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Mean pairwise ID: 74.58%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * ***** ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTT TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCG----TTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ** * * * * ****** * ** * * *** ***** * ZEA.MA_C CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC TRI.AE_B CCAAGTTG-GTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG------CCTTCTCAGGC ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC ******** ****** * *** *** * ** * * * ZEA.MA_C CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT TRI.AE_B CTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTC ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC ** ** ****** * *** ****** *************** *** *** ** ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA TRI.AE_B CAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CG ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CT ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT--C * ****** ********* ** ***** ** ** * * ** ZEA.MA_C CTAAAGCAGACCACCATTTTT TRI.AE_B CCATAGCAGACCACCATCTTT ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTTAGCAAACCACCATCTTT * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 74.75%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGG--ATTCTGATCC-TGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCC TRI.AE_B CTTGGTGCGG--TTTGTTGGCC-TGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCC ZEA.MA_C CTTGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCA----TGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCC ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTC------GTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCC ** * * * * ** **** * *** * * *** ***** ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA ZEA.MA_C GTTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCC----CTGGGCTTCCTTG ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCT----TTGGGTCTCTGCA * ******** ****** * *** *** * ** * * * ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCT TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCT ZEA.MA_C GACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCT ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACT * *** ** ****** * *** ****** *************** ****** ** ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTC ZEA.MA_A CCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT * ****** ******** * ** ***** ** ** *** ORY.SA_A -CTCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B -CGCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C ATACTAAAGCAGACCACCATTTTT ZEA.MA_A -CACTA-AGCAAACCACCATCTTT * * * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 75.61%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** **** ORY.SA_A TTTGGTGTGG--ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG TRI.AE_B CTTGGTGCGG--TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCG ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ZEA.MA_C CTTGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCG ** * * * * ** *** *** *** *** ****** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTT----TGGTCTCTCC-AG ZEA.MA_C TTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCC----TGGGCTTCCTTGG * ******** ******* * *** *** * ** * * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT ZEA.MA_C ACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCT *** ********* * *** ****** *************** *** *** *** ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC- TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC- ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT- ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCA * ****** ******** *** ***** * ** * **** ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CGCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_E CACTAA-GCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C TACTAAAGCAGACCACCATTTTT * * *********** ***
Mean pairwise ID: 75.99%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCC-TGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCC TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTT-GTTGGCC-TGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCC ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCG-----T-TGTGACACTGGCCGGCTTGCCC ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCC ** * ** ** * ** ***** *** ** ** *** ***** ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA ZEA.MA_F GTTCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-----GGGCCTCTTTA * ******** ** *** * * * ** ***** ** * * ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GC ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC ZEA.MA_F GACCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGC * *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** * ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC TRI.AE_B TTCCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACC ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC ZEA.MA_F TTCCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCC * *** ****** ******** * ** ****** *** ** * ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CCGCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_A TCACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F TCATTA-AACAGACCACCATCTTT * * * ** ************
Mean pairwise ID: 76.05%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** * ** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGAT--CCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCC TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCC ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCG----TT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCC ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCC ** * * ** ** ** **** ** ** * *** ***** ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA ZEA.MA_E GTCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTT----TGG-TCTCTCCA * ******** ****** * * **** *** * ** * * * ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GC ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC ZEA.MA_E GACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGC * *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** * ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC TRI.AE_B TTCCAACGGTGGAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACC ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC ZEA.MA_E TTCCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCC * *** ****** ******** ** ****** * *** *** * ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CCGCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_A TCACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_E TCACTA-AGCAGACCACCATCTTT * * * * ** ************
Mean pairwise ID: 76.35%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGT ** * * * * ****** *** * * *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC TRI.AE_B TCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGG ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCC-----TGGGCCTCTTTAGA ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCC----CTGGGCTTCCTTGGA ********* ** **** * * *** **** * ** * ** * * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT TRI.AE_B CCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA *** ** ****** * *** ****** *************** *** *** *** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-C TRI.AE_B CCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-C ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-C ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT * ****** ************ ***** ** * ** * ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT * * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.47%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * ***** * ZEA.MA_C TGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAAG TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAAG ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG * * * * ******* * * *** * * * *** ***** * ***** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC TRI.AE_B TTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ***** *** ** *** *** * ** * * * *** ** *** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGA ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG *** * *** ****** *************** *** *** ** ******** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGA ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG--ATCCTCTCTTAGCAAA ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAG--AGCCTCATTAAACAGA ********* *** ***** ** * * * * * ** * ZEA.MA_C CCACCATTTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ZEA.MA_B CCACCATCTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 76.