 47.40%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA--GGGTATCAAAGTGGTTGAACT-
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
****** ** ** * ** *** ** * ** * ** * *
CIN.HYB. -TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTG-AGCTATGTCGATCGGGT-GTCCGCACTAAG
***** * ** * * *** ** * * ** * * *** * ***
CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGA--GCTTTAGAATCG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGG-GGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTA-AGGAG
* * * * ****** * * ** ***** * * * *** ** * *
CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG
XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** **** * *** * * * * ** *
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC
XEN.LAE. TGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCGGTGCA---GAACAGCCTGAACAACACAGCGAGAC
**** * *** * * * ** ** * ******* * * ** * ***
CIN.HYB. ACCCATTT
XEN.LAE. ACAGTTCT
** * *
Mean pairwise ID: 47.40%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TGAGTGTGGATG
***** * ** ** * ****** * ** * *** * * ** ** **
LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** *****
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
LYC.ES_A CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** * * * * * ***** ** ** **** * ********* *
LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
LYC.ES_A CCACCTTT
CAE.EL_C TTGTCACT
* *
Mean pairwise ID: 47.40%
ZEA.MA_B -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGCGCGGATG
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGC--------TCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG
* ******** ******* * *** * * * * *** *** *
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT---G
** * * * * * ***** * * ***** * * *
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
LEI.MAJ. TCGGTGTGGCTTGCCC---CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG--TTGAAGCGA-G
* *** * ** * * ** ** * * * ** ** * * ****
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCG-TTGCA
**** * ** **** ** ** ******* * * * * *** *** ** * * *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTC---CGCACTTGAGCCCCA---CGCTTCGTCGCGAAGCC
* ** *** ** *** * * ** ** **** * ** * ** ** *
ZEA.MA_B CCATCTTT
LEI.MAJ. TT------
Mean pairwise ID: 47.40%
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGC-CTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCA
TRY.BR_B AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT
*** * * *** *** **** **** * *** * * *** * *
TET.ROS. GAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTG
TRY.BR_B GGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTCG
* * * * * * ** * *** ** * ** * * * * * ** *
TET.ROS. CTATGGTGGAAACC-TAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCC
TRY.BR_B GTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGGG
* * * ** ** *** * * * * * * ****** * * ** * **
TET.ROS. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT
TRY.BR_B TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA--GCACACC
****** ** ** ** *** ** * *** ** ** * ** * ** **
TET.ROS. CATTAAC-TGTCAAG-CTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT--
TRY.BR_B GAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
* * * * *** * ** ** * * * * ** * *
Mean pairwise ID: 47.40%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TGAGTGTGGATG
**** * ** ** * ****** * ** * *** * * ** ** **
LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** *****
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGG
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
LYC.ES_K CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* *
LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
LYC.ES_K CCACCTTT
CAE.EL_C TTGTCACT
* *
Mean pairwise ID: 47.42%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAATGTGGTGGAATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* * ** ** **** ** ***** *** * ** ** ** *** *
LYC.ES_N TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * **
LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
** * * * *** ** ** ***** * ** ** * * * ** *
LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAA-----CACAGCGAGA
**** ** * * *** ** *** * ****** * * *
LYC.ES_N CACCATTTTT
XEN.LAE. CACAGTTCT-
*** ** *
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** *** ***
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
HOM.SA_B -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
* ** * * * ** * *** *** ** *** ** * ** ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
HOM.SA_B GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC
***** ** * * * ** ** * * ** ** * * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
** * *
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** ***
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
HOM.SA_A GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC
***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
HOM.SA_A CCCGTCTCTT
** * **
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * *
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
RAT.RAT. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGAC
***** ** * * * ** **** ***** ** * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
RAT.RAT. CCCGTCTCTT
** * **
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** ** * ****** * ** * **** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * * *** * * *** **** * ** *** ** * ** *****
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
* * ** * * * * * ** * * * * *** *** **** *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
* ** * * * * * ***** * * * **** ******* **
ARA.TH_G GACAACGGTT-CGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT---
*** ** ** ** ***** ** * * ** * * ** ***
ARA.TH_G CCACCATTTT
CAE.EL_A --ATCATTT-
* *****
Mean pairwise ID: 47.42%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
** * * * ******* ***** * ** * * * *** *
HUM.LU_C GGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * * * *** ** * ** * ** ** * *** ** ** * * ***
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC--GCACTCCTAGACTGGAG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGG-GGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
** * ** * ****** * ** * * * * **** ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
** * *** ** ** ***** * * **** * **** * *
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGAC
*** ** *** *** ** * ******* * * ** * * ****
HUM.LU_C CATTTCTTTT
FUG.RUB. TCAGTCTTT-
*****
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
***** ** ** * ****** * ** * **** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * * *** * * *** ** * * ** *** ** * ** *****
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
* * ** * * * * * ** * * * * *** *** **** *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
* ** * * * * * ***** * * * **** ******* **
ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCC-ACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT---
*** ** ** * * ***** ** *** ** * * ** ***
ARA.TH_G CCACCATTTT
CAE.EL_D --ATCATTT-
* *****
Mean pairwise ID: 47.44%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG--TCTATATGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT
** * ***** * * * *** * * * ***** * ** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA
*** * * * * * * * * * ****** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCT-AGTAATAGG---ACTCCACCAGGGCATTAAAGA
*** *** ** ** * * ** ** ** * * * * **
ZEA.MA_G GC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT
TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGT
** ***** ** * ******** ***** *** ** *** ****** ***
ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
TET.THE. GGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAA-TCGGTTCTA----CTATCAAAGCCA
** ******** * * *** * * ** ** * * * ** * ****
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
TET.THE. GACATT------
**
Mean pairwise ID: 47.44%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** ** ** *** * ** *** ** * * *** ****** * *
TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTG-ATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCC
ORI.CUN. CGCTTGA---GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
***** * * * ******* * * * * * * ** *** *
TRI.AE_B AAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGT
ORI.CUN. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
***** * * **** * ** *** * **** *** * *
TRI.AE_B GGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTG
ORI.CUN. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * **
TRI.AE_B GAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG
ORI.CUN. GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGGGC-AACATAGCGA
* **** * *** ** * * *** * *** * ******
TRI.AE_B ACCACCATCTTT
ORI.CUN. GACCCTGTCTCC
* * ***
Mean pairwise ID: 47.44%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
***** * * ** ******* ** ** ** * * * * ** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG
** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * **
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** **** ** ** * * * **
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT
RAT.NOR. CCCGTCTCT---
** * ***
Mean pairwise ID: 47.45%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
* * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * ** *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_B AGTGAGAGGAG------GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG
** ** ** * **** **** * * * * * ** * ***
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG
CAE.EL_B TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
* * **** ** *** *** ** * * * * ** *** ** * * *
HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTG
CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******
HUM.LU_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCG
CAE.EL_B GCCGGACTGCG--CTTGTG--AGTTGACACGT-ATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCA
* *** ** * *** * *** * ** ** ** * * * **
HUM.LU_B GACCATTTCCTTT-
CAE.EL_B GACCACTTGTTTTT
***** ** ***
Mean pairwise ID: 47.46%
TET.ROS. GCCAGG----GTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGAT-G
** * ***** * *** *** *** ** * ** ** ** ***** * ** *
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-AGAGTGTG-----CCCGTTCCAAAC
ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
*** * * * ** * ***** * * **** *** ******
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCG-G
* * ** * * * * * * ** * ** * ** ***** * * *
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG
* ** * ******** * *** *** ** ** **** * *********
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------
**** * ** * * ***
Mean pairwise ID: 47.47%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
***** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** *
ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA
HOM.SA_A TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
***** * * * * * ** ** ** ** * ** * ****
ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG
HOM.SA_A GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * *
ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG
HOM.SA_A TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACT------CCAGCCTGTGCAACATAG
* * **** * *** ** * * ** * ** ** * * **
ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT-
HOM.SA_A CGAGACCCCGTCTCTT
* * ** * * *
Mean pairwise ID: 47.48%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC
**** ** * * *** * * ****** ***** *** * * *
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT
CAE.EL_C ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-----GC
**** *** * ** * * * * * *** ** ** * * *
ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG---
CAE.EL_C GGTGCAGTGGCCGGACA--GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACC
** * * ** * ** *** ** * ** ***** **
ZEA.MA_G --CAGACCACC-ATCTTT
CAE.EL_C TTCAGACCACTTGTCACT
******** ** *
Mean pairwise ID: 47.49%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
LYC.ES_M -------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATAT-TGGGCTGTCCCAGATGG
* ** * * * * * * ** * ** *** **** *
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC
LYC.ES_M CT-----GGGCTTGGTGGGCTAATTTCT----GGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGG
* * *** ** * * *** * ***** ***** ** ******
TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCC
LYC.ES_M -ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGG-GGCGGACCGCA
** * ** * * * * * * * * ***** * * * ***
TET.THE. TCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATA
LYC.ES_M TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGG
* ******** ***** *** *** * * ***** ** ************
TET.THE. CTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-
LYC.ES_M TCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
* * **** ***** **** * * *** ** **
Mean pairwise ID: 47.56%
TRI.AE_B --NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGC-GGTGTGGATG
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGC-----TCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG
* **** **** *** *** * *** ** * * * *** *
TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCG-TTCCAA
TRY.BR_B TCTTGGACAA---GCGGG---GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGT
* * * * ** ** *** ** **** ** **** * ** *
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCC-TTAAGTGGCA
TRY.BR_B GTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG
** *** ** * * * *** * ** ** ***** *** **** *
TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
TRY.BR_B GGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
** * * ** **** *** ** ******* ** ** *** * ** * **
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG--AGGCGGT
* *** * *** * ** ** ** *** * ** * ** *
TRI.AE_B CATCTTT
TRY.BR_B TT-----
Mean pairwise ID: 47.56%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
* ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * *** * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** * ** * * ** * ** ***** * * * ** * ***
ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
CAN.SPE. GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGA---GACCC
*** ** ** ** * * * **** ** * * *** ****
ARA.TH_C TCACTTT
CAN.SPE. CGTCTCT
** *
Mean pairwise ID: 47.56%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** ** * ** *** ** **** ** ** * *** * * **
GAL.GAL. CGCT--TG-AGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGC--CCGCCCGTTCC
**** ** *** * * * **** *** *** **** * ** ** *** *
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGG-TGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGT
*** * * * ** * * * * * ** * * * *** *
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA
TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * **
GAL.GAL. ACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTA-CTCCAGCA
**** * *** ** * * * ** **** * ** * ** * * *
GAL.GAL. TGTCTCC
TRI.AE_A GACCACC
* **
Mean pairwise ID: 47.57%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG-TCTATATGTGG-CAT--AAACAATGTAGGTTGT
** * ***** * * * *** *** * ** *** * *** * * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-AGTGTGCCCGCTCCAAAC
** * * ** * * * * * ** * ****** *****
ZEA.MA_F TGGTTGTGGCT--GGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC-
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAG---GACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCT
** *** ***** * * * * * * * * * ** **
ZEA.MA_F -AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTGTTGTGGTGG
*** * ** * ******** ***** *** ** *** *** **** *****
ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC
TET.THE. AAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTA----CTATCAAAGCCAGAC
********* * * * ** * * ** * ** * ** ** * *
ZEA.MA_F ACCATCTTT
TET.THE. ATT------
*
Mean pairwise ID: 47.57%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
**** ** ** * ** **** **** * * ** * * * * *
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** * *** ***** * *** **** * ** ** * ***
LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * ***
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGAC-
**** ** * * *** * * ** * ***** * * * **
LYC.ES_I ACCATTTTT
RAT.NOR. -CCGTCTCT
** * * *
Mean pairwise ID: 47.59%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* * * ** ** * ** *********** *** * * *** **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTT-GGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAA
FUG.RUB. GCTTGAGCTCA--GGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * ** ******* * ** ** ** * * ** ** * **
LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTC--CTAAAGCG
FUG.RUB. GTTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
* * * * * * * ** * * * *** * ** **** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
*** * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA
**** * * * *** * * * *** * ** ** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
FUG.RUB. CT-CAGTCTTT
* * ****
Mean pairwise ID: 47.59%
ZEA.MA_D -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGCGGAT
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
* ******** * * *** * * * * ** * ** ** * ***
ZEA.MA_D TCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTT--GACGTG----GTGCTCT------GCTTGGCTGT--
* ** ** *** * * * * **** * ** ** * **
ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
LEI.MAJ. -GTGTCGGT-GTGGCTTGCC----CCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC
** *** ****** ** * ** ** * * * *** *****
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCGTT
* **** * ** **** ** ** ******* * * * * * * *** ** *
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
LEI.MAJ. GC-AGAATCACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAG
* ** ** *** ** *** ** * *** **** ** ** * **
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
LEI.MAJ. CCTT-------
*
Mean pairwise ID: 47.59%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * ** * **
ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ***** * ** * * ** ** ** ** * * ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA
CAN.SPE. GGGA-------TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGT-GCAACATAGCGAG
*** *** * * * ***** *** * * ***
ARA.TH_G ACCACCATTTT
CAN.SPE. ACCCCGTCTCT
*** * * *
Mean pairwise ID: 47.59%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
**** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** **
CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA
* * *** * * * ** *** ** ** *** ** * **** ***
CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG
CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT--GGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** * * *** **** ** * * * * **
CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCCACCGCGCGGTG-CAGTGG
* ** *** * *** * ** * *** ** * * * * ****
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA
CAE.EL_B CCGGACTGC--GCTTGTGAGTT---GACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC
*** * * ** * * ** * * * **** ****** * ** ***
CIN.HYB. CACCCATTT--
CAE.EL_B CACTTGTTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 47.59%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * *** * ***
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
RAT.NOR. -TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
RAT.NOR. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA
***** ** * * * ** **** ***** ** * * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
RAT.NOR. CCCGTCTCT--
** * *
Mean pairwise ID: 47.60%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG--TCTATATGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT
** * ***** * * * *** * * * ***** * ** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA
*** * * * * * * * * * ****** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCT-AGTAATAGG---ACTCCACCAGGGCATTAAAGA
*** *** ** ** * * ** ** ** * * * * **
ZEA.MA_E GC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGG
TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCG-CTTGTTGTGG
** ***** ** * ******** ***** *** ** *** **** *** **
ZEA.MA_E TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
TET.THE. TGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAA-TCGGTTCTA----CTATCAAAGCC
*** ******** * * *** * * ** ** * * * ** * ****
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
TET.THE. AGACATT------
**
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * **** * *** *** * ** ***
LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG----
* *** ** * * *** * ** * * **** * * ** **
LYC.ES_I ACCACCATTTTT-
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
***** ****
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G
****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * ** *** *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* *** * * * ***** ** ** * ** **** **
LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * ** *** *** * **** * * *** * *** *
LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ****** * * * * * **** ** *** **** * ********
LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTG-ACACGTATAC--ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC
* *** * ** * ** * * ** * * * ** * * **
LYC.ES_C AACTACCACATTT
CAE.EL_C ACTTGTCACT---
* * ***
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * ** * *** *
LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** *
LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG
* ***** * *** * * **** **** * **** * *********
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
CAE.EL_A CCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA
*** ** * *** ** * * * **** * * * ** *
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
CAE.EL_A CTTATCATTT---
** ** *
Mean pairwise ID: 47.60%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC
* ** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG
RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG
RAT.NOR. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * *
ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA
RAT.NOR. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGG----CAACATAGCG
* * **** * *** ** * * ** *** * * * ****
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
RAT.NOR. AGAC-CCGTCTCT
* * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * ** * *** **
LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** *
LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ***** * * * * * **** **** * **** * ********
LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_D GCCGGACCGCG--CTTGTAAGTTG-ACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
* *** ** * ** ** * * * **** * * ** **
LYC.ES_G AACCACCACTTTT
CAE.EL_D ACTTATCATTT--
* * ** **
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * *
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** *
LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
* ****** * *** * * **** **** * **** *********
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
CAE.EL_B CCGGACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAG----
*** ** * *** ** * * * * **** * * **
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
** ** ****
Mean pairwise ID: 47.60%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
*** * ** *** * ** *** **** * ** * * * * *
CAE.BRI. GATGGAGTGAAGGGAGGA-GTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCC-CGCCCGT---TCCAAG
* ** ** * * * * * *** * *** * * * ** *** *** *
CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTT---ATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG
* ** **** **** * * *** ***** ** *** * ***** *
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
* **** ** *** * * ***** * ** **** * **
CAE.BRI. GGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCAC--AGCCTCTCTG---ATACCTTCAG
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
** ***** * * ** *** * ***** * * * ** ***
CAE.BRI. ACCACTTGTCATT
TRI.AE_A ACCACC-------
*****
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* *** * * * ***** * *** * ** **** **
LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * * *** *** * * ****** * * *** * *** *
LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ***** * * * * * **** ** *** **** ********
LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAA-GTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
* *** ** ** ** * * ** * * ** * * * **
LYC.ES_C AACTACCACATTT
CAE.EL_D ACTTATCATTT--
* ** ** *
Mean pairwise ID: 47.62%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA
* ** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG
RAT.NOR. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * ***
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
RAT.NOR. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * ** * * *
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
RAT.NOR. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA----ACATAG
** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** **
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
RAT.NOR. CGAGAC-CCGTCTCT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.62%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
***** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** *
ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA
RAT.RAT. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
***** * * * * * ** ** ** ** * ** * ****
ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG
RAT.RAT. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * *
ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG
RAT.RAT. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGGGCAACATAGCGAGA
* * **** * *** ** * * ** ** *** * * **** *
ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT
RAT.RAT. CC--CCGTCTCTT--
* ** * **
Mean pairwise ID: 47.63%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG
****** ** *** ****** * * * * ** **** *****
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTAT--GCGGCCCGCCCGTT
CAE.EL_B GA-----GTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG
** * * * * *** * *** *** ** * * * ** ****
ORY.SA_B CCAAGT--TGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTA
CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGG-TCAGTCCCGGGTGCATAAG
***** ***** * * * * * ** ** ** ** * ****
ORY.SA_B GAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAAC
CAE.EL_B GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGC-AGT
****** ** * * * ** * **** ** ***** ** * * *
ORY.SA_B GGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATG
CAE.EL_B GGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG--ACACGTATACACAGCCTTCTCAA-TACCTTC----
** * * * * ** * * * * ** * *** * *****
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT-
CAE.EL_B --AGACCACTTGTTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 47.65%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC
**** ** * * *** * * ****** ***** *** * * *
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGG
CAE.EL_B ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC------G
**** *** * ** * * * * * *** ** *** * *
ZEA.MA_E TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG--
CAE.EL_B CGGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATAC
** * * ** **** *** ** * ** ***** **
ZEA.MA_E ---CAGACCACCATCTTT-
CAE.EL_B CTTCAGACCACTTGTTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 47.68%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** *** * ***
GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
* ** ** *** * * *** * ** ** * * ***
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG-G
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG
* * ** * *** ***** * * * * * * *** * ** *
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCAG
* ******* **** ************** ** * * * * * * * ** * *
GAL.GAL. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCTGTCT
LEI.MAJ. AATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----
*** * ** * * * * *** **** ** * * **** ** *
GAL.GAL. CC
LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 47.73%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TAAGTGTGGATG
**** * ** ** * ****** * ** * *** * * * ** **
LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** *****
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGG
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
LYC.ES_K CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* *
LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
LYC.ES_K CCACCTTT
CAE.EL_B TTGTTTTT
***
Mean pairwise ID: 47.73%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TAAGTGTGGATG
***** * ** ** * ****** * ** * *** * * * ** **
LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** *****
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
LYC.ES_A CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** * * * * * ***** ** ** **** * ********* *
LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
LYC.ES_A CCACCTTT
CAE.EL_B TTGTTTTT
***
Mean pairwise ID: 47.73%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TGAGTGTGGATG
***** * ** ** * ****** * ** * *** * * ** ** **
LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** *****
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
LYC.ES_J CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* *
LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
LYC.ES_J CCACCTTT
CAE.EL_C TTGTCACT
* *
Mean pairwise ID: 47.73%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC--
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCAATA-CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGTGA
* *** ***** * *** * ** ** ** *** ** * ** **
ARA.TH_F TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * ** * * * * * ** * ** * ***** ***** *
ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTG-AGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
***** ** ** * * ** * * * ** ** ** * *
ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
TET.THE. GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
* ** ** * ******** ***** *** ** **** ****** * ***** **
ARA.TH_F ATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCA-AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----
** ** * * * *** *** * * * ** ** * * **
ARA.TH_F ACCATTTT
TET.THE. --------
Mean pairwise ID: 47.74%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
***** ** ** * ****** * ** * ***** * * *
ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCA-ACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * * *** * * *** **** ** * *** ** * ** *****
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* ** ** * * * * ** * * * * *** *** **** *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
* ** * * * * * ***** * * * **** * ******* **
ARA.TH_G GACAACGGTT-CGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG--
**** ** ** ** **** ** *** ** * * ** ****
ARA.TH_G CCACCATTTT
CAE.EL_C TCACT-----
***
Mean pairwise ID: 47.74%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* * ** ** **** ** ********* * ** * ** * **
LYC.ES_H TGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
XEN.LAE. CTTGA-GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
* ** * ** ****** ** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGGG
XEN.LAE. TCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * ***
LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * * * **** * * **** *
LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA
XEN.LAE. GGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACACA
**** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * ***
LYC.ES_H ACCACCTTTT
XEN.LAE. GTTCT-----
Mean pairwise ID: 47.74%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG----TGGAGACAATAAGGGGATGGGAC
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGA-
* ** * * ** *** ** *** *** ** * * ** * *** * ***
ARA.TH_C GTTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCC
RAT.RAT. --TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* * * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** *
ARA.TH_C AAGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTG
RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
***** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * *
ARA.TH_C GGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** *
ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA
RAT.RAT. TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC-ATAGCGAG-ACC
**** ** ** ** * * * **** ** * * ***
ARA.TH_C CCATCACTTT
RAT.RAT. CCGTCTCTT-
** ** ***
Mean pairwise ID: 47.74%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * *** * ***
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA
RAT.NOR. -TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * *
ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** **
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ***** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
RAT.NOR. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGAC
***** ** * * * ** **** ***** ** * * * **
ARA.TH_F CCACCATTTT
RAT.NOR. CCGTCTCT--
** * *
Mean pairwise ID: 47.76%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGA-
* ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** * * *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
ORI.CUN. --TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** *
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT
ORI.CUN. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
ORI.CUN. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** * ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
ORI.CUN. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAG
* ***** * * * * ** **** ***** ** * * * *
ARA.TH_E AACCACCATTTT
ORI.CUN. ACCCTGTCTCC-
* ** *
Mean pairwise ID: 47.76%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
**** ** ** * ** **** ** * *** * * * * ***
LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGC-CCTATCCA
GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTA-TGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
* * * * * ** ****** *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG
* * * * ** *** ** * * ** ** ** ** ***** * *
LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA
***** **** *** ** ** ***** ****** *** * ****
LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
GAL.GAL. CGGGATCGCG--CCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACAT-AGCGAG
**** ** ** *** * ** * * * ***** * * *
LYC.ES_G ACCACCACTTTT
GAL.GAL. ACCCTGTCTCC-
*** **
Mean pairwise ID: 47.76%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC
* * * * * ******** * *** * ** **
HUM.LU_A TGGGTCAACCTA-GTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCA-TTCCAA
LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGAC---GTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT
** * *** * * * * * * *** * * ** ***** *
HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA
LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGT--TAAAGTAGA
* *** * * * *** * ****** * * * *** ** *** **
HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGA
LEP.COL. GGA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC
** * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** *
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
LEP.COL. AGAACCACA---CCGCGGAGCCTGTCATCACC-TGCGCC-CCAGGC-GATCCT--GTGAA
** * ** * * * **** **** *** * * **** ** ** *
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT
LEP.COL. GCTTT-------
* *
Mean pairwise ID: 47.76%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * * ** * * ** *** * ** * ** * * ***** ***
LYC.ES_G AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA
* ** *** * * *** ** * ** * * * * ** ***
LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTG
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTC-TCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG
*** * * ** * ** *** * * *** *** * * * * * *** * *
LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
**** ** ** *** * * **** **** * **** *********
LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCA
***** ** * * ** * ** * **** * ** ** *
LYC.ES_G ACCACCACTTTT
CAE.BRI. CTTGTCATT---
** *
Mean pairwise ID: 47.76%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * ** * *** **
LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** *
LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ***** * * * * * **** **** * **** * ********
LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATAC-ACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC
* *** ** * ** ** * * * **** * * ** **
LYC.ES_O AACCACCACTTT
CAE.EL_D ACTTATCATTT-
* * ** **
Mean pairwise ID: 47.77%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** ** * ** *** ** **** * *** *** * ** * *
ZEA.MA_F TGTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTT
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGC-TATGCCG--AGCGGGCGTCCGCGCT
* ** * * * ******** * * * **** ** *** * * ** *
ZEA.MA_F CCAAGTTGGTTGTGGC-TGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGA
GAL.GAL. A-AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG---GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA
* * ** ***** * * **** *** *** * *** *
ZEA.MA_F AGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAAC
GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGGTC
* ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * *
ZEA.MA_F GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAAC
GAL.GAL. AGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG-CCTGGGCAACAT--AGC
** **** * *** ** ** ** * ** * * ** * ** *** * *
ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT
GAL.GAL. GAGACCCTGTCTCC
* * ***
Mean pairwise ID: 47.77%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC
**** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG
RAT.RAT. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG
RAT.RAT. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * *
ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA
RAT.RAT. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGG----CAACATAGCG
* * **** * *** ** * * ** *** * * * ****
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT-
RAT.RAT. AGACCCCGTCTCTT
* * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.77%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG
* ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * *** * **
ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * * *** * ** * * *** ** ** ** * * ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACG---GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
RAT.NOR. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC-ATAGCGAGACCCGTC
*** ** ** ***** * **** *** * * ** *****
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT
RAT.NOR. TCT-----------
*
Mean pairwise ID: 47.77%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** * ** * * ** *** * **** ** ** * ***
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * ** *** * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** *
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATA
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAA---CATAGCG
**** ** *** *** * **** * ** ****** * **
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
HOM.SA_B AGACCCCGTCTCT-
**** *** *
Mean pairwise ID: 47.78%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGC-CGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * ****
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGAGCGGGC-GTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** * * ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG--GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCT
* *** * * * * ** * * *** ** * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
GAL.GAL. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
GAL.GAL. CAGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG--CCTGGGCAACAT--A
* ** **** ** *** ** * * * ** * ** ** * ** ** *
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT
GAL.GAL. GCGAGACCCTGTCTCC
** * * ***
Mean pairwise ID: 47.78%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA
**** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG
RAT.RAT. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * ***
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
RAT.RAT. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * ** * * *
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
RAT.RAT. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA----ACATAG
** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** **
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT-
RAT.RAT. CGAGACCCCGTCTCTT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.80%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC
**** ** * * *** * * ****** ***** *** * * *
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT
CAE.EL_B ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-----GC
**** *** * ** * * * * * *** ** ** * * *
ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG---
CAE.EL_B GGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACC
** * * ** **** *** ** * ** ***** **
ZEA.MA_G --CAGACCACCATCTTT-
CAE.EL_B TTCAGACCACTTGTTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 47.80%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC-------TAACCAGGCTTAG
* * * * ******** ****** ** * *** *
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC
* * ***** * * *** ** ***** ** * *** * * * **
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCC----TAGAGTGG
LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGA--GGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG
* * ** ** ** * ** * ** **** **** * *** * ** *
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGG
LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTG
**** * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** *
HUM.LU_D AAGGATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCA----CCATGCTTCACTGGGCTGACTCTT
LEI.MAJ. CAGAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--
** ** ** *** ** * * * * *** ***** * * * **
HUM.LU_D AATAGGACCATTTCTTTT
LEI.MAJ. ------------------
Mean pairwise ID: 47.83%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC
**** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG
ORI.CUN. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-CGATCACTCGCCCACTT-CCAAC
ORI.CUN. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
** *** * *** ** ** ****** * **** * ** **
ZEA.MA_B GGTGGGAGGA------TAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACA-CAGACCCAGATCCT
ORI.CUN. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCT
****** * * **** ******* * ** ** * * *** ***
ZEA.MA_B CTCTTAGCAAACCACCATCTTT
ORI.CUN. GTCTCC----------------
***
Mean pairwise ID: 47.87%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATA--TGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT
** * * * * *** * * * ***** ** **** *
TRI.AE_A GTTG--TAGCGC-TGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGT-TTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA--
* * *** ** * * ** * * ** * ** * ***** *****
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCC-TGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCAC--GGTCCATAATGTG
TET.THE. ---ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAG
* ** ** *** * * * * ** *** ** * *** * *
TRI.AE_A GCAGGCACA-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG
TET.THE. CTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTG
* * * * ** * ******** ***** *** ** **** ****** ****
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
TET.THE. GAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
********* * * *** * * *** ** ** * * * * **
TRI.AE_A CCACC
TET.THE. -----
Mean pairwise ID: 47.88%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
* ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * ***** * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** * ** * * ** * ** ***** *** * ** * ***
ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
HOM.SA_B GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGACCC
*** ** ** ** * * * **** ** * * * ****
ARA.TH_C TCACTTT
HOM.SA_B CGTCTCT
** *
Mean pairwise ID: 47.88%
ZEA.MA_F -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTA-----GCGGGGAGGACG
* ******** * * *** * **** * ** * * ** * *** *
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
LEI.MAJ. TGGACCAGCGAGGG-TGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGT---
* * ** ** ** * * *** ** * ** ** * **
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LEI.MAJ. GTCGGT-GTGGCTTGC---CCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGA-G
** *** ****** * * * ** *** * ** * *******
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCGTTGC-A
** * * ** **** ** ** ******* * * * * * * *** ** ** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTC---CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-
* ** *** ** **** * * ** * * ** ** ** * ** *
ZEA.MA_F CATCTTT
LEI.MAJ. -------
Mean pairwise ID: 47.90%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
**
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
* * * * * * ** * * * * ** * *** ****** *******
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGGT
**** * ** * * * *** * *** * * *** *** ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* * ************* *********** *** * * ***** ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACT--ATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAAC-TAAAC
** **** * ** * * *** * * * **** *** * * ** * * ***
ARA.TH_A CACCATTTT
LYC.ES_L CACCACTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 47.90%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAG----TGAGGGTATCAAAGTGGTTGAAC
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
***** *** *** * ** *** **** ** * * * * *** ** *
CIN.HYB. -TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAA
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGG--AGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
******* * ** * * ** * *** * * * ** **** * **
CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGG-GGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
** * * * * ***** * * ** * ** * * * * * **
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTC-TACCTCTCGACTGTGG
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA---GTAG
** ** * *** ** * ** * ** ** * * ** *** ** *
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC
FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTGAAT-----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC
**** * * ** * ** * * ** **** ** * ** * ****
CIN.HYB. ACCCATTT-
FUG.RUB. TCAGTCTTT
* **
Mean pairwise ID: 47.90%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** ***** ****** * ** * * * * *********
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGT-GATGTA-ACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
CAE.EL_A --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
*** * * * **** * *** * *** ** * * * * **** ****
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC-CTTAAGTGGCA
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC
* ** * *** * ** *** ** * ** * **** *
TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
CAE.EL_A GTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCA-GACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG
* * *** * ** * * * * **** * * **** **
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
CAE.EL_A ACCGC-----GCTTGTGAGTTGACACACA-TACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCAC
* * *** * * * * * * * ** *** * * ********
TRI.AE_B C-ATCTTT-
CAE.EL_A TTATCATTT
*** **
Mean pairwise ID: 47.91%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* * * ** ** * ** *********** *** * * *** **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * **
LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * **
LYC.ES_H GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
** * * *** ** ** ***** * *** **** * * **** *
LYC.ES_H AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC
**** * * * *** * * * *** * ** ** * * **
LYC.ES_H AACCACCTTTT
FUG.RUB. --TCAGTCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 47.91%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
**** ** ** * ** **** ** * *** * * * * ***
LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_I GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_I AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** * * * *
LYC.ES_I CCACCATTTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
** * * **
Mean pairwise ID: 47.91%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGT-----GGGGACTATAAGATGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
* ** ** ** ** * ** **** ** ** *** * * *** ***
ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* ** ** * ** * ** * *** ** ** ** * * ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA
HOM.SA_A GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC--
*** ** * * * * * **** * * * ** * ** * *
ARA.TH_G ACCACCATTTT
HOM.SA_A -CCGTCTCTT-
** * **
Mean pairwise ID: 47.91%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** ** * ** *********** *** * * *** **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTT-GGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAA
FUG.RUB. GCTTGAGCTCA--GGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * ** ******* * ** ** ** * * ** ** * **
LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTC--CTAAAGTG
FUG.RUB. GTTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
* * * * * * * ** * * * *** * ** **** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
*** * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA
**** * * * *** * * * *** * ** ** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
FUG.RUB. CT-CAGTCTTT
* * ****
Mean pairwise ID: 47.92%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
**** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** **
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * ***** ** *** **** ********
LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCA--GA
* *** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** *
LYC.ES_H ACAACCACCTTTT
CAE.EL_D CCACTTATCATTT
** * * ***
Mean pairwise ID: 47.92%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * ** *** *
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** **
LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ****** * * * * * **** **** * **** ********
LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC
* *** * ** * *** ** * * * * **** * ** **
LYC.ES_G AACCACCACTTTT
CAE.EL_C ACTTGTCACT---
* ****
Mean pairwise ID: 47.92%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT-----GGGGGCAACAATGTGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
**** ** ** ** ** **** ** ** *** * * * ***
LYC.ES_F TG-TTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAG---GAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* *** ***** ** ****** * * **** * * ** ** *
LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGT
RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * *** ** * * * **** ** ** *
LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG
RAT.RAT. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
*** ** ** * *** ** ** ***** * **** *** ****
LYC.ES_F GAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTA
RAT.RAT. GTGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGA
* ***** ** * *** * * * ** * **** ** * ** *
LYC.ES_F AACCATCACTTTT
RAT.RAT. GACCCCGTCTCTT
*** ** **
Mean pairwise ID: 47.94%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGCCCGC
**** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** * **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGG--TCTGCGC--CTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGT
GAL.GAL. CGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGC
* * *** *** ** ** **** ** * *** * * **** * * ***
ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG
GAL.GAL. GCTAAGGCCGGCATCA-ATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA
* *** * * * * *** * *** ** ** * * * ****
ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG
GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCA
* ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * *
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGG
GAL.GAL. GTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAA----TAGCC-ACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAG
** **** ** *** ** * * *** ** * * ** *** *
ORY.SA_B CAGACCACCACCTTT
GAL.GAL. CGAGACCCTGTCTCC
* * * **
Mean pairwise ID: 47.94%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* *** * * * ***** ** ** * ** **** **
LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * ** *** *** * **** * * *** * *** *
LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ****** * * * * * **** ** *** **** * ********
LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCA-ACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTT
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG-ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCT-------TC
* *** ** * ** * * ** * ** *** * ** *
LYC.ES_C AAACTACCACATTT-
CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT
* ** ** ***
Mean pairwise ID: 47.94%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC----TGGA
*** ** ** *** * ** *** ** * * *** ****** ****
TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCC---TGCCCGTT
HOM.SA_A GGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCG-CTATGCCGATCGGGTGTCCGCA
* * * * ** * ** *** ** * *** * * ** ***
TRI.AE_B CCAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAA
HOM.SA_A CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
* ***** * * **** * ** *** * **** *** *
TRI.AE_B GTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGG
HOM.SA_A GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * *
TRI.AE_B TGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC
HOM.SA_A TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGTGC-AACATAGC
* * **** * *** ** * * *** * *** * ******
TRI.AE_B AGACCACCATCTTT-
HOM.SA_A GAGACCCCGTCTCTT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 47.94%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC
***** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** *
ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA
ORI.CUN. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
***** * * * * * ** ** ** ** * ** * ****
ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG
ORI.CUN. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * *
ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG
ORI.CUN. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGGGCAACATA-----G
* * **** * *** ** * * ** ** *** * * **** *
ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT
ORI.CUN. CGAGACCCTGTCTCC
* * * * *
Mean pairwise ID: 47.94%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA
**** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG
ORI.CUN. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * ***
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
ORI.CUN. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * ** * * *
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
ORI.CUN. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA----ACATAG
** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** **
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
ORI.CUN. CGAGACCCTGTCTCC
* * * * ***
Mean pairwise ID: 47.95%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGC-CGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * ****
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGAGCGGGC-GTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** * * ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG--GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCT
* *** * * * * ** * * *** ** * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
GAL.GAL. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGG
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
GAL.GAL. TCAGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG--CCTGGGCAACAT--
* ** **** * *** ** * * * ** * ** ** * ** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT-
GAL.GAL. AGCGAGACCCTGTCTCC
*** * * ***
Mean pairwise ID: 47.95%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGC-CGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * ****
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGAGCGGGC-GTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** * * ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG--GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCT
* *** * * * * ** * * *** ** * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
GAL.GAL. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGG
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
GAL.GAL. TCAGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG--CCTGGGCAACAT--
* ** **** ** *** ** * * * ** * ** ** * ** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT
GAL.GAL. AGCGAGACCCTGTCTCC
*** * * ***
Mean pairwise ID: 48.04%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATAT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
* *** * ** *** * * * **** * *** ** *** *****
LYC.ES_K TGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
TET.ROS. TCAG----AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG
* * * * ** * * * * * ** * * ***** ***** **
LYC.ES_K AGAGTAGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-G
**** * ** * ** * * * * * * * * *** * * *
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TET.ROS. AACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
***** * ******** ***** *** *** * * ***** ** *********
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACACT
*** * * ***** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_K ACCTTT
TET.ROS. ------
Mean pairwise ID: 48.05%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TAAGTGTGGATG
***** * ** ** * ****** * ** * *** * * * ** **
LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
* * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** *****
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
* * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * **
LYC.ES_J CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** * * * * * ***** ** *** **** * ********* *
LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC
** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * **
LYC.ES_J CCACCTTT
CAE.EL_B TTGTTTTT
***
Mean pairwise ID: 48.05%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCG-GATC
* ** * * ** ** * ** *** ***** * * *** ** * *
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
* * ** ** * * ** * ** ***** * * * * ** * ****
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTC-TCATGTC-TTCTAGAGTGGG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
* ** * * * * * * * * ** ***** ** ** ** **** * ***
ARA.TH_C GGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAA
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG
* **** *** ** ** ****** * * **** * * ** *
ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
XEN.LAE. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCC---TGAACAACAC--AGCGAGAC
**** ** ** ** * * * ** * ** * * * * * * * *
ARA.TH_C ATCACTTT
XEN.LAE. ACAGTTCT
* * *
Mean pairwise ID: 48.05%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATC-CAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT--
* *** * ** ***** * * **** ** ** * * **
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
TET.ROS. -AGTCAGAGTATGAGAGTTTGAT--GAGACAGTTTGC-TAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC
*** * * * * * * * * * * * **** ******
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCA-TGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
* ****** *** * ** * * * * * ** **** * *
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
TET.ROS. GA-ACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
** ***** * ******* ***** *** * ** * ***** * ********
ARA.TH_C GATTACGGGC-CATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGC------TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACA
*** ** * **** ** * *** * * * * ** ** *** ***
ARA.TH_C ATCACTTT
TET.ROS. CT------
*
Mean pairwise ID: 48.06%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ***** * * *
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * * * ***** * * **** *** ** ** * ***
LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * * *** ** * * * **** ** ** * ***
LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** *
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
HOM.SA_B GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTGA---GCAACATAGCGAGAC
***** ** * *** * * * ** * ***** * * ** * **
LYC.ES_F CATCACTTTT
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
* ** *
Mean pairwise ID: 48.06%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG---GGGGCATTAATGTGGTGGAATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
**** ** ** *** ** ***** *** * ** * ** ** *** *
LYC.ES_I TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * **
LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
** * * * *** ** ** ***** * ** ** * * * ** *
LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAA-----CACAGCGAGA
**** ** * * *** ** *** * ****** * * *
LYC.ES_I CACCATTTTT
XEN.LAE. CACAGTTCT-
*** ** *
Mean pairwise ID: 48.06%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT
* *** ****************
ZEA.MA_C G-GTAGTGG-CCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT--TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC
* ******* *** * * ** * *** * * ***** ** * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
*** ** *********** **************** ****** *** **********
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCC--TACTCCAGC-GAC
******* **** ***** * ***** * * * **** *** ***
ZEA.MA_C CACCATTTTT
TRI.AE_C CACCATC---
******
Mean pairwise ID: 48.06%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG---GGGGCATTAATGTGGTGGAATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ** ** ** *** ** ***** *** * ** * ** ** *** *
LYC.ES_B TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * **
LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
** * * * *** ** ** ***** ** *** * * * ** *
LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGA---ACAACAC--AGCGAGA
**** ** * * *** ** *** * ****** * * * * *
LYC.ES_B CACCACTTTT
XEN.LAE. CACAGTTCT-
*** * *
Mean pairwise ID: 48.08%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG--TCTATATGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT
** * ***** * * * *** * * * ***** * ** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA
*** * * * * * * * * * ****** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCT-AGTAATAGG---ACTCCACCAGGGCATTAAAGA
*** *** ** ** * * ** ** ** * * * * **
ZEA.MA_D GC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG
TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTGTTGTGG
** ***** ** * ******** ***** *** ** *** *** **** **
ZEA.MA_D TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
TET.THE. TGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAA-TCGGTTCTA----CTATCAAAGCC
*** ********* * * *** * * ** ** * * * ** * ****
ZEA.MA_D GACCACCATCTT
TET.THE. AGACATT-----
**
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA-
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * *** * * *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
RAT.NOR. --TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** *
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT
RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** * ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
RAT.NOR. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAG
* ***** * * * * ** **** ***** ** * * * *
ARA.TH_E AACCACCATTTT
RAT.NOR. ACCCGTCTCT--
* ** * *
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGA-
* ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** * * *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
HOM.SA_A --TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** *
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT
HOM.SA_A AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
HOM.SA_A GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** * ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
HOM.SA_A GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAG
* ***** * * * * ** ** * * ** ** ** * * * *
ARA.TH_E AACCACCATTTT
HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT
* ** * **
Mean pairwise ID: 48.08%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** ** ** *** * ** *** ** * * *** ****** * *
TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTG-ATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCC
CAN.SPE. CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
***** * * * ******* * * * * * * ** *** *
TRI.AE_B AAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGT
CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
***** * * **** * ** *** * **** *** * *
TRI.AE_B GGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTG
CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * **
TRI.AE_B GAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG
CAN.SPE. GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGTGC-AACATAGCGA
* **** * *** ** * * *** * *** * ******
TRI.AE_B ACCACCATCTTT
CAN.SPE. GACCCCGTCTCT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA-
* ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** *** * *
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
HOM.SA_B --TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT
* * * * * *** * * * * **** ** ** *** **** ** ** *
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT
HOM.SA_B AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
HOM.SA_B GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** * ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
HOM.SA_B GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAG
* ***** * * * * ** ** * * ** ** * * * * *
ARA.TH_E AACCACCATTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT-
* ** * *
Mean pairwise ID: 48.08%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACT---TGCCCTATCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** * * ** ** * ** * * ** ** ** * *
LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
ORI.CUN. CTGTCTCC----
* * **
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT--GAGGACAGAGG
* ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * **
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
RAT.RAT. ATCG-CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** *
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT
RAT.RAT. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * ***
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
RAT.RAT. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * * * * *** ** ** ****** * ***** * ****
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
RAT.RAT. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAG
* ***** * * * * ** **** ***** ** * * * *
ARA.TH_E AACCACCATTTT
RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT
* ** * **
Mean pairwise ID: 48.08%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G
****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * ** * * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** **
LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ****** * * * * * **** **** * **** ********
LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC
* *** * ** * *** ** * * * * **** * ** **
LYC.ES_O AACCACCACTTT
CAE.EL_C ACTTGTCACT--
* ****
Mean pairwise ID: 48.09%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** **
LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ****** * * * * * **** **** * **** ********
LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_B GCCGGACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAG---
* *** ** * *** ** * * * * **** * ** **
LYC.ES_O AACCACCACTTT--
CAE.EL_B -ACCACTTGTTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 48.10%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** *** ****
ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC
** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** *
ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC
**** ** * * *** * * ****** ***** *** * * *
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACG-
CAE.EL_C ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGC
**** *** * ** * * * * * *** ** *** * * *
ZEA.MA_E -GTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG
CAE.EL_C AGTGGCCGGACAGCGC----TTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTT-
**** *** * ** ** * ** * * ** ** * **
ZEA.MA_E CAGACCACC-ATCTTT
CAE.EL_C CAGACCACTTGTCACT
******** ** *
Mean pairwise ID: 48.10%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA----GGGTATCAAAGTGGTTGAAC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
****** *** *** * ** ** * ** * ** * **** * *
CIN.HYB. TTTGAGCTTG-GCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTC
HOM.SA_B C----GCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCAC
***** ** ** * ** ****** * * ** *** ** *** *
CIN.HYB. CAAGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTA
HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAA
**** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * *
CIN.HYB. GAATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGA
HOM.SA_B GGA--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * **** * * * *** ** ** **** * *** *** **
CIN.HYB. CTGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAA
HOM.SA_B CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGAGCAACATAG
* ** * **** * ** * * ** * ******** * * *
CIN.HYB. CAGGACACCCATTT--
HOM.SA_B CGAGAC-CCCGTCTCT
* *** *** * *
Mean pairwise ID: 48.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTG----GGAGGCTGAGGCTGGCG
**** * * ** *** * ******** ****** * *** * ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
FUG.RUB. GATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATG---TCGATCGGGTGTCCGT
* * ** ** * * ****** ** * * * * * * ** ****
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATATGGT---GCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCG---
* ***** *** * ** *** * * *** * * * **
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
FUG.RUB. CCTAAGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCC
***** * ** ** * * *** ** ** ***** * **** *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
FUG.RUB. GCTCAGTAGTGGGATCGCGC----CCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAAC--
** ** * **** * * * * * * * * ** **** *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
FUG.RUB. -ACAGCGGGACTCAGTCTTT
*** * * * * *****
Mean pairwise ID: 48.19%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAA
TRI.AE_C ------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG
*** ****** ****** ** **** * * * **** * ****
LYC.ES_M TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGT
TRI.AE_C T-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGC
* ***** ** * * * *** **** * ***** **********************
LYC.ES_M GAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTA
TRI.AE_C GACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTT
** * ****** * ************ *** ** ** * * ** * *
LYC.ES_M ACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT
TRI.AE_C GGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCATC---
**** * * * ***** * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.22%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
* ** ** ** * * ** **** **** * * ** ** * * * *
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** *** ***** *** **** * ** ** * ***
LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * ***
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** *
LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC
CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGACC
**** ** * * *** * * ** * ***** * ** * ***
LYC.ES_B ACCACTTTT
CAN.SPE. CCGTCTCT-
* ** *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** ** * *** * * * ** ***
LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_I GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_I AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** * * * *
LYC.ES_I CCACCATTTTT
ORI.CUN. CC-CTGTCTCC
** * * *
Mean pairwise ID: 48.23%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA--TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** ** ** *** * ** *** * *** * ** * *** ** * *
TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCT-TGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
XEN.LAE. CTTGA---GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA
**** * * * ******* * * * * * * ** *** * **
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC----CTTAAGTG
XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGG-GGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAG
*** * * **** ** * *** *** * **** ** * * *
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGG
XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG
* * *** *** ** ** ****** * *** *** * * * ** *
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
XEN.LAE. TGGGATCGC--GCCTGTG----AATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAAC-AACACAGCGAG
**** * *** ** * *** * * * * *** * ** ***
TRI.AE_B CCACCATCTTT
XEN.LAE. ACACAGTTCT-
*** * *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
ORI.CUN. CTGTCTCC---
* * **
Mean pairwise ID: 48.23%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA---GGTGGCGCGGAT
LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA
* * *** ******* ******* ** * * ** **
ZEA.MA_B GCTTTGCGA--TGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCC
LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT-
*** * * * * ** ** * ***** * * ***** * *
ZEA.MA_B AAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
LEP.COL. --GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGTA
** ** * ** * * * ** ** *** * * * * * * ** **
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
LEP.COL. G-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCG-TT
* ***** * ** **** *** ** ******* * ***** *** ** ** *
ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAA
LEP.COL. GCAGAACCACA--CCGCGGAGCCT-GTCATCACCTGCGCCCCAGG--CGATCCTGTGAAG
* ** * *** **** * * * * ** * * ***** * ** * **
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
LEP.COL. CTTT-------
*
Mean pairwise ID: 48.23%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC--
TET.THE. ----GCCAGGGTAGCAATA-CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGTGA
* *** ***** * *** * ** ** ** *** ** * ** **
ARA.TH_A TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * ** * * * * * ** * ** * ***** ***** *
ARA.TH_A TGTGAGTAATTA--GTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT---CCACCAGGGCATTAAAGAGCT
***** ** *** * * * *** * ** ** ** **
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA
* ** ** ** * ******** ***** *** ** **** ****** * *****
ARA.TH_A CGGATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
TET.THE. AGGATAACATACTCATTAACTGTCA-AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-
**** ** * * * *** *** * * * ** ** * * **
ARA.TH_A ACCACCATTTT
TET.THE. -----------
Mean pairwise ID: 48.23%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA--TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGA--T
* ** ** ** * ** ***** *** * *** * * ** ***
ARA.TH_F TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** * * ** * *** ** ** **** * * ** ** * ***
ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC-AGGTTCTAGAGTCGGAG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * * ** ** ** * * ** ** ** * * ***** * *
ARA.TH_F GGTAATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
*** * ** *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA-TGA
XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTG-------AACAACACAGCGA
***** ** * * * ** * ** * ***** * ** * **
ARA.TH_F ACCACCATTTT
XEN.LAE. GACACAGTTCT
*** ** *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGTGGTGGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
* * ** ** ** ** **** ** ** * **** * * * * * **
LYC.ES_N GTTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
RAT.NOR. --CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* **** * * ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** * * * *
LYC.ES_N CCACCATTTTT
RAT.NOR. C--CCGTCTCT
* ** * * *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
CAN.SPE. CCGTCTCT---
* * *
Mean pairwise ID: 48.24%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
**** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** **
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** *
LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* * *** * * * * * ***** ** *** **** ********
LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCA--GA
* *** * * *** ** ** * **** * * * ** ** *
LYC.ES_H ACAACCACCTTTT
CAE.EL_A CCACTTATCATTT
** * * ***
Mean pairwise ID: 48.24%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** * * *****
ZEA.MA_B TTTGCGATGGT---TTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * *** * ** ******* * * * * * * ** * ***
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT---GGTCAGTCCCGGGT----GCAT
** ** * ** ** ** *** * **** * * * **
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
CAE.EL_B AAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCC-ACCGC--GCGGTG
**** *** * * ** * * * * * *** ** *** ** * *****
ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCT-GCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAA
CAE.EL_B CAGTGGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTT-CAG
* * **** * **** * * *** * ** ** * * **
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT-
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 48.24%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * ** * *** **
LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** *
LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ***** * * * * * **** **** * **** * ********
LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_A GCCGGACCGCG--CTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACC
* *** ** * *** ** * * * **** * * ** **
LYC.ES_G AACCACCACTTTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT--
* * ** **
Mean pairwise ID: 48.26%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** ***
LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGT
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTG-----TCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG-
* ** ** * ** *** *** ** ** * * * ** **
LYC.ES_F CCAAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTT---GGCCTTTAG
CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCA--CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
****** * * ** ** * * * * * ** * ** * ** **
LYC.ES_F AGTGGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCA
CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCA
* * * **** * * * * * **** * ** * **** * *****
LYC.ES_F GTGGAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCT-A
CAE.EL_C GTGGCCGGACAGCG--CTTGTGA--GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCA
**** *** ** ** *** **** * ** * * *** * * * * *
LYC.ES_F ATTAAACCATCACTTTT
CAE.EL_C GACCACTTGTCACT---
* *****
Mean pairwise ID: 48.28%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGG-CAATAAGGTGGTGTTGGATG
DRO.MEL. -----GACTGGAAG-GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT----CTGATTG
* * ** ** ****** * * * * * * **** ** **
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGC-GCCT-GTGGTTTGCACTATG----CGGCCCGCC
DRO.MEL. TGGGATGGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTC
* * * ** * **** *** * ** * * ** *** *** ** *
ORY.SA_B CGTTCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGC-AC
DRO.MEL. CGCACTAAGCT-TGCCATCAATATGGG-TGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGG
** * *** * * * **** *** ** * ** * ** * * *
ORY.SA_B CTAGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCC
DRO.MEL. CTAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTA
*** * ** * * * * *** *** * ****** * * ****
ORY.SA_B AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCC
DRO.MEL. GGCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACT---GCCGTTATCAGCCCAACCGATATGG
* ** * ***** ** *** * * * *** * * ****** * *
ORY.SA_B ATGGCAGACCACCACCTTT
DRO.MEL. TTGG---ACCACAATCTTT
*** ***** * ****
Mean pairwise ID: 48.35%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG
SCH.POM. CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGG----TG
*********** ** **** **** * * * * * ** ***** **
YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG
SCH.POM. GTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGT-AG
* *** * * * * * * * * ** * * ** ** * * * * *
YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA
SCH.POM. TCTTCGTGG-CAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGT-TGGAAACAATGCA
*** ** * ** ** * * * ** * * * * * * ***
YAR.LI_B ATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATG
SCH.POM. CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCG-ATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCAGGATGTG
** * * * ** *** * ** *** ****** ** * * * ** **
YAR.LI_B TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---
SCH.POM. C-ATGGAAG-----TATAAACACAACGGTCGTT
******* * ** *** ** **
Mean pairwise ID: 48.38%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
**
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
* * * * * * ** * * * * ** * *** ****** *******
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG
**** * ** * * * *** * *** **** * *** * ** * *
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************* *********** *** * * ***** ******** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACT--ATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAAC-TAAACC
* **** * ** * * *** * * * **** *** * * ** * * ****
ARA.TH_F ACCATTTT
LYC.ES_L ACCACTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 48.38%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACC-CGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGT
TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT
** * * * * ** ******* ** **** ** ** ** ** * *
ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGTTCCAAACA
** * * * ** ** ** * ** ** ***** ***** *
ARA.TH_D GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGC-GGATTCTAAAGTCGGAGG
TET.ROS. GTGAGTTG-CTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
****** ** ** ** * **** * ** ***** *
ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
* * ** * ******* ***** *** ** **** ** **** * ***** **
ARA.TH_D ATCATA-GTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAG-CTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----
** * * ** ** *** * * * * * *** * **** *
ARA.TH_D ACCACTTT
TET.ROS. --------
Mean pairwise ID: 48.39%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * ******* * ** ** * ** *** *** ** ** * ***
HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** ** * * * **** * **
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * **** *
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCACTGCACTC-CAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC
**** ** *** *** * * * **** ** * * * * ** ***
HUM.LU_B CATTTCCTTT
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
* ** *
Mean pairwise ID: 48.39%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
** * * ** * ****** * ** * * ** * ** * ** *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC--TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCAAG
** * ** * * * * *** ** * ** * * * ** * *****
HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG
CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
* * ** * * ** ** * ****** * * * * ** * ** * * *
HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** ** *** * * ***** * * * **** * ******* *
HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTG-TCGCTCGCCCACAGCCTCT----CTGATACCT--TCAGACC
**** ** * * * * * ** *** * ** **** * * ** ****
HUM.LU_B ATTTCCTTT-
CAE.BRI. ACTTGTCATT
* ** *
Mean pairwise ID: 48.39%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
TET.ROS. GCCAGGGT-AGCAAT----GCCTGTGACCTCGT--GTGGCATAAACAATGTAG---TTAG
*** * * ***** ****** *** * ***** * * * ** *
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TET.ROS. AATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * *** * * * * * ** * ** ** ***** ****** *
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCA-GGGCATTAAAGAGCTGAG
* ****** ** * **** * *** ** * * * **** ***
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
TET.ROS. GA-ACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
* * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * *******
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----
****** * * * * * * * *** **** *
HUM.LU_A CATTTCTTTT
TET.ROS. ----------
Mean pairwise ID: 48.40%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * *
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * *** * ** * *** **
LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** *
LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ***** * * * * * **** **** * **** * ********
LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACC
* *** ** * *** ** * * * **** * * ** **
LYC.ES_O AACCACCACTTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT-
* * ** **
Mean pairwise ID: 48.40%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** ** ** *** * ** *** ** * * *** ***** ** *
TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCT-TGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCC
HOM.SA_B CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT
***** * * * ******* * * * * *** ** *** *
TRI.AE_B AAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGT
HOM.SA_B AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
***** * * **** * ** *** * **** *** * *
TRI.AE_B GGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTG
HOM.SA_B GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * **
TRI.AE_B GAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG
HOM.SA_B GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGAGC-AACATAGCGA
* **** * *** ** * * *** * *** * ******
TRI.AE_B ACCACCATCTTT
HOM.SA_B GACCCCGTCTCT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 48.41%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGACAAGTGT--
* * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGC--CC---TGTCCAAG
CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG
** * * * ** * * ***** * ** * ** ** **** *
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG
* ** * * ** * *** ** * ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
* ** * ** ** *** * * ***** ** *** **** * *******
LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT
CAE.BRI. GGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG-
** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** **
LYC.ES_K AAACAACCACCTTT
CAE.BRI. -ACCACTTGTCATT
* ** * **
Mean pairwise ID: 48.41%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC
**** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG
HOM.SA_A TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG
HOM.SA_A AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * *
ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA
HOM.SA_A TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG----CAACATAGCG
* * **** * *** ** * * ** *** * * * ****
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT-
HOM.SA_A AGACCCCGTCTCTT
* * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.41%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGT--GTGGCATAAACAATGTAG---TTAG
* * ****** ****** *** * ***** * * * ** *
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TET.ROS. AATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * *** * * * * * ** * ** ** ***** ****** *
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGG
* ****** ** * **** * *** * * **** ****
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TET.ROS. A-ACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
* ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ********
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGT--GCTACCTGG---ATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATA
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
***** * * ** * * *** **** *** * *** **
HUM.LU_D GGACCATTTCTTTT
TET.ROS. --------------
Mean pairwise ID: 48.42%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGT-GGATG
*** * ** *** ** *** * * * * ** **** *****
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCC---CGCCCGT
CAE.BRI. GA-----GTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGCGTCCGT
** * * * *** * *** ** *** *** ** ** ****
ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG
CAE.BRI. GCCAAGCGCTGCGTCGC-CAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAA
***** * ** *** * ** * ******* * * ** ** * **
ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG
CAE.BRI. GGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCA
* * * * * ** *** * * ***** * * * **** *
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGG
CAE.BRI. GTGGCCGGATAGCG--CTTGTG-AGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTT---
**** ***** ** * ** ** * ** *** * *** ** *
ORY.SA_B CAGACCACC-ACCTTT
CAE.BRI. CAGACCACTTGTCATT
******** * **
Mean pairwise ID: 48.42%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA
**** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG
HOM.SA_A CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * ***
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
HOM.SA_A GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * ** * * *
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
HOM.SA_A GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCA----ACATAG
** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** **
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT-
HOM.SA_A CGAGACCCCGTCTCTT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.42%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGACAGGAGGA
**** ** *** *** ** *** ** *** * * * ** *** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCGT
RAT.NOR. TCGATTGAGTCCA---GGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGC
* * * * * ** ** * **** ** ** ****** * ** ***
ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTA
RAT.NOR. ACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCTA
* ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * ****
ORY.SA_B GAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAAC
RAT.NOR. AGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATC
* ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * *
ORY.SA_B GGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATG
RAT.NOR. AGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGGGCAAC----ATA
** * **** ** **** ** * *** *** * * **
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT
RAT.NOR. GCGAGAC-CCGTCTCT
** * ** ** *
Mean pairwise ID: 48.52%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG-TGATA
** *** ** * * ** * **** * *** ** * * * *
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG
* * ** *** * * * * ** * * ***** ***** ** *
LYC.ES_K AGTAGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
TET.THE. AGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA
*** * ** * ** * * * * * * * * ***** * ***
LYC.ES_K C-CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT
*** * ******** ***** *** *** * * ***** ** **********
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGA
** * * **** ***** **** * * *** *
LYC.ES_K CCTTT
TET.THE. CATT-
* **
Mean pairwise ID: 48.54%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* **** * ** * ******** ***** * ** * * * *** *
HUM.LU_D GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * * * ** * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGAGG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGGT
** * * ** ****** ** * ** * * * **** * ** *
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
FUG.RUB. GCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG
** * *** ** ** ***** * * **** * **** * **
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
FUG.RUB. AT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTA-GTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGACT
** ** *** *** * ** * * * * ** * * ** * * ****
HUM.LU_D ATTTCTTTT
FUG.RUB. CAGTCTTT-
*****
Mean pairwise ID: 48.54%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTA-ACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACA-ATGTAGGTTGTGA-----T
* * * ** * ** ** * * ** * * ** *** * *** *
ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACA
* * ** * * * * * * * ** * * ***** ***** *
ARA.TH_E GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGG-CTCAAAC-GGCTTCTAAAGTTGGAG
TET.THE. ATGAGTT-GCTATG-GTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
***** * ** *** ** * * * ** *** * * ** ***** *
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
** ** ** * ******* ***** *** ** **** ****** * ***** *
ARA.TH_E GATCACA-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT---
*** *** * * * *** *** * * * ** ** * * **
ARA.TH_E CACCATTTT
TET.THE. ---------
Mean pairwise ID: 48.55%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCC-GGCTTGCCCATCCCAAGT
LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC
*** * ** * **** *** * * * *** * *** ***** *****
ZEA.MA_B -TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG
*** ** * *** **** ****** ***** ** * **** ** **
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAG-CTTCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * **** ******* *********** *** ** * ** ** * **** *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGAT---CCTCTCTTAGCAAA
LYC.ES_L GGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAA
******* * * *** * *** *** * *** *** * *** * ***
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
LYC.ES_L CCACCACTTT-
****** **
Mean pairwise ID: 48.55%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * ** *** **
ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
* * * ***** * ** * * *** ** ** ** *** ** ** * *
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** *
ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** *
ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA
HOM.SA_B GGGA-------TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC-TGAGCAACATAGCGAG
*** *** * * * ***** *** * ***
ARA.TH_G ACCACCATTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT
*** * * *
Mean pairwise ID: 48.55%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
** * * ** ******* ** ** ** * * * * ** **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** ** * * * **** * **
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA
RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * **** *
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACT-CTTAATCGGA
RAT.RAT. GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCAC--TGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** * * * **** ** * * * * * * * ** **
HUM.LU_B CCATTTCCTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
** ** **
Mean pairwise ID: 48.55%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** ** * * * **** * **
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * **** *
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACT-CTTAATCGGA
ORI.CUN. GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCAC--TGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** * * * **** ** * * * * * * * ** **
HUM.LU_B CCATTTCCTTT
ORI.CUN. CCCTGTCTCC-
** * **
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
CAN.SPE. CCGTCTCT---
* * *
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG
* * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
* * * **
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
HOM.SA_A CCGTCTCTT--
* * * *
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
ORI.CUN. CTGTCTCC---
* * **
Mean pairwise ID: 48.55%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
** * * ** ******* ** ** ** * * * * *** **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** ** * * * **** * **
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * **** *
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACT-CTTAATCGGA
RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCAC--TGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** * * * **** ** * * * * * * * ** **
HUM.LU_B CCATTTCCTTT
RAT.NOR. CCCGTCTCT--
** * **
Mean pairwise ID: 48.56%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** ** *** * ****** * * * * ** * * *****
ZEA.MA_B TTTGCGATGGT---TTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
** ** * * *** * ** ******* * * * * * * ** * ***
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT---GGTCAGTCCCGGGT----GCAT
** ** * ** ** ** *** * **** * * * **
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
CAE.EL_C AAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCC-ACCGC--GCGGTG
**** *** * * ** * * * * * *** ** *** ** * *****
ZEA.MA_B -GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAA
CAE.EL_C CAGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTT-CAG
* ** *** ** **** * * *** * ** ** * * **
ZEA.MA_B ACCACC-ATCTTT
CAE.EL_C ACCACTTGTCACT
***** ** *
Mean pairwise ID: 48.56%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
* ***** * ** ******* ** ** ** * * * * ** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** *** *** * **** * **
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG
RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCGA
**** ** *** *** * **** ** ** ****** * **
HUM.LU_D GACCATTTCTTTT
