There are 2083 alignments in the test set.
Mean pairwise ID: 29.18%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** * * * *** ** * ** CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATG--CGAAAGTTGGGC--CTCACGGTCCATAATGTGGCA ** * * **** * ** *** *** * * *** ***** * * CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG * * * * * * * ***** * ** **** * **** * CAE.EL_B GACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCAC ** ** * ** * * * * * * ** * ** * ** CAE.EL_B TTTTT TRI.AE_C CATC- *
Mean pairwise ID: 29.84%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** * * * *** ** * ** CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATG--CGAAAGTTGGGC--CTCACGGTCCATAATGTGGCA ** * * **** * ** *** *** * * *** ***** * * CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG * * * * * * * ***** * ** **** * **** * CAE.EL_C GACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACC-A ** * ** * ** * * * * * * ** * ** * ** CAE.EL_C TCACT TRI.AE_C CCATC **
Mean pairwise ID: 30.42%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA * ** * * *** * ** GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGT-GAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGG * * * * * * * ** * * * * ** * * * *** * ** GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** GAL.GAL. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTC TRI.AE_C AGGATAACGG--GCCGCTG--CACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG **** ** * * **** * * ** ***** * **** ** * GAL.GAL. TCC------ TRI.AE_C ACCACCATC **
Mean pairwise ID: 31.05%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** * * * *** ** * ** CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGC---CTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGG-TCCATAATGTGGCA * * * **** ** * *** * * ** *** * ***** * * * CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG * * * * * * * ***** * ** * **** * * **** * CAE.EL_D GAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAG--CGACCA ** ** ** * * * * **** * * ** *** * * CAE.EL_D TCATTT TRI.AE_C CCATC- ***
Mean pairwise ID: 31.13%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** * * * *** * * * DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGAT TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT---TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * * * **** * *** *** *** *** * * *** * ** * DRO.MEL. GAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * **** * *** ** * ****** * * * **** * ** * ** DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTA-TCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCT TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCA *** ** *** * * * * * ** * * * ** * * DRO.MEL. TT TRI.AE_C TC *
Mean pairwise ID: 31.37%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGT-CCGTGCCAAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** * * * *** ** * ** CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGC---CTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGG-TCCATAATGTGGCA * * * **** ** * *** * * ** *** * ***** * * * CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG * * * * * * * ***** * ** * **** * * **** * CAE.EL_A GAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAG--CGACCA ** ** ** ** * * * **** * * ** *** * * CAE.EL_A TCATTT TRI.AE_C CCATC- ***
Mean pairwise ID: 31.80%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * * * ** *** * *** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG ** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * ** ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** * ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTG TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA **** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * ORI.CUN. TCTCC TRI.AE_C CCATC * *
Mean pairwise ID: 31.91%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT * * * ** *** * ***** XEN.LAE. CGGTATCAATATGGT--GTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGT--CCATAATGTGGC *** * * * *** * ** * ** * * *** * *** * ** XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA * **** *** ** ** ****** ** **** * * * ** * XEN.LAE. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCAC **** ** *** ** * * * * **** * * ** ** XEN.LAE. TCT- TRI.AE_C CATC *
Mean pairwise ID: 31.94%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT LYC.ES_D -----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ** ** * *** FUG.RUB. TCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGCGGG * * * * * * ** * * * *** * * ***** * *** FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** * FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGAC LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAAC **** * * * *** * * * *** * ** ** * * * * ** FUG.RUB. TCAGTCTTT- LYC.ES_D CACCACTTTT ****
Mean pairwise ID: 32.03%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG LYC.ES_D -----------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAG ** * * ** * *** * ** * * * * LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC LYC.ES_D GCCCAAATGAAA--------ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG--GACCGCA ** ** * * * * ** * ** * * * * ** LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTCA LYC.ES_D TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCT--GTGCAGTGGAAGGATAATG * ** ** * * ** ** * ** *** * * * ** **** LEP.COL. GGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG-AACCACACCGCGGA LYC.ES_D GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG--GTTGCTCCAACTAAACCACCAC ** *** * * ** * *** * ***** *** * *** * LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT LYC.ES_D TTTT------------------------------------- *
Mean pairwise ID: 32.03%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * * * ** *** * *** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCC-TCACGGTCCATAATGTGG ** * * * * * * * ** * ** ** ** * * * *** * ** RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** * RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCG TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCG-TAGCCTACTCCAGCGACC **** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * * RAT.RAT. TCTCTT TRI.AE_C ACCATC * *
Mean pairwise ID: 32.03%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * * * ** *** * *** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCC-TCACGGTCCATAATGTGG ** * * * * * * * ** * ** ** ** * * * *** * ** HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** * HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCG TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCT-CGTAGCCTACTCCAGCGACC **** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * * HOM.SA_A TCTCTT TRI.AE_C ACCATC * *
Mean pairwise ID: 32.26%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT TRI.AE_C ---------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGT * * * ** **** * **** FUG.RUB. TCGGTATCGA----TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG TRI.AE_C TGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCAC--GGTC-CATAATGTG * *** * *** ** ** * ** ** **** **** * *** * * FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG * ** *** *** ** ** ***** ** **** * * ** * FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGT TRI.AE_C AAGGATAACGG--GCCGCTGCACTCC-TAGGCCG-CTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC **** ** * * ** * *** * * ** * * *** *** FUG.RUB. CTTT------ TRI.AE_C GACCACCATC
Mean pairwise ID: 32.35%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCG--TCCGTGCCAA TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA ** * * * *** * * CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCT---ATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGGC * ** *** **** ** * *** * *** ** *** * ***** * * CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA **** ** *** * * ***** * ** **** * **** CAE.BRI. GGATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTT TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAG--CGACC ***** ** * ** * * * ***** * ** *** * CAE.BRI. GTCATT TRI.AE_C ACCATC ***
Mean pairwise ID: 32.47%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * * * ** *** * *** RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG ** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * ** RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** * RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGG----CAACATAGCGAGAC TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA **** ** *** ** * * * * ** **** * * ***** RAT.NOR. CCGTCTCT TRI.AE_C CCATC--- ** **
Mean pairwise ID: 32.47%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_D ----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCC--TGTCCAAGCACAGA * ** * * ** **** ** ** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC * **** *** ** *** * * * * * *** * * * CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * ***** ** *** **** ********* ** CAE.EL_D AC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA * * * ** ** ** * * **** * * * ** ** * * CAE.EL_D TCATTT-- LYC.ES_D CCACTTTT ** **
Mean pairwise ID: 32.68%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * * * ** *** * *** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG ** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * ** CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** * CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAG-CGAGACCCC TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCT-CGTAGCCTACTCCAGCGACC **** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * ** ** CAN.SPE. GTCTCT TRI.AE_C ACCATC *
Mean pairwise ID: 32.74%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG TRI.AE_C ---------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGT--GG ** * ** * * * *** ** ** LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC TRI.AE_C ACC-GCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTG---GGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACC *** ** * *** **** * ** * * **** * * ** LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTT-GCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC TRI.AE_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAAC * * ** *** **** * * * * * ** * * **** * LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGGA TRI.AE_C GGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGAC-CACCATC-- ***** ** ** * * * * *** * * *** * **** LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT TRI.AE_C -----------------------------------------
Mean pairwise ID: 32.79%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_D ----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCC--TGTCCAAGCACAGA * ** * * ** **** ** ** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC * **** *** ** *** * * * * * *** * * * CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * ***** ** *** **** ********* ** CAE.EL_A AC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA * * * *** ** ** * * **** * * * ** ** * * CAE.EL_A TCATTT-- LYC.ES_D CCACTTTT ** **
Mean pairwise ID: 32.79%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC LYC.ES_D -----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * ** * ** * **** DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGAT LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC * * * * * ** *** *** * * **** * *** DRO.MEL. GAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** * ** DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT-ATCA--GCCCAACCGATA----TGGTTGGACCA LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA *** * *** ** * *** * * *** ** * * * **** DRO.MEL. CAATCTTT LYC.ES_D CCACTTTT * * ***
Mean pairwise ID: 33.01%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT LYC.ES_D ----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA * * * ** ** * *** XEN.LAE. CGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGCGGGG * * * ** * * ** * * ** * * ** **** * **** XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** * * XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCG-GTGCAGAACAGCCTGAACAACA----CAGCGAGAC- LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC *** * * * *** * * ** *** * **** * ** * * ** XEN.LAE. ACAGTTCT- LYC.ES_D ACCACTTTT ** * *
Mean pairwise ID: 33.01%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * *** ** *** * *** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTC-CATAATGTGG ** * * * * * * * ** * ** ** * *** * *** * ** HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_C CAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * **** *** ** ** ****** ** **** * * ** * HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAG-CGAGACCCC TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTC-GTAGCCTACTCCAGCGACC **** ** *** ** * * * * ** **** * * * ** * ** ** HOM.SA_B GTCTCT TRI.AE_C ACCATC *
Mean pairwise ID: 33.12%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAGC * * ** * ** ****** CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* ** CAE.EL_C ACAGCGCTT--GTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA * * * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * CAE.EL_C TCACT--- LYC.ES_D CCACTTTT ****
Mean pairwise ID: 33.12%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGT-CCGCGCTAA LYC.ES_D --------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * *** * ** * * GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG-GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_D AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG ** * * ** *** *** ** * * * * * * ***** * ** GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC LYC.ES_D GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ** * **** *** ** ** ****** * * ****** * * **** GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCAGCGTAGCCT----GGGCAACATAGCGAGA LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA **** * * * *** * ** * *** **** ** * * * * GAL.GAL. CCCTGTCTCC- LYC.ES_D CCACCACTTTT ** **
Mean pairwise ID: 33.45%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGC TRI.AE_C -----------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCT * * *** * * * * ** ** ** * LEI.MAJ. TTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGGCC TRI.AE_C TGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCT * * ** *** * * *** * ** * * ** **** ** **** LEI.MAJ. GGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA-GAATCACACCGCGGAGC TRI.AE_C GGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGC ** ** ******* * * * * *** ** ** * * ** ** ** ** LEI.MAJ. ATGTCCG---CACTTGAGCCCCAC-GCTTCGTCGCGAAGCCTT---- TRI.AE_C ACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC * * * **** *** * ** * ** * **
Mean pairwise ID: 33.59%
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCA-ATAGTGCATGTTCGGTGGTCTC LYC.ES_D -------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCC * ** * * * * * ** * * * ** * * * SCH.POM. GGGTTCGAGTCTCGCTTTC--GATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTT LYC.ES_D AAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCA * * * * * *** *** *** * * * * * * ** * * SCH.POM. CGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCAC LYC.ES_D CAGAGCAGTGAACAGCTC--CCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT--AATGGGTCGGTGTC-T * *** *** * *** ** * * * *** * ** * ** SCH.POM. TACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAG LYC.ES_D TATCAAG--TTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT------- ** * * ** * * ** * * * * ** ** * * SCH.POM. TATAAACACAACGGTCGTT LYC.ES_D -------------------
Mean pairwise ID: 33.70%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC TRI.AE_C -------------------------------------------GGTGGTCTGCCCG--TT ** ** * ** * YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT TRI.AE_C CCAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGG-----------GGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCA * * * * * * ** **** * * **** * ***** ** YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA TRI.AE_C CGGTCC--ATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGC ***** **** * * * * ** ** * * * * ** * YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT TRI.AE_C CCGCTTC--CAACGGTGGAAGGATAACGGGC----CGCTGCACTCCTAGGCCGCT--TGG * * * ** * * * *** ** ** ** * * * * YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT TRI.AE_C GCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC * * * * *** *** **
Mean pairwise ID: 34.08%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_D -----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ** ****** CAE.BRI. GCTGCGTCG--CCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAGCGGG * * ** * ** * * * * * ** *** * * * * *** * * * CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ** *** * * ***** ** *** **** * ********* CAE.BRI. GGATAGCGCTT--GTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCAC LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA ***** * * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** * CAE.BRI. TTGTCATT--- LYC.ES_D CCACCACTTTT ** *
Mean pairwise ID: 34.19%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_D ------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG * *** ** ** * *** HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG LYC.ES_D CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCGGG * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * *** HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGAC LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAAC **** * * * *** * ** * ** * **** * * * * ** HOM.SA_B CCCGTCTCT- LYC.ES_D CACCACTTTT * * ** *
Mean pairwise ID: 34.29%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG TRI.AE_C -----------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA-GTAGTG ** * * **** * * ** ** ** TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGG----TG TRI.AE_C GACCGCTTGGGGCCTA--TGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCG *** **** **** * ** * * * * *** * * * TRY.BR_A T-TGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCG-TTAAAGTGGGGGGAACGGGTCA TRI.AE_C CGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACG ***** * * **** *** * *** ** * ** ** * * TRY.BR_A GGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTT-CCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAG TRI.AE_C GGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGAC-CACCATC--- ***** ** ** ** * * * * *** ** ** ** * **** TRY.BR_A CATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG TRI.AE_C ----------------------------------------
Mean pairwise ID: 34.30%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAGC * * ** * ** ****** CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* ** CAE.EL_B AC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG----ACCA LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA * ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** **** CAE.EL_B CTTGTTTTT LYC.ES_D CCACTTTT- * ****
Mean pairwise ID: 34.68%
COL.BLU. CCGAACCTCATTACCTTGGCCTGTTACCCCA---AGTTGGGGGTCTTTAA-GGTTATTTG MUS.MU_A ------------------GCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGATC ****** *** * * *** * ** * * * COL.BLU. ATKTTKGGCCTATGCTACCKGCCKGGCTCTGGTCCTGCTTATTCTGGCCCGCCCGTTCCA MUS.MU_A GCTTGAGTCCAAGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG---TGTCCGCACTA * * ** * * * * * * * *** ** * * *** * * COL.BLU. AGCCGGGAGTTGGCCCATGTGGTTTATGCGAAGGTATAGGCTTCGGTGGTTCC MUS.MU_A AGTTCGGCAACAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAAGTTGC- ** ** *** * * ** * * * * * *
Mean pairwise ID: 34.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * *** * ** **** ** RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG * * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * **** RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * * RAT.NOR. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGACCC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC *** * * * *** * ** * ** * **** *** * * ** RAT.NOR. GTCTCT--- LYC.ES_D ACCACTTTT * **
Mean pairwise ID: 35.14%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG LYC.ES_D ------------TAGTTCTG--GCCTGCCCTGTCCAAGCACA--GAGTAGGATCACGAGG * * **** *** * * * * * * ** ** * * TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA LYC.ES_D CCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC-CGCAT-GAGGCTGG *** * * * **** * * * ** ** * * * ** TRY.BR_B GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG LYC.ES_D CTTCAC-AGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGAAGGATAA---TGGGTCGG ** * * * ** ** * ** *** * ** ***** *** ** *** TRY.BR_B TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA LYC.ES_D TGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG-GTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT--- ** * * ** * *** * ***** * * * * * * * TRY.BR_B GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT LYC.ES_D ------------------------------------
Mean pairwise ID: 35.18%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A * * *** * *** ****** ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG * *** ** * ** *** **** * * * * * ****** ** * ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ************** ******* ** * * ***** ** ********* ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT------------------------------- LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCAC ***** **** * * *** * * ** * ZEA.MA_H ------- LYC.ES_D CACTTTT
Mean pairwise ID: 35.23%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT LYC.ES_D ------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGG- * * * ***** ***** ** **** * TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-GAACCGCCTC LYC.ES_D ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATG ** * ** * * * * * * * * *** * * * ***** * TET.ROS. AGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT LYC.ES_D AGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTC ******** ***** *** *** * * ***** ** ************ TET.ROS. CATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGAC-ACT------ LYC.ES_D GGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT * * ***** * * * * * ** * * ** **
Mean pairwise ID: 35.28%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * *** * ** **** ** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG * * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * **** CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * * CAN.SPE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GTGCAACATAGCGAGACC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC *** * * * *** * ** * ** * **** * * * * *** CAN.SPE. CCGTCTCT- LYC.ES_D ACCACTTTT * ** *
Mean pairwise ID: 35.53%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG LYC.ES_D ------------TAGTTCTG--GCCTGCCCTGTCCAAGCACA--GAGTAGGATCACGAGG * * **** *** * * * * * * ** ** * * TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA LYC.ES_D CCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC-CGCATGAG-GCTGG *** * * * **** * * * ** ** * * * ** TRY.BR_A GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG LYC.ES_D CTTCAC-AGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGAAGGAT---AATGGGTCGG ** * * * ** ** * ** *** * ** ***** *** ** *** TRY.BR_A TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA LYC.ES_D TGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC----ACCACTTTT ** * * ** * *** * * * ** * *** * ** * TRY.BR_A GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG LYC.ES_D ---------------------------------
Mean pairwise ID: 35.60%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA-CACT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * ** **** *** * ARA.TH_G GGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGT-GCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCT * **** ** * ** * ** * * *** * * * ** * * ARA.TH_G TGAGTGAAC-CGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG ** * *** ** * *** * ** ** * ** * * ** * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCG--GGTCTTGGGCAGTGCGATAG ** * *** *** ** * ** * ****** * * ****** ARA.TH_G CAACGG--TTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCGCA-GGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT----- * * ** *** * * ** ** * * * * ** * ARA.TH_G CACCATTTT SCH.POM. ---------
Mean pairwise ID: 35.60%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * *** * ** **** ** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG * * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * **** HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * * HOM.SA_A GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GTGCAACATAGCGAGACC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC *** * * * *** * ** * ** * **** * * * * *** HOM.SA_A CCGTCTCTT LYC.ES_D ACCACTTTT * ** **
Mean pairwise ID: 35.76%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCT--GCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT TRI.AE_C --------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCT--T ** * ** **** * * ** * * ** * * TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCC TRI.AE_C GGGGCCTATGCGAAAGTTGGGC-CTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCT * ** * * ** *** ** ** ** * * * ** * ** ** **** TRY.BR_B GG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA- TRI.AE_C GGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTG ** * ** ******* *** * * **** * **** * * ** * ** TRY.BR_B ---TCTCAGGAC-TTTGCGCCCCA-AGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- TRI.AE_C CACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC ** *** * *** *** * ** * ** * * *
Mean pairwise ID: 35.76%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT *** **** *** * * CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * * ** * * ** * * * * *** * * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** * * * * * * ** * ** ** * * ** * ** ** * * CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGG-------AAACAATGCACATCACTACCGG--GTCTTGGGCAGTGC * * *** *** * * * * * * ***** * ** ** ** CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCAT SCH.POM. GATAG--CGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT * * ** * * * * ** * * ** *** **** ** * * CIN.HYB. TT SCH.POM. T- *
Mean pairwise ID: 35.77%
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCG TRI.AE_C -----------GGTGGTCTGCCCGTTC--CAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCT-A ***** *** * * ***** * * ** ** SCH.POM. GGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGT TRI.AE_C TGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCA-GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCAC * *** ** * ** ** ** ** * * ** * * **** SCH.POM. GGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGA-AACAATGCACATCACTA TRI.AE_C AG--AGCAGCGAC--AACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACTC * * ** *** * * ** * ** ** *** *** * * **** SCH.POM. CCGGGTC--TTGGGCAGTGCGATA-GCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAA TRI.AE_C CTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC----------------- * ** * ****** * * * **** ** SCH.POM. GTATAAACACAACGGTCGTT TRI.AE_C --------------------
Mean pairwise ID: 35.92%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG YAR.LI_B ----AGC--TGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG *** ***** * * **** * ***** *** * ** ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTC--TGGACTGCCCAATCCAAGCT YAR.LI_B TGC--GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG * * * *** * *** ** * ** ** ** * ** ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGA--AGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG ** ** * * * ** * * ***** * ** * * * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG YAR.LI_B GATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT-----ATGGCGGTGG * ** * * * * ***** * * ** * * ** * ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC YAR.LI_B GATAGCAA--CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------ ** * * * * * * * * * *** ** ** * * ARA.TH_G CACCATTTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 35.92%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_D -----------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * *** * ** **** ** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG LYC.ES_D T--AGGATCA---CGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-CTTCTTGATT-CCTAAAGCGGGG * * **** * * ** * * *** * * * ** ***** * **** RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * * RAT.RAT. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GGGCAACATAGCGAGACC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC *** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * *** RAT.RAT. CCGTCTCTT LYC.ES_D ACCACTTTT * ** **
Mean pairwise ID: 35.93%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG LYC.ES_D ------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTG--TCCA * ** * * * * ** YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG LYC.ES_D AGCACAGAGTAGGATCAC---GAGGCCCAAATGAAAATATG-GGCTTCTTGATTCCTAAA * * * ** ** * * ** ** * ** ** * * * ** YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA LYC.ES_D GCGGGGCGGACCGCAT-GAGGCTGGC-TTCACAGAGCAGT--GAACAGCTC--CCGCTCT * * * * ** * *** * * *** *** * * * * ** * * YAR.LI_B ATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATG LYC.ES_D GTGCAGTGGAAGGATAATGG--GTCGGTGTCTTATCAAGTT--CAGTAACGCCTAATGGG * *** ** * * * ** *** * * * ** ** * ** * YAR.LI_B TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC LYC.ES_D TTGCTCCAACTA-----AACCACCACTTTT ** * ** ** *** *** *
Mean pairwise ID: 36.10%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC LYC.ES_D ----TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCA-CGAGGCCCAAATGAA- ** **** *** * * * * * *** * * ** ** * ** * LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT LYC.ES_D -AATATGGGCTTCTTGATTC-CTAAAGCGGGGCG------GACCGCATG--AGGCTGGCT * *** *** * * * * * ** ** * * * ** * ***** LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAG-GCC LYC.ES_D T--CACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG-AAGGATAATGGGTCGGTGTC * * * **** * ** * * * * * * *** * ***** * * * LEI.MAJ. GGAAACGGAGCAGCC-CACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCAT LYC.ES_D TTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT-------- * * *** * ** * * * * * * * *** LEI.MAJ. GTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT LYC.ES_D -------------------------------------
Mean pairwise ID: 36.30%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCT---GTC * * ** *** * *** YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT LYC.ES_D C-AAGCACAGAGTAGGATCACGAGG---CCCAAATGAAAATATG-GGCTTCTTGATTCCT ** * * * ** ** ** ** * ** ** * * * ** YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA LYC.ES_D AAAGCGGGGCGGACCGCAT-GAGGCTGGC-TTCACAGAGCAG-TGAACAGCTCCCGC--- * * * * ** * *** * * *** *** * ** * ** * * YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT LYC.ES_D TCTGTGCAGTGGAAGGATAATGG--GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA--AT * * *** ** * * * ** *** * * ** * * * ** YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT LYC.ES_D GGGTTGCTCCAACTA--AACCACCACTTTT *** * ** ** * *** **
Mean pairwise ID: 36.33%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC * * ** * * *** * * * ** ZEA.MA_D TTGCGATG---GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG--C ** * * *** * **** *** ** ** * * * * * * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT SCH.POM. CACGTCTGT----TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACT---GGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** ** * * * ** * ** * ** * * * * * ** *** ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT SCH.POM. ACCG---ATGG----AGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGT * **** *** *** *** *** ****** * * * * ** ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG SCH.POM. GCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT * ** * ** * * * * * * * * * ** * ZEA.MA_D ACCACCATCTT SCH.POM. T----------
Mean pairwise ID: 36.36%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAA--GTG * *** **** *** *** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGAT--GCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC SCH.POM. -TTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCC ** * * * * * * * ** * * * * * *** * * ** * * ARA.TH_D TGTGAGTAATC-TGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG SCH.POM. CTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGT ** * ** ** * * * ** *** * * * ** ** ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCGGG-TCTTG-GGCAGTGCGAT *** * **** *** ** * ** * ***** **** ****** ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC SCH.POM. AGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT---- ** * * ** *** **** * * * ** * ARA.TH_D ACCACTTT SCH.POM. --------
Mean pairwise ID: 36.49%
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTA-GTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTC ** * ** * ** * ** ** ** * ** * *** * * TET.THE. GGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTG SCH.POM. GGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCG------ATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAG ** * *** * * ** * * * **** ** * * **** * TET.THE. CTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCCT SCH.POM. TCTTCGTGGCAAC-TGGCAGTTAAACCGTGT---AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATG * **** *** * * * * ** * * * * ****** TET.THE. CAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG-ATAACATACT SCH.POM. CACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTG ** * * * * ** * * * * * * ** TET.THE. CATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT SCH.POM. CATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT------------------ *** * **** * **** *
Mean pairwise ID: 36.49%
LEP.COL. ----------GCCGGAGCCTTG--CTCTGTAACCTTCGGG---GGCTTTCACCAGCTGAA LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG ** ** *** ** *** *** * *** * * * * * LEP.COL. CAGGGAGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGC LYC.ES_L CATGGAG----TTGGATCA-CGTGGCTTAGTCGAAAGACC--TGGGTTGCT-TGATTCCT ** **** **** ** * * * * * * * * **** ** ** LEP.COL. TGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAA-G LYC.ES_L AAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTG *** * * * * * ** ** ** ** * * **** * * LEP.COL. TAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA LYC.ES_L CAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTC ** **** * ** * * ** *** * *** * ** * LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT LYC.ES_L CAACTAAACCACCACTTT-------------------------------------- *** * *** *
Mean pairwise ID: 36.65%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGAT-G YAR.LI_A -----------------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG * * * * ** * * *** * ** * ORY.SA_B CCTGGTCGTT-TGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTC YAR.LI_A TCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-GCCATTTGGTT-GTCCTTTC ** * *** **** * * * ** ** *** * ** ** * ** *** ORY.SA_B CAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGC---GCCTGGGCGAA-GGCTCGAGCGTCCCTGCACCT YAR.LI_A CGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTA * * ** * * ** * * * * *** * * **** * * * * ORY.SA_B AGAGTGGC--GGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCC YAR.LI_A AGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG--TGGGTAT *** * * ** * * * * * ***** * * *** * * ORY.SA_B AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCA-GCCCTGGCC--CGCTTCCGGCCCAAGTGCCT YAR.LI_A GGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--- ****** * *** * * * * *** ** ** * * ORY.SA_B TCCATGGCAGACCACCACCTTT YAR.LI_A ----------------------
Mean pairwise ID: 36.69%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG SCH.POM. -------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGT--CGAAGTGTTT * * *** *** * * * ** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCG * ***** * * * ***** ** * * * ** ** * * LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA SCH.POM. ATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTA * ** * * ** ** ** * * * * * * * **** * * * * LYC.ES_E CCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA SCH.POM. CCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA---CCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCG ** ** *** *** ** * ** * * * *** ****** * LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC--CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC SCH.POM. ATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAA-ACACAACGGTCGTT------- * ** * * ** * * *** * * * * * * *** LYC.ES_E CACATTTT SCH.POM. --------
Mean pairwise ID: 36.76%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCC--GTTCCA ** ** * * **** YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG TRI.AE_C AGTTGAGTAGTGGACCGCTTGG-----------GGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGG * * * *** * *** * * * **** * ***** ** *** YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA TRI.AE_C TCCA--TAAT-----GTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCT------TCACAGAGCAGCG ** **** ** * * * ** * ** *** * *** YAR.LI_B ATC-CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATA-GCAACAAAGTGGTATA TRI.AE_C ACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG-ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG * * ** **** * * ** ** *** * * * * * * * * YAR.LI_B TGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC TRI.AE_C GGCCTCGTAGCCTACTC-CAGCGACCACCATC * * * ** * ** ** ** **
Mean pairwise ID: 36.82%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC LYC.ES_M ---------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCC * **** * *** * * ** * LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT LYC.ES_M CAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGAT *** * * *** ** * * * * ** * ** * * * *** * LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG----TTGAAGCGAGG-GAACCGGGTCA LYC.ES_M CACGAGGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGA * * ** * * *** * * *** * ** * **** * * LEI.MAJ. GGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATCACACCGCG LYC.ES_M GGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCG *** ** ** ****** ** * * * * ** ** * ** ** * ** LEI.MAJ. GAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--------- LYC.ES_M GTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT * * * * * *** * * * * * *
Mean pairwise ID: 36.86%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC * * ** * * *** * * * ** ZEA.MA_E TTGCGATG---GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG--C ** * * *** * **** *** ** ** * * * * * * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT SCH.POM. CACGTCTGT----TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACT---GGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** ** * * * ** * ** * ** * * * * * ** *** ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT SCH.POM. ACCG---ATGG----AGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGT * **** *** *** *** *** ****** * ** * * ** ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG SCH.POM. GCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT * ** * *** * * * * * * * * * ** * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT SCH.POM. T-----------
Mean pairwise ID: 37.06%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTG--GTCGAAGTGTTTAGTACTCC-CAATAGTGCATGT * * ******* * ** * * * ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA SCH.POM. TCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCC-CTCGATCTGCCACGTCTGTTCGA *** ** * * ** * **** *** * * * * * ** * * ** * **** * ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG SCH.POM. AG---AGTAGTCTTCGTG--GCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCG-ATGGAGGTTG ** **** * *** ** **** * ** * * * * ** ** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACA-GAGCAGCGAG-TACCGCCCGCTTCCAACGGT SCH.POM. G-AAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTC * * *** ** * * **** * * ** ** * * ** * ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA SCH.POM. GCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT----------------------- * * * * * * * * * * * ORY.SA_B GACCACCACCTTT SCH.POM. -------------
Mean pairwise ID: 37.10%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGG--TGGGACAC SCH.POM. ---------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAA * * **** *** * ARA.TH_F TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGAT--GTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA SCH.POM. GTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGAT *** ** * * ** * ** * **** * * * *** * * ** * ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGC--TTGCAGGTTCTAGAGTCGG SCH.POM. CCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGT * ** * ** ** * ** *** * * ** * * ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA SCH.POM. GTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTAC--CGGGTCTTGGGCAGTGCG *** * **** *** ** * ** * ***** * * * ****** ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA SCH.POM. ATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGG-----AAGTATAAACACA-----A * ** * * *** * **** ** * * ** * ARA.TH_F CCACCATTTT SCH.POM. CGGTCGTT-- * * **
Mean pairwise ID: 37.10%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGG--TGGGACAC SCH.POM. ---------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAA * * **** *** * ARA.TH_A TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGAT--GTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA SCH.POM. GTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGAT *** ** * * ** * ** * **** * * * *** * * ** * ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG SCH.POM. CCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGT * ** * ** ** * ** *** * * ** * * ** ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA SCH.POM. GTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTAC--CGGGTCTTGGGCAGTGCG *** * **** *** ** * ** * ***** * * * ****** ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA SCH.POM. ATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGA-----AGTATAAACACA-----A * ** * * *** * **** ** * * ** * ARA.TH_A CCACCATTTT SCH.POM. CGGTCGTT-- * * **
Mean pairwise ID: 37.22%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT ****** * * * **** **** * * * HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAG-CTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG * * * * * ** ** * * * * ** *** * *** * HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAA-GGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT *** * ***** * *** * * **** * * *** * * HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG YAR.LI_B GGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG * ** * * ** *** * ***** ** * * * * ** ** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------- *** * *** ** ** ** * ****** HUM.LU_D ATTTCTTTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 37.22%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_D -------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGT-CCAAGC--ACAGAGTAGGATCACGAGG ******** *** * ** * * ** * * ** *** * * ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG LYC.ES_D CCCAA-ATGAAAATATGGGCTTCTTGA-------------------TTCCTAAAGCGGGG * ** ** ** * * ** * * ***** * **** ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG LYC.ES_D CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * * ORI.CUN. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT----GGGCAACATAGCGAGACC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC *** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * *** ORI.CUN. CTGTCTCC- LYC.ES_D ACCACTTTT **
Mean pairwise ID: 37.25%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT **** * ** * ** * ** * CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCT--GGACTCTGC--ACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT ** * **** ** ** ** * * **** * ** * CAE.BRI. GCTGCG-TCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGC-----GGTCCCGGGCGCATAAGG YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT ***** * * ** ***** * * *** * * * * * * CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTGG YAR.LI_B AACTGGG-ATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG * * * * **** * * ** ****** * ** *** * *** * ** CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTT YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----- ******* * * * * * * * * * ** * * * CAE.BRI. GTCATT YAR.LI_B ------
Mean pairwise ID: 37.28%
YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGG--CAATAAGGTAGTGTGGATG * * * ** * * * *** ** * * **** * YAR.LI_B CGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT * ** *** ** * ** * ** * * * * * * * * YAR.LI_B -GCGTCTCGG--TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC-TGG--GA ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGA **** ** * * * * ** *** * * * ** * *** *** ** YAR.LI_B TACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA--TGGCGGTGGGATAG ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * * * * **** * * *** * ******* * YAR.LI_B CAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTA--TGCTATAGGCCCAAT----------------- ** * * ** ** *** * **
Mean pairwise ID: 37.28%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTC---GAAGTGTTTAG *** * * ** * ** *** * * LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC SCH.POM. TACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT * * * **** ** ** * * ** * * *** * ** * LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGC---GCGCCCCCT--CCGTTAAAGTA-GAGGAACT SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACC * * * * *** * * * * * ** * ****** * * ** LEP.COL. GGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACC SCH.POM. GATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGG * *** ** *** *** *** * * * * ** ** * * * * LEP.COL. GCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAG-GCGATCCTGTGAAGCTTT SCH.POM. ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT * * * ** * *** ** * * * **
Mean pairwise ID: 37.33%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC LYC.ES_D -------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGG * * * ***** ***** ** **** * TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCC LYC.ES_D -ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG-GGCGGACCGCA ** * ** * * * * * * * * ***** * * * *** TET.THE. TCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATA LYC.ES_D TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGG * ******** ***** *** *** * * ***** ** ************ TET.THE. CTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAG-ACATT- LYC.ES_D TCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT * * **** ***** **** * * * ** *** ** **
Mean pairwise ID: 37.37%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC-----AATGA TRI.AE_C -----------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGG ** ****** ***** * ** TET.THE. GTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAAC TRI.AE_C ACCGCT-TGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCAC--GGTCCATAATGTGGCA-GGCACC *** *** * * * * ** * *** ** * *** * * * ** * * TET.THE. GCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAAC TRI.AE_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAAC ** * ******** ***** *** ** **** ****** ************** TET.THE. ATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA-TCAAAGCCAGACATT------ TRI.AE_C GGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC * * *** * * * ** ** ** * * **** *
Mean pairwise ID: 37.41%
LEI.MAJ. ----GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC--CAGGCTTAGCGGGGAGGAC YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC ** * * * *** * * * * * * *** * * LEI.MAJ. GTGGACCA---GCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTG-TGTGT YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT *** * * ** ** * ** * * * ** * *** * ** * LEI.MAJ. CGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCG YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGAT-----TTCCGTTCTAAGATTAA--CTGGGAAACTT **** ** * * * * *** * * ** ** * * ** *** LEI.MAJ. GGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACA-CC YAR.LI_A CAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCG--GTGGGATCGCAACC * * * ** *** ** ** * ** * * *** ** ** LEI.MAJ. GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT YAR.LI_A AAGTGGTATATGT---TATGGAAGATATTTACGATCACGATT---- * * ** * ** * ** ***
Mean pairwise ID: 37.46%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT *** * ** * ** * ** * CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG----GCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT ** * * **** *** * ** * **** * ** * CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGG-----TGCATAAGGA YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAG--TAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA ***** *** * * *** ** * ** * * * * * ** CAE.EL_B GTGGT--GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTG YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG * **** ***** * ** ****** * ** *** * *** * * CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACT YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---- * *** ** * * * *** * * ** **** * * * CAE.EL_B TGTTTTT YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 37.50%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC * * ** * * *** * * * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGT--GGTCTCGGGTTCGAGTC---TCGCTTTCGATCCCTCGATC ** * * ** * *** *** * * * ** * * * * ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG-GCA SCH.POM. TGCCACGTCTGTTCGAAG------AGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA * * * *** **** **** * * * ** * * ** * * * * ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAA-CGGTGGAA SCH.POM. GTACCGATG-GAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA * * ** * **** ** *** *** ****** **** * ** * *** * ZEA.MA_C GGATAACAGG--CCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG SCH.POM. TAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT--- * ** *** *** * * * * * ** ** * * ZEA.MA_C ACCACCATTTTT SCH.POM. ------------
Mean pairwise ID: 37.62%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG SCH.POM. -------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGT--CGAAGTGTTT * * *** *** * * * ** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCG * ***** * * * ***** ** * * * ** ** * * * LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC SCH.POM. ATCTG--CCACGT----CTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCA---GTTAAAC * ** ** ** * ** **** * * ** * * ** * * ** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA SCH.POM. CGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAG-TGC ** ** * * * * *** * ** ** * * *** * * LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC SCH.POM. GATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATG--TGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT * ** ** * ** *** *** ** ** * ** *** * LYC.ES_O TTT SCH.POM. T-- *
Mean pairwise ID: 37.70%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAA-TGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * * * **** *** **** LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** * * * ***** ** * * * ** ** * * LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA SCH.POM. GATCTG--CCACGT----CTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGG---CAGTTAAA ** ** ** ** * ** **** * * ** * * ** * * * LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA SCH.POM. CCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAG-TG *** ** * * * * *** * ** ** * * *** * * LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA SCH.POM. CGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATG--TGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCG * ** ** * ** *** *** ** ** * ** *** * LYC.ES_G CTTTT SCH.POM. TT--- *
Mean pairwise ID: 37.86%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGCCTTCTTGTTGTGC-- ** *** ** * * * **** * ** * ** * ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG YAR.LI_B GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTG----GGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG ***** * ** * ** * *** ** * ** ** ** ** ** * ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG--AG YAR.LI_B TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * * ** * * **** * * * ** ****** * * ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG YAR.LI_B GATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCGGTGGGAT * ** * * * ***** * * * * * ** ** **** ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAAC YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGACTCTC-------- ** * * * * * *** *** *** **** ARA.TH_A CACCATTTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 37.99%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT *** * ** * ** * ** ** CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCA----CTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT ** * * ***** ** * * ** * * * **** * ** * CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAGG YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT ** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * * CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTGG YAR.LI_A AACTG-GGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG * * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** * ** CAE.EL_A CCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCACT YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------- *** *** * * * ** ** **** ** * CAE.EL_A TATCATTT YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 38.04%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGG-GGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT LYC.ES_L -GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTAT--AGTCTGGCCTGCCCTCTCC * ** * ** ***** **** ** * * ** * * TRY.BR_A GGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGT LYC.ES_L AAGCATGGAGTTGGATCACGTGGC-TTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAG ** * * ** * ** ** ** * *** * * * * * TRY.BR_A TGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGC LYC.ES_L TGGGGTGG--ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGC--AACGAACAGCTTCCGCTCTGTG ** *** * **** * * * ** * * ** * * * ** * TRY.BR_A CGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATC LYC.ES_L CAGTGGAAGGATAACGGGTCA-GTGCTCAG-CGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGC * *** * * * * * ** * * ** * * * * * ** * ** * TRY.BR_A TCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG LYC.ES_L TCCAA---CTAAACCACCACTTT------------- ** * ** * * * *
Mean pairwise ID: 38.11%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT SCH.POM. --------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGC--ATGTTC * ** ***** *** * * *** *** * TRI.AE_B GGTGCGGTTTG--TTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT SCH.POM. GGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT-CTGCCACGTCTGTTCGAAG- **** * * * * **** *** * * *** * * * **** *** TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCA---GGCCTTAAGTGGCA SCH.POM. -AGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAA ***** * ** **** ** * * * * * ** * TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG SCH.POM. TGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGT-GCGATAGCGATGGGATTCACCT-TCGCAGG **** * ** * *** * ** **** * * * * ** * * * *** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC SCH.POM. AT----GTGCATGGAAGTATAAACACAAC--GGTCGTT---------------------- ** * * * ** ** * * ** * * TRI.AE_B CATCTTT SCH.POM. -------
Mean pairwise ID: 38.11%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT **** * ** * ** * ** ** CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTT--GGGCTCTGC--ACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT ** * ***** * *** ** * * * * **** * ** * CAE.BRI. GCTGCG-TCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGC-----GGTCCCGGGCGCATAAGG YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT ***** * * ** ***** * * *** * * * * * * CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTGG YAR.LI_A AACTGGGAA-ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG * * * * **** * * ** ****** * ** *** * *** * ** CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT-ACCTTCAGACCACT YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------- **** ** * * * * * * * * *** ** * CAE.BRI. TGTCATT YAR.LI_A -------
Mean pairwise ID: 38.13%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** ** * ** *** * ** **** ** *** ** *** * ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTA--GTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG * ** ** * * ** ** **** * * * * * ** * *** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG ** * * * ** * ** * ** * * *** * ** * ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA * * *** ** * ** * * * * ** * *** **** * ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------- * * ** * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 38.16%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * **** *** * ** LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** ** * * ***** ** * * * * ** ** * * LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** * * * ** * * * * * ** **** * * * LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCG **** **** *** *** *** ** * * ** ****** * LYC.ES_A ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC SCH.POM. ATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACA--CAACGGT ***** ** * * * * * ** * ** * **** LYC.ES_A CTTT SCH.POM. CGTT * **
Mean pairwise ID: 38.19%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT *** * ** * ** * * ** CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA ** * * ***** ** * * ** *** * * * **** * ** * CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGG-----TGCATAAGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAG--TAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG ***** *** * * *** ** * ** * * * * * * CAE.EL_C AGTGGT--GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGT YAR.LI_A ATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGC * * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** * CAE.EL_C GGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGACCA YAR.LI_A GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------ ** *** ** * * * *** * ** * ** ** * CAE.EL_C CTTGTCACT YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 38.19%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGCCTTCTTGTTGTGC-- ** *** ** * * * **** * ** * ** * ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG YAR.LI_B GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTG----GGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG ***** * ** * ** * *** ** * ** ** ** ** ** * ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGA--AGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGG--AG YAR.LI_B TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * * ** * * **** * * *** * ****** * * ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG YAR.LI_B GATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCGGTGGGAT * ** * * * ***** * * * * * ** ** **** ARA.TH_F GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAAC YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGACTCTC-------- ** * * * * * *** *** *** **** ARA.TH_F CACCATTTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 38.19%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT ****** * * * **** **** * * * HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAG-CTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG * * * * * ** ** * * * * ** *** * *** * HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT *** * ***** * *** * * **** * *** *** * * HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG YAR.LI_B GGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG * ** * * ** *** * ***** ** * * * * ** ** HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------- *** * *** ** ** ** * * ****** HUM.LU_A ATTTCTTTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 38.20%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGG-TGGCTGCGGAT SCH.POM. -------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGT ** *** ** * * * * ORY.SA_A GTTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTG---CCC SCH.POM. GTTTAGTAC---TCCCAATAGTG-----CATGTT-CGGTGGTCTCG--GGTTCGAGTCTC **** ** * * ** ** ****** ** *** * ** * * * * ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG SCH.POM. GCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAG * * * * * *** * * * *** * * * * ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCT SCH.POM. ---TTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCAC--ATCACTACCGGGT **** * * ** * **** *** *** *** ****** ** * * ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC SCH.POM. CTTG--GGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCG--CAGGATGTGCATGGAAGTATA ** * **** * * * ****** * * * * ** *** ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT SCH.POM. AACACAACGGTCGTT------- ***** * *
Mean pairwise ID: 38.20%
ZEA.MA_A ------NCCGAGCTCTGTAGC----GAGAGCTTGT-AACCCGAGCGGGGGCATTAAGG-- LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC * ******** * * * *** * * ******* ** ZEA.MA_A TGGTGTGAATGCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCT LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT * * * ** ***** * *** * * * * **** * * **** ZEA.MA_A TGCCCATCCCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCA LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGGCCG ***** * ** *** * * * * * * ***** * ***** * ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACT LEI.MAJ. GAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCAC-ACCGCGGAGCATG ** ***** ** ** * * * * * * **** * * * * * * ZEA.MA_A CCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT LEI.MAJ. TCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------------------------ ** ** * * * *** * ** ZEA.MA_A CACTAAGCAAACCACCATCTTT LEI.MAJ. ----------------------
Mean pairwise ID: 38.24%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** * *** * * * * *** *** * ***** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** ******* * * * *** *** *** * * * LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * * LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAG---AGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA ** * * ** ** **** *** ** * * ** ** *** LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC YAR.LI_A TCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------- * * * *** * * ** ** * * * LYC.ES_B ACTTTT YAR.LI_A ------
Mean pairwise ID: 38.31%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT TRI.AE_C ----------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGA ** ************ * * ** TET.ROS. ATGGTGGAAACCTA----GTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGC TRI.AE_C CCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCAC--GGTCCATAATGTGGC-AGGCACCGC * * * **** * * ** * **** ** * *** * * *** ***** TET.ROS. CTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACAT TRI.AE_C GTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGG * ******** ***** *** ** **** ****** ************** TET.ROS. ACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT------- TRI.AE_C GCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC * * *** * ** * ** ** ** ** ** *
Mean pairwise ID: 38.31%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT *** * ** * ** * ** ** CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGC---TCTGCACTTG-GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT ** * * ***** ** * ** * * * * * **** * ** * CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAGG YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT ** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * * CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTGG YAR.LI_A AACTG-GGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCGG * * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** * ** CAE.EL_D CCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCACT YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------- *** *** * * ** * ** **** ** * CAE.EL_D TATCATTT YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 38.36%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * **** *** * ** LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** ** * * ***** ** * * * * ** ** * * LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** * * * * ** * * * * * ** **** ** * * LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC **** **** *** *** *** ** * * * ** ****** * LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA SCH.POM. GATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACA--CAACGG ***** ** * * * * * ** * ** * **** LYC.ES_K CCTTT SCH.POM. TCGTT * **
Mean pairwise ID: 38.36%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * **** *** * ** LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** ** * * ***** ** * * * * ** ** * * LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** * * * ** * * * * * ** **** * * * LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC **** **** *** *** *** ** * * * ** ****** * LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA SCH.POM. GATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACA--CAACGG ***** ** * * * * * ** * ** * **** LYC.ES_J CCTTT SCH.POM. TCGTT * **
Mean pairwise ID: 38.44%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGAT-G YAR.LI_B --------------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG * * * ** * * *** * ** * ORY.SA_B CCTGGTCGTT-TGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTC YAR.LI_B CCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG-GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTT-GTCCTTTC *** * *** **** * * * **** * ** ** ** *** * * ** *** ORY.SA_B CAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGC---GCCTGGGCGAA-GGCTCGAGCGTCCCTGCACCT YAR.LI_B CGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTA * * ** * * ** * * * * *** * * **** * * * * ORY.SA_B AGAGTGGC--GGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCC YAR.LI_B AGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG--TGGGTAT *** * * ** ** * * * * ***** * * *** * * ORY.SA_B AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCA-GCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTC YAR.LI_B GGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC ****** * *** * * * * *** * * * * * ** ORY.SA_B CATGGCAGACCACCACCTTT YAR.LI_B --------------------
Mean pairwise ID: 38.46%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_D -------------------------------------TAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA * * * **** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LYC.ES_D AGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCG ** * ** * * *** *** * ** ** **** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_D GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG * * * * ** ********* ************ ** * * ****** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGC-CCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_D AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAA ******** *** ** ** * * * * ** * * * * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_D ACCACCACTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 38.51%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG YAR.LI_B --------------AGCTGTAATGGCATTTT-GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG *** * * * ** * ** *** * * *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA YAR.LI_B TGC---GTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGC-TACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** * * * * * **** * * ** * * * ** * * ** ** CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTC---CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG-- YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT ** * * ** ** ***** * * * *** * * * ** ** CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGA YAR.LI_B GGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT--GGCGGTGGG *** * * * * * * ***** * * ** * * **** CIN.HYB. AGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTA-GGCTCATATAACCAGCC-TGGCTAGCCCAACAGGA YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------- * **** ** * * *** ** *** ** * * ** * CIN.HYB. CACCCATTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 38.51%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT *** * ** * ** * ** ** CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA ** * * ***** ** * * ** *** * * * **** * ** * CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGG-----TGCATAAGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAG--TAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG ***** *** * * *** ** * ** * * * * * * CAE.EL_B AGTGGT--GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGT YAR.LI_A ATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGC * * *** ***** * ** ****** * ** *** * *** * CAE.EL_B GGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGACCA YAR.LI_A GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------ ** *** ** * * * *** * ** * ** ** * CAE.EL_B CTTGTTTTT YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 38.52%
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC--CAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG ** * * * *** * * * * * * *** * ** LEI.MAJ. GACCA---GCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTG-TGTGTCGG YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG *** * ** * **** ** * * * ** * *** * ** **** LEI.MAJ. TGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGT YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGAT-----TTCCGTTCTAAGATTAA--CTGGGATACTTCAG * ** * * * * *** * * ** ** * * ** ** LEI.MAJ. CAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCA-CACCGCG YAR.LI_B TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTG * * * ** *** ** ** * ** ** * ** ** * * LEI.MAJ. GAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT YAR.LI_B GTATATGTTA-----TGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC- * **** ** * ** *** *
Mean pairwise ID: 38.64%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA ** ** ** CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA ** * ** * ** * * **** * ** *** ** * CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT * * **** * ** * * **** *** * * * * * * *** * * ** CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * **** ** *** **** ********* ** CAE.EL_A ACCGCGCTTGTGAGTT----GACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC * ** * * * * ** * * * *** * * ** ** * CAE.EL_A ATCATTT- LYC.ES_L ACCACTTT * ** **
Mean pairwise ID: 38.64%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA ** ** ** CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA ** * ** * ** * * **** * ** *** ** * CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT * * **** * ** * * **** *** * * * * * * *** * * ** CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * **** ** *** **** ********* ** CAE.EL_D ACCGCGCTTGTAAGTT----GACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC * ** * * * ** * * ** *** * * ** ** * CAE.EL_D ATCATTT- LYC.ES_L ACCACTTT * ** **
Mean pairwise ID: 38.67%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** ** * ** *** ** **** ** *** ** ** * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGC-CTGGG-TCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG * ** ** * * ***** * ****** * * * * * ** * *** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG ** * * * ** * ** * ** * * *** * ** * RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA * * *** ** * ** * * * * ** * *** **** * RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------- * * ** * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 38.76%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG YAR.LI_B ----AGCT--GTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGTA--AATCGCCTTCTTGTTGTGCG **** **** * * **** * ****** *** * * * * * ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG YAR.LI_B -TTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG-GCTACTTTGT---TGTCCTTTCCGAATTCTGCGG *** * * ** * ** * *** *** * * ** ** ** ** * ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG--AGG YAR.LI_B TTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGG * * * ** * * * * * ****** * ** ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG YAR.LI_B ATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCGGTGGGATA ** * * * * ***** * * * * ** ** **** ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA YAR.LI_B GCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGA-CTCTC-------- * * * * * * * *** ** *** ***** ARA.TH_D CCACTTT YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 38.77%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC LYC.ES_L ------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTA-TAGTCTGGCCTGCCCT * * * * * * *** * ******* * ** * LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT LYC.ES_L CTCCAAGCATGG--AGTTG-GATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCT--TGAT * * ** ** * ** * * ****** * * ** ** * * * * LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGGGAACCGGGTCAGGCC LYC.ES_L TCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTC * * ** * ** *** * * * * * ** * * **** * ** * * LEI.MAJ. GGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCATG LYC.ES_L TGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCT * * * ** * * * * ** * * ** ** * * LEI.MAJ. TCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT LYC.ES_L GCTCCAACTAAACCAC-CACTTT------------- * ** * * ** * * ***
Mean pairwise ID: 38.89%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAA-TATT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * **** *** * ** LYC.ES_H GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * * LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGA--AACAATGCACATCACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC * * **** *** *** *** ** * * * ** ****** * LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA SCH.POM. GATGGG----------ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAAC--ACAACGG ***** ** * * * * * ** * ** ***** LYC.ES_H CCTTTT SCH.POM. TCGTT- * **
Mean pairwise ID: 38.89%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC LYC.ES_L ----GTTGGGTTGAC-CCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCT * ** ** * * * * * * * * *** * ** ** * * YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT LYC.ES_L CCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCT---TAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCT ** * * * ** *** * ** ** * ***** * * ** YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA LYC.ES_L AAAGTGGGGTGGACTGCGT-GAGGCTGGT-TTCACAGAGCAAC-GAACAGCTTCCGCTCT * ** * ** * *** * *** *** *** * * **** * YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT LYC.ES_L GTGCAGTGGAAGGATAACGGGT-CAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCT * * ** * * * * *** * * * * * * ** *** * YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT LYC.ES_L GCTCCAACTAAACCACC-ACTTT------- * ** * ** *
Mean pairwise ID: 38.92%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG YAR.LI_B ------------------AGCTGTAATGGCATTTTG-----TCGGAGTGGTAAATCGCCT **** * *** * * * **** * * * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCAT---GTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAG YAR.LI_B TCTTGT-TGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA * * * ** * ****** * *** * * ** * ** ** *** * ARA.TH_E CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAG-GCTTGGCTCAAACGGCT----TCTAAAGT YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT * ** * ** * * ** ** * ** * **** * * ***** * ARA.TH_E TGG--AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCA YAR.LI_B TAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGC--CGTGGGTATGGCG * ** ** * * * * ***** * * * * * ** ** ARA.TH_E GTGGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCA YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTAT---TTGCAATCACGACTCTC- **** *** * * * * * *** *** *** **** ARA.TH_E TATGAACCACCATTTT YAR.LI_B ----------------
Mean pairwise ID: 38.96%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA-CGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * *** * * * * *** ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT SCH.POM. TAGT-ACTCCCAATAGTGCATGTTCGG--TGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCC ** ** ** * * * ****** *** ** * * * * * *** * ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCT-CGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG SCH.POM. CTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGT ** ** * * * * ** * ** ** ** * * ** * ** * * * ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGA-CGGTGGAA SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACA----TCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA **** **** *** ** * ** *** ** * ***** * *** * ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC SCH.POM. TAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAAC-ACAACGGTCGTT-- * *** * * * * *** **** * * ** * * ARA.TH_C ATCACTTT SCH.POM. --------
Mean pairwise ID: 39.02%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTG-GTAAATCGCCTTCTTGTTGTGC-G ** * *** * * **** * *** * ** ** * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG YAR.LI_B TTCGAGTTCTGGACTCTGCACT---GGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTT * * * * * * ** * * * ** ** *** ** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC YAR.LI_B GAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGA * *** * ** * ** * * * * * * **** * *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_B TACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAG * * * ** *** * **** ** * * * ** * ** ***** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAA-GTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA YAR.LI_B CAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACTCTC------------ * * **** **** * ** * ** * ** * *** LYC.ES_C CATTT YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 39.02%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC SCH.POM. ------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG----TTTAGTAC * ** *** ** *** ** ****** * HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG SCH.POM. T-CCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT--CGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT **** * * * * * *** * * * ** * * * * *** * ** ** HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCT-TGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACC ** ** ** * * ** * * ** **** ** * * HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC SCH.POM. GATGGAGGTTGGAA--ACAATGCA-CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGAT * **** *** *** *** * ** * * * ******* * * HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGC-TGACTCTTAATAGGACCATTT SCH.POM. GGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT---------- *** ** * * ***** * * * ** * * HUM.JA_B CTTTT SCH.POM. -----
Mean pairwise ID: 39.02%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG SCH.POM. --------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTC * * ** * * ** * *** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG SCH.POM. CCAATAGTGCATGT-TCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTC---GCTTTCGATCCCTCGATC ** ** * **** * * * * ** ** *** * * ** * * ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT SCH.POM. TGCC----ACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** **** *** *** * ** *** * *** * * ** * ** ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTAC--CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGC * * **** *** ** * ** * ***** * * * ****** ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACC SCH.POM. GATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGA-----AGTATAAACACA-----ACGGTC * * * * *** * **** ** * * ** ** * ARA.TH_E ATTTT SCH.POM. GTT-- **
Mean pairwise ID: 39.02%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTAC *** ***** * * * * ** LEI.MAJ. CAGCGAGGGTG---ATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG SCH.POM. TCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG * * *** ** * ** * ** *** * * * *** * ** LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGG----TGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG-GGAACCGGG SCH.POM. CCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGAT * * * * **** * * * ** *** ** ** * * **** LEI.MAJ. TCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCG SCH.POM. GGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTAC---CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGG *** ****** *** *** * * *** * * ** * * * LEI.MAJ. GAGCATGTCCGCACT-TGAGCCCC-ACGCTTCGTCGCGA-AGCCTT- SCH.POM. ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT ** * **** ** ** * * * * * * * * *
Mean pairwise ID: 39.05%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT YAR.LI_B ----------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAG-TGGTAAATCGCCT * * * *** *** *** *** * ** * * HUM.LU_B CAGCCCAGTG-GATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCT----TACTGGTCTGCCCATTCCAAGC YAR.LI_B TCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT *** * *** ** * * * ** **** ** ** **** * HUM.LU_B ----CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAA-GGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT *** * ***** * *** * * *** * * * * ** *** * HUM.LU_B GG--AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAG YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGT--GGGTATGGCGG ** * * * * * ***** * * ** * *** * HUM.LU_B TGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAAT YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTA-TATGTTATGGAAGGTATTTGC-AATCACGACTCTC--- *** * *** *** ** * * * * ** * ** ****** HUM.LU_B CGGACCATTTCCTTT YAR.LI_B ---------------
Mean pairwise ID: 39.07%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * * CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** ** * *** *** * ** * *** * CAE.EL_D GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG *** * * * * * * * ** ** ** * *** * * * CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTCGAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** * * CAE.EL_D CGCGCTTGTAAGT-TGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------- * * * ** * ** * * ** * * ** * CAE.EL_D TT TRY.BR_A --
Mean pairwise ID: 39.10%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG YAR.LI_A --------------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT * * * ****** * * * **** **** * * * HUM.LU_A GGTCAAC-CTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC- YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT---TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATT * * * * * * * *** * * * ** * * * ** ** **** * HUM.LU_A ---CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGG YAR.LI_A CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTA *** * ***** * *** * * **** * *** *** * HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA YAR.LI_A ACTGGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGT * * * * * ** *** * ***** ** * * * * ** HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG YAR.LI_A GGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------- **** * * *** ** ** ** ** * ** * HUM.LU_A ACCATTTCTTTT YAR.LI_A ------------
Mean pairwise ID: 39.12%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG LYC.ES_L --------------------------------GTTGGGTTGACCCAG-ATGGTTGGGTTC * ** * ** ** * ** TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTG--TTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT LYC.ES_L GGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTC * * ** **** *** * * * * * * * * **** * ** TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGG-GTCAGGC LYC.ES_L GAA-----------AGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGC ** *** * *** ********** * ** * ** **** TRY.BR_B CGGTG--ACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAG LYC.ES_L TGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTG *** ** ***** * ** *** *** * * * ** * ** * ** * * TRY.BR_B CATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-------- LYC.ES_L CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT * * * * ** ***** * * * * * *
Mean pairwise ID: 39.14%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAA-TGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * * **** *** **** LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * * LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * * LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGC---GATA * * **** *** ** * ** * ** * * ** *** **** LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT SCH.POM. GCGA--TGGGATTCACC----TTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT *** ** *** * * * ** ** * ** *** * * LYC.ES_N TTTT SCH.POM. T--- *
Mean pairwise ID: 39.14%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G * * * * ***** * * ** * ** * * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG * ***** * * *** ** * * * * ** * ** * * * LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LEI.MAJ. GTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG----TTGAAGCGAGG-GAA *** * * * ** * * *** * * *** * ** * * LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACG-TCCGCCGTTGCAGAATC *** * **** ** ** ****** ** * * * * * ** ** * ** ** LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----- * *** * * * * *** * * * * * * LYC.ES_J CTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 39.22%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGG--CATTGAGGCGGTGTGGATGC YAR.LI_B --------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTC ** ** ** * * * **** * * **** * * TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT YAR.LI_B GAGTTCTGGACT-CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG * * ** * ** ******* * * **** * * * ** * * * TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC YAR.LI_B GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTC-CGTTCTAAGA--TTAACTGG--GAT ** ** *** ** ** * *** * **** ** **** *** * TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA YAR.LI_B ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGGTGGGATAGCA ** * * * * ***** * * * * * ****** * * TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAG--CATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC YAR.LI_B ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------------- *** * * * **** * ** * ** * TRI.AE_B ATCTTT YAR.LI_B ------
Mean pairwise ID: 39.22%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA----ATCGTCTTCTTGTTGTG ** ** * ** * * * ****** * * ** * *** ARA.TH_D -GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT YAR.LI_A CGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG **** * ** * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ARA.TH_D GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG YAR.LI_A GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG ** * * ** * * * * * ****** * ** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA YAR.LI_A GAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA ** * * ** *** * ***** ** * * * * ** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC YAR.LI_A TCGCAACC--AAGTGGT----ATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------- ** * **** ** ***** * ***** * * ARA.TH_D CACTTT YAR.LI_A ------
Mean pairwise ID: 39.27%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** ** * ** *** ** **** ** *** ** * * GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCT--AGTGCTACAAACTGTG-GACCACCCATTCCAAG * * ** * * ** ** ***** * * * * * * ** * *** GAL.GAL. GCCGGCA-TCAATATGGTGAGCCCCGG-GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAAAGTGG * * * * * * *** ** * * * *** *** **** * ** GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA * * * *** ** * ****** * * **** * * ** GAL.GAL. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTC ZEA.MA_H AGGATAATG---------AGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------- **** * ** * ** *** * GAL.GAL. TCC ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 39.29%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA ** ** ** CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA ** * ** * ** * * *** * ** *** ** * CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT * ** **** * ** * * **** **** * * * * * *** * * *** CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * **** ** *** **** * ********* ** CAE.EL_C ACAGCGCTTGTGAGTT----GACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC * * ** * * * * ** * * ** *** * ** ** * CAE.EL_C GTCACT-- LYC.ES_L ACCACTTT ****
Mean pairwise ID: 39.29%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG YAR.LI_A --------------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT * * * ****** * * * **** **** * * * HUM.LU_D GGTCAAC-CTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC YAR.LI_A GTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT---TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATT * * * * * * * *** * * * ** * * * ** ** **** * HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG-GCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG YAR.LI_A CTGCGGTTGA-TGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * * ** * * * ** * ** * ** * * * * * HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAG--AGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG * ** * * * ** **** * *** * * ** ** * HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA YAR.LI_A TG--GGATCGCAACCAAGTGG------TATATGTTATGGAA--GATATTTACGATCACGA * ** ** * * *** ** * * * ** *** * ** * HUM.LU_D TTTCTTTT YAR.LI_A TT------ **
Mean pairwise ID: 39.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA--ATCGCCTTC ***** * ** * **** * * * * * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACT---CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA *** * ********* ** *** ** ** * * ***** * * RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATT-TCCGTTCTAAGA *** ** ** * * *** * * ** ** * * RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC * * * * * * * * *** ** * * * ** ****
Mean pairwise ID: 39.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC-GCCTTCT ***** * ** * **** * * * * *** * GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG YAR.LI_B TG-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTC---TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA * *** ** ********* ** *** ** ** * **** * * GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTG-ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA * ** **** * * * * * * * * * GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * ** *** * * GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- YAR.LI_B TGGGA--TAGCAACAA--AGTGGTATATGTTATGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC * * * ** * * ** * *** ** * * * * ***
Mean pairwise ID: 39.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA--ATCGTCTTC * ***** * ** * **** * * * * * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCT---CTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA *** * **** ****** *** ** *** * ** ***** * * RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATT-TCCGTTCTAAGA *** ** ** * * *** * * ** ** * * RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_A TTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATT-TACGATCACGATT--- * * * * * * * * *** * ** ** * ** *
Mean pairwise ID: 39.40%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G * * * * ***** * * ** * ** * * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG * ***** * * *** ** * * * * ** * ** * * * LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LEI.MAJ. GTGTGG--CTTGCCCCCCTGCAGAGGGTG-GCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GAAC *** ** * *** ** * * ** * * *** * ** * ** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCAC ** * **** ** ** ****** ** * * * ** ** * ** ** * LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCT LEI.MAJ. ACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------- *** * * * * *** * * * * * * LYC.ES_A TT LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 39.44%
YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGG--CAATAAGGTAGTGTGGATG ** * * * ** * * * *** ** * * **** * YAR.LI_A CGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT * * *** ** * *** * * * * * * * * * * YAR.LI_A -GCGTCTCGG--TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC-TGGGAAA ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGA **** ** * * * * ** *** * * * ** * *** *** * YAR.LI_A CTTCA-GTGGAGC-AATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA--TGGCGGTGGGATCG ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * * *** ** **** * * *** * ******* * YAR.LI_A CAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT ZEA.MA_H TAAT-GAGTCGC-TATGCTATAGGCCCAAT-------------- ** *** * **** *** * **
Mean pairwise ID: 39.46%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCG * ** * ***** * ** * * * * ** * TRI.AE_A GTTGTAGCGC-TGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG SCH.POM. GTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAG--- ** ** ** * ** * ** * * * ** *** * ** * **** *** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG SCH.POM. ---AGTAGTCTTCGTGGCAACT----GGCAGTTAAACCGTGTAGTAC-CGATG------- *** * * * *** * * ** * * ** * *** TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA SCH.POM. --------GAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGG---GTCTTGGGCAGTGCGATAG **** *** ** * ** * * * * * * * *** * TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC SCH.POM. CGATGGG-----ATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT ***** * *** ** ** ** * * ** ** * * *
Mean pairwise ID: 39.47%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAA-TGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * * * **** *** **** LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * * LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * * LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGC---GATA * * **** *** ** * ** * ** * * ** *** **** LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT SCH.POM. GCGA--TGGGATTCACC----TTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGT *** ** *** * * * ** ** * ** *** * * LYC.ES_I TTTT SCH.POM. T--- *
Mean pairwise ID: 39.47%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G * * * * ***** * * ** * ** * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG ** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * * * LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAAC *** * ** *** * * *** * *** * * * * * LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATCA * ** **** ** ** ****** ** * * * * ** ** * ** ** * LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LEI.MAJ. CACCGCGGAGCATGTCCG----CACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------ *** * * * ** * *** * * * * * * LYC.ES_H TTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 39.48%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAA-TGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * * **** *** **** LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAG-GTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT * * **** ** * * * *** ** * ** * ** ** * * LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGG-GCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG ** ** * * ** * *** * ** *** * * *** **** * * * LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAG ** * **** *** ** * ** * * ** * * ** ****** * LYC.ES_C TAACGAG--CCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACT SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAA-ACACAACGGTCGTT----- * * * ** ** * * * * * * ** * * * * *** LYC.ES_C ACCACATTT SCH.POM. ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT *** * ** * ** * ** * CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTT-----GTCCTTTCCGAA ** * * **** *** * ** * * **** * * **** * ** * CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT ** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * * CAE.EL_D GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTG YAR.LI_B TAACTG-GGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG * * **** ***** * ** ****** * ** *** * *** * * CAE.EL_D GCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACAT-ACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCAC YAR.LI_B GTGGGATAGCA---ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC- * *** ** ** ** * * * * * * * * * * * * CAE.EL_D TTATCATTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT *** * ** * ** * ** * CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTG-TATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG YAR.LI_B GTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTT-----GTCCTTTCCGAA ** * * **** *** * ** * * **** * * **** * ** * CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGA--AGGCGGTT----AGTCCCGGGTGCATAAG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT ** ** *** * * *** ** * *** * * * * * * * CAE.EL_A GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCGACCGCGTGGTGCAGTG YAR.LI_B TAACTG-GGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG * * **** ***** * ** ****** * ** *** * *** * * CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACAT-ACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCAC YAR.LI_B GTGGGATAGCA---ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC- * *** ** * ** * * * * * * * * * * * * * CAE.EL_A TTATCATTT YAR.LI_B ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTT------GTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTG *** * * * * * ** * ** *** * * *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA YAR.LI_A TGC---GTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGC-CATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** * * * * ** **** * * ** *** * ** * * ** ** CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTC---CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG-- YAR.LI_A CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT ** * * ** ** ***** * * * *** * * * ** ** CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGA YAR.LI_A GGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT--GGCGGTGGG *** * * * * * * ***** * * ** * * **** CIN.HYB. AGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTA-GGCTCATATA-ACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGA YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------ * ** * ** * * *** ** **** ** * * * * CIN.HYB. CACCCATTT YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 39.48%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTT * ** *** ** *** ** ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT ** ** * * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * ** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCG--CAGCTCCTAGAGTGGAGGG SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG ** ** * ** * * * ** ** ** ** ** ** * * * HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCGG--GTCTTGGGCAGTGCGATAG * * **** *** ** * ** * ****** * * ******* * HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTAC-CTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT------ * *** ** * * **** * * * ** * * HUM.LU_D ATTTCTTTT SCH.POM. ---------
Mean pairwise ID: 39.52%
LYC.ES_M -----------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGA YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGC-GTTCGAGT ** ** ** *** * * *** ** ** * ** LYC.ES_M TGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACG YAR.LI_A C--TTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGAT-GGG ****** * * * * ** *** *** * * * * * *** * LYC.ES_M AGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG YAR.LI_A CGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCA * * * * ** ***** **** * * * ** * * LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTC YAR.LI_A GTGGAGCAATCCAGCAGAGA--TCCAGTT----GCCGTGG--GTATGGCGG-TGGGATCG * ** *** * * *** * * ** **** * ** ** * ** LYC.ES_M TTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT YAR.LI_A CAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT------ * ***** ** * * * * * ** * * *
Mean pairwise ID: 39.55%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT ***** * * **** * *** ** * * ** ** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTT-GTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG **** * * * ** ** ** * * *** * * * * * ** * ZEA.MA_B GGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAGG YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * * ** * * ** ** * * ** * * * * * * * * ** ZEA.MA_B AATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CACTTCCAACGGTGGGA YAR.LI_B GATACTTCAG---TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA ** * *** * ***** **** * * *** * ******** ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACA---GACCCAGATCCTCTCTTAGCAAA YAR.LI_B TAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---------- ***** * * * ** * * * * ** *** ZEA.MA_B CCACCATCTTT YAR.LI_B -----------
Mean pairwise ID: 39.56%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT ** * * * ** * * * *** ** * * ** * ** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG-------GCCATTTGG-TTGTCCTTTCCGAA **** * * * ***** *** ** * * ** *** ** * ** * ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC YAR.LI_A TT--CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG ** * * ** **** * * ** * ** * * * * ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAG---AGCAGCGATC--ACTGCCG-ACTCCCAACG YAR.LI_A ATTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCG * ** * * ** * ** ***** **** ***** ** ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGC-TGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAA YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------- ****** *** *** * * * ** * * * * *** * ZEA.MA_A GCAAACCACCATCTTT YAR.LI_A ----------------
Mean pairwise ID: 39.60%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GTCTTC * ***** * ** * **** * * * * * RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA *** * **** ****** * ** ** *** * ** ***** * * RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_A T-AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATTTACGATCACGATT-- * * * * * * * * *** * ** * ** *
Mean pairwise ID: 39.60%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG SCH.POM. ----------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGA ** * * * *** * CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGA--CCGAGCGTCCGTGCCAA SCH.POM. AGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGA **** * * * * * **** ** **** ** * * * CAE.BRI. GCGCTGCGTC-GCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTG-GCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG SCH.POM. TCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCG * ** ** **** * * * ** * ** ** * ** * *** *** * CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG SCH.POM. TGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAA-CAATGCACATCA-CTACCGGGTCTTG-GGCAGTGC ** * ** * * ** * ** ** ** * * **** * ** * * CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTC SCH.POM. GATAGCG---ATGGGAT-TCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTC ******* ** * * ** * * ** * ** * * * ** *** CAE.BRI. ATT SCH.POM. GTT **
Mean pairwise ID: 39.61%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA ** ** ** CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA * ** * ** * ** ** ** * * * * ** *** ** * CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT LYC.ES_L GTTGGATCACGTGG----CTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT * ** ** * ** **** *** * * * * * * * *** * * *** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * ** ** *** * * **** ** *** **** * ********* ** CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTT----GTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTT LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC *** ** * * * * * * * ** *** * ** ** * CAE.BRI. GTCATT-- LYC.ES_L ACCACTTT ** *
Mean pairwise ID: 39.67%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC ZEA.MA_H ---NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGAT ** * * *** ** * * * ** * ** * *** DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAG--CTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA ZEA.MA_H GTCAATTGTGGTGCA-TGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA ** * * * ** * ** * ** ** *** * ** * ** DRO.MEL. GCT-TGCCATCAATAT-GGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCT-TTGCATCCCAAC--ACTAAAGTG * * * * * * ** **** *** * * * * **** * **** * * DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGG * * * * *** ** * ****** * * **** ** ** * DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTAT--------GCTATAGGCCCAAT------------------- ***** * ** * * *** ****** DRO.MEL. TCTTT ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 39.67%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAA-TGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * * * **** *** **** LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTC * * *** * * * ***** ** * ** * * ** ** * * * LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** * * ** * ** * ** * * * ** **** * * * LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT SCH.POM. ACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTA---CCGGGTCTTGGGCAGTGC---GAT * * **** *** ** * ** * ** * * ** *** *** LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA SCH.POM. AGCGA--TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATA----AACACAACGGTCG * *** ** *** * * * *** ** * * ** *** * LYC.ES_B CTTTT SCH.POM. TT--- *
Mean pairwise ID: 39.67%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTG-GTAAATCGTCTTCTTGTTGTGC-G ** ** * *** * * **** * *** * ** ** * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG YAR.LI_A TTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTG---GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTT * * * * * **** * ** ** ** *** ** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC YAR.LI_A GAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGA * *** * ** * ** * * * * * * **** * *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_A AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCG * * ** *** * **** ** * * * ** * ** **** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGA-ATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA YAR.LI_A CAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT--------------- * * * **** **** * * ** ** * *** * ** LYC.ES_C CATTT YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 39.68%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG SCH.POM. ----------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTT * ** *** ** *** ** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG SCH.POM. AGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT ** ** * * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * ** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTC--CTAGAGTGGAGG SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGT-CTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA ** ** * ** * * * ** ** ** ** * * ** * * HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG SCH.POM. GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTACCGG--GTCTTGGGCAGTGCGATA * * * **** *** ** * ** * ****** * * ******* * HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGC-TGACTCTTAATAGGAC SCH.POM. GCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT----- * *** ** * ** **** ** * ** * * HUM.LU_A CATTTCTTTT SCH.POM. ----------
Mean pairwise ID: 39.68%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGG-GCATTAAGGTGGTGTGGATGT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGA ***** * * **** * ** ** ** *** * * ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG YAR.LI_B GTTCTG---GACTCTGCAC-TGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATG * *** ** **** * ****** * *** ** *** * ** * * * ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG YAR.LI_B GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTT---CCGTTCTAAGATT-AACTGGGAT ** ** * * * ** * ** * ** * ** ** * ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG YAR.LI_B ACTTCA-GTGGAGC-AATCCAGCAGAGATCCAGTTGC---CGTGGGTATGGCGGTGGGAT * * *** ** ***** * * * * * * ******** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCAT----TGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----------- **** * * ** ** *** * ** ** *** ZEA.MA_F CACCATCTTT YAR.LI_B ----------
Mean pairwise ID: 39.68%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LYC.ES_L --------------------------------------------------GTTGGGTTGA ** ** ** CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LYC.ES_L CCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCC---TCTCCAAGCATGGA ** * ** * ** * * *** * ** *** ** * CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT LYC.ES_L GTTGGATCAC--GTGGCTTA--GTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT * ** **** * ** * * **** **** * * * * * *** * * *** CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** * * * * * **** ** *** **** * ********* ** CAE.EL_B ACTGCGCTTGTGAGTTGA-CACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTC-------AGACC LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC * ** * * * * * * ** * * * ** * ** * * *** CAE.EL_B ACTTGTTTTT LYC.ES_L ACCACTTT-- ** ***
Mean pairwise ID: 39.72%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG YAR.LI_B -----AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAG *** * * **** * * * * ** * ** ** * LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTG-CGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGC YAR.LI_B TTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGT * * * * ** * * * *** ** * * ** * ** ** * LEP.COL. CTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC YAR.LI_B CTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTG *** * ** * * * * * ** * * ** * * * * ** LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG-AACCACACCGCGG YAR.LI_B GAGCAATCCA-GCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGG ** * * * ** *** * ** ** ** ** ** * * *** * ** LEP.COL. AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT YAR.LI_B TATATGTTATGGAAGGTATTT---GCAATC--ACGACTCTC- *** ** * ** *** ** **
Mean pairwise ID: 39.73%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG YAR.LI_A ---------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTG ** * * ** *** * * * * *** * LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG----TCGGA YAR.LI_A TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGC ** * * **** * * ** *** * ** *** * * ** * LEP.COL. GGCCTCCGGGTGCCCC--CTTGCAGAAGGGGCGC-GCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAAC YAR.LI_A GGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTA--AGATTAAC ** *** * * * ** ** *** * ****** * *** *** LEP.COL. TGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACAC YAR.LI_A TGGGAAA---CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG--GTATGGCGG **** * * ** ****** *** * * ****** * * * * LEP.COL. CGCGGAGCCTGTCA--TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--- YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT * * * ** * * * * *** * * *
Mean pairwise ID: 39.74%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGTCTTCTTGTTGTGC-- ** ** *** ** * * * **** * ** * ** * ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG YAR.LI_A GTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT----TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG ***** ** * ** ** * ** *** *** * ** ** ** ** * ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG YAR.LI_A TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * * ** * * **** * * * ** ****** * ** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG YAR.LI_A GAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCGGTGGG ** * * ** *** * ***** ** * * ** *** * * ** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------ *** * ** * * * * **** ARA.TH_A CCATTTT YAR.LI_A -------
Mean pairwise ID: 39.74%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT YAR.LI_A -----------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTT *** * ****** * * * **** **** * * * * * HUM.LU_C CAAC-CCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC---- YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT---TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG * * * *** * * ** ** * ** ** ** **** * HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAA-GGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG YAR.LI_A CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT *** * ***** * *** * * **** * * * *** * * HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACCTCCCGCT--CTCGGCAGTGGA YAR.LI_A GGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG * * * * ** *** * ***** ** * * * *** *** **** HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------ * *** *** ** * * * * * * * * HUM.LU_C ACCATTTCTTTT YAR.LI_A ------------
Mean pairwise ID: 39.74%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG---GAG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCAATAAGGTAGTGTGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** ** * CAN.SPE. GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGT-GCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCC ** *** * ** * ** * ***** * * * * * ** * CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ZEA.MA_H AAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTG ***** * * * ** * ** * ** * * *** * * CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTG * * * * *** ** * ** * * * * ** * *** *** CAN.SPE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT ZEA.MA_H GAAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------- * * * * ** * ** ** ** * CAN.SPE. CT ZEA.MA_H --
Mean pairwise ID: 39.80%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GCCTTC ***** * ** * **** * * * * * RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA *** * ********* ** * ** ** ** * * ***** * * RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT- YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC * * * * * * * * *** ** * * ** ****
Mean pairwise ID: 39.80%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G * * * * ***** * * ** * ** * * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG * ***** * * *** ** * * * ** ** **** * * LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA LEI.MAJ. GTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG----TTGAAGCGAGG-GAA * ** * * * ** * * *** * * ***** ** * * LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACG-TCCGCCGTTGCAGAATC *** * **** ** ** ****** ** * * * * * ** ** * ** ** LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA----GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----- * *** * * * * *** * * * * * * LYC.ES_K CTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 39.80%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGG--CATTGAGGCGGTGTGGATGC YAR.LI_A -----CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTC *** ** ** * * * **** * * * **** * * TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT YAR.LI_A GAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGT-TGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGG * ** * * * *** * * ** * * **** * * * ** * * * TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC YAR.LI_A GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTC-CGTTCTAAGA--TTAACTGG--GAA ** ** *** ** ** * *** * **** ** **** *** * TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA YAR.LI_A ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT----ATGGCGGTGGGATC ** * * * * ***** * * * * * * ** ** **** TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCAT YAR.LI_A GCAACCAAGTGGTATATG------TTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------- ** * ** *** * *** * * ** TRI.AE_B CTTT YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 39.87%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC SCH.POM. --------------------------------CGCTGTAATGGCT--TGGTCGAAGTGTT **** * * ** * ** * * * DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC SCH.POM. TAGTACTCCCAA-TAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCT * ** * ** *** * * *** *** * ** * * DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTC--CGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGT-TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGG--CAGTTAAACCGTG * * * * ** * *** **** ******* * * *** * * DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG SCH.POM. TAGTACCGA--TGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCG * **** * *** ** ** ** * * ** * * ** * **** * DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCTT SCH.POM. ATAGCG--ATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCA-TGGAAGTATAAACACAACGGTCGT ****** ** * ** ** * ** ** * ** ** ** * DRO.MEL. T SCH.POM. T *
Mean pairwise ID: 39.87%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG **** * *** ********** ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCGGA TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG ******* * * **** ******* * ** ** * * *** ***** * ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA TRI.AE_C CACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** ***************** ********** ** ****** *** *********** ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------- TRI.AE_C TAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCAT *** * * **** ** * ** * ZEA.MA_H - TRI.AE_C C
Mean pairwise ID: 39.87%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG SCH.POM. ----------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGA ** * * * *** * CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGA--CCGAGCGTCCGTGCCAA SCH.POM. AGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGA **** * * ** * * * *** **** ** * * * CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG SCH.POM. TCCCTCGATCTGCC----ACGTCTGTTCGAAGAG---TAGTCTTCGTGGCAACTGGCA-G * ** ** * * * **** ***** **** * *** ** * CAE.EL_C GTGGATGGTTCAGGACCGA--AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-GCGGTGCAGTGGCC SCH.POM. TTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGC * * ** ** ***** **** * * **** ** * * * * * *** * CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCA-ATACCTTCAGAC-CACTT SCH.POM. AG--TGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG * *** * * ** ** * * * *** * ** * * * ** ** CAE.EL_C GTCACT SCH.POM. GTCGTT *** *
Mean pairwise ID: 39.94%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA----ATCGTCTTCTTGTTGTG ** * * * ** * * * ** ** * ** * * * *** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGC-CTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG YAR.LI_A CGTT--CGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCAT----TTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG * ** * ***** *** **** * *** * *** *** * ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG YAR.LI_A CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT * * *** * ** * * * * ** * ** * ** * ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CGCTTCCAACGGTGGG YAR.LI_A GGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG * * * ** *** * ***** **** * * *** * * ******* ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCA YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGG--AAGATATTTACGATCACGATT---------- * *** * * ** * * ** * ** * *** ZEA.MA_F CCATCTTT YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 39.94%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT LYC.ES_D ----------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA * ********** ****** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC *** * ** ** * * ******** * **** ** ** ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * ******** ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA LYC.ES_D ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCA **** ** * ** ** * *** ***** ** * **** ZEA.MA_C CCATTTTT LYC.ES_D CCACTTTT *** ****
Mean pairwise ID: 40.00%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT YAR.LI_A -------------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAG-TGGTAAATCGTCT ** * * *** *** *** *** * ** * * HUM.LU_B CAGCCCAGTG-GATCGGGTCCAGTGTT----AGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC YAR.LI_A TCTTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT *** * *** *** * * * * ** * * * ** ** **** * HUM.LU_B ----CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAA-GGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT *** * ***** * *** * * *** * * * * ** *** * HUM.LU_B GGAGGGCAA--TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAG YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGT--GGGTATGGCGG ** ** * * * * ***** * * ** * *** * HUM.LU_B TGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAAT YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTA-TATGTTATGGAAGATATTTAC-GATCACGATT------ *** * *** *** ** * * * ** ** ** * ** ** * HUM.LU_B CGGACCATTTCCTTT YAR.LI_A ---------------
Mean pairwise ID: 40.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTG---GTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGT ** * ***** *** * ** * ** *** *** CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGA--GCGTCCGTGCCAA SCH.POM. TCGGTGGTCTCGGGTTC-GAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAA * * * ** * * ** * * ** * * **** * **** ** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGG-GTGCATAAGGAGT SCH.POM. GAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTT--AAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAAC * * * * * * ** ** ** **** *** * * * * CAE.EL_A CGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAG-CAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC SCH.POM. AATGCACA--TCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCA ** * *** **** * * *** * * ***** * * * * ** CAE.EL_A GGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTAT SCH.POM. GGAT-GTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT------------------------- *** * ** ** *** * ***** * * CAE.EL_A CATTT SCH.POM. -----
Mean pairwise ID: 40.00%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** ** * ** *** **** **** ** *** ** **** * HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGC-CTGGG-TCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG * ** ** * * ***** * ****** * * * * * ** * *** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG ** * * * ** * ** * ** * * *** * ** * HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA * * *** ** * ** * * * * ** * *** **** * HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------- * * ** * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 40.00%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGCCTTCT ***** * ** * **** * * * ** * ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_B TG-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA * *** * ********* ** * ** ** ** * * ***** * * ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC * * * * * * * * *** ** * * * * ***
Mean pairwise ID: 40.00%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_D ----------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTC * * ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_D CAAGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC **** * *** ** * *** *** * * ***** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_D TAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT ***** ** * ** ** ********************** ** ** ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACC-TTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTC LYC.ES_D GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC * ************ ** * ** * * * * * * * * ** *** ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_D CA-ACTAAACCACCACTTTT * * * ******* ***
Mean pairwise ID: 40.07%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGTCTTCTTGTTGTGC-- ** ** *** ** * * * **** * ** * ** * ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG YAR.LI_A GTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT----TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG ***** ** * ** ** * ** *** *** * ** ** ** ** * ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGA--AGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG YAR.LI_A TTGATGGGC-GTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * * ** * * **** * * *** * ****** * ** ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG YAR.LI_A GAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCGGTGGG ** * * ** *** * ***** ** * * ** *** * * ** ** ARA.TH_F ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------ *** * ** * * * * **** ARA.TH_F CCATTTT YAR.LI_A -------
Mean pairwise ID: 40.07%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * * CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGT-TGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** *** * *** *** * ** * *** * CAE.EL_A GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG *** * * * * * * * ** ** ** * *** * * * CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTCGAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** * * CAE.EL_A CGCGCTTGTGAGT-TGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------- * * * *** * ** * ** ** * * ** * CAE.EL_A TT TRY.BR_A --
Mean pairwise ID: 40.13%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGG-GGGCAACAATGTGGTGGAATGTT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTT *** * *** * * * ****** * * ** * *** LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC YAR.LI_A CGA---GTCTTGGGCTCTGCACTTG----GCCA----TTTGGT-TGTCCTTTCCGAATTC * ***** ** **** ** * * *** ** *** *** * * LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA YAR.LI_A TGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * * * * ** * ** ** * * * *** * LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAG---AGCAACGA-CTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGG *** * * ** ** **** ** * *** *** * ** * ** * LYC.ES_F GATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACC YAR.LI_A GATCGCAACCAAGTGGTATAT--GTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------- **** * * **** * * * ** * * * * * * * * LYC.ES_F ATCACTTTT YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 40.13%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT ** ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGT-GCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTT LYC.ES_L GGGT-TGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC- * ** ** ** ***** ** * * * * *** * *** ****** ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC---AACACTAAAGTGGCG LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG * *** ** * * ** * * ****** ** * * * ********* * ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * ************* **** ****** *** * * **** ** ******* ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------ LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC ***** * *** * * * *** * ZEA.MA_H --------- LYC.ES_L CACCACTTT
Mean pairwise ID: 40.13%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATC-CAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT ******* ** * * **** * * * * XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT YAR.LI_B G-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACT---CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT * *** * ********* ** *** ** * * * ***** * * * XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA-- ** * ** ** * * *** * ** ** * * ** XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * ** ** * * *** *** XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC * * * * * *** * * ** * * * *** ***
Mean pairwise ID: 40.19%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_D -----------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAG * * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC LYC.ES_D CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG *** * *** * * **** * **** *** * *** ***** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** * ******************** ** ** ** *** * **** * ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAAA LYC.ES_D GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA ****** * * ** ** * * * * * * * ** * * * * ** *** ZEA.MA_A CCACCATCTTT LYC.ES_D CCACCACTTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 40.20%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG SCH.POM. ----------------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGA ** * * * *** * CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGA--CCGAGCGTCCGTGCCAA SCH.POM. AGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGA **** * * ** * * * *** **** ** * * * CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG SCH.POM. TCCCTCGATCTGCC----ACGTCTGTTCGAAGAG---TAGTCTTCGTGGCAACTGGCA-G * ** ** * * * **** ***** **** * *** ** * CAE.EL_B GTGGATGGTTCAGGACCGA--AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-GCGGTGCAGTGGCC SCH.POM. TTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGC * * ** ** ***** **** * * **** ** * * * * * *** * CAE.EL_B GGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCA-ATACCTTCAGAC-CACTT SCH.POM. AG--TGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG * **** * * ** ** * * * *** * ** * * * ** ** CAE.EL_B GTTTTT SCH.POM. GTCGTT ** **
Mean pairwise ID: 40.20%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * *********** ****** TRI.AE_B GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGGC LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG *** ** * * *** **** * * ***** * *** * ** * TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT *** * * ******* ************ ** ** ** ***** * ********** TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCACC LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACC ** ** ** ** ** **** * ** * * * ****** TRI.AE_B ATCTTT LYC.ES_D ACTTTT * ***
Mean pairwise ID: 40.20%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GCCTTC ***** * ** * **** * * * * * HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACT---CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA *** * ********* ** *** ** ** * * ***** * * HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATT-TCCGTTCTAAGA *** ** ** * * *** * * ** ** * * HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B TTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGC-GAGACCCCGTCTCT YAR.LI_B GTGGGATAGCAA-----CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCT * * * * ** * * * * ** ** ** * * * ** **** HOM.SA_A T YAR.LI_B C
Mean pairwise ID: 40.26%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT ** * * * ** * * * *** ** * * ** * * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTG---CACT-TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT **** * * * ***** * * * ** ** * ***** * *** *** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * * *** * * * ** ****** * *** * * * * ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCTTCCAACGGTG YAR.LI_A TGGGA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG ** * * * ** *** * ***** **** **** * * ***** ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAAC--TCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA YAR.LI_A GGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------- *** *** * * * * * * * * * ** ZEA.MA_G GACCACCATCTTT YAR.LI_A -------------
Mean pairwise ID: 40.26%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT ** * * * ** * * * *** ** * * * ** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATT-TGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG **** * * *** ** ** ** * * * * * * * * * * ** * ZEA.MA_B GGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAGG YAR.LI_A GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * * ** * * ** ** * * ** * * * * * * * * ** ZEA.MA_B AATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CACTTCCAACGGTGGGA YAR.LI_A GA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGA * * * ** *** * ***** **** * * *** * ******** ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA YAR.LI_A TCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTAC---GATCACGATT---------- *** * * * * ** * * * ** **** * ZEA.MA_B CCATCTTT YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 40.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC-GTCTTCT * ***** * ** * **** * * * * * * * GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG YAR.LI_A TG-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTC---TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA * *** ** **** ****** *** ** *** ** **** * * GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTG-ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGA * ** **** * * * * * * * * * GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA YAR.LI_A TTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * ** *** * * GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGA-GACCCTGTCTCC YAR.LI_A TGGGATC-----GCAACCAA-GTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-- * * * * *** * * ** * * ** *** * ** * * *
Mean pairwise ID: 40.33%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC YAR.LI_B ---------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG ****** * * * **** * ** * * * * * HUM.JA_A AGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAG-CTGCTT-GCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGA YAR.LI_B TGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGC-GG ** * ** ** * * * * ** *** * ** ** ** ** * HUM.JA_A GAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAA-GGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC YAR.LI_B TTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC-TAAGATTAACTGG * ***** * **** * * **** * * * ** *** * * HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT YAR.LI_B GATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGAT ** * * ** *** * ***** ** * * * * * ** **** HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT YAR.LI_B AGCAACAAAGTGGTATATG-----TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------ * * *** ** ** **** * **** ** * HUM.JA_A CTTTT YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 40.37%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG LYC.ES_L -GTTGGGTTGAC-CCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCA * ** ** * * * * * * * * *** * ** ** * * ** YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG LYC.ES_L AGCATGGAGTTGGATCAC---GTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAA * * *** ** ** * ** ** * ***** * * ** YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA LYC.ES_L GTGGGGTGGACTGCGT-GAGGCTGGT-TTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCT----CT * ** * ** * *** * *** *** *** * * * * * YAR.LI_B ATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATG LYC.ES_L GTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGA-GTCCAGTTAACGCCCTG--ATGGG * *** ** * * * * *** * *** ** ** * YAR.LI_B TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC LYC.ES_L CTGCTCCAACTA-----AACCACCACTTT- * * ** ** *** *** *
Mean pairwise ID: 40.38%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT YAR.LI_B ----------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTT ****** * * * **** **** * * * * * HUM.LU_C CAAC-CCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC---- YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGC---TACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTG * * * * ** * * ** * *** * ** ** **** * HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAA-GGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG YAR.LI_B CGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACT *** * ***** * *** * * **** * * * *** * * HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA-CTACCTCCCGCT--CTCGGCAGTGGA YAR.LI_B GGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG * ** * * ** *** * ***** ** * * * *** *** **** HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA---CGACTCTC------ * *** *** ** * * * * *** ****** HUM.LU_C ACCATTTCTTTT YAR.LI_B ------------
Mean pairwise ID: 40.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAAC--CTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG SCH.POM. -------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAG-TACTCCCAATA ***** ** * * * ** ** * * ** ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA SCH.POM. GTGCATGTTCGGT---GGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCAC * * ** * * ** * *** * * * * * * * * * * * *** ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA SCH.POM. GTCTGTT-CGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAA---CTGG---CAGTTAAACC--GTGTAGTA ** *** * ** * *** * ** **** *** *** * * * ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA SCH.POM. CCGATGG----AGGTTGGA--AACAATGCAC--ATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA **** *** *** *** *** ****** * * * * *** ** ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC SCH.POM. TAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGG----AAGTATAAACACAACGGTCGT * ** * * * *** * * ** ** * * * * * * ZEA.MA_F CATCTTT SCH.POM. T------
Mean pairwise ID: 40.40%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * * CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** ** * *** *** * ** * *** * CAE.EL_D GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG *** * * * * * * * ** ** ** * *** * * * CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTGCAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** ** * * CAE.EL_D CGCGCTTGTAAGT-TGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----- * * * ** * ** * * ** * * ** * ** CAE.EL_D TT TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 40.45%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC YAR.LI_A ----------CTTAG--CTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTG * * * ****** * * * **** **** * * * *** HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAG-A YAR.LI_A TGCGT-TCGAGTCTTGGGCTCTGC-ACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG ** * * ** * ** * ** * ** ** ** **** * * HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAG-GTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA YAR.LI_A GTTGA--TGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTG--AGATTTCCGTTCTAAGATTAA ***** ** * * *** * ** ***** * ** * * ** ** HUM.JA_B -TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACCTCCCGCTCTCGGCA--GTGGAAGG YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGG ** * * ** ** **** ** * ** ** * ** * * ** ** HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC YAR.LI_A ATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------------ ** * * *** * ** ** ** ** * HUM.JA_B ATTTCTTTT YAR.LI_A ---------
Mean pairwise ID: 40.47%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGTCTTCT * ***** * ** * **** * * * ** * ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_A TG-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA * *** * **** ****** * ** ** *** * ** ***** * * ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_A T-AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATT-TACGATCACGATT-- * * * * * * * * *** * ** ** * * *
Mean pairwise ID: 40.47%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGG-GCAATAAGGTAGTGTGGATGT *** ** * ** *** **** **** ** *** * * * *** * * HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ZEA.MA_H CAATTGTGGT-GCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAG * *** * ** * ** * ****** * * * *** ** * *** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG ** * * * ** * ** * ** * * *** * ** * HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGTGGAA * * *** ** * ** * * * * ** * *** **** * HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ZEA.MA_H GGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------- * * ** * ** ** ** * *
Mean pairwise ID: 40.51%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG * * FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGG-TGTCCGTACTAAG LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTT---GGGTTCGGTAGGCT-TATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG * **** * *** ** *** * * ** * * * ** ** ** * *** FUG.RUB. TTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * * * * *** * ** ** ** * * * * ***** * ** FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** * * *** ** ** **** * *** *** * * **** * FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTT--CAACCTGAGTAACA----CAGCGGG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** ** * **** * ***** * ** * FUG.RUB. ACTCAGTCTTT LYC.ES_L ACCACCACTTT ** ****
Mean pairwise ID: 40.52%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** *** * * ** ***** *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT YAR.LI_B TG-CGTTCGAGTTCTG--GACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT * ** ** ** * * * * ******* ** * * ** **** * ** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA YAR.LI_B CTGCGGTT-GATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * * * * *** * ** ** * * *** * * ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA YAR.LI_B AACTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAA--TCCAGCAGA-GATCCAGTTGCCGTGGGTA ** * ** * ** ***** **** * * ** * * * * * ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTG-GACCAT YAR.LI_B TGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCT * *** * * * ** **** * * * * ** *** * ARA.TH_C CACTTT YAR.LI_B C----- *
Mean pairwise ID: 40.58%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC * * ** * * *** * * * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG-T SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGG--TGGTCTCG----GGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGAT ** * * ** *** **** * ** ** * * * ***** * * ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG-GCA SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGA-----AGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA * ***** * ** * * *** * * * * ** * ** * * ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA SCH.POM. GTACCGATG-GAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGA * * * * *** *** *** *** ****** * * * *** ** ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA SCH.POM. ---TAGCGATGGGATTCACCTT---CGCAGGATGTGCATGGAAG---TATAAACA--CAA ** * * * * *** ** * ** * * ** * * * ** * * ZEA.MA_B CCATCTTT SCH.POM. CGGTCGTT * ** **
Mean pairwise ID: 40.59%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA YAR.LI_B TGCGTTC---GAGTTCTGGACTC--TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT ** ** ** *** ** ** ** * * ** ** *** *** * * LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA YAR.LI_B GCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * * *** * * * * * ** ***** **** * * * * LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_B CTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG----GGTATGGCGG * * * * ** *** * * * *** ** * * LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC YAR.LI_B TGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACTCTC **** * * **** ** * *** * **** * * ** * LYC.ES_A TTT YAR.LI_B ---
Mean pairwise ID: 40.66%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAA-TGTGGTGGAATGTT LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-- * * * ******* *** * * * * ** * LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LEI.MAJ. GACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC * ** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LEI.MAJ. GGTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAA * *** * ** *** * * *** * *** * * * * * LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTC-TAAGCGGTGGAAGGAT LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAAT * ** **** ** ** ***** * * *** * * ** ** * ** ** LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA LEI.MAJ. CACACCGCGGAGCA---TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCG---TCGCGAAGCCTT-- ** *** * ** ** * *** * * * * ** ** LYC.ES_B CTTTT LEI.MAJ. -----
Mean pairwise ID: 40.67%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGCCTTCT ***** * ** * **** * * * * * * HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_B TG-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA * *** ** ********* ** * ** ** ** * * ***** * * HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT- YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGGTATT-TGCAATCACGACTCTC * * * * * * * * ** ** * * * ** ****
Mean pairwise ID: 40.71%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** ** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAG LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAA ******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * * * ** * ZEA.MA_D ACCACCATCTT- LYC.ES_D ACCACCACTTTT ******* **
Mean pairwise ID: 40.71%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC * * ** * * *** * * * * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGG--GCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGA---------GTCTCGCTTTCGATCCCTC ** * * ** * * *** *** * * **** * ** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG SCH.POM. GATCTGCCACGTCTGTTCGA------AGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCG * * ***** * * ** * * *** * * * * * * ** ZEA.MA_A -GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG SCH.POM. TGTAGTACCGATG-GAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTG--GGCA * ** * * * *** *** *** *** ****** *** ** ** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA SCH.POM. GTGCGATAGCGATGG-GATTCACCTT--------CGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAAC * **** *** * * * *** ** * **** * * * * ** * ZEA.MA_A ACCACCATCTTT SCH.POM. ACAACGGTCGTT ** ** ** **
Mean pairwise ID: 40.71%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT ** * * * ** * * * *** ** * * ** * * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTG---CACT-TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT **** * * * ***** * * * ** ** * ***** * *** *** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * * *** * * * ** ****** * *** * * * * ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CGCTTCCAACGGTG YAR.LI_A TGGGA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG ** * * * ** *** * ***** **** * * *** * * ***** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAAC--TCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA YAR.LI_A GGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------- *** *** * * * * * * * * * ** ZEA.MA_D GACCACCATCTT YAR.LI_A ------------
Mean pairwise ID: 40.73%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** * *** * * * * *** *** * ***** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** ******* * * * *** *** *** * * * LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * * LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC YAR.LI_A TGGGAAAC-----TTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGC ** * * ** ****** ** * ** * * * * ** * LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT YAR.LI_A -----GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT- **** ** * * *** ** * * * * *** *** LYC.ES_I TT YAR.LI_A --
Mean pairwise ID: 40.73%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * * ***** *** * ***** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** ******* * * * *** *** *** * * * LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * * LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC YAR.LI_A TGGGAAAC-----TTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGC ** * * ** ****** ** * ** * * * * ** * LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT YAR.LI_A -----GGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT- **** ** * * *** ** * * * * *** *** LYC.ES_N TT YAR.LI_A --
Mean pairwise ID: 40.79%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGG--CATGTGGGAGATGGGACTTTGGG YAR.LI_A --CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAG * **** *** * * * ***** * * * * ** * ** * * HUM.JA_A TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAG YAR.LI_A TC------TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCC-TTTCCGAATTCTG---CGGT ** **** * * * * ** *** * * * **** ** HUM.JA_A AGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAA-GGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCA YAR.LI_A TGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC-TAAGATTAACTGGG * ***** * **** * * **** * * * ** *** * * HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA YAR.LI_A AAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATC * * * ** *** * ***** ** * * * * * ** **** HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC YAR.LI_A GCAACCAAGTGGTATATG-----TTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------- * *** ** ** **** * * * ** ** HUM.JA_A TTTT YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 40.80%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT SCH.POM. -------------------CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT ***** * * * *** * * ** ** HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * * * * ** *** * *** * * * **** * * * * * HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA-------- * * * * ** ** * * ** * * * * ** HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** *** ** *** * * * **** ** HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT * *** ** ** * ** *** * * * *** * * * *** *
Mean pairwise ID: 40.84%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCC * * ** * * *** * * * ** ZEA.MA_G TTGCGATG---GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC SCH.POM. CAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTG--C ** * * *** * **** *** ** ** * * * * * * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT SCH.POM. CACGTCTGT----TCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACT---GGCAGTTAAACCGTGTAGT ** ** ** * * * ** * ** * ** * * * * * ** *** ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG SCH.POM. ACCG---ATGG----AGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTG--GGCA * **** *** *** *** *** ****** ** * * ** ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA SCH.POM. GTGCGATAGCGATGGGATTCACCTT---CGCAGGATGTGCATGGA-----AGTATAAACA * **** ** * * *** * * ** ** ** * ** * * ZEA.MA_G CCACCATCTTT SCH.POM. CAACGGTCGTT * ** ** **
Mean pairwise ID: 40.85%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG ** ****** ****** ** ARA.TH_F TG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * *** * * * * * ***** * * *** * *** * * ** ** ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA TRI.AE_C CACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * ***************************** *** ******* ** * ***** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC TRI.AE_C TAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG---ACCAC * **** * * ** ** ***** * * * ** ***** ARA.TH_F CATTTT TRI.AE_C CATC-- ***
Mean pairwise ID: 40.89%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGT-------AAATCGTCTTCTTGTT ** * * * ** * * * *** ** * * ** * * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA YAR.LI_A GTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTG---CACT-TGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT **** * * * ***** * * * ** ** * ***** * *** *** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * * *** * * * ** ****** * *** * * * * ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCCG-GCTTCCAACGGTG YAR.LI_A TGGGA-AACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG ** * * * ** *** * ***** **** * * **** * * ***** ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAAC--TCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA YAR.LI_A GGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT---------- *** *** * * * * * * * * * ** ZEA.MA_E GACCACCATCTTT YAR.LI_A -------------
Mean pairwise ID: 40.91%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG ** ****** ****** ** ARA.TH_A TG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCA * *** * * * * * ***** * **** * * * ** ** ** ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG ** * ***************************** *** ******* ** * ***** * ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG---ACC *** **** * * ** ** ***** * * * ** *** ARA.TH_A ACCATTTT TRI.AE_C ACCATC-- *****
Mean pairwise ID: 40.93%
TRY.BR_B AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCT-TCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCT *** * * * **** * * * ** ** * * *** ** * TRY.BR_B GGAC---AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCT-TGGTTGCGTGTCGGT YAR.LI_B GGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCG **** * *** * ** * ** * * ****** * * ** * *** TRY.BR_B GTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAG YAR.LI_B GTCTGAGTAATCGGCTTTGAGA------TTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAG ** ** * * **** * ** * * * * ** * **** TRY.BR_B GCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA YAR.LI_B TGGAGCAATCCAGCAGAG-ATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGT * * ***** * * * *** * ** * * * * * * * TRY.BR_B TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT YAR.LI_B GGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--- * * ** * ** ** *** *
Mean pairwise ID: 40.97%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC LYC.ES_L -----------------------------------------------------GTTGGGT * *** DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC LYC.ES_L TGA--CCCAGATG-GTTGGGT--TCGGTAGGCTTATAGTC-TGGCCTGCCCTCTCCAAGC *** * *** ** ** * *** ** * ** * ** * * **** DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGA-GGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG ** * *** * * * * * * *** * * * * **** * *** DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG ** ** * * *** *** * **** * ** ** * *** * ***** * * DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTG----GACTGCCGTTATCAGCCCAA----CCGATATGGTTGGAC LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC **** ** * * * ** * * **** * ** * * * * * ** DRO.MEL. CACAATCTTT LYC.ES_L CACCACTTT- *** * **
Mean pairwise ID: 40.98%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ** ** *** * * ** ***** *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT YAR.LI_A TG-CGTTCGAGTCTTG--GGCTCTGCACTTGGCCAT---TTGGTTGTCCTTTCCGAATTC * ** ** * * ** * * * *** ** *** ** * * ** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA YAR.LI_A TGCGGTTGATG--GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * ***** * * * *** * ** ** * * *** * * ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATC-----CAGTTGCCGTGGGTATGG ** * * * ** ** **** * * * *** ** ** * * ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC YAR.LI_A CGGTGGG--ATCGCAA-CCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATC--ACGATT *** ** ** ** ** **** * * **** ** ** ARA.TH_C ACTTT YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 40.98%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC TRY.BR_A ---------------AGC--CGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTG-ATCCCG *** * * ** ***** * * * * * ** * DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTA---GCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA TRY.BR_A CTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG ** **** * ** * * ** * ****** ** * * DRO.MEL. A--GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGT-TGGCTAAGG TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG----AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG ** ** * * ** **** * *** *** *** * * *** * DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG TRY.BR_A TGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA----CCTTGCGCACGTTCCCGT *** **** *** **** * * ******* * * * * * DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA TRY.BR_A TCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG * * *** **** * * * * * * ** * * * * ** * * DRO.MEL. TCTTT TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 40.98%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG SCH.POM. ---------CGCTGTAATGGCTTG---GTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGT ** * ***** *** * ** * ** *** *** CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGA--GCGTCCGTGCCAA SCH.POM. TCGGTGGTCTCGGGTTC-GAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAA * * * ** * * ** * * * * * **** * **** ** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGG-GTGCATAAGGAGT SCH.POM. GAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTT--AAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAAC * * * * * * ** ** ** **** *** * * * * CAE.EL_D CGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAG-CAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC SCH.POM. AATGCACA--TCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCA ** * *** **** * * *** * * ***** * * * * ** CAE.EL_D GGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTAT SCH.POM. GGAT-GTGCATGGAAGTATAAACACA---ACGGTCGTT---------------------- *** * ** ** **** * ***** ** * * * CAE.EL_D CATTT SCH.POM. -----
Mean pairwise ID: 40.98%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** ***** ****** * ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * * LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************ ************ ** * ****** * *********** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCAT * *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** *** LYC.ES_H CTTTT TRI.AE_C C---- *
Mean pairwise ID: 41.00%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * * CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** * CAE.EL_B GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * ** CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** * * CAE.EL_B TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT TRY.BR_A CACACCGAGGAGC--ATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ * * *** * ** ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 41.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** ** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAG LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAA ******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * * * ** * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT LYC.ES_D ACCACCACTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 41.03%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC YAR.LI_B ---------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG ****** * * * **** **** * * * *** HUM.JA_B GGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAG- YAR.LI_B TGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGC---TACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGC ** * ** *** * * * * * ** * ** ** **** * * HUM.JA_B AGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAG-GTCTGGCTTGGTCAGCTCC----TAAAGCGGAG YAR.LI_B GGTTGA--TGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC ***** ** * * *** * ** ***** * * *** *** * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCA--GTGGA YAR.LI_B TGGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGAT--CCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGT * ** * * ** *** * ***** ** ** ** * ** * * ** HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG YAR.LI_B GGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------ ***** * *** * ** ** * ****** HUM.JA_B ACCATTTCTTTT YAR.LI_B ------------
Mean pairwise ID: 41.04%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAA-TGTT SCH.POM. ----------------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTT * * ** **** *** **** LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC SCH.POM. TAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCT ** * * * * * * ** ** **** * ** * ** ** * * LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC--CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG SCH.POM. CGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAG ** ** * ** ** * * * * * ** **** *** * * * * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA SCH.POM. TACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-ACTA--CCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAG ** * **** *** ** * ** * **** ** * ** ****** * LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT SCH.POM. CGATGGG---ATTCACCTT----CGCAGGATGTGCATGGAAGTATA---AACACAACGGT * *** * * * ** * * * * ** ** * ** *** * LYC.ES_F CACTTTT SCH.POM. CGTT--- * *
Mean pairwise ID: 41.06%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG---GAG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCAATAAGGTAGTGTGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** ** * RAT.NOR. GATCGATTG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGC-CTGGGTC-TAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTC ** **** ** ** * * ***** ****** * * * * * ** * RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA ZEA.MA_H CAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGT ***** * * * ** * ** * ** * * *** * RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT ZEA.MA_H GGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGGT ** * * * *** ** * ** * * * * ** * *** ** RAT.NOR. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCT ZEA.MA_H GGAAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------- ** * * * ** * ** ** ** * RAT.NOR. CT ZEA.MA_H --
Mean pairwise ID: 41.08%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGTAA-ATCGCCTTCTTGTTG-TGCG ***** * * **** * *** ** ** * *** * *** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT YAR.LI_B T----TCGAGTTCTGGACT--CTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG * ** ** * * ** * ** * * ******** *** *** * ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCC-GTTCTAAGATTAACTG * * *** *** ** * * *** ** * ** * * * * * * * * ZEA.MA_C GAACGGC---GTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA YAR.LI_B GGATACTTCAGTGGAGCAATCCA-GCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT--ATGGCGGTGGG * * *** ** ** ***** * * * * ** * ****** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAG--CATGGGCT-CGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC YAR.LI_B ATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--------- * **** * * **** ** * **** ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 41.14%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAA-TCGTCTTCT * * ***** * ** * **** * * * * * * HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_A TG-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA * *** ** **** ****** * ** ** *** * ** ***** * * HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_A T-AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT YAR.LI_A GTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTA---TGGAAGATATT-TACGATCACGATT-- * * * * * * * * ** * ** ** * ** *
Mean pairwise ID: 41.16%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG * **** * *** * * **** ** * * * ** ** * * *** RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * ** RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** * RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGGGCAACATAGCGAGA LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** * * ** * * *** ***** * * RAT.NOR. CCCGTCTCT-- LYC.ES_L ACCACCACTTT ** * **
Mean pairwise ID: 41.16%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC LYC.ES_M -------------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG ** *** * * *** DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCT---CATGTTGACGGAACGTCCGCACT LYC.ES_M GAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCC * **** * * * * ** ** * * * * ** ** * ** * DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG LYC.ES_M AAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG **** * * * * * ** *** *** * * **** * * DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG ** * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** * DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * * DRO.MEL. CCACAATCTTT LYC.ES_M CAACCACCTTT * ** * ****
Mean pairwise ID: 41.18%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ***** ***** ****** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC LYC.ES_D GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTA-AAGCGGGGCGG **** ** *** * ** * *** *** *** ** ** ***** * CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** * ******* ********** * *** * *** **** * ********** CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACC * * *** ** * * * * *** ** ** ** * ***** ** ** CIN.HYB. ATTT-- LYC.ES_D ACTTTT * **
Mean pairwise ID: 41.20%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GCCTTC ***** * ** * **** * * * * * CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_B TTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTC---TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAA *** ** ********* ** *** ** ** * * ***** * * CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_B TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** * * CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA YAR.LI_B T-AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCG * *** ** * ** * * * ** * *** ** * *** *** CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGC-GAGACCCCGTCTCT YAR.LI_B GTGGGATAGCAA-----CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCT * * * * ** * * * * ** ** ** * * * ** **** CAN.SPE. - YAR.LI_B C
Mean pairwise ID: 41.23%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG ** ****** ****** ** ARA.TH_D TG-AGTAATCTGTGTGGGTC--AGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCA * *** * * **** * * ***** * *** * *** *** ** ** ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG ** * ************ **************** *** *** *** ** * ***** * ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC---GACC *** * * ** * * ** ** **** * * ** * **** ARA.TH_D ACCACTTT TRI.AE_C ACCATC-- ****
Mean pairwise ID: 41.25%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA YAR.LI_A TGCGTTC---GAGTCTTGGGCTC--TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT ** ** ** ******* ** *** * * * ** *** *** * * LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA YAR.LI_A GCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * * *** * * * * * ** ***** **** * * * * LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG----GGTATGGCGG * * * * ** *** * * * *** ** * * LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC YAR.LI_A TGGGATCGCA----ACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT--- **** * * ***** ** * * * * * ** * * * LYC.ES_A TTT YAR.LI_A ---
Mean pairwise ID: 41.26%
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC ZEA.MA_H ------NCCGAGCTCTGTAGC----GAGTGCTTGT-AACCCGAGCGGGGGCAATAAGG-- * ******** * * * *** * * ******* * ** LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTGGCT ZEA.MA_H TAGTGTGGATG-TCAATTGTGGTG-CATG-TGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGAC ** * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** ***** LEI.MAJ. TGCCCCCCTGCAGAGG-GTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGGCC ZEA.MA_H CACCCATTCCAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATC---CC *** ** * ** * * * ** * * **** * * ** ** LEI.MAJ. GGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCATG ZEA.MA_H AACACTAAAGTGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGA-GTACCGCCCG * ** ** ** ** * * * * * *** * * ** * LEI.MAJ. TCCGCACTTG-AGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--------- ZEA.MA_H CCACCAGCGGTGGAAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT * ** * * * * ***** * ** *
Mean pairwise ID: 41.30%