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ****** *** * ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA * * * * *** **** * * *** * * * *** ***** * *** ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG ******* *** ** ** *** * ** * * * *** ** * ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTG ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ***** * *** ****** *************** *** *** ** ******* ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGC ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTA-AGC ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTA-AAC * ******** * *** ***** ** ** * * * ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT TRI.AE_B AGACCACCATCTTT ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 76.61%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ************ * * ** * ** * ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * **** * ****** ******* * LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ** ********* *********** ** ** ******* ** ********** LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATG-TCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * * *** * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_B ACTTTT LYC.ES_J ACCTTT LYC.ES_C ACATTT LYC.ES_F ACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 76.67%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** ** * *** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCT---TTGTTGGCCTGCCCGT ** * * ** * ** * *** * * *** ***** * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGA ******** ** *** * ** *** * ** * * ** * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA *** ** ****** * **** ****** ********************* *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT- ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT- ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC- ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCA * ****** ******** * ** ***** ** * ** *** ZEA.MA_A CACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F CATTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C TACTAAAGCAGACCACCATTTTT ** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 76.68%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** * ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGT ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCG-----T-TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT ** * ** ** * ******* *** ** ** *** ***** * ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC TRI.AE_B TCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGG ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-----GGGCCTCTTTAGA ******** ** *** * * * **** ***** ** * * * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT TRI.AE_B CCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTT ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** *** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT TRI.AE_B CCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCA *** ****** ********* ** ****** **** * * * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B CT-TAGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F TT-AAACAGACCACCATCTTT * ** ************
Mean pairwise ID: 76.80%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * **** ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTT-GCTGGCTTGCCCG TRI.AE_B CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCG ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCG----T--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCA ** * * ** ** * ** **** *** * ** *** ***** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTT----TGG-TCTCTCCAG ZEA.MA_B TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAG * ******** ****** * **** *** * ** * * * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT ZEA.MA_B ACCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACT *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** ** ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC ZEA.MA_B TCCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC **** ****** ******** ** ****** * **** * ** * * ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT * * ** ************
Mean pairwise ID: 76.87%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * * *** ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCC-TGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCC TRI.AE_B CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCC ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTC------GTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCC ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTC------GTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCC ** * * ** ** * ** ***** * *** * ** ** *** ***** ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA ZEA.MA_B ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA * ******** ****** * * ** ***** ** * * * * ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GC ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC ZEA.MA_B GACCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCAC * *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** * ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC TRI.AE_B TTCCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACC ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC ZEA.MA_B TTCCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCC * *** ****** ******** * ** ****** ** *** * * * ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CCGCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_A TCACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTCTT-AGCAAACCACCATCTTT * * * ** ************
Mean pairwise ID: 77.03%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** * * *** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCA ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTT----CTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCA ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATG-TTGTTGTA-AT-CTTGCTGGCTTGCCCG ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCT----TTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCG ** * * * * ** * * * * ** * * *** ***** ZEA.MA_A TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAG ZEA.MA_B TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAG ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG ZEA.MA_C TTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGG * ******** ****** * ** *** * ** * * * ** * ZEA.MA_A ACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACT ZEA.MA_B ACCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACT ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT ZEA.MA_C ACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCT *** ** ****** * **** ****** ********************* *** ** ZEA.MA_A CCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT ZEA.MA_B TCCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTC * ****** ******** * ** ***** ** ** * * *** ZEA.MA_A -CACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_B -CTCTT-AGCAAACCACCATCTTT ORY.SA_A -CTCTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C ATACTAAAGCAGACCACCATTTTT ** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.04%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * * ***** ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA * * * * * * *** **** * * ** * * *** ***** * **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ********** ** ** *** * ** * * * *** ** ** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGG ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG **** * *** ****** *************** *** *** ** ******** ZEA.MA_C AAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA TRI.AE_B AAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCA ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACT-AAGCA ZEA.MA_B GAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT-CTCT-TAGCA ******** * *** ***** ** ** * * * **** ZEA.MA_C GACCACCATTTTT TRI.AE_B GACCACCATCTTT ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_B AACCACCATCTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 