RNAlib-2.0.2
|
00001 #ifndef __VIENNA_RNA_PACKAGE_PARAMS_H__ 00002 #define __VIENNA_RNA_PACKAGE_PARAMS_H__ 00003 00004 #include "energy_const.h" 00005 #include "data_structures.h" 00006 00012 extern paramT *scale_parameters(void); 00013 00014 extern paramT *copy_parameters(void); 00015 00016 extern paramT *set_parameters(paramT *dest); 00017 00018 00019 pf_paramT *scale_pf_parameters(void); 00020 00027 pf_paramT *get_scaled_pf_parameters(void); 00028 00051 pf_paramT *get_boltzmann_factors( int dangle_model, 00052 double temperature, 00053 double alpha, 00054 double pf_scale); 00055 00056 pf_paramT *get_boltzmann_factor_copy(pf_paramT *parameters); 00057 00058 pf_paramT *get_scaled_alipf_parameters(unsigned int n_seq); 00059 00060 extern pf_paramT *copy_pf_param(void); 00061 00062 extern pf_paramT *set_pf_param(paramT *dest); 00063 00064 #endif