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGG--CTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCT SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTC-GAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCAT-GTTCGGTGGTCT ** * * * *** ** * * ** * * ** ** * * ** **** TRY.BR_A TGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT SCH.POM. CGGGT---TCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTC ** * * ** ** ** * ** * * * * * * * ** * ** TRY.BR_A GAGGTCGCCACTG-TAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGC SCH.POM. TTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAG-GTTGGAAACAATGCACAT ** ** **** ** * * * * * *** * ** * ** *** ** TRY.BR_A CGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATC SCH.POM. CACTACCGGG-----TCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGGATGTG * * *** * * ** * ** * * * ** * * TRY.BR_A TCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG SCH.POM. CATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT--------- *** * * *** *****
Mean pairwise ID: 41.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG * * * * ******* * **** * *** * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG ** **** * * *** ** * * * * ** * * * ** * LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAAC *** * ** ** * * ** *** ** * * *** * ** LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATCA * ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** ** * LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LEI.MAJ. CACCGCGGAGCATGTCCG----CACTTGAGCCCCACGCTTCGTC---GCGAAGCCTT--- * *** ** * * ** * *** * * ** * ** * LYC.ES_E ATTTT LEI.MAJ. -----
Mean pairwise ID: 41.31%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GTCTTC * * ***** * ** * **** * * * * * HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCT---CTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA *** * **** ****** *** ** *** * ** ***** * * HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCC----TAAGGA YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** **** HOM.SA_A GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG YAR.LI_A TAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGG ** *** * ** ***** * * * ***** ** * * HOM.SA_A TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGT YAR.LI_A TGGGATCGCAACCA--AGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------ ********* * * * * ** * * * * * ** *** HOM.SA_A CTCTT YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 41.33%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * *** * * * CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** * CAE.EL_C GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * ** CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGT--TCGAGA * * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** CAE.EL_C AGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ *** * * * ** ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 41.35%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG--GAT *** * ** ** * ******** ** * *** ** ** * * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * * * ** ** * * ** * ** ** ** * *** ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAG CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTT--AGTCCCGGGTGCA-TAAGG ** ** ** ** *** * ** * *** * ** ** * ARA.TH_C TGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGT CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA---AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * ** * * * * * ***** * * **** * ** ARA.TH_C GGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTG CAE.EL_A GGCCGGACCGCGC-TTGTGAGTTGACACACATAC-GCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC ** *** ** * * * * ** ** * ** * ARA.TH_C GACCATCACTTT CAE.EL_A ACTTATCATTT- **** **
Mean pairwise ID: 41.37%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * * * * * HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** * * * * ** ** ** * * * * * ** * ****** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT ** * * * *** ****** * * * * *** *** * HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG * * * * * * * ***** * * * **** ******* ** HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT CAE.EL_D ACCGCGCTTGTAAGTTGAC-ACACATACACAGCCTTCTCG-ATACCTTCAGACCACTTAT * ** * * * * ** * * * ** * * * ** HUM.JA_A CTCTTTT CAE.EL_D CATTT-- * **
Mean pairwise ID: 41.39%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * * CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGT-TGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** *** * *** *** * ** * *** * CAE.EL_A GCTACGTCACCAG-GGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-GTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG *** * * * * * * * ** ** ** * *** * * * CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTG--CGCACGTTCCCGTTGCAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** * * * ** ** * * CAE.EL_A CGCGCTTGTGAGT-TGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----- * * * *** * ** * ** ** * * ** * ** CAE.EL_A TT TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 41.40%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT ***** * * **** * *** ** * * * * * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTG---CACTGGGCTACTTTG-TTGTCCTTTCCGAATTCT **** * * ****** * * * * ** * ***** * *** *** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * * *** * * * ** ****** * *** * * * * ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCTTCCAACGGTG YAR.LI_B TGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG ** ** * * ** *** * ***** **** **** * * ***** ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTC---GAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC YAR.LI_B GGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------- *** *** * * * * ** * * * ** *** ZEA.MA_G AGACCACCATCTTT YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 41.42%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT LYC.ES_L --------------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGA * ** * ** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG LYC.ES_L TGGTTGGGTTCGGTAG-----GCTTATAGTCTGGCCTGCCC------TCTCCAAGCATGG * *** * * * ** * * *** * **** *** ** * GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG LYC.ES_L AGTTGGATCACGTGGCTTAGTC---GAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGGGG * **** * * ** * * ** * ** * * ** ***** * **** GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG ** ** * *** ** ** ***** * * ** *** * * **** * GAL.GAL. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTA-GCC----TGGGCAACAT-AGCGAGAC LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC *** ** * * *** *** * * *** * *** ***** * * * * ** GAL.GAL. CCTGTCTCC LYC.ES_L CACCACTTT * **
Mean pairwise ID: 41.45%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATC--GTCTTC * ***** * ** * **** * * * * * CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG YAR.LI_A TTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTC---TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAA *** ** **** ****** *** ** *** * ** ***** * * CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCC----TAAGGA YAR.LI_A TTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT *** ** ** * * *** * * ** ** ** **** CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG YAR.LI_A TAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGG ** *** * ** ***** * * * ***** ** * * CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGT YAR.LI_A TGGGATCGCAACCA--AGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------ ********* * * * * ** * * * * * ** *** CAN.SPE. CTCT YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 41.46%
TRY.BR_B ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG-TCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGT *** * * * **** * * * * * ** * * *** ** TRY.BR_B CTTGGAC-----AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTG-CGTG YAR.LI_A CTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTC ***** * * ** ** **** * * * * * *** * * *** TRY.BR_B TCGGTGTTGA-GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACG YAR.LI_A TCGGTCTGAGTAATCGGCTTTG-AGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTG ***** * *** * ** *** ****** * * * TRY.BR_B GGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGA YAR.LI_A GAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTT-GCCGTGGGTATGG---CGGTGGGATCGCA-ACCAA * ** ** * * *** ** ** * * * ** ** *** *** * TRY.BR_B GGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT YAR.LI_A GTGGTATAT----GTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------ * * ** * * ** * * ** ***
Mean pairwise ID: 41.46%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT ***** * * **** * *** ** * * * * ** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG--GCTACTTTG------TTGTCCTTTCCGAA **** * * ****** * *** ** * * ** ** *** ** * ** * ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC YAR.LI_B TT--CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAG ** * * ** **** * * ** * ** * * * * ZEA.MA_A AGGAA-TGGCGTAAGGC--TGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCCG-ACTCCCAACG YAR.LI_B ATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCG * ** *** ** * *** * ***** **** ***** ** ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGC-TGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAA YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---- ****** *** *** * * * ** * * *** ** ZEA.MA_A GCAAACCACCATCTTT YAR.LI_B ----------------
Mean pairwise ID: 41.46%
PER.AME. GATCCGTAACGCGAGCTTATAACTCGAGCGGGGGCTATAAAGGTGGTGTGGAACGAGCTG MUS.MU_A -GCCTGTAGTTCCAGCT----ACTCG---GGAGGCTGAGACAGGAGGATCGCTTGAGTCC * *** * **** ***** ** **** * * * * * *** PER.AME. ACTCGACCTGCCGGGTTGGGCCAGGGACTGCGGTGCTGGCTCGCCCGTTCCAAGTCGGGT MUS.MU_A AAGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-----GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTTCGGC * * *** ** * ** ** * * * * * *** * **** ** PER.AME. AGTGGGCCATGTGGCTTGGGCGAAGGCCTGGGTTTCTTGGCC-- MUS.MU_A AACAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAAGTTGC * *** * * * ** ** * *
Mean pairwise ID: 41.48%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA-ATCGTCTTCTTGTTGTGC-- ** ** * ** * * * **** * ** * ** * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG YAR.LI_A GTTCGAGTCT-----TGGGCTCTGCACTTGGC-CATTT---GGTTGTCCTTTCCGAATTC ***** *** ** **** ***** *** ** ** ** *** * * ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAG-GCTTGGCTCAAACGGCT----TCTAAAGTTGG YAR.LI_A TGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA ** * ** * * ** ** * ** * **** * * ***** ** ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG YAR.LI_A CTGGGAA-ACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTA-TGGCGG ** ** * * ** *** * ***** ** * * ** *** * * ** ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------- ***** ** ** * * * * **** ARA.TH_E ACCACCATTTT YAR.LI_A -----------
Mean pairwise ID: 41.48%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG * **** * *** * * ** * ** * * * ** ** * * *** ORI.CUN. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * ** ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** * ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGGGCAACAT-AGCGAG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** * * ** * * *** ***** * * * * ORI.CUN. ACCCTGTCTCC LYC.ES_L ACCACCACTTT *** **
Mean pairwise ID: 41.48%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** ** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_D GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ********************** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_D GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAA ****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * * * ** * * ZEA.MA_G CCACCATCTTT LYC.ES_D CCACCACTTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 41.58%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG * * * * ******* * **** * * * * * * LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG ** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * * * LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAAC *** * ** *** * * *** * *** * * * * * LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTC-TAAGCGGTGGAAGGATAA LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCC-CACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCA * ** **** ** ** ***** * * *** * * ** ** * ** ** * LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT LEI.MAJ. CACCGCGGAGCA---TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT---- * *** * ** ** * *** * * * * * * * ** LYC.ES_N TTT LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 41.61%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACA-ATAAGGTGGTGGAACAGT LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * * *** *** * *** * ** ** ** ARA.TH_D GGTTCAATTC--CTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAG LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGG---TGCTCTGCTTGGCTGTGT ** * * ** * * * **** * ** **** * ARA.TH_D CTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGC-CCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * *** ** * *** * * ** * * * * * ** *** ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTA-CAGCAGTGGAT LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** ** **** ** ** ******* * ** ** * * * ** ** * ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCC-GCTGGTTCGATCTCTCCTGGA LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCA--TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- * * ** * ** ** ** *** ** ** * *** * * * * * * * ARA.TH_D CCACCACTTT LEP.COL. ----------
Mean pairwise ID: 41.64%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC YAR.LI_B -------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTT ******* * * * **** * * * * FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT YAR.LI_B G-TTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCT---GCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAAT * *** ** ********* ** * *** * * * ***** * * * * FUG.RUB. TCGGTA-TCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCC----TAAGGA YAR.LI_B TCTGCGGTTGATG-GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT ** * * *** ** * * * *** * ** * ** **** FUG.RUB. GGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG YAR.LI_B TAACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCGG ** *** * ** ***** * ** ***** * * * FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTG-AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAG YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGG---AAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-- ****** ** * * ** * * * * * ** * * * ** *** FUG.RUB. TCTTT YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 41.64%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGG-GCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT SCH.POM. ----------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTG-CATGTT * ** ** *** * * * * * * * * * * * ** TRY.BR_B GGACAAGCGGGGGTTCT-GTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT SCH.POM. CGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCT--TTCGATCCCTCGATCTGCCACGT-CTGTTCGA * * ****** ** ** * * * * * * * *** * * TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTC-AGGC SCH.POM. AGAGTAGTCTTCGTGGCAA--------CTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGT ** * * ** * * * ** ****** * * * ** * * *** TRY.BR_B CGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATC SCH.POM. TGGAAACAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGA--TGGGATTCACC ** ** *** *** * * * * *** *** * * ** * TRY.BR_B TCAGGACTTTGCGCCCC-AAGTGTCGTCGCGA-GGCGGTTT SCH.POM. TTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT- * * * ** ** **** * * * * ** ***
Mean pairwise ID: 41.67%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG--GAT *** * ** ** * ******** ** * *** ** ** * * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * * * ** ** * * ** * ** ** ** * *** ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAG CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTT--AGTCCCGGGTGCA-TAAGG ** ** ** ** *** * ** * *** * ** ** * ARA.TH_C TGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGT CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA---AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * ** * * * * * ***** * * **** * ** ARA.TH_C GGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTG CAE.EL_D GGCCGGACCGCGC-TTGTAAGTTGACACACATAC-ACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC ** *** ** * * * * ** * ** * ** * ARA.TH_C GACCATCACTTT CAE.EL_D ACTTATCATTT- **** **
Mean pairwise ID: 41.67%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTG-CCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT LEP.COL. GCCGGA-GCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG--AGCTGTC ***** * ** ** *** ** * * ** ** * FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTG-GGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG * *** *** ** *** * ** * * * ** *** ** * FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG LEP.COL. GCC-----TCCGGGTGCC-CCCTTGCAGAAG---GGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGA * ** ** * * ** * ** *** * ** ** *** * * FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG LEP.COL. G-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGA * * * ** **** *** **** ***** ** * * * * * * ** * * FUG.RUB. ATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT------ * * * ** ** * * * ** * * * * * **
Mean pairwise ID: 41.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT SCH.POM. -------------------CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT ***** * * * *** * * ** ** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * ** * * ** *** * *** * * * ***** * * * * * HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA-------- * * * * ** ** * * ** * * * * ** HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC---ACTACCG-GGTCTTGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** ** *** *** * * * * **** ** HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATA--AACACAACGGTCGTT * *** ** ** * ** *** * * * *** * ** ** **
Mean pairwise ID: 41.78%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- *** * * * ***** * * ** *** * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGCGT * *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC TRY.BR_B GTCGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA * * * * * * * ** * * * * * * ***** **** *** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACA ** * **** ** * ** ****** ** * * * * * * **** * * LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC TRY.BR_B CCGAGG-AGCATCTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT- * * * *** * * ** **** * * ** * * * * LYC.ES_K CTTT TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 41.78%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** ******* * * * *** *** *** * * * LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA YAR.LI_A CGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * * LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAG--AGATCCAGTT----GCCGTGG--GTATGG ** * * ** ** *** ** *** * * ** **** * ** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC YAR.LI_A CGG-TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT--- ** * ** * ***** ** * * * * * ** * * * LYC.ES_H TTTT YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 41.80%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAA----ATCGTCTTCTTGTTGTG ** * * * ** * * * *** ** * ** * * * ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT YAR.LI_A CGTT--CGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCC--ATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG * * ** ***** * ** * * *** ** **** *** *** * ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG YAR.LI_A GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCC-GTTCTAAGATTAACTG * * *** *** ** * * *** ** * ** * * * * * * * * ZEA.MA_C GAACGGC---GTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA YAR.LI_A GGAAACTTCAGTGGAGCAATCCA-GCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT-----ATGGCGGT * * *** ** ** ***** * * * * ** * ** ** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA YAR.LI_A GGGATCGCAACCAAGTGGTATATG-------TTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-- **** ** * * ** *** *** ** * * ** * * ZEA.MA_C CCACCATTTTT YAR.LI_A -----------
Mean pairwise ID: 41.81%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT *** **** * * * *** * * ** ** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * * * * ** *** * *** * * * ***** * * * * * CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA-------- * * * * ** ** * * ** * * * * ** CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** *** ** *** * * * **** ** CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT * *** ** ** * ** *** * * * *** * * * *** *
Mean pairwise ID: 41.83%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * ** ***** * * * * **** * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCA-----GGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG-- * ** * ** * * *** * * * * * * * ** *** * RAT.RAT. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG LEP.COL. ------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGT **** * **** ** * * **** * ** * *** RAT.RAT. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG LEP.COL. AGAGG--AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTG ** ** *** ** **** *** ********** ** * * * * * ** * RAT.RAT. TGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCG LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- * * * * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** * RAT.RAT. TCTCTT LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 41.83%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGAT-GGTGGGACACT LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * * * ******* * *** * * * * * *** ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT LEI.MAJ. CGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGTGT ** * ** * ** ** * * ** * ** **** * * ARA.TH_F GTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LEI.MAJ. CGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGT--CCGCCGTTGAAGC--GAGGGA * ** * * * *** ** * * * * ** ***** ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGACGGA LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA * * ** **** ** ** ******* * ** * *** * ** ** * * * ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG---TCGCG-AAGCCTT **** * * ** * **** *** * * ** ** * ** ARA.TH_F CATTTT LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 41.88%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ***** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG ***** * * *** *** * *** ** *** * * ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********************** ** * ******* ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAC-TAAACCA * * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** * * ***** ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_D CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 41.90%
TRY.BR_A ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCG-TCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGT *** * * * **** * * * * * ** * * *** ** TRY.BR_A CTTGGAC-----AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTG-CGTG YAR.LI_A CTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTC ***** * * ** ** **** * * * * * *** * * *** TRY.BR_A TCGGTGTTGA-GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACG YAR.LI_A TCGGTCTGAGTAATCGGCTTTG-AGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTG ***** * *** * ** *** ****** * * * TRY.BR_A GGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGA YAR.LI_A GAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTT-GCCGTGGGTATGG---CGGTGGGATCGCA-ACCAA * ** ** * * *** ** ** * * * ** * * *** *** * TRY.BR_A GGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG YAR.LI_A GTGGTATAT----GTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--- * * ** * * ** * * ** ***
Mean pairwise ID: 41.91%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATC-CAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT * ******* ** * * **** * *** * XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT YAR.LI_A G-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCT---CTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT * *** * **** ****** *** ** * * * ** ***** * * * XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTT---GCTCTAAGGAG YAR.LI_A TCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT ** * ** ** * * *** * ** ** * ****** XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT YAR.LI_A AACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT-GGCGGT ** *** * ** ***** * * ***** ** * ** XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTG-AATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT YAR.LI_A GGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--------- ******** * * ** * * *** * * * * *** XEN.LAE. TCT YAR.LI_A ---
Mean pairwise ID: 41.97%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA *** ************** ** CIN.HYB. G-AGTGGGTT-CATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCAG * ***** * ** *** ***** * * *** * * ** * ** * CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG *** **** ******* ********** **** *** * ** * ** ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTG-TCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACC TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCAC ** ** **** * ** ***** * ** * *** *** * *** * CIN.HYB. CATTT TRI.AE_C CATC- ***
Mean pairwise ID: 41.97%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTTAGT * ** *** ** *** ** ** ** HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA SCH.POM. ACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT--CGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGA **** * ** * * * *** * * * ** * * * * *** * ** ** HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC--ACTCCTAGACTGGAGGGCAA SCH.POM. TCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTAC ** * * * * * ** ** * * * ** ** * * * HUM.LU_C TGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA SCH.POM. CGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCGATAG * **** *** *** *** * ** ** * *** ** * * **** HUM.LU_C CGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTT SCH.POM. CGATGGGATTCACCTT---CGCAGGATGTGCA--TGGA---AGTATAAACACAACGGTCG ** * * * **** * * *** ** *** * * * ** * ** * HUM.LU_C CTTTT SCH.POM. TT--- *
Mean pairwise ID: 41.98%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAAT-------CGTCTT ** ** * * ** * * * ** ** **** ** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC YAR.LI_A CTTGTTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACT-TGGCCATTT-----GGTTGTCCTTTC *** **** *** ** ***** * * * * ** * * *** ** *** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC YAR.LI_A CGAATTCTGCGGTTGAT--GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC * * ** * ** * * * * ** * * ** * ****** * * * * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCTT YAR.LI_A TAAGATTAACTGGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGT *** * * * * * ** *** * ***** **** **** * * ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTT---GGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC YAR.LI_A ATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT- ****** * *** ** * * ** * ** * * ** * ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT YAR.LI_A ------------------------
Mean pairwise ID: 41.99%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG * **** * *** * * **** ** * * * ** ** * * *** HOM.SA_A TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * ** HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** * HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGTGCAACAT-AGCGAG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** * * ** * * *** ** ** * * * * HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT LYC.ES_L ACCACCACTTT- *** * ** *
Mean pairwise ID: 42.02%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGG-GGGCAACAATGTGGTGGAATGTT YAR.LI_B ----AGC--TGTAATG---GCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTT *** ***** * ** * * * ****** * * * ** * *** LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC YAR.LI_B CGA---GTTCTGGACTCTGCACT----GGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCG- * * ** ** ** ****** * * ** *** ** ** LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAA-AGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG YAR.LI_B GTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * **** ***** * * * * * ** * ** * *** LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-CTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA YAR.LI_B GATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGA * * * ** *** * **** ** * *** *** * ** * ** *** LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT YAR.LI_B TAGCAACAAAGTGGTATAT--GTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-------- * * **** * * * ** * * * ** * * ** LYC.ES_F CACTTTT YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 42.04%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT ***** * * **** * *** ** * * * * * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTG---CACTGGGCTACTTTG-TTGTCCTTTCCGAATTCT **** * * ****** * * * * ** * ***** * *** *** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * * *** * * * ** ****** * *** * * * * ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCCG-GCTTCCAACGGTG YAR.LI_B TGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG ** ** * * ** *** * ***** **** * * **** * * ***** ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTC---GAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC YAR.LI_B GGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------- *** *** * * * * ** * * * ** *** ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 42.07%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT * * * **** * * ** * * ** GAL.GAL. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-GCCTGCCCTGTCCAA * * ** ** ******* *** **** * * * ** * ** GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * * * * **** ** * * * * * * ***** * *** GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * **** *** ** ** ****** * * ****** * * **** GAL.GAL. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCT LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA **** * * * *** * ** * *** **** * * * * * GAL.GAL. GTCTCC--- LYC.ES_M ACCACCTTT * **
Mean pairwise ID: 42.07%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT *** * * ** * *** * * * * ** CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG * *** * * * ** ** * *** * ** **** ** ** CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG * * **** *** ** *** * * * * * *** * * * CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG *** * * * * * ***** ** *** **** ********* * CAE.EL_D GAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG--ACCAC LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** * ** CAE.EL_D TTATCATTT LYC.ES_M CCACCTTT- * * **
Mean pairwise ID: 42.11%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT SCH.POM. -------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTTAGT * ** *** ** *** ** ** ** HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA SCH.POM. ACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGA **** * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * ** ** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAA SCH.POM. TCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTAC ** * ** * * * ** * * * * ** ** * * * * HUM.LU_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAA SCH.POM. CGATGGAGGTTGGA--AACAATGCAC--ATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCGATAG * **** *** *** *** * ** ** * ** ** * * **** HUM.LU_B CGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTC SCH.POM. CGATGGGATTCACCTTCG--CAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAAC--GGTCGTT-- ** * * * *** * ** **** ** * * * ** * * ** HUM.LU_B CTTT SCH.POM. ----
Mean pairwise ID: 42.12%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG * **** ** *** * * * ** ** * * * ** ** * * *** CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * ** CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** * CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGTGCAACAT-AGCGAG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** * * ** * * *** ** ** * * * * CAN.SPE. ACCCCGTCTCT LYC.ES_L ACCACCACTTT *** * ** *
Mean pairwise ID: 42.14%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT *** **** * * * *** * * ** * ** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * ** * * ** *** * ** * * * ***** * * * * * ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA-------- * * * * ** ** * * ** * * * * ** ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** *** ** *** * * * **** ** ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT * *** ** ** * ** *** * ** * *** * * * ***
Mean pairwise ID: 42.16%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA YAR.LI_B TGCGTTC---GAGTTCTGGACTC--TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT ** ** ** *** ** ** ** * * ** ** *** *** * * LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA YAR.LI_B GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * *** * * * * * ** ***** **** * * * LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGA-AGGA YAR.LI_B CTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAATC--CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGG * * ** * * ***** * **** * ** ** **** * * LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC YAR.LI_B CGGTGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACT **** * * **** ** * *** * **** * * ** LYC.ES_K ACCTTT YAR.LI_B CTC--- *
Mean pairwise ID: 42.16%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ****** ** LYC.ES_C AGTTGGGTC--TTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC *** * *** ** * * ***** * ****** * ** * *** **** * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ** ************ *********** *** * ****** * ********** LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCG-CTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACC **** *** ** * ** * * * ** * * ** ** ** ** *** LYC.ES_C ACATTT TRI.AE_C ATC--- *
Mean pairwise ID: 42.16%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA LYC.ES_D -----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA * ** * * ****** ******* ** HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGCAAT LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACC * ** * * ** *** * * * ***** * ** * * * HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC LYC.ES_D GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT ** ********************** ** * ********** *************** HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT LYC.ES_D GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTG--CTCCAACTAAACCACC *** ***** * * ** * * ** **** ** ** **** HUM.LU_C TCTTTT LYC.ES_D ACTTTT *****
Mean pairwise ID: 42.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTC----TT ** ** * ** * * * ****** **** * * * TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC YAR.LI_B GTTGT-GCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT ***** *** * * **** ** * ** ** * ** **** * ** TRI.AE_A GTAGTGGAC---CGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT-TAA * ** ** ** ** ** ** * *** * * * ** ** * ** * TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-CGCTTCCAACGGTGG YAR.LI_B CTGGGATA-CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGG * ** * * * * ** ** *** ** ** **** * * ****** TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCA--ATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG YAR.LI_B GATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC-------- * ** * * * ** *** * ** * * * TRI.AE_A ACCACC YAR.LI_B ------
Mean pairwise ID: 42.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTC----TT ** ** ** * ** * * * ****** **** * * * TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC YAR.LI_A GTTGT-GCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT ***** *** * * * *** ** * * * * * ** **** * ** TRI.AE_A GTAGTGGAC---CGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG YAR.LI_A GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT-TAA * ** ** ** ** ** ** * *** * * * ** ** * ** * TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-CGCTTCCAACGGTGG YAR.LI_A CTGGGA-AACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGG * ** * * * * ** ** *** ** ** **** * * ****** TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCAC-TCCTAGGCCA-ATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG YAR.LI_A GATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT----------- * ** * * * * * * * *** ** * TRI.AE_A ACCACC YAR.LI_A ------
Mean pairwise ID: 42.16%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA *** ****** ****** * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGG--TCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC * *** * *** **** ******* *** * ** * ** **** * * LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ** ************ *********** **** * * ****** * ********** LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATC TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCC--GCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGA-CCACC ****** *** ** ** ** * *** *** * * * * *** * LYC.ES_F ACTTTT TRI.AE_C ATC--- *
Mean pairwise ID: 42.17%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT YAR.LI_B ------AGCTGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGT-------AAATCGCCTTCTTGTT ***** * * **** * *** ** * * * * * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA YAR.LI_B GTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTG---CACTGGGCTACTTTG-TTGTCCTTTCCGAATTCT **** * * ****** * * * * ** * ***** * *** *** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * * *** * * * ** ****** * *** * * * * ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC-ACTCGCC-CGCTTCCAACGGTG YAR.LI_B TGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTG ** ** * * ** *** * ***** **** * * *** * * ***** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTC---GAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC YAR.LI_B GGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC------- *** **** * * * * ** * * * ** *** ZEA.MA_D AGACCACCATCTT YAR.LI_B -------------
Mean pairwise ID: 42.18%
SCH.POM. CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCG LYC.ES_L -----------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTA *** ** **** * ******* * ** SCH.POM. GGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGATCTG--CCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTT LYC.ES_L TAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTG ** * ** * ** ** * * * ** ** ***** ** * ** ** SCH.POM. CGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC-- LYC.ES_L GGTTGC--TTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA ** ** ** **** * * * ** * **** *** ** * ** * SCH.POM. ACTACCGG-GTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGG--------AT LYC.ES_L ACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAAC ** * * ** ****** * * *** ** ** * * SCH.POM. GTGC--ATGGAA-GTATAAACACAACGGTCGTT-- LYC.ES_L GCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT * * **** * *** *** * *
Mean pairwise ID: 42.19%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** * * ** *** **** ***** ** *** * * * * * ** FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT ZEA.MA_H AATTGTGGT-GCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG-TGGACCACCCATTCCAAGT *** * * ** * ** * ** * * * * * ** * * **** FUG.RUB. TCGGTATCGATAT---GGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA----CTAAAGTGG * *** * * * *** * * *** * *** * * **** * ** FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCAC-CAGCGGTGG * * * *** ** * ** * * ** * *** * *** **** FUG.RUB. GATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT ZEA.MA_H AAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------- * * * ** **** * * * * * * FUG.RUB. T ZEA.MA_H -
Mean pairwise ID: 42.19%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * * CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** * CAE.EL_B GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * ** CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** * * CAE.EL_B TGCGCTTGTGAGT-TGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTT TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----- * * *** * ** * * * ** * ** * ** CAE.EL_B T TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 42.21%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * * ******* * *** ** * *** * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCT----GGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGT LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ****** ** * ***** * * * * * ** * * * ** LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGG * * *** ** * * * * ** * ****** * * LYC.ES_E GGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA LEP.COL. AACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGAA ** **** ** ** ***** * * * * * * *** ** * ** * LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC LEP.COL. CCACACCGCGGAGCCTGTCA----TCACCTGCGCCC--CAGGCGATCCT-GTGAAGCTTT ** *** **** ** ** *** *** * ** ** ** ** LYC.ES_E CACATTTT LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 42.21%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTG-TGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAG SCH.POM. ----------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAA * ** **** * * * ** **** * ** TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGC SCH.POM. TA-GTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCT-CGATCTGCCAC ** *** * ** * * * * * ** *** * * * * TET.ROS. -TATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCCT SCH.POM. GTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTG--GCAACTGGCAGTTAAACCG-TGTAGTACCGATG * ** * *** **** * * ** * ** ***** * ** * **** TET.ROS. CAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACTC SCH.POM. GAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCTTG-GGCAGTGCGATAGCGATGGG *** *** **** ** * * *** * *** ** * **** * TET.ROS. ATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCA-GACACT---- SCH.POM. ATTCACCTTC--GCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT *** ** ** ** * ** * * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 42.21%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG *** ****** ****** ** ARA.TH_E TG-AGTAAGACGTGTGTGTC--AAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGT-GGCA * *** ** ** * * * ***** * **** * **** *** ** ** ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG ** * ************ **************** *** ******* ** * ***** * ARA.TH_E GATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCG---ACC *** ** * * * ** ** ***** * * * ** *** ARA.TH_E ACCATTTT TRI.AE_C ACCATC-- *****
Mean pairwise ID: 42.24%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- *** * * * ***** * * ** *** * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGCGT * *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC TRY.BR_A GTCGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA * * * * * * * ** * * * * * * ***** **** *** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCC--CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA ** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * * LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC TRY.BR_A CACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------- ** * * * *** * * **** * * ** * * * LYC.ES_K TTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 42.30%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_B -------------AGCTGTAATGGCATTTT--GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG * ** * * * ** ** ** *** * ***** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * * LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT YAR.LI_B AACTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT * ** ** * ** ****** ** * ** * * * * ** LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA YAR.LI_B GGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC ** * * * *** ** ** *** * **** * * * LYC.ES_N TTTTT YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 42.30%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC YAR.LI_A ----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTT * * ******* * * * **** * * * * FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT YAR.LI_A G-TTGTGCGTTCGAGTCTTGGGCTCT---GCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAAT * *** ** **** ****** * *** * * * ** ***** * * * * FUG.RUB. TCGGTA-TCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG YAR.LI_A TCTGCGGTTGATG-GGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGAT ** * * *** ** * * * *** * ** * ** * * FUG.RUB. TGCCCCGG----CCCAGGTCGGAAACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG YAR.LI_A TAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCGG * * ** *** * ** ***** * ** ***** * * * FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTG-AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAG YAR.LI_A TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT-------- ********* ** * ** * * * * * * * * * *** FUG.RUB. TCTTT YAR.LI_A -----
Mean pairwise ID: 42.31%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCC---TGCCCTCTCCAAG * **** * *** * * **** ** * * * ** ** * * *** RAT.RAT. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * ** RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** * RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCA-GCC----TGGGCAACAT-AGCGAG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** * * ** * * *** ***** * * * * RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT LYC.ES_L ACCACCACTTT- *** * ** *
Mean pairwise ID: 42.33%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCT--GTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * *** *** * * ** *** * ** * *** * CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG * **** * ** * * ** **** ** ** ** *** * * ** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA TRY.BR_A GAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC * **** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** * * CAE.BRI. GCGCTTGTGAGT-TGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------- * * *** * ** * ** ** * ** *
Mean pairwise ID: 42.35%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * * HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** * * * * ** *** * * * * * * ** * ****** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT * ** * * *** **** * * * * *** *** * HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG * * * * * * * ***** * * * **** * ******* ** HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT CAE.EL_C ACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCA-ATACCTTCAGACCACTTGT * * ** * * * * * ** * * * ** ** * * * * HUM.JA_A CTCTTTT CAE.EL_C CACT--- * **
Mean pairwise ID: 42.39%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_D ------------------------------TAGTTCT----GGCCTGCCCTGTCCAAGCA * *** *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC *** * * *** *** * * **** * **** *** * **** ***** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC ***** * ** ** * * ** ** * * * * * *** * ***** ZEA.MA_B ACCATCTTT LYC.ES_D ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 42.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_D ----------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ********* ****** ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_D ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC ** ** * * *** * *** ***** **** * *** ****** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_D GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** ********************** ** ** ****** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACC LYC.ES_D GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACC ***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * *** ZEA.MA_F ACCATCTTT LYC.ES_D ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 42.43%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC LEP.COL. -GCCGGAGCCTTG-----CTCTGTAACC----TTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * *** *** ******* * *** * * * * * * * DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCA---GCATAGGGTGCTTGCG-GCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * *** * ** *** * * ** ******* * * ** ** DRO.MEL. TTGCCATCAA-----TATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA LEP.COL. TGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAG * ** * ******* * ** * *** * * * * DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT LEP.COL. TAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACG-TCTGCCGTTGC ** **** *** **** * ** ******* * * * * * ** ** * DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAAT LEP.COL. AGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--- * * * ***** * * **** **** ** * DRO.MEL. CTTT LEP.COL. ----
Mean pairwise ID: 42.43%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG * * * * ******* * **** * *** * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCG ** **** * * *** ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LEI.MAJ. GTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GAA *** * ** ** * * ** *** ** * * *** * ** * * LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAATC *** ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** ** LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT-- ** *** ** * * ** * *** * * * * * * ** LYC.ES_O CTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 42.43%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA YAR.LI_A TGCGTTC---GAGTCTTGGGCTC--TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT ** ** ** ******* ** *** * * * ** *** *** * * LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA YAR.LI_A GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * *** * * * * * ** ***** **** * * * LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA--TCCAGTT----GCCGTGG--GTATG * * * * ** *** * * *** * * ** **** * ** LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC YAR.LI_A GCGG-TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT-- ** * ** * ***** ** * * * * * ** * * * LYC.ES_K CTTT YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 42.44%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG LYC.ES_L -------------------------------------------------------GTTGG * * * XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGG-TGTCCGCACTAAGT LYC.ES_L GTTGA-CCCAGATGGT-TGGGTT-CGGTAGGCT-TATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC **** **** * * **** * * * *** * * * ** ** ** * * *** XEN.LAE. TCGGTATCAA--TATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT--CCTAAAGTGG ** * * * * * * ** * ** * * * ** **** * ** XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * * *** * * **** * XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAG--AACAGCCTGAACAACA----CAGCGAG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** ** *** *** ***** * ** * * XEN.LAE. AC-ACAGTTCT LYC.ES_L ACCACCACTTT ** ** * *
Mean pairwise ID: 42.47%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGGAGCTGTCTG LYC.ES_M --------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTC-- * **** ** * * *** * * ****** LEP.COL. GACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGC LYC.ES_M --CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTG **** * ***** * * * * * ** * ** * * * LEP.COL. CTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-GAACTGGGT LYC.ES_M GATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCAT * * * *** * ** * ** * ****** * * * ** * * LEP.COL. CAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC--CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACC LYC.ES_M GAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAGGATAATGGG **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * ** * * LEP.COL. GCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--------- LYC.ES_M TCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT *** * ** *** *** **** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 42.47%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG LYC.ES_M --------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATT--GGGCTGTCCCAGATGGCTGG * * * *** * * * ** * * * * * ** * ** * TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA LYC.ES_M GCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTG------GATCACGA * * *** * ** ** * ** * **** * * ** TRY.BR_B GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAACGGGTCAGGCCG LYC.ES_M GGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG ** * * * ** * * * * * * ********** *** ** * **** * TRY.BR_B G--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGG-AGCAT LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGT * * ** ****** ** * * * * * * **** * * * * * * TRY.BR_B CTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT----- LYC.ES_M CTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT ** * * ** **** * * ** * * * *
Mean pairwise ID: 42.52%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * *** * * * CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * ** *** *** *** * ** * *** * CAE.EL_C GCTGCGTCACCAG-GGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * *** * * * * * * *** * * ** ** * *** * * ** CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG * * ** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** * * CAE.EL_C AGCGCTTGTGAGT-TGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCAC TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----- * * *** * ** * * * ** * ** * ** CAE.EL_C T TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 42.55%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG SCH.POM. --CGCTGTAATGGCTTGGT--CGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGT * * *** *** * * * ** * ***** * * * ***** LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA SCH.POM. CTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCT ** * * * ** ** * * ** ** * * * ** * * LYC.ES_M TGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTG SCH.POM. TCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGTTGGAA--ACAATGCACAT * * * ** **** * * * **** **** *** *** *** LYC.ES_M AACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAA SCH.POM. CACTAC-CGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGG----------ATTCACCTTCGCAG ** * * * ** ****** * ***** ** * * * * LYC.ES_M CGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT SCH.POM. GATGTGCATGGAAGTATAAAC--ACAACGGTCGTT * ** * ** ***** * **
Mean pairwise ID: 42.58%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * *** **** * *** * * * ***** * CIN.HYB. AGCT--------TGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT-- **** ** *** * * * ** *** * * ***** * ** CIN.HYB. CAAGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAAT LEP.COL. -GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCT--CCGTTAAAGT **** * ** *** ***** ** * * * *** * * CIN.HYB. CGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGT LEP.COL. AGAGGAAC--TGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGT * ** * ** ** **** ** ** **** ** * * * ** * ** CIN.HYB. GGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGG LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCA---TCACCTG--CGCCCCAGGCGATCCTGTGAA * ** * *** ***** * * * *** * * ** * ** CIN.HYB. ACACCCATTT LEP.COL. GCTTT----- *
Mean pairwise ID: 42.62%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * *** *** * **** ** * * * ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG * **** ** *** *** * * ** **** ** ** ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGGG * ** * * * * * ** * *** ** * ****** * *** ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT TRY.BR_A AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAG ** * ** **** *** ** ******* * ** * * * * ** * * ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- ** * * ** ****** *** ** ** * ** ** * * ARA.TH_D ACTTT TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 42.62%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** * *** * * * * *** *** * ***** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * * LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT YAR.LI_B AACTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAAT--CCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTAT * ** ** * ** ****** ** * ** * * * * ** LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA YAR.LI_B GGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC ** * * * *** ** ** *** * **** * * * LYC.ES_I TTTTT YAR.LI_B -----
Mean pairwise ID: 42.63%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA CAE.EL_D --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-CGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** * **** ** * ** * ** ** * ** * **** *** ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAG-TCCCGGGTGCATAAGGAG ** ** ** *** ** * **** * * * ** * * ** * * ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG CAE.EL_D TCGTGGATGGTTCAGGAC------CGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAG * * * ** * * * * * *** ** ** * * * ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG CAE.EL_D TGGCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * ** * * ** * * * **** * * * * * ZEA.MA_C ACCACCATTTTT CAE.EL_D CTTATCATTT-- * *****
Mean pairwise ID: 42.67%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * * ******* * *** ** * *** * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCT----GGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ****** ** * ***** * * * * * ** * * * * LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG- * * *** ** * * * * ** * ****** * * LYC.ES_O GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGA * ** * ** **** ** ** ***** * * * * * * *** ** * ** LYC.ES_O ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCTGTCA----TCACCTGCGCCCCA---GGCGATCCTGTGAAGCTT * ** *** **** ** ** *** * * * *** * ** * LYC.ES_O CCACTTT LEP.COL. T------
Mean pairwise ID: 42.67%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ***** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG ***** * * *** *** *** * *** * *** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ******* ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAC-TAAACCAC * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** * * ****** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_D CACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 42.67%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ****** **** ****** TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG LYC.ES_D GAGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG * *** * * * *** * **** **** ** * * * *** * ** * TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ** ** ********************** ** * ****** * ********* TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCAC ******* ** ** * * * ** * **** * * ***** * * ***** TRI.AE_A C------ LYC.ES_D CACTTTT *
Mean pairwise ID: 42.67%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * * ******* ****** ** * * * * LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGG---CTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** * * ** *** ** * * * * * ** **** ** LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGCGTTCTCGC---GCCGTTAAAGTGGGGGG * * **** * ** ** * * * * * *** *** ****** * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRY.BR_A AACGG-GTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA ** * ** **** *** ** ***** * * * *** * * * ** ** * LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGC----GCCCCAAGTGTCGTC--GCGAGGCGG- *** * ** * * * * * ** * ** * * * * LYC.ES_F CACTTTT TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 42.67%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC ** ** * * * ** ** ****** ***** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG TRY.BR_A GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG * * * * *** * * * * * ** ** ** * *** * GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * ** * * * * * ** * ***** * * *** * **** GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA TRY.BR_A GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------- * * ** ** * * ** * * ** * * * ***** *
Mean pairwise ID: 42.72%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT *** * * ** * *** * * * * ** CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG * *** * * * ** ** * * *** * ** **** ** ** CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG * * **** *** ** *** * * * * * *** * * * CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG *** * * * * * ***** ** *** **** ********* * CAE.EL_A GAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAG--ACCAC LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ** * * *** ** ** * * **** * * * ** ** * ** CAE.EL_A TTATCATTT LYC.ES_M CCACCTTT- * * **
Mean pairwise ID: 42.72%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G * *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * * ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG **** ** * ** * * * * * * ** * * ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA **** ** ** **** ** * ** ******* * * * **** * * ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGC---ATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG ** * * ** * ** * ** * * * **** ** ** * ** * ZEA.MA_E ACCATCTTT TRY.BR_B GTTT-----
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** ***** ****** * ** LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * * LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************ *********** *** ** * **** * ************* LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCAT *** * ** ** *** ** ** * **** * * * ***** ******** LYC.ES_I TTTT TRI.AE_C C---
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- *** * * * ***** * * ** *** * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G * *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * * LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC TRY.BR_B TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA ** ** * * * * ** * * * * * * ********** *** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACA ** * **** ** * ** ****** ** * * * * * * **** * * LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC TRY.BR_B CCGAGG-AGCATCTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT- * * * *** * * ** **** * * ** * * * * LYC.ES_J CTTT TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** ***** ****** * ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * * LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************ *********** *** ** * ***** * ************* LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCAT *** * ** ** *** ** ** * **** * * ** *** * ******* LYC.ES_B TTTT TRI.AE_C C---
Mean pairwise ID: 42.76%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG ** ***** ****** * ** LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** * * *** * * * * * *** **** * * LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************ *********** *** ** * **** * ************* LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCAT *** * ** ** *** ** ** * **** * * * ***** ******** LYC.ES_N TTTT TRI.AE_C C---
Mean pairwise ID: 42.77%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT * * **** * * * *** *** FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * * * ** ******** * ** *** * * * ** ** * ** FUG.RUB. GTTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTG * * * * * * * ** * * * *** * * ***** * * FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG *** * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** * FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA **** * * * *** * * * *** * ** ** * * * FUG.RUB. CT-CAGTCTTT LYC.ES_M CAACCACCTTT * * ****
Mean pairwise ID: 42.81%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG ** * * *** *** * **** ** *** * * ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGG-TGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC * ** * ** ** *** * * ** **** * * ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT LEI.MAJ. GGTGTGGCTTGCCC---CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC--GAGGGA * ** ** * ** *** * * * * * * *** ***** ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTA-CAGCAGTGGATGGA LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA * * ** **** ** ** ******* * ** * * * * ** ** * * * ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG-----TCGCGAAGCCT *** * ** ** * ** * **** **** * **** ** * * * ARA.TH_D CACTTT LEI.MAJ. T-----
Mean pairwise ID: 42.81%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA YAR.LI_B TGCGTTC---GAGTTCTGGACTC--TGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT ** ** ** *** ** ** ** * * ** ** *** *** * * LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA YAR.LI_B GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * * *** * * * * * ** ***** **** * * * * LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGA-AGGA YAR.LI_B CTG-----GGATACTTCAGTGGAGCAATC--CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGG * * ** * * ***** * **** * ** ** **** * * LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC YAR.LI_B CGGTGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACT **** * * **** ** * *** * **** * * ** LYC.ES_J ACCTTT YAR.LI_B CTC--- *
Mean pairwise ID: 42.86%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGG-GGACTATAAGATGGTGGAACACT YAR.LI_A -CTTAGC--TGTAATGGCATTTTGT---CGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTT *** ***** * * **** * ***** * * * ** * * * ARA.TH_G GGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG YAR.LI_A CGA--GTCTTGGGCTCTGCACTTG-----GCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGG ** * * * * * *** * *** * ** ** ** * ** * ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGA--AGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG YAR.LI_A TTGATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTT---CTAAGATTAACT * ** * * * ** * * ***** * ** * *** ** * ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG YAR.LI_A GGGAAACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGA-----TCCAGTT----GCCGTGGGT-- * * * ** *** * ***** ** *** * * ** **** ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC YAR.LI_A ATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT- * **** ** ** *** * **** * * * * * ** * ** ARA.TH_G ACCATTTT YAR.LI_A --------
Mean pairwise ID: 42.90%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG LYC.ES_M --------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATA * * * ** ** * ** *** XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG * * **** ** ******* ** **** * * * ** ** * *** XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTGG * * * ** * * ** * * ** * * ** **** * ** XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT LYC.ES_M GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ** * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** * XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCG-GTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC **** * * * *** * * ** *** * **** * * * * * ** XEN.LAE. AGTTCT---- LYC.ES_M AACCACCTTT *
Mean pairwise ID: 42.90%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGG-ATC ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** ** **** *** **** ***** ** * * * *** * ** XEN.LAE. GCTTG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCT-GCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACC----ACCCATTCCAA *** ** ** * * ** ** * ** *** ** * ** * ** XEN.LAE. GTTCGGTATCAATAT---GGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA-----CACTAAAG *** *** * * ** * * *** * * *** * * * **** * XEN.LAE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG ZEA.MA_H TGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCC-ACCAGCGG ** * * * *** ** * ** * * ** * *** * *** * XEN.LAE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT ZEA.MA_H TGGAAGGA------TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------ *** * * * ** ** * * ** * ** XEN.LAE. TCT ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 42.90%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT----GATCCCGCTTAGCGG *** * ******* **** ** *** * * * ARA.TH_G GATCGGCCC--ACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGG--TGTTCTGCTTG-GTT * ** * ** * ** ** ***** * * * *** ** * * * ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAAC-CAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG TRY.BR_B GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG--TGGGG * * ** * * * * * * ** * * * * ***** ** ** ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA * * * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * * ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGC--TCGTAACCCGCTTGAA TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- * ** * ** * ** * * * ** * *** * ** ** ARA.TH_G CCACCATTTT TRY.BR_B ----------
Mean pairwise ID: 42.91%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG YAR.LI_A -----------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGT ** **** ** * * * * * * * * * * TET.THE. G-ATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG-AGTT YAR.LI_A GCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTT * * *** ** * ** ** ** * * ** ** *** ** ** *** TET.THE. GCTATG-GTGGTAACCT-AGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG-GAAAC YAR.LI_A GATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAA * * * ** ** ****** ** * * * ** * *** * * TET.THE. GCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACA YAR.LI_A ACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGATCGCA * **** **** * *** ** * ****** * * * *** ** **** ** TET.THE. TACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT YAR.LI_A ACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------- * * * * * * * *** ****
Mean pairwise ID: 42.95%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ****** ** LYC.ES_K AGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC *** * * * **** * **** * ***** ** * * * *** * ** * LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ***** ********************** ** * ****** * ********** LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCA ** *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** *** LYC.ES_K CCTTT TRI.AE_C TC--- *
Mean pairwise ID: 42.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT *** **** * * * *** * * ** ** RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * ** * * ** *** * *** * * * ***** * * * * * RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA-------- * * * * ** ** * * ** * * * * ** RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCG-GGTCTTGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** *** ** *** * * * * **** ** RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT * *** ** ** * ** *** * ** * *** * * * *** *
Mean pairwise ID: 42.95%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC TRY.BR_B ---------------AGC--CGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTG-ATCCCG *** * * ** ***** * * * * * ** * DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTA---GCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA TRY.BR_B CTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG ** **** * ** * * ** * ****** ** * * DRO.MEL. A--GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGT-TGGCTAAGG TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG----AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG ** ** * * ** **** * *** *** *** * * *** * DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG TRY.BR_B TGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC--CCGTTG *** **** *** **** * * ******* * * * * * * * ** * DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA TRY.BR_B CAGAA--GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG * * ** **** * * * * * * ** * * * * ** * * DRO.MEL. TCTTT TRY.BR_B TTT-- * *
Mean pairwise ID: 42.95%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * *** *** * **** ** * * * ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG * **** ** *** *** * * ** **** ** ** ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGGG * ** * * * * * ** * *** ** * ****** * *** ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT TRY.BR_B AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG ** * ** **** *** ** ******* * ** * * * * ** * * * ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- ** * * ** ****** *** ** ** * ** ** * * ARA.TH_D ACTTT TRY.BR_B -----
Mean pairwise ID: 42.95%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * ** ***** * * * ** **** * CAN.SPE. TCGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTG-GGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG-- * ** ** ** *** ** *** * * * * * * ** *** * CAN.SPE. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG LEP.COL. ------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGT **** * **** ** * * **** * ** * *** CAN.SPE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG LEP.COL. AGAG--GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTG ** * **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** * CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCG LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- * * * * ** ** * ** * ** * ** ** * * ** * CAN.SPE. TCTCT LEP.COL. -----
Mean pairwise ID: 42.96%
LYC.ES_M --------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG--GGCTGTCCCAGATGGCTGG TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG * * * *** * * * ** * * * * * ** * ** * LYC.ES_M GCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTG------GATCACGA TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA * * *** * ** ** * ** * **** * * ** LYC.ES_M GGCC-CAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG TRY.BR_A GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAACGGGTCAGGCCG ** * * * ** * * * * * * ********** *** ** * **** * LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTC TRY.BR_A G--TGACGGAGCAGCC--CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAG-C * * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * * ** * * LYC.ES_M TTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT TRY.BR_A ATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---------- * *** * * **** * * ** * * *
Mean pairwise ID: 43.00%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * ******* ****** * ** * * * * LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** * LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TRY.BR_A TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGG TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA **** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** ** LYC.ES_B ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---- * ** ** * * * * *** * * * * * LYC.ES_B CACTTTT TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 43.00%
CAE.EL_C ------ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACG-GTAGATGAGTG YAR.LI_B AGCTGTAATG-GCATTTTGTCGGA--GTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTT * * ** * ** *** * ** * ** ******* * * **** CAE.EL_C TGGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGT YAR.LI_B C---TGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT-TGTCCTTTCCGAATTCTGCGG-------TT **** * * ** * ** *** **** ** * * ** * * * CAE.EL_C GCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG YAR.LI_B GATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTT---GAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGG * *** ** ** * ** * **** * ** * * * * CAE.EL_C GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAA-AGCCACCGCGCGGTGCAGTG YAR.LI_B GA--------TACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTG-GGTATGGCG ** * ***** * ** ****** * ** *** * *** * * CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACT YAR.LI_B GTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---- * *** *** * * * *** * * ** **** * * * CAE.EL_C TGTCACT YAR.LI_B -------
Mean pairwise ID: 43.01%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGA--TAGAT LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCT *** * * * **** * * * *** * ** * * * ** * * TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTT LEP.COL. GGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGG * * * ** ** * *** * * * * * * TET.THE. GCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCC LEP.COL. CCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-AGTAGAGGAACTGGG ** ** * *** * * *** * ** * * ** ** ***** * TET.THE. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGT-TGTGGTGGAAGGATAACATAC LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCC--ACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACAC-C ****** ****** ** *** ** * *** ** ** ** * ** * *** * TET.THE. TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT LEP.COL. GCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT * ****** ** * * * * **
Mean pairwise ID: 43.04%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * ** ** * ** *** * ** * *** * * * ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATT--TGTTGTTGGCATAGGTC-TGGACTGCCCAATCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC * * * *** * ****** **** ** ** * ** ****** ARA.TH_G TGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT ** ** * * ** ** * * ** *** ** **** * ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG * * ** *** * * ***** * * * **** * ******* *** ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCA-CACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTG--T * * ** ** * * * **** * * * ** **** ARA.TH_G CACCATTTT CAE.BRI. CATT----- **
Mean pairwise ID: 43.05%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG LYC.ES_D ----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * ** **** ****** ******* **** HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAATG LYC.ES_D TAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCG * ** * * * *** *** * ******** ** * * * * HUM.JA_A CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG LYC.ES_D CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG * ********* ************ ** ** ********** *************** * HUM.JA_A GGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATCTCTT LYC.ES_D GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTT ******** * * * ** * ** * **** * *** HUM.JA_A TT LYC.ES_D TT **
Mean pairwise ID: 43.09%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTC-TGTAACCT--TCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG----GGGA * * *** *** ** ******* ****** * * * *** HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TRY.BR_A CGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTG--CGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--GGTTGCGT * * * **** ** * * * ** ** * * * * * HUM.LU_C GGTGG-GCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT TRY.BR_A GTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC * ** * ***** * * * *** * ** * *** *** ** HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC TRY.BR_A GGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCAC * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** ** * ** HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC TRY.BR_A ACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTG--TCGTCGCGAGGCGG--------- ** ** ** * * * *** ** * * * * HUM.LU_C TTTT TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 43.09%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG * * * * * * * *** * ** * * ** * * * * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * ** ** * * ** * * * * * *** * ** * ****** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG CAE.EL_C GCTGCGTCA--CCAGGGGA--TGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG * * * **** ** * ** ** * * * * * * HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******* * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAG--TTGA--CACGTATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCAGAC ** * * ** *** * **** ** * ** * * * * * *** HUM.LU_C CATTTCTTTT- CAE.EL_C CACTTGTCACT ** ** *
Mean pairwise ID: 43.09%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA YAR.LI_A TGCGTTC---GAGTCTTGGGCTC--TGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCT ** ** ** ******* ** *** * * * ** *** *** * * LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA YAR.LI_A GCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAA * * * *** * * * * * ** ***** **** * * * * LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA YAR.LI_A CTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA--TCCAGTT----GCCGTGG--GTATG * * * * ** *** * * *** * * ** **** * ** LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC YAR.LI_A GCGG-TGGGATCGCAACCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCA-CGATT-- ** * ** * ***** ** * * * * * ** * * * LYC.ES_J CTTT YAR.LI_A ----
Mean pairwise ID: 43.09%
LYC.ES_J ---GTCGAGCTTAGTAACGTGGGC--TTGTAATCCAAGTGGA---GACATCAAAGTGGTT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC ** ** * * * * * * * * * ** *** LYC.ES_J GAATATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCTCATGTTGAC---GGAACGTCCGCACT * **** * *** * ** * * * ** ** * ** * LYC.ES_J AAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG **** * * * * * ** *** *** * * **** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG ** * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA ***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT DRO.MEL. CCACAATCTTT * ** * ****
Mean pairwise ID: 43.09%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT--CTGATTGTGGGATGG YAR.LI_B ------------------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTG ******* * ** * ** ** * * * DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA YAR.LI_B TTGTGCGTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCT * * * * *** * ** * * *** * **** * * DRO.MEL. GC--TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG YAR.LI_B GCGGTTGATGGGCGTCTCGGT-CTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTT--CTAAGATT ** *** * * *** * * * * * ** *** *** ***** DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAG-AGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCGGT ** *** ** * ** ******* * **** ****** * ** DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAAT YAR.LI_B GGGATAGC--AACAAAGTGGTATAT-GTTATGGAA------GGTATT-TGCAATCACGAC ******** * * ***** * ***** * *** * * *** * DRO.MEL. CTTT YAR.LI_B TCTC *
Mean pairwise ID: 43.09%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG LYC.ES_L GGGTTGA-CCCAGATGGT-TGGGTT-CGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG * **** ***** * * **** * ** *** *** ** ** * * *** HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTC-CCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATT-CCTAAAGTGG ** * ** *** * * ** ** ** * * ** ***** * ** HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA **** ** * *** ** ** ***** * * ** *** *** **** * HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTC--CAGCCTGAGCAACA----TAGCGAG LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAA **** ** * * *** *** * * ** * * ***** * * * * HOM.SA_B ACCCCGTCTCT LYC.ES_L ACCACCACTTT *** * ** *
Mean pairwise ID: 43.09%
LYC.ES_A ---GGCGAGCTTAGTAACGTGGGC--TTGTAATCCAAGTGGA---GACATCAAAGTGGTT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * ** ** * * * * * * * * * ** *** LYC.ES_A GAATATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCTCATGTTGAC---GGAACGTCCGCACT * **** * *** * ** * * * ** ** * ** * LYC.ES_A AAGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG **** * * * * * ** *** *** * * **** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG ** * **** *** ** * ***** ** * ***** * ***** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA ***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT DRO.MEL. CCACAATCTTT * ** * ****
Mean pairwise ID: 43.13%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** ****** * * * * ** **** * * ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT---CGTCGTCTACGTCG-ACCGAGCGTCCGTGCC ** * * * * ** ** ** ** * * * * ** **** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT CAE.EL_D AAGCGCTACGTCAC-CAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * *** *** ****** ** * * ** * ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ** * ** * * * * * ***** * * ** **** * * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTG-GCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA CAE.EL_D GCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGA-TACCTTC--AGACC * *** ** * * * * * ** * * * * ***** * * ORY.SA_B GACCACCACCTTT CAE.EL_D ACTTATCATTT-- * ** *
Mean pairwise ID: 43.14%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAG-GCTGAGGCTGGCGGAT SCH.POM. -------------------CGCTGTAAT--GGCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT ******* * * * ** * * ** * ** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * * ** * ** *** * ** * * ****** * * * * * * FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTGTT--CGA-AGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCA--GTTAAACCGTGTA-------- * * * *** * ** ** * * ** * ** * * ** ** FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTC-TTGGGCAGTGCGA * *** **** ****** * *** *** * *** * * * * **** ** FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT SCH.POM. TAGCGAT-GGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAA-CGGTCGTT * *** * ** * * * ** * * * * * * * *** **
Mean pairwise ID: 43.14%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TRI.AE_C ----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGT * ****** ******* * * HUM.LU_C GGTGGGCTGA--GGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCC-TAGACTGGAGGGCA TRI.AE_C AGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * * *** *** ***** * * * * * *** ** *** **** HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ***************************** ** ****** * * *********** HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGC-TTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC ******** *** * ** * * ** * * ** **** * ***** HUM.LU_C TCTTTT TRI.AE_C ------
Mean pairwise ID: 43.17%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ***** *** ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCT---TGCCCATCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC ** ** * * * **** * ** ** * ** * * ** * * ZEA.MA_A CAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGA CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCG-GAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAG **** * ** * ** * * *** ** * *** * * * * * ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG CAE.EL_D GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTG * * * * **** * * * * * * *** ** **** * * ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCT-CAGAACCTCACTAAG CAE.EL_D CAGTGGCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGA * * ** ** * * * * ** *** ** * * * * ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT CAE.EL_D CCACTTATCATTT-- * * * *** *
Mean pairwise ID: 43.18%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG-TGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** * * ** ***** *** * * * * ** * *** * ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * ** * ** * * * ** * * * **** * ** ** ** * *** ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGGT * * * *** * * * ** * ** *** ** * *** ** * ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG FUG.RUB. GCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG * * *** ** ** ***** * **** **** * ** ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAACC FUG.RUB. ATCGCGCC-------CGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTC *** * ** * * * ** * * * * * ** * ARA.TH_E ACCATTTT FUG.RUB. AGTCTTT- * ***
Mean pairwise ID: 43.18%
CIN.HYB. -ACCGG--GCTTGGTAACGCTAGTCTATA-ACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAAC DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGG-TCTGATTGTGGGATGGC ** ** * **** * * ** * ** ****** * * * **** * CIN.HYB. TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * *** ** * ** * * ** * ** * *** * *** CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATG-GAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG * * ** * ** * * ** * ** * * * *** CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG * * * * *** *** * *** ** ** * ** * * * ** * CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTG-----GACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCA **** * ******** * ** * * ***** * **** CIN.HYB. CCATTT-- DRO.MEL. CAATCTTT * ** *
Mean pairwise ID: 43.19%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA LYC.ES_L ---------------------------------------------GTTGGGTTGACCCAG *** * * * TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT LYC.ES_L ATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCT---GGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGG- * * *** * * * * ** * ***** ***** ** ****** TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTT----CACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGC LYC.ES_L ATCACGTGG-CTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG-GGTGGACTGC ** * * **** * *** * * * ***** * * * ** ** TET.ROS. CTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACA- LYC.ES_L GTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGG * ******* ***** ** *** * * ***** ** ************* TET.ROS. --TACTCATTAACT-GTCAAGCTAAT---CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT---- LYC.ES_L GTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTT * * * * * *** ** *** * * * *** ** * * ** ** TET.ROS. - LYC.ES_L T
Mean pairwise ID: 43.19%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATC-CAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT * * *** ** * ***** * * * * ** * * * * ** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAG-----TTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * * ***** * *** * ** * * *** *** * ** FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * * ******* * * * * ******* * *** FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA * ** * **** ** *** * **** *** *** ** * *** FUG.RUB. T--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT-CGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----- * * * * * ** * * ** * * * ** ** *** *** FUG.RUB. T TET.THE. -
Mean pairwise ID: 43.23%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- *** * * * ***** * * ** *** * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G * *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * * LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC TRY.BR_A TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA ** ** * * * * ** * * * * * * ********** *** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCC--CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA ** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * * LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC TRY.BR_A CACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------- ** * * * *** * * **** * * ** * * * LYC.ES_J TTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 43.23%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA---TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACA FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGC--TGGCGGA * ** * ** * ** ***** *** * **** * ** *** * ARA.TH_F CTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA FUG.RUB. TCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * ** * ** * ** * ** * ** * **** * * ** ** * ** ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGGA FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG * * * * ** ** ** * ** * * ***** * ** ** ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG * * * *** ** ** ***** * **** **** * ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAA FUG.RUB. GGATCGCGCC-------CGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC ***** ** ** * * * ** * * * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT FUG.RUB. TCAGTCTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 43.23%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG- ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT ****** ** *** * ****** * * * * ** ********** CAE.EL_C -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA * ** * * **** ** * * * *** * ** * ** * **** CAE.EL_C GCGCTGC-GTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAA-AGT * * ** ***** ** *** * **** ** * *** CAE.EL_C GGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG ZEA.MA_H GGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCAC--CAGCGG ** *** * * ** * *** ** ***** ** * ** * CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC ZEA.MA_H TGGAAGGATAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT---------------------- * * * ***** * * * ** * *** * CAE.EL_C ACT ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 43.23%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G * *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * * ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG **** ** * ** * * * * * * ** * * ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCG-ATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCG-AG **** ** ** **** ** * ** ******* * * *** * * ** * * ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGC---ATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGC ** * * ** * ** * ** * * * **** ** ** * ** * ZEA.MA_E CACCATCTTT TRY.BR_A GG--------
Mean pairwise ID: 43.23%
CAE.EL_B -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGT-GGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA * * * * * * * * * ** ** * * **** * * *** CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG TET.THE. GGATATGAG----AGTTTGATG-AGACAGTT-----TGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * *** *** ** * *** * * * * * *** **** CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * ** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** * CAE.EL_B TGGA-TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA * * * ***** * ** * *** **** **** * ** **** *** CAE.EL_B CTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT---- * ** * * ** ** ** * * * * * ***** * * CAE.EL_B TTT TET.THE. ---
Mean pairwise ID: 43.23%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG- ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT ****** ** *** * ****** * * * * ** ********** CAE.EL_B -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA * ** * * **** ** * * * *** * ** * ** * **** CAE.EL_B GCGCTGC-GTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAA-AGT * * ** ***** ** *** * **** ** * *** CAE.EL_B GGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG ZEA.MA_H GGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTG ** *** * * ** * *** ** ***** ** * * * CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT ZEA.MA_H GA--AGGATAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT---------------------- ** * * ***** * * * ** * *** * CAE.EL_B TTT ZEA.MA_H ---
Mean pairwise ID: 43.24%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG ZEA.MA_H ------NCCGAGCTCTGTAGC----GAGTGCTTGTA--ACCCGAGCGGGGG--------- ** ******** * * * **** * * * ** * *** LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGAC-GTGGTGC-TCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGG ZEA.MA_H --CA--ATAAGGTAGTGTGGATGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA ** *** *** * * ** * ******* * *** *** * * * LEP.COL. CCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGT ZEA.MA_H ACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG ** ** *** ** ** * * ** * * * * * ** LEP.COL. CAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGG ZEA.MA_H CATCCCAACACTAAAGTGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCG----AG ** ** ** ** ** ** * *** * *** * * *** * * * LEP.COL. AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-------------- ZEA.MA_H TACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG-GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT ** * **** *** * * *** ** * *** *
Mean pairwise ID: 43.27%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCCGG ****** *** *** * ** ** * ** ** * ** *** * CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA ORI.CUN. AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGC--GCTATGCCGATCGGGTGTCCG ** * **** * * ** * ** * * **** * *** CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTG-AGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG----G ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * * **** * * * ** * **** * * * * * * CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTC---ACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGT ORI.CUN. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT ** * ** * * * * ** **** * *** *** ** * ** CIN.HYB. GGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGG ORI.CUN. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGGGCAACATAGCGAG * **** * ** * * ** * ********* * * * * * CIN.HYB. ACACCCATTT-- ORI.CUN. AC-CCTGTCTCC ** ** * *
Mean pairwise ID: 43.32%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * * ******* ****** ** * * * * LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGG---CTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** * * ** *** ** * * * * * ** **** ** LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGCGTTCTCGC---GCCGTTAAAGTGGGGGG * * **** * ** ** * * * * * *** *** ****** * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRY.BR_B AACGG-GTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA ** * ** **** *** ** ***** * * * *** * * * ** * ** * LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGC----GCCCCAAGTGTCGTC--GCGAGGCGGT *** * ** * * * * * ** * ** * * * * * LYC.ES_F CACTTTT TRY.BR_B TT-----
Mean pairwise ID: 43.32%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * ******* ****** * ** * * * * LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** * LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TRY.BR_B TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGG TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA **** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** * ** LYC.ES_B ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT- * ** ** * * * * *** * * * * * LYC.ES_B CACTTTT TRY.BR_B -------
Mean pairwise ID: 43.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT *** **** * * * *** * * ** ** ** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * ** * * ** *** * *** * * * ***** * * * * * RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTC--GTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTA-------- * * * * ** ** * * ** * * * * ** RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. -GTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATC---ACTACCG-GGTCTTGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** ** *** *** * * * * **** ** RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATA--AACACAACGGTCGTT * *** ** ** * ** *** * ** * *** * ** ** **
Mean pairwise ID: 43.34%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAAT-------CGCCTT ** * * ** * * * ** ** **** ** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC YAR.LI_B CTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGG-GCTACTTTG-----TTGTCCTTTC *** **** *** * **** * * ** * * *** *** ** *** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC YAR.LI_B CGAATTCTGCGGTTGAT--GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTC * * ** * ** * * * * ** * * ** * ****** * * * * ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATC--ACTGCC-CGCT YAR.LI_B TAAGATTAACTGGGATA-CTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGG *** * * ** * * * * ** *** * ***** **** **** * ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTG-GGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC YAR.LI_B TATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACT * ****** * **** ** * * ** ** * * ** * * ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT YAR.LI_B CTC-------------------- ***
Mean pairwise ID: 43.37%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT----GATCCCGCTTAGCGG *** * ******* **** ** *** * * * ARA.TH_G GATCGGCCC--ACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT-CTGTTG-CGTTGACTTGG--TGTTCTGCTTG-GTT * ** * ** * ** ** ***** * * * *** ** * * * ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAAC-CAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG TRY.BR_A GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAG--TGGGG * * ** * * * * * * ** * * * * ***** ** ** ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA * * * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGC-TCGTAACCCGCTTGAAC TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--- * ** * ** * ** *** ** ** * * **** * * * ARA.TH_G CACCATTTT TRY.BR_A ---------
Mean pairwise ID: 43.38%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG LYC.ES_L ----------------------------------------------GTTGGGTTGACCCA **** * * TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC LYC.ES_L GATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTG---GCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGG *** * *** * * * * ** * ***** ****** ** ****** TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTC----CACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACG LYC.ES_L -ATCACG-TGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG-GGTGGACTG ** * * * **** * *** * * ***** * * * * TET.THE. CCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACA LYC.ES_L CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACG * * ******* ***** ** *** * * ***** ** ************* TET.THE. ------TACTCA------TTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAG-ACA LYC.ES_L GGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACT * **** * * * ** ** ** * * * * ** *** ** TET.THE. TT LYC.ES_L TT **
Mean pairwise ID: 43.41%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA---TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACA FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGC--TGGCGGA * ** * ** * ** ***** *** * **** * ** *** * ARA.TH_A CTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA FUG.RUB. TCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * ** * ** * ** * ** * ** * **** * * ** ** * ** ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG FUG.RUB. GTTCGGTATCGATA-TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * * ** * ** *** * * ** ** ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT * * * *** ** ** ***** * **** **** * ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGA FUG.RUB. GGGATCGCGCC-------CGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA ***** ** ** * * * ** * * * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT FUG.RUB. CTCAGTCTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 43.42%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG ** ** *** ** *** *** * * * * * * CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * * * * ** * * ** ** * *** *** * * * *** ** CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG ** *** ** ** * * * *** *** * * ***** * * * * * CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGT-GCAGTGGCC LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCAC--CCCACGCACGTCCGCCGTTGCA ** ** ***** * **** * ***** * * ** *** ** ** ** ** CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---- * * * * *** ** * ** * * * * ** CAE.EL_C CACT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.42%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA--CTCGGGAGGCTGAGACAGGAG- LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * ** ***** * * * ***** **** RAT.NOR. -GATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG-- * * ** *** ** *** * * * * * * * ** *** * RAT.NOR. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG LEP.COL. ------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGT **** * **** ** * * **** * ** * *** RAT.NOR. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG LEP.COL. AGAG--GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTG ** * **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** * RAT.NOR. TGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGT LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- * * * * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** * RAT.NOR. CTCT LEP.COL. ----
Mean pairwise ID: 43.42%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** * *** * * * * *** *** * ***** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG YAR.LI_A ---TGCGTTCGAGTCTTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** ******* * * * * ** *** *** * * * LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC YAR.LI_A CGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * *** **** ***** * * * * ** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTATGG * * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * ** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC YAR.LI_A CGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT--ATGTTATGGAAGATATT----TACGATCACGAT *** * * * ****** ** *** * * * * * *** * LYC.ES_G TTTT YAR.LI_A T--- *
Mean pairwise ID: 43.42%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG ** ** *** ** *** *** * *** * * * CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * * * * ** * * ** * ** *** *** * * * *** ** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG * *** ** * * * * ** *** * * ***** * * * * * CAE.EL_D TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAG * ** ***** * **** * ***** * * * * *** ** ** ** * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGC--ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * * * * ** * * ** * * ** * * * ** *** CAE.EL_D ATTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.44%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATGAGTGTGGATG ****** ** *** * ** *** * ** * ** ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGT-AATCTTGCTGGCTTGCCCGTT CAE.EL_C G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG *** * ***** * **** ***** ** * * * * **** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTC--ACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAGTCCCGGGTGCA ***** * ** * ** ** ** * * ** * * * ** ORY.SA_A CTAA-AGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC CAE.EL_C TAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGC * ***** * * ** * **** ** *** ** ** * * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC CAE.EL_C AGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTT---CTCAATACCTTCA * * *** * * *** * * ** * * ** * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT CAE.EL_C GACCACTTGTCACT------ ** ** ***
Mean pairwise ID: 43.45%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** ****** * * * * ** **** * * ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT---CGTTGTCTACGTCG-ACCGAGCGTCCGTGCC ** * * * * ** ** ** ** * * * * ** **** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT CAE.EL_A AAGCGCTACGTCAC-CAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * *** *** ****** ** * * ** * ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ** * ** * * * * * ***** * * ** **** * * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGC-CGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGA-TACCTTC--AGACC * *** ** * * * *** ** * * * * ***** * * ORY.SA_B GACCACCACCTTT CAE.EL_A ACTTATCATTT-- * ** *
Mean pairwise ID: 43.46%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG- ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT ****** ** *** * ****** * * * * ** ********** CAE.EL_D -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA * ** * * **** ** * * ** * ** * ** * **** CAE.EL_D GC-GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA-CAC-TAAAGTGG * ** ** **** ** *** ** * **** * *** * * CAE.EL_D CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA ** ** * * * * * ***** * * ** **** ** **** CAE.EL_D CGGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA ZEA.MA_H AGGA------TAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT-------------------- *** * * *** * * * ** * *** * CAE.EL_D TCATTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 43.46%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ******* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** ** ***** * * * * *** **** * * LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ** *********** *********** *** ** ****** * *********** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGG-CCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCA **** *** *** *** ** ** * **** * * ** ** ** ** **** LYC.ES_E CATTTT TRI.AE_C TC----
Mean pairwise ID: 43.49%
HUM.LU_C ------GGTCTTAGCAACTTG-GTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAAC DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC ** *** *** ** * * *** ** * * * * * HUM.LU_C TTTGGGTCA-ACCCAGTG-GTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATG----TTGACGGAACGTCCGCACT * ** * * * * ** ** ** **** * * ** * * * ** * HUM.LU_C AAGCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAG----TCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAA **** * ** * * * *** ** * ** * * * ** HUM.LU_C AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC---CTCCCGCTCTCGGCAGT DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT * * *** *** * * * **** * * ***** * ****** HUM.LU_C GGAAGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAAT DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACTGCCGTTAT-CAGCCCAACCGATA--TGGT * ***** ** **** * ** * * * * ** * * ** * * HUM.LU_C AGGACCATTTCTTTT DRO.MEL. TGGACCACAATCTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 43.49%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ***** *** ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCT---TGCCCATCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC ** ** * * * **** * ** ** * ** * * ** * * ZEA.MA_A CAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGA CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCG-GAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAG **** * ** * ** * * *** ** * *** * * * * * ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG CAE.EL_A GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTG * * * * **** * * * * * * *** ** **** * * ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCT-CAGAACCTCACTAAG CAE.EL_A CAGTGGCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGA * * ** ** ** * * * ** *** ** * * * * ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT CAE.EL_A CCACTTATCATTT-- * * * *** *
Mean pairwise ID: 43.51%
LYC.ES_B ---GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG-GGGGCATTAATGTGGTGGAAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC ** ** * * * * * * ** * ** * ** * * ***** LYC.ES_B GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * ***** * * ** * * ** * * ** * *** LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA *** * *** * ** *** * * * * *** * *** LYC.ES_B CGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAG DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG * * * * *** *** * **** * * **** *** ** ** ** * * LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCA **** ** *** ** * * * * * * * * * ** **** LYC.ES_B CCACTTTT DRO.MEL. CAATCTTT * * ***
Mean pairwise ID: 43.51%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G * *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * * ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG **** ** * ** * * * * * * ** * * ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC--CCGTTCGA **** ** ** **** ** * ** ******* * *** * * * * * ** ** ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACCA TRY.BR_A GAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCGG * * ** * *** ** * * * **** ** ** * ** * ZEA.MA_G CCATCTTT TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 43.51%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG * * * * ******* ****** ** * * *** * LYC.ES_G GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ***** ***** * ***** * * * * * ** * * * * LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG- * * *** ** * * * * ** * ****** * * LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGA * ** * ** **** ** ** ***** * * * * * * *** ** * ** LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCTGTCA----TCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTT * ** *** **** ** ** *** * * * *** * ** * LYC.ES_G CCACTTTT LEP.COL. T-------
Mean pairwise ID: 43.51%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * * * * * HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** * * * * ** *** * * * * * * ** * ****** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT * ** * * *** **** * * * * *** *** * HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG * * * * * * * ***** * * * **** * ******* ** HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT CAE.EL_B ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCA-ATACCTT----CAGACCAC * ** * * * * * ** * * * ** ** * ******* HUM.JA_A CTCTTTT- CAE.EL_B TTGTTTTT * ****
Mean pairwise ID: 43.51%
LYC.ES_H -GTTG--AGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATA DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC ** ** ** * * * * * * * *** * * **** LYC.ES_H TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC * ***** * * ** * * ** * * ** * **** LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGAT ** * *** * ** *** * * * * *** * *** LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG DRO.MEL. GAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG * * * * *** *** * ***** ** ** ***** * ***** * ** LYC.ES_H ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGACCAC *** * *** ** * *** * * ** * * ** * * ** ** LYC.ES_H CACCTTTT DRO.MEL. AATCTTT- * ****
Mean pairwise ID: 43.52%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC ** * ** * * * ** ** ****** * * CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRY.BR_A GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG * * * * *** * * * * * ** ***** * ** * CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG ** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * *** CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG TRY.BR_A GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA * **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * CAN.SPE. T TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 43.55%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG ********** ******* * HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * *** * * ** *** ***** * **** * * * ** **** * HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG *** ***************************** ** ****** * * ******** HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGT--AGCCTACTCCAGCGACCAC *********** *** *** ** * ** ** ** **** * ** HUM.LU_A CATTTCTTTT TRI.AE_C CATC------ ***
Mean pairwise ID: 43.55%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT **** ** ** * ** **** ** * *** * * * * *** LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCCA GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * * * * * ** ****** *** **** * * ** * * LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * **** ** * * ** * * * * *** * ** LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC ** * * * *** ** ** ***** * ** * ** * * ** LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTG----GGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * *** ***** * * * ** LYC.ES_I CACCATTTTT GAL.GAL. C-CTGTCTCC * * * *
Mean pairwise ID: 43.56%
CAE.EL_C -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGT-GGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA * * * * * * * * * ** ** * * **** * * *** CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG TET.THE. GGATATGAG----AGTTTGATG-AGACAGTT-----TGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * *** *** ** * *** * * * * * *** **** CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * ** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** * CAE.EL_C TGGA-TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA * * * ***** * ** * *** **** **** * ** **** *** CAE.EL_C CAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT---- * * ** * * ** ** ** * * * * * ***** * * CAE.EL_C ACT TET.THE. ---
Mean pairwise ID: 43.59%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA--GGTGGTGCGGATT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA * * *** ******* ******* ** * * * * * ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC- LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGT-GCTCTGCTTGGCTG * * * * ** * *** ** ** *** * **** * * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT ** ** * * ** * * ** * * * * * * * * * **** ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGT * ***** * ** **** *** ** ******* *** ** * * ** ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG LEP.COL. TGCAGAACCAC--ACCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAG * ** * ** **** * * * * ** **** ** ** * ** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT LEP.COL. CTTT--------
Mean pairwise ID: 43.59%
ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC SCH.POM. ------CGCTGTAATG---GCTTG--GTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTT * ***** * ***** * ** * * * *** **** ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG SCH.POM. CG--GTGGT-CTCGGGTTCGAGTCTCGC-TTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCG ***** * * * * **** * * * * * * ** * *** * * * ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGA--AAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGA SCH.POM. AAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCG-ATGGAGGTTGGAAA *** * **** **** ** * ** * * * * ** * * ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTT-CATAGAGCAGCGAG-TACCGCCCG---CCACCAGCGGTGG SCH.POM. CAATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCGATAGCGATGGGATTCACCTTCGCAGG ** *** ** * * * **** * * ** ** * **** ** ** ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT SCH.POM. ATGTGCATGGAAGTA-TAAACACAACGGTCGTT * * * ** ** * * * * *
Mean pairwise ID: 43.61%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG * * * * ******* * **** *** * * * * * LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCT-TGGCTGTGTGTC * * * * *** * * * * ** ** **** ** * * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGAC LEI.MAJ. G-GTGTGGCTTGCCCCCCTGCA-GAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GAAC * ** ** ** * ** ** ** * *** ** ** * * * ** LYC.ES_F TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAGGATC LEI.MAJ. CGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATC * ** **** ** ** ***** * * * ** *** * * ** ** * ** *** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LEI.MAJ. ACACCGCGGAGC-----ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTC--GCGAAGCCTT-- ** * ** **** ** * ** * * * * ** ** * LYC.ES_F CTTTT LEI.MAJ. -----
Mean pairwise ID: 43.61%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG TRI.AE_C ---------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTA * *** ****** ******* *** HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAG--CCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA TRI.AE_C GTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCA-CGGTCCATAATGTGGCAGGCAC ** * * ** * * **** ** *** * * * * *** * ** **** HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA TRI.AE_C CGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAA ************ ******************* ****** * * ************ HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTT TRI.AE_C CGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCT-TGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC- ******* *** ** * *** * * *** **** * ***** HUM.JA_B CTTTT TRI.AE_C -----
Mean pairwise ID: 43.61%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG- ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT *** * ** *** * ** *** * * * * ** ********** CAE.BRI. -GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA * ** * * **** * * ** *** * * ** * ** * **** CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAG----GGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG ZEA.MA_H GT--TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGT * ***** * * ** * * * ** *** * ** ** * * *** CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC ZEA.MA_H GGCGG-ACATTGCGTGAGGCTGGCTT-CATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCAC--CAGC * ** ** ** *** * ** *** ***** ** * ** CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTG ZEA.MA_H GGTGGAAGGATAATGAGT---CGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------- * * * * ***** **** * * ** * * * CAE.BRI. TCATT ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 43.61%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ****** ** LYC.ES_J AGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC **** * * * **** * **** * ***** ** * * * *** **** * LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ***** ********************** ** * ****** * ********** LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCA ** *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** *** LYC.ES_J CCTTT TRI.AE_C TC--- *
Mean pairwise ID: 43.62%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACC-------TTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCG ** * ** ****** * ** * ** * * * * * ** XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT LEI.MAJ. GGGAGGACGTGGACCAGCGAGG-GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCT * * *** * * * * *** ** ** **** * ** * * XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT LEI.MAJ. GTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG ** ** * *** * ** * * * * * ** * * * XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGAT LEI.MAJ. GAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCAGAAT ******* **** ************** ** * * * * * * ** * * ** XEN.LAE. CGCGCCTGTGAATA-GCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT LEI.MAJ. CACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGA-GCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT----- * * ** ** * * * * * * ** * * **** *
Mean pairwise ID: 43.67%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC ** ** * * * ** ** ****** ***** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG TRY.BR_B GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG * * * * *** * * * * * ** ** ** * *** * GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * ** * * * * * ** * ***** * * *** * **** GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA TRY.BR_B GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * * GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT---- * * ** ** * * ** * * ** * * * ***** * * *
Mean pairwise ID: 43.67%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT-CGGGGGCTGATCCCGCTTAG ** ** ** * ** * * * *** * * * * * CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCT--GTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * * * * * * * *** *** * * ** *** * ** * *** * CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG * **** * ** * * ** **** ** ** ** *** * * ** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA TRY.BR_B GAACGGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC * **** ***** * * * * ***** * * * *** ** * * ** ** * * CAE.BRI. GCGCTTGTGAGT-TGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT------ * * *** * ** * ** ** * ** * **
Mean pairwise ID: 43.69%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG ********** ******* * HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * *** * * ** *** ***** * **** * * * * ** **** ** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TRI.AE_C CACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** ***************************** ** ****** * * ********* HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC TRI.AE_C TAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGT--AGCCTACTCCAGCGACCACC ********** *** *** * * ** ** ** **** * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT TRI.AE_C ATC------ **
Mean pairwise ID: 43.69%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G * *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * * ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG **** ** * ** * * * * * * ** * * ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGG TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA **** ** ** **** ** * ** ******* * *** * * **** * * ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGC---ATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG ** * * ** * ** * ** * * * **** ** ** * ** * ZEA.MA_G ACCATCTTT TRY.BR_B GTTT-----
Mean pairwise ID: 43.69%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA * * * ******* * *** * * * * * ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTG--TTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT LEI.MAJ. CGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGTGT * * ** ** * ****** ** *** * * * ** **** * ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LEI.MAJ. CGGTGTGGCTTGCCC---CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAG--CGAGGG * *** * ** ** *** * * * * * * * * *** ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCAGCAGTGGACGG LEI.MAJ. AACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGA * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * * ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCC-GCTTGAAC LEI.MAJ. ATCACA---CCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * ** * ** ** **** * ** * **** * ** * ARA.TH_G CACCATTTT LEI.MAJ. ---------
Mean pairwise ID: 43.71%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCG-GA TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTG--TCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGA * * *** ** * ***** * * * * * * * * ** GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAA * * * * ***** * **** **** ** * * * **** * ** GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA * * ******* ** * * * ******* *** GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** ** GAL.GAL. AT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCT TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT-CGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT---- ** * * * ** * ** * * * ** *** **** * GAL.GAL. CC TET.THE. --
Mean pairwise ID: 43.71%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTA--CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAG- ** * ** ***** * * * ***** ***** HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA LEP.COL. -CTGTCTGGACC--AGCATAGGGTGCT-TGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTG-GCTG * ** ** * * * *** * *** * * ** ** * ** HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG ** * * * ** ** ** * ** **** * ** * *** * * HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG LEP.COL. AG-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GTTGCAG * **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** * * HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCT LEP.COL. AACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT---- * * * ** ** * ** * ** * ** ** * * ** * HOM.SA_B CT LEP.COL. --
Mean pairwise ID: 43.71%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- *** * * * ***** * * ** *** * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G * *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * * LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC TRY.BR_A TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA ** ** * * * * * ** * * * * * * ********** *** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCAC ** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** ** * * LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCT TRY.BR_A ACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------- ** * * * *** * * **** * * ** * * * LYC.ES_A TT TRY.BR_A --
Mean pairwise ID: 43.71%
DRO.MEL. ---------GACTG-GAAGGTTGGCAGCTTCTGTA-----ATCACGCTTCTGTGAGGTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ** ** * * * * * ** ** * * ***** ** DRO.MEL. G--ATTGTGGGATGGCCTGAGGCTGGGAT--CTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGA TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC * * * * ** * * ***** ******* * * ** ** **** DRO.MEL. CGGAACGTCCGCACTAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTC TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC * **** **** ** ***** ** ** * ****** * DRO.MEL. AGGTTGGCTAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCG TRI.AE_A ACAGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGC-AGCGACAACTGCCCGCTTCCAA------CGG * * * *** ** * ** * ** ** * * ** ** **** * * DRO.MEL. TGGTAGGCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATAT TRI.AE_A TGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAG-- *** *** * * ** ** * * ** * ***** * * * DRO.MEL. GGTTGGACCACAATCTTT TRI.AE_A ---CAGACCACC------ ******
Mean pairwise ID: 43.73%
LYC.ES_K -GTTG--AGCTTAGTAACGTGGGC--TTGTAATCCAAGTGGA---GACATCAAAGTGGTT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC ** ** ** * * * * * * * * * ** *** LYC.ES_K GAATATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGC-GGACCAGCTCATGTTGAC---GGAACGTCCGCACT * **** * *** * ** * * * ** ** * ** * LYC.ES_K AAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG **** * * * * * ** *** *** * * **** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG ** * **** *** ** * ***** ** ** ***** * ***** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTT--ATCAGCCCAACCGATATGGT----TGGA ***** * *** ** * *** * * ** * * ** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT DRO.MEL. CCACAATCTTT * ** * ****
Mean pairwise ID: 43.73%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** *** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-TGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTG--CTTG * *** * * * *** * *** *** * ** * * * * * ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTC-GCGCCGTTAAAGTGG **** ** ** ** ** * * * * * * **** ** * ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGAC-TCCCAACGGTGG TRY.BR_A GGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG **** ** ** **** ** * ** ******* * *** ** * ** * ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA TRY.BR_A AAGCACACCGAGGA----GCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTC--GCGAG ** * * *** * *** * * ** * ** * * ** ** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRY.BR_A GCGG------- *
Mean pairwise ID: 43.75%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG ** ** *** ** *** *** * *** * * * CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * * * * ** * * ** ** * *** *** * * * *** ** CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG ** *** ** ** * * * *** *** * * ***** * * * * * CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGT-GCAGTGGCC LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCAC--CCCACGCACGTCCGCCGTTGCA ** ** ***** * **** * ***** * * ** *** ** ** ** ** CAE.EL_B GGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---- * * * * *** ** * ** * * * * ** CAE.EL_B TTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.75%
LYC.ES_I GCCG-AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGC--TTAGCGGGGAGGACG--- **** **** * *** *** * ** ** *** * ** *** LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LEI.MAJ. ----TGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC ** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LEI.MAJ. GGTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAA * *** * ** *** * * *** * *** * * * * * LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTC-TAAGCGGTGGAAGGATA LEI.MAJ. CCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCC-CACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATC * ** **** ** ** ***** * * *** * * ** ** * ** ** LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LEI.MAJ. ACACCGCGGAGCA---TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT--- ** *** * ** ** * *** * * * * * * * ** LYC.ES_I TTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 43.75%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG YAR.LI_B --------AGCTGTAATGGCATTT---TGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG--TG *** ** * * * *** * * ** ** * * * * TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG-AGTTG YAR.LI_B CGTTCGAGTTCTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTG * *** * ** ** * **** ** ** *** ** ** **** TET.THE. CTATG-GTGGTAACCT-AGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG-GAAACG YAR.LI_B ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATA * * ** ** ****** ** * * * ** * *** * * TET.THE. CCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACAT YAR.LI_B CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGATAGCAA * **** **** * *** ** * ****** * * * *** ** ***** ** TET.THE. ACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT YAR.LI_B CAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC---- * * * * * * * * * **** *
Mean pairwise ID: 43.77%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG *** * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * ** * ** * *** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG CAE.EL_D TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA * * *** ** *** *** ** * ** *** * * *** * HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA CAE.EL_D GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGC--GTGGTGCAG * **** * ** ** * * * ** ** **** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCAC---CATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA CAE.EL_D TGGCCGGACCGCGCT-TGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA * * ** * * *** * ** ** *** * * ** * * * ** HUM.LU_A CCATTTCTTTT-- CAE.EL_D CCACTTATCATTT *** ** * *
Mean pairwise ID: 43.79%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG * * * * * ******* **** ** * * *** * LYC.ES_N GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ***** ***** * ***** * * * * * ** * * * * LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC LEP.COL. GTCGGAG-GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * * * ** * **** *** **** ** * * *** ** * LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC---CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** ** **** ** ** ***** * **** * * * * * * LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTTT- *** * * * * *** ** **** * * * *** * ** * LYC.ES_N ATTTTT LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 43.79%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG- ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTAGTGTGGATGT ****** ** *** * ****** * * * * ** ********** CAE.EL_A -GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTG---GACCACCCATTCCAA * ** * * **** ** * * * ** * ** * ** * **** CAE.EL_A GC-GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA-CAC-TAAAGTGG * ** ** **** ** *** ** * **** * *** * * CAE.EL_A CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA ** ** * * * * * ***** * * ** **** ** **** CAE.EL_A CGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA ZEA.MA_H AGGA------TAATGAGTCGCTATGC-TATA-GGCCCAAT-------------------- *** * ***** * * * ** *** * CAE.EL_A TCATTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 43.81%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAG-GCTTGGGCTGTCGGATC SCH.POM. -------------------CGCTGTAATG-GCTTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATA ******* * * * ** * ** * * ** XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT SCH.POM. GTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACGT * ** * * ** *** * * * * * ****** * * * * ** XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG SCH.POM. CTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGG-------------CAACTGGCAGT--TAAACCGTGT * * * * ** *** *** ** * ** * *** * * XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** *** * *** * * * * **** ** XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACA-ACGGTCGTT * *** ** ** * ** **** * * * * * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 43.83%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ****** ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGC-GGGGCG ***** ** * * * *** *** *** * * ****** ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * ******* ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAC-TAAACCA * * * * * *** *** ** ** **** *** * ** * * ***** ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_D CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 43.83%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * * ***** * * * * * * * **** * * LYC.ES_K GGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT *** * ***** * * ***** * * * * * ** * ** * * LYC.ES_K ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG- * * * * *** * ** * ** * ***** * * LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC--CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG * ** * * **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * ** LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA LEP.COL. AACCACACCGCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- * * *** * ** *** *** **** * * * * ** * LYC.ES_K CCACCTTT LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 43.85%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT * * *** ** ***** * * * ** * * * ** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATG-----AGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * * * ***** * * * *** * * *** **** * ** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * ******* ** * * ** ******** *** ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT--CCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----- * * * * ** * *** * * * ** *** **** * ORI.CUN. C TET.THE. -
Mean pairwise ID: 43.85%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTA--GAAT * * *** ** * ****** * * * * ** * ** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA * *** ***** * **** **** ** * * * *** * ** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * * ******* *** * GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** *** GAL.GAL. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** ** * * * * **** ** GAL.GAL. C TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 43.86%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAA---TAGTC LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCT *** * * * **** **** * *** * ** * * ** * TET.ROS. AGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTT LEP.COL. GGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGG ** * * ** ** * *** * * * * * * TET.ROS. GCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCC LEP.COL. CCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-AGTAGAGGAACTGGG ** ** * *** * * *** * ** * * ** ** ******* * TET.ROS. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACAC-CG ****** ****** ** *** * ** ** ** ** * ** * *** * TET.ROS. CATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT LEP.COL. CGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT * ****** ** * * ** * * * *
Mean pairwise ID: 43.87%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ** * * * ****** ** ** ** * * * * *** * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * *** HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * ** * * * **** ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC RAT.NOR. GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGAC *** ** *** *** ***** * * ** * ** ** ** *** HUM.LU_C CATTTCTTTT RAT.NOR. CCGTCTCT-- * * *
Mean pairwise ID: 43.87%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGA--CATTAAGATGGTGGGACAC LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * * * ******* * *** ** * ** * ARA.TH_A TGGTTCGGTTC-CTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT- ** * * * * * ** * ** * * ** * ** *** * ** ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG---TTAAAGTAGAG * * * *** *** * ** ** * * * ** *** * ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGA LEP.COL. GAAC--TGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC * ** ** **** *** ** ******* * ** ** *** * ** ** * ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA LEP.COL. AGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC----TGCGCCCCAGG--CGATCC--TGTGAA * * *** * * * *** *** ** * * ** ***** * **** ARA.TH_A CCACCATTTT LEP.COL. GCTTT----- *
Mean pairwise ID: 43.89%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * * ***** *** * * *** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG YAR.LI_A TGC-GTTCGAGTC--TTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** * ** ****** * * * * ** *** *** * * * LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC YAR.LI_A CGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * *** **** ***** * * * * ** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA YAR.LI_A TGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTATGG * * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * ** LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC YAR.LI_A CGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT--ATGTTATGGAAGATATT----TACGATCACGAT *** * * * ****** ** *** * * * * * *** * LYC.ES_O TTT YAR.LI_A T-- *
Mean pairwise ID: 43.93%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT------TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACA ** * ** * ****** * * ** ***** * * ** * XEN.LAE. CTTGAGT-CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTG-TCCGC---ACT LEP.COL. GGGAGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTT-GCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCT * * *** * ** ** ** ** **** ** ** ** XEN.LAE. AAGT-TCGGTATCAATATGGTGTTCC--TGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA LEP.COL. GTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCC----TCCGTTAA ** **** * **** ** ** * ** ** * ** * * *** XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGT LEP.COL. AGTAGAG-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT * * * **** ** **** *** ********** ** * * * * * * ** XEN.LAE. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACA LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT * * * * * ** ** * * ** * * * * ** * XEN.LAE. GTTCT LEP.COL. -----
Mean pairwise ID: 43.93%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGA-AATGGGACTTTAGTT TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT--CT *** * * * ******** * *** ** * * *** * * HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCA-TTCCAAGCCGAG TRY.BR_A TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT ** * * ** ** * * ** **** ** **** ** * * ** HUM.JA_B AGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA TRY.BR_A GTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGTGGGGGG-AA * * * * * * * *** ** ** ***** ** *** ** HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA * ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** ** * * HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTT TRY.BR_A CACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGG-------- * ** ** ** * * * ** * * * * * * HUM.JA_B CTTTT TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 43.93%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ****** ** LYC.ES_A AGTTGGATC--TCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC **** * * * **** * **** * ***** ** * * * *** **** * LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ***** ********************** ** ** ****** * ********** LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCA ** *** ** ** * * ** * * **** * * * ***** * ** *** LYC.ES_A CCTTT TRI.AE_C TC--- *
Mean pairwise ID: 43.95%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** * *** * * * * *** *** * ***** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * * LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCG-----TAAAGTG YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * *** * * * * * ** *** * ** **** *** * LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATA-AGTTTCCGCTCTAA--GCGG YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAG--TGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGG ** ** * * ** *** * **** *** **** *** * **** LYC.ES_B TGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATT YAR.LI_B TGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC----- *** * *** * *** * * * *** * * * *** LYC.ES_B AAACCACCACTTTT YAR.LI_B --------------
Mean pairwise ID: 44.01%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTGT TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA *** ****** ****** ** ARA.TH_G G-AGTGAACCGTATGAA--CCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGG-CCTCACGGTCCATAATG-TGGCAG * **** **** ** * * ***** *** * ** ***** *** * * * * ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * * **** ************************ ** ****** ** * ***** ** ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCC-------TCGTAGCCTACTCCAGCG * ***** ** ** * * ** ** ** * ***** ** ** * * ARA.TH_G ACCATTTT- TRI.AE_C ACCACCATC **** *
Mean pairwise ID: 44.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGACAGGAG **** ** * ** *** ******* ** *** * * *** * * * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC RAT.NOR. GATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC * * ** * * * * * * * ** * ** * * * ** *** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------CC ***** * * ** * ** ** * ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA RAT.NOR. TAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGA *** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA RAT.NOR. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-CCAGCCTGGG----CAACA ** ** * **** * ** ** * * ** * *** * * * ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT RAT.NOR. TAGCGAGAC-CCGTCTCT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.03%
LYC.ES_M --------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGG YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGC-GTTCGAGTT-- ** ** ** *** * * *** ** ** * ** * LYC.ES_M CTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACG YAR.LI_B CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGAT-GGG **** ** * ******* *** * ** *** *** * * * * * *** * LYC.ES_M AGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTG YAR.LI_B CGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTG-----GGATA * * * * ** ***** **** * * * ** * ** * LYC.ES_M GCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGA-AGGATAATGGGTCGGTG YAR.LI_B CTTCAGTGGAGCAATC--CAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCA * ***** * **** * ** ** **** * * **** * LYC.ES_M TCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT YAR.LI_B ----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGACTCTC--- * **** ** * *** * **** * * ** *
Mean pairwise ID: 44.05%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA--GGTGGTGCGGATT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA * * *** ******* ******* ** * * * * * ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC- LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGT-GCTCTGCTTGGCTG * * * * ** * *** ** ** *** * **** * * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT ** ** * * ** * * ** * * * * * * * * * **** ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCG-TT * ***** * ** **** *** ** ******* * ** * * ** ** * ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA LEP.COL. GCAGAACCACA--CCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGC * ** * ** **** * * * * ** **** ** ** * ** ZEA.MA_G CCACCATCTTT LEP.COL. TTT--------
Mean pairwise ID: 44.05%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG * * * * * * * *** * ** * * ** * ** * * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * ** ** * * ** * * * * * *** * ** * ****** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG CAE.EL_B GCTGCGTCA--CCAGGGGA--TGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG * * * **** ** * ** ** * * * * * * HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ******* * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAG--TTGA--CACGTATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCAGAC ** * ** *** * **** ** * ** * * * * * *** HUM.LU_C CATTTCTTTT- CAE.EL_B CACTTGTTTTT ** ** ****
Mean pairwise ID: 44.05%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * ** ** * ** ***** * * * * * * *** * ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA **** * ** ** ** ** * ** * **** * ** **** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG ** ** ** * * * * * ** * * ** * *** * *** * ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC * * * ** *** * * ***** * * ** * ******* ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC CAE.BRI. GGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTC----TCTGATACCTTC-AGAC **** ** *** * ** * * *** * *** ** * *** ARA.TH_D CACCACTTT-- CAE.BRI. CACTTGTCATT *** *
Mean pairwise ID: 44.06%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGCCCGCCG **** ** * ** *** ******* ** *** * * *** * * * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT GAL.GAL. GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG-CCGAGCGGGC--GTCCGC * * ** * * * ****** ** * * * * ** *** * *** ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC GAL.GAL. GCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCC----CGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTG-- * *** * * ** * * * ** * * * * * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC GAL.GAL. CCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCC ***** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC GAL.GAL. GGTCAGTAACGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGG---CAA ** ** **** * *** * * * ** * ** * * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT GAL.GAL. CATAGCGAGACCCTGTCTCC * * * * * ***
Mean pairwise ID: 44.08%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC TET.THE. ----GCCAGGGTAGCAATACCTGT------GTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG * *** * *** **** * * * ** ** * * * * * DRO.MEL. TGA-GGCTGGGATCT-ACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTT--TGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA *** * * **** * * * * * *** * ** * * * * **** * ** DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA * * ***** * * ** * * * * **** *** DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG * *** ** **** * ** * *** ** * ** *** * ** * ** DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCG---TTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAAT TET.THE. ATAACATACTC--ATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT--- *** * *** * **** * * *** * * ** * * *** DRO.MEL. CTTT TET.THE. ----
Mean pairwise ID: 44.08%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTC-TGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTAACCAGGCTTAG ** ** *** ** *** *** * *** * * * CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * * * * ** * * ** ** ** *** *** * * * *** ** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA----TAAGGAG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGT--GGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG * *** ** * * * * ** *** * * ***** * * * * * CAE.EL_A TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAG * ** ***** * **** * ***** * * * * *** ** ** ** * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGC--ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * * * * *** * * ** * * ** * * * ** *** CAE.EL_A ATTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 44.12%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCT--TAGCGGGGAG * * *** * ****** * * * * *** * * * * * LYC.ES_C AACATGC-CCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA LEI.MAJ. GACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCT---GTGT ** ** **** * * *** ** * * ** **** * * LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG LEI.MAJ. GTCGGTGTGGCTTGCCC-CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GA * ** * **** ** ** *** * * ** * * ** * *** * ** * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAAT ** * ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** ** LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LEI.MAJ. CACACCGCGGAG-CATGTCCGC---ACTTGAGCCCCACGCTTCGTC---GCGAAGCCTT- ** * * * *** * * ** * * * * ** * ** * LYC.ES_C ACATTT LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 44.12%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG * * * * ******* ****** ** * * *** * LYC.ES_I GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ***** ***** * ***** * * * * * ** * * * * LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC LEP.COL. GTCGGAG-GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * * * ** * **** *** **** ** * * *** ** * LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC---CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** ** **** ** ** ***** * **** * * * * * * LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTTT- *** * * * * *** ** **** * * * *** * ** * LYC.ES_I ATTTTT LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 44.12%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TRI.AE_C ----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGT ********** ******* * * HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCA TRI.AE_C AGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA *** * * ** *** ***** * **** * * * * ** **** **** HUM.LU_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************ **************** ** ****** ** * *********** HUM.LU_B ACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCT-ACTCCAGCGACCACCATC ******** *** * * * ** * * * * *** **** ***** HUM.LU_B TCCTTT TRI.AE_C ------
Mean pairwise ID: 44.12%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTG-TGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG LEP.COL. ------------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGC-TGAACA * *** **** * ** * **** * * * ** ** * CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LEP.COL. GGG--AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGG * * ** * * ** * ** * * * * *** *** * * * *** * CAE.EL_C CGCTGCGTCA----CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA LEP.COL. CTGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-A * ** *** ** ** ** * * *** ** * ** * * * * * CAE.EL_C GTGGTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG LEP.COL. GTAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTG ** * *** *** ***** * * ** * ***** * * * * ** *** ** * CAE.EL_C CCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- * * ** * * *** * * ** * ** * * * * CAE.EL_C GTCACT LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 44.12%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA LYC.ES_D -----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA * ** **** ****** ******* ** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT LYC.ES_D GTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACC ** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * * HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC LYC.ES_D GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT ** ********* ************ ** * ********* *************** HUM.LU_B GGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT LYC.ES_D GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG--GTTGCTCC-AACTAAACCACC *** ***** ** ** ** * * * *** * *** ** **** HUM.LU_B TCCTTT LYC.ES_D ACTTTT * ***
Mean pairwise ID: 44.12%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * ******* ****** * ** * * * * LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** * LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TRY.BR_A TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA **** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** ** * LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- ** ** * * * * **** * * ** * * * LYC.ES_I ATTTTT TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 44.12%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTG-TGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG LEP.COL. ------------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGC-TGAACA * *** **** * ** * **** * * * ** ** * CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LEP.COL. GGG--AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGG * * ** * * ** * ** * * * * *** *** * * * *** * CAE.EL_B CGCTGCGTCA----CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA LEP.COL. CTGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA-A * ** *** ** ** ** * * *** ** * ** * * * * * CAE.EL_B GTGGTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG LEP.COL. GTAGAGGAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTG ** * *** *** ***** * * ** * ***** * * * * ** *** ** * CAE.EL_B CCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- * * ** * * *** * * ** * ** * * * * CAE.EL_B GTTTTT LEP.COL. ------
Mean pairwise ID: 44.13%
TRY.BR_A AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCT-TCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCT *** * * * **** * * * ** ** * * *** ** * TRY.BR_A GGAC---AAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGC--TTGGTTG-CGTGTCG YAR.LI_B GGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCG **** * *** * ** * ** * * ****** *** * * *** *** TRY.BR_A GTGTTGA-GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGT YAR.LI_B GTCTGAGTAATCGGCTTTG-AGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAG ** * *** * ** *** ****** * * ** TRY.BR_A CAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGA YAR.LI_B CAATCCAGCAGAGATCCAGTT-GCCGTGGGTATGG---CGGTGGGATAGCA-ACAAAGTG ** ** * * *** ** ** * * * ** * * **** ** ** TRY.BR_A GCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG YAR.LI_B GTATAT----GTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC * ** * * ** * ** ** *** *
Mean pairwise ID: 44.16%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_D --------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG **** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCC--AACTAAACCA ** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * ** **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_D CCACTTTT *****
Mean pairwise ID: 44.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRY.BR_A TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G * *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * * ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG **** ** * ** * * * * * * ** * * ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTCG **** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** * ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC TRY.BR_A AGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG ** * *** * *** ** * * * **** ** ** * ** * ZEA.MA_D ACCATCTT TRY.BR_A G-------
Mean pairwise ID: 44.16%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** *** * * ** ***** *** * * * *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * * LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG YAR.LI_B CTGCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * *** * * * * * ** *** * ** **** * * LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA-AGG YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAG--AGATCCAGTT----GCCGTGGGTATG * ** * * ** ** *** ** *** * * ** **** * * LYC.ES_H ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC YAR.LI_B GCGGTGGGATAGCA----ACAAAGTGGTATATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCA-CGAC **** * * **** ** * *** * **** * * ** LYC.ES_H CACCTTTT YAR.LI_B TCTC---- *
Mean pairwise ID: 44.16%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-G ** * * * ******* * *** * * * * ** * * ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCG------TTGACGTGGTGCTCTGCTTG-GCTG ** * ** * * ** ** * ** * * *** * * **** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAG-GCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LEI.MAJ. TGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGG ** ** * * * * ** * **** * * * * ** ** *** ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGACG LEI.MAJ. GAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAG * * * ** **** ** ** ******* * ** * *** * ** ** * * ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG-TCGCG---AAGCC ***** * * ** * **** *** * * ** ** * * ** ARA.TH_A ACCATTTT LEI.MAJ. TT------
Mean pairwise ID: 44.16%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGG--CAACAATGTGGTGGAATGT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * * * * ******* * *** ** ** * * LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGG-GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCT-TGGCTGTGTG ** * * * ** * * ***** * * * * ** ** **** ** * * LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTAT-ACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG LEP.COL. TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG-G * * *** * * * *** ** * ** *** *** * * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAGG LEP.COL. AACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA **** ** **** ** ** ***** * * * * *** * * *** ** * ** LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA LEP.COL. ACCACACCGCGGAGCCT-----GTCATCACCTGCGCCC--CAGGCGATCCTGTGAAGCTT * *** * ** *** * ** ** *** * * ** * LYC.ES_F TCACTTTT LEP.COL. T------- *
Mean pairwise ID: 44.16%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * * ***** * * * * * * * **** * * LYC.ES_J GGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT *** * ***** * * ***** * * * * * ** * ** * * LYC.ES_J ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG- * * * * *** * ** * ** * ****** * * LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC--CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG * ** * * **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * ** LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA LEP.COL. AACCACACCGCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- * * *** * ** *** *** **** * * * * ** * LYC.ES_J CCACCTTT LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 44.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--G * *** * * * *** * * * * * *** * *** * * * * ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG **** ** * ** * * * * * * ** * * ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTGC **** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** * ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC TRY.BR_B AGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCG ** * *** * *** ** * * * **** ** ** * ** * ZEA.MA_D ACCATCTT TRY.BR_B GTTT----
Mean pairwise ID: 44.16%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_D ---------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGTAATCT-GTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG ***** * * ** ** *** ** * * ****** *** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * **** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC-CAACTAAACCA * ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * ** * ** **** ARA.TH_D CCACTTT- LYC.ES_D CCACTTTT *******
Mean pairwise ID: 44.19%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG- CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC * ** * * *** * ** * ** * * * * *** * * **** ** ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG-ACCTGAAGCG CAE.EL_D AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAG *** ** * * ** * * ** * * * * ** * * * * * * ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG CAE.EL_D TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGC-AGTGGCC * * **** * * * ** * * *** * * * * ** ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC CAE.EL_D GGACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCA---GACCACT *** * * ** ** * ** * ** * * * *** ** ZEA.MA_F CACCATCTTT CAE.EL_D TATCATTT-- * *** *
Mean pairwise ID: 44.19%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** ********* ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC * * * * * ***** * * * * * **** ***** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAG-GGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG ** *** ** ** ** * * * * * * ** * * ** * * ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTT-CACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTG----CAGTGGCC * ***** *** * ** *** *** ** * * * **** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC CAE.BRI. GGATAGC--GCTTGTG-AGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT ***** * ** ** ** ****** * **** * * * * ZEA.MA_C CACCATTTTT CAE.BRI. TGTCATT--- ****
Mean pairwise ID: 44.19%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGC ** * ** * * * ** ** ****** * * CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRY.BR_B GGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC----TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG * * * * *** * * * * * ** ***** * ** * CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG ** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * *** CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG TRY.BR_B GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA * **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * * CAN.SPE. T TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 44.19%
CAE.EL_A -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCT-TTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTG * **** * * * *** * * * * * * * * ** ** CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LEP.COL. GACCAGCATAGGG-----TGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT---G ** * ** ** * * ***** * ** * * * * *** * CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG LEP.COL. TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGG * * * ** ** * ** * ***** ** * *** * *** ** * CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC LEP.COL. -AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGAAC *** ***** * * ** * ***** * * ** * *** *** ** ** * ** CAE.EL_A CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATT LEP.COL. CACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-------- * * * *** ** ** ** **** * * * * CAE.EL_A T LEP.COL. -
Mean pairwise ID: 44.19%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAA-TGTGGTGGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * * ** ** ** ** **** ** ** * **** * * * * *** LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCCA GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * * * * * ** ****** *** **** * * ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * **** ** * * ** * * * * *** * ** LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC ** * * * *** ** ** ***** * ** * ** * * ** LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTG----GGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * *** ***** * * * ** LYC.ES_N CACCATTTTT GAL.GAL. C-CTGTCTCC * * * *
Mean pairwise ID: 44.19%
CAE.EL_D -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCT-TTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTG * **** * * * *** * * * * * * * * ** ** CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LEP.COL. GA-CCAGCATAGGGTGCTTGCG-GCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGC-TGTGTGTCGGA ** ** *** * ** * ** * *** ** * ** * *** * CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG LEP.COL. GGC-----CTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGG ** * ** ** * ** * ***** ** * *** * *** ** * CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGAC LEP.COL. -AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTTGCAGAAC *** ***** * * ** * ***** * * ** * *** *** ** ** * ** CAE.EL_D CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATT LEP.COL. CACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-------- * * * ** ** * ** **** * * * * CAE.EL_D T LEP.COL. -