77.09%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGAT---CCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCC ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCC ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCG----TT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCC ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCC ** * * * * ** *** * ** ** *** ***** ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG ZEA.MA_C GTTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTG ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCA ZEA.MA_E GTCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCA * ******** ****** * *** *** * ** * * ** ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC ZEA.MA_C GACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGC ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC ZEA.MA_E GACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGC * *** ** ****** * **** ****** ********************* *** * ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC ZEA.MA_C TATTAACGGTGGAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTT ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC ZEA.MA_E TTCCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCC * * ****** ******** ** ***** * ** * *** *** ORY.SA_A CCT-CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C CATACTAAAGCAGACCACCATTTTT ZEA.MA_A TCA-CTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_E TCA-CTA-AGCAGACCACCATCTTT *** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.11%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ***** *** ************* * **** * * ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * * * **** * ****** ****** * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_E -CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC *********************** ** * ***** **************** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTT-CAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * *** * * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 77.21%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** * ***** ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GT-TGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTT---GTATGTG-CCACTGGCCGGCCTGCCCGTT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTC---AT-GGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTT ** * *** ****** * ** * * *** ***** * ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGAC ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_C CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC ******** ** *** * * *** *** * ** * * ** * * ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_C CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT ** ** ****** * **** ****** ********************* *** ** ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCT ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGA-GCCTCA ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGA-GTCCCT ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA * ****** ********* ** ***** ** * * * *** * ZEA.MA_B CTT-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C CTAAAGCAGACCACCATTTTT * * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.23%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GCGGATT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** * **** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTC---GTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_C CTTGGTACCGT--GTCTTTGCCTGGGTTC----ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGT ** * * *** ** *** * * * * *** ***** * ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTT----CCTTGGA ******** ****** * *** *** * ** * * * * * ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA *** ** ****** * **** ****** ********************* *** ** ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-C ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT-C ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-C ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT * ****** ******** ** ***** * ** * * ** *** ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT ** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.29%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** ** **** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTT-GTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCG ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCG ** * ** ** * ** **** *** ** * *** ****** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-----TTGGTCTCTCCAG ZEA.MA_F TTCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCC-----TGGGCCTCTTTAG * ******** ** **** * * **** *** * ** * * * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT ZEA.MA_F ACCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCT *** *** ****** * *** ******* *************** *** *** *** ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC ZEA.MA_F TCCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC **** ****** ******** *** ****** **** ** * * * ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT * * ***************
Mean pairwise ID: 77.34%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** * ** ** ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCT-GGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCCT-GGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCA ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA * * * * * * *** *** * ** * ** *** ***** * *** ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG *********** ** *** *** * ** * * * *** ** * ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTG ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ***** * *** ****** *************** *** **** ** ******* ZEA.MA_C GAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC TRI.AE_B GAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGC ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTA-AGC ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTA-AGC * ******** *** ***** * ** *** * * *** ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT TRI.AE_B AGACCACCATCTTT ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 77.36%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ************* * **** * * ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * ************* ****** * * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * * ********* *********** ** * ***** **************** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTT-CAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * *** * * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_J ACCTTT- LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 77.43%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * **** ** ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA * * * * * * *** *** * *** * * * *** ***** * **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ********** ** *** *** * ** * * * *** ** ** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGG ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG **** * *** ****** *************** *** *** ** ******** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACT-AAGCAG ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT-CTCT-TAGCAA ******** *** ***** * ** * * ** * **** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TRI.AE_B ACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_B ACCACCATCTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 77.55%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** **** **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTT--GCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTG-GCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** *** * *** * ** *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-TTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCT--TCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ****** **** ** *** *** * ** * * * *** ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTCCAACGGTGG **** * *** ****** *************** *** *** *** ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAAG-CAG ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAAA-CAG ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG ******** **** ***** ** * ** * * *** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_F ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TRI.AE_B ACCACCATCTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 