RAT.NOR. GACCCGTCTCT--
**** * *
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G
**** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * *** * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * ***** ** *** **** * ********
LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCA--GA
* *** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** *
LYC.ES_H ACAACCACCTTTT
CAE.EL_C CCACTTGTCACT-
** * *
Mean pairwise ID: 48.56%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
***** * * ** ******* ** ** ** * * * * * *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG
** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * **
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCA-CTAGGCTGACTCTTAATAG
RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC--ATAGCGA
**** ** *** *** **** ** ** * ** ** **
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
RAT.RAT. GACCCCGTCTCTT
**** *** **
Mean pairwise ID: 48.56%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC
**** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG
CAN.SPE. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG
CAN.SPE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * *
ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA
CAN.SPE. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG----CAACATAGCG
* * **** * *** ** * * ** *** * * * ****
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
CAN.SPE. AGACCCCGTCTCT
* * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCA-ACAA-TGTGG-TGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * * ** ** * ** *** * * * * ** * **** ***** ***
LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC--GTCCGTGCC
* ** *** * *** ** * * * * ** * ** **
LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTG
CAE.BRI. AAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG
**** * * ** * ** * * *** * * * * *** ** * *
LYC.ES_F GGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGG
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
* ** ** ** *** * * **** * ** * **** * *********
LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA
CAE.BRI. CCGGATAGCG--CTTGTGA--GTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT-ACCT--TCAG
**** ** ** *** *** * * * * *** * * *** * *
LYC.ES_F ACCATCACTTTT-
CAE.BRI. ACCACTTGTCATT
**** * *
Mean pairwise ID: 48.56%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
***** * * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG
** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * **
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCA-CTAGGCTGACTCTTAATAG
ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC--ATAGCGA
**** ** *** *** **** ** ** * ** ** **
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
ORI.CUN. GACCCTGTCTCC-
**** * ***
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_K A--TTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC--TGGCCTGCCCTGT
GAL.GAL. CGCTTGAGC----CCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC
*** ** **** ** * ****** *** *** * ** * ** *
LYC.ES_K CCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG
GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG-GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGG
* ** * * ** *** *** ** * * * * * * ***** *
LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
GAL.GAL. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT
**** * **** *** ** ** ****** * * ****** * * ****
LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA
GAL.GAL. AACGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * *** **** * * * *
LYC.ES_K AACAACCACCTTT
GAL.GAL. CCCTGTCTCC---
* * **
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * * *** *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC
CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* *** * * * ***** ** *** * ** **** **
LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT
CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * * *** *** * * ****** * * *** * *** *
LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG
* ***** * * * * * **** ** *** **** ********
LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA
CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACC
* *** ** ** *** * * *** * * ** * * * **
LYC.ES_C AACTACCACATTT
CAE.EL_A ACTTATCATTT--
* ** ** *
Mean pairwise ID: 48.57%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA
**** ** ** ******** * ** * ** * * *** * * **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG
CAN.SPE. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * ***
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
CAN.SPE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * ** * * *
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
CAN.SPE. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCA----ACATAG
** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** **
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
CAN.SPE. CGAGACCCCGTCTCT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.58%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCCGG
**** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG
ORI.CUN. AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
* *** *** * ** ** * **** ** ** ****** * ** ***
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * ***
ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA
ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** *
ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT
ORI.CUN. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGGGCAAC----AT
* ** * **** ** **** ** * *** *** * * **
ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT
ORI.CUN. AGCGAGACCCTGTCTCC
** * * **
Mean pairwise ID: 48.69%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** ** * ** *** * ** ***** ** * * * * * *** *
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGG-TGTGCTAC--TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
XEN.LAE. CTTG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
*** ** * * * **** *** ** **** * * * * *** * ****
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGT--CCATAATGT
XEN.LAE. TCGGTATCA----ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGA
* *** *** * * ** * *** ** ** * *** * *** *
TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG
XEN.LAE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTA
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * * **
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAG
XEN.LAE. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACAC
* **** * *** ** * * * ** **** ** * * **
TRI.AE_A ACCACC
XEN.LAE. AGTTCT
* *
Mean pairwise ID: 48.70%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** ***** ****** * ** * * * * *********
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGT-GATGT-AACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
CAE.EL_B --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
*** * * * **** * *** * *** *** * * * * **** ****
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG
* ** * *** * ** *** * * ** * ** * * *
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
CAE.EL_B GTG----GATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTGCAGTG
* * * * * * * * *** ***** *** * * ***** * *
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCAC
* **** * * * * ** * * * *** * * ********
TRI.AE_B CATCTTT-
CAE.EL_B TTGTTTTT
***
Mean pairwise ID: 48.70%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
****** * ** ***** ****** * ** * * * * *********
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGT-GATGT-AACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
CAE.EL_C --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
*** * * * **** * *** * *** *** * * * * **** ****
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG
* ** * *** * ** *** * * ** * ** * * *
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
CAE.EL_C GTG----GATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTGCAGTG
* * * * * * * * *** ***** *** * * ***** * *
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCAC
* **** * * * * ** * * * *** * * ********
TRI.AE_B C-ATCTTT
CAE.EL_C TTGTCACT
** *
Mean pairwise ID: 48.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGC
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** * * **
ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TET.ROS. TC----AGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG--AGTGTGCCCGTTCCAAAC
* * ** * * * ** ** ** * ***** * ****
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCT--GACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT---TCACCAGGGCATTAAAGAGCT
* *** ** * ** **** * ** * ** * * ** ** *
ZEA.MA_B -AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
TET.ROS. GAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTATTGTGGTGG
***** ** * ******** ***** *** ** *** *** *** *****
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
TET.ROS. AAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGACAC
********* * * *** * * * ** * * * * *** * * **
ZEA.MA_B CACCATCTTT
TET.ROS. T---------
Mean pairwise ID: 48.71%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* * ** ** **** ** ********* * ** * ** * **
LYC.ES_K TGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG
XEN.LAE. CTTGAGT--CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * **** ** * ****** ** *** ** * * ** ** * ***
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGCGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** * * ** * * ** * * ** **** * **
LYC.ES_K GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
** * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** *
LYC.ES_K AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC
**** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * **
LYC.ES_K AACCACCTTT
XEN.LAE. AGTTCT----
*
Mean pairwise ID: 48.71%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
** * * ** * ******* ** ** ** * * * **** **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** ** * * * **** * **
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA
HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** * **** *
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC
HOM.SA_A GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC
**** ** *** *** * * * **** ** * * ** * ** ***
HUM.LU_B CATTTCCTTT
HOM.SA_A CCCGTCTCTT
* ** **
Mean pairwise ID: 48.71%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGT---CACCCATGTGGGGGCATTGAG-GCGGTGTGGAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC
* * **** * *** *** * * ** * * *** * ** ***
TRI.AE_B GCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA
* ** * * * ** * ** * * * *** ** * *** * **
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAG-GCCTTAAGTGGC
DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG
* * * * ****** * ** ** * * ** *** * ** * * **
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAA
DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
* * *** * *** *** * ****** * * * *** * ** *
TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGAC
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAA----CCGATATGGTTGGAC
***** * *** * * ** *** * * *** *** ** * ***
TRI.AE_B CACCATCTTT
DRO.MEL. CACAATCTTT
*** ******
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
DRO.MEL. -GACTGG-AAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCAC--GCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGAT
* ** * ** ** *** * ** ** * ** *** * ** * ****
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGT-TAGCTGC----------TTGCTGGTCTGCCCATTC
DRO.MEL. GGCCTGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC
*** ** * ** ** * ** **** * *** ** * ** *
HUM.JA_A CAAGCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA
DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA
**** * ** *** *** ** * ** ** **** **
HUM.JA_A GGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA
** * * * * *** *** * ****** * * ***** * ******
HUM.JA_A GAAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAG
DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATAT-GGTTGG
* ***** ** *** * *** * ** * *** ** * * * * *
HUM.JA_A ACCATCTCTTTT
DRO.MEL. ACCACAATCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
** * * ** ******* ** ** ** * * * * **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
* * ******* * ** ** * ***** *** * ** * * ** * **
HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGG
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** * ** **** * * * ** * ** * * * **** * **
HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** * ****
HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCC--TGG----GCAACATAGCGAG
**** ** *** *** ** * ** * * * *** * * ** *
HUM.LU_B ACCATTTCCTTT
GAL.GAL. ACCCTGTCTCC-
*** * **
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGG----GCATGTGGGAAATGGAACT--
LEP.COL. ----GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGT
* * * * * ******** * *** * * * * * *** **
HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTG-GTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCT-TACCCGGCTGCCCATTCCA
LEP.COL. CTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGA
*** ** * ** * * * * * * * **** * * ***** * *
HUM.LU_C AGCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGA
LEP.COL. GGCCTCCGGGTGCCC-------CCTTGCAGAAGGGGCGCG-CCCCCTCCGTTAAAGTAGA
*** **** * *** * ***** * * * * ** * * **
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGA
LEP.COL. GGA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC
** * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** *
HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG
LEP.COL. AGAACCAC--ACCGCGGAGCCT---GTCATCACC-TGCGCCCCAGGCGATCCT--GTGAA
** * ** *** * **** * ** *** * * * * ** ** *
HUM.LU_C ACCATTTCTTTT
LEP.COL. GCTTT-------
* *
Mean pairwise ID: 48.72%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA-GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG--TGA
** * ***** * * * *** * * * ** * ** ** * ** **
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGC---TAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * ** * * * ** * ** *** * * ****** *****
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGT--TGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT----CCACCAGGGCATTAAAGAGC
*** ** * *** * * * * **** * * ** ** ** ** *
ZEA.MA_C CA-GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
TET.THE. TAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGG
* **** ** * ****** * ***** *** ** *** * *** * *****
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TET.THE. AAGGATAACATACT-------CATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCA
********** * *** ** * * * * ** *****
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
TET.THE. GACATT------
**
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** * ** ******* ** ** ** * * * * *
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATC--GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
** ***** * ** ** * ***** *** **** * ** * **
HUM.JA_B GCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT-CCTAAAGCGG
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * ** ******* * ** *** * * ***** * **
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
* * * * *** ** ** ****** ** ****** * * ****
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAA---TAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAA---CATAGCGAG
**** ** *** *** * * * * ** ** *** ** * ** *
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
GAL.GAL. ACCCTGTCTCC-
*** * ***
Mean pairwise ID: 48.72%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA--TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGA--T
* ** ** ** * ** ***** *** * *** * * ** ***
ARA.TH_A TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** * * ** * *** ** ** **** * * ** ** * ***
ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA
XEN.LAE. TTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCAC-CAGGTTGCTCTAAGGAG
* * * * ** ** ** * * ** ** ** *** ****** *
ARA.TH_A GGGTAATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG
**** * ** *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA-TG
XEN.LAE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTG-------AACAACACAGCG
***** ** * * * ** * ** * ***** * ** * *
ARA.TH_A AACCACCATTTT
XEN.LAE. AGACACAGTTCT
* *** ** *
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ***** * ** ******* ** ** ** * * * * *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
* * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** * * ** * **
HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGG
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** * ** **** * * * ** * ** *** * **** * **
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
* * * * *** ** ** ****** * ****** * * ****
HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGC---CTGGGCAA---CATAGCGAG
**** ** *** *** * ** * * ****** * ** *
HUM.LU_D ACCATTTCTTTT
GAL.GAL. ACCCTGTCTCC-
*** * ***
Mean pairwise ID: 48.73%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** * * ****** * ** * ** ** * ***** ***
LYC.ES_G AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
* ** ** * * ** ** * * ** * * * ** ***
LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT
CAE.EL_B AGCGCTGCGTC--ACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
*** * * ** * ** * * * * * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ****** * * * * * **** **** * **** ********
LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
CAE.EL_B GCCGGACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAG---
* *** ** * *** ** * * * * **** * ** **
LYC.ES_G AACCACCACTTTT-
CAE.EL_B -ACCACTTGTTTTT
***** ****
Mean pairwise ID: 48.73%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTC-GTGTGG---CATAAACAATGTAGTTAGAAT--
*** * * ****** *** *** ** * **** * * *
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGC---TGCCCATTCCAAGCCGA
TET.ROS. -AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGT
** * ** ** * * * ***** * ***** ****** * *
HUM.JA_B GAGTTGAGCTG-TGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTC-CTAAAGCGGAGGG
TET.ROS. GAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAG---GACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
****** ** ** * ** * * * *** *** * ***** * * *
HUM.JA_B CAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
** ** * ******* ***** *** ** *** * ***** * ********
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGT--GCTGCTTGG---ACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
***** * * *** * * * ** * **** * *** **
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
TET.ROS. --------------
Mean pairwise ID: 48.73%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGACAAGTGT--
** * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGC--CC---TGTCCAAG
CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG
** * * * ** * * ***** * ** * ** ** **** *
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG
* ** * ** ** * *** ** * ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_A TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
* ** * ** ** *** * * ***** ** ** **** * *******
LYC.ES_A GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT
CAE.BRI. GGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG-
** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** **
LYC.ES_A AAACAACCACCTTT
CAE.BRI. -ACCACTTGTCATT
* ** * **
Mean pairwise ID: 48.73%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_L ----------------------------------------------GTTGGGTTGA---C
** * **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_L CCAGATGGTTGGGTTCGG----TAGGCTTATAGTCTG---------GCCTGCCCTCTCCA
* * * *** * * ** * ** * * ** ** *** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTG-CACCTAGAGT
LYC.ES_L AGC-ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT
** * ** * * ** * * **** * * * * * ** **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_L GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTG
** * * * ************************* *** * * ***** * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTG--CCTTCCATGGC
LYC.ES_L GAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACT
************* * *** * * ** ** **** ** * *
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
LYC.ES_L AAACCACCACTTT-
* ******** **
Mean pairwise ID: 48.73%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
DRO.MEL. -GACTGG-AAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCAC--GCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGAT
* ** * ** ** *** * ** ** * ** ** * ** * * *
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGT-TAGCTGC----------TTGCTGGGCTGCCCATTC
DRO.MEL. GGCCTGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC
**** ** * ***** * ** **** * *** ** * ** *
HUM.JA_B CAAGCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGC
DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA
**** * * ** *** *** ** **** * **** *
HUM.JA_B GGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA
** * * * * *** *** * ****** * * ***** * ******
HUM.JA_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA
DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACT-GCCGTTATCAGCCCAACCGATA--TGGTT
* ***** ** **** * ***** ** * * * * * ** * *
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
DRO.MEL. GGACCACAATCTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 48.73%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATGAG--TGTG
** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * *** * * **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * * * * ** * ***
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCTGG--GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG
CAE.EL_C TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
* * **** ** *** *** ** * ** * ** *** ** * * *
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******
HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCT-ACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAAT
CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACAC-AGCCTTCTC------AATACCT--T
* *** * ** * * * ** * ** *** * **** * * * * *
HUM.LU_D AGGACCATTTCTTTT-
CAE.EL_C CAGACCACTTGTCACT
***** ** *
Mean pairwise ID: 48.87%
ZEA.MA_C -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGTGGAT
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC
* ******** * * *** * * * * ** * ** ** *****
ZEA.MA_C GCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
LEI.MAJ. CAGCGA----GGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGC-TCTGCTTGGCTGTGTGT-CGGT
* * ** ** *** *** * * **** * ** * * *** ** *
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
LEI.MAJ. GTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGG-CGCGGGTCCG-----CCGTTGAAGCGA------
** * * * ** * ** *** ** ** ** * *** * * *
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
LEI.MAJ. -GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCAC-GCACGTCCGCCGTTGC
***** * ** **** * ** ******* * * * * * * ** *
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
LEI.MAJ. AGAATCACA--CCGCGG-AGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
** ** *** ** * * ****** * * *** ** ** * **** * ****
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
LEI.MAJ. -----------
Mean pairwise ID: 48.87%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** * **** ******** *** * * * * * * ** * *
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* ** *** * ** ** * * **** * * * * ** ** * ***
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT--CCTAAAGAGGAG
XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* * ** *** ** ** * ** ** ** ** * * * **** **** *
HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG
* * * *** ** ** ****** * * **** * **** * *
HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC
XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACA-ACACAGCGAGACA---C
*** ** * * *** ** ** ** * * * ** *** * ** *
HUM.JA_A ATCTCTTTT
XEN.LAE. AGTTCT---
* ***
Mean pairwise ID: 48.87%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAAT----ACCTGTG-TCTATATGTGG---CATAAACAATGTAGGTTGT
* * ****** ***** * * ** ** * **** **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACA
* * * * * * * * * ** * ** ** ***** ***** *
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
TET.THE. ATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGG
****** ** ** **** * *** * * **** ***
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TET.THE. A-AACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
** ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ********
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
TET.THE. ATAACATACTCAT--TAACTG------TCAAACT--AATCGGTT--CTACTATCAAAGCC
***** * * ** *** ** ** * * ** * ** ** * **
HUM.LU_D ATTTCTTTT
TET.THE. AGACATT--
* **
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATG-TGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
* * ** ** ** ** **** ** ** * **** * * * * * ***
LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** * * * *
LYC.ES_N CCACCATTTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
** * * **
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG
* * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
RAT.NOR. C--CCGTCTCT
* ** ** *
Mean pairwise ID: 48.87%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTG-TGGATGT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGACAGAGGA
*** ** * ** *** ** **** * *** * * * ** * ** *
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTA
* ** * * ******* ** ** * * * *** ** *** * *
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAGCG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
**** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * *
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
* * * * *** ** ** ****** * * * **** * * **
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
RAT.RAT. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGGGCAACAT--AGCGAGA
* **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * *
ZEA.MA_F CACCATCTTT-
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* ** ** ** * * ** **** ** * *** * * * ** ***
LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** *
LYC.ES_B AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACA-TAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * *** ***** * ** * *
LYC.ES_B CCACCACTTTT
ORI.CUN. CCCTGTCTCC-
** **
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATA-
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
* *** * ** *** * * * **** * *** ** *** *****
LYC.ES_H TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** *
LYC.ES_H TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * * ** * ***** * *
LYC.ES_H GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
**** ** * ******* ***** *** *** * * ***** ** *******
LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACA
***** * * ***** * * * * * ** ** * *
LYC.ES_H CCACCTTTT
TET.ROS. CT-------
*
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
HOM.SA_A CCGTCTCTT--
* * * *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** **** * * ** ** * * * *
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** *** ***** *** **** * ** ** * ***
LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * ***
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGACC
**** ** * * *** * * ** * ***** ** * * ***
LYC.ES_I ACCATTTTT
CAN.SPE. -CCGTCTCT
** * * *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG
* ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
* * * **
Mean pairwise ID: 48.88%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
**** * * ** * ****** * ** * * ** * ** * * *
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC--TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCAAG
** ** ** * * * * *** ** * ** * * * ** * *****
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGG--GTTGCGCACGTCCTAGAGTGG
CAE.BRI. CGCTGCGTCGC-CAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCG-CATAAGGAGT
* * ** * * * * * ** ** * ****** ** ** ** * ** * *
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC
* *** ** *** * * ***** * * * **** * *******
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCT---CTGATACCT--TCAG
***** ** * * * * * * ** * ** **** * * * *
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT-
CAE.BRI. ACCACTTGTCATT
**** ** * *
Mean pairwise ID: 48.88%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
***** * * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * * ** ** * ** ** * ** *** *** ** ** * ***
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG
** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * **
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCA-CTAGGCTGACTCTTAATAG
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC--ATAGCGA
**** ** *** *** **** ** ** * * ** **
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
HOM.SA_B GACCCCGTCTCT-
**** *** *
Mean pairwise ID: 48.90%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-------GCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT
**** ** ** **** ** *** * ** ** * ** ** * ** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCGT
XEN.LAE. CGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGC
* * *** *** * ** * * ** ** ***** * ** ***
ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCA--CCT
XEN.LAE. ACTAAGTTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGG-GGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCT
* ***** *** * * *** * ****** * ** **** ** * **
ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA
XEN.LAE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGAT
* * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * *
ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT
XEN.LAE. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAAC-AGCCTGAACAA----CAC
* ** * **** ** *** ** * * ** * * *** * **
ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT
XEN.LAE. AGCGAGACACAGTTCT-
** *** *
Mean pairwise ID: 49.01%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** ** *****
RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAG--------GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
* ** * *** ** * *** * ** **** * **
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG-
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * **
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA
* * ******* **** ************** ** * * * * * ** *
RAT.RAT. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCCGTC
LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** **
RAT.RAT. TCTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 49.01%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGT-GGTTGAACTTT
TET.THE. GCCAGGGT-AGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGAT--
** ** * * ** * ** * ** * *** * *** ** ***** *
CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
TET.THE. -AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAA
** * ** * * **** * * * * * ** * ****** *****
CIN.HYB. AGAGTGGGT-TCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
TET.THE. TGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGAC--TCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
**** * * * ** * * ** * * * * * ** *** * *
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
TET.THE. GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG
* ** ** * ******* ***** * * ****** * ** ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
TET.THE. ATAACATACTC-ATTAACT---GTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-
** *** * * * ** * * *** * * *** * * * ****
CIN.HYB. ATTT
TET.THE. ----
Mean pairwise ID: 49.03%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTG-TAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
LYC.ES_L GG-TTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
* *** * ** * ******* * *** * ***** ***** ******
CIN.HYB. AGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGG-CTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGGT
**** ** *** ** * * **** * * **** *** ** * * ****
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* * ***** ****************** **** * ** **** * ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAAC---CAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
** ** * * * * * ** **** * * **** ***** **
CIN.HYB. CCCATTT-
LYC.ES_L ACCACTTT
*** **
Mean pairwise ID: 49.03%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
**
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATA-TCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA
* * * * *** ** * * * * **** **** ****** *******
ARA.TH_D GTGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGG-CTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG
LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGG
**** **** * ** **** * * ** * * * ******* ** *
ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ************************* *** * * ** ** ******** *
ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACT--ATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTC-CAACTAAA
*** * * ** * * **** * * * ** * *** * ** * ** *
ARA.TH_D CCACCACTTT
LYC.ES_L CCACCACTTT
**********
Mean pairwise ID: 49.03%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGCCGGAGGA
*** ** * ** *** * ** **** * *** * * * ** * *** *
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTA
* ** * * ******* ** ** * * * *** ** *** * *
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAGCG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
**** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * *
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
* * * * *** ** ** ****** * * * **** * * **
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
ORI.CUN. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGGGCAACAT--AGCGAGA
* **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * *
ZEA.MA_F CACCATCTTT
ORI.CUN. CCCTGTCTCC
* * ***
Mean pairwise ID: 49.03%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
LEI.MAJ. ----GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTAACCAGGCTTAG-----CGGGG
* * * * ******** ****** * * * ***
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGG
LEI.MAJ. AGGAC--GTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGT
* * ***** * * *** ** ***** ** * *** * * * ** *
HUM.LU_B GAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCC----TAGAGTGGAG
LEI.MAJ. GTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGA---GGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG
* ** ** ** * ** * ** **** **** * *** * ** ***
HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-CCGGCAGTGGAA
LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA
** * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * * ** ** * *
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC
LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCA----TGTCCGCACT------TGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA
* ** ** *** ** **** * * ** ** ** *** ***
HUM.LU_B CATTTCCTTT
LEI.MAJ. AGCCTT----
*
Mean pairwise ID: 49.03%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TRI.AE_C ---------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGT
* ** ***************
ZEA.MA_F TG-GTTGTGGCTGG--TGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
TRI.AE_C TGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC
** ** **** * ****** ***** * ******** * * * * ***
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA
***** **************************** *** ******************
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCA
TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA
******** ********** * * ** ** * ** * * * * * * *****
ZEA.MA_F CCATCTTT
TRI.AE_C CCATC---
*****
Mean pairwise ID: 49.03%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ** ** ** **** ** ********* * ** * ** * **
LYC.ES_J TGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG
XEN.LAE. CTTGAGT--CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * **** ** * ****** ** *** ** * * ** ** * ***
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** * * ** * * ** * * ** **** * **
LYC.ES_J GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
** * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** *
LYC.ES_J AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC
**** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * **
LYC.ES_J AACCACCTTT
XEN.LAE. AGTTCT----
*
Mean pairwise ID: 49.03%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** ** * ** *********** *** * * *** **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTT-GGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAA
FUG.RUB. GCTTGAGCTCA--GGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * ** ******* * ** ** ** * * ** ** * **
LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** * * * ** * * ** * * * ***** * **
LYC.ES_A GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
** * *** *** ** ** ***** * ** ** **** * * **** *
LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC
**** * * * *** * * * *** * ** ** * * **
LYC.ES_A AACCACCTTT
FUG.RUB. T-CAGTCTTT
* ****
Mean pairwise ID: 49.04%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRI.AE_C ------------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCA
* ** * **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGT-GTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
TRI.AE_C AGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTT-GGGCCTCACGGTCCATAATGT
***** **** * * ** **** ***** * * * ** ** * * * ** **
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_C GGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG
*** ** * ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
TRI.AE_C GAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG-GGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-G
********************* *** * ****** **** **** * ** *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
TRI.AE_C ACCACCATC---
******* *
Mean pairwise ID: 49.04%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGG-TAGCGTTGGCTTGTCACC-CGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGAT
TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATG-CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGT-TAGAAT
****** **** ** * *** *** ** * ** ** ** ** ** * * **
ORY.SA_B GCCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTC
TET.ROS. AGTCAGA-GTATG-----AGAGTTTGATGAGACAGTTTGC--TAAG-AGTGTGCCCGTTC
* ** ** * ** ** ****** ** * * ********
ORY.SA_B CAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGA
TET.ROS. CAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTT--CACCAGGGCATTAAAG
*** * * * * ** ** *** * *** * * *** *
ORY.SA_B GTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGG
TET.ROS. AGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGG
** * ** * ******* ***** *** ** ** ****** **
ORY.SA_B TGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC
TET.ROS. TGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT--CGGTTC---TGCTATTCTGATC
************ * * * * * *** * *** * * *
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
TET.ROS. AGAC-ACT------
**** **
Mean pairwise ID: 49.04%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
***** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG
** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * **
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG
**** ** *** *** **** ** ** * ** * ** *
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT
HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT
*** *** **
Mean pairwise ID: 49.04%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGTGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * **
ZEA.MA_A GCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCT-TCAGCGGACTATGTC---GATCGGGT-GTCCGTAC
**** ** ** ******** * ** * ** * * *** * * ** * *
ZEA.MA_A CAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGGA
FUG.RUB. TAAGTTCG--GTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAG
***** * ** ** ** **** * * *** ** ** * ***
ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG
FUG.RUB. GAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAG
* ** * * *** ** ** ***** * ** ** * *
ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC
FUG.RUB. TAGTGGGATCGC---GCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACA----GC
* * **** * *** ** * ** *** ** ** * * ** **
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
FUG.RUB. GGGACTCAGTCTTT
* * *****
Mean pairwise ID: 49.04%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** * * ****** *** **** * ** ** * *
LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
CAN.SPE. CCGTCTCT----
* * *
Mean pairwise ID: 49.04%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGC
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * **
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TET.ROS. TCAGA---GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGC---TAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC
* * ** * * ** * ** *** * * ************
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGT--TGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTT----CACCAGGGCATTAAAGAGC
* *** ** * ***** * * * **** * * ** ** ** ** *
ZEA.MA_C C-AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG
TET.ROS. TGAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGG
****** ** * ****** * ***** *** ** *** * *** * *****
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TET.ROS. AAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATC--GGTTCTGCTATTCTGATCAGACAC
********** * * * * * ** * * * * * **
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
TET.ROS. T-----------
Mean pairwise ID: 49.04%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGACAAGTGT--
** * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGC--CC---TGTCCAAG
CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG
** * * * ** * * ***** * ** * ** ** **** *
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAG
CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG
* ** * ** ** * *** ** * ** *** * * * * * *** *
LYC.ES_J TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT
* ** * ** ** *** * * ***** ** *** **** * *******
LYC.ES_J GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT
CAE.BRI. GGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG-
** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** **
LYC.ES_J AAACAACCACCTTT
CAE.BRI. -ACCACTTGTCATT
* ** * **
Mean pairwise ID: 49.04%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * **
LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGC-CCTATCCAA
GAL.GAL. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTA-TGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* * ** ** ******* *** **** * * ** ** * * *
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * ** *** ** * * ** ** ** ** ***** * **
LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
**** *** * *** ** ** ***** ****** *** * ****
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGC-AACATAGCGAGA
**** ** ** *** * ** * * * ***** *** * *
LYC.ES_E CTACCACATTTT
GAL.GAL. CC-CTGTCTCC-
* * *
Mean pairwise ID: 49.05%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG
** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG
* * * ** *** * **** **** * * * * * ** * ***
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCTGG--GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG
CAE.EL_B TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
* * **** ** *** *** ** * ** * ** *** ** * * *
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******
HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCT-ACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAAT
CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACAC-AGCCTTCTC------AATACCT--T
* *** ** * * * ** * ** *** * **** * * * * *
HUM.LU_D AGGACCATTTCTTTT-
CAE.EL_B CAGACCACTTGTTTTT
***** ** ****
Mean pairwise ID: 49.06%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGACAG
**** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG
RAT.RAT. AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
* *** *** * ** ** * **** ** ** ****** * ** ***
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * ***
ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA
RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** *
ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT
RAT.RAT. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGGGCAAC----AT
* ** * **** ** **** ** * *** *** * * **
ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT-
RAT.RAT. AGCGAGACCCCGTCTCTT
** * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGC
TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA-
** * * * ** *** *** ** **** * ** ** * ***
TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
TET.ROS. -GTCAGAGTA-TGAGAGTTTGATGAGACAGT-TTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG
** ** ** * * ** * * ** * ** * *********** *
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTA-GTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGG
* ** * * * ** * * ** ** ** ** ***
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
TET.ROS. AACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
** ** * ******** ***** *** ** **** ****** **********
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-----
*** * * *** * ** *** ** ** * ** ** **
Mean pairwise ID: 49.18%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG-TGATA
* ** *** ** * * ** * **** * *** ** * * * *
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG
* * ** *** * * * * ** * * ***** ***** ** *
LYC.ES_J AGTTGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
TET.THE. AGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA
***** ** * ** * * * * * * * * ***** * ***
LYC.ES_J C-CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT
*** * ******** ***** *** *** * * ***** ** **********
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGA
** * * **** ***** **** * * *** *
LYC.ES_J CCTTT
TET.THE. CATT-
* **
Mean pairwise ID: 49.19%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
** * ** * ******** ***** * ** * * * *** **
HUM.LU_B GGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * *** *** * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***
HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGAG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
** * * ** *** * ** * ** ** ** * * * **** * ** *
HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
** * *** ** ** ***** * * **** ** **** * *
HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTG--AATAGACGCTGTA-GTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGACT
*** ** *** *** * * * * * ***** * ** * * ****
HUM.LU_B ATTTCCTTT
FUG.RUB. CAGTCTTT-
** **
Mean pairwise ID: 49.19%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAAT-GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT
* *** **** ** *** *** * ***** * ** * ** ** *
ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
** * * * * * * ** * ** * ***** ***** *
ARA.TH_A GTGAGTAATTAGTGTTGAG-TTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGG--ACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** ** * * *** ** ** **
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
** * ** * ******** ***** *** ** **** ******* * ***** *
ARA.TH_A GATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT---
*** ** * * * *** * * * * * ***** ** **** * *
ARA.TH_A CACCATTTT
TET.ROS. ---------
Mean pairwise ID: 49.19%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
** * ** * ******** ***** * ** * * * * *** *
HUM.JA_A GGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * *** ** * ** ** * * ** * * * * ** ** * * ***
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGAG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* * * ** *** ** ** * ** * *** ** * * ***** **** *
HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
** * *** ** ** ***** * * **** * **** * *
HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGACC
FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTG--AAT--AGACGCTGTAGTT-CAACCTGAGTAACACAGCGGGACT
*** ** * * *** * * * * * * ** * * ** * * ***
HUM.JA_A ATCTCTTTT
FUG.RUB. CAGTCTTT-
*****
Mean pairwise ID: 49.20%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * * **
HOM.SA_A CGCT--TG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC
**** ** ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** *
HOM.SA_A AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTC-TCACGGTCCATAATG
***** * * * * ** * ** * ** * ** * * * *** *
HOM.SA_A AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * **
HOM.SA_A AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAG--CGAGA
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCT-CGCAGCCTACTCCAGCA
* **** * *** ** * * * ** * **** *** * ** * *
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
TRI.AE_A GACCACC----
** *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
* ** ** ** * * ** **** ** * *** * * * *** ***
LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** *
LYC.ES_B AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** * ** * *
LYC.ES_B CCACCACTTTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
** * ** **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
CAN.SPE. CCGTCTCT---
* * *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGTGGTGGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
* * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * * * * **
LYC.ES_N -GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
CAN.SPE. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * * * ** ****** *** **** * ** ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** ** * * *
LYC.ES_N CCACCATTTTT
CAN.SPE. CC-CCGTCTCT
** ** * * *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** ** * *** * * * *** ***
LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_I GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_I AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** ** * * *
LYC.ES_I CCACCATTTTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
** * * **
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** * ** ******* ** ** ** * * * * *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA
* * ****** * ** ** * ***** *** ** * * ** * **
HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGG
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** **** * * * ** * ** * * * * ***** ****
HUM.JA_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
* * * * *** ** ** ****** * ****** * * ****
HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGA
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCAG-CGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ***** * * ** ** * * ** ***
HUM.JA_A CCATCTCTTTT
GAL.GAL. CCCTGTCTCC-
** * ***
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* ***** * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** *** *** * **** * **
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG
ORI.CUN. GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCGA
**** ** *** *** * **** ** ** ****** * **
HUM.LU_D GACCATTTCTTTT
ORI.CUN. GACCCTGTCTCC-
**** * ***
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
* ** ** ** * ** **** ** * *** * * * * ***
LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** *
LYC.ES_B AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACA-TAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * *** ***** * ** * *
LYC.ES_B CCACCACTTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
** * ** **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
ORI.CUN. CTGTCTCC---
* * **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GACAGAGGA
**** ** * ** *** ** **** * ** * *** * * * * **
LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA
RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG
RAT.RAT. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * **
LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** *
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** *** ** * * * * ** *** * *
LYC.ES_C CTACCACATTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
* * * **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG
* ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
RAT.NOR. C--CCGTCTCT
* ** ** *
Mean pairwise ID: 49.20%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** ** * ** *** ** **** ** ** * *** * * * * **
RAT.RAT. CGCT--TG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC
**** ** ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** *
RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTC-TCACGGTCCATAATG
***** * * * * ** * ** * ** * ** * * * *** *
RAT.RAT. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * **
RAT.RAT. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAG--CGAGA
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCA
* **** * *** ** * * * ** * **** * ** * ** * *
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
TRI.AE_A GACCACC----
** *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GCCGGAGGA
**** ** * ** *** * ** **** * ** * *** * * * * ***
LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA
ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG
ORI.CUN. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * **
LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** *
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** *** ** * * * * ** *** * *
LYC.ES_C CTACCACATTT
ORI.CUN. CC-CTGTCTCC
* * *
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** * ** ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * ***
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** **** ** * ** *** * * * * ***** ****
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC
RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGGGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** ****
HUM.JA_A C-ATCTCTTTT
RAT.NOR. CCGTCTCT---
* *****
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
* ***** * ** * ******* ** ** ** * * * *** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** *** *** * **** * **
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
HOM.SA_A GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** * **** ** ** * ** * ** **
HUM.LU_D CCATTTCTTTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
** *** **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGT-GGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * * ** ***
LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** * * * *
LYC.ES_N CCACCATTTTT
ORI.CUN. CC-CTGTCTCC
** * * *
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
***** * ** * ******** ***** * ** * * * *** *
HUM.LU_A GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
* * * * ** * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTC--CTAGAGTGGA
FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCAC-CAGGTCGCCTAAGGAGGG
** * * ** *** * ** * ** * ** * * ** *** *** * **
HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG
* ** * *** ** ** ***** * * **** * **** *
HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA
FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTA-GTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGA
**** ** *** *** * * * * * * ** * * ** * * ***
HUM.LU_A CCATTTCTTTT
FUG.RUB. CTCAGTCTTT-
* *****
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
* ***** * ** ******* ** ** ** * * * * * *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * ***
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** *** *** * **** * **
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG
RAT.RAT. GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCGA
**** ** *** *** * **** ** ** ****** * **
HUM.LU_D GACCATTTCTTTT
RAT.RAT. GACCCCGTCTCTT
**** *** **
Mean pairwise ID: 49.21%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCAGG
**** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG
CAN.SPE. AGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
* *** *** ** ** ** * *** ** ** ****** * ** ***
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * ***
ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA
CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** *
ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT
CAN.SPE. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGTGCAAC----AT
* ** * **** ** **** ** * *** *** * * **
ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT
CAN.SPE. AGCGAGACCCCGTCTCT
** * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.21%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** *
ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCAC
***** ** * ** ***** * * *** ** * * *** ** *** *
ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA
HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
***** * * * * * ** ** ** ** * ** * ****
ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG
HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
* ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * *
ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG
HOM.SA_B TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGAGCAACATA-----G
* * **** * *** ** * * ** ** *** * **** *
ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT
HOM.SA_B CGAGACCCCGTCTCT
* * ** * * *
Mean pairwise ID: 49.34%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** ** ******
RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
LEI.MAJ. CG---TGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
** * *** ** * *** * ** **** * **
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG-
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * **
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA
* * ******* **** ************** ** * * * * * ** *
RAT.NOR. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCGTCT
LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** **
RAT.NOR. CT
LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 49.34%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGG-TTGTGATAG
*** * * ***** * * ** ** *** * * ** * **
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
TET.THE. ATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAG
* ** ** * * * * ** * * ** ***** ***** * ***
HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCAC--AGCTCCTAAAGAGG-AGGGCA
TET.THE. TTG--CTATG-GTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAA
*** ** ** * * * * * ** *** * ******* * ** *
HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
TET.THE. ACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATA
* ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * ***********
HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
TET.THE. ACATACTCAT-TAACT---GTCAAACTAATCGGTTC-TACTATCAAAGCCAGACATT---
** * *** * ** * ** * * * * ** * ***** *
HUM.JA_A TTTT
TET.THE. ----
Mean pairwise ID: 49.34%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAAC-TCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAAT-GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT--
* * **** * * * ** * ** ** *** * *** ** *** * *
CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
TET.ROS. -AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG
** * * * **** * * * * * ** * ************ *
CIN.HYB. AGAGTGGGT-TCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
**** * * * ** * ** * * * * * * ** *** * * *
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
* * ** * ******* ***** * * ****** * ** ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
TET.ROS. ATAACATACTC-ATTAACT---GTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-
** *** * * * ** * * *** * * **** * * *****
CIN.HYB. ATTT
TET.ROS. ----
Mean pairwise ID: 49.34%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** ** ******
HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAG--------GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
* ** * *** ** * *** * ** **** * **
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG-
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * **
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA
* * ******* **** ************** ** * * * * * ** *
HOM.SA_A GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCT-GTGCAACATAGCGAGACCCCGTC
LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** **
HOM.SA_A TCTT
LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 49.35%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
LEI.MAJ. -GCC--GGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT-------AACCAGGCTTAGCGGG
*** * * * * ******** ****** * * *** * *
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAG
LEI.MAJ. GAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTG
**** * * *** ** ***** *** * *** * * * ** * *
HUM.JA_A AGTTGGGCTGTGTGATCTGG--GCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
LEI.MAJ. TGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGGGA
** ** ** * * ** *** *** * * * ** * *** * ****
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGGA
LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA
* * ** **** ** ** ******* ***** * *** * ** ** ** * ** *
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATC
LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGC-----ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGC-TTCGTCGCGAAGCCTT-
* ** *** ** * * ** * ** ** ** * * ** *
HUM.JA_A TCTTTT
LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 49.36%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCG-GAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** * * ** *** * ** ***** ** ** **** * * * ** * **
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTC---GATCGGGTGTCCGTACT
TRI.AE_A CGCT---GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCC
**** * * * * * **** * * * * ** * * * * **** *
FUG.RUB. AAGTTCGGTATCGA----TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAA
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCAC--GGTC-CATAA
***** *** * *** *** ** * *** ** **** **** * ***
FUG.RUB. GGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA
TRI.AE_A TGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACG
* ** ** * * *** ** ** ***** ** **** * *
FUG.RUB. GTAGTGGGATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT
TRI.AE_A GTGGAAGGATAATGG--GCCGCTGCACTCC-TAGGCCAAT-TGGGCCTCGCAGCCTACTC
** * **** * * * ** * *** *** ** * * ****
FUG.RUB. CAGTCTTT----
TRI.AE_A CAGCAGACCACC
***
Mean pairwise ID: 49.36%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** ** *
ZEA.MA_A CTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCT----GCACTGAGCTATGTCGATCGGGT-GTCCGCACT
*** * ** ******** ** * * * * *** * * ** *
ZEA.MA_A AAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCT--GCAGACCTGGA
XEN.LAE. AAGTTCG--GTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAG
***** * ** ** ** * ** * * *** * ** ** * * * **
ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG
XEN.LAE. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAG
* ** *** * *** ** ** ****** * ** ** * * *
ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC
XEN.LAE. TAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCT--GAACAACAC--AGC
* * **** * *** ** * * * *** ** **** *** ***
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
XEN.LAE. GAGACACAGTTCT-
* *** * *
Mean pairwise ID: 49.36%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
LEI.MAJ. -GCC--GGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT-------AACCAGGCTT-AGCGG
*** * * * * ******** ****** ** * *** **
HUM.JA_B GGCCCAT-TGGATCGGATCCAGTG-TTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGA
LEI.MAJ. GGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGT
** * **** * * *** ** ***** *** * * *** * * * ** *
HUM.JA_B GAGTTGAGCTGTGTGAGCCGG--ACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG
LEI.MAJ. GTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGGG
* ** * ** * ** * *** * **** ** * ***** ****
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGG
LEI.MAJ. AACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGA
* * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * **
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCA----CCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA
LEI.MAJ. ATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------
** ** *** ** ** * ** *** * *** * * * **
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
LEI.MAJ. --------------
Mean pairwise ID: 49.36%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG--ACAGAGG
* * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** * * ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT----GGGCAACATAGCGAG
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT
** ** **
Mean pairwise ID: 49.37%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCTGG
**** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG
HOM.SA_A AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG
* *** *** * ** ** * **** ** ** ****** * ** ***
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * ***
ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA
HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** *
ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT
HOM.SA_A CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGTGCAAC----AT
* ** * **** ** **** ** * *** *** * * **
ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT-
HOM.SA_A AGCGAGACCCCGTCTCTT
** * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.50%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** ** ******
CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
* ** ** *** * * *** * ** **** * **
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG-
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * **
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA
* * ******* **** ************** ** * * * * * ** *
CAN.SPE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCT-GTGCAACATAGCGAGACCCCGTC
LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** **
CAN.SPE. TCT
LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 49.51%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT
* *** ** ** *** *** * ***** * * * ** * *
ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
** * ** * * * * * * ** * * ***** ***** *
ARA.TH_E GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGG--CTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG
TET.ROS. GTGAGTT-GCTATG-GTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** * ** *** ** * * * ** *** ** *****
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
** * ** * ******* ***** *** ** **** ******* * ***** *
ARA.TH_E GATCACA-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT---
*** *** * * * *** * * * * * ***** ** **** * *
ARA.TH_E CACCATTTT
TET.ROS. ---------
Mean pairwise ID: 49.51%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG-TGATA
** ** *** ** * * ** * **** * *** ** * * * *
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG
* * ** *** * * * * ** * * ***** ***** ** *
LYC.ES_A AGTTGG-ATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
TET.THE. AGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA
***** ** * ** * * * * * * * * ***** * ***
LYC.ES_A C-CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC-CCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT
*** * ******** ***** *** *** ** ***** ** **********
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGA
** * * **** ***** **** * * *** *
LYC.ES_A CCTTT
TET.THE. CATT-
* **
Mean pairwise ID: 49.51%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT
TRY.BR_B ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT
* * *** * * * ******** * *** ** * * ***** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
TRY.BR_B C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG
* * ** ** **** * ** *** ** ***** *
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG
TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGT---CGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGC-CGT--TAAAGTGGGGG
** **** * * * * * ** *** * **** *** ** ***** **
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TRY.BR_B G-AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA
* ** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * **
HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC
TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAG--TG--TCGTCGCGAGGCG
* ** ** ** * ** ** *** * * ** ** ** * * *
HUM.LU_A ATTTCTTTT
TRY.BR_B GTTT-----
***
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G
**** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * *
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC
CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC
* * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** **
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT
CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA
** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** *
LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG
* ** *** * * * * * ***** ** *** **** * ********
LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
CAE.EL_B GCCGGAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTC---AG
* *** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** * *
LYC.ES_H ACAACCACCTTTT
CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT
** ** ****
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
HOM.SA_A CCGTCTCTT--
* * * *
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG
* ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
RAT.RAT. CCCCGTCTCTT
* * * **
Mean pairwise ID: 49.52%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGC
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** ****
ZEA.MA_A TTTGCG-ATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCG--TTCCAAACAGTG
* * * *** * ** * * * * ** ** *** ** * *
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
TET.ROS. AGTTGCTA-----TGGTGGAAAC-CTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCAT-TAAAGAGCT
***** ** ****** * **** * ** * * *** ****
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
TET.ROS. G-AGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGG
* ***** ** * ******** ***** *** ** *** * ** *****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
TET.ROS. AAGGATAACATACTCATTA-ACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
******** * * * *** * * **** ** * ** * * **
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TET.ROS. -----------
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-ACAGGAGGA
**** ** * ** *** ** **** * ** * *** * * * ***
LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA
RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* ** * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG
RAT.NOR. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * **
LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** *
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** *** ** * * * * ** *** * *
LYC.ES_C CTACCACATTT
RAT.NOR. C--CCGTCTCT
* ** * *
Mean pairwise ID: 49.52%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
* ***** * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * * ** ** * ** ** * ** *** *** ** ** * ***
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
** * ** ******* * ** *** *** * **** * **
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAA---CATAGCGA
**** ** *** *** * **** ** ** *** ** * **
HUM.LU_D GACCATTTCTTTT
HOM.SA_B GACCCCGTCTCT-
**** *** *
Mean pairwise ID: 49.52%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** **
HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTAA
* * ******* * ** ** * ***** *** * ** ** ** * **
HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGG
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* ** * ** ******* * ** ** * * * **** * **
HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** * **** *
HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGA
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** * * * **** ** * * ** * ** **
HUM.LU_B CCATTTCCTTT
CAN.SPE. CCCCGTCTCT-
** ** *
Mean pairwise ID: 49.52%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** *
ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC----GATGGGGTGTCCGCAC
**** * * * ******** * ** * ** * * ** ** ** *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG
HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG
HOM.SA_B AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * *
ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA
HOM.SA_B TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAG----CAACATAGCG
* * **** * *** ** * * ** *** * ** * ****
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
HOM.SA_B AGACCCCGTCTCT
* * ** *** *
Mean pairwise ID: 49.52%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** ** **** *** * ** ***** * * * ** * ** ** * *
ZEA.MA_F TTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTC---GATCGGG-TGTCCGCACT
** * * ******** ** ** * ** * * *** ** *** *
ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTT--TAGACCTGAAGC
XEN.LAE. AAGTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGA
***** * * * * * * * ** * ** * ** * * * * ** * *
ZEA.MA_F GGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
XEN.LAE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGT
** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * * **
ZEA.MA_F GGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA
XEN.LAE. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG-CCTGAACAACAC--AGCGAG
* **** * *** ** ** ** * ** * * ** ** * ** * *
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
XEN.LAE. ACACAGTTCT-
*** * *
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GCAGGAGGA
**** ** * ** *** * ** **** * ** * *** * * * * ***
LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA
CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * ****** ** * ** ** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG
CAN.SPE. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * **
LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** *
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** *** ** * * * * * *** * *
LYC.ES_C CTACCACATTT
CAN.SPE. CC-CCGTCTCT
* ** * *
Mean pairwise ID: 49.53%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** ***
LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGT
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTG-----TCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG-
* ** ** * ** *** *** ** ** * * * ** **
LYC.ES_F CCAAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTT---GGCCTTTAG
CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCA--CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA
****** * * ** ** * * * * * ** * ** * ** **
LYC.ES_F AGTGGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCA
CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCA
* * * **** * * * * * **** * ** * **** * *****
LYC.ES_F GTGGAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAA
CAE.EL_B GTGGCCGGACTGCG--CTTGTGA--GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT-ACCT--
**** *** ** ** *** **** * ** * * *** * * ***
LYC.ES_F TTAAACCATCACTTTT-
CAE.EL_B TCAGACCACTTGTTTTT
* * **** ****
Mean pairwise ID: 49.67%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AGATGGGACTTTGGG
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTC---
*** * * * ******** * *** ** * ** ***** *
HUM.JA_A TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCA-TTCCAAGCCGA
TRY.BR_A TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG-
* * * * ** **** * ** **** ** ***** ** * * **
HUM.JA_A GAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCA
TRY.BR_A GTGTTGAGGT-CGCCA-CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-A
* **** * * * * *** **** * ** * * ** ***** ** *** *
HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC
* * ** **** *** ** ******* ****** *** * * ** ** *
HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------
** ** ** ** ** ** ** * * ** ** * *
HUM.JA_A TTTT
TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 49.68%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * * **
CAN.SPE. CGCT--TG-AGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC
**** ** *** * * * **** *** *** **** * * * * * *** *
CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG
***** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** *
CAN.SPE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * **
CAN.SPE. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAG--CGAGA
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCT-CGCAGCCTACTCCAGCA
* **** * *** ** * * * ** * **** *** * ** * *
CAN.SPE. CCCCGTCTCT
TRI.AE_A GACCACC---
** *
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
**** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * **
LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGC-CCTATCCAA
GAL.GAL. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTA-TGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA
* * ** ** ******* *** **** * * ** ** * * *
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * ** *** ** * * ** ** ** ** ***** * **
LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
**** **** *** ** ** ***** ****** *** * ****
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACAT-AGCGAGA
**** ** ** *** * ** * * * ***** * * * *
LYC.ES_O CCACCACTTT
GAL.GAL. CCCTGTCTCC
** **
Mean pairwise ID: 49.68%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * * ** *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * ***
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** **** ** * ** *** * * * * ***** ****
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC
ORI.CUN. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGGGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** ****
HUM.JA_A CATCTCTTTT
ORI.CUN. CCTGTCTCC-
* * ***
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** * * ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC
**** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
HOM.SA_A CCGTCTCTT---
* * * *
Mean pairwise ID: 49.68%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGCGCGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT
*** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ******
ZEA.MA_B GCTTTGCGAT---GGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATG--TCGATCGGG--TGTCCGTAC
*** * * * ******** * ** * ** ** * * ** ** ** * *
ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTG-ACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACA
FUG.RUB. TAAGTT--CGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAG
***** ** ** * ** **** * * *** ** ** * ****
ZEA.MA_B GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACG
FUG.RUB. GAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA
* ** * * *** ** ** ***** * * * *** * *
ZEA.MA_B GTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGC
FUG.RUB. GTAGTGGGATCGC--GCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAG----TAACACAGC
** * **** * *** ** * * ** * ** * * ***
ZEA.MA_B AAACCACCATCTTT
FUG.RUB. GGGACTCAGTCTTT
* * *****
Mean pairwise ID: 49.68%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** * ** ******* ** ** ** * * * ** * *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * ***
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** **** ** * ** *** * * * * ***** ****
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC
RAT.RAT. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGGGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** ****
HUM.JA_A CATCTCTTTT
RAT.RAT. CCCGTCTCTT
* *** **
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ** ** ** **** ** ********* * ** * ** * **
LYC.ES_A TGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG
XEN.LAE. CTTGAGT--CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * **** ** * ****** ** *** ** * * ** ** * ***
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** * * * ** * * ** * * ** **** * **
LYC.ES_A GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
** * **** *** ** ** ****** * ** * **** * * **** *
LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC
**** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * **
LYC.ES_A AACCACCTTT
XEN.LAE. AGTTCT----
*
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACC-CAAGTGGGGATGTTAATGTGGT-GGAAT-G
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
* *** * ** *** *** * **** ***** ** **** *
LYC.ES_N TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** *
LYC.ES_N TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * * ** * ***** * *
LYC.ES_N GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
**** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * ********
LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT-----CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-A
****** * ** * * * * * * * * * * ** ** * ** *
LYC.ES_N CCATTTTT
TET.ROS. CT------
*
Mean pairwise ID: 49.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTA-GAATA
*** * ***** * ****** *** ** * ** ** * * * **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TET.ROS. GTCAGAGTA-----TGA----GAGTTTGATGAGACAGTT-TGCTAAGAGTGTGCCCGTTC
* * ** *** * * *** ** * * * *********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGA-AGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TET.ROS. CAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGG--------GCA
*** * * ** ** ** * * * *** *** * * **
ORY.SA_A CTAAAGTGGC-AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
TET.ROS. TTAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTA
***** * *** ** ** * ******** ***** *** ** *** ******
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
TET.ROS. TTGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATC--GGTTCTG---CTATT
*************** ** * ** * * * ** * * * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
TET.ROS. CTGATCAGAC-ACT------
* ***** **
Mean pairwise ID: 49.83%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** ** ******
ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
* ** * *** ** * *** * ** **** * **
ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG-
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * **
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA
* * ******* **** ************** ** * * * * * ** *
ORI.CUN. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCTGTC
LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** ** *
ORI.CUN. TCC
LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 49.84%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_L ------------------------------------------------------------
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
LYC.ES_L GTTGG-GTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCT----GGCCTGCCCTCT
**** ** ** * *** **** * * ** ** *** *** ***** *
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
LYC.ES_L CCAAGC-ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGG----GTTGCTTGATTC
***** * *** ** * ***** * **** * * * * * * ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
LYC.ES_L CTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTG
********* * ** ************ *********** *** ** *****
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGA-GTCCCTC
LYC.ES_L TGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGC
* ************* ** *** * * * ** ** **** ** * * *
ORY.SA_A TACAAC-AGACCACCATCTTT
LYC.ES_L TCCAACTAAACCACCACTTT-
* **** * ******* **
Mean pairwise ID: 49.84%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAA------GCTACTGGGAGGCTGAGGCTGG
**** * *** *** ** *** * ** * ** * ** ** ** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGG--TCTGCGCCT--GTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGT
FUG.RUB. CGGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGT-GTCCGT
* * *** *** *** ** **** ** * * ** * *** * ****
ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG
FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAA
* ***** *** ** * *** ** ****** ** * ** * * * ****
ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG
FUG.RUB. GGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA
* ** * * * *** ** ** ***** * * **** * *
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGG
FUG.RUB. GTAGTGGGATCGCGCCCGTGAATAGAC---GCTGTAGTTCAACCTGAGTAA----CACAG
** * **** ** * ** * ** * * ** *** ** *
ORY.SA_B CAGACCACCACCTTT
FUG.RUB. CGGGACTCAGTCTTT
* * * * ****
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
**** ** * ** ***** ** ***** ** * * * ** * ** * *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG---TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT
* **** ** * ** ** ** * * ** * * ** ** * ***
LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT--CCTAAAGTGGGG
XEN.LAE. CGGTATCAA-TATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* * * * *** ** * * ** ** ** * ** * **** * ****
LYC.ES_C TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG
** ** * *** ** ** ***** * * * **** * * **** * *
LYC.ES_C GATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACT
XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGA-ATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT
*** ** *** *** *** * * * * * **** * * ** * * *
LYC.ES_C ACCACATTT
XEN.LAE. TCT------
*
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAA----TGGGGGCATTAATGTGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
**** * ** * * ** ***** **** **** * * * *** ***
LYC.ES_G GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * * ** ******* * ** *** * * * ** ** * **
LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** *** *** * * ** ** ** * ***** * **
LYC.ES_G GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
**** *** *** ** ** **** *** * *** * **** *
LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
FUG.RUB. GGGATCGCG--CCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGA
**** ** ** *** * ** * ** * * ** * * * * *
LYC.ES_G CCACCACTTTT
FUG.RUB. CTCAGTCTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 49.84%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA---TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * ** *** * ** *** * *** * *** ****** * *
TRI.AE_B GCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATG-TAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
FUG.RUB. GCTTGA---GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA
***** * * * * ******** * * * * * * * ** **** * *
TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGTG
FUG.RUB. AGTTCGGTATCGATATGGTG-CTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
**** * * * **** ** * * *** * * **** *** * * *
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGG
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
* ** ** *** ** ** ***** * * * *** * * ** *
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
FUG.RUB. TGGGATCGC-GCCCGT----GAATAGAC--GCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGG
**** * * *** * ** * * *** * * * * ** *** *
TRI.AE_B CCACCATCTTT
FUG.RUB. ACTCAGTCTTT
* * *****
Mean pairwise ID: 49.84%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCA--TGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACAC
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGA---
* ** ** ** * ** ** ***** *** * *** ** * ** * *
ARA.TH_E TGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA
XEN.LAE. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * * * ***** * * * * *** * ** **** * ** ** ** * **
ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTA-AAGTTGG
XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * * * **** * * * ** ** ** *** ** * ** *** **
ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * **** * **** *
ARA.TH_E CGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA-TGA
XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTG-------AACAACACAGCGA
***** * * * * ** * ** * ***** * ** * **
ARA.TH_E ACCACCATTTT
XEN.LAE. GACACAGTTCT
*** ** *
Mean pairwise ID: 49.84%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA
* ** ******** ****
ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * *** * *** *** ** ** *** * * * * ***
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG
***** * **************************** *** *** *************
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
TRI.AE_C GAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GA
* ********************* * ** ** * * * * ***** *** **
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
TRI.AE_C CCACCATC---
********
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** **** * * ** ***** * * *
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** *** ***** * *** **** ** ** ** * ***
LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * ***
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGACC
**** ** * * *** * * ** * ****** * * ***
LYC.ES_I ACCATTTTT
HOM.SA_B -CCGTCTCT
** * * *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACC-CGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT
TET.ROS. GCCAGG----GTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAG-------TT
*** * *** * ** *** *** ** **** ******** * **
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAG
TET.ROS. AGAATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA
* ** * * * **** * * * * * ** * ***** *****
LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG-GA
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
** ****** * ** ** *** ** * *** ** * **
LYC.ES_F TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
* ** ** * ******* ***** ** ** * * ***** ** *******
LYC.ES_F GATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACC
TET.ROS. GATAAC------ATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACA
*** ** * *** ** * * ** ** * * * ** ** * **
LYC.ES_F ATCACTTTT
TET.ROS. CT-------
*
Mean pairwise ID: 49.84%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** * *** *** * *** * *
ZEA.MA_F TGTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTT
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGC-TATGCC---GATCGGG-TGTCCGCA
* ** * * * ******** * * * **** * *** ** ***
ZEA.MA_F CCAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAA
CAN.SPE. CTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
* ***** * * * *** * * ** ** *** * * *** *
ZEA.MA_F GCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACG
CAN.SPE. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * *
ZEA.MA_F GTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACA
CAN.SPE. GTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGTGCAACAT--AGCG
** * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * *
ZEA.MA_F GACCACCATCTTT
CAN.SPE. AGACCCCGTCTCT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 49.84%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
***** * * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTAA
* * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** ** ** * **
HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTG
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAG
* ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * *
HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
* * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG
CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGA
**** ** *** *** **** ** ** * ** * **
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
CAN.SPE. GACCCCGTCTCT-
**** *** *
Mean pairwise ID: 49.84%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTG-TGGATGT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGCTGGAGGA
*** ** * ** *** * ** **** * *** * * * ** * **** *
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTA
* ** * * ******* ** ** * * * *** ** *** * *
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAGCG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
**** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * *
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
* * * * *** ** ** ****** * * * **** * * **
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC
HOM.SA_A GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGTGCAACAT--AGCGAGA
* **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * *
ZEA.MA_F CACCATCTTT-
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
* ** ** ** * * ** **** **** * * ** ***** * * *
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** *** ***** * *** **** ** ** ** * ***
LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * ***
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** *
LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGACC
**** ** * * *** * * ** * ****** * ** * ***
LYC.ES_B ACCACTTTT
HOM.SA_B CCGTCTCT-
* ** *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG
* ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * *
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
RAT.NOR. C--CCGTCTCT
* ** ** *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GCTGGAGGA
**** ** * ** *** * ** **** * ** * *** * * * * ****
LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA
HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG
HOM.SA_A GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * **
LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** *
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA
**** ** *** *** *** ** * * * * * *** * *
LYC.ES_C CTACCACATTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
* * * **
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATAT
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
* ** *** ** * * *** * * * **** * *** ** *** *****
LYC.ES_J TGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
TET.ROS. TCAG----AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG
* * * * ** * * * * * ** * * ***** ***** **
LYC.ES_J AGAGTTGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
****** ** * ** * * * * * * * ***** * * *
LYC.ES_J GA-CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
** **** * ******** ***** *** *** * * ***** ** ********
LYC.ES_J ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACAC
**** * * ***** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_J CACCTTT
TET.ROS. T------
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAG------GTTG
** *** ** * * ** * **** * *** ** * ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** *
LYC.ES_H TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * *
LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
TET.THE. G--AAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA
* ** ** * ******* ***** *** *** * * ***** ** ******
LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA
TET.THE. GGATAACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGC
****** * * **** ***** **** * * ***
LYC.ES_H ACCACCTTTT
TET.THE. CAGACATT--
** **
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
**** * * ** * ****** * ** * * ** * ** * * *
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC--TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCAAG
** ** ** * * * * *** ** * ** * * * ** * *****
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG
CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
* * ** * * ** ** * ********* * * * ** * ** * * *
HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
*** ** *** * * ***** * * * **** * ******* *
HUM.LU_D GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCAT-GCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
CAE.BRI. GATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGA---TACCTTCA----GA
**** ** * *** * * ** *** ** ** *** ** * * **
HUM.LU_D CCATTTCTTTT-
CAE.BRI. CCACTTGTCATT
*** ** * *
Mean pairwise ID: 50.00%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * * **
ORI.CUN. CGCT--TG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC
**** ** ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** *
ORI.CUN. AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG
***** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** *
ORI.CUN. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * **
ORI.CUN. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTA-CTCCAGC
* **** * *** ** * * * ** * **** * ** * ** * * *
ORI.CUN. CTGTCTCC
TRI.AE_A AGACCACC
* **
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
**** ** ** * ** **** **** * * ** * * * * *
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** * *** ***** * *** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ***
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
*** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
RAT.NOR. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGACC
**** ** ** *** * * * * ** * *** ***** * * *
LYC.ES_G CACCACTTTT
RAT.NOR. CGTCTCT---
* * **
Mean pairwise ID: 50.00%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA
* ** ******** ****
ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * *** * *** *** ** ** *** * * * * ***
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG
***** * **************************** *** *****************
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
TRI.AE_C GAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GA
* ******** ************ * ** ** * * * * ***** *** **
ZEA.MA_D CCACCATCTT
TRI.AE_C CCACCATC--
********
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
* ***** * ** * ******* ** ** ** * * * ** *
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTAA
* * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** ** ** * **
HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGG
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* ** * ** ******* * ** *** *** * **** * **
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG
**** ** *** *** * **** ** ** * ** * ** *
HUM.LU_D ACCATTTCTTTT
CAN.SPE. ACCCCGTCTCT-
*** *** *
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * * ** *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ****** * ** ** * ** *** * * * ** ** * ***