Mean pairwise ID: 44.19%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCA----TGTGGGGACATTTAGATGGTGGAAC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * ** * * ** *** * ** ** * * * ** * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA * ** * * * * *** *** * * * * * ** * ** **** ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG ** ** ** * * * ** * * **** *** * *** * ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC * * * ** *** * * ***** * * **** ******* * ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAA CAE.BRI. GGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATAC--CTTCAGACCAC **** * ** * ** * * * * * **** *** * * *** * * ARA.TH_E CCACCATTTT CAE.BRI. TTGTCATT-- ****
Mean pairwise ID: 44.19%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATC-CAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTA--GAAT * * *** ** ******* * * * * * * ** * * * ** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAG-----TTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA * *** ***** * *** * ** * * *** **** * ** FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * * ******* * * * ******** * *** * FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA * *** * **** ** *** * **** *** *** ** * *** FUG.RUB. T--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT----- * * * * * ** * * ** * *** ** *** * FUG.RUB. T TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 44.19%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT * * * **** * * *** * * ** CAN.SPE. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * ** ** ******* *** **** * * ** ** * ** CAN.SPE. GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTGG * * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * ** CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_M GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACCC LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC **** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * * CAN.SPE. CGTCTCT--- LYC.ES_M AACCACCTTT * *
Mean pairwise ID: 44.19%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** ** ** * ** **** ** * *** * * * * *** LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCCA GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * * * * * ** ****** *** **** * * ** * * LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * **** ** * * ** * * * * *** * ** LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC ** * * * *** ** ** ***** ** * *** * * ** LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCC---TGGGCAACA-TAGCGAGAC **** ** * * *** * * *** *** ***** * ** * ** LYC.ES_B CACCACTTTT GAL.GAL. CCTGTCTCC- * **
Mean pairwise ID: 44.19%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ** * * * * ****** ** ** ** * * * *** * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * * ***** ** * ** * * *** ** ** ** * *** HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * ** * * * **** ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC HOM.SA_B GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA--TAGCGAGAC *** ** *** *** ***** * * ** * * ** ** *** HUM.LU_C CATTTCTTTT HOM.SA_B CCCGTCTCT- * *** *
Mean pairwise ID: 44.20%
ARA.TH_G ------------GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCAC-GCTTCTG---TGAGGTCTGATTGTGGGAT * * * ***** * **** * ** ** * * *** ARA.TH_G GGTGGAACACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCC DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCT-----CATGTTGACGGAACGTCC ** * **** * ** **** * * *** *** * ** ARA.TH_G AATCCAAGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTAC-GGTTGCTA DRO.MEL. GCACTAAGCTTGCCATCAAT-ATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCT * ***** * ** * * *** * ** * * * * ***** ARA.TH_G AAGGTTGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAG DRO.MEL. AAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGG **** * * * * * *** ** * ****** * * ***** * * ARA.TH_G CAGTGGACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACC DRO.MEL. CAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCG--ATA **** * *** * ** ** * * * * ** ** ** * ARA.TH_G CGCTTGAACCACCATTTT- DRO.MEL. TGGTTGGACCACAATCTTT * *** ***** ** **
Mean pairwise ID: 44.20%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGCTGGAG **** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC HOM.SA_A GATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC * * ** * * * * * * * ** * ** * * * ** *** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC HOM.SA_A TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------CC ***** * * ** * ** ** * ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA HOM.SA_A TAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGA *** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA HOM.SA_A TCAGTAGTGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG---CAACA ** ** * **** * *** * * * ** ** * * * * ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT- HOM.SA_A TAGCGAGACCCCGTCTCTT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.22%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- ** * * * *** **** * * * *** * * CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA TRY.BR_A GTCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTG-CGTTG-ACTTGGTGTTC---TGCTTGGTTGC ***** *** * ** ***** * * * ** *** * * * * ** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC TRY.BR_A GTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG-- * ** *** ** * * ** * ** * * *** * * ***** CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT TRY.BR_A AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAG ** * ** **** *** ** **** ** **** * * * ** ** * CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGC-TAGCCCAACAGGACACCCA TRY.BR_A CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------- *** **** *** *** * ** ** * * ** * * CIN.HYB. TTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 44.22%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTC-TGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGT * *** * *** **** * * ** * * * ** * * ** * DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG TET.ROS. CAGAGTATGAGAGTT------TGATGAGACAGTT--TGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA * *** ** ** * * * *** * ** * * * * *** * ** DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ***** * * ** * * * **** *** ** DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** **** * ** * *** ** * ** *** * ** * *** DRO.MEL. TAGCGTACCGGAGTGGACTGCCG---TTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC TET.ROS. TAACATACTC--ATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT---- ** * *** * **** * * *** * * * * ** * *** DRO.MEL. TTT TET.ROS. ---
Mean pairwise ID: 44.23%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA **** ** * * *** * * * ** * * * * * * ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * * **** * * * * ***** * * * **** * * *** ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCAG CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** ** * * * * ** *** * * * * * ZEA.MA_G ACCACCATCTTT CAE.EL_D CTTATCATTT-- * *** *
Mean pairwise ID: 44.23%
ARA.TH_C --GTCGAAC-TCAGTAACGCGGGC--TTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * *** * * * * * * * * * * ** ******* ARA.TH_C CGTTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTC DRO.MEL. TGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAG----CGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC * ** * * * ** * * *** * ** ** ** ** ** * ARA.TH_C CAAGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGT DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA *** * * * * * ** * ** * ** *** ** *** * ARA.TH_C GGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTG DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA *** **** * *** *** * ****** * ***** * * * ** ARA.TH_C GAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGG * **** ** ** * * * * * * * * *** * * **** ARA.TH_C ACCATCACTTT- DRO.MEL. ACCACAATCTTT **** * **
Mean pairwise ID: 44.23%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA **** ** * * *** * * * ** * * * * * * ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAG-CGACCGCGTGGTGCAGT * * * **** * * * * ***** * * ** **** * * ** ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCA CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC ** *** * ** * * * * ** *** * * * * * ZEA.MA_D GACCACCATCTT CAE.EL_D ACTTATCATTT- * *** *
Mean pairwise ID: 44.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ****** ** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** ** ***** * * * * *** **** * * LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************** *********** *** ** ****** * *********** LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGG-CCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCA **** *** *** *** ** ** * **** * * ** ***** ******* LYC.ES_G CTTTT TRI.AE_C TC---
Mean pairwise ID: 44.26%
TET.THE. GCCAGG----GTAGCAA-TACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG--TGA ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGT ** * ***** * * * *** * * ** ** ** **** ** ** TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGT-TTGCTAAGAGTG---TGCCCGCTCCAAA ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTG--GGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAG * * * * * * ** * *** * * ** *** *** ***** TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCG- * ** * * * * * * * ** * ** * ** ***** * TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG * * ** * ******** * *** *** ** ** **** * ******** TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------- ***** * ** * * ***
Mean pairwise ID: 44.27%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT-----GGGGGCAACAATGTGGTGGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT **** ** ** ** ** **** ** ** *** * * * *** LYC.ES_F TGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGC-CCTGTCCA GAL.GAL. CGCTTGAGCC--CAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-CGAGCGGGCGTCCGCGCT * * * ** * ** ****** * * *** * ** ** * * * LYC.ES_F AGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCC-TTTAGAGTG GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG * * * * * *** * * * ** *** ** ** * * LYC.ES_F GGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGG GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA ** ** ** * *** ** ** ***** * **** * * **** LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGA--TAGGTTGCCTAATT GAL.GAL. CGGGATCGCG---------CCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCG ***** ** ** *** * ** * * * * ** * ** LYC.ES_F AAACCATCACTTTT GAL.GAL. AGACCCTGTCTCC- * *** * **
Mean pairwise ID: 44.30%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT *** * **** ********* ARA.TH_C GGGAGTTGAG--GCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTT-GGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCA * * ** ** **** ***** * * *** **** * ** **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG TRI.AE_C GGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG * *************** ************** * ** ****** ********** ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA TRI.AE_C GATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCA *** ******* *** *** ** ** ** * ** ** * **** ***** ARA.TH_C TCACTTT TRI.AE_C CCATC-- **
Mean pairwise ID: 44.30%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA LYC.ES_M ---------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATAT---TGGGCTGTCCCAG * *** ** * *** * * * * * TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT LYC.ES_M ATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCT----GGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGG- * * * *** ** * * *** * ***** ***** ** ****** TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCCT LYC.ES_M ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGG-GGCGGACCGCAT ** * ** * * * * * * * ***** * * * ***** * TET.ROS. CAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATAC LYC.ES_M GAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGT ******** ***** *** *** * * ***** ** ************ TET.ROS. TCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACACT------ LYC.ES_M CGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT * * ***** * * * * * ** ** * **
Mean pairwise ID: 44.30%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG * * * * * * *** * * * ** * ** *** * * * * ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCT-ATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTT---GCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG * * ** * ** * ** * * * * ** * ** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG LEI.MAJ. TCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGT----TGAAGCGAGGG * ** ** * ** * * *** ****** ** * ** * *** ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTC-TTGACGGTGGAAG LEI.MAJ. A-ACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAG * **** ** **** ** ** ******* ***** * *** * * * ** * ** ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTC---CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCT ** ** * ** * * * **** *** * ** *** ** ARA.TH_C TCACTTT LEI.MAJ. T------ *
Mean pairwise ID: 44.34%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * * * * * HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** * * * * ** *** ** * * * * * ** * ****** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT ** * * * *** ****** * * * * *** *** * HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG * * * * * * * ***** * * * **** ******* ** HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT CAE.EL_A AC--CGCGCTTGTG--AGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGACCAC * ** * *** * *** *** * * * * * * ******** HUM.JA_A CTCTTTT-- CAE.EL_A TTATCATTT * * *
Mean pairwise ID: 44.34%
LYC.ES_E ---GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG-GGGATGTTAAGGTGGTGGAAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC ** ** * * * * * * * ** * ** * * * * * **** LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * ***** * ** ** * * ** ** * ** * *** LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA * *** ** *** * * * * **** * *** LYC.ES_E TGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG DRO.MEL. TGAACC-GGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGGG ** *** * * *** * **** * ** * * *** * ***** * ** LYC.ES_E ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA DRO.MEL. ATAGCGTACCGGAGTG----GACTGCCGTTA---TCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCA *** ** ***** * * * ** *** * * * * * * *** ** * LYC.ES_E CCACATTTT DRO.MEL. CAATCTTT- * * ***
Mean pairwise ID: 44.34%
ZEA.MA_B -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATG DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG * * ** * ** ***** * ** * * * * * * * * * ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGAC-TCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA * * * *** *** * ** * * * * *** * ** * ** ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG * * * * * ** ** * * * * * *** ** * *** * ** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTT-CCCGTGGTAGGCAGTAGT * *** * * *** ** * ****** * * * *** * ** * ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACC DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAA--CCGATATGGTTGGACC ***** * *** * ** ** * **** ** * * *** ZEA.MA_B ACCATCTTT DRO.MEL. ACAATCTTT ** ******
Mean pairwise ID: 44.37%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT * * *** ** * ***** * * * ** * * * ** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * * * ***** * *** **** * * *** **** * ** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * ******* ** * * ** ******** *** RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT--CCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----- * * * * ** * *** * * * ** *** **** RAT.RAT. TT TET.THE. --
Mean pairwise ID: 44.37%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- ** * * * *** **** * * * *** * * CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTG-CGTTG-ACTTGGTGTTC---TGCTTGGTTGC ***** *** * ** ***** * * * ** *** * * * * ** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC TRY.BR_B GTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG-- * ** *** ** * * ** * ** * * *** * * ***** CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT TRY.BR_B AACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAG ** * ** **** *** ** **** ** **** * * * ** * ** * CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCAT TRY.BR_B CACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT---- *** **** *** *** * ** ** * * * * * CIN.HYB. TT TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 44.37%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-- *** * * * ***** * * ** *** * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TRY.BR_B GTCTTGGACAAGCGG--GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG---TGTTCTGCTTGGTTGC-G * *** ** ** *** * ** * ** * * ** *** * * LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC TRY.BR_B TGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGAA ** ** * * * * * ** * * * * * * ********** *** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC ** * **** ** * ** ****** ** ** *** * * * ** * ** * * LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCT TRY.BR_B ACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGA--GGCGGTTT--- ** * * * *** * * **** * * ** * * * * LYC.ES_A TT TRY.BR_B --
Mean pairwise ID: 44.37%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA----TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGAC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * ** * ** *** * ** ** * * * ** * ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA * ** * ** * *** ** * * * * **** * ** **** ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCT-CCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT ** ** ** ** * * * ** * * **** * ** * ** * ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC * * * ** *** * * ***** * * **** ******* ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGA CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATAC--CTTCAGACCA ***** ** ** * ** * * * * * **** *** * * *** * * ARA.TH_A ACCACCATTTT CAE.BRI. CTTGTCATT-- ****
Mean pairwise ID: 44.37%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCT----CTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCT *** **** * * * * * ** ** * ** *** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-TGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA TRY.BR_B TAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTG--CTTG * *** * * * *** * *** *** * ** * * * * * ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTC-GCGCCGTTAAAGTGG **** ** ** ** ** * * * * * * **** ** * ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGAC-TCCCAACGGTGG TRY.BR_B GGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG **** ** ** **** ** * ** ******* * *** ** * ** * * ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA TRY.BR_B AAGCACACCGAGGA----GCATCTCAGGACT---TTGCGCCCCAAGTGTCGTC--GCGAG ** * * *** * *** * * ** * ** * * ** ** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRY.BR_B GCGGTTT---- * *
Mean pairwise ID: 44.41%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG *** * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * * ** * ** * *** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG CAE.EL_A TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA * * *** ** *** *** ** * ** *** * * *** * HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA CAE.EL_A GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGC--GTGGTGCAG * **** * ** ** * * * ** ** **** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCAC---CATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA CAE.EL_A TGGCCGGACCGCGCT-TGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA * * ** * * *** ** ** ** *** * * ** * * * ** HUM.LU_A CCATTTCTTTT-- CAE.EL_A CCACTTATCATTT *** ** * *
Mean pairwise ID: 44.41%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTG--GAT *** * ** ** * ******** ** * *** ** * ** * * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * * * ** ** * * * * ** ** ** * *** ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGT-CTTCTAGA CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTC--AGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** ** *** *** ** ** *** * ** * * ** ARA.TH_C GTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAG **** *** * ** * **** ** ***** * ** * * * ARA.TH_C TGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATT CAE.EL_C TGGCCGGACAGCGC-TTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC *** *** ** * * * * ** * ** * * ** * ARA.TH_C GGACCATCACTTT CAE.EL_C CACTTGTCACT-- *****
Mean pairwise ID: 44.41%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG TRI.AE_C -----------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAG *** ****** ****** ** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRI.AE_C TAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCA **** * *** ** ** ** ***** * * * * *** **** * * LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_C CCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA ************** *********** *** ** ****** * *********** LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA TRI.AE_C ACGGGCCGCTGCACTCCTAGG-CCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCA **** *** *** *** ** ** * **** * * ** ***** ******* LYC.ES_O CTTT TRI.AE_C TC--
Mean pairwise ID: 44.44%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * ******* ****** * ** * * * * LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGC TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** ** ** *** ** ** * * * ** ** *** * LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TRY.BR_B TCGGTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG * * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA **** * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** * ** * LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- ** ** * * * * **** * * ** * * * LYC.ES_I ATTTTT TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 44.44%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--CGGAGG * ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * *** *** ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * * ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG ORI.CUN. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** * ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_D ATGGATCATA---GTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGC-TGGTTCGATCTCTC ORI.CUN. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGT ***** ** ** * ** **** *** * * * * ** * ARA.TH_D CTGGACCACCACTTT ORI.CUN. CTCC----------- **
Mean pairwise ID: 44.48%
HOM.SA_A ------GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTC-CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCT LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGT--CT *** ** * ** * * * ** ****** * ** **** ** HOM.SA_A GGAGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG LEP.COL. GGACCAGCATA-------GGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG *** * * ** * * *** * * * * * * * ** *** * HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA LEP.COL. --------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAA **** * **** ** * * **** * ** * ** HOM.SA_A GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT LEP.COL. GTAGAGG--AACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT * ** ** *** ** **** *** ********** ** * * * * * ** HOM.SA_A AGTGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCC LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTT * * * * * ** ** * ** * ** * ** ** * * ** * HOM.SA_A CGTCTCTT LEP.COL. T-------
Mean pairwise ID: 44.48%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCAC-CAGCTGAACAGGG * * * * ******* ****** ** * * *** * LYC.ES_B GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ***** ***** * ***** * * * * * ** * * * * LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC LEP.COL. GTCGGAG-GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * * * ** * **** *** **** ** * * *** ** * LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTC-TAAGCGGTGGAAG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG * * ** ** **** ** ** ***** * * * *** * * ** ** * ** LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA LEP.COL. AACCACACCGCGGAGC---CTGTCATCACCTGCGCCCCAGG---CGATCCTGTGAAGCTT * ** *** * *** ** *** * * * ** * ** * LYC.ES_B CCACTTTT LEP.COL. T-------
Mean pairwise ID: 44.52%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ** * * * * ****** ** ** ** * * * *** * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * *** HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * ** * * * **** ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC ORI.CUN. GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGAC *** ** *** *** ***** * * ** * ** ** ** *** HUM.LU_C CATTTCTTTT ORI.CUN. CCTGTCTCC- * * ***
Mean pairwise ID: 44.52%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT * * *** ** ****** * * * * ** * ** ** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATG-----AGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA * **** ***** * * * *** * * *** *** * ** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * ** ******* *** * ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** ORI.CUN. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** ** * * * * * **** ** ORI.CUN. C TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 44.52%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAG-GTTGTGAT * * *** ** * ***** * * * ** * * *** HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * * ***** * *** **** * * *** **** * ** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * ******* ** * * ** ******** *** HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT----- * * * * ** * *** * * * * ** *** **** HOM.SA_B T TET.THE. -
Mean pairwise ID: 44.52%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT ** * * * ****** ** ** ** * * * * ** * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * *** HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * ** * * * **** ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC RAT.RAT. GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGAC *** ** *** *** ***** * * ** * ** ** ** *** HUM.LU_C CATTTCTTTT RAT.RAT. CCCGTCTCTT * *** **
Mean pairwise ID: 44.52%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG- CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC * ** * * *** * ** **** * * * * *** * * **** ** ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG-ACCTGAAGCG CAE.EL_A AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAG *** ** * * ** * * ** * * * * ** * * * * * * ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG CAE.EL_A TCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGC-AGTGGCC * * **** * * * ** * * *** * * * * ** ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC CAE.EL_A GGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCA---GACCACT *** * * ** ** * ** * ** * * * *** ** ZEA.MA_F CACCATCTTT CAE.EL_A TATCATTT-- * *** *
Mean pairwise ID: 44.52%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * * ** * * ** *** * ** * ** * * ***** *** LYC.ES_B AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA * ** *** * * *** ** * ** * ** * ** *** LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT *** * ** * ** ** **** * * * * * *** * * LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC ** * * ** *** * * **** * *** **** * ** **** LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT ***** ** * * *** ** ** * **** * ** * * LYC.ES_B CACCACTTTT CAE.BRI. TGTCATT--- ** *
Mean pairwise ID: 44.59%
TRI.AE_B -NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT LEP.COL. GCCGGAGCC--TTGC-----TCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * **** **** *** *** * *** ** * * TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT LEP.COL. TG-TCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT ** * ** * ***** * ** * ** ** **** * * TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGG-GCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG-AGGA * ** * ***** * ** *** *** * * * **** * *** TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTT-CCAACGGTGGAAGGAT LEP.COL. ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCC-CACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAAC ** ** **** ** ** ******* ** ** *** * * ** * ** * TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA LEP.COL. CACA--CCGCGG-AGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT---- *** **** * *** ** * * *** *** * * * * TRI.AE_B TCTTT LEP.COL. -----
Mean pairwise ID: 44.62%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATAAGTGTGGATG ****** ** *** * ** *** * ** * ** ** * ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGT-AATCTTGCTGGCTTGCCCGTT CAE.EL_B G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG *** * ***** * **** ***** ** * * * * **** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTC--ACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAG--TCCCGGGTG ***** * ** * ** ** ** * * ** * * ** * ** ORY.SA_A CTAAAGTGGCAG-GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC CAE.EL_B CATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC * *** * * * * * * * * * * *** ** ** * * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC CAE.EL_B -----GCGGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCT * ** * * ** **** * * * * * ** ** * ORY.SA_A TACAAC----AGACCACCATCTTT- CAE.EL_B CAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT * ** ******* ***
Mean pairwise ID: 44.63%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCA-GTGTGGTGGAATGTT TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGG------ *** ** * * ****** * * * *** * * * ** LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG--TGTTCTG-CTTGGTTGC * ** * * * *** ** *** * * *** ** *** * * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGC-CAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG TRY.BR_A GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA * ** ** * *** ** * * * * ** * * * * ** ********** * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRY.BR_A ACGG-GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCC-CGTTCGAGAAGCAC ** * ** **** *** * ** * * ** * ** ** * **** * LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTAC TRY.BR_A ACCGAGG-AGCATCTCAGGACTTTG-----CGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- * **** ** ** * * ** * * * * * ** * ** LYC.ES_C CACATTT TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 44.65%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGTGGGAG **** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * * ** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC HOM.SA_B GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATGGGGTGTCCGCAC * * ** * * * * * * ** * ** * *** ** *** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------CC ***** * * ** * ** ** * ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA HOM.SA_B TAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGA *** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA HOM.SA_B TCAGTAGTGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAG---CAACA ** ** * **** * *** * * * ** ** *** * * ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT HOM.SA_B TAGCGAGACCCCGTCTCT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.66%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTG---GGGACAATAAGGTGGTGGAACA FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGC--TGGCGGA * ** * ** ** * ** *** * ** ** **** * *** *** * ARA.TH_D GTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGAC-ATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA FUG.RUB. TCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * ** * ** * ** * ** ** *** ** * * * ** ** * ** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGG * * * * *** * ** * ** * * *** ** * *** ** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG * * * *** ** ** ***** * *** **** * ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC FUG.RUB. GGATCGCGCCCGTGAAT-----AGA--CGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC ***** * * *** * ** * * * * * * * **** ARA.TH_D CACCACTTT FUG.RUB. TCAGTCTTT ****
Mean pairwise ID: 44.69%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT- TET.THE. ----------GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG ** * ** * *** ****** * * * * *** HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAG--CTGCTTGCTGGGC---TGCCCATTCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * ** **** ** ** * * * ***** * ***** ***** * HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG--A TET.THE. AATGAGTT--GCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA ***** *** ** * * * ** *** * * ** * * HUM.JA_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA ** ** ** * ******* ***** *** ** *** * ***** * ****** HUM.JA_B GGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGA TET.THE. GGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA--TCAAAGCCAGACATT- ******* * * * * * * * * *** * * * * HUM.JA_B CCATTTCTTTT TET.THE. -----------
Mean pairwise ID: 44.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGG-TGGCTGCGGAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGACAGAG **** ** * ** *** ******* ** *** * * *** ** * ** ORY.SA_A GTTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT RAT.RAT. GATCGCT-TGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCA * * * * ** * * * * * * * ** * ** * * * ** *** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC RAT.RAT. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------C * ***** * * ** * ** ** * ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC RAT.RAT. CTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTG **** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT RAT.RAT. ATCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-CCAGCCTGGG----CAAC *** ** * **** * ** ** * * ** * *** * * ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT- RAT.RAT. ATAGCGAGACCCCGTCTCTT * * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG **** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT CAN.SPE. GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG---CCGATCGGGTGTCCGC * * ** * * * ****** ** * * * * * * ** *** ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC CAN.SPE. ACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG------ * ***** * * ** * ** ** * ** ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC CAN.SPE. CCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCT ***** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC CAN.SPE. GATCAGTAGTGGGATCGCGC----CTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG---CAA *** ** * **** * *** * * * ** ** * * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT CAN.SPE. CATAGCGAGACCCCGTCTCT * * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 44.70%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT-- * ** ** ** ***** * * * *** * ** CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTT----GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC *** **** * *** * * * * * * * * * * * **** **** * CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** ** CAE.EL_B GGATGGT-TCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGAT * * * ***** * ** * *** **** **** ** **** *** CAE.EL_B TGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTT TET.ROS. AACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT----- * ** * * ** ** * ** * * * * * ****** *** CAE.EL_B TT TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 44.70%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG TET.ROS. GCCAGG----GTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** ** ** ** ******** * * * *** * ** * CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGA-----GTGTGCCCGTTCCAAAC ** **** ** * ** ** * * * * * **** **** * CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ** ** ** * ** * * ** ** **** *** ** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGA-AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAT TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGAT * ** ** *** * ** * **** **** **** ** **** **** CAE.BRI. AGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA TET.ROS. AACATACTCATTAACTGTCAA--GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * * ** * * **** ** * * *** ** * **** CAE.BRI. TT TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 44.72%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCAGA LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGG *** * * * **** **** * *** * *** * * * TET.ROS. GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGCT LEI.MAJ. ACCAGCGAG---GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTGTGTCGGT * *** * *** * * * * **** * * * * *** ** * * TET.ROS. ATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGG-AACCGCCTC LEI.MAJ. GTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTC *** ** * *** * * * * ** **** ***** ** TET.ROS. AGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACTCA LEI.MAJ. AGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGT-CCGCCGTTGCAGAATCACAC-CGCG **** ** *** ** *** * * * * * * ** * ** ** *** * * TET.ROS. TTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT- LEI.MAJ. GAGCATGTCC-GCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT **** ** * * * * *** * * **
Mean pairwise ID: 44.73%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA **** ** * * *** * * * ** * * * * * * ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAG-CGACCGCGTGGTGCAGT * * * **** * * * * ***** * * ** * ** * * ** ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCA CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC ** *** ** ** ** * * * ** *** * * * * * ZEA.MA_E GACCACCATCTTT CAE.EL_A ACTTATCATTT-- * *** *
Mean pairwise ID: 44.73%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAAC--TCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * *** * * ****** ** * * ** *** * * LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA LEP.COL. TGTCTGGACC---AGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGG--TGCTCTGCTTGGCTGT ** ** * ***** ** * * * *** *** *** LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGG-----CCAAGC-GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTG LEP.COL. GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCT--CCGTTAAAGTA * * * * *** ** ** ***** * ** * * ****** LYC.ES_C GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTG LEP.COL. GAG-GAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTT * * * **** ** **** ** ** ***** * * *** *** * * *** ** LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA LEP.COL. GCAGAACCACACCGCGGAGCCTG------TCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCT-GTGA * ** * ** * * * * *** * ** *** * ** ** * LYC.ES_C AACTACCACATTT LEP.COL. AGCTTT------- * **
Mean pairwise ID: 44.74%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTC-TGTAACCT--TCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG----GGGA * * *** *** ** ******* ****** * * * *** HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TRY.BR_B CGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTG--CGTTGACTTGGTGTTCTGCTT--GGTTGCGT * * * **** ** * * * ** ** * * * * * HUM.LU_C GGTGG-GCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT TRY.BR_B GTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC * ** * ***** * * * *** * ** * *** *** ** HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC TRY.BR_B GGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * ** * ** HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC TRY.BR_B ACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTG-------TCGTCGCGAGGCGGTTT- ** ** ** * * * *** ** ** * * * *** HUM.LU_C TTTT TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 44.76%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGT--------GGAGACAATAAGGGGATG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAA-GTGTGGATG ** ** ** * ** ***** ** * * ****** * ***** ARA.TH_C GGACGTTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCAT CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGT-GTTGTCGGCAACGGCGACC-----GAGCGTCCGT * * *** ** * **** * **** *** * * ** ** * ARA.TH_C TCCAAGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGC--GAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTA CAE.BRI. GCCAAGCGCTGCGTCG--CCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA ***** * ** * ** *** ** * ******* * * * * * ** ARA.TH_C GAGTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGAC CAE.BRI. AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGA---AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGC * * ** ** ** *** * * ***** * * **** * * ARA.TH_C GGTGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGA CAE.BRI. AGTGGCCGGATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG **** **** ** * ** ** * * * ** ** * ARA.TH_C TTGGACCATCACTTT CAE.BRI. ACCACTTGTCATT-- *** *
Mean pairwise ID: 44.77%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** * * * ***** * * ** *** * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG ** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRY.BR_B GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGAT TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC * * ** **** *** ** ****** ** * * * * * * **** * LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TRY.BR_B ACCGAGG-AGCATCTCAGGACTTT-----GCGCCCCAAGTGTCGTCGCG--AGGCGGTTT * * * * *** * * ** **** * * ** * * * * LYC.ES_H CCTTTT TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 44.77%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG YAR.LI_B -------------AGCTGTAATGGCATTTT--GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG * ** * * * ** ** ** *** * * *** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * **** ** * ******* *** * ** *** *** * LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG YAR.LI_B CTGCGGTTGAT-GGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * * *** * * * * * *** **** ***** * * * * LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTA ** * * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * * LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC YAR.LI_B TGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGT-TATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTC * *** * * * * **** ** * ** ** * **** * * * LYC.ES_O CACTTT YAR.LI_B TC----
Mean pairwise ID: 44.77%
LYC.ES_G GCCG-AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGG--CTTAGCGGGGAGGACG--- **** **** * *** *** * ** ** *** * ** *** LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA LEI.MAJ. ----TGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC ** ***** * * *** ** * * * * ** * * * * LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG LEI.MAJ. GGTGTGGCT----TGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGG-GA * *** * ** ** * * ** *** ** * * *** * ** * LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAAT **** ** **** ** ** ***** * * * * * * ** ** * ** ** LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC LEI.MAJ. CACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA---AGCCTT- ** *** ** * * ** * *** * * * * * * ** LYC.ES_G ACTTTT LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 44.81%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** * * ** *** ** *** *** ** * * * * * * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTG-GCCCGCCCATTCCAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG * * ** * ** * * ** * ** ***** * * ** ** * *** ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCA-TGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG-GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * * ** ** ** * ** * ** ** *** * *** ARA.TH_C GGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAA GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG * **** *** ** ** ****** * ****** * * * ** ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC GAL.GAL. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTG----GGCAACATAGCGAGACC **** ** ** ** * * * ** * ** * * **** ARA.TH_C ATCACTTT GAL.GAL. CTGTCTCC * **
Mean pairwise ID: 44.81%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACA-GGG * * *** ******* ******* ** * * ** * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT * * * * * **** * ** * * ** * ** * * * * ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG-AG * * **** ** ** * ** * ** ** ** *** * ** ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA **** * ** **** * * ** ******* * ** ** * * ** * ** ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA LEP.COL. ACCACA--CCGCGG-AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--- * *** ** * * *** ** ** * * * ** ** * * **** ZEA.MA_C CCATTTTT LEP.COL. --------
Mean pairwise ID: 44.81%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG ** * * ******* * **** * ** * * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTG--TTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGG--CTGTG ** * ** * * * ** ** *** * ** * ** **** * * ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG LEI.MAJ. TGTCGGTGTGGCTTGC-CCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC--GAGG *** ** * * ** * ** *** * * * ** * *** **** ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGACG LEI.MAJ. GAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAG * * * ** **** ** ** ******* * ** * *** * ** ** * * ARA.TH_E GATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCG-TCGCG---AAGCC ****** * * ** * **** *** * * ** ** * * ** ARA.TH_E ACCATTTT LEI.MAJ. TT------
Mean pairwise ID: 44.81%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT ** * * * ******** * *** ** * * ***** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC TRY.BR_A C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG * * ** ** **** * ** *** ** ***** * HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG TRY.BR_A TCGGTGTTGAG----GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG ** **** * ** ** * ** * * *** ** ** ***** *** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TRY.BR_A -AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA ** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** ** * HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA TRY.BR_A GCACACCGAGGAGC-ATCTCAGGACTTTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGG----- ** ** ** * ** * ** ** * * * * * * HUM.LU_D TTTCTTTT TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 44.81%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * ******* ****** * ** * * * * LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTG ** ** ** *** ** ** * * * * *** ** ** LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT TRY.BR_A C-GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG- * * ** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA *** ** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** ** LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--- * ** ** ** * ** * ** *** * * * * * * LYC.ES_G CCACTTTT TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 44.82%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT SCH.POM. ------------------CGC-TGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAAT *** **** * * * *** * * ** * ** ** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG SCH.POM. AGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTTCGAGT-CTCGCTTTCGATCCCTCGATC-TGCCACG * * * * ** *** * *** * * * *** * ** * ** * * GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG SCH.POM. TCTG---TTCGAAGAGTAGTCTTCGTGG----------CAACTGGCAGT-TAAACCGTGT * * * * ** * ** ** ** * ** * *** * * GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA SCH.POM. AGTACCGATGGAGGTTGGAAACAATGCACATCA---CTACCGGGTCT-TGGGCAGTGCGA * **** **** ****** *** *** ** *** * * * * * * ** GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC SCH.POM. TAGCGA-TGGGATTCACCTTCGCAGGATGTGCATGGAAGTATAAACACAACG-GTCGTT * *** ** ** * ** **** * * ** * *** * * * ***
Mean pairwise ID: 44.82%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG TRY.BR_A ------AGCCGGAGCGCAT---TGCTCTGTAAC--CTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG ** * *** * ** * * * *** * ** ** * * * ** XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT TRY.BR_A GGGACGTCTTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGTT *** *** ** * * * * ** ** ***** * ** *** XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTC-CTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG TRY.BR_A GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTT--AAAGTGGGG ** ** * * * * ** * * ** * * * * * * ** * **** XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA TRY.BR_A GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA **** ** **** *** ********* ** * ** * * ** * * XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGC-CGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ * * ** ** * * * * * * ** * * ***** *
Mean pairwise ID: 44.84%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG * * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * ** * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** ** * * * ** ** ** * * * * ** * ****** HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT ** * * * *** ****** * * * * ** * * * HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGG CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG * * * * * * * ***** * * * **** ******* ** HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA CAE.EL_D AC--CGCGCTTGTA--AGTTGACACAC-ATACACAGCCTTCTCGATACCT--TCAGACCA * ** ** ** * *** *** ** ** ** ** * * ** ***** HUM.LU_B TTTCCTTT-- CAE.EL_D CTTATCATTT ** *
Mean pairwise ID: 44.84%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG ** * * * ** ******* *** * * * * * ** * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * * **** ** * ** * **** * *** ** ** * *** HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGC XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT ** ** * ****** ** * * ** * * *** HUM.LU_C AATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG * ** *** ** ** ****** * * **** * **** * ** HUM.LU_C ATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC- XEN.LAE. AT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACAC--AGCGAGACA ** ** *** *** **** * * ** * * ** * * *** HUM.LU_C CATTTCTTTT XEN.LAE. CAGTTCT--- ** ****
Mean pairwise ID: 44.85%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT * * *** ** ***** * * * ** * * * ** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * * ***** * **** **** * * *** **** * ** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * ******* ** * * ** ******** *** CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** CAN.SPE. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT----- * * * * ** * ** * ** ** * ** *** **** CAN.SPE. T TET.THE. -
Mean pairwise ID: 44.85%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG- ** ** * * * ** ** ****** * * RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG ** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * ** RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ** RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG TRY.BR_A GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG ** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTC TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * RAT.NOR. T TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 44.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATAAGTGTGGATG ****** ** *** * ** *** * ** * ** ** * ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTA-ATCTTGCTGGCTTGCCCGTT CAE.EL_A G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG *** * ***** * **** ***** * * * * * **** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCA--CCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC----GGTTAGTCCCGGGTGC ***** ** * ** ** ** * * * ** * * * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC CAE.EL_A ATAAGGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGG *** * * * * * * * * * * ***** * * * **** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCC--CAGAGTCCCT CAE.EL_A TGCAGTGGCCGGAC--CGCGCTTGTG-AGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCT * **** *** * *** ** * * * * *** * * *** ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT CAE.EL_A TCA-GACCACTTATCATTT-- * ** * *** *
Mean pairwise ID: 44.87%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA **** ** * * *** * * * ** * * * * * * ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * * **** * * * * ***** * * * **** * * *** ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCAG CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** ** ** * * * ** *** * * * * * ZEA.MA_G ACCACCATCTTT CAE.EL_A CTTATCATTT-- * *** *
Mean pairwise ID: 44.87%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATAAGTGTG **** * ** ** * ****** * ** * * ** * * ** ** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** ** LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * **** * *** *** ** *** LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** * ** * * * * **** * * * ** ** * LYC.ES_N ACCACCATTTTT CAE.EL_D CTTATCATTT-- * *****
Mean pairwise ID: 44.87%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** ** LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * **** * *** **** ** *** LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** * ** * * * * **** * * ** * * LYC.ES_B ACCACCACTTTT CAE.EL_D CTTATCATTT-- * ** **
Mean pairwise ID: 44.87%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA---GGTGGTGTGAAT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA * * *** ******* ******* ** * * ** * ZEA.MA_A GCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCC LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT- *** * * *** ** * ***** ** * ***** * * ZEA.MA_A AAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGC LEP.COL. --GTCGGAGGCCTCCGG-GTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT ** ** * ** ** * * * ** ** *** * * * * * * * ** ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTG * ***** * ** **** *** ** ******* * ** ** * ** ** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA LEP.COL. CAG----AACCACACCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTG-AA *** * **** * * * * * ** ** * * ** * ** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT LEP.COL. GCTTT------- *
Mean pairwise ID: 44.87%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** ** ** ** ** *** ** ** * **** * ** * * * ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATC---TGAGCTGCCCAGTC GAL.GAL. CGC--TTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTG-CAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT * ** * * * ** * *** ** *** * * ** ** * ARA.TH_D CAAGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTC GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA * ** * * *** ** *** * * * * ** * * * ** ** * * *** ARA.TH_D GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTG GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * **** **** ARA.TH_D GATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTG GAL.GAL. ACGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCAGCGTAGCCTG--GGC---AACATAGCGA ***** * * * * * ** * *** * ** * * * ARA.TH_D GACCACCACTTT GAL.GAL. GACCCTGTCTCC **** **
Mean pairwise ID: 44.87%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA **** ** * * *** * * * ** * * * * * * ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAG-CGACCGCGTGGTGCAGT * * * **** * * * * ***** * * ** **** * * ** ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCA CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC ** *** * ** ** * * * ** *** * * * * * ZEA.MA_D GACCACCATCTT CAE.EL_A ACTTATCATTT- * *** *
Mean pairwise ID: 44.88%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCC-GCTTAG ** ** * * * ** ** ****** * * * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG ** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * ** RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ** RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG TRY.BR_A GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG ** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCT TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * RAT.RAT. CTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 44.88%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * * * ******* * **** ** * * * * * LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG ** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * * LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRY.BR_A GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** *** LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA * * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** ** * * LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT TRY.BR_A CACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-------- * ** * * * * **** * * ** * * * LYC.ES_N TTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 44.90%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA CAE.EL_A --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-TGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** * **** ** * ** ** ** ** * ** * **** *** ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAG-TCCCGGGTGCATAAGGAG ** ** ** *** ** * **** * * * ** * * ** * * ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG CAE.EL_A TCGTGGATGGTTCAGGAC------CGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGC--GTGGTGC * * * ** * * * * * *** ** ** * **** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAG--GCCTAGACTTCATACTAAAGC CAE.EL_A AGTGGCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC * * * * ** * * * * * * ** * **** * * * * * ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT CAE.EL_A CACTTATCATTT-- * *****
Mean pairwise ID: 44.97%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ***** *** ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGC---TCGTTGT-GACACTGGCCGGCTTGCCCATC CAE.EL_C AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC-GTCCGTG ** ** * * * **** * ******* ** * *** * ** * ZEA.MA_A CCAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGG CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGG ***** * * ** * * ** * * * * * * * * * ** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG CAE.EL_C AGTGGTGG--ATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCG ** ** * **** * * * * * * *** ** * ** * ** ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGA-GCCTA-ACTCAGGCT-CAGAACCTCACT CAE.EL_C GTGCAGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTC *** * *** ** **** * ** ** *** ** * ** * ZEA.MA_A AAGCAAACCACCATCTTT CAE.EL_C AGACCACTTGTCACT--- * * * **
Mean pairwise ID: 44.98%
ZEA.MA_F -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-TAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG * * ** * ** ***** * * * * * * *** * * ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA * * ** *** * ** * * * * *** * *** * ** ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCAT--TCAGGT-TGGCTAAGGA * * * * * ** ** ** * ** ** *** * * ** ** * * ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCG--CCCGCTTCCAACGGTGG DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGA-AAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG ** *** * * * ** * * * * **** ** * **** * ** * ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCG--GAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAA--CCGATATGGTTGGACC ***** * *** * * * *** ** * *** ** * **** ZEA.MA_F ACCATCTTT DRO.MEL. ACAATCTTT ** ******
Mean pairwise ID: 44.98%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGA--CATTAAGATGGTGGGACAC LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * * * ******* * *** ** * ** * ARA.TH_F TGGTTCGGTTC-CTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT- ** * * * * * ** * ** * * ** * ** *** * ** ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTG-AGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAG LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTT--AAAGTAG--A * * * *** *** ** *** * * *** * *** * ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGAC LEP.COL. GGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA ** * ** ** **** *** ** ******* * ** ** *** * ** ** * ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC----TGCGCCCCAGG--CGATCC--TGTGAAG * * *** * * * *** *** ** * * ** ***** * **** ARA.TH_F CACCATTTT LEP.COL. CTTT----- *
Mean pairwise ID: 44.98%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * * ***** * * * * * * * **** * * LYC.ES_H GGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ***** ***** * ***** * * * * * ** * * * * LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTG-CCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * * * *** *** *** **** ** * * *** ** * LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAAG LEP.COL. GAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAG * * ** ** **** ** ** ****** ** *** *** * * *** ** * ** LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA LEP.COL. AACCACACCGCGGAG-CCTGTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- * * *** * * * *** *** **** * * * * ** * LYC.ES_H CCACCTTTT LEP.COL. ---------
Mean pairwise ID: 45.00%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT * * *** ** * ****** * * * * ** ** ** RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA * **** ***** * *** **** * * *** *** * ** RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * ** ******* *** * RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** RAT.NOR. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** ** * * * * * **** *
Mean pairwise ID: 45.02%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG * ** ** ** ** ** *** ** ** * **** * ** * ** ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * * ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG RAT.NOR. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** * ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG RAT.NOR. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA ***** * * * * * **** *** * ** * * * * * ARA.TH_D ACCACCACTTT RAT.NOR. CCCGTCTCT-- ** * **
Mean pairwise ID: 45.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGATAAGTGTGGATG ****** ** *** * ** *** * ** * ** ** * ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTA-ATCTTGCTGGCTTGCCCGTT CAE.EL_D G--AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGT---ATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG *** * ***** * **** ** ** * * * * * **** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCA--CCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC----GGTTAGTCCCGGGTGC ***** ** * ** ** ** * * * ** * * * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC CAE.EL_D ATAAGGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGG *** * * * * * * * * * * ***** * * * **** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGG-GCCCGCTTCTGGCC--CAGAGTCCC CAE.EL_D TGCAGTGGCCGGAC--CGCGCT--TGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACC * **** *** * *** ** * *** * * *** * * ** ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT CAE.EL_D TTCA-GACCACTTATCATTT-- * * ** * *** *
Mean pairwise ID: 45.03%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG LEI.MAJ. ------------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGG * *** *** * * * * * ** ** * * * ** CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC LEI.MAJ. ----GAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC *** * * ** * * * ** * ** ** *** * * * *** ** CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGG--AAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG ** **** ** * ** * * *** ***** ** * * * * * CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGT-GCAGTGGCCGG LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCAC--CCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGA * *** ***** * **** * ***** * * ** *** ** ** ** ** * CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA LEI.MAJ. ATCACACCGCGGAGCA--TGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---- ** * * *** * *** * * * * * * * ** *** CAE.BRI. TT LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 45.03%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT-- * ** ** ** ***** * * * *** * ** CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTT----GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC *** **** * *** * * * * * * * * * * * **** **** * CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ** ** * * ** * * * ** * * ** *** *** ** CAE.EL_C GGATGGT-TCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGAC TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGAT * * * ***** * ** * *** **** **** ** **** *** CAE.EL_C AGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCA TET.ROS. AACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT----- * * ** * * ** ** * ** * * * * * ****** *** CAE.EL_C CT TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 45.05%
ZEA.MA_D -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG * * ** * ** ***** * ** * * * * * *** **** ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCA-GCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** * * *** * ** * * * * * * * *** * *** * ZEA.MA_D AAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATT--CAGGT-TGGCTAA *** * * * * ** ** * * *** * *** * *** ** ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCG--CCCGCTTCCAACGG DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGA-AAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAG * *** *** * * * ** * * * * **** ** * **** * * ZEA.MA_D TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA DRO.MEL. TAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCA--ACCGATATGGTTG * * ***** * *** * * ** ***** ** * ZEA.MA_D GACCACCATCTT- DRO.MEL. GACCACAATCTTT ****** *****
Mean pairwise ID: 45.06%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGC--CCGTTC GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTT---CTGGGCT-GCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC ***** ** * ** ***** * *** ** * ** ** *** * ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG--ACCTAT GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG---GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA *** * * * * *** ** * ** *** * ** **** ZEA.MA_C AGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCA---CAGAGCAGCGATCAC-TGCCGGCTATT GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT * ** **** * *** * * *** ** ** * ****** * * ZEA.MA_C AACGGTGGAAGG---ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTA-AGGCCTAGACTTC GAL.GAL. AACGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCT ***** * * * *********** * * ** * * * * **** ZEA.MA_C ATACTAAAGCAGACCACCATTTTT GAL.GAL. GTCTCC------------------ *
Mean pairwise ID: 45.07%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG LYC.ES_D ----------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * ** **** ****** ******* **** HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAATG LYC.ES_D TAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCG * * * * ** * *** * *** * * *********** * * * * HUM.JA_B CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG LYC.ES_D CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG * ********* ************ ** * ********** *************** * HUM.JA_B GGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC LYC.ES_D GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAACTAAACCACCAC ** ***** ** * ** * * * ** * ** ** **** * HUM.JA_B TTTT LYC.ES_D TTTT ****
Mean pairwise ID: 45.07%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** ** * ******* * *** ** * * ** ** * ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG * ** *** ******* ** * * ** ** **** ** ** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGTA TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGC-GCCGTTAAAGT--GGGGGGA * ** * ** ** **** * ** ** * ** *** * *** * ARA.TH_F ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGATC TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC * * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * * ARA.TH_F ACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACCA TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGG------- ** * * ***** ** * * ** *** * * * ARA.TH_F TTTT TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 45.07%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * * * ******* * **** ** * * * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTT--GG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G ** * ** ** ** ** ** * * * ** ** ** ** * * LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRY.BR_A TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGA ** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** *** LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC ** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** ** * LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ ** ** ** * ** * ** *** * * * * * * LYC.ES_O CTTT TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 45.07%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG TRI.AE_C ---------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTA * ********** ******* *** HUM.JA_A TTGGGCTG--TGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAA TRI.AE_C GTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGG-CCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCAC *** * * ** * ** ***** * **** * *** * * *** * ** **** HUM.JA_A TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA TRI.AE_C CGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAA ************ **************** ** ****** * * ************ HUM.JA_A CGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC TRI.AE_C CGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCACCATC-- **** ** *** * * **** * ** * * **** ****** HUM.JA_A TTTT TRI.AE_C ----
Mean pairwise ID: 45.08%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGA-GACAATAAGGGGATGGGACGTT CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG--GAT *** * ** ** * ******** ** * *** ** ** * * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCC---CGCCCATTCCA CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * * * ** ** * * * * ** ** ** * *** ARA.TH_C AGTTGGGAGTTG---AGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGT-CTTCTAGA CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTC--AGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** ** *** *** ** ** *** * ** * * ** ARA.TH_C GTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAG **** *** * ** * **** ** ***** * ** * * * ARA.TH_C TGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATT CAE.EL_B TGGCCGGACTGCGC-TTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCT----TC *** *** * ** * * * * ** * ** * * ** * ARA.TH_C GGACCATCACTTT-- CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 45.10%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** ** * ******* * *** ** * * ** ** * ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTT--GCGTG * ** *** ******* ** * * ** ** **** ** ** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGG * ** * ** ** **** * *** ** * ** *** * *** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA TRY.BR_A GAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA ** * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGG----- *** * * ***** ** * * ** *** * * * ARA.TH_A CATTTT TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 45.10%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAA----AGTGGTTGAAC LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA * * * ** *** **** * * * * ** ** ** CIN.HYB. TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG LEI.MAJ. CGTGGACC-AGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT---GTG ** * ** * * ** * * ** *** * * ***** * ** * CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG LEI.MAJ. TCG-GTGTGGCTTG----CCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGG-GTCCGCCGTTGAAGCGAG *** * **** ** ** ** *** * * * * ** ** * *** ** * CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA LEI.MAJ. GGA-ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCGTTGCA ** * * ** **** ** ** **** ** * ** * ** * ** * * CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCACGCTTCGTC--GCGAAGCCT * ** *** ***** * * * ** * * * * * * * * * * CIN.HYB. CCATTT LEI.MAJ. T-----
Mean pairwise ID: 45.10%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * * * ******* * **** ** * * * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G ** * ** ** ** ** ** * * * * *** ** ** * * * LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRY.BR_A TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAA ** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** * * LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA TRY.BR_A CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCA * ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** ** * * LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTACCA TRY.BR_A CACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------- * ** ** * ** * ** *** * * * ** * ** LYC.ES_E CATTTT TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 45.10%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT TRY.BR_A -------------------AGCCGGAGCGC--ATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATC * * ** * * *** * * ** ** ** * HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGG----GCTGTAGTGC-GCTATGCCGATGGGGTGTCCGCA TRY.BR_A CCGCTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TG * * *** * ** *** ** * ** * * * * ** ***** * HOM.SA_B CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG TRY.BR_A CTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAA ** *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA TRY.BR_A GTGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTT * **** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** HOM.SA_B GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCC TRY.BR_A CGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- * * * * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***** * HOM.SA_B GTCTCT TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 45.11%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * * HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG * * * * *** * *** **** * * ** * * ** *** * HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA ** ** * * * * * ** * *** *** ** ** ** * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCT--GGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_D GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG ** * * ** * ** * ** ***** * ** * **** ****** HUM.JA_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCAC-CATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAAT CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAA-GTTGACACACATACACAGCCTTCT----CGATACCT--T * *** ** ** ** * * ** ** ** * ** ** * * * HUM.JA_B AGGACCATTTCTTTT-- CAE.EL_D CAGACCACTTATCATTT ***** ** * *
Mean pairwise ID: 45.13%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGT-GGATG LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT *** * * ** * *** * ** * * ** CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG * *** * * * ** ** * * ** * ** **** ** ** CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAA---TGAAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAGTGGGG * ** **** *** * * ** **** * * * * * * *** * * ** CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* * CAE.EL_C GACAGCGCTT--GTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ** * * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** CAE.EL_C TTGTCACT LYC.ES_M CCACCTTT * *
Mean pairwise ID: 45.13%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTGT LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA *** ***** ****** ******* ARA.TH_G GAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT LYC.ES_D GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCGG **** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** * ******************** ** * ********** ******** *** ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGC--TCCAACTAAACCA ** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * ** * ***** ARA.TH_G CCATTTT- LYC.ES_D CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 45.13%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT *** * * ** * *** * * * * ** CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGCACAG * *** * * * ** ** * * ** * ** **** ** ** CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAA---TGAAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAGTGGGG * ** **** *** * * ** **** * * * * * * *** * * ** CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* * CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** CAE.EL_B TTGTTTTT LYC.ES_M CCACCTTT ***
Mean pairwise ID: 45.13%
LYC.ES_I -GCCG--AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG-GGGGCATTAATGTGGTGGAAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC * * ** ** * * * * * * ** * ** * ** * * ***** LYC.ES_I GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * ***** * * ** * * ** * * ** * *** LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA *** * *** * ** *** * * * * *** * *** LYC.ES_I CGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAG DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG * * * * *** *** * **** * * **** * * ** ** ** * * LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCA---ACCGATATGGTTGGACCA **** ** *** ** *** ** ** * * * * * ** **** LYC.ES_I CCATTTTT DRO.MEL. CAATCTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 45.13%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGCTTAGCG--G *** * * ******* ****** * ** * * * * LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGG---CTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTG ** ** ** *** ** ** * * * * *** ** ** LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT TRY.BR_B C-GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG- * * ** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA *** ** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** * ** LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCA TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT * ** ** ** * ** * ** *** * * * * * * LYC.ES_G CCACTTTT TRY.BR_B --------
Mean pairwise ID: 45.14%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** ** ******** * **** * * * * *** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRY.BR_A TCT----TGGA---CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGA---CTTGGTGTTCTGCTTG--- * * **** * * *** * * **** **** ** *** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGG-GCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TRY.BR_A ---GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-------GTTCTCGCGCCG ******* ** * * * ** * ** * * ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TRY.BR_A TTAAAGTGGGGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC ******** ** ** * ** **** ** * ** ******* * *** * * * * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT TRY.BR_A --CCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTC * ** ** * *** * *** ** ** *** **** *** * ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TRY.BR_A GCGAGGCGG---------- * *
Mean pairwise ID: 45.14%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA--GGGCATCAGTGTGGTGGAATGT DRO.MEL. ----------GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTG * * ** * * * ** ** * ** ** *** *** ** LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA---- DRO.MEL. TGGG-ATGGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGT ** *** ** ** * * ** * * * ** ** * * LYC.ES_C --GCAAAGAGTTGGGTCT-----TGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTC--C DRO.MEL. CCGCACTAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGC *** ** * * * ** * **** * * * * * * * * LYC.ES_C TAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGT DRO.MEL. TAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAG *** * *** ** ** * * *** *** * **** * ** ** ***** * LYC.ES_C GCAGTGGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTC DRO.MEL. GCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGT-------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATA ***** * ***** ** ** * ** * * * * ** * * * * LYC.ES_C TAGTTAAACTACCACATTT DRO.MEL. TGGTTGGACCACAATCTTT * *** ** ** * ***
Mean pairwise ID: 45.14%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA-GTCAG YAR.LI_A --CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG--TAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCG * * * **** * * * **** **** * * ** * ** * TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTG-AGTTG YAR.LI_A AGTCTTGGGCTCTG------CACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTG *** * * * ** ** ** ** * * ** ** **** ** ** **** TET.ROS. CTATG-GTGGAAACCT-AGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-GAACCG YAR.LI_A ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAA * * ** ** ****** ** ** * * ** * * * * TET.ROS. CCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACAT YAR.LI_A CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCG-TGGGTATGGCGGTGGGATCGCAA * **** **** * *** ** * ****** * * *** ** **** ** TET.ROS. ACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT YAR.LI_A CCAAGTGGTATATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT------- * * * * * * * * ** ***
Mean pairwise ID: 45.16%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT ** * * * * ****** ** ** ** * * * **** * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * **** ** * ** * * *** *** ** ** * *** HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGAG HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * ** * * * **** ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC HOM.SA_A GAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTG--TGCAACATAGCGAGAC *** ** *** *** ***** * * ** * * ** * ** *** HUM.LU_C CATTTCTTTT HOM.SA_A CCCGTCTCTT * *** **
Mean pairwise ID: 45.16%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG------GGGATGTTAATGTGG-TGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG * * * ** ** * ** *** * ** * ** * * ***** *** LYC.ES_N AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA * ** *** * * *** ** * ** * ** * ** *** LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT *** * ** * ** ** **** * * * * * *** * * LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGA CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC ** * * ** *** * * **** * *** *** * ** **** LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT ***** ** * * *** ** ** * **** * * ** ** * LYC.ES_N CACCATTTTT CAE.BRI. TGTCATT--- ****
Mean pairwise ID: 45.16%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA----TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGAC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * ** * ** *** * ** ** * * * ** * ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGC-GTCCGTGCCAA * ** * ** * *** ** * * * * **** * ** **** ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTG-GCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGA CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG ** ** ** ** * * * ******* * * * * ** * ** * ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC * * * ** *** * * ***** * * **** ******* * ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTG-CTGGTCCGATCTCATATGAA CAE.BRI. GGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATAC--CTTCAGACCAC **** ** ** * ** * * * * * **** *** * * *** * * ARA.TH_F CCACCATTTT CAE.BRI. TTGTCATT-- ****
Mean pairwise ID: 45.18%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG- ** * ** * * * ** ** ****** *** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC---TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG ** *** *** *** ** * * * ** ***** * ** * ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG ** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * *** ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG TRY.BR_A GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA * **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * ORI.CUN. C TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 45.18%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC TRY.BR_A --------AGCCGGAGCGCAT-TGCTCTGTAACCTTC--GGGGGCTGATCCCGCTTAGCG * ** *** ** * ** ** * ** ****** * * FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT TRY.BR_A GGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTG----TTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * ** * * *** *** * * ** ** ***** * * ** ** FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTC-CTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG TRY.BR_A TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG * ** *** * * * * ** * * ** ** * * * ** *** **** FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA TRY.BR_A GAAC--GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA * ** **** *** *** ***** ** * ** * * ** * * FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTT--CAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT TRY.BR_A GCACACCGAGGAGCAT-CTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ * * ** ** * * * * * ** * ** *** * *** * * FUG.RUB. T TRY.BR_A -
Mean pairwise ID: 45.18%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT * * *** ** ****** * * * * ** * ** ** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA * *** ***** * **** **** * * *** *** * ** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * ** ******* *** * CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** CAN.SPE. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** * ** *** * * **** * CAN.SPE. T TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 45.19%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG--ACAGAGG * ** ** ** ** ** *** ** ** * **** * *** ** ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * * ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG RAT.RAT. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** * ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG RAT.RAT. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GGC---AACATAGCGAG ***** * * * * * **** *** * ** * * * * ARA.TH_D ACCACCACTTT- RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT *** * ** *
Mean pairwise ID: 45.19%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG- CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC * ** * * *** * ** **** * * * *** * * **** ** ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG *** ** * * ** * * ** * * * ** * * *** * ZEA.MA_F CAG-GCATGGCGTGAGGCTGGCT--TCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCAC-CGCGCGGTGC-AGTGG * * **** * * * * **** ** *** *** ** * * * ** ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG CAE.EL_C CCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTT *** * * ** * * * ** * ** * * * *** ** ZEA.MA_F ACCACCATCTTT CAE.EL_C GTCACT------ ***
Mean pairwise ID: 45.19%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LEI.MAJ. -----GCCGG--AGCTCTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG *** * *** ** *** *** * **** ** *** * ** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTG------GTGCTCTGCTTG----- * *** * * * *** * ** ** * * * ** * ORY.SA_B AGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LEI.MAJ. -GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC * ** ** ** **** ** ** ** *** * * *** * ** * ** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTG * *** * * ** **** ** ** ******* ** * * * *** ** ** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LEI.MAJ. CAGAATCA------CACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTT--CGTCGCGA * * * * ** * * * **** * ** ** * * * ** ORY.SA_B ACCACCACCTTT LEI.MAJ. AGCCTT------ * *
Mean pairwise ID: 45.19%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_H A--TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTG-ACTTGCCCTATCC GAL.GAL. CGCTTGAGCC---CAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT *** ** * ** ****** *** **** * * ** * LYC.ES_H AAGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTG GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * **** ** * * ** * * * * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA *** * * * *** ** ** ****** * * ****** * * **** LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA GAL.GAL. CGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * *** **** * * * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT GAL.GAL. CTGTCTCC---- * * **
Mean pairwise ID: 45.19%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** * * ***** ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCT---TGCCCATCCCA CAE.EL_A AGTGAGAGGAGG---AGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * **** * ** ** * ** * * ** * *** ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT ** ** * ** ** ** *** * * * ** * * ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG CAE.EL_A CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAA-AAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG * * **** * * * * * ***** * * ** ** * * * **** ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC CAE.EL_A CCGGACC----GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTT-CAGAC *** ** ** **** * * ** * ** ** * * ** ** ZEA.MA_B CACC-ATCTTT- CAE.EL_A CACTTATCATTT *** *** **
Mean pairwise ID: 45.21%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT TRY.BR_A ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTT-AG ** * ** * * * ** ** ****** * * * HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA TRY.BR_A CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG ** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * ** HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ** HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG TRY.BR_A GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAG ** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * HOM.SA_A CTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 45.21%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * * * ******* * **** ** * * * * * LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG ** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * * LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRY.BR_B GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** *** LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCA * * ** **** *** ** ***** * * ** *** * * ** * ** * * LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT TRY.BR_B CACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT----- * ** * * * * **** * * ** * * * LYC.ES_N TTT TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 45.25%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** * * * ***** * * ** *** * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTC-TGACTTGCCCTATCCAAGCTTA TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG ** ** ** ** ** ** ** * * * ** ** *** * * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA TRY.BR_A GTGTTGAG----GTCGCC--ACTGTAGAGA-GGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA * **** ** *** * ** *** * ** * ** * *** ** *** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC * * ** **** *** ** ****** ** ** *** * * * ** ** * LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCAC TRY.BR_A ACACCGAGGAG-CATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------ * ** * * * *** * * **** * * ** * * * LYC.ES_H CTTTT TRY.BR_A -----
Mean pairwise ID: 45.28%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTG-TGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG LEP.COL. ------------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGC-TGAACA * *** * ** * ** * **** * * ** ** ** * CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG LEP.COL. GGGAGCTGTCTGGA--CCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGG * * * * *** ** * * ** ** ** *** * * * *** * CAE.BRI. CGCTGCGTCG-------CCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAA LEP.COL. CTGTGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCG-CCCCCTCCGTTAAA * ** **** ** ** * * ** * ***** *** *** ** ** CAE.BRI. GGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG LEP.COL. GTAGAGGAAC-TGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC-TGCCGTT * ** ** * ** ***** * * ** * ***** * * * * ** *** ** CAE.BRI. GCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT LEP.COL. GCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT- ** * * * * *** ** ** * ** *** * * * * CAE.BRI. TGTCATT LEP.COL. -------
Mean pairwise ID: 45.28%
ORI.CUN. ------GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTC-CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCC LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTG--TCT *** ** * ** * ** * ** ****** * ** **** * ORI.CUN. GGAGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG LEP.COL. GGACCAGCATA-------GGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG *** * * ** * * *** * * * * * * * ** *** * ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA LEP.COL. --------TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAA **** * **** ** * * **** * ** * ** ORI.CUN. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT LEP.COL. GTAGAG--GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT * ** * **** ** **** *** ********** ** * * * * * ** ORI.CUN. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCAC-CTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTT * * * * * ** ** * ** * ** * ** *** * * ** * ORI.CUN. TGTCTCC LEP.COL. T------ *
Mean pairwise ID: 45.28%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCA-GTGTGGTGGAATGTT TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGG------ *** ** * * ****** * * * *** * * * ** LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGG--TGTTCTG-CTTGGTTGC * ** * * * *** ** *** * * *** ** *** * * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGC-CAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG TRY.BR_B GTGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGA * ** ** * *** ** * * * * ** * * * * ** ********** * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRY.BR_B ACGG-GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCC-CGTTGCAGAAGCAC ** * ** **** *** * ** * * ** * ** ** * * **** * LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTAC TRY.BR_B ACCGAGG-AGCATCTCAGGACTTTG-----CGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- * **** ** ** * * ** * * * * * ** * ** * LYC.ES_C CACATTT TRY.BR_B -------
Mean pairwise ID: 45.31%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_D --------------------------------TAGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_D AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG **** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_D ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_D AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCC--AACTAAACC ** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * ** *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_D ACCACTTTT * *****
Mean pairwise ID: 45.34%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGT-GGTGGAA * * * **** * * *** ** *** ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA LYC.ES_M TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG LYC.ES_M AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA **** * * * *** * ** * ** * **** * * * * ORI.CUN. CTGTCTCC--- LYC.ES_M CAACCACCTTT * * **
Mean pairwise ID: 45.34%
LYC.ES_F -GCCG--AGCTTTGTAACGTGGGCTTGTA-ACCCGAGTGGGGGC-AACAATGTGGTGGAA DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * * ** ** * * * * * * * *** ** * * ** * *** LYC.ES_F TGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA DRO.MEL. TGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAG--CGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA ** ** * * ** * * ** *** ***** ** * ** * * LYC.ES_F AGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCT-TTAGAGTGG DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG *** * *** * * ** * ** ** ** * ** LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGA DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT **** ** * * *** *** * **** * * *** **** * ***** * LYC.ES_F AGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAA DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAG----TGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATA---TGGTTGGA **** ** * * * * ** * * * * ** * * * * ** * LYC.ES_F CCATCACTTTT DRO.MEL. CCACAATCTTT *** * ***
Mean pairwise ID: 45.34%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA--GGTGGTGCGGATT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA * * *** ******* ******* ** * * * * * ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC- LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGT-GCTCTGCTTGGCTG * * * * ** * *** ** ** *** * **** * * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT LEP.COL. TGTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGT ** ** * * ** * * ** * * * * * * * * * **** ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT LEP.COL. AG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTT * ***** * ** **** *** ** ******* * ***** * * ** ** * ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG LEP.COL. GC-AGAACCACA--CCGCGGAGCCT--GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAG * ** * *** **** * * * * ** **** ** ** * ** ZEA.MA_D ACCACCATCTT LEP.COL. CTTT-------
Mean pairwise ID: 45.36%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC SCH.POM. ------------------------CGCTGTAATGGCTTGGTCGAAGTG-----TTTAGTA * ** *** ** ** ** ** ** HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG SCH.POM. CTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGGTCTCGGGTT-CGAGTCT-CGCTTTCGATCCCTCGAT **** * * * ** * *** * * * ** * **** * * *** * ** ** HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGG-GTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT SCH.POM. CTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAGTCTTCGTGGCAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACC ** ** ** ** * * ** ** * * * ** **** * * * HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC SCH.POM. GATGGAGGTTGGAA--ACAATGCA--CATCACTACCGGGTCTTGG--GCAGTGCGATAGC * **** *** *** *** * *** ** * *** ** * * **** * HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCTT SCH.POM. GATGGGATTCACCTTCG--CAGGATG-----TGCATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT * * * * *** * ** *** ****** * *** ** * * ** HUM.JA_A TT SCH.POM. --
Mean pairwise ID: 45.36%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT * * *** ** * ****** * * * * ** * *** ** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA * **** ***** * *** **** * * *** *** * ** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * ** ******* *** * RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** RAT.RAT. T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** ** * * * * * **** * RAT.RAT. TT TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 45.36%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC LEI.MAJ. -------------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGG ** * ** * ** ** * ** ** * * * DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAGC LEI.MAJ. GGAGGACGTGGACCA--GCGAGGGTGATTTGCT-GCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC **** * * * * *** * ** *** ******* * * ** ** DRO.MEL. TTGCCATCAATATGGGT-GCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG-- LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCG--CGGGTCCGCCGTTGAAGCG * ** * *** * *** * ** ***** * *** ** ** * DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACG-TCCGCCGTTGCAG ******** **** **** ******* * * * * * ** ** * * DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCT LEI.MAJ. AATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACT-TGAGCCCCAC--GCTTCGTCG---CGAAGCCT ** * ***** * * * ***** ** * ** * * * ** DRO.MEL. TT LEI.MAJ. T- *
Mean pairwise ID: 45.36%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT * * *** ** * ***** * * * ** * * * * ** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA * * * * ***** * *** **** * * *** **** * ** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * ******* ** * * ** ******** *** HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** HOM.SA_A T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT----- * * * * ** * ** * ** ** * ** *** **** HOM.SA_A TT TET.THE. --
Mean pairwise ID: 45.37%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG * * * * * * * *** * ** * * ** * ** * * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * ** ** * * ** * ** * * *** * ** * ****** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGG-ACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG CAE.EL_D -GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT----GCATAAGGA * * ** * * ** * *** ****** * * * * * * HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC * ** ** * ** * ** ***** * * * **** ******* HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA CAE.EL_D GGAC--CGCGCTTGTAAG--TTGACACA-CA-TACACAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA *** ** ** ** * **** ** ** * ** * ** * * * ** HUM.LU_C CCATTTCTTTT-- CAE.EL_D CCACTTATCATTT *** ** * *
Mean pairwise ID: 45.37%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** ** ARA.TH_F ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC * * ** * * * ** * *** * * * **** * ** ** ARA.TH_F AAGCTGTGAGTAATTAGTGT-TGA--GTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGT CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG **** ** ** * ** * *** ** * ** ** * * * * ** ARA.TH_F CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT CAE.EL_C TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAGT ** ** * * * ** * **** ** * ** * ** * ***** ARA.TH_F GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT CAE.EL_C GGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA--CACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGAC ** **** ** ** * ** * * * * **** ** *** * ARA.TH_F GAACCACCATTTT CAE.EL_C CACTTGTCACT-- * ** *
Mean pairwise ID: 45.39%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * * * ******* * **** ** * * * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACTT--GG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G ** * ** ** ** ** ** * * * ** ** ** ** * * LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRY.BR_B TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG-GGA ** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** *** LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC ** ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** * ** * LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCA TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--- ** ** ** * ** * ** *** * * * * * * LYC.ES_O CTTT TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 45.39%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT-- * ** ** ** ***** * * * *** * ** CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTT----GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC *** **** * *** * * * * * * * * * * * **** **** * CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCAT-TAAAGAGCTGA * ** * * ** ** * * ** * * ** *** *** *** * CAE.EL_A GGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA *** * ***** * ** * *** **** **** * ** **** *** CAE.EL_A C--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT---- * ** * * ** ** * ** * * * * ****** *** CAE.EL_A ATTT TET.ROS. ----
Mean pairwise ID: 45.39%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** ** * ******* * *** ** * * ** ** * ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTTGCG--TG * ** *** ******* ** * * ** ** **** ** ** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGTA TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGC-GCCGTTAAAGT--GGGGGGA * ** * ** ** **** * ** ** * ** *** * *** * ARA.TH_F ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGATC TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC * * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * * * ARA.TH_F ACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACCA TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT---- ** * * ***** ** * * ** *** * * * ARA.TH_F TTTT TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 45.42%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** ** * ******* * *** ** * * ** ** * ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGAC-TTGGTGTTCTGCTTGGTT--GCGTG * ** *** ******* ** * * ** ** **** ** ** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTT-CTCGCGCCG---TTAAAGT--GGGGG * ** * ** ** **** * *** ** * ** *** * *** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA TRY.BR_B GAACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA ** * ** **** ** * ** ******* * ** * *** * ** * * * ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT-- *** * * ***** ** * * ** *** * * * ARA.TH_A CATTTT TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 45.42%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTT--CTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT--CTGATTGTGGGAT YAR.LI_A -----------------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCT *** ******* * ** * ** ** ** * DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT YAR.LI_A TGTTGTGCGTTCGAGTCT--TGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATT * * * * *** ** * * ** * *** * * * **** * * DRO.MEL. AAGC--TTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGG YAR.LI_A CTGCGGTTGATGGGCGTCTCGGT-CTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTT--CTAAGA ** *** * * *** * * * * * ** *** *** ***** DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAG-AGTTCCCGTGGTAGGCAGTA YAR.LI_A TTAACTGGGAAACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGG-GTATGGCG ** *** ** * ** ******* * **** ****** * DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA YAR.LI_A GTGGGAT--CGCAACCAAGTGGTATAT-GTTATGGAA------GATATT-TACGATCACG ******* ** * * ***** * ***** ***** * ** *** DRO.MEL. ATCTTT YAR.LI_A ATT--- **
Mean pairwise ID: 45.42%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG YAR.LI_A ------CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGTCTTCTTGTTG ***** *** * * * ***** *** * * *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG YAR.LI_A TGC-GTTCGAGTC--TTGGGCTCTGCAC-TTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTG ** ** * ** ****** * * * * ** *** *** * * * * LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC YAR.LI_A CGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAAC * * *** * * * * * *** **** ***** * * * * ** LYC.ES_E CCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA--CGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA YAR.LI_A T-GGGAAACT---TCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGT---TGCCGTGG--GTATG * ** ** * ****** * * * *** * *** **** * ** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA YAR.LI_A GCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT--ATGTTATGGAAGATATTT-------ACGATCA *** * * * ****** ** *** * * ** ** * ** LYC.ES_E CATTTT YAR.LI_A CGATT- * **
Mean pairwise ID: 45.45%
LYC.ES_N -GTTG--AGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG-GGGATGTTAATGTGGTGGAAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC ** ** ** * * * * * * * ** * ** * * * * * ***** LYC.ES_N GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * ***** * * ** * * ** * * ** * *** LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA *** * *** * ** *** * * * * *** * *** LYC.ES_N CGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAG DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG * * * * *** *** * **** * * **** * * ** ** ** * * LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCA---ACCGATATGGTTGGACCA **** ** *** ** *** ** ** * * * * * ** **** LYC.ES_N CCATTTTT DRO.MEL. CAATCTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 45.45%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGCGCGGATGC TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******* * *** ** * * *** *** * ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TRY.BR_A CTTGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG---GTTGCGTGT *** * *** * ***** * * ***** * * ** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG TRY.BR_A CGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG *** ** * ** ** *** ** * ** ** ** ** ** * ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG TRY.BR_A GAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTCGAG *** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** *** * * * ** *** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG-ATCCTCTCTTAGCAAACCA TRY.BR_A AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTT-TGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG---- * *** * *** * * * * ** ** ** ** * ** ZEA.MA_B CCATCTTT TRY.BR_A --------
Mean pairwise ID: 45.45%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT LEP.COL. ----GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * * * * ******** * **** * * * ***** * * HUM.LU_B CAGCCCAGT--GGATCGGGT-CCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCA-TTCCAAGCC LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTC * * ** **** * * * * * ** ***** * * * HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG LEP.COL. GGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGC--CCCCTCCGTTAAAGTAGAGGA ** * * * *** * ***** * * * * * ** *** **** HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-CCGGCAGTGGAAGG LEP.COL. -ACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA * ** ** **** ** ** ******* * ***** *** * * ** ** * ** HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA LEP.COL. ACCACACCGCGG--------AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCT * ** *** * * *** * * ** * * * * * * HUM.LU_B TTTCCTTT LEP.COL. TT------ **
Mean pairwise ID: 45.45%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** ** ******** * **** * * * * *** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRY.BR_B TCT----TGGA---CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGA---CTTGGTGTTCTGCTTG--- * * **** * * *** * * **** **** ** *** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGG-GCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TRY.BR_B ---GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGC-------GTTCTCGCGCCG ******* ** * * * ** * ** * * ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TRY.BR_B TTAAAGTGGGGGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC ******** ** ** * ** **** ** * ** ******* * *** * * * * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT TRY.BR_B --CCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTC * ** * ** * *** * *** ** ** *** **** *** * ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TRY.BR_B GCGAGGCGGTTT------- * *
Mean pairwise ID: 45.45%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTC-GACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA **** ** * * *** * * * ** * * * * * * ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGC-GACCGC-----GT * * * **** * * * * * *** ** ** * * * ** ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG--- CAE.EL_D GGTGCAGTGGCCGG--ACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACC ** * * ** * ** *** * ** ** ** ***** * ZEA.MA_E --CAGACCACC-ATCTTT- CAE.EL_D TTCAGACCACTTATCATTT ******** *** **
Mean pairwise ID: 45.45%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTTTAGT LEP.COL. -GCC--GGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC *** * * * * * ******** * *** * ** ** * HUM.JA_B TCGGCCCAT-TGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGA LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCT--TGGCTGTGTGTCGG * * ** * * * * * * *** * **** *** * * ** HUM.JA_B GAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTC-CTAAAGCGGAGGGC LEP.COL. AGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG---GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGA- * *** * * ***** *** * * * ***** **** HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGGA LEP.COL. ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAA * ** ** **** ** ** ******* * ***** *** * ** ** ** * ** * HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA LEP.COL. CCACA---CCGCGGAGCCTG---TCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCT--GTGAAGCTT ** * * * ** ** ** ** * ** ** ** * * HUM.JA_B TTTCTTTT LEP.COL. T------- *
Mean pairwise ID: 45.48%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT * * * **** * * ****** * ** HOM.SA_B CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA LYC.ES_M ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * ** ** ******* * *** **** *** ** ** * ** HOM.SA_B GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTGG * * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * ** HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT LYC.ES_M GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGA LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC **** * * * *** * ** * ** * **** * * * HOM.SA_B CCCCGTCTCT LYC.ES_M AACCACCTTT ** ** *
Mean pairwise ID: 45.48%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGT--GGAT LYC.ES_M ------------------------CAAGTGGGGATGTTAA-GGTGGTGGAATATTGGGCT *** * * ** * *** * * * * ** * CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGC-TAATTTCTGGC--CTGCCC--TGTCCAAGCACA * * ** * * ***** * * * * ** **** ** * CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG LYC.ES_M GAGTTGGATCACGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * * ** ** * *** ** * ** *** * * * * * *** * * * CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ** *** * * ***** ** *** **** * ********* CAE.BRI. GGATAGCGCTT--GTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG--ACC LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ***** * * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** * * CAE.BRI. ACTTGTCATT LYC.ES_M AACCACCTTT * * **
Mean pairwise ID: 45.48%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * * ** * * ** *** * ** * ** * * ***** *** LYC.ES_I AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA * ** *** * * *** ** * ** * ** * ** *** LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT *** * ** * ** ** **** * * * * * *** * * LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGA CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC ** * * ** *** * * **** * *** *** * ** **** LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACT ***** ** * * *** ** ** * **** * * ** ** * LYC.ES_I CACCATTTTT CAE.BRI. TGTCATT--- ****
Mean pairwise ID: 45.48%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTA---CTCGGGAGGCTGAGGCCGGAG **** ** * ** *** * ******* ** *** * * *** * ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGT-TGTAATCTTGCTGGCTTGCCCG ORI.CUN. GATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC----TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG * * ** * * * * ****** *** ** * ** * * * ** *** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTG----- * ***** * * ** * ** ** * ** ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT ORI.CUN. -CCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGC ***** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ORI.CUN. TGATCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-CCAGCCTGGG----CA *** ** * **** * ** ** * * ** * *** * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ORI.CUN. ACATAGCGAGACCCTGTCTCC * * * * * ***
Mean pairwise ID: 45.48%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACT-ATAAGATGG-TGGAACAC LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * * ******* * *** * * ** ** * * ARA.TH_G TGGATCGGCC--CACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAG LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGT ** * * ** ** ** * * * **** * * * ** **** ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGC-CCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * *** *** ** ** * ** * ** * * * ** ** *** ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCAGCAGTGGAC LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** * ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCA--TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- * ** ** ** *** ** ** ** * ** * ** * **** ARA.TH_G CCACCATTTT LEP.COL. ----------
Mean pairwise ID: 45.48%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG * * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * ** * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** ** * * * ** *** ** * * * * ** * ****** HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT ** * * * *** ****** * * * * ** * * * HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGG CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG * * * * * * * ***** * * * **** ******* ** HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA CAE.EL_A AC--CGCGCTTGTG--AGTTGACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGACCA * ** ** *** * *** *** ** ** ** ** * * ** ***** HUM.LU_B TTTCCTTT-- CAE.EL_A CTTATCATTT ** *
Mean pairwise ID: 45.51%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** * ** ******* ** ** ** * * * * ** * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * *** HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG RAT.NOR. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * ** *** * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** * HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** * **** * ** * * * ** HUM.JA_B ACCATTTCTTTT RAT.NOR. CCCGTCTCT--- ** * ***
Mean pairwise ID: 45.51%
CAE.BRI. -ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGG---CATAAACAAT--GTAGGTTGTGATA * **** * * * * ** * ** * ** * * ** *** CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGA-----GTGTGCCCGCTCCAAA ** * * **** ** * ** ** * * * * * *** **** CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * ** ** ** * ** * * * ** ** **** *** * CAE.BRI. TGCA-CGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA * * ** ****** * ** * **** **** **** * ** **** *** CAE.BRI. TAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCAT TET.THE. TAACAT-----ACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAA--GCCAGACAT ** * * * * * * * ** * *** *** * * * *** CAE.BRI. T TET.THE. T *
Mean pairwise ID: 45.51%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT- DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * * * * ** ** * * * * * * *** ****** ARA.TH_F ---GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA ** * ** ** * * ** * ** * ****** * * ** * ** ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAG DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTT----GGCTAAGG *** * * ** * ** ** ** * **** * ****** * * ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC---TTCCCGCTTACAGCAGTGG DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG * *** *** * * * **** * * ****** ***** * ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT-TGG **** ** * ** * ** * * * ** ***** * * ** ARA.TH_F ACCACCATTTT- DRO.MEL. ACCACAATCTTT ***** ** **
Mean pairwise ID: 45.51%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGC TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******* * *** ** * * * * *** * ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTC-ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG TRY.BR_A CTTGGACAA-------GCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG------G * * ** ** ****** * * ** *** ** **** * * ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACC--TATAGTG TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG---AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG *** ** * **** * **** *** * ** * ** ** **** ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG TRY.BR_A GGGGGAACGG-GTCAGGCCG--GTGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTC * ******* ** **** * * ** ******* *** ** * * ** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TRY.BR_A GAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG ** * *** *** * ** ** * ** * ** * * ** * ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TRY.BR_A ------------
Mean pairwise ID: 45.51%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTT--AGAAT * * *** ** ******* * * * * ** ** ** ** HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA * *** ***** * *** **** * * *** *** * ** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * ** ******* *** * HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** HOM.SA_B T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** * ** *** * * **** * HOM.SA_B T TET.ROS. -
Mean pairwise ID: 45.51%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * *** ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA GAL.GAL. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATA-TGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** ** **** * * ** * *** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA * * * * * *** ** ** ****** * ***** **** ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCT-GCTGGTCCGATCTCATATG GAL.GAL. CGGGATCGCGCCT-------GTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAG ***** ** * * * * ***** ** * ** * * * * * ARA.TH_A AACCACCATTTT GAL.GAL. ACCCTGTCTCC- * ** *
Mean pairwise ID: 45.54%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAG-TGCGCTATGCCG--AGCGGGC--GTCCGCG **** ** ** ******** * ** * ** * ** *** * ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGA GAL.GAL. CTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG-GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAG * *** * * * * * ** * * * * * * * * *** ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG GAL.GAL. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAG * ** *** * *** ** ** ****** * ** ** * * ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC GAL.GAL. TAACGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCA----ACATAGC * **** * *** ** * * * * ** ** * * ** *** ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT GAL.GAL. GAGACCCTGTCTCC * * * ***
Mean pairwise ID: 45.54%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT- DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * * * * ** ** * * * * * * *** ****** ARA.TH_A ---GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA ** * ** ** * * ** * ** * ****** * * ** * ** ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGC--ATTCAGGTT----GGCTAA *** * * ** * ** ** ** * **** ** ****** * ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC---TTCCCGCTTACAGCAGT DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT * * *** *** * * * **** * * ****** ***** ARA.TH_A GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT-T * **** ** * ** * ** * * * ** ***** * * * ARA.TH_A GAACCACCATTTT- DRO.MEL. GGACCACAATCTTT * ***** ** **
Mean pairwise ID: 45.54%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** ** ARA.TH_A ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC * * ** * * * ** * *** * * * **** * ** ** ARA.TH_A AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTC CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCGGGTGCATAA-- **** ** ** * ** * ** **** *** * * ** * * * ARA.TH_A GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAG CAE.EL_C --GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG * ** ** ** * ** * ** ***** * * **** **** ARA.TH_A TGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA CAE.EL_C TGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA--CACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGA *** **** ** ** * ** * * * * **** ** *** * ARA.TH_A TGAACCACCATTTT CAE.EL_C CCACTTGTCACT-- * ** *
Mean pairwise ID: 45.54%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCC-GCTTAG ** ** * * * ** ** ****** * * * RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG ** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * ** RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ** RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG TRY.BR_B GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG ** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCT TRY.BR_B AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * * RAT.RAT. CTT TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 45.57%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * * HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG * * * * *** * *** **** * * * ** * * ** *** * HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA ** ** * * * * * ** * *** *** ** ** ** * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCT--GGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_A GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG ** * * ** * ** * ** ***** * ** * **** ****** HUM.JA_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAG---TTGACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TC * *** ** ** *** * *** *** ** * ** * * * HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT-- CAE.EL_A AGACCACTTATCATTT ***** ** * *
Mean pairwise ID: 45.57%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTT--GTGACC-CGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACA DRO.MEL. ---GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATG ** * * ***** ** * * ** * * * * * **** * ARA.TH_D GT----GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTC DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC * ** * ** * * ** * * ** *** * * * ** * ARA.TH_D CAAGCT-GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGAC--TCAGGCGGATTCTAAA DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCT---AA ***** * * *** ** *** * ** * ** * ***** * * ** ARA.TH_D GTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCA DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCA * ** * * * * *** *** * ****** * * ***** *** ARA.TH_D GTGGATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTC DRO.MEL. GTAGTGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT ** * **** ** *** * * * * * ** **** * ARA.TH_D CTGGACCACCACTTT- DRO.MEL. -TGGACCACAATCTTT ******** * **
Mean pairwise ID: 45.60%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** *** ******* * *** ** * * * ** * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGT--CCAAGC TRY.BR_A TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTC * ** **** ********** * ** ** **** ** * * ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG TRY.BR_A GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGT--GGGG *** * * ** *** ** * * * ** ** ****** * ** ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG TRY.BR_A GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA * ** * ** **** *** ** ******* * ** * *** * ** * ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGG---- * **** * * ***** ** * * ** *** * * * ARA.TH_E CCATTTT TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 45.60%
GAL.GAL. ------GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTC-CCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCC LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGT---- *** ** * ** * ** * ** ****** * ** **** GAL.GAL. GCCGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCG LEP.COL. -CTGGACCAGCATAG----GGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG * *** * ** ** * * *** * * * * * ** ** * GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA LEP.COL. T-CGGAGGCC--------TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAA * ***** * ** **** * ** * *** * ** * *** GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT LEP.COL. AGTAGAG-GAACTGGGTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCC-GT * * * **** ** **** *** ********** ** * * * * * * * ** GAL.GAL. AACGGGATCGCGCCTGTGAATA-GCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC LEP.COL. TGCAGAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC-TGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTT * * * * * ** ** * ** * * ** *** * * ** * GAL.GAL. TGTCTCC LEP.COL. T------ *
Mean pairwise ID: 45.63%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACAT-TTAGATGGTGGAACACT LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC ** * * * ******* * *** ** ** * ARA.TH_E GGTTCGGGTC--CACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAG LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGT ** ** * ** ** * ** * **** * ** * ** **** * ARA.TH_E CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGC-CCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG * *** ** *** * * ** *** * * * ** * *** ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA-CAGCAGTGGAC LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** ** **** ** ** ******* * ** ** *** * ** ** * ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCTGTCATCACC----TGCGCCCCAGG--CGATCC--TGTGAAG * * **** * * * *** *** ** * * ** ***** * **** ARA.TH_E CACCATTTT LEP.COL. CTTT----- *
Mean pairwise ID: 45.63%
LYC.ES_O -GCCG--AGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG-GGGATGTTAAGGTGGTGGAAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC * * ** ** * * * * * * * ** * ** * * * * * **** LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * ***** * ** ** * * ** ** * ** * *** LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA * * *** ** *** * * * * **** * *** LYC.ES_O TGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG ** **** * *** *** * **** * ** * * *** * ***** * * LYC.ES_O GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGT----GGACTGCCGTTA---TCAGCCCAACCGATATGGTTGGACC **** ** ***** * * * ** *** * * * * * ** *** LYC.ES_O ACCACTTT- DRO.MEL. ACAATCTTT ** * **
Mean pairwise ID: 45.63%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ***** ** * * ****** * ** * ****** * * * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGCA-TGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC * * * ** ** * *** **** ** ** * * ** ****** ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA ** ** * * * ** * ** * * * * * *** * * *** * ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC ** ** ** * ** * ** ***** * * **** ******* * ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA--CACAGCCTTCTCAAT-ACCTTCAGACCACT *** * ** * ** * * * * **** ** *** * * ARA.TH_E CACCATTTT CAE.EL_C TGTCACT-- ** *
Mean pairwise ID: 45.63%
LYC.ES_G -GCCG--AGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG-GGGGCATTAATGTGGTGGAAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTG-TAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC * * ** ** * * * * * * ** * ** * ** * * ***** LYC.ES_G GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAAG * ***** * * ** * * ** ** * ** * *** LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG DRO.MEL. CTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGGA * * *** ** *** * * * * **** * *** LYC.ES_G TGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG DRO.MEL. TGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG ** **** * *** *** * **** * ** * * *** * ***** * * LYC.ES_G GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTG----GACTGCCGTTATCAGCCCA---ACCGATATGGTTGGACC **** ** ***** * * * ** *** * * * * * ** *** LYC.ES_G ACCACTTTT DRO.MEL. ACAATCTTT ** * ***
Mean pairwise ID: 45.66%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ** * * * ****** ** ** ** * * * * * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNC--CAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA * * * ***** ** * ** * ****** *** * * *** * ** * ** HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGA GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** ** * ** ** ** * * **** ** HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG * * * * *** ** ** ****** * ****** * * **** HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA GAL.GAL. GGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACA--TAGCGAGA **** ** *** *** ***** * * * * ** ** ** ** HUM.LU_C CCATTTCTTTT GAL.GAL. CCCTGTCTCC- ** * ***
Mean pairwise ID: 45.67%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG TET.ROS. GCCAGG----GTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG *** ** ** ** ******* * * * * * * * * ** * XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-----AGTGTGCCCGTTCCAAACA **** ***** * ** * **** * * *** *** * ** XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG-GG TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGG--GCATTAAAGAGCTGA * * ******* * * ******** ** *** *** * XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** *** ** * *** XEN.LAE. T--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAA-GCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * * ** * * * * ******
Mean pairwise ID: 45.69%
ZEA.MA_E -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG * * ** * ** ***** * ** * * * * * *** **** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCA-GCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** * * *** * ** * * * * * * * *** * *** * ZEA.MA_E AAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATT--CAGGT-TGGCTAA *** * * * * ** ** * * *** * *** * *** ** ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCG--CCGGCTTCCAACGG DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGA-AAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAG * *** *** * * * ** * * * * **** ** * ** * * * ZEA.MA_E TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA DRO.MEL. TAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTA--TCAGCCC---AACCGATATGGTTG * * ***** ** *** * * * **** ** * ** * ZEA.MA_E GACCACCATCTTT DRO.MEL. GACCACAATCTTT ****** ******
Mean pairwise ID: 45.69%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ***** ** ** * ******** * * * * * *** * ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA **** * ** ** * ** ** * * **** * ** **** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG----- ** ** ** * * * * * * * ** * * * * * *** * * *** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG CAE.EL_C GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG * ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * ******* ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG CAE.EL_C CCGGACAGCGCTTGTGAGTT-----GACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTC-AG *** ** *** ** * *** * ** ** ** ** * * ARA.TH_D ACCACCACTTT-- CAE.EL_C ACCACTTGTCACT ***** *
Mean pairwise ID: 45.70%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT * * *** ** ******* * * * * ** * * ** ** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGTTCCAAA * **** ***** * *** **** * * *** *** * ** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA * * ******* ** * * ** ******* *** * HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ****** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** HOM.SA_A T--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGC-TATTCTGATCAGACACT----- * * * * ** * ** * ** *** * * **** * HOM.SA_A TT TET.ROS. --
Mean pairwise ID: 45.71%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA CAE.EL_C --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-TGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** * **** ** * ** ** * ** * ** * **** *** ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAGTCCCGGGTGCATA--- ** ** ** *** * ** * ** *** * * ** *** ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCT-GTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG CAE.EL_C --AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTG **** ** * ** * * * * *** ** * * ***** ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG-C CAE.EL_C CAGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA---CACAGCCTTCTCAATACCTTC * * * * ** * * * * ** ** * ** **** * ** * ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT- CAE.EL_C AGACCACTTGTCACT ******* *
Mean pairwise ID: 45.72%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT-- * ** ** ** ***** * * * *** * ** CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA--GTTT--GCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC *** **** * *** * * * * ** * * * * * * **** **** * CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCAT-TAAAGAGCTGA * ** * * ** ** * * ** * * ** *** *** *** * CAE.EL_D GGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA *** * ***** * ** * *** **** **** * ** **** *** CAE.EL_D C--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGC-TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-ACT---- * ** * * ** ** * ** * * * * ****** *** CAE.EL_D ATTT TET.ROS. ----
Mean pairwise ID: 45.75%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TET.THE. -------GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGG--CATAAACAA-TGTAGGTTG * * ** * ** *** * * * ** * ** *** * * * CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG TET.THE. TGATAGAT-AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA * *** **** * ** ** * * * * * * * *** **** CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGG-GATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCAT-TAAAGAGCT * * ** * * ** * **** * * ** * * ** *** *** *** CAE.EL_A GTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG *** * ***** * ** * *** **** **** ** ** **** * CAE.EL_A GAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT-- ** * ** * * ** ** ** ** * * * * ***** * * CAE.EL_A TCATTT TET.THE. ------
Mean pairwise ID: 45.75%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG *** * * * ******* * **** ** * * * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGCGTTGACT--TGG--TGTTCTGCTTGGTTGC-G ** * ** ** ** ** ** * * * * *** ** ** * * * LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTC-CAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA TRY.BR_B TGTCGG-TGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAA ** ** * ** **** * * ** * * * * * ********** * * LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCA * ** **** *** ** ***** * * *** *** * * ** * ** * * LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTT-CTAGTTAAACTACCA TRY.BR_B CACCGAGGAGCATCTCAGGAC---TTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT---- * ** ** * ** * ** *** * * * ** * ** * LYC.ES_E CATTTT TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 45.75%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG TET.THE. -------GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGG--CATAAACAA-TGTAGGTTG * * ** * ** *** * * * ** * ** *** * * * CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG TET.THE. TGATAGAT-AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAA * *** **** * ** ** * * * * * * * *** **** CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGG-GATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCAT-TAAAGAGCT * * ** * * ** * **** * * ** * * ** *** *** *** CAE.EL_D GTGGA--TGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG *** * ***** * ** * *** **** **** ** ** **** * CAE.EL_D GAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTA TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAAC-TAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGAC-ATT-- ** * ** * * ** ** ** ** * * * * ***** * * CAE.EL_D TCATTT TET.THE. ------
Mean pairwise ID: 45.75%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT TRY.BR_B -------------------AGCCGGAGCGC--ATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATC * * ** * * *** * * ** ** ** * HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGG----GCTGTAGTGC-GCTATGCCGATGGGGTGTCCGCA TRY.BR_B CCGCTTAGCGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TG * * *** * ** *** ** * ** * * * * ** ***** * HOM.SA_B CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG TRY.BR_B CTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAA ** *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA TRY.BR_B GTGGGGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTT * **** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** HOM.SA_B GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCC TRY.BR_B GCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGT * * * * * ** ** * * ** * * * ** ** * * ***** * HOM.SA_B GTCTCT TRY.BR_B TT---- *
Mean pairwise ID: 45.78%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG **** ** *** **** ** ***** ** * * * ** * ** * * LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAA--GGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * ** * * ** ** * * **** * * ** ** * *** LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGC--CTTTAGAGTGGGAT XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT * * * ** ** * *** ** ** ** * *** * LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG * ** * *** ** ** ***** * ***** * * **** * ** LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA XEN.LAE. ATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGC--AGAACAGCCTGA---ACAACACAGCGAGAC-- *** ** * *** ** * * ** * ***** * * * ** LYC.ES_F TCACTTTT XEN.LAE. ACAGTTCT ** ** *
Mean pairwise ID: 45.79%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ***** *** ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGC---TCGTTGT-GACACTGGCCGGCTTGCCCATC CAE.EL_B AGTGAGAGGAG-----GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC-GTCCGTG ** ** * * * **** * ******* ** * *** * ** * ZEA.MA_A CCAAGT-TGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGG CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGG ***** * * ** * * ** * * * * * * * * * ** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG CAE.EL_B AGTGGTGG--ATGGTTCAGGACCGA------AAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCG ** ** * **** * * * * * * *** ** * ** * ** ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG CAE.EL_B GTGCAGTGGC--CGGA----CTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT *** * ** * **** *** * ** * ** * *** ** ZEA.MA_A -----CAAACCACCATCTTT- CAE.EL_B ACCTTCAGACCACTTGTTTTT ** ***** ***
Mean pairwise ID: 45.80%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCT--CTGTAACCTTCGGGGGC-TAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG *** * * * **** * * * *** *** ** * * * ** * TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC LEI.MAJ. GACCAGCGAG---GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTGTGTCGG ** * *** * *** * * * * **** * * * ** ** * TET.THE. TATGG-TGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGA-GCTAAGGAAACGCC LEI.MAJ. TGTGGCTTGCCCCCCTGCAG-AGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGG * *** * * ** * * *** * * * * ** ** * **** ** TET.THE. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATACT LEI.MAJ. TCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGT-CCGCCGTTGCAGAATCACACCGC ****** ** *** ** *** * * * * * * ** * ** ** *** TET.THE. CATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT LEI.MAJ. GGAGCATGTCCGCACT--TGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT * * *** * * * ** ** ** * * **
Mean pairwise ID: 45.81%
ZEA.MA_A -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGC TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG * * * * * * * ** * ** * ** * ** ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGAC---AGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAAT--GA * ** * ** ** * * * * * * ** ** *** ** * ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG TET.THE. GTTGCTA-----TGGTGGTAAC-CTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCAT-TAAAGAGCTA **** ** ****** * **** * ** * * *** **** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG TET.THE. -AGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA ***** ** * ******** ***** *** ** *** * ** ***** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAAC TET.THE. AGGATAACATACTCATTA-ACTGTCAAACTAATC--GGTTCTA---CTATCAAAGCCAGA ******** * * * *** * * **** ** ** ** * **** * ZEA.MA_A CACCATCTTT TET.THE. CATT------ **
Mean pairwise ID: 45.81%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGA--CAATAAGGGGATGGGACGT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * * * * *** * * * ** ** * * * ** * ARA.TH_C TGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGG-GTTGG-GCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGC----TGTG ** * ** * * ** * * *** **** * * **** ** * ARA.TH_C AGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG LEP.COL. TGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCC--TCCGTTAAAGTAG ** ** * * ** * ***** ** * * * ** ** *** * ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTC-TTGACGGTGG LEP.COL. AGGA-ACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTG *** ** * ** **** ** ** ******* ******* *** * * * ** * ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA LEP.COL. CAGAACCACACCGCGGAGCCTGTC--ATCACCTGCGCCCCA----GGCGATCCTGTGAAG ** * ** * **** * * ** * **** * ** *** * ARA.TH_C CCATCACTTT LEP.COL. CTTT------ * *
Mean pairwise ID: 45.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTG-ACGGTAGACAAGTGTGGATG *** * ** *** * ****** * ** * ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC CAE.BRI. G--AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCG--GCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGC *** * ***** * *** * * ** * * * **** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC CAE.BRI. CAAG---CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGC---GGTCCCGGGCGCA **** ** * * * *** ** ** * ** * * * * * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA CAE.BRI. TAAGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGA------AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGC-- *** * * **** ** *** * * ***** ** ** * * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA CAE.BRI. ---GCGGTGCAGTGGCCGGATA--GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTG * ** * * ** * ** * * * * ** ***** ** * **** ORY.SA_A CAAC----AGACCACC-ATCTTT CAE.BRI. ATACCTTCAGACCACTTGTCATT ** ******* ** **
Mean pairwise ID: 45.83%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGC TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******* * *** ** * * * * *** * ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTC-ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG TRY.BR_B CTTGGACAA-------GCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG------G * * ** ** ****** * * ** *** ** **** * * ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACC--TATAGTG TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAG---AGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG *** ** * **** * **** *** * ** * ** ** **** ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG TRY.BR_B GGGGGAACGG-GTCAGGCCG--GTGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTG * ******* ** **** * * ** ******* *** ** * * ** * ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TRY.BR_B CAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG ** * *** *** * ** ** * ** * ** * * ** * ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TRY.BR_B TTT---------
Mean pairwise ID: 45.83%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG * ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * *** * ** ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** * * * ** * *** * * ** * * ** ** * * ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG CAN.SPE. AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** * ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCC-GCTGGTTCGATCTCTCCTG CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAAT-------AGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAA-CATAGCGA ***** * * * * ***** ** ** ** * * * * ARA.TH_D GACCACCACTTT CAN.SPE. GACCCCGTCTCT **** * ** *
Mean pairwise ID: 45.83%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** * * ***** ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCT---TGCCCATCCCA CAE.EL_D AGTGAGAGGAGG---AGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * **** * ** ** * ** * * ** * *** ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT ** ** * ** ** ** *** * * * ** * * ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG CAE.EL_D CGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAA-AAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG * * **** * * * * * ***** * * ** ** * * * **** ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC CAE.EL_D CCGGACC----GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTT-CAGAC *** ** ** * **** * * *** * ** ** * * ** ** ZEA.MA_B CACC-ATCTTT- CAE.EL_D CACTTATCATTT *** *** **
Mean pairwise ID: 45.83%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** ** * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG--CCGAGCGGGCGTCCGCG-CT **** * * * ******** * ** * ** * *** *** * * * * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGC GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG-GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA * * ** * * ** * * * * * * * * **** * ZEA.MA_B GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGT GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * ** ZEA.MA_B GGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAA GAL.GAL. AACGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGG----CAACATAGCGA **** * *** ** * * ** * ** * * * **** * ZEA.MA_B ACCACCATCTTT GAL.GAL. GACCCTGTCTCC * * ***
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** ** LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * **** * *** **** ** *** LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA--GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** * * *** * * * * **** * * ** * * LYC.ES_B ACCACCACTTTT CAE.EL_A CTTATCATTT-- * ** **
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATAAGTGTG **** * ** ** * ****** * ** * * ** * * ** ** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** ** LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * **** * *** *** ** *** LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA--GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** * * *** * * * * **** * * * ** ** * LYC.ES_N ACCACCATTTTT CAE.EL_A CTTATCATTT-- * *****
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGT----GGGGATGTTAAGGTG---GTGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * * ** ** * ** *** * ** * * * * * *** *** LYC.ES_E AATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA * * *** * * *** ** * ** * * * * ** *** LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTG CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTC-TCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG ** * * ** * ** *** * * *** *** * * * * * *** * * LYC.ES_E GGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGG--GCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC **** ** * *** * * **** **** * **** ********* LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCAC ***** ** * * ** * ** * **** * * ** * LYC.ES_E CTACCACATTTT CAE.BRI. TTGTCATT---- * **
Mean pairwise ID: 45.83%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** ** LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * **** * *** *** ** *** LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** * ** * * * * **** * * * ** ** * LYC.ES_I ACCACCATTTTT CAE.EL_D CTTATCATTT-- * *****
Mean pairwise ID: 45.86%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** ** * ******** * * * * * * *** * ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA **** * ** ** * ** ** * * **** * ** **** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG----- ** * ** * * * * * * ** * * * *** * * *** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG CAE.EL_A GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG * ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * * ******* ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG CAE.EL_A CCGGACCGCGCTTGTGAGTT-----GACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCTTC-AG *** * ** *** ** *** ** * ** ***** ** * * ARA.TH_D ACCACCACTTT--- CAE.EL_A ACCACTTATCATTT ***** *
Mean pairwise ID: 45.86%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** ** * ******** * * * * * * *** * ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA **** * ** ** * * ** * * **** * ** **** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG----- ** * ** * * * * * * ** * * * *** * * *** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG CAE.EL_D GAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG * ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * * ******* ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG CAE.EL_D CCGGACCGCGCTTGTAAGTT-----GACACAC-ATACACAGCCTTCTCGATACCTTC-AG *** * ** **** ** *** ** * ** ***** ** * * ARA.TH_D ACCACCACTTT--- CAE.EL_D ACCACTTATCATTT ***** *
Mean pairwise ID: 45.86%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** ** *** * ****** **** * ** * * * * * * CAE.EL_D GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCG---TTCCAAG * ** ** * * ** * *** ** ** * ** ** *** *** * CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGGGT--CTCACGGTCCATAATG * * * ** **** * * ** *** ** * * *** ***** * CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT * * * * * * * * * ***** * ** * **** * * ** CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCG---ATACCTTCAG TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG ** *** * ** * * * * * **** * * ** *** CAE.EL_D ACCACTTATCATTT TRI.AE_A ACCACC-------- *****
Mean pairwise ID: 45.87%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTT-AG ** * ** * * * ** ** ****** * * * HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG ** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * ** HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ** HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG TRY.BR_B GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG ** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT TRY.BR_B AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * * HOM.SA_A CTT TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 45.90%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGA-AATGGGACTTTAGTT TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT--CT *** * * * ******** * *** ** * * *** * * HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCA-TTCCAAGCCGAG TRY.BR_B TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT ** * * ** ** * * ** **** ** **** ** * * ** HUM.JA_B AGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA TRY.BR_B GTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGTGGGGGG-AA * * * * * * * *** ** ** ***** ** *** ** HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA TRY.BR_B CGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCA * ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** * ** * * HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTT TRY.BR_B CACCGAGGAGCATCTCAGGACT----TTGCGCCCCAAGTG---TCGTCGCGAGGCGGTTT * ** ** ** * * * * * * ** ** * * * *** HUM.JA_B CTTTT TRY.BR_B -----
Mean pairwise ID: 45.90%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT TET.THE. -GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT *** * * * ***** * * ** * * * * * * HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGAT---GAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGA * * * * * * * * ** * ** ** ***** ***** * ** HUM.LU_B GTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCA TET.THE. GTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCAC--CAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAA **** ** ** **** * *** ** * ** * * ** * HUM.LU_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATA TET.THE. ACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATA * ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * *********** HUM.LU_B ACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTT TET.THE. AC------ATACTCATTAA-CTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT- ** * ** ** * ** * * *** ** ** * **** HUM.LU_B CCTTT TET.THE. -----
Mean pairwise ID: 45.91%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** *** **** ZEA.MA_G TTTGC--GATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGC----GACCGAGC-GTCCGTGC ** * ** * *** * * *** * ** * *** * * **** * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.BRI. CAAGCGCTGCGTCGCCA--GGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA-- **** ** ** ** * ** * * * *** ** * * * ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT CAE.BRI. ---AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGC-----GC **** *** * **** * * * ***** ** ** * * * ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG--- CAE.BRI. GGTGCAGTGGCCGGATA--GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACC ** * * ** ** *** * * ***** ****** ** * ZEA.MA_G --CAGACCACC-ATCTTT CAE.BRI. TTCAGACCACTTGTCATT ******** ** **
Mean pairwise ID: 45.93%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-G *** *** ******* * *** ** * * * ** * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGT--CCAAGC TRY.BR_B TCTTGGACAAGCGGG--GGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTC * ** **** ********** * ** ** **** ** * * ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG TRY.BR_B GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-------GCCGTTAAAGT--GGGG *** * * ** *** ** * * * ** ** ****** * ** ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG TRY.BR_B GGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA * ** * ** **** *** ** ******* * ** * *** * ** * * ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT-TTGCGCCCCAAGTGTC-GTCGCGAGGCGGTTT- * **** * * ***** ** * * ** *** * * * ARA.TH_E CCATTTT TRY.BR_B -------
Mean pairwise ID: 45.93%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** **** ** *** ******* * * * ** * * ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * ** **** * * ** ** **** * * * * ** * * **** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTC-TCATGTCTTCTAGAGTGGGG FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * ** * ** * *** * * * ** * ** ** ** *** *** * **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG *** *** ** ** ***** * * **** * * ** * * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA FUG.RUB. GATCGCGC-CCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCT *** ** ** * ** * * * *** * ** * * ARA.TH_C TCACTTT FUG.RUB. TT----- *
Mean pairwise ID: 45.95%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGA-ACACT TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTG-TCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGAT ** * * * * * *** * * ** ** ** * *** ** * ARA.TH_G GGATCGGCC-CACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGCTCCAAACA *** ** * ** *** * * ** * ** ***** ***** * ARA.TH_G GTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG TET.THE. ATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAG--GACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA ***** * ** **** ** * * *** ** ***** * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG ** * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ***** * ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA--TCAAAGCCAGACATT-- ** *** * ** * * * * ** ** ** * ** * ARA.TH_G CACCATTTT TET.THE. ---------
Mean pairwise ID: 45.95%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAA----TGGGGGCATTAATGTGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC **** * ** * * ** ***** **** **** * * * *** *** LYC.ES_I GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * ** LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * ** LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAA-AGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG ** * * *** ** * ** * * * ** * * ** * LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTC **** ** * * *** * * *** * ** ** * * * * LYC.ES_I ACCATTTTT FUG.RUB. AGTCTTT-- * ***
Mean pairwise ID: 45.95%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG ** * * **** ******** *** * * * * * ** ** * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * ** **** * ** ** * * **** * * * ** ** * *** HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG ** * ** *** * ** * ** * ** * * * * ** * * *** HUM.LU_B CAATGCG--TGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG * ** *** ** ** ****** * * **** ** **** * * HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTG------AATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGAC *** ** *** *** * * ** * * * ** * ** * HUM.LU_B ATTTCCTTT XEN.LAE. ACAGTTCT- * *
Mean pairwise ID: 45.97%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTG-AT * * *** ** * ***** * * * ** * * ** RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-----AGAGTGTGCCCGCTCCAAA *** * * ***** * *** **** * * *** **** * ** RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG TET.THE. CAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * * ******* ** * * ** ******** *** RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA *** ** * **** ** *** ** **** *** * *** ** * *** RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT TET.THE. TAACATAC-TCATTAACTGTCAAACT--AATCGGTTCTAC-TATCAAAGCCAGACATT * * * * ** * *** * * * * ** ** * * ** * * *
Mean pairwise ID: 45.98%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** ** * ** ***** ***** **** * * *** *** * ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTC--TGGACTGCCCAATCCA FUG.RUB. GCTTGA---GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA ** ** ** ** * ** * ** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG FUG.RUB. AGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * *** ** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT * * * *** ** ** ***** * * **** * **** * ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA FUG.RUB. GGGA-------TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACC-TGAGTAACACAGCGGG *** *** ** * * * ** * ** * ***** * * ARA.TH_G ACCACCATTTT FUG.RUB. ACTCAGTCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 45.98%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA * * * **** * * *** *** *** HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA LYC.ES_M TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG LYC.ES_M AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA **** * * * *** * ** * ** * **** ** * * * HOM.SA_A CCGTCTCTT-- LYC.ES_M CAACCACCTTT * * * *
Mean pairwise ID: 45.98%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA * * * **** * * *** * *** RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA LYC.ES_M TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG LYC.ES_M AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG LYC.ES_M GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA LYC.ES_M AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA **** * * * *** * ** * ** * **** *** * * * RAT.RAT. CCCCGTCTCTT LYC.ES_M CAACCACCTTT * * * **
Mean pairwise ID: 46.00%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGA-TGTGAACGC TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******* * *** ** * * * * *** TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG TRY.BR_A CTTGGACAAGCGGGGGTTCTG--TTGCGTTGACT--TGGTGTTCTGCTTG------GTTG * * ** * ** *** ** ** ** ** ** * ** * **** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG TRY.BR_A CGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCG-CCGTTAAAGTGGGGGG *** ** * ** ** * * **** ** * *** **** ** TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGAAGG TRY.BR_A AACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC ** * ** **** ** * ** ******* *** * * **** **** TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC TRY.BR_A ACACCGAGGAGCA----TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG----- * * * * ** ** *** * * * ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 46.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGG-TAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATG TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAG-GTTG--TG ****** **** * ** * ** ** ** ** * **** ** ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC TET.THE. ATAGATAGGATATG---AGAGTTTGATGAGACAGTTTGC--TAAG-AGTGTGCCCGCTCC * * * * * * ** ** ****** ** * * ***** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAG TET.THE. AAACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTC--CACCAGGGCATTAAAGA ** * * * ** ** *** * *** * * *** * ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGT ** * ** * ******* ***** *** ** ** ****** *** ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA TET.THE. GGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT--CGGTTC---TACTATCAAAGCCA *********** * * * * * *** * * * ** * * ** ORY.SA_B GACCACCACCTTT TET.THE. GACATT------- ***
Mean pairwise ID: 46.01%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG * * * * * * * *** * ** * * ** * ** * * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGT-GCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * ** ** * * ** * * ** * * *** * ** * ****** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGG-ACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG CAE.EL_A -GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT----GCATAAGGA * * ** * * ** * *** ****** * * * * * * HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC * ** ** * ** * ** ***** * * * **** ******* HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA CAE.EL_A GGAC--CGCGCTTGTGAG--TTGACACA-CA-TACGCAGCCTTCTCGATACCT--TCAGA *** ** ** *** * **** ** ** * ** * ** * * * ** HUM.LU_C CCATTTCTTTT-- CAE.EL_A CCACTTATCATTT *** ** * *
Mean pairwise ID: 46.01%
ZEA.MA_C -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG * * ** * ** ***** * ** * * * * * *** * * ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCC DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTA--CTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT * ** * * * * *** ** * ** ***** * * *** * ZEA.MA_C AAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATAT-GGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA *** * * * * ** ** ** * ** ** *** *** *** * ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA ** * **** * * *** * * ****** * * * ** * * * ** ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT----TG * ***** * ** * * ** ** * *** * * ** * ZEA.MA_C GACCACCATTTTT DRO.MEL. GACCACAATCTTT ****** ** ***
Mean pairwise ID: 46.03%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATGAG--TGTG *** * * * ** * ** *** * ** * * ** * *** * * ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * * * * ** * *** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA--- CAE.EL_C TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA * * **** ** *** *** * * ** * * * * *** * HUM.LU_A -GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ****** HUM.LU_A GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATA CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATACACAGCCTTCTCAA---TACCTTCA--- * *** * ** * * * * ** ** ** * * ** * * HUM.LU_A GGACCATTTCTTTT- CAE.EL_C -GACCACTTGTCACT ***** ** *
Mean pairwise ID: 46.08%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TET.THE. GCCAGGGT-AGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATA *** * * ** * * * ** ** ** * **** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TET.THE. GGATATG-AGAGTTTGAT-----GAGACAGTTTGCTAAGA--------GTGTGCCCGCTC ** ** * **** * ** *** * * * ****** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC TET.THE. CAAACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT-------CCACCAGGGCAT *** * ** ** ** * * * * * * * *** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACA-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TET.THE. TAAAGAGCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGT ***** * * * * * ** * ******** ***** *** ** *** ****** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT TET.THE. TGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATC---------GGTTCTACT *************** ** * ** * * * ** * ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TET.THE. ATCAAAGCCAGACATT--- * * ** * ***
Mean pairwise ID: 46.10%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGA-GTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGT TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAG-GTTGTGAT ** * * * * * **** * * **** ** ** ** * * * ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGCTCCAAACA * * * * ** ** ** * ** ** ***** ***** * ARA.TH_D GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGC-GGATTCTAAAGTCGGAGG TET.THE. ATGAGTTG-CTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG ***** ** ** *** * ***** * ** ***** * * ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG TET.THE. GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG * ** ** * ******* ***** *** ** **** ** *** * ***** ** ARA.TH_D ATCATA-GTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCAAA-CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT---- ** * * ** ** *** * * * * * * ** * * * ARA.TH_D ACCACTTT TET.THE. --------