77.75%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ***** *** ************ * * ** * ** * ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * * * **** * ****** ******* * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ************************* ** ** ******* ** ********** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * * *** * * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 77.89%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** ** **** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTT---G-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTC---ATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGT ** * * ** ** *** * * * *** ******* ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCT-----CTCCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCT-----CTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTT----CCTTGGA ******** ** **** * *** *** * ** * * * * ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA *** ** ****** * *********** ********************* *** *** ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-C ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-C ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-C ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT * ****** ******** *** ***** ** * * ** * *** ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT ** * *********** ***
Mean pairwise ID: 77.92%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ***** *** ************* * **** * ** ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * **** * ****** ******* * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * * *** * * * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_J ACCTTT- LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 78.67%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ************* * * ** ** * ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * * * **** * ****** ****** * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC *************************** * ***** * ** ********** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-C-CAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC *** *** * *** * * ** ***** ** ** *** ****** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 79.16%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ******* **** ************ ** * *** * ** ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ****** * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** * ** * * *** ** * * ** * ** ****** *** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * ********* *********** ** * ***** * ** ********** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAG-TCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * *** * * * ** *** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_J ACCTTT- LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 79.90%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** **** * ** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCT-GGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA * * ** ** *** * ***** * ** * * ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG ******* *** * ** **** *** * ** * * ** ** *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTCCAACGGTG ***** * *** ******* *************** *** *** ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCA ZEA.MA_F GGAGGATAACAG-GCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACA TRI.AE_B GAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA * ******** ********* *** ** ** * * * ** ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_E GACCACCATCTTT ZEA.MA_F GACCACCATCTTT TRI.AE_B GACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 79.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***************** ** ***** * ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ****** * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** * ** * * *** ** * * ** * ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * ********* *********** ** * ***** **************** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * ** *** * * * ** *** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_J ACCTTT- LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 79.95%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************ ** * *** * ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ****** * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** **** * * *** ** * * *** * ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_E -CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC *********************** ** * ***** * ** ********** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * *** * * ** *** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 80.08%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * * *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA * * ** ** * **** ****** ** *** * ** ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTGGGTGG-CTGGGGCGAAAGCTT--CGCCTTCTCAGGCCTTAAGTG ******* *** * ** ** ***** ** * * ** ** *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTG ***** * *** ******* *************** *** * ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTT-AGCA ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACA TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA * ******** * ********* *** * ** * * ** ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_B AACCACCATCTTT ZEA.MA_F GACCACCATCTTT TRI.AE_B GACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 80.11%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAA * * ** ** * **** ***** * *** * * ** *** ***** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ****** *** ** **** *** * ** * * ** ** *** ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGG **** * *** ******* *************** *** * ************* ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTT-AGCAAA ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGA TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA ******** ********* **** * * ** * * ** * ZEA.MA_E CCACCATCTTT ZEA.MA_B CCACCATCTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 80.57%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** ** * ** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCT--TTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCT-GGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * ** ** *** ** ** * ** * ** *** ***** * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGG----TCTCTGCAGA ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ** *** * * **** *** * ** * * *** * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAG-GCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC *** ****** ******** ** ****** *** ** ** **** * * ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT ** * ** ************
Mean pairwise ID: 80.57%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************ *** ** * * * ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** ** ******* * * **** * ****** ****** ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * ********* *********** ** * * ***** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC * * *** * * * ** * ** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_B TTTT- LYC.ES_J CTTT- LYC.ES_C ATTT- ***
Mean pairwise ID: 80.78%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** * * *** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGT--TGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_F TTTCCTGACGG-ATTCTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * ** ***** ** ** * * *** ** ** *** ***** * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ** *** *** ** ***** ** * * * *** * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC *** ****** ******** * ** ****** *** * * **** * * ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT * * ** ************