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** **** ** * ** *** * * * * ***** ****
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC
CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** ****
HUM.JA_A CATCTCTTTT
CAN.SPE. CCCGTCTCT-
* *** *
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
** * ** * ******** ***** * ** * * * *** *
HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
** ** ** * ** * * * ** * * * ** ** ** * * ***
HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT-CCTAAAGCGGAG
FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* * ** ** *** ** * * ** * ** * * ***** * ** *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
** * *** ** ** ***** ** * **** * **** * *
HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATAGG
FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTGAA---TAGAC--GCTGTAGTTCAACCTGAG-TAACAC--AGCGGG
*** ** *** *** * *** * * ***** ***** * ** * * **
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
FUG.RUB. ACTCAGTCTTT-
** *****
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG
* * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
** * **** * * ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGA
**** * * * *** * * * * * ** * *** **** * * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
RAT.NOR. C--CCGTCTCT-
* ** ** *
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGT-----GAGGGCATCAGTGTGGTGGAA
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
**** ** * ** *** ** **** * ** * * * * ** * ***
LYC.ES_C TGTTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
GAL.GAL. CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC--GTCCGCG
* * * ****** ** * ** ** * * * * * * * **** *
LYC.ES_C CAAAGAGTTGGGTC----TTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAG
GAL.GAL. CTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGG
* *** * ** * *** *** * * ** * ** * ** * ***** *
LYC.ES_C TGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGT
GAL.GAL. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT
****** ** * *** ** ** ***** * * ****** * * ****
LYC.ES_C GGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTT
GAL.GAL. AACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTA-GCCTGGGCAACA----TAGCG
**** ** *** *** * * ** ** * * *** * ***
LYC.ES_C AAACTACCACATTT
GAL.GAL. AGACC-CTGTCTCC
* ** * *
Mean pairwise ID: 50.16%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGTGGTGGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
* * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * **** * **
LYC.ES_N -GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
HOM.SA_B CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
* * * * * ** ****** * *** **** ** ** ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ****** * * *
LYC.ES_N CCACCATTTTT
HOM.SA_B CC-CCGTCTCT
** ** * * *
Mean pairwise ID: 50.16%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATG-TGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
* * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * * *** ***
LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * *
LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** *
LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGA
**** ** * * *** * * ** * ***** ** * * *
LYC.ES_N CCACCATTTTT
HOM.SA_A CCCCGTCTCTT
** * * **
Mean pairwise ID: 50.16%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** **
ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATGCCGATGG--GG--TGTCCGCA
**** ** ** ******** * * ** * ** * *** ** ** **
ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG
HOM.SA_B CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA
* ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * ***
ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG
HOM.SA_B GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * ** * * *
ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG
HOM.SA_B GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCA----ACATAG
** * **** * *** ** * * * *** ** ** * ** **
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
HOM.SA_B CGAGACCCCGTCTCT
* * * ** *** *
Mean pairwise ID: 50.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTT-GGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA
*** * ** * ** *** *** ** * * * * ********* ****
ZEA.MA_D GT-TGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAG-CTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGT-GGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTG
* *** *** * ** ***** ** *** * * *** ** * *** *****
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_L GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCT-TCCGCTCTGTGCAGTG
* * * ************ *********** *** ** ***** * ***
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA---GCCTCACTAAGC
LYC.ES_L GAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACT
* ******** ** * *** * **** *** * * **** ** ** * * **
ZEA.MA_D AGACCACCATCTT
LYC.ES_L AAACCACCACTTT
* ******* **
Mean pairwise ID: 50.16%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGG----GCATGTGGGAGATGGGACT--T
LEP.COL. -GCC--GGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
*** * * * * * ******** * *** * * * * * ** **
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCA-TTCCAAG
LEP.COL. TGGACCAGC--ATAGGGT-GCTTGCGGCGTTGACG---TGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG
*** **** ** ** * * * * * *** * ** ** ***** * *
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG
LEP.COL. TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG--GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG
** * *** ** * ***** ** * * * * ***** ***
HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAA
LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA
* * ** ** **** ** ** ******* ******* *** * ** ** ** * *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC
LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCT-----GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTG-TGAAGCT
* * ** *** ** * ** ** * * ** ** ** * * * *
HUM.JA_A ATCTCTTTT
LEP.COL. TT-------
*
Mean pairwise ID: 50.16%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGTGGGAG--
**** ** *** *** ** *** ** *** * * * ** ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC----GGCCCGCCCG
HOM.SA_B --GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATGGGGTGTCCG
* *** *** ** ** ** * **** ** ** ****** ** * ***
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT
HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * ***
ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA
HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** *
ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT
HOM.SA_B CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGAGCAAC----AT
* ** * **** ** **** ** * *** *** ** * **
ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT
HOM.SA_B AGCGAGACCCCGTCTCT
** * ** ** *
Mean pairwise ID: 50.16%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** * * *
ZEA.MA_B CTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATG--TCGATCGGG--TGTCCGCACTA
*** * * * ******** * * ** ** * * ** ** ** * *
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTG-ACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCT--GCAGACCTACAG
XEN.LAE. AGTT--CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGG
**** ** ** * ** * ** * * *** * ** ** * * * *** *
ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG
XEN.LAE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATCAG
** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * *
ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA
XEN.LAE. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AGCG
* * **** * *** ** * * ** **** ** ** * * * ***
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
XEN.LAE. AGACACAGTTCT-
* *** * *
Mean pairwise ID: 50.16%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTATCAAAGTGGTTGAAC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTG--TGGAT
****** * ** ** * ** * * *** * ** **** ***** ** *
CIN.HYB. TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGT-CTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAA
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* * ** ** ***** *** * ** ** * * **** ****
CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCG-GGTGATGTGAGCTTTAGAATCG
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGA--G
* * ** * ** *** * ******* * *** * * ** * ** * *
CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG
CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG
** *** ** *** * * *** * **** * * * * ****
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA
CAE.BRI. CCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTCG-CTCGCCCA--CAGCCTCTCTGATACCTTCAGAC
**** * ** * * ** * * *** * ****** ** ** ***
CIN.HYB. CACCCATTT--
CAE.BRI. CACTTGTCATT
*** *
Mean pairwise ID: 50.16%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT
TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAAT-GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT
* *** **** ** *** *** * ***** * ** * ** ** *
ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
** * * * * * * ** * ** * ***** ***** *
ARA.TH_F GTGAGTAATTAGTGTTGAG---TTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTG--A
****** ** ** ** * * * * *** * * ** **** *
ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
** * ** * ******** ***** *** ** **** ******* * ***** *
ARA.TH_F GATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT---
*** ** * * * *** * * * * * ***** ** **** * *
ARA.TH_F CACCATTTT
TET.ROS. ---------
Mean pairwise ID: 50.16%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATAT
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** ** *** ** * * *** * * * **** * *** ** *** *****
LYC.ES_A TGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
TET.ROS. TCAG----AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG
* * * * ** * * * * * ** * * ***** ***** **
LYC.ES_A AGAGTTGG-ATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG
****** ** * ** * * * * * * * ***** * * *
LYC.ES_A GA-CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC-CCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG
** **** * ******** ***** *** *** ** ***** ** ********
LYC.ES_A ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACAC
**** * * ***** * * * * * ** ** * **
LYC.ES_A CACCTTT
TET.ROS. T------
Mean pairwise ID: 50.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT
* *
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
* * * * * ** *** ** * ** * ****** **** ******
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAG--CTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGG--CTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* **** * * *** **** ****** ****** * * * * *** ****
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* ** ************ *********** *** * ***** * *******
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG--GGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGAC
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC
***** *** * *** * * ** *** ** * *** * ** ***** * * **
TRI.AE_A CACC-----
LYC.ES_L CACCACTTT
****
Mean pairwise ID: 50.31%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG-ACAGAGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * ***
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
RAT.RAT. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--
* ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT--
RAT.RAT. AGCGAGACCCCGTCTCTT
*** * ** ***
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT-CGGATC
*** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** *****
ZEA.MA_G CTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTC
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGCA
*** * ** ******** ******* * *** ** ***
ZEA.MA_G CCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCA--GACCTGA
XEN.LAE. CTAAGTTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA
* ***** * * * ** * * * *** ** * ** * * ** *
ZEA.MA_G AGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACG
XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCA
* ** *** * *** ** ** ****** * **** * * *
ZEA.MA_G GTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC
XEN.LAE. GTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AGC
** * **** ** *** ** * * * ** *** ** ** * *** ***
ZEA.MA_G AGACCACCATCTTT
XEN.LAE. GAGACACAGTTCT-
*** * *
Mean pairwise ID: 50.32%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACC-CATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGT
** * *** ** *** *** * ***** * * * ** * ** *
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
TET.ROS. CAG---AGTATGAGAGTTTGA---TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
* ** ** * ** ** ** * * ************
TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGG----CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC-
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCA----GGGCATTAAAGAGCT
* *** * ***** ** * * **** ** *** **** **
TRI.AE_B -AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCGCTTCCAACGGTGGA
TET.ROS. GAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGA
*** *** * * ******* ***** *** ** **** ******* ******
TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC
TET.ROS. AGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATC-GGTTCTGCTATTCTG--ATCAGACAC
********* * * * * * ** ** ** *** * * ** * **
TRI.AE_B CACCATCTTT
TET.ROS. T---------
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
TET.THE. GCCAGGGT-AGCAAT----ACCTGTG-TCTATATGTGG---CATAAACAATGTAGGTTGT
*** * * ***** ***** * * ** ** * **** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACA
* * * * * * * * * ** * ** ** ***** ***** *
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG
TET.THE. ATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCA-GGGCATTAAAGAGCTAAG
****** ** ** **** * *** ** * * * **** **
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
TET.THE. GA-AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
* ** ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * *******
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
TET.THE. GATAACATACTCAT--TAACTG------TCAAACT--AATCGGTT--CTACTATCAAAGC
****** * * ** *** ** ** * * ** * ** ** * *
HUM.LU_A CATTTCTTTT
TET.THE. CAGACATT--
** **
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTC-GTGTGG---CATAAACAATGTA--GTTAGAA
*** * * * ****** *** *** ** * **** * ** *
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGT--TAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGG
TET.ROS. TAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGT
** * * ** ** ** * ** ** ***** ****** * *
HUM.LU_B GAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
TET.ROS. GAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAA-AGAGCTGAGGA
****** ** * **** * *** ** * * **** ****
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
TET.ROS. -ACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA
* ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * *********
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGAC-TCTTAATCGGACCA
TET.ROS. TAAC------ATACTCATTAA-CTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACAC
**** * ** ** * ** * * * *** *** * * *** ***
HUM.LU_B TTTCCTTT
TET.ROS. T-------
*
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * * *** *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * ***
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** **** ** * ** *** * * * * ***** ****
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC
HOM.SA_A GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** ****
HUM.JA_A CATCTCTTTT
HOM.SA_A CCCGTCTCTT
* *** **
Mean pairwise ID: 50.32%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG--GAATAT
* ** **** ********** * **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_M TGGGCTGTC----CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTGTCC
** ** * * * *** ** ** *** * * * * **** **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_M AAGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT
*** * ** * * *** *** * ** ** **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_M GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
** * * * ** ********* ************ ** * * ****** * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_M GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
********* *** ** ** * *** ** * * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_M ACAACCACCTTT
** *********
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** * ** * ******* ** ** ** * * * * ** *
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* * ****** * ** ** * ** *** * *** ** ** * ***
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** **** ** * ** *** * * * * ***** ****
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
* * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** *
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC
**** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** ****
HUM.JA_A CATCTCTTTT
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
* *** *
Mean pairwise ID: 50.32%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** **
LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
** * **** * * ****** * *** **** ** ** ** * *
LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *
LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAG
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * *
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT-
** ** *
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGACAGGAGGA
*** ** * ** *** ** **** * *** * * * ** * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGG---CCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTC
RAT.NOR. TC--GATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCAC
** ** ** ** ** ******* ** ** * * * *** ** *** *
ZEA.MA_F CAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAG
RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
***** * * * *** * * ** ** *** * * *** * *
ZEA.MA_F CGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG
RAT.NOR. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG
** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * *
ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG
RAT.NOR. TAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGGGCAACAT-AGCGAG
* * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * **
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
RAT.NOR. AC--CCGTCTCT
** ** *** *
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA
* ** ******** ****
ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * *** * *** *** ** ** *** * * * * ***
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
***** * **************************** *********************
ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
TRI.AE_C AAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GAC
********************* * ** ** * * * * ***** *** ***
ZEA.MA_G CACCATCTTT
TRI.AE_C CACCATC---
*******
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTT-GGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA
*** * ** * ** *** *** ** * * * * ********* ****
ZEA.MA_E GT-TGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAG-CTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGT-GGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTG
* *** *** * ** ***** ** *** * * *** ** * *** *****
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_L GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCG-CTCTGTGCAGTG
* * * ************ *********** *** ** *** ** * ***
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA---GCCTCACTAAGC
LYC.ES_L GAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACT
* *********** * *** * **** *** * * **** ** ** * * **
ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT
LYC.ES_L AAACCACCACTTT-
* ******* **
Mean pairwise ID: 50.32%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
LYC.ES_L ---------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTT
*** * * **** **
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT-T
LYC.ES_L G----GGTTCGGTAG-----GCTTATAGT---------CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
* **** * * * **** * * *********** ****** *
TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG--CCTTAAGTGGCAGG
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG
** *** ****** * ****** * ** * *** ****** *
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
** *** ******************* *** ** ** ***** * *********
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGC-AGACCA
LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA
**** ** * *** * * ** * *** * * ** * * * ****
TRI.AE_B CCATCTTT
LYC.ES_L CCACTTT-
*** **
Mean pairwise ID: 50.36%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGA--G
SCH.POM. ---CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGG
*********** ** **** **** * * * ** * ** ***** *
YAR.LI_A TCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGC-G
SCH.POM. TCTCGGGTTCGAGTCTCG--CTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAG
*** *** ** ** * * ** * * * ** * * * * ** * * *
YAR.LI_A TCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGT
SCH.POM. TCTTCGT---GGCAACTGGCAGTTAAA---CCGTG-TAGTACCGA-TGGAGGTTGGAAAC
*** ** * ** *** * * * **** ** * * *** *
YAR.LI_A GGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGG
SCH.POM. AATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCG-ATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCAG
*** ** * * * ** *** * ** *** ****** ** * * *
YAR.LI_A TATATGTTATGGAAG-ATATTTACGATCACGATT
SCH.POM. GATGTGC-ATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT
** ** ******* *** ** * **
Mean pairwise ID: 50.47%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRI.AE_C --------------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTC
* *** *********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGA-GGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TRI.AE_C CAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT------TGGGCCTCACGGTCC
******* ******* *** ***** * ***** * * ** ** * * **
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TRI.AE_C ATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCC
*** *********** **************************** *************
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
TRI.AE_C AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG-GGCCTCGTAGCCTACT
* *************** *** ******* * ****** **** * ** **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_C CCAGC-GACCACCATC---
** * **********
Mean pairwise ID: 50.47%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG-ACAGAGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * ***
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
RAT.RAT. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--A
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** *
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT-
RAT.RAT. GCGAGACCCCGTCTCTT
** * ** *** *
Mean pairwise ID: 50.48%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTT-GGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA
*** * ** * ** *** *** ** * * * * ********* ****
ZEA.MA_G GT-TGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAG-CTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGT-GGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTG
* *** *** * ** ***** ** *** * * *** ** * *** *****
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_L GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * ************ *********** *** ** ***** * ****
ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA---GCCTCACTAAGCA
LYC.ES_L AAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA
*********** * *** * **** *** * * **** ** ** * * ** *
ZEA.MA_G GACCACCATCTTT
LYC.ES_L AACCACCACTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 50.48%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT-CGGATC
*** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** *****
ZEA.MA_E CTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTC
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGCA
*** * ** ******** ******* * *** ** ***
ZEA.MA_E CCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCA--GACCTGA
XEN.LAE. CTAAGTTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA
* ***** * * * ** * * * *** ** * ** * * ** *
ZEA.MA_E AGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAAC
XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATC
* ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * * *
ZEA.MA_E GGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG
XEN.LAE. AGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AG
** * **** ** *** ** * * * ** *** ** ** * *** **
ZEA.MA_E CAGACCACCATCTTT
XEN.LAE. CGAGACACAGTTCT-
* *** * *
Mean pairwise ID: 50.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_L ----------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGT
** * ** **** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
LYC.ES_L TGGGTTCG---------GTAGGCTTATAGT---------CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA
*** ** * ** * ** ** ********** ******
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
* *** * * **** * ** * * ****** * * * **** *****
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* ** *********** *********** *** ** * *** * * ********
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC-AGACC
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
***** ** ** *** * * * **** *** ** * ** * * * ***
ZEA.MA_C ACCATTTTT
LYC.ES_L ACCACTTT-
**** ***
Mean pairwise ID: 50.50%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGT--GTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTC
*** * * ****** *** * ***** * * * ***
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
TET.ROS. AGAGTATGAGA--GTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAG
** ** ** * * * * ** * * ** ***** ****** * * ***
HUM.JA_A TTGGGCTG-TGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT
TET.ROS. TTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAG--GACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAAC
*** ** ** * * * * * * ** * * ******* * * **
HUM.JA_A -GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
TET.ROS. CGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAA
** * ******* ***** *** ** ** * ***** * ************
HUM.JA_A CGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCT
TET.ROS. CATACTCAT-TAACT---GTCAAGCTAATCGGTTC-TGCTATTCTGATCAGACACT----
* * *** * ** * ** * * *** * * ******* *
HUM.JA_A TTT
TET.ROS. ---
Mean pairwise ID: 50.63%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG-ACAGAGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * ***
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
RAT.RAT. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT-
RAT.RAT. AGCGAGACCCCGTCTCTT
*** * ** *** *
Mean pairwise ID: 50.63%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGCGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT
*** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ******
ZEA.MA_D TCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGT
*** * * ** ******** ** ****** * *** ** ****
ZEA.MA_D CCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTG
FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATA--TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTA
* ***** * * * * * *** * ** *** ** * * ***
ZEA.MA_D AAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAA
FUG.RUB. AGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCT
* * ** * * *** ** ** ***** * * * **** *
ZEA.MA_D CGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
FUG.RUB. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAA--CCTGAGTAACAC--A
* ** * **** * *** ** * * *** ** *** *** *
ZEA.MA_D GCAGACCACCATCTT-
FUG.RUB. GCGGGACTCAGTCTTT
** * * * ****
Mean pairwise ID: 50.63%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
ORI.CUN. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--A
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** *
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT
ORI.CUN. GCGAGACCCTGTCTCC
** * * ***
Mean pairwise ID: 50.63%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGC-TTAGCGGG
**** * ** *** *** *** ******* * * * ** * *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRY.BR_A GACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT----CTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG-----
*** * * **** * **** * * *** * * * ** *
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACC--TAGA
TRY.BR_A -GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGA----GGCGTTCTCGCGCCGTTAAA
******* ** *** ** **** * ** **** * ** ** ** *
ORY.SA_B GTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-TTCCAACG
TRY.BR_A GTGG-GGGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTT
**** *** * * ** **** *** ** ******* ** * * ****
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTC-CATG
TRY.BR_A CGAGAAGCACACCGAGGA---GCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAG
**** * * ** * *** * * ** * ** ** ******** * ** * *
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT
TRY.BR_A GCGG------------
** *
Mean pairwise ID: 50.64%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT-CGGATC
*** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** *****
ZEA.MA_D CTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTC
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGCA
*** * ** ******** ******* * *** ** ***
ZEA.MA_D CCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCA--GACCTGA
XEN.LAE. CTAAGTTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA
* ***** * * * ** * * * *** ** * ** * * ** *
ZEA.MA_D AGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAAC
XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATC
* ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * * *
ZEA.MA_D GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG
XEN.LAE. AGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AG
** * **** * *** ** * * * ** *** ** ** * *** **
ZEA.MA_D CAGACCACCATCTT
XEN.LAE. CGAGACACAGTTCT
* *** * *
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** **** * * ** ** * * * *
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** *** ***** *** **** * * ** ** * ***
LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ***
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
*** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
CAN.SPE. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGAC
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * * * **
LYC.ES_G CACCACTTTT
CAN.SPE. CCCGTCTCT-
* * ** *
Mean pairwise ID: 50.65%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA
*** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * *** **
HOM.SA_B CGCT--TG-AGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT
TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC
**** ** *** * * * **** *** *** **** * * *** * *** *
HOM.SA_B AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG
TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG
***** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** *
HOM.SA_B AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT
TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT
** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * **
HOM.SA_B AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAG--CGAGA
TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTC-GCAGCCTACTCCAGCA
* **** * *** ** * * * ** * **** *** * ** * *
HOM.SA_B CCCCGTCTCT
TRI.AE_A GACCACC---
** *
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
***** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** *
LYC.ES_H GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** *
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC
* *** * * * * * * ** * * ******** *
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT
* ************* **** ******* ** * * ***** ** **********
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT--------------------------------
**** **** * * *** * * ** *
LYC.ES_H CCTTTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
**************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_D GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
**** ** *** * ** * * * **** *** * * **** ** ** *** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_D CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_D ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACC
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ** ******* *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_D ACTTTT
******
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAG-TGTGGTGGAATG-T
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
**** ** * ** *** * ** **** * ** * * ** ***** * * *
LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGT---GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* ****** ** * ** *** * * * * *** ** ** * ***
LYC.ES_C CAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * ***
LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
*** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** *
LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC
**** ** *** *** *** ** * * * * * *** * **
LYC.ES_C TACCACATTT
HOM.SA_B C-CCGTCTCT
** * *
Mean pairwise ID: 50.79%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
ORI.CUN. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT
ORI.CUN. AGCGAGACCCTGTCTCC
*** * * ***
Mean pairwise ID: 50.79%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
ORI.CUN. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--
* ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT-
ORI.CUN. AGCGAGACCCTGTCTCC
*** * * ***
Mean pairwise ID: 50.79%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCA-------GCTTCTTGACGGTAGACAAGTG
*** * ** *** * ** *** * *** ** ** *** ** **
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTG----GCCTGCCC--TGTCCAA
CAE.BRI. TGGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGT
*** ***** *** * **** ** ** * * * ** ****
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGG----CCAAGCG-AAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAA
CAE.BRI. GCCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAG
** *** * ** *** *** ** ** ****** * * * * **** * ***
LYC.ES_C GTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAG
CAE.BRI. GAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG
* * **** ** ** *** * * **** ** *** **** * ******
LYC.ES_C TGGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT
CAE.BRI. TGGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGA
*** ***** ** * ** * * ** * * * ** * * **
LYC.ES_C TAAACTACCACATTT
CAE.BRI. CCACTTGTCATT---
* * **
Mean pairwise ID: 50.80%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGCGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT
*** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ******
ZEA.MA_G TCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGT
*** * * ** ******** ** ****** * *** ** ****
ZEA.MA_G CCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAA
FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATA--TGGTGCTCCTGGGGGAGCCC-GGGATCACCAGGTC-GCC
* ***** * * * * * *** * ** *** ** ** **** * *
ZEA.MA_G GTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGG
FUG.RUB. TAAGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTC
* *** ** * * * ** * * * *** **** * * * *
ZEA.MA_G TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA
FUG.RUB. AGTAGTGGGATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAA--CCTGAGTAACAC--AGCG
* * * ** *** ** * * *** ** *** *** ***
ZEA.MA_G GACCACCATCTTT
FUG.RUB. GGACTCAGTCTTT
* * * *****
Mean pairwise ID: 50.80%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG
* * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** **
LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ****** * *** *** * *** ** ** * *
LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAG
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * *
LYC.ES_K CAACCACCTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT
** ** *
Mean pairwise ID: 50.83%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA
LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA
** * ** * ***** * * * ** ***** ** *******
HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG
* ** ** *** ** * *** * ** * **** * **
HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG-
LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC
* * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * **
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA
* * ******* **** ************** ** * * * * * ** *
HOM.SA_B GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGA-GCAACATAGCGAGACCCCGTC
LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---
* *** * ** * * * * ***** **** * ** * * **** **
HOM.SA_B TCT
LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 50.94%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
HOM.SA_A TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--
* ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT--
HOM.SA_A AGCGAGACCCCGTCTCTT
*** * ** ***
Mean pairwise ID: 50.95%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGCGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT
*** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ******
ZEA.MA_E TCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGT
*** * * ** ******** ** ****** * *** ** ****
ZEA.MA_E CCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTG
FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATA--TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTA
* ***** * * * * * *** * ** *** ** * * ***
ZEA.MA_E AAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAA
FUG.RUB. AGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCT
* * ** * * *** ** ** ***** * * * ** * *
ZEA.MA_E CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
FUG.RUB. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAA--CCTGAGTAACAC--A
* ** * **** ** *** ** * * *** ** *** *** *
ZEA.MA_E GCAGACCACCATCTTT
FUG.RUB. GCGGGACTCAGTCTTT
** * * * *****
Mean pairwise ID: 50.95%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGC-TTAGCGGG
**** * ** *** *** *** ******* * * * ** * *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRY.BR_B GACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT----CTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG-----
*** * * **** * **** * * *** * * * ** *
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACC--TAGA
TRY.BR_B -GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGA----GGCGTTCTCGCGCCGTTAAA
******* ** *** ** **** * ** **** * ** ** ** *
ORY.SA_B GTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-TTCCAACG
TRY.BR_B GTGG-GGGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTT
**** *** * * ** **** *** ** ******* ** * * ****
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTC-CATG
TRY.BR_B GCAGAAGCACACCGAGGA---GCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAG
* **** * * ** * *** * * ** * ** ** ******** * ** * *
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT
TRY.BR_B GCGGTTT---------
** *
Mean pairwise ID: 50.95%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG-GAGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * ***
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
RAT.NOR. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
RAT.NOR. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
RAT.NOR. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACA-TA
* ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** ** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT
RAT.NOR. GCGAGACCCGTCTCT-
***** ***
Mean pairwise ID: 50.96%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGGTGGTGGAATA
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
* ** ** ** **** ** ***** *** * ** ** * ** ***
LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * **** ** ******* ** **** * * * ** ** * ***
LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT--CCTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * * ** *** *** * * ** ** ** ** **** * **
LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
**** *** * *** ** ** ***** ***** *** * **** *
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGC-AGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACA
**** ** ** *** * * ** * * * ****** * * ** * *
LYC.ES_E CTACCACATTTT
XEN.LAE. GTTCT-------
* *
Mean pairwise ID: 50.97%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
**
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTT-TCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCG--GTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA
* * * * ** ** * * ** *** * * ***** ****** *******
ARA.TH_E GTGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGG-CTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG
LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGG
**** ** * *** * * **** * * *** * * * ******* ** *
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ************************* *** * * ***** ******** *
ARA.TH_E GATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACT--ATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAAC-TAAA
*** ** * * ** * * *** * * * **** *** * * ** * * **
ARA.TH_E CCACCATTTT
LYC.ES_L CCACCACTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 50.97%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTA-AGGTGGTGGAATATT
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT-
* ** *** ** * * ** * * * **** *** * **
LYC.ES_E GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGCTCCAAACAAT
** * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** *
LYC.ES_E GAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTG--GGGT
TET.THE. GAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGAC--TCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGG
****** ** ** ** * * * ** * * ** ** ***** * *
LYC.ES_E GGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TET.THE. AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
** * * ******* ***** ** ***** * ****** ** *********
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
TET.THE. TAAC------ATACTCATTAACTGTCA-----AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAG
**** * * ** * ** ** ** ** * * *** ** * *
LYC.ES_E CACATTTT
TET.THE. -ACATT--
*****
Mean pairwise ID: 51.10%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
HOM.SA_A CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--A
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** *
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT-
HOM.SA_A GCGAGACCCCGTCTCTT
** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.10%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
CAN.SPE. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--
* ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT-
CAN.SPE. AGCGAGACCCCGTCTCT
*** * ** ***
Mean pairwise ID: 51.12%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** ** * ** *** * ** **** * *** *** * ****** *
ZEA.MA_F TGTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTT
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGC-TATGCCGATGG--GG--TGTCCGCA
* ** * * * ******** * * * **** *** ** ** ***
ZEA.MA_F CCAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAA
HOM.SA_B CTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG
* ***** * * * *** * * ** ** *** * * *** *
ZEA.MA_F GCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACG
HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCA
* ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * *
ZEA.MA_F GTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACA
HOM.SA_B GTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGAGCAACAT--AGCG
** * **** * *** ** ** ** * ** *** ** **** *** * *
ZEA.MA_F GACCACCATCTTT
HOM.SA_B AGACCCCGTCTCT
* ** *** *
Mean pairwise ID: 51.13%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG---GGGGCATTAATGTGGTGGAATG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
**** ** ** *** ** ***** *** * ** * ** ** *** *
LYC.ES_G TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * ** * ** ****** ** **** * * * ** ** * ***
LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT--CCTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** *** *** * * ** ** ** ** **** * **
LYC.ES_G GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
**** **** *** ** ** ***** ***** *** * **** *
LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
XEN.LAE. GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGC-AGAACAGCCTGA---ACAACAC--AGCGAG
**** ** ** *** * * ** * * * ****** * * * * *
LYC.ES_G CCACCACTTTT
XEN.LAE. ACACAGTTCT-
*** * *
Mean pairwise ID: 51.13%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAG------GTTG
** *** ** * * ** * **** ***** * ****
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** *
LYC.ES_N TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * *
LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAA
TET.THE. G--AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA
* ** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * *******
LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
TET.THE. GGATAACA------TACTCATTAACTGTCAAA----CTAATCGGTT-CTACTATCAAAGC
******* * ** * * * * ** ** **** ** * ** *** *
LYC.ES_N ACCATTTTT
TET.THE. CAGACATT-
* **
Mean pairwise ID: 51.13%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** **
LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ****** * *** *** * *** ** ** * *
LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** *
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAG
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * *
LYC.ES_J CAACCACCTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT
** ** *
Mean pairwise ID: 51.20%
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG
TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG
*** ****** ******
LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGG
TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC
* **** * * *** * * * **** * * * * *** ****
LYC.ES_L GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAA
TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
* ** ************ *********** *** * ***** * ******
LYC.ES_L GGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAA
TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG--GGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GA
********** * *** * * ** ** ** * *** * * ** ***** * *
LYC.ES_L CCACCACTTT
TRI.AE_C CCACCATC--
******
Mean pairwise ID: 51.26%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
HOM.SA_A TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT-
HOM.SA_A AGCGAGACCCCGTCTCTT
*** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.27%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG-GAGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * ***
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
RAT.NOR. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
RAT.NOR. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
RAT.NOR. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACA-TAG
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** **
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT
RAT.NOR. CGAGAC--CCGTCTCT
**** ** *** *
Mean pairwise ID: 51.27%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
CAN.SPE. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--A
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** *
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT
CAN.SPE. GCGAGACCCCGTCTCT
** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.28%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** ** * *** * * * ** ***
LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
ORI.CUN. TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCC---TGGGCAACAT-AGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * *** ***** * * *
LYC.ES_G ACCACCACTTTT
ORI.CUN. ACCCTGTCTCC-
*** **
Mean pairwise ID: 51.29%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGG-TGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
**** * ** ** * ** ***** ***** **** * * *** *** ***
LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * ** ******** * ** *** * * * ** ** * **
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
* * * * * ** *** *** * * ** ** ** * ***** * **
LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
**** *** *** ** ** **** *** * *** * **** *
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGA
**** ** ** *** * ** * ** * * ** * * * * *
LYC.ES_O CCACCACTTT
FUG.RUB. CTCAGTCTTT
* ****
Mean pairwise ID: 51.30%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACC-CAAATGGGGGCATTAATGTGGT-GGAAT-G
TET.ROS. GCCAGGGT-AGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
*** * * ** **** * *** *** * *** * ***** ** **** *
LYC.ES_I TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** *
LYC.ES_I TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * * ** * ***** * *
LYC.ES_I GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
**** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * ********
LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT-----CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-A
****** * ** * * * * * * * * * * ** ** * ** *
LYC.ES_I CCATTTTT
TET.ROS. CT------
*
Mean pairwise ID: 51.32%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AGATGGGACTTTGGG
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTC---
*** * * * ******** * *** ** * ** ***** *
HUM.JA_A TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCA-TTCCAAGCCGA
TRY.BR_B TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG-
* * * * ** **** * ** **** ** ***** ** * * **
HUM.JA_A GAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCA
TRY.BR_B GTGTTGAGGT-CGCCA-CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-A
* **** * * * * *** **** * ** * * ** ***** ** *** *
HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC
* * ** **** *** ** ******* ****** *** * * ** * ** *
HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTG---TCGTCGCGAGGCGGTTT-
** ** ** ** ** ** ** * * ** ** * ** * * *
HUM.JA_A TTTT
TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 51.42%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG-GAGGA
*** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * ***
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
RAT.NOR. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
RAT.NOR. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
RAT.NOR. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACA-TA
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT
RAT.NOR. GCGAGAC--CCGTCTCT
**** ** *** *
Mean pairwise ID: 51.42%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ***
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * *** ** ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
CAN.SPE. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT
CAN.SPE. AGCGAGACCCCGTCTCT
*** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.45%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
**
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATA-GGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCG--GTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA
* * * **** *** ** ** * ** *** ** ****** ****** *******
ARA.TH_G GTGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGG-TTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAG-TGGGG
**** * * * ** * **** * ** * * ** ****** * * *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ***** ******* *********** *** * ** ******* ******** *
ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACT--ATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA
LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGC--TCCAACTAA
** ***** ** ** * * **** * * * * * *** * ** * *
ARA.TH_G ACCACCATTTT
LYC.ES_L ACCACCACTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 51.45%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAA-GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGT
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** **** * ** * ** ** ** * **
ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TET.ROS. T------CAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-AGTGTGCCCGTTCCAAA
* * ** * ** * * * * * ** * ************
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCT--GGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACC-TGAAGCGG
TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAA----TAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAG
* ** *** ***** * * * ** * ** ** * * ** *
ZEA.MA_F C--AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
TET.ROS. CTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTATTGTGGT
* *** * ** * ******** ***** *** ** *** *** **** ***
ZEA.MA_F GGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA
TET.ROS. GGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCTG--CTATTCTGATCAGA
** ********* * * * ** * * ** ***** * * * * * ****
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
TET.ROS. C-ACT------
* **
Mean pairwise ID: 51.45%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_L ----------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGT
** * ** **** *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_L T------GGGTTCGG----TAGGCTTATA---------GTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC
* ** *** * * ***** ** * * ********* ******
ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGG-CCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG
*** *** * * **** * **** * ****** *** * *** *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCT-TCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** ** ***** * **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCG-GTCCAGA---GCCTCATTAAACAGA
LYC.ES_L GGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAA
******* ** * *** ** ** *** * * ** ** ** * ** * *
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
LYC.ES_L CCACCACTTT-
****** **
Mean pairwise ID: 51.48%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
***** *** ** * *********** ** **** *** ** *** * ****
LYC.ES_N GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** *
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC
* *** * * * * * * ** * * ******** *
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT
* ************* **** ****** *** ** *** **************
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA
ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------------
** ****** * * ** * * *** *
LYC.ES_N TTTTT
ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 51.60%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGTGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * * ** *** * ** ***** * **** *** * *** * *
ZEA.MA_F GTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTC
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCG-GACTATGTC---GATCGGG-TGTCCGTAC
* ** ** * * ******** * ** * * ** * * *** ** **** *
ZEA.MA_F CAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAG
FUG.RUB. TAAGTTCGGTATCGATA-TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGG
***** * * * * * *** **** * * *** *** * *** * *
ZEA.MA_F CGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG
FUG.RUB. AGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAG
** ** * *** ** ** ***** * * * **** * * *
ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG
FUG.RUB. TAGTGGGAT--CGCGCCCGTGAATAG-ACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGG
* * **** * *** ** ** * * ** * * ** *** ** * * *
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
FUG.RUB. GACTCAGTCTTT
* * *****
Mean pairwise ID: 51.60%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** ** * *** * * * *** ***
LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
HOM.SA_A TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * * *
LYC.ES_G ACCACCACTTTT
HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT
*** * ** **
Mean pairwise ID: 51.60%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGG-TGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* ** * ** ** * ** ***** ***** **** * * *** *** ***
LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA
* * * * ** ******** * ** *** * * * ** ** * **
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
** * * * * ** *** *** * * ** ** ** * ***** * **
LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT
**** ** * *** ** ** **** *** * *** * **** *
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAG-TAACACAGCGGGA
**** ** ** *** * ** * ** * * ** * * ** *
LYC.ES_E CTACCACATTTT
FUG.RUB. CT--CAGTCTTT
** ** ***
Mean pairwise ID: 51.60%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
**** ** ** * ** **** ** * *** * * * * ***
LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * * ** * ** ****** * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
RAT.RAT. TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCC---TGGGCAACAT-AGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * *** ***** * * *
LYC.ES_G ACCACCACTTTT
RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT
*** * ** **
Mean pairwise ID: 51.61%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
*** * * ** ***** ** *** * ** * * * * *********
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGAT--GTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
CAE.BRI. --AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
*** * * * **** * *** * * *** * * * **** ****
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC-CTTAAGTGGCA
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
* ** * * *** ** ** *** * ** ** * *** * **** *
TRI.AE_B G-GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAA
CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
* **** * *** * * ***** * * * * **** * ****
TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC
CAE.BRI. GGATAGC--GCTTGTG-AGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTC-TGATACCTT--CAGACC
***** * ** ** ** ** *** * ***** ** * ******
TRI.AE_B ACC-ATCTTT
CAE.BRI. ACTTGTCATT
** ** **
Mean pairwise ID: 51.62%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** ** * *********** ** **** ****** *** * ** *
LYC.ES_E GGGC-TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGT-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** ***** * *** ** * *** * *** *******
LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * * * * ***** * * * * * ********* *
LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* *********** **** ****** *** * * **** ** *********
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------
*** * ** * * * * * **
LYC.ES_E CACATTTT
ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 51.74%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * ***
ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC------GATGGGGTGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * ** ** ***
ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA
HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** *
ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
HOM.SA_B TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGAGCAACAT--
* ** * **** * *** ** * * * ** *** ** **** **
ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT-
HOM.SA_B AGCGAGACCCCGTCTCT
*** * ** ***
Mean pairwise ID: 51.77%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG
* ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** **
LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA
HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA
** * **** ** * ****** * *** *** * *** ** ** * *
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * *
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
*** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** *
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAG
**** * * * *** * * * * * ** * **** * * *
LYC.ES_A CAACCACCTTT
HOM.SA_B ACCCCGTCTCT
** ** *
Mean pairwise ID: 51.90%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * ***
ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC------GATGGGGTGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * ** ** ***
ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA
HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT
* * ** *** * *** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA
HOM.SA_B CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGAGCAACAT--A
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** **** ** *
ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT
HOM.SA_B GCGAGACCCCGTCTCT
** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.94%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGGTGGTGGAATA
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
**** ** ** **** ** ***** *** * ** ** * ** ***
LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
* * **** ** ******* ** **** * * * ** ** * ***
LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT--CCTAAAGTGG
XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG
* * * ** *** *** * * ** ** ** ** **** * **
LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT
**** **** *** ** ** ***** ***** *** * **** *
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGC-AGAACAGCCTGAACAAC----ACAGCGAGA
**** ** ** *** * * ** * * * ****** * ** * *
LYC.ES_O CCACCACTTT
XEN.LAE. C-ACAGTTCT
* ** * *
Mean pairwise ID: 51.95%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACC-CAAATGGGGGCATTAATGTGGT-GGAAT-G
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
* ** *** **** * *** *** * *** * ***** ** **** *
LYC.ES_B TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** *
LYC.ES_B TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * * ** * ***** * *
LYC.ES_B GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
**** ** * ******* ***** ** ** ** ** ***** * ********
LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT-----CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-A
****** * ** * * * * * * * * *** *** ** * ** *
LYC.ES_B CCACTTTT
TET.ROS. CT------
*
Mean pairwise ID: 51.95%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------GTTGGGT
******
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGC-TGCCCATTCCAAGCCGGG
LYC.ES_L TGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGG
****** * *** * ** *** * * *** ***** ******* **
HUM.LU_C AGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGN-GCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGCA
LYC.ES_L AGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
** *** * * * * * **** * ** ** * ***** * *** * * *
HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_L CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
************* *********** *** * ** ******* **************
HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAA--CACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_L ACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTG--CTCCAACTAAACCA
***** * **** * *** * * * * * ******* ** ****
HUM.LU_C TTTCTTTT
LYC.ES_L CCACTTT-
****
Mean pairwise ID: 51.96%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
***** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** *
LYC.ES_K GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
* ** * **** * *** * * *** * *** ******
LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * ** *** **** * * * * * ****** ** *
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* ** ************** ******* ** * * ***** ** *********
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT-------------------------------
***** **** * * *** * * ** *
LYC.ES_K ACCTTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.04%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAA----GGTGGTGGAAT
**** **** *** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
LYC.ES_M ATTGG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTGT
**** * * * *** ****** ** ** **** * ***** ***** *
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
LYC.ES_M CCAAGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTC
***** * *** ** * *** *** * * ***** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
LYC.ES_M CTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTG
********* * ** ** ********************** ** ** ******
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
LYC.ES_M TGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCT
* ************ ** * ** * * *** * * **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_M CCAATAAACAACCACCTTT
*** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 52.05%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG-GAGGA
*** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * ***
ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC------GATGGGGTGTCCG
* *** * ** ******** * ******* * ** ** ***
ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT
HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT
* ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * ***
ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA
HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA
* * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * *
ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA
HOM.SA_B TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGAGCAACAT--
* ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** **** **
ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT
HOM.SA_B AGCGAGACCCCGTCTCT
*** * ** *** *
Mean pairwise ID: 52.12%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
LYC.ES_L ----------------------------------------------------GTTGGGTT
** * *
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTG-CTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
LYC.ES_L GACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGA
* **** * * ** * * ** *** * * **** ****** ******* **
HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGG-TCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA
LYC.ES_L GTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
**** *** * **** * **** *** * ******** ** * * *
HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_L TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************* *** * ** ******* ***************
HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACC--ATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_L CGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTG--CTCCAACTAAACCAC
**** * ***** * *** * * ** **** ** ****
HUM.JA_B TTCTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
****
Mean pairwise ID: 52.12%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
******* *** * * *********** * ******* *** ** *** * ****
LYC.ES_G GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** **** * *** ** * *** * *** ******
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * * * * ***** * * * * * ********* *
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* ************ **** ****** *** * * **** ** *********
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------
*** * ** * * * * * **
LYC.ES_G CACTTTT
ZEA.MA_H -------
Mean pairwise ID: 52.13%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
LYC.ES_M ----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATTG
** ****** ** *** **** * ** *
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * **** ** * *** *** * *********** ******
TRI.AE_B GTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGGC
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
*** ** * *** **** * * ***** * *** **** *
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
*** * * ******* ************ ** ** ** ***** * **********
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA
LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** ** ** ** ** **** * ** * * ** ****
TRI.AE_B TCTTT
LYC.ES_M CCTTT
****
Mean pairwise ID: 52.13%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** * * *********** * ******* *** ** *** * ****
LYC.ES_B GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** *
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC
* *** * * * * * * ** * * ******** *
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT
* ************* **** ****** *** * **** **************
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA
ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------------
** ****** * * ** * * *** *
LYC.ES_B CTTTT
ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 52.20%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * **
ZEA.MA_G TT----TGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAG-----------AGTGTGCCCGT
* * ** * ** ** * * * * **** * * *******
ZEA.MA_G CCCAAGTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACC-T
TET.ROS. TCCAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCT-AGTAATAG----GACTTCACCAGGGCAT
**** * *** *** ** *** * * ** ** * ** **** * *
ZEA.MA_G GAAGTGGC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TET.ROS. TAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTAT
** ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** ******
ZEA.MA_G AACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT
TET.ROS. TGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCT---GCTATTCT
***** ******** * * *** * * ** ** * * ** **
ZEA.MA_G AAGCAGACCACCATCTTT
TET.ROS. GATCAGAC-ACT------
* ***** **
Mean pairwise ID: 52.24%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
* ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** * * **
LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
CAN.SPE. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * ** ** ******* *** **** * * ** ** * **
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
CAN.SPE. GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * **
LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGA
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** * *
LYC.ES_E CTACCACATTTT
CAN.SPE. CC-CCGTCTCT-
* ** * *
Mean pairwise ID: 52.26%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** * * **
LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
CAN.SPE. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* * ** ** ******* *** **** * * ** ** * **
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
CAN.SPE. GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * **
LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAAC----ATAGCGAGA
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * * * *
LYC.ES_O CCACCACTTT
CAN.SPE. CCCCGTCTCT
** * ** *
Mean pairwise ID: 52.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
**** ** ** * * ** **** **** * * ** ***** * * *
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
* ** ** *** ***** * *** **** *** ** ** * ***
LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ***
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
*** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
HOM.SA_B GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGAC
**** ** ** *** * * * * ** * ****** * * * **
LYC.ES_G CACCACTTTT
HOM.SA_B CCCGTCTCT-
* * ** *
Mean pairwise ID: 52.29%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** *
LYC.ES_A GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
* ** * **** * *** * * *** * *** ******
LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * ** *** **** * * * * * ********* *
LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* ** ************** ******* ** * ***** ** *********
LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT-------------------------------
***** **** * * *** * * ** *
LYC.ES_A ACCTTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.29%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
******* *** ** * *********** ** **** ****** *** * ** *
LYC.ES_O GGGC-TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** ***** * *** ** * *** * *** ******
LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * * * * ***** * * * * * ********* *
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* ************ **** ****** *** * * **** ** *********
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------
*** * ** * * * * * **
LYC.ES_O CACTTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.35%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * **
ZEA.MA_E TT----TGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAG-----------AGTGTGCCCGT
* * ** * ** ** * * * * **** * * *******
ZEA.MA_E CCCAAGTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACC-T
TET.ROS. TCCAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCT-AGTAATAG----GACTTCACCAGGGCAT
**** * *** *** ** *** * * ** ** * ** **** * *
ZEA.MA_E GAAGTGGC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTC
TET.ROS. TAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCG-CTTA
** ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** **** ***
ZEA.MA_E CAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC
TET.ROS. TTGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCT---GCTATTC
***** ******** * * *** * * ** ** * * ** *
ZEA.MA_E TAAGCAGACCACCATCTTT
TET.ROS. TGATCAGAC-ACT------
* * ***** **
Mean pairwise ID: 52.43%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
* ** * * * * * ******** ** ******* ** * ** * *
HUM.LU_C GGTCA--ACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT
* ** * *** * ******* ** * * ***********
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGG-ACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT-CCCAACACTAAAGTGGCGG
* * ***** * ** *** ****** *** * ** *** * *** **
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG
** ****************** ********** **** ***** * ** ********
HUM.LU_C ATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------
**** * * ** * ** * *** *
HUM.LU_C ATTTCTTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 52.46%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
******* *** * * *********** * ******* *** ** *** * ****
LYC.ES_I GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** *
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC
* *** * * * * * * ** * * ******** *
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT
* ************* **** ****** *** ** *** **************
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA
ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------------
** ****** * * ** * * *** *
LYC.ES_I TTTTT
ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 52.48%
CAE.EL_B -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
** * * ** * ** *** * ****** *** *** *****
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTA-TGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
* **** *** *** *** * * * ** *** ** ****** * *
CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
*** * *** * *** ** *** * * * ** ** *******
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
* ** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * *
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCT
** *** **** *** * ***** * *** * ****** *
CAE.EL_B TTT
DRO.MEL. TT-
**
Mean pairwise ID: 52.56%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAG----TGAGGGCATCAGTGTGGTGGAAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
**** * * ** *** * ** ***** **** ** * * * ** *** ***
LYC.ES_C GTTGAACATGCCCAGAAGGTA-GGGCTTGTGTG-ACAAT-TCTCTGGCCTGCCCTGTCCA
FUG.RUB. GCTTGA---GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA
* * * ** *** ** * ****** * * ** ** ** * * ** ** * *
LYC.ES_C AGCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTG
FUG.RUB. AGTTCGGTATCGA-TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG
** * * * * * *** ** * * ** * ** * ** ***** * *
LYC.ES_C GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG
***** * * *** ** ** **** * *** **** * * **** *
LYC.ES_C AAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTGA-ATAGACGCT----GTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGG
**** ** *** *** *** * * * * * ** * * **
LYC.ES_C ACTACCACATTT
FUG.RUB. ACT-CAGTCTTT
*** * ***
Mean pairwise ID: 52.61%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** *
LYC.ES_J GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
* ** * **** * *** * * *** * *** ******
LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA
* *** ** * ** *** **** * * * * * ********* *
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
* ** ************** ******* ** * * ***** ** *********
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT-------------------------------
***** **** * * *** * * ** *
LYC.ES_J ACCTTT
ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.72%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGT-GGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** ** ***
LYC.ES_E TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_E GGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGGGCAACA----TAGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** *
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
ORI.CUN. ACC-CTGTCTCC-
** * *
Mean pairwise ID: 52.75%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
TET.THE. GCCAGGGTA-GCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAG------GTTG
*** * * * ** * * ** **** ******** * ****
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* *** * * **** * * * * * ** * ***** ***** *
LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTC-TATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGAT
TET.THE. AATGAGTTGC-TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA
* ****** * ***** ** ** **** ** * *** ** * *
LYC.ES_F GGAC-TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG
*** ** * ******* ***** ** ** * * ***** ** *******
LYC.ES_F GATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACC
TET.THE. GATAAC------ATACTCATTAA---CTGTCAAA---CTAATCGGTTCTACTATCAAAGC
*** ** * *** ** * ** **** ** ** **** ** *** *
LYC.ES_F ATCACTTTT
TET.THE. CAGACATT-
** **
Mean pairwise ID: 52.83%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTC
TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * **
ZEA.MA_D TT----TGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAG-----------AGTGTGCCCGT
* * ** * ** ** * * * * **** * * *******
ZEA.MA_D CCCAAGTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACC-T
TET.ROS. TCCAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCT-AGTAATAG----GACTTCACCAGGGCAT
**** * *** *** ** *** * * ** ** * ** **** * *
ZEA.MA_D GAAGTGGC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC
TET.ROS. TAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTA
** ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** *** ****
ZEA.MA_D CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC
TET.ROS. TTGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCT---GCTATTC
***** ********* * * *** * * ** ** * * ** *
ZEA.MA_D TAAGCAGACCACCATCTT
TET.ROS. TGATCAGAC-ACT-----
* * ***** **
Mean pairwise ID: 52.87%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
* ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * **
LYC.ES_E --ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCC
RAT.NOR. CGATTGAG---TCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
**** * *** ** ******* * *** **** * * ** ** *
LYC.ES_E AAGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGT
RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
**** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** *
LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
****** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** ****
LYC.ES_E GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTA
RAT.NOR. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGGGCAACA----TAGCGA
* **** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** *
LYC.ES_E AACTACCACATTTT
RAT.NOR. GAC--CCGTCTCT-
** ** * *
Mean pairwise ID: 52.88%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
**** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * **
LYC.ES_O --ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCC
RAT.NOR. CGATTGAG---TCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
**** * *** ** ******* * *** **** * * ** ** *
LYC.ES_O AAGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGT
RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** *
LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA
****** **** *** ** ** ***** ****** *** ** ****
LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
RAT.NOR. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGAG
* **** ** ** *** * * * * ** * ***** *** *
LYC.ES_O AACCACCACTTT
RAT.NOR. ACCCGTCTCT--
* ** * **
Mean pairwise ID: 52.92%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA--
* ** **** ********* * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
*** * ** * ******* * ** * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_M CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
*** * * *** *** * * **** * **** *** * **** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_M GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** *
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_M CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 52.96%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** *** *** ** * * **** * ** * *** * ** ** ** ** * *
CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
* *** * * ******* * ** *** *** ******** *
CIN.HYB. AG-AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGT-GGCGG
* ******** * * *** ***** *** * ** * * ** * * ** **
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG
** ***** ******* **** ***** **** *** * * * * ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCA-AT------------------------------
** * ** ** ** ***** ** **
CIN.HYB. ATTT
ZEA.MA_H ----
Mean pairwise ID: 53.04%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
* ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * *** * ***
LYC.ES_E TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_E GGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGGGCAACA----TAGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** *
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
RAT.RAT. ACC-CCGTCTCTT
** ** * **
Mean pairwise ID: 53.07%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATA----CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAG---GTTG
* ** *** *** * *** * * *** ** *** ** ** * ****
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** *
LYC.ES_B TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * *
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA
TET.THE. --GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA
* ** ** * ******* ***** ** ** ** ** ***** * *******
LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC
TET.THE. GGATAACA------TACTCATTAACTGTCAAA----CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCC
******* * ** * * * * ** ** ** * *** ** **
LYC.ES_B ACCACTTTT
TET.THE. AG-ACATT-
* ** **
Mean pairwise ID: 53.11%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
LYC.ES_L -----------------------------------------------------GTTGGGT
******
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
LYC.ES_L TGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAG-GCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGA
***** * * **** * ** * **** ****** ******* ***
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG-CCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAA
LYC.ES_L GTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
***** *** * * * **** * ********** ***** ***** * * *
HUM.LU_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_L TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************* *** * ** ****** ***************
HUM.LU_B CGGGCCGGTGCT-ACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTT
LYC.ES_L CGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCA
**** * ***** * ***** * *** * ** ****
HUM.LU_B CCTTT
LYC.ES_L CTTT-
* **
Mean pairwise ID: 53.23%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA--
* ** **** *********** ****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_M TTGGGCTG--TCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
*** * ** * * * ******* * ** * * * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
*** * *** * * **** * **** *** * *** ** **
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** * ******************** ** ** ** *** * **** *
ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC
LYC.ES_M GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * ****
ZEA.MA_A CACCATCTTT
LYC.ES_M AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 53.23%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** *** *
HUM.JA_B AGTT-CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACT--GTGGACCACCCATTCCAAGT
* ** ** *** * ** ** **** ** ** *** * ***********
HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCG-GACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT--CCCAACACTAAAGTGGCG
* * ** * * * *** * **** * * ** * * ****** ** *
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
* ** ************* **** ********** *** ***** * ** *******
HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------
***** * * ** * * * ****
HUM.JA_B CATTTCTTTT
ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 53.25%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ******** ** *** **
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAG--TGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
* *** * * **** * ** * * * *** ** ************
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGG--GCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAAAGTGGC
** * ** * ** ** * * *** * * ** ** *** *****
ARA.TH_C GGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAA
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
*** * ************ **** ********* *** ***** ********
ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
**** * * * * * * ***** *
ARA.TH_C ATCACTTT
ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 53.27%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTA-AGGTGGTGGAATATT
TET.THE. GCC-AGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT-
*** ** *** ** * * ** * * * **** *** * **
LYC.ES_O GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGCTCCAAACAAT
** * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** **
LYC.ES_O GAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
TET.THE. GAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGG
****** ** ** ** * * * ** * * ** ** ***** * **
LYC.ES_O AC-CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TET.THE. AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA
* *** * ******* ***** ** ***** * ****** ** *********
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
TET.THE. TAACATACTCAT------TAACTGTCA-----AACTAATCGGTT-CTACTATCAAAGCCA
**** ** * ** * ** ** ** ** * ** * ** *** *
LYC.ES_O CACTTT
TET.THE. GACATT
** **
Mean pairwise ID: 53.38%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** * * *********** * **** ** **** * *** ***
ARA.TH_A GGTT-CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA--ACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
** *** * * * ** *** ** * * ** * **** ******
ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGT---TGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
ZEA.MA_H TGC--GTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGC--ATCCCAACACTAAAGT-G
** *** * ** * * * * ***** **** ** ** * *** *** *
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG
ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGG
* ** * ****************** ********** *** ***** **** ****
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------
* **** * * * * ** *** *
ARA.TH_A ACCACCATTTT
ZEA.MA_H -----------
Mean pairwise ID: 53.40%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TET.THE. GCCAGGGT-AGCAATA----CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAG---GTTG
*** * * ** *** * *** * * *** ** *** ** ** * ****
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** *
LYC.ES_I TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG
****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * *
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAA
TET.THE. G--AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA
* ** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * *******
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
TET.THE. GGATAACA------TACTCATTAACTGTCAAA----CTAATCGGTT-CTACTATCAAAGC
******* * ** * * * * ** ** **** ** * ** *** *
LYC.ES_I ACCATTTTT
TET.THE. CAGACATT-
* **
Mean pairwise ID: 53.40%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** * * *********** * **** ** **** * *** ***
ARA.TH_F GGTT-CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA--ACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
** *** * * * ** *** ** * * ** * **** ******
ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGT---TGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGA
ZEA.MA_H TGC--GTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGT-GGC
** *** * ** * * * * ***** **** ** * * *** *** **
ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
** * ****************** ********** *** ***** **** *****
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
**** * * * * ** *** *
ARA.TH_F CACCATTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 53.42%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG
TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG
* *** *****************
TRI.AE_B -GTAGTGGGCTGGGTGG--CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAG
TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
******* * * *** * ******* ** * * ** * * ** *** *******
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGG
TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
***** *** ******* *********************** ******************
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCT-TGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GACCAC
***** ********** * ***** ******** ** ** * *** ******
TRI.AE_B CATCTTT
TRI.AE_C CATC---
****
Mean pairwise ID: 53.53%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
**** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * *** * ***
LYC.ES_O TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG---GGCAACAT-AGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * ***** *** * * *
LYC.ES_O ACCACCACTTT-
RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT
*** * ** *
Mean pairwise ID: 53.55%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGG----A
******* **** ** * ************** ******** ** ** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGA----AGGGCTA-ATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA
*** ** ** ** *** ** ** ** **** * * *** * *** *****
LYC.ES_F GC-ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACT-AAAGTGGC
* * *** ** * * * ** ****** * ** * * * * *****
LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
* ************* **** ****** *** ** ***** ** ******
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
**** * * * * ** * * ** *
LYC.ES_F CATCACTTTT
ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 53.57%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
** ******* ***** ****** * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** ****** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** * * *** *** * *** *** ** * *
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********************** ** * ******* ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_M CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 53.57%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
** * * ** * ** ******** ** ******* ** ** * * *
HUM.JA_A GGTCA--GCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT
* * *** * ***** **** ** ** *** * ***********
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTG-ATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGGCG
* * **** * * ** ****** *** * * * ****** ** *
HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
* ** ************* **** ********** *** ***** * ** *******
HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCA
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCC-CAAT-----------------------------
***** * **** * * **** * **
HUM.JA_A TCTCTTTT
ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 53.59%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
****** ** * * ** ***** *** ***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
LYC.ES_M GGCT-GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
*** * * ** * * **** ** * ***** ***** ****** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
LYC.ES_M GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCGG
**** ** *** * ** * *** *** *** ** * * **** *
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** * ******* ********** * *** * *** **** * **********
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC
* * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** **
CIN.HYB. ATTT--
LYC.ES_M ACCTTT
* *
Mean pairwise ID: 53.62%
CAE.EL_C -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGG-AT
DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT--CTGATTGTGGGAT
** * * ** * ** *** * ****** *** *** ***** **
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTA-TGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCC
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** **** *** *** *** * * * ** *** ** ****** *
CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
**** * *** * *** ** *** * * * ** ** *******
CAE.EL_C TGGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
* ** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** *
CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-AT
*** **** **** *** * ***** * *** * ****** *
CAE.EL_C CACT
DRO.MEL. CTTT
* *
Mean pairwise ID: 53.62%
CAE.EL_D -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
** * * ** * ** *** * ****** *** *** *****
CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTATGTCGTCGTCT-ACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
* **** *** *** *** * ** * ** *** ** ****** * *
CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
*** * *** * *** ** *** ** * * ** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-ATC
** *** *** *** * * ***** ***** * ****** ***
CAE.EL_D ATTT
DRO.MEL. TTT-
**
Mean pairwise ID: 53.62%
CAE.EL_A -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
** * * ** * ** *** * ****** *** *** *****
CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTA-TGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
* **** *** *** *** * * * ** *** ** ****** * *
CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
*** * *** * *** ** *** ** * * ** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-ATC
** *** **** *** * * ***** ***** * ****** ***
CAE.EL_A ATTT
DRO.MEL. TTT-
**
Mean pairwise ID: 53.70%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGT-GGTGGAA
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** ** ***
LYC.ES_O TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG---GGCAACAT-AGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * ***** *** * * *
LYC.ES_O ACCACCACTTT
ORI.CUN. ACCCTGTCTCC
*** **
Mean pairwise ID: 53.72%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** * * *********** * **** ** * ** * *** * *
ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCC-GGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA--ACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
** *** ** * *** ** *** ** * * * *** * **** ******
ARA.TH_E TGTG-AGTAAGACGTGTGTGTCA-AGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGC--ATCCCAACACTAAAGT-GGC
** * *** * * ** * ***** **** ** * * ******* **
ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
** * ************* **** ********** *** ***** **** *****
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
**** * * * ** *** *
ARA.TH_E CACCATTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 53.85%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
* ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * ****** * **
LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
HOM.SA_B CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* * ** ** ******* * *** **** *** ** ** * **
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
HOM.SA_B GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * **
LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGA
**** ** ** *** * * * * ** * ****** * *** * *
LYC.ES_E CTACCACATTTT
HOM.SA_B CC-CCGTCTCT-
* ** * *
Mean pairwise ID: 53.87%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAG-GCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
*** *** ** * * **** * ** * **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGC-TGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG
******** *** * * * **** * * ******** ***** ***** * *
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************* *********** *** * ** ******* ************
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACC--ATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCC--AACTAAAC
******* * ***** * ***** * ** * ***** * ** **
HUM.LU_A CATTTCTTTT
LYC.ES_L CACCACTTT-
** ****
Mean pairwise ID: 53.87%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAG-GCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT
*** *** ** * * **** * ** * **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG--CTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG
******** *** * * * **** * ********* ***** ***** * *
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************* *********** *** * ** ******* ************
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACC--ATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCC--AACTAAAC