Mean pairwise ID: 46.10%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC **** * ** ** * ** ***** ** ** * * ** ** * * * LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTGAAGGGCTAATGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * * ** * * ****** * ** **** * * ** ** * *** LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGGAT FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGGT * * * * ** ** *** ** * ** * *** * LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG FUG.RUB. GCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG * * * *** ** ** **** ** ***** * * **** * ** LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA FUG.RUB. ATCGCG--CCCGTGA--ATAGACGCTGTAGTTCAACCTGA---GTAACACAGCGGGACTC *** ** * *** * ** * * ******* ** * * ** LYC.ES_F TCACTTTT FUG.RUB. AGTCTTT- ****
Mean pairwise ID: 46.13%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT **** ** ** ** ** **** ** ** * * * ** * * * * * LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * * ***** * * **** * * ** ** * *** LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * * *** ** * * * **** ** ** * *** LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** * LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC RAT.NOR. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGAGAC ***** ** * *** * * * ** * **** ** * ** * ** LYC.ES_F CATCACTTTT RAT.NOR. C--CGTCTCT * * * *
Mean pairwise ID: 46.13%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGG--GGACAATAAGGTGGTGGAACAG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ** ** ** ** * ** *** * ** * *** * ** ** * * * ARA.TH_D TGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATC--TGAGCTGCCCAGTCCAA XEN.LAE. C--TTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTG-CACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** * * * * ** * *** **** *** ** * * ** ** * ** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTA-AAGTCGG XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * * * *** * ** * ** ** * *** ** * ** *** ** ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * *** * **** * ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGC------GAG ***** * * * * * * ** * *** * * * * ARA.TH_D CCACCACTTT XEN.LAE. ACACAGTTCT *** * *
Mean pairwise ID: 46.13%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** ** * ****** * ** * **** * * * ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCA-ACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * * *** * * *** **** ** * *** ** * ** ***** ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * ** ** * * * * ** * * * * *** *** **** * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG * ** * * * * * ***** * * * **** * ******* ** ARA.TH_G GACAACGGTT-CGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT *** ** ** ** **** ** *** ** * * ** **** ARA.TH_G CCACCATTTT CAE.EL_B TTT-------
Mean pairwise ID: 46.13%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * * ****** * ** * ***** * * * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGCA-TGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC * * * ** ** * *** **** ** ** * * ** ****** ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA ** ** * * * ** * ** * * * * * *** * * *** * ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC ** ** ** * ** * ** ***** * * **** ******* * ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC CAE.EL_B GGACTGCGCTTGTGAGTTG------ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC *** * ** * ** * ** *** * ** * ** * * ** * ARA.TH_E CACCATTTT- CAE.EL_B ACTTGTTTTT ****
Mean pairwise ID: 46.13%
TRY.BR_B ------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGA ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCG-AGTGCT-TGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGG--TAGTGTGGA * * **** * **** ******* * **** ** * *** * *** TRY.BR_B CGTC-----TTGGACAAGCGGG-GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-----TGCTTG ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA *** * * ** * * ** *** *** * ** * * * * TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGG-GTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGC ******* ** *** ** *** * * ** * * ******** TRY.BR_B GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-CACCAGCGGTGGA ** * * ** **** ** * * ******* ** * * ** * * ** TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT ZEA.MA_H AGGATAATGAG-----TCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------- ** * * *** ** * ** * **** *
Mean pairwise ID: 46.15%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG **** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** ** CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA * * *** * * * ** ** ** ** *** ** * **** *** CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** ** * * *** ****** ** * * * * * ** CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTG-CAGTGG * * *** * *** * ** * *** * * * * * * **** CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA CAE.EL_D CCGGACCGC--GCTTGTAAGTT---GACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC *** * ** * ** * * ** *** ****** ** *** CIN.HYB. CACCCATTT--- CAE.EL_D CACTTATCATTT *** **
Mean pairwise ID: 46.15%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * *** ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA GAL.GAL. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC-AGGTT-CTAGAGTCG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATA-TGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** ** **** * * ** * *** * ***** * ** * ARA.TH_F GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA * * * * * *** ** ** ****** * ***** **** ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCT-GCTGGTCCGATCTCATATG GAL.GAL. CGGGATCGCGCCTGTGAAT-------AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAG ***** ** * * * * ***** ** * ** * * * * * ARA.TH_F AACCACCATTTT GAL.GAL. ACCCTGTCTCC- * ** *
Mean pairwise ID: 46.15%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** * * ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTT--CTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG **** ** * ** * ** * ** * * * * * * ** *** * *** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTG--GACCTATAGTG XEN.LAE. TTCG--GTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAG ** * ** * * * * * * * *** ** ** * * *** * * ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG * **** * *** * ** ****** * ** * * * ** * ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG XEN.LAE. TGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCGGTGCAGA-ACAGCCTGAACAACACAGCGAGACAC **** * *** ** * ** * * **** ** ** * * ** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT XEN.LAE. AGTTCT------ * *
Mean pairwise ID: 46.15%
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG TRY.BR_B ------AGCCGGAGCGCAT---TGCTCTGTAAC--CTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCG ** * *** * ** * * * *** * ** ** * * * ** XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT TRY.BR_B GGGACGTCTTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGTT *** *** ** * * * * ** ** ***** * ** *** XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTC-CTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG TRY.BR_B GCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTT--AAAGTGGGG ** ** * * * * ** * * ** * * * * * * ** * **** XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA TRY.BR_B GGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA **** ** **** *** ********* ** * ** * * ** * * * XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGC-CGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCG--GTTT- * * ** ** * * * * * * ** * * ***** * ***
Mean pairwise ID: 46.18%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-- **** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCC---TGTCCAAG CAE.EL_A GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * *** * * *** * *** ** * ** **** * LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * **** *** ** *** * * * * * *** * LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * *** * * * * * ***** ** *** **** ******* LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCAG-- ** *** * * *** ** ** * **** * * * ** ** LYC.ES_K AACAACCACCTTT- CAE.EL_A ACCACTTATCATTT * ** * * **
Mean pairwise ID: 46.18%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG- ** ** * * * ** ** ****** * * RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGA----CAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTG ** *** *** ** * ** * * * * ** ***** * ** RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRY.BR_B GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGG *** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * ** RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG TRY.BR_B GGGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCA--CCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAG ** **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTC TRY.BR_B AAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCG-GTTT- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * ** * RAT.NOR. T TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 46.18%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT TRY.BR_B ------------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAG- ** * ** * * * ** ** ****** *** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRY.BR_B CGGGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTC---TGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGG ** *** *** *** ** * * * ** ***** * ** * ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGG ** * ** * * * * * ** * * ** * ** * * * *** * *** ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG TRY.BR_B GGGAAC-GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA * **** ** **** *** ********* ** ** ** * * ** * * ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGC-CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT--- * * * ** ** * * ** * * * ** * * * ***** * * * ORI.CUN. C TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 46.18%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** ** ARA.TH_F ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC * * ** * * * ** * *** * * * **** * ** ** ARA.TH_F AAGCTGTGAGTAATTAGTGT-TGA--GTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGT CAE.EL_B AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG **** ** ** * ** * *** ** * ** ** * * * * ** ARA.TH_F CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCAGT ** ** * * * ** * **** ** * ** * ** * ***** ARA.TH_F GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT CAE.EL_B GGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG------ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCA ** **** ** ** * ** * ** *** * ** * ** * * ARA.TH_F GAACCACCATTTT- CAE.EL_B GACCACTTGTTTTT ** * ****
Mean pairwise ID: 46.18%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-- **** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT--TCTGGCCTGCCC---TGTCCAAG CAE.EL_D GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * *** * * *** * ** *** * ** **** * LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * **** *** ** *** * * * * * *** * LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * *** * * * * * ***** ** *** **** ******* LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG-- ** *** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** LYC.ES_K AACAACCACCTTT- CAE.EL_D ACCACTTATCATTT * ** * * **
Mean pairwise ID: 46.20%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGG--GGGCATGTGGGAAATGGAACATTGG DRO.MEL. -------GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGG * * ** * * * ** ** * ** ** * * *** HUM.LU_B GTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGT-TAGCTGC----------TTACTGGTCTGCCCA DRO.MEL. GATGGCCT-GAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCG * *** * ** * ** ** * ** **** * ** ** * ** HUM.LU_B TTCCAAGCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAG DRO.MEL. CACTAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAA * **** * * ** *** * *** ** * *** * * *** HUM.LU_B AGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCA DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCA * ** * * * * *** *** * ****** * * ***** **** HUM.LU_B GTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAA DRO.MEL. GTAGTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATA--TGG ** * ***** ** **** * *** * ** * *** * ** * HUM.LU_B TCGGACCATTTCCTTT DRO.MEL. TTGGACCACAATCTTT * ****** ****
Mean pairwise ID: 46.20%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA----GGGTATCAAAGTGGTTGAAC GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ****** *** *** * ** ** * ** * ** * * * * CIN.HYB. TTTGAGCTTG-GCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA GAL.GAL. C----GCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCG---TCCG ***** ** ** * ** *** ** * * ** ** ** *** CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGC---GAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAA GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCA-ATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTA * ** ** *** * * ***** * * ** * * ** ** * CIN.HYB. TCGGGGGGCAATGCG--TTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGAC GAL.GAL. AGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTC * **** * ** *** ** ** **** * *** *** * * * CIN.HYB. TGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAAC-CAGCCTGGCTAGCCCAA GAL.GAL. AGTAACGGGATCGC--GCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAG ** **** * *** * * * ** * * * ******* * * * CIN.HYB. CAGGACACCCATTT-- GAL.GAL. CGAGAC-CCTGTCTCC * *** ** * *
Mean pairwise ID: 46.21%
TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA-GTCAG YAR.LI_B -----AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG--TAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCG * * **** * * * **** **** * ** * ** * TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTG-AGTTG YAR.LI_B AGTTCTGGACTCTG------CACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTG *** ** * ** ** * **** ** ** **** ** ** **** TET.ROS. CTATG-GTGGAAACCT-AGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-GAACCG YAR.LI_B ATGGGCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATA * * ** ** ****** ** ** * * ** * * * * TET.ROS. CCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAA-ACTTGCCGCT--TATTGTGGTGGAAGGATAAC YAR.LI_B CTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAAC * **** **** * *** ** * ****** *** * ***** * *** TET.ROS. ATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT YAR.LI_B AAAGTGGT-ATATGTTATGGAAG--GTATTTGCAATCACGACTCTC---- * * * * * *** * * * * * *** ** **
Mean pairwise ID: 46.25%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_D ---------------------------------TA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA ** ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_D CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG **** * ** * * * * *** *** ** ** * *** ** **** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_D GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ****** ********* ************ * ** ********** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_D TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCAC * * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** * * **** ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_D CACTTTT ******
Mean pairwise ID: 46.25%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * *** * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * *** ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA ORI.CUN. GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGACCC *** ** ** ** * * * **** ** * * **** ARA.TH_C TCACTTT ORI.CUN. TGTCTCC * **
Mean pairwise ID: 46.25%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGC-AGCTTCTGTAATC---ACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGG--G * * * * ** ** ****** * ** * ** ** ** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTG-TAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT DRO.MEL. ATGGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCA * * * * **** ** * * * ** *** ** * *** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC DRO.MEL. CTAAGCTTGCCATCAATATG--GGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTT--GGC- * *** * * * ** ** *** * ** ** * ** ** * *** ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC DRO.MEL. -TAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTA *** * ** * * ** * * *** ** * ****** * * * **** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT DRO.MEL. GGCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAA----CCGAT * ** * ***** * * * * ** *** * ***** ** * ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT DRO.MEL. ATGGTTGGACCACAATCTTT * ****** ******
Mean pairwise ID: 46.25%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG YAR.LI_B ---------AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGG------TAAATCGCCTTCTTGTTG ** * *** * * * * *** *** * ***** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * *** ** * ******* *** * ** *** *** * LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG YAR.LI_B CTGCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * * *** * * * * * *** **** ***** * * * * LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA YAR.LI_B AACTGGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGA---TCCAGTT---GCCGTGG--GTA ** * * * ** ** ** * * * *** ** ** **** * * LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC YAR.LI_B TGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATGT-TATGGAAGGTATTTGCAAT-----CAC * *** * * * * **** ** * ** ** * **** *** LYC.ES_G CACTTTT YAR.LI_B GACTCTC *** *
Mean pairwise ID: 46.26%
TRY.BR_A ------AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGA ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCG-AGTGCT-TGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGG--TAGTGTGGA * * **** * **** ******* * **** ** * *** * *** TRY.BR_A CGTC-----TTGGACAAGCGGG-GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTC-----TGCTTG ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA *** * * ** * * ** *** *** * ** * * * * TRY.BR_A GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGG-GTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGC ******* ** *** ** *** * * ** * * ******** TRY.BR_A GGGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-CACCAGCGGTGGA ** * * ** **** ** * * ******* ** * * ** * ** TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG ZEA.MA_H AGGATAATGAG-----TCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------- ** * * *** ** * ** * **** *
Mean pairwise ID: 46.28%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAATG-TGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * * * ** ** * ** ***** ***** **** * * * * *** *** LYC.ES_N GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * ** LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * ** LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAA-AGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG ** * * *** ** * ** * * * ** * * ** * LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTC **** ** * * *** * * *** * ** ** * * * * LYC.ES_N ACCATTTTT FUG.RUB. AGTCTTT-- * ***
Mean pairwise ID: 46.28%
ZEA.MA_B -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGC TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG * * * * * * * ** * ** * ** *** ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTC-TGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAGAGTGTGCCCG--CTCCAAACAATGAG * ** **** ** * * * * * * ** * * *** * * * ** ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA TET.THE. TTGCTA-----TGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT---CCACCAGGGCATTAAAGAGCTA *** ** ** ** **** * ** * * * * ** ** * * ZEA.MA_B -GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTGTTGTGGTGGA **** ** * ******** ***** *** ** *** *** *** ***** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACC TET.THE. AGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAAT-CGGTTCTA----CTATCAAAGCCAGAC ********* * * *** * * * ** * * * * ** ** *** * * ZEA.MA_B ACCATCTTT TET.THE. ATT------ *
Mean pairwise ID: 46.28%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** * *** ** *** * ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * * * * ** ** * * * ** * ** ****** ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCT-TGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA * ** * ** * * ** ****** * * * *** * ** * ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC ** ** ** * ** * ** ***** * * **** * ******* * ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC CAE.EL_A GGACCGCGCTTGTGAGTTGA-CACACATACGCAGCCTTCTCGATAC--CTTCAGACCACT *** * ** ** * ** * ** * ** * * * * * * *** * * ARA.TH_F CACCATTTT CAE.EL_A TATCATTT- * *****
Mean pairwise ID: 46.30%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LEP.COL. -----GCCGG--AGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAG---CTGAACAG *** * *** *** *** *** ******* * * * ** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LEP.COL. GGAGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT * ** ** * * * ** ** ** * ** * * * ** * ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LEP.COL. GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCG--CGCCCCCTCCGTTAAAGTA * * ** * * * * * *** * ***** ** ** *** * ** *** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LEP.COL. G-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC * ** * ** ** **** ** ** ******* *** * * ** ** ** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA LEP.COL. AGA---ACCACACCGC-GGAGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGA-TCCTGTGAAGCT * * * **** * **** * * * ** **** * * * * ** ORY.SA_B CCACCACCTTT LEP.COL. TT---------
Mean pairwise ID: 46.30%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ***** * * ** ******* ** ** ** * * * * * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA * * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** * * ** * ** HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** * ** ** ** ** * * * **** * ** HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG * * * * *** ** ** ****** * ****** * * **** HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA GAL.GAL. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGC---CTGGGCAA---CATAGCGAGA **** ** *** *** * ** * * ** *** * ** ** HUM.LU_A CCATTTCTTTT GAL.GAL. CCCTGTCTCC- ** * ***
Mean pairwise ID: 46.30%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG * ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * ****** ** ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA * * ** * * * ** * *** * * ** ** * ** ** * * ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG HOM.SA_B AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** * ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG HOM.SA_B TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--AGC---AACATAGCGAG ***** * * * * * **** *** * * * * * * ARA.TH_D ACCACCACTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT *** * ** *
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_A -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATG DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGG * * ** * ** ***** * ** * * * * * *** ** * ZEA.MA_A CTTTGCGATGG--CTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCC DRO.MEL. CCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCT--CATGTTGAC-GGAACGTCCGCAC * * * *** * *** * ** * * * * ** * ** * ** * ZEA.MA_A CAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAG DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGG *** * * * * **** ** * * * * * *** ** * ** * ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGT DRO.MEL. AGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT ** * *** * * *** ** * ****** * * * ** * ** ZEA.MA_A GGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCA DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTA-CCGGAGTGGACTGCCGTTA--TCAGCCC---AACCGATATGGTTG * ***** ** * *** * ** ** **** * **** * ZEA.MA_A AACCACCATCTTT DRO.MEL. GACCACAATCTTT ***** ******
Mean pairwise ID: 46.33%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** ** ** *** ** *** ** * * *** **** * * * TRI.AE_B TGCTTGGTGC--GGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGT-GCGCTATG-CCGAGCGGGCGTCCGCGCTA ***** * ** * *** *** * * * * * ** ** *** * * ** * TRI.AE_B CAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAG GAL.GAL. -AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCG--GGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGG * * ** * *** ** * * *** * * **** *** * * TRI.AE_B TGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGT GAL.GAL. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * ** TRI.AE_B GGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA GAL.GAL. AACGGGAT-------CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCG **** *** * * ** ** * * * ****** TRI.AE_B GACCACCATCTTT GAL.GAL. AGACCCTGTCTCC * * ***
Mean pairwise ID: 46.33%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAG----TGGGGACAATAAGGTGGTGGAAC HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG * ** ** ** ** * ** *** ** ** * **** * *** **** ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGC-TGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** * * * * ** * *** * * ** * * ** ** * * ARA.TH_D AGCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATT-CTAAAGTCG HOM.SA_A AGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * * ** * * ** ** * * * * ** * *** * ARA.TH_D GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCC-GCTGGTTCGATCTCTCCTG HOM.SA_A TGGGATCGCGCCTGTGAAT-------AGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAA-CATAGCGA ***** * * * * ***** ** ** ** * * * * ARA.TH_D GACCACCACTTT- HOM.SA_A GACCCCGTCTCTT **** * ** *
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG- CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTC---GACCGAGC-GTCCGTGCC * ** * * *** * ** **** * * * *** * * **** ** ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG CAE.EL_B AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG *** ** * * ** * * ** * * * ** * * *** * ZEA.MA_F CAG-GCATGGCGTGAGGCTGGCT--TCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG CAE.EL_B TGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCAC-CGCGCGGTGC-AGTGG * * **** * * * * **** ** *** *** ** * * * ** ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG CAE.EL_B CCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCA-------G *** * * ** * * * ** * ** * * * *** * ZEA.MA_F ACCACCATCTTT- CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCC-GGCTTGCCCATCCCAA LYC.ES_L TTGGGTTGAC--CCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA *** * ** * * * **** *** * * * * * *** ***** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG * * *** * **** ****** ***** ** * *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA * * **** ******* *********** *** ** * *** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA---ACCTCACTAAGCA LYC.ES_L AGGATAACGG-GTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA ********* * * *** * *** * * * * ** * ** * * * ** * ZEA.MA_A AACCACCATCTTT LYC.ES_L AACCACCACTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 46.33%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTT--CTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ***** ** * ** * ** * ** * * * * * ** *** * * ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATAGT CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA **** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** * ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * ** ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA CAN.SPE. GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACT------CCAGCCTGTGCAACATAGCG * **** * *** ** * * ** * ** ** * * *** ZEA.MA_C GACCACCATTTTT CAN.SPE. AGACCCCGTCTCT * ** * * *
Mean pairwise ID: 46.33%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGA-TGTGAACGC TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******* * *** ** * * * * *** TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG TRY.BR_B CTTGGACAAGCGGGGGTTCTG--TTGCGTTGACT--TGGTGTTCTGCTTG------GTTG * * ** * ** *** ** ** ** ** ** * ** * **** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG TRY.BR_B CGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCG-CCGTTAAAGTGGGGGG *** ** * ** ** * * **** ** * *** **** ** TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGC-TTCCAACGGTGGAAGG TRY.BR_B AACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC ** * ** **** ** * ** ******* *** * * **** * **** TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC TRY.BR_B ACACCGAGGAGCA----TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT-- * * * * ** ** *** * * * ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 46.35%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG *** * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * * * * ** * *** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCG-AAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA--- CAE.EL_B TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA * * **** ** *** *** * * ** * * * * *** * HUM.LU_A -GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ****** HUM.LU_A GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATA CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATACACAGCCTTCTCAA---TACCTTCA--- * *** ** * * * * ** ** ** * * ** * * HUM.LU_A GGACCATTTCTTTT- CAE.EL_B -GACCACTTGTTTTT ***** ** ****
Mean pairwise ID: 46.35%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGAATGC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** ***** *** ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGT-GACACTGGC--CGGCTTGCCCATCC CAE.BRI. AGTGAAGGGAG-----GAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGC ** * * * **** * ***** * ** *** * * * ** * * ZEA.MA_A CAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAG CAE.BRI. CAAGC--GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTC------CCGGGCG **** * * *** **** *** * * *** ** ** ** * ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG CAE.BRI. CATAAGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGC--GCGG * **** *** * * **** * * * ***** ** * ** * *** ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC CAE.BRI. TGCAGTGGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTT-C ** * *** ** *** ** * ** * ** * ZEA.MA_A AAACCACC-ATCTTT CAE.BRI. AGACCACTTGTCATT * ***** ** **
Mean pairwise ID: 46.35%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA------TGTGGGGACATTAAGATGGTGGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** ** ** * ** * *** ** ARA.TH_A ACACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGT--CGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCC * * ** * * * ** * *** * * * **** * ** ** ARA.TH_A AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTC CAE.EL_B AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCGGGTGCATAA-- **** ** ** * ** * ** **** *** * * ** * * * ARA.TH_A GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAG CAE.EL_B --GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG * ** ** ** * ** * ** ***** * * **** **** ARA.TH_A TGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA CAE.EL_B TGGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG------ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTC *** **** ** ** * ** * ** *** * ** * ** * * ARA.TH_A TGAACCACCATTTT- CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT ** * ****
Mean pairwise ID: 46.35%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC * *** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** * ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG ***** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG RAT.NOR. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * * ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG RAT.NOR. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGGGCAACATAGCGAGA * * **** * *** ** * * ** ** *** * * **** * ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT RAT.NOR. CCCGTCTCT------ * * *
Mean pairwise ID: 46.35%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC **** ** * * *** * * ****** ***** *** * * * ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC--CGCTTCCAAC CAE.EL_C ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGC **** *** * ** * * * * * *** ** *** *** * ZEA.MA_D GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAA CAE.EL_C AGTGGCCGGACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAG **** *** * * ** ** * * ** *** * * * * * ZEA.MA_D GCAGACCACCATCTT CAE.EL_C ACCACTTGTCACT-- * **
Mean pairwise ID: 46.41%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCC-----CGCTTAGCGG * * * * *** * * * ** * ** * * * ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT TRY.BR_A GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** ** * ** *** * **** * * ** ** * ** * ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG TRY.BR_A TCGGTGTTGAGG--TCGCCACTGTAGAGAGGC---GTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGGGG * ** ******* * * * * **** * **** * * * ** ******** ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG TRY.BR_A -GAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA ** ** ** **** *** ** ******* ****** *** * * * ** ** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT TRY.BR_A AGCACAC-CGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGG---- * ** * * * ** ** * * * ***** * ** *** * ARA.TH_C CACTTT TRY.BR_A ------
Mean pairwise ID: 46.43%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT TET.THE. -GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTG-TCTATATGTGG---CATAAACAATGTAGGTTGTGAT * * * * * ***** * * ** ** * **** * ** * * HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGC--TAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGG TET.THE. AGATAGGATA-TGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAAT * * * * * ** ** * ** * ***** ***** * HUM.LU_C GAGGTGGGCTGAGGG--ACCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG TET.THE. GAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCT--AAGG *** ** ** ** **** * *** ** * *** * ** * ** HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TET.THE. AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA ** ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ********* HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA TET.THE. TAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTA--TCAAAGCCAGACATT---- **** * * * * * * * * **** *** * * * * HUM.LU_C TTTCTTTT TET.THE. --------
Mean pairwise ID: 46.43%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGCGCGGATGC TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******* * *** ** * * *** *** * ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TRY.BR_B CTTGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG---GTTGCGTGT *** * *** * ***** * * ***** * * ** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG TRY.BR_B CGGTGTTGAG-GTCGCCACTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG *** ** * ** ** *** ** * ** ** ** ** ** * ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCAC-TTCCAACGGTGGGA TRY.BR_B GAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA *** ** ** **** ** * ** ******* * ** ** *** **** * * * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATC--TCAGGACTTTGCGC---CCCAAGTG---TCGTCGCGAGGCG * * * * ** ** * * * * * * **** * ** * ** * * ZEA.MA_B CCATCTTT TRY.BR_B GTTT---- *
Mean pairwise ID: 46.45%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ***** * **** ******** *** * * * * * ** * * HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * * * ** * ** ** * * **** * * * ** ** * *** HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC XEN.LAE. CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGGT ** * ** ****** ** ** * * * * ** * * *** HUM.LU_D AATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG XEN.LAE. GAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG * ** *** ** ** ****** * * **** * **** * ** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC- XEN.LAE. AT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACA----GCCTGAACAACAC--AGCGAGACA ** ** *** *** * * ** * * * ** * * *** HUM.LU_D CATTTCTTTT XEN.LAE. CAGTTCT--- ** ****
Mean pairwise ID: 46.45%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** * *** ** *** * ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * * * * ** ** * * * ** * ** ****** ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA----GG * ** * ** * * ** ****** ** * * * ** * * * * ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC ** ** ** * ** * ** ***** * * **** * ******* ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA CAE.EL_A CGGACCGCGCTTGTGAGTTGA-CACACATACGCAGCCTTCTCGATAC--CTTCAGACCAC **** * ** ** * ** * ** * ** * * * * * * *** * * ARA.TH_A CCACCATTTT CAE.EL_A TTATCATTT- * *****
Mean pairwise ID: 46.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ** * * * * LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTGAAGGGCTAATGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * * * ***** * * *** * * ** ** * *** LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG CAN.SPE. TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * * *** ** * * * **** ** ** * *** LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** * LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC CAN.SPE. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTGT---GCAACATAGCGAGAC ***** ** * *** * * * ** * **** * * ** * ** LYC.ES_F CATCACTTTT CAN.SPE. CCCGTCTCT- * ** *
Mean pairwise ID: 46.47%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * * * * ******** * *** * ** ** HUM.LU_D TGGGTCAACCTA-GTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCA-TTCCAA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGAC---GTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ** * *** * * * * * * *** * * ** ***** * HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGG-GCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA LEP.COL. GTCGGAGGCC--TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGA * *** * * * *** ** ** * * * * * * * ** *** ** HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGA LEP.COL. GGA-ACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC ** * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** * HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG LEP.COL. AGAACCACA---CCGCGGAGCCTGTCATCACC-TGCGCCCCAGG--CGATCCT--GTGAA ** * ** * * * **** **** *** * * ** ** ** * HUM.LU_D ACCATTTCTTTT LEP.COL. GCTTT------- * *
Mean pairwise ID: 46.47%
HUM.LU_D ---GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTA-ACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGAC DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * ** *** * * * * * *** ** * * * ** * HUM.LU_D TTTGGGTCA-ACCTAGTGGATCG-GGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGC-TCA--TGTTGACGGAAC-GTCCGCACT * ** * * *** ** * * ** **** * * ** * ** * * * ** * HUM.LU_D AAGCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGA-GGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA **** * * ** *** * *** * ** * * * *** * * * HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT ** * ** * ** * ****** * * ***** * ****** * HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCA-GCCCAACCGATATGGTT-------GG ***** ** **** * *** * ** ** ** * ** * ** HUM.LU_D ACCATTTCTTTT DRO.MEL. ACCACAATCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 46.47%
ZEA.MA_E -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGCGGAT LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC * ******** * * *** * * * * ** * ** ** * *** ZEA.MA_E TCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTT--GACGTG----GTGCTCT------GCTTGGCTGT-- * ** ** *** * * * * **** * ** ** * ** ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT LEI.MAJ. -GTGTCGGT-GTGGCTTGCC----CCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC ** *** ****** ** * ** ** * * * *** ***** ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGT * **** * ** **** ** ** ******* *** * ** * * ** ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG LEI.MAJ. TGCAGAATCACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAG * ** ** ** ** *** ** * *** **** ** ** * ** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT LEI.MAJ. CCTT-------- *
Mean pairwise ID: 46.47%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G ***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * ** *** * LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * **** * *** **** * ** *** LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCA * *** * ** * * *** * ** * * **** * ** * * LYC.ES_B ACCACCACTTTT CAE.EL_C CTTGTCACT--- ****
Mean pairwise ID: 46.47%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT LYC.ES_M ---------------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT * * * **** * * ** * * ** RAT.NOR. CGATTGAG---TCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT LYC.ES_M --ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTGTCC **** * *** ** ******* * *** **** * * ** ** * RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA LYC.ES_M AAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGT *** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA LYC.ES_M GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG **** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** RAT.NOR. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCAC-TGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAG LYC.ES_M GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA * **** * * * *** * ** * ** * **** *** * * RAT.NOR. AC--CCGTCTCT LYC.ES_M ACAACCACCTTT ** ** ** *
Mean pairwise ID: 46.47%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA---GGGTATCAAAGTGGTTGAACT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA--GACAGGAGG ****** *** *** * ** ** * ** * *** * * * * * CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * * ** * * ** *** * * CIN.HYB. AGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGA RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAAGG *** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * ** CIN.HYB. ATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACT RAT.NOR. A--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** * CIN.HYB. GTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA RAT.NOR. GTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGGGCAACATAGCG ** * **** * ** * * ** * ********* * * * * CIN.HYB. GGACACCCATTT RAT.NOR. AGACCCGTCTCT *** * * *
Mean pairwise ID: 46.47%
ZEA.MA_G -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT DRO.MEL. GACTGGAA--GGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG * * ** * ** ***** * ** * * * * * *** **** ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCA-GCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** * * *** * ** * * * * * * * *** * *** * ZEA.MA_G AAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATA-TGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATT--CAGGT-TGGCTAA *** * * * * ** ** * * *** * *** * *** ** ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT DRO.MEL. GGAGGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGT * *** *** * * * ** * * * ****** * * * **** * ** ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG DRO.MEL. AGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTA--TCAGCCC---AACCGATATGGTTGG * ***** ** *** * * * **** ** * ** * * ZEA.MA_G ACCACCATCTTT DRO.MEL. ACCACAATCTTT ***** ******
Mean pairwise ID: 46.50%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** *** LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGT----CTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCC * ** ** * ** *** *** *** * * ** ** LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTA--TAGCCACTTGGCCTTTAGAGT CAE.EL_A AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTC-CCGGGTGCATAAGGA **** * ** * ** * *** * *** * * ** ** * LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * **** * * * * * **** * ** **** ******** LYC.ES_F GAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCT-AATT CAE.EL_A GCCGGACCGCG--CTTGTGA--GTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC * *** * ** ** *** **** * * * *** * * * * * * LYC.ES_F AAACCATCACTTTT CAE.EL_A CACTTATCATTT-- * **** **
Mean pairwise ID: 46.50%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGT-----GGGGACTATAAGATGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT * ** ** ** ** ** **** ** ** *** * ** * *** ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** ** * ** * ** * *** ** ** ** * * ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** * ARA.TH_G CGGACAACG---GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT RAT.RAT. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTC *** ** ** ***** * **** *** * * * **** ARA.TH_G TGAACCACCATTTT RAT.RAT. TCTT---------- *
Mean pairwise ID: 46.50%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGT-----GGGGACTATAAGATGGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * ** ** ** ** * ** **** ** ** *** * * ** *** ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** ** * ** * ** * *** ** ** ** * * ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** * ARA.TH_G CGGACAACG---GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT ORI.CUN. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTC *** ** ** ***** * **** *** * * * ** * ARA.TH_G TGAACCACCATTTT ORI.CUN. TCC----------- *
Mean pairwise ID: 46.50%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** ** *** * ****** **** * ** * * * * * * CAE.EL_A GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCG---TTCCAAG * ** ** * * ** * *** ** ** ** ** ** *** *** * CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGGGT--CTCACGGTCCATAATG * * * ** **** * * ** *** ** * * *** ***** * CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT * * * * * * * * * ***** * ** * **** * * ** CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCG---ATACCTTCAG TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG ** *** * ** ** * * * * **** * * ** *** CAE.EL_A ACCACTTATCATTT TRI.AE_A ACCACC-------- *****
Mean pairwise ID: 46.50%
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATAC-CTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT TRY.BR_A AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGC-TGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCT *** * * *** * * **** * * * *** * * * * * * ** * TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTT TRY.BR_A TGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTC *** * * * * * ** * *** ** * ** * *** * ** TET.THE. GCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGC TRY.BR_A GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGG * * * * *** ** *** * * * * * ****** * ** **** TET.THE. CTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATAC TRY.BR_A GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCG ****** ** ** ** *** ** * *** *** ** ** * *** TET.THE. TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT TRY.BR_A AGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- * *** ** * * * ** ** ** *
Mean pairwise ID: 46.51%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC TRY.BR_B --------AGCCGGAGCGCAT-TGCTCTGTAACCTTC--GGGGGCTGATCCCGCTTAGCG * ** *** ** * ** ** * ** ****** * * FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT TRY.BR_B GGGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTG----TTGCGTTGACTTGGTGTTC-TGCTTGGT * ** * * *** *** * * ** ** ***** * * ** ** FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTC-CTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG TRY.BR_B TGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGG * ** *** * * * * ** * * ** ** * * * ** *** **** FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA TRY.BR_B GAAC--GGGTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCAC--CTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA * ** **** *** *** ***** ** * ** * * ** * * * FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTT--CAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTT TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCAT-CTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGG--CGGTTT- * * ** ** * * * * * ** * ** *** * *** * * ** * FUG.RUB. T TRY.BR_B -
Mean pairwise ID: 46.51%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT LEP.COL. GCCGGAGCC--TTGC-----TCTGTAACCT--TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA *** * **** ******* ****** ** * * ** * * TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT-TG LEP.COL. GCTGTCTGG--ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTG * *** * * ** * * ** ** * ** * ** * * ** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTA--TGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA LEP.COL. TGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAG-A ** * * ** ** ** ** *** *** * * * * * *** ** * * TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG LEP.COL. GGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGA ** ** * ** **** *** ** ******* ** * * ** ** ** * TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC LEP.COL. ACCAC---ACCGCGGAGCCTGTCA-TCACCTGCGCCC--CAGGCGATCCTGTGAAGCTTT * **** * * * ** ** *** *** * * * * * TRI.AE_A C LEP.COL. -
Mean pairwise ID: 46.52%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** ****** * * * ** ** ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTAT--GCGGCCCGCCCGTTC CAE.EL_C A-----GTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC ** * * * * *** * *** *** ** * * * ** **** * ORY.SA_B CAAGT--TGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGG-TCAGTCCCGGGTGCATAAGG **** ***** * * * * * ** ** ** ** * **** * ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG CAE.EL_C AGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGT----GCA ***** ** * * * ** * **** ** ***** ** * * ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTG-GCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATG CAE.EL_C GTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAA-TACCTTC--AG **** *** * ** * * * * * * ** * *** * ***** * ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT CAE.EL_C ACCACTTGTCACT--- * ***
Mean pairwise ID: 46.53%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT TRY.BR_A AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-GTCT *** *** * * * ******** * *** ** * * * * * * HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TRY.BR_A TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT * * ** ** **** * ** *** ** ***** * ** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT TRY.BR_A GTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC **** * * *** **** * * *** ** ** ***** *** ** HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC TRY.BR_A GGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCAC * ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** ** * ** HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTCC TRY.BR_A ACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--------- ** ** ** * ** ** * * * * *** HUM.LU_B TTT TRY.BR_A ---
Mean pairwise ID: 46.56%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTAC-----TTGGAGGCTTGGGCTGTCG **** ** * ** *** * ******** *** * *** ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT XEN.LAE. GATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATG---TCGATCGGGTGTCCGC * * ** * * * * ****** ** * * * * * * * ** *** ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC XEN.LAE. ACTAAGTTCGGTATCAATATGGT---GTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTT--GC * ***** *** ** * * * * **** * * * * ** ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC XEN.LAE. TCTAAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCC **** * ** * ** * *** ** ** ****** * **** * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC XEN.LAE. GATCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAAC-AGCCTGAA----CAA *** ** * **** * ** ** * ** * * *** * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT XEN.LAE. CACAGCGAGACACAGTTCT- *** * *** * *
Mean pairwise ID: 46.58%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGT TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******** * *** ** * * * * *** ** ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TRY.BR_A CTTG-GACAAGCGGGGGTTCTG---TTGCGT---TGACTTGGTGTTCTGCTTG------G * *** ** *** *** * *** * * **** * * ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGAC-CTGAAGCGGCA TRY.BR_A TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG *** *** * ** ** ** * * ** *** * * * *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA TRY.BR_A GGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTCGA ** * ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** ** ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC TRY.BR_A GAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCGG- * * *** * **** ** * * * * ** ** ** * ** * ZEA.MA_F CATCTTT TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 46.58%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGT-GGTGTGGATGT TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT *** ** ******** * *** ** * * * * *** ** ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TRY.BR_B CTTG-GACAAGCGGGGGTTCTG---TTGCGT---TGACTTGGTGTTCTGCTTG------G * *** ** *** *** * *** * * **** * * ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGAC-CTGAAGCGGCA TRY.BR_B TTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGG *** *** * ** ** ** * * ** *** * * * *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA TRY.BR_B GGAACGG-GTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGCCCAC-CTTGCGCACGTTC--CCGTTGCA ** * ** ** **** ** * ** ******* * ** ** * * * * * ** * * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC TRY.BR_B GAAGCACACCGAGGAGCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG-AGGCGGT * * *** * **** ** * * * * ** ** ** * ** * ZEA.MA_F CATCTTT TRY.BR_B TT-----
Mean pairwise ID: 46.60%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** * *** ** *** * ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * * * * ** ** * * * ** * ** ****** ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCT-TGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAG-----GA * ** * ** * * ** ****** * * * *** * ** * ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCC ** ** ** * ** * ** ***** * * **** * ******* * ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC CAE.EL_D GGACCGCGCTTGTAAGTTGA-CACACATAC-ACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCACT *** * ** ** ** * ** * ** * **** ** * *** * * ARA.TH_F CACCATTTT CAE.EL_D TATCATTT- * *****
Mean pairwise ID: 46.60%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT * ** ***** * ******* ZEA.MA_B G-GTAGTGTCTGAC--GGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG--TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC * ****** * ***** ******* ***** *** * ** * *** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA *** * **** *********************** *** **** ************* ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACC TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGA-CC ******** *********** ** ** * * * * *** *** * ** ZEA.MA_B ACCATCTTT TRI.AE_C ACCATC--- ******
Mean pairwise ID: 46.60%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCT---TCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGG * * * * * ***** * * * * * * * **** * * LYC.ES_A GGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG LEP.COL. AGCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT *** * ***** * * ***** * * * * ** ** **** * LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG LEP.COL. GTCGGAG--GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGA * *** * ** * **** ** * * ** ** * ****** * LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTC-TGTGCAGTGGAA LEP.COL. G-GAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** * * **** *** ** ****** ** *** *** * * *** ** * * LYC.ES_A GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCT-GTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT * * * *** * ** *** *** **** * * * * ** * LYC.ES_A ACCACCTTT LEP.COL. ---------
Mean pairwise ID: 46.62%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTG---GGGACTATAAGATGGTGGAACA XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ** ** *** ** * ** ***** *** * ** * * ** *** * ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTC--TGGACTGCCCAATCCAA XEN.LAE. CTTGA---GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** ** * *** * ** ** ** *** * * ** ** * ** ARA.TH_G GCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTA-AAGGTTG XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * * ** * * * ******* **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * * **** * * **** * ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA XEN.LAE. GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGA------ACAACACAGC-GA *** ** * * * * ** * * * * *** * ** ARA.TH_G ACCACCATTTT XEN.LAE. GACACAGTTCT *** ** *
Mean pairwise ID: 46.62%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG **** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** ** CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA * * *** * * * ** *** ** ** *** ** * **** *** CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT--GGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** * * *** **** ** * * * * ** CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCCACCGCGCGGTG-CAGTGG * ** *** * *** * ** * *** ** * * * * **** CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA CAE.EL_C CCGGACAGC--GCTTGTGAGTT---GACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC *** * ** * * ** * * * **** ****** * ** *** CIN.HYB. CACCCATTT-- CAE.EL_C CACTTGTCACT *** *
Mean pairwise ID: 46.62%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG * ** ***** * ***** ZEA.MA_A TTG-GTAGTGT-CTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG--TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG *** ****** * * * ***** ******* ***** *** * * * * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ***** * **** *********************** ****** ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA TRI.AE_C AAGGATAACGG-GCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGA- ********* *********** ** * * * *** * *** *** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRI.AE_C CCACCATC--- ********
Mean pairwise ID: 46.62%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** * **** ******** *** * * * * * ** * HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT ** * *** * ** * * * **** * * * ** ** ** * *** HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGGAG XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * * * ** *** ** * * ** ** * * * **** * ** * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** ** * **** * **** * * HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGC---CTGAACAA---CACAGCGAGAC *** ** *** *** * ** * * **** * * * *** HUM.JA_B -CATTTCTTTT XEN.LAE. ACAGTTCT--- ** ****
Mean pairwise ID: 46.62%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--CGGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** ** ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA ORI.CUN. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA ***** ** * * * ** **** ***** ** * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT ORI.CUN. CCCTGTCTCC- ** *
Mean pairwise ID: 46.62%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ** * * * * ****** ** ** ** * * * *** * HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNC--CAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATC-GGGTGTCCGCACTAA * * * ***** ** * ** * ****** *** * * ** ** ** * ** HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT-CCTAGACTGGA CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * ** ** * * * ** * * * **** ** HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCACTCCAGCCTG--TGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** ***** * * ** * * ** * ** ** HUM.LU_C CCATTTCTTTT CAN.SPE. CCCCGTCTCT- ** *** *
Mean pairwise ID: 46.62%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * *** ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA CAN.SPE. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA CAN.SPE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA ***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT CAN.SPE. CCCCGTCTCT- ** * *
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTC-GTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA ** * * * * ** *** *** *** ** ** * *** * * * * ARA.TH_G GATCG-GCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG TET.ROS. GTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGTTCCAAACAG * * * * ** *** * * ** * ** ***** ***** * * ARA.TH_G TGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAG--GACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ***** * ** **** ** * * * * ** ***** * ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG * * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ***** ** ARA.TH_G ACAACG-----GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTT TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- * *** ** * ** * **** * ** * *** * ** ARA.TH_G GAACCACCATTTT TET.ROS. -------------
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * * ****** * ** * ***** * * * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC * * * ** ** * *** **** * * ** * * ** ****** ARA.TH_E ----TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTG CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAGGAGTCG ** * * * * **** * ** * * * * * * * *** * ARA.TH_E GAGGGTAATGCGTGA--GGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT CAE.EL_A T-GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGA-------CCGCGTGGTGCAGT ** * * * ** * *** ** * * ***** **** * ***** ARA.TH_E GGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT CAE.EL_A GGCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGA-CACACATACGCAGCCTTCTCGATAC--CTTCAGAC ** **** * * ** * ** * ** * ** * * * * * * *** * ARA.TH_E GAACCACCATTTT CAE.EL_A CACTTATCATTT- * * *****
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * * * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC GAL.GAL. --TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT * * * * * *** * * * * *** ** ** *** ** * ** * ARA.TH_E AAG-CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTT GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * ** * * *** * * * * ** * *** ** ** * * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCT-GCTGGTCCGATCTCATAT GAL.GAL. ACGGGATCGCGCCT-------GTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGA ***** * * * * * ***** ** * ** * * * * ARA.TH_E GAACCACCATTTT GAL.GAL. GACCCTGTCTCC- ** ** *
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGT----GGGGACAATAAGGTGGTGGAAC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** ** * ******** * * * * * * *** * ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGT-CGACCGAGC-GTCCGTGCCAA **** * ** ** * ** ** * * **** * ** **** ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAG----- ** ** ** * * * * * * * ** * * * * * *** * * *** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGG CAE.EL_B GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG * ** ** ** * ** * ** ***** * * ** * ******* ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG CAE.EL_B CCGGACTGCGCTTGTGAGTT-----GACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTC-AG *** ** *** ** * *** * ** ** ** ** * * ARA.TH_D ACCACCACTTT-- CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 46.65%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * * ****** * ** * ***** * * * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGT-TCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC * * * ** ** * *** ** * * * ** * * ** ****** ARA.TH_E ----TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTG CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTG-CATAAGGAGTCG ** * * * * **** * ** * * * * * * * *** * ARA.TH_E GAGGGTAATGCGTGA--GGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT CAE.EL_D T-GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGA-------CCGCGTGGTGCAGT ** * * * ** * *** ** * * ***** **** * ***** ARA.TH_E GGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT CAE.EL_D GGCCGGACCGCGCTTGTAAGTTGA-CACACATAC-ACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGAC ** **** * * ** ** * ** * ** * **** ** * *** * ARA.TH_E GAACCACCATTTT CAE.EL_D CACTTATCATTT- * * *****
Mean pairwise ID: 46.65%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATAAGTGTG **** * ** ** * ****** * ** * * ** * * ** ** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * **** * *** *** * ** *** LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG---- * *** ** * * *** * ** * * **** * * ** ** LYC.ES_N ACCACCATTTTT- CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ***** ****
Mean pairwise ID: 46.65%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATG-TGGTGGAATGTT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT-----TCTTGACGGTAGATGAGTGT- **** * ** ** * ****** * ** * * ** * * * * ** *** LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAG CAE.EL_C GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** * LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAG CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_N TGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGT CAE.EL_C AGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT * ** *** * * * * * **** * *** *** * ** ** LYC.ES_N GGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTA CAE.EL_C GGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC ** *** * ** * * *** * ** * * **** * * ** ** LYC.ES_N AACCACCATTTTT CAE.EL_C ACTTGTCACT--- * ** *
Mean pairwise ID: 46.67%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG----ACAGA *** ** ** *** ** *** ** * * *** ***** ** TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCC---TGCCCGTT RAT.RAT. GGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCG-CTATGCCGATCGGGTGTCCGCA * * * * ** * ** *** ** * *** * * ** *** TRI.AE_B CCAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAA RAT.RAT. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG * ***** * * **** * ** *** * **** *** * TRI.AE_B GTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGG RAT.RAT. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * * TRI.AE_B TGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC RAT.RAT. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGGGC-AACATAGC * * **** * *** ** * * *** * *** * ****** TRI.AE_B AGACCACCATCTTT- RAT.RAT. GAGACCCCGTCTCTT * ** *** *
Mean pairwise ID: 46.67%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATGC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** ********* ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCC---TGCCCGTTCCA CAE.EL_B --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGT-TGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** * **** ** * ** ** * ** * ** * **** *** ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGA---TGGTCAGTCCCGGGTGCATA--- ** ** ** *** * ** * ** *** * * ** *** ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCT-GTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG CAE.EL_B --AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTG **** ** * ** * * * * *** ** * * ***** ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG-C CAE.EL_B CAGTGGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA---CACAGCCTTCTCAATACCTTC * * * * ** * * * * ** ** * ** **** * ** * ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT- CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 46.71%
TRI.AE_B -NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT LEI.MAJ. GCCGGAGCT--CTGC-----TCTGTAACCTTCG-GGGGCTAACCAGGCTTAGCGG--GGA * ***** *** *** *** * **** * **** * ** * TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCG-TTCCAAGT LEI.MAJ. GGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGT * * ** * * *** ** * ** ** **** * * ** TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC LEI.MAJ. CGGT-GTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGC---CGTTGAAGCGAGGGA *** **** ** *** * * * ** * * * * ** * * ** TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATC *** ** **** ** ** ******* * * * * ** * ** ** TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCAT LEI.MAJ. ACA--CCGCGG-AGCATGTCCGCACT-TGAGCCCCACGCTTCGTCGCG--AAGCCTT--- *** **** * ****** * * ** ** *** * * ** * * ** TRI.AE_B CTTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 46.73%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** *** **** ZEA.MA_E TTTGC--GATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGC----GACCGAGC-GTCCGTGC ** * ** * *** * * *** * ** * *** * * **** * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.BRI. CAAGCGCTGCGTCGCCA--GGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA-- **** ** ** ** * ** * * * *** ** * * * ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACG- CAE.BRI. ---AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGC **** *** * **** * * * ***** ** *** * * * ZEA.MA_E -GTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG CAE.BRI. AGTGGCCGGATAGCG----------CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT **** ***** ** *** * * ***** ****** ** * ZEA.MA_E -----CAGACCACC-ATCTTT CAE.BRI. ACCTTCAGACCACTTGTCATT ******** ** **
Mean pairwise ID: 46.73%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** *** **** ZEA.MA_D TTTGC--GATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGC----GACCGAGC-GTCCGTGC ** * ** * *** * * *** * ** * *** * * **** * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.BRI. CAAGCGCTGCGTCGCCA--GGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATA-- **** ** ** ** * ** * * * *** ** * * * ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC--CGCTTCCAAC CAE.BRI. ---AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGC **** *** * **** * * * ***** ** *** *** * ZEA.MA_D GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG CAE.BRI. AGTGGCCGGATA----------GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT **** ***** ** *** * * ***** ****** ** * ZEA.MA_D -----CAGACCACC-ATCTT- CAE.BRI. ACCTTCAGACCACTTGTCATT ******** ** *
Mean pairwise ID: 46.73%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGA-- LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * *** ******** * *** * ** ** *** ORY.SA_A TGTTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCT-GCTTGGCTGTGTGT *** *** * * * * ** * * ** ** ** *** *** * ** ** ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC LEP.COL. CGGAGGCCTCCGGGTGCCCC--------CTTGCAGAAGGGGCGCGC----CCCCTCCG-- * * * *** ** *** ***** ** * ***** ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC LEP.COL. -TTAAAGTAG-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTC ****** * *** ** * ** **** *** ** ******* * ** * * ** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGA-GTCCCT LEP.COL. TGCCGTTGCAGA---ACCACACCGCGG-AGCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCT ** ** * * ** * ** * * * ** * * * * ***** * *** ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT LEP.COL. GTGAAGCTTT----------- * * *
Mean pairwise ID: 46.73%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCG-GGGGCTGATCC-----CGCTTAGCGG * * * * *** * * * ** * ** * * * ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT TRY.BR_B GGACGTCTTGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG ** ** * ** *** * **** * * ** ** * ** * ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG TRY.BR_B TCGGTGTTGAGG--TCGCCACTGTAGAGAGGC---GTTCTCGCGCCGT-TAAAGTGGGGG * ** ******* * * * * **** * **** * * * ** ******** ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG TRY.BR_B -GAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA ** ** ** **** *** ** ******* ****** *** * * * ** * ** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT TRY.BR_B AGCACAC-CGAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAA-GTGTCGTCGCGAGGCGGTTT- * ** * * * ** ** * * * ***** * ** *** * ARA.TH_C CACTTT TRY.BR_B ------
Mean pairwise ID: 46.77%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * *** ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA CAN.SPE. -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** * * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA CAN.SPE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC ***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT CAN.SPE. CCCGTCTCT- ** * *
Mean pairwise ID: 46.77%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA---GGTGGTGTGGAT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA * * *** ******** ******* ** * * ** ** ZEA.MA_F GTTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCG-TTCC LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGG---GTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGT * * *** * * ** * ***** ** * * **** * * ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGC-GAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG LEP.COL. GTGTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGTA ** ** * * ** * * * ** ***** * *** * * * * *** ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG LEP.COL. G-AGGAACTGGGTCAGGCCGGC--AACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCGTTG * *** * * ** **** *** ** ******* * ***** * * ** ** ** ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC LEP.COL. C-AGAACCACACCGCGGAGCCTGTCA---TCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCT ** * *** ** ** * ** ** ** * ** ** * ** ZEA.MA_F CACCATCTTT LEP.COL. TT--------
Mean pairwise ID: 46.77%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ** * * * * LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * * ***** * * **** * * ** ** * *** LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * * *** ** * * * **** ** ** * *** LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** * LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC ORI.CUN. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGAGAC ***** ** * *** * * * ** * **** ** * ** * ** LYC.ES_F CATCACTTTT ORI.CUN. CCTGTCTCC- * * **
Mean pairwise ID: 46.77%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA-TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** * ****** * ** * *** ** *** * ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * * * * ** ** * * * ** * ** ****** ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAA----GG * ** * ** * * ** ****** ** * * * ** * * * * ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGC ** ** ** * ** * ** ***** * * **** * ******* ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA CAE.EL_D CGGACCGCGCTTGTAAGTTGA-CACACATAC-ACAGCCTTCTCGAT-ACCTTCAGACCAC **** * ** ** ** * ** * ** * **** ** * *** * * ARA.TH_A CCACCATTTT CAE.EL_D TTATCATTT- * *****
Mean pairwise ID: 46.77%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--CGGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** ** ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA ORI.CUN. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGAC ***** ** * * * ** **** ***** ** * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT ORI.CUN. CCTGTCTCC- ** *
Mean pairwise ID: 46.79%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGTGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_C GCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTT--CTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA ***** * * ** * ** **** * * * * * ** **** * ** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATAGTG FUG.RUB. GTTCG--GTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG *** * ** * * * *** * * **** ** ** * **** * * ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCT--CAGTAG * * * * *** * * ** * * * * ** * * ** * ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG FUG.RUB. TGGGATCGC--GCCCGTGAA---TAGACGC---TGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGG **** * *** ** * * * * * * * * ** ** * *** * ZEA.MA_C ACCACCATTTTT FUG.RUB. GACTCAGTCTTT * * * ***
Mean pairwise ID: 46.79%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** ** LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * **** * *** *** ** *** LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_A GCCGGACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA--GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA * *** ** * * *** * * * * **** * * * ** ** * LYC.ES_I ACCACCATTTTT CAE.EL_A CTTATCATTT-- * *****
Mean pairwise ID: 46.79%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** * ** * * ** *** * * ** ** ** * *** HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG CAN.SPE. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * ** *** * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** * HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG **** ** *** *** * **** * ** * ** * ** * HUM.JA_B ACCATTTCTTTT CAN.SPE. ACCCCGTCTCT- *** *** *
Mean pairwise ID: 46.79%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG **** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** ** CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA * * *** * * * ** *** ** ** *** ** * **** *** CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGC--GGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** ** * * *** ****** ** * * * * * ** CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCGACCGCGTGGTG-CAGTGG * * *** * *** * ** * *** * * * * * * **** CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA CAE.EL_A CCGGACCGC--GCTTGTGAGTT---GACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC *** * ** * * ** * * ** *** ****** ** *** CIN.HYB. CACCCATTT--- CAE.EL_A CACTTATCATTT *** **
Mean pairwise ID: 46.79%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * ** *** * LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * **** * *** *** * ** *** LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCA * *** * ** * * *** * ** * * **** * * ** ** * LYC.ES_I ACCACCATTTTT CAE.EL_C CTTGTCACT--- ** *
Mean pairwise ID: 46.79%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_J A--TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTC GAL.GAL. CGCTTGAGC----CCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC *** ** **** ** * ** ** * ** * * * * * ** * LYC.ES_J CAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * **** ** * * * * * * ***** * LYC.ES_J GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA **** * **** *** ** ** ****** * * ****** * * **** LYC.ES_J GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA GAL.GAL. ACGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGAC **** * * * *** * * * * * *** **** * * * * LYC.ES_J ACAACCACCTTT GAL.GAL. CCTGTCTCC--- * * **
Mean pairwise ID: 46.79%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGC * * * * ** * ***** * * * * * *** **** * ARA.TH_E ----GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCA DRO.MEL. CTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCT--CATGTTGACGGAACGTCCGCACTA ** * ** ** ** * * * * ****** ** * ** * * ARA.TH_E AGCT-GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTG DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG **** * * ** * * *** ** * **** * * **** * * ARA.TH_E GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG DRO.MEL. GATGA-ACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG ** * * * * *** *** * ****** * * ****** ***** * ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGT-TGG **** * * ** * ** * * * ** ***** * * ** ARA.TH_E ACCACCATTTT- DRO.MEL. ACCACAATCTTT ***** ** **
Mean pairwise ID: 46.82%
TRI.AE_A -NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGC LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCT--------CTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG- * ****** * * ******* * *** * * * * * * TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG LEI.MAJ. -GACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGC-TGCGTTGACG-TGGTGCTCTGCTT---GGCTG * ** * * *** * ** * ** ** * * * *** * * ** * ** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG LEI.MAJ. TGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGG ** ** * ** * * *** * * *** * ** * * ** TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA LEI.MAJ. AACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA-GAA ** * ** **** ** ** ******* * * * * *** ** ** * * * TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGTCCG---CACTTGAGCCCCAC-GCTTCGTCGCGAAGCCTT-- * * ** *** * ** *** *** * * ** * ** * ** *
Mean pairwise ID: 46.82%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * *** HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG ORI.CUN. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * ** *** * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** * HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATA ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCG **** ** *** *** * **** * ** *** ** * ** HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT ORI.CUN. AGACCCTGTCTCC- **** * ***
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-- ***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCC---TGTCCAAG CAE.EL_A GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * *** * * *** * *** ** * ** **** * LYC.ES_A CACAGAGTTGGATC-TCGAGGCCCAAATG--AAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAG CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * * ** * ** ** ** ** ** * * * * * *** * LYC.ES_A TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * *** * * * * * ***** ** ** **** ******* LYC.ES_A GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCAG-- ** *** * * *** ** ** * **** * * * ** ** LYC.ES_A AACAACCACCTTT- CAE.EL_A ACCACTTATCATTT * ** * * **
Mean pairwise ID: 46.82%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC LEI.MAJ. ------------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTC--GGGGGCTAAC-CAGGCTTAGC * ** *** * ** ** * ** **** * * *** * * FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT LEI.MAJ. GGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTG-CTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * *** * * * * * ** ** ** **** * * ** * FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG-GGG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG * ** *** * *** ** * ** * * * **** * ** * * FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTC-CGCCGTTGCAGAA * **** **** ******** ***** ** * * * * * * * ** * * * FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCATGT-CCGCACTTGAGCCCCA----CGCTTCGTCGCGAAGCCTT- ** * ** ** * * * * ** * ** * * * ** * ** ***
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-- ***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT--TCTGGCCTGCCC---TGTCCAAG CAE.EL_D GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * *** * * *** * ** *** * ** **** * LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * * **** *** ** *** * * * * * *** * LYC.ES_J TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * *** * * * * * ***** ** *** **** ******* LYC.ES_J GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG-- ** *** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** LYC.ES_J AACAACCACCTTT- CAE.EL_D ACCACTTATCATTT * ** * * **
Mean pairwise ID: 46.82%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** ** *** * ****** **** * ** * * * *** * CAE.EL_C GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGC-CCGCCCGT---TCCAAG * ** ** * * ** * *** ** ** ** * ** *** *** * CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCG-GGTGCATAAG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGG---GTCTCACGGTCCATAAT * ** * ** **** * * ** *** *** *** * *** ***** CAE.EL_C GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG TRI.AE_A GTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGG * * * * * * * * * ***** * ** **** * * CAE.EL_C TGGCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCT---CAATACCTTCA TRI.AE_A TGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCA *** *** * * * ** * * * * **** * * ** ** CAE.EL_C GACCACTTGTCACT TRI.AE_A GACCACC------- ******
Mean pairwise ID: 46.82%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGTGGATG- CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** ********* ZEA.MA_F --TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTG---GGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCC * ** * * *** * ** **** * * * *** * * **** ** ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG CAE.BRI. AAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG *** ** ** * ** *** ** * * **** ** * * *** * ZEA.MA_F CAG-GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCC--CGCTTCCAACGG CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGA------AAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG * *** *** *** * * ***** ** *** *** * * ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGC-CGCTGCATTGCAAGCCCA-ACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAAC CAE.BRI. TGGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCT--TCAGAC *** ***** * * * ** ***** * * ** *** * * ** ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT CAE.BRI. CACTTGTCATT--- ***
Mean pairwise ID: 46.82%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** * ** ******* ** ** ** * * * * * * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * *** HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG RAT.RAT. TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * ** *** * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** * HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATA RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCG **** ** *** *** * **** * ** *** ** * ** HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT RAT.RAT. AGACCCCGTCTCTT **** *** **
Mean pairwise ID: 46.82%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** ** *** * ****** **** * ** * * * * * * CAE.EL_B GATGGAGTGA-GAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGC-CCGCCCGT---TCCAAG * ** ** * * ** * *** ** ** ** * ** *** *** * CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCG-GGTGCATAAG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATG--CGAAAGCTGG---GTCTCACGGTCCATAAT * ** * ** **** * * ** *** *** *** * *** ***** CAE.EL_B GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG TRI.AE_A GTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGG * * * * * * * * * ***** * ** **** * * CAE.EL_B TGGCCGGAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCT---CAATACCTTCA TRI.AE_A TGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCA *** *** ** ** ** * * * * **** * * ** ** CAE.EL_B GACCACTTGTTTTT TRI.AE_A GACCACC------- ******
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-- ***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCC---TGTCCAAG CAE.EL_A GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * *** * * *** * *** ** * ** **** * LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAAT-----GAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.EL_A CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * * **** *** ** *** * * * * * *** * LYC.ES_J TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.EL_A AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * *** * * * * * ***** ** *** **** ******* LYC.ES_J GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA CAE.EL_A GGCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCAG-- ** *** * * *** ** ** * **** * * * ** ** LYC.ES_J AACAACCACCTTT- CAE.EL_A ACCACTTATCATTT * ** * * **
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** *** LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG-CC * ** ** * ** *** * * * * * * * ** ** ** LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTA--TAGCCACTTGGCCTTTAGAGT CAE.EL_D AAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTC-CCGGGTGCATAAGGA **** * ** * ** * *** * *** * * ** ** * LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * **** * * * * * **** * ** **** ******** LYC.ES_F GAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCT-AATT CAE.EL_D GCCGGACCGCG--CTTGTAA--GTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC * *** * ** ** ** **** * * * * *** * * * * * * LYC.ES_F AAACCATCACTTTT CAE.EL_D CACTTATCATTT-- * **** **
Mean pairwise ID: 46.82%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-- ***** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT--TCTGGCCTGCCC---TGTCCAAG CAE.EL_D GGATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * *** * * *** * ** *** * ** **** * LYC.ES_A CACAGAGTTGGATC-TCGAGGCCCAAATG--AAAATATGGGC--TTCTTGATTCCTAAAG CAE.EL_D CCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGG * ** * * ** * ** ** ** ** ** * * * * * *** * LYC.ES_A TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.EL_D AGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGT * * *** * * * * * ***** ** ** **** ******* LYC.ES_A GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA CAE.EL_D GGCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCAG-- ** *** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** LYC.ES_A AACAACCACCTTT- CAE.EL_D ACCACTTATCATTT * ** * * **
Mean pairwise ID: 46.84%
XEN.LAE. GCC-GGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATA-TGTGGCA--TAAACAATGTAGGTTGT--GATA *** *** * **** ** ** * ** * * ** *** *** XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-----AGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * * ***** * ** * **** * * *** **** * ** XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG-G TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGG--GCATTAAAGAGCTA * * ******* * * * ******* ** *** *** XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG *** ** * **** ** *** ** **** *** *** ** * ** XEN.LAE. AT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTC TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCAA-ACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT---- ** * * * ** * * * * * * * * ** *** ***** XEN.LAE. T TET.THE. -
Mean pairwise ID: 46.84%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA----GGGTATCAAAGTGGTTGAAC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ****** *** *** * ** ** * ** * ** * * * * * CIN.HYB. TTTGAGCTTG-GCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTC CAN.SPE. C----GCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC ***** ** ** * ** *** ** * * ** * * ** *** * CIN.HYB. CAAGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTA CAN.SPE. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAA **** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * * CIN.HYB. GAATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGA CAN.SPE. GGA--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** CIN.HYB. CTGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAA CAN.SPE. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGTGCAACATAG * ** * **** * ** * * ** * ******** * * * CIN.HYB. CAGGACACCCATTT-- CAN.SPE. CGAGAC-CCCGTCTCT * *** *** * *
Mean pairwise ID: 46.84%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG ** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * ** * ** * *** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG--GCTGGGTTGCG--CAGCTCCTAGAGTGGAG CAE.EL_D TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA * * *** ** *** *** * * ** *** ** ** * * * HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCT--GGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_D GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG ** * * ** * ** * ** ***** * * * **** ****** HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTG---TAAGTTGACACAC-ATACACAGCCTTCTCGATACCT--TC * *** ** ** * ** * ** *** ** * * ** * * * HUM.LU_D GGACCATTTCTTTT-- CAE.EL_D AGACCACTTATCATTT ***** ** * *
Mean pairwise ID: 46.84%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC-------TAACCAGGCTTAG * * * * ******** ****** ** * *** * HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * ***** * * *** ** ***** ** * *** * * * ** HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG-GGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG * * ** ** ** * ** * ** ** *** * * ** * * ** *** HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAA LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA ** * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * * HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGGTCCA----CCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAA LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---- * ** ** *** ** * * * *** ***** * * ** HUM.LU_A TAGGACCATTTCTTTT LEI.MAJ. ----------------
Mean pairwise ID: 46.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAG-- * * *** ******** * *** ** * * ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LEI.MAJ. ---GACGTGGACC---AGCGAGGGTGATTTGCTGC-GTTGACGTGGTGCTCTGCTTG--- * ***** * * *** ** ** ** * ** ** *** * ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LEI.MAJ. ---GCTGTGT-GTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC---GCGGGTCCGCCGT * ** ** ** ** * ** * ** * ** ** **** * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LEI.MAJ. TGAAGCGA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCG * *** * ** ** * ** **** ** ** ******* * * * * * *** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LEI.MAJ. CCGTTGCA-GAATCACA--CCGCGG-AGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTC-G ** ** * * ** *** * ** * * * ** * * *** * **** * * ** ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT LEI.MAJ. CGA-AGCCTT-------- * * ** *
Mean pairwise ID: 46.86%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT TRY.BR_B AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGAC-GTCT *** *** * * * ******** * *** ** * * * * * * HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA TRY.BR_B TGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGT * * ** ** **** * ** *** ** ***** * ** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT TRY.BR_B GTTGAGGTCGCCA--CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-AAC **** * * *** **** * * *** ** ** ***** *** ** HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC TRY.BR_B GGGTCAGGCCGGT--GACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCAC * ** **** *** ** ******* * **** *** * * ** * ** * ** HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTCC TRY.BR_B ACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT------ ** ** ** * ** ** * * * * *** HUM.LU_B TTT TRY.BR_B ---
Mean pairwise ID: 46.88%
TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATAC-CTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT TRY.BR_B AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGC-TGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCT *** * * *** * * **** * * * *** * * * * * * ** * TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTT TRY.BR_B TGGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTC *** * * * * * ** * *** ** * ** * *** * ** TET.THE. GCTATGGTGGTAACC-TAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGC TRY.BR_B GGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGG * * * * *** ** *** * * * * * ****** * ** **** TET.THE. CTCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATAC TRY.BR_B GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCG ****** ** ** ** *** ** * *** *** ** * ** * *** TET.THE. TCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT-- TRY.BR_B AGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT * *** ** * * * ** ** ** * *
Mean pairwise ID: 46.93%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG YAR.LI_B -------------AGCTGTAATGGCATTTT--GTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTG * ** * * * ** ** ** *** * * *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGG---TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA YAR.LI_B TGC-GTTCGAGTT--CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGT----TGTCCTTTCCGAATT ** ** * ** * **** ** * ******* *** * ** *** *** * * LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG YAR.LI_B CTGCGGTTGATGG-GCGTCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATT * * * * *** * * * * * *** **** ***** * * * * LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA--CGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG YAR.LI_B AACT----GGGATACTTCAGTGGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGT---TGCCGTGG--GT ** ** * ** ****** * * * *** * *** **** * LYC.ES_E ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA YAR.LI_B ATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTAT--ATGTT--ATGGAAGGTATTTGC--AATCA ** *** * * * * **** ** *** **** ** * * ** * LYC.ES_E CCACATTTT YAR.LI_B CGACTCTC- * ** *
Mean pairwise ID: 46.95%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * * * * ***** * ** * * ** * ** * * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGG-GNCCAGTGCTAGCTGCT-TACCCGGCTGCCCATTCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** ** ** ** * * * ** ** * *** * ** * ****** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCG-AAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAG CAE.BRI. -GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG * ** * * * ** * ** ** ****** ** * * * * ** * * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** ** *** * * ***** * * * **** * ******* * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC CAE.BRI. GATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCC----CACAGCCTCTCTGATACCT--TCAGAC **** ** * *** * * * * ** * **** * * * *** HUM.LU_C CATTTCTTTT- CAE.BRI. CACTTGTCATT ** ** * *
Mean pairwise ID: 46.95%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG-AAATGGGACTTT CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * * ** * ****** * ** * * ** * ** ** * * HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCT-TGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC *** * * * *** ** * * * * ** * ****** HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAG-CTCCTAAAGCGGAG CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCT-CCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG * ** * * ** **** ** * * ***** * * * * *** * * * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** ** *** * * ***** * ** * **** * ******* * HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCT---CTGATACCT--TCAGAC **** ** * * ** * * ** * ** **** * * * *** HUM.JA_B CATTTCTTTT- CAE.BRI. CACTTGTCATT ** ** * *
Mean pairwise ID: 46.95%
ZEA.MA_G -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGCGGAT LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC * ******** * * *** * * * * ** * ** ** * *** ZEA.MA_G TCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTT--GACGTG----GTGCTCT------GCTTGGCTGT-- * ** ** *** * * * * **** * ** ** * ** ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT LEI.MAJ. -GTGTCGGT-GTGGCTTGCC----CCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC ** *** ****** ** * ** ** * * * *** ***** ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCG-TT * **** * ** **** ** ** ******* * * * * * *** ** * ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA LEI.MAJ. GCAGAATCACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGC * ** ** ** ** *** ** * *** **** ** ** * ** ZEA.MA_G CCACCATCTTT LEI.MAJ. CTT-------- *
Mean pairwise ID: 46.95%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG ***** * * **** ******** *** * * * * * ** * * HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * * * ** * ** ** * * **** * * * ** ** * *** HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGC--GCACGTCCTAGAGTGGAG XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG ** * ** *** * ** * ** ** * * * * *** * ** * HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * * **** * **** * * HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACA----GCCTGAACAACAC--AGCGAGAC *** ** *** *** *** ** * * * ** * * *** HUM.LU_A -CATTTCTTTT XEN.LAE. ACAGTTCT--- ** ****
Mean pairwise ID: 46.96%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * ** * *** * LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** * LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG * ***** * *** * * **** **** * **** * ********* LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA CAE.EL_D CCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTG-ACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCA *** ** * ** ** * * * **** * * * ** * LYC.ES_E ACTACCACATTTT CAE.EL_D CTTATCATTT--- ** ** *
Mean pairwise ID: 46.98%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA---GGGTATCAAAGTGGTTGAACT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA--GGCTGGAGG ****** *** *** * ** ** * ** * *** * * ** ** * CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * * ** * * ** *** * * CIN.HYB. AGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGA HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAAGG *** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * ** CIN.HYB. ATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACT HOM.SA_A A--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** * CIN.HYB. GTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA HOM.SA_A GTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGTGCAACATAGCG ** * **** * ** * * ** * ******** * * * * CIN.HYB. GGACACCCATTT--- HOM.SA_A AGAC-CCCGTCTCTT *** *** * *
Mean pairwise ID: 47.00%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATGAG--TGTG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * *** * * * HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG * * * * *** * *** **** * * * * * * ** *** * HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCT-TGGTCAGCTCCTAAAGCGGA CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCACCAGG---GGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATA ** ** * ** * * *** ** *** * ******* ** ** * HUM.JA_B GGG--CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGT CAE.EL_C AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT ** ** ** * ** * ** ***** * ** * **** * ***** HUM.JA_B GGAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCAC-CATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAA CAE.EL_C GGCCGGACAGC--GCTTGTGA-GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT--ACCTTCA- ** *** * * ** *** * * ** * ** * ** * ** * * HUM.JA_B TAGGACCATTTCTTTT- CAE.EL_C ---GACCACTTGTCACT ***** ** *
Mean pairwise ID: 47.04%
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGC-CTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCA TRY.BR_A AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT *** * * *** *** **** **** * *** * * *** * * TET.ROS. GAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTG TRY.BR_A GGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTCG * * * * * * ** * *** ** * ** * * * * * ** * TET.ROS. CTATGGTGGAAACC-TAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCC TRY.BR_A GTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGGG * * * ** ** *** * * * * * * ****** * * ** * ** TET.ROS. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT TRY.BR_A TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAA--GCACACC ****** ** ** ** *** ** * *** ** ** ** * ** ** TET.ROS. CATTAAC-TGTCAAG-CTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT TRY.BR_A GAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- * * * * *** * ** ** * * * * ** *
Mean pairwise ID: 47.08%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT LEI.MAJ. ----GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCT-------AACCAGGCTTAGCGG * * ** * ******** ****** ** *** * * HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTG-CTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGG LEI.MAJ. GGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGT * **** * * *** * ***** ** * * *** * * * ** * HUM.LU_C GAGGTGGGCTGAG--GGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGC LEI.MAJ. GTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGA * * ** ** * ** ** *** * * * * * * ** ***** HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGGA LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * ** * HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGCAT-----GTCCGCACT--TGAGCCCCAC-GCTTCGTCGCGAAGCCT * ** *** ** * * **** * * * * * ** * ** HUM.LU_C TTTCTTTT LEI.MAJ. T------- *
Mean pairwise ID: 47.08%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG-CCTGTGACCTC-GTGTGG---CATAAACAATGTAG--TTAGAA * * * * * * ***** *** *** ** * **** * ** * HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGC--TAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGG TET.ROS. TAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGT * * * * * ** ** * ** * ***** ****** * * HUM.LU_C GAGGTGGGCTGAGGGA--CCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG TET.ROS. GAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAA *** ** ** *** *** * *** ** * *** * *** * HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TET.ROS. C--CGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ********* HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT------ **** * * * * * * * * **** ** **** * HUM.LU_C TTTCTTTT TET.ROS. --------
Mean pairwise ID: 47.08%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT ** * * * ******** * *** ** * * ***** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC TRY.BR_B C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG * * ** ** **** * ** *** ** ***** * HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG TRY.BR_B TCGGTGTTGAG----GTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG ** **** * ** ** * ** * * *** ** ** ***** *** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TRY.BR_B -AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA ** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * ** * HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA TRY.BR_B GCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAG--TG--TCGTCGCGAGGCGG ** ** ** * * ** *** * * * ** ** * * * HUM.LU_D TTTCTTTT TRY.BR_B TTT----- ***
Mean pairwise ID: 47.10%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG TET.THE. ----GCCAGGGTAGCA-ATACCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGT-- * *** * * **** ** * ** * ** ** * ** ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTG---GCCCGCCCATTCCAA TET.THE. GATAGATAGGATATGA--GAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA * * *** ** * * *** * * * * * * ** * **** ***** ARA.TH_C GTTGGGAGTTGAGGCA-TGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA ****** *** * ** * * * * * ** **** ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGA TET.THE. AGGAAAC-GCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA *** ** ** * ******* ***** *** * ** * ***** * ****** ARA.TH_C AGGATTACGGGC-CATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA TET.THE. AGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCG-GTTCTACTA------TCAAAGCCAG ***** ** * **** ** * * * * * * * ** ** * ARA.TH_C CCATCACTTT TET.THE. ACATT----- ***
Mean pairwise ID: 47.10%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAA----TGGGGGCATTAATGTGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** * * ** ***** **** **** * * * *** *** LYC.ES_B GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * ** LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * ** LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT ** * * *** ** ** **** *** *** * * ** * LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGAC **** ** * * *** * * *** * * ** * * * * ** LYC.ES_B CACCACTTTT FUG.RUB. TCAGTCTTT- ****
Mean pairwise ID: 47.12%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA- * ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** * * * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC CAN.SPE. --TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * * * * * *** * * * * *** ** ** *** * ** ** ** * ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT CAN.SPE. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG CAN.SPE. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAG * ***** * * * * ** ** * * ** ** ** * * * * ARA.TH_E AACCACCATTTT CAN.SPE. ACCCCGTCTCT- * ** * *
Mean pairwise ID: 47.12%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_A A--TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTC GAL.GAL. CGCTTGAGC----CCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC *** ** **** ** * ** ** * ** * * * * * ** * LYC.ES_A CAAGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * **** ** * * * * * * ***** * LYC.ES_A GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTG GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA **** * **** *** ** ** ****** * ** ****** * * **** LYC.ES_A GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA GAL.GAL. ACGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGAC **** * * * *** * * * * * *** **** * * * * LYC.ES_A ACAACCACCTTT GAL.GAL. CCTGTCTCC--- * * **
Mean pairwise ID: 47.12%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * *** * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** * *** * ** * * ** *** * * ** ** ** * *** HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG HOM.SA_A TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * ** *** * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** * HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG **** ** *** *** * **** * ** * ** * ** * HUM.JA_B ACCATTTCTTTT HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT *** *** **
Mean pairwise ID: 47.13%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G * * * * ** * ** *** * ** * * ** ** * ** * * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG * * ** *** * **** **** * * * * * ** * *** HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG CAE.EL_C TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA * * **** ** *** *** ** * * * * ** *** ** * * * HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTG CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ****** HUM.LU_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCG CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTG--AGTTGACACGT-ATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCA * *** * ** * *** * *** * ** ** ** * * * ** HUM.LU_B GACCATTTCCTTT- CAE.EL_C GACCACTTGTCACT ***** **
Mean pairwise ID: 47.13%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG----GA *** ** ** *** ** *** ** * * *** **** * * ** TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCC---TGCCCGTT RAT.NOR. GGATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCG-CTATGCCGATCGGGTGTCCGCA * * * * ** * ** *** ** * *** * * ** *** TRI.AE_B CCAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAA RAT.NOR. CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG * ***** * * **** * ** *** * **** *** * TRI.AE_B GTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGG RAT.NOR. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * * TRI.AE_B TGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC RAT.NOR. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGGGC-AACATAGC * * **** * *** ** * * *** * *** * ****** TRI.AE_B AGACCACCATCTTT RAT.NOR. GAGAC-CCGTCTCT * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.13%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGT-GGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * ** * *** ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGG--ACTGCCCAATC GAL.GAL. CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGC-TATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC * ** ** ***** * ** * * ** ** ** ** * * * * ** * ARA.TH_G CAAGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGT GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * ** *** ** * * ** * * ****** **** ARA.TH_G TGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTG GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA * * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** ARA.TH_G GACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTT GAL.GAL. ACGGGA-------TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAG--CGTAGCCTGGGCAACATAGC *** *** * * * ***** * ** * ** * * * ARA.TH_G GAACCACCATTTT- GAL.GAL. GAGACCCTGTCTCC ** * * * *
Mean pairwise ID: 47.15%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG ** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * * ** * ** * *** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAG--GCTGGGTTGCG--CAGCTCCTAGAGTGGAG CAE.EL_A TGCCAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAA * * *** ** *** *** * * ** *** ** ** * * * HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCT--GGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_A GGAGTCGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG ** * * ** * ** * ** ***** * * * **** ****** HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATA CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAG---TTGACACAC-ATACGCAGCCTTCTCGATACCT--TC * *** ** ** *** * ** *** ** * * ** * * * HUM.LU_D GGACCATTTCTTTT-- CAE.EL_A AGACCACTTATCATTT ***** ** * *
Mean pairwise ID: 47.21%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT TET.THE. GCCAGGGTAG---CAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG--TGATA ** * *** * * ** ****** * * * * ** ** * TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA---TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAA * * * * ** * ** ** ** * * ****** ***** TRI.AE_B GTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC--AGGC TET.THE. TGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA *** * ***** * ** * * *** **** ** *** TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT * * * * ******* ***** *** ** **** ******* *********** TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGG----TTCTACT--ATCAAAGCCAGACATT- **** * * * * * ** * * **** ** *** ** TRI.AE_B TCTTT TET.THE. -----
Mean pairwise ID: 47.23%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT * ** * * ** *** ** *** *** ** * * * ** *** * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * *** ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA RAT.NOR. GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGACCCG *** ** ** ** * * * **** ** * ** * * * ** ARA.TH_C TCACTTT RAT.NOR. TCTCT-- ** **
Mean pairwise ID: 47.23%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT * ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * *** * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * *** ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA HOM.SA_A GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG-ACCCCG *** ** ** ** * * * **** ** * * *** ** ARA.TH_C TCACTTT HOM.SA_A TCTCTT- ** ***
Mean pairwise ID: 47.23%
TRI.AE_B --NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGC-GGTGTGGATG TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGC-----TCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG * **** **** *** *** * *** ** * * * *** * TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCG-TTCCAA TRY.BR_A TCTTGGACAA---GCGGG---GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGT * * * * ** ** *** ** **** ** **** * ** * TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCC-TTAAGTGGCA TRY.BR_A GTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG ** *** ** * * * *** * ** ** ***** *** **** * TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG TRY.BR_A GGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA ** * * ** **** *** ** ******* ** ** *** * ** ** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG--AGGCGG- * *** * *** * ** ** ** *** * ** * ** * TRI.AE_B CATCTTT TRY.BR_A -------
Mean pairwise ID: 47.25%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT * ** ** ** * ** **** **** * * ** * * * * * LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** * *** ***** * *** **** * ** ** * *** LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *** LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** * LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGACCC **** ** * * *** * * ** * *** ***** * * ** LYC.ES_B ACCACTTTT RAT.NOR. GTCTCT--- * **
Mean pairwise ID: 47.25%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT TRY.BR_A ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT * * *** * * * ******** * *** ** * * ***** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC TRY.BR_A C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG * * ** ** **** * ** *** ** ***** * HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG TRY.BR_A TCGGTGTTGAGGT---CGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGC-CGT--TAAAGTGGGGG ** **** * * * * * ** *** * **** *** ** ***** ** HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TRY.BR_A G-AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGA * ** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** ** HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC TRY.BR_A AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--- * ** ** ** * ** ** *** * * ** * * ** HUM.LU_A ATTTCTTTT TRY.BR_A ---------
Mean pairwise ID: 47.25%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** ***** ****** * ** * * * * ********* TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATG--TAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA CAE.EL_D --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA *** * * * **** * *** * ** * * * * **** **** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC-CTTAAGTGGCA CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC * ** * *** * ** *** ** * ** * **** * TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG CAE.EL_D GTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCA-GACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG * * *** * ** * * * * **** * * **** ** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC CAE.EL_D ACCGC--GCTTGTA-AGTTGACACACATACACAGCCTTCT-CGATACCTT--CAGACCAC * * ** * ** * * * **** ** * ** * ******** TRI.AE_B C-ATCTTT- CAE.EL_D TTATCATTT *** **
Mean pairwise ID: 47.27%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGG-TGGAATGT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ** **** * LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGC-GCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * ** * * ** ** ** ** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_F GCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGG HOM.SA_A GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * *** ** * * * **** ** ** * ** LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGA HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** * LYC.ES_F AGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAA HOM.SA_A GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTGT---GCAACATAGCGAGA ***** ** * *** * * * ** * **** * * ** * * LYC.ES_F CCATCACTTTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT ** ** **
Mean pairwise ID: 47.27%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** *** *** ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA HOM.SA_B -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA * ** * * * ** * *** *** ** *** ** * ** ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA HOM.SA_B TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAGA ***** ** * * * ** ** * * ** ** * * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT HOM.SA_B CCCCGTCTCT- ** * *
Mean pairwise ID: 47.27%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** *** ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA HOM.SA_A TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA ***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT ** * **
Mean pairwise ID: 47.27%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * * ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA RAT.RAT. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA ***** ** * * * ** **** ***** ** * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT ** * **
Mean pairwise ID: 47.27%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGT----GGGGATGTTAAGGTG---GTGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * * ** ** * ** *** * ** * * * * * *** *** LYC.ES_O AATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA * * *** * * *** ** * ** * * * * ** *** LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTG CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTC-TCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG *** * * ** * ** *** * * *** *** * * * * * *** * * LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG **** ** ** *** * * **** **** * **** ********* LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCA ***** ** * * ** * ** * **** * ** ** * LYC.ES_O ACCACCACTTT CAE.BRI. CTTGTCATT-- ** *
Mean pairwise ID: 47.28%
HUM.LU_A -GCCGGTC--TTAGCAACGTGGGCCTGTA-ACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGAC DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * ** ** *** * * * * * *** ** * * * ** * HUM.LU_A TTTGGGTCA-ACCTAGTGGATCG-GGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCC DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGC-TCA--TGTTGACGGAAC-GTCCGCACT * ** * * *** ** * * ** **** * * ** * ** * * * ** * HUM.LU_A AAGCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG **** * * ** *** * *** ** *** * * *** * * HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAG * * * * * *** ** * ****** * * ***** * ****** * HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG DRO.MEL. TGGGATAGCGTACCGGAGT------GGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGAT--ATGGTTG ***** ** **** * ** * ** * * * * ** * * * HUM.LU_A GACCATTTCTTTT DRO.MEL. GACCACAATCTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 47.28%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ***** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * **** * *** **** * ** *** LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCT----TCAG * *** ** * * *** * ** * * **** * ** * * LYC.ES_B ACCACCACTTTT- CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ***** ****
Mean pairwise ID: 47.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G ***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * ** * * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** * LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG * ****** * *** * * **** **** * **** ********* LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA CAE.EL_C CCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCA *** * ** * *** ** * * * * **** * * ** * LYC.ES_E ACTACCACATTTT CAE.EL_C CTTGTCACT---- * ***
Mean pairwise ID: 47.30%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGACAAGTGT-- * * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGC-TAATTTCTGACT-TGCCCTA---TCCAAG CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG ** ** * * ** * * ***** * * ** * ** * *** * LYC.ES_H CTTAGAGTTGGATCATGTGG----CCCAATTGAAGAAATGG-ACTACTTGATTCGTAAAG CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG * ** * ** ** ** ** * * * *** * * * * *** * LYC.ES_H TGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT * ** * * ** *** * * ***** ** *** **** * ******* LYC.ES_H GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT CAE.BRI. GGCCGGATAGCG--CTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCA-- ** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** LYC.ES_H AAACAACCACCTTTT CAE.BRI. GACCACTTGTCATT- * ** * **
Mean pairwise ID: 47.30%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA---GGGTATCAAAGTGGTTGAACT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GACAGAGGA ****** *** *** * ** ** * ** * *** * ** * ** CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTCCA RAT.RAT. TCGC-TTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * * ** * ** ****** * * ** * * ** *** * * CIN.HYB. AGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGA RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAAGG *** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * ** CIN.HYB. ATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACT RAT.RAT. A--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** * CIN.HYB. GTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA RAT.RAT. GTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGGGCAACATAGCG ** * **** * ** * * ** * ********* * * * * CIN.HYB. GGACACCCATTT--- RAT.RAT. AGAC-CCCGTCTCTT *** *** * *
Mean pairwise ID: 47.30%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * ** *** * ** *** * * * * ** * * ***** ZEA.MA_B TTTGC---GATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCG--GCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA ** ** * * *** * ** *** * ** *** * ** * *** ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTC-TGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG CAE.BRI. AGC--GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCC-CGGGCGCATA--- ** * * *** * *** *** * * *** ** * * * * * ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACG-- CAE.BRI. --AGGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCA **** *** * * **** * * * ***** ** *** * * * ZEA.MA_B GTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGC CAE.BRI. GTGGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTC---TCTGATACCTTC **** ***** * ** ** * * * ***** * * ** * * ZEA.MA_B AAACCACC-ATCTTT CAE.BRI. AGACCACTTGTCATT * ***** ** **
Mean pairwise ID: 47.32%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * * HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCAT---TCCAAG CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG * * * * *** * *** **** * * * * * * ** *** * HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCT-TGGTCAGCTCCTAAAGCGGA CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGG---GGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATA ** ** * ** * * *** ** *** * ******* ** ** * HUM.JA_B GGG--CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGT CAE.EL_B AGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT ** ** ** * ** * ** ***** * ** * **** * ***** HUM.JA_B GGAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCAC-CATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAA CAE.EL_B GGCCGGAC--TGCGCTTGTGA-GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT--ACCTTCA- ** *** * ** *** * * ** * ** * ** * ** * * HUM.JA_B TAGGACCATTTCTTTT- CAE.EL_B ---GACCACTTGTTTTT ***** ** ****
Mean pairwise ID: 47.34%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_D TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC **** ** * * *** * * ****** ***** *** * * * ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG CAE.EL_B ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC------G **** *** * ** * * * * * *** ** *** * * ZEA.MA_D TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG-- CAE.EL_B CGGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATAC ** * * ** **** *** ** * ** ***** ** ZEA.MA_D ---CAGACCACCATCTT-- CAE.EL_B CTTCAGACCACTTGTTTTT ******** **
Mean pairwise ID: 47.37%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGC *** ** * ** *** ** **** ** ** * * * ** ** RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAG * * ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** * *** RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATGTGG ** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** * ** RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGA * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** * RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGT TRI.AE_A AGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAGAC **** * *** ** * * * ** * **** * ** * ** * RAT.NOR. CTCT TRI.AE_A CACC * *
Mean pairwise ID: 47.39%
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC * ** **** ****** *** * ** * LYC.ES_M GGGC-TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** ***** * *** ** * *** * *** ****** LYC.ES_M CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA * *** ** * ** *** **** * * * * * ********* * LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * ** ************** ******* ** * * ***** ** ********* LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT------------------------------- ***** **** * * *** * * ** * LYC.ES_M ACCTTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 47.40%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * * ** * ****** * ** * * ** * * * * * HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGCT-TGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ** * * * * * * *** ** * * * * ** * ****** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT * ** * * ** * * ********* * * ** * *** *** * HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG *** ** *** * * ***** * * * **** * ******* ** HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTG-TCGCTCGCCCACAGCCTCT-CTGATACCTT----CAGACCAC *** ** * * * * * * * *** * * ** * ** * ******* HUM.JA_A CTCTTTT- CAE.BRI. TTGTCATT * * *
Mean pairwise ID: 47.40%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA--GGGTATCAAAGTGGTTGAACT- XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG ****** ** ** * ** *** ** * ** * ** * * CIN.HYB. -TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTG-AGCTATGTCGATCGGGT-GTCCGCACTAAG ***** * ** * * *** ** * * ** * * *** * *** CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGA--GCTTTAGAATCG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGG-GGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTA-AGGAG * * * * ****** * * ** ***** * * * *** ** * * CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG *** * * * *** ** ** **** * *** * * * * ** * CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC XEN.LAE. TGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCGGTGCA---GAACAGCCTGAACAACACAGCGAGAC **** * *** * * * ** ** * ******* * * ** * *** CIN.HYB. ACCCATTT XEN.LAE. ACAGTTCT ** * *
Mean pairwise ID: 47.40%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TGAGTGTGGATG ***** * ** ** * ****** * ** * *** * * ** ** ** LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** ***** LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** LYC.ES_A CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** * * * * * ***** ** ** **** * ********* * LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC ** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** LYC.ES_A CCACCTTT CAE.EL_C TTGTCACT * *
Mean pairwise ID: 47.40%
ZEA.MA_B -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGT-GGCGCGGATG LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGC--------TCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGG * ******** ******* * *** * * * * *** *** * ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LEI.MAJ. ACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT---G ** * * * * * ***** * * ***** * * * ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA LEI.MAJ. TCGGTGTGGCTTGCCC---CCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCG--TTGAAGCGA-G * *** * ** * * ** ** * * * ** ** * * **** ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCG-TTGCA **** * ** **** ** ** ******* * * * * *** *** ** * * * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTC---CGCACTTGAGCCCCA---CGCTTCGTCGCGAAGCC * ** *** ** *** * * ** ** **** * ** * ** ** * ZEA.MA_B CCATCTTT LEI.MAJ. TT------
Mean pairwise ID: 47.40%
TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGC-CTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTCA TRY.BR_B AGCCGGAGC-GCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTT *** * * *** *** **** **** * *** * * *** * * TET.ROS. GAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTG TRY.BR_B GGACAAGCGGGGGTTCTGTTGC-GTTGACTTGGTGT---TCTGCTT--GGTTGCGTGTCG * * * * * * ** * *** ** * ** * * * * * ** * TET.ROS. CTATGGTGGAAACC-TAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCC TRY.BR_B GTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTG--GGGGGAACGGG * * * ** ** *** * * * * * * ****** * * ** * ** TET.ROS. TCAGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACT TRY.BR_B TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCC--ACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAA--GCACACC ****** ** ** ** *** ** * *** ** ** * ** * ** ** TET.ROS. CATTAAC-TGTCAAG-CTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT-- TRY.BR_B GAGGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT * * * * *** * ** ** * * * * ** * *
Mean pairwise ID: 47.40%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TGAGTGTGGATG **** * ** ** * ****** * ** * *** * * ** ** ** LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** ***** LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGG CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** LYC.ES_K CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* * LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC ** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** LYC.ES_K CCACCTTT CAE.EL_C TTGTCACT * *
Mean pairwise ID: 47.42%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAATGTGGTGGAATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * * ** ** **** ** ***** *** * ** ** ** *** * LYC.ES_N TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * *** LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * ** LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT ** * * * *** ** ** ***** * ** ** * * * ** * LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAA-----CACAGCGAGA **** ** * * *** ** *** * ****** * * * LYC.ES_N CACCATTTTT XEN.LAE. CACAGTTCT- *** ** *
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** *** *** ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA HOM.SA_B -TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA * ** * * * ** * *** *** ** *** ** * ** ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA HOM.SA_B GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC ***** ** * * * ** ** * * ** ** * * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT HOM.SA_B CCCGTCTCT- ** * *
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** *** ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA HOM.SA_A GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC ***** ** * * * ** ** * * ** ** ** * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT HOM.SA_A CCCGTCTCTT ** * **
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * * ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA RAT.RAT. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGAC ***** ** * * * ** **** ***** ** * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT RAT.RAT. CCCGTCTCTT ** * **
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** ** * ****** * ** * **** * * * ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * * *** * * *** **** * ** *** ** * ** ***** ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG * * ** * * * * * ** * * * * *** *** **** * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG CAE.EL_A TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG * ** * * * * * ***** * * * **** ******* ** ARA.TH_G GACAACGGTT-CGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT--- *** ** ** ** ***** ** * * ** * * ** *** ARA.TH_G CCACCATTTT CAE.EL_A --ATCATTT- * *****
Mean pairwise ID: 47.42%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ** * * * ******* ***** * ** * * * *** * HUM.LU_C GGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGC-TTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * * * *** ** * ** * ** ** * *** ** ** * * *** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC--GCACTCCTAGACTGGAG FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGG-GGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ** * ** * ****** * ** * * * * **** ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG ** * *** ** ** ***** * * **** * **** * * HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGAC *** ** *** *** ** * ******* * * ** * * **** HUM.LU_C CATTTCTTTT FUG.RUB. TCAGTCTTT- *****
Mean pairwise ID: 47.42%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ***** ** ** * ****** * ** * **** * * * ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTC-TACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * * *** * * *** ** * * ** *** ** * ** ***** ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG * * ** * * * * * ** * * * * *** *** **** * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG CAE.EL_D TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG * ** * * * * * ***** * * * **** ******* ** ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCC-ACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTT--- *** ** ** * * ***** ** *** ** * * ** *** ARA.TH_G CCACCATTTT CAE.EL_D --ATCATTT- * *****
Mean pairwise ID: 47.44%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG--TCTATATGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT ** * ***** * * * *** * * * ***** * ** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA *** * * * * * * * * * ****** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCT-AGTAATAGG---ACTCCACCAGGGCATTAAAGA *** *** ** ** * * ** ** ** * * * * ** ZEA.MA_G GC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGT ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** ****** *** ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG TET.THE. GGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAA-TCGGTTCTA----CTATCAAAGCCA ** ******** * * *** * * ** ** * * * ** * **** ZEA.MA_G ACCACCATCTTT TET.THE. GACATT------ **
Mean pairwise ID: 47.44%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** ** ** *** * ** *** ** * * *** ****** * * TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTG-ATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCC ORI.CUN. CGCTTGA---GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT ***** * * * ******* * * * * * * ** *** * TRI.AE_B AAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGT ORI.CUN. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA ***** * * **** * ** *** * **** *** * * TRI.AE_B GGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTG ORI.CUN. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * ** TRI.AE_B GAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG ORI.CUN. GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGGGC-AACATAGCGA * **** * *** ** * * *** * *** * ****** TRI.AE_B ACCACCATCTTT ORI.CUN. GACCCTGTCTCC * * ***
Mean pairwise ID: 47.44%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ***** * * ** ******* ** ** ** * * * * ** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * ** HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** **** ** ** * * * ** HUM.LU_A ACCATTTCTTTT RAT.NOR. CCCGTCTCT--- ** * ***
Mean pairwise ID: 47.45%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG * * * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * ** * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_B AGTGAGAGGAG------GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG ** ** ** * **** **** * * * * * ** * *** HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG CAE.EL_B TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA * * **** ** *** *** ** * * * * ** *** ** * * * HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTG CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ****** HUM.LU_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCG CAE.EL_B GCCGGACTGCG--CTTGTG--AGTTGACACGT-ATACACAGCCTTCTCAATACCT--TCA * *** ** * *** * *** * ** ** ** * * * ** HUM.LU_B GACCATTTCCTTT- CAE.EL_B GACCACTTGTTTTT ***** ** ***
Mean pairwise ID: 47.46%
TET.ROS. GCCAGG----GTAGCAA-TGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGAT-G ** * ***** * *** *** *** ** * ** ** ** ***** * ** * TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTA-AGAGTGTG-----CCCGTTCCAAAC ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT *** * * * ** * ***** * * **** *** ****** TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCG-G * * ** * * * * * * ** * ** * ** ***** * * * TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG * ** * ******** * *** *** ** ** **** * ********* TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------- **** * ** * * ***
Mean pairwise ID: 47.47%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC ***** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** * ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA HOM.SA_A TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG ***** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG HOM.SA_A GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * * ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG HOM.SA_A TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACT------CCAGCCTGTGCAACATAG * * **** * *** ** * * ** * ** ** * * ** ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT- HOM.SA_A CGAGACCCCGTCTCTT * * ** * * *
Mean pairwise ID: 47.48%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC **** ** * * *** * * ****** ***** *** * * * ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT CAE.EL_C ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-----GC **** *** * ** * * * * * *** ** ** * * * ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG--- CAE.EL_C GGTGCAGTGGCCGGACA--GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACC ** * * ** * ** *** ** * ** ***** ** ZEA.MA_G --CAGACCACC-ATCTTT CAE.EL_C TTCAGACCACTTGTCACT ******** ** *
Mean pairwise ID: 47.49%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG LYC.ES_M -------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATAT-TGGGCTGTCCCAGATGG * ** * * * * * * ** * ** *** **** * TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC LYC.ES_M CT-----GGGCTTGGTGGGCTAATTTCT----GGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGG * * *** ** * * *** * ***** ***** ** ****** TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCC LYC.ES_M -ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGG-GGCGGACCGCA ** * ** * * * * * * * * ***** * * * *** TET.THE. TCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATA LYC.ES_M TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGG * ******** ***** *** *** * * ***** ** ************ TET.THE. CTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT- LYC.ES_M TCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT * * **** ***** **** * * *** ** **
Mean pairwise ID: 47.56%
TRI.AE_B --NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGC-GGTGTGGATG TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGC-----TCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACG * **** **** *** *** * *** ** * * * *** * TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCG-TTCCAA TRY.BR_B TCTTGGACAA---GCGGG---GGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGT * * * * ** ** *** ** **** ** **** * ** * TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCC-TTAAGTGGCA TRY.BR_B GTCGGTGTTGAGGTCGCCA-CTGTAGAGAG------GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGG ** *** ** * * * *** * ** ** ***** *** **** * TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG TRY.BR_B GGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCC-CACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA ** * * ** **** *** ** ******* ** ** *** * ** * ** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCG--AGGCGGT * *** * *** * ** ** ** *** * ** * ** * TRI.AE_B CATCTTT TRY.BR_B TT-----
Mean pairwise ID: 47.56%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT * ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * *** * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** * ** * * ** * ** ***** * * * ** * *** ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA CAN.SPE. GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGA---GACCC *** ** ** ** * * * **** ** * * *** **** ARA.TH_C TCACTTT CAN.SPE. CGTCTCT ** *
Mean pairwise ID: 47.56%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** ** * ** *** ** **** ** ** * *** * * ** GAL.GAL. CGCT--TG-AGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGC--CCGCCCGTTCC **** ** *** * * * **** *** *** **** * ** ** *** * GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGG-TGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGT *** * * * ** * * * * * ** * * * *** * GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTA TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** GAL.GAL. ACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTA-CTCCAGCA **** * *** ** * * * ** **** * ** * ** * * * GAL.GAL. TGTCTCC TRI.AE_A GACCACC * **
Mean pairwise ID: 47.57%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG-TCTATATGTGG-CAT--AAACAATGTAGGTTGT ** * ***** * * * *** *** * ** *** * *** * * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-AGTGTGCCCGCTCCAAAC ** * * ** * * * * * ** * ****** ***** ZEA.MA_F TGGTTGTGGCT--GGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC- TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAG---GACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCT ** *** ***** * * * * * * * * * ** ** ZEA.MA_F -AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTGTTGTGGTGG *** * ** * ******** ***** *** ** *** *** **** ***** ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC TET.THE. AAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTA----CTATCAAAGCCAGAC ********* * * * ** * * ** * ** * ** ** * * ZEA.MA_F ACCATCTTT TET.THE. ATT------ *
Mean pairwise ID: 47.57%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT **** ** ** * ** **** **** * * ** * * * * * LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** * *** ***** * *** **** * ** ** * *** LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *** LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGAC- **** ** * * *** * * ** * ***** * * * ** LYC.ES_I ACCATTTTT RAT.NOR. -CCGTCTCT ** * * *
Mean pairwise ID: 47.59%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * * * ** ** * ** *********** *** * * *** ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTT-GGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAA FUG.RUB. GCTTGAGCTCA--GGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * ** ******* * ** ** ** * * ** ** * ** LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTC--CTAAAGCG FUG.RUB. GTTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG * * * * * * * ** * * * *** * ** **** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG *** * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA **** * * * *** * * * *** * ** ** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT FUG.RUB. CT-CAGTCTTT * * ****
Mean pairwise ID: 47.59%
ZEA.MA_D -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGCGGAT LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC * ******** * * *** * * * * ** * ** ** * *** ZEA.MA_D TCTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC LEI.MAJ. CAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTT--GACGTG----GTGCTCT------GCTTGGCTGT-- * ** ** *** * * * * **** * ** ** * ** ZEA.MA_D CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT LEI.MAJ. -GTGTCGGT-GTGGCTTGCC----CCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGC ** *** ****** ** * ** ** * * * *** ***** ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT LEI.MAJ. GA-GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCGTT * **** * ** **** ** ** ******* * * * * * * *** ** * ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG LEI.MAJ. GC-AGAATCACACCGCGGAGCATGTC----CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAG * ** ** *** ** *** ** * *** **** ** ** * ** ZEA.MA_D ACCACCATCTT LEI.MAJ. CCTT------- *
Mean pairwise ID: 47.59%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * ** * ** ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ***** * ** * * ** ** ** ** * * ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG CAN.SPE. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** * ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA CAN.SPE. GGGA-------TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGT-GCAACATAGCGAG *** *** * * * ***** *** * * *** ARA.TH_G ACCACCATTTT CAN.SPE. ACCCCGTCTCT *** * * *
Mean pairwise ID: 47.59%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTA--TCAAAGTGGTTGA CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG **** ** * ** ** * * * * *** * ** **** * * **** ** CIN.HYB. ACTTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCA CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCG-ACCGAGC--GTCCGTGCCA * * *** * * * ** *** ** ** *** ** * **** *** CIN.HYB. AGTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCG CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT--GGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** * * *** **** ** * * * * ** CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAG-ACAAAAGCCACCGCGCGGTG-CAGTGG * ** *** * *** * ** * *** ** * * * * **** CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA CAE.EL_B CCGGACTGC--GCTTGTGAGTT---GACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC *** * * ** * * ** * * * **** ****** * ** *** CIN.HYB. CACCCATTT-- CAE.EL_B CACTTGTTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 47.59%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * *** * *** ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA RAT.NOR. -TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_A AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * * ** ** *** * * ** ** ** * * * ** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA RAT.NOR. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGA ***** ** * * * ** **** ***** ** * * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT RAT.NOR. CCCGTCTCT-- ** * *
Mean pairwise ID: 47.60%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG--TCTATATGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT ** * ***** * * * *** * * * ***** * ** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA *** * * * * * * * * * ****** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCT-AGTAATAGG---ACTCCACCAGGGCATTAAAGA *** *** ** ** * * ** ** ** * * * * ** ZEA.MA_E GC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGG TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCG-CTTGTTGTGG ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** **** *** ** ZEA.MA_E TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA TET.THE. TGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAA-TCGGTTCTA----CTATCAAAGCC *** ******** * * *** * * ** ** * * * ** * **** ZEA.MA_E GACCACCATCTTT TET.THE. AGACATT------ **
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * **** * *** *** * ** *** LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGAC-ACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG---- * *** ** * * *** * ** * * **** * * ** ** LYC.ES_I ACCACCATTTTT- CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ***** ****
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G ****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * ** *** * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * *** * * * ***** ** ** * ** **** ** LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * ** *** *** * **** * * *** * *** * LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ****** * * * * * **** ** *** **** * ******** LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTG-ACACGTATAC--ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC * *** * ** * ** * * ** * * * ** * * ** LYC.ES_C AACTACCACATTT CAE.EL_C ACTTGTCACT--- * * ***
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * ** * *** * LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** * LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGG * ***** * *** * * **** **** * **** * ********* LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA CAE.EL_A CCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACCA *** ** * *** ** * * * **** * * * ** * LYC.ES_E ACTACCACATTTT CAE.EL_A CTTATCATTT--- ** ** *
Mean pairwise ID: 47.60%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC * ** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG RAT.NOR. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA RAT.NOR. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGG----CAACATAGCG * * **** * *** ** * * ** *** * * * **** ZEA.MA_B AACCACCATCTTT RAT.NOR. AGAC-CCGTCTCT * * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * ** * *** ** LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** * LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ***** * * * * * **** **** * **** * ******** LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_D GCCGGACCGCG--CTTGTAAGTTG-ACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC * *** ** * ** ** * * * **** * * ** ** LYC.ES_G AACCACCACTTTT CAE.EL_D ACTTATCATTT-- * * ** **
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ***** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * * LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGT CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** * LYC.ES_E ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA--AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG * ****** * *** * * **** **** * **** ********* LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA CAE.EL_B CCGGACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAG---- *** ** * *** ** * * * * **** * * ** LYC.ES_E ACTACCACATTTT CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ** ** ****
Mean pairwise ID: 47.60%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGT-----GAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT *** * ** *** * ** *** **** * ** * * * * * CAE.BRI. GATGGAGTGAAGGGAGGA-GTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCC-CGCCCGT---TCCAAG * ** ** * * * * * *** * *** * * * ** *** *** * CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTT---ATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG * ** **** **** * * *** ***** ** *** * ***** * CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT * **** ** *** * * ***** * ** **** * ** CAE.BRI. GGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCAC--AGCCTCTCTG---ATACCTTCAG TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG ** ***** * * ** *** * ***** * * * ** *** CAE.BRI. ACCACTTGTCATT TRI.AE_A ACCACC------- *****
Mean pairwise ID: 47.60%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * * *** * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * *** * * * ***** * *** * ** **** ** LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * * *** *** * * ****** * * *** * *** * LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ***** * * * * * **** ** *** **** ******** LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAA-GTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC * *** ** ** ** * * ** * * ** * * * ** LYC.ES_C AACTACCACATTT CAE.EL_D ACTTATCATTT-- * ** ** *
Mean pairwise ID: 47.62%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA * ** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG RAT.NOR. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * *** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG RAT.NOR. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * ** * * * ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG RAT.NOR. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA----ACATAG ** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** ** ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT RAT.NOR. CGAGAC-CCGTCTCT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.62%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC ***** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** * ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA RAT.RAT. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG ***** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG RAT.RAT. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * * ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG RAT.RAT. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGGGCAACATAGCGAGA * * **** * *** ** * * ** ** *** * * **** * ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT RAT.RAT. CC--CCGTCTCTT-- * ** * **
Mean pairwise ID: 47.63%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGT-GGATG ****** ** *** ****** * * * * ** **** ***** ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTAT--GCGGCCCGCCCGTT CAE.EL_B GA-----GTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG ** * * * * *** * *** *** ** * * * ** **** ORY.SA_B CCAAGT--TGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTA CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGG-TCAGTCCCGGGTGCATAAG ***** ***** * * * * * ** ** ** ** * **** ORY.SA_B GAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAAC CAE.EL_B GAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGA-CAAAAGCCACCGCGCGGTGC-AGT ****** ** * * * ** * **** ** ***** ** * * * ORY.SA_B GGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATG CAE.EL_B GGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG--ACACGTATACACAGCCTTCTCAA-TACCTTC---- ** * * * * ** * * * * ** * *** * ***** ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT- CAE.EL_B --AGACCACTTGTTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 47.65%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC **** ** * * *** * * ****** ***** *** * * * ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGG CAE.EL_B ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC------G **** *** * ** * * * * * *** ** *** * * ZEA.MA_E TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG-- CAE.EL_B CGGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATAC ** * * ** **** *** ** * ** ***** ** ZEA.MA_E ---CAGACCACCATCTTT- CAE.EL_B CTTCAGACCACTTGTTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 47.68%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** *** * *** GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG * ** ** *** * * *** * ** ** * * *** GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG-G LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG * * ** * *** ***** * * * * * * *** * ** * GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCAG * ******* **** ************** ** * * * * * * * ** * * GAL.GAL. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCTGTCT LEI.MAJ. AATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT---- *** * ** * * * * *** **** ** * * **** ** * GAL.GAL. CC LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 47.73%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TAAGTGTGGATG **** * ** ** * ****** * ** * *** * * * ** ** LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** ***** LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGG CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** LYC.ES_K CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* * LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC ** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** LYC.ES_K CCACCTTT CAE.EL_B TTGTTTTT ***
Mean pairwise ID: 47.73%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TAAGTGTGGATG ***** * ** ** * ****** * ** * *** * * * ** ** LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** ***** LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** LYC.ES_A CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** * * * * * ***** ** ** **** * ********* * LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC ** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** LYC.ES_A CCACCTTT CAE.EL_B TTGTTTTT ***
Mean pairwise ID: 47.73%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TGAGTGTGGATG ***** * ** ** * ****** * ** * *** * * ** ** ** LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** ***** LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** LYC.ES_J CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* * LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA CAE.EL_C GACAGC--GCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC ** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** LYC.ES_J CCACCTTT CAE.EL_C TTGTCACT * *
Mean pairwise ID: 47.73%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC-- TET.THE. ----GCCAGGGTAGCAATA-CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGTGA * *** ***** * *** * ** ** ** *** ** * ** ** ARA.TH_F TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * ** * * * * * ** * ** * ***** ***** * ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTG-AGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG ***** ** ** * * ** * * * ** ** ** * * ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG TET.THE. GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG * ** ** * ******** ***** *** ** **** ****** * ***** ** ARA.TH_F ATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC TET.THE. ATAACATACTCATTAACTGTCA-AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT---- ** ** * * * *** *** * * * ** ** * * ** ARA.TH_F ACCATTTT TET.THE. --------
Mean pairwise ID: 47.74%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ***** ** ** * ****** * ** * ***** * * * ARA.TH_G GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTG--GACTGCCCAATCCAAG CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCA-ACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * * *** * * *** **** ** * *** ** * ** ***** ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * ** ** * * * * ** * * * * *** *** **** * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG CAE.EL_C TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG * ** * * * * * ***** * * * **** * ******* ** ARA.TH_G GACAACGGTT-CGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTG-- **** ** ** ** **** ** *** ** * * ** **** ARA.TH_G CCACCATTTT CAE.EL_C TCACT----- ***
Mean pairwise ID: 47.74%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * * ** ** **** ** ********* * ** * ** * ** LYC.ES_H TGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC XEN.LAE. CTTGA-GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * *** LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGGG XEN.LAE. TCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * *** LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * * * **** * * **** * LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA XEN.LAE. GGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACACA **** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * *** LYC.ES_H ACCACCTTTT XEN.LAE. GTTCT-----
Mean pairwise ID: 47.74%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG----TGGAGACAATAAGGGGATGGGAC RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGA- * ** * * ** *** ** *** *** ** * * ** * *** * *** ARA.TH_C GTTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCC RAT.RAT. --TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * * * ** ** * * ** * ** ***** * * * ** * ARA.TH_C AAGTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTG RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ***** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * * ARA.TH_C GGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA RAT.RAT. TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC-ATAGCGAG-ACC **** ** ** ** * * * **** ** * * *** ARA.TH_C CCATCACTTT RAT.RAT. CCGTCTCTT- ** ** ***
Mean pairwise ID: 47.74%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTAAGATGGTGGGAC RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * *** * *** ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCA RAT.NOR. -TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** ** * * ** * *** *** ** *** * * ** ** * * ARA.TH_F AGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTT-CTAGAGTCGG RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * * ** ** * * ** * * * ****** * ** ** ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA RAT.NOR. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--ACTGCACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAGAC ***** ** * * * ** **** ***** ** * * * ** ARA.TH_F CCACCATTTT RAT.NOR. CCGTCTCT-- ** * *
Mean pairwise ID: 47.76%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGA- * ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** * * * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC ORI.CUN. --TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** * ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT ORI.CUN. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG ORI.CUN. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG ORI.CUN. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAG * ***** * * * * ** **** ***** ** * * * * ARA.TH_E AACCACCATTTT ORI.CUN. ACCCTGTCTCC- * ** *
Mean pairwise ID: 47.76%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT **** ** ** * ** **** ** * *** * * * * *** LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGC-CCTATCCA GAL.GAL. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTA-TGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT * * * * * ** ****** *** **** * * ** ** * * LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG * * * * ** *** ** * * ** ** ** ** ***** * * LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAA ***** **** *** ** ** ***** ****** *** * **** LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA GAL.GAL. CGGGATCGCG--CCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACAT-AGCGAG **** ** ** *** * ** * * * ***** * * * LYC.ES_G ACCACCACTTTT GAL.GAL. ACCCTGTCTCC- *** **
Mean pairwise ID: 47.76%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGC * * * * * ******** * *** * ** ** HUM.LU_A TGGGTCAACCTA-GTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCA-TTCCAA LEP.COL. TGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGAC---GTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT ** * *** * * * * * * *** * * ** ***** * HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA LEP.COL. GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGT--TAAAGTAGA * *** * * * *** * ****** * * * *** ** *** ** HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGA LEP.COL. GGA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC ** * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** * HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG LEP.COL. AGAACCACA---CCGCGGAGCCTGTCATCACC-TGCGCC-CCAGGC-GATCCT--GTGAA ** * ** * * * **** **** *** * * **** ** ** * HUM.LU_A ACCATTTCTTTT LEP.COL. GCTTT------- * *
Mean pairwise ID: 47.76%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * * ** * * ** *** * ** * ** * * ***** *** LYC.ES_G AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCA * ** *** * * *** ** * ** * * * * ** *** LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGG-GCTACTAGATTCCTAAAGTG CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTC-TCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG *** * * ** * ** *** * * *** *** * * * * * *** * * LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG **** ** ** *** * * **** **** * **** ********* LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA CAE.BRI. CCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCA ***** ** * * ** * ** * **** * ** ** * LYC.ES_G ACCACCACTTTT CAE.BRI. CTTGTCATT--- ** *
Mean pairwise ID: 47.76%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * ** * *** ** LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** * LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ***** * * * * * **** **** * **** * ******** LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATAC-ACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACC * *** ** * ** ** * * * **** * * ** ** LYC.ES_O AACCACCACTTT CAE.EL_D ACTTATCATTT- * * ** **
Mean pairwise ID: 47.77%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** ** * ** *** ** **** * *** *** * ** * * ZEA.MA_F TGTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTT GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGC-TATGCCG--AGCGGGCGTCCGCGCT * ** * * * ******** * * * **** ** *** * * ** * ZEA.MA_F CCAAGTTGGTTGTGGC-TGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGA GAL.GAL. A-AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG---GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA * * ** ***** * * **** *** *** * *** * ZEA.MA_F AGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAAC GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGGTC * ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * ZEA.MA_F GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAAC GAL.GAL. AGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG-CCTGGGCAACAT--AGC ** **** * *** ** ** ** * ** * * ** * ** *** * * ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT GAL.GAL. GAGACCCTGTCTCC * * ***