Mean pairwise ID: 80.84%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************ ** * *** * ** ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ******* * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** * ** * * *** ** * * **** ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ** ********* *********** ** ** ******* ** ********** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * * *** * * * ** *** ** ** *** * *** **** * * LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_J ACCTTT- LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 80.92%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ***************************** ********************* * ** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCT-GGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA * * * ** * *** * *** * ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCG ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG ******* *** * * ** *** *** * ** ** ** ***** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG ***** * ***** ****** ********************* *** ** ******* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GC ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GC ZEA.MA_F GGAGGATAACAG-GCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAA-AC ZEA.MA_C GAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC * ******** *** ***** ** * ** *** * *** * ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 80.98%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** * **** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTC---GT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_F TTTCCTGACGG-ATTCTGGGCCTGGGCTT---GT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * ** ***** ** **** * * * ** *** ***** * ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGG----TCTCTGCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ** *** * **** *** * ** * * *** * ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** *** ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCA ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT *** ****** ******** ** ****** **** * * ***** * * ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B CTT-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT * * ** ************
Mean pairwise ID: 81.32%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ***************************** ******************* * * *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCA * * *** *** **** * * **** * * * *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG ******* *** * * ** ** *** * ** *** ** ***** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG ***** * ***** ****** ********************* *** ** ******* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA-ACCTCACTAA-GC ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCTCTTA-GC ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGA-GCCTCATTAA-AC ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC * ******** * *** ***** ** * *** * * * * ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_B AAACCACCATCTTT ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 81.40%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ***************************** ******************* * **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAA * * *** *** *** * **** * * * *** ***** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ****** *** * * ** *** *** * ** ** ** ***** ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG **** * ***** ****** ********************* *** ** ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA--GCCTCACTAAGCAG ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA--TCCTCTCTTAGCAA ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGA--GCCTCATTAAACAG ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** *** ***** ** * * * *** * * * ** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_B ACCACCATCTTT ZEA.MA_F ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 81.47%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************ *** ** * * * ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** ** ******* * * * * **** * ****** ****** ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA- LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *********************** ** * * ***** * ** ************ LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC * * *** * * * ** * ** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_B TTTT- LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_C ATTT- ***
Mean pairwise ID: 81.60%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCC-CGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCA * * * ** *** * **** ***** * ** * * ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG *********** ** * ** *** ****** * ** *** *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTCCAACGGTG ***** * *** ******* *************** *** *** ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTT-AGCA ZEA.MA_E GGAGGATAAC-GGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCA TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA * ******** ********* * *** * * ** * * **** ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_B AACCACCATCTTT ZEA.MA_E GACCACCATCTTT TRI.AE_B GACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 81.67%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************* ****** * * * ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** ** ******* * * **** * ****** ****** ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC * * *** * * * * * ** * ** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_J CTTT- LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_C ATTT- ***
Mean pairwise ID: 81.94%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** * * ** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGAC--ACTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTT--GTGAC--TCTAGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCC-CGGGCTCGCTATGTGCC--TTTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * * * ***** ** ** * * ** * ** *** ***** * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ****** * * ** * *** * ** ** * * * ** * * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAAC-GGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC *** ****** ******** ** ******* * * *** * * * **** * * ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT ** * ** ************
Mean pairwise ID: 82.46%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** ******* **** ******** * ** ****** *** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** *** *** ** ** * *** **** ******* ********* ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ***** * ** * * ******* *** * * * * *** ** ***** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ** ***** ******* ******************* **** ** ********** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA * *** * * * ** * ********* * ***** ** * * * ** **** ARA.TH_A CCATTTT ARA.TH_E CCATTTT ARA.TH_D CCACTTT ARA.TH_G CCATTTT *** ***
Mean pairwise ID: 82.49%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************ *** ** * *** * ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** *** ******* * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA * * * **** * * *** ** ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_H CCTTTT LYC.ES_J CCTTT- LYC.ES_B CTTTT- LYC.ES_C CATTT- * ***
Mean pairwise ID: 83.03%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ************************************************** * * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCC-CGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCA * * * * *** *** *** ** *** * * * *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG *********** * * ** ** *** * ** *** ** ***** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG ******* ***** ****** ********************* *** ** ******* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA-ACCTCACTAA-GC ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCTCTTA-GC ZEA.MA_E GGAGGATAAC-GGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA-GCCTCACTAA-GC ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC * ******** *** ***** * ** ** * *** * ** * ** ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_B AAACCACCATCTTT ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 84.71%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-GCTACT-TGGAGGCTTGGGCTGTCGGAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ****** * ****** ******* *** ****** ******* * * * **** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ******** *************** * * ***** *** **** ***** ***** FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG *** *** ******** * ****** ** ******** ** ********** FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG *** ******************* *********** * ******* * ****** *** FUG.RUB. ATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- HOM.SA_A ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ******** ******** * ** * * **** **** **** *** * ** FUG.RUB. - XEN.LAE. - HOM.SA_A T GAL.GAL. -