******* * ***** * **** * ** ******* * ** **
HUM.LU_D CATTTCTTTT
LYC.ES_L CACCACTTT-
** ****
Mean pairwise ID: 53.87%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * ****** * **
LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
HOM.SA_B CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* * ** ** ******* * *** **** *** ** ** * **
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG
HOM.SA_B GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * **
LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT
**** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAGA
**** ** ** *** * * * * ** * ****** * * * *
LYC.ES_O CCACCACTTT
HOM.SA_B CCCCGTCTCT
** * ** *
Mean pairwise ID: 53.87%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
TET.ROS. GCCAGG----GTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGT------TAG
*** * ***** * ** * *** *** * ** *** ** * *
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAGCA
TET.ROS. AATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA
** * * ** * * * * ** **** ** ** * ***** ***** **
LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCT--GCTGGGCTCCTAAAGTGGGG
TET.ROS. GTGAGTTGC-TATGGTGGA--AACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTG
****** * * **** ** * * * ** ** * ** ***** * *
LYC.ES_C TGGA-CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
TET.ROS. AGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAA
*** * ** * ******* ***** ** *** * * ***** ** ******
LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
TET.ROS. GGATAACATAC-----TCAT-TAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC
******* * **** *** * * * ** * * *** **** * * **
LYC.ES_C TACCACATTT
TET.ROS. -ACT------
**
Mean pairwise ID: 53.92%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
LYC.ES_M --------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGC
********* * ** ***** *****
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
LYC.ES_M TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA
***** * *** *** *** ** * * ****** ******* **
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGCAAT
LYC.ES_M GTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACC
* *** * * ** *** * * * ***** * *** * * *
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
LYC.ES_M GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
** ********************** ** * ********** ***************
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT
LYC.ES_M GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
*** ***** * * ** * * ** **** ** * * * ****
HUM.LU_C TCTTTT
LYC.ES_M TTT---
* *
Mean pairwise ID: 53.99%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
* ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** *** ***
LYC.ES_E TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_E GGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAG
**** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** *
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
HOM.SA_A ACC-CCGTCTCTT
** ** * **
Mean pairwise ID: 54.02%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
* ** **** *********** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT-
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 54.02%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
**** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** *** ***
LYC.ES_O TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA
HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA
* * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * *
LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG
HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *
LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG
***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** *
LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG-AC
**** ** ** *** * * * * ** * ***** ** * * *
LYC.ES_O ACCACCACTTT
HOM.SA_A CCCGTCTCTT-
** * ***
Mean pairwise ID: 54.07%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
** ******* ***** ****** * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** ****** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
**** * * *** *** *** * *** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ******* ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC
* ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** **
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_M CACCTTT
** **
Mean pairwise ID: 54.19%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
*** ** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** * * *
HUM.LU_A GGTCA--ACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT
* * * ***** **** ** ** *** * ***********
HUM.LU_A CGGG-AGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA--CTAAAGTGGCG
* * *** ** * * *** ****** * * * * * ** *** ***** *
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
* ** ****************** ********** **** ***** * ** *******
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------
***** * * ** * * ** ***
HUM.LU_A CATTTCTTTT
ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 54.34%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACC-CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGT-GGAATA-
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
* ** *** ** ** *** *** * **** ** ** ** *****
LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** *
LYC.ES_E CAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * ** * ** ** ***** * *
LYC.ES_E GGACCCG--TGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
*** *** * ******* ***** ** ***** * ****** ** *******
LYC.ES_E GATAACGGAC-CGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCT-----AAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC
****** ** * * ** **** * *** * * * *** **** * * **
LYC.ES_E TACCACATTTT
TET.ROS. -ACT-------
**
Mean pairwise ID: 54.34%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
* ** **** *********** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_M CAACCACCTTT
* **** ****
Mean pairwise ID: 54.37%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
** *** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** * * *
HUM.LU_D GGTCA--ACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT
* * * ***** **** ** ** *** * ***********
HUM.LU_D CGGG-AGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCGG
* * *** ** * * *** ****** *** * * ** * * ** ***** **
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG
** ****************** ********** **** ***** * ** ********
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------
**** * * ** * * * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 54.43%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
LYC.ES_L ----------------------------------------------------GTTGGGTT
******
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTG-CTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
LYC.ES_L GACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGA
**** * * **** * ** *** * * **** ****** ******* **
HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGG-CTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAA
LYC.ES_L GTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
***** *** * * **** * * **** ** ******** ** * * *
HUM.JA_A TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_L TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************* *** ** ** ******* ***************
HUM.JA_A CGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTT--AATCAGACCATCT
LYC.ES_L CGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCA
****** ***** * * * * * *** ** * ** * **** *
HUM.JA_A CTTTT
LYC.ES_L CTTT-
****
Mean pairwise ID: 54.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
* ** **** *********** * ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_M GGG--CTGTCCCAGATGGCTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
** * ** * ** ***** * ***** ** ** ********** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
*** * ** ** * * ******** * **** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * ******
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
LYC.ES_M AACCACCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 54.65%
COL.BLU. CCGAACCTCATTACCTTGGCCTGTTACCCCAAGTTGGGGGTCTTTAAGGTTATTTGATKT
PER.AME. ----GATCCGTAACGCGAGCTTATAACTCGAG--CGGGGGCTATAAAGGTGGTGTGGAAC
* * ** ** * * ** * * ***** * ***** * **
COL.BLU. ---TKGGCCTATGCTACCKGCCKGGCTCTGGTCCTGCTTATTCTGGCCCGCCCGTTCCAA
PER.AME. GAGCTGACTCGACCTGCCGGGTTGGGCCAGGGACTGCG-GTGCTGGCTCGCCCGTTCCAA
* * ** ** * ** * ** **** * ***** ************
COL.BLU. GCCGGGAGTTGGCCCATGTGGTTTATGCGAAGGTATAGGCTTCGGTGGTTCC
PER.AME. GTCGGGTAGTGGGCCATGTGGCTTGGGCGAAGGCCTGGGTTTCT-TGGCC--
* **** *** ******** ** ******* * ** *** ***
Mean pairwise ID: 54.66%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
TET.THE. GCCAGG----GTAGCA-ATACCTGTGTCT-ATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGTGA
*** * ***** * *** ** * ** ** *** * ** * ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAGC
TET.THE. TAGATA---GGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* ** ** ** * *** ** **** ** ** * ***** ***** *
LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCT--GCTGGGCTCCTAAAGTGGG
TET.THE. AATGAGTTGC-TATGGTGG--TAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCT
** ****** * * **** ** * * * ** ** * ** ***** *
LYC.ES_C GTGGAC-TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA
*** ** * ******* ***** ** *** * * ***** ** *****
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
TET.THE. AGGATAACATAC-----TCATTAACTGTCAAA------CTAATCGGTTCTACTATCAAAG
******** * **** * **** ** ** ** * * *** **
LYC.ES_C CTACCACATTT
TET.THE. CCAG-ACATT-
* * *****
Mean pairwise ID: 54.66%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT
* **** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_K TGGGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA
** * * * * ** ** ** * * * * **** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LYC.ES_K AGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCG
** * ** * * *** *** * ** ** **** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * * ** ********* ************ ** * * ****** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******** *** ** ** * *** ** * * * * *
ORY.SA_B CCACCACCTTT
LYC.ES_K CAACCACCTTT
* *********
Mean pairwise ID: 54.79%
CAE.BRI. -ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG
DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG
** ** * ** * ** **** * ****** *** *** *****
CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTC-CTGTGGGTGTTGTCGGCA-ACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCA
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
* *** * *** *** * * ** * * *** ** ****** * *
CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
*** * ** * **** * * *** * * * * ** * *******
CAE.BRI. GGTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
* ** ** ** ***** **** ****** *** ** *** * ***** * *
CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTC
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-ATC
******* **** * * ** ***** * **** * ****** **
CAE.BRI. ATT
DRO.MEL. TTT
**
Mean pairwise ID: 54.82%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
LYC.ES_M -------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCT
********* * ** * *** * *****
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
**** * *** *** *** ** **** ****** ******* ****
HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAATG
LYC.ES_M TTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCG
**** * * * *** *** * ******** ** * * * *
HUM.JA_A CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG
LYC.ES_M CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG
* ********* ************ ** ** ********** *************** *
HUM.JA_A GGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCTTT
LYC.ES_M GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTT
******** * * * ** * ** * * ** * * * **
HUM.JA_A T
LYC.ES_M T
*
Mean pairwise ID: 54.84%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** **** **** *********** ** **** * ***** * *** * *
ARA.TH_G GGAT-CGGCCCACGGGTC-GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTA-CA-AACTGTGGACCACCCATTCCAAGT
* ** ** * * * ** * * ** * ** * * ***** **** ******
ARA.TH_G TGTG-AGTGAACCGTATGAACCA-AGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGA
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTT--TGCATCCCAACACTAAAG-TGGC
** * **** ** ***** * ** * * * * ****** * *
ARA.TH_G GGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGAC
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
** ******* ************ ********** **** ***** **** *****
ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
*** ** * *** * * *** *
ARA.TH_G CCACCATTTT
ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 54.84%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
* ** **** *********** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ********************** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_M AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 54.84%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
TET.THE. GCC-AGGGTAGCAAT----ACCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAG---GTTG
*** ** *** *** * *** * * *** ** *** ** ** * ****
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCT----GGCCTGCCCTATCCAAGC
TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC
* * * *** * * *** ** * * *** * ***** ***** *
LYC.ES_G ACAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG
TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGAC--TCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA
* ****** ** ** ** * * * ** * * ** ** ***** *
LYC.ES_G TGGAC-CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA
*** *** * ******* ***** ** ***** * ****** ** ******
LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
TET.THE. GGATAACATACTCAT------TAACTGTCA-----AACTAATCGGTT-CTACTATCAAAG
******* ** * ** * ** ** ** ** * ** * ** ***
LYC.ES_G CACCACTTTT
TET.THE. CCAGACATT-
* ** **
Mean pairwise ID: 54.87%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ******** ************* * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** ** * ** ** * * ** **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** * ** ** *** ** * * ******* ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * **** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** *
ARA.TH_D CCACTTT-
LYC.ES_M CCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 54.87%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
********* * ** *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** ** ** * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_M CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 54.93%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
LYC.ES_M -------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCT
********* * ** *** * ** *
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG
* **** * ** *** *** ** **** ****** ******* ****
HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAATG
LYC.ES_M TTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCG
*** * * ** * *** * *** * * ******** ** * * * *
HUM.JA_B CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG
LYC.ES_M CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG
* ********* ************ ** * ********** *************** *
HUM.JA_B GGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
LYC.ES_M GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTT
** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * **** *
HUM.JA_B TTTT
LYC.ES_M T---
*
Mean pairwise ID: 55.05%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
* ******* **** *** ** *** *
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
LYC.ES_M GG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * * **** ** **** **** * ****** **** ******
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
LYC.ES_M AGAGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
* **** * * * *** * **** **** ** * * * *** ****
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
LYC.ES_M GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* ** ** ********************** ** * ****** * ********
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC
LYC.ES_M ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
******** ** ** * * * ** * **** * * ***** * ** **
TRI.AE_A C------
LYC.ES_M CACCTTT
*
Mean pairwise ID: 55.08%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_D -----------------------------TAGTTC--TGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* *** ******************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ** ** * ** **** *** ****** ** * ******** **** ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * ***** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_D CTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 55.31%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT
* ***** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_A TGGGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA
** * * * * ** ** ** * * * * **** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAG-GCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG
** * * * * * * *** *** * ** ** **** ****
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * * ** ********* ************ ** * ****** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******** *** ** ** * *** ** * * * * *
ORY.SA_B CCACCACCTTT
LYC.ES_A CAACCACCTTT
* *********
Mean pairwise ID: 55.31%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT
* ***** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_J TGGGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA
** * * * * ** ** ** * * * * **** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LYC.ES_J AGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG
** * ** * * *** *** * ** ** **** ****
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * * ** ********* ************ ** * * ****** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******** *** ** ** * *** ** * * * * *
ORY.SA_B CCACCACCTTT
LYC.ES_J CAACCACCTTT
* *********
Mean pairwise ID: 55.34%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACC-CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGT-GGAATA-
TET.ROS. GCCAGGGT-AGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
*** * * ** ** * * *** *** * **** ** ** ** *****
LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** **
LYC.ES_O CAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * ** * ** ** ***** * *
LYC.ES_O GGA-CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
*** **** * ******* ***** ** ***** * ****** ** *******
LYC.ES_O GATAACGGAC-CGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGC-----TAAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC
****** ** * * ** **** **** * * * *** ** ** * **
LYC.ES_O CACCACTTT
TET.ROS. -ACT-----
**
Mean pairwise ID: 55.41%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * ***** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_D TTTT-
***
Mean pairwise ID: 55.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
******** ****** * ********* * ** * ***** * ** *** * ****
LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAA-CTGTGGACCACCCATTCCAAGTT
* ** * * ** ** *** **** ** *** * *** ******
LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCA-AGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGT
ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGG
* ***** * * *** ***** **** * * * ********* *
LYC.ES_C GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG
* ************* **** ****** *** ** * ***** ** ********
LYC.ES_C ATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA
ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------
**** *** * * * **** * ***
LYC.ES_C CCACATTT
ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 55.59%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT
* **** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_H TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC
** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_H AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT
*** * * * * * *** **** * * * * ** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG
** * * * ************************** ** * * ****** * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA
********* *** ** ** * *** ** * * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT-
LYC.ES_H ACAACCACCTTTT
** *********
Mean pairwise ID: 55.63%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * ****
CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTT-CAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
* **** ****** *** * * * * *** ***** ** * ****** * ***
CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* ** * ** *** *** *** ** ** ** ******* *
CAE.EL_D TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ** **** * **** * ***** ***** *** * * **** * ***
CAE.EL_D CCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA---CTCAGTCT
***** ** * * *** * ** *** * ** ** ** * *
CAE.EL_D TT
FUG.RUB. TT
**
Mean pairwise ID: 55.66%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
*** **** *********** * ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_M G---GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
* * * * * * ********* ** ** * * * ********* ******
ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
* *** * * *** * *** ***** **** * *** *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ********************** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACC
LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA
****** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * **
ZEA.MA_F ACCATCTTT
LYC.ES_M ACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 55.66%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG-GAACAGT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****** *** **** ****** ******* **** ********* *** * *
ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTC-GGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCT-ACAAAC-TGTGGACCACCCATTCCAAGT
** * * * * * ** ** **** *** * * ** * **** ******
ARA.TH_D TGTG-AGTAATCTGTGTGGGTCA-GGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGC--ATCCCAACACTAAAGT-GGC
** * *** * * * * ****** **** * * * * ******* **
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT
ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
** * ************* **** ********** *** *** * **** *****
ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
**** ** *** * ** *** *
ARA.TH_D CACCACTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 55.81%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
*** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** * * * *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCT--GTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAA
** ****** * ** ** ** ** * *** ******* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT-GG
CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG
** * ***** * * * * **** * *** *** ** * * * **
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCT-CTACCTCTCGACTGTGG
** * **** ******* ********** **** ** * ** * ** ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC
***** ** **** * * ** ** * * * ** * ** ***
ZEA.MA_E CACCATCTTT
CIN.HYB. ACCCATTT--
**** *
Mean pairwise ID: 55.92%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** ** ***********
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_D TTTT
****
Mean pairwise ID: 55.95%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
* ** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** * * *
HUM.LU_B GGGT-CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT
* * ** * ***** **** ** ** *** * ***********
HUM.LU_B CGGG-AGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT-CCCAACAC-TAAAGTGGCG
* * *** ** * * *** ****** ** * * * * ** * * ** ***** *
HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
* ** ************* **** ********** **** ***** ** ** *******
HUM.LU_B GATAACGGGCCG--GTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGA
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTA-TAGGCCCAAT-----------------------------
***** * * ** ***** * ** ***
HUM.LU_B CCATTTCCTTT
ZEA.MA_H -----------
Mean pairwise ID: 55.96%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * ****
CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTT-CAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
* **** ****** *** * * * * *** ***** ** * ****** * ***
CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* ** * ** *** *** *** ** ** ** ******* *
CAE.EL_A TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ** **** * **** * ***** ***** *** * * **** * ***
CAE.EL_A CCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA---CTCAGTCT
***** **** * *** * ** *** * ** ** ** * *
CAE.EL_A TT
FUG.RUB. TT
**
Mean pairwise ID: 55.99%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
*** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** * * * *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCT--GTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAA
** ****** * ** ** ** ** * *** ******* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT-GG
CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG
** * ***** * * * * **** * *** *** ** * * * **
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGA
** * **** ******* ********** **** ** * ** * ** ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
CIN.HYB. AGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA
***** ** **** * * ** ** * * * ** * ** ***
ZEA.MA_G ACCATCTTT
CIN.HYB. CCCATTT--
**** *
Mean pairwise ID: 55.99%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
********* * ** *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** ** ** * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_M ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 56.13%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACC-CAAATGGGGGCATTAATGTGGT-GGAAT-G
TET.ROS. GCC-AGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG
*** ** *** *** ** *** *** * *** * ***** ** **** *
LYC.ES_G TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA
* * * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** **
LYC.ES_G CAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA
****** ** ** ** * * * ** * ** ** ***** * *
LYC.ES_G GGA-CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG
*** **** * ******* ***** ** ***** * ****** ** *******
LYC.ES_G GATAACGGAC-CGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCT-----AAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC
****** ** * * ** **** * *** * * * *** ** ** * **
LYC.ES_G CACCACTTTT
TET.ROS. -ACT------
**
Mean pairwise ID: 56.17%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
** ******* ** ** ******** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * *** ** ** ** *** ******* ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** ** * * * *** *** *** * * ******* ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * ******* ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_M CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 56.21%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
LYC.ES_M --------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGC
********* * ** ***** ******
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
LYC.ES_M TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA
***** * *** *** *** ** **** ****** ******* **
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
LYC.ES_M GTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACC
***** * * ** *** **** * * ***** ***** * * *
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
LYC.ES_M GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
** ********* ************ ** * ********* ***************
HUM.LU_B GGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
LYC.ES_M GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACAACC
*** ***** ** ** ** * * * *** * ** * ** *
HUM.LU_B TCCTTT
LYC.ES_M ACCTTT
*****
Mean pairwise ID: 56.25%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ***** * ****** ******* **
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
* ******** * * *** *********** ************** **********
LYC.ES_I TTTT
LYC.ES_D TTTT
****
Mean pairwise ID: 56.25%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ***** * ****** ******* **
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
* ******** * * *** *********** ************** **********
LYC.ES_N TTTT
LYC.ES_D TTTT
****
Mean pairwise ID: 56.31%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
*** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** * * * *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCT--GTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAA
** ****** * ** ** ** ** * *** ******* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT-GG
CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG
** * ***** * * * * **** * *** *** ** * * * **
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCT-CTACCTCTCGACTGTGG
** * **** ******* ********** **** ** * ** * ** ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC
***** *** **** * * ** ** * * * ** * ** ***
ZEA.MA_D CACCATCTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
**** *
Mean pairwise ID: 56.41%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGG---ACT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG
** ** * ** ** * *** * ** ** ** ******* *****
ZEA.MA_B TTGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGG-TCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGA
* *** * * * * **** * * *** * * **** *****
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
HUM.JA_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **** ******* *************** ** * *** ** * * ****
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC--CAGATCCTCTCTTAGCAA-
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
******** **** *** *** **** ** * * ****** *
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 56.44%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** *** ****** * ** *** * ***** **** ** **** *
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
**** ****** *** * ** * *** ***** ** * ***** * ***
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTCG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* *** * ** * *** *** * ** ** *** ******* *
CAE.EL_D TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * ***
CAE.EL_D CCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC-CACTTATCA
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT--
***** *** * * * * ******* * * ** **** ** ** *
CAE.EL_D TTT
XEN.LAE. ---
Mean pairwise ID: 56.44%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** *** ****** * ** *** * ***** **** ** **** *
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
**** ****** *** * ** * *** ***** ** * ***** * ***
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTCG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* *** * ** * *** *** * ** ** *** ******* *
CAE.EL_A TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * ***
CAE.EL_A CCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC-CACTTATCA
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT--
***** ***** * * * ****** * * ** **** ** ** *
CAE.EL_A TTT
XEN.LAE. ---
Mean pairwise ID: 56.48%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * ****
CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGC-TTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
* **** ****** *** * * * * * * ***** ** * ****** * ***
CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* * ** * ** *** *** ** ** ** ** ******* **
CAE.EL_B TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ** **** * **** * ***** ****** *** ** * **** * ***
CAE.EL_B CTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT-
**** **** * *** * ** *** ** ** *** * ***
CAE.EL_B T
FUG.RUB. -
Mean pairwise ID: 56.63%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * ** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_H GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** *
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
*** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * **** ******* ************ ** ** * *** ** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** *
ZEA.MA_B CCATCTTT-
LYC.ES_H CCACCTTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 56.63%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
*** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** **** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGT--TGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG
** ****** * **** ** * ** * ********* * *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG
* * **** * * * ****** *** ** * ** * * ***
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA
CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA
** * **** ******* ********** **** ** * *** * ** **** *
ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAACC
CIN.HYB. GGATTAC-AAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA
**** ** ****** * ** ** * * * * * * ** **
ZEA.MA_A ACCATCTTT
CIN.HYB. CCCATTT--
**** *
Mean pairwise ID: 56.68%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
***** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** *
LYC.ES_H GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** *
LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
*** ** ***** *** * * ** ** * *** **** *
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* *** ******************** ** ** ** ***** * *********
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC
*** ** ** ** ** **** * ** * * ** ***
LYC.ES_H ACCTTTT
TRI.AE_B ATCTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 56.81%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
*** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGC-TTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
* **** ****** *** * * * * * * ***** ** * ****** * ***
CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* * ** * ** *** *** ** ** ** ** ******* **
CAE.EL_C TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ** **** * **** * ***** ****** *** ** * **** * ***
CAE.EL_C CAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCAC
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT--CAGTCTT
**** **** * *** * ** *** ** ** *** ***
CAE.EL_C T
FUG.RUB. T
*
Mean pairwise ID: 57.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAG-TGGTTG--AACT
*** *** *** ** ** ** **** **** * *** * **** *** ** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA-----CCTGGCTTGCCCGTTC
** * *** ** **** * * * * ***************
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
CIN.HYB. CAAGTCGAG-AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATG-----TGAGCTT
***** * * ****** * * * ******** * ** **
ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
CIN.HYB. TAGAATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTC
** * * ** **** **** ******* ********** **** ** * ** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTT--CTGGCCCAGAGTCCCT
CIN.HYB. GACTGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGG----CTA
* ********** *** ** * * *** *** * * * *** * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
CIN.HYB. GCCCAACAGGACACCCATTT-
****** **** **
Mean pairwise ID: 57.01%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC--GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCA
** *** *** * ** * *** * ** ** ** ******* ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
HUM.JA_B AGCCGAGAGT-TGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCG
** * *** * * ** * * * * *** * *** * * *** ****
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
HUM.JA_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* ** * **** ******* *************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
HUM.JA_B AAGGATAACGG-GCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA
********* **** *** *** ** * * * * ** *** * *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT---
HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 57.05%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG--GAATGT
* **** *** *** ******* **** ** **** *** ****** * ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_N TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC
** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_N AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT
*** * * * * * *** **** * * * * ** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTG
** * * * ************************* *** ** **** * *****
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
*********** * ** ** * * ** * ** * * * * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_N ACCACCATTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 57.05%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_H GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ************ ************ ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_H AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT--
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 57.05%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_H GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * * * ****** * ** * * * * * ******* *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_H CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
* *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_H GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * **** ******* ************ ** ** ** *** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAA
LYC.ES_H AGGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * ***
ZEA.MA_A CCACCATCTTT-
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
* **** ****
Mean pairwise ID: 57.14%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
*** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** **** * * *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
** *** ** **** ** * ** * * ********* * ******
ZEA.MA_B GGTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** * * * * ****** *** ** * ** * *** *
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAAC-CTCTACCTCTCGACTGTGGAAG
* * **** ******* ********** **** ** * * ** * ** **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCA-ACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGG--CTAGCCCAACAGGACA
*** ******** * ** ** ** * * * ** * ** * * ** **
ZEA.MA_B CCATCTTT
CIN.HYB. CCCATTT-
** **
Mean pairwise ID: 57.14%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** ****** ** * **** ****** ** ** **** **** **
ARA.TH_G GA-TCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA--CCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* *** * * ** ** * *** * * * **** ***** ******
ARA.TH_G GTGAGTGAAC-CGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* ***** * * * * ******** * * * * ** * * **
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
* * ************* ********** **** ***** ***** * ***** **
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGC--TAGCCCAACAGGACA
* ** ** * * * ** *** * ** * ** *** * **
ARA.TH_G ACCATTTT
CIN.HYB. CCCATTT-
******
Mean pairwise ID: 57.19%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
***** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** *
LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * ** ** * *** * * * *********** ******
LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG
*** ** * *** **** * * ***** * *** *** ** *
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
*** * * ******* ************ ** ** ** ***** * *********
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC
*** ** ** ** ** **** * ** * * ** ***
LYC.ES_K ACCTTT
TRI.AE_B ATCTTT
* ****
Mean pairwise ID: 57.23%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA
* ***** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_K TTGGGCTTT-ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTT---CTGGCCTGCCCTGTC
** ** * * * ***** ** * ** * ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_K CAAGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC
**** * *** ** * *** *** * * ***** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_K TAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT
***** ** * ** ** ********************** ** ** ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LYC.ES_K GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC
* ************ ** * ** * * *** * * **
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_K CAATAAACAACCACCTTT
*** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 57.23%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GAACTT
* ** * * * * * ******** ** ******** ** ** ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
*** * * * *** ** * ** ** * ****** *******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGN--GCGCACTCCTAGACTGGAG
** ** * * * * ****** **** ** * **** * ***
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
** * *********** **************** ** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCT--CGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTG-ACTCTTAATAGGA
****** **** *** * ** ** * ** ** * ** * ** ** **
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
HUM.LU_C CCATTTCTTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 57.37%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA
* ***** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_H TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC
** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_H CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG
**** * * *** * * *** **** * ** ** *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_H TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT
******** * * ************ ************ ** ** ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LYC.ES_H GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC
* ************ ** * ** * * *** * * **
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT-
LYC.ES_H CAATAAACAACCACCTTTT
*** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 57.37%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_H GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ************ ************ ** ** ** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_H AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT-
LYC.ES_H CAACCACCTTTT
* **** ****
Mean pairwise ID: 57.38%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
****** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** *
LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * ** ** * *** * * * *********** ******
LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG
*** ** * *** **** * * ***** * *** ****** *
LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
*** * * ******* ************ ** ** ***** * **********
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA
** ** ** ** ** **** * ** * * ** ****
LYC.ES_A CCTTT
TRI.AE_B TCTTT
****
Mean pairwise ID: 57.51%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT
* ** * * * * * ******** ** ******** ** ** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA
*** * * *** **** * * ** * ** * ****** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGA
* ** ** * * * * * *** * *** * * * * *** * ***
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **************************** ** ****** * * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGAC
HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAG
******** ***** *** * * ***** *** * * * * * ** *** * *
ZEA.MA_D CACCATCTT----
HUM.LU_C GACCATTTCTTTT
***** *
Mean pairwise ID: 57.51%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA
** *** *** * ** * * * ** * ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGA-CCTGAAGTGG
HUM.JA_B GCCGAGAGTTGA-GCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG
* * *** * * * * * **** * *** * *** *** *** **
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG
** * ************ *************** ** ****** * * ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCC--TCACTAAGCA
HUM.JA_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAG
******** ***** *** * * **** * * * * **** ***
ZEA.MA_D GACCACCATCTT-
HUM.JA_B GACCATTTCTTTT
***** **
Mean pairwise ID: 57.57%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ************** ***********
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ******** ***********
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_D TTTT
***
Mean pairwise ID: 57.57%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
* **** ****** *** * ** ** *** * *** ** ******* ** **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCG-GTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTG-AGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * * ** ** ** * * ** ** *** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
GAL.GAL. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
** ***** *** * * * *** * ***** * * * ***** * **
CAE.EL_D ATTT
GAL.GAL. C---
Mean pairwise ID: 57.61%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
*** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** ** * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* * * * ***** * * ** **** **************
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT-GGCA
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTC-GGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG
* ***** * * ** *** **** * *** * * ** * * **
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAG
** * **** ****** ********** **** ** * ** * ** *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA---CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC
*** *** *** * * * ***** *** * ** ** ** * *** *
ZEA.MA_C ACCATTTTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
*** ***
Mean pairwise ID: 57.69%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_E G---GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA
* * * * * ** **** * * * ** * * * ** ****** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGG
* ** *** * * * * **** * **** * ** * ** **** *
ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG
*** * ************ *************** *** ** **** ** * ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG
ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
**** ** * * ** *** * * * * * *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ARA.TH_E ACCACCATTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 57.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_J GGGCTTTA----CCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
** * * * ****** * ** * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
*** * *** * * **** * **** *** * *** ** **
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA
LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** * ******************** ** ** ** *** * **** *
ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC
LYC.ES_J GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * ****
ZEA.MA_A CACCATCTTT
LYC.ES_J AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 57.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_K GGGCTTTA----CCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
** * * * ****** * ** * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
*** * *** * * **** * **** *** * *** *****
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA
LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** * ******************** ** ** ** *** * **** *
ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC
LYC.ES_K GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * ****
ZEA.MA_A CACCATCTTT
LYC.ES_K AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 57.79%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_L GGTTGACC-CAGATGGTTGGGTTCGG-TAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA
*** ** * ** ** ******** * ** **** ******* **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATG-GGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT
******* ** * ***** * *** * **** * ** * *** *******
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
*** ************************ ** ** ** ******* * ********
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACT--ATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC
** ***** ** *** **** *** * * * ** ** ** ***** * * ***
ARA.TH_C ATCACTTT
LYC.ES_L ACCACTTT
* ******
Mean pairwise ID: 57.83%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT
* ** * * * * * ******** ** ******** ** ** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA
*** * * *** **** * * ** * ** * ****** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGA
* ** ** * * * * * *** * *** * * * * *** * ***
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **************************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGAC
HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAG
************** *** * * ***** *** * * * * * ** *** * *
ZEA.MA_E CACCATCTTT---
HUM.LU_C GACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 57.83%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA
** *** *** * ** * * * ** * ** ** ****** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGA-CCTGAAGTGG
HUM.JA_B GCCGAGAGTTGA-GCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG
* * *** * * * * * **** * *** * *** *** *** **
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG
** * ************ *************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCC--TCACTAAGCA
HUM.JA_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAG
************** *** * * **** * * * * **** ***
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
HUM.JA_B GACCATTTCTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 57.84%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
****** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** *
LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * ** ** * *** * * * *********** ******
LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG
*** ** * *** **** * * ***** * *** ****** *
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
*** * * ******* ************ ** ** ** ***** * *********
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC
*** ** ** ** ** **** * ** * * ** ***
LYC.ES_J ACCTTT
TRI.AE_B ATCTTT
* ****
Mean pairwise ID: 57.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA
* ****** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_J TTGGGCTTT-ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTT---CTGGCCTGCCCTGTC
** ** * * * ***** ** * ** * ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_J CAAGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC
**** * *** ** * *** *** * * ***** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_J TAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT
******** * ** ** ********************** ** ** ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LYC.ES_J GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC
* ************ ** * ** * * *** * * **
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_J CAATAAACAACCACCTTT
*** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 57.88%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
****** **** **************** ** **** * **** *** * * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAG--CCGGCTTGCCCATCCCAAG
ARA.TH_G G---GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAG
*** * * ** ** * ***** *** * ** ****** *****
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
** **** * * ****** * ** * * * * * *
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC-CTCCCGCTCTCAGCAGTGGAC
** ** **** *********************** ** * *** ** ** * ****
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGC--AAA
ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
*** *** ** ** * *** * * ** * * * ** **
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
ARA.TH_G CCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 57.88%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCA
*** * ** *** * *** * *** * ** ** ** ******* ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
HUM.JA_A AGCCGAGAGT-TGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAG
** * *** * * ** * * *** * *** * ***** * *** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
HUM.JA_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* ** * **** ******* *************** *** ** *** * * ****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
HUM.JA_A AAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGA
********* * * **** * * * ** * *** ** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
HUM.JA_A CCATCTCTTTT
*** * ***
Mean pairwise ID: 57.88%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_H GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ************ ************ ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT-
LYC.ES_H AACCACCTTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 57.89%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ******** ***********
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_D TTTT
****
Mean pairwise ID: 57.89%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** *
CAE.EL_D ATTT
RAT.NOR. ----
Mean pairwise ID: 57.93%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
********** **** ******** * **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * **** ** ** *** ** *** * ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** * ******************** ** * ********** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA
** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * ***
ARA.TH_G ACCATTTT-
LYC.ES_M ACCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 57.93%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** * *** *** *** * * * ****** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
*** ** * * ** *** * * * ***** * ** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * ***
HUM.LU_C ATTTCTTTT
LYC.ES_K ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 58.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG--GAATGT
* ***** *** ** ******* **** * ******* *** ****** * ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_B TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC
** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_B AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT
*** * * * * * *** **** * * * * ** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG
** * * * ************************* *** * ***** * *****
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA
*********** * ** ** * * ** * * * * * ** * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_B ACCACCACTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 58.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG--GAATGT
******* *** ** ******* **** * ******* *** ****** * ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_I TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC
** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_I AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT
*** * * * * * *** **** * * * * ** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTG
** * * * ************************* *** ** **** * *****
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA
*********** * ** ** * * ** * ** * * * * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_I ACCACCATTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 58.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGG--TTGAAC-T
*** ** **** ** * * * * ** * ** * *** * ** **** *** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
CIN.HYB. TTGA--GCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCA
** * *** * * ** * **** * * * * *** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT-
CIN.HYB. AGTCGAG-AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATC
*** * * ** * ** * **** *********** * * **** *
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
CIN.HYB. GGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTG
** *** * ***** ****************** **** *** * ** * ** ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
CIN.HYB. GAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATAT--AACCAGCCTGGCTAGCCCAACAG
******* ** **** * * *** * * ** ** ** * ***
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
CIN.HYB. GACACCCATTT-
**** **
Mean pairwise ID: 58.12%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATA--
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_A TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
*** * * * ****** * ** * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
*** * * ** *** * * **** * **** *** * **** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT--CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** * ******************** ** * ** *** ** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** *
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_A CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 58.13%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAA----GATGGTGGAAC
* ****** *** ******* *********** **** * *** * * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATT----TGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATC
*** ** * * * ******** ** **** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ARA.TH_G CAAGCTGTG-AGTGAACCGTATGAACCA-AGCGAAGG--TTTGATCCGTACGGTTG--CT
**** ** * **** *** * * * ******* **** * * * *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
ARA.TH_G AAAGGTTGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCA
** ** * ** * **** *********************** ** ****** **
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
ARA.TH_G GCAGTGGACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAAC
* ***** *** *** * * ** * ** ** * ** * * *
ORY.SA_A CAAC--AGACCACCATCTTT
ARA.TH_G CCGCTTGAACCACCATTTT-
* * ******** **
Mean pairwise ID: 58.18%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA
* ****** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_A TTGGGCTTT-ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTT---CTGGCCTGCCCTGTC
** ** * * * ***** ** * ** * ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_A CAAGC-ACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC
**** * *** ** * *** *** * * ***** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_A TAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGT
******** * ** ** ********************** ** * ** ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LYC.ES_A GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC
* ************ ** * ** * * *** * * **
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_A CAATAAACAACCACCTTT
*** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 58.20%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_K GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** **
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_K AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT-
LYC.ES_K CAACCACCTTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 58.20%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_E G---GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA
* * * * * ** **** * * * ** * * * ** ****** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGG
* ** *** * * * * **** * **** * ** * ** **** *
ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
*** * ************ *************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAGA
ARA.TH_E CGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
**** ** * * ** *** * * * * * * *
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
ARA.TH_E CCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** *** * *** * * ***** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_D ATTT
HOM.SA_B T---
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
* **** ****** *** * ** ** *** * *** ** ******* ** **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCG-GTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTG-AGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * * ** ** ** * * ** ** *** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
GAL.GAL. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
** ***** ***** * * *** ** ***** * * * ***** * **
CAE.EL_A ATTT
GAL.GAL. C---
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** *
CAE.EL_A ATTT
RAT.NOR. ----
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_D ATTT
CAN.SPE. T---
Mean pairwise ID: 58.25%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** * *** *** *** * * * ****** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
*** *** * * ** *** * * * ***** * *** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********* *************
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * ***
HUM.LU_C ATTTCTTTT
LYC.ES_A ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 58.26%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAA----GGTGGTGGAAT
* ****** **** ** * ** *********** **** *** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
LYC.ES_E ATTGG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTAT
**** * * * *** ****** ** ** **** * ***** ***** *
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
LYC.ES_E CCAAGT-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAG-----AATGGGCTACTAGATTC
****** * *** ** * ** *** * * *** ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
LYC.ES_E CTAAAGTGGGGTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTG
********* * ** *********** *********** *** * ******
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
LYC.ES_E TGCAGTGGAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTT
* ************* * * * *** * * ** *** * * *
ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT-
LYC.ES_E CTAGTTAAACTACCACATTTT
* * ** **** ***
Mean pairwise ID: 58.28%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** *** ****** * ** *** * ***** **** ** **** *
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
**** ****** *** * ** * * * ***** ** * ***** * ***
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTGG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* * *** * ** * *** *** * * ** ** *** ******* **
CAE.EL_B TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
** * ** **** * **** * ***** *** ** *** ** * **** * ***
CAE.EL_B CTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC-CACTTGTTT
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT--
**** ***** * * * ******* *** ** **** ** ** *
CAE.EL_B TT
XEN.LAE. --
Mean pairwise ID: 58.28%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT
* ** * * * * * ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGAC-ACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA
*** * * *** * ** * ** * * ** ** * ******* ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAG-CGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
HUM.LU_C GCCGGGAG-GTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNG--CGCACTCCTAGACTG
* ** ** ** * ** *** ** * **** *** ** *** *** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
HUM.LU_C GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* ** * **** *********************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
HUM.LU_C AAGGATAACGG-GCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATA
********* **** *** * ******* * * ** *** * *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT---
HUM.LU_C GGACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 58.31%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAAC-TT
*** *** *** ** ** * **** *** * *** ** ** ***** ** * **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
CIN.HYB. TGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT
* ** ** **** **** ** * * *** **************
ZEA.MA_F TGGTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCT-GAAGCGGCA
CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG
* **** * ** * * ******** *** * ** * *** ***
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCT-CTACCTCTCGACTGTGGAA
**** **** ******* ********** **** ** * ** * ** **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC
**** *** **** * * * ** ** * * ** ***** ***
ZEA.MA_F CATCTTT
CIN.HYB. CCATTT-
* **
Mean pairwise ID: 58.33%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTG-GGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * *** *** * * *** *****
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **************************** ** ****** * * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG
******** ***** *** * *** * * * ** *** * *
ZEA.MA_D ACCATCTT----
HUM.LU_D ACCATTTCTTTT
***** *
Mean pairwise ID: 58.33%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA
** *** *** * ** * * * ** * ** ** ****** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGA-CCTGAAGTGG
HUM.JA_B GCCGAGAGTTGA-GCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG
* * *** * * * * * **** * *** * *** *** *** **
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * ************ *************** ** ****** * * ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCC--TCACTAAGCAG
HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG
************** *** * * **** * * * * **** *** *
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
HUM.JA_B ACCATTTCTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 58.33%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT
* ** * * * * * ******** ** ******** ** ** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA
*** * * *** **** * * ** * ** * ****** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGA
* ** ** * * * * * *** * *** * * * * *** * ***
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
** * **************************** ** ****** * * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGACC
HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG
************* *** * * ***** *** * * * * * ** *** * *
ZEA.MA_G ACCATCTTT---
HUM.LU_C ACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 58.39%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_N GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGA
* * ************ *********** **** * * **** * ******
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * **
ZEA.MA_D CACCATCTT-
LYC.ES_N CACCATTTTT
****** **
Mean pairwise ID: 58.39%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
****** **** **************** ** **** * **** ***** * * **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGT-TGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ARA.TH_G GGAT--CGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGC
* * ** * * ** ** * ** ** * ** *** ****** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ARA.TH_G TGTGAGTGAACCGTATGAACC-AAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
** **** * * * * *** *** * * * * * ** *
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG
** * **** ****** **************** ** ** *** * * * ***** *
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA-CTAAAGCAGAC
ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC
** *** * * ** ** * ** * ** ** ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
ARA.TH_G CACCATTTT-
*********
Mean pairwise ID: 58.42%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
* * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** **** * *** * *** * * * * *** ** * *********
RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
*** * * *********** ** **** * * * ******* ********
RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ******* * ********
RAT.RAT. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
**** *** ** * * * ***** * * ** * **** *
RAT.RAT. CTT
DRO.MEL. TTT
**
Mean pairwise ID: 58.42%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
* * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** * ****
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
* **** * *** * *** * * * * *** ** * *********
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
RAT.NOR. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * *********** ** **** * * * ******* ********
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ******* * ********
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
RAT.NOR. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTC
**** *** ** * * * ***** * * ** * **** **
DRO.MEL. TTT
RAT.NOR. T--
*
Mean pairwise ID: 58.44%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATA--
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_J TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
*** * * * ****** * ** * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
*** * * *** *** * * **** * **** *** * **** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** *
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_J CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 58.44%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATA--
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_K TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
*** * * * ****** * ** * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
*** * * *** *** * * **** * **** *** * **** *****
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** *
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_K CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 58.47%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA--
****** *** ** * *********** ** **** *********** ****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_E TTGGGCTG--TCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
*** * ** * * * ******* * ** * * * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_E T--ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGG
* ** ** * * * * ** * ** **** ** * *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_E GGTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
* * *** ******* *********** *** * * ** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA
LYC.ES_E AGGATAACGGA-CCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
********* * *** *** * ** * * * ** * * *** **
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT-
LYC.ES_E ACTACCACATTTT
** **** ***
Mean pairwise ID: 58.47%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * **
HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
*** * * ** *** * *** * ** * ** ******* *****
HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGA-GTGACCTGGGCGAAGGCT--GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGG
ZEA.MA_B TTGGTAGT--GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
** *** * **** * * * ***** *** **** * **** ** **
HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
** * **** *********************** ** *** ** * * ****
HUM.LU_D AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAG
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC--CAGATCCTCTCTTAGCAA
******** **** *** ** *** ** * * ****** *
HUM.LU_D GACCATTTCTTTT
ZEA.MA_B -ACCACCATCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 58.47%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
****** *** *********** ******* **** ** **********
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * ** * ** ** *** * * * * * * * * ****** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG
* ** *** * * ** * *** * **** ** * ** **** *
ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGG
*** * ************ *************** *** ** *** ** * ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC---A
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCA-CTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTG
**** * * ** * ** *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
ARA.TH_D GACCACCACTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 58.47%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGA---ACT
* ** * * * * * ******** ** ******** ** * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTG-TGACT-CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAG
*** * ** *** * ** * ** ** ** * ******* *****
ZEA.MA_B TTGGTAG-TGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC--GCACTCCTAGACTGGA
** ** ** *** * ***** *** ** *** **** * **
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC-CTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **** *********************** ** * *** ** * * ****
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAG---ACCCAGATCCTCTCTTAGCAA
HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAG
******** **** *** * ******* ***** * * * * ****** *
ZEA.MA_B -ACCACCATCTTT
HUM.LU_C GACCATTTCTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 58.52%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_K GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** **
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_K AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_K CAACCACCTTT
* **** ****
Mean pairwise ID: 58.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_H GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_H CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* *** * * ** * * * *** ** * * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * *********** ************ ** ** ** *** * * ******
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT-
LYC.ES_H AACCACCTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 58.52%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_E G---GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA
* * * * * ** **** * * * ** * * * ** ****** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGG
* ** *** * * * * **** * **** * ** * ** **** *
ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG
*** * ************ *************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG
ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
**** **** * ** *** * * * * * *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
ARA.TH_E ACCACCATTTT
******** **
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_A ATTT
CAN.SPE. T---
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** *** * *** * * ***** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_A ATTT
HOM.SA_B T---
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ****** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * **
CAE.EL_D ATTT
ORI.CUN. C---
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_D ATTT
HOM.SA_A TT--
*
Mean pairwise ID: 58.58%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** * *** *** *** * * * ****** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
*** *** * * ** *** * * * ***** * *** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * ***
HUM.LU_C ATTTCTTTT
LYC.ES_J ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 58.58%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACTTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
* ** ** * * * ******** *********** * *** **** *
HUM.LU_C GGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * * ** * ** * * * *** ** * * * **** *******
HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGA--GGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* * **** * * *** * * ***** *** * ** *** *
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
*** ***************************** ** ****** * * ********
HUM.LU_C ATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCA-ATTGGGCCTCGCAGCCTACTCC--AGCAGACC
**** ****** *** * ** * * * ** * * ** **** * ****
HUM.LU_C ATTTCTTTT
TRI.AE_A ACC------
*
Mean pairwise ID: 58.58%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_K GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCT--TGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
** * **** * ***** ** * * ********** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
LYC.ES_K ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGG
*** * ** ** * * ******** * **** ** **
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
LYC.ES_K CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAACA
***** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * **
ZEA.MA_C ACCATTTTT
LYC.ES_K ACCACCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 58.61%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** ****
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
* **** ****** *** * ** ** * * * *** ** ******* ** **
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** *** * ** * * *** * ** ** ** *** ******* *
CAE.EL_B GTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * **
CAE.EL_B ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTT
GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGTCT
* **** ***** * * *** * ***** *** * ***** *** *
CAE.EL_B TT
GAL.GAL. CC
Mean pairwise ID: 58.61%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
*** *** ****** * ** *** * ***** **** ** * **** *
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
**** ****** *** * ** * * * ***** ** * ***** * ***
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTGG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* * *** * ** * *** *** * * ** ** *** ******* **
CAE.EL_C TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
** * ** **** * **** * ***** *** ** *** ** * **** * ***
CAE.EL_C CAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC-CACTTGTCA
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT--
**** ***** * * * ******* *** ** **** ** ** *
CAE.EL_C CT
XEN.LAE. --
Mean pairwise ID: 58.63%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
*** **** ****** * * **** * **** *** * *** ***** *** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGA-TGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
* *** * * **** ** ** ***** ***** ******
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACT-TGGCCTTTAGAGTGGGATGG
CIN.HYB. AGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGG
***** ** *** ** ** **** * * * ** ******* * ** **
LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
CIN.HYB. CAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGA
* ***** ****************** *** * * **** * *********
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
CIN.HYB. TTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCC--TGGCTAGCCCAACAGGACACC
* ** ** * * ** * * * ** * * * * * *** ** **
LYC.ES_F CACTTTT
CIN.HYB. CATTT--
** **
Mean pairwise ID: 58.65%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_G GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
** * * * ****** * ** * * * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_G C--ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGG
** ** * * * * ** * ** **** ** * *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_G GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
* * **** ******* *********** *** * * ** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA
LYC.ES_G AGGATAACGGA-CCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
********* * *** *** * ** * * * ** * * * * ** **
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
LYC.ES_G ACCACCACTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 58.65%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTG-GGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * *** *** * * *** *****
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **************************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG
************** *** * *** * * * ** *** * *
ZEA.MA_E ACCATCTTT---
HUM.LU_D ACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 58.71%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * ** *** * *** * * * ** * ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA
* * *** * * * * *** * *** **** * * *** *** **
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * ************ *************** *** ****** * * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCC-CAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGAC
******** ** ** *** * * *** * * * ** *** *****
ZEA.MA_D CACCATCTT-
HUM.JA_A CATCTCTTTT
** * **
Mean pairwise ID: 58.71%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_A GGGCTTTA----CCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
** * * * ****** * ** * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
*** * * *** * * **** * **** *** * *** ** **
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA
LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCG-CTCTGTGCAGTGGAA
* * ** * ******************** ** * ** *** *** * **** *
ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC
LYC.ES_A GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * ****
ZEA.MA_A CACCATCTTT
LYC.ES_A AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 58.73%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA
*** * * * *** * *** * *** * ** * ** ******* ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAG-CGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGC
HUM.LU_D AGCCGGGAGT-TGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT--GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT
** ** *** * * ** * * ** * **** *** **** * *** ***
ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
HUM.LU_D GGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG
** ** * **** *********************** ** ** *** * * ***
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA
HUM.LU_D GAAGGATAACGG-GCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAAT
* ********* **** *** ** * * * ** *** *
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT---
HUM.LU_D AGGACCATTTCTTTT
* ***** * *
Mean pairwise ID: 58.79%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** * * **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** * * ** * * ** * * * ****** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTT--GGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * *** * * ****** **** ** * * * ***
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
** * **** *********************** *** ** ** ** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAGCA
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
**** *** ** * ** ** ** *** *** * * *
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
ARA.TH_F AACCACCATTTT-
********* **
Mean pairwise ID: 58.79%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
*** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * **
HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAG
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
*** * * ** *** * *** * ** * ** ******* *****
HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGA-GTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCAC-GTCCTAGAGTGG
ZEA.MA_B TTGGTAGT--GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
** *** * **** * * * ***** * * ** * * * **** ** **
HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
** * **** *********************** ** *** ** * * ****
HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC--CAGATCCTCTCTTAGCAA
******** **** *** ** * *** ** * ** ****** *
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
ZEA.MA_B -ACCACCATCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 58.82%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** **** ****** * * *** ****** * *************** ***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
LYC.ES_A GGCTTTACC-AGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
**** * ** ****** ** * ***** ***** ****** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCGG
**** ** ** * ** * *** *** *** ** * * **** *
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** * ******* ********** * *** * * * *** * **********
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC
* * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** **
CIN.HYB. ATTT--
LYC.ES_A ACCTTT
* *
Mean pairwise ID: 58.84%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_J GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_J AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT-
LYC.ES_J CAACCACCTTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 58.88%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ****** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC
** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * **
CAE.EL_A ATTT
ORI.CUN. C---
Mean pairwise ID: 58.88%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_A ATTT
HOM.SA_A TT--
*
Mean pairwise ID: 58.88%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_D ATTT
RAT.RAT. TT--
*
Mean pairwise ID: 58.90%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
** **** * *** *** *** ** * ***** *******
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
*** *** * * ** **** * * ** ** * *** * *
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************** ************ ** * ********** *************
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * ***
LYC.ES_H ACCTTTT--
HUM.LU_C ATTTCTTTT
* * **
Mean pairwise ID: 58.92%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
*** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA
*** * * * *** * *** * *** * ** * ** ******* ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
HUM.LU_A AGCCGGGAGT-TGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTG
** ** *** * * ** * * ** * *** ***** * * *** *** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* ** * **** *********************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
HUM.LU_A AAGGATAACGG-GCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATA
********* **** *** ** * * * * * ** *** * *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT---
HUM.LU_A GGACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 58.94%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
***** * ****** ******* * **** ** * ** ** * * ****
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * **
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* *
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
RAT.NOR. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT-
** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** *
CAE.BRI. TT
RAT.NOR. --
Mean pairwise ID: 58.94%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
***** * ****** ******* * **** ** * ** ** ****
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTG-GGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA
* *** ****** *** ** ** ** ** * * *** ** ******* ** **
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** ** * ** ** *** *** ** ** ** ******* *
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
** **** ***** * * * ** * ***** * * ***** * **
CAE.BRI. TT
GAL.GAL. --
Mean pairwise ID: 58.96%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
*** *** ** ** ** * * ** ** *** *** ** * * *** ** * *
CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
* ** ** **** *** * * ***** **************
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
TRI.AE_B GGTAGTGGGCT-GGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTT--AAGTGGCAG
* ****** * ** * * ***** *** * ** ** ** ** *
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTC-CAACGGTGGAAGG
*** ********************** **** *** * * ** * ** ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCC-CAACAGGACAC
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
** *** **** * * * *** * * * * *** * *** * *** ***
CIN.HYB. CCATTT-
TRI.AE_B CATCTTT
* **
Mean pairwise ID: 58.96%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** ****** ** * * ** * **** ** * ** ***** **** **
ARA.TH_D -GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA--CCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* * * * ** ** *** * * * *** ***** ******
ARA.TH_D GTGAGTAA-TCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** * *** ********* * * * * * * ** * **** **
ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
* ******* ****************** **** ** ** ** * * ***** **
ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCT-AGCCCAACAGGACAC
** * * ** *** *** ** ** *** ** ** * * * * * ****
ARA.TH_D CCACTTT
CIN.HYB. CCATTT-
*** **
Mean pairwise ID: 58.97%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
*** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * * * *** * * * *** *****
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **************************** ** ****** * * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
******** ***** *** * * *** * * ** ** *** * *
ZEA.MA_D ACCATCTT----
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT
***** *
Mean pairwise ID: 58.97%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
****** *** *********** ******* **** ** **********
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * ** * ** ** *** * * * * * * * * ****** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG
* ** *** * * ** * *** * **** ** * ** **** *
ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGA
*** * ************ *************** *** *** *** ** * ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC---AG
ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCA-CTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG
**** * * ** * ** *** ** ***** * ** * *
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
ARA.TH_D ACCACCACTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ARA.TH_E -GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
*** * * * * * ** * * ** ** * ** *** ****** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCT-TGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA
** *** ** * * *** **** *** * *** *** * *
ZEA.MA_C GGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
** * *********** *************** *** ** *** * * *****
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
**** **** * * ** * * ** * * * * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
ARA.TH_E CACCATTTT-
*********
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * ** *** * *** * * * ** * ** ** ****** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA
* * *** * * * * *** * *** **** * * *** *** **
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * ************ *************** *** ** *** * * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCC-CAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGAC
*********** ** *** * * *** * * * ** *** *****
ZEA.MA_E CACCATCTTT
HUM.JA_A CATCTCTTTT
** * ***
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA--
****** *** ** * *********** ** **** ********* * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA
*** * ** * ******* * ** * * * *** ***** ******
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAAT-GGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
*** * * * * ** * * ***** * *** ** * **** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_E GGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAA-AAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
* * *** ******* *********** *** * * ** *** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAACC
LYC.ES_E GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACT
****** *** *** * ** * * * ** * * *** ****
ZEA.MA_B ACCATCTTT-
LYC.ES_E ACCACATTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_N GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC--GCTCTAAGCGGTGGA
* * ************ *********** **** * * * *** * ******
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
********* * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * **
ZEA.MA_E CACCATCTTT
LYC.ES_N CACCATTTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_K GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** **
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ********************** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
LYC.ES_K GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_K AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--T
** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC
* ** * * ** * ** * ** ** ** *** *** ****** *******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTC-TGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG
* *** * * * ** ** *** * *** * * **** ** **
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
** * *********** *************** ** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCC-TAGACTTCATACTAAAGCAGAC
HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
****** **** *** ** *** * * * * * ** * * ** ** ***
ZEA.MA_C CACCATTTTT
HUM.JA_B CATTTCTTTT
** ****
Mean pairwise ID: 59.06%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAA----GATGGTGGGAC
* ****** **** * * *** ********* * **** ** *** * * **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATG---TTTCTGAGCTGCCCAGTC
**** ** * ** ** * **** * * ** *** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ARA.TH_A CAAGCTGTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATG-----CAGGTTC
**** ** * *** * * ** ******** * ** * ** *
ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
ARA.TH_A TAGAGTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTAC
** *** ** ** * **************************** *** ******* *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
ARA.TH_A AGCAGTGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATC
* * ***** **** ** * * * ** * ** ** * * ****
ORY.SA_A ACA-ACAGACCACCATCTTT
ARA.TH_A TCATATGAACCACCATTTT-
** * ******** **
Mean pairwise ID: 59.08%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
* * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** ** ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** **** * *** * *** * * * * *** ** * *********
HOM.SA_A AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
*** * * *********** ** **** * * * ******* ********
HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ******* * ********
HOM.SA_A GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
**** *** ** * * * ***** * * ** * **** *
HOM.SA_A CTT
DRO.MEL. TTT
**
Mean pairwise ID: 59.08%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** * * * *** * * ***** * **
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * *
CAE.EL_B TTT
HOM.SA_B T--
*
Mean pairwise ID: 59.08%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ** ** * * * *** ** * ***** * **
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * *
CAE.EL_B TTT
CAN.SPE. T--
*
Mean pairwise ID: 59.08%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * **
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * *
CAE.EL_B TTT
RAT.NOR. ---
Mean pairwise ID: 59.15%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** ** ******* * * * * ****** * * ** * * * * ** ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* ** * * **** * * * ***** **** ********
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** * **** **************** ** * **** * ****
ARA.TH_C G-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
* * **** ****************** *** ***** **** *** ********
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACC
***** *** * * ** ** *** *** ** ** * ****
ARA.TH_C CACTTT
CIN.HYB. CATTT-
** **
Mean pairwise ID: 59.15%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
***** *** ** * ****** ***** ****** ** * * **** * *** *
LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** *
LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
*** ** ***** *** * * ** ** * *** **** *
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
* *** ******************* *** ** * **** * ************
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTA-ACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCACC
*** * ** ** ** * ** * **** * ** * * ******
LYC.ES_N ATTTTT
TRI.AE_B ATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG--GAACAG
****** *** *********** ******* **** ** ********** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGT-TGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ARA.TH_D TGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
**** * * ** * ** * * * * * ** ****** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGAC-CTATAGTGGC
ARA.TH_D TGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGC--TTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG
** *** * ** * * **** **** * * ** *** *** *** *
ZEA.MA_C AGGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGA
*** * *********** *************** *** ** ** * * *****
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA
**** * ** * * * * * ** * ** *** ** **
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
ARA.TH_D CCACCACTTT-
****** ***
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_A GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC--CCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** * *** ***** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT-
LYC.ES_A CAACCACCTTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_J GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** ** ** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_J AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_J CAACCACCTTT
* **** ****
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTG-GGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * *** *** * * *** *****
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
** * **************************** ** ****** * * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACCA
HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
************* *** * *** * * * ** *** * * *
ZEA.MA_G CCATCTTT---
HUM.LU_D CCATTTCTTTT
**** * *
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** * * * * * ******* *** ******** ** ** * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.LU_C GGTCAACCCAG--TGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC
** * *** * ** * ** ** ** ** * ****** *******
ZEA.MA_F TGGTTG-TGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGG
** * *** * *** * ********** * * * *** * ** *
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
*** **************************** ** ****** * * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG--AGCCTCA---TTAAACAGA
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA
****** ***** *** **** *** * ** ** * ** * **** **
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
HUM.LU_C CCATTTCTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 59.21%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * **
CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
*** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *
CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC
RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * **
CAE.EL_A ATTT
RAT.RAT. TT--
*
Mean pairwise ID: 59.22%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_N GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAA
* * ************ *********** **** * * **** * ****** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGACC
LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * ***
ZEA.MA_G ACCATCTTT
LYC.ES_N ACCATTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 59.22%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_J GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCT--TGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
** * **** * ***** ** * * ********** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
LYC.ES_J ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
*** * ** ** * * ******** * **** *****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
LYC.ES_J CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAACA
***** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * **
ZEA.MA_C ACCATTTTT
LYC.ES_J ACCACCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 59.24%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA
* ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA
*** * ** *** * *** * *** * ** * ** ******* ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
HUM.LU_B AGCCGGGAGT-TGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTG
** ** *** * * ** * * ** * *** ***** * *** *** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
HUM.LU_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGG
* ** * **** ******* *************** ** ** ***** * ****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAGC
HUM.LU_B AAGGATAACGG-GCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATC
********* **** *** *** * * * * * * * *** *** ** *
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
HUM.LU_B GGACCATTTCCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 59.27%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG
***** * ****** * ****** * ***** **** ** **** *
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
*** ****** *** ** ** * ** * * *** ** * ***** * ***
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCA-TAAGGAGTGG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
* * ** * ** *** * *** ** ** ** ** ******* **
CAE.BRI. TGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
** ** *** **** * **** * ****** *** ** *** ** * **** * ***
CAE.BRI. TAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGAC-CACTTGTCA
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT--
* **** ***** * * ** * ******* * ** **** ** ** *
CAE.BRI. TT
XEN.LAE. --
Mean pairwise ID: 59.27%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
***** * ****** ******** * **** ** * ** ** * ****
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * **
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* *
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * **
CAE.BRI. TT
ORI.CUN. --
Mean pairwise ID: 59.27%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
***** * ****** * ****** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* *** ****** *** ** *** ** ** * * *** * * ***** * **
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* *
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
HOM.SA_B ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * * **
CAE.BRI. TT
HOM.SA_B --
Mean pairwise ID: 59.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** **** ****** * * **** ****** ** * * ** ***** *** ***
LYC.ES_E GGCT-GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
*** * * ** * * **** ** * ***** ***** ******* *
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG-
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** ****** * * *** * *** * ** ** * * *** **
LYC.ES_E -ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
* *** ****************** ****** ** ** * * **********
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
** **** * * * * ** *** ** * **** * * ** **
LYC.ES_E ACATTTT
CIN.HYB. ATTT---
* *
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA
* ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * ** *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * ** * *** * * *** *****
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCCCGGCAGTGGA
** * ************ *************** ** ****** ** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT---AAGCAG
HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG
******** ***** *** * * * *** * * * * *** *** ** * *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT-
HUM.LU_B ACCATTTCCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA--
******* *** ** * *********** ** **** *********** ****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_O TTGGGCTG--TCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
*** * ** * * * ******* * ** * * * * *** ***** *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_O C--ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGG
** ** * * * * ** * ** **** ** * *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA
* * **** ******* *********** *** * * ** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA
LYC.ES_O AGGATAACGGA-CCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA
********* * *** *** * ** * * * ** * * * * ** **
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
LYC.ES_O ACCACCACTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
****** *** *********** ******* **** ** **********
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * ** * ** ** *** * * * * * * * * ****** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG
* ** *** * * ** * *** * **** ** * ** **** *
ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGG
*** * ************ *************** *** *** *** ** * ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC---A
ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCA-CTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTG
**** * ** ** * ** *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_D GACCACCATCTT
ARA.TH_D GACCACCACTTT
******** **
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
*** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * * * *** * * * *** *****
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **************************** ** ** *** * * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG
************** *** * * *** * * ** ** *** * *
ZEA.MA_E ACCATCTTT---
HUM.LU_A ACCATTTCTTTT
***** * *
Mean pairwise ID: 59.35%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
****** *** * ************* * **** **** ** *** * * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGAC-TCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
ARA.TH_E G-GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC
* *** ***** * ** * ** * * * * ** ****** *****
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTT-GGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG
** *** * * ** ****** **** ** ** *** ** * **
ZEA.MA_B GA-ATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGAC
* * **** ******* *************** *** *** *** ** * ****
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTA-GCAAAC
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
**** *** * * *** * * * * * *** *** * ***
ZEA.MA_B CACCATCTTT
ARA.TH_E CACCATTTT-
****** **
Mean pairwise ID: 59.35%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
****** *** *********** *** ** **** ** ********** **
ARA.TH_D GTTCAAT---TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCAC-TGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
* * ** ** ** * ** ** ** * * * ****** ******
ARA.TH_D CTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGCA
** ** *** ** ** ********* ** * ** *** ***
ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGGAT
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
** * ************ *************** *** *** *** ** * ****
ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGAC
**** * ** ** * * ** *** ** ** * ** * ***
ARA.TH_D CACCACTTT-
ZEA.MA_F CACCATCTTT
***** **
Mean pairwise ID: 59.35%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
****** *** * ************ * * **** **** ** ***** * * *
ARA.TH_E GGTT--CGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCAC-TGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
* *** * * ** * ** *** ** ** * * ** ****** ******
ARA.TH_E CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGC-GGCA
** ** *** * ** ******** *** * ** *** **
ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGAC
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
** * ************ *************** *** ******* ** * ****
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGAC
**** **** * ** *** ** * * * * * * **
ARA.TH_E CACCATTTT-
ZEA.MA_F CACCATCTTT
****** **
Mean pairwise ID: 59.35%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_I GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGA
* * ************ *********** **** * * **** * ******
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * **
ZEA.MA_D CACCATCTT-
LYC.ES_I CACCATTTTT
****** **
Mean pairwise ID: 59.41%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
* * ** * **** ** ***** ** * *** ** * * **** * ****
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTCGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
** **** * *** * *** * * * * *** ** * *********
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
ORI.CUN. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * *********** ** **** * * * ******* ********
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ******* * ********
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
ORI.CUN. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC-CTGTC
**** *** ** * * * ***** * * ** * **** * **
DRO.MEL. TTT
ORI.CUN. TCC
*
Mean pairwise ID: 59.41%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * * ****
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * *** ** * * * *** * * ***** * **
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * **
CAE.EL_C ACT
HOM.SA_B T--
Mean pairwise ID: 59.41%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * **
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * *
HOM.SA_A TT-
CAE.EL_B TTT
**
Mean pairwise ID: 59.41%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT
*** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * **
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * **
HOM.SA_A TT-
CAE.EL_C ACT
Mean pairwise ID: 59.41%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ** ** * * * *** ** * ***** * **
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * **
CAE.EL_C ACT
CAN.SPE. T--
Mean pairwise ID: 59.42%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* ** ** ******** ***** ****** * * ** **** * * **
ARA.TH_G GGAT-CGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
* * *** ** * * * ** ** * **** ****** ****** *
ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAG--GCCTTAAGTGGCAGG
* **** * * ** ***** * ** * * * ** * ** * **
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* *********** **************** ** * ***** ** * ***** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC--GCCATAGCAGACCA
*** * ** ** ** ** ** *** ** * * * ** ****
ARA.TH_G CCATTTT-
TRI.AE_B CCATCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 59.42%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** * *** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
LYC.ES_C GAACAT-GCCCAGAAGGTAGGGCTTGTG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
* * * *** * ** ** ** ********** ******
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCT-TGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGT
*** * * * * *** **** ****** * * **** *****
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
LYC.ES_C GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* ** *********** *********** *** * ** *** * * ********
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA
LYC.ES_C ATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA
***** **** ** ** * ** ** * ** * * * ** *
ZEA.MA_C CCATTTTT
LYC.ES_C CCACATTT
*** ***
Mean pairwise ID: 59.48%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** ** *** * ********* ****** *** * *** ** **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * ** *** * ** ** ** * ******** ******* *
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGTA
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCA
*** ** ** ********* ** ** ****** *
ARA.TH_F ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGATC
HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
********************************** ******* * ******** ****
ARA.TH_F ACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCACC
HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT
**** * * ** * ** ** * **** * ** *** * * ****
ARA.TH_F ATTTT-
HUM.LU_C TCTTTT
***
Mean pairwise ID: 59.48%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
* **** ****** * * *** ****** * *************** ***
LYC.ES_K GGCTTTACC-AGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
**** * ** ****** ** * ***** ***** ****** *
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCGG
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** *** * ** * *** *** *** ** * ***** *
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
* ** * ******* ********** * *** * *** **** * **********
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
* * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** **
LYC.ES_K ACCTTT
CIN.HYB. ATTT--
* *
Mean pairwise ID: 59.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
****** *** ** * *********** ** **** *********** * ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_E GGG--CTGTCCCAGATGGCTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** ***** * ***** ** ** ********** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * * * * * ****** * **** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* ** ********** *********** *** * * *** * * ******
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_E GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
******* * ** *** * ** **** **** * * * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT-
LYC.ES_E TACCACATTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 59.49%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_A GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCC--GCTCTGTGCAGTGGA
* * ** ********************** ** * *** * *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA
******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_A CAACCACCTTT
* **** ****
Mean pairwise ID: 59.54%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTG---G
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCG--GGAGGCTGAGCCCGCCGG
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** * **** * *
CAE.EL_C ATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCC
GAL.GAL. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
** * **** ****** *** * ** ** * * * *** ** ******* **
CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * ** *** * ** * * *** * ** ** ** *** *******
CAE.EL_C TGGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC
GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** *
CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT
GAL.GAL. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGT
*** **** ***** * * *** * ***** *** * ***** ***
CAE.EL_C CACT
GAL.GAL. CTCC
* *
Mean pairwise ID: 59.55%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * ** *** * *** * * * ** * ** ** ****** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA
* * *** * * * * *** * *** **** * * *** *** **
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
** * ************ *************** *** ****** * * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCC-CAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC
********** ** *** * * *** * * * ** *** ******
ZEA.MA_G ACCATCTTT
HUM.JA_A ATCTCTTTT
* * ***
Mean pairwise ID: 59.56%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTG-TGGTGG--AATG
**************** * ** ****** **** * ***** * * *** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_C TTGAACATG--CCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC---AATTCT-CTGGCCTGCCCTGTC
** ** * ** * ** * *** *** * ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_C CAAGCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCA-AGCGAAGGCTTGGG-----CTGCTGGGCTCC
**** * **** * **** ******** * * ** ** * **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_C TAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGT
******** * ** ************ *********** *** * ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTG-CACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
LYC.ES_C GCAGTGGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTC
* ************* ** ** ** * * * * ** * * * * *
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_C TAGTTAAACTACCACATTT
* ** **** ***
Mean pairwise ID: 59.60%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
***** * ****** ******** * **** ** * ** ** * ****
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTG-GGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* *** ****** *** ** ** ** ** * * *** ** * ***** * **
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
* * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* *
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
** **** ***** * * * ** * ****** * * * ***** * * **
CAE.BRI. TT
CAN.SPE. --
Mean pairwise ID: 59.61%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** ***** ** * **** ** *** ** ** * **** **** **
ARA.TH_E -GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA--CCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* * ** * * * ** ***** * * **** ***** ******
ARA.TH_E GTGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** * * *** * ********** ** * * * * ** * * ** **
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
* ******* ****************** **** ** ** ** * * ***** **
ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA-GGACAC
** *** * ** ** ** ** *** ** ** * * * * * * **
ARA.TH_E CCATTTT
CIN.HYB. CCATTT-
******
Mean pairwise ID: 59.62%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA
* ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * ** *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * ** * *** * * *** *****
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCCCGGCAGTGGA
** * ************ *************** ** ** *** ** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT---AAGCAG
HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG
************** *** * * * *** * * * * *** *** ** * *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
HUM.LU_B ACCATTTCCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 59.67%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** * **** ****** *******
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** * * * *** *** * ******** ** * *
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * * ********* *************
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT
** ********* * * * ** * ** * * ** * *
LYC.ES_A CCTTT
HUM.JA_A CTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 59.67%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** * **** ****** *******
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
***** ** * * * *** *** * ******** ** * *
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** ** ********** *************
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT
** ********* * * * ** * ** * * ** * *
LYC.ES_K CCTTT
HUM.JA_A CTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 59.67%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
* * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** * ****
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTT-CTGGGCTGCAGTGCG--CTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT
** **** * *** * *** * ** * * *** ** * ******* **
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCAT-TCAGGTTGGCTAAGGA
GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAG-CCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA
*** * *********** * * **** *** **** ******* *******
DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT
GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC
*** ******** ***** **** ***** * * ******* * *****
DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTAT-CAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA
GAL.GAL. GGGATCGCGCCTGTGAATAG-CCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC-CTG
***** *** ** * * * * * **** * * ** * **** *
DRO.MEL. TCTTT
GAL.GAL. TCTCC
***
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_B GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCCGCTCTAAGCGGTGGA
* * ************ *********** **** * * ***** * ******
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
******** * ** ** ** *** *** * * * * ** * **** * **
ZEA.MA_D CACCATCTT-
LYC.ES_B CACCACTTTT
***** **
Mean pairwise ID: 59.68%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
** ** ** * ** ******** *********** * *** * ** *
HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* ** * ** * * ** * ** *** ** ***** * **** *******
HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACG-AAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* * ** * * ** * * * * * **** * * * * *** * ** *
HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
*** ************ ******************* ****** * * ********
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGC--AGCCTACTCC--AGCAGAC
**** ****** *** * * * ** * * ** * *** **** * ***
HUM.JA_B CATTTCTTTT
TRI.AE_A CACC------
**
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
****** *** * ************* * **** **** ** ***** *** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGT-GACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ARA.TH_E --GGTTCGGGTCCACGGGCC--GGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCA
* ** * ***** ** ***** * ** * * ** ****** ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ARA.TH_E AGCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTT-GGCTCAAACGGCTTCTAAAGTT
** ** *** *** * * ** ****** **** ** ** ** **
ZEA.MA_A GCAGGA-ATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
* *** * **** ******* *************** *** ** ** ** * ***
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAG
ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA
* **** ** ** * ** ** ** *** *** * * *
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
ARA.TH_E TGAACCACCATTTT-
********* **
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_J GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ********************** ** ** ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
LYC.ES_J GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_J AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
****** *** *********** ******* **** ** ********** * *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * ** * ** ** * * ** * ***** * * * ****** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTGGAG-C
ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTT--GACTCAGGCGGATTCTAAAGTC
* ** *** *** *** ** ***** **** * ** ** ** ** *
ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
ARA.TH_D GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTG
** ** * **** ******* *************** *** ** ** ** * ***
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC--
ARA.TH_D GATGGATCAT-AGTTCGAAGT-CTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCC
* **** * * ** * ** * ** *** *** * ** *
ZEA.MA_A -AAACCACCATCTTT
ARA.TH_D TGGACCACCACTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 59.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAA----GGTGGTGGAAT
******** **** ** * ** *********** **** *** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
LYC.ES_O ATTGG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTAT
**** * * * *** ****** ** ** **** * ***** ***** *
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
LYC.ES_O CCAAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAG-----AATGGGCTACTAGATTC
***** * *** ** * ** *** * * *** ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
LYC.ES_O CTAAAGTGGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTG
********* * ** ************ *********** *** * ******
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
LYC.ES_O TGCAGTGGAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCT
* ************* * * * *** * * ** *** * * **
ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT
LYC.ES_O CCAATTAAACCACCACTTT-
*** * ******* **
Mean pairwise ID: 59.74%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * **
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * *
RAT.RAT. TT-
CAE.EL_B TTT
**
Mean pairwise ID: 59.74%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACAC-
****** *** * * ************ * **** ******* *** * *** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAG--CCGGCTTGCCCATCCCAAG
ARA.TH_F -TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
** **** ** ** ** * **** * * * ****** *****
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTACAG-CG
ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG----CTTGCAGGTTCTAGAGTCG
** *** * * * * ****** **** * ***** *** ** **
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
ARA.TH_F GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTG
* ** * **** *********************** *** *** *** ** * ***
ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTA-GCA
ARA.TH_F GACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
* **** ** * * *** * * * * * *** *** *
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
ARA.TH_F AACCACCATTTT-
********* **
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* *** * * ** *** *** * **** ****** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** * *** * *** * * ******** ** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA-ACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * ********** *************
HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * ****
HUM.JA_B TTTCTTTT
LYC.ES_A CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 59.74%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** ** * ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * **
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * **
RAT.RAT. TT-
CAE.EL_C ACT
Mean pairwise ID: 59.74%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ****** * * * *** ** * ***** * **
CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT
ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** ***
CAE.EL_B TTT
ORI.CUN. TCC
*
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* *** * * ** *** *** * **** ****** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
***** * * * ** * *** * *** * * *********** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * ********** *************
HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * ****
HUM.JA_B TTTCTTTT
LYC.ES_K CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* *** * * ** *** *** * **** ****** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** * *** * *** * * ******** ** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * ********** *************
HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * ****
HUM.JA_B TTTCTTTT
LYC.ES_J CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 59.74%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GGACTT
*** * * *** *** *** **** ** ******* ** ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
HUM.JA_B TAGTTCG---GCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCA
* *** ** * * ** ** * ** *** * ** ** * **** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
HUM.JA_B AGCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCC-GGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCG
** * * * * * * *** ** ****** * * ** **** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.JA_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* *** * ***************************** *** ****** * * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCC--TTCCATGGCA
HUM.JA_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAG
*************** *** ** * *** * * * * ** **
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
HUM.JA_B GACCATTTCTTTT
***** * ***
Mean pairwise ID: 59.74%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG--GAATAT
******* *** *** ******* **** ** **** ********** * **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_O TGGGCTGTC----CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTATCC
** ** * * * *** ** ** *** * * * * **** **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_O AAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT
*** * ** * * * * *** * * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
** * * * ************************ *** * * ****** * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC-A
LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
************ *** *** ** * * ** *** * * ** * *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
LYC.ES_O AACCACCACTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 59.74%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
*** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * ****
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
** **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * **
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC---CGTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** ***
CAE.EL_C ACT
RAT.NOR. TCT
**
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** *** *** * **************** * * ***** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** **** * *** *** *** ** * ***** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
*** *** * * ** **** * * ** ** * *** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** ** * ****** ** **********
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG-CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGA-TGGGTTG--CTCCAATTAAACCA
**** * ***** * **** *** * * * **** ** *** ****
HUM.LU_C TTTCTTTT
LYC.ES_N CCATTTTT
****
Mean pairwise ID: 59.80%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** **** ****** * * *** ****** * *************** ***
LYC.ES_J GGCTTTACC-AGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
**** * ** ****** ** * ***** ***** ****** *
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG-
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** *** * ** * *** *** *** ** * * *** **
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
* ** * ******* ********** * *** * *** **** * **********
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
* * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** **
LYC.ES_J ACCTTT
CIN.HYB. ATTT--
* *
Mean pairwise ID: 59.81%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT
******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ** * *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTG-TGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* *** * ** ***** * * ** * ** * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** **** * **** ** ** *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ************ *********** *** * ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
******** *** ** * ** **** * * * * ** *** * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT-
LYC.ES_C CTACCACATTT
* **** **
Mean pairwise ID: 59.81%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT
*** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * * * *** * * * *** *****
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA
** * **************************** ** ****** * * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACCA
HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA
************* *** * * *** * * ** ** *** * * *
ZEA.MA_G CCATCTTT---
HUM.LU_A CCATTTCTTTT
**** * *
Mean pairwise ID: 59.87%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA--
******* *** ** * *********** ** **** ********* * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
*** * ** * ******* * ** * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAAT-GGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
*** * * * * ** * * ***** * *** ** * **** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_O GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAA-AAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
* * **** ******* *********** *** * * ** *** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAACC
LYC.ES_O GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC
****** *** *** * ** * * * ** * * *** * *****
ZEA.MA_B ACCATCTTT
LYC.ES_O ACCACTTT-
**** **
Mean pairwise ID: 59.87%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATG-TGGTGG--AATG
******** **** * * ** ********** ******* *** * *** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_G TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATC
** ** ** * ***** ** ** **** * ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_G CAAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAG-----AATGGGCTACTAGATTCC
**** * *** ** * ** *** * * *** ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_G TAAAGTGGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGT
******** * ** ************ *********** *** * ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LYC.ES_G GCAGTGGAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTC
* ************* * * * *** * * ** *** * * **
ORY.SA_A CAAC-AGACCACCATCTTT
LYC.ES_G CAATTAAACCACCACTTTT
*** * ******* ***
Mean pairwise ID: 59.87%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATG-TGGTGG--AATG
* ***** **** ** * ** *********** **** *** * *** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_N TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC
** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_N CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG
**** * * *** * * *** **** * ** ** *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_N TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAA
******** * * ************ *********** **** * * **** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTCT
LYC.ES_N GCGGTGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC
*************** * * ** * ** * ** * * * * * ** ***
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_N A-ATTAAACCACCATTTTT
* * * ******** ***
Mean pairwise ID: 59.87%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG--GAATAT
* ***** *** *** ******* **** ** **** ********** * **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_E TGGGCTGTC----CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTATCC
** ** * * * *** ** ** *** * * * * **** **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_E AAGT-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT
**** * ** * * * * *** * * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_E GGGGTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
** * * * *********************** *** * * ****** * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAA-GTGCCTTCCATGGCA
LYC.ES_E GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTA
************ *** *** ** * * ** *** * * ** * * * *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT-
LYC.ES_E AACTACCACATTTT
** ***** ***
Mean pairwise ID: 59.87%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_A GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCT--TGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
** * **** * ***** ** * * ********** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
LYC.ES_A ACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG
*** * * ** ** * * ******** * **** *****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
LYC.ES_A CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCG-CTCTGTGCAGTGGAAG
* ** ** ******** ************* ** * ** *** ** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAACA
***** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * **
ZEA.MA_C ACCATTTTT
LYC.ES_A ACCACCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 59.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
***** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** *
LYC.ES_H GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** *
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** *
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* ************ ************ ** * ****** * *********
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
******* ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** ***
LYC.ES_H ACCTTTT
TRI.AE_A -------
Mean pairwise ID: 59.93%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
***** * ****** * ****** * **** ** * ** ** * ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * **
HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
* * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* *
HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
HOM.SA_A ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
** **** ***** * * * ** * ****** * * * ***** * * **
HOM.SA_A T-
CAE.BRI. TT
*
Mean pairwise ID: 59.93%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT
***** * ****** ******* * **** ** * ** ** * * ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
* *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * **
RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG
CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG
* * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* *
RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG
*** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * **
RAT.RAT. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA
** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * * **
RAT.RAT. T-
CAE.BRI. TT
*
Mean pairwise ID: 59.94%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT
******* *** *** ******* ******* ******** ** ****** * ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_F TGGGTCCAT----CTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
**** * **** * ** ** ** * * * **** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LYC.ES_F AGC-ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTG
** * ** * * * ** **** * * *** * ** *******
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_F GGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * ************************* *** ** ****** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC-AG
LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA
****** ****** *** * ** ** * ** * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_F ACCATCACTTTT
**** *** ***
Mean pairwise ID: 59.94%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** *
ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG
*** * **************************** *** ** **** ** * ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
**** **** * ** *** * * * * * *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ARA.TH_A ACCACCATTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 59.94%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** *
ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG
*** * **************************** *** ** **** ** * ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG
ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
**** **** * ** *** * * * * * *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ARA.TH_F ACCACCATTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 59.94%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
****** *** ** * *********** ** **** *********** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
** *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGA
* * *********** *********** *** * ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
******** * *** *** * * ** * * * * *** * ** *** * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT--
LYC.ES_E CTACCACATTTT
* **** **
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.JA_B GTTCGGCCCAT--TGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC
* * ** *** * * * ** * ** ** ** ** ****** *******
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGG
* ** * *** * *** ****** **** * *** ****** *
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
*** ************ *************** ** ****** * * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCC--TCATTAAACAGAC
HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
****** ***** *** **** * *** ** **** **** ***
ZEA.MA_F CACCATCTTT
HUM.JA_B CATTTCTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 60.00%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** * **** ****** *******
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** * * * *** *** * ******** ** * *
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** ** ********** *************
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT
** ********* * * * ** * ** * * ** * *
LYC.ES_J CCTTT
HUM.JA_A CTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 60.00%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAA----GATGGTGGGAC
* ****** **** * * *** ********* * **** ** *** * * **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTC---TGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTC
**** ** * ** ** * ** *** * ** ** *** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ARA.TH_F CAAGCTGTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGC-------TTGGCTTGCAGGTTC
**** ** * *** * * ** ******** *** * * ** *
ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
ARA.TH_F TAGAGTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTAC
** *** ** ** * **************************** *** ******* *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
ARA.TH_F AGCAGTGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATC
* * ***** **** ** * * * ** * ** ** * * ****
ORY.SA_A ACA-ACAGACCACCATCTTT
ARA.TH_F TCATATGAACCACCATTTT-
** * ******** **
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_I GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC--GCTCTAAGCGGTGGA
* * ************ *********** **** * * * *** * ******
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC
********* * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * **
ZEA.MA_E CACCATCTTT
LYC.ES_I CACCATTTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_A GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * * ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG
* *** * ***** * * ** * ** *** * *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ** ********************** ** * ** ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
LYC.ES_A GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC
****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_A AACCACCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA---CA
****** **** **************** ** **** * **** ***** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGG--TCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAA
** *** * ** *** * * * * ** * * * ** ****** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTGAAGTG
ARA.TH_G GCTGTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT
* ** **** ** * * * **** **** ** * * * * * **
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCAGCAGTG
* ** ** **** *********************** ** ** *** ** * ***
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA--
ARA.TH_G GACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
* *** ***** ** ** * * *** ** ** ** * *** * *
ZEA.MA_E --GACCACCATCTTT
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * *** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_N GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* *** * * ** * * * *** ** * * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGAA
* * *********** *********** **** * * ** ** * * ********
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAAC
******* * * ** ** * * * * * * * * * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
LYC.ES_N CACCATTTTT
**********
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
****** **** **************** ** **** * **** ***** *** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGT-GACACTGGCC-GGCTTGCCCATCCCA
ARA.TH_G G---GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA
*** * *** * ** * ***** * ** ** * ** ****** ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAAC-CAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT
** ** **** ** * * * ****** * ** * * * *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGG
* ** ** **** *********************** ** ** *** ** * ****
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCA--
ARA.TH_G ACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCC--ACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
*** **** * * *** * ** *** ** * *** * *
ZEA.MA_A --AACCACCATCTTT
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT-
********* **
Mean pairwise ID: 60.00%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG--GAACAC
* ***** * *** ** ****** **** ** **** * ***** ***** * * *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTA-TGCGGCCCGCCCGTTCC
ARA.TH_G TGGATCG-----GCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCC
* *** ** ** * *** *** *** * ** * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAG-
ARA.TH_G AAGCTGTGAGTGAACCGTATGAA--CCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGG
*** ** * ** * * ******* * ** * * * *** **
ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT
ARA.TH_G TTGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGT
* * *********** ******* *************** **** ****** ** * **
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATGGC
ARA.TH_G GGACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
*** *** ***** ** ** * * ** ** * ** * * * * * *
ORY.SA_B AGA-CCACCACCTTT
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT-
** ****** **
Mean pairwise ID: 60.06%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG--GAATGT
******* *** ** ******* **** * ******* *** ****** * ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC
LYC.ES_G TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTATCC
** ** * * * ** ** ** *** * * * * **** **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
LYC.ES_G AAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT
*** * ** * * * * *** * * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG
** * * * ************************ *** * * ****** * ***
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC-A
LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA
************ *** *** ** * * ** *** * * ** * *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
LYC.ES_G AACCACCACTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 60.06%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** ** *** * ********** ********* * ***** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** **** * *** *** *** ** * ***** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
*** *** * * ** **** * * ** ** * *** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** ** * ****** ** **********
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG-CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGA-TGGGTTG--CTCCAATTAAACCA
**** * ***** * **** *** * * * **** ** *** ****
HUM.LU_C TTTCTTTT
LYC.ES_I CCATTTTT
****
Mean pairwise ID: 60.06%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** * **** * ** **** ****** *** ** * * **** ***
HUM.LU_B GG-TCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* * ** ** * ***** ** * ** **** ***** ******* *
HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** ** ** **** ******** **** * **** * ** **
HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
********* ****************** **** ***** *** ** * ********
HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATA---ACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA
** ** ***** * *** * * ** ** * * * * * * **
HUM.LU_B TTTCCTTT
CIN.HYB. CCCATTT-
**
Mean pairwise ID: 60.06%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
****** *** * * ************ * **** ******* *** * *** **
ARA.TH_A --GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTA--GCCGGCTTGCCCATCCCAAG
* **** ** ** ** * **** * * * ****** *****
ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTT--GGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTACAG-CG
** *** * * * * ****** **** ** ***** *** ** **
ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
* ** * **** *********************** *** *** *** ** * ***
ARA.TH_A GACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG
ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTA-GCA
* **** ** * * *** * * * * * *** *** *
ARA.TH_A AACCACCATTTT-
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
********* **
Mean pairwise ID: 60.07%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
* * ** * **** ** ***** ** * *** ** * * **** * ****
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTT-CTGGGCTGCAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
** **** * *** * *** * ** * * *** ** * *********
CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
*** * * *********** ** **** * * * ******* ********
CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ******* * ********
CAN.SPE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCG-TC
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
**** *** ** * * * ***** * * ** * **** * **
CAN.SPE. TCT
DRO.MEL. TTT
* *
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** *
ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG
*** * **************************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG
ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
**** ** * * ** *** * * * * * *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
ARA.TH_F ACCACCATTTT
******** **
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGG---ACT
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * * **
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG
*** * * * ** *** * *** * ** ** ** ******* *****
ZEA.MA_B TTGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTG-GGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA
* *** * * * ***** *** ***** * **** ** **
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCAC-CTCCCGCTCTCGGCAGTGGA
** * **** ******* *************** *** * *** ** * * ****
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG-ATCCTCTCTTAG-CAAA
HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGA
******** * ** *** *** *** * ** * * * * ** * ****** ** *
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
HUM.JA_A CCATCTCTTTT
*** * ***
Mean pairwise ID: 60.13%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
*** *** ** ** ** * **** * **** *** ** ****** * ***** *
CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
TRI.AE_A GT-TGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * ** ** * ****** * * ***** ************* *
CIN.HYB. AG-AGTGGGTT-CATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGCA
* ***** * ** * * ***** *** **** * * ** * **
CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAG
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
**** **** ******* ********** **** *** * ** * ** *******
CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTG-TCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC
*** * **** * ** ***** ** ** * * *** *** *** ***
CIN.HYB. CCATTT
TRI.AE_A C-----
*
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT
******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ** * *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTG-TGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* *** * ** ***** * * ** * ** * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** **** * **** ** ** *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * ************ *********** *** * ** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
********* *** ** * ** **** * * * * ** *** * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_C CTACCACATTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 60.13%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* *** * * ****** ***** ********** * * **** * *** *
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** *
LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
*** ** ***** *** * * ** ** * *** **** *
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
* *** ******************* *** ** * **** * ************
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTA-ACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCACC
*** * ** ** ** * ** * **** * ** * * ******
LYC.ES_I ATTTTT
TRI.AE_B ATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA
* ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA
*** * ** *** * *** * * * ** * * ** ****** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
* ** *** * * * * * *** * ** * *** * * *** *****
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA
** * ************ *************** ** ****** ** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT---AAGCAGA
HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGA
************* *** * * * *** * * * * *** *** ** * **
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
HUM.LU_B CCATTTCCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 60.13%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
****** *** * * *********** * * **** ******* ***** *** *
ARA.TH_A GGTT--CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
* *** * ** ** ** ** * ** ** * * * ****** ******
ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGC
** ** * *** * * * ******** *** * * ** ** ***
ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGA
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
** * **************************** *** ******* ** * ****
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA
**** ** * * ** *** ** * * * * * * *
ARA.TH_A CCACCATTTT-
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
******* **
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
****** *** *********** ******* **** ** ******** * *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGAC-TCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
ARA.TH_D GTTCAAT--TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
* * ** * *** * * ** * **** * ** * * ****** *****
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTACAG-CGGC
ARA.TH_D TGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTT--GACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
** *** * ** ** ***** **** * ** ** *** ** ***
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGGA
** * **** ******* *************** *** *** *** ** * ****
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGC-AAA
ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA
**** * * ** * * *** * * ** * * * * *** * *
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
ARA.TH_D CCACCACTTT-
****** **
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** *
ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG
*** * **************************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG
ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA
**** ** * * ** *** * * * * * *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
ARA.TH_A ACCACCATTTT
******** **
Mean pairwise ID: 60.19%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA---CA
****** **** **************** ** **** * **** ***** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGG--TCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAA
** *** * ** *** * * * * ** * * * ** ****** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTGAAGTG
ARA.TH_G GCTGTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT
* ** **** ** * * * **** **** ** * * * * * **
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCAGCAGTG
* ** ** **** *********************** ** ****** ** * ***
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA--
ARA.TH_G GACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT
* *** *** * ** ** * * *** ** ** ** * *** * *
ZEA.MA_D --GACCACCATCTT
ARA.TH_G TGAACCACCATTTT
******** **
Mean pairwise ID: 60.19%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** **** * * *** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
** * *** ****** * ** * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAAT-GGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
*** * * * * ** * * ***** * *** ** * **** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAA-AAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
* * **** ******* *********** *** * * ** *** * **** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAACC
LYC.ES_G GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC
****** *** *** * ** * * * ** * * *** * *****
ZEA.MA_B ACCATCTTT
LYC.ES_G ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 60.19%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_I GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAA
* * ************ *********** **** * * **** * ****** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGACC
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC
******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * ***
ZEA.MA_G ACCATCTTT
LYC.ES_I ACCATTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 60.26%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACA-CTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
LYC.ES_C ----GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGT-GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
** * * ***** ** ****** * * *** ***** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTT-GGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGG
* *** * * ** * ****** **** *** *** *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * **** ******* *********** *** * ** *** * ****
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA
LYC.ES_C AGGATAACGA-GCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
********** *** ** * * ** *** * * * * *** **
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
LYC.ES_C ACTACCACATTT
** **** ***
Mean pairwise ID: 60.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******* ** ***** * *** * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_M GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_M CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
****** ** * * * * *** *** ** ** * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
****** ********* ************ * ** ********** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC
* * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_M CACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 60.26%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
****** *** * * ****** ***** ********** * * **** * *** *
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** *
LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCC-TTAAGTGGCAGG
*** ** ***** *** * * ** ** * * ****** *
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* *** ******************* *** ** * ***** * ***********
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTA-ATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC
**** * ** ** ** * ** * **** * * ** ** * *****
LYC.ES_B CACTTTT
TRI.AE_B CATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 60.32%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ***** *** *** * **************** * ** ***** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
** ***** * *** *** *** ** * * ****** ******
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC
*** *** * * * *** * * * * ***** * *** * *
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* *********** *********** *** * ** ***** * *************
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGA-TGGGCTG--TTCTAGTTAAACT
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
***** ******* ** *** * ** * ******* * ** * **
LYC.ES_E ACCACATTTT
HUM.LU_C ATTTCTTTT-
* * ***
Mean pairwise ID: 60.32%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
******** ****** * ********* * ** * ****** * **** * * *** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT-CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
LYC.ES_C GAACAT--GCCCAGAAGGTAGGGCTTGT-GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ***** ** ***** * * *** ***** *****
ZEA.MA_B TGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTT-GGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGG
*** * * * ** * ****** **** *** *** **** ** **
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_C TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * **** ******* *********** *** * * *** ** * **** *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAAC
LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
******* **** ** * * ** **** * * * * *** ****
ZEA.MA_B CACCATCTTT
LYC.ES_C TACCACATTT
**** ***
Mean pairwise ID: 60.32%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ARA.TH_A -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
*** * ** ** * ** * *** ** * ** ** ****** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCT-TGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA
** *** ** *** *** **** *** ** *** *** * *
ZEA.MA_C GGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
** * *********** **************** *** ** *** * * *****
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
ARA.TH_A GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
**** ** * * * ** * * ** * * * * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
ARA.TH_A CACCATTTT-
*********
Mean pairwise ID: 60.32%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_B GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCG-CTCTAAGCGGTGGA
* * ************ *********** **** * * *** ** * ******
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
********* * ** ** ** *** *** * * * * ** * **** * **
ZEA.MA_E CACCATCTTT
LYC.ES_B CACCACTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 60.32%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** * *** ** **** ****** *** ** * * ********
HUM.LU_C GG-TCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCT-GCCCATTCCAAGC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTC---TGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT
* * * ** *** * ** * * *** **** **** *******
HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG--GNGCGCACTCCTAGACTGGAG
CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG
** *** ** * **** ********* * * * ** * ** *
HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAG
********** ******* ********** **** ***** ****** * *******
HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATA-TAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC
*** ** ***** * * *** ** * * * ** * **** * * ** *****
HUM.LU_C CATTTCTTTT
CIN.HYB. -ACCCATTT-
* ***
Mean pairwise ID: 60.32%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
** *** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * *
HUM.LU_D GGTCAACCTAGT--GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
** * * ** * ** * ** * ** ** * ** ****** *******
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
** ** ** * * * * ********** **** * *** ** ** *
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
*** **************************** ** ****** * * **** **
HUM.LU_D GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCC--TCATTAAACAGAC
****** ***** *** *** * * * ** * ** **** ***
HUM.LU_D CATTTCTTTT
ZEA.MA_F CACCATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 60.39%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT
******* **** ** * ************** ******* ** ****** * *** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
LYC.ES_F GGGT-CCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
*** ** * * ** **** * * * * * ********** ******
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTAT--AGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGAT
*** * * * * ** * * ** * * * ** ***** *
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* ** *********** *********** *** * * ** *** * * ********
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA
LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA
** ** *** * *** ** * * ** * ** * * ** * ****
ZEA.MA_C CCATTTTT
LYC.ES_F TCACTTTT
** ****
Mean pairwise ID: 60.39%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
******* ** ** * ********************** ** *** ** *** * *
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGG-GCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG--CTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* ** ** ** ** * **** ** ****** **** ******
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGG--TCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGAT
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* *** * *** *** ****** * * * ** * ** **** *
LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* ** ************ *********** **** * * ****** * ********
LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG--GCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCA
** * **** *** ** ** ** * *** ** * * * * ****
LYC.ES_F TCACTTTT
TRI.AE_A CC------
*
Mean pairwise ID: 60.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_J G--GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG-GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ******** ** ** * ********* ******
ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_J ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
* *** * * *** * *** ***** **** * *** *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** ********************** ** ** ****** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA
LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** *
ZEA.MA_F CCATCTTT
LYC.ES_J CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 60.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_K G--GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG-GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ******** ** ** * ********* ******
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_K ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
** ** * * *** * *** ***** **** * *** ******
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** ********************** ** ** ****** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA
LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** *
ZEA.MA_F CCATCTTT
LYC.ES_K CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** * ***** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG
***** * * *** *** * *** ** *** * *
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********************** ** * ******* ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_K CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** * *** * * **************** * * ****** **
ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** **** ** *** ** * ** * * ******* ******* *
ARA.TH_G TGAG-TGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT--CCTAGACTGGAGGG
*** ** * * ** * ******* * * * * * * * *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* ***** ************************************** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
***** ** ** * * * ** ** ** **** * * * * ****
ARA.TH_G CCATTTT-
HUM.LU_C TTTCTTTT
***
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
******** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** * ***** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** * * *** *** * *** *** ** * *
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********************** ** * ******* ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_J CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** * ***** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** * * * *** *** * *** *** ** * *
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********************** ** ** ****** ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_A CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 60.40%
DRO.MEL. GACTGGAAGGT-TGGCA-GCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGA-TTGTGGGATG
XEN.LAE. -GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC
* ** * * **** * ******** *** ** **** ** *** ****
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGC--ACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTA
** **** * *** * *** * ** ** **** ** * **********
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGG-CTAAGGAG
XEN.LAE. AGTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAG
** * * ********** * *** **** * * ******* ********
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ****** ********
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
XEN.LAE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGAC-ACAGTT
**** *** ** * * * * * ***** * * * * * *** *** *
DRO.MEL. TTT
XEN.LAE. CT-
*
Mean pairwise ID: 60.40%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
*** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * * ****
CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA
* **** ****** *** * ****** * * * *** ** * ***** * **
CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT
ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG
* * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** *******
CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG
ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG
**** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * *
CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC
ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGTC
** **** ***** * * *** ****** *** * ***** ****
CAE.EL_C ACT
ORI.CUN. TCC
*
Mean pairwise ID: 60.40%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
* * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** * * ****
DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT
** **** * *** * *** * * * * *** ** ** *********
DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG
HOM.SA_B AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG
*** * * *********** ** **** * * * ******* ********
DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG
HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG
** ******** ***** **** ***** * * ******* * ********
DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
HOM.SA_B GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACC-CCGTC
**** *** ** * * * ***** * * * ** * **** * **
DRO.MEL. TTT
HOM.SA_B TCT
* *
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** *
ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
*** * **************************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAGA
ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
**** **** * ** *** * * * * * * *
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
ARA.TH_A CCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_G GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGA
* * ************ *********** *** * ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
******** * *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT-
LYC.ES_G CCACCACTTTT
****** **
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * *********** * * **** ******* ***** *** *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
ARA.TH_F GGTT--CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG
* *** * ** ** ** ** * ** ** * * * ****** ******
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGC
ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGA
** ** * *** * * * ******** *** ** * ** ** ***
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGA
** * **************************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
**** ** * * ** *** ** * * * * * * *
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
ARA.TH_F CCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGG
* ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** *
ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA
*** * **************************** *** ******* ** * ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAGA
ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA
**** **** * ** *** * * * * * * *
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
ARA.TH_F CCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 60.46%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
*** **** **** * * * **** *** ** *** ** ** ***** *** ***
LYC.ES_G GGCTGTACC-AGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
*** * ** * ****** ** * ***** ***** ****** *
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG-
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** ****** * * *** * *** * ** ** * * *** **
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
* **** ****************** ****** ** ** * * **********
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
** **** * * * * ** *** ** * **** **** ** **
LYC.ES_G ACTTTT
CIN.HYB. ATTT--
* **
Mean pairwise ID: 60.46%
HUM.LU_C --GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACTTTG
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
* *** * * * *** ***** ********** ** ** * * *
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG
*** ** * * ** * *** * *** * * ****** ******* *
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCA
TRI.AE_B GTAG-TGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGCA
* ** ******* * * * ******* *** * ** *** * *** ****
HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA
TRI.AE_B CCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA
*** ******* **************** ** * ***** * * ***********
HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT
TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCACC
** ***** *** * ** *** * *** * * * * * ** ** ****
HUM.LU_C TCTTTT
TRI.AE_B ATCTTT
***
Mean pairwise ID: 60.51%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT---GTGGGAAATGGAACT
* * * * * * * * *** **** ** ******* * ** ****
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
HUM.LU_C TTGG--GTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCA
*** ** * * ** * * ** *** * ** * * * **** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
HUM.LU_C AGCCGGGAGGTGGGC-TGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG-GNGCGCACTCCTAGACTG
** * * * * * ** ** ************** * * * * ****** **
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.LU_C GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* *** * ************* *************** **** ****** * * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCC--CGCT-TCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC
HUM.LU_C AAGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATA-
*************** *** * *** * ** * * * ** ** *
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
HUM.LU_C GGACCATTTCTTTT
***** * ***
Mean pairwise ID: 60.51%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA---CA
****** **** **************** ** **** * **** ***** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGG--TCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAA
** *** * ** *** * * * * ** * * * ** ****** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTGAAGTG
ARA.TH_G GCTGTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT
* ** **** ** * * * **** **** ** * * * * * **
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGG
* ** ** **** *********************** ** ****** ** * ****
ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA---
ARA.TH_G ACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTT
*** ***** ** ** * * *** ** ** ** * *** * *
ZEA.MA_G -GACCACCATCTTT
ARA.TH_G GAACCACCATTTT-
******** **
Mean pairwise ID: 60.52%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
***** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG-
LYC.ES_H G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
* * * * ******** ** ** * * * * * ***** ******
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ************ ************ ** ** ****** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA
LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** *
ZEA.MA_F CCATCTTT-
LYC.ES_H CCACCTTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 60.52%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_B GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* * *** * * *** * * * * * ** * * * ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA
* * ************ *********** **** * * ***** * ****** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGACC
LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC
******** * ** ** ** *** *** * * * * ** * **** * ***
ZEA.MA_G ACCATCTTT
LYC.ES_B ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 60.58%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
****** *** ** * *********** ** **** *********** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
** *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCG-CTTTGTGCAGTGGA
* * *********** *********** *** * *** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA
********** *** *** * * ** * * * * *** * ** *** * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT-
LYC.ES_E CTACCACATTTT
* **** ***
Mean pairwise ID: 60.59%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
*********** *** * ********* * **** ****** * *** ** *** * *
LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC
* ** * * ** ** ** *** ****** **** ******
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCC--AAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* *** * **** * * ***** *** *** * ** * *** **** *
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** ************ *********** *** * ****** * *********
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC
*** * *** ** * ** *** * ** * ** ** ** * ** **
LYC.ES_C CACATTT
TRI.AE_A C------
*
Mean pairwise ID: 60.62%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT----GTGGGAAATGGAAC
* ** ** * * * ************* ******* * ** ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
HUM.LU_C TTTGG-GTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCA--GTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTC
***** ** * * * ** *** ** * *** * * ***** ***
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
HUM.LU_C CAAGCCGGGAGGTGGGCTG-AGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT------CC
**** * * ****** * **** * * ********* * ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
HUM.LU_C TAGACTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCG
** * *** **** **************************** ** ****** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCC--CGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
HUM.LU_C GCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTC
* ************* *** * *** ***** *** * ** * * * * ***
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
HUM.LU_C TTAATAGGACCATTTCTTTT
* * ***** ***
Mean pairwise ID: 60.63%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** * * **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA
* * * ** ** ** * * ** * * ** * * * ****** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTGGAG-C
ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTT--GGCTCATGCAGGTTCTAGAGTC
* ** *** * *** * * ****** **** ** ***** ** *** *
ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
ARA.TH_A GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG
** ** * **** *********************** *** ** ** ** * ***
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAG
ARA.TH_A GACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA
* **** *** ** * ** ** ** *** *** * * *
ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT
ARA.TH_A TGAACCACCATTTT-
********* **
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT
******* **** ** * ********** ** ******* ** ****** * *****
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_F G---GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
* ** ** * ******** * * * * ********* ******
ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGA
* *** * * ** **** * * * ** *** * ** ** *
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_F TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** * ** ****** * **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCC-AACTCGGTCCAGA--GCCTCATTAAACAGAC
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
**** ** *** *** * ** ** *** ** ** * * *** * **
ZEA.MA_F CACCATCTTT
LYC.ES_F CATCACTTTT
** ** ***
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT
******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ** * *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTG-TGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* *** * ** ***** * * ** * ** * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** **** * **** ** ** *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
******** *** ** * ** **** * * * * ** *** * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_C TACCACATTT
**** ***
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * *********** * *********** ****** * *** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_B GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* *** * * ** * * * *** ** * * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA
* * *********** *********** **** * * * *** * * ********
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC
******* * * ** ** * * * ** **** * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
LYC.ES_B CACCACTTTT
***** ****
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
******* *** ** * *********** ** **** *********** * ** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_O GGG--CTGTCCCAGATGGCTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** ***** * ***** ** ** ********** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
*** * * * * * * ****** * **** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* ** *********** *********** *** * * *** * * ******
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_O GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
******* * ** *** * ** **** **** * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
LYC.ES_O CACCACTTT-
***** ***
Mean pairwise ID: 60.66%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** **** **** * * * **** *** ** *** ** ** ***** *** ***
LYC.ES_B GGCTGTACC-AGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
*** * ** * ****** ** * *** ******* ****** *
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG-
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * *** **
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
******* ****************** *** ** * **** * **********
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCA
** ** *** ** * * ** ** ** * **** * ** ** ***
LYC.ES_B CTTTT
CIN.HYB. TTT--
**
Mean pairwise ID: 60.70%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GGACTT
**** * * * *** *** *** **** ** ******* ** ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGT---GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA
**** * ** ** * ** *** * ** ** * **** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
HUM.LU_A AGCCGGGAGTTGGGC-TGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTG
** * * * * ** * ************ * * * * *********
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* *** * ************* *************** **** ****** * * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGC--TTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG
*************** *** ** ** ** * * * * * * **
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
HUM.LU_A GACCATTTCTTTT
***** * ***
Mean pairwise ID: 60.71%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** ** *** * ********* ****** *** * *** ** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * ** *** * ** ** ** * ******** ******* *
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCAC-TCCTAGA-CTGGAGGG
*** ** ** ********* *** * ***** ******
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
*********************************** ******* * ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
* **** * * ** * ** ** * **** * ** *** * * ****
ARA.TH_A CCATTTT-
HUM.LU_C TTTCTTTT
***
Mean pairwise ID: 60.71%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* * ***** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
**** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_K CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 60.71%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ******* * *********** ******* * * ** ******** **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGG-GCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** * ** ** *** * * * * ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAG-TGGGATG
**** * * ** * * **** ** * ** ** ** ** * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ***** ******* *********** ****** ******** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCC-TAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA
**** ** * *** * *** ** ** ** *****
ARA.TH_G CCATTTT-
LYC.ES_F TCACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 60.71%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** ** *** * * *** **** ******* ** ** ****** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* **** * ** *** * **** * * * ******** ******* *
ARA.TH_D TGAG-TAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG--GNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG
*** * *** * * ********** *** * ** * ******
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
*************** ******************* **** ** * ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCT-GGACCA
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
* * * ** * ** * ** ** * **** ** * * ******
ARA.TH_D CCACTTT-
HUM.LU_C TTTCTTTT
****
Mean pairwise ID: 60.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * *********** ** **** **** **** * * *** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** *
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
*** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT--TTCGCTCTAAGCGGTGGAAG
* * **** ******* *********** **** * * * ** * ****** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
****** ** ** ** ** **** *** * * * * * *** * ******
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_N CCATTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 60.71%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
****** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_A G--GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG-GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
* * * ******** ** ** * ********* ******
ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_A ACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
* *** * * *** * *** ***** **** * *** *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC--CCGCTCTGTGCAGTGGAAG
* * ** ********************** ** * *** ***** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA
LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA
***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** *
ZEA.MA_F CCATCTTT
LYC.ES_A CCACCTTT
*** ****
Mean pairwise ID: 60.76%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG--GAACAC
* ***** * *** * * ****** **** * **** ** * ** ***** * * *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC
ARA.TH_E ----TGGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC
* *** * * ** * * **** *** *** * * ** * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCG--TAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGA
ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTG----TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAA
*** ** * ** ***** * ********* * * ** *** *
ORY.SA_B GT-GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG
ARA.TH_E GTTGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCA
** ** ***** ***************************** *** ******* ** *
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATG
ARA.TH_E GTGGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCAT
***** **** ** * * ** * * ** ** * * * ** * **
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT
ARA.TH_E ATGAACCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 60.77%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
****** *** ** * *********** ** **** *********** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
** *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* * *********** *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_E GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
********* *** *** * * ** * * * * *** * ** *** * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT-
LYC.ES_E TACCACATTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 60.77%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
****** **** *************** *** **** * **** ***** * * *
ARA.TH_G G---GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGG-CCGGCCTGCCCGTTCCAAG
** * * ** ** **** ** ** ** * ** ****** ******
ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGCA
** *** ** * * ******* ** ** ** *** *
ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCAGCAGTGGAC
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
** ** **** *********************** ** ****** ** * ****
ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACA----GA
*** *** * ** ** *** *** ***** * *** * * * *
ARA.TH_G CCACCATTTT-
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
******* **
Mean pairwise ID: 60.77%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * *********** ** **** **** ****** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_N GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * * * ****** * ** * * * * * ******* *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_N CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
* *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGA
* * **** ******* *********** **** * * ** *** * ******
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGCAAA
LYC.ES_N AGGATAACGA-GTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
********** * ** ** ** **** * * * ** * * * * ** ***
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
LYC.ES_N CCACCATTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 60.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATG-TGGTGG--AATG
******** **** * * ** ********** ******* *** * *** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_I TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC
** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_I CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG
**** * * *** * * *** **** * ** ** *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_I TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAA
******** * * ************ *********** **** * * **** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTCT
LYC.ES_I GCGGTGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC
*************** * * ** * ** * ** * * * * * ** ***
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_I A-ATTAAACCACCATTTTT
* * * ******** ***
Mean pairwise ID: 60.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATG-TGGTGG--AATG
******** *** ** * ** ******** ** ******* ** * *** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_F TTGGGTCC--ATCTTGATGGATGGGCT--TGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTC
** *** ** **** ** * ** * **** ** ***** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_F CAAGC-ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATA------GCCACTTGGCCTT
**** * *** ** ** ** * **** * * ** ** * *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_F TAGAGTGGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGT
** ***** * * ** ************ *********** *** * * ******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
LYC.ES_F GCAGTGGAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCC
* ********** ** **** *** * *** * ** ** ** *
ORY.SA_A CAAC-AGACCACCATCTTT
LYC.ES_F TAATTAAACCATCACTTTT
** * **** ** ***
Mean pairwise ID: 60.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATG-TGGTGG--AATG
* ****** **** * * ** ********** ******* *** * *** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
LYC.ES_B TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC
** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
LYC.ES_B CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG
**** * * *** * * *** **** * ** ** *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
LYC.ES_B TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAA
******** * * ************ *********** **** * * ***** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTCT
LYC.ES_B GCGGTGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCT
*************** * * ** * ** * ** * ** * * * * ****
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
LYC.ES_B A-ATTAAACCACCACTTTT
* * * ******* ***
Mean pairwise ID: 60.84%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** ***** *** * **** ** *** ** ** ** **** * ** **
ARA.TH_F -GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCAT-GTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTC---TGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT
* * ** * * * ** ** *** * ** * *** ***** ******
ARA.TH_F TGTGAGTAA-TTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCT--TGCAGGTTCTAGAGTCGGA
CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTC-CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG
* **** ** **** ************ ** * ** * * **** ****
ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA
*** ******* ******* ********** **** ** ** ** * * *****
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA-GGAC
**** ** * ** ** ** ** *** ** ** * * * * * * **
ARA.TH_F CACCATTTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
******
Mean pairwise ID: 60.90%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT
* ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * * *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT-CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
HUM.LU_B GGGTCA-GCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
* * * *** * ** * ** * ** ** * ** ******* *****
ZEA.MA_B TGGTAGT--GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGA-GTGACCTGGGCGAAGGCCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA
** *** * **** * * * ***** ** * **** * **** ** **
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTAC-CTCCCGCTCCCGGCAGTGGA
** * **** ******* *************** ** * *** ** ** * ****
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT--CTCTTAG-CAA
HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG
******** **** *** *** * *** ** * * * **** ****** *
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
HUM.LU_B ACCATTTCCTTT
**** ****
Mean pairwise ID: 60.91%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** * ***** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
**** * * * *** *** *** * *** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** ** ****** ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC
* ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** **
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_A CACCTTT
** **
Mean pairwise ID: 60.91%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* *** *** * ****** ** ** *** ****** * **** * *** *
LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTA-GGGCTTGTGTGACAATTCT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
* * ** ********* ** * *********** ******
LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
*** *** **** ***** **** * ** ** * * *** **** *
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** *** ******************* *** * ** ***** * *********
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC
**** *** ** ** * * * ** * * * *** * ** **
LYC.ES_C CACATTT
TRI.AE_B CATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 60.91%
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
******** ** *** * ****** **** * ******* * *** *********
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTT-GTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACT--GTGGACCACCCATTCCAAGT
** *** * ******* * *** * ** ** *** * *** ********
TRI.AE_B TG-GTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT-CCCAACACTAAAGTGGCGG
** ******** * ** ** *********** ** * * ** ** ******* *
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGG
ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG
** *** ******* **** ********** ** *** ** *** **********
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------
**** * **** ** ***** *
TRI.AE_B CATCTTT
ZEA.MA_H -------
Mean pairwise ID: 60.91%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
***** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** *
LYC.ES_K GG-GCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCT-ACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * *** ** **** *** * * ****** **** ******