Mean pairwise ID: 47.77%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC **** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG RAT.RAT. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG RAT.RAT. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA RAT.RAT. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGG----CAACATAGCG * * **** * *** ** * * ** *** * * * **** ZEA.MA_B AACCACCATCTTT- RAT.RAT. AGACCCCGTCTCTT * * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.77%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG * ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * *** * ** ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * * *** * ** * * *** ** ** ** * * ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG RAT.NOR. AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** * ARA.TH_G CGGACAACG---GTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT RAT.NOR. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC-ATAGCGAGACCCGTC *** ** ** ***** * **** *** * * ** ***** ARA.TH_G TGAACCACCATTTT RAT.NOR. TCT----------- *
Mean pairwise ID: 47.77%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** * ** * * ** *** * **** ** ** * *** HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT--CCTAAAGCGG HOM.SA_B TTCGGCATCAA--TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * ** *** * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** ** ****** ** **** * HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATA HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAA---CATAGCG **** ** *** *** * **** * ** ****** * ** HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT HOM.SA_B AGACCCCGTCTCT- **** *** *
Mean pairwise ID: 47.78%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGC-CGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * **** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGAGCGGGC-GTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** * * *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG--GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCT * *** * * * * ** * * *** ** * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA GAL.GAL. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA GAL.GAL. CAGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG--CCTGGGCAACAT--A * ** **** ** *** ** * * * ** * ** ** * ** ** * ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT GAL.GAL. GCGAGACCCTGTCTCC ** * * ***
Mean pairwise ID: 47.78%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA **** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG RAT.RAT. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * *** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG RAT.RAT. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * ** * * * ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG RAT.RAT. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA----ACATAG ** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** ** ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT- RAT.RAT. CGAGACCCCGTCTCTT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.80%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_G TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_G CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC **** ** * * *** * * ****** ***** *** * * * ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGT CAE.EL_B ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC-----GC **** *** * ** * * * * * *** ** ** * * * ZEA.MA_G GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG--- CAE.EL_B GGTGCAGTGGCCGG--ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACC ** * * ** **** *** ** * ** ***** ** ZEA.MA_G --CAGACCACCATCTTT- CAE.EL_B TTCAGACCACTTGTTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 47.80%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC-------TAACCAGGCTTAG * * * * ******** ****** ** * *** * HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC LEI.MAJ. CGGGGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGC * * ***** * * *** ** ***** ** * *** * * * ** HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCC----TAGAGTGG LEI.MAJ. TGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGA--GGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG * * ** ** ** * ** * ** **** **** * *** * ** * HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGG LEI.MAJ. AGGGAACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTG **** * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * HUM.LU_D AAGGATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCA----CCATGCTTCACTGGGCTGACTCTT LEI.MAJ. CAGAATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-- ** ** ** *** ** * * * * *** ***** * * * ** HUM.LU_D AATAGGACCATTTCTTTT LEI.MAJ. ------------------
Mean pairwise ID: 47.83%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC **** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG ORI.CUN. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-CGATCACTCGCCCACTT-CCAAC ORI.CUN. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT ** *** * *** ** ** ****** * **** * ** ** ZEA.MA_B GGTGGGAGGA------TAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACA-CAGACCCAGATCCT ORI.CUN. AGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCT ****** * * **** ******* * ** ** * * *** *** ZEA.MA_B CTCTTAGCAAACCACCATCTTT ORI.CUN. GTCTCC---------------- ***
Mean pairwise ID: 47.87%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT TET.THE. -----GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATA--TGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT ** * * * * *** * * * ***** ** **** * TRI.AE_A GTTG--TAGCGC-TGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGT-TTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA-- * * *** ** * * ** * * ** * ** * ***** ***** TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCC-TGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCAC--GGTCCATAATGTG TET.THE. ---ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAG * ** ** *** * * * * ** *** ** * *** * * TRI.AE_A GCAGGCACA-GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG TET.THE. CTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTG * * * * ** * ******** ***** *** ** **** ****** **** TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA TET.THE. GAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT ********* * * *** * * *** ** ** * * * * ** TRI.AE_A CCACC TET.THE. -----
Mean pairwise ID: 47.88%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAG-TGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT * ** * * ** **** ** *** *** ** * * * * ***** * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * ** * ** * * ** * ** ***** *** * ** * *** ARA.TH_C TTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ** ** * * * * ** * ** * * ** ** *** * **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** *** ** ** ****** * ****** ** * ** * * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA HOM.SA_B GATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGACCC *** ** ** ** * * * **** ** * * * **** ARA.TH_C TCACTTT HOM.SA_B CGTCTCT ** *
Mean pairwise ID: 47.88%
ZEA.MA_F -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTA-----GCGGGGAGGACG * ******** * * *** * **** * ** * * ** * *** * ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA LEI.MAJ. TGGACCAGCGAGGG-TGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCT---CTGCTTGGCTGTGT--- * * ** ** ** * * *** ** * ** ** * ** ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LEI.MAJ. GTCGGT-GTGGCTTGC---CCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGA-G ** *** ****** * * * ** *** * ** * ******* ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGCCCAC-CCCACGCACGTCCGCCGTTGC-A ** * * ** **** ** ** ******* * * * * * * *** ** ** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCATGTC---CGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT- * ** *** ** **** * * ** * * ** ** ** * ** * ZEA.MA_F CATCTTT LEI.MAJ. -------
Mean pairwise ID: 47.90%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT * * * * * * ** * * * * ** * *** ****** ******* ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGGT **** * ** * * * *** * *** * * *** *** ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * * ************* *********** *** * * ***** ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACT--ATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAAC-TAAAC ** **** * ** * * *** * * * **** *** * * ** * * *** ARA.TH_A CACCATTTT LYC.ES_L CACCACTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 47.90%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAG----TGAGGGTATCAAAGTGGTTGAAC FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ***** *** *** * ** *** **** ** * * * * *** ** * CIN.HYB. -TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAA FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGG--AGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA ******* * ** * * ** * *** * * * ** **** * ** CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG FUG.RUB. GTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGG-GGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG ** * * * * ***** * * ** * ** * * * * * ** CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTC-TACCTCTCGACTGTGG FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA---GTAG ** ** * *** ** * ** * ** ** * * ** *** ** * CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC FUG.RUB. TGGGATCGCGCCCGTGAAT-----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC **** * * ** * ** * * ** **** ** * ** * **** CIN.HYB. ACCCATTT- FUG.RUB. TCAGTCTTT * **
Mean pairwise ID: 47.90%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** ***** ****** * ** * * * * ********* TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGT-GATGTA-ACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA CAE.EL_A --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA *** * * * **** * *** * *** ** * * * * **** **** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC-CTTAAGTGGCA CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTC * ** * *** * ** *** ** * ** * **** * TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG CAE.EL_A GTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCA-GACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGG * * *** * ** * * * * **** * * **** ** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC CAE.EL_A ACCGC-----GCTTGTGAGTTGACACACA-TACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCAC * * *** * * * * * * * ** *** * * ******** TRI.AE_B C-ATCTTT- CAE.EL_A TTATCATTT *** **
Mean pairwise ID: 47.91%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * * * ** ** * ** *********** *** * * *** ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * ** ******* * ** *** * * ** ** * ** LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** *** ** * ** *** ** * * * *** * ** LYC.ES_H GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT ** * * *** ** ** ***** * *** **** * * **** * LYC.ES_H AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC **** * * * *** * * * *** * ** ** * * ** LYC.ES_H AACCACCTTTT FUG.RUB. --TCAGTCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 47.91%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT **** ** ** * ** **** ** * *** * * * * *** LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_I GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_I AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** * * * * LYC.ES_I CCACCATTTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT ** * * **
Mean pairwise ID: 47.91%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGT-----GGGGACTATAAGATGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT * ** ** ** ** * ** **** ** ** *** * * *** *** ARA.TH_G CACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * ** ** * ** * ** * *** ** ** ** * * ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** * ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA HOM.SA_A GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC-- *** ** * * * * * **** * * * ** * ** * * ARA.TH_G ACCACCATTTT HOM.SA_A -CCGTCTCTT- ** * **
Mean pairwise ID: 47.91%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** ** * ** *********** *** * * *** ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTT-GGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAA FUG.RUB. GCTTGAGCTCA--GGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * ** ******* * ** ** ** * * ** ** * ** LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTC--CTAAAGTG FUG.RUB. GTTCGGTATCGA--TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG * * * * * * * ** * * * *** * ** **** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG *** * *** *** ** ** ***** * *** **** * * **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA **** * * * *** * * * *** * ** ** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT FUG.RUB. CT-CAGTCTTT * * ****
Mean pairwise ID: 47.92%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G **** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_D GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * *** * * ** * *** ** LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_D CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_D GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * ***** ** *** **** ******** LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA CAE.EL_D GCCGGAC--CGCGCTTGTAAGTTGACACACATA-CACAGCCTTCTCGATACCTTCA--GA * *** * * ** ** ** * * **** * * * ** ** * LYC.ES_H ACAACCACCTTTT CAE.EL_D CCACTTATCATTT ** * * ***
Mean pairwise ID: 47.92%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * ** *** * LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** ** LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ****** * * * * * **** **** * **** ******** LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC * *** * ** * *** ** * * * * **** * ** ** LYC.ES_G AACCACCACTTTT CAE.EL_C ACTTGTCACT--- * ****
Mean pairwise ID: 47.92%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT-----GGGGGCAACAATGTGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT **** ** ** ** ** **** ** ** *** * * * *** LYC.ES_F TG-TTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAG---GAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * *** ***** ** ****** * * **** * * ** ** * LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGT RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * *** ** * * * **** ** ** * LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG RAT.RAT. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA *** ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** LYC.ES_F GAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTA RAT.RAT. GTGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGA * ***** ** * *** * * * ** * **** ** * ** * LYC.ES_F AACCATCACTTTT RAT.RAT. GACCCCGTCTCTT *** ** **
Mean pairwise ID: 47.94%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGCCCGC **** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** * ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGG--TCTGCGC--CTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGT GAL.GAL. CGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGC * * *** *** ** ** **** ** * *** * * **** * * *** ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG GAL.GAL. GCTAAGGCCGGCATCA-ATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAA * *** * * * * *** * *** ** ** * * * **** ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG GAL.GAL. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCA * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * * ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGG GAL.GAL. GTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAA----TAGCC-ACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAG ** **** ** *** ** * * *** ** * * ** *** * ORY.SA_B CAGACCACCACCTTT GAL.GAL. CGAGACCCTGTCTCC * * * **
Mean pairwise ID: 47.94%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * * *** * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * *** * * * ***** ** ** * ** **** ** LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * ** *** *** * **** * * *** * *** * LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ****** * * * * * **** ** *** **** * ******** LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCA-ACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTT CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTG-ACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCT-------TC * *** ** * ** * * ** * ** *** * ** * LYC.ES_C AAACTACCACATTT- CAE.EL_B AGACCACTTGTTTTT * ** ** ***
Mean pairwise ID: 47.94%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC----TGGA *** ** ** *** * ** *** ** * * *** ****** **** TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCC---TGCCCGTT HOM.SA_A GGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCG-CTATGCCGATCGGGTGTCCGCA * * * * ** * ** *** ** * *** * * ** *** TRI.AE_B CCAAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAA HOM.SA_A CTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG * ***** * * **** * ** *** * **** *** * TRI.AE_B GTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGG HOM.SA_A GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * * TRI.AE_B TGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC HOM.SA_A TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGTGC-AACATAGC * * **** * *** ** * * *** * *** * ****** TRI.AE_B AGACCACCATCTTT- HOM.SA_A GAGACCCCGTCTCTT * ** *** *
Mean pairwise ID: 47.94%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCAC ***** ** * ** ***** * * *** ** * * * * ** *** * ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA ORI.CUN. TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG ***** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG ORI.CUN. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * * ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG ORI.CUN. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGGGCAACATA-----G * * **** * *** ** * * ** ** *** * * **** * ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT ORI.CUN. CGAGACCCTGTCTCC * * * * *
Mean pairwise ID: 47.94%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA **** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG ORI.CUN. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * *** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG ORI.CUN. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * ** * * * ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG ORI.CUN. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCA----ACATAG ** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** ** ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT ORI.CUN. CGAGACCCTGTCTCC * * * * ***
Mean pairwise ID: 47.95%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGC-CGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * **** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGAGCGGGC-GTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** * * *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG--GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCT * *** * * * * ** * * *** ** * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA GAL.GAL. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGG * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA GAL.GAL. TCAGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG--CCTGGGCAACAT-- * ** **** * *** ** * * * ** * ** ** * ** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT- GAL.GAL. AGCGAGACCCTGTCTCC *** * * ***
Mean pairwise ID: 47.95%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGC-CGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * **** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG GAL.GAL. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGAGCGGGC-GTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** * * *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT GAL.GAL. CGCTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGG--GGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCT * *** * * * * ** * * *** ** * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA GAL.GAL. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCCGG * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA GAL.GAL. TCAGTAACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAG--CCTGGGCAACAT-- * ** **** ** *** ** * * * ** * ** ** * ** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT GAL.GAL. AGCGAGACCCTGTCTCC *** * * ***
Mean pairwise ID: 48.04%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATAT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG * *** * ** *** * * * **** * *** ** *** ***** LYC.ES_K TGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC TET.ROS. TCAG----AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG * * * * ** * * * * * ** * * ***** ***** ** LYC.ES_K AGAGTAGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG-G **** * ** * ** * * * * * * * * *** * * * LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TET.ROS. AACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ***** * ******** ***** *** *** * * ***** ** ********* LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACACT *** * * ***** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_K ACCTTT TET.ROS. ------
Mean pairwise ID: 48.05%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGA-GACATCAAAGTGGTTGAATATT CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGA-TAAGTGTGGATG ***** * ** ** * ****** * ** * *** * * * ** ** LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCAAG CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG * * * ** ** ** * ** * * * * ** * ** ***** LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG * * * ** ** * * *** ** * * * * * *** * * ** LYC.ES_J CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG CAE.EL_B TGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** * * * * * ***** ** *** **** * ********* * LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA CAE.EL_B GAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--ACCAC ** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * ** LYC.ES_J CCACCTTT CAE.EL_B TTGTTTTT ***
Mean pairwise ID: 48.05%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCG-GATC * ** * * ** ** * ** *** ***** * * *** ** * * ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTC-TGGCCCGCCCATTCCAAGT XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT * * ** ** * * ** * ** ***** * * * * ** * **** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTC-TCATGTC-TTCTAGAGTGGG XEN.LAE. TCGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG * ** * * * * * * * * ** ***** ** ** ** **** * *** ARA.TH_C GGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAA XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG * **** *** ** ** ****** * * **** * * ** * ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC XEN.LAE. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCC---TGAACAACAC--AGCGAGAC **** ** ** ** * * * ** * ** * * * * * * * * ARA.TH_C ATCACTTT XEN.LAE. ACAGTTCT * * *
Mean pairwise ID: 48.05%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATC-CAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT-- * *** * ** ***** * * **** ** ** * * ** ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT TET.ROS. -AGTCAGAGTATGAGAGTTTGAT--GAGACAGTTTGC-TAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC *** * * * * * * * * * * * **** ****** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCA-TGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG * ****** *** * ** * * * * * ** **** * * ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG TET.ROS. GA-ACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG ** ***** * ******* ***** *** * ** * ***** * ******** ARA.TH_C GATTACGGGC-CATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGC------TAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACA *** ** * **** ** * *** * * * * ** ** *** *** ARA.TH_C ATCACTTT TET.ROS. CT------ *
Mean pairwise ID: 48.06%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAG-TGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * * * ** ***** * * * LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCT-TGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * * * * * ***** * * **** *** ** ** * *** LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAA-GTATAGCCACTTGGCC-TTTAGAGTGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * * *** ** * * * **** ** ** * *** LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ** * *** ** ** ***** * **** *** **** * LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC HOM.SA_B GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCACTGC--ACTCCAGCCTGA---GCAACATAGCGAGAC ***** ** * *** * * * ** * ***** * * ** * ** LYC.ES_F CATCACTTTT HOM.SA_B CCCGTCTCT- * ** *
Mean pairwise ID: 48.06%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG---GGGGCATTAATGTGGTGGAATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG **** ** ** *** ** ***** *** * ** * ** ** *** * LYC.ES_I TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * *** LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * ** LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT ** * * * *** ** ** ***** * ** ** * * * ** * LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAA-----CACAGCGAGA **** ** * * *** ** *** * ****** * * * LYC.ES_I CACCATTTTT XEN.LAE. CACAGTTCT- *** ** *
Mean pairwise ID: 48.06%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT TRI.AE_C --------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTT * *** **************** ZEA.MA_C G-GTAGTGG-CCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC TRI.AE_C GAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT--TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC * ******* *** * * ** * *** * * ***** ** * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA *** ** *********** **************** ****** *** ********** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCC--TACTCCAGC-GAC ******* **** ***** * ***** * * * **** *** *** ZEA.MA_C CACCATTTTT TRI.AE_C CACCATC--- ******
Mean pairwise ID: 48.06%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG---GGGGCATTAATGTGGTGGAATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ** ** ** *** ** ***** *** * ** * ** ** *** * LYC.ES_B TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** * ** ****** ** **** * * ** ** * *** LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT--CGTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** *** ** * ** *** ** * ** *** * ** LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT ** * * * *** ** ** ***** ** *** * * * ** * LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGA---ACAACAC--AGCGAGA **** ** * * *** ** *** * ****** * * * * * LYC.ES_B CACCACTTTT XEN.LAE. CACAGTTCT- *** * *
Mean pairwise ID: 48.08%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTG--TCTATATGTGGCAT--AAACAATGTAGGTTGT ** * ***** * * * *** * * * ***** * ** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAA *** * * * * * * * * * ****** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TET.THE. ACAATGAGTTGCTATGGTGGTAACCT-AGTAATAGG---ACTCCACCAGGGCATTAAAGA *** *** ** ** * * ** ** ** * * * * ** ZEA.MA_D GC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG TET.THE. GCTAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTGTTGTGG ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** *** **** ** ZEA.MA_D TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA TET.THE. TGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAACTAA-TCGGTTCTA----CTATCAAAGCC *** ********* * * *** * * ** ** * * * ** * **** ZEA.MA_D GACCACCATCTT TET.THE. AGACATT----- **
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA- * ** ** ** * ** **** ** * * **** * *** * * * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC RAT.NOR. --TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** * ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG RAT.NOR. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAG * ***** * * * * ** **** ***** ** * * * * ARA.TH_E AACCACCATTTT RAT.NOR. ACCCGTCTCT-- * ** * *
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGA- * ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** * * * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC HOM.SA_A --TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** * ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT HOM.SA_A AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG HOM.SA_A GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG HOM.SA_A GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGTGCAACATAGCGAG * ***** * * * * ** ** * * ** ** ** * * * * ARA.TH_E AACCACCATTTT HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT * ** * **
Mean pairwise ID: 48.08%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** ** ** *** * ** *** ** * * *** ****** * * TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTG-ATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCC CAN.SPE. CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT ***** * * * ******* * * * * * * ** *** * TRI.AE_B AAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGT CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA ***** * * **** * ** *** * **** *** * * TRI.AE_B GGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTG CAN.SPE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * ** TRI.AE_B GAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG CAN.SPE. GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGTGC-AACATAGCGA * **** * *** ** * * *** * *** * ****** TRI.AE_B ACCACCATCTTT CAN.SPE. GACCCCGTCTCT * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA- * ** ** ** * * ** **** ** * * **** * ** *** * * ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC HOM.SA_B --TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT * * * * * *** * * * * **** ** ** *** **** ** ** * ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT HOM.SA_B AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG HOM.SA_B GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG HOM.SA_B GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC----ACTGCACT--CCAGCCTGAGCAACATAGCGAG * ***** * * * * ** ** * * ** ** * * * * * ARA.TH_E AACCACCATTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT- * ** * *
Mean pairwise ID: 48.08%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACT---TGCCCTATCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** * * ** ** * ** * * ** ** ** * * LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT ORI.CUN. CTGTCTCC---- * * **
Mean pairwise ID: 48.08%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATG----TGGGGACATTTAGATGGTGGAAC RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT--GAGGACAGAGG * ** ** ** * ** **** ** * * **** * ** * ** ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC RAT.RAT. ATCG-CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * * * * ***** * * * * **** ** ** *** * ** ** ** * ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTT-CTAAAGTT RAT.RAT. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * * * ** * ** ** ** * * * * ** * *** ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG RAT.RAT. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * * * * *** ** ** ****** * ***** * **** ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG RAT.RAT. GTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTG--CACTCCAGCCTG--GG--CAACATAGCGAG * ***** * * * * ** **** ***** ** * * * * ARA.TH_E AACCACCATTTT RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT * ** * **
Mean pairwise ID: 48.08%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATGAGTGT-G ****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * ** * * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** ** LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ****** * * * * * **** **** * **** ******** LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACC * *** * ** * *** ** * * * * **** * ** ** LYC.ES_O AACCACCACTTT CAE.EL_C ACTTGTCACT-- * ****
Mean pairwise ID: 48.09%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * ** * *** ** LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTG--AAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ****** * * * * * **** **** * **** ******** LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_B GCCGGACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--- * *** ** * *** ** * * * * **** * ** ** LYC.ES_O AACCACCACTTT-- CAE.EL_B -ACCACTTGTTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 48.10%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGTGCGGATTC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** *** **** ZEA.MA_E TTTGCGATG--GCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGT-CAACGTCGACCGAGC-GTCCGTGC ** ** * * * *** * * *** * * * * * *** * * **** * ZEA.MA_E CAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACT-GTCGGAAGA--TGGTCAGTCCCG----GGTGC **** ** * * *** * * ****** ***** *** * * * ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACG- CAE.EL_C ATAAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGC **** *** * ** * * * * * *** ** *** * * * ZEA.MA_E -GTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG CAE.EL_C AGTGGCCGGACAGCGC----TTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTT- **** *** * ** ** * ** * * ** ** * ** ZEA.MA_E CAGACCACC-ATCTTT CAE.EL_C CAGACCACTTGTCACT ******** ** *
Mean pairwise ID: 48.10%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGA----GGGTATCAAAGTGGTTGAAC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ****** *** *** * ** ** * ** * ** * **** * * CIN.HYB. TTTGAGCTTG-GCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACC--TGGCTTGCCCGTTC HOM.SA_B C----GCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCAC ***** ** ** * ** ****** * * ** *** ** *** * CIN.HYB. CAAGTCGAG----AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTA HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTT---GCCTAA **** * * * * * * * * ***** ** * * * ** * * CIN.HYB. GAATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGA HOM.SA_B GGA--GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * **** * * * *** ** ** **** * *** *** ** CIN.HYB. CTGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAA HOM.SA_B CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACT-----CCAGCCTGAGCAACATAG * ** * **** * ** * * ** * ******** * * * CIN.HYB. CAGGACACCCATTT-- HOM.SA_B CGAGAC-CCCGTCTCT * *** *** * *
Mean pairwise ID: 48.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTG----GGAGGCTGAGGCTGGCG **** * * ** *** * ******** ****** * *** * ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGA--TCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT FUG.RUB. GATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATG---TCGATCGGGTGTCCGT * * ** ** * * ****** ** * * * * * * ** **** ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATATGGT---GCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCG--- * ***** *** * ** *** * * *** * * * ** ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC FUG.RUB. CCTAAGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCC ***** * ** ** * * *** ** ** ***** * **** * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC FUG.RUB. GCTCAGTAGTGGGATCGCGC----CCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAAC-- ** ** * **** * * * * * * * * ** **** * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT FUG.RUB. -ACAGCGGGACTCAGTCTTT *** * * * * *****
Mean pairwise ID: 48.19%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAA TRI.AE_C ------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG *** ****** ****** ** **** * * * **** * **** LYC.ES_M TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGT TRI.AE_C T-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGC * ***** ** * * * *** **** * ***** ********************** LYC.ES_M GAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTA TRI.AE_C GACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTT ** * ****** * ************ *** ** ** * * ** * * LYC.ES_M ACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTTT TRI.AE_C GGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA-CCATC--- **** * * * ***** * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.22%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT * ** ** ** * * ** **** **** * * ** ** * * * * LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** *** ***** *** **** * ** ** * *** LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *** LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** * LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGACC **** ** * * *** * * ** * ***** * ** * *** LYC.ES_B ACCACTTTT CAN.SPE. CCGTCTCT- * ** *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT **** ** ** * * ** **** ** * *** * * * ** *** LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_I GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_I AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** * * * * LYC.ES_I CCACCATTTTT ORI.CUN. CC-CTGTCTCC ** * * *
Mean pairwise ID: 48.23%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA--TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** ** ** *** * ** *** * *** * ** * *** ** * * TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCT-TGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA XEN.LAE. CTTGA---GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA **** * * * ******* * * * * * * ** *** * ** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC----CTTAAGTG XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGG-GGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAG *** * * **** ** * *** *** * **** ** * * * TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGG XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG * * *** *** ** ** ****** * *** *** * * * ** * TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA XEN.LAE. TGGGATCGC--GCCTGTG----AATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAAC-AACACAGCGAG **** * *** ** * *** * * * * *** * ** *** TRI.AE_B CCACCATCTTT XEN.LAE. ACACAGTTCT- *** * *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT ORI.CUN. CTGTCTCC--- * * **
Mean pairwise ID: 48.23%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA---GGTGGCGCGGAT LEP.COL. -------GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGA * * *** ******* ******* ** * * ** ** ZEA.MA_B GCTTTGCGA--TGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCC LEP.COL. GCTGTCTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGT- *** * * * * ** ** * ***** * * ***** * * ZEA.MA_B AAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG LEP.COL. --GTCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCG--TTAAAGTA ** ** * ** * * * ** ** *** * * * * * * ** ** ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG LEP.COL. G-AGGAACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGCCCAC-CTCGCGCACGTCTGCCG-TT * ***** * ** **** *** ** ******* * ***** *** ** ** * ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAA LEP.COL. GCAGAACCACA--CCGCGGAGCCT-GTCATCACCTGCGCCCCAGG--CGATCCTGTGAAG * ** * *** **** * * * * ** * * ***** * ** * ** ZEA.MA_B CCACCATCTTT LEP.COL. CTTT------- *
Mean pairwise ID: 48.23%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC-- TET.THE. ----GCCAGGGTAGCAATA-CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGTGA * *** ***** * *** * ** ** ** *** ** * ** ** ARA.TH_A TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * ** * * * * * ** * ** * ***** ***** * ARA.TH_A TGTGAGTAATTA--GTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT---CCACCAGGGCATTAAAGAGCT ***** ** *** * * * *** * ** ** ** ** ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA * ** ** ** * ******** ***** *** ** **** ****** * ***** ARA.TH_A CGGATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA TET.THE. AGGATAACATACTCATTAACTGTCA-AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT- **** ** * * * *** *** * * * ** ** * * ** ARA.TH_A ACCACCATTTT TET.THE. -----------
Mean pairwise ID: 48.23%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA--TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGA--T * ** ** ** * ** ***** *** * *** * * ** *** ARA.TH_F TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** * * ** * *** ** ** **** * * ** ** * *** ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC-AGGTTCTAGAGTCGGAG XEN.LAE. TTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * * ** ** ** * * ** ** ** * * ***** * * ARA.TH_F GGTAATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT *** * ** *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA-TGA XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTG-------AACAACACAGCGA ***** ** * * * ** * ** * ***** * ** * ** ARA.TH_F ACCACCATTTT XEN.LAE. GACACAGTTCT *** ** *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGTGGTGGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT * * ** ** ** ** **** ** ** * **** * * * * * ** LYC.ES_N GTTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA RAT.NOR. --CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * **** * * ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** * * * * LYC.ES_N CCACCATTTTT RAT.NOR. C--CCGTCTCT * ** * * *
Mean pairwise ID: 48.23%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT CAN.SPE. CCGTCTCT--- * * *
Mean pairwise ID: 48.24%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G **** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * * ** * *** ** LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGAAATG-GACTACTT---GATTCGTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** * ** * * ** * * * * *** * LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * * *** * * * * * ***** ** *** **** ******** LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATA-CGCAGCCTTCTCGATACCTTCA--GA * *** * * *** ** ** * **** * * * ** ** * LYC.ES_H ACAACCACCTTTT CAE.EL_A CCACTTATCATTT ** * * ***
Mean pairwise ID: 48.24%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** * * ***** ZEA.MA_B TTTGCGATGGT---TTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * *** * ** ******* * * * * * * ** * *** ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT---GGTCAGTCCCGGGT----GCAT ** ** * ** ** ** *** * **** * * * ** ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG CAE.EL_B AAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCC-ACCGC--GCGGTG **** *** * * ** * * * * * *** ** *** ** * ***** ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCT-GCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAA CAE.EL_B CAGTGGCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTT-CAG * * **** * **** * * *** * ** ** * * ** ZEA.MA_B ACCACCATCTTT- CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 48.24%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** * * ****** * ** * * * * ** * * *** * LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * ** * *** ** LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** * LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ***** * * * * * **** **** * **** * ******** LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_A GCCGGACCGCG--CTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACC * *** ** * *** ** * * * **** * * ** ** LYC.ES_G AACCACCACTTTT CAE.EL_A ACTTATCATTT-- * * ** **
Mean pairwise ID: 48.26%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** *** LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGT CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTG-----TCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG- * ** ** * ** *** *** ** ** * * * ** ** LYC.ES_F CCAAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTT---GGCCTTTAG CAE.EL_C CCAAGCGCTGCGTCA--CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA ****** * * ** ** * * * * * ** * ** * ** ** LYC.ES_F AGTGGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCA CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCA * * * **** * * * * * **** * ** * **** * ***** LYC.ES_F GTGGAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCT-A CAE.EL_C GTGGCCGGACAGCG--CTTGTGA--GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCA **** *** ** ** *** **** * ** * * *** * * * * * LYC.ES_F ATTAAACCATCACTTTT CAE.EL_C GACCACTTGTCACT--- * *****
Mean pairwise ID: 48.28%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGG-CAATAAGGTGGTGTTGGATG DRO.MEL. -----GACTGGAAG-GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT----CTGATTG * * ** ** ****** * * * * * * **** ** ** ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGC-GCCT-GTGGTTTGCACTATG----CGGCCCGCC DRO.MEL. TGGGATGGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTC * * * ** * **** *** * ** * * ** *** *** ** * ORY.SA_B CGTTCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGC-AC DRO.MEL. CGCACTAAGCT-TGCCATCAATATGGG-TGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGG ** * *** * * * **** *** ** * ** * ** * * * ORY.SA_B CTAGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCC DRO.MEL. CTAAGGAGGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTA *** * ** * * * * *** *** * ****** * * **** ORY.SA_B AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCC DRO.MEL. GGCAGTAGTGGGATAGCGTACCGGAGTGGACT---GCCGTTATCAGCCCAACCGATATGG * ** * ***** ** *** * * * *** * * ****** * * ORY.SA_B ATGGCAGACCACCACCTTT DRO.MEL. TTGG---ACCACAATCTTT *** ***** * ****
Mean pairwise ID: 48.35%
YAR.LI_B AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTTCTG SCH.POM. CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGG----TG *********** ** **** **** * * * * * ** ***** ** YAR.LI_B GACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCTCGG SCH.POM. GTCTCGGGTTCGAGTCTCGCTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGT-AG * *** * * * * * * * * ** * * ** ** * * * * * YAR.LI_B TCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGAGCA SCH.POM. TCTTCGTGG-CAACTGGCAGTTAAACCGTGTAGTACCGATGGAGGT-TGGAAACAATGCA *** ** * ** ** * * * ** * * * * * * *** YAR.LI_B ATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTATATG SCH.POM. CATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCG-ATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCAGGATGTG ** * * * ** *** * ** *** ****** ** * * * ** ** YAR.LI_B TTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC--- SCH.POM. C-ATGGAAG-----TATAAACACAACGGTCGTT ******* * ** *** ** **
Mean pairwise ID: 48.38%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT * * * * * * ** * * * * ** * *** ****** ******* ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG **** * ** * * * *** * *** **** * *** * ** * * ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************* *********** *** * * ***** ******** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACT--ATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAAC-TAAACC * **** * ** * * *** * * * **** *** * * ** * * **** ARA.TH_F ACCATTTT LYC.ES_L ACCACTTT **** ***
Mean pairwise ID: 48.38%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACC-CGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGT TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT ** * * * * ** ******* ** **** ** ** ** ** * * ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTG---TGCCCGTTCCAAACA ** * * * ** ** ** * ** ** ***** ***** * ARA.TH_D GTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGC-GGATTCTAAAGTCGGAGG TET.ROS. GTGAGTTG-CTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ****** ** ** ** * **** * ** ***** * ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG * * ** * ******* ***** *** ** **** ** **** * ***** ** ARA.TH_D ATCATA-GTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAG-CTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT---- ** * * ** ** *** * * * * * *** * **** * ARA.TH_D ACCACTTT TET.ROS. --------
Mean pairwise ID: 48.39%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * ******* * ** ** * ** *** *** ** ** * *** HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** ** * * * **** * ** HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** * HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCACTGCACTC-CAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC **** ** *** *** * * * **** ** * * * * ** *** HUM.LU_B CATTTCCTTT HOM.SA_B CCCGTCTCT- * ** *
Mean pairwise ID: 48.39%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG ** * * ** * ****** * ** * * ** * ** * ** * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC--TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCAAG ** * ** * * * * *** ** * ** * * * ** * ***** HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG * * ** * * ** ** * ****** * * * * ** * ** * * * HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** ** *** * * ***** * * * **** * ******* * HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTG-TCGCTCGCCCACAGCCTCT----CTGATACCT--TCAGACC **** ** * * * * * ** *** * ** **** * * ** **** HUM.LU_B ATTTCCTTT- CAE.BRI. ACTTGTCATT * ** *
Mean pairwise ID: 48.39%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG TET.ROS. GCCAGGGT-AGCAAT----GCCTGTGACCTCGT--GTGGCATAAACAATGTAG---TTAG *** * * ***** ****** *** * ***** * * * ** * HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TET.ROS. AATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA * * *** * * * * * ** * ** ** ***** ****** * HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCA-GGGCATTAAAGAGCTGAG * ****** ** * **** * *** ** * * * **** *** HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG TET.ROS. GA-ACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG * * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ******* HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT---- ****** * * * * * * * *** **** * HUM.LU_A CATTTCTTTT TET.ROS. ----------
Mean pairwise ID: 48.40%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** * ** ** * ****** * ** * * * *** * * * * * LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * *** * ** * *** ** LYC.ES_O ACAGAGTTGGATCAT-GTGGTCCAATTGAAAGAATG-GGCTA---CTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * * *** ** ** ** *** * ** ** * * * * *** * LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ***** * * * * * **** **** * **** * ******** LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACC * *** ** * *** ** * * * **** * * ** ** LYC.ES_O AACCACCACTTT CAE.EL_A ACTTATCATTT- * * ** **
Mean pairwise ID: 48.40%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATG----TGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** ** ** *** * ** *** ** * * *** ***** ** * TRI.AE_B TGCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCT-TGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCC HOM.SA_B CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT ***** * * * ******* * * * * *** ** *** * TRI.AE_B AAGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGT HOM.SA_B AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA ***** * * **** * ** *** * **** *** * * TRI.AE_B GGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTG HOM.SA_B GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ** * *** *** ** ** ****** * **** *** * * ** TRI.AE_B GAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG HOM.SA_B GTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG----CCTGAGC-AACATAGCGA * **** * *** ** * * *** * *** * ****** TRI.AE_B ACCACCATCTTT HOM.SA_B GACCCCGTCTCT * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.41%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGACAAGTGT-- * * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGC--CC---TGTCCAAG CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG ** * * * ** * * ***** * ** * ** ** **** * LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG * ** * * ** * *** ** * ** *** * * * * * *** * LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT * ** * ** ** *** * * ***** ** *** **** * ******* LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT CAE.BRI. GGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG- ** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** LYC.ES_K AAACAACCACCTTT CAE.BRI. -ACCACTTGTCATT * ** * **
Mean pairwise ID: 48.41%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC **** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG HOM.SA_A TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG HOM.SA_A AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA HOM.SA_A TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG----CAACATAGCG * * **** * *** ** * * ** *** * * * **** ZEA.MA_B AACCACCATCTTT- HOM.SA_A AGACCCCGTCTCTT * * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.41%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGT--GTGGCATAAACAATGTAG---TTAG * * ****** ****** *** * ***** * * * ** * HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TET.ROS. AATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA * * *** * * * * * ** * ** ** ***** ****** * HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGG * ****** ** * **** * *** * * **** **** HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TET.ROS. A-ACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG * ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ******** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGT--GCTACCTGG---ATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATA TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- ***** * * ** * * *** **** *** * *** ** HUM.LU_D GGACCATTTCTTTT TET.ROS. --------------
Mean pairwise ID: 48.42%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGG-GGCAATAAGGTGGTGTTGGATG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGT-GGATG *** * ** *** ** *** * * * * ** **** ***** ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCC---CGCCCGT CAE.BRI. GA-----GTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACG-GCGACCGAGCGTCCGT ** * * * *** * *** ** *** *** ** ** **** ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG CAE.BRI. GCCAAGCGCTGCGTCGC-CAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAA ***** * ** *** * ** * ******* * * ** ** * ** ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG CAE.BRI. GGAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCA * * * * * ** *** * * ***** * * * **** * ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGG CAE.BRI. GTGGCCGGATAGCG--CTTGTG-AGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTT--- **** ***** ** * ** ** * ** *** * *** ** * ORY.SA_B CAGACCACC-ACCTTT CAE.BRI. CAGACCACTTGTCATT ******** * **
Mean pairwise ID: 48.42%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA **** * ** ******** * * ** * ** * * *** * * ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG HOM.SA_A CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * *** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG HOM.SA_A GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * ** * * * ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG HOM.SA_A GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCA----ACATAG ** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** ** ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT- HOM.SA_A CGAGACCCCGTCTCTT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.42%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGACAGGAGGA **** ** *** *** ** *** ** *** * * * ** *** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCGT RAT.NOR. TCGATTGAGTCCA---GGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGC * * * * * ** ** * **** ** ** ****** * ** *** ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTA RAT.NOR. ACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCTA * ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * **** ORY.SA_B GAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAAC RAT.NOR. AGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATC * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * * ORY.SA_B GGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATG RAT.NOR. AGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGGGCAAC----ATA ** * **** ** **** ** * *** *** * * ** ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT RAT.NOR. GCGAGAC-CCGTCTCT ** * ** ** *
Mean pairwise ID: 48.52%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG-TGATA ** *** ** * * ** * **** * *** ** * * * * LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG * * ** *** * * * * ** * * ***** ***** ** * LYC.ES_K AGTAGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA TET.THE. AGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA *** * ** * ** * * * * * * * * ***** * *** LYC.ES_K C-CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT *** * ******** ***** *** *** * * ***** ** ********** LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGA ** * * **** ***** **** * * *** * LYC.ES_K CCTTT TET.THE. CATT- * **
Mean pairwise ID: 48.54%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * **** * ** * ******** ***** * ** * * * *** * HUM.LU_D GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * * * ** * ** ** * * ** * * * ** ** * * *** HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGAGG FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGGT ** * * ** ****** ** * ** * * * **** * ** * HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG FUG.RUB. GCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG ** * *** ** ** ***** * * **** * **** * ** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC FUG.RUB. AT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTA-GTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGACT ** ** *** *** * ** * * * * ** * * ** * * **** HUM.LU_D ATTTCTTTT FUG.RUB. CAGTCTTT- *****
Mean pairwise ID: 48.54%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTA-ACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACA-ATGTAGGTTGTGA-----T * * * ** * ** ** * * ** * * ** *** * *** * ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT TET.THE. AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACA * * ** * * * * * * * ** * * ***** ***** * ARA.TH_E GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGG-CTCAAAC-GGCTTCTAAAGTTGGAG TET.THE. ATGAGTT-GCTATG-GTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA ***** * ** *** ** * * * ** *** * * ** ***** * ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG ** ** ** * ******* ***** *** ** **** ****** * ***** * ARA.TH_E GATCACA-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC TET.THE. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT--- *** *** * * * *** *** * * * ** ** * * ** ARA.TH_E CACCATTTT TET.THE. ---------
Mean pairwise ID: 48.55%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCC-GGCTTGCCCATCCCAAGT LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC *** * ** * **** *** * * * *** * *** ***** ***** ZEA.MA_B -TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG *** ** * *** **** ****** ***** ** * **** ** ** ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAG-CTTCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * **** ******* *********** *** ** * ** ** * **** * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGAT---CCTCTCTTAGCAAA LYC.ES_L GGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAA ******* * * *** * *** *** * *** *** * *** * *** ZEA.MA_B CCACCATCTTT LYC.ES_L CCACCACTTT- ****** **
Mean pairwise ID: 48.55%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAG----TGGGGACTATAAGATGGTGGAAC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * ** *** ** ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGT-CGGATTTGTTGTTGGC-ATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA * * * ***** * ** * * *** ** ** ** *** ** ** * * ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTG HOM.SA_B AGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * ** * ** ****** **** * ARA.TH_G AGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGA HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** * ARA.TH_G CGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA HOM.SA_B GGGA-------TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC-TGAGCAACATAGCGAG *** *** * * * ***** *** * *** ARA.TH_G ACCACCATTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT *** * * *
Mean pairwise ID: 48.55%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT ** * * ** ******* ** ** ** * * * * ** ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** ** * * * **** * ** HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** * HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACT-CTTAATCGGA RAT.RAT. GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCAC--TGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** * * * **** ** * * * * * * * ** ** HUM.LU_B CCATTTCCTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT ** ** **
Mean pairwise ID: 48.55%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** ** * * * **** * ** HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** * HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACT-CTTAATCGGA ORI.CUN. GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCAC--TGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** * * * **** ** * * * * * * * ** ** HUM.LU_B CCATTTCCTTT ORI.CUN. CCCTGTCTCC- ** * **
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT CAN.SPE. CCGTCTCT--- * * *
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG * * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT * * * **
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT HOM.SA_A CCGTCTCTT-- * * * *
Mean pairwise ID: 48.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT ORI.CUN. CTGTCTCC--- * * **
Mean pairwise ID: 48.55%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ** * * ** ******* ** ** ** * * * * *** ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** ** * * * **** * ** HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** * HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACT-CTTAATCGGA RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCAC--TGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** * * * **** ** * * * * * * * ** ** HUM.LU_B CCATTTCCTTT RAT.NOR. CCCGTCTCT-- ** * **
Mean pairwise ID: 48.56%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGG-GGCATTAAGGTGGCGCGGATGC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** ** *** * ****** * * * * ** * * ***** ZEA.MA_B TTTGCGATGGT---TTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA ** ** * * *** * ** ******* * * * * * * ** * *** ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG CAE.EL_C AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGAT---GGTCAGTCCCGGGT----GCAT ** ** * ** ** ** *** * **** * * * ** ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCT-GGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG CAE.EL_C AAGGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCC-ACCGC--GCGGTG **** *** * * ** * * * * * *** ** *** ** * ***** ZEA.MA_B -GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAA CAE.EL_C CAGTGGCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTT-CAG * ** *** ** **** * * *** * ** ** * * ** ZEA.MA_B ACCACC-ATCTTT CAE.EL_C ACCACTTGTCACT ***** ** *
Mean pairwise ID: 48.56%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT * ***** * ** ******* ** ** ** * * * * ** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** *** *** * **** * ** HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCGA **** ** *** *** * **** ** ** ****** * ** HUM.LU_D GACCATTTCTTTT RAT.NOR. GACCCGTCTCT-- **** * *
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATGAGTGT-G **** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * *** * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_C CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_C GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * ***** ** *** **** * ******** LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA CAE.EL_C GCCGGACAGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTCA--GA * *** * * *** ** ** ** * * **** * * ** ** * LYC.ES_H ACAACCACCTTTT CAE.EL_C CCACTTGTCACT- ** * *
Mean pairwise ID: 48.56%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT ***** * * ** ******* ** ** ** * * * * * * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * ** HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCA-CTAGGCTGACTCTTAATAG RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC--ATAGCGA **** ** *** *** **** ** ** * ** ** ** HUM.LU_A GACCATTTCTTTT RAT.RAT. GACCCCGTCTCTT **** *** **
Mean pairwise ID: 48.56%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCAC **** * * * ******** * ** * ** * *** * * ** * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG CAN.SPE. TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG CAN.SPE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA CAN.SPE. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTG----CAACATAGCG * * **** * *** ** * * ** *** * * * **** ZEA.MA_B AACCACCATCTTT CAN.SPE. AGACCCCGTCTCT * * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCA-ACAA-TGTGG-TGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * * ** ** * ** *** * * * * ** * **** ***** *** LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAA--CGGCGACCGAGC--GTCCGTGCC * ** *** * *** ** * * * * ** * ** ** LYC.ES_F AAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTG CAE.BRI. AAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAG **** * * ** * ** * * *** * * * * *** ** * * LYC.ES_F GGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGG CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG * ** ** ** *** * * **** * ** * **** * ********* LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA CAE.BRI. CCGGATAGCG--CTTGTGA--GTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGAT-ACCT--TCAG **** ** ** *** *** * * * * *** * * *** * * LYC.ES_F ACCATCACTTTT- CAE.BRI. ACCACTTGTCATT **** * *
Mean pairwise ID: 48.56%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ***** * * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * ** HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCA-CTAGGCTGACTCTTAATAG ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC--ATAGCGA **** ** *** *** **** ** ** * ** ** ** HUM.LU_A GACCATTTCTTTT ORI.CUN. GACCCTGTCTCC- **** * ***
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_K A--TTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC--TGGCCTGCCCTGT GAL.GAL. CGCTTGAGC----CCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGC *** ** **** ** * ****** *** *** * ** * ** * LYC.ES_K CCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG GAL.GAL. TAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGG-GAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGG * ** * * ** *** *** ** * * * * * * ***** * LYC.ES_K CGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT GAL.GAL. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT **** * **** *** ** ** ****** * * ****** * * **** LYC.ES_K GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATA GAL.GAL. AACGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCAGCGTAGCCTGG-GCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * *** **** * * * * LYC.ES_K AACAACCACCTTT GAL.GAL. CCCTGTCTCC--- * * **
Mean pairwise ID: 48.56%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G ****** ** *** * ****** * *** * * * * ** * * *** * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCC---TGTCCAAGC CAE.EL_A GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * *** * * * ***** ** *** * ** **** ** LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGC-----GAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT CAE.EL_A CAAGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * * *** *** * * ****** * * *** * *** * LYC.ES_C GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_A GTCGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTG * ***** * * * * * **** ** *** **** ******** LYC.ES_C GAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTA CAE.EL_A GCCGGAC--CGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCA-GCCTTCTCGATACCTTCAGACC * *** ** ** *** * * *** * * ** * * * ** LYC.ES_C AACTACCACATTT CAE.EL_A ACTTATCATTT-- * ** ** *
Mean pairwise ID: 48.57%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAG-TGCGCTATG---CCGATCGGGT-GTCCGCA **** ** ** ******** * ** * ** * * *** * * ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG CAN.SPE. CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * *** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG CAN.SPE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * ** * * * ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG CAN.SPE. GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCA----ACATAG ** * **** * *** ** * * * *** ** * * ** ** ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT CAN.SPE. CGAGACCCCGTCTCT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.58%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCCGG **** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG ORI.CUN. AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG * *** *** * ** ** * **** ** ** ****** * ** *** ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * *** ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT ORI.CUN. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGGGCAAC----AT * ** * **** ** **** ** * *** *** * * ** ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT ORI.CUN. AGCGAGACCCTGTCTCC ** * * **
Mean pairwise ID: 48.69%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** ** * ** *** * ** ***** ** * * * * * *** * TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGG-TGTGCTAC--TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT XEN.LAE. CTTG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT *** ** * * * **** *** ** **** * * * * *** * **** TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGT--CCATAATGT XEN.LAE. TCGGTATCA----ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGA * *** *** * * ** * *** ** ** * *** * *** * TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG XEN.LAE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTA ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * * ** TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAG XEN.LAE. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACAC * **** * *** ** * * * ** **** ** * * ** TRI.AE_A ACCACC XEN.LAE. AGTTCT * *
Mean pairwise ID: 48.70%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** ***** ****** * ** * * * * ********* TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGT-GATGT-AACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA CAE.EL_B --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA *** * * * **** * *** * *** *** * * * * **** **** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG * ** * *** * ** *** * * ** * ** * * * TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG CAE.EL_B GTG----GATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTGCAGTG * * * * * * * * *** ***** *** * * ***** * * TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCAC * **** * * * * ** * * * *** * * ******** TRI.AE_B CATCTTT- CAE.EL_B TTGTTTTT ***
Mean pairwise ID: 48.70%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ****** * ** ***** ****** * ** * * * * ********* TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGT-GATGT-AACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA CAE.EL_C --AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA *** * * * **** * *** * *** *** * * * * **** **** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG * ** * *** * ** *** * * ** * ** * * * TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG CAE.EL_C GTG----GATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGC--GCGGTGCAGTG * * * * * * * * *** ***** *** * * ***** * * TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACG-TATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCAC * **** * * * * ** * * * *** * * ******** TRI.AE_B C-ATCTTT CAE.EL_C TTGTCACT ** *
Mean pairwise ID: 48.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGC TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** * * ** ZEA.MA_B TTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TET.ROS. TC----AGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG--AGTGTGCCCGTTCCAAAC * * ** * * * ** ** ** * ***** * **** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCT--GACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT---TCACCAGGGCATTAAAGAGCT * *** ** * ** **** * ** * ** * * ** ** * ZEA.MA_B -AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG TET.ROS. GAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTATTGTGGTGG ***** ** * ******** ***** *** ** *** *** *** ***** ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC TET.ROS. AAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGACAC ********* * * *** * * * ** * * * * *** * * ** ZEA.MA_B CACCATCTTT TET.ROS. T---------
Mean pairwise ID: 48.71%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * * ** ** **** ** ********* * ** * ** * ** LYC.ES_K TGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG XEN.LAE. CTTGAGT--CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * **** ** * ****** ** *** ** * * ** ** * *** LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGCGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** * * ** * * ** * * ** **** * ** LYC.ES_K GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT ** * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** * LYC.ES_K AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC **** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * ** LYC.ES_K AACCACCTTT XEN.LAE. AGTTCT---- *
Mean pairwise ID: 48.71%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT ** * * ** * ******* ** ** ** * * * **** ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** **** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_B CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGA HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** ** * * * **** * ** HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** * HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC HOM.SA_A GGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC **** ** *** *** * * * **** ** * * ** * ** *** HUM.LU_B CATTTCCTTT HOM.SA_A CCCGTCTCTT * ** **
Mean pairwise ID: 48.71%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGT---CACCCATGTGGGGGCATTGAG-GCGGTGTGGAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGATGGCC * * **** * *** *** * * ** * * *** * ** *** TRI.AE_B GCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA DRO.MEL. TGAGGCTGGGATCTACTG--CGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTAA * ** * * * ** * ** * * * *** ** * *** * ** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAG-GCCTTAAGTGGC DRO.MEL. GCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGGG * * * * ****** * ** ** * * ** *** * ** * * ** TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGC-GACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAA DRO.MEL. ATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG * * *** * *** *** * ****** * * * *** * ** * TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGAC DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTG---CCGTTATCAGCCCAA----CCGATATGGTTGGAC ***** * *** * * ** *** * * *** *** ** * *** TRI.AE_B CACCATCTTT DRO.MEL. CACAATCTTT *** ******
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC DRO.MEL. -GACTGG-AAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCAC--GCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGAT * ** * ** ** *** * ** ** * ** *** * ** * **** HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGT-TAGCTGC----------TTGCTGGTCTGCCCATTC DRO.MEL. GGCCTGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC *** ** * ** ** * ** **** * *** ** * ** * HUM.JA_A CAAGCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA **** * ** *** *** ** * ** ** **** ** HUM.JA_A GGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTG DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA ** * * * * *** *** * ****** * * ***** * ****** HUM.JA_A GAAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAG DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATAT-GGTTGG * ***** ** *** * *** * ** * *** ** * * * * * HUM.JA_A ACCATCTCTTTT DRO.MEL. ACCACAATCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ** * * ** ******* ** ** ** * * * * ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA * * ******* * ** ** * ***** *** * ** * * ** * ** HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGG GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** * ** **** * * * ** * ** * * * **** * ** HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC * * * * *** ** ** ****** * ****** ** * **** HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCC--TGG----GCAACATAGCGAG **** ** *** *** ** * ** * * * *** * * ** * HUM.LU_B ACCATTTCCTTT GAL.GAL. ACCCTGTCTCC- *** * **
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGG----GCATGTGGGAAATGGAACT-- LEP.COL. ----GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGT * * * * * ******** * *** * * * * * *** ** HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTG-GTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCT-TACCCGGCTGCCCATTCCA LEP.COL. CTGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGA *** ** * ** * * * * * * * **** * * ***** * * HUM.LU_C AGCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGA LEP.COL. GGCCTCCGGGTGCCC-------CCTTGCAGAAGGGGCGCG-CCCCCTCCGTTAAAGTAGA *** **** * *** * ***** * * * * ** * * ** HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGA LEP.COL. GGA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGC ** * ** ** **** *** ** ******* * ***** *** * ** ** ** * HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG LEP.COL. AGAACCAC--ACCGCGGAGCCT---GTCATCACC-TGCGCCCCAGGCGATCCT--GTGAA ** * ** *** * **** * ** *** * * * * ** ** * HUM.LU_C ACCATTTCTTTT LEP.COL. GCTTT------- * *
Mean pairwise ID: 48.72%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA-GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGC TET.THE. GCCAGG----GTAGCAATA-CCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG--TGA ** * ***** * * * *** * * * ** * ** ** * ** ** ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT TET.THE. TAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGC---TAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * ** * * * ** * ** *** * * ****** ***** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGT--TGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT----CCACCAGGGCATTAAAGAGC *** ** * *** * * * * **** * * ** ** ** ** * ZEA.MA_C CA-GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG TET.THE. TAAGGAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGG * **** ** * ****** * ***** *** ** *** * *** * ***** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TET.THE. AAGGATAACATACT-------CATTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCA ********** * *** ** * * * * ** ***** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TET.THE. GACATT------ **
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** * ** ******* ** ** ** * * * * * HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATC--GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA ** ***** * ** ** * ***** *** **** * ** * ** HUM.JA_B GCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT-CCTAAAGCGG GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * ** ******* * ** *** * * ***** * ** HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC * * * * *** ** ** ****** ** ****** * * **** HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAA---TAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAA---CATAGCGAG **** ** *** *** * * * * ** ** *** ** * ** * HUM.JA_B ACCATTTCTTTT GAL.GAL. ACCCTGTCTCC- *** * ***
Mean pairwise ID: 48.72%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCA--TGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACAC XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGA--T * ** ** ** * ** ***** *** * *** * * ** *** ARA.TH_A TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGC-ATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** * * ** * *** ** ** **** * * ** ** * *** ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA XEN.LAE. TTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCAC-CAGGTTGCTCTAAGGAG * * * * ** ** ** * * ** ** ** *** ****** * ARA.TH_A GGGTAATGCG--TGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAG **** * ** *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA-TG XEN.LAE. TGGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTG-------AACAACACAGCG ***** ** * * * ** * ** * ***** * ** * * ARA.TH_A AACCACCATTTT XEN.LAE. AGACACAGTTCT * *** ** *
Mean pairwise ID: 48.72%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ***** * ** ******* ** ** ** * * * * * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA * * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** * * ** * ** HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGG GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** * ** **** * * * ** * ** *** * **** * ** HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC * * * * *** ** ** ****** * ****** * * **** HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGC---CTGGGCAA---CATAGCGAG **** ** *** *** * ** * * ****** * ** * HUM.LU_D ACCATTTCTTTT GAL.GAL. ACCCTGTCTCC- *** * ***
Mean pairwise ID: 48.73%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG------GGGGCATTAATGTGG-TGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** * * ****** * ** * ** ** * ***** *** LYC.ES_G AATGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCA CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATG---TCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA * ** ** * * ** ** * * ** * * * ** *** LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGC--TACTAGATTCCTAAAGT CAE.EL_B AGCGCTGCGTC--ACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA *** * * ** * ** * * * * * **** * * * * * * *** * LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ****** * * * * * **** **** * **** ******** LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA CAE.EL_B GCCGGACTGCG--CTTGTGAGTTGACACGTATAC-ACAGCCTTCTCAATACCTTCAG--- * *** ** * *** ** * * * * **** * ** ** LYC.ES_G AACCACCACTTTT- CAE.EL_B -ACCACTTGTTTTT ***** ****
Mean pairwise ID: 48.73%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTC-GTGTGG---CATAAACAATGTAGTTAGAAT-- *** * * ****** *** *** ** * **** * * * HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGC---TGCCCATTCCAAGCCGA TET.ROS. -AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGT ** * ** ** * * * ***** * ***** ****** * * HUM.JA_B GAGTTGAGCTG-TGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTC-CTAAAGCGGAGGG TET.ROS. GAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAG---GACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ****** ** ** * ** * * * *** *** * ***** * * * HUM.JA_B CAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG ** ** * ******* ***** *** ** *** * ***** * ******** HUM.JA_B ATAACGGGCCGGT--GCTGCTTGG---ACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- ***** * * *** * * * ** * **** * *** ** HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT TET.ROS. --------------
Mean pairwise ID: 48.73%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGACAAGTGT-- ** * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGC--CC---TGTCCAAG CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG ** * * * ** * * ***** * ** * ** ** **** * LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG * ** * ** ** * *** ** * ** *** * * * * * *** * LYC.ES_A TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT * ** * ** ** *** * * ***** ** ** **** * ******* LYC.ES_A GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT CAE.BRI. GGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG- ** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** LYC.ES_A AAACAACCACCTTT CAE.BRI. -ACCACTTGTCATT * ** * **
Mean pairwise ID: 48.73%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_L ----------------------------------------------GTTGGGTTGA---C ** * **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_L CCAGATGGTTGGGTTCGG----TAGGCTTATAGTCTG---------GCCTGCCCTCTCCA * * * *** * * ** * ** * * ** ** *** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTG-CACCTAGAGT LYC.ES_L AGC-ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT ** * ** * * ** * * **** * * * * * ** **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_L GGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTG ** * * * ************************* *** * * ***** * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTG--CCTTCCATGGC LYC.ES_L GAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACT ************* * *** * * ** ** **** ** * * ORY.SA_B AGACCACCACCTTT LYC.ES_L AAACCACCACTTT- * ******** **
Mean pairwise ID: 48.73%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC DRO.MEL. -GACTGG-AAGGTTGGCAGCTTCTGTAATCAC--GCTTCTGTGAGGTCTGATTGTGGGAT * ** * ** ** *** * ** ** * ** ** * ** * * * HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGT-TAGCTGC----------TTGCTGGGCTGCCCATTC DRO.MEL. GGCCTGA-GGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCAC **** ** * ***** * ** **** * *** ** * ** * HUM.JA_B CAAGCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGC DRO.MEL. TAAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGA **** * * ** *** *** ** **** * **** * HUM.JA_B GGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTG DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGG--GGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTA ** * * * * *** *** * ****** * * ***** * ****** HUM.JA_B GAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA DRO.MEL. GTGGGATAGCGTACCGGAG-----TGGACT-GCCGTTATCAGCCCAACCGATA--TGGTT * ***** ** **** * ***** ** * * * * * ** * * HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT DRO.MEL. GGACCACAATCTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 48.73%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATGAG--TGTG ** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * *** * * ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_C GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * * * * ** * *** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCTGG--GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG CAE.EL_C TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA * * **** ** *** *** ** * ** * ** *** ** * * * HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_C GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ****** HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCT-ACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAAT CAE.EL_C GCCGGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACAC-AGCCTTCTC------AATACCT--T * *** * ** * * * ** * ** *** * **** * * * * * HUM.LU_D AGGACCATTTCTTTT- CAE.EL_C CAGACCACTTGTCACT ***** ** *
Mean pairwise ID: 48.87%
ZEA.MA_C -NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTT-GTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGG-TGTGGAT LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTGGAC * ******** * * *** * * * * ** * ** ** ***** ZEA.MA_C GCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA LEI.MAJ. CAGCGA----GGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGC-TCTGCTTGGCTGTGTGT-CGGT * * ** ** *** *** * * **** * ** * * *** ** * ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG LEI.MAJ. GTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGG-CGCGGGTCCG-----CCGTTGAAGCGA------ ** * * * ** * ** *** ** ** ** * *** * * * ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA LEI.MAJ. -GGGAACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGCCCACCCCAC-GCACGTCCGCCGTTGC ***** * ** **** * ** ******* * * * * * * ** * ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA LEI.MAJ. AGAATCACA--CCGCGG-AGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT ** ** *** ** * * ****** * * *** ** ** * **** * **** ZEA.MA_C CCACCATTTTT LEI.MAJ. -----------
Mean pairwise ID: 48.87%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** * **** ******** *** * * * * * * ** * * HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * ** *** * ** ** * * **** * * * * ** ** * *** HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT--CCTAAAGAGGAG XEN.LAE. CGGTATCAATATG-GTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * * ** *** ** ** * ** ** ** ** * * * **** **** * HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG * * * *** ** ** ****** * * **** * **** * * HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACA-ACACAGCGAGACA---C *** ** * * *** ** ** ** * * * ** *** * ** * HUM.JA_A ATCTCTTTT XEN.LAE. AGTTCT--- * ***
Mean pairwise ID: 48.87%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAAT----ACCTGTG-TCTATATGTGG---CATAAACAATGTAGGTTGT * * ****** ***** * * ** ** * **** ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACA * * * * * * * * * ** * ** ** ***** ***** * HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG TET.THE. ATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGG ****** ** ** **** * *** * * **** *** HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TET.THE. A-AACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG ** ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ******** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC TET.THE. ATAACATACTCAT--TAACTG------TCAAACT--AATCGGTT--CTACTATCAAAGCC ***** * * ** *** ** ** * * ** * ** ** * ** HUM.LU_D ATTTCTTTT TET.THE. AGACATT-- * **
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATG-TGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT * * ** ** ** ** **** ** ** * **** * * * * * *** LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** * * * * LYC.ES_N CCACCATTTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT ** * * **
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG * * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT RAT.NOR. C--CCGTCTCT * ** ** *
Mean pairwise ID: 48.87%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTG-TGGATGT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGACAGAGGA *** ** * ** *** ** **** * *** * * * ** * ** * ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTA * ** * * ******* ** ** * * * *** ** *** * * ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAGCG RAT.RAT. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG **** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * * ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA * * * * *** ** ** ****** * * * **** * * ** ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC RAT.RAT. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGGGCAACAT--AGCGAGA * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * * ZEA.MA_F CACCATCTTT- RAT.RAT. CCCCGTCTCTT * ** *** *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * ** ** ** * * ** **** ** * *** * * * ** *** LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** * LYC.ES_B AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACA-TAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * *** ***** * ** * * LYC.ES_B CCACCACTTTT ORI.CUN. CCCTGTCTCC- ** **
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATA- TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG * *** * ** *** * * * **** * *** ** *** ***** LYC.ES_H TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** * LYC.ES_H TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * * ** * ***** * * LYC.ES_H GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG **** ** * ******* ***** *** *** * * ***** ** ******* LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACA ***** * * ***** * * * * * ** ** * * LYC.ES_H CCACCTTTT TET.ROS. CT------- *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT HOM.SA_A CCGTCTCTT-- * * * *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT **** ** ** * * ** **** **** * * ** ** * * * * LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** *** ***** *** **** * ** ** * *** LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *** LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGACC **** ** * * *** * * ** * ***** ** * * *** LYC.ES_I ACCATTTTT CAN.SPE. -CCGTCTCT ** * * *
Mean pairwise ID: 48.87%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG * ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT * * * **
Mean pairwise ID: 48.88%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG **** * * ** * ****** * ** * * ** * ** * * * HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC--TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCAAG ** ** ** * * * * *** ** * ** * * * ** * ***** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGG--GTTGCGCACGTCCTAGAGTGG CAE.BRI. CGCTGCGTCGC-CAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCG-CATAAGGAGT * * ** * * * * * ** ** * ****** ** ** ** * ** * * HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA CAE.BRI. GGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGC * *** ** *** * * ***** * * * **** * ******* HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG CAE.BRI. CGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCT---CTGATACCT--TCAG ***** ** * * * * * * ** * ** **** * * * * HUM.LU_A ACCATTTCTTTT- CAE.BRI. ACCACTTGTCATT **** ** * *
Mean pairwise ID: 48.88%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ***** * * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * * ** ** * ** ** * ** *** *** ** ** * *** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * ** HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCA-CTAGGCTGACTCTTAATAG HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC--ATAGCGA **** ** *** *** **** ** ** * * ** ** HUM.LU_A GACCATTTCTTTT HOM.SA_B GACCCCGTCTCT- **** *** *
Mean pairwise ID: 48.90%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-------GCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT **** ** ** **** ** *** * ** ** * ** ** * ** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCGT XEN.LAE. CGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGC * * *** *** * ** * * ** ** ***** * ** *** ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCA--CCT XEN.LAE. ACTAAGTTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGG-GGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCT * ***** *** * * *** * ****** * ** **** ** * ** ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA XEN.LAE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGAT * * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * * ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT XEN.LAE. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAAC-AGCCTGAACAA----CAC * ** * **** ** *** ** * * ** * * *** * ** ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT XEN.LAE. AGCGAGACACAGTTCT- ** *** *
Mean pairwise ID: 49.01%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** ** ***** RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAG--------GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG * ** * *** ** * *** * ** **** * ** RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG- LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC * * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * ** RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA * * ******* **** ************** ** * * * * * ** * RAT.RAT. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCCGTC LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** ** RAT.RAT. TCTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 49.01%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGT-GGTTGAACTTT TET.THE. GCCAGGGT-AGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGAT-- ** ** * * ** * ** * ** * *** * *** ** ***** * CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG TET.THE. -AGATAGGATATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAA ** * ** * * **** * * * * * ** * ****** ***** CIN.HYB. AGAGTGGGT-TCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG TET.THE. TGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGAC--TCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG **** * * * ** * * ** * * * * * ** *** * * CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG TET.THE. GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGG * ** ** * ******* ***** * * ****** * ** ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC TET.THE. ATAACATACTC-ATTAACT---GTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT- ** *** * * * ** * * *** * * *** * * * **** CIN.HYB. ATTT TET.THE. ----
Mean pairwise ID: 49.03%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTG-TAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG LYC.ES_L GG-TTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT * *** * ** * ******* * *** * ***** ***** ****** CIN.HYB. AGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGG-CTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGGT **** ** *** ** * * **** * * **** *** ** * * **** CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * * ***** ****************** **** * ** **** * ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAAC---CAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC ** ** * * * * * ** **** * * **** ***** ** CIN.HYB. CCCATTT- LYC.ES_L ACCACTTT *** **
Mean pairwise ID: 49.03%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATA-TCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA * * * * *** ** * * * * **** **** ****** ******* ARA.TH_D GTGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGG-CTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGG **** **** * ** **** * * ** * * * ******* ** * ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ************************* *** * * ** ** ******** * ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACT--ATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTC-CAACTAAA *** * * ** * * **** * * * ** * *** * ** * ** * ARA.TH_D CCACCACTTT LYC.ES_L CCACCACTTT **********
Mean pairwise ID: 49.03%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGCCGGAGGA *** ** * ** *** * ** **** * *** * * * ** * *** * ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTA * ** * * ******* ** ** * * * *** ** *** * * ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAGCG ORI.CUN. AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG **** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * * ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA * * * * *** ** ** ****** * * * **** * * ** ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC ORI.CUN. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGGGCAACAT--AGCGAGA * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * * ZEA.MA_F CACCATCTTT ORI.CUN. CCCTGTCTCC * * ***
Mean pairwise ID: 49.03%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT LEI.MAJ. ----GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCT--TCGGGGGCTAACCAGGCTTAG-----CGGGG * * * * ******** ****** * * * *** HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGG LEI.MAJ. AGGAC--GTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGT * * ***** * * *** ** ***** ** * *** * * * ** * HUM.LU_B GAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCC----TAGAGTGGAG LEI.MAJ. GTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGA---GGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAG * ** ** ** * ** * ** **** **** * *** * ** *** HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTC-CCGGCAGTGGAA LEI.MAJ. GGAACCGGGTCAGGCCGGA--AACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCA ** * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * * ** ** * * HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC LEI.MAJ. GAATCACACCGCGGAGCA----TGTCCGCACT------TGAGCCCCACGCTTCGTCGCGA * ** ** *** ** **** * * ** ** ** *** *** HUM.LU_B CATTTCCTTT LEI.MAJ. AGCCTT---- *
Mean pairwise ID: 49.03%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT TRI.AE_C ---------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGT * ** *************** ZEA.MA_F TG-GTTGTGGCTGG--TGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC TRI.AE_C TGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT-TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC ** ** **** * ****** ***** * ******** * * * * *** ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA ***** **************************** *** ****************** ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCA TRI.AE_C AGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGCGACCA ******** ********** * * ** ** * ** * * * * * * ***** ZEA.MA_F CCATCTTT TRI.AE_C CCATC--- *****
Mean pairwise ID: 49.03%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ** ** ** **** ** ********* * ** * ** * ** LYC.ES_J TGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG XEN.LAE. CTTGAGT--CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * **** ** * ****** ** *** ** * * ** ** * *** LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** * * ** * * ** * * ** **** * ** LYC.ES_J GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT ** * **** *** ** ** ****** * * * **** * * **** * LYC.ES_J AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC **** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * ** LYC.ES_J AACCACCTTT XEN.LAE. AGTTCT---- *
Mean pairwise ID: 49.03%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** ** * ** *********** *** * * *** ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTT-GGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAA FUG.RUB. GCTTGAGCTCA--GGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * ** ******* * ** ** ** * * ** ** * ** LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** * * * ** * * ** * * * ***** * ** LYC.ES_A GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT ** * *** *** ** ** ***** * ** ** **** * * **** * LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTG----AATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGAC **** * * * *** * * * *** * ** ** * * ** LYC.ES_A AACCACCTTT FUG.RUB. T-CAGTCTTT * ****
Mean pairwise ID: 49.04%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRI.AE_C ------------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCA * ** * ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGT-GTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT TRI.AE_C AGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTT-GGGCCTCACGGTCCATAATGT ***** **** * * ** **** ***** * * * ** ** * * * ** ** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_C GGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG *** ** * ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG TRI.AE_C GAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG-GGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-G ********************* *** * ****** **** **** * ** * ORY.SA_B ACCACCACCTTT TRI.AE_C ACCACCATC--- ******* *
Mean pairwise ID: 49.04%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGG-TAGCGTTGGCTTGTCACC-CGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGAT TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATG-CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGT-TAGAAT ****** **** ** * *** *** ** * ** ** ** ** ** * * ** ORY.SA_B GCCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTC TET.ROS. AGTCAGA-GTATG-----AGAGTTTGATGAGACAGTTTGC--TAAG-AGTGTGCCCGTTC * ** ** * ** ** ****** ** * * ******** ORY.SA_B CAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGA TET.ROS. CAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTT--CACCAGGGCATTAAAG *** * * * * ** ** *** * *** * * *** * ORY.SA_B GTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGG TET.ROS. AGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGG ** * ** * ******* ***** *** ** ** ****** ** ORY.SA_B TGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC TET.ROS. TGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT--CGGTTC---TGCTATTCTGATC ************ * * * * * *** * *** * * * ORY.SA_B AGACCACCACCTTT TET.ROS. AGAC-ACT------ **** **
Mean pairwise ID: 49.04%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT ***** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTGG HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAGG ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * ** HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG **** ** *** *** **** ** ** * ** * ** * HUM.LU_A ACCATTTCTTTT HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT *** *** **
Mean pairwise ID: 49.04%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGTGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ** ZEA.MA_A GCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCT-TCAGCGGACTATGTC---GATCGGGT-GTCCGTAC **** ** ** ******** * ** * ** * * *** * * ** * * ZEA.MA_A CAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGGA FUG.RUB. TAAGTTCG--GTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAG ***** * ** ** ** **** * * *** ** ** * *** ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG FUG.RUB. GAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAG * ** * * *** ** ** ***** * ** ** * * ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC FUG.RUB. TAGTGGGATCGC---GCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACA----GC * * **** * *** ** * ** *** ** ** * * ** ** ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT FUG.RUB. GGGACTCAGTCTTT * * *****
Mean pairwise ID: 49.04%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** * * ****** *** **** * ** ** * * LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT CAN.SPE. CCGTCTCT---- * * *
Mean pairwise ID: 49.04%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGC TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * ** ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT TET.ROS. TCAGA---GTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGC---TAAGAGTGTGCCCGTTCCAAAC * * ** * * ** * ** *** * * ************ ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGT--TGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TET.ROS. AGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTT----CACCAGGGCATTAAAGAGC * *** ** * ***** * * * **** * * ** ** ** ** * ZEA.MA_C C-AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGG TET.ROS. TGAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGG ****** ** * ****** * ***** *** ** *** * *** * ***** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TET.ROS. AAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATC--GGTTCTGCTATTCTGATCAGACAC ********** * * * * * ** * * * * * ** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TET.ROS. T-----------
Mean pairwise ID: 49.04%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTT----CTTGACGGTAGACAAGTGT-- ** * * ** ** * ** *** * ** * * * * ** * * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGC--CC---TGTCCAAG CAE.BRI. GGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTG ** * * * ** * * ***** * ** * ** ** **** * LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGG----CCCAAATGAAAATATGG-GCTTCTTGATTCCTAAAG CAE.BRI. CCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGG * ** * ** ** * *** ** * ** *** * * * * * *** * LYC.ES_J TGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGT CAE.BRI. AGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGT * ** * ** ** *** * * ***** ** *** **** * ******* LYC.ES_J GGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC-GCCTAATGGGTTGCTCCAAT CAE.BRI. GGCCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTC--GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAG- ** ***** * *** ** ** * ** ** **** * * ** ** LYC.ES_J AAACAACCACCTTT CAE.BRI. -ACCACTTGTCATT * ** * **
Mean pairwise ID: 49.04%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * ** LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGC-CCTATCCAA GAL.GAL. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTA-TGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * * ** ** ******* *** **** * * ** ** * * * LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * ** *** ** * * ** ** ** ** ***** * ** LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC **** *** * *** ** ** ***** ****** *** * **** LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGC-AACATAGCGAGA **** ** ** *** * ** * * * ***** *** * * LYC.ES_E CTACCACATTTT GAL.GAL. CC-CTGTCTCC- * * *
Mean pairwise ID: 49.05%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTG---ACGGTAGATAAG--TGTG ** ** * * ** * ** *** * ** * * ** * ** * * ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAG-GAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGC--GTCCG * * * ** *** * **** **** * * * * * ** * *** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGG--CGAAGGCTGG--GTTGCGCAGCTCCTAGAG--TGG CAE.EL_B TGCCAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA * * **** ** *** *** ** * ** * ** *** ** * * * HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAG--AGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * * ** ** * ** * ** ***** * * * **** * ****** HUM.LU_D GAAGGATAACGGGCCGGTGCT-ACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAAT CAE.EL_B GCCGGACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACAC-AGCCTTCTC------AATACCT--T * *** ** * * * ** * ** *** * **** * * * * * HUM.LU_D AGGACCATTTCTTTT- CAE.EL_B CAGACCACTTGTTTTT ***** ** ****
Mean pairwise ID: 49.06%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGACAG **** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG RAT.RAT. AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG * *** *** * ** ** * **** ** ** ****** * ** *** ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * *** ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT RAT.RAT. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGGGCAAC----AT * ** * **** ** **** ** * *** *** * * ** ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT- RAT.RAT. AGCGAGACCCCGTCTCTT ** * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGC TET.ROS. -----GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATA- ** * * * ** *** *** ** **** * ** ** * *** TRI.AE_A TGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG TET.ROS. -GTCAGAGTA-TGAGAGTTTGATGAGACAGT-TTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG ** ** ** * * ** * * ** * ** * *********** * TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTA-GTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGG * ** * * * ** * * ** ** ** ** *** TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA TET.ROS. AACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA ** ** * ******** ***** *** ** **** ****** ********** TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC TET.ROS. TAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT----- *** * * *** * ** *** ** ** * ** ** **
Mean pairwise ID: 49.18%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG-TGATA * ** *** ** * * ** * **** * *** ** * * * * LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG * * ** *** * * * * ** * * ***** ***** ** * LYC.ES_J AGTTGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA TET.THE. AGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA ***** ** * ** * * * * * * * * ***** * *** LYC.ES_J C-CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT *** * ******** ***** *** *** * * ***** ** ********** LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGA ** * * **** ***** **** * * *** * LYC.ES_J CCTTT TET.THE. CATT- * **
Mean pairwise ID: 49.19%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ** * ** * ******** ***** * ** * * * *** ** HUM.LU_B GGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * *** *** * ** ** * * ** * * * ** ** * * *** HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGGAG FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ** * * ** *** * ** * ** ** ** * * * **** * ** * HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG ** * *** ** ** ***** * * **** ** **** * * HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTG--AATAGACGCTGTA-GTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGACT *** ** *** *** * * * * * ***** * ** * * **** HUM.LU_B ATTTCCTTT FUG.RUB. CAGTCTTT- ** **
Mean pairwise ID: 49.19%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAAT-GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT * *** **** ** *** *** * ***** * ** * ** ** * ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA ** * * * * * * ** * ** * ***** ***** * ARA.TH_A GTGAGTAATTAGTGTTGAG-TTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGG--ACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** ** * * *** ** ** ** ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG ** * ** * ******** ***** *** ** **** ******* * ***** * ARA.TH_A GATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT--- *** ** * * * *** * * * * * ***** ** **** * * ARA.TH_A CACCATTTT TET.ROS. ---------
Mean pairwise ID: 49.19%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ** * ** * ******** ***** * ** * * * * *** * HUM.JA_A GGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * *** ** * ** ** * * ** * * * * ** ** * * *** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGAG FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * * * ** *** ** ** * ** * *** ** * * ***** **** * HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG ** * *** ** ** ***** * * **** * **** * * HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGACC FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTG--AAT--AGACGCTGTAGTT-CAACCTGAGTAACACAGCGGGACT *** ** * * *** * * * * * * ** * * ** * * *** HUM.JA_A ATCTCTTTT FUG.RUB. CAGTCTTT- *****
Mean pairwise ID: 49.20%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * * ** HOM.SA_A CGCT--TG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC **** ** ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** * HOM.SA_A AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTC-TCACGGTCCATAATG ***** * * * * ** * ** * ** * ** * * * *** * HOM.SA_A AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** HOM.SA_A AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAG--CGAGA TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCT-CGCAGCCTACTCCAGCA * **** * *** ** * * * ** * **** *** * ** * * HOM.SA_A CCCCGTCTCTT TRI.AE_A GACCACC---- ** *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT * ** ** ** * * ** **** ** * *** * * * *** *** LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** * LYC.ES_B AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** * ** * * LYC.ES_B CCACCACTTTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT ** * ** **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA CAN.SPE. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT CAN.SPE. CCGTCTCT--- * * *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGTGGTGGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT * * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * * * * ** LYC.ES_N -GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA CAN.SPE. CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * * * ** ****** *** **** * ** ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG CAN.SPE. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** ** * * * LYC.ES_N CCACCATTTTT CAN.SPE. CC-CCGTCTCT ** ** * * *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT **** ** ** * * ** **** ** * *** * * * *** *** LYC.ES_I TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_I AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_I GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_I AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** ** * * * LYC.ES_I CCACCATTTTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT ** * * **
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** * ** ******* ** ** ** * * * * * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC-GTCCGCGCTAA * * ****** * ** ** * ***** *** ** * * ** * ** HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGG GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATG-GTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** **** * * * ** * ** * * * * ***** **** HUM.JA_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC * * * * *** ** ** ****** * ****** * * **** HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGA GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCAG-CGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ***** * * ** ** * * ** *** HUM.JA_A CCATCTCTTTT GAL.GAL. CCCTGTCTCC- ** * ***
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * ***** * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** *** *** * **** * ** HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG ORI.CUN. GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCGA **** ** *** *** * **** ** ** ****** * ** HUM.LU_D GACCATTTCTTTT ORI.CUN. GACCCTGTCTCC- **** * ***
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT * ** ** ** * ** **** ** * *** * * * * *** LYC.ES_B TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_B AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_B GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** * LYC.ES_B AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACA-TAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * *** ***** * ** * * LYC.ES_B CCACCACTTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT ** * ** **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA ORI.CUN. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT ORI.CUN. CTGTCTCC--- * * **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GACAGAGGA **** ** * ** *** ** **** * ** * *** * * * * ** LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG RAT.RAT. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * ** LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** * LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA RAT.RAT. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** *** ** * * * * ** *** * * LYC.ES_C CTACCACATTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT * * * **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG * ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT RAT.NOR. C--CCGTCTCT * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.20%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** ** * ** *** ** **** ** ** * *** * * * * ** RAT.RAT. CGCT--TG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC **** ** ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** * RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTC-TCACGGTCCATAATG ***** * * * * ** * ** * ** * ** * * * *** * RAT.RAT. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** RAT.RAT. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAG--CGAGA TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCA * **** * *** ** * * * ** * **** * ** * ** * * RAT.RAT. CCCCGTCTCTT TRI.AE_A GACCACC---- ** *
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GCCGGAGGA **** ** * ** *** * ** **** * ** * *** * * * * *** LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG ORI.CUN. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * ** LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** * LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA ORI.CUN. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** *** ** * * * * ** *** * * LYC.ES_C CTACCACATTT ORI.CUN. CC-CTGTCTCC * * *
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** * ** ******* ** ** ** * * * ** * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * *** HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA RAT.NOR. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** **** ** * ** *** * * * * ***** **** HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC RAT.NOR. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGGGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** **** HUM.JA_A C-ATCTCTTTT RAT.NOR. CCGTCTCT--- * *****
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT * ***** * ** * ******* ** ** ** * * * *** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** *** *** * **** * ** HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGA HOM.SA_A GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** * **** ** ** * ** * ** ** HUM.LU_D CCATTTCTTTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT ** *** **
Mean pairwise ID: 49.20%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGT-GGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * * ** *** LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG----GGCAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** * * * * LYC.ES_N CCACCATTTTT ORI.CUN. CC-CTGTCTCC ** * * *
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ***** * ** * ******** ***** * ** * * * *** * HUM.LU_A GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT * * * * ** * ** ** * * ** * * * ** ** * * *** HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTC--CTAGAGTGGA FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCAC-CAGGTCGCCTAAGGAGGG ** * * ** *** * ** * ** * ** * * ** *** *** * ** HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTG * ** * *** ** ** ***** * * **** * **** * HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA FUG.RUB. GGAT--CGCGCCCGTGAA---TAGACGCTGTA-GTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGGGA **** ** *** *** * * * * * * ** * * ** * * *** HUM.LU_A CCATTTCTTTT FUG.RUB. CTCAGTCTTT- * *****
Mean pairwise ID: 49.20%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT * ***** * ** ******* ** ** ** * * * * * * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * * * ** * ** ** * ** *** * * ** ** * *** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** *** *** * **** * ** HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG RAT.RAT. GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA---CATAGCGA **** ** *** *** * **** ** ** ****** * ** HUM.LU_D GACCATTTCTTTT RAT.RAT. GACCCCGTCTCTT **** *** **
Mean pairwise ID: 49.21%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCAGG **** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG CAN.SPE. AGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG * *** *** ** ** ** * *** ** ** ****** * ** *** ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * *** ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT CAN.SPE. CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGTGCAAC----AT * ** * **** ** **** ** * *** *** * * ** ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT CAN.SPE. AGCGAGACCCCGTCTCT ** * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.21%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * ZEA.MA_C TGCTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT--TGTTGGCCTGCCCGTTC HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTT---CTGGGCT-GTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCAC ***** ** * ** ***** * * *** ** * * *** ** *** * ZEA.MA_C CAAGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGG-ACCTATA HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCC--CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG ***** * * * * * ** ** ** ** * ** * **** ZEA.MA_C GTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGG HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG * ** **** * *** * ** ****** * ** * * * * * ZEA.MA_C TGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAG HOM.SA_B TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG-CCTGAGCAACATA-----G * * **** * *** ** * * ** ** *** * **** * ZEA.MA_C CAGACCACCATTTTT HOM.SA_B CGAGACCCCGTCTCT * * ** * * *
Mean pairwise ID: 49.34%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** ** ****** RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA LEI.MAJ. CG---TGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG ** * *** ** * *** * ** **** * ** RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG- LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC * * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * ** RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA * * ******* **** ************** ** * * * * * ** * RAT.NOR. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCGTCT LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** ** RAT.NOR. CT LEI.MAJ. --
Mean pairwise ID: 49.34%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAGG-TTGTGATAG *** * * ***** * * ** ** *** * * ** * ** HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG TET.THE. ATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAG * ** ** * * * * ** * * ** ***** ***** * *** HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCAC--AGCTCCTAAAGAGG-AGGGCA TET.THE. TTG--CTATG-GTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAA *** ** ** * * * * * ** *** * ******* * ** * HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA TET.THE. ACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATA * ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * *********** HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC TET.THE. ACATACTCAT-TAACT---GTCAAACTAATCGGTTC-TACTATCAAAGCCAGACATT--- ** * *** * ** * ** * * * * ** * ***** * HUM.JA_A TTTT TET.THE. ----
Mean pairwise ID: 49.34%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAAC-TCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAAT-GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAAT-- * * **** * * * ** * ** ** *** * *** ** *** * * CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG TET.ROS. -AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAG-ACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG ** * * * **** * * * * * ** * ************ * CIN.HYB. AGAGTGGGT-TCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG **** * * * ** * ** * * * * * * ** *** * * * CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG * * ** * ******* ***** * * ****** * ** ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC TET.ROS. ATAACATACTC-ATTAACT---GTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT- ** *** * * * ** * * *** * * **** * * ***** CIN.HYB. ATTT TET.ROS. ----
Mean pairwise ID: 49.34%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** ** ****** HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAG--------GGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG * ** * *** ** * *** * ** **** * ** HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG- LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC * * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * ** HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA * * ******* **** ************** ** * * * * * ** * HOM.SA_A GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCT-GTGCAACATAGCGAGACCCCGTC LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** ** HOM.SA_A TCTT LEI.MAJ. ----
Mean pairwise ID: 49.35%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC LEI.MAJ. -GCC--GGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT-------AACCAGGCTTAGCGGG *** * * * * ******** ****** * * *** * * HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTG-TTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAG LEI.MAJ. GAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGTG **** * * *** ** ***** *** * *** * * * ** * * HUM.JA_A AGTTGGGCTGTGTGATCTGG--GCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC LEI.MAJ. TGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGGGA ** ** ** * * ** *** *** * * * ** * *** * **** HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGGA LEI.MAJ. ACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAA * * ** **** ** ** ******* ***** * *** * ** ** ** * ** * HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATC LEI.MAJ. TCACACCGCGGAGC-----ATGTCCGCACTTGAGCCCCACGC-TTCGTCGCGAAGCCTT- * ** *** ** * * ** * ** ** ** * * ** * HUM.JA_A TCTTTT LEI.MAJ. ------
Mean pairwise ID: 49.36%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCG-GAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** * * ** *** * ** ***** ** ** **** * * * ** * ** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTC---GATCGGGTGTCCGTACT TRI.AE_A CGCT---GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCC **** * * * * * **** * * * * ** * * * * **** * FUG.RUB. AAGTTCGGTATCGA----TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAA TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCAC--GGTC-CATAA ***** *** * *** *** ** * *** ** **** **** * *** FUG.RUB. GGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA TRI.AE_A TGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACG * ** ** * * *** ** ** ***** ** **** * * FUG.RUB. GTAGTGGGATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT TRI.AE_A GTGGAAGGATAATGG--GCCGCTGCACTCC-TAGGCCAAT-TGGGCCTCGCAGCCTACTC ** * **** * * * ** * *** *** ** * * **** FUG.RUB. CAGTCTTT---- TRI.AE_A CAGCAGACCACC ***
Mean pairwise ID: 49.36%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** ** * ZEA.MA_A CTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCT----GCACTGAGCTATGTCGATCGGGT-GTCCGCACT *** * ** ******** ** * * * * *** * * ** * ZEA.MA_A AAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCT--GCAGACCTGGA XEN.LAE. AAGTTCG--GTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAG ***** * ** ** ** * ** * * *** * ** ** * * * ** ZEA.MA_A GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGG XEN.LAE. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAG * ** *** * *** ** ** ****** * ** ** * * * ZEA.MA_A TGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC XEN.LAE. TAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCT--GAACAACAC--AGC * * **** * *** ** * * * *** ** **** *** *** ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT XEN.LAE. GAGACACAGTTCT- * *** * *
Mean pairwise ID: 49.36%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC LEI.MAJ. -GCC--GGAGCTCTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGCT-------AACCAGGCTT-AGCGG *** * * * * ******** ****** ** * *** ** HUM.JA_B GGCCCAT-TGGATCGGATCCAGTG-TTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGA LEI.MAJ. GGAGGACGTGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTGGCTGT ** * **** * * *** ** ***** *** * * *** * * * ** * HUM.JA_B GAGTTGAGCTGTGTGAGCCGG--ACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG LEI.MAJ. GTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCG-AGGG * ** * ** * ** * *** * **** ** * ***** **** HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAAGG LEI.MAJ. AACCGGGTCAGGCCGGAA--ACGGAGCAGC--CCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGA * * ** **** ** ** ******* * *** * *** * ** ** ** * ** HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCA----CCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA LEI.MAJ. ATCACACCGCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT------ ** ** *** ** ** * ** *** * *** * * * ** HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT LEI.MAJ. --------------
Mean pairwise ID: 49.36%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG--ACAGAGG * * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** * * ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT----GGGCAACATAGCGAG **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT ** ** **
Mean pairwise ID: 49.37%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGC-----TACTCGGGAGGCTGAGGCTGG **** ** *** *** ** *** ** *** * * ** ** ** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCG----CCCG HOM.SA_A AGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATCGGGTGTCCG * *** *** * ** ** * **** ** ** ****** * ** *** ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * *** ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT HOM.SA_A CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGTGCAAC----AT * ** * **** ** **** ** * *** *** * * ** ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT- HOM.SA_A AGCGAGACCCCGTCTCTT ** * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.50%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** ** ****** CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG * ** ** *** * * *** * ** **** * ** CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG- LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC * * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * ** CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA * * ******* **** ************** ** * * * * * ** * CAN.SPE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCT-GTGCAACATAGCGAGACCCCGTC LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** ** CAN.SPE. TCT LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 49.51%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT * *** ** ** *** *** * ***** * * * ** * * ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA ** * ** * * * * * * ** * * ***** ***** * ARA.TH_E GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGG--CTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG TET.ROS. GTGAGTT-GCTATG-GTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** * ** *** ** * * * ** *** ** ***** ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG ** * ** * ******* ***** *** ** **** ******* * ***** * ARA.TH_E GATCACA-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT--- *** *** * * * *** * * * * * ***** ** **** * * ARA.TH_E CACCATTTT TET.ROS. ---------
Mean pairwise ID: 49.51%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAGGTTG-TGATA ** ** *** ** * * ** * **** * *** ** * * * * LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG TET.THE. GATAGGATATGAGAGTTTGA-TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATG * * ** *** * * * * ** * * ***** ***** ** * LYC.ES_A AGTTGG-ATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA TET.THE. AGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGA ***** ** * ** * * * * * * * * ***** * *** LYC.ES_A C-CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC-CCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TET.THE. AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGAT *** * ******** ***** *** *** ** ***** ** ********** LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TET.THE. AACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGA ** * * **** ***** **** * * *** * LYC.ES_A CCTTT TET.THE. CATT- * **
Mean pairwise ID: 49.51%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AAATGGGACTT TRY.BR_B ---AGCCGGAGCG-CATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGT * * *** * * * ******** * *** ** * * ***** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC TRY.BR_B C---TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTG * * ** ** **** * ** *** ** ***** * HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG TRY.BR_B TCGGTGTTGAGGT---CGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGC-CGT--TAAAGTGGGGG ** **** * * * * * ** *** * **** *** ** ***** ** HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TRY.BR_B G-AACGGGTCAGGCCGG--TGACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGA * ** * ** **** ** * ** ******* * **** *** * * ** * ** HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC TRY.BR_B AGCACACCGAGGAGCATCTCAGG---ACTTTGCGCCCCAAG--TG--TCGTCGCGAGGCG * ** ** ** * ** ** *** * * ** ** ** * * * HUM.LU_A ATTTCTTTT TRY.BR_B GTTT----- ***
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCT----TCTTGACGGTAGATAAGTGT-G **** * ** ** * ****** * ** * * * * ** * * * * * * LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTA---TCCAAGC CAE.EL_B GATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGC * * *** * * * ** ** * * ** * * ** * *** ** LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTG--AAGAAATGGAC--TACTTGATTCGTAAAGT CAE.EL_B CAAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGA ** * ** *** ** * ** * **** * * * * * * *** * LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG CAE.EL_B GTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTG * ** *** * * * * * ***** ** *** **** * ******** LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA CAE.EL_B GCCGGAC--TGCGCTTGTGAGTTGACACGTATA-CACAGCCTTCTCAATACCTTC---AG * *** ** * *** ** ** ** * * **** * * ** * * LYC.ES_H ACAACCACCTTTT CAE.EL_B ACCACTTGTTTTT ** ** ****
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC--TGGAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT HOM.SA_A CCGTCTCTT-- * * * *
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG--GACAGAGG * ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA RAT.RAT. ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT RAT.RAT. CCCCGTCTCTT * * * **
Mean pairwise ID: 49.52%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGC TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** **** ZEA.MA_A TTTGCG-ATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCG--TTCCAAACAGTG * * * *** * ** * * * * ** ** *** ** * * ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG TET.ROS. AGTTGCTA-----TGGTGGAAAC-CTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCAT-TAAAGAGCT ***** ** ****** * **** * ** * * *** **** ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG TET.ROS. G-AGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGG * ***** ** * ******** ***** *** ** *** * ** ***** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA TET.ROS. AAGGATAACATACTCATTA-ACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT ******** * * * *** * * **** ** * ** * * ** ZEA.MA_A CCACCATCTTT TET.ROS. -----------
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-ACAGGAGGA **** ** * ** *** ** **** * ** * *** * * * *** LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * ** * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG RAT.NOR. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * ** LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** * LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA RAT.NOR. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** *** ** * * * * ** *** * * LYC.ES_C CTACCACATTT RAT.NOR. C--CCGTCTCT * ** * *
Mean pairwise ID: 49.52%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT * ***** * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * * ** ** * ** ** * ** *** *** ** ** * *** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGGA HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG ** * ** ******* * ** *** *** * **** * ** HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCA--CTGGGCTGACTCTTAATAG HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAA---CATAGCGA **** ** *** *** * **** ** ** *** ** * ** HUM.LU_D GACCATTTCTTTT HOM.SA_B GACCCCGTCTCT- **** *** *
Mean pairwise ID: 49.52%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGAACAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ** * * ** * ******* ** ** ** * * * *** ** HUM.LU_B TGGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTAA * * ******* * ** ** * ***** *** * ** ** ** * ** HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-CCTAGAGTGG CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * ** * ** ******* * ** ** * * * **** * ** HUM.LU_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** * **** * HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGA CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTG--AATAG--CCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** * * * **** ** * * ** * ** ** HUM.LU_B CCATTTCCTTT CAN.SPE. CCCCGTCTCT- ** ** *
Mean pairwise ID: 49.52%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGCGCGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * ZEA.MA_B TGCTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC----GATGGGGTGTCCGCAC **** * * * ******** * ** * ** * * ** ** ** * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACAG HOM.SA_B TAAGTTCGGCATCAAT-ATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * * ** * ** ** *** ** * * **** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG HOM.SA_B AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA HOM.SA_B TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAG----CAACATAGCG * * **** * *** ** * * ** *** * ** * **** ZEA.MA_B AACCACCATCTTT HOM.SA_B AGACCCCGTCTCT * * ** *** *
Mean pairwise ID: 49.52%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** ** **** *** * ** ***** * * * ** * ** ** * * ZEA.MA_F TTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTC---GATCGGG-TGTCCGCACT ** * * ******** ** ** * ** * * *** ** *** * ZEA.MA_F AAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTT--TAGACCTGAAGC XEN.LAE. AAGTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGA ***** * * * * * * * ** * ** * ** * * * * ** * * ZEA.MA_F GGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT XEN.LAE. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGT ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * * ** ZEA.MA_F GGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA XEN.LAE. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG-CCTGAACAACAC--AGCGAG * **** * *** ** ** ** * ** * * ** ** * ** * * ZEA.MA_F CCACCATCTTT XEN.LAE. ACACAGTTCT- *** * *
Mean pairwise ID: 49.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GCAGGAGGA **** ** * ** *** * ** **** * ** * *** * * * * *** LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * ****** ** * ** ** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG CAN.SPE. GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * ** LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** * LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** *** ** * * * * * *** * * LYC.ES_C CTACCACATTT CAN.SPE. CC-CCGTCTCT * ** * *
Mean pairwise ID: 49.53%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGT----GGGGGCAAC--AATGTGG-TGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ****** * ** ** * ****** * * * * ** * * ***** *** LYC.ES_F AATGTTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGT CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTG-----TCAACGTCGACCGAGCGTCCGTG- * ** ** * ** *** *** ** ** * * * ** ** LYC.ES_F CCAAGCACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTT---GGCCTTTAG CAE.EL_B CCAAGCGCTGCGTCA--CCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAA ****** * * ** ** * * * * * ** * ** * ** ** LYC.ES_F AGTGGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCA CAE.EL_B GGAGTGGTGGATGGTTCAGGACCGAA---AGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCA * * * **** * * * * * **** * ** * **** * ***** LYC.ES_F GTGGAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAA CAE.EL_B GTGGCCGGACTGCG--CTTGTGA--GTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAAT-ACCT-- **** *** ** ** *** **** * ** * * *** * * *** LYC.ES_F TTAAACCATCACTTTT- CAE.EL_B TCAGACCACTTGTTTTT * * **** ****
Mean pairwise ID: 49.67%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AGATGGGACTTTGGG TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTC--- *** * * * ******** * *** ** * ** ***** * HUM.JA_A TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCA-TTCCAAGCCGA TRY.BR_A TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG- * * * * ** **** * ** **** ** ***** ** * * ** HUM.JA_A GAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCA TRY.BR_A GTGTTGAGGT-CGCCA-CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-A * **** * * * * *** **** * ** * * ** ***** ** *** * HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_A ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGC * * ** **** *** ** ******* ****** *** * * ** ** * HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC TRY.BR_A ACACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG------- ** ** ** ** ** ** ** * * ** ** * * HUM.JA_A TTTT TRY.BR_A ----
Mean pairwise ID: 49.68%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * * ** CAN.SPE. CGCT--TG-AGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC **** ** *** * * * **** *** *** **** * * * * * *** * CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG ***** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** * CAN.SPE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** CAN.SPE. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAG--CGAGA TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCT-CGCAGCCTACTCCAGCA * **** * *** ** * * * ** * **** *** * ** * * CAN.SPE. CCCCGTCTCT TRI.AE_A GACCACC--- ** *
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT **** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * ** LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGC-CCTATCCAA GAL.GAL. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTA-TGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTA * * ** ** ******* *** **** * * ** ** * * * LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG GAL.GAL. AGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * ** *** ** * * ** ** ** ** ***** * ** LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC **** **** *** ** ** ***** ****** *** * **** LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA GAL.GAL. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT----AGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACAT-AGCGAGA **** ** ** *** * ** * * * ***** * * * * LYC.ES_O CCACCACTTT GAL.GAL. CCCTGTCTCC ** **
Mean pairwise ID: 49.68%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * * ** * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * *** HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA ORI.CUN. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** **** ** * ** *** * * * * ***** **** HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC ORI.CUN. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGGGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** **** HUM.JA_A CATCTCTTTT ORI.CUN. CCTGTCTCC- * * ***
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * * * ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA HOM.SA_A ATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** * * ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAGACC **** * * * *** * * * * * ** * **** ** * * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT HOM.SA_A CCGTCTCTT--- * * * *
Mean pairwise ID: 49.68%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGCGCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT *** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ****** ZEA.MA_B GCTTTGCGAT---GGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCC FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATG--TCGATCGGG--TGTCCGTAC *** * * * ******** * ** * ** ** * * ** ** ** * * ZEA.MA_B CAAGTTGGTAGTGTCTG-ACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTACA FUG.RUB. TAAGTT--CGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAG ***** ** ** * ** **** * * *** ** ** * **** ZEA.MA_B GCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACG FUG.RUB. GAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA * ** * * *** ** ** ***** * * * *** * * ZEA.MA_B GTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGC FUG.RUB. GTAGTGGGATCGC--GCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAG----TAACACAGC ** * **** * *** ** * * ** * ** * * *** ZEA.MA_B AAACCACCATCTTT FUG.RUB. GGGACTCAGTCTTT * * *****
Mean pairwise ID: 49.68%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** * ** ******* ** ** ** * * * ** * * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * *** HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA RAT.RAT. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** **** ** * ** *** * * * * ***** **** HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC RAT.RAT. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGGGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** **** HUM.JA_A CATCTCTTTT RAT.RAT. CCCGTCTCTT * *** **
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGG--AGACATCAAAGTGGTTGAATAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ** ** ** **** ** ********* * ** * ** * ** LYC.ES_A TGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCAAG XEN.LAE. CTTGAGT--CCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * **** ** * ****** ** *** ** * * ** ** * *** LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT--CCTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** * * * ** * * ** * * ** **** * ** LYC.ES_A GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT ** * **** *** ** ** ****** * ** * **** * * **** * LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAAC-ACAGCGAGACAC **** * * * *** * * * ** *** * **** * * * * * ** LYC.ES_A AACCACCTTT XEN.LAE. AGTTCT---- *
Mean pairwise ID: 49.68%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACC-CAAGTGGGGATGTTAATGTGGT-GGAAT-G TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG * *** * ** *** *** * **** ***** ** **** * LYC.ES_N TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** * LYC.ES_N TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * * ** * ***** * * LYC.ES_N GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG **** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * ******** LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT-----CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-A ****** * ** * * * * * * * * * * ** ** * ** * LYC.ES_N CCATTTTT TET.ROS. CT------ *
Mean pairwise ID: 49.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTA-GAATA *** * ***** * ****** *** ** * ** ** * * * ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TET.ROS. GTCAGAGTA-----TGA----GAGTTTGATGAGACAGTT-TGCTAAGAGTGTGCCCGTTC * * ** *** * * *** ** * * * ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGA-AGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TET.ROS. CAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGG--------GCA *** * * ** ** ** * * * *** *** * * ** ORY.SA_A CTAAAGTGGC-AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC TET.ROS. TTAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTA ***** * *** ** ** * ******** ***** *** ** *** ****** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC TET.ROS. TTGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATC--GGTTCTG---CTATT *************** ** * ** * * * ** * * * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT TET.ROS. CTGATCAGAC-ACT------ * ***** **
Mean pairwise ID: 49.83%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** ** ****** ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG * ** * *** ** * *** * ** **** * ** ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG- LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC * * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * ** ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA * * ******* **** ************** ** * * * * * ** * ORI.CUN. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGG-GCAACATAGCGAGACCCTGTC LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * *** * ** * * * * ***** **** ** * * **** ** * ORI.CUN. TCC LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 49.84%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_L ------------------------------------------------------------ ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT LYC.ES_L GTTGG-GTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCT----GGCCTGCCCTCT **** ** ** * *** **** * * ** ** *** *** ***** * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC LYC.ES_L CCAAGC-ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGG----GTTGCTTGATTC ***** * *** ** * ***** * **** * * * * * * ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC LYC.ES_L CTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTG ********* * ** ************ *********** *** ** ***** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGA-GTCCCTC LYC.ES_L TGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGC * ************* ** *** * * * ** ** **** ** * * * ORY.SA_A TACAAC-AGACCACCATCTTT LYC.ES_L TCCAACTAAACCACCACTTT- * **** * ******* **
Mean pairwise ID: 49.84%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAA------GCTACTGGGAGGCTGAGGCTGG **** * *** *** ** *** * ** * ** * ** ** ** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGG--TCTGCGCCT--GTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGT FUG.RUB. CGGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGT-GTCCGT * * *** *** *** ** **** ** * * ** * *** * **** ORY.SA_B TCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAG FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAA * ***** *** ** * *** ** ****** ** * ** * * * **** ORY.SA_B AGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG FUG.RUB. GGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCA * ** * * * *** ** ** ***** * * **** * * ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGG FUG.RUB. GTAGTGGGATCGCGCCCGTGAATAGAC---GCTGTAGTTCAACCTGAGTAA----CACAG ** * **** ** * ** * ** * * ** *** ** * ORY.SA_B CAGACCACCACCTTT FUG.RUB. CGGGACTCAGTCTTT * * * * ****
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG **** ** * ** ***** ** ***** ** * * * ** * ** * * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG---TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGTT * **** ** * ** ** ** * * ** * * ** ** * *** LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT--CCTAAAGTGGGG XEN.LAE. CGGTATCAA-TATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * * * * *** ** * * ** ** ** * ** * **** * **** LYC.ES_C TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGG ** ** * *** ** ** ***** * * * **** * * **** * * LYC.ES_C GATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACT XEN.LAE. GAT--CGCGCCTGTGA-ATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGT *** ** *** *** *** * * * * * **** * * ** * * * LYC.ES_C ACCACATTT XEN.LAE. TCT------ *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAA----TGGGGGCATTAATGTGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC **** * ** * * ** ***** **** **** * * * *** *** LYC.ES_G GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * * ** ******* * ** *** * * * ** ** * ** LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** *** *** * * ** ** ** * ***** * ** LYC.ES_G GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT **** *** *** ** ** **** *** * *** * **** * LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA FUG.RUB. GGGATCGCG--CCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGA **** ** ** *** * ** * ** * * ** * * * * * LYC.ES_G CCACCACTTTT FUG.RUB. CTCAGTCTTT- * ****
Mean pairwise ID: 49.84%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA---TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * ** *** * ** *** * *** * *** ****** * * TRI.AE_B GCTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATG-TAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA FUG.RUB. GCTTGA---GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA ***** * * * * ******** * * * * * * * ** **** * * TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG---CCTTAAGTG FUG.RUB. AGTTCGGTATCGATATGGTG-CTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG **** * * * **** ** * * *** * * **** *** * * * TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGG FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG * ** ** *** ** ** ***** * * * *** * * ** * TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA FUG.RUB. TGGGATCGC-GCCCGT----GAATAGAC--GCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGG **** * * *** * ** * * *** * * * * ** *** * TRI.AE_B CCACCATCTTT FUG.RUB. ACTCAGTCTTT * * *****
Mean pairwise ID: 49.84%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCA--TGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACAC XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGA--- * ** ** ** * ** ** ***** *** * *** ** * ** * * ARA.TH_E TGGTTCGGGTCCACGGGC-CGGTTCTGTTGTTGGC-ATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA XEN.LAE. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * * * ***** * * * * *** * ** **** * ** ** ** * ** ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTA-AAGTTGG XEN.LAE. GTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * * * **** * * * ** ** ** *** ** * ** *** ** ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * **** * **** * ARA.TH_E CGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA-TGA XEN.LAE. GGGATCGCGCCTGTGAATAGCC--GGTGCAGAACAGCCTG-------AACAACACAGCGA ***** * * * * ** * ** * ***** * ** * ** ARA.TH_E ACCACCATTTT XEN.LAE. GACACAGTTCT *** ** *
Mean pairwise ID: 49.84%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA * ** ******** **** ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * *** * *** *** ** ** *** * * * * *** ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG ***** * **************************** *** *** ************* ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA TRI.AE_C GAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GA * ********************* * ** ** * * * * ***** *** ** ZEA.MA_E CCACCATCTTT TRI.AE_C CCACCATC--- ********
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT **** ** ** * * ** **** **** * * ** ***** * * * LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** *** ***** * *** **** ** ** ** * *** LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *** LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGACC **** ** * * *** * * ** * ****** * * *** LYC.ES_I ACCATTTTT HOM.SA_B -CCGTCTCT ** * * *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACC-CGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTT TET.ROS. GCCAGG----GTAGCA-ATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAG-------TT *** * *** * ** *** *** ** **** ******** * ** LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAG TET.ROS. AGAATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAA * ** * * * **** * * * * * ** * ***** ***** LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG-GA TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ** ****** * ** ** *** ** * *** ** * ** LYC.ES_F TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG * ** ** * ******* ***** ** ** * * ***** ** ******* LYC.ES_F GATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACC TET.ROS. GATAAC------ATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACA *** ** * *** ** * * ** ** * * * ** ** * ** LYC.ES_F ATCACTTTT TET.ROS. CT------- *
Mean pairwise ID: 49.84%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** * *** *** * *** * * ZEA.MA_F TGTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTT CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGC-TATGCC---GATCGGG-TGTCCGCA * ** * * * ******** * * * **** * *** ** *** ZEA.MA_F CCAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAA CAN.SPE. CTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG * ***** * * * *** * * ** ** *** * * *** * ZEA.MA_F GCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACG CAN.SPE. GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * ZEA.MA_F GTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACA CAN.SPE. GTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGTGCAACAT--AGCG ** * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * * ZEA.MA_F GACCACCATCTTT CAN.SPE. AGACCCCGTCTCT * ** *** *
Mean pairwise ID: 49.84%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ***** * * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTAA * * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** ** ** * ** HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGT--CCTAGAGTG CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCAC-CAGGTTGCCTAAGGAG * ** * ** ******* * ** * ** * ** ** **** * * HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG * * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG CAN.SPE. TGGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGA **** ** *** *** **** ** ** * ** * ** HUM.LU_A GACCATTTCTTTT CAN.SPE. GACCCCGTCTCT- **** *** *
Mean pairwise ID: 49.84%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTG-TGGATGT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGCTGGAGGA *** ** * ** *** * ** **** * *** * * * ** * **** * ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTA * ** * * ******* ** ** * * * *** ** *** * * ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAGCG HOM.SA_A AGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG **** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * * ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA * * * * *** ** ** ****** * * * **** * * ** ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGAC HOM.SA_A GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGTGCAACAT--AGCGAGA * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * * ZEA.MA_F CACCATCTTT- HOM.SA_A CCCCGTCTCTT * ** *** *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT * ** ** ** * * ** **** **** * * ** ***** * * * LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** *** ***** * *** **** ** ** ** * *** LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTGGG HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * *** LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ***** ** * *** ** * * ** * LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGACC **** ** * * *** * * ** * ****** * ** * *** LYC.ES_B ACCACTTTT HOM.SA_B CCGTCTCT- * ** *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG * ** ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCC---TGCCCTGTCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ** ** * ** * * * * ** ** * * LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCT---GGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * **** *** * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT RAT.NOR. C--CCGTCTCT * ** ** *
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGA---GGGCATCAGTGTGGTGGAATG HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAG-GCTGGAGGA **** ** * ** *** * ** **** * ** * *** * * * * **** LYC.ES_C TTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCC---TGCCCTGTCCAA HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * * **** ** * ** *** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGG HOM.SA_A GTTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * ** LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** * LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA HOM.SA_A GGGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGA **** ** *** *** *** ** * * * * * *** * * LYC.ES_C CTACCACATTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT * * * **
Mean pairwise ID: 49.84%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATAT TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG * ** *** ** * * *** * * * **** * *** ** *** ***** LYC.ES_J TGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC TET.ROS. TCAG----AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG * * * * ** * * * * * ** * * ***** ***** ** LYC.ES_J AGAGTTGG-ATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ****** ** * ** * * * * * * * ***** * * * LYC.ES_J GA-CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG ** **** * ******** ***** *** *** * * ***** ** ******** LYC.ES_J ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACAC **** * * ***** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_J CACCTTT TET.ROS. T------
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAG------GTTG ** *** ** * * ** * **** * *** ** * *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** * LYC.ES_H TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG ****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * * LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA TET.THE. G--AAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA * ** ** * ******* ***** *** *** * * ***** ** ****** LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA TET.THE. GGATAACATACTCATTAACTGTCAAA-----------CTAATCGGTTCTACTATCAAAGC ****** * * **** ***** **** * * *** LYC.ES_H ACCACCTTTT TET.THE. CAGACATT-- ** **
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG **** * * ** * ****** * ** * * ** * ** * * * HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGG-GTCCAGTGTTAGCTGC--TTACTGGTCTGCCCATTCCAAG CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGC-GTCCGTGCCAAG ** ** ** * * * * *** ** * ** * * * ** * ***** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGG-GTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG * * ** * * ** ** * ********* * * * ** * ** * * * HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG CAE.BRI. TGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG *** ** *** * * ***** * * * **** * ******* * HUM.LU_D GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCAT-GCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGA CAE.BRI. GATAGCG--CTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGA---TACCTTCA----GA **** ** * *** * * ** *** ** ** *** ** * * ** HUM.LU_D CCATTTCTTTT- CAE.BRI. CCACTTGTCATT *** ** * *
Mean pairwise ID: 50.00%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * * ** ORI.CUN. CGCT--TG-AGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC **** ** ** * * * **** *** *** **** * * * * * *** * ORI.CUN. AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG ***** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** * ORI.CUN. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** ORI.CUN. AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCG-CAGCCTA-CTCCAGC * **** * *** ** * * * ** * **** * ** * ** * * * ORI.CUN. CTGTCTCC TRI.AE_A AGACCACC * **
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT **** ** ** * ** **** **** * * ** * * * * * LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** * *** ***** * *** **** * * ** ** * *** LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGGG RAT.NOR. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *** LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG *** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC RAT.NOR. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGACC **** ** ** *** * * * * ** * *** ***** * * * LYC.ES_G CACCACTTTT RAT.NOR. CGTCTCT--- * * **
Mean pairwise ID: 50.00%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA * ** ******** **** ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * *** * *** *** ** ** *** * * * * *** ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG ***** * **************************** *** ***************** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA TRI.AE_C GAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GA * ******** ************ * ** ** * * * * ***** *** ** ZEA.MA_D CCACCATCTT TRI.AE_C CCACCATC-- ********
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAAATGGGACTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT * ***** * ** * ******* ** ** ** * * * ** * HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTC--CAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCACTAA * * * ** ** * ** ** * ***** *** * ** ** ** * ** HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCT--CCTAGAGTGG CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * ** * ** ******* * ** *** *** * **** * ** HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGA-----ATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG **** ** *** *** * **** ** ** * ** * ** * HUM.LU_D ACCATTTCTTTT CAN.SPE. ACCCCGTCTCT- *** *** *
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * * ** * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ****** * ** ** * ** *** * * * ** ** * *** HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA CAN.SPE. TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** **** ** * ** *** * * * * ***** **** HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC CAN.SPE. GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** **** HUM.JA_A CATCTCTTTT CAN.SPE. CCCGTCTCT- * *** *
Mean pairwise ID: 50.00%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAG-TGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ** * ** * ******** ***** * ** * * * *** * HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT ** ** ** * ** * * * ** * * * ** ** ** * * *** HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCT-CCTAAAGCGGAG FUG.RUB. TCGGTATCGATATG-GTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * * ** ** *** ** * * ** * ** * * ***** * ** * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG ** * *** ** ** ***** ** * **** * **** * * HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCA--CTGAGCTGACTCTTAATAGG FUG.RUB. GAT--CGCGCCCGTGAA---TAGAC--GCTGTAGTTCAACCTGAG-TAACAC--AGCGGG *** ** *** *** * *** * * ***** ***** * ** * * ** HUM.JA_B ACCATTTCTTTT FUG.RUB. ACTCAGTCTTT- ** *****
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG--GAGG * * ** ** ** ** **** *** ** * * ** * * ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA RAT.NOR. ATCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA ** * **** * * ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG RAT.NOR. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA RAT.NOR. TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCC---TGGGCAACATAGCGAGA **** * * * *** * * * * * ** * *** **** * * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT RAT.NOR. C--CCGTCTCT- * ** ** *
Mean pairwise ID: 50.00%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGT-----GAGGGCATCAGTGTGGTGGAA GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT **** ** * ** *** ** **** * ** * * * * ** * *** LYC.ES_C TGTTGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG GAL.GAL. CGCTTGA---GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGC--GTCCGCG * * * ****** ** * ** ** * * * * * * * **** * LYC.ES_C CAAAGAGTTGGGTC----TTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAG GAL.GAL. CTAAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGG * *** * ** * *** *** * * ** * ** * ** * ***** * LYC.ES_C TGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGT GAL.GAL. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGT ****** ** * *** ** ** ***** * * ****** * * **** LYC.ES_C GGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTT GAL.GAL. AACGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTA-GCCTGGGCAACA----TAGCG **** ** *** *** * * ** ** * * *** * *** LYC.ES_C AAACTACCACATTT GAL.GAL. AGACC-CTGTCTCC * ** * *
Mean pairwise ID: 50.16%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATGTGGTGGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT * * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * **** * ** LYC.ES_N -GTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA HOM.SA_B CGCTTGA--GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA * * * * * ** ****** * *** **** ** ** ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ****** * * * LYC.ES_N CCACCATTTTT HOM.SA_B CC-CCGTCTCT ** ** * * *
Mean pairwise ID: 50.16%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAATG-TGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT * * ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * * * *** *** LYC.ES_N TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * ** ** * * LYC.ES_N AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_N GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAA-CGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ***** * ** * ** ** * * ** * LYC.ES_N AAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTG-TG---CAACATAGCGAGA **** ** * * *** * * ** * ***** ** * * * LYC.ES_N CCACCATTTTT HOM.SA_A CCCCGTCTCTT ** * * **
Mean pairwise ID: 50.16%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGAA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** ** ZEA.MA_A TGCTTT-GCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATC HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAG-TGCGCTATGCCGATGG--GG--TGTCCGCA **** ** ** ******** * * ** * ** * *** ** ** ** ZEA.MA_A CCAAGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAG-ACCTGG HOM.SA_B CTAAGTTCG--GCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAA * ***** * * ** ** * ** ** *** ** * * *** ZEA.MA_A AGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACG HOM.SA_B GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * ** * * * ZEA.MA_A GTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAG HOM.SA_B GTAGTGGGATCGC---GCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCA----ACATAG ** * **** * *** ** * * * *** ** ** * ** ** ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT HOM.SA_B CGAGACCCCGTCTCT * * * ** *** *
Mean pairwise ID: 50.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTT-GGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA *** * ** * ** *** *** ** * * * * ********* **** ZEA.MA_D GT-TGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAG-CTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGT-GGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTG * *** *** * ** ***** ** *** * * *** ** * *** ***** ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_L GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCT-TCCGCTCTGTGCAGTG * * * ************ *********** *** ** ***** * *** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA---GCCTCACTAAGC LYC.ES_L GAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACT * ******** ** * *** * **** *** * * **** ** ** * * ** ZEA.MA_D AGACCACCATCTT LYC.ES_L AAACCACCACTTT * ******* **
Mean pairwise ID: 50.16%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGG----GCATGTGGGAGATGGGACT--T LEP.COL. -GCC--GGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC *** * * * * * ******** * *** * * * * * ** ** HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCA-TTCCAAG LEP.COL. TGGACCAGC--ATAGGGT-GCTTGCGGCGTTGACG---TGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTG *** **** ** ** * * * * * *** * ** ** ***** * * HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG LEP.COL. TCGGAGGCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG--GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAG ** * *** ** * ***** ** * * * * ***** *** HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTC-TCGGCAGTGGAA LEP.COL. GA-ACTGGGTCAGGCCGGCA--ACGGAGCAGC--CCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCA * * ** ** **** ** ** ******* ******* *** * ** ** ** * * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC LEP.COL. GAACCACACCGCGGAGCCT-----GTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTG-TGAAGCT * * ** *** ** * ** ** * * ** ** ** * * * * HUM.JA_A ATCTCTTTT LEP.COL. TT------- *
Mean pairwise ID: 50.16%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGGTGGGAG-- **** ** *** *** ** *** ** *** * * * ** ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGG-GTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC----GGCCCGCCCG HOM.SA_B --GATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGT--GCGCTATGCCGATGGGGTGTCCG * *** *** ** ** ** * **** ** ** ****** ** * *** ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCT HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGG--GGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * * ** * * ** *** * ** ** * * *** ORY.SA_B AGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAA HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** * * * * *** ** ** ****** * * **** * ORY.SA_B CGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCAT HOM.SA_B CAGTAGTGGGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAC---TCCAGCCTGAGCAAC----AT * ** * **** ** **** ** * *** *** ** * ** ORY.SA_B GGCAGACCACCACCTTT HOM.SA_B AGCGAGACCCCGTCTCT ** * ** ** *
Mean pairwise ID: 50.16%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** * * * ZEA.MA_B CTTTG--CGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATG--TCGATCGGG--TGTCCGCACTA *** * * * ******** * * ** ** * * ** ** ** * * ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTG-ACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCT--GCAGACCTACAG XEN.LAE. AGTT--CGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGG **** ** ** * ** * ** * * *** * ** ** * * * *** * ZEA.MA_B CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGG XEN.LAE. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATCAG ** *** * *** ** ** ****** * * * *** * * * * ZEA.MA_B TGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCA XEN.LAE. TAGTGGGATCGC--GCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AGCG * * **** * *** ** * * ** **** ** ** * * * *** ZEA.MA_B AACCACCATCTTT XEN.LAE. AGACACAGTTCT- * *** * *
Mean pairwise ID: 50.16%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGT----GAGGGTATCAAAGTGGTTGAAC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTG--TGGAT ****** * ** ** * ** * * *** * ** **** ***** ** * CIN.HYB. TTTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGT-CTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAA CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * * ** ** ***** *** * ** ** * * **** **** CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCG-GGTGATGTGAGCTTTAGAATCG CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGA--G * * ** * ** *** * ******* * *** * * ** * ** * * CIN.HYB. GGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGG CAE.BRI. TGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGG ** *** ** *** * * *** * **** * * * * **** CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGC-CCAACAGGA CAE.BRI. CCGGATAGC--GCTTGTGAGTTGTCG-CTCGCCCA--CAGCCTCTCTGATACCTTCAGAC **** * ** * * ** * * *** * ****** ** ** *** CIN.HYB. CACCCATTT-- CAE.BRI. CACTTGTCATT *** *
Mean pairwise ID: 50.16%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACC-CATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACT TET.ROS. ----GCCAGGGTAGCAAT-GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGA--AT * *** **** ** *** *** * ***** * ** * ** ** * ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TET.ROS. AGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACA---GTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA ** * * * * * * ** * ** * ***** ***** * ARA.TH_F GTGAGTAATTAGTGTTGAG---TTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAG TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTG--A ****** ** ** ** * * * * *** * * ** **** * ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG ** * ** * ******** ***** *** ** **** ******* * ***** * ARA.TH_F GATCACG-GTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCA-AGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT--- *** ** * * * *** * * * * * ***** ** **** * * ARA.TH_F CACCATTTT TET.ROS. ---------
Mean pairwise ID: 50.16%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATC-CAAGTGGAGACATCAAAGTGGTT-GAATAT TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** ** *** ** * * *** * * * **** * *** ** *** ***** LYC.ES_A TGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC TET.ROS. TCAG----AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAG * * * * ** * * * * * ** * * ***** ***** ** LYC.ES_A AGAGTTGG-ATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG TET.ROS. TGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAG ****** ** * ** * * * * * * * ***** * * * LYC.ES_A GA-CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC-CCGCTCTGTGCAGTGGAAGG TET.ROS. GAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGG ** **** * ******** ***** *** *** ** ***** ** ******** LYC.ES_A ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC TET.ROS. ATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCT------GCTATTCTGATCAGACAC **** * * ***** * * * * * ** ** * ** LYC.ES_A CACCTTT TET.ROS. T------
Mean pairwise ID: 50.16%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT LYC.ES_L ---------------------------------------------------------GTT * * TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG LYC.ES_L GGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT * * * * * ** *** ** * ** * ****** **** ****** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAG--CTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGG--CTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG * **** * * *** **** ****** ****** * * * * *** **** TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * ** ************ *********** *** * ***** * ******* TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG--GGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGAC LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAAC ***** *** * *** * * ** *** ** * *** * ** ***** * * ** TRI.AE_A CACC----- LYC.ES_L CACCACTTT ****
Mean pairwise ID: 50.31%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG-ACAGAGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * *** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA RAT.RAT. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT-- * ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT-- RAT.RAT. AGCGAGACCCCGTCTCTT *** * ** ***
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT-CGGATC *** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** ***** ZEA.MA_G CTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTC XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGCA *** * ** ******** ******* * *** ** *** ZEA.MA_G CCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCA--GACCTGA XEN.LAE. CTAAGTTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA * ***** * * * ** * * * *** ** * ** * * ** * ZEA.MA_G AGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACG XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCA * ** *** * *** ** ** ****** * **** * * * ZEA.MA_G GTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC XEN.LAE. GTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AGC ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** ** * *** *** ZEA.MA_G AGACCACCATCTTT XEN.LAE. GAGACACAGTTCT- *** * *
Mean pairwise ID: 50.32%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACC-CATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT TET.ROS. GCCAGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGT ** * *** ** *** *** * ***** * * * ** * ** * TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT TET.ROS. CAG---AGTATGAGAGTTTGA---TGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA * ** ** * ** ** ** * * ************ TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGG----CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC- TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCA----GGGCATTAAAGAGCT * *** * ***** ** * * **** ** *** **** ** TRI.AE_B -AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCGCTTCCAACGGTGGA TET.ROS. GAGGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGA *** *** * * ******* ***** *** ** **** ******* ****** TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC TET.ROS. AGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAATC-GGTTCTGCTATTCTG--ATCAGACAC ********* * * * * * ** ** ** *** * * ** * ** TRI.AE_B CACCATCTTT TET.ROS. T---------
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG TET.THE. GCCAGGGT-AGCAAT----ACCTGTG-TCTATATGTGG---CATAAACAATGTAGGTTGT *** * * ***** ***** * * ** ** * **** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCA-GTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TET.THE. GATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACA * * * * * * * * * ** * ** ** ***** ***** * HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG TET.THE. ATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCA-GGGCATTAAAGAGCTAAG ****** ** ** **** * *** ** * * * **** ** HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG TET.THE. GA-AACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG * ** ** * ******** ***** *** ** ** * ***** * ******* HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC TET.THE. GATAACATACTCAT--TAACTG------TCAAACT--AATCGGTT--CTACTATCAAAGC ****** * * ** *** ** ** * * ** * ** ** * * HUM.LU_A CATTTCTTTT TET.THE. CAGACATT-- ** **
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT TET.ROS. -GCCAGGGTAGCA-ATGCCTGTGACCTC-GTGTGG---CATAAACAATGTA--GTTAGAA *** * * * ****** *** *** ** * **** * ** * HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGT--TAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGG TET.ROS. TAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGT ** * * ** ** ** * ** ** ***** ****** * * HUM.LU_B GAGTTGGGCTGA--GTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG TET.ROS. GAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAA-AGAGCTGAGGA ****** ** * **** * *** ** * * **** **** HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA TET.ROS. -ACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGA * ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * ********* HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGAC-TCTTAATCGGACCA TET.ROS. TAAC------ATACTCATTAA-CTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACAC **** * ** ** * ** * * * *** *** * * *** *** HUM.LU_B TTTCCTTT TET.ROS. T------- *
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * * *** * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** *** * ** ** * ** *** * * * ** ** * *** HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA HOM.SA_A TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** **** ** * ** *** * * * * ***** **** HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC HOM.SA_A GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGTGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** **** HUM.JA_A CATCTCTTTT HOM.SA_A CCCGTCTCTT * *** **
Mean pairwise ID: 50.32%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG--GAATAT * ** **** ********** * ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_M TGGGCTGTC----CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTGTCC ** ** * * * *** ** ** *** * * * * **** **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_M AAGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT *** * ** * * *** *** * ** ** **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_M GGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG ** * * * ** ********* ************ ** * * ****** * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_M GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA ********* *** ** ** * *** ** * * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_M ACAACCACCTTT ** *********
Mean pairwise ID: 50.32%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGG--GGCATGTGGGAGATGGGACTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** * ** * ******* ** ** ** * * * * ** * HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGC-TTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * * ****** * ** ** * ** *** * *** ** ** * *** HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-CCTAAAGAGGA HOM.SA_B TTCGGCATCAATATG-GTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** **** ** * ** *** * * * * ***** **** HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG * * * * *** ** ** ****** * ****** ** **** * HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGAC HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTG--AAT--AGCCACTGCACTC-CAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC **** ** * * *** * * ***** ** * ** ** * * ** **** HUM.JA_A CATCTCTTTT HOM.SA_B CCCGTCTCT- * *** *
Mean pairwise ID: 50.32%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** ** LYC.ES_H ATTGGGCTGTACCAGATGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGACTTGCCCTATCCA HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA ** * **** * * ****** * *** **** ** ** ** * * LYC.ES_H AGCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATT-CGTAAAGTG HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** ** * ** **** ** * ** * *** * * LYC.ES_H GGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * * * *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_H AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAG **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * LYC.ES_H CAACCACCTTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT- ** ** *
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACT-CGGGAGGCTGAGACAGGAGGA *** ** * ** *** ** **** * *** * * * ** * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGG---CCTGGGCTTGTATGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGTTC RAT.NOR. TC--GATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGG-TGTCCGCAC ** ** ** ** ** ******* ** ** * * * *** ** *** * ZEA.MA_F CAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAG RAT.NOR. TAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG ***** * * * *** * * ** ** *** * * *** * * ZEA.MA_F CGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG RAT.NOR. AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCAG ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * * ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG RAT.NOR. TAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGGGCAACAT-AGCGAG * * **** * *** ** ** ** * ** *** ** * ** *** * ** ZEA.MA_F ACCACCATCTTT RAT.NOR. AC--CCGTCTCT ** ** *** *
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_C -----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAA * ** ******** **** ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_C GTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * *** * *** *** ** ** *** * * * * *** ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG TRI.AE_C GCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ***** * **************************** ********************* ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC TRI.AE_C AAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GAC ********************* * ** ** * * * * ***** *** *** ZEA.MA_G CACCATCTTT TRI.AE_C CACCATC--- *******
Mean pairwise ID: 50.32%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTT-GGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA *** * ** * ** *** *** ** * * * * ********* **** ZEA.MA_E GT-TGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAG-CTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGT-GGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTG * *** *** * ** ***** ** *** * * *** ** * *** ***** ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG LYC.ES_L GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCG-CTCTGTGCAGTG * * * ************ *********** *** ** *** ** * *** ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA---GCCTCACTAAGC LYC.ES_L GAAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACT * *********** * *** * **** *** * * **** ** ** * * ** ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT LYC.ES_L AAACCACCACTTT- * ******* **
Mean pairwise ID: 50.32%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT LYC.ES_L ---------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTT *** * * **** ** TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT-T LYC.ES_L G----GGTTCGGTAG-----GCTTATAGT---------CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT * **** * * * **** * * *********** ****** * TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGG--CCTTAAGTGGCAGG LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG ** *** ****** * ****** * ** * *** ****** * TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ** *** ******************* *** ** ** ***** * ********* TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGC-AGACCA LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA **** ** * *** * * ** * *** * * ** * * * **** TRI.AE_B CCATCTTT LYC.ES_L CCACTTT- *** **
Mean pairwise ID: 50.36%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGA--G SCH.POM. ---CGCTGTAATGGC--TTGGTCGAAGTGTTTAGTACTCCCAATAGTGCATGTTCGGTGG *********** ** **** **** * * * ** * ** ***** * YAR.LI_A TCTTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGC-G SCH.POM. TCTCGGGTTCGAGTCTCG--CTTTCGATCCCTCGATCTGCCACGTCTGTTCGAAGAGTAG *** *** ** ** * * ** * * * ** * * * * ** * * * YAR.LI_A TCTCGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGT SCH.POM. TCTTCGT---GGCAACTGGCAGTTAAA---CCGTG-TAGTACCGA-TGGAGGTTGGAAAC *** ** * ** *** * * * **** ** * * *** * YAR.LI_A GGAGCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGG SCH.POM. AATGCACATCACTACCGGGTCTTGGGCAGTGCG-ATAGCGATGGGATT-CACCTTCGCAG *** ** * * * ** *** * ** *** ****** ** * * * YAR.LI_A TATATGTTATGGAAG-ATATTTACGATCACGATT SCH.POM. GATGTGC-ATGGAAGTATAAACACAACGGTCGTT ** ** ******* *** ** * **
Mean pairwise ID: 50.47%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRI.AE_C --------------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTC * *** ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGA-GGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TRI.AE_C CAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT------TGGGCCTCACGGTCC ******* ******* *** ***** * ***** * * ** ** * * ** ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TRI.AE_C ATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCC *** *********** **************************** ************* ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT TRI.AE_C AACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG-GGCCTCGTAGCCTACT * *************** *** ******* * ****** **** * ** ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_C CCAGC-GACCACCATC--- ** * **********
Mean pairwise ID: 50.47%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG-ACAGAGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * *** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA RAT.RAT. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--A * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** * ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT- RAT.RAT. GCGAGACCCCGTCTCTT ** * ** *** *
Mean pairwise ID: 50.48%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_L -----------------------------------------------------------G ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_L TTGGGTTGACCCAGATGGTT-GGGTTCGGTAGGC-TTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAA *** * ** * ** *** *** ** * * * * ********* **** ZEA.MA_G GT-TGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAG-CTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGT-GGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTG * *** *** * ** ***** ** *** * * *** ** * *** ***** ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_L GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGG * * * ************ *********** *** ** ***** * **** ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA---GCCTCACTAAGCA LYC.ES_L AAGGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA *********** * *** * **** *** * * **** ** ** * * ** * ZEA.MA_G GACCACCATCTTT LYC.ES_L AACCACCACTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 50.48%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT-CGGATC *** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** ***** ZEA.MA_E CTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTC XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGCA *** * ** ******** ******* * *** ** *** ZEA.MA_E CCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCA--GACCTGA XEN.LAE. CTAAGTTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA * ***** * * * ** * * * *** ** * ** * * ** * ZEA.MA_E AGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAAC XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATC * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * * * ZEA.MA_E GGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG XEN.LAE. AGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AG ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** ** * *** ** ZEA.MA_E CAGACCACCATCTTT XEN.LAE. CGAGACACAGTTCT- * *** * *
Mean pairwise ID: 50.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_L ----------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGT ** * ** **** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT LYC.ES_L TGGGTTCG---------GTAGGCTTATAGT---------CTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA *** ** * ** * ** ** ********** ****** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT * *** * * **** * ** * * ****** * * * **** ***** ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * ** *********** *********** *** ** * *** * * ******** ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC-AGACC LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC ***** ** ** *** * * * **** *** ** * ** * * * *** ZEA.MA_C ACCATTTTT LYC.ES_L ACCACTTT- **** ***
Mean pairwise ID: 50.50%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGT--GTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAGTC *** * * ****** *** * ***** * * * *** HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG TET.ROS. AGAGTATGAGA--GTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAG ** ** ** * * * * ** * * ** ***** ****** * * *** HUM.JA_A TTGGGCTG-TGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT TET.ROS. TTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAG--GACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAAC *** ** ** * * * * * * ** * * ******* * * ** HUM.JA_A -GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA TET.ROS. CGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAA ** * ******* ***** *** ** ** * ***** * ************ HUM.JA_A CGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCT TET.ROS. CATACTCAT-TAACT---GTCAAGCTAATCGGTTC-TGCTATTCTGATCAGACACT---- * * *** * ** * ** * * *** * * ******* * HUM.JA_A TTT TET.ROS. ---
Mean pairwise ID: 50.63%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG-ACAGAGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * *** * *** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG RAT.RAT. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT RAT.RAT. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA RAT.RAT. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA RAT.RAT. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT-- * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT- RAT.RAT. AGCGAGACCCCGTCTCTT *** * ** *** *
Mean pairwise ID: 50.63%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT *** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ****** ZEA.MA_D TCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGT *** * * ** ******** ** ****** * *** ** **** ZEA.MA_D CCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTG FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATA--TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTA * ***** * * * * * *** * ** *** ** * * *** ZEA.MA_D AAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAA FUG.RUB. AGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCT * * ** * * *** ** ** ***** * * * **** * ZEA.MA_D CGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA FUG.RUB. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAA--CCTGAGTAACAC--A * ** * **** * *** ** * * *** ** *** *** * ZEA.MA_D GCAGACCACCATCTT- FUG.RUB. GCGGGACTCAGTCTTT ** * * * ****
Mean pairwise ID: 50.63%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA ORI.CUN. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT--A * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** * ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT ORI.CUN. GCGAGACCCTGTCTCC ** * * ***
Mean pairwise ID: 50.63%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRY.BR_A ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGC-TTAGCGGG **** * ** *** *** *** ******* * * * ** * * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRY.BR_A GACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT----CTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG----- *** * * **** * **** * * *** * * * ** * ORY.SA_B AGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACC--TAGA TRY.BR_A -GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGA----GGCGTTCTCGCGCCGTTAAA ******* ** *** ** **** * ** **** * ** ** ** * ORY.SA_B GTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-TTCCAACG TRY.BR_A GTGG-GGGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTT **** *** * * ** **** *** ** ******* ** * * **** ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTC-CATG TRY.BR_A CGAGAAGCACACCGAGGA---GCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAG **** * * ** * *** * * ** * ** ** ******** * ** * * ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT TRY.BR_A GCGG------------ ** *
Mean pairwise ID: 50.64%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGA--GCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGT-CGGATC *** ** **** *** * ** ***** ** * ** * ** ** ***** ZEA.MA_D CTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTC XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGCA *** * ** ******** ******* * *** ** *** ZEA.MA_D CCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCA--GACCTGA XEN.LAE. CTAAGTTCGGTATCAATA-TGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAA * ***** * * * ** * * * *** ** * ** * * ** * ZEA.MA_D AGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAAC XEN.LAE. GGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACCCCCGTGCCGATC * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * * * ZEA.MA_D GGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAG XEN.LAE. AGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAG--CCTGAACAACAC--AG ** * **** * *** ** * * * ** *** ** ** * *** ** ZEA.MA_D CAGACCACCATCTT XEN.LAE. CGAGACACAGTTCT * *** * *
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT **** ** ** * * ** **** **** * * ** ** * * * * LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** *** ***** *** **** * * ** ** * *** LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGGG CAN.SPE. TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *** LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG *** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC CAN.SPE. GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGAC **** ** ** *** * * * * ** * ***** * * * ** LYC.ES_G CACCACTTTT CAN.SPE. CCCGTCTCT- * * ** *
Mean pairwise ID: 50.65%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAG----TGGGGGCATTAAAGTGATGTGAA *** ** * ** *** * ** **** ** ** * *** * * *** ** HOM.SA_B CGCT--TG-AGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT TRI.AE_A CGCTGTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTA--CTGCTGGCCCGCCCGTTCC **** ** *** * * * **** *** *** **** * * *** * *** * HOM.SA_B AAGTTCGGCATCAATATGGT--GACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGG TRI.AE_A AAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTC-CATAATG ***** * * * * ** * ** * ** * * *** * *** * HOM.SA_B AGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGT TRI.AE_A TGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGT ** * ** * *** ** ** ****** ** **** * * ** HOM.SA_B AGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAG--CGAGA TRI.AE_A GGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTC-GCAGCCTACTCCAGCA * **** * *** ** * * * ** * **** *** * ** * * HOM.SA_B CCCCGTCTCT TRI.AE_A GACCACC--- ** *
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ***** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** * LYC.ES_H GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** * LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC * *** * * * * * * ** * * ******** * LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT * ************* **** ******* ** * * ***** ** ********** LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT-------------------------------- **** **** * * *** * * ** * LYC.ES_H CCTTTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_D --------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_D GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA **** ** *** * ** * * * **** *** * * **** ** ** *** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_D CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_D ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACC * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ** ******* * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_D ACTTTT ******
Mean pairwise ID: 50.65%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAG-TGTGGTGGAATG-T HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT **** ** * ** *** * ** **** * ** * * ** ***** * * * LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGT---GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * ****** ** * ** *** * * * * *** ** ** * *** LYC.ES_C CAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAA-TATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * * *** * * ** ** * * ** * ***** * *** LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG *** ** * *** ** ** ***** * * ****** *** **** * LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC HOM.SA_B GGAT--CGCGCCTGTGA---ATAG--CCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGAC **** ** *** *** *** ** * * * * * *** * ** LYC.ES_C TACCACATTT HOM.SA_B C-CCGTCTCT ** * *
Mean pairwise ID: 50.79%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA ORI.CUN. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT-- * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT ORI.CUN. AGCGAGACCCTGTCTCC *** * * ***
Mean pairwise ID: 50.79%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ORI.CUN. TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT ORI.CUN. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA ORI.CUN. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA ORI.CUN. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACAT-- * ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT- ORI.CUN. AGCGAGACCCTGTCTCC *** * * ***
Mean pairwise ID: 50.79%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCA-------GCTTCTTGACGGTAGACAAGTG *** * ** *** * ** *** * *** ** ** *** ** ** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTG----GCCTGCCC--TGTCCAA CAE.BRI. TGGATGGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGT *** ***** *** * **** ** ** * * * ** **** LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGG----CCAAGCG-AAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAA CAE.BRI. GCCAAGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAG ** *** * ** *** *** ** ** ****** * * * * **** * *** LYC.ES_C GTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAG CAE.BRI. GAGTGGTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAG * * **** ** ** *** * * **** ** *** **** * ****** LYC.ES_C TGGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT CAE.BRI. TGGCCGGATAGCGCTTGTGAGTTGTC---GCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGA *** ***** ** * ** * * ** * * * ** * * ** LYC.ES_C TAAACTACCACATTT CAE.BRI. CCACTTGTCATT--- * * **
Mean pairwise ID: 50.80%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT *** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ****** ZEA.MA_G TCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGT *** * * ** ******** ** ****** * *** ** **** ZEA.MA_G CCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAA FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATA--TGGTGCTCCTGGGGGAGCCC-GGGATCACCAGGTC-GCC * ***** * * * * * *** * ** *** ** ** **** * * ZEA.MA_G GTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGG FUG.RUB. TAAGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTC * *** ** * * * ** * * * *** **** * * * * ZEA.MA_G TGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA FUG.RUB. AGTAGTGGGATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAA--CCTGAGTAACAC--AGCG * * * ** *** ** * * *** ** *** *** *** ZEA.MA_G GACCACCATCTTT FUG.RUB. GGACTCAGTCTTT * * * *****
Mean pairwise ID: 50.80%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG * * ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** ** LYC.ES_K ATTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ****** * *** *** * *** ** ** * * LYC.ES_K AGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGCG HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAG **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * LYC.ES_K CAACCACCTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT ** ** *
Mean pairwise ID: 50.83%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCC-CAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA LEI.MAJ. -------GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGA ** * ** * ***** * * * ** ***** ** ******* HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA LEI.MAJ. ---CGTGGACCAGCGAGG--------GTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTC-TGCTTG * ** ** *** ** * *** * ** * **** * ** HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGG-TGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG- LEI.MAJ. GCTGTGTGTCGGTGTGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGC-GCGGGTCCGCCGTTGAAGC * * * ** * *** * ** *** * ** *** * * * * *** * ** HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG LEI.MAJ. GAGGGAACCGGGTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCC-GTTGCA * * ******* **** ************** ** * * * * * ** * HOM.SA_B GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGA-GCAACATAGCGAGACCCCGTC LEI.MAJ. GAATCACACC-GCGGAGCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--- * *** * ** * * * * ***** **** * ** * * **** ** HOM.SA_B TCT LEI.MAJ. ---
Mean pairwise ID: 50.94%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA HOM.SA_A TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT-- * ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT-- HOM.SA_A AGCGAGACCCCGTCTCTT *** * ** ***
Mean pairwise ID: 50.95%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTG-GCGGAT *** * * ** *** * ** ***** ** *** *** * *** * ****** ZEA.MA_E TCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGT-----CGATCGGG-TGTCCGT *** * * ** ******** ** ****** * *** ** **** ZEA.MA_E CCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTG FUG.RUB. ACTAAGTTCGGTATCGATA--TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTA * ***** * * * * * *** * ** *** ** * * *** ZEA.MA_E AAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAA FUG.RUB. AGGAGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCT * * ** * * *** ** ** ***** * * * ** * * ZEA.MA_E CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA FUG.RUB. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAA--CCTGAGTAACAC--A * ** * **** ** *** ** * * *** ** *** *** * ZEA.MA_E GCAGACCACCATCTTT FUG.RUB. GCGGGACTCAGTCTTT ** * * * *****
Mean pairwise ID: 50.95%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRY.BR_B ----AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTT--CGGGGGC--TGATCCCGC-TTAGCGGG **** * ** *** *** *** ******* * * * ** * * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRY.BR_B GACGTCTTGGACAAGCGGGGGTT----CTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTG----- *** * * **** * **** * * *** * * * ** * ORY.SA_B AGTTGCGTAGCG-TGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACC--TAGA TRY.BR_B -GTTGCGTGTCGGTGTTGAGGTCGCCACTGTAGAGA----GGCGTTCTCGCGCCGTTAAA ******* ** *** ** **** * ** **** * ** ** ** * ORY.SA_B GTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGC-TTCCAACG TRY.BR_B GTGG-GGGGAACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTT **** *** * * ** **** *** ** ******* ** * * **** ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTC-CATG TRY.BR_B GCAGAAGCACACCGAGGA---GCATCTCAGGACT--TTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAG * **** * * ** * *** * * ** * ** ** ******** * ** * * ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT TRY.BR_B GCGGTTT--------- ** *
Mean pairwise ID: 50.95%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG-GAGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * *** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT RAT.NOR. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA RAT.NOR. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA RAT.NOR. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACA-TA * ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** ** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT RAT.NOR. GCGAGACCCGTCTCT- ***** ***
Mean pairwise ID: 50.96%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGGTGGTGGAATA XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG * ** ** ** **** ** ***** *** * ** ** * ** *** LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * **** ** ******* ** **** * * * ** ** * *** LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT--CCTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * * ** *** *** * * ** ** ** ** **** * ** LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT **** *** * *** ** ** ***** ***** *** * **** * LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGC-AGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACA **** ** ** *** * * ** * * * ****** * * ** * * LYC.ES_E CTACCACATTTT XEN.LAE. GTTCT------- * *
Mean pairwise ID: 50.97%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTT-TCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCG--GTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA * * * * ** ** * * ** *** * * ***** ****** ******* ARA.TH_E GTGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGG-CTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGT-GGGG **** ** * *** * * **** * * *** * * * ******* ** * ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ************************* *** * * ***** ******** * ARA.TH_E GATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACT--ATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAAC-TAAA *** ** * * ** * * *** * * * **** *** * * ** * * ** ARA.TH_E CCACCATTTT LYC.ES_L CCACCACTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 50.97%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTA-AGGTGGTGGAATATT TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT- * ** *** ** * * ** * * * **** *** * ** LYC.ES_E GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGCTCCAAACAAT ** * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** * LYC.ES_E GAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTG--GGGT TET.THE. GAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGAC--TCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGG ****** ** ** ** * * * ** * * ** ** ***** * * LYC.ES_E GGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TET.THE. AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA ** * * ******* ***** ** ***** * ****** ** ********* LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC TET.THE. TAAC------ATACTCATTAACTGTCA-----AACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAG **** * * ** * ** ** ** ** * * *** ** * * LYC.ES_E CACATTTT TET.THE. -ACATT-- *****
Mean pairwise ID: 51.10%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA HOM.SA_A CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--A * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** * ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT- HOM.SA_A GCGAGACCCCGTCTCTT ** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.10%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA CAN.SPE. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT-- * ** * **** * *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT- CAN.SPE. AGCGAGACCCCGTCTCT *** * ** ***
Mean pairwise ID: 51.12%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGTGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** ** * ** *** * ** **** * *** *** * ****** * ZEA.MA_F TGTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTT HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGC-TATGCCGATGG--GG--TGTCCGCA * ** * * * ******** * * * **** *** ** ** *** ZEA.MA_F CCAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAA HOM.SA_B CTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAG * ***** * * * *** * * ** ** *** * * *** * ZEA.MA_F GCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACG HOM.SA_B GAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGATCA * ** * * * *** ** ** ****** * * * **** * * ZEA.MA_F GTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACA HOM.SA_B GTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCA-CTCCAGCCTGAGCAACAT--AGCG ** * **** * *** ** ** ** * ** *** ** **** *** * * ZEA.MA_F GACCACCATCTTT HOM.SA_B AGACCCCGTCTCT * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.13%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATG---GGGGCATTAATGTGGTGGAATG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG **** ** ** *** ** ***** *** * ** * ** ** *** * LYC.ES_G TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * ** * ** ****** ** **** * * * ** ** * *** LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT--CCTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** *** *** * * ** ** ** ** **** * ** LYC.ES_G GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT **** **** *** ** ** ***** ***** *** * **** * LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA XEN.LAE. GGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCGGTGC-AGAACAGCCTGA---ACAACAC--AGCGAG **** ** ** *** * * ** * * * ****** * * * * * LYC.ES_G CCACCACTTTT XEN.LAE. ACACAGTTCT- *** * *
Mean pairwise ID: 51.13%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAG------GTTG ** *** ** * * ** * **** ***** * **** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** * LYC.ES_N TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG ****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * * LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAA TET.THE. G--AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA * ** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * ******* LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC TET.THE. GGATAACA------TACTCATTAACTGTCAAA----CTAATCGGTT-CTACTATCAAAGC ******* * ** * * * * ** ** **** ** * ** *** * LYC.ES_N ACCATTTTT TET.THE. CAGACATT- * **
Mean pairwise ID: 51.13%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** ** LYC.ES_J ATTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ****** * *** *** * *** ** ** * * LYC.ES_J AGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * * ****** *** **** * LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAG **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * LYC.ES_J CAACCACCTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT ** ** *
Mean pairwise ID: 51.20%
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAG TRI.AE_C ----------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAG *** ****** ****** LYC.ES_L CATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGG TRI.AE_C TTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGC * **** * * *** * * * **** * * * * *** **** LYC.ES_L GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAA TRI.AE_C AGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA * ** ************ *********** *** * ***** * ****** LYC.ES_L GGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAA TRI.AE_C GGATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTG--GGCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GA ********** * *** * * ** ** ** * *** * * ** ***** * * LYC.ES_L CCACCACTTT TRI.AE_C CCACCATC-- ******
Mean pairwise ID: 51.26%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG HOM.SA_A TCGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT HOM.SA_A CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA HOM.SA_A AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA HOM.SA_A TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT-- * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT- HOM.SA_A AGCGAGACCCCGTCTCTT *** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.27%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG-GAGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * *** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT RAT.NOR. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA RAT.NOR. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA RAT.NOR. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACA-TAG * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** ** ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT RAT.NOR. CGAGAC--CCGTCTCT **** ** *** *
Mean pairwise ID: 51.27%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA CAN.SPE. CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT--A * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** * ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT CAN.SPE. GCGAGACCCCGTCTCT ** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.28%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT **** ** ** * * ** **** ** * *** * * * ** *** LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA ORI.CUN. TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCC---TGGGCAACAT-AGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * *** ***** * * * LYC.ES_G ACCACCACTTTT ORI.CUN. ACCCTGTCTCC- *** **
Mean pairwise ID: 51.29%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGG-TGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC **** * ** ** * ** ***** ***** **** * * *** *** *** LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * ** ******** * ** *** * * * ** ** * ** LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG * * * * * ** *** *** * * ** ** ** * ***** * ** LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT **** *** *** ** ** **** *** * *** * **** * LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC-AGCGGGA **** ** ** *** * ** * ** * * ** * * * * * LYC.ES_O CCACCACTTT FUG.RUB. CTCAGTCTTT * ****
Mean pairwise ID: 51.30%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACC-CAAATGGGGGCATTAATGTGGT-GGAAT-G TET.ROS. GCCAGGGT-AGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG *** * * ** **** * *** *** * *** * ***** ** **** * LYC.ES_I TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** * LYC.ES_I TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * * ** * ***** * * LYC.ES_I GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG **** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * ******** LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT-----CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-A ****** * ** * * * * * * * * * * ** ** * ** * LYC.ES_I CCATTTTT TET.ROS. CT------ *
Mean pairwise ID: 51.32%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGG--AGATGGGACTTTGGG TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTC--- *** * * * ******** * *** ** * ** ***** * HUM.JA_A TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCA-TTCCAAGCCGA TRY.BR_B TTGGACAAGCGG---GGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCG- * * * * ** **** * ** **** ** ***** ** * * ** HUM.JA_A GAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCA TRY.BR_B GTGTTGAGGT-CGCCA-CTGTAGAGAGGC---GTTCTCGC-GCCGTTAAAGTGGGGGG-A * **** * * * * *** **** * ** * * ** ***** ** *** * HUM.JA_A ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA TRY.BR_B ACGGGTCAGGCCGGTG--ACGGAGCAGC--CCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGC * * ** **** *** ** ******* ****** *** * * ** * ** * HUM.JA_A ACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC TRY.BR_B ACACCGAGGAGCATCTCAGG--ACTTTGCGCCCCAAGTG---TCGTCGCGAGGCGGTTT- ** ** ** ** ** ** ** * * ** ** * ** * * * HUM.JA_A TTTT TRY.BR_B ----
Mean pairwise ID: 51.42%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAG-GAGGA *** ** * ** *** ** **** ** *** *** * ** * * *** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG RAT.NOR. TCGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT RAT.NOR. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA RAT.NOR. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA RAT.NOR. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGGGCAACA-TA * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT RAT.NOR. GCGAGAC--CCGTCTCT **** ** *** *
Mean pairwise ID: 51.42%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * *** * * *** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG CAN.SPE. TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGC-----CGATCGGG-TGTCCG * *** * ** ******** * ******* * *** ** *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT CAN.SPE. CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA CAN.SPE. AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA CAN.SPE. TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGTGCAACAT-- * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** * ** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT CAN.SPE. AGCGAGACCCCGTCTCT *** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.45%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATA-GGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCG--GTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA * * * **** *** ** ** * ** *** ** ****** ****** ******* ARA.TH_G GTGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGG-TTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAG-TGGGG **** * * * ** * **** * ** * * ** ****** * * * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ***** ******* *********** *** * ** ******* ******** * ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACT--ATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGA LYC.ES_L GATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGC--TCCAACTAA ** ***** ** ** * * **** * * * * * *** * ** * * ARA.TH_G ACCACCATTTT LYC.ES_L ACCACCACTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 51.45%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAA-GCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGT TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** **** * ** * ** ** ** * ** ZEA.MA_F TTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TET.ROS. T------CAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAG-AGTGTGCCCGTTCCAAA * * ** * ** * * * * * ** * ************ ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCT--GGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACC-TGAAGCGG TET.ROS. CAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAA----TAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAG * ** *** ***** * * * ** * ** ** * * ** * ZEA.MA_F C--AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT TET.ROS. CTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTATTGTGGT * *** * ** * ******** ***** *** ** *** *** **** *** ZEA.MA_F GGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA TET.ROS. GGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCTG--CTATTCTGATCAGA ** ********* * * * ** * * ** ***** * * * * * **** ZEA.MA_F CCACCATCTTT TET.ROS. C-ACT------ * **
Mean pairwise ID: 51.45%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_L ----------------------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGT ** * ** **** * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_L T------GGGTTCGG----TAGGCTTATA---------GTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGC * ** *** * * ***** ** * * ********* ****** ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGG-CCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LYC.ES_L ATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGG *** *** * * **** * **** * ****** *** * *** *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_L TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCT-TCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** ** ***** * **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCG-GTCCAGA---GCCTCATTAAACAGA LYC.ES_L GGATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAA ******* ** * *** ** ** *** * * ** ** ** * ** * * ZEA.MA_F CCACCATCTTT LYC.ES_L CCACCACTTT- ****** **
Mean pairwise ID: 51.48%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ***** *** ** * *********** ** **** *** ** *** * **** LYC.ES_N GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** * LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC * *** * * * * * * ** * * ******** * LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT * ************* **** ****** *** ** *** ************** LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------- ** ****** * * ** * * *** * LYC.ES_N TTTTT ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 51.60%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCG---GGGGCATTAAGGTGGTGTGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * * ** *** * ** ***** * **** *** * *** * * ZEA.MA_F GTTTC--CTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTC FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCG-GACTATGTC---GATCGGG-TGTCCGTAC * ** ** * * ******** * ** * * ** * * *** ** **** * ZEA.MA_F CAAGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAG--ACCTGAAG FUG.RUB. TAAGTTCGGTATCGATA-TGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGG ***** * * * * * *** **** * * *** *** * *** * * ZEA.MA_F CGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGG FUG.RUB. AGGGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAG-GTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAG ** ** * *** ** ** ***** * * * **** * * * ZEA.MA_F TGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAG FUG.RUB. TAGTGGGAT--CGCGCCCGTGAATAG-ACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACAC--AGCGG * * **** * *** ** ** * * ** * * ** *** ** * * * ZEA.MA_F ACCACCATCTTT FUG.RUB. GACTCAGTCTTT * * *****
Mean pairwise ID: 51.60%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT **** ** ** * * ** **** ** * *** * * * *** *** LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA HOM.SA_A TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * ***** * * * LYC.ES_G ACCACCACTTTT HOM.SA_A ACCCCGTCTCTT *** * ** **
Mean pairwise ID: 51.60%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGG-TGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * ** * ** ** * ** ***** ***** **** * * *** *** *** LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTT-GGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA FUG.RUB. GCTTGA--GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAA * * * * ** ******** * ** *** * * * ** ** * ** LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG FUG.RUB. GTTCGGTATCG-ATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG ** * * * * ** *** *** * * ** ** ** * ***** * ** LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAA--ACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGT **** ** * *** ** ** **** *** * *** * **** * LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA FUG.RUB. GGGAT--CGCGCCCGTGAAT----AGACGCTGTAGTTCAACCTGAG-TAACACAGCGGGA **** ** ** *** * ** * ** * * ** * * ** * LYC.ES_E CTACCACATTTT FUG.RUB. CT--CAGTCTTT ** ** ***
Mean pairwise ID: 51.60%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAAT-----GGGGGCATTAATGTGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT **** ** ** * ** **** ** * *** * * * * *** LYC.ES_G TGTTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * * ** * ** ****** * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_G AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_G GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_G AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA RAT.RAT. TGGGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCC---TGGGCAACAT-AGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * *** ***** * * * LYC.ES_G ACCACCACTTTT RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT *** * ** **
Mean pairwise ID: 51.61%
TRI.AE_B NCCGAGC-TAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCA-TGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGC CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG *** * * ** ***** ** *** * ** * * * * ********* TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGAT--GTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA CAE.BRI. --AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA *** * * * **** * *** * * *** * * * **** **** TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGC-CTTAAGTGGCA CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG * ** * * *** ** ** *** * ** ** * *** * **** * TRI.AE_B G-GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAG-CGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAA CAE.BRI. GTGCACGGCTCAGGGCCGAA---AGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC * **** * *** * * ***** * * * * **** * **** TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC CAE.BRI. GGATAGC--GCTTGTG-AGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTC-TGATACCTT--CAGACC ***** * ** ** ** ** *** * ***** ** * ****** TRI.AE_B ACC-ATCTTT CAE.BRI. ACTTGTCATT ** ** **
Mean pairwise ID: 51.62%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** ** * *********** ** **** ****** *** * ** * LYC.ES_E GGGC-TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGT-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** ***** * *** ** * *** * *** ******* LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGGA * *** ** * * * * ***** * * * * * ********* * LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * *********** **** ****** *** * * **** ** ********* LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------- *** * ** * * * * * ** LYC.ES_E CACATTTT ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 51.74%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * *** ZEA.MA_D TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC------GATGGGGTGTCCG * *** * ** ******** * ******* * ** ** *** ZEA.MA_D TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_D GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCA HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * **** * ZEA.MA_D ACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA HOM.SA_B TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGAGCAACAT-- * ** * **** * *** ** * * * ** *** ** **** ** ZEA.MA_D AGCAGACCACCATCTT- HOM.SA_B AGCGAGACCCCGTCTCT *** * ** ***
Mean pairwise ID: 51.77%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAG----TGGAGACATCAAAGTGGTTGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG--GAGG * ** ** ** ** * ** **** *** ** * * ** * **** ** LYC.ES_A ATTGGGCTTTACCAGAAGGT-TGGGCT-TGGTGGGCTTAGTTC-TGGCCTGCCCTGTCCA HOM.SA_B ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTA ** * **** ** * ****** * *** *** * *** ** ** * * LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_B AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** * * * ** * * ** * * * ** ***** * * LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAG-TGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG *** * **** *** ** ** ****** * ** ****** *** **** * LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA HOM.SA_B TGGGAT--CGCGCCTGTGAAT-AGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAG **** * * * *** * * * * * ** * **** * * * LYC.ES_A CAACCACCTTT HOM.SA_B ACCCCGTCTCT ** ** *
Mean pairwise ID: 51.90%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * *** ZEA.MA_G TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC------GATGGGGTGTCCG * *** * ** ******** * ******* * ** ** *** ZEA.MA_G TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_G GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAA HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGAT * * ** *** * *** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G CGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAA HOM.SA_B CAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGAGCAACAT--A * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** **** ** * ZEA.MA_G GCAGACCACCATCTTT HOM.SA_B GCGAGACCCCGTCTCT ** * ** *** *
Mean pairwise ID: 51.94%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTG---GGGATGTTAAGGTGGTGGAATA XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG **** ** ** **** ** ***** *** * ** ** * ** *** LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG XEN.LAE. CTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG * * **** ** ******* ** **** * * * ** ** * *** LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT--CCTAAAGTGG XEN.LAE. TTCGGTATCA-ATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGG * * * ** *** *** * * ** ** ** ** **** * ** LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA XEN.LAE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGT **** **** *** ** ** ***** ***** *** * **** * LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA XEN.LAE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCGGTGC-AGAACAGCCTGAACAAC----ACAGCGAGA **** ** ** *** * * ** * * * ****** * ** * * LYC.ES_O CCACCACTTT XEN.LAE. C-ACAGTTCT * ** * *
Mean pairwise ID: 51.95%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACC-CAAATGGGGGCATTAATGTGGT-GGAAT-G TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG * ** *** **** * *** *** * *** * ***** ** **** * LYC.ES_B TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** ***** ***** * LYC.ES_B TAGAGTTGG-ATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * * ** * ***** * * LYC.ES_B GGAAT-GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG **** ** * ******* ***** ** ** ** ** ***** * ******** LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAAT-----CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC-A ****** * ** * * * * * * * * *** *** ** * ** * LYC.ES_B CCACTTTT TET.ROS. CT------ *
Mean pairwise ID: 51.95%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT LYC.ES_L -----------------------------------------------------GTTGGGT ****** HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGC-TGCCCATTCCAAGCCGGG LYC.ES_L TGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGG ****** * *** * ** *** * * *** ***** ******* ** HUM.LU_C AGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGN-GCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGCA LYC.ES_L AGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGA ** *** * * * * * **** * ** ** * ***** * *** * * * HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_L CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA ************* *********** *** * ** ******* ************** HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAA--CACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_L ACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTG--CTCCAACTAAACCA ***** * **** * *** * * * * * ******* ** **** HUM.LU_C TTTCTTTT LYC.ES_L CCACTTT- ****
Mean pairwise ID: 51.96%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ***** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** * LYC.ES_K GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG * ** * **** * *** * * *** * *** ****** LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA * *** ** * ** *** **** * * * * * ****** ** * LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * ** ************** ******* ** * * ***** ** ********* LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT------------------------------- ***** **** * * *** * * ** * LYC.ES_K ACCTTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.04%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAA----GGTGGTGGAAT **** **** *** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT LYC.ES_M ATTGG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTGT **** * * * *** ****** ** ** **** * ***** ***** * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC LYC.ES_M CCAAGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTC ***** * *** ** * *** *** * * ***** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC LYC.ES_M CTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTG ********* * ** ** ********************** ** ** ****** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT LYC.ES_M TGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCT * ************ ** * ** * * *** * * ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_M CCAATAAACAACCACCTTT *** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 52.05%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCG----GGGGCATTAAGGTGGTGCGGA HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGG-GAGGA *** ** * ** *** * ** **** ** *** *** * ****** * *** ZEA.MA_E TTCTTTGCGAT--GGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG HOM.SA_B TCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCC------GATGGGGTGTCCG * *** * ** ******** * ******* * ** ** *** ZEA.MA_E TCCCAAGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCT HOM.SA_B CACTAAGTTCGGCATCAATA-TGGTGACCTCC-CGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCT * ***** * * * ** * * * *** *** ** * * * *** ZEA.MA_E GAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCA HOM.SA_B AAGGAGGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAG-GTCAAAACTCCCGTGCTGA * * ** *** * *** ** ** ****** * * * ** * * ZEA.MA_E ACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA HOM.SA_B TCAGTAGTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAG--CCTGAGCAACAT-- * ** * **** ** *** ** * * * ** *** ** **** ** ZEA.MA_E AGCAGACCACCATCTTT HOM.SA_B AGCGAGACCCCGTCTCT *** * ** *** *
Mean pairwise ID: 52.12%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC LYC.ES_L ----------------------------------------------------GTTGGGTT ** * * HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTG-CTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA LYC.ES_L GACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGA * **** * * ** * * ** *** * * **** ****** ******* ** HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGG-TCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAA LYC.ES_L GTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC **** *** * **** * **** *** * ******** ** * * * HUM.JA_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_L TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************* *** * ** ******* *************** HUM.JA_B CGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACC--ATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_L CGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTG--CTCCAACTAAACCAC **** * ***** * *** * * ** **** ** **** HUM.JA_B TTCTTTT LYC.ES_L CACTTT- ****
Mean pairwise ID: 52.12%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ******* *** * * *********** * ******* *** ** *** * **** LYC.ES_G GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** **** * *** ** * *** * *** ****** LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGGA * *** ** * * * * ***** * * * * * ********* * LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * ************ **** ****** *** * * **** ** ********* LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------- *** * ** * * * * * ** LYC.ES_G CACTTTT ZEA.MA_H -------
Mean pairwise ID: 52.13%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT LYC.ES_M ----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATTG ** ****** ** *** **** * ** * TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * **** ** * *** *** * *********** ****** TRI.AE_B GTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGGC LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG *** ** * *** **** * * ***** * *** **** * TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT *** * * ******* ************ ** ** ** ***** * ********** TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** ** ** ** ** **** * ** * * ** **** TRI.AE_B TCTTT LYC.ES_M CCTTT ****
Mean pairwise ID: 52.13%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** * * *********** * ******* *** ** *** * **** LYC.ES_B GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** * LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC * *** * * * * * * ** * * ******** * LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT * ************* **** ****** *** * **** ************** LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------- ** ****** * * ** * * *** * LYC.ES_B CTTTT ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 52.20%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTC TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * ** ZEA.MA_G TT----TGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAG-----------AGTGTGCCCGT * * ** * ** ** * * * * **** * * ******* ZEA.MA_G CCCAAGTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACC-T TET.ROS. TCCAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCT-AGTAATAG----GACTTCACCAGGGCAT **** * *** *** ** *** * * ** ** * ** **** * * ZEA.MA_G GAAGTGGC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TET.ROS. TAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTAT ** ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** ****** ZEA.MA_G AACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT TET.ROS. TGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCT---GCTATTCT ***** ******** * * *** * * ** ** * * ** ** ZEA.MA_G AAGCAGACCACCATCTTT TET.ROS. GATCAGAC-ACT------ * ***** **
Mean pairwise ID: 52.24%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT * ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** * * ** LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA CAN.SPE. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * ** ** ******* *** **** * * ** ** * ** LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG CAN.SPE. GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ** LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAGA **** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** * * LYC.ES_E CTACCACATTTT CAN.SPE. CC-CCGTCTCT- * ** * *
Mean pairwise ID: 52.26%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** * * ** LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA CAN.SPE. CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * * ** ** ******* *** **** * * ** ** * ** LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG CAN.SPE. GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ** LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA CAN.SPE. GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAAC----ATAGCGAGA **** ** ** *** * * * * ** * ***** * * * * LYC.ES_O CCACCACTTT CAN.SPE. CCCCGTCTCT ** * ** *
Mean pairwise ID: 52.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAA-CCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT **** ** ** * * ** **** **** * * ** ***** * * * LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTT--GGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG * ** ** *** ***** * *** **** *** ** ** * *** LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGGG HOM.SA_B TTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * *** LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGA--AACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG *** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC HOM.SA_B GGATCGCG--CCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGAC **** ** ** *** * * * * ** * ****** * * * ** LYC.ES_G CACCACTTTT HOM.SA_B CCCGTCTCT- * * ** *
Mean pairwise ID: 52.29%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** * LYC.ES_A GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG * ** * **** * *** * * *** * *** ****** LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA * *** ** * ** *** **** * * * * * ********* * LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * ** ************** ******* ** * ***** ** ********* LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT------------------------------- ***** **** * * *** * * ** * LYC.ES_A ACCTTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.29%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ******* *** ** * *********** ** **** ****** *** * ** * LYC.ES_O GGGC-TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** ***** * *** ** * *** * *** ****** LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGGA * *** ** * * * * ***** * * * * * ********* * LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * ************ **** ****** *** * * **** ** ********* LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------------------- *** * ** * * * * * ** LYC.ES_O CACTTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.35%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTC TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * ** ZEA.MA_E TT----TGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAG-----------AGTGTGCCCGT * * ** * ** ** * * * * **** * * ******* ZEA.MA_E CCCAAGTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACC-T TET.ROS. TCCAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCT-AGTAATAG----GACTTCACCAGGGCAT **** * *** *** ** *** * * ** ** * ** **** * * ZEA.MA_E GAAGTGGC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTC TET.ROS. TAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCG-CTTA ** ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** **** *** ZEA.MA_E CAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC TET.ROS. TTGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCT---GCTATTC ***** ******** * * *** * * ** ** * * ** * ZEA.MA_E TAAGCAGACCACCATCTTT TET.ROS. TGATCAGAC-ACT------ * * ***** **
Mean pairwise ID: 52.43%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC * ** * * * * * ******** ** ******* ** * ** * * HUM.LU_C GGTCA--ACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT * ** * *** * ******* ** * * *********** HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGG-ACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT-CCCAACACTAAAGTGGCGG * * ***** * ** *** ****** *** * ** *** * *** ** HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG ** ****************** ********** **** ***** * ** ******** HUM.LU_C ATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------- **** * * ** * ** * *** * HUM.LU_C ATTTCTTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 52.46%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ******* *** * * *********** * ******* *** ** *** * **** LYC.ES_I GGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG ** ** ** **** * *** ** * ** *** ****** * LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCG-GATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGTGGCGGAC * *** * * * * * * ** * * ******** * LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT ZEA.MA_H ATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGAT * ************* **** ****** *** ** *** ************** LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA ZEA.MA_H AATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------------- ** ****** * * ** * * *** * LYC.ES_I TTTTT ZEA.MA_H -----
Mean pairwise ID: 52.48%
CAE.EL_B -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG ** * * ** * ** *** * ****** *** *** ***** CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTA-TGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA * **** *** *** *** * * * ** *** ** ****** * * CAE.EL_B AGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG *** * *** * *** ** *** * * * ** ** ******* CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG * ** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * * CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATCT ** *** **** *** * ***** * *** * ****** * CAE.EL_B TTT DRO.MEL. TT- **
Mean pairwise ID: 52.56%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAG----TGAGGGCATCAGTGTGGTGGAAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC **** * * ** *** * ** ***** **** ** * * * ** *** *** LYC.ES_C GTTGAACATGCCCAGAAGGTA-GGGCTTGTGTG-ACAAT-TCTCTGGCCTGCCCTGTCCA FUG.RUB. GCTTGA---GCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA * * * ** *** ** * ****** * * ** ** ** * * ** ** * * LYC.ES_C AGCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCT-CCTAAAGTG FUG.RUB. AGTTCGGTATCGA-TATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAG ** * * * * * *** ** * * ** * ** * ** ***** * * LYC.ES_C GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG FUG.RUB. GGGTGCCCCGGCCCAGGTCGGA--AACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAG ***** * * *** ** ** **** * *** **** * * **** * LYC.ES_C AAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA FUG.RUB. TGGGAT--CGCGCCCGTGA-ATAGACGCT----GTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGG **** ** *** *** *** * * * * * ** * * ** LYC.ES_C ACTACCACATTT FUG.RUB. ACT-CAGTCTTT *** * ***
Mean pairwise ID: 52.61%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** ** * ******** ** ** ** * ** ** ** ** ** ** * LYC.ES_J GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC-A ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG * ** * **** * *** * * *** * *** ****** LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCC--AACACTAAAGTGGCGGA * *** ** * ** *** **** * * * * * ********* * LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA * ** ************** ******* ** * * ***** ** ********* LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTAT-AGGCCCAAT------------------------------- ***** **** * * *** * * ** * LYC.ES_J ACCTTT ZEA.MA_H ------
Mean pairwise ID: 52.72%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGT-GGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** ** *** LYC.ES_E TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_E GGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGGGCAACA----TAGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** * LYC.ES_E ACTACCACATTTT ORI.CUN. ACC-CTGTCTCC- ** * *
Mean pairwise ID: 52.75%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG TET.THE. GCCAGGGTA-GCAATACCTGTGTCTA---TATGTGGCATAAACAATGTAG------GTTG *** * * * ** * * ** **** ******** * **** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * *** * * **** * * * * * ** * ***** ***** * LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTC-TATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGAT TET.THE. AATGAGTTGC-TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAA * ****** * ***** ** ** **** ** * *** ** * * LYC.ES_F GGAC-TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG TET.THE. GGAAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAG *** ** * ******* ***** ** ** * * ***** ** ******* LYC.ES_F GATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACC TET.THE. GATAAC------ATACTCATTAA---CTGTCAAA---CTAATCGGTTCTACTATCAAAGC *** ** * *** ** * ** **** ** ** **** ** *** * LYC.ES_F ATCACTTTT TET.THE. CAGACATT- ** **
Mean pairwise ID: 52.83%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACC-CGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTC TET.ROS. GCCAGG----GTAGC-AATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG ** * ***** * ** *** *** ** * ** * ** ** ** * ** ZEA.MA_D TT----TGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC--AGTTTGCTAAG-----------AGTGTGCCCGT * * ** * ** ** * * * * **** * * ******* ZEA.MA_D CCCAAGTTGGTAGTGGCT--GGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACC-T TET.ROS. TCCAAACAGTGAGTTGCTATGGTGGAAACCT-AGTAATAG----GACTTCACCAGGGCAT **** * *** *** ** *** * * ** ** * ** **** * * ZEA.MA_D GAAGTGGC--AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC TET.ROS. TAAAGAGCTGAGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCC-GCTTA ** ** ***** ** * ******** ***** *** ** *** *** **** ZEA.MA_D CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC TET.ROS. TTGTGGTGGAAGGATAACATACTCATTAACTGTCAAGCTAA-TCGGTTCT---GCTATTC ***** ********* * * *** * * ** ** * * ** * ZEA.MA_D TAAGCAGACCACCATCTT TET.ROS. TGATCAGAC-ACT----- * * ***** **
Mean pairwise ID: 52.87%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT * ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * ** LYC.ES_E --ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCC RAT.NOR. CGATTGAG---TCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT **** * *** ** ******* * *** **** * * ** ** * LYC.ES_E AAGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGT RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA **** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * LYC.ES_E GGGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ****** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** LYC.ES_E GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTA RAT.NOR. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGGGCAACA----TAGCGA * **** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** * LYC.ES_E AACTACCACATTTT RAT.NOR. GAC--CCGTCTCT- ** ** * *
Mean pairwise ID: 52.88%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT **** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * ** * * ** LYC.ES_O --ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCC RAT.NOR. CGATTGAG---TCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT **** * *** ** ******* * *** **** * * ** ** * LYC.ES_O AAGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGT RAT.NOR. AAGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGA *** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG RAT.NOR. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTA ****** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA RAT.NOR. GTGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG---GGCAACATAGCGAG * **** ** ** *** * * * * ** * ***** *** * LYC.ES_O AACCACCACTTT RAT.NOR. ACCCGTCTCT-- * ** * **
Mean pairwise ID: 52.92%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA-- * ** **** ********* * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA *** * ** * ******* * ** * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_M CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC *** * * *** *** * * **** * **** *** * **** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_M GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_M GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** * ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_M CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 52.96%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** *** *** ** * * **** * ** * *** * ** ** ** ** * * CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG * *** * * ******* * ** *** *** ******** * CIN.HYB. AG-AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGT-GGCGG * ******** * * *** ***** *** * ** * * ** * * ** ** CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG ** ***** ******* **** ***** **** *** * * * * ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCA-AT------------------------------ ** * ** ** ** ***** ** ** CIN.HYB. ATTT ZEA.MA_H ----
Mean pairwise ID: 53.04%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT * ** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * *** * *** LYC.ES_E TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_E GGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGGGCAACA----TAGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** * LYC.ES_E ACTACCACATTTT RAT.RAT. ACC-CCGTCTCTT ** ** * **
Mean pairwise ID: 53.07%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TET.THE. -GCCAGGGTAGCAATA----CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAG---GTTG * ** *** *** * *** * * *** ** *** ** ** * **** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** * LYC.ES_B TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG ****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * * LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA TET.THE. --GAAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA * ** ** * ******* ***** ** ** ** ** ***** * ******* LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC TET.THE. GGATAACA------TACTCATTAACTGTCAAA----CTAATCGGTTCTACTATCAAAGCC ******* * ** * * * * ** ** ** * *** ** ** LYC.ES_B ACCACTTTT TET.THE. AG-ACATT- * ** **
Mean pairwise ID: 53.11%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT LYC.ES_L -----------------------------------------------------GTTGGGT ****** HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA LYC.ES_L TGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAG-GCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGA ***** * * **** * ** * **** ****** ******* *** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG-CCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAA LYC.ES_L GTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ***** *** * * * **** * ********** ***** ***** * * * HUM.LU_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_L TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************* *** * ** ****** *************** HUM.LU_B CGGGCCGGTGCT-ACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTT LYC.ES_L CGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCA **** * ***** * ***** * *** * ** **** HUM.LU_B CCTTT LYC.ES_L CTTT- * **
Mean pairwise ID: 53.23%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA-- * ** **** *********** **** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_M TTGGGCTG--TCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG *** * ** * * * ******* * ** * * * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG *** * *** * * **** * **** *** * *** ** ** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** * ******************** ** ** ** *** * **** * ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC LYC.ES_M GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * **** ZEA.MA_A CACCATCTTT LYC.ES_M AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 53.23%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** *** * HUM.JA_B AGTT-CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACT--GTGGACCACCCATTCCAAGT * ** ** *** * ** ** **** ** ** *** * *********** HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCG-GACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT--CCCAACACTAAAGTGGCG * * ** * * * *** * **** * * ** * * ****** ** * HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG * ** ************* **** ********** *** ***** * ** ******* HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------ ***** * * ** * * * **** HUM.JA_B CATTTCTTTT ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 53.25%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ******** ** *** ** ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAG--TGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGT * *** * * **** * ** * * * *** ** ************ ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGG--GCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA---CACTAAAGTGGC ** * ** * ** ** * * *** * * ** ** *** ***** ARA.TH_C GGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAA ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA *** * ************ **** ********* *** ***** ******** ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- **** * * * * * * ***** * ARA.TH_C ATCACTTT ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 53.27%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTA-AGGTGGTGGAATATT TET.THE. GCC-AGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGAT- *** ** *** ** * * ** * * * **** *** * ** LYC.ES_O GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA TET.THE. AGGATATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGCTCCAAACAAT ** * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** ** LYC.ES_O GAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG TET.THE. GAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACT--CCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGG ****** ** ** ** * * * ** * * ** ** ***** * ** LYC.ES_O AC-CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TET.THE. AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGA * *** * ******* ***** ** ***** * ****** ** ********* LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC TET.THE. TAACATACTCAT------TAACTGTCA-----AACTAATCGGTT-CTACTATCAAAGCCA **** ** * ** * ** ** ** ** * ** * ** *** * LYC.ES_O CACTTT TET.THE. GACATT ** **
Mean pairwise ID: 53.38%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** * * *********** * **** ** **** * *** *** ARA.TH_A GGTT-CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA--ACTGTGGACCACCCATTCCAAGT ** *** * * * ** *** ** * * ** * **** ****** ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGT---TGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG ZEA.MA_H TGC--GTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGC--ATCCCAACACTAAAGT-G ** *** * ** * * * * ***** **** ** ** * *** *** * ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGG ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGG * ** * ****************** ********** *** ***** **** **** ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------- * **** * * * * ** *** * ARA.TH_A ACCACCATTTT ZEA.MA_H -----------
Mean pairwise ID: 53.40%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TET.THE. GCCAGGGT-AGCAATA----CCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAG---GTTG *** * * ** *** * *** * * *** ** *** ** ** * **** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT-CTGA---CTTGCCCTATCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * *** * * *** ** * * *** ** * ***** ***** * LYC.ES_I TTAGAGTTGG-ATCATG-TGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAG ****** ** ** * ** * * ** * * ** * *** * * * LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCGCTCTAAGCGGTGGAA TET.THE. G--AAACGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA * ** ** * ******* ***** ** ** ** ** **** * ******* LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC TET.THE. GGATAACA------TACTCATTAACTGTCAAA----CTAATCGGTT-CTACTATCAAAGC ******* * ** * * * * ** ** **** ** * ** *** * LYC.ES_I ACCATTTTT TET.THE. CAGACATT- * **
Mean pairwise ID: 53.40%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** * * *********** * **** ** **** * *** *** ARA.TH_F GGTT-CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA--ACTGTGGACCACCCATTCCAAGT ** *** * * * ** *** ** * * ** * **** ****** ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGT---TGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGA ZEA.MA_H TGC--GTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACTAAAGT-GGC ** *** * ** * * * * ***** **** ** * * *** *** ** ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA ** * ****************** ********** *** ***** **** ***** ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- **** * * * * ** *** * ARA.TH_F CACCATTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 53.42%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG TRI.AE_C -------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTG * *** ***************** TRI.AE_B -GTAGTGGGCTGGGTGG--CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAG TRI.AE_C AGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAG-TTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAG ******* * * *** * ******* ** * * ** * * ** *** ******* TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGG TRI.AE_C GCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG ***** *** ******* *********************** ****************** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC TRI.AE_C ATAACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCT-TGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GACCAC ***** ********** * ***** ******** ** ** * *** ****** TRI.AE_B CATCTTT TRI.AE_C CATC--- ****
Mean pairwise ID: 53.53%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT **** ** ** ** ** **** ** ** * **** * * *** * *** LYC.ES_O TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA RAT.RAT. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG RAT.RAT. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA RAT.RAT. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG---GGCAACAT-AGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * ***** *** * * * LYC.ES_O ACCACCACTTT- RAT.RAT. ACCCCGTCTCTT *** * ** *
Mean pairwise ID: 53.55%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGG----A ******* **** ** * ************** ******** ** ** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGA----AGGGCTA-ATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ZEA.MA_H TGTCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA *** ** ** ** *** ** ** ** **** * * *** * *** ***** LYC.ES_F GC-ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACACT-AAAGTGGC * * *** ** * * * ** ****** * ** * * * * ***** LYC.ES_F ATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAA ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA * ************* **** ****** *** ** ***** ** ****** LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- **** * * * * ** * * ** * LYC.ES_F CATCACTTTT ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 53.57%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ** ******* ***** ****** * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** ****** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** * * *** *** * *** *** ** * * ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********************** ** * ******* ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_M CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 53.57%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ** * * ** * ** ******** ** ******* ** ** * * * HUM.JA_A GGTCA--GCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT * * *** * ***** **** ** ** *** * *********** HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTG-ATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGGCG * * **** * * ** ****** *** * * * ****** ** * HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG * ** ************* **** ********** *** ***** * ** ******* HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCA ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCC-CAAT----------------------------- ***** * **** * * **** * ** HUM.JA_A TCTCTTTT ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 53.59%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ****** ** * * ** ***** *** *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA LYC.ES_M GGCT-GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA *** * * ** * * **** ** * ***** ***** ****** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC LYC.ES_M GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCGG **** ** *** * ** * *** *** *** ** * * **** * CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** * ******* ********** * *** * *** **** * ********** CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC * * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** ** CIN.HYB. ATTT-- LYC.ES_M ACCTTT * *
Mean pairwise ID: 53.62%
CAE.EL_C -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGG-AT DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGT--CTGATTGTGGGAT ** * * ** * ** *** * ****** *** *** ***** ** CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTA-TGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCC DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** **** *** *** *** * * * ** *** ** ****** * CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG **** * *** * *** ** *** * * * ** ** ******* CAE.EL_C TGGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG * ** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-AT *** **** **** *** * ***** * *** * ****** * CAE.EL_C CACT DRO.MEL. CTTT * *
Mean pairwise ID: 53.62%
CAE.EL_D -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG ** * * ** * ** *** * ****** *** *** ***** CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTATGTCGTCGTCT-ACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA * **** *** *** *** * ** * ** *** ** ****** * * CAE.EL_D AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG *** * *** * *** ** *** ** * * ** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG ** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-ATC ** *** *** *** * * ***** ***** * ****** *** CAE.EL_D ATTT DRO.MEL. TTT- **
Mean pairwise ID: 53.62%
CAE.EL_A -ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG ** * * ** * ** *** * ****** *** *** ***** CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTC-CTGTGTA-TGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCA DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA * **** *** *** *** * * * ** *** ** ****** * * CAE.EL_A AGCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG *** * *** * *** ** *** ** * * ** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG ** * ** **** **** ***** *** ** *** * ***** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-ATC ** *** **** *** * * ***** ***** * ****** *** CAE.EL_A ATTT DRO.MEL. TTT- **
Mean pairwise ID: 53.70%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGT-GGTGGAA ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** ** *** LYC.ES_O TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA ORI.CUN. CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG ORI.CUN. AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA ORI.CUN. TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG---GGCAACAT-AGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * ***** *** * * * LYC.ES_O ACCACCACTTT ORI.CUN. ACCCTGTCTCC *** **
Mean pairwise ID: 53.72%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** * * *********** * **** ** * ** * *** * * ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCC-GGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAA--ACTGTGGACCACCCATTCCAAGT ** *** ** * *** ** *** ** * * * *** * **** ****** ARA.TH_E TGTG-AGTAAGACGTGTGTGTCA-AGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGC--ATCCCAACACTAAAGT-GGC ** * *** * * ** * ***** **** ** * * ******* ** ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA ** * ************* **** ********** *** ***** **** ***** ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- **** * * * ** *** * ARA.TH_E CACCATTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 53.85%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT * ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * ****** * ** LYC.ES_E ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA HOM.SA_B CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * * ** ** ******* * *** **** *** ** ** * ** LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG HOM.SA_B GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ** LYC.ES_E GGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGAGCAACA----TAGCGAGA **** ** ** *** * * * * ** * ****** * *** * * LYC.ES_E CTACCACATTTT HOM.SA_B CC-CCGTCTCT- * ** * *
Mean pairwise ID: 53.87%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAG-GCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT *** *** ** * * **** * ** * **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGC-TGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG ******** *** * * * **** * * ******** ***** ***** * * HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************* *********** *** * ** ******* ************ HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACC--ATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCC--AACTAAAC ******* * ***** * ***** * ** * ***** * ** ** HUM.LU_A CATTTCTTTT LYC.ES_L CACCACTTT- ** ****
Mean pairwise ID: 53.87%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAG-GCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCAT *** *** ** * * **** * ** * **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG--CTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG LYC.ES_L GGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTG ******** *** * * * **** * ********* ***** ***** * * HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA LYC.ES_L GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************* *********** *** * ** ******* ************ HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACC--ATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC LYC.ES_L TAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCC--AACTAAAC ******* * ***** * **** * ** ******* * ** ** HUM.LU_D CATTTCTTTT LYC.ES_L CACCACTTT- ** ****
Mean pairwise ID: 53.87%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGGTGGTGGAAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * ****** * ** LYC.ES_O ATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA HOM.SA_B CGCTTGA-GCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * * ** ** ******* * *** **** *** ** ** * ** LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTGG HOM.SA_B GTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * ** LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGT **** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA HOM.SA_B GGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGAGCAAC----ATAGCGAGA **** ** ** *** * * * * ** * ****** * * * * LYC.ES_O CCACCACTTT HOM.SA_B CCCCGTCTCT ** * ** *
Mean pairwise ID: 53.87%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG TET.ROS. GCCAGG----GTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGT------TAG *** * ***** * ** * *** *** * ** *** ** * * LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAGCA TET.ROS. AATAGTCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACA ** * * ** * * * * ** **** ** ** * ***** ***** ** LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCT--GCTGGGCTCCTAAAGTGGGG TET.ROS. GTGAGTTGC-TATGGTGGA--AACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTG ****** * * **** ** * * * ** ** * ** ***** * * LYC.ES_C TGGA-CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA TET.ROS. AGGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAA *** * ** * ******* ***** ** *** * * ***** ** ****** LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC TET.ROS. GGATAACATAC-----TCAT-TAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC ******* * **** *** * * * ** * * *** **** * * ** LYC.ES_C TACCACATTT TET.ROS. -ACT------ **
Mean pairwise ID: 53.92%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT LYC.ES_M --------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGC ********* * ** ***** ***** HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA LYC.ES_M TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA ***** * *** *** *** ** * * ****** ******* ** HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGCAAT LYC.ES_M GTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACC * *** * * ** *** * * * ***** * *** * * * HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC LYC.ES_M GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT ** ********************** ** * ********** *************** HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT LYC.ES_M GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * **** HUM.LU_C TCTTTT LYC.ES_M TTT--- * *
Mean pairwise ID: 53.99%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT * ** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** *** *** LYC.ES_E TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_E AGTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_E GGGTGGACCCGTG-AGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** *** * *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_E AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTGTGCAACA----TAGCGAG **** ** ** *** * * * * ** * ***** * *** * LYC.ES_E ACTACCACATTTT HOM.SA_A ACC-CCGTCTCTT ** ** * **
Mean pairwise ID: 54.02%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A * ** **** *********** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_D CCACCATCTT- LYC.ES_M CAACCACCTTT * **** ***
Mean pairwise ID: 54.02%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAG----TGGGGATGTTAAGG-TGGTGGAA HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT **** ** ** ** * ** **** ** ** * **** * * *** *** *** LYC.ES_O TATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCT-TGGTGGGCTA-ATTTCTGGCCTGCCCTATCCA HOM.SA_A CGCTTGA--GTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTA * * **** ** ******* * *** **** * * ** ** * * LYC.ES_O AGCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATT-CCTAAAGTG HOM.SA_A AGTTCGGCATCA-ATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG ** * * * ** *** * * * ** * ** ** ** ***** * * LYC.ES_O GGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGG HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAA--ACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAG ***** **** *** ** ** ***** ****** *** ** **** * LYC.ES_O AAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA HOM.SA_A TGGGAT--CGCGCCTGTGAATAGCCA-CTGCACTCCAGCCTG-TGCAACATAGCGAG-AC **** ** ** *** * * * * ** * ***** ** * * * LYC.ES_O ACCACCACTTT HOM.SA_A CCCGTCTCTT- ** * ***
Mean pairwise ID: 54.07%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ** ******* ***** ****** * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** ****** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG **** * * *** *** *** * *** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ******* ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** ** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_M CACCTTT ** **
Mean pairwise ID: 54.19%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC *** ** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** * * * HUM.LU_A GGTCA--ACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT * * * ***** **** ** ** *** * *********** HUM.LU_A CGGG-AGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA--CTAAAGTGGCG * * *** ** * * *** ****** * * * * * ** *** ***** * HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG * ** ****************** ********** **** ***** * ** ******* HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------ ***** * * ** * * ** *** HUM.LU_A CATTTCTTTT ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 54.34%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACC-CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGT-GGAATA- TET.ROS. -GCCAGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG * ** *** ** ** *** *** * **** ** ** ** ***** LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** * LYC.ES_E CAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * ** * ** ** ***** * * LYC.ES_E GGACCCG--TGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG *** *** * ******* ***** ** ***** * ****** ** ******* LYC.ES_E GATAACGGAC-CGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCT-----AAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC ****** ** * * ** **** * *** * * * *** **** * * ** LYC.ES_E TACCACATTTT TET.ROS. -ACT------- **
Mean pairwise ID: 54.34%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A * ** **** *********** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_M AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_M CAACCACCTTT * **** ****
Mean pairwise ID: 54.37%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ** *** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** * * * HUM.LU_D GGTCA--ACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT * * * ***** **** ** ** *** * *********** HUM.LU_D CGGG-AGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCGG * * *** ** * * *** ****** *** * * ** * * ** ***** ** HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG ** ****************** ********** **** ***** * ** ******** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------- **** * * ** * * * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 54.43%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC LYC.ES_L ----------------------------------------------------GTTGGGTT ****** HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTG-CTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA LYC.ES_L GACCCAGATGGTTGGGTTCGGTA--GGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGA **** * * **** * ** *** * * **** ****** ******* ** HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGG-CTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAA LYC.ES_L GTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ***** *** * * **** * * **** ** ******** ** * * * HUM.JA_A TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_L TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************* *** ** ** ******* *************** HUM.JA_A CGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTT--AATCAGACCATCT LYC.ES_L CGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCA ****** ***** * * * * * *** ** * ** * **** * HUM.JA_A CTTTT LYC.ES_L CTTT- ****
Mean pairwise ID: 54.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT * ** **** *********** * ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_M GGG--CTGTCCCAGATGGCTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG ** * ** * ** ***** * ***** ** ** ********** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG *** * ** ** * * ******** * **** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * ****** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT LYC.ES_M AACCACCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 54.65%
COL.BLU. CCGAACCTCATTACCTTGGCCTGTTACCCCAAGTTGGGGGTCTTTAAGGTTATTTGATKT PER.AME. ----GATCCGTAACGCGAGCTTATAACTCGAG--CGGGGGCTATAAAGGTGGTGTGGAAC * * ** ** * * ** * * ***** * ***** * ** COL.BLU. ---TKGGCCTATGCTACCKGCCKGGCTCTGGTCCTGCTTATTCTGGCCCGCCCGTTCCAA PER.AME. GAGCTGACTCGACCTGCCGGGTTGGGCCAGGGACTGCG-GTGCTGGCTCGCCCGTTCCAA * * ** ** * ** * ** **** * ***** ************ COL.BLU. GCCGGGAGTTGGCCCATGTGGTTTATGCGAAGGTATAGGCTTCGGTGGTTCC PER.AME. GTCGGGTAGTGGGCCATGTGGCTTGGGCGAAGGCCTGGGTTTCT-TGGCC-- * **** *** ******** ** ******* * ** *** ***
Mean pairwise ID: 54.66%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG TET.THE. GCCAGG----GTAGCA-ATACCTGTGTCT-ATATGTGG-CATAAACAATGTAGGTTGTGA *** * ***** * *** ** * ** ** *** * ** * *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTG---GCCTGCCCTGTCCAAGC TET.THE. TAGATA---GGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * ** ** ** * *** ** **** ** ** * ***** ***** * LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCT--GCTGGGCTCCTAAAGTGGG TET.THE. AATGAGTTGC-TATGGTGG--TAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCT ** ****** * * **** ** * * * ** ** * ** ***** * LYC.ES_C GTGGAC-TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA TET.THE. AAGGAAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGA *** ** * ******* ***** ** *** * * ***** ** ***** LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA TET.THE. AGGATAACATAC-----TCATTAACTGTCAAA------CTAATCGGTTCTACTATCAAAG ******** * **** * **** ** ** ** * * *** ** LYC.ES_C CTACCACATTT TET.THE. CCAG-ACATT- * * *****
Mean pairwise ID: 54.66%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT * **** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_K TGGGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA ** * * * * ** ** ** * * * * **** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LYC.ES_K AGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCG ** * ** * * *** *** * ** ** **** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_K GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG * * * * ** ********* ************ ** * * ****** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA LYC.ES_K AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******** *** ** ** * *** ** * * * * * ORY.SA_B CCACCACCTTT LYC.ES_K CAACCACCTTT * *********
Mean pairwise ID: 54.79%
CAE.BRI. -ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG DRO.MEL. GACTGGAAG--GTTGGCAGCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGATTGTG-GGATG ** ** * ** * ** **** * ****** *** *** ***** CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTC-CTGTGGGTGTTGTCGGCA-ACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCA DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA * *** * *** *** * * ** * * *** ** ****** * * CAE.BRI. AGCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGT DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG *** * ** * **** * * *** * * * * ** * ******* CAE.BRI. GGTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG * ** ** ** ***** **** ****** *** ** *** * ***** * * CAE.BRI. GATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTC DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACA-ATC ******* **** * * ** ***** * **** * ****** ** CAE.BRI. ATT DRO.MEL. TTT **
Mean pairwise ID: 54.82%
HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC LYC.ES_M -------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCT ********* * ** * *** * ***** HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG **** * *** *** *** ** **** ****** ******* **** HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAATG LYC.ES_M TTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCG **** * * * *** *** * ******** ** * * * * HUM.JA_A CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG LYC.ES_M CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG * ********* ************ ** ** ********** *************** * HUM.JA_A GGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCTTT LYC.ES_M GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTT ******** * * * ** * ** * * ** * * * ** HUM.JA_A T LYC.ES_M T *
Mean pairwise ID: 54.84%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** **** **** *********** ** **** * ***** * *** * * ARA.TH_G GGAT-CGGCCCACGGGTC-GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTA-CA-AACTGTGGACCACCCATTCCAAGT * ** ** * * * ** * * ** * ** * * ***** **** ****** ARA.TH_G TGTG-AGTGAACCGTATGAACCA-AGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGA ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTT--TGCATCCCAACACTAAAG-TGGC ** * **** ** ***** * ** * * * * ****** * * ARA.TH_G GGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGAC ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA ** ******* ************ ********** **** ***** **** ***** ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- *** ** * *** * * *** * ARA.TH_G CCACCATTTT ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 54.84%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A * ** **** *********** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_M TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_M GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_M GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ********************** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_M AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 54.84%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG TET.THE. GCC-AGGGTAGCAAT----ACCTGTG-TCTATATGTGG-CATAAACAATGTAG---GTTG *** ** *** *** * *** * * *** ** *** ** ** * **** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCT----GGCCTGCCCTATCCAAGC TET.THE. TGATAGATAGGATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAAC * * * *** * * *** ** * * *** * ***** ***** * LYC.ES_G ACAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG TET.THE. AATGAGTTGCTATGGTGGTAACCTAGTAATAGGAC--TCCACCAGGGCATTAAAGAGCTA * ****** ** ** ** * * * ** * * ** ** ***** * LYC.ES_G TGGAC-CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA TET.THE. AGGAAACGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAA *** *** * ******* ***** ** ***** * ****** ** ****** LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC TET.THE. GGATAACATACTCAT------TAACTGTCA-----AACTAATCGGTT-CTACTATCAAAG ******* ** * ** * ** ** ** ** * ** * ** *** LYC.ES_G CACCACTTTT TET.THE. CCAGACATT- * ** **
Mean pairwise ID: 54.87%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ******** ************* * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** ** * ** ** * * ** **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** * ** ** *** ** * * ******* ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * **** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** * ARA.TH_D CCACTTT- LYC.ES_M CCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 54.87%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ********* * ** *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_M CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 54.93%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC LYC.ES_M -------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCT ********* * ** *** * ** * HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG LYC.ES_M GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAG * **** * ** *** *** ** **** ****** ******* **** HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAATG LYC.ES_M TTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCG *** * * ** * *** * *** * * ******** ** * * * * HUM.JA_B CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG LYC.ES_M CATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATG * ********* ************ ** * ********** *************** * HUM.JA_B GGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC LYC.ES_M GGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACCTT ** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * **** * HUM.JA_B TTTT LYC.ES_M T--- *
Mean pairwise ID: 55.05%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT * ******* **** *** ** *** * TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG LYC.ES_M GG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * * **** ** **** **** * ****** **** ****** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG LYC.ES_M AGAGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC * **** * * * *** * **** **** ** * * * *** **** TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG LYC.ES_M GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * ** ** ********************** ** * ****** * ******** TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGC-CAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC LYC.ES_M ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC ******** ** ** * * * ** * **** * * ***** * ** ** TRI.AE_A C------ LYC.ES_M CACCTTT *
Mean pairwise ID: 55.08%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_D -----------------------------TAGTTC--TGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * *** ******************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ** ** * ** **** *** ****** ** * ******** **** **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * ***** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_D CTTTT * ***
Mean pairwise ID: 55.31%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT * ***** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_A TGGGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA ** * * * * ** ** ** * * * * **** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LYC.ES_A AGCACAGAGTTGGATCTCGAG-GCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG ** * * * * * * *** *** * ** ** **** **** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_A GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGG * * * * ** ********* ************ ** * ****** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA LYC.ES_A AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******** *** ** ** * *** ** * * * * * ORY.SA_B CCACCACCTTT LYC.ES_A CAACCACCTTT * *********
Mean pairwise ID: 55.31%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT * ***** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_J TGGGCTTT----ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCA ** * * * * ** ** ** * * * * **** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LYC.ES_J AGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTG ** * ** * * *** *** * ** ** **** **** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_J GGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG * * * * ** ********* ************ ** * * ****** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA LYC.ES_J AAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******** *** ** ** * *** ** * * * * * ORY.SA_B CCACCACCTTT LYC.ES_J CAACCACCTTT * *********
Mean pairwise ID: 55.34%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACC-CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGT-GGAATA- TET.ROS. GCCAGGGT-AGCAATG----CCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG *** * * ** ** * * *** *** * **** ** ** ** ***** LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** ** LYC.ES_O CAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACT--TCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * ** * ** ** ***** * * LYC.ES_O GGA-CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGCA--ACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG *** **** * ******* ***** ** ***** * ****** ** ******* LYC.ES_O GATAACGGAC-CGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGC-----TAAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC ****** ** * * ** **** **** * * * *** ** ** * ** LYC.ES_O CACCACTTT TET.ROS. -ACT----- **
Mean pairwise ID: 55.41%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * ***** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_D TTTT- ***
Mean pairwise ID: 55.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ******** ****** * ********* * ** * ***** * ** *** * **** LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAA-CTGTGGACCACCCATTCCAAGTT * ** * * ** ** *** **** ** *** * *** ****** LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCA-AGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGT ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAA--CACTAAAGTGGCGG * ***** * * *** ***** **** * * * ********* * LYC.ES_C GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG * ************* **** ****** *** ** * ***** ** ******** LYC.ES_C ATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------- **** *** * * * **** * *** LYC.ES_C CCACATTT ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 55.59%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGG--TTGAATAT * **** *** *** ******* * ** ** ** * ** ** **** *** ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_H TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC ** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_H AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT *** * * * * * *** **** * * * * ** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_H GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTG ** * * * ************************** ** * * ****** * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_H GAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA ********* *** ** ** * *** ** * * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT- LYC.ES_H ACAACCACCTTTT ** *********
Mean pairwise ID: 55.63%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * **** CAE.EL_D GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTT-CAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG * **** ****** *** * * * * *** ***** ** * ****** * *** CAE.EL_D CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * ** * ** *** *** *** ** ** ** ******* * CAE.EL_D TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ** **** * **** * ***** ***** *** * * **** * *** CAE.EL_D CCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA---CTCAGTCT ***** ** * * *** * ** *** * ** ** ** * * CAE.EL_D TT FUG.RUB. TT **
Mean pairwise ID: 55.66%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT *** **** *********** * ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_M G---GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG * * * * * * ********* ** ** * * * ********* ****** ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LYC.ES_M CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG * *** * * *** * *** ***** **** * *** *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_M CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ********************** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACC LYC.ES_M GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA ****** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** ZEA.MA_F ACCATCTTT LYC.ES_M ACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 55.66%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG-GAACAGT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****** *** **** ****** ******* **** ********* *** * * ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTC-GGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCT-ACAAAC-TGTGGACCACCCATTCCAAGT ** * * * * * ** ** **** *** * * ** * **** ****** ARA.TH_D TGTG-AGTAATCTGTGTGGGTCA-GGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGC--ATCCCAACACTAAAGT-GGC ** * *** * * * * ****** **** * * * * ******* ** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT ZEA.MA_H GGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAA ** * ************* **** ********** *** *** * **** ***** ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- **** ** *** * ** *** * ARA.TH_D CACCACTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 55.81%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT *** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** * * * * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCT--GTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAA ** ****** * ** ** ** ** * *** ******* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT-GG CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG ** * ***** * * * * **** * *** *** ** * * * ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCT-CTACCTCTCGACTGTGG ** * **** ******* ********** **** ** * ** * ** **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC ***** ** **** * * ** ** * * * ** * ** *** ZEA.MA_E CACCATCTTT CIN.HYB. ACCCATTT-- **** *
Mean pairwise ID: 55.92%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** ** *********** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_D TTTT ****
Mean pairwise ID: 55.95%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC * ** * * ** * ** ******** ** ******* ** * ** * * * HUM.LU_B GGGT-CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAAGT * * ** * ***** **** ** ** *** * *********** HUM.LU_B CGGG-AGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT-CCCAACAC-TAAAGTGGCG * * *** ** * * *** ****** ** * * * * ** * * ** ***** * HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG * ** ************* **** ********** **** ***** ** ** ******* HUM.LU_B GATAACGGGCCG--GTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGA ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTA-TAGGCCCAAT----------------------------- ***** * * ** ***** * ** *** HUM.LU_B CCATTTCCTTT ZEA.MA_H -----------
Mean pairwise ID: 55.96%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * **** CAE.EL_A GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTT-CAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG * **** ****** *** * * * * *** ***** ** * ****** * *** CAE.EL_A CGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * ** * ** *** *** *** ** ** ** ******* * CAE.EL_A TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ** **** * **** * ***** ***** *** * * **** * *** CAE.EL_A CCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCAT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGA---CTCAGTCT ***** **** * *** * ** *** * ** ** ** * * CAE.EL_A TT FUG.RUB. TT **
Mean pairwise ID: 55.99%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT *** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** * * * * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCT--GTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAA ** ****** * ** ** ** ** * *** ******* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT-GG CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG ** * ***** * * * * **** * *** *** ** * * * ** ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGA ** * **** ******* ********** **** ** * ** * ** **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC CIN.HYB. AGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA ***** ** **** * * ** ** * * * ** * ** *** ZEA.MA_G ACCATCTTT CIN.HYB. CCCATTT-- **** *
Mean pairwise ID: 55.99%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ********* * ** *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_M ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_M AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_M ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 56.13%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACC-CAAATGGGGGCATTAATGTGGT-GGAAT-G TET.ROS. GCC-AGGGTAGCAAT----GCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAGTTAGAATAG *** ** *** *** ** *** *** * *** * ***** ** **** * LYC.ES_G TTGGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA TET.ROS. TCAGAGTATGAGAGTTTGATGAGAC-AGTTTGCTAAG----AGTGTGCCCGTTCCAAACA * * * * ** * * ** * ** ***** * ***** ***** ** LYC.ES_G CAGAGTTGG-ATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT TET.ROS. GTGAGTTGCTATGGTGGAAACCTAGTAATAGGAC--TTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGA ****** ** ** ** * * * ** * ** ** ***** * * LYC.ES_G GGA-CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG TET.ROS. GGAACCGCCTCAGGCTGGC--AACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAG *** **** * ******* ***** ** ***** * ****** ** ******* LYC.ES_G GATAACGGAC-CGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC TET.ROS. GATAACATACTCATTAACTGTCAAGCT-----AAT--CGGTTCTGCTATTCTGATCAGAC ****** ** * * ** **** * *** * * * *** ** ** * ** LYC.ES_G CACCACTTTT TET.ROS. -ACT------ **
Mean pairwise ID: 56.17%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ** ******* ** ** ******** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * *** ** ** ** *** ******* ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** ** * * * *** *** *** * * ******* ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * ******* ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_M CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 56.21%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT LYC.ES_M --------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGC ********* * ** ***** ****** HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA LYC.ES_M TGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGA ***** * *** *** *** ** **** ****** ******* ** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT LYC.ES_M GTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACC ***** * * ** *** **** * * ***** ***** * * * HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC LYC.ES_M GCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT ** ********* ************ ** * ********* *************** HUM.LU_B GGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT LYC.ES_M GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACAACC *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * ** * HUM.LU_B TCCTTT LYC.ES_M ACCTTT *****
Mean pairwise ID: 56.25%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC * ******** * * *** *********** ************** ********** LYC.ES_I TTTT LYC.ES_D TTTT ****
Mean pairwise ID: 56.25%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC * ******** * * *** *********** ************** ********** LYC.ES_N TTTT LYC.ES_D TTTT ****
Mean pairwise ID: 56.31%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT *** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** * * * * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCT--GTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAA ** ****** * ** ** ** ** * *** ******* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT-GG CIN.HYB. GTCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGG ** * ***** * * * * **** * *** *** ** * * * ** ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG CIN.HYB. GGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCT-CTACCTCTCGACTGTGG ** * **** ******* ********** **** ** * ** * ** **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC CIN.HYB. AAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC ***** *** **** * * ** ** * * * ** * ** *** ZEA.MA_D CACCATCTT CIN.HYB. ACCCATTT- **** *
Mean pairwise ID: 56.41%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGG---ACT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAG ** ** * ** ** * *** * ** ** ** ******* ***** ZEA.MA_B TTGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC HUM.JA_B CCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGG-TCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGA * *** * * * * **** * * *** * * **** ***** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG HUM.JA_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **** ******* *************** ** * *** ** * * **** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC--CAGATCCTCTCTTAGCAA- HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG ******** **** *** *** **** ** * * ****** * ZEA.MA_B ACCACCATCTTT HUM.JA_B ACCATTTCTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 56.44%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** *** ****** * ** *** * ***** **** ** **** * CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT **** ****** *** * ** * *** ***** ** * ***** * *** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTCG XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * *** * ** * *** *** * ** ** *** ******* * CAE.EL_D TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA ** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *** CAE.EL_D CCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC-CACTTATCA XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-- ***** *** * * * * ******* * * ** **** ** ** * CAE.EL_D TTT XEN.LAE. ---
Mean pairwise ID: 56.44%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** *** ****** * ** *** * ***** **** ** **** * CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT **** ****** *** * ** * *** ***** ** * ***** * *** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTCG XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * *** * ** * *** *** * ** ** *** ******* * CAE.EL_A TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGA XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA ** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * *** CAE.EL_A CCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGAC-CACTTATCA XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-- ***** ***** * * * ****** * * ** **** ** ** * CAE.EL_A TTT XEN.LAE. ---
Mean pairwise ID: 56.48%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * **** CAE.EL_B GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGC-TTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG * **** ****** *** * * * * * * ***** ** * ****** * *** CAE.EL_B CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * * ** * ** *** *** ** ** ** ** ******* ** CAE.EL_B TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ** **** * **** * ***** ****** *** ** * **** * *** CAE.EL_B CTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT- **** **** * *** * ** *** ** ** *** * *** CAE.EL_B T FUG.RUB. -
Mean pairwise ID: 56.63%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * ** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_H GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** * ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC *** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * **** ******* ************ ** ** * *** ** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** * ZEA.MA_B CCATCTTT- LYC.ES_H CCACCTTTT *** ****
Mean pairwise ID: 56.63%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT *** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** **** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGT--TGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAG ** ****** * **** ** * ** * ********* * ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC CIN.HYB. TCGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG * * **** * * * ****** *** ** * ** * * *** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA ** * **** ******* ********** **** ** * *** * ** **** * ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAACC CIN.HYB. GGATTAC-AAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA **** ** ****** * ** ** * * * * * * ** ** ZEA.MA_A ACCATCTTT CIN.HYB. CCCATTT-- **** *
Mean pairwise ID: 56.68%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ***** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** * LYC.ES_H GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** * LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG *** ** ***** *** * * ** ** * *** **** * LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * *** ******************** ** ** ** ***** * ********* LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC *** ** ** ** ** **** * ** * * ** *** LYC.ES_H ACCTTTT TRI.AE_B ATCTTT- * ****
Mean pairwise ID: 56.81%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC *** * ****** * ** *** * ** *** ** * ** ** * * **** CAE.EL_C GAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGC-TTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG * **** ****** *** * * * * * * ***** ** * ****** * *** CAE.EL_C CGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * * ** * ** *** *** ** ** ** ** ******* ** CAE.EL_C TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ** **** * **** * ***** ****** *** ** * **** * *** CAE.EL_C CAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCAC FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT--CAGTCTT **** **** * *** * ** *** ** ** *** *** CAE.EL_C T FUG.RUB. T *
Mean pairwise ID: 57.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAG-TGGTTG--AACT *** *** *** ** ** ** **** **** * *** * **** *** ** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC CIN.HYB. TTGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA-----CCTGGCTTGCCCGTTC ** * *** ** **** * * * * *************** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC CIN.HYB. CAAGTCGAG-AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATG-----TGAGCTT ***** * * ****** * * * ******** * ** ** ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC CIN.HYB. TAGAATCGGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTC ** * * ** **** **** ******* ********** **** ** * ** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTT--CTGGCCCAGAGTCCCT CIN.HYB. GACTGTGGAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGG----CTA * ********** *** ** * * *** *** * * * *** * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT CIN.HYB. GCCCAACAGGACACCCATTT- ****** **** **
Mean pairwise ID: 57.01%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC--GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCA ** *** *** * ** * *** * ** ** ** ******* *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG HUM.JA_B AGCCGAGAGT-TGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCG ** * *** * * ** * * * * *** * *** * * *** **** ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG HUM.JA_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * ** * **** ******* *************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA HUM.JA_B AAGGATAACGG-GCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATA ********* **** *** *** ** * * * * ** *** * * ZEA.MA_A CCACCATCTTT--- HUM.JA_B GGACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 57.05%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG--GAATGT * **** *** *** ******* **** ** **** *** ****** * *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_N TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC ** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_N AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT *** * * * * * *** **** * * * * ** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_N GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTG ** * * * ************************* *** ** **** * ***** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_N GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA *********** * ** ** * * ** * ** * * * * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_N ACCACCATTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 57.05%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_H GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ************ ************ ** ** ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_H AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_D CCACCATCTT-- LYC.ES_H CAACCACCTTTT * **** ***
Mean pairwise ID: 57.05%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_H GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * * * ****** * ** * * * * * ******* ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_H CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG * *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_H GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA * * **** ******* ************ ** ** ** *** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAA LYC.ES_H AGGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * *** ZEA.MA_A CCACCATCTTT- LYC.ES_H CAACCACCTTTT * **** ****
Mean pairwise ID: 57.14%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT *** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** **** * * * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT CIN.HYB. GAGCT-TGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC ** *** ** **** ** * ** * * ********* * ****** ZEA.MA_B GGTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** * * * * ****** *** ** * ** * *** * ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAAC-CTCTACCTCTCGACTGTGGAAG * * **** ******* ********** **** ** * * ** * ** **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCA-ACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGG--CTAGCCCAACAGGACA *** ******** * ** ** ** * * * ** * ** * * ** ** ZEA.MA_B CCATCTTT CIN.HYB. CCCATTT- ** **
Mean pairwise ID: 57.14%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** ****** ** * **** ****** ** ** **** **** ** ARA.TH_G GA-TCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA--CCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * *** * * ** ** * *** * * * **** ***** ****** ARA.TH_G GTGAGTGAAC-CGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * ***** * * * * ******** * * * * ** * * ** ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG * * ************* ********** **** ***** ***** * ***** ** ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGC--TAGCCCAACAGGACA * ** ** * * * ** *** * ** * ** *** * ** ARA.TH_G ACCATTTT CIN.HYB. CCCATTT- ******
Mean pairwise ID: 57.19%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ***** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** * LYC.ES_K GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * ** ** * *** * * * *********** ****** LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG *** ** * *** **** * * ***** * *** *** ** * LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA *** * * ******* ************ ** ** ** ***** * ********* LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC *** ** ** ** ** **** * ** * * ** *** LYC.ES_K ACCTTT TRI.AE_B ATCTTT * ****
Mean pairwise ID: 57.23%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA * ***** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_K TTGGGCTTT-ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTT---CTGGCCTGCCCTGTC ** ** * * * ***** ** * ** * ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_K CAAGC-ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC **** * *** ** * *** *** * * ***** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_K TAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT ***** ** * ** ** ********************** ** ** ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LYC.ES_K GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC * ************ ** * ** * * *** * * ** ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_K CAATAAACAACCACCTTT *** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 57.23%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GAACTT * ** * * * * * ******** ** ******** ** ** ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.LU_C TGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC *** * * * *** ** * ** ** * ****** ******* ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGN--GCGCACTCCTAGACTGGAG ** ** * * * * ****** **** ** * **** * *** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ** * *********** **************** ** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCT--CGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTG-ACTCTTAATAGGA ****** **** *** * ** ** * ** ** * ** * ** ** ** ZEA.MA_C CCACCATTTTT HUM.LU_C CCATTTCTTTT *** ****
Mean pairwise ID: 57.37%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA * ***** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_H TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC ** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_H CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG **** * * *** * * *** **** * ** ** * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_H TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT ******** * * ************ ************ ** ** ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LYC.ES_H GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC * ************ ** * ** * * *** * * ** ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT- LYC.ES_H CAATAAACAACCACCTTTT *** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 57.37%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_H GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ************ ************ ** ** ** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_H AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT- LYC.ES_H CAACCACCTTTT * **** ****
Mean pairwise ID: 57.38%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ****** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** * LYC.ES_A GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * ** ** * *** * * * *********** ****** LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG *** ** * *** **** * * ***** * *** ****** * LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT *** * * ******* ************ ** ** ***** * ********** LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACCA ** ** ** ** ** **** * ** * * ** **** LYC.ES_A CCTTT TRI.AE_B TCTTT ****
Mean pairwise ID: 57.51%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT * ** * * * * * ******** ** ******** ** ** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA *** * * *** **** * * ** * ** * ****** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGA * ** ** * * * * * *** * *** * * * * *** * *** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **************************** ** ****** * * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGAC HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAG ******** ***** *** * * ***** *** * * * * * ** *** * * ZEA.MA_D CACCATCTT---- HUM.LU_C GACCATTTCTTTT ***** *
Mean pairwise ID: 57.51%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA ** *** *** * ** * * * ** * ** ** ****** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGA-CCTGAAGTGG HUM.JA_B GCCGAGAGTTGA-GCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG * * *** * * * * * **** * *** * *** *** *** ** ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG ** * ************ *************** ** ****** * * **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCC--TCACTAAGCA HUM.JA_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAG ******** ***** *** * * **** * * * * **** *** ZEA.MA_D GACCACCATCTT- HUM.JA_B GACCATTTCTTTT ***** **
Mean pairwise ID: 57.57%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ************** *********** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ******** *********** LYC.ES_O TTT- LYC.ES_D TTTT ***
Mean pairwise ID: 57.57%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA * **** ****** *** * ** ** *** * *** ** ******* ** ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCG-GTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTG-AGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * * ** ** ** * * ** ** *** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC GAL.GAL. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC ** ***** *** * * * *** * ***** * * * ***** * ** CAE.EL_D ATTT GAL.GAL. C---
Mean pairwise ID: 57.61%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT *** *** *** ** ** * **** * ** * *** ** ** ***** ** * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * * * * ***** * * ** **** ************** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT-GGCA CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTC-GGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG * ***** * * ** *** **** * *** * * ** * * ** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAG ** * **** ****** ********** **** ** * ** * ** ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA---CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGAC *** *** *** * * * ***** *** * ** ** ** * *** * ZEA.MA_C ACCATTTTT CIN.HYB. ACCCATTT- *** ***
Mean pairwise ID: 57.69%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_E G---GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA * * * * * ** **** * * * ** * * * ** ****** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGG * ** *** * * * * **** * **** * ** * ** **** * ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG *** * ************ *************** *** ** **** ** * **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA **** ** * * ** *** * * * * * * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ARA.TH_E ACCACCATTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 57.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_J GGGCTTTA----CCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG ** * * * ****** * ** * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC LYC.ES_J CACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG *** * *** * * **** * **** *** * *** ** ** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** * ******************** ** ** ** *** * **** * ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC LYC.ES_J GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * **** ZEA.MA_A CACCATCTTT LYC.ES_J AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 57.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_K GGGCTTTA----CCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG ** * * * ****** * ** * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC LYC.ES_K CACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG *** * *** * * **** * **** *** * *** ***** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** * ******************** ** ** ** *** * **** * ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC LYC.ES_K GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * **** ZEA.MA_A CACCATCTTT LYC.ES_K AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 57.79%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_L GGTTGACC-CAGATGGTTGGGTTCGG-TAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCA *** ** * ** ** ******** * ** **** ******* **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATG-GGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG LYC.ES_L TGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGT ******* ** * ***** * *** * **** * ** * *** ******* ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG LYC.ES_L GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG *** ************************ ** ** ** ******* * ******** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACT--ATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC LYC.ES_L ATAACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACC ** ***** ** *** **** *** * * * ** ** ** ***** * * *** ARA.TH_C ATCACTTT LYC.ES_L ACCACTTT * ******
Mean pairwise ID: 57.83%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT * ** * * * * * ******** ** ******** ** ** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA *** * * *** **** * * ** * ** * ****** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGA * ** ** * * * * * *** * *** * * * * *** * *** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **************************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGAC HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAG ************** *** * * ***** *** * * * * * ** *** * * ZEA.MA_E CACCATCTTT--- HUM.LU_C GACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 57.83%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA ** *** *** * ** * * * ** * ** ** ****** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGA-CCTGAAGTGG HUM.JA_B GCCGAGAGTTGA-GCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG * * *** * * * * * **** * *** * *** *** *** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG ** * ************ *************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCC--TCACTAAGCA HUM.JA_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAG ************** *** * * **** * * * * **** *** ZEA.MA_E GACCACCATCTTT HUM.JA_B GACCATTTCTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 57.84%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ****** *** ** * ****** * *** **** * *** * * *** ** ** * LYC.ES_J GGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * ** ** * *** * * * *********** ****** LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG *** ** * *** **** * * ***** * *** ****** * LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA *** * * ******* ************ ** ** ** ***** * ********* LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC *** ** ** ** ** **** * ** * * ** *** LYC.ES_J ACCTTT TRI.AE_B ATCTTT * ****
Mean pairwise ID: 57.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA * ****** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_J TTGGGCTTT-ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTT---CTGGCCTGCCCTGTC ** ** * * * ***** ** * ** * ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_J CAAGC-ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC **** * *** ** * *** *** * * ***** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_J TAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGT ******** * ** ** ********************** ** ** ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LYC.ES_J GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC * ************ ** * ** * * *** * * ** ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_J CAATAAACAACCACCTTT *** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 57.88%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT ****** **** **************** ** **** * **** *** * * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAG--CCGGCTTGCCCATCCCAAG ARA.TH_G G---GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAG *** * * ** ** * ***** *** * ** ****** ***** ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG ** **** * * ****** * ** * * * * * * ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC-CTCCCGCTCTCAGCAGTGGAC ** ** **** *********************** ** * *** ** ** * **** ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGC--AAA ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA *** *** ** ** * *** * * ** * * * ** ** ZEA.MA_B CCACCATCTTT ARA.TH_G CCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 57.88%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCA *** * ** *** * *** * *** * ** ** ** ******* *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG HUM.JA_A AGCCGAGAGT-TGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAG ** * *** * * ** * * *** * *** * ***** * *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG HUM.JA_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * ** * **** ******* *************** *** ** *** * * **** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA HUM.JA_A AAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGA ********* * * **** * * * ** * *** ** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT HUM.JA_A CCATCTCTTTT *** * ***
Mean pairwise ID: 57.88%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_H GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_H GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ************ ************ ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT- LYC.ES_H AACCACCTTTT **** ****
Mean pairwise ID: 57.89%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ******** *********** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_D TTTT ****
Mean pairwise ID: 57.89%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT ** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * CAE.EL_D ATTT RAT.NOR. ----
Mean pairwise ID: 57.93%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ********** **** ******** * ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * **** ** ** *** ** *** * ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_M AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-TGGGGCG **** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** * ******************** ** * ********** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA ** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * *** ARA.TH_G ACCATTTT- LYC.ES_M ACCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 57.93%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** * *** *** *** * * * ****** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG *** ** * * ** *** * * * ***** * ** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * *** HUM.LU_C ATTTCTTTT LYC.ES_K ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 58.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG--GAATGT * ***** *** ** ******* **** * ******* *** ****** * *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_B TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC ** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_B AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT *** * * * * * *** **** * * * * ** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_B GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTG ** * * * ************************* *** * ***** * ***** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_B GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAA *********** * ** ** * * ** * * * * * ** * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_B ACCACCACTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 58.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG--GAATGT ******* *** ** ******* **** * ******* *** ****** * *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_I TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGACTTGCCCTATCC ** ** * * * ** ** ** *** * * * * * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_I AAGCTTAGAGTTGGAT-CATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT *** * * * * * *** **** * * * * ** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_I GGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTG ** * * * ************************* *** ** **** * ***** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_I GAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAA *********** * ** ** * * ** * ** * * * * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_I ACCACCATTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 58.01%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGG--TTGAAC-T *** ** **** ** * * * * ** * ** * *** * ** **** *** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA CIN.HYB. TTGA--GCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCA ** * *** * * ** * **** * * * * *** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT- CIN.HYB. AGTCGAG-AGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATC *** * * ** * ** * **** *********** * * **** * ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG CIN.HYB. GGGGGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTG ** *** * ***** ****************** **** *** * ** * ** *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG CIN.HYB. GAAGGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATAT--AACCAGCCTGGCTAGCCCAACAG ******* ** **** * * *** * * ** ** ** * *** ORY.SA_B ACCACCACCTTT CIN.HYB. GACACCCATTT- **** **
Mean pairwise ID: 58.12%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATA-- ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_A TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA *** * * * ****** * ** * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC *** * * ** *** * * **** * **** *** * **** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT--CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** * ******************** ** * ** *** ** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** * ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_A CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 58.13%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAA----GATGGTGGAAC * ****** *** ******* *********** **** * *** * * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ARA.TH_G ACTGGATCGGCCCACGGGTCGGATT----TGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATC *** ** * * * ******** ** **** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ARA.TH_G CAAGCTGTG-AGTGAACCGTATGAACCA-AGCGAAGG--TTTGATCCGTACGGTTG--CT **** ** * **** *** * * * ******* **** * * * * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA ARA.TH_G AAAGGTTGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCA ** ** * ** * **** *********************** ** ****** ** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA ARA.TH_G GCAGTGGACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAAC * ***** *** *** * * ** * ** ** * ** * * * ORY.SA_A CAAC--AGACCACCATCTTT ARA.TH_G CCGCTTGAACCACCATTTT- * * ******** **