LYC.ES_K AGAGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* *** * * * *** * **** **** ** * * * *** * **
LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* ** ** ********************** ** * ****** * ********
LYC.ES_K ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC
******** ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** **
LYC.ES_K CACCTTT
TRI.AE_A C------
*
Mean pairwise ID: 60.91%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** * * ************ ****** ****** ** ** * ** **
ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGC-TACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * *** * * **** *** ** * * *** * **** ****** *
ARA.TH_F GTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* * *** * * * * * * ***** *** ** * *** * * ** *
ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* * ***************************** *** ******* ** * ***** **
ARA.TH_F ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA--CTCCAGCAGACCA
** * ** * * *** * ***** * * *** ****
ARA.TH_F CCATTTT
TRI.AE_A CC-----
**
Mean pairwise ID: 60.91%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
*** * * ***** **** * * **** ** ************* ********
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTAT--AGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* *** **** ** ****** * **** ** ****** ***
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
******************************* ** **********************
LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCAT
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
***** ******* ****** ** ****** ** *** * ** *******
LYC.ES_F CACTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
******
Mean pairwise ID: 60.91%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
******** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** * ***** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
**** * * *** *** *** * *** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ******* ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC
* ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** **
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_J CACCTTT
** **
Mean pairwise ID: 60.94%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAA----GGTGGTGGAAC
* ****** **** ******* *** **** ** **** ** *** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATA---TATCTGAGCTGCCCAGTC
**** * ** ** ** *** ** ** * *** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ARA.TH_D CAAGCTGTG-AGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGC-TTGACTCAGG----CGGATTC
**** ** * *** * * *** * ********* ** ** * * * *
ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
ARA.TH_D TAAAGTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTAC
****** ** ** * ************ *************** *** *** *** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCC-CAGAGTCCCTC
ARA.TH_D AGCAGTGGATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATC
* * ***** **** * ** * * ** * ** ** * ** * * ** **
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ARA.TH_D TCTCCTGGACCACCACTTT-
* ******** **
Mean pairwise ID: 60.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * *** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_I GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG
* *** * * ** * * * *** ** * * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGAA
* * *********** *********** **** * * ** ** * * ********
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAAC
******* * * ** ** * * * * * * * * * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
LYC.ES_I CACCATTTTT
**********
Mean pairwise ID: 60.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * *** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_G GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
** * ** * ** **** * ***** ** ** ********** ******
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
*** * * * * * * ****** * **** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* ** *********** *********** *** * * *** * * ******
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
******* * ** *** * ** **** **** * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
LYC.ES_G CACCACTTTT
***** ****
Mean pairwise ID: 60.97%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T
****************** ********************** ****** ***** *** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
ZEA.MA_H CAATTGTGG--TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAG
*** * * * ****** ** *** ** ***** *****
ZEA.MA_A TTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA---CTAAAGTGG
*** ****** * ** ** * ************ ** * ** ** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA
* * ** **** ************ ********** ** *** * *** ******
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAAC
ZEA.MA_H AGGATAATGA-GTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------
******* ** * **** ** * *** **
ZEA.MA_A CACCATCTTT
ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 60.98%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
*** **** ****** * * **** ****** ** * * ** ***** *** ***
LYC.ES_O GGCT-GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
*** * * ** * * **** ** * ***** ***** ****** *
LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG-
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** ****** * * *** * *** * ** ** * * *** **
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
* **** ****************** ****** ** ** * * **********
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
** **** * * * * ** *** ** * **** **** ** **
LYC.ES_O ACTTT
CIN.HYB. ATTT-
* **
Mean pairwise ID: 60.98%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* **** ****** * * **** ****** ** * * ** ***** *** ***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
LYC.ES_N GGCT-GTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
*** * ** * ****** ** * *** ******* ****** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCGG
**** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * **** *
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGC-TCTAAGCGGTGGAAGGAT
******* ****************** *** ** * * *** * **********
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCA
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA
** ** *** ** * * ** ** ** * ** * **** ** ***
CIN.HYB. TTT--
LYC.ES_N TTTTT
***
Mean pairwise ID: 61.04%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAG--
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* ** ** ******** **** ****** ** * *** **** *
ARA.TH_D TGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG-TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
**** * ** * ** ** * ** ** ** * * *** ****** ******
ARA.TH_D TGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGG
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAG--TGGCAG
** *** *** **** * ****** **** * * * *** ** *
ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGAAGG
* * *** ************************ *** ** *** ** * ***** **
ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG-CCATAGCAGACCA
** * ** ** * * * ** ** *** ** * * * * *****
ARA.TH_D CCACTTT-
TRI.AE_B CCATCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 61.04%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
****** *** ** * ****** ***** ****** ** *** **** * ** *
LYC.ES_E GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATCCAAGTA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * **** ** * *** *** * *********** *******
LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
*** ** **** ***** * * ** ** * *** **** *
LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
*** *** ******************* *** ** ** ****** * *********
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC
**** * *** *** * * * **** * * * *** * ** **
LYC.ES_E CACATTTT
TRI.AE_B CATCTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 61.04%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
***** *** ** * ********** *** **** **** ****** * *****
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG-
LYC.ES_N G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
* * * * ******** ** ** * * * * * ***** ******
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGAAG
* * ************ *********** **** * * **** * ****** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACCA
LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
****** * ** ** * ** *** * * * * * ** * ****
ZEA.MA_F CCATCTTT
LYC.ES_N CCATTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 61.06%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT----GTGGGAAATGGGAC
** ** * ** * ************** ******* * ** **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
HUM.JA_B TTTAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTG----CTTGCTGGGCTGCCCATT
*** ** ** * ** ** **** * ** ******** ***** **
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
HUM.JA_B CCAAGCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCG-GACGAAGGTCTG-GCTTGG----TCAGCTC
***** * * ** ** * * ** * ****** ** **** * ** * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
HUM.JA_B CTAAAGCGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTC
****** ** **** ************ *************** ** ****** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCC-CAGAGTCCCTC
HUM.JA_B GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACT
* ************* *** * *** ***** *** * * * * ***
ORY.SA_A TACAACAG-ACCACCATCTTT
HUM.JA_B CTTAATAGGACCATTTCTTTT
** ** **** ***
Mean pairwise ID: 61.09%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_G GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCG-CTTTGTGCAGTGGA
* * ************ *********** *** * *** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
********** *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_G CCACCACTTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 61.11%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** ********* **************** * * ***** ***
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** **** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************************** *** ** * ***** ** **********
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
**** * ***** * ** * * * *** * *** ****
HUM.LU_B TCCTTT
LYC.ES_N ATTTTT
***
Mean pairwise ID: 61.11%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* ** ** * ****** **** ********* * * **** * *** *
LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGA-TGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
*** * *** *** ******** * * * *********** ******
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC
*** *** **** ****** * *** * * ***** * *
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAC-AACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
** *** ******************* **** * ***** * **********
LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATC
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGG-CCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC
** *** *** ** * ** * *** ** *** * * **** *
LYC.ES_F ACTTTT
TRI.AE_B ATCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 61.11%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** ** *** ***** *******
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** * **** ** * ** ***** ** * *
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
**************************** ** ** ********** *************
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT
** ********* * * * ** * ** * * ** * *
LYC.ES_H CCTTTT
HUM.JA_A CTTTT-
* ***
Mean pairwise ID: 61.13%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
****** ****** * ****** * ** *** ** * ** ** * ****
CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTG-GGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
* *** ****** *** ** * * * * * * *** ** * ****** * ***
CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
* * *** * ** **** * *** * ** ** ** *** ******* **
CAE.BRI. TGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
*** * *** **** * **** * ****** ****** *** ** * **** * ***
CAE.BRI. TAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCAT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT--CAGTCTT
* **** **** * * **** ** *** * * ** *** *** *
CAE.BRI. T
FUG.RUB. T
*
Mean pairwise ID: 61.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****************** ********************** ****** *********
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGC-TACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTT
* *** * ********* * * * * *** * *** *********
ZEA.MA_C G-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTT--GCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG
* ******* * *** ** * **** * ** * ** *** ** ** ******
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG
* * *********** ***** ********** ** *** ** * * *********
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------
***** * * ** ** *** * *
ZEA.MA_C ACCATTTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 61.17%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** * * ** * ** ******* *** ******** ** * ** * * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.JA_A GGTCAGCCCAT--TGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
* ** *** * ** * ** * ** ** ** ** ****** *******
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG
* ** ** *** * ********** *** * * *** *** ** *
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
*** ************ *************** *** ****** * * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGACC
HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC
****** ** ** *** * * *** * **** ** **** ******
ZEA.MA_F ACCATCTTT
HUM.JA_A ATCTCTTTT
* * ***
Mean pairwise ID: 61.17%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
** *** ***** *** * **** ** *** ** ** ** **** * ** **
ARA.TH_A -GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCAT-GTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTC---TGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT
* * ** * * * ** ** *** * ** * *** ***** ******
ARA.TH_A TGTGAGTAA-TTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA
CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTC-CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG
* **** ** **** ************ ** * *** * * **** ****
ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA
*** ******* ******* ********** **** ** ** ** * * *****
ARA.TH_A GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA-GGAC
**** ** * ** ** ** ** *** ** ** * * * * * * **
ARA.TH_A CACCATTTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
******
Mean pairwise ID: 61.17%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** ********* ***** ******** * *** * * *** ****
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
**** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * ********* *************
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACA
** *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * **
HUM.LU_B ATTTCCTTT
LYC.ES_K ACCACCTTT
* *****
Mean pairwise ID: 61.17%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ***** *** *** * **************** * ** ***** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
** ***** * *** *** *** ** * * ****** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*** *** * * * *** * * * * ***** * *** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGA-TGGGCTG--CTCCAATTAAACC
***** ******* ** *** * ** * ******* *** ***
HUM.LU_C ATTTCTTTT
LYC.ES_O ACCACTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 61.17%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** * * ************ ****** ****** ** ** * ** **
ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGC-TACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * *** * * **** *** ** * * *** * **** ****** *
ARA.TH_A GTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGC
* * *** * * * * * * ***** *** ** ** * * ** ** **
ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
** * ***************************** *** ******* ** * *****
ARA.TH_A GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA--CTCCAGCAGAC
**** * ** * * *** * ***** * * *** **
ARA.TH_A CACCATTTT
TRI.AE_A CACC-----
****
Mean pairwise ID: 61.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT
* ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.LU_B GGGT-CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
*** * * * * **** ** ** ** ** *** ****** *******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG
** *** * * * * ****** ***** **** * * * **** *****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
** * *********** *************** ** ** *** * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
****** **** *** * *** * * * ** * * * * ** ** * ****
ZEA.MA_C ACCATTTTT
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 61.22%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT
******* ******* ******* ** * ** * ***** * ****** * ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
LYC.ES_C -TGAACATGCCCA---GAAGGTAGGGCTTGTG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCA
** * * * * * * ** **** * * * * **** **** ****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
LYC.ES_C AGCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCC-AAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTG
** * * ** * * * *** ********* * ** * ** **** ****
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_C GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * * ************************* *** ** * ****** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAA-GTGCCTTCCATGGCAG
LYC.ES_C AAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA
********** *** ** * * * * * * ** * * * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
LYC.ES_C ACTACCACATTT
** ***** ***
Mean pairwise ID: 61.24%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** *** ********* **************** * * *** * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** * * ** *** *** ** *** ***** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************************** *** ** * ****** ** **********
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTG--CTCCAATTAAACCAC
**** * ***** * ** *** * * ** * ** *** ****
HUM.JA_B TTCTTTT
LYC.ES_N CATTTTT
****
Mean pairwise ID: 61.24%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* *** * * ****** ***** ********** * * **** * *** *
LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * *** ** * *** *** * *********** ******
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
*** ** **** ***** * * ** ** * *** **** *
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
*** *** ******************* *** ** ** ****** * *********
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC
**** * *** *** * * * **** * * ** * * *****
LYC.ES_G CACTTTT
TRI.AE_B CATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 61.24%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* ** * ******* ************ **** ** **** *** **
ARA.TH_F -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG-TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
*** ***** * ** ** ** ** * * ** *** ****** ******
ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGT-GGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGG
** *** * ** * * * ***** **** ** * * * * ** **
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGGA
* *** ******* **************** *** ** **** ** * ***** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATA-GCAGACCAC
* ** * * ** * ** ** *** * * ** * * *****
ARA.TH_F CATTTT-
TRI.AE_B CATCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 61.24%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** * ***** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
***** * * *** *** *** * *** * *** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ******* ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC
* ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** **
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_K CACCTTT
** **
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--T
*** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
*** * * * * **** ** ** ** ** *** ****** *******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGC-TGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG
** *** * * * * ****** *** * **** * * * **** *****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
** * *********** **************** ** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCT-TAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
****** **** *** * **** * * * * * * ** ** ***
ZEA.MA_C CACCATTTTT
HUM.LU_A CATTTCTTTT
** ****
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** * ** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_G GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
** * * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
********* *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_G CACCACTTTT
***** ***
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
******* *** ** * *********** ** **** *********** * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGA
* * ************ *********** *** * ****** * ****
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
******** * *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * *
ZEA.MA_D CCACCATCTT
LYC.ES_O CCACCACTTT
****** **
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATG--
******* **** ** * ************** ******* ** **** * * ***
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCC-GGCTTGCCCATCCCAAGT
LYC.ES_F TTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC
*** * * * * ****** * * * * * *** ***** *****
ZEA.MA_B TGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCC--TTTAGAGTGGGA
*** * * * * ** ****** * * ** ** ** ** ** *
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_F TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * **** ******* *********** *** * ** *** ** * **** *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCC-AACACAGACCCAG-ATCCTCTCTTAGCAAAC
LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC
**** ** ** *** ******* ** **** * *** * * ** * ****
ZEA.MA_B CACCATCTTT
LYC.ES_F CATCACTTTT
** ** ***
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--T
** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
*** * * * * **** ** ** ** ** *** ****** *******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC--TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG
** *** * * * * ****** **** **** * * * **** *****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
** * *********** **************** ** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCT-TAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
HUM.LU_D GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
****** **** *** * *** * * * * * * * ** ** ***
ZEA.MA_C CACCATTTTT
HUM.LU_D CATTTCTTTT
** ****
Mean pairwise ID: 61.31%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
*** **** **** * * * **** *** ** *** ** ** ***** *** ***
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
LYC.ES_I GGCT-GTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
*** * ** * ****** ** * *** ******* ****** *
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCGG
**** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * **** *
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGC-TCTAAGCGGTGGAAGGAT
******* ****************** *** ** * * *** * **********
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCA
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA
** ** *** ** * * ** ** ** * ** * **** ** ***
CIN.HYB. TTT--
LYC.ES_I TTTTT
***
Mean pairwise ID: 61.34%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GGACTT
* ** ** * * *** *** *** **** ** ******* ** ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGT---GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA
**** * ** ** * ** *** * ** ** * **** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
HUM.LU_D AGCCGGGAGTTGGGC-TGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTG
** * * * * ** * ************** * * * * ** *********
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.LU_D GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* *** * ************* *************** **** ****** * * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGC--TTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
HUM.LU_D AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAG
*************** *** ** * ** * * * * * **
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
HUM.LU_D GACCATTTCTTTT
***** * ***
Mean pairwise ID: 61.36%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ** ***** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********* *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_A CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 61.36%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** ** *** * ********** ********* * ***** ***
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** **** * *** *** *** ** * ***** *******
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
*** *** * * ** **** * * ** ** * *** * *
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** * * ******* ** **********
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG-CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGA-TGGGCTG--CTCTAATTAAACCA
**** * ***** * **** *** * ** * ******* **** ****
HUM.LU_C TTTCTTTT
LYC.ES_B CCACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 61.36%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** *** ********* ***** ******** * *** * * * * **
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* * *** * * ** *** *** ** *** ***** *******
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * *
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
**************************** ** * ********** *************
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * ****
LYC.ES_H CCTTTT--
HUM.JA_B TTTCTTTT
* **
Mean pairwise ID: 61.36%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** ** *** ** * ********* ****** *** * * ****** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * ** *** * ** * ** ** * ********* ******* *
ARA.TH_E TGAG-TAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG--GNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG
*** * * * * * ********* ** ** * *******
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
*************** ******************* ******* * ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
* ** * * * ** * ** ** * **** * ** *** * * ****
ARA.TH_E CCATTTT-
HUM.LU_C TTTCTTTT
***
Mean pairwise ID: 61.40%
LYC.ES_D TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATA
TRI.AE_C ----GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-
*** ****** ****** ** *** * * * **** * **** *
LYC.ES_D TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA
TRI.AE_C TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA
***** ** * * * *** * ** * ***** ********************** **
LYC.ES_D ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC
TRI.AE_C CAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGG
* ****** * ************ *** ** ** * * ** * *
LYC.ES_D GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT
TRI.AE_C GCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCATC---
**** * * * ***** * *******
Mean pairwise ID: 61.41%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * *********** * *********** ****** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_B GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * * * ****** * ** * * * * * ******* *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_B CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
* *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA
* * **** ******* *********** **** * * * *** * ******
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGCAAA
LYC.ES_B AGGATAACGA-GTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA
********** * ** ** ** **** * * * ** * * * * **** ***
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
LYC.ES_B CCACCACTTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 61.41%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
******* *** ** * *********** ** **** *********** * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCG-CTTTGTGCAGTGGA
* * ************ *********** *** * *** *** * ****
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA
********** *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
LYC.ES_O CCACCACTTT-
****** **
Mean pairwise ID: 61.44%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
***** *** ** * *********** ******* **** *** ** *** * *
LYC.ES_N GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** *
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** *
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* ************ *********** *** ** * **** * ***********
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCACC
*** * * ** ** *** ** *** * **** * * ***** * ******
LYC.ES_N ATTTTT
TRI.AE_A ------
Mean pairwise ID: 61.44%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** ** ****** ********** ********* * ***** ***
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** **** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************************** *** ** * ***** ** **********
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
**** * ***** * ** * * * *** * *** ****
HUM.LU_B TCCTTT
LYC.ES_I ATTTTT
***
Mean pairwise ID: 61.49%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* ** * ******* ************ **** ** **** *** **
ARA.TH_A -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG-TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
*** ***** * ** ** ** ** * * ** *** ****** ******
ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGT-GGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAG--TGGCA
** *** * ** * * * ***** **** ** **** ** **
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAG
** * *** ******* **************** *** ** **** ** * ***** *
ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATA-GCAGACC
*** ** * * ** * ** ** *** * * ** * * ***
ARA.TH_A ACCATTTT-
TRI.AE_B ACCATCTTT
***** **
Mean pairwise ID: 61.49%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** ********* ***** ******** * *** * * *** ****
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * ******** *************
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACA
** *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * **
HUM.LU_B ATTTCCTTT
LYC.ES_A ACCACCTTT
* *****
Mean pairwise ID: 61.49%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ***** ** *** * ********** ********* * ***** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
** **** * *** *** *** ** * * ****** *******
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC
*** *** * * * *** * * * * ***** * *** * *
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * ** ***** * *************
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGA-TGGGCTGCTCC--AATTAAACC
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
***** ******* ** *** * ** * ******* * *** ***
LYC.ES_G ACCACTTTT
HUM.LU_C ATTTCTTTT
* *****
Mean pairwise ID: 61.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACT--T
** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC
*** * * ** * **** ** ** ** *** *** ****** *******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTG-GGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG
* *** * * * ****** **** *** * * **** ** **
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
** * *********** *************** *** ** *** * * *******
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGC-CACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC
****** ** * *** * ***** * * * * * * ** ** ** ******
ZEA.MA_C ACCATTTTT
HUM.JA_A ATCTCTTTT
* * ****
Mean pairwise ID: 61.56%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
* **** ****** * * *** ****** * *************** ***
LYC.ES_H GGCTGTACC-AGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA
*** * ** * ****** ** * *** ******* ****** *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG-
CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC
**** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * *** **
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT
******* ****************** * *** * *** **** * **********
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC
CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC
* * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** **
LYC.ES_H ACCTTTT
CIN.HYB. ATTT---
* *
Mean pairwise ID: 61.56%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ***** ********* **************** * ** ***** ****
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** ***** * *** *** *** ** **** ****** ******
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
* *********************** *** * ** ***** *************
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
***** ******* * * * *** * * ** * ** *
LYC.ES_E ACATTTT
HUM.LU_B TCCTTT-
* ***
Mean pairwise ID: 61.56%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
** *** ** ****** ********** ********* * *** * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** * * ** *** *** ** *** ***** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************************** *** ** * ****** ** **********
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTG--CTCCAATTAAACCAC
**** * ***** * ** *** * * ** * ** *** ****
HUM.JA_B TTCTTTT
LYC.ES_I CATTTTT
****
Mean pairwise ID: 61.56%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* *** ** * ****** ***** ****** ** *** **** * ** *
LYC.ES_O GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** * **** ** * *** *** * *********** ******
LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG
*** ** **** ***** * * ** ** * *** ****** *
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
*** *** ******************* *** ** ** ****** * *********
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC
**** * *** *** * * * **** * * ** * * *****
LYC.ES_O CACTTT-
TRI.AE_B CATCTTT
** **
Mean pairwise ID: 61.61%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A
******* *** ** * *********** ** **** *********** * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA
*** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG
* *** * * ** * * *** * ** ** * *** ******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC
LYC.ES_O GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
********* *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
LYC.ES_O CACCACTTT-
***** **
Mean pairwise ID: 61.61%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** ** **************** ******* * *** ** ** **** **
ARA.TH_G GGATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG--CTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* ** * **** * * * ** ** * * **** * **** ****** *
ARA.TH_G GTG-AGTGAACCGTATGAACC--AAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGA
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCT-CACGGTCCATAATG-TGGC
* * **** **** ** * * ***** * * * ** ***** *** * * *
ARA.TH_G GGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGAC
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
** * **** ************************ ** ****** ** * *****
ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCT---ACTCCAGCAGA
*** ** ** ** ** * * *** * ** * ** ** * *
ARA.TH_G CCACCATTTT
TRI.AE_A CCACC-----
*****
Mean pairwise ID: 61.61%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT
****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ARA.TH_F -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
*** * ** ** * ** * *** ** * ** ** ****** ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGC--TTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGA
** *** ** *** *** **** * ***** * ** *** *** * *
ZEA.MA_C GGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
** * *********** **************** *** ** *** * * *****
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
**** ** * * * ** * * ** * * * * ** * **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
ARA.TH_F CACCATTTT-
*********
Mean pairwise ID: 61.61%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
*** ** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * *
HUM.LU_A GGTCAACCTAGT--GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
** * * ** * ** * ** * ** ** * ** ****** *******
HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
** ** ** * * * * ********* ***** * * *** ** ** *
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
*** **************************** ** ****** * * **** **
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG-AGCCTCA---TTAAACAGAC
****** ***** *** * *** * * * ** ** ** * **** ***
HUM.LU_A CATTTCTTTT
ZEA.MA_F CACCATCTTT
** ***
Mean pairwise ID: 61.69%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** *********** ****** ** ** ****** * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** * * ** *** * * ***** *** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGT-TCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG-
**** ** * **** * * ** ** * ****** *** **
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** ****** * ****** ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACCA
***** *** * * ** ** * **** * * * * * * *****
ARA.TH_F CCATTTT-
LYC.ES_F TCACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 61.69%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ** ***** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_J CCTTT---
* *
Mean pairwise ID: 61.69%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** **** * * *** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** *
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
*** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT--TTCGCTCTAAGCGGTGGAAG
* * **** ******* *********** **** * * * ** * ****** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
****** ** ** ** ** **** *** * * * * * *** * ******
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_I CCATTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 61.72%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATC-ACGCTTCTGTGAGGTCT-GATTGTGGGATG
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
* * ** * * **** * ******** * *** *** **** * ** ****
DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTT-CTGGGCTTCAG--CGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA
** **** *** * *** * * * * * **** ** * ***** ****
DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG
FUG.RUB. AGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG
** * * *** ****** * *** **** *** * ***** * *********
DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG
FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG
* ** **** ***** **** ***** * ** ****** *********
DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTAT-CAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC
FUG.RUB. GATCGCGCCCGTGAATAGAC-GCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT-CAGTC
*** *** * ** * *** ** ** * ** ** * * * * **** ** **
DRO.MEL. TTT
FUG.RUB. TTT
***
Mean pairwise ID: 61.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * *********** * *********** ****** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
LYC.ES_I GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG
** * * * ****** * ** * * * * * ******* *****
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
LYC.ES_I CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG
* *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGA
* * **** ******* *********** **** * * ** *** * ******
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGCAAA
LYC.ES_I AGGATAACGA-GTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA
********** * ** ** ** **** * * * ** * * * * ** ***
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
LYC.ES_I CCACCATTTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 61.76%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* **************** * * * *** * ***
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** ** *** ***** *******
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** * **** ** * ** ***** ** * *
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************************** *** * * * ***** ** **********
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC
**** ******* * ** * * * * *** * *** * **** *
LYC.ES_N ATTTTT
HUM.JA_A TCTTTT
****
Mean pairwise ID: 61.78%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG--GGACAC
* ***** * *** * * ****** **** * **** ** **** ***** *** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC
ARA.TH_A TGGTTCGGTT---CCTCGGATCGGT-TCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC
* *** ** * * ** ** * *** ** *** * * * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ARA.TH_A AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGT-TGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGT
*** ** * * *** * * ** ********* * * * *******
ORY.SA_B -GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT
ARA.TH_A CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT
** ***** ************* *************** *** ******* ** * **
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATGGC
ARA.TH_A GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
*** **** **** * ** * * ** ** * * * ** * **
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
ARA.TH_A GAACCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 61.81%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
****************** ********** ********** ****** **********
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCG--GCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_H AATTG-TGGTGCATGTGCCTGGGTCTA---GTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA
** ** ** ******* * **** ** * * * * *** ******
ZEA.MA_F GTTG-GTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG
**** ** **** * ** ** ****** ** * * * * ** *** **
ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGG
* * *** ***************** ********** ** ******* *** ******
ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------
******* * **** * * ******
ZEA.MA_F ACCATCTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 61.81%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT-
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
*** * * **** * ** **** ****** *** ** * * * *****
HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
** * *** * * ** ** ** * ** **** ***** ******* *
HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTG-GTCAGCTCCTAAAGCGGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
****** * *** * * ****** ** * ** **** ** *** **
HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
********* ****************** **** ****** ****** * ********
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCAT-ATAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC-
** ** ***** * *** * * ** ** * *** * * ** *****
HUM.JA_B ATTTCTTTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
* ***
Mean pairwise ID: 61.81%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** *********** ****** ** ** ****** * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** * * ** *** * * ***** *** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
**** ** * **** * * ** ** * * ****** *** **
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************* *********** ****** * ****** ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACC
****** *** * * ** ** * **** * * * * * * ****
ARA.TH_A ACCATTTT-
LYC.ES_F ATCACTTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 61.81%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** ********* ***** ******** * *** * * *** ****
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** **** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********* ************ ** * ********* *************
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACA
** *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * **
HUM.LU_B ATTTCCTTT
LYC.ES_J ACCACCTTT
* *****
Mean pairwise ID: 61.81%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* *** * *** *** * ******** ********** * ***** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAG--GGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGC-TGCCCATTCCAAGCC
**** * * * * *** * *** * * *** ***** *******
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGC
*** **** ** * ** **** * * **** *** *
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** ****** ******** *************
LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAACC
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC--AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
****** **** * ***** * **** * * ** ** * **** ***
LYC.ES_F ATCACTTTT
HUM.LU_C ATTTCTTTT
** *****
Mean pairwise ID: 61.86%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT
******* **** ** * ************** ******* ** ****** ** * *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCC-GGCCTGCCCGTCCCA
LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTG--AAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * *** *** ***** * * * ** ** * ********* ***
ZEA.MA_D AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
LYC.ES_F AGCACAGAGTTGG-GTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG
** *** * * * * * ** *** * * * * ** * *****
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * ************ *********** *** * ** ****** * ****
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCC-AACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAG
LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA
***** ** *** *** *** *** ** *** * ** ** * **** *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT-
LYC.ES_F ACCATCACTTTT
**** ** **
Mean pairwise ID: 61.86%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** ** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTT-CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA
*** * * * ****** * * **** * * * *** ****** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ARA.TH_C GTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTC-GGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG
***** *** * *** ** ****** *** ******* ** *** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGA
* * **** ******* ************** *** ** *** *******
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAG--AACCTCACTAAGCAA
ARA.TH_C AGGATTACGG-GCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG
***** *** *** *** * ***** * ** * * ** * ** * * *
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
ARA.TH_C ACCATCACTTT-
**** ** **
Mean pairwise ID: 61.89%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
****** *** *** * * * * ** ************* ********
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGG-CTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* ** **** * **** * * **** **** * ****************
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
******************************** **** **********************
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTC-TGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
**** * ***** *** ** ** * * ********** ** * ***** **
LYC.ES_C CACATTT
LYC.ES_L CACTTT-
*** **
Mean pairwise ID: 61.89%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** *
LYC.ES_J GG-GCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCT-ACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * *** ** **** *** * * ****** **** ******
LYC.ES_J AGAGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* **** * * * *** * **** **** ** * * * *** ****
LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* ** ** ********************** ** * ****** * ********
LYC.ES_J ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC
******** ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** **
LYC.ES_J CACCTTT
TRI.AE_A C------
*
Mean pairwise ID: 61.94%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T
****************** ********************** ****** *** **** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGG-TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAA
*** * ** *** *** * ** ** * *** * ****
ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG
**** ******* * **** ** ** *** ******** * *** ** ******
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGG
* * ** ***************** ********** ** **** ** *** ******
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------
******* * * **** ** ******
ZEA.MA_E CACCATCTTT
ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 61.97%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ***** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* **********************************************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
************************************************ ***** *****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_D TTTT-
***
Mean pairwise ID: 62.01%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * ********** ** *********** ****** * *****
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG-
LYC.ES_I G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
* * * * ******** ** ** * * * * * ***** ******
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGAAG
* * ************ *********** **** * * **** * ****** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACCA
LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA
****** * ** ** * ** *** * * * * * ** * ****
ZEA.MA_F CCATCTTT
LYC.ES_I CCATTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 62.01%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* * ***** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
*************** ************ ** * ********** *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_H CCTTTT--
* **
Mean pairwise ID: 62.01%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * *********** * *********** **** * * *** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** *
ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
*** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** **
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCCGCTCTAAGCGGTGGAAG
* * **** ******* *********** **** * * ** ** * ****** **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACCA
LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA
****** ** ** ** ** **** *** * * * * * * **** * ******
ZEA.MA_B CCATCTTT
LYC.ES_B CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 62.01%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** ****** ************ ******* ***** ****** * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
* * * * ** ** ****** ****** ****** ******
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
**** * *** * *** * **** ** *** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* *********** *********** *** * * ****** ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTAC
**** * * * ** *** ** ***** *** * * *** * * *** **
ARA.TH_F CATTTT--
LYC.ES_E CACATTTT
** **
Mean pairwise ID: 62.09%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ***** ** ****** ********** ********* * ***** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** **** * * *** *** *** ** **** ****** *******
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************ *** * ** ***** *************
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
***** ******* * * * *** * *** ****
LYC.ES_G ACTTTT
HUM.LU_B TCCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 62.09%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ** ****** ********** ********* * * *** * ***
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** ** *** ***** *******
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** * **** ** * ** ***** ** * *
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************************** *** * * * ***** ** **********
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC
**** ******* * ** * * * * *** * *** * **** *
LYC.ES_I ATTTTT
HUM.JA_A TCTTTT
****
Mean pairwise ID: 62.09%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ***** ********* **************** * ** ***** ****
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
** ***** * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************************ *** * ** ***** *************
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
***** ******* * * * *** * *** ****
HUM.LU_B TCCTTT
LYC.ES_O ACTTT-
* **
Mean pairwise ID: 62.10%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG--GGACAC
* ***** * *** * * ****** **** * **** ** **** ***** *** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC
ARA.TH_F TGGTTCGGTT---CCTCGGATCGGT-TCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC
* *** ** * * ** ** * *** ** *** * * * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ARA.TH_F AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGT-TGAGCGAAGGCTTGGC--TTGCAGGTTCTAGAGT
*** ** * * *** * * ** ********* * * * * *******
ORY.SA_B -GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT
ARA.TH_F CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT
** ***** ************* *************** *** ******* ** * **
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATGGC
ARA.TH_F GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT
*** **** **** * ** * * ** ** * * * ** * **
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
ARA.TH_F GAACCACCATTTT-
******* **
Mean pairwise ID: 62.14%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * * *** * *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCC-GGCTTGCCCATCCCAAGT
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
* * ****** ** * * * ** ** * *** ****** ******
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTG-ACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTC-GGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
*** *** * * *** ** ****** *** ******* *** ** **
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCAC-CTCCCGCTCTTGACGGTGGAA
* * **** ******* ************** *** * *** ** ******* *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACC
ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC
**** ** *** *** * ******* * ** * * ** *** * ***
ZEA.MA_B ACCATCTTT
ARA.TH_C ATCACTTT-
* ** **
Mean pairwise ID: 62.14%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** * ************* ****** **** * ** ** **** **
ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG--GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * ****** * **** * ** * * **** * **** ****** *
ARA.TH_E GTG-AGTAAGACGTGTGTG--TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGC
* * *** ** ** * * * ***** *** ** ** **** *** ** **
ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
** * ************ **************** *** ******* ** * *****
ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA--CTCCAGCAGAC
**** * * * * *** * ***** * * *** **
ARA.TH_E CACCATTTT
TRI.AE_A CACC-----
****
Mean pairwise ID: 62.14%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T
****************** ********************** ****** *** **** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGG-TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAA
*** * ** *** *** * ** ** * *** * ****
ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG
**** ******* * **** ** ** *** ******** * *** ** ******
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA
* * ** ***************** ********** ** ****** *** ******
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_H AGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------
******* * * **** ** ******
ZEA.MA_G ACCATCTTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 62.14%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T
****************** ********************** ****** *** **** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_H CAATTGTGG-TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAA
*** * ** *** *** * ** ** * *** * ****
ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG
**** ******* * **** ** ** *** ******** * *** ** ******
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGG
* * ** ***************** ********** ** ******* *** ******
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------
******* * **** ** ******
ZEA.MA_D CACCATCTT
ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 62.14%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* * ****** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
**** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_K ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 62.18%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT
******* **** ** * ************** ******* ** ****** ** * *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCC-GGCCTGCCCGTCCCA
LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTG--AAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * *** *** ***** * * * ** ** * ********* ***
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
LYC.ES_F AGCACAGAGTTGG-GTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG
** *** * * * * * ** *** * * * * ** * *****
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGG
* * * ************ *********** *** * ** ** *** * ****
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCC-AACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAG
LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA
***** ****** *** *** *** ** *** * ** ** * **** *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
LYC.ES_F ACCATCACTTTT
**** ** ***
Mean pairwise ID: 62.21%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* **************** * ** * *** * ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** **** * *** *** *** ** **** ****** ******
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** ** *** * *** * ******** ** * *
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* *********************** *** * ** ***** * *************
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC
***** ****** * * * * *** ** * ** * * ** * *
LYC.ES_E ACATTTT
HUM.JA_A TCTTTT-
* ***
Mean pairwise ID: 62.21%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** *
LYC.ES_A GG-GCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCT-ACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * *** ** **** *** * * ****** **** ******
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* **** * * * *** * **** **** ** * * * *** ****
LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
* ** ** ********************** ** ** ****** * ********
LYC.ES_A ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC
******** ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** **
LYC.ES_A CACCTTT
TRI.AE_A C------
*
Mean pairwise ID: 62.21%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
*** * * **** * ** **** ****** *** ** * * * * ******
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACA-CCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
HUM.JA_A GG-TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
* * ** * * ***** * * * ** **** ***** ******* *
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCAC-AGCTCCTAAAGAGGAGG
****** ** *** *** ********* **** **** ** ** **
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
********* ****************** **** ***** ****** * ********
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCA--GCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
** ** * *** * *** *** ** ** ** ** * *** **
CIN.HYB. CCATTT-
HUM.JA_A CTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 62.21%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******* ** * ******** ************ **** ** **** * * **
ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
* * *** **** * ** ** ** * ** **** ****** ****** *
ARA.TH_E GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAG--TGGCAGG
* *** * * *** * ***** **** ** * * *** *** **
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGGA
* *** ************************ *** ** **** ** * ***** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATA-GCAGACCAC
* **** * ** * ** ** *** * * ** * * *****
ARA.TH_E CATTTT-
TRI.AE_B CATCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 62.21%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT
TRI.AE_B -NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
* * *** ** * ** *** ***** ********** ** ** *** *
HUM.LU_D GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
*** * ** * * ** * *** * *** **** ****** *******
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC
** *** ****** *** * ******* *** * *** ***** ***
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
* *** ******* **************** ** * ***** * * **********
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCAC
*** ***** *** * *** ** * ** * * * * * ** ** ****
HUM.LU_D TTCTTTT
TRI.AE_B CATCTTT
***
Mean pairwise ID: 62.26%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
* ** ** ** * ** ******** *********** * *** **** *
HUM.LU_B GGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* *** * * ** * **** * ** *** ** **** * **** *******
HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA
* * *** * * ** * * ***** ** ***** * * * * ** ****
HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
**** ************ **************** ** ****** ** * *******
HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA---CTCCAGCAGAC
***** ****** *** * * * *** * * * *** ** * * ***
HUM.LU_B CATTTCCTTT
TRI.AE_A CACC------
**
Mean pairwise ID: 62.26%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT
******** ****** * ********* *** * ****** * ****** * *****
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCT-GGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_C G---AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG
** * * * ******** ** * * * * ********* ******
ZEA.MA_F TTGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LYC.ES_C CAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGG
** ** * ** ** * ******** ***** ** *** *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_C TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCG-GTCCA--GAGCCTCATTAAACAGAC
LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
******* *** ** * *** **** *** * ** ** * **
ZEA.MA_F CACCATCTTT
LYC.ES_C TACCACATTT
**** ***
Mean pairwise ID: 62.26%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAA-GGTAG-TGTGGATG
******** ******** ** ******** ********** *** *** * ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTC---TAGTGCTACAAACT--GTGGACCACCCATTC
* ***** ** ****** * * ** * ** ** *** *** ***
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ZEA.MA_H CAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGC------TTTGCATC-CCAACAC
**************** * ** ******** ** ***** ** ** * *
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
ZEA.MA_H TAAAGTGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCA
********* * ** ***************** ********** ** ****** ***
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
ZEA.MA_H GCGGTGGAAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------
************** * *** * * ***** *
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_H ------------------
Mean pairwise ID: 62.26%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** ****** ************ ******* ***** ****** * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
* * * * ** ** ****** ****** ****** ******
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGT-GGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
**** * *** * * *** * *** * * *** *** ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_E G--ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
* * *********** *********** *** * * ****** ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LYC.ES_E ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACT
** **** * * * ** *** ** ***** *** * * *** * * ***
ARA.TH_A ACCATTTT--
LYC.ES_E ACCACATTTT
**** **
Mean pairwise ID: 62.26%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT
* ** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
HUM.LU_B GGGTCA-GCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC
* * * *** * ** * ** * ** ** * ** ****** *******
ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
** ** ** * * * * *************** * *** ** ** *
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCCCGGCAGTGGAAG
*** ************ *************** ** ****** ** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTC-CAGAGCCTCA---TTAAACAGAC
HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC
****** ***** *** * * *** * * ** * * *** * **** * ***
ZEA.MA_F CACCATCTTT
HUM.LU_B CATTTCCTTT
** ****
Mean pairwise ID: 62.30%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GAACAT
* * * * *** *** *** **** ** ******* ** ** * *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
HUM.LU_B TGGGTCA---GCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA
**** ** * ** ** * ** *** * ** ** * **** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
HUM.LU_B AGCCGGGAGTTGGGC-TGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTG
** * * * * ** * ************* * * * * ** *********
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.LU_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGG
* *** * ***************************** **** ****** ** * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCC--TTCCATGGCA
HUM.LU_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTACT-TGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCG
*************** *** * *** ** * * * ** * ** *
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
HUM.LU_B GACCATTTCCTTT
***** *****
Mean pairwise ID: 62.31%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTA----GATGGTGGAAC
* ****** **** * **** ********* * **** ** * * * * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTC---TGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTC
**** ** * * * ** * ******** ** ** **** ***** **
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC-
ARA.TH_E CAAGCTGTG-AGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGC------TTGGCTCAAACGGCTT
**** ** * *** * ** * * * ******** ** *** ****
ORY.SA_A CTAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
ARA.TH_E CTAAAGTTGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA
******* ** ** * ************ *************** *** *******
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ARA.TH_E CAGCAGTGGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGAT
** * ***** **** **** * * ** * ** ** * * ****
ORY.SA_A TACA-ACAGACCACCATCTTT
ARA.TH_E CTCATATGAACCACCATTTT-
** * ******** **
Mean pairwise ID: 62.34%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T
****************** ********************** ****** * * ***** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT
ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTT
**** ** ******* ** ** ** ***** *******
ZEA.MA_B G-GTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA---CTAAAGTGGCG
* ****** * *** ** * ************ ** * ** *** ** ***
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGGAA
* ** **** ************ ********** ** ***** * *** ****** *
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-----------------------------
****** ** **** ** * ******
ZEA.MA_B CCATCTTT
ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 62.34%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
******** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** * ** ** *** ** * * ******* ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * **** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** *
ARA.TH_D CCACTTT-
LYC.ES_J CCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 62.34%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
****** *** * * ********** ** *********** ****** * *****
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG-
LYC.ES_B G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC
* * * * ******** ** ** * * * * * ***** ******
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC
** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCCGCTCTAAGCGGTGGAAG
* * ************ *********** **** * * ***** * ****** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACCA
LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA
****** * ** ** * ** *** * * * ** * *** * ****
ZEA.MA_F CCATCTTT
LYC.ES_B CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 62.34%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** * ********* ** *** ** *** * ****** * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
* * * * ** ** **** ** * **** ****** ********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT-GGGGTG
**** * ** * ************* * * *** *** ** * *
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************* *********** *** ** ******* ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCA-CTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA
* *** ** *** * ** * * * *** *** * * *** * * *** *
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_C CCACATTT
*** **
Mean pairwise ID: 62.38%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
****** *** ** * ********** *** **** *********** * ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_E G---GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
* * * * * * ********* ** ** * * * ********* ******
ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG
* * *** * ** ** * *** * ***** ** * *** *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_E TGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* * *********** *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGAC
LYC.ES_E GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC
******* * *** *** ** **** * * * ** ** ** ** * **
ZEA.MA_F CACCATCTTT-
LYC.ES_E TACCACATTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 62.38%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATG--GGACTT
*** * * *** *** *** **** ** ******* ** * ** ***
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
HUM.JA_A TGGGTCA---GCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCA
**** ** * * ** ** * ** *** * ** ** * **** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
HUM.JA_A AGCCGAGAGTTGGGC-TGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAG
** * * * * ** * ************* * * * * ** **** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
HUM.JA_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG
* *** * ***************************** *** ****** * * ****
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
HUM.JA_A AAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGA
************ ** *** * **** * * * *** ** ****
ORY.SA_B CCACCACCTTT
HUM.JA_A CCATCTCTTTT
*** * * ***
Mean pairwise ID: 62.38%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
*** ** ** ** * ** ******** *********** * *** * ** *
HUM.LU_A GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * ** * **** * ** *** ** **** * **** *******
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAG-CTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA
* * *** * * ** * * ***** * ****** * * * ** ****
HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
**** ***************************** ** ****** * * *******
HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGC--AGCCTACTCC--AGCAGA
***** ****** *** *** ** * * ** ** * ** **** * **
HUM.LU_A CCATTTCTTTT
TRI.AE_A CCACC------
***
Mean pairwise ID: 62.38%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT
******* **** ** * ************** ******* ** ****** ** * *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCC-GGCCTGCCCGTCCCA
LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTG--AAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA
* * *** *** ***** * * * ** ** * ********* ***
ZEA.MA_G AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
LYC.ES_F AGCACAGAGTTGG-GTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG
** *** * * * * * ** *** * * * * ** * *****
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGA
* * * ************ *********** *** * * ****** * ****
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCC-AACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGA
LYC.ES_F AGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAA
***** ****** *** *** *** ** *** * ** ** * **** * *
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
LYC.ES_F CCATCACTTTT
*** ** ***
Mean pairwise ID: 62.42%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** * * *********** * ************ *** ** *** * *
LYC.ES_B GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** *
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** *
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* ************ *********** *** ** * ***** * ***********
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCACC
*** * * ** ** *** ** *** * **** * ** *** * * ******
LYC.ES_B ACTTTT
TRI.AE_A ------
Mean pairwise ID: 62.42%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
******* *** * * *********** * ************ *** ** *** * *
LYC.ES_I GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** *
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** *
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
* ************ *********** *** ** * **** * ***********
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCACC
*** * * ** ** *** ** *** * **** * * ***** * ******
LYC.ES_I ATTTTT
TRI.AE_A ------
Mean pairwise ID: 62.46%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** *** ********* **************** * ** *** * **
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* * **** * ** *** *** ** **** ****** ******
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
******* **** ** *** * *** * * ******** ** * *
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* *********************** *** ** ** ***** * *************
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
***** ******* * * * *** * * ** **** * ** * ** *
LYC.ES_E CCACATTTT
HUM.JA_B TTTCTTTT-
* ***
Mean pairwise ID: 62.46%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
TRI.AE_C ------------------------------------------------------------
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC
TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA
* *** * ***************
TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC
************ ****** ********** **** ************************
TRI.AE_A ACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
** *********************************************************
TRI.AE_A AATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC--
TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GACCACCAT
** ********************* ********** ************* *******
TRI.AE_A -
TRI.AE_C C
Mean pairwise ID: 62.46%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ************ ***** ****** ****** * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * * * * ** ** ****** ****** ****** *******
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGT-GGTCCAATTGAAAGAATGGGCTAC-TAGATTCCTAAAGTGGGGT
**** * *** * * *** * *** * ** *** * ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
* * ************ *********** *** * * ****** ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACC
** **** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ****
ARA.TH_A ACCATTTT-
LYC.ES_G ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 62.46%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGT--AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGG
LYC.ES_A AGAGTTGGATCT-CGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGC
**** **** * ** ** *** ** * * ******* ** *
ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG
LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGAAGG
* * ** ********* ************ ** ** ** * ******** **
ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
LYC.ES_A ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACA
** ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * **
ARA.TH_D ACCACTTT-
LYC.ES_A ACCACCTTT
***** **
Mean pairwise ID: 62.46%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ***** ********* ***** ******** * *** * * *** ****
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** **** * * *** *** *** ** *** ***** *******
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
**************************** ** * ********* *************
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA-ACC
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
** *** ***** ** ** ** * * * *** * *** * ***
LYC.ES_H ACCTTTT--
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* * *
Mean pairwise ID: 62.54%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** * ********* ** *** ** *** * ****** * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
* * * * ** ** **** ** * **** ****** ********
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC-AGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
**** * ** * ************* *** ** ** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** *** ** ******* ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCA-CTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTAC
*** ** *** * ** * * * *** *** * * *** * * *** **
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_C CACATTT
** **
Mean pairwise ID: 62.54%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
*** ** *** ** * ****** * *** **** * ** * *** * ** *** * *
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCT-TGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
*** * **** * *** * * * ** * * ****** **** ********
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
TRI.AE_B TGGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTA-AGTGGCAG
*** *** * * * * * * ***** *** * ** ** ***** *
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
*** *** ********************** * ** * ***** ***********
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC
** ** **** *** * **** ** ** ** * ** * * *****
ARA.TH_C CACTTT-
TRI.AE_B CATCTTT
** **
Mean pairwise ID: 62.54%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ************ ***** ****** ****** * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * * * * ** ** ****** ****** ****** *******
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
**** * *** * *** * **** ** *** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * * ****** ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCAC
**** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ******
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_G CACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 62.58%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGAC-TTT
** * * ********* ******** ********** * *** * **
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC
** * * ***** ** * * * ** * **** ****** *******
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCC-ACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG
******* * *** * ***** ** * ** * ** ** ** ** *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* ************************* **** * ******** ************
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAAC
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCC--ACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC
* ****** ***** *** ** ** * * * ** * **** **
LYC.ES_F CATCACTTTT
HUM.JA_B CATTTCTTTT
*** *****
Mean pairwise ID: 62.58%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
** *** ** ** * ** ******** *********** * *** * ** *
HUM.LU_D GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * ** * **** * ** *** ** **** * **** *******
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG
* * *** * * ** * * ***** ******* * * * * ** **** *
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG
*** ***************************** ** ****** * * ********
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC
TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGC--AGCCTACTCC--AGCAGAC
**** ****** *** *** * * * ** ** * ** **** * ***
HUM.LU_D CATTTCTTTT
TRI.AE_A CACC------
**
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ************ ***** ****** ****** * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC
**** * *** * * **** *** * * ** *** ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGG
* *************** *********** *** * ** * *** *** ***** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_I ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCA
** *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * *****
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_I CCATTTTT
*******
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** ** ** ** *** * ****** ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGACGT-GTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** ** * * * *** *** *** * * ******* ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** ** ****** ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_A CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGTAATCT-GTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG
***** * * ** ** *** ** * * ****** *** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * **** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** *
ARA.TH_D CCACTTT-
LYC.ES_K CCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** ** ** ** *** * ****** ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGC-GGGGCG
***** ** * * * *** *** *** * * ****** ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * ******* ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_K CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ** ****** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********* *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_A ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 62.78%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ****** * ****** ************ *** ** ********* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** ** ** ** * *** * ** * **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
**** **** * **** * * * ** ** * ** *** *** **
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************* ****** * *** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCC--ACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACC
*** * * * *** ** * ** * * * * * * * ***
ARA.TH_D ACCACTTT-
LYC.ES_F ATCACTTTT
* ******
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ** ***** ********* **************** * ** *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* *********** *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGT-CCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
***** ******* * ** *** * * ***** * ** * ** *
HUM.LU_A TTTCTTTT-
LYC.ES_E CCACATTTT
* ***
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
******* * **** * ** **** ****** *** ** * * * ******
HUM.LU_D GG-TCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* * * *** * ***** ** * ** **** ***** ******* *
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** ** ** **** ********* **** * **** * ** **
HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
********* ******* ********** **** ***** ****** * ********
HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCAT-ATAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC-
** ** ***** * * * * ** ** * **** * * ** *****
HUM.LU_D ATTTCTTTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
* ***
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
**** *** * **** * ** **** ****** *** ** * * * ******
HUM.LU_A GG-TCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC
* * * *** * ***** ** * ** **** ***** ******* *
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGG
CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG
* **** ** ** **** ******* **** * * **** * ** **
HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG
********* ******* ********** **** ***** ****** * ********
HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC
CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCAT-ATAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC-
** ** ***** * * * ** ** ** * **** * * ** *****
HUM.LU_A ATTTCTTTT
CIN.HYB. ACCCATTT-
* ***
Mean pairwise ID: 62.78%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC
**** * *** * * **** *** * * ** *** ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG
* *************** ************ ** * ******* ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG-AAC
LYC.ES_H ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC
** * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** *** ***
ARA.TH_A CACCATTTT
LYC.ES_H CACCTTTT-
**** ***
Mean pairwise ID: 62.78%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** ******* * ****** **** ******** ************* * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
* * ** ** * ** ** * * ** **** ****** ******
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
**** ***** ** *** * ** * * * ******* ** **
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_E --ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* *********************** *** * * ** *** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGAT-CCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA
* * * ** * ** ** * *** ** *** * *** * *** * ** *
ARA.TH_D CCACTTT--
LYC.ES_E CCACATTTT
**** **
Mean pairwise ID: 62.87%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ************ ***** ****** ****** * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
**** * *** * * **** *** * * * *** * ** * *
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************** *********** *** * ** * *** *** ***** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC
* *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ******
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_I CATTTTT
******
Mean pairwise ID: 62.87%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** * * ****** **** * ***** ** *** ********* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ***** ** **** ** * * * ****** ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTA-AGCGGTGGAAGGA
*************************** *** * ** * ** *** ***** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTC-CAATTAAACCAC
* * *** ** **** ** *** * *** * * ** * * *****
ARA.TH_D CACTTT-
LYC.ES_I CATTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 62.87%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
** *** ** ****** ********** ********* * *** * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** * * ** *** *** ** *** ***** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************************** *** ** * ******* ** **********
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTG--CTCTAATTAAACCAC
**** * ***** * ** *** * * ** **** **** ****
HUM.JA_B TTCTTTT
LYC.ES_B CACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 62.87%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* * ***** ********* **************** * * *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** ** * ****** ** **********
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC
**** * ***** * *** ***** * * ** ** * *** ****
HUM.LU_A TTCTTTT
LYC.ES_N CATTTTT
****
Mean pairwise ID: 62.99%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** ** * * *** * ****** ****** ****** * * ***** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAG-GTAGGGCTTGTG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
***** * ** * *** * * * * * ****** *******
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC
*** **** * * * ********* * ** * ****** * *** * *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** *** ** ********** *************
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGC-CAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
**** *** *** * ** **** ** ******* * ** * ** *
LYC.ES_C CCACATTT
HUM.LU_C TTTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 62.99%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ***** ****** ************ ******* **** ****** * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC
**** * *** * * **** *** * * ** *** ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGG
* *************** *********** *** * ** * *** *** ***** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_N ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCA
** *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * *****
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_N CCATTTTT
*******
Mean pairwise ID: 62.99%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
******** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** ** ** ** *** * ****** ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG
**** ** * * * *** *** *** * * ******* ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** ********* ************ ** * ******* ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** *
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_J CCACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 62.99%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
**** * *** * * **** *** * * * *** * ** * *
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
*************** ************ ** * ******* ******** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG-AACC
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
* * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** *** ****
ARA.TH_F ACCATTTT
LYC.ES_H ACCTTTT-
*** ***
Mean pairwise ID: 62.99%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** ** * *********** ******* **** *** ** *** *
LYC.ES_E GGGCTGTCCCAGATGGC-TGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** *** ** **** **** * ****** **** *******
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** ** **** * * * * *** **** *
LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** *********** *********** *** ** ****** * *********
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC
*** ** *** *** *** ** * *** **** * ** ** ** * ** **
LYC.ES_E CACATTTT
TRI.AE_A C-------
*
Mean pairwise ID: 63.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAGATG-GGACT
** ** * ** * ************** ******* ** * ** ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTGCTGGTCTGCCCATT
** *** * ** * *** ** **** * ** ******** ***** **
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
HUM.JA_A CCAAGCCGAGAGTTGGGCTGT-GTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-----C
***** * * ***** * * * * ********* * * ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
HUM.JA_A CTAAAGAGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTC
****** ** **** ************ *************** *** ****** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
HUM.JA_A GGCAGTGGAAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCT
* ************* ** * *** ******** * * * * * ****
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
HUM.JA_A TAATCAGACCATCTCTTTT
* ******* * ***
Mean pairwise ID: 63.06%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATG-T
******* **** ** * ************** ******* ** ****** ***** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCC-GGCTTGCCCATCCCAA
LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGA---TGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
* * *** *** ****** * * * * ** * *** ***** ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTA-GCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGC
LYC.ES_F GC--ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTAT--AGCCACTTGGCCTTTAGAGT
* ** ** *** * * **** ****** * * * ** * ***
ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG
LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG
** * * * **** ******* *********** *** * * ** *** * ***
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAG-CCTAACTCAGGCTCAGAACCTCAC-TAAGC
LYC.ES_F GAAGGATCACGG-GCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATT
* ***** *** ** *** ******* ****** * * * * * ***
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
LYC.ES_F AAACCATCACTTTT
****** ** ***
Mean pairwise ID: 63.07%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ********* **************** * ** * *** * ***
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** **** * *** *** *** ** **** ****** *******
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** ** *** * *** * ******** ** * *
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************ *** * ** ***** * *************
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC
***** ****** * * * * *** ** *** * **** *
LYC.ES_O ACTTT-
HUM.JA_A TCTTTT
****
Mean pairwise ID: 63.11%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
******* *** * * ********** ** *********** ****** * *****
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
LYC.ES_G G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC
* * * * ******** ** ** * * * ********* ******
ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT
* *** * ** ** * *** * ***** ** * *** *** **
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGAAG
* * ************ *********** *** * ****** * **** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGACC
LYC.ES_G GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC
****** * *** *** ** **** * * * ** ** ** * ** * ***
ZEA.MA_F ACCATCTTT
LYC.ES_G ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 63.11%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** *** * *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
*** ** * * ****** * ** ** * * ***** **** ********
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTC-GGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
*** *** * * * * * *** **** * *** ** * *** *****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
* ** *********** ************** *** ** *** ** **********
ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACC
*** ** ***** *** * ** * ** ** * * * * * ****
ZEA.MA_C ACCATTTTT
ARA.TH_C ATCACTTT-
* ** ***
Mean pairwise ID: 63.11%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ** ****** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** * **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
******* * * ** *** **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ** ********************** ** * ********** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_J ACCTTT---
* * *
Mean pairwise ID: 63.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGG--GGATG-GGACG
* *** ******* ** * ** *** * ***** ** * ** *** * ** ** *** *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGG-GTTGG-GCTATATT-CTGGCCCGCCCATTC
** *** * * * *** * **** * ** ** ***** **** ***
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTG-GCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ARA.TH_C CAAGTTGGGAGTTGAG--GCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCT-----T
******* * ** * * * ****** * ******** * * ***
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
ARA.TH_C CTAGAGTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTT
*** ***** * ** ************ ************** *** ******
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
ARA.TH_C GACGGTGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTA-TGACCCAATAAGCCGCT
************ ** *** *** * **** ** ** **** ** **
ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT
ARA.TH_C CCGATTGGACCATCACTTT-
* * ***** ** **
Mean pairwise ID: 63.19%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ***** ******* * ****** **** ******** *** ********* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ***** ** **** ** * * * ****** ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTA-AGCGGTGGAAGGA
*************************** *** * ** * ** *** ***** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTC-CAATTAAACCAC
* * *** ** **** ** *** * *** * * ** * * *****
ARA.TH_D CACTTT-
LYC.ES_N CATTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 63.19%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ***** ****** ************ ******* **** ****** * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
**** * *** * * **** *** * * * *** * ** * *
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************** *********** *** * ** * *** *** ***** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC
* *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ******
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_N CATTTTT
******
Mean pairwise ID: 63.19%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* * ****** ********* **************** * * *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** ** * ****** ** **********
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC
**** * ***** * *** **** * **** ** * *** ****
HUM.LU_D TTCTTTT
LYC.ES_N CATTTTT
****
Mean pairwise ID: 63.21%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC
********* ** ***** ************** ******* *** ** **** * *
TRI.AE_A G-TTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG
**** * ** * * ***** * * * * *** ** *** **********
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
ZEA.MA_H CGTAGTGGGTT-TCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCGGA
******** * * ** * ********* * ** * * *** ***** *
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA
** ***************** ********** ** ****** *** ***********
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC
ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------
***** * **** ** * *****
Mean pairwise ID: 63.23%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
******* *** ** * ********** *** **** *********** * ** **
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