Mean pairwise ID: 58.18%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAG-TGGTTG--AATA * ****** **** ** * ** ***** ***** ** * ** **** *** ** ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_A TTGGGCTTT-ACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTT---CTGGCCTGCCCTGTC ** ** * * * ***** ** * ** * ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_A CAAGC-ACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGG-----CTTCTTGATTCC **** * *** ** * *** *** * * ***** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_A TAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGT ******** * ** ** ********************** ** * ** ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LYC.ES_A GCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTC * ************ ** * ** * * *** * * ** ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_A CAATAAACAACCACCTTT *** * ** **** ****
Mean pairwise ID: 58.20%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_K GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** ** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_K AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_D CCACCATCTT- LYC.ES_K CAACCACCTTT * **** ***
Mean pairwise ID: 58.20%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_E G---GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA * * * * * ** **** * * * ** * * * ** ****** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGG * ** *** * * * * **** * **** * ** * ** **** * ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA *** * ************ *************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAGA ARA.TH_E CGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA **** ** * * ** *** * * * * * * * ZEA.MA_G CCACCATCTTT ARA.TH_E CCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** *** * *** * * ***** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_D ATTT HOM.SA_B T---
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA * **** ****** *** * ** ** *** * *** ** ******* ** ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCG-GTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGT GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTG-AGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * * ** ** ** * * ** ** *** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG GAL.GAL. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC GAL.GAL. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC ** ***** ***** * * *** ** ***** * * * ***** * ** CAE.EL_A ATTT GAL.GAL. C---
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT ** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * CAE.EL_A ATTT RAT.NOR. ----
Mean pairwise ID: 58.22%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_D ATTT CAN.SPE. T---
Mean pairwise ID: 58.25%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** * *** *** *** * * * ****** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG *** *** * * ** *** * * * ***** * *** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********* ************* HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * *** HUM.LU_C ATTTCTTTT LYC.ES_A ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 58.26%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAA----GGTGGTGGAAT * ****** **** ** * ** *********** **** *** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT LYC.ES_E ATTGG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTAT **** * * * *** ****** ** ** **** * ***** ***** * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC LYC.ES_E CCAAGT-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAG-----AATGGGCTACTAGATTC ****** * *** ** * ** *** * * *** ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC LYC.ES_E CTAAAGTGGGGTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTG ********* * ** *********** *********** *** * ****** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT LYC.ES_E TGCAGTGGAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTT * ************* * * * *** * * ** *** * * * ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT- LYC.ES_E CTAGTTAAACTACCACATTTT * * ** **** ***
Mean pairwise ID: 58.28%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** *** ****** * ** *** * ***** **** ** **** * CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT **** ****** *** * ** * * * ***** ** * ***** * *** CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTGG XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * * *** * ** * *** *** * * ** ** *** ******* ** CAE.EL_B TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA ** * ** **** * **** * ***** *** ** *** ** * **** * *** CAE.EL_B CTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC-CACTTGTTT XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-- **** ***** * * * ******* *** ** **** ** ** * CAE.EL_B TT XEN.LAE. --
Mean pairwise ID: 58.28%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT * ** * * * * * ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGAC-ACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA *** * * *** * ** * ** * * ** ** * ******* **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAG-CGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG HUM.LU_C GCCGGGAG-GTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNG--CGCACTCCTAGACTG * ** ** ** * ** *** ** * **** *** ** *** *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG HUM.LU_C GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * ** * **** *********************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA HUM.LU_C AAGGATAACGG-GCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATA ********* **** *** * ******* * * ** *** * * ZEA.MA_A CCACCATCTTT--- HUM.LU_C GGACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 58.31%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAAC-TT *** *** *** ** ** * **** *** * *** ** ** ***** ** * ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT CIN.HYB. TGAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGC-ACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT * ** ** **** **** ** * * *** ************** ZEA.MA_F TGGTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCT-GAAGCGGCA CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG * **** * ** * * ******** *** * ** * *** *** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCT-CTACCTCTCGACTGTGGAA **** **** ******* ********** **** ** * ** * ** **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC **** *** **** * * * ** ** * * ** ***** *** ZEA.MA_F CATCTTT CIN.HYB. CCATTT- * **
Mean pairwise ID: 58.33%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTG-GGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * *** *** * * *** ***** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **************************** ** ****** * * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG ******** ***** *** * *** * * * ** *** * * ZEA.MA_D ACCATCTT---- HUM.LU_D ACCATTTCTTTT ***** *
Mean pairwise ID: 58.33%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.JA_B TTAGTTCGGCCCATTGGATC-GGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAA ** *** *** * ** * * * ** * ** ** ****** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGA-CCTGAAGTGG HUM.JA_B GCCGAGAGTTGA-GCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGG * * *** * * * * * **** * *** * *** *** *** ** ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG HUM.JA_B AGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * ************ *************** ** ****** * * **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCC--TCACTAAGCAG HUM.JA_B AGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGG ************** *** * * **** * * * * **** *** * ZEA.MA_G ACCACCATCTTT HUM.JA_B ACCATTTCTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 58.33%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CT * ** * * * * * ******** ** ******** ** ** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGG-TNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAA *** * * *** **** * * ** * ** * ****** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_C GCCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGA * ** ** * * * * * *** * *** * * * * *** * *** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA ** * **************************** ** ****** * * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGACC HUM.LU_C GGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGG ************* *** * * ***** *** * * * * * ** *** * * ZEA.MA_G ACCATCTTT--- HUM.LU_C ACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 58.39%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_N GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGA * * ************ *********** **** * * **** * ****** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC ******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * ** ZEA.MA_D CACCATCTT- LYC.ES_N CACCATTTTT ****** **
Mean pairwise ID: 58.39%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT ****** **** **************** ** **** * **** ***** * * ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGT-TGGCCTGCCCGTTCCAAGT ARA.TH_G GGAT--CGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGC * * ** * * ** ** * ** ** * ** *** ****** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ARA.TH_G TGTGAGTGAACCGTATGAACC-AAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG ** **** * * * * *** *** * * * * * ** * ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACG ** * **** ****** **************** ** ** *** * * * ***** * ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA-CTAAAGCAGAC ARA.TH_G GACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAAC ** *** * * ** ** * ** * ** ** ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT ARA.TH_G CACCATTTT- *********
Mean pairwise ID: 58.42%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT * * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** **** * *** * *** * * * * *** ** * ********* RAT.RAT. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG *** * * *********** ** **** * * * ******* ******** RAT.RAT. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ******* * ******** RAT.RAT. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCT DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC **** *** ** * * * ***** * * ** * **** * RAT.RAT. CTT DRO.MEL. TTT **
Mean pairwise ID: 58.42%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT * * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** * **** DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT * **** * *** * *** * * * * *** ** * ********* DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG RAT.NOR. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * *********** ** **** * * * ******* ******** DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG RAT.NOR. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ******* * ******** DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC RAT.NOR. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTC **** *** ** * * * ***** * * ** * **** ** DRO.MEL. TTT RAT.NOR. T-- *
Mean pairwise ID: 58.44%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATA-- ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_J TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA *** * * * ****** * ** * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC *** * * *** *** * * **** * **** *** * **** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** * ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_J CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 58.44%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATA-- ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** **** * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_K TTGGGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA *** * * * ****** * ** * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC *** * * *** *** * * **** * **** *** * **** ***** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** * ******************** ** ** * *** ** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACT-TTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** * ** ** * * ** ** * * * * * * **** * ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_K CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 58.47%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA-- ****** *** ** * *********** ** **** *********** **** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_E TTGGGCTG--TCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG *** * ** * * * ******* * ** * * * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_E T--ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGG * ** ** * * * * ** * ** **** ** * *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_E GGTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA * * *** ******* *********** *** * * ** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA LYC.ES_E AGGATAACGGA-CCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA ********* * *** *** * ** * * * ** * * *** ** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT- LYC.ES_E ACTACCACATTTT ** **** ***
Mean pairwise ID: 58.47%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * ** HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAG ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG *** * * ** *** * *** * ** * ** ******* ***** HUM.LU_D CCGGGAGTTGGGCTGA-GTGACCTGGGCGAAGGCT--GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGG ZEA.MA_B TTGGTAGT--GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ** *** * **** * * * ***** *** **** * **** ** ** HUM.LU_D AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ** * **** *********************** ** *** ** * * **** HUM.LU_D AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAG ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC--CAGATCCTCTCTTAGCAA ******** **** *** ** *** ** * * ****** * HUM.LU_D GACCATTTCTTTT ZEA.MA_B -ACCACCATCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 58.47%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ****** *** *********** ******* **** ** ********** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * ** * ** ** *** * * * * * * * * ****** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG * ** *** * * ** * *** * **** ** * ** **** * ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGG *** * ************ *************** *** ** *** ** * **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC---A ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCA-CTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTG **** * * ** * ** *** ** ***** * ** * ZEA.MA_E GACCACCATCTTT ARA.TH_D GACCACCACTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 58.47%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGA---ACT * ** * * * * * ******** ** ******** ** * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTG-TGACT-CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG HUM.LU_C TTGGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAG *** * ** *** * ** * ** ** ** * ******* ***** ZEA.MA_B TTGGTAG-TGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC HUM.LU_C CCGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC--GCACTCCTAGACTGGA ** ** ** *** * ***** *** ** *** **** * ** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG HUM.LU_C GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTAC-CTCCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **** *********************** ** * *** ** * * **** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAG---ACCCAGATCCTCTCTTAGCAA HUM.LU_C AGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAG ******** **** *** * ******* ***** * * * * ****** * ZEA.MA_B -ACCACCATCTTT HUM.LU_C GACCATTTCTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 58.52%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_K GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** ** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_K AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_K CAACCACCTTT * **** ****
Mean pairwise ID: 58.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_H GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_H CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * *** * * ** * * * *** ** * * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_H GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * *********** ************ ** ** ** *** * * ****** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_H GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT- LYC.ES_H AACCACCTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 58.52%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_E G---GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAA * * * * * ** **** * * * ** * * * ** ****** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_E GCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGG * ** *** * * * * **** * **** * ** * ** **** * ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_E AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG *** * ************ *************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG ARA.TH_E ACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA **** **** * ** *** * * * * * * ZEA.MA_D ACCACCATCTT ARA.TH_E ACCACCATTTT ******** **
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_A ATTT CAN.SPE. T---
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** *** * *** * * ***** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_A ATTT HOM.SA_B T---
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ****** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC ** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * ** CAE.EL_D ATTT ORI.CUN. C---
Mean pairwise ID: 58.55%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_D ATTT HOM.SA_A TT-- *
Mean pairwise ID: 58.58%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** * *** *** *** * * * ****** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG *** *** * * ** *** * * * ***** * *** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * *** HUM.LU_C ATTTCTTTT LYC.ES_J ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 58.58%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACTTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT * ** ** * * * ******** *********** * *** **** * HUM.LU_C GGGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * * ** * ** * * * *** ** * * * **** ******* HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGA--GGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * * **** * * *** * * ***** *** * ** *** * HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG *** ***************************** ** ****** * * ******** HUM.LU_C ATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCA-ATTGGGCCTCGCAGCCTACTCC--AGCAGACC **** ****** *** * ** * * * ** * * ** **** * **** HUM.LU_C ATTTCTTTT TRI.AE_A ACC------ *
Mean pairwise ID: 58.58%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_K GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCT--TGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC ** * **** * ***** ** * * ********** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA LYC.ES_K ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGG *** * ** ** * * ******** * **** ** ** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG LYC.ES_K CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAACA ***** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * ** ZEA.MA_C ACCATTTTT LYC.ES_K ACCACCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 58.61%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** **** CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA * **** ****** *** * ** ** * * * *** ** ******* ** ** CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTG GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** *** * ** * * *** * ** ** ** *** ******* * CAE.EL_B GTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * ** CAE.EL_B ACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTT GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGTCT * **** ***** * * *** * ***** *** * ***** *** * CAE.EL_B TT GAL.GAL. CC
Mean pairwise ID: 58.61%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG *** *** ****** * ** *** * ***** **** ** * **** * CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT **** ****** *** * ** * * * ***** ** * ***** * *** CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCA-TAAGGAGTGG XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * * *** * ** * *** *** * * ** ** *** ******* ** CAE.EL_C TGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA ** * ** **** * **** * ***** *** ** *** ** * **** * *** CAE.EL_C CAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGAC-CACTTGTCA XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-- **** ***** * * * ******* *** ** **** ** ** * CAE.EL_C CT XEN.LAE. --
Mean pairwise ID: 58.63%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG *** **** ****** * * **** * **** *** * *** ***** *** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGA-TGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG * *** * * **** ** ** ***** ***** ****** LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACT-TGGCCTTTAGAGTGGGATGG CIN.HYB. AGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGG ***** ** *** ** ** **** * * * ** ******* * ** ** LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA CIN.HYB. CAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGA * ***** ****************** *** * * **** * ********* LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT CIN.HYB. TTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCAGCC--TGGCTAGCCCAACAGGACACC * ** ** * * ** * * * ** * * * * * *** ** ** LYC.ES_F CACTTTT CIN.HYB. CATTT-- ** **
Mean pairwise ID: 58.65%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_G GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG ** * * * ****** * ** * * * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_G C--ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGG ** ** * * * * ** * ** **** ** * *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_G GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA * * **** ******* *********** *** * * ** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA LYC.ES_G AGGATAACGGA-CCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA ********* * *** *** * ** * * * ** * * * * ** ** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT LYC.ES_G ACCACCACTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 58.65%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTG-GGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * *** *** * * *** ***** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **************************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC HUM.LU_D AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGG ************** *** * *** * * * ** *** * * ZEA.MA_E ACCATCTTT--- HUM.LU_D ACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 58.71%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA *** * ** *** * *** * * * ** * ** ** ****** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA * * *** * * * * *** * *** **** * * *** *** ** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * ************ *************** *** ****** * * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCC-CAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGAC ******** ** ** *** * * *** * * * ** *** ***** ZEA.MA_D CACCATCTT- HUM.JA_A CATCTCTTTT ** * **
Mean pairwise ID: 58.71%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_A GGGCTTTA----CCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG ** * * * ****** * ** * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC LYC.ES_A CACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAA-TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG *** * * *** * * **** * **** *** * *** ** ** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGGA LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCG-CTCTGTGCAGTGGAA * * ** * ******************** ** * ** *** *** * **** * ZEA.MA_A GGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAAC LYC.ES_A GGATAATGG-GTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** * * ** ** * * * * * * * ** * * ** * **** ZEA.MA_A CACCATCTTT LYC.ES_A AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 58.73%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA *** * * * *** * *** * *** * ** * ** ******* *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAG-CGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGC HUM.LU_D AGCCGGGAGT-TGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT--GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT ** ** *** * * ** * * ** * **** *** **** * *** *** ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG HUM.LU_D GGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTG ** ** * **** *********************** ** ** *** * * *** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA HUM.LU_D GAAGGATAACGG-GCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAAT * ********* **** *** ** * * * ** *** * ZEA.MA_A ACCACCATCTTT--- HUM.LU_D AGGACCATTTCTTTT * ***** * *
Mean pairwise ID: 58.79%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** * * ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** * * ** * * ** * * * ****** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTT--GGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * *** * * ****** **** ** * * * *** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA ** * **** *********************** *** ** ** ** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAGCA ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG **** *** ** * ** ** ** *** *** * * * ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ARA.TH_F AACCACCATTTT- ********* **
Mean pairwise ID: 58.79%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT *** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * ** HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAG ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG *** * * ** *** * *** * ** * ** ******* ***** HUM.LU_A CCGGGAGTTGGGCTGA-GTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCAC-GTCCTAGAGTGG ZEA.MA_B TTGGTAGT--GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ** *** * **** * * * ***** * * ** * * * **** ** ** HUM.LU_A AGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ** * **** *********************** ** *** ** * * **** HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC--CAGATCCTCTCTTAGCAA ******** **** *** ** * *** ** * ** ****** * HUM.LU_A GACCATTTCTTTT ZEA.MA_B -ACCACCATCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 58.82%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** **** ****** * * *** ****** * *************** *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA LYC.ES_A GGCTTTACC-AGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA **** * ** ****** ** * ***** ***** ****** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCGG **** ** ** * ** * *** *** *** ** * * **** * CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGC-TCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** * ******* ********** * *** * * * *** * ********** CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC * * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** ** CIN.HYB. ATTT-- LYC.ES_A ACCTTT * *
Mean pairwise ID: 58.84%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_J GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_J AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_D CCACCATCTT- LYC.ES_J CAACCACCTTT * **** ***
Mean pairwise ID: 58.88%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ****** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTC ** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * ** CAE.EL_A ATTT ORI.CUN. C---
Mean pairwise ID: 58.88%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_A ATTT HOM.SA_A TT-- *
Mean pairwise ID: 58.88%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_D GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_D GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_D CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_D GACCGCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** *** * * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_D ATTT RAT.RAT. TT-- *
Mean pairwise ID: 58.90%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ***** *** *** * ***** ******** * *** * * *** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG ** **** * *** *** *** ** * ***** ******* LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC *** *** * * ** **** * * ** ** * *** * * LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************** ************ ** * ********** ************* LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAA-TGGGTTGCTCCAATAAACAACC HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC ** *** ***** * * ** * * ** **** ** * * * *** LYC.ES_H ACCTTTT-- HUM.LU_C ATTTCTTTT * * **
Mean pairwise ID: 58.92%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT *** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA *** * * * *** * *** * *** * ** * ** ******* *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG HUM.LU_A AGCCGGGAGT-TGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTG ** ** *** * * ** * * ** * *** ***** * * *** *** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * ** * **** *********************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA HUM.LU_A AAGGATAACGG-GCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATA ********* **** *** ** * * * * * ** *** * * ZEA.MA_A CCACCATCTTT--- HUM.LU_A GGACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 58.94%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ***** * ****** ******* * **** ** * ** ** * * **** CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * ** CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* * CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA RAT.NOR. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT- ** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * CAE.BRI. TT RAT.NOR. --
Mean pairwise ID: 58.94%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ***** * ****** ******* * **** ** * ** ** **** CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTG-GGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAA * *** ****** *** ** ** ** ** * * *** ** ******* ** ** CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG GAL.GAL. GGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** ** * ** ** *** *** ** ** ** ******* * CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ** **** ***** * * * ** * ***** * * ***** * ** CAE.BRI. TT GAL.GAL. --
Mean pairwise ID: 58.96%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT *** *** ** ** ** * * ** ** *** *** ** * * *** ** * * CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT * ** ** **** *** * * ***** ************** CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG TRI.AE_B GGTAGTGGGCT-GGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTT--AAGTGGCAG * ****** * ** * * ***** *** * ** ** ** ** * CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTC-CAACGGTGGAAGG *** ********************** **** *** * * ** * ** ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCC-CAACAGGACAC TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC ** *** **** * * * *** * * * * *** * *** * *** *** CIN.HYB. CCATTT- TRI.AE_B CATCTTT * **
Mean pairwise ID: 58.96%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** ****** ** * * ** * **** ** * ** ***** **** ** ARA.TH_D -GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA--CCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * * * * ** ** *** * * * *** ***** ****** ARA.TH_D GTGAGTAA-TCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** * *** ********* * * * * * * ** * **** ** ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG * ******* ****************** **** ** ** ** * * ***** ** ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCT-AGCCCAACAGGACAC ** * * ** *** *** ** ** *** ** ** * * * * * **** ARA.TH_D CCACTTT CIN.HYB. CCATTT- *** **
Mean pairwise ID: 58.97%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT *** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * * * *** * * * *** ***** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **************************** ** ****** * * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG ******** ***** *** * * *** * * ** ** *** * * ZEA.MA_D ACCATCTT---- HUM.LU_A ACCATTTCTTTT ***** *
Mean pairwise ID: 58.97%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ****** *** *********** ******* **** ** ********** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * ** * ** ** *** * * * * * * * * ****** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG * ** *** * * ** * *** * **** ** * ** **** * ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGA *** * ************ *************** *** *** *** ** * **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC---AG ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCA-CTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGG **** * * ** * ** *** ** ***** * ** * * ZEA.MA_G ACCACCATCTTT ARA.TH_D ACCACCACTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ****** *** * ************* * **** **** ** ***** * * ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ARA.TH_E -GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC *** * * * * * ** * * ** ** * ** *** ****** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCT-TGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA ** *** ** * * *** **** *** * *** *** * * ZEA.MA_C GGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC ** * *********** *************** *** ** *** * * ***** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC **** **** * * ** * * ** * * * * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT ARA.TH_E CACCATTTT- *********
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA *** * ** *** * *** * * * ** * ** ** ****** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA * * *** * * * * *** * *** **** * * *** *** ** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * ************ *************** *** ** *** * * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCC-CAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGAC *********** ** *** * * *** * * * ** *** ***** ZEA.MA_E CACCATCTTT HUM.JA_A CATCTCTTTT ** * ***
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA-- ****** *** ** * *********** ** **** ********* * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA *** * ** * ******* * ** * * * *** ***** ****** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAAT-GGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT *** * * * * ** * * ***** * *** ** * **** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_E GGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAA-AAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG * * *** ******* *********** *** * * ** *** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAACC LYC.ES_E GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACT ****** *** *** * ** * * * ** * * *** **** ZEA.MA_B ACCATCTTT- LYC.ES_E ACCACATTTT **** ***
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_N GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC--GCTCTAAGCGGTGGA * * ************ *********** **** * * * *** * ****** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_N AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC ********* * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * ** ZEA.MA_E CACCATCTTT LYC.ES_N CACCATTTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_K GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_K GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** *** ** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_K GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ********************** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC LYC.ES_K GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_K AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 59.03%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--T ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.JA_B TAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC * ** * * ** * ** * ** ** ** *** *** ****** ******* ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTC-TGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAG * *** * * * ** ** *** * *** * * **** ** ** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG HUM.JA_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ** * *********** *************** ** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCC-TAGACTTCATACTAAAGCAGAC HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC ****** **** *** ** *** * * * * * ** * * ** ** *** ZEA.MA_C CACCATTTTT HUM.JA_B CATTTCTTTT ** ****
Mean pairwise ID: 59.06%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAA----GATGGTGGGAC * ****** **** * * *** ********* * **** ** *** * * ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ARA.TH_A ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATG---TTTCTGAGCTGCCCAGTC **** ** * ** ** * **** * * ** *** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ARA.TH_A CAAGCTGTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATG-----CAGGTTC **** ** * *** * * ** ******** * ** * ** * ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC ARA.TH_A TAGAGTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTAC ** *** ** ** * **************************** *** ******* * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT ARA.TH_A AGCAGTGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATC * * ***** **** ** * * * ** * ** ** * * **** ORY.SA_A ACA-ACAGACCACCATCTTT ARA.TH_A TCATATGAACCACCATTTT- ** * ******** **
Mean pairwise ID: 59.08%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT * * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** ** **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** **** * *** * *** * * * * *** ** * ********* HOM.SA_A AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG *** * * *********** ** **** * * * ******* ******** HOM.SA_A GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ******* * ******** HOM.SA_A GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCT DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC **** *** ** * * * ***** * * ** * **** * HOM.SA_A CTT DRO.MEL. TTT **
Mean pairwise ID: 59.08%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** * * * *** * * ***** * ** CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * * CAE.EL_B TTT HOM.SA_B T-- *
Mean pairwise ID: 59.08%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ** ** * * * *** ** * ***** * ** CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * * CAE.EL_B TTT CAN.SPE. T-- *
Mean pairwise ID: 59.08%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * ** CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * CAE.EL_B TTT RAT.NOR. ---
Mean pairwise ID: 59.15%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** ** ******* * * * * ****** * * ** * * * * ** *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAG-ACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * ** * * **** * * * ***** **** ******** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** * **** **************** ** * **** * **** ARA.TH_C G-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG * * **** ****************** *** ***** **** *** ******** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACC ***** *** * * ** ** *** *** ** ** * **** ARA.TH_C CACTTT CIN.HYB. CATTT- ** **
Mean pairwise ID: 59.15%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ***** *** ** * ****** ***** ****** ** * * **** * *** * LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** * LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG *** ** ***** *** * * ** ** * *** **** * LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT * *** ******************* *** ** * **** * ************ LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTA-ACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCACC *** * ** ** ** * ** * **** * ** * * ****** LYC.ES_N ATTTTT TRI.AE_B ATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG--GAACAG ****** *** *********** ******* **** ** ********** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGT-TGGCCTGCCCGTTCCAAGT ARA.TH_D TGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC **** * * ** * ** * * * * * ** ****** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGAC-CTATAGTGGC ARA.TH_D TGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGC--TTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG ** *** * ** * * **** **** * * ** *** *** *** * ZEA.MA_C AGGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGA *** * *********** *************** *** ** ** * * ***** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA **** * ** * * * * * ** * ** *** ** ** ZEA.MA_C CCACCATTTTT ARA.TH_D CCACCACTTT- ****** ***
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_A GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC--CCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** * *** ***** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* ** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_D CCACCATCTT- LYC.ES_A CAACCACCTTT * **** ***
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_J GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** ** ** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_J AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_J CAACCACCTTT * **** ****
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT ** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_D GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTG-GGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * *** *** * * *** ***** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA HUM.LU_D GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA ** * **************************** ** ****** * * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACCA HUM.LU_D GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGA ************* *** * *** * * * ** *** * * * ZEA.MA_G CCATCTTT--- HUM.LU_D CCATTTCTTTT **** * *
Mean pairwise ID: 59.16%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** * * * * * ******* *** ******** ** ** * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.LU_C GGTCAACCCAG--TGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGC ** * *** * ** * ** ** ** ** * ****** ******* ZEA.MA_F TGGTTG-TGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGG ** * *** * *** * ********** * * * *** * ** * ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG HUM.LU_C GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG *** **************************** ** ****** * * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG--AGCCTCA---TTAAACAGA HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC-AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGA ****** ***** *** **** *** * ** ** * ** * **** ** ZEA.MA_F CCACCATCTTT HUM.LU_C CCATTTCTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 59.21%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_A GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** *** * *** ** * ***** * ** CAE.EL_A GCGCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * * *** * ** * ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_A CGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCG RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG *** * ** **** * **** * ***** *** * *** * * **** * * CAE.EL_A GACCGCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATC RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** ***** ***** * * *** ****** * * * ***** * * ** CAE.EL_A ATTT RAT.RAT. TT-- *
Mean pairwise ID: 59.22%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_N GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_N GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAA * * ************ *********** **** * * **** * ****** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGACC LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC ******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * *** ZEA.MA_G ACCATCTTT LYC.ES_N ACCATTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 59.22%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_J GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCT--TGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC ** * **** * ***** ** * * ********** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA LYC.ES_J ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG *** * ** ** * * ******** * **** ***** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG LYC.ES_J CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * ** ** ******** ************* ** ** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAACA ***** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * ** ZEA.MA_C ACCATTTTT LYC.ES_J ACCACCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 59.24%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA * ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGA--CACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC--GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA *** * ** *** * *** * *** * ** * ** ******* *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG HUM.LU_B AGCCGGGAGT-TGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTG ** ** *** * * ** * * ** * *** ***** * *** *** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG HUM.LU_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGG * ** * **** ******* *************** ** ** ***** * **** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAGC HUM.LU_B AAGGATAACGG-GCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATC ********* **** *** *** * * * * * * * *** *** ** * ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT HUM.LU_B GGACCATTTCCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 59.27%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATCG ***** * ****** * ****** * ***** **** ** **** * CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC XEN.LAE. CTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT *** ****** *** ** ** * ** * * *** ** * ***** * *** CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCA-TAAGGAGTGG XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG * * ** * ** *** * *** ** ** ** ** ******* ** CAE.BRI. TGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA ** ** *** **** * **** * ****** *** ** *** ** * **** * *** CAE.BRI. TAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGAC-CACTTGTCA XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-- * **** ***** * * ** * ******* * ** **** ** ** * CAE.BRI. TT XEN.LAE. --
Mean pairwise ID: 59.27%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ***** * ****** ******** * **** ** * ** ** * **** CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * ** CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* * CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * ** CAE.BRI. TT ORI.CUN. --
Mean pairwise ID: 59.27%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ***** * ****** * ****** * **** ** * ** ** * * **** CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * *** ****** *** ** *** ** ** * * *** * * ***** * ** CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* * CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA HOM.SA_B ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * * ** CAE.BRI. TT HOM.SA_B --
Mean pairwise ID: 59.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** **** ****** * * **** ****** ** * * ** ***** *** *** LYC.ES_E GGCT-GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA *** * * ** * * **** ** * ***** ***** ******* * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG- CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** ****** * * *** * *** * ** ** * * *** ** LYC.ES_E -ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT * *** ****************** ****** ** ** * * ********** LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC ** **** * * * * ** *** ** * **** * * ** ** LYC.ES_E ACATTTT CIN.HYB. ATTT--- * *
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA * ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * ** *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * ** * *** * * *** ***** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCCCGGCAGTGGA ** * ************ *************** ** ****** ** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT---AAGCAG HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG ******** ***** *** * * * *** * * * * *** *** ** * * ZEA.MA_D ACCACCATCTT- HUM.LU_B ACCATTTCCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA-- ******* *** ** * *********** ** **** *********** **** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_O TTGGGCTG--TCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG *** * ** * * * ******* * ** * * * * *** ***** ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_O C--ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGG ** ** * * * * ** * ** **** ** * *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_O GGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGA * * **** ******* *********** *** * * ** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA LYC.ES_O AGGATAACGGA-CCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAA ********* * *** *** * ** * * * ** * * * * ** ** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT LYC.ES_O ACCACCACTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ****** *** *********** ******* **** ** ********** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * ** * ** ** *** * * * * * * * * ****** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGG * ** *** * * ** * *** * **** ** * ** **** * ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_D AGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGG *** * ************ *************** *** *** *** ** * **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGC---A ARA.TH_D ATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCA-CTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTG **** * ** ** * ** *** ** ***** * ** * ZEA.MA_D GACCACCATCTT ARA.TH_D GACCACCACTTT ******** **
Mean pairwise ID: 59.29%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT *** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * * * *** * * * *** ***** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **************************** ** ** *** * * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC HUM.LU_A AGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGG ************** *** * * *** * * ** ** *** * * ZEA.MA_E ACCATCTTT--- HUM.LU_A ACCATTTCTTTT ***** * *
Mean pairwise ID: 59.35%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ****** *** * ************* * **** **** ** *** * * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGAC-TCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT ARA.TH_E G-GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGC * *** ***** * ** * ** * * * * ** ****** ***** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG ARA.TH_E TGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTT-GGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG ** *** * * ** ****** **** ** ** *** ** * ** ZEA.MA_B GA-ATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGAC * * **** ******* *************** *** *** *** ** * **** ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTA-GCAAAC ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC **** *** * * *** * * * * * *** *** * *** ZEA.MA_B CACCATCTTT ARA.TH_E CACCATTTT- ****** **
Mean pairwise ID: 59.35%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ****** *** *********** *** ** **** ** ********** ** ARA.TH_D GTTCAAT---TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCAC-TGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG * * ** ** ** * ** ** ** * * * ****** ****** ARA.TH_D CTGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGCA ** ** *** ** ** ********* ** * ** *** *** ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGGAT ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA ** * ************ *************** *** *** *** ** * **** ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGAC ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGAC **** * ** ** * * ** *** ** ** * ** * *** ARA.TH_D CACCACTTT- ZEA.MA_F CACCATCTTT ***** **
Mean pairwise ID: 59.35%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ****** *** * ************ * * **** **** ** ***** * * * ARA.TH_E GGTT--CGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCAC-TGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG * *** * * ** * ** *** ** ** * * ** ****** ****** ARA.TH_E CTGTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAG ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGC-GGCA ** ** *** * ** ******** *** * ** *** ** ARA.TH_E GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGAC ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA ** * ************ *************** *** ******* ** * **** ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGAC **** **** * ** *** ** * * * * * * ** ARA.TH_E CACCATTTT- ZEA.MA_F CACCATCTTT ****** **
Mean pairwise ID: 59.35%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_I GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGA * * ************ *********** **** * * **** * ****** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC ******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * ** ZEA.MA_D CACCATCTT- LYC.ES_I CACCATTTTT ****** **
Mean pairwise ID: 59.41%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT * * ** * **** ** ***** ** * *** ** * * **** * **** DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGTCGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT ** **** * *** * *** * * * * *** ** * ********* DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG ORI.CUN. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * *********** ** **** * * * ******* ******** DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG ORI.CUN. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ******* * ******** DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC ORI.CUN. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC-CTGTC **** *** ** * * * ***** * * ** * **** * ** DRO.MEL. TTT ORI.CUN. TCC *
Mean pairwise ID: 59.41%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * * **** CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * *** ** * * * *** * * ***** * ** CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT HOM.SA_B GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG HOM.SA_B GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC HOM.SA_B GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * ** CAE.EL_C ACT HOM.SA_B T--
Mean pairwise ID: 59.41%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * ** HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * * HOM.SA_A TT- CAE.EL_B TTT **
Mean pairwise ID: 59.41%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT *** *** ****** * ** *** * **** ** * ** ** * * **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * ** HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* HOM.SA_A GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * HOM.SA_A GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * ** HOM.SA_A TT- CAE.EL_C ACT
Mean pairwise ID: 59.41%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ** ** * * * *** ** * ***** * ** CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG CAN.SPE. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC CAN.SPE. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * ** CAE.EL_C ACT CAN.SPE. T--
Mean pairwise ID: 59.42%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* ** ** ******** ***** ****** * * ** **** * * ** ARA.TH_G GGAT-CGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT * * *** ** * * * ** ** * **** ****** ****** * ARA.TH_G GTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAG--GCCTTAAGTGGCAGG * **** * * ** ***** * ** * * * ** * ** * ** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * *********** **************** ** * ***** ** * ***** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC--GCCATAGCAGACCA *** * ** ** ** ** ** *** ** * * * ** **** ARA.TH_G CCATTTT- TRI.AE_B CCATCTTT **** **
Mean pairwise ID: 59.42%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT ******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** * *** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT LYC.ES_C GAACAT-GCCCAGAAGGTAGGGCTTGTG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA * * * *** * ** ** ** ********** ****** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCT-TGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGT *** * * * * *** **** ****** * * **** ***** ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG LYC.ES_C GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * ** *********** *********** *** * ** *** * * ******** ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA LYC.ES_C ATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTA ***** **** ** ** * ** ** * ** * * * ** * ZEA.MA_C CCATTTTT LYC.ES_C CCACATTT *** ***
Mean pairwise ID: 59.48%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** ** *** * ********* ****** *** * *** ** ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * ** *** * ** ** ** * ******** ******* * ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGTA HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCA *** ** ** ********* ** ** ****** * ARA.TH_F ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGATC HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA ********************************** ******* * ******** **** ARA.TH_F ACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCACC HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT **** * * ** * ** ** * **** * ** *** * * **** ARA.TH_F ATTTT- HUM.LU_C TCTTTT ***
Mean pairwise ID: 59.48%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG * **** ****** * * *** ****** * *************** *** LYC.ES_K GGCTTTACC-AGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA **** * ** ****** ** * ***** ***** ****** * LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCGG CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** *** * ** * *** *** *** ** * ***** * LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT * ** * ******* ********** * *** * *** **** * ********** LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC * * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** ** LYC.ES_K ACCTTT CIN.HYB. ATTT-- * *
Mean pairwise ID: 59.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ****** *** ** * *********** ** **** *********** * ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_E GGG--CTGTCCCAGATGGCTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** ***** * ***** ** ** ********** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * * * * * ****** * **** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA * ** ********** *********** *** * * *** * * ****** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_E GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC ******* * ** *** * ** **** **** * * * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT- LYC.ES_E TACCACATTTT **** ***
Mean pairwise ID: 59.49%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_A GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCC--GCTCTGTGCAGTGGA * * ** ********************** ** * *** * *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA LYC.ES_A AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAA ******* *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_A CAACCACCTTT * **** ****
Mean pairwise ID: 59.54%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTG---G GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCG--GGAGGCTGAGCCCGCCGG *** *** ****** *** *** * **** ** * ** * **** * * CAE.EL_C ATGGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCC GAL.GAL. ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGC-TGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT ** * **** ****** *** * ** ** * * * *** ** ******* ** CAE.EL_C AAGCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAG GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * ** *** * ** * * *** * ** ** ** *** ******* CAE.EL_C TGGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCC GAL.GAL. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * CAE.EL_C GGACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGT GAL.GAL. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGT *** **** ***** * * *** * ***** *** * ***** *** CAE.EL_C CACT GAL.GAL. CTCC * *
Mean pairwise ID: 59.55%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGA---CT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAA *** * ** *** * *** * * * ** * ** ** ****** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.JA_A GCCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA * * *** * * * * *** * *** **** * * *** *** ** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA ** * ************ *************** *** ****** * * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCC-CAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC HUM.JA_A GGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC ********** ** *** * * *** * * * ** *** ****** ZEA.MA_G ACCATCTTT HUM.JA_A ATCTCTTTT * * ***
Mean pairwise ID: 59.56%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTG-TGGTGG--AATG **************** * ** ****** **** * ***** * * *** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_C TTGAACATG--CCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC---AATTCT-CTGGCCTGCCCTGTC ** ** * ** * ** * *** *** * ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_C CAAGCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCA-AGCGAAGGCTTGGG-----CTGCTGGGCTCC **** * **** * **** ******** * * ** ** * ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_C TAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGT ******** * ** ************ *********** *** * ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTG-CACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT LYC.ES_C GCAGTGGAAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTC * ************* ** ** ** * * * * ** * * * * * ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_C TAGTTAAACTACCACATTT * ** **** ***
Mean pairwise ID: 59.60%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ***** * ****** ******** * **** ** * ** ** * **** CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTG-GGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * *** ****** *** ** ** ** ** * * *** ** * ***** * ** CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG CAN.SPE. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG * * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* * CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ** **** ***** * * * ** * ****** * * * ***** * * ** CAE.BRI. TT CAN.SPE. --
Mean pairwise ID: 59.61%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** ***** ** * **** ** *** ** ** * **** **** ** ARA.TH_E -GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCA--CCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * * ** * * * ** ***** * * **** ***** ****** ARA.TH_E GTGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** * * *** * ********** ** * * * * ** * * ** ** ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG * ******* ****************** **** ** ** ** * * ***** ** ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA-GGACAC ** *** * ** ** ** ** *** ** ** * * * * * * ** ARA.TH_E CCATTTT CIN.HYB. CCATTT- ******
Mean pairwise ID: 59.62%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA * ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * ** *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * ** * *** * * *** ***** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCCCGGCAGTGGA ** * ************ *************** ** ** *** ** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT---AAGCAG HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG ************** *** * * * *** * * * * *** *** ** * * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT HUM.LU_B ACCATTTCCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 59.67%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** * **** ****** ******* LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** * * * *** *** * ******** ** * * LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * * ********* ************* LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT ** ********* * * * ** * ** * * ** * * LYC.ES_A CCTTT HUM.JA_A CTTTT * ***
Mean pairwise ID: 59.67%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** * **** ****** ******* LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ***** ** * * * *** *** * ******** ** * * LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** ** ********** ************* LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT ** ********* * * * ** * ** * * ** * * LYC.ES_K CCTTT HUM.JA_A CTTTT * ***
Mean pairwise ID: 59.67%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT * * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** * **** DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTT-CTGGGCTGCAGTGCG--CTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCT ** **** * *** * *** * ** * * *** ** * ******* ** DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCAT-TCAGGTTGGCTAAGGA GAL.GAL. AAGGCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAG-CCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGA *** * *********** * * **** *** **** ******* ******* DRO.MEL. GGGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGT GAL.GAL. GGGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAAC *** ******** ***** **** ***** * * ******* * ***** DRO.MEL. GGGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTAT-CAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAA GAL.GAL. GGGATCGCGCCTGTGAATAG-CCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC-CTG ***** *** ** * * * * * **** * * ** * **** * DRO.MEL. TCTTT GAL.GAL. TCTCC ***
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_B GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCCGCTCTAAGCGGTGGA * * ************ *********** **** * * ***** * ****** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC ******** * ** ** ** *** *** * * * * ** * **** * ** ZEA.MA_D CACCATCTT- LYC.ES_B CACCACTTTT ***** **
Mean pairwise ID: 59.68%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ** ** ** * ** ******** *********** * *** * ** * HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * ** * ** * * ** * ** *** ** ***** * **** ******* HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACG-AAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * * ** * * ** * * * * * **** * * * * *** * ** * HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG *** ************ ******************* ****** * * ******** HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGC--AGCCTACTCC--AGCAGAC **** ****** *** * * * ** * * ** * *** **** * *** HUM.JA_B CATTTCTTTT TRI.AE_A CACC------ **
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT ****** *** * ************* * **** **** ** ***** *** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGT-GACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCA ARA.TH_E --GGTTCGGGTCCACGGGCC--GGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCA * ** * ***** ** ***** * ** * * ** ****** *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ARA.TH_E AGCTGTGAGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGCTT-GGCTCAAACGGCTTCTAAAGTT ** ** *** *** * * ** ****** **** ** ** ** ** ZEA.MA_A GCAGGA-ATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG ARA.TH_E GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG * *** * **** ******* *************** *** ** ** ** * *** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAG ARA.TH_E GACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA * **** ** ** * ** ** ** *** *** * * * ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT ARA.TH_E TGAACCACCATTTT- ********* **
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_J GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_J GCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_J GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ********************** ** ** ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC LYC.ES_J GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_J AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 59.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ****** *** *********** ******* **** ** ********** * * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ARA.TH_D GTTCAAT----TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * ** * ** ** * * ** * ***** * * * ****** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTGGAG-C ARA.TH_D GCTGTGAGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGCTT--GACTCAGGCGGATTCTAAAGTC * ** *** *** *** ** ***** **** * ** ** ** ** * ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG ARA.TH_D GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTG ** ** * **** ******* *************** *** ** ** ** * *** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGC-- ARA.TH_D GATGGATCAT-AGTTCGAAGT-CTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCC * **** * * ** * ** * ** *** *** * ** * ZEA.MA_A -AAACCACCATCTTT ARA.TH_D TGGACCACCACTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 59.69%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAA----GGTGGTGGAAT ******** **** ** * ** *********** **** *** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATC-CTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT LYC.ES_O ATTGG-GCTGTCCCAGATGGCTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTAT **** * * * *** ****** ** ** **** * ***** ***** * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC LYC.ES_O CCAAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAG-----AATGGGCTACTAGATTC ***** * *** ** * ** *** * * *** ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC LYC.ES_O CTAAAGTGGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTG ********* * ** ************ *********** *** * ****** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT LYC.ES_O TGCAGTGGAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCT * ************* * * * *** * * ** *** * * ** ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT LYC.ES_O CCAATTAAACCACCACTTT- *** * ******* **
Mean pairwise ID: 59.74%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * * **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * ** RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * * RAT.RAT. TT- CAE.EL_B TTT **
Mean pairwise ID: 59.74%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACAC- ****** *** * * ************ * **** ******* *** * *** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAG--CCGGCTTGCCCATCCCAAG ARA.TH_F -TGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG ** **** ** ** ** * **** * * * ****** ***** ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTACAG-CG ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG----CTTGCAGGTTCTAGAGTCG ** *** * * * * ****** **** * ***** *** ** ** ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ARA.TH_F GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTG * ** * **** *********************** *** *** *** ** * *** ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTA-GCA ARA.TH_F GACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG * **** ** * * *** * * * * * *** *** * ZEA.MA_B AACCACCATCTTT ARA.TH_F AACCACCATTTT- ********* **
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * *** * * ** *** *** * **** ****** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** * *** * *** * * ******** ** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA-ACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * ********** ************* HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * **** HUM.JA_B TTTCTTTT LYC.ES_A CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 59.74%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** ** * **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * ** RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* RAT.RAT. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * RAT.RAT. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTC CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** * * ** RAT.RAT. TT- CAE.EL_C ACT
Mean pairwise ID: 59.74%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATAAGTGTGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_B GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ****** * * * *** ** * ***** * ** CAE.EL_B GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_B GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_B GACTGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTT ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** *** CAE.EL_B TTT ORI.CUN. TCC *
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * *** * * ** *** *** * **** ****** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG ***** * * * ** * *** * *** * * *********** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * ********** ************* HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * **** HUM.JA_B TTTCTTTT LYC.ES_K CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * *** * * ** *** *** * **** ****** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** * *** * *** * * ******** ** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * ********** ************* HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * **** HUM.JA_B TTTCTTTT LYC.ES_J CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 59.74%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GGACTT *** * * *** *** *** **** ** ******* ** ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA HUM.JA_B TAGTTCG---GCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCA * *** ** * * ** ** * ** *** * ** ** * **** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG HUM.JA_B AGCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCC-GGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCG ** * * * * * * *** ** ****** * * ** **** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.JA_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * *** * ***************************** *** ****** * * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCC--TTCCATGGCA HUM.JA_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAG *************** *** ** * *** * * * * ** ** ORY.SA_B GACCACCACCTTT HUM.JA_B GACCATTTCTTTT ***** * ***
Mean pairwise ID: 59.74%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG--GAATAT ******* *** *** ******* **** ** **** ********** * ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_O TGGGCTGTC----CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTATCC ** ** * * * *** ** ** *** * * * * **** **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_O AAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT *** * ** * * * * *** * * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_O GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG ** * * * ************************ *** * * ****** * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC-A LYC.ES_O GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA ************ *** *** ** * * ** *** * * ** * * ORY.SA_B GACCACCACCTTT LYC.ES_O AACCACCACTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 59.74%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT *** *** ****** *** *** * **** ** * ** ** * **** CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA ** **** ****** *** * *** ** * * * *** ** * ***** * ** CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT RAT.NOR. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG RAT.NOR. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC RAT.NOR. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC---CGTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** *** CAE.EL_C ACT RAT.NOR. TCT **
Mean pairwise ID: 59.74%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** *** *** * **************** * * ***** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** **** * *** *** *** ** * ***** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG *** *** * * ** **** * * ** ** * *** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** ** * ****** ** ********** HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG-CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGA-TGGGTTG--CTCCAATTAAACCA **** * ***** * **** *** * * * **** ** *** **** HUM.LU_C TTTCTTTT LYC.ES_N CCATTTTT ****
Mean pairwise ID: 59.80%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** **** ****** * * *** ****** * *************** *** LYC.ES_J GGCTTTACC-AGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA **** * ** ****** ** * ***** ***** ****** * LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG- CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** *** * ** * *** *** *** ** * * *** ** LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT * ** * ******* ********** * *** * *** **** * ********** LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC * * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** ** LYC.ES_J ACCTTT CIN.HYB. ATTT-- * *
Mean pairwise ID: 59.81%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT ******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ** * * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTG-TGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * *** * ** ***** * * ** * ** * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGG * *** * * ** **** * **** ** ** *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ************ *********** *** * ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA ******** *** ** * ** **** * * * * ** *** * * ZEA.MA_D CCACCATCTT- LYC.ES_C CTACCACATTT * **** **
Mean pairwise ID: 59.81%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGA---CT *** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * * * *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_A GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * * * *** * * * *** ***** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA HUM.LU_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAA ** * **************************** ** ****** * * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACCA HUM.LU_A GGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA ************* *** * * *** * * ** ** *** * * * ZEA.MA_G CCATCTTT--- HUM.LU_A CCATTTCTTTT **** * *
Mean pairwise ID: 59.87%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATA-- ******* *** ** * *********** ** **** ********* * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA *** * ** * ******* * ** * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAAT-GGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT *** * * * * ** * * ***** * *** ** * **** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_O GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAA-AAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG * * **** ******* *********** *** * * ** *** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAACC LYC.ES_O GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC ****** *** *** * ** * * * ** * * *** * ***** ZEA.MA_B ACCATCTTT LYC.ES_O ACCACTTT- **** **
Mean pairwise ID: 59.87%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATG-TGGTGG--AATG ******** **** * * ** ********** ******* *** * *** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_G TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATC ** ** ** * ***** ** ** **** * ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_G CAAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAG-----AATGGGCTACTAGATTCC **** * *** ** * ** *** * * *** ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_G TAAAGTGGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGT ******** * ** ************ *********** *** * ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LYC.ES_G GCAGTGGAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTC * ************* * * * *** * * ** *** * * ** ORY.SA_A CAAC-AGACCACCATCTTT LYC.ES_G CAATTAAACCACCACTTTT *** * ******* ***
Mean pairwise ID: 59.87%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATG-TGGTGG--AATG * ***** **** ** * ** *********** **** *** * *** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_N TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC ** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_N CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG **** * * *** * * *** **** * ** ** * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_N TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAA ******** * * ************ *********** **** * * **** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTCT LYC.ES_N GCGGTGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC *************** * * ** * ** * ** * * * * * ** *** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_N A-ATTAAACCACCATTTTT * * * ******** ***
Mean pairwise ID: 59.87%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG--GAATAT * ***** *** *** ******* **** ** **** ********** * ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_E TGGGCTGTC----CCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTATCC ** ** * * * *** ** ** *** * * * * **** **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_E AAGT-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT **** * ** * * * * *** * * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_E GGGGTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG ** * * * *********************** *** * * ****** * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAA-GTGCCTTCCATGGCA LYC.ES_E GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTA ************ *** *** ** * * ** *** * * ** * * * * ORY.SA_B GACCACCACCTTT- LYC.ES_E AACTACCACATTTT ** ***** ***
Mean pairwise ID: 59.87%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** ** ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_A GGGCTTTAC-CAGAAGGTTGGGCT--TGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC ** * **** * ***** ** * * ********** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA LYC.ES_A ACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATG-AAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGG *** * * ** ** * * ******** * **** ***** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG LYC.ES_A CGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCG-CTCTGTGCAGTGGAAG * ** ** ******** ************* ** * ** *** ** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTA-ATGGGTTGCTCCAATAAACA ***** ** * ** ** * *** ***** * * ** * * ** ZEA.MA_C ACCATTTTT LYC.ES_A ACCACCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 59.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ***** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** * LYC.ES_H GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** * LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** * LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * ************ ************ ** * ****** * ********* LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC ******* ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** *** LYC.ES_H ACCTTTT TRI.AE_A -------
Mean pairwise ID: 59.93%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT ***** * ****** * ****** * **** ** * ** ** * **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * ** HOM.SA_A GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG * * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* * HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** HOM.SA_A ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA ** **** ***** * * * ** * ****** * * * ***** * * ** HOM.SA_A T- CAE.BRI. TT *
Mean pairwise ID: 59.93%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGACAAGTGTGGAT ***** * ****** ******* * **** ** * ** ** * * **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTG-GGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA CAE.BRI. GGAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAA * *** ****** *** ** *** ** ** * * *** ** * ***** * ** RAT.RAT. GTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGG CAE.BRI. GCGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTG * * ** ** * ** * *** * ** ** ** ** ******* * RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG CAE.BRI. GTGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGG *** ** *** **** * **** * ****** *** * *** ** * **** * ** RAT.RAT. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT CAE.BRI. ATAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCA ** **** ***** * * * ** * ****** * * ***** * * ** RAT.RAT. T- CAE.BRI. TT *
Mean pairwise ID: 59.94%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT ******* *** *** ******* ******* ******** ** ****** * *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_F TGGGTCCAT----CTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA **** * **** * ** ** ** * * * **** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LYC.ES_F AGC-ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTG ** * ** * * * ** **** * * *** * ** ******* ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_F GGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGG * * * ************************* *** ** ****** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC-AG LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA ****** ****** *** * ** ** * ** * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_F ACCATCACTTTT **** *** ***
Mean pairwise ID: 59.94%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** * ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG *** * **************************** *** ** **** ** * **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA **** **** * ** *** * * * * * * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ARA.TH_A ACCACCATTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 59.94%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** * ZEA.MA_E AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG *** * **************************** *** ** **** ** * **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA **** **** * ** *** * * * * * * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ARA.TH_F ACCACCATTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 59.94%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A ****** *** ** * *********** ** **** *********** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG ** *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGA * * *********** *********** *** * ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA ******** * *** *** * * ** * * * * *** * ** *** * * ZEA.MA_D CCACCATCTT-- LYC.ES_E CTACCACATTTT * **** **
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.JA_B GTTCGGCCCAT--TGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGC * * ** *** * * * ** * ** ** ** ** ****** ******* ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG HUM.JA_B CGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGG * ** * *** * *** ****** **** * *** ****** * ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG *** ************ *************** ** ****** * * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCC--TCATTAAACAGAC HUM.JA_B GATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC ****** ***** *** **** * *** ** **** **** *** ZEA.MA_F CACCATCTTT HUM.JA_B CATTTCTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 60.00%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** * **** ****** ******* LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** * * * *** *** * ******** ** * * LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** ** ********** ************* LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT ** ********* * * * ** * ** * * ** * * LYC.ES_J CCTTT HUM.JA_A CTTTT * ***
Mean pairwise ID: 60.00%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAA----GATGGTGGGAC * ****** **** * * *** ********* * **** ** *** * * ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ARA.TH_F ACTGGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTC---TGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTC **** ** * ** ** * ** *** * ** ** *** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ARA.TH_F CAAGCTGTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGC-------TTGGCTTGCAGGTTC **** ** * *** * * ** ******** *** * * ** * ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC ARA.TH_F TAGAGTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTAC ** *** ** ** * **************************** *** ******* * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT ARA.TH_F AGCAGTGGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATC * * ***** **** ** * * * ** * ** ** * * **** ORY.SA_A ACA-ACAGACCACCATCTTT ARA.TH_F TCATATGAACCACCATTTT- ** * ******** **
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_I GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC--GCTCTAAGCGGTGGA * * ************ *********** **** * * * *** * ****** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_I AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAAC ********* * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * ** ZEA.MA_E CACCATCTTT LYC.ES_I CACCATTTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** ** ** ** * *** ** ***** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_A GGGCTTTACCAG---AAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * * ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_A GCACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGG * *** * ***** * * ** * ** *** * *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_A GCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ** ********************** ** * ** ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACT-TCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC LYC.ES_A GGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAG-TAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAAC ****** *** ** ** * ** ** ** * * *** * * * ** * * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_A AACCACCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA---CA ****** **** **************** ** **** * **** ***** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGG--TCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAA ** *** * ** *** * * * * ** * * * ** ****** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTGAAGTG ARA.TH_G GCTGTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT * ** **** ** * * * **** **** ** * * * * * ** ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCAGCAGTG * ** ** **** *********************** ** ** *** ** * *** ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA-- ARA.TH_G GACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT * *** ***** ** ** * * *** ** ** ** * *** * * ZEA.MA_E --GACCACCATCTTT ARA.TH_G TGAACCACCATTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * *********** ** **** **** ****** * *** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_N GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_N CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * *** * * ** * * * *** ** * * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_N GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGAA * * *********** *********** **** * * ** ** * * ******** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_N GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAAC ******* * * ** ** * * * * * * * * * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT LYC.ES_N CACCATTTTT **********
Mean pairwise ID: 60.00%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT ****** **** **************** ** **** * **** ***** *** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGT-GACACTGGCC-GGCTTGCCCATCCCA ARA.TH_G G---GATCGGCCCACGGGTC--GGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCA *** * *** * ** * ***** * ** ** * ** ****** *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ARA.TH_G AGCTGTGAGTGAACCGTATGAAC-CAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT ** ** **** ** * * * ****** * ** * * * * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGG * ** ** **** *********************** ** ** *** ** * **** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCA-- ARA.TH_G ACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCC--ACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT *** **** * * *** * ** *** ** * *** * * ZEA.MA_A --AACCACCATCTTT ARA.TH_G TGAACCACCATTTT- ********* **
Mean pairwise ID: 60.00%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG--GAACAC * ***** * *** ** ****** **** ** **** * ***** ***** * * * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTA-TGCGGCCCGCCCGTTCC ARA.TH_G TGGATCG-----GCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCC * *** ** ** * *** *** *** * ** * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAG- ARA.TH_G AAGCTGTGAGTGAACCGTATGAA--CCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGG *** ** * ** * * ******* * ** * * * *** ** ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT ARA.TH_G TTGAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGT * * *********** ******* *************** **** ****** ** * ** ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATGGC ARA.TH_G GGACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT *** *** ***** ** ** * * ** ** * ** * * * * * * ORY.SA_B AGA-CCACCACCTTT ARA.TH_G TGAACCACCATTTT- ** ****** **
Mean pairwise ID: 60.06%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG--GAATGT ******* *** ** ******* **** * ******* *** ****** * *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTG-TGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCC LYC.ES_G TGGGCTGT----ACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCT--AATTTCTGGCCTGCCCTATCC ** ** * * * ** ** ** *** * * * * **** **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT LYC.ES_G AAGC-ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT *** * ** * * * * *** * * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG LYC.ES_G GGGGTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTG ** * * * ************************ *** * * ****** * *** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC-A LYC.ES_G GAAGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTA ************ *** *** ** * * ** *** * * ** * * ORY.SA_B GACCACCACCTTT LYC.ES_G AACCACCACTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 60.06%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** ** *** * ********** ********* * ***** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** **** * *** *** *** ** * ***** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG *** *** * * ** **** * * ** ** * *** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** ** * ****** ** ********** HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG-CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGA-TGGGTTG--CTCCAATTAAACCA **** * ***** * **** *** * * * **** ** *** **** HUM.LU_C TTTCTTTT LYC.ES_I CCATTTTT ****
Mean pairwise ID: 60.06%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** * **** * ** **** ****** *** ** * * **** *** HUM.LU_B GG-TCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * * ** ** * ***** ** * ** **** ***** ******* * HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** ** ** **** ******** **** * **** * ** ** HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG ********* ****************** **** ***** *** ** * ******** HUM.LU_B ATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATA---ACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACA ** ** ***** * *** * * ** ** * * * * * * ** HUM.LU_B TTTCCTTT CIN.HYB. CCCATTT- **
Mean pairwise ID: 60.06%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ****** *** * * ************ * **** ******* *** * *** ** ARA.TH_A --GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTA--GCCGGCTTGCCCATCCCAAG * **** ** ** ** * **** * * * ****** ***** ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTT--GGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCG ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTACAG-CG ** *** * * * * ****** **** ** ***** *** ** ** ARA.TH_A GAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG * ** * **** *********************** *** *** *** ** * *** ARA.TH_A GACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTA-GCA * **** ** * * *** * * * * * *** *** * ARA.TH_A AACCACCATTTT- ZEA.MA_B AACCACCATCTTT ********* **
Mean pairwise ID: 60.07%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT * * ** * **** ** ***** ** * *** ** * * **** * **** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTT-CTGGGCTGCAGTGCG--CTATGCCGATCGGGTGTCCGCACT DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT ** **** * *** * *** * ** * * *** ** * ********* CAN.SPE. AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG *** * * *********** ** **** * * * ******* ******** CAN.SPE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ******* * ******** CAN.SPE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCG-TC DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC **** *** ** * * * ***** * * ** * **** * ** CAN.SPE. TCT DRO.MEL. TTT * *
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** * ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG *** * **************************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG ARA.TH_F ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA **** ** * * ** *** * * * * * * ZEA.MA_D ACCACCATCTT ARA.TH_F ACCACCATTTT ******** **
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGG---ACT ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * * ** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAG *** * * * ** *** * *** * ** ** ** ******* ***** ZEA.MA_B TTGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC HUM.JA_A CCGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTG-GGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGA * *** * * * ***** *** ***** * **** ** ** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG HUM.JA_A GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCAC-CTCCCGCTCTCGGCAGTGGA ** * **** ******* *************** *** * *** ** * * **** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG-ATCCTCTCTTAG-CAAA HUM.JA_A AGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGA ******** * ** *** *** *** * ** * * * * ** * ****** ** * ZEA.MA_B CCACCATCTTT HUM.JA_A CCATCTCTTTT *** * ***
Mean pairwise ID: 60.13%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGT-TGAACTTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT *** *** ** ** ** * **** * **** *** ** ****** * ***** * CIN.HYB. GAGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG TRI.AE_A GT-TGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * ** ** * ****** * * ***** ************* * CIN.HYB. AG-AGTGGGTT-CATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGCA * ***** * ** * * ***** *** **** * * ** * ** CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAG TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG **** **** ******* ********** **** *** * ** * ** ******* CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTG-TCTTAGGCTCATATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC *** * **** * ** ***** ** ** * * *** *** *** *** CIN.HYB. CCATTT TRI.AE_A C----- *
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT ******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ** * * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTG-TGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * *** * ** ***** * * ** * ** * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGG * *** * * ** **** * **** ** ** *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGA * * ************ *********** *** * ** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_C AGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA ********* *** ** * ** **** * * * * ** *** * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_C CTACCACATTT * **** ***
Mean pairwise ID: 60.13%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* *** * * ****** ***** ********** * * **** * *** * LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** * LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG *** ** ***** *** * * ** ** * *** **** * LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT * *** ******************* *** ** * **** * ************ LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTA-ACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCACC *** * ** ** ** * ** * **** * ** * * ****** LYC.ES_I ATTTTT TRI.AE_B ATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAA---CA * ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAA *** * ** *** * *** * * * ** * * ** ****** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC HUM.LU_B GCCGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA * ** *** * * * * * *** * ** * *** * * *** ***** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAA ** * ************ *************** ** ****** ** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT---AAGCAGA HUM.LU_B GGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGA ************* *** * * * *** * * * * *** *** ** * ** ZEA.MA_G CCACCATCTTT HUM.LU_B CCATTTCCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 60.13%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ****** *** * * *********** * * **** ******* ***** *** * ARA.TH_A GGTT--CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG * *** * ** ** ** ** * ** ** * * * ****** ****** ARA.TH_A CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGC ** ** * *** * * * ******** *** * * ** ** *** ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGA ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG ** * **************************** *** ******* ** * **** ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA **** ** * * ** *** ** * * * * * * * ARA.TH_A CCACCATTTT- ZEA.MA_F CCACCATCTTT ******* **
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ****** *** *********** ******* **** ** ******** * * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGAC-TCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT ARA.TH_D GTTCAAT--TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC * * ** * *** * * ** * **** * ** * * ****** ***** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTACAG-CGGC ARA.TH_D TGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTT--GACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA ** *** * ** ** ***** **** * ** ** *** ** *** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCTCTTACAGCAGTGGA ** * **** ******* *************** *** *** *** ** * **** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGC-AAA ARA.TH_D TGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA **** * * ** * * *** * * ** * * * * *** * * ZEA.MA_B CCACCATCTTT ARA.TH_D CCACCACTTT- ****** **
Mean pairwise ID: 60.13%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** * ZEA.MA_D AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGG *** * **************************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAG ARA.TH_A ACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGA **** ** * * ** *** * * * * * * ZEA.MA_D ACCACCATCTT ARA.TH_A ACCACCATTTT ******** **
Mean pairwise ID: 60.19%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA---CA ****** **** **************** ** **** * **** ***** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGG--TCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAA ** *** * ** *** * * * * ** * * * ** ****** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTGAAGTG ARA.TH_G GCTGTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT * ** **** ** * * * **** **** ** * * * * * ** ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCAGCAGTG * ** ** **** *********************** ** ****** ** * *** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA-- ARA.TH_G GACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCT * *** *** * ** ** * * *** ** ** ** * *** * * ZEA.MA_D --GACCACCATCTT ARA.TH_G TGAACCACCATTTT ******** **
Mean pairwise ID: 60.19%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** **** * * *** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA ** * *** ****** * ** * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAAT-GGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT *** * * * * ** * * ***** * *** ** * **** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAA-AAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAG * * **** ******* *********** *** * * ** *** * **** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAACC LYC.ES_G GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC ****** *** *** * ** * * * ** * * *** * ***** ZEA.MA_B ACCATCTTT LYC.ES_G ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 60.19%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_I GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_I GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAA * * ************ *********** **** * * **** * ****** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGACC LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACC ******** * ** ** ** *** *** * * * * * * * ** * *** ZEA.MA_G ACCATCTTT LYC.ES_I ACCATTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 60.26%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT ******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACA-CTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA LYC.ES_C ----GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGT-GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA ** * * ***** ** ****** * * *** ***** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTT-GGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGG * *** * * ** * ****** **** *** *** *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_C GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA * * **** ******* *********** *** * ** *** * **** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA--GAACCTCACTAAGCAA LYC.ES_C AGGATAACGA-GCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA ********** *** ** * * ** *** * * * * *** ** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT LYC.ES_C ACTACCACATTT ** **** ***
Mean pairwise ID: 60.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******* ** ***** * *** * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_M GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA ** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_M CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG ****** ** * * * * *** *** ** ** * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_M GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ****** ********* ************ * ** ********** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_M TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC * * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** * ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_M CACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 60.26%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ****** *** * * ****** ***** ********** * * **** * *** * LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATCCAAGCT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * *** ** * *** *** * *** * ***** ****** * LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCC-TTAAGTGGCAGG *** ** ***** *** * * ** ** * * ****** * LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * *** ******************* *** ** * ***** * *********** LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTA-ATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC **** * ** ** ** * ** * **** * * ** ** * ***** LYC.ES_B CACTTTT TRI.AE_B CATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 60.32%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ***** *** *** * **************** * ** ***** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG ** ***** * *** *** *** ** * * ****** ****** LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC *** *** * * * *** * * * * ***** * *** * * LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * *********** *********** *** * ** ***** * ************* LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGA-TGGGCTG--TTCTAGTTAAACT HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC ***** ******* ** *** * ** * ******* * ** * ** LYC.ES_E ACCACATTTT HUM.LU_C ATTTCTTTT- * * ***
Mean pairwise ID: 60.32%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT ******** ****** * ********* * ** * ****** * **** * * *** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT-CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT LYC.ES_C GAACAT--GCCCAGAAGGTAGGGCTTGT-GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ***** ** ***** * * *** ***** ***** ZEA.MA_B TGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA LYC.ES_C AAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTT-GGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGG *** * * * ** * ****** **** *** *** **** ** ** ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_C TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * **** ******* *********** *** * * *** ** * **** * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA--GATCCTCTCTTAGCAAAC LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC ******* **** ** * * ** **** * * * * *** **** ZEA.MA_B CACCATCTTT LYC.ES_C TACCACATTT **** ***
Mean pairwise ID: 60.32%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ARA.TH_A -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC *** * ** ** * ** * *** ** * ** ** ****** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCT-TGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA ** *** ** *** *** **** *** ** *** *** * * ZEA.MA_C GGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC ** * *********** **************** *** ** *** * * ***** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC ARA.TH_A GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC **** ** * * * ** * * ** * * * * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT ARA.TH_A CACCATTTT- *********
Mean pairwise ID: 60.32%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_B GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCG-CTCTAAGCGGTGGA * * ************ *********** **** * * *** ** * ****** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_B AGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC ********* * ** ** ** *** *** * * * * ** * **** * ** ZEA.MA_E CACCATCTTT LYC.ES_B CACCACTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 60.32%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** * *** ** **** ****** *** ** * * ******** HUM.LU_C GG-TCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCT-GCCCATTCCAAGC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTC---TGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT * * * ** *** * ** * * *** **** **** ******* HUM.LU_C CGGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG--GNGCGCACTCCTAGACTGGAG CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGG ** *** ** * **** ********* * * * ** * ** * HUM.LU_C GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG CIN.HYB. GGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAG ********** ******* ********** **** ***** ****** * ******* HUM.LU_C GATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC CIN.HYB. GATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATA-TAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC *** ** ***** * * *** ** * * * ** * **** * * ** ***** HUM.LU_C CATTTCTTTT CIN.HYB. -ACCCATTT- * ***
Mean pairwise ID: 60.32%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ** *** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * * HUM.LU_D GGTCAACCTAGT--GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT ** * * ** * ** * ** * ** ** * ** ****** ******* HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG ** ** ** * * * * ********** **** * *** ** ** * HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG *** **************************** ** ****** * * **** ** HUM.LU_D GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCC--TCATTAAACAGAC ****** ***** *** *** * * * ** * ** **** *** HUM.LU_D CATTTCTTTT ZEA.MA_F CACCATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 60.39%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT ******* **** ** * ************** ******* ** ****** * *** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT LYC.ES_F GGGT-CCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA *** ** * * ** **** * * * * * ********** ****** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTAT--AGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGAT *** * * * * ** * * ** * * * ** ***** * ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * ** *********** *********** *** * * ** *** * * ******** ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA ** ** *** * *** ** * * ** * ** * * ** * **** ZEA.MA_C CCATTTTT LYC.ES_F TCACTTTT ** ****
Mean pairwise ID: 60.39%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ******* ** ** * ********************** ** *** ** *** * * LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGG-GCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG--CTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * ** ** ** ** * **** ** ****** **** ****** LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGG--TCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGAT TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * *** * *** *** ****** * * * ** * ** **** * LYC.ES_F GGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * ** ************ *********** **** * * ****** * ******** LYC.ES_F ATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG--GCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCA ** * **** *** ** ** ** * *** ** * * * * **** LYC.ES_F TCACTTTT TRI.AE_A CC------ *
Mean pairwise ID: 60.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_J G--GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG-GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ******** ** ** * ********* ****** ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_J ACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC * *** * * *** * *** ***** **** * *** *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** ********************** ** ** ****** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA LYC.ES_J GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** * ZEA.MA_F CCATCTTT LYC.ES_J CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 60.39%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_K G--GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG-GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ******** ** ** * ********* ****** ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_K ACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC ** ** * * *** * *** ***** **** * *** ****** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** ********************** ** ** ****** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA LYC.ES_K GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** * ZEA.MA_F CCATCTTT LYC.ES_K CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** * ***** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG ***** * * *** *** * *** ** *** * * ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********************** ** * ******* ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_K CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** * *** * * **************** * * ****** ** ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ** **** ** *** ** * ** * * ******* ******* * ARA.TH_G TGAG-TGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT--CCTAGACTGGAGGG *** ** * * ** * ******* * * * * * * * ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * ***** ************************************** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA ***** ** ** * * * ** ** ** **** * * * * **** ARA.TH_G CCATTTT- HUM.LU_C TTTCTTTT ***
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ******** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** * ***** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** * * *** *** * *** *** ** * * ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********************** ** * ******* ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_J CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 60.39%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** * ***** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** * * * *** *** * *** *** ** * * ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********************** ** ** ****** ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_A CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 60.40%
DRO.MEL. GACTGGAAGGT-TGGCA-GCTTCTGTAATCACGCTTCTGTGAGGTCTGA-TTGTGGGATG XEN.LAE. -GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCAGCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC * ** * * **** * ******** *** ** **** ** *** **** DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTT-CTGGGCTGC--ACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTA ** **** * *** * *** * ** ** **** ** * ********** DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGG-CTAAGGAG XEN.LAE. AGTTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAG ** * * ********** * *** **** * * ******* ******** DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG XEN.LAE. GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ****** ******** DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC XEN.LAE. GGATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGAC-ACAGTT **** *** ** * * * * * ***** * * * * * *** *** * DRO.MEL. TTT XEN.LAE. CT- *
Mean pairwise ID: 60.40%
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTC-AGCTTCTTGAC-GGTAGATGAGTGTGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT *** *** ****** **** *** * **** ** * ** ** * * **** CAE.EL_C GGAGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAA ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGC-TGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAA * **** ****** *** * ****** * * * *** ** * ***** * ** CAE.EL_C GCGCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGT-GCATAAGGAGT ORI.CUN. GTTCGGCATCAATATGGTG-ACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGG * * ** *** * ** ** *** ** ** * ** *** ** ******* CAE.EL_C GGTGGAT-GGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCG ORI.CUN. GGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGG **** * ** **** * **** * ***** *** * *** ** * **** * * CAE.EL_C GACAGCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTC ORI.CUN. GATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACC--CTGTC ** **** ***** * * *** ****** *** * ***** **** CAE.EL_C ACT ORI.CUN. TCC *
Mean pairwise ID: 60.40%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATCAC-GCTTCTGTGAGGTCTGA--TTGTGGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT * * ** * **** * ***** ** * *** ** * * **** * * **** DRO.MEL. GGCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACT HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTT-CTGGGCTGTAGTGCG--CTATGCCGATGGGGTGTCCGCACT ** **** * *** * *** * * * * *** ** ** ********* DRO.MEL. AAGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAG HOM.SA_B AAGTTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAG *** * * *********** ** **** * * * ******* ******** DRO.MEL. GGATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTG HOM.SA_B GGGTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTG ** ******** ***** **** ***** * * ******* * ******** DRO.MEL. GGATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTATCAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC HOM.SA_B GGATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACC-CCGTC **** *** ** * * * ***** * * * ** * **** * ** DRO.MEL. TTT HOM.SA_B TCT * *
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** * ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ARA.TH_A AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA *** * **************************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAGA ARA.TH_A CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA **** **** * ** *** * * * * * * * ZEA.MA_G CCACCATCTTT ARA.TH_A CCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_G GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGA * * ************ *********** *** * ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA ******** * *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * * ZEA.MA_D CCACCATCTT- LYC.ES_G CCACCACTTTT ****** **
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * *********** * * **** ******* ***** *** * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG ARA.TH_F GGTT--CGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAG * *** * ** ** ** ** * ** ** * * * ****** ****** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGC ARA.TH_F CTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGA ** ** * *** * * * ******** *** ** * ** ** *** ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTT-CCCGCTTACAGCAGTGGA ** * **************************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA **** ** * * ** *** ** * * * * * * * ZEA.MA_F CCACCATCTTT ARA.TH_F CCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 60.45%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_F G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** *** * * ** ** * * * * ****** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ARA.TH_F GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG--CTTGCAGGTTCTAGAGTCGG * ** *** * * * * ** **** * **** * ** * * ** *** * ZEA.MA_G AGGA-ATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ARA.TH_F AGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGA *** * **************************** *** ******* ** * **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACT--AAGCAGA ARA.TH_F CGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAA **** **** * ** *** * * * * * * * ZEA.MA_G CCACCATCTTT ARA.TH_F CCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 60.46%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG *** **** **** * * * **** *** ** *** ** ** ***** *** *** LYC.ES_G GGCTGTACC-AGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA *** * ** * ****** ** * ***** ***** ****** * LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG- CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** ****** * * *** * *** * ** ** * * *** ** LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT * **** ****************** ****** ** ** * * ********** LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC ** **** * * * * ** *** ** * **** **** ** ** LYC.ES_G ACTTTT CIN.HYB. ATTT-- * **
Mean pairwise ID: 60.46%
HUM.LU_C --GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACTTTG TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT * *** * * * *** ***** ********** ** ** * * * HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG *** ** * * ** * *** * *** * * ****** ******* * HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCA TRI.AE_B GTAG-TGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGCA * ** ******* * * * ******* *** * ** *** * *** **** HUM.LU_C ATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATA TRI.AE_B CCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATA *** ******* **************** ** * ***** * * *********** HUM.LU_C ACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATT TRI.AE_B ACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCACC ** ***** *** * ** *** * *** * * * * * ** ** **** HUM.LU_C TCTTTT TRI.AE_B ATCTTT ***
Mean pairwise ID: 60.51%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT---GTGGGAAATGGAACT * * * * * * * * *** **** ** ******* * ** **** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA HUM.LU_C TTGG--GTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCA *** ** * * ** * * ** *** * ** * * * **** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG HUM.LU_C AGCCGGGAGGTGGGC-TGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG-GNGCGCACTCCTAGACTG ** * * * * * ** ** ************** * * * * ****** ** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.LU_C GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * *** * ************* *************** **** ****** * * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCC--CGCT-TCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC HUM.LU_C AAGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATA- *************** *** * *** * ** * * * ** ** * ORY.SA_B AGACCACCACCTTT HUM.LU_C GGACCATTTCTTTT ***** * ***
Mean pairwise ID: 60.51%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAA---CA ****** **** **************** ** **** * **** ***** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_G CTGGATCGGCCCACGGG--TCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAA ** *** * ** *** * * * * ** * * * ** ****** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAG--ACCTGAAGTG ARA.TH_G GCTGTGAGTGA--ACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTT * ** **** ** * * * **** **** ** * * * * * ** ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_G GAGGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGG * ** ** **** *********************** ** ****** ** * **** ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCA--- ARA.TH_G ACGGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTT *** ***** ** ** * * *** ** ** ** * *** * * ZEA.MA_G -GACCACCATCTTT ARA.TH_G GAACCACCATTTT- ******** **
Mean pairwise ID: 60.52%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ***** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG- LYC.ES_H G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC * * * * ******** ** ** * * * * * ***** ****** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_H TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC ** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ************ ************ ** ** ****** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA LYC.ES_H GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** * ZEA.MA_F CCATCTTT- LYC.ES_H CCACCTTTT *** ****
Mean pairwise ID: 60.52%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_B GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * * * ***** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_B GCTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * * *** * * *** * * * * * ** * * * ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA * * ************ *********** **** * * ***** * ****** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAGACC LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACC ******** * ** ** ** *** *** * * * * ** * **** * *** ZEA.MA_G ACCATCTTT LYC.ES_B ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 60.58%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A ****** *** ** * *********** ** **** *********** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG ** *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCG-CTTTGTGCAGTGGA * * *********** *********** *** * *** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_E AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAA ********** *** *** * * ** * * * * *** * ** *** * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT- LYC.ES_E CTACCACATTTT * **** ***
Mean pairwise ID: 60.59%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT *********** *** * ********* * **** ****** * *** ** *** * * LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC * ** * * ** ** ** *** ****** **** ****** LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCC--AAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * *** * **** * * ***** *** *** * ** * *** **** * LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** ************ *********** *** * ****** * ********* LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC *** * *** ** * ** *** * ** * ** ** ** * ** ** LYC.ES_C CACATTT TRI.AE_A C------ *
Mean pairwise ID: 60.62%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT----GTGGGAAATGGAAC * ** ** * * * ************* ******* * ** *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC HUM.LU_C TTTGG-GTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCA--GTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTC ***** ** * * * ** *** ** * *** * * ***** *** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC HUM.LU_C CAAGCCGGGAGGTGGGCTG-AGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACT------CC **** * * ****** * **** * * ********* * ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA HUM.LU_C TAGACTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCG ** * *** **** **************************** ** ****** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCC--CGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC HUM.LU_C GCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTC * ************* *** * *** ***** *** * ** * * * * *** ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT HUM.LU_C TTAATAGGACCATTTCTTTT * * ***** ***
Mean pairwise ID: 60.63%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** * * ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ARA.TH_A G---GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAA * * * ** ** ** * * ** * * ** * * * ****** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGAC-CTGGAG-C ARA.TH_A GCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTT--GGCTCATGCAGGTTCTAGAGTC * ** *** * *** * * ****** **** ** ***** ** *** * ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG ARA.TH_A GGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTG ** ** * **** *********************** *** ** ** ** * *** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT---AAG ARA.TH_A GACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA * **** *** ** * ** ** ** *** *** * * * ZEA.MA_A CAAACCACCATCTTT ARA.TH_A TGAACCACCATTTT- ********* **
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT ******* **** ** * ********** ** ******* ** ****** * ***** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_F G---GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG * ** ** * ******** * * * * ********* ****** ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LYC.ES_F CACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGA * *** * * ** **** * * * ** *** * ** ** * ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_F TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** * ** ****** * **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCC-AACTCGGTCCAGA--GCCTCATTAAACAGAC LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC **** ** *** *** * ** ** *** ** ** * * *** * ** ZEA.MA_F CACCATCTTT LYC.ES_F CATCACTTTT ** ** ***
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT ******** ****** * ********* * ** * ****** * ****** ** * * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_C TGAACATGCCCAGAAGG--TAGGGCTTG-TGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * *** * ** ***** * * ** * ** * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_C GCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGG * *** * * ** **** * **** ** ** *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_C GTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC ******** *** ** * ** **** * * * * ** *** * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_C TACCACATTT **** ***
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * *********** * *********** ****** * *** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_B GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_B CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * *** * * ** * * * *** ** * * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_B GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAA * * *********** *********** **** * * * *** * * ******** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_B GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAAC ******* * * ** ** * * * ** **** * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT LYC.ES_B CACCACTTTT ***** ****
Mean pairwise ID: 60.65%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ******* *** ** * *********** ** **** *********** * ** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_O GGG--CTGTCCCAGATGGCTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** ***** * ***** ** ** ********** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG *** * * * * * * ****** * **** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA * ** *********** *********** *** * * *** * * ****** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_O GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC ******* * ** *** * ** **** **** * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT LYC.ES_O CACCACTTT- ***** ***
Mean pairwise ID: 60.66%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** **** **** * * * **** *** ** *** ** ** ***** *** *** LYC.ES_B GGCTGTACC-AGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA *** * ** * ****** ** * *** ******* ****** * LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG- CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * *** ** LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT ******* ****************** *** ** * **** * ********** LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCA ** ** *** ** * * ** ** ** * **** * ** ** *** LYC.ES_B CTTTT CIN.HYB. TTT-- **
Mean pairwise ID: 60.70%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GGACTT **** * * * *** *** *** **** ** ******* ** ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGT---GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA **** * ** ** * ** *** * ** ** * **** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG HUM.LU_A AGCCGGGAGTTGGGC-TGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTG ** * * * * ** * ************ * * * * ********* ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.LU_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * *** * ************* *************** **** ****** * * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGC--TTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA HUM.LU_A AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAG *************** *** ** ** ** * * * * * * ** ORY.SA_B GACCACCACCTTT HUM.LU_A GACCATTTCTTTT ***** * ***
Mean pairwise ID: 60.71%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** ** *** * ********* ****** *** * *** ** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * ** *** * ** ** ** * ******** ******* * ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCAC-TCCTAGA-CTGGAGGG *** ** ** ********* *** * ***** ****** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA *********************************** ******* * ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA * **** * * ** * ** ** * **** * ** *** * * **** ARA.TH_A CCATTTT- HUM.LU_C TTTCTTTT ***
Mean pairwise ID: 60.71%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * * ***** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG **** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_K CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 60.71%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ******* * *********** ******* * * ** ******** ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGG-GCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** * ** ** *** * * * * ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAG-TGGGATG **** * * ** * * **** ** * ** ** ** ** * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ***** ******* *********** ****** ******** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCC-TAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCA **** ** * *** * *** ** ** ** ***** ARA.TH_G CCATTTT- LYC.ES_F TCACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 60.71%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** ** *** * * *** **** ******* ** ** ****** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG * **** * ** *** * **** * * * ******** ******* * ARA.TH_D TGAG-TAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG--GNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG *** * *** * * ********** *** * ** * ****** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA *************** ******************* **** ** * ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCT-GGACCA HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA * * * ** * ** * ** ** * **** ** * * ****** ARA.TH_D CCACTTT- HUM.LU_C TTTCTTTT ****
Mean pairwise ID: 60.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * *********** ** **** **** **** * * *** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_N GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** * ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC *** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT--TTCGCTCTAAGCGGTGGAAG * * **** ******* *********** **** * * * ** * ****** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA ****** ** ** ** ** **** *** * * * * * *** * ****** ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_N CCATTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 60.71%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT ****** *** ** * ******** * *** ** * *** ** ***** ** ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_A G--GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG-GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC * * * ******** ** ** * ********* ****** ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_A ACAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC * *** * * *** * *** ***** **** * *** *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTC--CCGCTCTGTGCAGTGGAAG * * ** ********************** ** * *** ***** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTG-CAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA LYC.ES_A GATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAA ***** ** ** ** ** **** ** * * * * * * ** * ** * ZEA.MA_F CCATCTTT LYC.ES_A CCACCTTT *** ****
Mean pairwise ID: 60.76%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG--GAACAC * ***** * *** * * ****** **** * **** ** * ** ***** * * * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC ARA.TH_E ----TGGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCC * *** * * ** * * **** *** *** * * ** * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCG--TAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGA ARA.TH_E AAGCTGTGAGTAAGACGTGTGTG----TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAA *** ** * ** ***** * ********* * * ** *** * ORY.SA_B GT-GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG ARA.TH_E GTTGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCA ** ** ***** ***************************** *** ******* ** * ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATG ARA.TH_E GTGGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCAT ***** **** ** * * ** * * ** ** * * * ** * ** ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT ARA.TH_E ATGAACCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 60.77%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A ****** *** ** * *********** ** **** *********** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_E TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_E GTACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG ** *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_E GTGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA * * *********** *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_E GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC ********* *** *** * * ** * * * * *** * ** *** * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT- LYC.ES_E TACCACATTTT **** ***
Mean pairwise ID: 60.77%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ****** **** *************** *** **** * **** ***** * * * ARA.TH_G G---GATCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGG-CCGGCCTGCCCGTTCCAAG ** * * ** ** **** ** ** ** * ** ****** ****** ARA.TH_G CTGTGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAG ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAG-CGGCA ** *** ** * * ******* ** ** ** *** * ARA.TH_G GGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCAGCAGTGGAC ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA ** ** **** *********************** ** ****** ** * **** ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACA----GA *** *** * ** ** *** *** ***** * *** * * * * ARA.TH_G CCACCATTTT- ZEA.MA_F CCACCATCTTT ******* **
Mean pairwise ID: 60.77%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * *********** ** **** **** ****** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_N GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * * * ****** * ** * * * * * ******* ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_N CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG * *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_N GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGA * * **** ******* *********** **** * * ** *** * ****** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGCAAA LYC.ES_N AGGATAACGA-GTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA ********** * ** ** ** **** * * * ** * * * * ** *** ZEA.MA_A CCACCATCTTT LYC.ES_N CCACCATTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 60.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATG-TGGTGG--AATG ******** **** * * ** ********** ******* *** * *** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_I TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC ** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_I CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG **** * * *** * * *** **** * ** ** * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_I TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAA ******** * * ************ *********** **** * * **** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTCT LYC.ES_I GCGGTGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC *************** * * ** * ** * ** * * * * * ** *** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_I A-ATTAAACCACCATTTTT * * * ******** ***
Mean pairwise ID: 60.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATG-TGGTGG--AATG ******** *** ** * ** ******** ** ******* ** * *** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_F TTGGGTCC--ATCTTGATGGATGGGCT--TGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTC ** *** ** **** ** * ** * **** ** ***** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_F CAAGC-ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATA------GCCACTTGGCCTT **** * *** ** ** ** * **** * * ** ** * * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_F TAGAGTGGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGT ** ***** * * ** ************ *********** *** * * ****** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA LYC.ES_F GCAGTGGAAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCC * ********** ** **** *** * *** * ** ** ** * ORY.SA_A CAAC-AGACCACCATCTTT LYC.ES_F TAATTAAACCATCACTTTT ** * **** ** ***
Mean pairwise ID: 60.82%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATG-TGGTGG--AATG * ****** **** * * ** ********** ******* *** * *** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC LYC.ES_B TTGGGC-TGTACCAGATGGTTGGGCT---TGGTGGGCTAATTT--CTGACTTGCCCTATC ** ** ** * ***** ** ** **** * *** ******* ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC LYC.ES_B CAAGCTTAGAGTTGGATCAT-GTGGCCCAATTGAAGA-----AATGGACTACTTGATTCG **** * * *** * * *** **** * ** ** * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA LYC.ES_B TAAAGTGGGGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAA ******** * * ************ *********** **** * * ***** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCA-GAGTCCCTCT LYC.ES_B GCGGTGGAAGGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCT *************** * * ** * ** * ** * ** * * * * **** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT LYC.ES_B A-ATTAAACCACCACTTTT * * * ******* ***
Mean pairwise ID: 60.84%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** ***** *** * **** ** *** ** ** ** **** * ** ** ARA.TH_F -GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCAT-GTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTC---TGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT * * ** * * * ** ** *** * ** * *** ***** ****** ARA.TH_F TGTGAGTAA-TTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCT--TGCAGGTTCTAGAGTCGGA CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTC-CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG * **** ** **** ************ ** * ** * * **** **** ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA *** ******* ******* ********** **** ** ** ** * * ***** ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA-GGAC **** ** * ** ** ** ** *** ** ** * * * * * * ** ARA.TH_F CACCATTTT CIN.HYB. ACCCATTT- ******
Mean pairwise ID: 60.90%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT * ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * * * * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACT-CTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT HUM.LU_B GGGTCA-GCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC * * * *** * ** * ** * ** ** * ** ******* ***** ZEA.MA_B TGGTAGT--GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGA-GTGACCTGGGCGAAGGCCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGA ** *** * **** * * * ***** ** * **** * **** ** ** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG HUM.LU_B GGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTAC-CTCCCGCTCCCGGCAGTGGA ** * **** ******* *************** ** * *** ** ** * **** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT--CTCTTAG-CAA HUM.LU_B AGGATAACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGG ******** **** *** *** * *** ** * * * **** ****** * ZEA.MA_B ACCACCATCTTT HUM.LU_B ACCATTTCCTTT **** ****
Mean pairwise ID: 60.91%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** * ***** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG **** * * * *** *** *** * *** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** ** ****** ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** ** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_A CACCTTT ** **
Mean pairwise ID: 60.91%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* *** *** * ****** ** ** *** ****** * **** * *** * LYC.ES_C GAACATGCCCAGAAGGTA-GGGCTTGTGTGACAATTCT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT * * ** ********* ** * *********** ****** LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG *** *** **** ***** **** * ** ** * * *** **** * LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGA-CAACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** *** ******************* *** * ** ***** * ********* LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC **** *** ** ** * * * ** * * * *** * ** ** LYC.ES_C CACATTT TRI.AE_B CATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 60.91%
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ******** ** *** * ****** **** * ******* * *** ********* TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTT-GTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACT--GTGGACCACCCATTCCAAGT ** *** * ******* * *** * ** ** *** * *** ******** TRI.AE_B TG-GTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ZEA.MA_H TGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCAT-CCCAACACTAAAGTGGCGG ** ******** * ** ** *********** ** * * ** ** ******* * TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGG ZEA.MA_H ACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGG ** *** ******* **** ********** ** *** ** *** ********** TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC ZEA.MA_H ATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------- **** * **** ** ***** * TRI.AE_B CATCTTT ZEA.MA_H -------
Mean pairwise ID: 60.91%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ***** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** * LYC.ES_K GG-GCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCT-ACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * *** ** **** *** * * ****** **** ****** LYC.ES_K AGAGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGC TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * *** * * * *** * **** **** ** * * * *** * ** LYC.ES_K GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * ** ** ********************** ** * ****** * ******** LYC.ES_K ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC ******** ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** ** LYC.ES_K CACCTTT TRI.AE_A C------ *
Mean pairwise ID: 60.91%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** * * ************ ****** ****** ** ** * ** ** ARA.TH_F GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGC-TACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * *** * * **** *** ** * * *** * **** ****** * ARA.TH_F GTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * * *** * * * * * * ***** *** ** * *** * * ** * ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * * ***************************** *** ******* ** * ***** ** ARA.TH_F ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA--CTCCAGCAGACCA ** * ** * * *** * ***** * * *** **** ARA.TH_F CCATTTT TRI.AE_A CC----- **
Mean pairwise ID: 60.91%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG *** * * ***** **** * * **** ** ************* ******** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTAT--AGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* *** **** ** ****** * **** ** ****** *** LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ******************************* ** ********************** LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCAT LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC ***** ******* ****** ** ****** ** *** * ** ******* LYC.ES_F CACTTTT LYC.ES_L CACTTT- ******
Mean pairwise ID: 60.91%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ******** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** * ***** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG **** * * *** *** *** * *** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ******* ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** ** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_J CACCTTT ** **
Mean pairwise ID: 60.94%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAA----GGTGGTGGAAC * ****** **** ******* *** **** ** **** ** *** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ARA.TH_D AGTGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATA---TATCTGAGCTGCCCAGTC **** * ** ** ** *** ** ** * *** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ARA.TH_D CAAGCTGTG-AGTAATCTGTGTGGG-TCAGGCGAAGGC-TTGACTCAGG----CGGATTC **** ** * *** * * *** * ********* ** ** * * * * ORY.SA_A TAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC ARA.TH_D TAAAGTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTAC ****** ** ** * ************ *************** *** *** *** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCC-CAGAGTCCCTC ARA.TH_D AGCAGTGGATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATC * * ***** **** * ** * * ** * ** ** * ** * * ** ** ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ARA.TH_D TCTCCTGGACCACCACTTT- * ******** **
Mean pairwise ID: 60.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * *** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_I GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** **** * ***** ** ** ** * ***** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_I CTTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTG-AAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGG * *** * * ** * * * *** ** * * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_I GCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGAA * * *********** *********** **** * * ** ** * * ******** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_I GGATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAAC ******* * * ** ** * * * * * * * * * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT LYC.ES_I CACCATTTTT **********
Mean pairwise ID: 60.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * *** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTT-TGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_G GGG--CTGTACCAGATGGTTGGGCT--TGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG ** * ** * ** **** * ***** ** ** ********** ****** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC LYC.ES_G CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG *** * * * * * * ****** * **** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA * ** *********** *********** *** * * *** * * ****** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC ******* * ** *** * ** **** **** * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT LYC.ES_G CACCACTTTT ***** ****
Mean pairwise ID: 60.97%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T ****************** ********************** ****** ***** *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG ZEA.MA_H CAATTGTGG--TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAG *** * * * ****** ** *** ** ***** ***** ZEA.MA_A TTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_H TTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA---CTAAAGTGG *** ****** * ** ** * ************ ** * ** ** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA * * ** **** ************ ********** ** *** * *** ****** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAAC ZEA.MA_H AGGATAATGA-GTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------- ******* ** * **** ** * *** ** ZEA.MA_A CACCATCTTT ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 60.98%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG *** **** ****** * * **** ****** ** * * ** ***** *** *** LYC.ES_O GGCT-GTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA *** * * ** * * **** ** * ***** ***** ****** * LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG- CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** ****** * * *** * *** * ** ** * * *** ** LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT * **** ****************** ****** ** ** * * ********** LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC ** **** * * * * ** *** ** * **** **** ** ** LYC.ES_O ACTTT CIN.HYB. ATTT- * **
Mean pairwise ID: 60.98%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * **** ****** * * **** ****** ** * * ** ***** *** *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA LYC.ES_N GGCT-GTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA *** * ** * ****** ** * *** ******* ****** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCGG **** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * **** * CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGC-TCTAAGCGGTGGAAGGAT ******* ****************** *** ** * * *** * ********** CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCA LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA ** ** *** ** * * ** ** ** * ** * **** ** *** CIN.HYB. TTT-- LYC.ES_N TTTTT ***
Mean pairwise ID: 61.04%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAG-- TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* ** ** ******** **** ****** ** * *** **** * ARA.TH_D TGGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG-TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT **** * ** * ** ** * ** ** ** * * *** ****** ****** ARA.TH_D TGTGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGG TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAG--TGGCAG ** *** *** **** * ****** **** * * * *** ** * ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGAAGG * * *** ************************ *** ** *** ** * ***** ** ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG-CCATAGCAGACCA ** * ** ** * * * ** ** *** ** * * * * ***** ARA.TH_D CCACTTT- TRI.AE_B CCATCTTT *** **
Mean pairwise ID: 61.04%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ****** *** ** * ****** ***** ****** ** *** **** * ** * LYC.ES_E GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATCCAAGTA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * **** ** * *** *** * *********** ******* LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG *** ** **** ***** * * ** ** * *** **** * LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA *** *** ******************* *** ** ** ****** * ********* LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC **** * *** *** * * * **** * * * *** * ** ** LYC.ES_E CACATTTT TRI.AE_B CATCTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 61.04%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT ***** *** ** * ********** *** **** **** ****** * ***** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG- LYC.ES_N G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC * * * * ******** ** ** * * * * * ***** ****** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_N TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC ** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGAAG * * ************ *********** **** * * **** * ****** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACCA LYC.ES_N GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA ****** * ** ** * ** *** * * * * * ** * **** ZEA.MA_F CCATCTTT LYC.ES_N CCATTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 61.06%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT----GTGGGAAATGGGAC ** ** * ** * ************** ******* * ** ** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT HUM.JA_B TTTAGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTG----CTTGCTGGGCTGCCCATT *** ** ** * ** ** **** * ** ******** ***** ** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC HUM.JA_B CCAAGCCGAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCG-GACGAAGGTCTG-GCTTGG----TCAGCTC ***** * * ** ** * * ** * ****** ** **** * ** * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC HUM.JA_B CTAAAGCGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTC ****** ** **** ************ *************** ** ****** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCC-CAGAGTCCCTC HUM.JA_B GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACT * ************* *** * *** ***** *** * * * * *** ORY.SA_A TACAACAG-ACCACCATCTTT HUM.JA_B CTTAATAGGACCATTTCTTTT ** ** **** ***
Mean pairwise ID: 61.09%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_G GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCG-CTTTGTGCAGTGGA * * ************ *********** *** * *** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_G AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA ********** *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_G CCACCACTTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 61.11%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** ********* **************** * * ***** *** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** **** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************************** *** ** * ***** ** ********** HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC **** * ***** * ** * * * *** * *** **** HUM.LU_B TCCTTT LYC.ES_N ATTTTT ***
Mean pairwise ID: 61.11%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* ** ** * ****** **** ********* * * **** * *** * LYC.ES_F GGGTCCATCTTGATGGA-TGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT *** * *** *** ******** * * * *********** ****** LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC *** *** **** ****** * *** * * ***** * * LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAC-AACTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ** *** ******************* **** * ***** * ********** LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATC TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGG-CCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCACC ** *** *** ** * ** * *** ** *** * * **** * LYC.ES_F ACTTTT TRI.AE_B ATCTTT * ***
Mean pairwise ID: 61.11%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * * *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** ** *** ***** ******* LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** * **** ** * ** ***** ** * * LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT **************************** ** ** ********** ************* LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCT ** ********* * * * ** * ** * * ** * * LYC.ES_H CCTTTT HUM.JA_A CTTTT- * ***
Mean pairwise ID: 61.13%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCA-GCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC ****** ****** * ****** * ** *** ** * ** ** * **** CAE.BRI. GAGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAG FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTG-GGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG * *** ****** *** ** * * * * * * *** ** * ****** * *** CAE.BRI. CGCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG * * *** * ** **** * *** * ** ** ** *** ******* ** CAE.BRI. TGCAC-GGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA *** * *** **** * **** * ****** ****** *** ** * **** * *** CAE.BRI. TAGCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCAT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT--CAGTCTT * **** **** * * **** ** *** * * ** *** *** * CAE.BRI. T FUG.RUB. T *
Mean pairwise ID: 61.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****************** ********************** ****** ********* ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGC-TACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTT * *** * ********* * * * * *** * *** ********* ZEA.MA_C G-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTT--GCATCCCAACAC-TAAAGTGGCG * ******* * *** ** * **** * ** * ** *** ** ** ****** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAG * * *********** ***** ********** ** *** ** * * ********* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC ZEA.MA_H GATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------ ***** * * ** ** *** * * ZEA.MA_C ACCATTTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 61.17%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** * * ** * ** ******* *** ******** ** * ** * * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.JA_A GGTCAGCCCAT--TGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC * ** *** * ** * ** * ** ** ** ** ****** ******* ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGG * ** ** *** * ********** *** * * *** *** ** * ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG *** ************ *************** *** ****** * * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGACC HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC ****** ** ** *** * * *** * **** ** **** ****** ZEA.MA_F ACCATCTTT HUM.JA_A ATCTCTTTT * * ***
Mean pairwise ID: 61.17%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ** *** ***** *** * **** ** *** ** ** ** **** * ** ** ARA.TH_A -GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCAT-GTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTC---TGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGT * * ** * * * ** ** *** * ** * *** ***** ****** ARA.TH_A TGTGAGTAA-TTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA CIN.HYB. CGAGAGTGGGTTCATGTTTC-CTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGG * **** ** **** ************ ** * *** * * **** **** ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC CIN.HYB. GGGCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAA *** ******* ******* ********** **** ** ** ** * * ***** ARA.TH_A GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC CIN.HYB. GGATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACA-GGAC **** ** * ** ** ** ** *** ** ** * * * * * * ** ARA.TH_A CACCATTTT CIN.HYB. ACCCATTT- ******
Mean pairwise ID: 61.17%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** ********* ***** ******** * *** * * *** **** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG **** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * ********* ************* HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACA ** *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * ** HUM.LU_B ATTTCCTTT LYC.ES_K ACCACCTTT * *****
Mean pairwise ID: 61.17%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ***** *** *** * **************** * ** ***** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC ** ***** * *** *** *** ** * * ****** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG *** *** * * * *** * * * * ***** * *** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGA-TGGGCTG--CTCCAATTAAACC ***** ******* ** *** * ** * ******* *** *** HUM.LU_C ATTTCTTTT LYC.ES_O ACCACTTT- * ****
Mean pairwise ID: 61.17%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** * * ************ ****** ****** ** ** * ** ** ARA.TH_A GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGC-TACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * *** * * **** *** ** * * *** * **** ****** * ARA.TH_A GTG-AGTAATTAGTGTTGAGTTGA-GCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGA TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGC * * *** * * * * * * ***** *** ** ** * * ** ** ** ARA.TH_A GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA ** * ***************************** *** ******* ** * ***** ARA.TH_A GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA--CTCCAGCAGAC **** * ** * * *** * ***** * * *** ** ARA.TH_A CACCATTTT TRI.AE_A CACC----- ****
Mean pairwise ID: 61.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT * ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.LU_B GGGT-CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC *** * * * * **** ** ** ** ** *** ****** ******* ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG ** *** * * * * ****** ***** **** * * * **** ***** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG ** * *********** *************** ** ** *** * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC ****** **** *** * *** * * * ** * * * * ** ** * **** ZEA.MA_C ACCATTTTT HUM.LU_B ATTTCCTTT * ***
Mean pairwise ID: 61.22%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG--GAATGT ******* ******* ******* ** * ** * ***** * ****** * *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA LYC.ES_C -TGAACATGCCCA---GAAGGTAGGGCTTGTG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCA ** * * * * * * ** **** * * * * **** **** **** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG LYC.ES_C AGCAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCC-AAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTG ** * * ** * * * *** ********* * ** * ** **** **** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_C GGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGG * * * * ************************* *** ** * ****** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAA-GTGCCTTCCATGGCAG LYC.ES_C AAGGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAA ********** *** ** * * * * * * ** * * * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT LYC.ES_C ACTACCACATTT ** ***** ***