LYC.ES_O G---GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG
* * * * * * ********* ** ** * * * ********* ******
ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG
* *** * ** ** * *** * ***** ** * *** *** **
ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
LYC.ES_O TGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGAA
* * ************ *********** *** * ****** * **** *
ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGAC
LYC.ES_O GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC
******* * *** *** ** **** * * * ** ** ** * ** * **
ZEA.MA_F CACCATCTTT
LYC.ES_O CACCACTTT-
***** **
Mean pairwise ID: 63.31%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** ****** ************ ******* ***** ****** * * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** ****** ****** *******
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGT-GGTCCAATTGAAAGAATGGGCTAC-TAGATTCCTAAAGTGGGGT
**** * *** * * *** * *** * ** *** * ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_O GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG
* * ************ *********** *** * * ****** ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LYC.ES_O ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACC
** **** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ****
ARA.TH_A ACCATTTT
LYC.ES_O ACCACTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 63.31%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
** *** ********* **************** * ** *** * **
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * **** * ** *** *** ** **** ****** *******
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* **** ** *** * *** * * ******** ** * *
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************************ *** ** ** ***** * *************
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--CTCCAATTAAACCA
***** ******* * * * *** * * ** **** *** ****
HUM.JA_B TTTCTTTT
LYC.ES_O CCACTTT-
****
Mean pairwise ID: 63.31%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** * * ****** **** * ***** ** *** ********* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * *** ** * ** ** * * ** **** ****** *******
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG
**** ***** ** *** * ** * * * ******* ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************ *** * * ** *** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGAT-CCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTC-CAATTAAACCA
* * * ** * ** ** * *** ** *** * *** * ** * * ****
ARA.TH_D CCACTTT-
LYC.ES_G CCACTTTT
*******
Mean pairwise ID: 63.31%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
*** *** *** ** * ****** * * *** ** * ** ***** * ** *** ***
ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
* ****** ** * ** ** * * **** **** ********
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
ZEA.MA_F TGGTTGTGGCTG-GTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
*** ** * * **** *** ******** *** *** * ** ** ** *
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCT-CCCGCTCTTGACGGTGGAAG
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
* ************ ************** *** ****** ******* **
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG--AGCCTCATTAAACAGACCA
*** ** **** *** ** * ****** * *** **** * * *****
ARA.TH_C TCACTTT-
ZEA.MA_F CCATCTTT
** **
Mean pairwise ID: 63.40%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ** ****** ********** ********* * * *** * ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** ** **** ****** *******
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** ** *** * *** * ******** ** * *
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************ *** * ** ***** * *************
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC
***** ****** * * * * *** ** *** * **** *
LYC.ES_G ACTTTT
HUM.JA_A TCTTTT
*****
Mean pairwise ID: 63.40%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** ****** ************ ******* ***** ****** * * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * * * ** ** ****** ****** ****** *******
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
**** * *** * *** * **** ** *** * ** * *
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * * ****** ******** ****
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCAC
**** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ******
ARA.TH_F CATTTT
LYC.ES_O CACTTT
** ***
Mean pairwise ID: 63.43%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* * ****** ********* ***** ******** * *** * * * * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
*************** ************ ** * ********** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_H ACCTTTT--
* * **
Mean pairwise ID: 63.43%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ** *********** ****** ** * ******** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* ** ** ** ** * ***** **** ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
**** * * *** * **** * * ** ** *** * ** *** *** **
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************* ****** * ****** ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACC
**** * *** * * ** ** * **** * * * * * * ****
ARA.TH_E ACCATTTT-
LYC.ES_F ATCACTTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 63.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG
*** *** *** ** * * *************** **** ***** *** ***
LYC.ES_C AACATG-CCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTC-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTA-GACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG
* * ** * ** ** *** *** **** * ***** ***** ******
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGC-TGGGCTCCTAAAGTGGGGTG
CIN.HYB. AGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGG
***** ** ** *** * ********** *** ** *** ** **** *
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
CIN.HYB. CAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGA
* ***** ****************** **** * *** **** * *********
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
CIN.HYB. TTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACC
* ** **** * ** ** * *** ** * * **** * * ** *
LYC.ES_C CACATTT
CIN.HYB. CATTT--
** *
Mean pairwise ID: 63.52%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** ***** * * ****** **** * ***** ** *** ********* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ***** ** **** ** * * * ****** ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************************** *** * ** ** ** *** ***** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCAC
* * *** ** **** ** *** * *** * *** * *****
ARA.TH_D CACTTT-
LYC.ES_B CACTTTT
******
Mean pairwise ID: 63.55%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG-GAACAGT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
****** *** *********** ************ ** *** *** ** **** *
ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG--GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * **** * * *** * ** ** *** * **** ****** *
ARA.TH_D GTG-AGTAATCTGTGTGGG--TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGC
* * *** * * **** * * ***** *** * ** *** *** ** **
ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
** * ************ **************** *** *** *** ** * *****
ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGT-CTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA---CTCCAGCAGA
**** ** * ** * *** ** * * * * * *** * * *** **
ARA.TH_D CCACCACTTT
TRI.AE_A CCACC-----
*****
Mean pairwise ID: 63.64%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** ***** ************ ***** ****** ****** * **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC
**** * *** * * **** *** * * ** *** ** *
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGG
* *************** *********** *** * ** ***** *** ***** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_B ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCA
** *** * * ** *** ** ***** *** * * *** ** * *****
ARA.TH_A CCATTTT-
LYC.ES_B CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 63.73%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** *** ** ****** ********** ********* * * *** * ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
** *** * * *** *** *** ** *** ***** *******
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
******** **** * **** ** * ** ***** ** * *
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************************** *** * * ******* ** **********
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC
**** ******* * ** * * * * * *** ** **** * **** *
LYC.ES_B ACTTTT
HUM.JA_A TCTTTT
*****
Mean pairwise ID: 63.75%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAAATG-GAACA
* ** ** * ** * ************** ******* ** ** * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTACTGGTCTGCCCATT
** *** * ** * *** ** **** * ** *** **** ***** **
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
HUM.LU_B CCAAGCCGGGAGTTGGGCTG-AGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-----C
***** * * ***** * ** * * * *********** * * ** ** *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
HUM.LU_B CTAGAGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCC
*** ***** **** ************ *************** ** ****** **
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CTC
HUM.LU_B GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTC
* ************* *** * *** ***** ** * * * * * ***
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
HUM.LU_B TTAATCGGACCATTTCCTTT
* * * ***** ****
Mean pairwise ID: 63.78%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG--GGACGT
* *** * *** ** ******* * ** ** ** * ******** * ** *** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ARA.TH_C TGGGTCGATCTCATTGGG---CCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCC
***** * * * ** * * * * * * ** *** * ********* ****
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ARA.TH_C AAGTTGGG-AGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGT
****** * ** * ** * *********** * ** * *******
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
ARA.TH_C GGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTG
** ** * *************************** *** ****** ******
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ARA.TH_C GAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG
******* ******* *** ** **** ** ** * *** * *
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ARA.TH_C ACCATCACTTT-
**** *** **
Mean pairwise ID: 63.84%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* *** * ********* ******** ********** * ***** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
HUM.LU_B GGTC-AGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
**** * * ***** ** * * * ** * **** ****** *******
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
******** **** ** **** * * * * ** ******** *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
* ************************* ****** ******* ************
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCAT
* ****** ***** *** * * ** * * * **** *****
LYC.ES_F CACTTTT
HUM.LU_B TTCCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 63.84%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
******* *** * * *********** * ************ *** ** *** * *
LYC.ES_G GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** ** **** **** * ****** **** ******
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** ** **** * * * * *** **** *
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** ************ *********** *** ** ****** * *********
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC
*** ** *** *** *** ** * *** **** * ** ***** * *****
LYC.ES_G CACTTTT
TRI.AE_A C------
*
Mean pairwise ID: 63.84%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ** ****** ** ****** ********** ********* * *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** ** * ****** ** **********
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC
**** * ***** * *** **** * **** ** * *** ****
HUM.LU_D TTCTTTT
LYC.ES_I CATTTTT
****
Mean pairwise ID: 63.84%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** ***** ************ ***** ****** ****** * **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * * * ** ** ****** ******* ***** ********
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
**** * *** * * **** *** * * * *** * ** * *
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************** *********** *** * ** ***** *** ***** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCAC
* *** * * ** *** ** ***** *** * * *** ** * ******
ARA.TH_F CATTTT-
LYC.ES_B CACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 63.84%
HUM.LU_B --GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATTG
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
* *** ** * ** *** ***** ********** ** ** * * *
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG
*** * ** * * ** * *** * *** **** ****** ******* *
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
TRI.AE_B GTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTA-AGTGGCAGGC
* *** ****** *** * ******* ** * * * * *** * ** ***** ***
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT
* *** ************************ ** * ***** ** * **********
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCAT
TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCAT--AGCAGACCAC
*** ***** *** * *** ** * ** * ** * * * * *****
HUM.LU_B TTCCTTT
TRI.AE_B CATCTTT
****
Mean pairwise ID: 63.84%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
**** ***** ** ****** ********** ********* * *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** ** * ****** ** **********
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC
**** * ***** * *** ***** * * ** ** * *** ****
HUM.LU_A TTCTTTT
LYC.ES_I CATTTTT
****
Mean pairwise ID: 63.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAAATG-GGACT
* ** *** ** * ** * ************** ******* ** ** ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTACTGGTCTGCCCATT
** *** * ** * *** ** **** * ** *** **** ***** **
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
HUM.LU_D CCAAGCCGGGAGTTGGGCTG-AGTGACCTGGGCGAAGGC------TGGGTTGCGCAGCTC
***** * * ***** * ** * * * ********* * * * * * * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
HUM.LU_D CTAGAGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTC
*** ***** **** **************************** ** ****** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGC--TTCTGGCCCAGAGTCCCT
HUM.LU_D GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACT
* ************* *** * *** * *** ** * * ** * * * **
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
HUM.LU_D CTTAATAGGACCATTTCTTTT
** * ***** ***
Mean pairwise ID: 63.96%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** *** ** ****** ********** ********* * *** * **
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* * *** * * ** *** *** ** **** ****** *******
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
******* **** ** *** * *** * * ******** ** * *
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************ *** ** ** ***** * *************
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
***** ******* * * * *** * * ** **** * *** ****
LYC.ES_G CCACTTTT
HUM.JA_B TTTCTTTT
*****
Mean pairwise ID: 63.96%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
* ** ** ** **** * ** *** **** ******* ** ** *** ** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* **** ** **** * ** * * * *** ******* ******* *
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
**** *** *** ******** ** * ** * *** *** ******
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
*************** ******************* **** ** * ******** ***
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGA-TCTCTCCTGGACCA
* * * ** * * * ***** *** * ** * ** *** ******
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_D CCACTTT-
****
Mean pairwise ID: 64.08%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ***** ** **** ** * * * ****** ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
**************************** ** * **** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA
* ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** *
ARA.TH_D CCACTTT--
LYC.ES_H CCACCTTTT
**** **
Mean pairwise ID: 64.08%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ** ****** ********* **************** * ** *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG-
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* *********** *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
***** ******* * ** * **** * ******* * ** * ** *
HUM.LU_D TTTCTTTT-
LYC.ES_E CCACATTTT
* ***
Mean pairwise ID: 64.08%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATG-GGACTTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
** ** ** * ** ******** *********** * **** * ** *
HUM.JA_A GGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* *** * ** * **** * ** *** ** ***** * **** *******
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTG--TGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGG-TCTCACGGTCCATAATGTGGCA
* * *** * * ** * * ***** ****** ** *** * * *** * **
HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
**** ************ **************** ** ****** * * *******
HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAAT-TGGGCCTCGCA-GCCTACTCCAGCAGACC
***** *** ** *** * * ***** *** * *** ** ** * ******
HUM.JA_A ATCTCTTTT
TRI.AE_A ACC------
* *
Mean pairwise ID: 64.17%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** ******* * ****** **** ******** ************* * **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * ** ** * ** ** * * ** **** ****** *******
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG
**** ***** ** *** * ** * * * ******* ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************ *** * * ** *** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGAT-CCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTC-CAATTAAACCA
* * * ** * ** ** * *** ** *** * *** * ** * * ****
ARA.TH_D CCACTTT
LYC.ES_O CCACTTT
*******
Mean pairwise ID: 64.17%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ** ***** ** ****** ********** ********* * *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** * * ******* ** **********
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTG--CTCTAATTAAACCAC
**** * ***** * *** ***** * * ***** **** ****
HUM.LU_A TTCTTTT
LYC.ES_B CACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 64.17%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
HUM.JA_A ---GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACT--TT
* **** ** * ** *** ***** ********** ** * ** * * **
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTT-GTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
HUM.JA_A GGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
** * * **** *** *** * ******** ****** *******
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG
* *** ****** *** ******* *** * * *** * *** * ** **
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
** *** ************************ ** * ***** * * *********
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAG-CAGACCAC
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
**** ** ** *** * ****** * *** * * * * ** *******
TRI.AE_B CATCTTT
HUM.JA_A CTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 64.24%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG--GAACAG
* ***** * *** ** ****** ******* **** ************* * *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC
ARA.TH_D TGGTTCAATT---CCTCGGGTC-GGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCC
* ** ** * * ***** * **** * * ** *** * * **** ***
ORY.SA_B AAGTTGCG--TAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGA
ARA.TH_D AAGCTGTGAGTAATCTGTGTGGG----TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAA
*** ** * ** ******** ********** ** * * *** *
ORY.SA_B GT-GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG
ARA.TH_D GTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCA
** ** ***** ***************************** *** *** *** ** *
ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATG
ARA.TH_D GTGGATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTC
***** **** * * ** * * * * ** ** * ** * ** * ** *
ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT
ARA.TH_D CTGGACCACCACTTT-
********* **
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** ** ****** ********** ********* * ***** ***
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** **** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************************** *** * * ****** ** **********
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCT--GCTCT-AATTAAACCA
**** * ***** * ** ***** * ** *** * **** *** ****
HUM.LU_B TTTCCTTT
LYC.ES_B CCACTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.JA_B ---GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--TT
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT
* **** ** * ** *** ***** ********** ** ** * * **
HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTT-GTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
** *** **** ** *** * ******** ****** *******
HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG
* *** * **** *** ** **** * * ** * **** * *** * ** **
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** *** *************************** * ***** * * *********
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCA
**** ***** *** ** *** *** * *** * * * * * * ** ** ****
HUM.JA_B TTTCTTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
***
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
*** ** ** ** * ** *** ***** ********** ** ** *** *
HUM.LU_A GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
*** * ** * * ** * *** * *** **** ****** *******
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTA-AGTGGCAGG
** *** ****** *** * ******* * * * * * ** * * ** ***** **
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** *** ******* **************** ** * ***** * * *********
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCA
**** ***** *** * **** ** * ** * * * * * ** ** ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
***
Mean pairwise ID: 64.29%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** ** * ****** ** * **** ** ** * ********* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
* *** ** * ** ** ***** * **** ****** ********
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT-GGGGTG
**** ****** ** *********** ** * ******* ** * *
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************* *** ** **** ** ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTC-TCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA
* * * *** * * ** ** ** * * * * *** * *** * ** *
ARA.TH_D CCACTTT-
LYC.ES_C CCACATTT
**** **
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
**** ***** ********* **************** * ** *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
** ** ** * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGT-CCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA
***** ******* * ** *** * * ***** * *** ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_O CCACTTT-
****
Mean pairwise ID: 64.31%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGT-GGATGT
****** ****** ****** ********************** **** *****
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_H C-AATTGTG-GTGCATGTG-CCTGGGTCTA-GTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCA
* * ** * ** ** * *** * ** * * ** ** ** ** *** *****
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
ZEA.MA_H AGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTT-GCATCCCAACAC-TAAAGTG
********** * ** * ** **** ****** *** ** **** *** ** ****
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGG
**** *************** **** ********************* *** ******
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------
******** * * **** ***** *
ORY.SA_B CCACCACCTTT
ZEA.MA_H -----------
Mean pairwise ID: 64.38%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
******* *** ** * *********** ******* **** *** ** *** *
LYC.ES_O GGGCTGTCCCAGATGGC-TGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG
* * * * * *** *** ** **** **** * ****** **** ******
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG
* **** * *** * ** ** **** * * * * *** **** *
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA
** ************ *********** *** ** ****** * *********
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC
*** ** *** *** *** ** * *** **** * ** ***** * *****
LYC.ES_O CACTTT
TRI.AE_A C-----
*
Mean pairwise ID: 64.40%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * **
ARA.TH_G GA-TCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** *** ** *** ** *** *** ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG
**** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** * ******************** ** * ********** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA
** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * ***
ARA.TH_G ACCATTTT-
LYC.ES_K ACCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 64.40%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * **
ARA.TH_G GA-TCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** *** ** *** ** *** *** ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** * ******************** ** * ********* ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA
** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * ***
ARA.TH_G ACCATTTT-
LYC.ES_A ACCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 64.49%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAAATG-GGACT
**** ** ** * ** * ************** ******* ** ** ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTACTGGTCTGCCCATT
** *** * ** * *** ** **** * ** *** **** ***** **
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
HUM.LU_A CCAAGCCGGGAGTTGGGCTG-AGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCAC-----GTC
***** * * ***** * ** * * * ******** ** * * ** * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
HUM.LU_A CTAGAGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTC
*** ***** **** **************************** ** ****** *
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGC--TTCTGGCCCAGAGTCCCT
HUM.LU_A GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACT
* ************* *** * *** * **** ** * * ** * ** * **
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
HUM.LU_A CTTAATAGGACCATTTCTTTT
** * ***** ***
Mean pairwise ID: 64.50%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** ** **** * ** *** **** ******* ** ** * *** ** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* *** * * ** **** * ** * * * *** ******* ******* *
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA-GGAGGG
**** ******* ********** * ** * * * ****** ******
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
******************************** ** **** ** * ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
* * * *** * ** * **** **** * * * *** *****
ARA.TH_D CACTTT-
HUM.JA_A CTCTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 64.50%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ** ****** ** ****** ********** ********* * *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
** * ** * * *** *** *** ** *** ***** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
*************** *********** *** * * ******* ** **********
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTG--CTCTAATTAAACCAC
**** * ***** * *** **** * ******* **** ****
HUM.LU_D TTCTTTT
LYC.ES_B CACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 64.61%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
* ** ** ** *** ** ** ********* ****** *** * * *** ** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* ** ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* *
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG
ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
**** * * * *** ******* *** * * * *** *** ******
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
*************** ******************* ******* * ******** ***
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
* ** * * * * * **** *** ** * * ** *** * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_E CCATTTT-
***
Mean pairwise ID: 64.61%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
**** ***** ** ****** ********** ********* * *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGT-CCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA
***** ******* * ** *** * * ***** * *** ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_G CCACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 64.61%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** * **** * ** **************** * * ******* **
ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** ***** ** **** * **** ** **** ******* ******* *
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAG-TGGAGGG
**** * * * *** * ******* ** * * * * *** ** * *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
* ***** ******* **************************** * ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTAC-TTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
***** ** ** ** ***** *** ** * * * * * * ****
ARA.TH_G CCATTTT-
HUM.LU_B TTTCCTTT
**
Mean pairwise ID: 64.61%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** **** * * ************* ***** * *** ******** **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** *** ** *** ** *** * **** ***** *********
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
* ***** ******* *********** *** * * ******* *** ***** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGC--TCTAATTAAACCA
**** *** * * **** ** * * * *** * * ** *****
ARA.TH_G CCATTTT-
LYC.ES_B CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 64.61%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
* ** ** *** ** * *** * ******** * ** ** **** ** ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
HUM.LU_C GGTCAACC-CAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCC
**** * * ** *** **** * * *** * * * * ************
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGG
***** ** * *** * ********* * * ** ***** *** **
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* ************ ************** * ************ * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA
HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
* ******* *** ***** ** ** * * * ** * * ** ******
ARA.TH_C TCACTTT-
HUM.LU_C TTTCTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 64.61%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** ** * ******* ****** ****** ****** * * *** * **
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTT-GTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
***** * * ** **** * * * **** ****** *******
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
******* * **** *** ****** *** ** * ********** ** * *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************* *** * ********** *************
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCA-CCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
**** *** *** * ** * * ** ** **** * ** * ** *
LYC.ES_C CCACATTT
HUM.JA_B TTTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 64.74%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** * *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA
*** * * * * ** ***** *** ** ** * * **** **** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTT-AGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ARA.TH_C GTTGGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG
***** *** * *** ***** **** * *** ****** ** *****
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCT-CCCGCTCTTGACGGTGG
* * ************ ************** *** ** *** *******
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG--AGCCTCACTAAGCAG
ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG
***** ******* *** * ******** ** * **** **** * * * *
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ARA.TH_C ACCATCACTTT-
**** ** **
Mean pairwise ID: 64.82%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** * * ********* ******** ********** * * *** * ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
HUM.JA_A GGTC-AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
**** * * ***** ** * * * ** * **** ****** *******
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG
********* *** *** **** * * * * * ** ** ** ** *
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* ************************* **** * ******** ************
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGACCAT
* ***** ***** *** * * * ** ** * * **** * *****
LYC.ES_F CACTTTT
HUM.JA_A CTCTTTT
* *****
Mean pairwise ID: 64.82%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ** ************ ***** **** * ******** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * ** ** ** ** *** ****** ***** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************************** *** * ** * *** *** ***** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC
* ** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ******
ARA.TH_E CATTTT-
LYC.ES_I CATTTTT
******
Mean pairwise ID: 64.94%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
* ** ** * **** * ** **************** * * *** ** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* ** ** * ** **** * **** ** **** ******* ******* *
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAG-TGGAGGG
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
**** * * * *** * ******* ** * * * *** ** * *****
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
* ***** ************************************** ******** ***
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
***** ** ** ** ***** *** * * ** * * * * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_G CCATTTT-
***
Mean pairwise ID: 64.94%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * ** ** ** ** *** ****** ***** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
**************************** ** * ******* ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG-AACC
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
* * * * * *** *** ** ** **** *** * ** *** ****
ARA.TH_E ACCATTTT
LYC.ES_H ACCTTTT-
*** ***
Mean pairwise ID: 64.94%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ***** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** *** ** *** ** *** * **** ***** *********
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ***** ******* ************ ** * ********** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC
** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * ****
ARA.TH_G ACCATTTT
LYC.ES_H ACCTTTT-
*** ***
Mean pairwise ID: 64.95%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** * *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA
*** * * * * ** ***** *** ** ** * * **** **** * ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTT-AGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ARA.TH_C GTTGGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG
***** *** * *** ***** **** * *** ****** ** *****
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCT-CCCGCTCTTGACGGTGG
* * ************ ************** *** ****** *******
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG--AGCCTCACTAAGCAG
ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG
***** ** **** *** * ******** ** * **** **** * * * *
ZEA.MA_D ACCACCATCTT
ARA.TH_C ACCATCACTTT
**** ** **
Mean pairwise ID: 65.05%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
******** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * **
ARA.TH_G GA-TCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC
* * ** *** ** *** ** *** *** ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ** * ******************** ** * ********** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA
** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * ***
ARA.TH_G ACCATTTT-
LYC.ES_J ACCACCTTT
**** **
Mean pairwise ID: 65.15%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** ** *** ** ********* ****** *** * * ****** **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGT-GATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG
**** **** ** ** ********* ** * *** * ** * ******
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
*************** **************** ** ******* * ******** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTT-GGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
* **** * * * ** * **** **** * * * *** * ****
ARA.TH_F CATTTT-
HUM.JA_A CTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 65.15%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
*** ****** ** * ****** * ** ***** * ** *** * **** **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGT-GTGCTAC-TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * * ***** *** **** * **** * *********** *********
ARA.TH_C GGGAGTTGAG--GCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA
* * ** ** **** * ***** *** ******** * ** ****
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* ** ************ ************** * ** ****** **********
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCA
*** * ***** *** *** ** *** * * ** * * **** *****
ARA.TH_C TCACTTT
TRI.AE_A CC-----
*
Mean pairwise ID: 65.15%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ***** ****** ** ************ ******* ** * ******** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * ** ** ** ** *** ****** ***** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************************** *** * ** * *** *** ***** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC
* ** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ******
ARA.TH_E CATTTT-
LYC.ES_N CATTTTT
******
Mean pairwise ID: 65.25%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ******* ** ********** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** *************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_M GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
******* *** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_M CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_M ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_M CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 65.26%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ** ****** ********* **************** * ** *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
** ** ** * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA
***** ******* * ** * **** * ******* * *** ****
HUM.LU_D TTTCTTTT
LYC.ES_O CCACTTT-
****
Mean pairwise ID: 65.26%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ********* **** * *** **** ** ************* ****** *
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** **** * * ****** **** * ** *******************
LYC.ES_E ACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** **************************** * ******** ****************
LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
***** * **** * *** * **** *** ********** ** * ***** **
LYC.ES_E CACATTTT
LYC.ES_L CACTTT--
*** **
Mean pairwise ID: 65.26%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** * * ************* ***** * *** ******** **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** *** ** *** ** *** * **** ***** *********
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
* ***** ******* *********** *** ** * ****** *** ***** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGC--TCCAATTAAACCA
**** *** * * **** ** * * * *** * * ** ** *****
ARA.TH_G CCATTTT-
LYC.ES_I CCATTTTT
*******
Mean pairwise ID: 65.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
***** ** ****** * ****** * ******** *** ***** * *** ** **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
ARA.TH_G GATCGGCCC--ACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT
* *** * *** *** ** * * *** ***** * ***** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAG-TGGGGG
ARA.TH_G GTGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG
* **** ** * * * * ******** * * * * * * *** ** * * **
ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG
* **** ******* ************** * ************ * ***** **
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGC--TCCGATTGGACC
ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
* **** * *** * * ******** ** * ** *** *** ***
ARA.TH_C ATCACTTT
ARA.TH_G ACCATTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 65.27%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG
*** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** * *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA
*** * * * * ** ***** *** ** ** * * **** **** * ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTT-AGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ARA.TH_C GTTGGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG
***** *** * *** ***** **** * *** ****** ** *****
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGA
* * ************ ************** *** ****** *******
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG--AGCCTCACTAAGCAGA
ARA.TH_C AGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA
***** ******* *** * ******** ** * **** **** * * * **
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
ARA.TH_C CCATCACTTT-
*** ** **
Mean pairwise ID: 65.37%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** ** **** * ** *** **** ******* ** ** ******* **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* *** * ** **** * ** * * * *** ******* ******* *
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
**** *** *** ********* ** * ** * * *** *** ******
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
*********************************** **** ** * ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTC--CTGGACC
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTT-GGTCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
* * * ** * ** * ***** *** * ***** * **** *****
ARA.TH_D ACCACTTT-
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* * **
Mean pairwise ID: 65.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** ** * ******* ****** ****** ****** * * * *** * ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTT-GTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
***** * * *** **** * * * **** ****** *******
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
********* **** * ********* *** ** ********** ** * *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************* *** * ********** *************
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTT-CAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCAC--TCTTAATCAGACCAT
**** * * *** * * * * * * *** * * ** * * ** *
LYC.ES_C CACATTT
HUM.JA_A CTCTTTT
* * ***
Mean pairwise ID: 65.47%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* *** ******* ** ******** * ****** * ** * * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_C AA-CATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGT--GACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
* * ** ** *** * * ** * * ** ******* **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG
****** * * ** * * ********** *** * * ** *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
*** ************************ ** * ********** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
* *** **** ** * * ** ** * * * ** ** * ** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_C CACATTT
*** **
Mean pairwise ID: 65.58%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** * ** ********* ** *** ** *** ******** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGT--GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
* * ** ** *** ** ** * ***** ****** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT-GGGGTG
**** * * **** * *************** **** ******* ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************* *** ** ******* ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCA-CTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA
* ** ** *** * ** * * * *** *** * * *** * * *** *
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_C CCACATTT
*** **
Mean pairwise ID: 65.58%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** * ***** ******* * *** ****** ************* ********
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
**** ******** *** * **** * **** * ************** **** **
LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** ** ********* *********** ******** **********************
LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA
LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA
** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** *
LYC.ES_K CCACCTTT
LYC.ES_L CCACTTT-
**** **
Mean pairwise ID: 65.58%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ** ****** ** ****** ********** ********* * *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
** * ** * * *** *** *** ** **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
******* *** * *** * **** * * ***** ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************ *********** *** * ** ***** * *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA
***** ******* * ** * **** * ******* * *** ****
HUM.LU_D TTTCTTTT
LYC.ES_G CCACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 65.58%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** * ***** ******* * *** ****** ************* ********
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
********** ** *** * **** * **** * ******************* **
LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** ** ********* *********** **** *** **********************
LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA
LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA
** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** *
LYC.ES_A CCACCTTT
LYC.ES_L CCACTTT-
**** **
Mean pairwise ID: 65.58%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
* ** ** ** *** ** ********* ****** *** * ****** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
**** *** ** ******* *** * *** ** ******* ******
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
*********************************** ******* * ******** ***
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
* **** * * * * **** *** ** * * ** *** * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_A CCATTTT-
***
Mean pairwise ID: 65.58%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***** ** ************ ***** **** * ******** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * * ** ** ** ** *** ******* ****** *******
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG
**** ** * **** *** *** * *** * * * ******* ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************ *** * * ****** ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCA
* ** * * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * *****
ARA.TH_E CCATTTT-
LYC.ES_G CCACTTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 65.58%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** * **** * ** **************** * * *** ** *
ARA.TH_G GATCGGCCCAC-GGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ******** ** ****** **** ** **** ******* ******* *
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGGG
**** ** * ** *** ** ******* ** * * * * ****** *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* ***** ******* **************** ************* ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
***** ** ** * * **** ***** * *** * * * * ****
ARA.TH_G CCATTTT-
HUM.JA_B TTTCTTTT
***
Mean pairwise ID: 65.58%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
* ** *** ** **** * ** *** **** ******* ** ** *** ** **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* **** ** **** * ** * * * *** ******* ******* *
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTT-GCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
**** *** *** ********** * * ** * * *** *** ******
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
*************** ******************* **** ** * ******** ***
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGA-TCTCTCCTGGACCA
* * * ** * * ******* *** * **** ** *** ******
HUM.LU_D TTTCTTTT
ARA.TH_D CCACTTT-
****
Mean pairwise ID: 65.69%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* *** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_I GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
****** **** * * * **** ** * ** * ** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA
** ************************ ** * * * ***** ***********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC
LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
* *** * * ** ** *** *** ** ** ** * ***** *** **** *
ARA.TH_C ACTTT-
LYC.ES_I ATTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 65.70%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** ****** ** ************ ******* ** ** ******** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
* * * *** ** ** ** *** ******* ****** ******
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
**** ** * **** *** *** * *** * * * ******* ** **
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_E --ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* *********************** *** * * ****** ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA
* ** * * * * ** *** ** ***** *** * * *** * * *** *
ARA.TH_E CCATTTT--
LYC.ES_E CCACATTTT
*** **
Mean pairwise ID: 65.80%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** ***** ** ************ ***** **** * ******** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * * ** ** ** ** *** ****** ***** ********
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG
**** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
*************************** *** * ** ***** *** ***** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCAC
* ** * * ** *** ** ***** *** * * *** ** * ******
ARA.TH_E CATTTT-
LYC.ES_B CACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 65.81%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** ****** * ******************** **** ******** * **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC
* * **** ** ** *** ** *** * ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAG--TGGGGT
**** * * * * ** **** *** * ** * * ** ****** ** **
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_E GGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
*** ******* *********** *** * ** ***** * ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAAT-CCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGT--TCTAGTTAAACT
***** ** *** *** * *** ** * * * *** ** * ** ***
ARA.TH_G ACCATTTT--
LYC.ES_E ACCACATTTT
**** **
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** ** *** ** ********* ****** *** * * ****** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGT-GATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA-GGAGG
**** **** ** ** ********* ** ** *** * *** ** *****
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
* *************** **************** ** ******* * ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCA
** **** * * * ** * **** **** * * * *** * ****
ARA.TH_A CCATTTT-
HUM.JA_A TCTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 65.91%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
* ** ** ** *** ** ********* ****** *** * ****** **
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC--AGGTTCTAGAGTCGGAGGG
**** *** ** ******* *** **** * ** ******* ******
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
*********************************** ******* * ******** ***
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
* **** * * * * **** *** ** * * ** *** * * ****
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_F CCATTTT-
***
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
***** ** ****** ****** * *** **** **** **** * ****** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCC-TCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
* *** * * * ** *** * * ***** ***** * ***** ****** *
ARA.TH_A GTGAGTAATTAGTGTTGAGTT-GAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG
ARA.TH_C GGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGT-GGGG
* **** * * * ** *********** ** ** ********* ** *
ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
* * ************ ************** * ** ******* * ***** *
ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACC
*** **** * * * * ******** ** * *** ** ** ** ***
ARA.TH_A ACCATTTT
ARA.TH_C ATCACTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
* ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
HUM.JA_B GTTCGGCC-CATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC
* *** * ****** *** * * * * *** * **** * ************
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG
* ******** ** * ** ****** ** * ** *** ** ** **
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* *************************** * ************ * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
* ******* *** * ***** *** ** * *** * * ** ******
ARA.TH_C TCACTTT-
HUM.JA_B TTTCTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ***** ****** * ******************** *** ******** **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT
* * *** *** ** *** ** *** * **** ***** *********
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG
**** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
* ***** ******* *********** *** ** * ****** *** ***** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGC--TCCAATTAAACCA
**** *** * * **** ** * * * *** * * ** ** *****
ARA.TH_G CCATTTT-
LYC.ES_N CCATTTTT
*******
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** * **** * ** **************** * * * *** ** **
ARA.TH_G GATCGGCCCAC-GGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** ***** ** **** * **** ** **** ******* ******* *
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAG-GAGGG
**** * * ** *** * ******* * * ** ** * * ****** *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* ***** ******* **************** ************* ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTC-ACTGCATGCACTCTTAATCAGACCA
***** *** ** ** **** ****** *** * * * ****
ARA.TH_G CCATTTT-
HUM.JA_A TCTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** ** **** * ** *** **** ******* ** ** *** ** *
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
**** * * ** ***** * ** * * * *** ******** ******* *
ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGGG
**** * ******* * * * ****** ** ** * * * * ****** *******
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
******************************** ** **** ** * ******** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCT-GGACCA
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
* * * ** * ** ** **** **** * *** ** * * ******
ARA.TH_D CCACTTT-
HUM.JA_B TTTCTTTT
****
Mean pairwise ID: 66.01%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ** ** ******* ******** * ******** ** *** * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_N GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
****** **** * * * **** ** * ** * ** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA
** ************************ ** * * * ***** ***********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC
LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
* *** * * ** ** *** *** ** ** ** * ***** *** **** *
ARA.TH_C ACTTT-
LYC.ES_N ATTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 66.02%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ****** *** ** * ********* ****** ** * * ******** **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTG--TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
* ***** *** ** **** ** ** ***** ****** *******
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAG-TGGGGTG
**** * * * ** *********** *** * * ** * ****** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ***** ******* *********** *** ** ********** ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGT--TCTAGTTAAACT
**** * * ** * ** * ** * * *** * *** ** * ** ***
ARA.TH_G ACCATTTT-
LYC.ES_C ACCACATTT
**** **
Mean pairwise ID: 66.02%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** * * ************* ***** * *** ******** **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * *** *** ** *** ** *** * ***** ****** ********
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAG-TGGGGTG
**** * * * * ** **** *** * ** * * ** ****** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* **** ******* *********** *** * ** ***** * ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAAT-CCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGC--TCCAATTAAACC
***** ** *** *** * *** ** * * * *** * ** ** ****
ARA.TH_G ACCATTTT-
LYC.ES_G ACCACTTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 66.02%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** ** *** ** ********* ****** *** * *** *** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
**** *** ** ******** *** * **** * ******* ******
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
*************** ******************* ******* * ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA--TGAACC
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGT-CCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
* **** * * ** * **** *** ******* *** ** * ***
ARA.TH_A ACCATTTT-
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* **
Mean pairwise ID: 66.02%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** ***** * * *** * *** * ******** ********** **
LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************************* ******** **********************
LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA
LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA
** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** *
LYC.ES_H CCACCTTTT
LYC.ES_L CCACTTT--
**** **
Mean pairwise ID: 66.02%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ** **** * ********* ******** ********** * *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAG-TGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
**** * ** * ***** ** * * * ** * **** ****** *******
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG
******** **** ** **** * * * ** ******** *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** ****** ******** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCC--ACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC
LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAACC
****** ***** ** *** ** * * ** ** * **** ***
HUM.LU_D ATTTCTTTT
LYC.ES_F ATCACTTTT
** *****
Mean pairwise ID: 66.12%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* *
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** ***** * * *** * *** * ******** ********** **
LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ***************************** ** *** ***** ** **********
LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCC-TGATGGGTTGCTCCAATTAAACCAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
**** *** *** ** ********* ****** ******* ******** ********
LYC.ES_N CATTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 66.12%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* *
LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** ***** * * *** * *** * ******** ********** **
LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ***************************** ** *** ***** ** **********
LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCC-TGATGGGTTGCTCCAATTAAACCAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
**** *** *** ** ********* ****** ******* ******** ********
LYC.ES_I CATTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 66.13%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
**** *** * ********* ******** ********** * *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAG-TGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
**** * ** * ***** ** * * * ** * **** ****** *******
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
******** **** ** **** * * * * ******** *
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
* ************* *********** ****** ******** ************
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCC--ACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAAC
* ****** ***** ** **** ** * **** ** * **** **
HUM.LU_A CATTTCTTTT
LYC.ES_F CATCACTTTT
*** *****
Mean pairwise ID: 66.23%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
**** ** ** * ******* ****** ****** ****** * * *** * ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGG-CTTGTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
** ** * * *** * **** * * * **** ****** *******
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
******** *** * ******* **** *** ***** ***** * *
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** *** ** ********** *************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTC-ACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
**** *** *** * * ** ** * ** * ***** * ** * ** *
HUM.LU_A TTTCTTTT
LYC.ES_C CCACATTT
* ***
Mean pairwise ID: 66.23%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** * ***** ******* * *** ****** ************* ********
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
************* *** * **** * **** * ******************* **
LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** ** ********* *********** ******** **********************
LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA
LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA
** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** *
LYC.ES_J CCACCTTT
LYC.ES_L CCACTTT-
**** **
Mean pairwise ID: 66.34%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** ** *** ** ********* ****** *** * *** *** **
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC--AGGTTCTAGAGTCGGAGGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
**** *** ** ******** *** **** ** * ******* ******
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
*************** ******************* ******* * ******** ***
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA--TGAACC
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTT-GGTCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
* **** * * ** * **** *** ******* *** ** * ***
ARA.TH_F ACCATTTT-
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* **
Mean pairwise ID: 66.45%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ** ** ******* ******** *************** ** * * * * * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_K GG-CTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGG--TGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
** * * ** ** *** * ** ****** ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG
**** * ** * * * * *** *** ** ** * *** ** ****
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
****** ********* ************ * ** ********** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC
* * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_K CACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 66.45%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* *
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** ***** * * *** * *** * ******** ********** **
LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ***************************** ** ********* ** **********
LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCC-TGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
**** *** *** ** ********* ** *** ************* ** ********
LYC.ES_B CACTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
******
Mean pairwise ID: 66.45%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *** ** ******* ******** *************** ** * * * * * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_A GG-CTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGG--TGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
** * * ** ** *** * ** ****** ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
****** * * * * * *** *** ** ** * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
****** ********* ************ * * * ********* * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC
* * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_A CACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 66.56%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
* ** *** ** *** ** ** ********* ****** *** * * *** ** **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* ** ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* *
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTT-GCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
**** * * * *** ********* ** * * *** *** *** ******
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
*************** ******************* ******* * ******** ***
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
* ** * * * * ** **** *** **** * ** *** * * ****
HUM.LU_D TTTCTTTT
ARA.TH_E CCATTTT-
***
Mean pairwise ID: 66.56%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
* ** *** * **** * ** **************** * * *** ** **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* ** ** * ** **** * **** ** **** ******* ******* *
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTT-GCGCAGCTCCTAGAG-TGGAGGG
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
**** * * * *** * ******* * * * * * * * *** ** * *****
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
* ***** ************************************** ******** ***
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
***** ** ** ** ****** *** * * **** * * * * ****
HUM.LU_D TTTCTTTT
ARA.TH_G CCATTTT-
***
Mean pairwise ID: 66.56%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ** ** ******* ******** *************** ** * * * * * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_H GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
****** **** * * * **** ** * ** * ** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
** ************************* * ** ********** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC
* * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT--
LYC.ES_H CACCTTTT
*** **
Mean pairwise ID: 66.67%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** ** * ******* ****** ****** ****** * * ***** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTT-GTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
****** * * *** **** * * * **** ****** *******
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
******** *** * ******** **** *** ******* ***** * *
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
* ************************* *** ** ********* *************
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG---TTCTAGTTAAACT
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTAC-TTGGTCCACC--ATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
**** *** *** * * ** ** * **** *** * * ** * **
LYC.ES_C ACCACATTT
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* * ***
Mean pairwise ID: 66.67%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
***** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_B GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT
** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG
****** **** * * * **** ** * ** * ** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA
** ************************ ** * * ******* ***********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC
LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
* *** * * ** ** *** *** ** ** ** ** **** *** **** *
ARA.TH_C ACTTT-
LYC.ES_B ACTTTT
*****
Mean pairwise ID: 66.78%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
** ** *** ** ** ********* ****** *** * * * *** ** **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * * ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* *
ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA-GGAGGG
**** * * ***** ********* ** ** ** *** ****** ******
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
******************************** ** ******* * ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
* ** * * * * ** * **** **** * * * *** * ****
ARA.TH_E CATTTT-
HUM.JA_A CTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 66.88%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
***** ** ****** ****** * *** **** **** **** * ****** **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
ARA.TH_F GTTCGGT-TCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT
* *** * ** * ** *** * * ***** ***** * ***** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
ARA.TH_F GTGAGTAATTAGTGTTGAGTT-GAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGT--TCTAGAGTCGGAG
* **** * * * ** *********** ** * ** ** ******** ** *
ARA.TH_C AG-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG
* * ************ ************** * ** ******* * ***** *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACC
ARA.TH_F GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC
*** **** * * * * ******** ** * *** ** ** ** ***
ARA.TH_C ATCACTTT
ARA.TH_F ACCATTTT
* ** ***
Mean pairwise ID: 66.88%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
* ** *** ** *** ** ********* ****** *** * ****** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
**** *** ** ********* ** * **** * ******* ******
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
*********************************** ******* * ******** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
* **** * * * ** **** *** **** * ** *** * * ****
ARA.TH_A CCATTTT-
HUM.LU_D TTTCTTTT
***
Mean pairwise ID: 66.99%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** ** *** ** ** ********* ****** *** * * ******* **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** * * ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* *
ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG
**** * * * *** ******** *** * * *** *** *** ******
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
*********************************** ******* * ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA--TGAACC
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGT-CCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
* ** * * * ** * **** *** ******* *** ** * ***
ARA.TH_E ACCATTTT-
HUM.LU_B ATTTCCTTT
* **
Mean pairwise ID: 67.10%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
* ** *** ** *** ** ********* ****** *** * ****** **
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* *
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGGC
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCT-TGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT
**** *** ** ********* ** * **** * ******* ******
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
*********************************** ******* * ******** ****
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCAC
**** * * * ** **** *** **** * ** *** * * ****
HUM.LU_D TTCTTTT
ARA.TH_F CATTTT-
***
Mean pairwise ID: 67.10%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** ****** ** ************ ******* ** ** ******** * **
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * * *** ** ** ** *** ******* ****** *******
ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG
**** ** * **** *** *** * *** * * * ******* ** * *
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* ************************ *** * * ****** ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCA
* ** * * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * *****
ARA.TH_E CCATTTT
LYC.ES_O CCACTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 67.21%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ** *** ** * ******* ****** ****** ****** * * *** * ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGG-CTTGTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA
** ** * * *** * **** * * * **** ****** *******
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG
******** *** * ********* *** *** ******* ***** * *
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
* ************* *********** *** ** ********** *************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTC-ACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA
**** *** *** * * * ** * ** ******* * ** * ** *
HUM.LU_D TTTCTTTT
LYC.ES_C CCACATTT
* ***
Mean pairwise ID: 67.21%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
***** ** ******* * ******** ** ***** ********** * *** ** **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGG-GTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT
ARA.TH_D GTTCAAT-TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATAT-CTGAGCTGCCCAGTCCAAGC
* ** ** ** * *** *** * * ** ***** *** * ***** ******
ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG
ARA.TH_D TGTGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG
** **** * ** * ** ********* * ** * ***** *** ** *
ARA.TH_C AG-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG
ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG
* * *************************** * ** **** ** * ***** *
ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTC-CGATTGGACC
ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC
*** * * * * ** * ******** *** * ** ** * ******
ARA.TH_C ATCACTTT
ARA.TH_D ACCACTTT
* ******
Mean pairwise ID: 67.31%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** ** *** ** ********* ****** *** * ****** *
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
****** * * ******* ** *** ** ** *** ******** ******* *
ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGT-GAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGG
**** * **** *** * ****** ***** *** * *** ** ******
ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
* *************** **************** ** ******* * ******** **
ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACC
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC
** **** * * *** ** **** **** *** * ** *** * * ***
ARA.TH_A ACCATTTT-
HUM.JA_B ATTTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 67.31%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
* ** ** **** **** *** * ******** * ** ** **** ** ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
HUM.LU_B GGTCAGCC-CAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
**** * ** *** ***** * * * *** * **** * ************
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
******** * * * * ******** **** * ** ********* **
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA
* *************************** * *********** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCC--GCTCC-GATTGGACC
HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC
* ******* *** * * * **** *** ** * ** *** ** *****
ARA.TH_C ATCACTTT-
HUM.LU_B ATTTCCTTT
** * **
Mean pairwise ID: 67.43%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
***** ** ****** * ****** * *** **** **** * ** * *** ** **
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
ARA.TH_E GTTCGGGTCCAC-GGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT
* *** ** ******* * * * *** ****** * ***** ****** *
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
ARA.TH_E GTGAGT-AAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG
* **** ** * ** * ** ********** ** ** * * ****** *** ** *
ARA.TH_C G-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG
ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
* * *************************** * ** ******* * ***** **
ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACCA
ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA
** ** * * * * * ******** ** * *** ** ** ** ****
ARA.TH_C TCACTTT
ARA.TH_E CCATTTT
** ***
Mean pairwise ID: 67.43%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
***** ** ******* ******** *************** ** * * * * * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_J GG-CTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGG--TGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
** * * ** ** *** * ** ****** ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG
****** ** * * * * *** *** ** ** * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
****** ********* ************ * ** ********** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC
* * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_J CACCTTT
*** **
Mean pairwise ID: 67.53%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** ****** * ******************** **** ******** * **
ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC
* * **** ** ** *** ** *** * ***** ****** ********
ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAG-TGGGGTG
**** * * * * ** **** *** * ** * * ** ****** * * * *
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
* **** ******* *********** *** * ** ***** * ******** ***
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAAT-CCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGC--TCCAATTAAACC
***** ** *** *** * *** ** * * * *** * ** ** ****
ARA.TH_G ACCATTTT
LYC.ES_O ACCACTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 67.76%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
*****************************
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ***** **************************************** *********
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
******************************* ****************************
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
************************************************ ***** *****
LYC.ES_A CTTT
LYC.ES_D TTTT
***
Mean pairwise ID: 67.86%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** ** *** ** ** ********* ****** *** * * *** ** *
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
****** * ** *** ** **** ** ** ************ ******* *
ARA.TH_E TGAGT-AAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGC-GGAGGG
**** ** ***** * * ****** ***** * *** ****** ******
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
******************************** ** ******* * ******** ***
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA
HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA
* ** * * * *** ** **** **** *** * ** *** * * ****
ARA.TH_E CCATTTT-
HUM.JA_B TTTCTTTT
***
Mean pairwise ID: 67.86%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* *** ** ****** ******** * ** ***** * *** ** * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAG--GGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA
**** **** *** ** ** * ** ** ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG
****** * ** * * * **** * * * * * ** * * *********
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA
*** ************************ ** * * ******** * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCC--ACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA
LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCA
* ****** * *** * *** ** ** * *** *** * ** * *** ****
ARA.TH_C TCACTTT-
LYC.ES_F TCACTTTT
*******
Mean pairwise ID: 67.96%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
** ** *** ** ********* ****** *** * ****** *
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
****** * * ******* ** *** ** ** *** ******** ******* *
ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTG--CAGGTTCTAGAGTCGGAGG
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGT-GAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGG
**** * **** *** * ****** ******* *** * *** ** ******
ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG
HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG
* *************** **************** ** ******* * ******** **
ARA.TH_F ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACC
HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC
** **** * * *** ** **** **** *** * ** *** * * ***
ARA.TH_F ACCATTTT-
HUM.JA_B ATTTCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 67.97%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
***
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ********* **** * *** **** ** ************* ********
LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** **** * * ****** **** * ** *******************
LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** ***************************** * ******** ****************
LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
***** * **** * *** * **** *** **************** ********
LYC.ES_O CACTTT
LYC.ES_L CACTTT
******
Mean pairwise ID: 68.08%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ************* * *** **** ** ************* ********
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** **** * * ****** **** * ** *******************
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** ***************************** * ******** ****************
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
***** * **** * *** * **** *** **************** ********
LYC.ES_G CACTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
******
Mean pairwise ID: 68.08%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
* ** **** **** *** * ******** * ** ** ******** ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
HUM.JA_A GGTCAGCC-CATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
**** * ****** ***** * * * *** * **** * ************
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG
* ****** * ** * * * ********* ***** ** ** *** ** ** **
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* *************************** ************** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACC-CAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
* ***** * *** * *** ** *** * * * ** ** ******
ARA.TH_C CACTTT-
HUM.JA_A CTCTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 68.42%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
*****************************
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ********************************************** *********
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
************************************************ ***** *****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_D TTTT
***
Mean pairwise ID: 68.51%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
***** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_E GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA
** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** *******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
****** **** * * * * *** * *** * * * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
**** *********************** ** * ** ***** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
* **** ** ******** ** *** ** ** ** ** * ** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT--
LYC.ES_E CACATTTT
*** **
Mean pairwise ID: 68.51%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
* ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* ***
HUM.LU_A GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
**** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
******** * * * * ******* **** * * ********* **
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
* ************ ************** * ************ * * *********
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA
* ******* *** * * * **** *** ** ** ** * * ** ******
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_C TCACTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 68.83%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
* ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* ***
HUM.LU_D GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
**** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
******** * * * * ********* **** * ** ********* **
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
* ************ ************** * ************ * * *********
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA
* ******* *** * * **** *** ** * ** * * ** ******
HUM.LU_D TTTCTTTT
ARA.TH_C TCACTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 68.91%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGC-GGATGC
****** ****** ****** *************** ******** * ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_B TTTGCGA--TGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
* * ** * *** *** ** ** ** * *** **** **** * ***
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
ZEA.MA_B AGTTG-GTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
***** **** ** ** *** ** * *** * * * ** ***** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
** ** ** **** ******* *************** ** ***** ************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGAT-CCTCTCTTAGCAA
* ******** ********* **** * * **** * *** * * ***
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 69.06%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* *** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_G GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
** * * ** ** *** * ** ******* ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
****** **** * * * * *** * *** * * * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
**************************** ** * ** ***** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
* **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** ****
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_G CACTTTT
******
Mean pairwise ID: 69.08%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
*****************************
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
************************************************************
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
************************************************ ***** *****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_D TTTT
***
Mean pairwise ID: 69.18%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
****** ** * * ********** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ****** ** ******* * * * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_M CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 69.75%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GAATGC
****** ****** ****** *************** *********** * ****
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
* * * **** *** ** ** ** **** **** **** * ***
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCA--CCTAGAG
ZEA.MA_A AGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG-GTCTCTGCAGACCTGGAG
***** **** ** ** *** ** ***** *** * *** ***** *** ***
ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT
ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGT
*** ** ** **** ******* *************** ** *** ** ********
ORY.SA_B GGAAGGATAACGG-GCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC
ZEA.MA_A GGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGC
** ********* ********* *** ** *** ** * *** * **
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
* ******* ****
Mean pairwise ID: 70.19%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGT-GAACGC
****** ** *** ****** ******* ******* *** *** *** * * **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRI.AE_A T--GTTGTA-GCGCTGCGGGCCTG-GTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCA
** ** ***** *** *** * *** *** *** ***************
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGT-GTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
TRI.AE_A AGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT
********** * * ** ** * ***** *** * * ** * * * ** **
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG
*** ** * ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
********* *********** *** * ** ** **** **** * ****
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
TRI.AE_A ACCACC------
******
Mean pairwise ID: 70.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* *** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_O GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
****** **** * * * * *** * *** * * * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
**************************** ** * ** ***** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
* **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** ****
ARA.TH_C CACTTT
LYC.ES_O CACTTT
******
Mean pairwise ID: 70.42%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT
******** *********************** ** *** * * **** *
LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG
TRY.BR_A TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG
***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* *
LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG
TRY.BR_A ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG
* * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * ***
LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG
TRY.BR_A TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTCGAGAAGCACACCGAG
********* **************** ******** * ***** **** ******* *
LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
TRY.BR_A GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
**** * *** ** * ******** * * * ** **
Mean pairwise ID: 70.65%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** * * * ***
ZEA.MA_B -TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TRI.AE_A GTTGTAGCG--CTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG-CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
*** * * ******** ** * **** ** ** *** **** * ******
ZEA.MA_B TG-GTAGTGTCTGAC--GGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG
** ****** * ****** ********* ******* * ** * **
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGG
**** * **** *********************** *** **** *************
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC
******* *********** ** **** * * * * *** **** **
ZEA.MA_B CACCATCTTT
TRI.AE_A CACC------
****
Mean pairwise ID: 70.83%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGT
****** ****** ****** *** ********** *********** *****
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_F TTCCTGA--CGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
* * * * *** *** ** *** * **** ***** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGC--TCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
***** * * ******* ********** * ** ** * **** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
** ** ** ************ *************** ** ******************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCC--AGAGCCTCATTAAACAG
* ******** ********** * **** ** * ** ** **** ***
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 70.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** **** * ***
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * * * *** ******* ** ***** **************
ZEA.MA_C G-GTAGTGG-CCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC--TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC
* ******* *** * **** *** * ** **** ** * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
*** ** *********** **************** ****** *** **********
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAGAC
****** **** ***** * * ** ***** * * * **** *******
ZEA.MA_C CACCATTTTT
TRI.AE_A CACC------
****
Mean pairwise ID: 70.98%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT
******** *********************** ** *** * * **** *
LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG
TRY.BR_B TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG
***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* *
LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG
TRY.BR_B ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG
* * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * ***
LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG
TRY.BR_B TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTGCAGAAGCACACCGAG
********* **************** ******** * *********** ******* *
LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
TRY.BR_B GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
**** * *** ** * ******** * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 71.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAA-GGTGGTGTTGGATG
******* ****** ** *** **** ********** *** ***** *****
ORY.SA_A TTTGGTG---TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCG
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCC---TGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCG
**** ** * * *** *** *** *** * *** *** *****
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAG-----CGTCCCTGC
*************** * * * ** ** * ********* * * ** * *
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT
ORY.SA_B ACCTAGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTT
**** ****** ** * ************ *************** ** ********
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ORY.SA_B CCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT
*** *************** *** ****** * ********** ****** ** *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_B CCATGGCAGACCACCACCTTT
* * ********** ****
Mean pairwise ID: 71.15%
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAA
LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
**** ************ *****
LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG
LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG
*** **** ******** *** * **** * **** * ************** **
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
LYC.ES_D GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
** **** ** ********* *********** ******** *****************
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA
LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAACTA
******* ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ***********
LYC.ES_L AACCACCACTTT-
LYC.ES_D AACCACCACTTTT
************
Mean pairwise ID: 71.70%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ****** ***
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCC-TGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAG
* * ** * ***** *** ** * **** **** * *** **** * *****
ZEA.MA_A TTG-GTAGTGT-CTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTG
*** ****** * * ****** ********* ******* * * * *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
***** * **** *********************** ****** ** **********
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
TRI.AE_A AAGGATAATGG-GCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
******* * *********** ** * ** * * *** * *** **** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRI.AE_A CCACC------
*****
Mean pairwise ID: 71.79%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGT--GATGTGAACG
*********** ******** ******** ** ******* ***** * ** * * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRI.AE_A CT-GTTGTAG-CGCTG----CGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTC
* * *** * *** ***** * * * *** * ******* ********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGA-GGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TRI.AE_A CAAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC------TGGGTCTCACGGTCC
*************** *** ******* ***** ** * * ** * * **
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TRI.AE_A ATAATGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCC
*** **************************************** *************
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
TRI.AE_A AACGGTGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACT
* ************** *** ******* * ** ** **** * ** **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_A CCAGCAGACCACC------
** *********
Mean pairwise ID: 71.88%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC
****** ****** ****** *************** ********** **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ZEA.MA_D TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
* * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_D AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
*** ** ** ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA
** ******** ********** * **** ** ****** * **** * ***
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
ZEA.MA_D GACCACCATCTT-
******** ***
Mean pairwise ID: 72.03%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRI.AE_B NCCGAGCTAG-TTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGT-GGATGC
****** ** * *** *********** * ******* * *** ***** ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTT---GGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
**** * * * ** *** ** **** * * ** **** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
TRI.AE_B AGTTG-GTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC-GCCTTCTCAGGCCTTAAGTG
***** **** * * **** ** ******* *** ** * * *** ****
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGG
** ** * *** *********************** ** *** **************
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
********* ************ ******** **** ** **** *****
ORY.SA_B CCACCACCTTT
TRI.AE_B CCACCATCTTT
****** ****
Mean pairwise ID: 72.20%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC
****** ****** ****** *************** ********** **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ZEA.MA_E TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
* * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_E AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
*** ** ** ************ *************** ** **** ************
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA
** ******************* * **** ** ****** * **** * ***
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
******** ****
Mean pairwise ID: 72.22%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
************************* ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT-
LYC.ES_H CCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 72.44%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC
****** ****** ****** *************** ********** **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ZEA.MA_G TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
* * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_G AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
*** ** ** ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAG
* ******************* * **** ** ****** * **** * ****
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 72.46%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * **************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
**** ** *** * ** * * * **** *** * * **** ** ** *** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_K CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 72.52%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGC
****** ****** ****** *************** *********** ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA
**** ** *** *** * **** *** * **** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTC-GAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_C AGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT
***** **** * ** ** ** ****** **** * * ** *** ** ***** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG
*** ** * *********** *************** ** *** *** *******
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT-CCATGGCA
ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA
********** **** ******* *** ***** **** * * * * * ***
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
ZEA.MA_C GACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 72.67%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ****** *****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * ** ** *** ******** ** ** ** * ** *** ***** * ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
********** * ** **** ********** * ** *** *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGA
**** * *** ******* *************** ******* ** **********
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAA
TRI.AE_B AGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
******** * ********* ** *** *** *** * * * **** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRI.AE_B CCACCATCTTT
***********
Mean pairwise ID: 72.73%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * *******
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
* * * ***** * ********** ** ** * ** ** *** ***** * ******
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
******** * **** ********** * ** *** *** ** *****
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* * *** ******* *************** *** ** ************* **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA
******* ********* ** **** * ** * * ** * ***** ****
ZEA.MA_B CCATCTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
********
Mean pairwise ID: 72.79%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * **************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
******* ** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** * ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_A ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_A CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 73.44%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * **************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
******* *** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_J CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 73.63%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ** * * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA
* * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** ****
ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * ***
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG
***** * **************************** *** *** *************
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
* ******* ************* * ** **** * * * * ***** ******
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
TRI.AE_A CCACC------
*****
Mean pairwise ID: 73.83%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
******** *********** ******** ********** *** ***** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT
** * * * * * ******** * * ***** * ** ** ********* *
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
******** ****** * ****** * ***** ** ** * * *** * *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCC
*** ** ****** * **** ******************************* ** *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_A CAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCA
** ****** ******** * ** ******* *** *** ** *** **** * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A CTA-AGCAAACCACCATCTTT
*** * ** ************
Mean pairwise ID: 73.84%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG
LYC.ES_L ---------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGG
***** ** ********* **** * *** **
LYC.ES_M CTAATT-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-A
LYC.ES_L CTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGA
** ** ************* ******** ************* *** * **** *
LYC.ES_M TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGT
LYC.ES_L CCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAAC
**** * ******************* **** ** ********* ***********
LYC.ES_M GAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-
LYC.ES_L GAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTT
******** ************************ ***** *** ** * * *** ****
LYC.ES_M AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT
LYC.ES_L AACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT-
****** * ***** ******** ***** ***** **
Mean pairwise ID: 73.87%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ** * * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA
* * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** ****
ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * ***
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG
***** * **************************** *** *****************
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
* ******* ************ * ** **** * * * * ***** ******
ZEA.MA_D CCACCATCTT
TRI.AE_A CCACC-----
*****
Mean pairwise ID: 74.11%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** **************** ** *********** *** **** * * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TRI.AE_A GT-TGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
** * * ******** ** * ***** **** * **** *************
ZEA.MA_F TG-GTTGTGGCTGG--TGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC
** ** **** * ******* ***** ** **** *** * * * * ***
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA
***** **************************** *** ******************
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG-AGCCTCATTAAACAGACC
TRI.AE_A AGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC
******* ********** * * ** **** * ** * * ***** * * ******
ZEA.MA_F ACCATCTTT
TRI.AE_A ACC------
***
Mean pairwise ID: 74.11%
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
******** ******* ******** **** *********** * * * **** * ***
TRI.AE_B TGGTGCGGT-TTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTAC--TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
* ** * ** ******* ** * ** ** ******** *************
TRI.AE_B TG-GTAGTGGGCTGGGTGG--CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGC
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCT-CACGGTCCATAATGTGGC
** ******* * * *** ** ********* * ** * * * ** *** *****
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
****** *** ******* *********************** ****************
TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAAT-TGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC
****** ********** * ** * ******** * ** * ********
TRI.AE_B ACCATCTTT
TRI.AE_A ACC------
***
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
*********** * ** **** *** ****** * ** *** *** *******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGA
*** * *** ******* *************** *** ****************
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC
******************* * **** **** ** * * * *******
ZEA.MA_D CACCATCTT-
TRI.AE_B CACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ** * * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA
* * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** ****
ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * ***
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
***** * **************************** *********************
ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC
******* ************* * ** **** * * * * ***** *******
ZEA.MA_G CACCATCTTT
TRI.AE_A CACC------
****
Mean pairwise ID: 74.34%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*** ***** **** ********** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
************************************************** * *******
ZEA.MA_C TGGT-ACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
* * * ** *** ******* ** * *** * * * *** ***** * ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
******** * * ** *** *** * ** **** ** ****** ** ****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGAA
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
**** ***** ****** ********************* *** ** ******** *
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTA--GCAAAC
******** *** ***** ** ** * ** ** *** * ** *** **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
ZEA.MA_B CACCATCTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
*********** * ** **** *** ****** * ** *** *** *******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGA
*** * *** ******* *************** *** **** *************
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC
******** ********** * **** **** ** * * * *******
ZEA.MA_E CACCATCTTT
TRI.AE_B CACCATCTTT
**********
Mean pairwise ID: 74.67%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*** ***** **** ********** ***
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_I TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 74.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
****************************************************** *****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * * ** ****** ** * *** * * * *** ***** * ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
********** * * *** *** *** * ** **** ** ***** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
****** ***** ****** ************************* ** ********
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GCAA
ZEA.MA_C AGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
******** * *** ***** ** ** * **** *** ***** ***
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 74.76%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
*********** * ** **** *** ****** * ** *** *** *******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA
*** * *** ******* *************** ****** ************** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGACC
TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC
******* ********** * **** **** ** * * * ********
ZEA.MA_G ACCATCTTT
TRI.AE_B ACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 74.91%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA
LYC.ES_D --TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA
* ***************************** *************************
LYC.ES_M TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA
LYC.ES_D TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA
********************* **************************************
LYC.ES_M ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC
LYC.ES_D ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC
************************************************************
LYC.ES_M GCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT
LYC.ES_D GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT
******************* ***** ***** ***
Mean pairwise ID: 75.57%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ******* ******************** ******* ** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ************** ****** ***
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** ****
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
* *************************** * ***** ****************
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
**** * **** * *** * * ** ****** ** ** *** ****** * *
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 75.66%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** **** ************** ****** ** * * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
***************************** ** * ****** ** ************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
**** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** ****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 75.70%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** *******
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
*** ********** * ********************************* *** ****
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
*** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT
*** * ***************
Mean pairwise ID: 75.99%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
**************** ********** ***
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_N TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 76.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** *******
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_D CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_D CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
*** ********** * ********************************* ********
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_D CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
*** ****** ************ ******* * * **** ** ********* * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_D CTA-AGCAGACCACCATCTT-
*** * **************
Mean pairwise ID: 76.10%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
******* *** *** **** *** ***** * ******* * * ** ** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC
****** ** ** * ******* ** ***** ********* *********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
TRI.AE_B CAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGCC
******* ********* ** * **** ****** ** ** ** * * * **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
TRI.AE_B TTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCA
* ************* *** ******* *************** ****** *******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
TRI.AE_B ACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCA
******************* ****** * ********** **** *** * *
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B TAGCAGACCACCATCTTT
* ***************
Mean pairwise ID: 76.14%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ******************** ******* *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
***************************** *** * ***** ** **********
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
*** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_N ATTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 76.25%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** *******
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_G CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
ZEA.MA_G CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
*** ********** * ******************************************
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ZEA.MA_G CAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC
** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_G TA-AGCAGACCACCATCTTT
** * ***************
Mean pairwise ID: 76.30%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** *** * * ********* *** ********** *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAG
* ** *** ** * ************* **** * ** ** *****************
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
TRI.AE_B TTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
***** **** * * **** ******* ** * * *** * ** *** *** *****
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGAAG
*** *** ******* *************** *** **************** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAA-CTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA
TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA
***************** **** ** ** * ** * * * *******
ZEA.MA_F CCATCTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
********
Mean pairwise ID: 76.32%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*** ***** **** ********** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** ******************************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 76.34%
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
******** * ********************** * * ************ * * **
LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG
TRY.BR_A GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
*** **** **** * ** ********* ***** ********* ** **********
LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG
TRY.BR_A GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG
* * ** *** **** * *** ******* *** * *** * *********
LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA
TRY.BR_A CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCA
**** *************** ******* * ***** **** ******* ******
LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
TRY.BR_A TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
* ** * **** * ****** * ********* **
Mean pairwise ID: 76.39%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* * ********* ******* * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ** ** * ** **** *** ****** ** * ******** **** ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_K CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
******** *** ************** * **** ***** ** ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC-AATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * *** ********************** *
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
********** **** * * **** * * * * ** *** ** ****** ****
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
****************************** *** ***********************
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
*** ** **** * * *** * *** ** ***** ** ** *** ****** * *
LYC.ES_C ACATTT
LYC.ES_F ACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************* *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT-
LYC.ES_H CCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 76.49%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******** ********** *** ***** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTC
***** * *** ****** * ** *** *** **** *********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ZEA.MA_C CAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGACC
******* ******* * * **** **** ***** * * ***** ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
ZEA.MA_C TATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTA
** ********* ** *********** ************************ *** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT-CT
ZEA.MA_C ACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACT
******************* ***** * ***** ***** **** *** * * * **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C AAAGCAGACCACCATTTTT
* * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.62%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ************
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
**** * ** * ** ******* * ** *** * *** ********************
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
TRI.AE_B GGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
******** * * ** *** ***** * ** ** * ** * *** ********
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGAAGG
* ** *** ****** *************** ******* ** ************
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGACCA
********** ************* **** ***** * * * *********
ZEA.MA_C CCATTTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 76.64%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** **** ************* *** ** ****** * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
***************************** ** * ****** ** ************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
**** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** ****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 76.87%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG
******** * ********************** * * ************ * * **
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG
*** **** **** * ** ********* ***** ********* ** **********
TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG
LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG
* * ** *** **** * *** ******* *** * *** * *********
TRY.BR_B CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA
LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA
**** *************** ******* * *********** ******* ******
TRY.BR_B TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--
* ** * **** * ****** * ********* ** *
Mean pairwise ID: 77.05%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*******************************
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************ ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_M CTTT-
***
Mean pairwise ID: 77.12%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
********* **** *************** * ******** *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
***************************** *** * ***** ** **********
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
*** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_I ATTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 77.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** *************************** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
* * ** * * * ****** * * ****** ** *****************
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
***** ***** * *** *** ***** ***** ***** ** ** ***** ** ***
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
*** * ************ ********************* *** *** ********
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA
************* ***** ** * * * ** * *** * ** ****
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 77.19%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG
******** *********** ******** ********** *** ****** *******
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GTTGTG--ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
** * * *** ***** ******* * ***** * *** ** ********* *
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC
******** ****** * * ****** * ***** ** ** * * *** * * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
*** ** ****** * **** **************************** **** ****
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC
** ****** ********* ** ******* *** **** * * ****** * ***
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B T-TAGCAAACCACCATCTTT
* * ** ************
Mean pairwise ID: 77.20%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* ***** * ************* ******** *********** ******
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* *********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
***** * ** * ** ******** *** * * * * * *** ** *****
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
** ***** *************************** ******* **************
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * *******
ARA.TH_A CCATTTT
ARA.TH_G CCATTTT
*******
Mean pairwise ID: 77.22%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC-CAGGCTTAGCGGGGAGG-ACGTGG
******** ********************** * * *** * * ***** ***
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC
LEI.MAJ. ACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTG---
****** ** **** *********************************** *
LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC
LEI.MAJ. -TGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTC
* ******* ****** ** ****** ** ***** *** ***** *****
LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGGA
LEI.MAJ. AGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGA
******* **************** * ******** ************ ***********
LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
LEI.MAJ. GCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
** **** *** ** ****** ** * ***** **
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* * ********* ******* * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_J CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* * ********* ******* * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
****** *** * ** **** *** ****** ** * ************* ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** ****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_A CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
********* ******************** ******* ** ********** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ************** **********
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** ****
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
* **************************** * ***** ****************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
**** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_O ACTTT-
*****
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ******* **** *************** * ******** *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
***************************** *** ******* ** **********
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
*** * *** *** ******* * ** ****** ** *** ************ *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_B ACTTTT
******
Mean pairwise ID: 77.52%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
********* ***** * ************* ******** *********** ******
ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* *********
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTT-CTAGAGTCGGAGGG
***** * ** * ** ******** *** * * **** *** ** *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
** ***** *************************** ******* **************
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * *******
ARA.TH_G CCATTTT
ARA.TH_F CCATTTT
*******
Mean pairwise ID: 77.88%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** **** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
* * * * * ** ** *** ** ********** *********** ****
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** *****
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
****** ************ ********************* *** *** ********
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAG
************* ***** * ** * * ***** *** * ***** ****
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
ZEA.MA_D ACCACCATCTT-
******** **
Mean pairwise ID: 77.96%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** ************* *** ** ****** * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
***************************** ** * ******* ** ************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
**** * **** * * *** ** **** *********** **** ****** *****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_B TTTT
***
Mean pairwise ID: 78.10%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* *************** **** ********* ***** ********** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* ** ** ********* ** ** ** **** **** ******* *********
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT
***** * * ** ** ** ******* **** * *** * ****** ******
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC
* ***** ******* ******************* **** ** ********** ***
ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCAC
ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC
* ****** * * * ** *********** ******* *** * * * * ** *****
ARA.TH_D CACTTT
ARA.TH_G CATTTT
** ***
Mean pairwise ID: 78.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******* *********** *** ***** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCT---TGTATGTGCCA-CTGGCCGGCCTGCCCGTT
*** ** ******** ******* *** ** * ** ** *** ********
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGAC
******** ** **** * ** ****** *********** * * *** * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC
** *** ******** ********************************* *********
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCAT
** ****** ************ ****** **** ** ** ****** * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F TA-AACAGACCACCATCTTT
** *****************
Mean pairwise ID: 78.14%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** **** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
* * * * * ** ** *** ** ********** *********** ****
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** *****
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
****** ************ ************************ *** ********
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAGA
******** **** ***** * ** * * ***** *** * ***** *****
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 78.21%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
**************************************************** **** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** *** *** ** ********** *********** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** *****
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
****** ************ ********************* ******* ********
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GCAG
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
******** **** ***** * ** * * ***** *** ***** ****
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 78.62%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*******************************
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************ ***********
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_M CTTT
**
Mean pairwise ID: 78.76%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
********* **** *************** * ******** *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ************** **********
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** ****
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
* **************************** * ***** ****************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
**** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_G ACTTTT
******
Mean pairwise ID: 79.61%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** **** ************** ****** ** * * ********** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
* ****** ** ******* * * * * ************* ******** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** * ****** ** * ******************
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
***************************** * ** ***** ******************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** *****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_O TTT-
**
Mean pairwise ID: 79.74%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* ***** ************** ******** * ****************
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* **** ******* *** * ************ ***** ******* *********
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT
***** * *** ** ********** *** * **** * ****** * ******
ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC
* ***** ******* ******************* ******* **************
ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC
** *** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ********
ARA.TH_E CATTTT
ARA.TH_G CATTTT
******
Mean pairwise ID: 80.33%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** **** ************** ****** ** * * ********** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
* ****** ** ******* * * * * ************* ****** * **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** * ****** ** * ******************
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
**************************** * ** ***** ******************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
** ** *** * * ****** * **** *****************************
LYC.ES_C ATTT-
LYC.ES_E ATTTT
****
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** **** ************* *** ** ****** * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
* ***** *** ******* * * * * ************* ******** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** * ****** ** * ******************
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
***************************** * ** ***** ******************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** *****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_G TTTT
***
Mean pairwise ID: 80.94%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********* ******* *** ******* *********** * * *****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
********* *************** *** * ***** *** **** ***** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
*** *** ******** ** ******** ** ******** *************
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ********* ****** ****
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** ** * **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************************ ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
** ********* *********** ** * ****** ** ************
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC
LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_A TTT
LYC.ES_N TTT
***
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
** ********* *********** ** * ****** ** ************
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC
LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_A TTT
LYC.ES_I TTT
***
Mean pairwise ID: 81.25%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_K CTTT
***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************************* ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_A CTTT-
***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_K CTTT-
***
Mean pairwise ID: 81.58%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA-ACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** * * * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_A CTTT
***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******* ** * ** ***** ********
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* **********************************************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_H TTTT
LYC.ES_M TTT-
***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
*************************** ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 82.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********* ******* *** ******* ************ * ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
******** *************** ** * ***** ************** ******
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT-
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
************** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_J CTTT
***
Mean pairwise ID: 82.24%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
* * ******* *** ********************************* ***** * *
HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
* **** *** *** ****** ********* * ******************* **
HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT
* ** **** * ** * ** ****** ** * ****** * **********
HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
************ **************** ******************************
HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
********** **** ** ** ** * **** ************************
HUM.JA_B TTTT
HUM.LU_C TTTT
****
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ************************ ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 82.27%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
****** ********* ******* *** ******* *********** * ** ****
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** *************** ** * ***** ************** ******
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.30%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
*************************** ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_J CTTT-
***
Mean pairwise ID: 82.57%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ***********
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_O TTT-
**
Mean pairwise ID: 82.61%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********** ******* *** ******* ************* ** ****
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
******** *************** * * ***** ************** ******
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_K CTTT
***
Mean pairwise ID: 82.89%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT
* * ******* *** **************************** **** *********
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
** **** *** **** ****** ********* * * ***************** **
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT
HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT
* ******* * ** ************* * ** ** ****** * **********
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
************ **************** ******************************
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTC--ACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
*** ****** **** **** ** ** **** ********* ****** **
HUM.LU_C TTTT
HUM.JA_A TTTT
****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************************* ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ***********
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** ** ***** ******************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_A CTTT
**
Mean pairwise ID: 82.95%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
*************************** ** ** **** * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** ****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_I TTTT-
***
Mean pairwise ID: 83.22%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_A CTTT
***
Mean pairwise ID: 83.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*********************** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_H CTTTT
****
Mean pairwise ID: 83.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * *****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ******************* ** ****** *** **** ****** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
*** ************ ** ******** ** *********** **********
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ********* ****** ***
GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* ***** ****** ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 83.33%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
*************** * ******* **** ********* **** ****** *** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
**** ******** **** ****** * *** * ***********************
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTT--GCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
******** **** * ** *********** ** ** * ***** **********
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
**************** ************************ ************** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
*** *** *** ****** *********** ****** ******* ** *****
ARA.TH_D CACTTT
ARA.TH_F CATTTT
** ***
Mean pairwise ID: 83.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************************* ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ***********
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_O TTT-
**
Mean pairwise ID: 83.61%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ****************** *** ******* ************ ** ****
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
********* *************** ** * ***** **** ********* ******
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** * * ** ****** **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.67%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ************
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** ** * * *** **********************
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
*** **** ******* * ********** * ******** *********** **
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
* * ** ***** ******** ***** ******* ****** ***************
CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT-
************** * * * * ****** ****************** *****
Mean pairwise ID: 83.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ****************** *** ******* **************** ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
******** *************** ** * ***** ************** ******
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT-
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** ******************* * ***** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT-TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
* ** ** *************** ** **** * ** ****** ***** * ******
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
ZEA.MA_F TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
**** *** *** ******* ***** ** * *** **** ****** ********
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
* ******* ********************************* ****************
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCAC
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
******* ********* * ******** * * ***** **** * * ** *****
ZEA.MA_B CATCTTT
ZEA.MA_F CATCTTT
*******
Mean pairwise ID: 83.88%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_J CTTT
***
Mean pairwise ID: 83.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ************** **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************ *** * ** ***** ******************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_O TTT--
**
Mean pairwise ID: 83.95%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********** ******* *** ******* ************* ** ****
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
********* *************** *** * ***** ************** ******
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.99%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
*************** * ******* **** ********* **** ****** *** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
**** ******** **** ****** * *** * ***********************
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
******** **** * ** *********** **** ** * ***** **********
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
**************** ************************ ************** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
*** *** *** ****** *********** ****** ******* ** *****
ARA.TH_A CATTTT
ARA.TH_D CACTTT
** ***
Mean pairwise ID: 84.00%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ************
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** **** * *** **********************
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
*** **** ******* * ********** * ******** *********** **
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
* * ** ***** ******** ***** ******* ****** ***************
CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT-
******** ***** * * * ******** ****************** *****
Mean pairwise ID: 84.05%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ******* *** ******* ** ***** ** ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
************************** * ** ****** *********************
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
RAT.RAT. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* **** ******* ***** ******** * **
RAT.RAT. T
XEN.LAE. -
Mean pairwise ID: 84.24%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** *********************** *** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT-TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
* ** ** ** ******* ****** ** **** *********** ***** * ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
****** *** ********* *** ***** ** * *** **** ******* *****
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG
ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
**** ******* **************************** *** ** **********
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
ZEA.MA_F GAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA
********* * ********* * **** ***** ** **** ***** *** ** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
***********
Mean pairwise ID: 84.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
*************************************** * ************** **
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************ *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT-
LYC.ES_H CTTTT
***
Mean pairwise ID: 84.26%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
*************** ******** **** ********* * ** ********** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
**** *** **** *** *** ** ** *** * **** ******************
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT
******* ***** **** *********** **** *** ********* *******
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
**************************************** ************** ****
ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC
ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACC
** **** *** ****** *********** ****** ******* ** ******
ARA.TH_D ACTTT
ARA.TH_E ATTTT
* ***
Mean pairwise ID: 84.59%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ****************************************** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
*************************** ** ** **** * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** ****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_N TTTT-
***
Mean pairwise ID: 84.62%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ************
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** ** * ***** **********************
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
******** ******* * ******** * * ******** **************
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT
* * ** ***** ******** ***** ******************************
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT
CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT
************** * * ******** ******************* **
Mean pairwise ID: 84.92%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
************** ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
*************************** ** ******* * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
** ***** ** *** *** ***************** **** ****** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_B TTTT-
***
Mean pairwise ID: 84.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * ****
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** *********************** * ** ****** *********************
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
RAT.NOR. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT
******************* **** ******* ***** ******** * ***
Mean pairwise ID: 84.95%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ***********
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** ** * ***** **********************
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
******** ******* * ******** * * ******** **************
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA
* * ** ***** ******** ***** ****************************** *
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT
CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT
************** * * ******** ********************* *
Mean pairwise ID: 85.00%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ********* *** ******* ** ***** ** * ****
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ***************** * ** ****** **** ****************
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
HOM.SA_B ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* **** ******** ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 85.00%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** * ******* *** ******* ** ***** *** * ****
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
************************** ** ****** *********************
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* **** ******* ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 85.33%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** * ******* *** ******* ** ***** *** * ****
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ******************* ** ****** *********************
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* **** ******* ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 85.53%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
************** ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************** **
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
**************************** ** *** *** * ** ************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** *******************
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 85.71%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ********* *** ******* ** ***** ***** ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
************************** * ** ****** *********************
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
HOM.SA_A ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* **** ******* ***** ******** * **
HOM.SA_A T
XEN.LAE. -
Mean pairwise ID: 85.81%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******* ** * ** ***** ********
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * **************************
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
*** ********************************************** *********
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_K TTT
LYC.ES_M TTT
***
Mean pairwise ID: 85.81%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******* ** * ** ***** ********
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * **************************
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* **************************************************
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
******************************* ****************************
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_A TTT
LYC.ES_M TTT
***
Mean pairwise ID: 85.95%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-GCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC
****** * ****** ************** ****** ******* ***** ******
FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT
XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT
******* *************** ** * ******************** *******
FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGC-CTAAGGAGGGG
XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG
******** ******** ************* ************ ** ***********
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** *********** ************
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******* ******** ** ** ** ** ***** ********* *** **** *
Mean pairwise ID: 86.18%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************ ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ************** **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
**************************** ** ******* * ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** ** *** *** ******************** **************
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_O TTT-
***
Mean pairwise ID: 86.47%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******* ** * ** ***** ********
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * **************************
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
************************************************************
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_J TTT
LYC.ES_M TTT
***
Mean pairwise ID: 86.51%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* *********** ***************** ***** *******************
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
*************************************** * ************** **
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
**************************** ** ** **** * ** ************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** *******************
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_N TTTT
****
Mean pairwise ID: 86.51%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****************************************** ********** ***
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************** **
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
**************************** ** *** *** * ** ************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** *******************
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 86.73%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** ********************* **** *
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
* ** ** ** ******* ***** * ******** **************** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
****** ******** ** **** *** * ** * ** **** ********** ***
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
*** ************************************ *******************
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC
******** ********** * * ********** ** *********** *** ******
ZEA.MA_G ACCATCTTT
ZEA.MA_F ACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 86.73%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** ********************* **** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
* ** ** ** ******* ***** * ******** **************** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
****** ******** ** **** *** * ** * ** **** ********** ***
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
*** **************************************** ***************
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC
******** ********** * * ********** ** *********** *** ******
ZEA.MA_E ACCATCTTT
ZEA.MA_F ACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 87.06%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** ********************* **** *
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
* ** ** ** ******* ***** * ******** **************** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
****** ******** ** **** *** * ** * ** **** ********** ***
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
*** ********************************************************
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC
******************* * * ********** ** *********** *** ******
ZEA.MA_D ACCATCTT-
ZEA.MA_F ACCATCTTT
********
Mean pairwise ID: 87.30%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
* * **************************************** ***********
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
***** ** * ************************** **********************
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
*********** **** *********** **** ** ** ***** ** *******
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************** **************** ***************************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
****** ********* **** ******** * **** ********* ******
HUM.LU_A TTCTTTT
HUM.JA_A CTCTTTT
******
Mean pairwise ID: 87.62%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
* * ***************************************************
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** ** * ******** ***************** **** *****************
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
****** **** **** * ** ****** **** *** ** ***** ** *******
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************** **************** ***************************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT
************** * *** ******** ****** *********************
HUM.LU_A TTCTTTT
HUM.JA_B TTCTTTT
*******
Mean pairwise ID: 87.83%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
** ********* *** ************************************ ******
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
** ******** **** ****** *********** * ********************
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT
* ********* *************** * ***** ******** ***********
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
************ **************************** ******************
HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTC
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
********** **** *** ** ****** * ************ **********
HUM.LU_B CTTT
HUM.LU_C TTTT
***
Mean pairwise ID: 87.95%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
** ********* *** ********************************* ******
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
******** ***** **** ****** *********** * *****************
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGT-TGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGC
**** ********* **************** ***** ******** ********
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
************************************************************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
************* * ** * ** ** * **************************
HUM.LU_D TTCTTTT
HUM.LU_C TTCTTTT
*******
Mean pairwise ID: 87.95%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG
************ *** ********************************* ******
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG
******** ***** **** ****** *********** * *****************
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCAC-TCCTAGACTGGAGGGC
**** ********* ************** * ****** ******* ********
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
************************************************************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
************* * ** * * ** ** * *** **********************
HUM.LU_A TTCTTTT
HUM.LU_C TTCTTTT
*******
Mean pairwise ID: 88.52%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
* * ********************************************* ** ** * *
HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
* ***** ******** ***************** **** ***************** **
HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
**** **** **** * ** ****** **** *** ********* ** **********
HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
***************************** *********** ******************
HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGC-TGACTCTTAATAGGACCATTT
HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTT
*********** ***** ******** ******* * *********** *********
HUM.JA_B CTTTT
HUM.LU_B CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 88.52%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
** *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
************************************************************
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
************************************************************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
************************* ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_B TTTT-
***
Mean pairwise ID: 88.52%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
************************************************************
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
************************************************************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
************************* ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_I TTTT-
***
Mean pairwise ID: 88.82%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
************************************************************
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
*************************************** * ************** **
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
**************************** ** ** **** * ** ************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** *******************
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_I TTTT
****
Mean pairwise ID: 88.93%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
*** **************************************** ***********
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
***** ** * ************************** **********************
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGG-TTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC
*********** **** **************** * ** ********* ** *******
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************** **************** ***************************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
****** ********* *** ******** * ***** ********* ******
HUM.LU_D TTCTTTT
HUM.JA_A CTCTTTT
******
Mean pairwise ID: 89.03%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
************************************************** ****** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
********* ********** ******* **** ** * ****** ***** ******
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
********** *** *** **** ***** ********* ***** ******* ** **
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
************ **************************** **** *************
ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
********* ************ ********* *** ****** **** ** **** **
ZEA.MA_G CACCATCTTT
ZEA.MA_B CACCATCTTT
**********
Mean pairwise ID: 89.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
************************************************** ****** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
********* ********** ******* **** ** * ****** ***** ******
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
********** *** *** **** ***** ********* ***** ******* ** **
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
************ ******************************** *************
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
********* ************ ********* *** ****** **** ** **** **
ZEA.MA_E CACCATCTTT
ZEA.MA_B CACCATCTTT
**********
Mean pairwise ID: 89.10%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** * ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
********************* ******* * *** * ******** ***** *****
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_D AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
*********** **** ** **** ***** ********* ***** ******** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
************* **************************** *** ** *********
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA
ZEA.MA_D GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
********** * ************ ***** ********* **** ************
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
ZEA.MA_D ACCACCATCTT-
***********
Mean pairwise ID: 89.25%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA
*** ***************************************************
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG
* ** ** * ******** ***************** **** *****************
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG-CTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC
****** **** **** * ** ****** **** *** ********* ** *******
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
*************** **************** ***************************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT
************** * **** ******** ******* *********************
HUM.LU_D TTCTTTT
HUM.JA_B TTCTTTT
*******
Mean pairwise ID: 89.30%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
***************** ******************************* * ****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
************************** *************** *** ****** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***************** * ** ****** * ** **********************
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
********************************************* * ****** ****
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
************************ ****** ***************** *****
Mean pairwise ID: 89.33%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
***************** ******************************* * * ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
******** ***************** *************** **** ****** *****
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***************** * ** ****** * ** **********************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
********************************************* * ****** ****
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
************************ ****** ***************** *****
Mean pairwise ID: 89.35%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
************************************************** ****** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
********* ********** ******* **** ** * ****** ***** ******
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
********** *** *** **** ***** ********* ***** ******* ** **
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
************ ********************************* *************
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
********** ************ ********* *** ****** **** ** **** **
ZEA.MA_D CACCATCTT-
ZEA.MA_B CACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 89.40%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAG-TTAGAATAGTCAG
************** ****** * ******************* ** **** **
TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC
TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGC
**************************************** ******** ********
TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCCTC
TET.ROS. TATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCCTC
******** ***************** ******************** ***** ******
TET.THE. AGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATACTCA
TET.ROS. AGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACTCA
********************************** *************************
TET.THE. TTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT
TET.ROS. TTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT
*********** ************ **** ****** *
Mean pairwise ID: 89.44%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC
******************************************** ********** * **
HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG
************** ********************** *********************
HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAATG
HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAATG
*** ********* * ** ****** ** * * ************ ***********
HUM.JA_B CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG
HUM.JA_A CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG
**************************** *******************************
HUM.JA_B GGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTCT
HUM.JA_A GGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCT
** ******* ***** ** ******** ***** ********* ****** ***
HUM.JA_B TTT
HUM.JA_A TTT
***
Mean pairwise ID: 89.47%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* **********************************************************
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
*************************************** * ************** **
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
**************************** ** ******* * ** ************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
** ***** ** *** *** ******************** **************
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_B TTTT
****
Mean pairwise ID: 89.51%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
*************************** ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
************************************************************
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
************************************************************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
************************* ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_N TTTT-
***
Mean pairwise ID: 89.71%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** * ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
********************* ******* * *** * ******** ***** *****
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_G AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
*********** **** ** **** ***** ********* ***** ******** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
************* ******************************* ** **********
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
ZEA.MA_G GAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
********** ************ ***** ********* **** ************ *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
***********
Mean pairwise ID: 89.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** * ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
********************* ******* * *** * ******** ***** *****
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
*********** **** ** **** ***** ********* ***** ******** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
************* **************************** **** ** *********
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA
ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG
*********** ************ ***** ********* **** ************
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
************
Mean pairwise ID: 89.77%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT
HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT
* * **************************************** **** ** ******
HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
******* ************************** ********************** **
HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT
HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT
********* **** ************ **** ** ********* ** **********
HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
***************************** *********** ******************
HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTCC
HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATCTCT
*** ************* ******** ****** ********** ****** **
HUM.LU_B TTT
HUM.JA_A TTT
***
Mean pairwise ID: 90.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
************************************************** * ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
******** ***************** *************** **** ****** *****
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***************** * ** ****** * ** **********************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
********************************************* * ****** ****
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
************************ ************************ *****
Mean pairwise ID: 90.30%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
************************************************** * * ****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** ***************** *************** **** ****** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***************** * ** ****** * ** **********************
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
********************************************* * ****** ****
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT
************************ ************************ *****
Mean pairwise ID: 90.64%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
***************** ******************************** * * ****
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
****************************************** **** ****** *****
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***************** * ** ****** * ** **********************
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
********************************************* * ****** ****
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
************************ ****** ***************** *****
Mean pairwise ID: 90.85%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
**************** ************************* ********* ******
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
****** *** *** ******** *** ************ ******************
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTT--GCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
******* **** * ** *************** * * ***** *** ******
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
**************** *******************************************
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
**** *******************************************************
ARA.TH_E CATTTT
ARA.TH_F CATTTT
******
Mean pairwise ID: 90.97%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
***************** ******************************** *** ****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ***************** ************** **** ****** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***************** * ** ****** * ** **********************
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
********************************************* * ****** ****
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
************************ *******************************
Mean pairwise ID: 91.45%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *********************************************************
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* ***************** ****************************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_H TTTT
LYC.ES_A TTT-
***
Mean pairwise ID: 91.50%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
**************** ************************* ********* ******
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
****** *** *** ******** *** ************ ******************
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
******* **** * ** ***************** * * ***** *** ******
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
**************** *******************************************
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
**** *******************************************************
ARA.TH_A CATTTT
ARA.TH_E CATTTT
******
Mean pairwise ID: 92.11%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
************************************************************
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* **********************************************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_H TTTT
LYC.ES_K TTT-
***
Mean pairwise ID: 92.31%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC
YAR.LI_B ---AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTT
********************************** *********************
YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT
YAR.LI_B CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT
*** ********* *** * ** ************************************
YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA
YAR.LI_B CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGA
************************************************ ***********
YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT
YAR.LI_B GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTAT
******************************************** ***** *********
YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---
YAR.LI_B ATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC
************ ***** * ******* *
Mean pairwise ID: 92.43%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *********************************************************
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* **********************************************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_H TTTT
LYC.ES_J TTT-
***
Mean pairwise ID: 92.58%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
************************************************** * * *****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
********* ********** *************** ** ********************
ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
************* **** ******************************** ******
ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGGG
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
**************************************** *** *** ***********
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAAC
ZEA.MA_B AGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
******** ******************** *** *** * **** **** ** *******
ZEA.MA_A CACCATCTTT
ZEA.MA_B CACCATCTTT
**********
Mean pairwise ID: 93.18%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
** *********************************************** ** ***
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
***** ** ***************************************************
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
***************************** ************ ****************
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
*************** **************************** ***************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGC-TGACTCTTAATAGGACCA
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
**************** *** ********* ****** * * *********** ******
HUM.LU_A TTTCTTTT
HUM.LU_B TTTCCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 93.67%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
************************************************************
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***************************** *** **************************
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
*** ************** *********** *** ********************* **
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT
*********************************** ****** ****************
CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT-
******** ********* *************** ***************** * **
Mean pairwise ID: 93.67%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
************************************************ ***********
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***************************** *** **************************
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
*** ************** *********** *** ********************* **
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA
*********************************** ****** ****************
CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT-
******** ********* *************** ***************** *** *
Mean pairwise ID: 94.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
************************************************ ***********
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
********************************* **************************
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
*** ************** *********** *** ********************* **
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA
*********************************** ****** ****************
CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT-
****************** **** ********** ***************** *** *
Mean pairwise ID: 94.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
************************************************************
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
********************************* **************************
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
*** ************** *********** *** ********************* **
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT
*********************************** ****** ****************
CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT-
****************** **** ********** ***************** * **
Mean pairwise ID: 94.10%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
****** ******** *************************************** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
************************************************************
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
* **********************************************************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
****************************************** ** * ****** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_G TTTT-
***
Mean pairwise ID: 94.16%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG
** *********************************************** ** ***
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
***** ** ***************************************************
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
****************************** *****************************
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT
*************** **************************** ***************
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGC-TGACTCTTAATAGGACCA
HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA
**************** *** ********* ******** * *********** ******
HUM.LU_D TTTCTTTT
HUM.LU_B TTTCCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 96.37%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** *********** ***************** ***** *******************
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
************************************************************
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
************************************************************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
************************************* **********************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCACT
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
*************************** ********** ***** ************* *
LYC.ES_B TTT
LYC.ES_N TTT
***
Mean pairwise ID: 96.66%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
***************** ******************************* *******
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** ********************************** ****************
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT
********************************** ***************** ******
Mean pairwise ID: 96.71%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
************** ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
****** ******** ********************************************
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
************************************************************
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
************************************************************
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_O TTT-
***
Mean pairwise ID: 96.72%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* **********************************************************
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
******************************************************* ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
************************************************************
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
* **********************************************************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
****************************************** ** * ****** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_O TTT--
**
Mean pairwise ID: 96.99%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
****************** ******************************** *******
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ****************** *************** ****************
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
********************************** ***************** *****
Mean pairwise ID: 97.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
***************** ******************************** ******
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
******** ********************************** ****************
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT-
********************************** ************************
Mean pairwise ID: 97.33%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
***************** ******************************* * *******
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** *********************************************************
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT-
********************************** ***************** ******
Mean pairwise ID: 97.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
***************** ********************************* ******
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ***************** *********************************
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT-
********************************** ************************
Mean pairwise ID: 97.66%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
***************** ******************************** *********
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** ***************** *********************************
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT
********************************** ***************** ******
Mean pairwise ID: 97.66%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
**************************************************** *******
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ***************** ********************************
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
********************************** ***************** *****
Mean pairwise ID: 97.66%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
***************** ******************************** * *******
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ************************ ********************************
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT
**************************************************** *****
Mean pairwise ID: 97.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
****************** ********************************* *******
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
*************************** ********************************
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
********************************** ***************** *****
Mean pairwise ID: 97.67%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
***************** ********************************* * ******
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
*************************** ********************************
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
**************************************************** *****
Mean pairwise ID: 97.67%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
************************************************** ******
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** *********************************************************
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT-
**************************************************** ******
Mean pairwise ID: 97.68%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* *********** ***************** ***** *******************
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
************************************************************
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
************************************************************
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
************************************************************
LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT
LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT
************************************************************
LYC.ES_I TT
LYC.ES_N TT
**
Mean pairwise ID: 97.72%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
* *** ******************************************************
HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG
************************************************************
HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC
HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG-CTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC
***************************** ************ ****************
HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT
************************************************************
HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT
******************** **************** **********************
HUM.LU_A TTCTTTT
HUM.LU_D TTCTTTT
*******
Mean pairwise ID: 97.99%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
****************** ******************************** *******
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
************************** **************** ****************
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
********************************** ************************
Mean pairwise ID: 98.00%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
*************************************************** *******
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
******** ********************************** ****************
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT-
********************************** ************************
Mean pairwise ID: 98.00%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
***************** ******************************** ******
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
************************************************************
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
********************************** *************************
Mean pairwise ID: 98.02%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *********************************************************
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************************
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
*** ***** **************************************** *********
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
******************************* ****************************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_K TTT
LYC.ES_A TTT
***
Mean pairwise ID: 98.02%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* **********************************************************
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
************************************************************
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
************************************************************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
************************************* **********************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCACT
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
*************************** ********** ***** ************* *
LYC.ES_B TTT
LYC.ES_I TTT
***
Mean pairwise ID: 98.19%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
************************************************************
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA
TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA
************************************************************
TRY.BR_B GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG
TRY.BR_A GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG
************************************************************
TRY.BR_B TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA
TRY.BR_A TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA
********************************** ************************
TRY.BR_B GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
TRY.BR_A GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---
*********************************
Mean pairwise ID: 98.33%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
****************** ********************************* *******
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ***************** *********************************
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
************************************************************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
************************************************************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT-
***********************************************************
Mean pairwise ID: 98.33%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
************************************************ ***********
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
************************************************************
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
************************************************************
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA
***********************************************************
CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT
CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT
******************************************************* *
Mean pairwise ID: 99.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
************************************************************
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***************************** ******************************
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
************************************************************
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
************************************************************
CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
******** *************** ***********************************
Mean pairwise ID: 99.01%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* **********************************************************
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************************
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* **************************************************
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
******************************* ****************************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_J TTT
LYC.ES_A TTT
***
Mean pairwise ID: 99.01%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *********************************************************
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************************
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ********************************************** *********
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_J TTT
LYC.ES_K TTT
***
Mean pairwise ID: 99.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
************************************************************
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
************************************************************
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
************************************************************
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
******************************************** ***************
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
******** ***************************************************
ZEA.MA_E ACCATCTTT
ZEA.MA_D ACCATCTT-
********
Mean pairwise ID: 99.03%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
************************************************************
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
************************************************************
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
************************************************************
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGG
**************************************** *******************
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
******** ***************************************************
ZEA.MA_D ACCATCTT-
ZEA.MA_G ACCATCTTT
********
Mean pairwise ID: 99.35%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
************************************************************
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
************************************************************
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCT--TGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
************************************ **********************
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
************************************************************
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
************************************************************
ARA.TH_A CATTTT
ARA.TH_F CATTTT
******
Mean pairwise ID: 99.35%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
************************************************************
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
************************************************************
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
************************************************************
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGG
**************************************** *** ***************
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC
************************************************************
ZEA.MA_E ACCATCTTT
ZEA.MA_G ACCATCTTT
*********