Mean pairwise ID: 61.24%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** *** ********* **************** * * *** * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** * * ** *** *** ** *** ***** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************************** *** ** * ****** ** ********** HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTG--CTCCAATTAAACCAC **** * ***** * ** *** * * ** * ** *** **** HUM.JA_B TTCTTTT LYC.ES_N CATTTTT ****
Mean pairwise ID: 61.24%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* *** * * ****** ***** ********** * * **** * *** * LYC.ES_G GGGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * *** ** * *** *** * *********** ****** LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG *** ** **** ***** * * ** ** * *** **** * LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA *** *** ******************* *** ** ** ****** * ********* LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC **** * *** *** * * * **** * * ** * * ***** LYC.ES_G CACTTTT TRI.AE_B CATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 61.24%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* ** * ******* ************ **** ** **** *** ** ARA.TH_F -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG-TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT *** ***** * ** ** ** ** * * ** *** ****** ****** ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGT-GGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGG ** *** * ** * * * ***** **** ** * * * * ** ** ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGGA * *** ******* **************** *** ** **** ** * ***** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATA-GCAGACCAC * ** * * ** * ** ** *** * * ** * * ***** ARA.TH_F CATTTT- TRI.AE_B CATCTTT *** **
Mean pairwise ID: 61.24%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * * * ** ** ****** * ***** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGG-CTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG ***** * * *** *** *** * *** * *** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ******* ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAAC * ** * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** ** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_K CACCTTT ** **
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--T *** ** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.LU_A TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC *** * * * * **** ** ** ** ** *** ****** ******* ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGC-TGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG ** *** * * * * ****** *** * **** * * * **** ***** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ** * *********** **************** ** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCT-TAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC ****** **** *** * **** * * * * * * ** ** *** ZEA.MA_C CACCATTTTT HUM.LU_A CATTTCTTTT ** ****
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** * ** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_G GGGCTGTA-CCAGATGG--TTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA ** * * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_G GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_G GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_G GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC ********* *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_G CACCACTTTT ***** ***
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A ******* *** ** * *********** ** **** *********** * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGA * * ************ *********** *** * ****** * **** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA ******** * *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * * ZEA.MA_D CCACCATCTT LYC.ES_O CCACCACTTT ****** **
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATG-- ******* **** ** * ************** ******* ** **** * * *** ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCC-GGCTTGCCCATCCCAAGT LYC.ES_F TTGGGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGC *** * * * * ****** * * * * * *** ***** ***** ZEA.MA_B TGGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA LYC.ES_F ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCC--TTTAGAGTGGGA *** * * * * ** ****** * * ** ** ** ** ** * ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_F TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * **** ******* *********** *** * ** *** ** * **** * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCC-AACACAGACCCAG-ATCCTCTCTTAGCAAAC LYC.ES_F GGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAAC **** ** ** *** ******* ** **** * *** * * ** * **** ZEA.MA_B CACCATCTTT LYC.ES_F CATCACTTTT ** ** ***
Mean pairwise ID: 61.29%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--T ** *** * * ** * ** ******** ** ******** ** ** * * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC *** * * * * **** ** ** ** ** *** ****** ******* ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA HUM.LU_D CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC--TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG ** *** * * * * ****** **** **** * * * **** ***** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG HUM.LU_D GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ** * *********** **************** ** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCT-TAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC HUM.LU_D GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC ****** **** *** * *** * * * * * * * ** ** *** ZEA.MA_C CACCATTTTT HUM.LU_D CATTTCTTTT ** ****
Mean pairwise ID: 61.31%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG *** **** **** * * * **** *** ** *** ** ** ***** *** *** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA LYC.ES_I GGCT-GTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA *** * ** * ****** ** * *** ******* ****** * CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCGG **** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * **** * CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGC-TCTAAGCGGTGGAAGGAT ******* ****************** *** ** * * *** * ********** CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCCA LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCA ** ** *** ** * * ** ** ** * ** * **** ** *** CIN.HYB. TTT-- LYC.ES_I TTTTT ***
Mean pairwise ID: 61.34%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GGACTT * ** ** * * *** *** *** **** ** ******* ** ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA HUM.LU_D TGGGTCAACCTAGT---GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA **** * ** ** * ** *** * ** ** * **** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG HUM.LU_D AGCCGGGAGTTGGGC-TGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTG ** * * * * ** * ************** * * * * ** ********* ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.LU_D GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * *** * ************* *************** **** ****** * * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGC--TTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA HUM.LU_D AAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAG *************** *** ** * ** * * * * * ** ORY.SA_B GACCACCACCTTT HUM.LU_D GACCATTTCTTTT ***** * ***
Mean pairwise ID: 61.36%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ** ***** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********* ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_A CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 61.36%
HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** ** *** * ********** ********* * ***** *** HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** **** * *** *** *** ** * ***** ******* HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGC-ACTCCTAGACTGGAGGGC LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG *** *** * * ** **** * * ** ** * *** * * HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** * * ******* ** ********** HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG-CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGA-TGGGCTG--CTCTAATTAAACCA **** * ***** * **** *** * ** * ******* **** **** HUM.LU_C TTTCTTTT LYC.ES_B CCACTTTT *****
Mean pairwise ID: 61.36%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** *** ********* ***** ******** * *** * * * * ** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG * * *** * * ** *** *** ** *** ***** ******* LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC ******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * * LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT **************************** ** * ********** ************* LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA HUM.JA_B AACGGGCCGGTG-CTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA ** *** ***** ** * ** * * * ** * ** * * * **** LYC.ES_H CCTTTT-- HUM.JA_B TTTCTTTT * **
Mean pairwise ID: 61.36%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** ** *** ** * ********* ****** *** * * ****** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * ** *** * ** * ** ** * ********* ******* * ARA.TH_E TGAG-TAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNG--GNGCGCACTCCTAGACTGGAGGG *** * * * * * ********* ** ** * ******* ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA *************** ******************* ******* * ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA * ** * * * ** * ** ** * **** * ** *** * * **** ARA.TH_E CCATTTT- HUM.LU_C TTTCTTTT ***
Mean pairwise ID: 61.40%
LYC.ES_D TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATA TRI.AE_C ----GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGAGTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGT- *** ****** ****** ** *** * * * **** * **** * LYC.ES_D TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA TRI.AE_C TGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGCACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGA ***** ** * * * *** * ** * ***** ********************** ** LYC.ES_D ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC TRI.AE_C CAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCGCTTGG * ****** * ************ *** ** ** * * ** * * LYC.ES_D GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT TRI.AE_C GCCTCGTAGCCTACTCCAGC--GACCACCATC--- **** * * * ***** * *******
Mean pairwise ID: 61.41%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * *********** * *********** ****** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_B GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * * * ****** * ** * * * * * ******* ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_B CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG * *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_B GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGA * * **** ******* *********** **** * * * *** * ****** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGCAAA LYC.ES_B AGGATAACGA-GTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAA ********** * ** ** ** **** * * * ** * * * * **** *** ZEA.MA_A CCACCATCTTT LYC.ES_B CCACCACTTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 61.41%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A ******* *** ** * *********** ** **** *********** * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCG-CTTTGTGCAGTGGA * * ************ *********** *** * *** *** * **** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_O AGGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAA ********** *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * * ZEA.MA_E CCACCATCTTT LYC.ES_O CCACCACTTT- ****** **
Mean pairwise ID: 61.44%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ***** *** ** * *********** ******* **** *** ** *** * * LYC.ES_N GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** * LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** * LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * ************ *********** *** ** * **** * *********** LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCACC *** * * ** ** *** ** *** * **** * * ***** * ****** LYC.ES_N ATTTTT TRI.AE_A ------
Mean pairwise ID: 61.44%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** ** ****** ********** ********* * ***** *** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** **** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************************** *** ** * ***** ** ********** HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC **** * ***** * ** * * * *** * *** **** HUM.LU_B TCCTTT LYC.ES_I ATTTTT ***
Mean pairwise ID: 61.49%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* ** * ******* ************ **** ** **** *** ** ARA.TH_A -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG-TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT *** ***** * ** ** ** ** * * ** *** ****** ****** ARA.TH_A TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGT-GGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAG--TGGCA ** *** * ** * * * ***** **** ** **** ** ** ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAG ** * *** ******* **************** *** ** **** ** * ***** * ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATA-GCAGACC *** ** * * ** * ** ** *** * * ** * * *** ARA.TH_A ACCATTTT- TRI.AE_B ACCATCTTT ***** **
Mean pairwise ID: 61.49%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** ********* ***** ******** * *** * * *** **** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * ******** ************* HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACA ** *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * ** HUM.LU_B ATTTCCTTT LYC.ES_A ACCACCTTT * *****
Mean pairwise ID: 61.49%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ***** ** *** * ********** ********* * ***** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG ** **** * *** *** *** ** * * ****** ******* LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC *** *** * * * *** * * * * ***** * *** * * LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * ** ***** * ************* LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGA-TGGGCTGCTCC--AATTAAACC HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAG--CCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC ***** ******* ** *** * ** * ******* * *** *** LYC.ES_G ACCACTTTT HUM.LU_C ATTTCTTTT * *****
Mean pairwise ID: 61.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACT--T ** * * ** * ** ******** ** ******** ** * ** * * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.JA_A TGGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGC *** * * ** * **** ** ** ** *** *** ****** ******* ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA HUM.JA_A CGAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTG-GGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG * *** * * * ****** **** *** * * **** ** ** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ** * *********** *************** *** ** *** * * ******* ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGC-CACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC ****** ** * *** * ***** * * * * * * ** ** ** ****** ZEA.MA_C ACCATTTTT HUM.JA_A ATCTCTTTT * * ****
Mean pairwise ID: 61.56%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG * **** ****** * * *** ****** * *************** *** LYC.ES_H GGCTGTACC-AGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCGA *** * ** * ****** ** * *** ******* ****** * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG- CIN.HYB. GAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGGC **** ** ****** ** * **** ** * *** ** * * *** ** LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT CIN.HYB. AATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGAT ******* ****************** * *** * *** **** * ********** LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAA-ACAACC CIN.HYB. TACAAGCCGGAGTGTC-TTAGGCTCA-TATAACCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACCC * * *** ** * * * * *** ** ** ** * **** * *** ** LYC.ES_H ACCTTTT CIN.HYB. ATTT--- * *
Mean pairwise ID: 61.56%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ***** ********* **************** * ** ***** **** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** ***** * *** *** *** ** **** ****** ****** LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT * *********************** *** * ** ***** ************* LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT ***** ******* * * * *** * * ** * ** * LYC.ES_E ACATTTT HUM.LU_B TCCTTT- * ***
Mean pairwise ID: 61.56%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ** *** ** ****** ********** ********* * *** * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** * * ** *** *** ** *** ***** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************************** *** ** * ****** ** ********** HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTG--CTCCAATTAAACCAC **** * ***** * ** *** * * ** * ** *** **** HUM.JA_B TTCTTTT LYC.ES_I CATTTTT ****
Mean pairwise ID: 61.56%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* *** ** * ****** ***** ****** ** *** **** * ** * LYC.ES_O GGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTT--CTGGCCTGCCCTATCCAAGCA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** * **** ** * *** *** * *********** ****** LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTC-AGGCCTTAAGTGGCAGG *** ** **** ***** * * ** ** * *** ****** * LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAA-CTGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA *** *** ******************* *** ** ** ****** * ********* LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGC-AGACCAC **** * *** *** * * * **** * * ** * * ***** LYC.ES_O CACTTT- TRI.AE_B CATCTTT ** **
Mean pairwise ID: 61.61%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAAT--A ******* *** ** * *********** ** **** *********** * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA LYC.ES_O TTGGGCTGTCCCAGATGGCT-GGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAA *** * ** * *** ***** * ** ** * * ********* **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC LYC.ES_O GCACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGG * *** * * ** * * *** * ** ** * *** ****** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_O GTGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA--GAGCCTCACTAAGCAGAC LYC.ES_O GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC ********* *** *** * * ** * * * * *** * ** * * ** * ** ZEA.MA_G CACCATCTTT LYC.ES_O CACCACTTT- ***** **
Mean pairwise ID: 61.61%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTG-GAACACT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** ** **************** ******* * *** ** ** **** ** ARA.TH_G GGATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTG--CTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * ** * **** * * * ** ** * * **** * **** ****** * ARA.TH_G GTG-AGTGAACCGTATGAACC--AAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGA TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCT-CACGGTCCATAATG-TGGC * * **** **** ** * * ***** * * * ** ***** *** * * * ARA.TH_G GGGTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGAC TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA ** * **** ************************ ** ****** ** * ***** ARA.TH_G GGACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAA TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCT---ACTCCAGCAGA *** ** ** ** ** * * *** * ** * ** ** * * ARA.TH_G CCACCATTTT TRI.AE_A CCACC----- *****
Mean pairwise ID: 61.61%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG-GGACACT ****** *** * * ************ * **** ******* ***** *** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCT-TTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ARA.TH_F -GGTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGC *** * ** ** * ** * *** ** * ** ** ****** ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ARA.TH_F TGTGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGC--TTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGA ** *** ** *** *** **** * ***** * ** *** *** * * ZEA.MA_C GGA-ACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA ARA.TH_F GGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC ** * *********** **************** *** ** *** * * ***** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC ARA.TH_F GGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC **** ** * * * ** * * ** * * * * ** * ** ZEA.MA_C CACCATTTTT ARA.TH_F CACCATTTT- *********
Mean pairwise ID: 61.61%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT *** ** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * * HUM.LU_A GGTCAACCTAGT--GGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT ** * * ** * ** * ** * ** ** * ** ****** ******* HUM.LU_A CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGG ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG ** ** ** * * * * ********* ***** * * *** ** ** * HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCTCGGCAGTGGAAG ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG *** **************************** ** ****** * * **** ** HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG-AGCCTCA---TTAAACAGAC ****** ***** *** * *** * * * ** ** ** * **** *** HUM.LU_A CATTTCTTTT ZEA.MA_F CACCATCTTT ** ***
Mean pairwise ID: 61.69%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** *********** ****** ** ** ****** * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** * * ** *** * * ***** *** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGT-TCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG- **** ** * **** * * ** ** * ****** *** ** ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** ****** * ****** ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACCA ***** *** * * ** ** * **** * * * * * * ***** ARA.TH_F CCATTTT- LYC.ES_F TCACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 61.69%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ** ***** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_J CCTTT--- * *
Mean pairwise ID: 61.69%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** **** * * *** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_I GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** * ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC *** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT--TTCGCTCTAAGCGGTGGAAG * * **** ******* *********** **** * * * ** * ****** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA ****** ** ** ** ** **** *** * * * * * *** * ****** ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_I CCATTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 61.72%
DRO.MEL. GACTGGAAGGTTGGCA-GCTTCTGTAATC-ACGCTTCTGTGAGGTCT-GATTGTGGGATG FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC * * ** * * **** * ******** * *** *** **** * ** **** DRO.MEL. GCCTGAGGCTGGGATCTACTGCGTAGCGGACCAGCTCATGTTGACGGAACGTCCGCACTA FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTT-CTGGGCTTCAG--CGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTA ** **** *** * *** * * * * * **** ** * ***** **** DRO.MEL. AGCTTGCCATCAATATGGGTGCCATGGAGGAGTCCGTGGCATTCAGGTTGGCTAAGGAGG FUG.RUB. AGTTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGG ** * * *** ****** * *** **** *** * ***** * ********* DRO.MEL. GATGAACCGGGCCAGGGGTGAAAACCAGCAGCCAAGAGTTCCCGTGGTAGGCAGTAGTGG FUG.RUB. GGTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGG * ** **** ***** **** ***** * ** ****** ********* DRO.MEL. GATAGCGTACCGGAGTGGACTGCCGTTAT-CAGCCCAACCGATATGGTTGGACCACAATC FUG.RUB. GATCGCGCCCGTGAATAGAC-GCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACT-CAGTC *** *** * ** * *** ** ** * ** ** * * * * **** ** ** DRO.MEL. TTT FUG.RUB. TTT ***
Mean pairwise ID: 61.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * *********** * *********** ****** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG LYC.ES_I GGGCTGTA----CCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAG ** * * * ****** * ** * * * * * ******* ***** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG LYC.ES_I CT--TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGG * *** ** * * * * * * *** *** ** * * * ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG LYC.ES_I GGCGGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCG-CTCTAAGCGGTGGA * * **** ******* *********** **** * * ** *** * ****** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGCAAA LYC.ES_I AGGATAACGA-GTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAA ********** * ** ** ** **** * * * ** * * * * ** *** ZEA.MA_A CCACCATCTTT LYC.ES_I CCACCATTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 61.76%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* **************** * * * *** * *** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** ** *** ***** ******* LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** * **** ** * ** ***** ** * * LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************************** *** * * * ***** ** ********** LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC **** ******* * ** * * * * *** * *** * **** * LYC.ES_N ATTTTT HUM.JA_A TCTTTT ****
Mean pairwise ID: 61.78%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG--GGACAC * ***** * *** * * ****** **** * **** ** **** ***** *** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC ARA.TH_A TGGTTCGGTT---CCTCGGATCGGT-TCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC * *** ** * * ** ** * *** ** *** * * * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ARA.TH_A AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGT-TGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGT *** ** * * *** * * ** ********* * * * ******* ORY.SA_B -GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT ARA.TH_A CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT ** ***** ************* *************** *** ******* ** * ** ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATGGC ARA.TH_A GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT *** **** **** * ** * * ** ** * * * ** * ** ORY.SA_B AGACCACCACCTTT ARA.TH_A GAACCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 61.81%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ****************** ********** ********** ****** ********** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCG--GCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_H AATTG-TGGTGCATGTGCCTGGGTCTA---GTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAA ** ** ** ******* * **** ** * * * * *** ****** ZEA.MA_F GTTG-GTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG **** ** **** * ** ** ****** ** * * * * ** *** ** ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGG * * *** ***************** ********** ** ******* *** ****** ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------- ******* * **** * * ****** ZEA.MA_F ACCATCTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 61.81%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTT- CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG *** * * **** * ** **** ****** *** ** * * * ***** HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC ** * *** * * ** ** ** * ** **** ***** ******* * HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTG-GTCAGCTCCTAAAGCGGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG ****** * *** * * ****** ** * ** **** ** *** ** HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG ********* ****************** **** ****** ****** * ******** HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCAT-ATAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC- ** ** ***** * *** * * ** ** * *** * * ** ***** HUM.JA_B ATTTCTTTT CIN.HYB. ACCCATTT- * ***
Mean pairwise ID: 61.81%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** *********** ****** ** ** ****** * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** * * ** *** * * ***** *** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG **** ** * **** * * ** ** * * ****** *** ** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************* *********** ****** * ****** ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACC ****** *** * * ** ** * **** * * * * * * **** ARA.TH_A ACCATTTT- LYC.ES_F ATCACTTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 61.81%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** ********* ***** ******** * *** * * *** **** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** **** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********* ************ ** * ********* ************* HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGG----GTTGCTCCAATAAACA ** *** ***** ** ** ** * * * *** * ** * ** HUM.LU_B ATTTCCTTT LYC.ES_J ACCACCTTT * *****
Mean pairwise ID: 61.81%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * *** * *** *** * ******** ********** * ***** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAG--GGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGC-TGCCCATTCCAAGCC **** * * * * *** * *** * * *** ***** ******* LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGC *** **** ** * ** **** * * **** *** * LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** ****** ******** ************* LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAACC HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCC--AACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC ****** **** * ***** * **** * * ** ** * **** *** LYC.ES_F ATCACTTTT HUM.LU_C ATTTCTTTT ** *****
Mean pairwise ID: 61.86%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT ******* **** ** * ************** ******* ** ****** ** * * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCC-GGCCTGCCCGTCCCA LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTG--AAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * *** *** ***** * * * ** ** * ********* *** ZEA.MA_D AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG LYC.ES_F AGCACAGAGTTGG-GTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG ** *** * * * * * ** *** * * * * ** * ***** ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGG * * * ************ *********** *** * ** ****** * **** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCC-AACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAG LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA ***** ** *** *** *** *** ** *** * ** ** * **** * ZEA.MA_D ACCACCATCTT- LYC.ES_F ACCATCACTTTT **** ** **
Mean pairwise ID: 61.86%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** ** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTT-CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA *** * * * ****** * * **** * * * *** ****** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ARA.TH_C GTTGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTC-GGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG ***** *** * *** ** ****** *** ******* ** *** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGA * * **** ******* ************** *** ** *** ******* ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAG--AACCTCACTAAGCAA ARA.TH_C AGGATTACGG-GCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG ***** *** *** *** * ***** * ** * * ** * ** * * * ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ARA.TH_C ACCATCACTTT- **** ** **
Mean pairwise ID: 61.89%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ****** *** *** * * * * ** ************* ******** LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGG-CTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* ** **** * **** * * **** **** * **************** LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ******************************** **** ********************** LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTC-TGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC **** * ***** *** ** ** * * ********** ** * ***** ** LYC.ES_C CACATTT LYC.ES_L CACTTT- *** **
Mean pairwise ID: 61.89%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** * LYC.ES_J GG-GCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCT-ACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * *** ** **** *** * * ****** **** ****** LYC.ES_J AGAGTTGGATCAC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * **** * * * *** * **** **** ** * * * *** **** LYC.ES_J GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * ** ** ********************** ** * ****** * ******** LYC.ES_J ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC ******** ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** ** LYC.ES_J CACCTTT TRI.AE_A C------ *
Mean pairwise ID: 61.94%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T ****************** ********************** ****** *** **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGG-TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAA *** * ** *** *** * ** ** * *** * **** ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG **** ******* * **** ** ** *** ******** * *** ** ****** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGG * * ** ***************** ********** ** **** ** *** ****** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------- ******* * * **** ** ****** ZEA.MA_E CACCATCTTT ZEA.MA_H ----------
Mean pairwise ID: 61.97%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* ********************************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ************************************************ ***** ***** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_D TTTT- ***
Mean pairwise ID: 62.01%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * ********** ** *********** ****** * ***** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG- LYC.ES_I G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC * * * * ******** ** ** * * * * * ***** ****** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_I TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC ** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT--TCGCTCTAAGCGGTGGAAG * * ************ *********** **** * * **** * ****** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACCA LYC.ES_I GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCA ****** * ** ** * ** *** * * * * * ** * **** ZEA.MA_F CCATCTTT LYC.ES_I CCATTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 62.01%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * * ***** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT *************** ************ ** * ********** ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTG-CTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA ** *** ***** ** ** ** * * * ** ** * * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_H CCTTTT-- * **
Mean pairwise ID: 62.01%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * *********** * *********** **** * * *** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT LYC.ES_B GGGCTGTACCAGATGG--TTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * *** ****** * ** * * * * ******* ***** * ZEA.MA_B GGTAGT-GTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCC-AATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC *** * * * * *** * * *** *** ** * * ** ** ** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCCGCTCTAAGCGGTGGAAG * * **** ******* *********** **** * * ** ** * ****** ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACCA LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA ****** ** ** ** ** **** *** * * * * * * **** * ****** ZEA.MA_B CCATCTTT LYC.ES_B CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 62.01%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** ****** ************ ******* ***** ****** * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC * * * * ** ** ****** ****** ****** ****** ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- **** * *** * *** * **** ** *** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * *********** *********** *** * * ****** ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTAC **** * * * ** *** ** ***** *** * * *** * * *** ** ARA.TH_F CATTTT-- LYC.ES_E CACATTTT ** **
Mean pairwise ID: 62.09%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ***** ** ****** ********** ********* * ***** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** **** * * *** *** *** ** **** ****** ******* LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT * ************************ *** * ** ***** ************* LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT ***** ******* * * * *** * *** **** LYC.ES_G ACTTTT HUM.LU_B TCCTTT * ***
Mean pairwise ID: 62.09%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ** ****** ********** ********* * * *** * *** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** ** *** ***** ******* LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** * **** ** * ** ***** ** * * LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************************** *** * * * ***** ** ********** LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC **** ******* * ** * * * * *** * *** * **** * LYC.ES_I ATTTTT HUM.JA_A TCTTTT ****
Mean pairwise ID: 62.09%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ***** ********* **************** * ** ***** **** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC ** ***** * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************************ *** * ** ***** ************* HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATT LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC ***** ******* * * * *** * *** **** HUM.LU_B TCCTTT LYC.ES_O ACTTT- * **
Mean pairwise ID: 62.10%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTG--GGACAC * ***** * *** * * ****** **** * **** ** **** ***** *** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC ARA.TH_F TGGTTCGGTT---CCTCGGATCGGT-TCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCC * *** ** * * ** ** * *** ** *** * * * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ARA.TH_F AAGCTGTGAGTAATTAGTGTTGAGT-TGAGCGAAGGCTTGGC--TTGCAGGTTCTAGAGT *** ** * * *** * * ** ********* * * * * ******* ORY.SA_B -GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT ARA.TH_F CGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGT ** ***** ************* *************** *** ******* ** * ** ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATGGC ARA.TH_F GGACGGATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATAT *** **** **** * ** * * ** ** * * * ** * ** ORY.SA_B AGACCACCACCTTT ARA.TH_F GAACCACCATTTT- ******* **
Mean pairwise ID: 62.14%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * * *** * * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCC-GGCTTGCCCATCCCAAGT ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT * * ****** ** * * * ** ** * *** ****** ****** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTG-ACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTC-GGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG *** *** * * *** ** ****** *** ******* *** ** ** ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCAC-CTCCCGCTCTTGACGGTGGAA * * **** ******* ************** *** * *** ** ******* * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCA-GATCCTCTCTTAGCAAACC ARA.TH_C GGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACC **** ** *** *** * ******* * ** * * ** *** * *** ZEA.MA_B ACCATCTTT ARA.TH_C ATCACTTT- * ** **
Mean pairwise ID: 62.14%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** * ************* ****** **** * ** ** **** ** ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG--GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * ****** * **** * ** * * **** * **** ****** * ARA.TH_E GTG-AGTAAGACGTGTGTG--TCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGA TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGC * * *** ** ** * * * ***** *** ** ** **** *** ** ** ARA.TH_E GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGAC TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA ** * ************ **************** *** ******* ** * ***** ARA.TH_E GGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAAC TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA--CTCCAGCAGAC **** * * * * *** * ***** * * *** ** ARA.TH_E CACCATTTT TRI.AE_A CACC----- ****
Mean pairwise ID: 62.14%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T ****************** ********************** ****** *** **** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGG-TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAA *** * ** *** *** * ** ** * *** * **** ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG **** ******* * **** ** ** *** ******** * *** ** ****** ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGA * * ** ***************** ********** ** ****** *** ****** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_H AGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT---------------------------- ******* * * **** ** ****** ZEA.MA_G ACCATCTTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 62.14%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T ****************** ********************** ****** *** **** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_H CAATTGTGG-TGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTG--TGGACCACCCATTCCAA *** * ** *** *** * ** ** * *** * **** ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_H GTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTG--CATCCCAACACTAAAGTGG **** ******* * **** ** ** *** ******** * *** ** ****** ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_H CGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGG * * ** ***************** ********** ** ******* *** ****** ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------- ******* * **** ** ****** ZEA.MA_D CACCATCTT ZEA.MA_H ---------
Mean pairwise ID: 62.14%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * * ****** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG **** ** * * ** *** **** * * ***** ** ** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_K ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 62.18%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT ******* **** ** * ************** ******* ** ****** ** * * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCC-GGCCTGCCCGTCCCA LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTG--AAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * *** *** ***** * * * ** ** * ********* *** ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG LYC.ES_F AGCACAGAGTTGG-GTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG ** *** * * * * * ** *** * * * * ** * ***** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTC-CCCGCTCTGTGCAGTGG * * * ************ *********** *** * ** ** *** * **** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCC-AACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAG LYC.ES_F AAGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAA ***** ****** *** *** *** ** *** * ** ** * **** * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT LYC.ES_F ACCATCACTTTT **** ** ***
Mean pairwise ID: 62.21%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* **************** * ** * *** * *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** **** * *** *** *** ** **** ****** ****** LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** ** *** * *** * ******** ** * * LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * *********************** *** * ** ***** * ************* LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC ***** ****** * * * * *** ** * ** * * ** * * LYC.ES_E ACATTTT HUM.JA_A TCTTTT- * ***
Mean pairwise ID: 62.21%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGT-TGAATATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** ** * ******** ** ***** * *** ****** * **** * LYC.ES_A GG-GCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCT-ACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * *** ** **** *** * * ****** **** ****** LYC.ES_A AGAGTTGGATCTC--GAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGC TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * **** * * * *** * **** **** ** * * * *** **** LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG * ** ** ********************** ** ** ****** * ******** LYC.ES_A ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACT-CCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCAC ******** ** ** * * ** ** * **** * * ***** * ** ** LYC.ES_A CACCTTT TRI.AE_A C------ *
Mean pairwise ID: 62.21%
CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG *** * * **** * ** **** ****** *** ** * * * * ****** CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTAGACA-CCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC HUM.JA_A GG-TCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC * * ** * * ***** * * * ** **** ***** ******* * CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCAC-AGCTCCTAAAGAGGAGG ****** ** *** *** ********* **** **** ** ** ** CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG ********* ****************** **** ***** ****** * ******** CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAACCA--GCCTGGCTAGCCCAACAGGACAC HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT ** ** * *** * *** *** ** ** ** ** * *** ** CIN.HYB. CCATTT- HUM.JA_A CTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 62.21%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTG-GAACACT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******* ** * ******** ************ **** ** **** * * ** ARA.TH_E GGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT * * *** **** * ** ** ** * ** **** ****** ****** * ARA.TH_E GTGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG TRI.AE_B GGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAG--TGGCAGG * *** * * *** * ***** **** ** * * *** *** ** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAAGGA * *** ************************ *** ** **** ** * ***** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATA-GCAGACCAC * **** * ** * ** ** *** * * ** * * ***** ARA.TH_E CATTTT- TRI.AE_B CATCTTT *** **
Mean pairwise ID: 62.21%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT TRI.AE_B -NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT * * *** ** * ** *** ***** ********** ** ** *** * HUM.LU_D GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT *** * ** * * ** * *** * *** **** ****** ******* HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAGGC ** *** ****** *** * ******* *** * *** ***** *** HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT * *** ******* **************** ** * ***** * * ********** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCAC *** ***** *** * *** ** * ** * * * * * ** ** **** HUM.LU_D TTCTTTT TRI.AE_B CATCTTT ***
Mean pairwise ID: 62.26%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT * ** ** ** * ** ******** *********** * *** **** * HUM.LU_B GGGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * *** * * ** * **** * ** *** ** **** * **** ******* HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA * * *** * * ** * * ***** ** ***** * * * * ** **** HUM.LU_B GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAG TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG **** ************ **************** ** ****** ** * ******* HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA---CTCCAGCAGAC ***** ****** *** * * * *** * * * *** ** * * *** HUM.LU_B CATTTCCTTT TRI.AE_A CACC------ **
Mean pairwise ID: 62.26%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTG-GAATGTT ******** ****** * ********* *** * ****** * ****** * ***** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCT-GGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_C G---AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTG-ACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAG ** * * * ******** ** * * * * ********* ****** ZEA.MA_F TTGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LYC.ES_C CAAAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGG ** ** * ** ** * ******** ***** ** *** *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_C TGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCG-GTCCA--GAGCCTCATTAAACAGAC LYC.ES_C GGATAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC ******* *** ** * *** **** *** * ** ** * ** ZEA.MA_F CACCATCTTT LYC.ES_C TACCACATTT **** ***
Mean pairwise ID: 62.26%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAA-GGTAG-TGTGGATG ******** ******** ** ******** ********** *** *** * ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ZEA.MA_H TCAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTC---TAGTGCTACAAACT--GTGGACCACCCATTC * ***** ** ****** * * ** * ** ** *** *** *** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ZEA.MA_H CAAGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGC------TTTGCATC-CCAACAC **************** * ** ******** ** ***** ** ** * * ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA ZEA.MA_H TAAAGTGGCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCA ********* * ** ***************** ********** ** ****** *** ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA ZEA.MA_H GCGGTGGAAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT-------------------- ************** * *** * * ***** * ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_H ------------------
Mean pairwise ID: 62.26%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** ****** ************ ******* ***** ****** * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC * * * * ** ** ****** ****** ****** ****** ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGT-GGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG **** * *** * * *** * *** * * *** *** ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_E G--ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG * * *********** *********** *** * * ****** ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LYC.ES_E ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACT ** **** * * * ** *** ** ***** *** * * *** * * *** ARA.TH_A ACCATTTT-- LYC.ES_E ACCACATTTT **** **
Mean pairwise ID: 62.26%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATT * ** * * ** * ** ******* *** ******** ** ** * * ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT HUM.LU_B GGGTCA-GCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGC * * * *** * ** * ** * ** ** * ** ****** ******* ZEA.MA_F TGGTTGT-GGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG HUM.LU_B CGGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG ** ** ** * * * * *************** * *** ** ** * ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG HUM.LU_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCT-CCCGCTCCCGGCAGTGGAAG *** ************ *************** ** ****** ** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTC-CAGAGCCTCA---TTAAACAGAC HUM.LU_B GATAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGAC ****** ***** *** * * *** * * ** * * *** * **** * *** ZEA.MA_F CACCATCTTT HUM.LU_B CATTTCCTTT ** ****
Mean pairwise ID: 62.30%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG--GAACAT * * * * *** *** *** **** ** ******* ** ** * * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA HUM.LU_B TGGGTCA---GCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCA **** ** * ** ** * ** *** * ** ** * **** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG HUM.LU_B AGCCGGGAGTTGGGC-TGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTG ** * * * * ** * ************* * * * * ** ********* ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.LU_B GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGG * *** * ***************************** **** ****** ** * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCC--TTCCATGGCA HUM.LU_B AAGGATAACGGGCCGGTGCTACT-TGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCG *************** *** * *** ** * * * ** * ** * ORY.SA_B GACCACCACCTTT HUM.LU_B GACCATTTCCTTT ***** *****
Mean pairwise ID: 62.31%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTA----GATGGTGGAAC * ****** **** * **** ********* * **** ** * * * * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ARA.TH_E ACTGGTTCGGGTCCACGGGCCGGTTC---TGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTC **** ** * * * ** * ******** ** ** **** ***** ** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC- ARA.TH_E CAAGCTGTG-AGTAAGACGTGTGTG-TCAAGCGAAGGC------TTGGCTCAAACGGCTT **** ** * *** * ** * * * ******** ** *** **** ORY.SA_A CTAAAGT-GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC ARA.TH_E CTAAAGTTGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTA ******* ** ** * ************ *************** *** ******* ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ARA.TH_E CAGCAGTGGACGGATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGAT ** * ***** **** **** * * ** * ** ** * * **** ORY.SA_A TACA-ACAGACCACCATCTTT ARA.TH_E CTCATATGAACCACCATTTT- ** * ******** **
Mean pairwise ID: 62.34%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATG-T ****************** ********************** ****** * * ***** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGTT ZEA.MA_H CAATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTT **** ** ******* ** ** ** ***** ******* ZEA.MA_B G-GTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ZEA.MA_H GCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACA---CTAAAGTGGCG * ****** * *** ** * ************ ** * ** *** ** *** ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA ZEA.MA_H GACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCCACCAGCGGTGGAA * ** **** ************ ********** ** ***** * *** ****** * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCA ZEA.MA_H GGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT----------------------------- ****** ** **** ** * ****** ZEA.MA_B CCATCTTT ZEA.MA_H --------
Mean pairwise ID: 62.34%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ******** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** * ** ** *** ** * * ******* ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * **** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** * ARA.TH_D CCACTTT- LYC.ES_J CCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 62.34%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ****** *** * * ********** ** *********** ****** * ***** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG- LYC.ES_B G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGC * * * * ******** ** ** * * * * * ***** ****** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_B TTAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGC ** * *** * ** *** * **** *** * *** * * * *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTT-TCCGCTCTAAGCGGTGGAAG * * ************ *********** **** * * ***** * ****** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCA--GAGCCTCATTAAACAGACCA LYC.ES_B GATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCA ****** * ** ** * ** *** * * * ** * *** * **** ZEA.MA_F CCATCTTT LYC.ES_B CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 62.34%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** * ********* ** *** ** *** * ****** * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA * * * * ** ** **** ** * **** ****** ******** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT-GGGGTG **** * ** * ************* * * *** *** ** * * ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************* *********** *** ** ******* ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCA-CTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA * *** ** *** * ** * * * *** *** * * *** * * *** * ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_C CCACATTT *** **
Mean pairwise ID: 62.38%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ****** *** ** * ********** *** **** *********** * ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_E G---GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG * * * * * * ********* ** ** * * * ********* ****** ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LYC.ES_E TACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG * * *** * ** ** * *** * ***** ** * *** *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_E TGGACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGAA * * *********** *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGAC LYC.ES_E GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAAC ******* * *** *** ** **** * * * ** ** ** ** * ** ZEA.MA_F CACCATCTTT- LYC.ES_E TACCACATTTT **** ***
Mean pairwise ID: 62.38%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATG--GGACTT *** * * *** *** *** **** ** ******* ** * ** *** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA HUM.JA_A TGGGTCA---GCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCA **** ** * * ** ** * ** *** * ** ** * **** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG HUM.JA_A AGCCGAGAGTTGGGC-TGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAG ** * * * * ** * ************* * * * * ** **** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG HUM.JA_A GAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGG * *** * ***************************** *** ****** * * **** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA HUM.JA_A AAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGA ************ ** *** * **** * * * *** ** **** ORY.SA_B CCACCACCTTT HUM.JA_A CCATCTCTTTT *** * * ***
Mean pairwise ID: 62.38%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT *** ** ** ** * ** ******** *********** * *** * ** * HUM.LU_A GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * ** * **** * ** *** ** **** * **** ******* HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAG-CTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA * * *** * * ** * * ***** * ****** * * * ** **** HUM.LU_A GGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG **** ***************************** ** ****** * * ******* HUM.LU_A GATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGA TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGC--AGCCTACTCC--AGCAGA ***** ****** *** *** ** * * ** ** * ** **** * ** HUM.LU_A CCATTTCTTTT TRI.AE_A CCACC------ ***
Mean pairwise ID: 62.38%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG--GAATGT ******* **** ** * ************** ******* ** ****** ** * * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCC-GGCCTGCCCGTCCCA LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGAT--GGGCTTG--AAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCA * * *** *** ***** * * * ** ** * ********* *** ZEA.MA_G AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG LYC.ES_F AGCACAGAGTTGG-GTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGG ** *** * * * * * ** *** * * * * ** * ***** ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG LYC.ES_F GATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGA * * * ************ *********** *** * * ****** * **** ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCC-AACTCAGGCCCAG-AGCCTCACTAAGCAGA LYC.ES_F AGGATCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAA ***** ****** *** *** *** ** *** * ** ** * **** * * ZEA.MA_G CCACCATCTTT LYC.ES_F CCATCACTTTT *** ** ***
Mean pairwise ID: 62.42%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** * * *********** * ************ *** ** *** * * LYC.ES_B GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** * LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** * LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * ************ *********** *** ** * ***** * *********** LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCACC *** * * ** ** *** ** *** * **** * ** *** * * ****** LYC.ES_B ACTTTT TRI.AE_A ------
Mean pairwise ID: 62.42%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ******* *** * * *********** * ************ *** ** *** * * LYC.ES_I GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** ** **** **** * *** * **** ****** * LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGC-CCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** * * *** * * * * *** **** * LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGT-TTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA * ************ *********** *** ** * **** * *********** LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCACC *** * * ** ** *** ** *** * **** * * ***** * ****** LYC.ES_I ATTTTT TRI.AE_A ------
Mean pairwise ID: 62.46%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** *** ********* **************** * ** *** * ** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG * * **** * ** *** *** ** **** ****** ****** LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC ******* **** ** *** * *** * * ******** ** * * LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * *********************** *** ** ** ***** * ************* LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA HUM.JA_B AACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA ***** ******* * * * *** * * ** **** * ** * ** * LYC.ES_E CCACATTTT HUM.JA_B TTTCTTTT- * ***
Mean pairwise ID: 62.46%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT TRI.AE_C ------------------------------------------------------------ TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTGC TRI.AE_C ------------------------------------GGTGGTCTGCCCGTTCCAAGTTGA * *** * *************** TRI.AE_A GTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC TRI.AE_C GTAGTGGACCGCTTGGGGCCTATGCGAAAGTTGGGCCTCACGGTCCATAATGTGGCAGGC ************ ****** ********** **** ************************ TRI.AE_A ACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT TRI.AE_C ACCGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT ** ********************************************************* TRI.AE_A AATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC-- TRI.AE_C AACGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCGCTTGGGCCTCGTAGCCTACTCCAGC-GACCACCAT ** ********************* ********** ************* ******* TRI.AE_A - TRI.AE_C C
Mean pairwise ID: 62.46%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ************ ***** ****** ****** * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * * * * ** ** ****** ****** ****** ******* ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGT-GGTCCAATTGAAAGAATGGGCTAC-TAGATTCCTAAAGTGGGGT **** * *** * * *** * *** * ** *** * ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG * * ************ *********** *** * * ****** ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LYC.ES_G ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACC ** **** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * **** ARA.TH_A ACCATTTT- LYC.ES_G ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 62.46%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGT--AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGG LYC.ES_A AGAGTTGGATCT-CGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGC **** **** * ** ** *** ** * * ******* ** * ARA.TH_D GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGG LYC.ES_A GGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGT-GCAGTGGAAGG * * ** ********* ************ ** ** ** * ******** ** ARA.TH_D ATCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC LYC.ES_A ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACA ** ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** ARA.TH_D ACCACTTT- LYC.ES_A ACCACCTTT ***** **
Mean pairwise ID: 62.46%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ***** ********* ***** ******** * *** * * *** **** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** **** * * *** *** *** ** *** ***** ******* LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT **************************** ** * ********* ************* LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACA-ACC HUM.LU_B AACGGGCCGGTGC--TACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC ** *** ***** ** ** ** * * * *** * *** * *** LYC.ES_H ACCTTTT-- HUM.LU_B ATTTCCTTT * * *
Mean pairwise ID: 62.54%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** * ********* ** *** ** *** * ****** * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA * * * * ** ** **** ** * **** ****** ******** ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC-AGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG **** * ** * ************* *** ** ** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** *** ** ******* ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCA-CTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTAC *** ** *** * ** * * * *** *** * * *** * * *** ** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_C CACATTT ** **
Mean pairwise ID: 62.54%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT *** ** *** ** * ****** * *** **** * ** * *** * ** *** * * ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCT-TGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT *** * **** * *** * * * ** * * ****** **** ******** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG TRI.AE_B TGGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTA-AGTGGCAG *** *** * * * * * * ***** *** * ** ** ***** * ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGG *** *** ********************** * ** * ***** *********** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCAC ** ** **** *** * **** ** ** ** * ** * * ***** ARA.TH_C CACTTT- TRI.AE_B CATCTTT ** **
Mean pairwise ID: 62.54%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ************ ***** ****** ****** * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * * * * ** ** ****** ****** ****** ******* ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG **** * *** * *** * **** ** *** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * * ****** ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCAC **** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ****** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_G CACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 62.58%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGAC-TTT ** * * ********* ******** ********** * *** * ** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC ** * * ***** ** * * * ** * **** ****** ******* LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCC-ACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG ******* * *** * ***** ** * ** * ** ** ** ** * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * ************************* **** * ******** ************ LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAAC HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCC--ACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGAC * ****** ***** *** ** ** * * * ** * **** ** LYC.ES_F CATCACTTTT HUM.JA_B CATTTCTTTT *** *****
Mean pairwise ID: 62.58%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ** *** ** ** * ** ******** *********** * *** * ** * HUM.LU_D GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * ** * **** * ** *** ** **** * **** ******* HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGA--CCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAG * * *** * * ** * * ***** ******* * * * * ** **** * HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG TRI.AE_A GCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGG *** ***************************** ** ****** * * ******** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGAC TRI.AE_A ATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGC--AGCCTACTCC--AGCAGAC **** ****** *** *** * * * ** ** * ** **** * *** HUM.LU_D CATTTCTTTT TRI.AE_A CACC------ **
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ************ ***** ****** ****** * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC **** * *** * * **** *** * * ** *** ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_I GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGG * *************** *********** *** * ** * *** *** ***** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_I ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCA ** *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ***** ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_I CCATTTTT *******
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** ** ** ** *** * ****** ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGACGT-GTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** ** * * * *** *** *** * * ******* ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCT-CCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** ** ****** ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_A CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGTAATCT-GTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG ***** * * ** ** *** ** * * ****** *** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * **** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** * ARA.TH_D CCACTTT- LYC.ES_K CCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 62.66%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** ** ** ** *** * ****** ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGC-GGGGCG ***** ** * * * *** *** *** * * ****** ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * ******* ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_K CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ** ****** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********* ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_A ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 62.78%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ****** * ****** ************ *** ** ********* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGT-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** ** ** ** * *** * ** * **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG **** **** * **** * * * ** ** * ** *** *** ** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************************* ****** * *** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCC--ACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACC *** * * * *** ** * ** * * * * * * * *** ARA.TH_D ACCACTTT- LYC.ES_F ATCACTTTT * ******
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ** ***** ********* **************** * ** *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC ** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ****** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * *********** *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGT-CCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA ***** ******* * ** *** * * ***** * ** * ** * HUM.LU_A TTTCTTTT- LYC.ES_E CCACATTTT * ***
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG ******* * **** * ** **** ****** *** ** * * * ****** HUM.LU_D GG-TCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * * * *** * ***** ** * ** **** ***** ******* * HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** ** ** **** ********* **** * **** * ** ** HUM.LU_D GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG ********* ******* ********** **** ***** ****** * ******** HUM.LU_D ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCAT-ATAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC- ** ** ***** * * * * ** ** * **** * * ** ***** HUM.LU_D ATTTCTTTT CIN.HYB. ACCCATTT- * ***
Mean pairwise ID: 62.78%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG **** *** * **** * ** **** ****** *** ** * * * ****** HUM.LU_A GG-TCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCT-GTAGACACCGCAC-CTGGCTTGCCCGTTCCAAGTC * * * *** * ***** ** * ** **** ***** ******* * HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGG CIN.HYB. GAGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGG * **** ** ** **** ******* **** * * **** * ** ** HUM.LU_A GCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG CIN.HYB. GCAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGG ********* ******* ********** **** ***** ****** * ******** HUM.LU_A ATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACC CIN.HYB. ATTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCAT-ATAACCAGCCTGGCTAGCCC--AACAGGAC- ** ** ***** * * * ** ** ** * **** * * ** ***** HUM.LU_A ATTTCTTTT CIN.HYB. ACCCATTT- * ***
Mean pairwise ID: 62.78%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC **** * *** * * **** *** * * ** *** ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_H GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGG * *************** ************ ** * ******* ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG-AAC LYC.ES_H ATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAAC ** * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** *** *** ARA.TH_A CACCATTTT LYC.ES_H CACCTTTT- **** ***
Mean pairwise ID: 62.78%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** ******* * ****** **** ******** ************* * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC * * ** ** * ** ** * * ** **** ****** ****** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG **** ***** ** *** * ** * * * ******* ** ** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_E --ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * *********************** *** * * ** *** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGAT-CCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA * * * ** * ** ** * *** ** *** * *** * *** * ** * ARA.TH_D CCACTTT-- LYC.ES_E CCACATTTT **** **
Mean pairwise ID: 62.87%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ************ ***** ****** ****** * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG **** * *** * * **** *** * * * *** * ** * * ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************** *********** *** * ** * *** *** ***** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC * *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ****** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_I CATTTTT ******
Mean pairwise ID: 62.87%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** * * ****** **** * ***** ** *** ********* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ***** ** **** ** * * * ****** ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTA-AGCGGTGGAAGGA *************************** *** * ** * ** *** ***** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTC-CAATTAAACCAC * * *** ** **** ** *** * *** * * ** * * ***** ARA.TH_D CACTTT- LYC.ES_I CATTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 62.87%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ** *** ** ****** ********** ********* * *** * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** * * ** *** *** ** *** ***** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* **** ** **** *** * * ** ***** ** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************************** *** ** * ******* ** ********** HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTG--CTCTAATTAAACCAC **** * ***** * ** *** * * ** **** **** **** HUM.JA_B TTCTTTT LYC.ES_B CACTTTT *****
Mean pairwise ID: 62.87%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * * ***** ********* **************** * * *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** ** * ****** ** ********** HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC **** * ***** * *** ***** * * ** ** * *** **** HUM.LU_A TTCTTTT LYC.ES_N CATTTTT ****
Mean pairwise ID: 62.99%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** ** * * *** * ****** ****** ****** * * ***** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAG-GTAGGGCTTGTG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG ***** * ** * *** * * * * * ****** ******* LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGC-GCACTCCTAGACTGGAGGGC *** **** * * * ********* * ** * ****** * *** * * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** *** ** ********** ************* LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGC-CAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA **** *** *** * ** **** ** ******* * ** * ** * LYC.ES_C CCACATTT HUM.LU_C TTTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 62.99%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ***** ****** ************ ******* **** ****** * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC **** * *** * * **** *** * * ** *** ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_N GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGG * *************** *********** *** * ** * *** *** ***** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_N ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCA ** *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ***** ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_N CCATTTTT *******
Mean pairwise ID: 62.99%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ******** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** ** ** ** *** * ****** ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGT-GGGGCG **** ** * * * *** *** *** * * ******* ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** ********* ************ ** * ******* ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * * * * * *** *** ** ** **** *** * *** ** *** * ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_J CCACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 62.99%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** ******** *** **** ***** ** **** * * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG **** * *** * * **** *** * * * *** * ** * * ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA *************** ************ ** * ******* ******** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG-AACC LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC * * ** * * *** *** ** ** **** *** * ** *** **** ARA.TH_F ACCATTTT LYC.ES_H ACCTTTT- *** ***
Mean pairwise ID: 62.99%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** ** * *********** ******* **** *** ** *** * LYC.ES_E GGGCTGTCCCAGATGGC-TGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** *** ** **** **** * ****** **** ******* LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** ** **** * * * * *** **** * LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** *********** *********** *** ** ****** * ********* LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC *** ** *** *** *** ** * *** **** * ** ** ** * ** ** LYC.ES_E CACATTTT TRI.AE_A C------- *
Mean pairwise ID: 63.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAGATG-GGACT ** ** * ** * ************** ******* ** * ** *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT HUM.JA_A TTGGGTCAGCCCATTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTGCTGGTCTGCCCATT ** *** * ** * *** ** **** * ** ******** ***** ** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC HUM.JA_A CCAAGCCGAGAGTTGGGCTGT-GTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCT-----C ***** * * ***** * * * * ********* * * ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC HUM.JA_A CTAAAGAGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTC ****** ** **** ************ *************** *** ****** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT HUM.JA_A GGCAGTGGAAGGATAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCT * ************* ** * *** ******** * * * * * **** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT HUM.JA_A TAATCAGACCATCTCTTTT * ******* * ***
Mean pairwise ID: 63.06%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTG-GAATG-T ******* **** ** * ************** ******* ** ****** ***** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCC-GGCTTGCCCATCCCAA LYC.ES_F TGGGTCCATCTTGATGGA---TGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA * * *** *** ****** * * * * ** * *** ***** **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGG-GCTCTA-GCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGC LYC.ES_F GC--ACAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTAT--AGCCACTTGGCCTTTAGAGT * ** ** *** * * **** ****** * * * ** * *** ZEA.MA_A GGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTG LYC.ES_F GGGATGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTG ** * * * **** ******* *********** *** * * ** *** * *** ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAG-CCTAACTCAGGCTCAGAACCTCAC-TAAGC LYC.ES_F GAAGGATCACGG-GCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATT * ***** *** ** *** ******* ****** * * * * * *** ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT LYC.ES_F AAACCATCACTTTT ****** ** ***
Mean pairwise ID: 63.07%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ********* **************** * ** * *** * *** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** **** * *** *** *** ** **** ****** ******* LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** ** *** * *** * ******** ** * * LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************************ *** * ** ***** * ************* LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC ***** ****** * * * * *** ** *** * **** * LYC.ES_O ACTTT- HUM.JA_A TCTTTT ****
Mean pairwise ID: 63.11%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT ******* *** * * ********** ** *********** ****** * ***** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT LYC.ES_G G--GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGC * * * * ******** ** ** * * * ********* ****** ZEA.MA_F -TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG LYC.ES_G ACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGT * *** * ** ** * *** * ***** ** * *** *** ** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG LYC.ES_G GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGAAG * * ************ *********** *** * ****** * **** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGACC LYC.ES_G GATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACC ****** * *** *** ** **** * * * ** ** ** * ** * *** ZEA.MA_F ACCATCTTT LYC.ES_G ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 63.11%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** *** * * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTT-TGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT *** ** * * ****** * ** ** * * ***** **** ******** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTC-GGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG *** *** * * * * * *** **** * *** ** * *** ***** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAG ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG * ** *********** ************** *** ** *** ** ********** ZEA.MA_C GATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACC ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACC *** ** ***** *** * ** * ** ** * * * * * **** ZEA.MA_C ACCATTTTT ARA.TH_C ATCACTTT- * ** ***
Mean pairwise ID: 63.11%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ** ****** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTG--GGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** * **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG ******* * * ** *** **** * * ***** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ** ********************** ** * ********** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_J ACCTTT--- * * *
Mean pairwise ID: 63.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGG--GGATG-GGACG * *** ******* ** * ** *** * ***** ** * ** *** * ** ** *** * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGG-GTTGG-GCTATATT-CTGGCCCGCCCATTC ** *** * * * *** * **** * ** ** ***** **** *** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTG-GCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ARA.TH_C CAAGTTGGGAGTTGAG--GCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCT-----T ******* * ** * * * ****** * ******** * * *** ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC ARA.TH_C CTAGAGTGGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTT *** ***** * ** ************ ************** *** ****** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT ARA.TH_C GACGGTGGAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTA-TGACCCAATAAGCCGCT ************ ** *** *** * **** ** ** **** ** ** ORY.SA_A ACAAC-AGACCACCATCTTT ARA.TH_C CCGATTGGACCATCACTTT- * * ***** ** **
Mean pairwise ID: 63.19%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ***** ******* * ****** **** ******** *** ********* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ***** ** **** ** * * * ****** ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTA-AGCGGTGGAAGGA *************************** *** * ** * ** *** ***** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTC-CAATTAAACCAC * * *** ** **** ** *** * *** * * ** * * ***** ARA.TH_D CACTTT- LYC.ES_N CATTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 63.19%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ***** ****** ************ ******* **** ****** * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG **** * *** * * **** *** * * * *** * ** * * ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************** *********** *** * ** * *** *** ***** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC * *** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ****** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_N CATTTTT ******
Mean pairwise ID: 63.19%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * * ****** ********* **************** * * *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** ** * ****** ** ********** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC **** * ***** * *** **** * **** ** * *** **** HUM.LU_D TTCTTTT LYC.ES_N CATTTTT ****
Mean pairwise ID: 63.21%
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGTGGATGTC ********* ** ***** ************** ******* *** ** **** * * TRI.AE_A G-TTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG ZEA.MA_H AATTGTGGTGCATGTGCCTGGGTCTAGTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCAAGTTG **** * ** * * ***** * * * * *** ** *** ********** TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG ZEA.MA_H CGTAGTGGGTT-TCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTTGCATCCCAACAC-TAAAGTGGCGGA ******** * * ** * ********* * ** * * *** ***** * TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ZEA.MA_H CATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGGAAGGA ** ***************** ********** ** ****** *** *********** TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACCACC ZEA.MA_H TAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT------------------------------- ***** * **** ** * *****
Mean pairwise ID: 63.23%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT ******* *** ** * ********** *** **** *********** * ** ** ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGG-GCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG LYC.ES_O G---GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG-GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAG * * * * * * ********* ** ** * * * ********* ****** ZEA.MA_F T-TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA LYC.ES_O CACAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGG * *** * ** ** * *** * ***** ** * *** *** ** ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA LYC.ES_O TGGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACT-TCCGCTTTGTGCAGTGGAA * * ************ *********** *** * ****** * **** * ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA---GCCTCATTAAACAGAC LYC.ES_O GGATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAAC ******* * *** *** ** **** * * * ** ** ** * ** * ** ZEA.MA_F CACCATCTTT LYC.ES_O CACCACTTT- ***** **
Mean pairwise ID: 63.31%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** ****** ************ ******* ***** ****** * * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * * * ** ** ****** ****** ****** ******* ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGT-GGTCCAATTGAAAGAATGGGCTAC-TAGATTCCTAAAGTGGGGT **** * *** * * *** * *** * ** *** * ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_O GGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGG * * ************ *********** *** * * ****** ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LYC.ES_O ATAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACC ** **** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * **** ARA.TH_A ACCATTTT LYC.ES_O ACCACTTT **** ***
Mean pairwise ID: 63.31%
HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ** *** ********* **************** * ** *** * ** HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * **** * ** *** *** ** **** ****** ******* HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* **** ** *** * *** * * ******** ** * * HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************************ *** ** ** ***** * ************* HUM.JA_B AACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--CTCCAATTAAACCA ***** ******* * * * *** * * ** **** *** **** HUM.JA_B TTTCTTTT LYC.ES_O CCACTTT- ****
Mean pairwise ID: 63.31%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** * * ****** **** * ***** ** *** ********* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * *** ** * ** ** * * ** **** ****** ******* ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG **** ***** ** *** * ** * * * ******* ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * ************************ *** * * ** *** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGAT-CCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTC-CAATTAAACCA * * * ** * ** ** * *** ** *** * *** * ** * * **** ARA.TH_D CCACTTT- LYC.ES_G CCACTTTT *******
Mean pairwise ID: 63.31%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG-GGACGTT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT *** *** *** ** * ****** * * *** ** * ** ***** * ** *** *** ARA.TH_C GGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT * ****** ** * ** ** * * **** **** ******** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG ZEA.MA_F TGGTTGTGGCTG-GTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG *** ** * * **** *** ******** *** *** * ** ** ** * ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCT-CCCGCTCTTGACGGTGGAAG ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG * ************ ************** *** ****** ******* ** ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG--AGCCTCATTAAACAGACCA *** ** **** *** ** * ****** * *** **** * * ***** ARA.TH_C TCACTTT- ZEA.MA_F CCATCTTT ** **
Mean pairwise ID: 63.40%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ** ****** ********** ********* * * *** * *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** ** **** ****** ******* LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** ** *** * *** * ******** ** * * LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************************ *** * ** ***** * ************* LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC ***** ****** * * * * *** ** *** * **** * LYC.ES_G ACTTTT HUM.JA_A TCTTTT *****
Mean pairwise ID: 63.40%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** ****** ************ ******* ***** ****** * * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * * * ** ** ****** ****** ****** ******* ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG **** * *** * *** * **** ** *** * ** * * ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * * ****** ******** **** ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCAC **** * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ****** ARA.TH_F CATTTT LYC.ES_O CACTTT ** ***
Mean pairwise ID: 63.43%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * * ****** ********* ***** ******** * *** * * * * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT *************** ************ ** * ********** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC--TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCT-AATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** *** ***** ** * * ** * ** * * **** ** * * * *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_H ACCTTTT-- * * **
Mean pairwise ID: 63.43%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ** *********** ****** ** * ******** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT-CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * ** ** ** ** * ***** **** ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_F AGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGC-CACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG **** * * *** * **** * * ** ** *** * ** *** *** ** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_F -ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************************* ****** * ****** ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACC--ACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG--CCTAATTAAACC **** * *** * * ** ** * **** * * * * * * **** ARA.TH_E ACCATTTT- LYC.ES_F ATCACTTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 63.52%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG CIN.HYB. ACCGGGCTTGGTAACGCTAGTCTATAACTCAAGTGAGGGTATCAAAGTGGTTGAACTTTG *** *** *** ** * * *************** **** ***** *** *** LYC.ES_C AACATG-CCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTC-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA CIN.HYB. AGCTTGGCTTAGCTAGTTGGGTCTGTA-GACACCGCACCTGGCTTGCCCGTTCCAAGTCG * * ** * ** ** *** *** **** * ***** ***** ****** LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGC-TGGGCTCCTAAAGTGGGGTG CIN.HYB. AGAGTGGGTTCATGTTTCCTGAGCGAAGGCTCGGGTGATGTGAGCTTTAGAATCGGGGGG ***** ** ** *** * ********** *** ** *** ** **** * LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA CIN.HYB. CAATGCGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCTGCGAAAACCTCTACCTCTCGACTGTGGAAGGA * ***** ****************** **** * *** **** * ********* LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC CIN.HYB. TTACAAGCCGGAGTGTCTTAGGCTCATATAA--CCAGCCTGGCTAGCCCAACAGGACACC * ** **** * ** ** * *** ** * * **** * * ** * LYC.ES_C CACATTT CIN.HYB. CATTT-- ** *
Mean pairwise ID: 63.52%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** ***** * * ****** **** * ***** ** *** ********* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ***** ** **** ** * * * ****** ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************************** *** * ** ** ** *** ***** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCAC * * *** ** **** ** *** * *** * *** * ***** ARA.TH_D CACTTT- LYC.ES_B CACTTTT ******
Mean pairwise ID: 63.55%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG-GAACAGT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ****** *** *********** ************ ** *** *** ** **** * ARA.TH_D GGTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG--GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * **** * * *** * ** ** *** * **** ****** * ARA.TH_D GTG-AGTAATCTGTGTGGG--TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGA TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT-GGC * * *** * * **** * * ***** *** * ** *** *** ** ** ARA.TH_D GGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGAT TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA ** * ************ **************** *** *** *** ** * ***** ARA.TH_D GGATCATAGTTCGAAGT-CTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGA TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTA---CTCCAGCAGA **** ** * ** * *** ** * * * * * *** * * *** ** ARA.TH_D CCACCACTTT TRI.AE_A CCACC----- *****
Mean pairwise ID: 63.64%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** ***** ************ ***** ****** ****** * ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGC **** * *** * * **** *** * * ** *** ** * ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG LYC.ES_B GGAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGG * *************** *********** *** * ** ***** *** ***** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_B ATAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCA ** *** * * ** *** ** ***** *** * * *** ** * ***** ARA.TH_A CCATTTT- LYC.ES_B CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 63.73%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** *** ** ****** ********** ********* * * *** * *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ** *** * * *** *** *** ** *** ***** ******* LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ******** **** * **** ** * ** ***** ** * * LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************************** *** * * ******* ** ********** LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTC-CAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATC **** ******* * ** * * * * * *** ** **** * **** * LYC.ES_B ACTTTT HUM.JA_A TCTTTT *****
Mean pairwise ID: 63.75%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAAATG-GAACA * ** ** * ** * ************** ******* ** ** * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT HUM.LU_B TTGGGTCAGCCCAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTACTGGTCTGCCCATT ** *** * ** * *** ** **** * ** *** **** ***** ** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC HUM.LU_B CCAAGCCGGGAGTTGGGCTG-AGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCT-----C ***** * * ***** * ** * * * *********** * * ** ** * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC HUM.LU_B CTAGAGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCC *** ***** **** ************ *************** ** ****** ** ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CTC HUM.LU_B GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTC * ************* *** * *** ***** ** * * * * * *** ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT HUM.LU_B TTAATCGGACCATTTCCTTT * * * ***** ****
Mean pairwise ID: 63.78%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATG--GGACGT * *** * *** ** ******* * ** ** ** * ******** * ** *** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ARA.TH_C TGGGTCGATCTCATTGGG---CCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCC ***** * * * ** * * * * * * ** *** * ********* **** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ARA.TH_C AAGTTGGG-AGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGT ****** * ** * ** * *********** * ** * ******* ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG ARA.TH_C GGGGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTG ** ** * *************************** *** ****** ****** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ARA.TH_C GAAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG ******* ******* *** ** **** ** ** * *** * * ORY.SA_B ACCACCACCTTT ARA.TH_C ACCATCACTTT- **** *** **
Mean pairwise ID: 63.84%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * *** * ********* ******** ********** * ***** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA HUM.LU_B GGTC-AGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC **** * * ***** ** * * * ** * **** ****** ******* LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG ******** **** ** **** * * * * ** ******** * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA * ************************* ****** ******* ************ LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCAT * ****** ***** *** * * ** * * * **** ***** LYC.ES_F CACTTTT HUM.LU_B TTCCTTT * ***
Mean pairwise ID: 63.84%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTG-GAATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ******* *** * * *********** * ************ *** ** *** * * LYC.ES_G GG-GCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** ** **** **** * ****** **** ****** LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** ** **** * * * * *** **** * LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** ************ *********** *** ** ****** * ********* LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC *** ** *** *** *** ** * *** **** * ** ***** * ***** LYC.ES_G CACTTTT TRI.AE_A C------ *
Mean pairwise ID: 63.84%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ** ****** ** ****** ********** ********* * *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** ** * ****** ** ********** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC **** * ***** * *** **** * **** ** * *** **** HUM.LU_D TTCTTTT LYC.ES_I CATTTTT ****
Mean pairwise ID: 63.84%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** ***** ************ ***** ****** ****** * ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * * * ** ** ****** ******* ***** ******** ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGT-GGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG **** * *** * * **** *** * * * *** * ** * * ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************** *********** *** * ** ***** *** ***** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCAC * *** * * ** *** ** ***** *** * * *** ** * ****** ARA.TH_F CATTTT- LYC.ES_B CACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 63.84%
HUM.LU_B --GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GAACATTG TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT * *** ** * ** *** ***** ********** ** ** * * * HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTTG *** * ** * * ** * *** * *** **** ****** ******* * HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC TRI.AE_B GTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTA-AGTGGCAGGC * *** ****** *** * ******* ** * * * * *** * ** ***** *** HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT TRI.AE_B ACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGAT * *** ************************ ** * ***** ** * ********** HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCAT TRI.AE_B AACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCAT--AGCAGACCAC *** ***** *** * *** ** * ** * ** * * * * ***** HUM.LU_B TTCCTTT TRI.AE_B CATCTTT ****
Mean pairwise ID: 63.84%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG **** ***** ** ****** ********** ********* * *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** ** * ****** ** ********** HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCC--AATTAAACCAC **** * ***** * *** ***** * * ** ** * *** **** HUM.LU_A TTCTTTT LYC.ES_I CATTTTT ****
Mean pairwise ID: 63.86%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAAATG-GGACT * ** *** ** * ** * ************** ******* ** ** *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT HUM.LU_D TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTACTGGTCTGCCCATT ** *** * ** * *** ** **** * ** *** **** ***** ** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC HUM.LU_D CCAAGCCGGGAGTTGGGCTG-AGTGACCTGGGCGAAGGC------TGGGTTGCGCAGCTC ***** * * ***** * ** * * * ********* * * * * * * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC HUM.LU_D CTAGAGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTC *** ***** **** **************************** ** ****** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGC--TTCTGGCCCAGAGTCCCT HUM.LU_D GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACT * ************* *** * *** * *** ** * * ** * * * ** ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT HUM.LU_D CTTAATAGGACCATTTCTTTT ** * ***** ***
Mean pairwise ID: 63.96%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** *** ** ****** ********** ********* * *** * ** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG * * *** * * ** *** *** ** **** ****** ******* LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC ******* **** ** *** * *** * * ******** ** * * LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************************ *** ** ** ***** * ************* LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA HUM.JA_B AACGGGCCGGTGC-TGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA ***** ******* * * * *** * * ** **** * *** **** LYC.ES_G CCACTTTT HUM.JA_B TTTCTTTT *****
Mean pairwise ID: 63.96%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG * ** ** ** **** * ** *** **** ******* ** ** *** ** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * **** ** **** * ** * * * *** ******* ******* * HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG **** *** *** ******** ** * ** * *** *** ****** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA *************** ******************* **** ** * ******** *** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGA-TCTCTCCTGGACCA * * * ** * * * ***** *** * ** * ** *** ****** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_D CCACTTT- ****
Mean pairwise ID: 64.08%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ******* * ****** * ** ***** **** ** ***** *** * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** ** * ** ** * * ** ***** ***** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ***** ** **** ** * * * ****** ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA **************************** ** * **** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTC-TCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG--CTCCAATAAACAA * ** * *** **** *** * ** ** *** *** * * *** * ** * ARA.TH_D CCACTTT-- LYC.ES_H CCACCTTTT **** **
Mean pairwise ID: 64.08%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ** ****** ********* **************** * ** *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC ** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ****** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG- ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_E GACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * *********** *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA ***** ******* * ** * **** * ******* * ** * ** * HUM.LU_D TTTCTTTT- LYC.ES_E CCACATTTT * ***
Mean pairwise ID: 64.08%
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATG-GGACTTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ** ** ** * ** ******** *********** * **** * ** * HUM.JA_A GGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACT-GCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * *** * ** * **** * ** *** ** ***** * **** ******* HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTG--TGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGG-TCTCACGGTCCATAATGTGGCA * * *** * * ** * * ***** ****** ** *** * * *** * ** HUM.JA_A GGCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAG TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG **** ************ **************** ** ****** * * ******* HUM.JA_A GATAACGGGTCGGTGC-TACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACC TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAAT-TGGGCCTCGCA-GCCTACTCCAGCAGACC ***** *** ** *** * * ***** *** * *** ** ** * ****** HUM.JA_A ATCTCTTTT TRI.AE_A ACC------ * *
Mean pairwise ID: 64.17%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** ******* * ****** **** ******** ************* * ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * ** ** * ** ** * * ** **** ****** ******* ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG **** ***** ** *** * ** * * * ******* ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * ************************ *** * * ** *** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGAT-CCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTC-CAATTAAACCA * * * ** * ** ** * *** ** *** * *** * ** * * **** ARA.TH_D CCACTTT LYC.ES_O CCACTTT *******
Mean pairwise ID: 64.17%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ** ***** ** ****** ********** ********* * *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** * * ******* ** ********** HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTG--CTCTAATTAAACCAC **** * ***** * *** ***** * * ***** **** **** HUM.LU_A TTCTTTT LYC.ES_B CACTTTT *****
Mean pairwise ID: 64.17%
TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT HUM.JA_A ---GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACT--TT * **** ** * ** *** ***** ********** ** * ** * * ** TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTT-GTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT HUM.JA_A GGGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC ** * * **** *** *** * ******** ****** ******* TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG * *** ****** *** ******* *** * * *** * *** * ** ** TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ** *** ************************ ** * ***** * * ********* TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAG-CAGACCAC HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT **** ** ** *** * ****** * *** * * * * ** ******* TRI.AE_B CATCTTT HUM.JA_A CTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 64.24%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTG--GAACAG * ***** * *** ** ****** ******* **** ************* * * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCAC-TATGCGGCCCGCCCGTTCC ARA.TH_D TGGTTCAATT---CCTCGGGTC-GGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCC * ** ** * * ***** * **** * * ** *** * * **** *** ORY.SA_B AAGTTGCG--TAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGA ARA.TH_D AAGCTGTGAGTAATCTGTGTGGG----TCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAA *** ** * ** ******** ********** ** * * *** * ORY.SA_B GT-GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACG ARA.TH_D GTCGGAGGGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCA ** ** ***** ***************************** *** *** *** ** * ORY.SA_B GTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCC-CAAGTGCCTTCCATG ARA.TH_D GTGGATGGATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTC ***** **** * * ** * * * * ** ** * ** * ** * ** * ORY.SA_B GCAGACCACCACCTTT ARA.TH_D CTGGACCACCACTTT- ********* **
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** ** ****** ********** ********* * ***** *** HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** **** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************************** *** * * ****** ** ********** HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTG-GTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCT--GCTCT-AATTAAACCA **** * ***** * ** ***** * ** *** * **** *** **** HUM.LU_B TTTCCTTT LYC.ES_B CCACTTTT * ***
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.JA_B ---GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACT--TT TRI.AE_B NCCGAGCTAGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCTT * **** ** * ** *** ***** ********** ** ** * * ** HUM.JA_B AGTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_B GGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTT-GTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT ** *** **** ** *** * ******** ****** ******* HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGCAGG * *** * **** *** ** **** * * ** * **** * *** * ** ** HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** *** *************************** * ***** * * ********* HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCA **** ***** *** ** *** *** * *** * * * * * * ** ** **** HUM.JA_B TTTCTTTT TRI.AE_B CCATCTTT ***
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATG-GGACTTT TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT *** ** ** ** * ** *** ***** ********** ** ** *** * HUM.LU_A GGGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT *** * ** * * ** * *** * *** **** ****** ******* HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG TRI.AE_B GGTAGT-GGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTA-AGTGGCAGG ** *** ****** *** * ******* * * * * * ** * * ** ***** ** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA TRI.AE_B CACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAAC-TGCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** *** ******* **************** ** * ***** * * ********* HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA TRI.AE_B TAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC-CATAGCAG-ACCA **** ***** *** * **** ** * ** * * * * * ** ** **** HUM.LU_A TTTCTTTT TRI.AE_B CCATCTTT ***
Mean pairwise ID: 64.29%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ** * ****** ** * **** ** ** * ********* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TG-TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA * *** ** * ** ** ***** * **** ****** ******** ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT-GGGGTG **** ****** ** *********** ** * ******* ** * * ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************************* *** ** **** ** ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTC-TCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCA LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA * * * *** * * ** ** ** * * * * *** * *** * ** * ARA.TH_D CCACTTT- LYC.ES_C CCACATTT **** **
Mean pairwise ID: 64.29%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG **** ***** ********* **************** * ** *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC ** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGT-CCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA ***** ******* * ** *** * * ***** * *** **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_O CCACTTT- ****
Mean pairwise ID: 64.31%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_H NCCGAGCTCTGTAGCGAGTGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTAGTGT-GGATGT ****** ****** ****** ********************** **** ***** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_H C-AATTGTG-GTGCATGTG-CCTGGGTCTA-GTGCTACAAACTGTGGACCACCCATTCCA * * ** * ** ** * *** * ** * * ** ** ** ** *** ***** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG ZEA.MA_H AGTTGCGTAGTGGGTTTCGGATGCCTTGGCGAAAGCTTT-GCATCCCAACAC-TAAAGTG ********** * ** * ** **** ****** *** ** **** *** ** **** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_H GCGGACATTGCGTGAGGCTGGCTTCATAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCCACCAGCGGTGG **** *************** **** ********************* *** ****** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA ZEA.MA_H AAGGATAATGAGTCGCTATGCTATAGGCCCAAT--------------------------- ******** * * **** ***** * ORY.SA_B CCACCACCTTT ZEA.MA_H -----------
Mean pairwise ID: 64.38%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTG-GAATATT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ******* *** ** * *********** ******* **** *** ** *** * LYC.ES_O GGGCTGTCCCAGATGGC-TGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTA-CTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTTG * * * * * *** *** ** **** **** * ****** **** ****** LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGT-CCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG TRI.AE_A CGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCAGG * **** * *** * ** ** **** * * * * *** **** * LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA TRI.AE_A CACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAGGA ** ************ *********** *** ** ****** * ********* LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC TRI.AE_A TAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGG-GCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCAC *** ** *** *** *** ** * *** **** * ** ***** * ***** LYC.ES_O CACTTT TRI.AE_A C----- *
Mean pairwise ID: 64.40%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * ** ARA.TH_G GA-TCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** *** ** *** ** *** *** ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_K AGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-CGGGGCG **** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** * ******************** ** * ********** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA ** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * *** ARA.TH_G ACCATTTT- LYC.ES_K ACCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 64.40%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * ** ARA.TH_G GA-TCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** *** ** *** ** *** *** ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_A AGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-TGGGGCG **** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** * ******************** ** * ********* ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA ** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * *** ARA.TH_G ACCATTTT- LYC.ES_A ACCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 64.49%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCAT--GTGGGAAATG-GGACT **** ** ** * ** * ************** ******* ** ** *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT HUM.LU_A TTGGGTCAACCTAGTGGATC-GGGTCCAGTGTTAGCTG----CTTACTGGTCTGCCCATT ** *** * ** * *** ** **** * ** *** **** ***** ** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC HUM.LU_A CCAAGCCGGGAGTTGGGCTG-AGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCAC-----GTC ***** * * ***** * ** * * * ******** ** * * ** * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC HUM.LU_A CTAGAGTGGAGGGCAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTC *** ***** **** **************************** ** ****** * ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGC--TTCTGGCCCAGAGTCCCT HUM.LU_A GGCAGTGGAAGGATAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACT * ************* *** * *** * **** ** * * ** * ** * ** ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT HUM.LU_A CTTAATAGGACCATTTCTTTT ** * ***** ***
Mean pairwise ID: 64.50%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** ** **** * ** *** **** ******* ** ** * *** ** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * *** * * ** **** * ** * * * *** ******* ******* * ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA-GGAGGG **** ******* ********** * ** * * * ****** ****** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ******************************** ** **** ** * ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT * * * *** * ** * **** **** * * * *** ***** ARA.TH_D CACTTT- HUM.JA_A CTCTTTT * ****
Mean pairwise ID: 64.50%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ** ****** ** ****** ********** ********* * *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT ** * ** * * *** *** *** ** *** ***** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG ******* *** ** **** *** * * ** ** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT *************** *********** *** * * ******* ** ********** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTG--CTCTAATTAAACCAC **** * ***** * *** **** * ******* **** **** HUM.LU_D TTCTTTT LYC.ES_B CACTTTT *****
Mean pairwise ID: 64.61%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG * ** ** ** *** ** ** ********* ****** *** * * *** ** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG * ** ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* * HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG **** * * * *** ******* *** * * * *** *** ****** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA *************** ******************* ******* * ******** *** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA * ** * * * * * **** *** ** * * ** *** * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_E CCATTTT- ***
Mean pairwise ID: 64.61%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG **** ***** ** ****** ********** ********* * *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGT-CCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA ***** ******* * ** *** * * ***** * *** **** HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_G CCACTTTT *****
Mean pairwise ID: 64.61%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** * **** * ** **************** * * ******* ** ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** ***** ** **** * **** ** **** ******* ******* * ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAG-TGGAGGG **** * * * *** * ******* ** * * * * *** ** * ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA * ***** ******* **************************** * ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTAC-TTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA ***** ** ** ** ***** *** ** * * * * * * **** ARA.TH_G CCATTTT- HUM.LU_B TTTCCTTT **
Mean pairwise ID: 64.61%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** **** * * ************* ***** * *** ******** ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** *** ** *** ** *** * **** ***** ********* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG **** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA * ***** ******* *********** *** * * ******* *** ***** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGC--TCTAATTAAACCA **** *** * * **** ** * * * *** * * ** ***** ARA.TH_G CCATTTT- LYC.ES_B CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 64.61%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG * ** ** *** ** * *** * ******** * ** ** **** ** *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT HUM.LU_C GGTCAACC-CAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCC **** * * ** *** **** * * *** * * * * ************ ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA HUM.LU_C GGGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGG ***** ** * *** * ********* * * ** ***** *** ** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA HUM.LU_C CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * ************ ************** * ************ * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA HUM.LU_C TAACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA * ******* *** ***** ** ** * * * ** * * ** ****** ARA.TH_C TCACTTT- HUM.LU_C TTTCTTTT * ****
Mean pairwise ID: 64.61%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** ** * ******* ****** ****** ****** * * *** * ** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTT-GTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG ***** * * ** **** * * * **** ****** ******* LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC ******* * **** *** ****** *** ** * ********** ** * * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************************* *** * ********** ************* LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCA-CCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA **** *** *** * ** * * ** ** **** * ** * ** * LYC.ES_C CCACATTT HUM.JA_B TTTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 64.74%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** * * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA *** * * * * ** ***** *** ** ** * * **** **** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTT-AGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ARA.TH_C GTTGGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG ***** *** * *** ***** **** * *** ****** ** ***** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCT-CCCGCTCTTGACGGTGG * * ************ ************** *** ** *** ******* ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG--AGCCTCACTAAGCAG ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG ***** ******* *** * ******** ** * **** **** * * * * ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ARA.TH_C ACCATCACTTT- **** ** **
Mean pairwise ID: 64.82%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** * * ********* ******** ********** * * *** * *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA HUM.JA_A GGTC-AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC **** * * ***** ** * * * ** * **** ****** ******* LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG ********* *** *** **** * * * * * ** ** ** ** * LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * ************************* **** * ******** ************ LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCAT HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCACT-CTTAATCAGACCAT * ***** ***** *** * * * ** ** * * **** * ***** LYC.ES_F CACTTTT HUM.JA_A CTCTTTT * *****
Mean pairwise ID: 64.82%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ** ************ ***** **** * ******** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * ** ** ** ** *** ****** ***** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************************** *** * ** * *** *** ***** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC * ** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ****** ARA.TH_E CATTTT- LYC.ES_I CATTTTT ******
Mean pairwise ID: 64.94%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG * ** ** * **** * ** **************** * * *** ** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** * ** **** * **** ** **** ******* ******* * HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAG-TGGAGGG ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG **** * * * *** * ******* ** * * * *** ** * ***** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA * ***** ************************************** ******** *** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ***** ** ** ** ***** *** * * ** * * * * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_G CCATTTT- ***
Mean pairwise ID: 64.94%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** ** ******** *** **** ***** * **** *** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * ** ** ** ** *** ****** ***** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA **************************** ** * ******* ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGC-TCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATG-AACC LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC * * * * * *** *** ** ** **** *** * ** *** **** ARA.TH_E ACCATTTT LYC.ES_H ACCTTTT- *** ***
Mean pairwise ID: 64.94%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ***** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** *** ** *** ** *** * **** ***** ********* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_H AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG **** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ***** ******* ************ ** * ********** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACC ** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * **** ARA.TH_G ACCATTTT LYC.ES_H ACCTTTT- *** ***
Mean pairwise ID: 64.95%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** * * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA *** * * * * ** ***** *** ** ** * * **** **** * **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTT-AGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ARA.TH_C GTTGGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG ***** *** * *** ***** **** * *** ****** ** ***** ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCT-CCCGCTCTTGACGGTGG * * ************ ************** *** ****** ******* ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG--AGCCTCACTAAGCAG ARA.TH_C AAGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGG ***** ** **** *** * ******** ** * **** **** * * * * ZEA.MA_D ACCACCATCTT ARA.TH_C ACCATCACTTT **** ** **
Mean pairwise ID: 65.05%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ******** ****** * ******** ******** *** ** **** *** * ** ARA.TH_G GA-TCGGCCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTG--GTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAC * * ** *** ** *** ** *** *** ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_J AGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAG-TGGGGCG **** * * * * **** *** * ** * * ** ****** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ** * ******************** ** * ********** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACA-CAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTG---CTCCAATAAACA ** ** *** * * * *** * ** ** * * *** * * * * * *** ARA.TH_G ACCATTTT- LYC.ES_J ACCACCTTT **** **
Mean pairwise ID: 65.15%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** ** *** ** ********* ****** *** * * ****** ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTTCTAGAGTCGGAGGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGT-GATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG **** **** ** ** ********* ** * *** * ** * ****** ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA *************** **************** ** ******* * ******** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTT-GGGCCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT * **** * * * ** * **** **** * * * *** * **** ARA.TH_F CATTTT- HUM.JA_A CTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 65.15%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT *** ****** ** * ****** * ** ***** * ** *** * **** ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT TRI.AE_A GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGT-GTGCTAC-TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * * ***** *** **** * **** * *********** ********* ARA.TH_C GGGAGTTGAG--GCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGG TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGTGGCA * * ** ** **** * ***** *** ******** * ** **** ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG TRI.AE_A GGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAAG * ** ************ ************** * ** ****** ********** ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA TRI.AE_A GATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGC-AGACCA *** * ***** *** *** ** *** * * ** * * **** ***** ARA.TH_C TCACTTT TRI.AE_A CC----- *
Mean pairwise ID: 65.15%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ***** ****** ** ************ ******* ** * ******** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * ** ** ** ** *** ****** ***** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************************** *** * ** * *** *** ***** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAAT-TAAACCAC * ** * * ** *** ** ***** *** * ** ** * ****** ARA.TH_E CATTTT- LYC.ES_N CATTTTT ******
Mean pairwise ID: 65.25%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ******* ** ********** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************************* LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_M GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA ******* *** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_M CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_M ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_M CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 65.26%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ** ****** ********* **************** * ** *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC ** ** ** * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA ***** ******* * ** * **** * ******* * *** **** HUM.LU_D TTTCTTTT LYC.ES_O CCACTTT- ****
Mean pairwise ID: 65.26%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ********* **** * *** **** ** ************* ****** * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** **** * * ****** **** * ** ******************* LYC.ES_E ACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** **************************** * ******** **************** LYC.ES_E AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC ***** * **** * *** * **** *** ********** ** * ***** ** LYC.ES_E CACATTTT LYC.ES_L CACTTT-- *** **
Mean pairwise ID: 65.26%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** * * ************* ***** * *** ******** ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** *** ** *** ** *** * **** ***** ********* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_I AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG **** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA * ***** ******* *********** *** ** * ****** *** ***** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGC--TCCAATTAAACCA **** *** * * **** ** * * * *** * * ** ** ***** ARA.TH_G CCATTTT- LYC.ES_I CCATTTTT *******
Mean pairwise ID: 65.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ***** ** ****** * ****** * ******** *** ***** * *** ** ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT ARA.TH_G GATCGGCCC--ACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCT * *** * *** *** ** * * *** ***** * ***** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAG-TGGGGG ARA.TH_G GTGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGG * **** ** * * * * ******** * * * * * * *** ** * * ** ARA.TH_C AGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG ARA.TH_G GTATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGG * **** ******* ************** * ************ * ***** ** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGC--TCCGATTGGACC ARA.TH_G ACAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC * **** * *** * * ******** ** * ** *** *** *** ARA.TH_C ATCACTTT ARA.TH_G ACCATTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 65.27%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGA---CG *** *** *** ** * ****** * ** ** ** * ** ***** * ** * * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ARA.TH_C TTGGGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAA *** * * * * ** ***** *** ** ** * * **** **** * **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTT-AGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ARA.TH_C GTTGGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGG ***** *** * *** ***** **** * *** ****** ** ***** ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ARA.TH_C GGGAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGA * * ************ ************** *** ****** ******* ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAG--AGCCTCACTAAGCAGA ARA.TH_C AGGATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGA ***** ******* *** * ******** ** * **** **** * * * ** ZEA.MA_G CCACCATCTTT ARA.TH_C CCATCACTTT- *** ** **
Mean pairwise ID: 65.37%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** ** **** * ** *** **** ******* ** ** ******* ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * *** * ** **** * ** * * * *** ******* ******* * ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG **** *** *** ********* ** * ** * * *** *** ****** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA *********************************** **** ** * ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTC--CTGGACC HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTT-GGTCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC * * * ** * ** * ***** *** * ***** * **** ***** ARA.TH_D ACCACTTT- HUM.LU_B ATTTCCTTT * * **
Mean pairwise ID: 65.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** ** * ******* ****** ****** ****** * * * *** * *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTT-GTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ***** * * *** **** * * * **** ****** ******* LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC ********* **** * ********* *** ** ********** ** * * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT * ************************* *** * ********** ************* LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTT-CAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTGCATGCAC--TCTTAATCAGACCAT **** * * *** * * * * * * *** * * ** * * ** * LYC.ES_C CACATTT HUM.JA_A CTCTTTT * * ***
Mean pairwise ID: 65.47%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * *** ******* ** ******** * ****** * ** * * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_C AA-CATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGT--GACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA * * ** ** *** * * ** * * ** ******* **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_C AAGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTG ****** * * ** * * ********** *** * * ** *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA *** ************************ ** * ********** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCA-CTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC * *** **** ** * * ** ** * * * ** ** * ** ** ** * ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_C CACATTT *** **
Mean pairwise ID: 65.58%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** * ** ********* ** *** ** *** ******** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGT--GTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA * * ** ** *** ** ** * ***** ****** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGT-GGGGTG **** * * **** * *************** **** ******* ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************************* *** ** ******* ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCA-CTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA * ** ** *** * ** * * * *** *** * * *** * * *** * ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_C CCACATTT *** **
Mean pairwise ID: 65.58%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** * ***** ******* * *** ****** ************* ******** LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG **** ******** *** * **** * **** * ************** **** ** LYC.ES_K ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** ** ********* *********** ******** ********************** LYC.ES_K AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA ** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** * LYC.ES_K CCACCTTT LYC.ES_L CCACTTT- **** **
Mean pairwise ID: 65.58%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ** ****** ** ****** ********** ********* * *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC ** * ** * * *** *** *** ** **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG ******* *** * *** * **** * * ***** ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT * ************ *********** *** * ** ***** * ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGC-TACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCC--AATTAAACCA ***** ******* * ** * **** * ******* * *** **** HUM.LU_D TTTCTTTT LYC.ES_G CCACTTTT *****
Mean pairwise ID: 65.58%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** * ***** ******* * *** ****** ************* ******** LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG ********** ** *** * **** * **** * ******************* ** LYC.ES_A ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** ** ********* *********** **** *** ********************** LYC.ES_A AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA ** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** * LYC.ES_A CCACCTTT LYC.ES_L CCACTTT- **** **
Mean pairwise ID: 65.58%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG * ** ** ** *** ** ********* ****** *** * ****** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG **** *** ** ******* *** * *** ** ******* ****** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA *********************************** ******* * ******** *** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA * **** * * * * **** *** ** * * ** *** * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_A CCATTTT- ***
Mean pairwise ID: 65.58%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***** ** ************ ***** **** * ******** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * * ** ** ** ** *** ******* ****** ******* ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG **** ** * **** *** *** * *** * * * ******* ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * ************************ *** * * ****** ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCA * ** * * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ***** ARA.TH_E CCATTTT- LYC.ES_G CCACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 65.58%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** * **** * ** **************** * * *** ** * ARA.TH_G GATCGGCCCAC-GGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ******** ** ****** **** ** **** ******* ******* * ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGGG **** ** * ** *** ** ******* ** * * * * ****** ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * ***** ******* **************** ************* ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA ***** ** ** * * **** ***** * *** * * * * **** ARA.TH_G CCATTTT- HUM.JA_B TTTCTTTT ***
Mean pairwise ID: 65.58%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG * ** *** ** **** * ** *** **** ******* ** ** *** ** ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * **** ** **** * ** * * * *** ******* ******* * HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTT-GCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG **** *** *** ********** * * ** * * *** *** ****** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA *************** ******************* **** ** * ******** *** HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGA-TCTCTCCTGGACCA * * * ** * * ******* *** * **** ** *** ****** HUM.LU_D TTTCTTTT ARA.TH_D CCACTTT- ****
Mean pairwise ID: 65.69%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * *** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_I GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_I TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG ****** **** * * * **** ** * ** * ** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_I GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA ** ************************ ** * * * ***** *********** ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC LYC.ES_I TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC * *** * * ** ** *** *** ** ** ** * ***** *** **** * ARA.TH_C ACTTT- LYC.ES_I ATTTTT * ***
Mean pairwise ID: 65.70%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** ****** ** ************ ******* ** ** ******** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC * * * *** ** ** ** *** ******* ****** ****** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG **** ** * **** *** *** * *** * * * ******* ** ** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_E --ACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * *********************** *** * * ****** ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGT-TAAACTA * ** * * * * ** *** ** ***** *** * * *** * * *** * ARA.TH_E CCATTTT-- LYC.ES_E CCACATTTT *** **
Mean pairwise ID: 65.80%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** ***** ** ************ ***** **** * ******** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * * ** ** ** ** *** ****** ***** ******** ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_B AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGT-GGGGCG **** ** * **** *** **** *** * * * ****** ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA *************************** *** * ** ***** *** ***** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAAT-TAAACCAC * ** * * ** *** ** ***** *** * * *** ** * ****** ARA.TH_E CATTTT- LYC.ES_B CACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 65.81%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** ****** * ******************** **** ******** * ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTAC * * **** ** ** *** ** *** * ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_E AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAG--TGGGGT **** * * * * ** **** *** * ** * * ** ****** ** ** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_E GGACCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA *** ******* *********** *** * ** ***** * ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAAT-CCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGT--TCTAGTTAAACT ***** ** *** *** * *** ** * * * *** ** * ** *** ARA.TH_G ACCATTTT-- LYC.ES_E ACCACATTTT **** **
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** ** *** ** ********* ****** *** * * ****** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGT-GATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA-GGAGG **** **** ** ** ********* ** ** *** * *** ** ***** ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG HUM.JA_A GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG * *************** **************** ** ******* * ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA HUM.JA_A ATAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCA ** **** * * * ** * **** **** * * * *** * **** ARA.TH_A CCATTTT- HUM.JA_A TCTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 65.91%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG * ** ** ** *** ** ********* ****** *** * ****** ** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGT-GGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC--AGGTTCTAGAGTCGGAGGG **** *** ** ******* *** **** * ** ******* ****** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA *********************************** ******* * ******** *** HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA * **** * * * * **** *** ** * * ** *** * * **** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_F CCATTTT- ***
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG ***** ** ****** ****** * *** **** **** **** * ****** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCC-TCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT * *** * * * ** *** * * ***** ***** * ***** ****** * ARA.TH_A GTGAGTAATTAGTGTTGAGTT-GAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAG ARA.TH_C GGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGT-GGGG * **** * * * ** *********** ** ** ********* ** * ARA.TH_A GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG ARA.TH_C GAGACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG * * ************ ************** * ** ******* * ***** * ARA.TH_A GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACC *** **** * * * * ******** ** * *** ** ** ** *** ARA.TH_A ACCATTTT ARA.TH_C ATCACTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA * ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT HUM.JA_B GTTCGGCC-CATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCC * *** * ****** *** * * * * *** * **** * ************ ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA HUM.JA_B GAGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGG * ******** ** * ** ****** ** * ** *** ** ** ** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * *************************** * ************ * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA * ******* *** * ***** *** ** * *** * * ** ****** ARA.TH_C TCACTTT- HUM.JA_B TTTCTTTT * ****
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ***** ****** * ******************** *** ******** ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTT * * *** *** ** *** ** *** * **** ***** ********* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_N AGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAG-TGGGGCG **** * * * * ** **** **** ** * * ** ***** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA * ***** ******* *********** *** ** * ****** *** ***** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGC--TCCAATTAAACCA **** *** * * **** ** * * * *** * * ** ** ***** ARA.TH_G CCATTTT- LYC.ES_N CCATTTTT *******
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** * **** * ** **************** * * * *** ** ** ARA.TH_G GATCGGCCCAC-GGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** ***** ** **** * **** ** **** ******* ******* * ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAG-GAGGG **** * * ** *** * ******* * * ** ** * * ****** ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * ***** ******* **************** ************* ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTC-ACTGCATGCACTCTTAATCAGACCA ***** *** ** ** **** ****** *** * * * **** ARA.TH_G CCATTTT- HUM.JA_A TCTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 65.91%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** ** **** * ** *** **** ******* ** ** *** ** * ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG **** * * ** ***** * ** * * * *** ******** ******* * ARA.TH_D TGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGGG **** * ******* * * * ****** ** ** * * * * ****** ******* ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ******************************** ** **** ** * ******** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCT-GGACCA HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA * * * ** * ** ** **** **** * *** ** * * ****** ARA.TH_D CCACTTT- HUM.JA_B TTTCTTTT ****
Mean pairwise ID: 66.01%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ** ** ******* ******** * ******** ** *** * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_N GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_N TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG ****** **** * * * **** ** * ** * ** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_N GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGA ** ************************ ** * * * ***** *********** ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC LYC.ES_N TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC * *** * * ** ** *** *** ** ** ** * ***** *** **** * ARA.TH_C ACTTT- LYC.ES_N ATTTTT * ***
Mean pairwise ID: 66.02%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ** * ********* ****** ** * * ******** ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTG--TGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA * ***** *** ** **** ** ** ***** ****** ******* ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAG-TGGGGTG **** * * * ** *********** *** * * ** * ****** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_C GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ***** ******* *********** *** ** ********** ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCA-CTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_C TAACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGT--TCTAGTTAAACT **** * * ** * ** * ** * * *** * *** ** * ** *** ARA.TH_G ACCATTTT- LYC.ES_C ACCACATTT **** **
Mean pairwise ID: 66.02%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** * * ************* ***** * *** ******** ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * *** *** ** *** ** *** * ***** ****** ******** ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_G AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAG-TGGGGTG **** * * * * ** **** *** * ** * * ** ****** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * **** ******* *********** *** * ** ***** * ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAAT-CCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGC--TCCAATTAAACC ***** ** *** *** * *** ** * * * *** * ** ** **** ARA.TH_G ACCATTTT- LYC.ES_G ACCACTTTT **** ***
Mean pairwise ID: 66.02%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** ** *** ** ********* ****** *** * *** *** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG **** *** ** ******** *** * **** * ******* ****** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA *************** ******************* ******* * ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA--TGAACC HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGT-CCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC * **** * * ** * **** *** ******* *** ** * *** ARA.TH_A ACCATTTT- HUM.LU_B ATTTCCTTT * **
Mean pairwise ID: 66.02%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** ***** * * *** * *** * ******** ********** ** LYC.ES_H AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ************************* ******** ********************** LYC.ES_H AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA ** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** * LYC.ES_H CCACCTTTT LYC.ES_L CCACTTT-- **** **
Mean pairwise ID: 66.02%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ** **** * ********* ******** ********** * *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAG-TGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA **** * ** * ***** ** * * * ** * **** ****** ******* HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGG ******** **** ** **** * * * ** ******** * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_F ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** ****** ******** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCC--ACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACC LYC.ES_F CACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAACC ****** ***** ** *** ** * * ** ** * **** *** HUM.LU_D ATTTCTTTT LYC.ES_F ATCACTTTT ** *****
Mean pairwise ID: 66.12%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* * LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** ***** * * *** * *** * ******** ********** ** LYC.ES_N AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ***************************** ** *** ***** ** ********** LYC.ES_N AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCC-TGATGGGTTGCTCCAATTAAACCAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC **** *** *** ** ********* ****** ******* ******** ******** LYC.ES_N CATTTTT LYC.ES_L CACTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 66.12%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* * LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** ***** * * *** * *** * ******** ********** ** LYC.ES_I AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ***************************** ** *** ***** ** ********** LYC.ES_I AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCC-TGATGGGTTGCTCCAATTAAACCAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC **** *** *** ** ********* ****** ******* ******** ******** LYC.ES_I CATTTTT LYC.ES_L CACTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 66.13%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG **** *** * ********* ******** ********** * *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAG-TGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTT--CTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA **** * ** * ***** ** * * * ** * **** ****** ******* HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG ******** **** ** **** * * * * ******** * HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA * ************* *********** ****** ******** ************ HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCC--ACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGAC LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTG---CCTAATTAAAC * ****** ***** ** **** ** * **** ** * **** ** HUM.LU_A CATTTCTTTT LYC.ES_F CATCACTTTT *** *****
Mean pairwise ID: 66.23%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG **** ** ** * ******* ****** ****** ****** * * *** * *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGG-CTTGTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA ** ** * * *** * **** * * * **** ****** ******* HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG ******** *** * ******* **** *** ***** ***** * * HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** *** ** ********** ************* HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTC-ACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA **** *** *** * * ** ** * ** * ***** * ** * ** * HUM.LU_A TTTCTTTT LYC.ES_C CCACATTT * ***
Mean pairwise ID: 66.23%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** * ***** ******* * *** ****** ************* ******** LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG ************* *** * **** * **** * ******************* ** LYC.ES_J ACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** ** ********* *********** ******** ********************** LYC.ES_J AATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAA LYC.ES_L AACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCA ** ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ******** ***** * LYC.ES_J CCACCTTT LYC.ES_L CCACTTT- **** **
Mean pairwise ID: 66.34%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** ** *** ** ********* ****** *** * *** *** ** ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * * ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGC--AGGTTCTAGAGTCGGAGGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG **** *** ** ******** *** **** ** * ******* ****** ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA *************** ******************* ******* * ******** *** ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA--TGAACC HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTT-GGTCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC * **** * * ** * **** *** ******* *** ** * *** ARA.TH_F ACCATTTT- HUM.LU_B ATTTCCTTT * **
Mean pairwise ID: 66.45%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ** ** ******* ******** *************** ** * * * * * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_K GG-CTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGG--TGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA ** * * ** ** *** * ** ****** ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_K CAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCG **** * ** * * * * *** *** ** ** * *** ** **** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_K GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ****** ********* ************ * ** ********** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_K TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC * * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** * ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_K CACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 66.45%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ************* * *** **** ** **** * ****** ******* * LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAA-TGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** ***** * * *** * *** * ******** ********** ** LYC.ES_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ***************************** ** ********* ** ********** LYC.ES_B AACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCC-TGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC **** *** *** ** ********* ** *** ************* ** ******** LYC.ES_B CACTTTT LYC.ES_L CACTTT- ******
Mean pairwise ID: 66.45%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * *** ** ******* ******** *************** ** * * * * * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_A GG-CTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGG--TGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA ** * * ** ** *** * ** ****** ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_A CAGAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG ****** * * * * * *** *** ** ** * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_A GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGC-TCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ****** ********* ************ * * * ********* * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_A TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC * * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** * ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_A CACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 66.56%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG * ** *** ** *** ** ** ********* ****** *** * * *** ** ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG * ** ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* * HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTT-GCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG **** * * * *** ********* ** * * *** *** *** ****** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA *************** ******************* ******* * ******** *** HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA * ** * * * * ** **** *** **** * ** *** * * **** HUM.LU_D TTTCTTTT ARA.TH_E CCATTTT- ***
Mean pairwise ID: 66.56%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG * ** *** * **** * ** **************** * * *** ** ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_G GATCGGCCCA-CGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** * ** **** * **** ** **** ******* ******* * HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTT-GCGCAGCTCCTAGAG-TGGAGGG ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG **** * * * *** * ******* * * * * * * * *** ** * ***** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA * ***** ************************************** ******** *** HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ***** ** ** ** ****** *** * * **** * * * * **** HUM.LU_D TTTCTTTT ARA.TH_G CCATTTT- ***
Mean pairwise ID: 66.56%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ** ** ******* ******** *************** ** * * * * * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_H GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_H TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG ****** **** * * * **** ** * ** * ** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_H GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ** ************************* * ** ********** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_H TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC * * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** * ARA.TH_C CACTTT-- LYC.ES_H CACCTTTT *** **
Mean pairwise ID: 66.67%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** ** * ******* ****** ****** ****** * * ***** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTT-GTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ****** * * *** **** * * * **** ****** ******* LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ******** *** * ******** **** *** ******* ***** * * LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT * ************************* *** ** ********* ************* LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG---TTCTAGTTAAACT HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTAC-TTGGTCCACC--ATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC **** *** *** * * ** ** * **** *** * * ** * ** LYC.ES_C ACCACATTT HUM.LU_B ATTTCCTTT * * ***
Mean pairwise ID: 66.67%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ***** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_B GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCT ** * * ** ** *** * ** ******* ***** * **** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_B TAGAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCG ****** **** * * * **** ** * ** * ** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_B GAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGA ** ************************ ** * * ******* *********** ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCATC LYC.ES_B TAACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC * *** * * ** ** *** *** ** ** ** ** **** *** **** * ARA.TH_C ACTTT- LYC.ES_B ACTTTT *****
Mean pairwise ID: 66.78%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG ** ** *** ** ** ********* ****** *** * * * *** ** ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * * ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* * ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGA-GGAGGG **** * * ***** ********* ** ** ** *** ****** ****** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ******************************** ** ******* * ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT * ** * * * * ** * **** **** * * * *** * **** ARA.TH_E CATTTT- HUM.JA_A CTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 66.88%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ***** ** ****** ****** * *** **** **** **** * ****** ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT ARA.TH_F GTTCGGT-TCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCT * *** * ** * ** *** * * ***** ***** * ***** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGA-GGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG ARA.TH_F GTGAGTAATTAGTGTTGAGTT-GAGCGAAGGCTTGGCTTGCAGGT--TCTAGAGTCGGAG * **** * * * ** *********** ** * ** ** ******** ** * ARA.TH_C AG-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG ARA.TH_F GGTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACG * * ************ ************** * ** ******* * ***** * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACC ARA.TH_F GATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACC *** **** * * * * ******** ** * *** ** ** ** *** ARA.TH_C ATCACTTT ARA.TH_F ACCATTTT * ** ***
Mean pairwise ID: 66.88%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG * ** *** ** *** ** ********* ****** *** * ****** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG **** *** ** ********* ** * **** * ******* ****** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA *********************************** ******* * ******** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA * **** * * * ** **** *** **** * ** *** * * **** ARA.TH_A CCATTTT- HUM.LU_D TTTCTTTT ***
Mean pairwise ID: 66.99%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** ** *** ** ** ********* ****** *** * * ******* ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG * ** * * ** *** ** **** ** ** **** ******* ******* * ARA.TH_E TGAGTAAGAC-GTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGG **** * * * *** ******** *** * * *** *** *** ****** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA *********************************** ******* * ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATA--TGAACC HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGCTACTTGGT-CCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC * ** * * * ** * **** *** ******* *** ** * *** ARA.TH_E ACCATTTT- HUM.LU_B ATTTCCTTT * **
Mean pairwise ID: 67.10%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG * ** *** ** *** ** ********* ****** *** * ****** ** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * ** ******* ** *** ** ** *** ******* ******* * HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGT-GGAGGGC ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCT-TGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGGT **** *** ** ********* ** * **** * ******* ****** HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT ARA.TH_F AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT *********************************** ******* * ******** **** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT ARA.TH_F CACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCAC **** * * * ** **** *** **** * ** *** * * **** HUM.LU_D TTCTTTT ARA.TH_F CATTTT- ***
Mean pairwise ID: 67.10%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** ****** ** ************ ******* ** ** ******** * ** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTG--GGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * * *** ** ** ** *** ******* ****** ******* ARA.TH_E TGAGTAAGA-CGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGT-GGGGTG **** ** * **** *** *** * *** * * * ******* ** * * ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * ************************ *** * * ****** ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAA-CCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAAT-TAAACCA * ** * * * * ** *** ** ***** *** * * ** ** * ***** ARA.TH_E CCATTTT LYC.ES_O CCACTTT *** ***
Mean pairwise ID: 67.21%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ** *** ** * ******* ****** ****** ****** * * *** * *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGG-CTTGTGTGA-CAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAA ** ** * * *** * **** * * * **** ****** ******* HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC LYC.ES_C AGAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGG ******** *** * ********* *** *** ******* ***** * * HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_C ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT * ************* *********** *** ** ********** ************* HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTC-ACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA LYC.ES_C AACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTG--TTCTAGTTAAACTA **** *** *** * * * ** * ** ******* * ** * ** * HUM.LU_D TTTCTTTT LYC.ES_C CCACATTT * ***
Mean pairwise ID: 67.21%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ***** ** ******* * ******** ** ***** ********** * *** ** ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGG-GTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGT ARA.TH_D GTTCAAT-TCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATAT-CTGAGCTGCCCAGTCCAAGC * ** ** ** * *** *** * * ** ***** *** * ***** ****** ARA.TH_C TGGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGG ARA.TH_D TGTGAGT-AATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAG ** **** * ** * ** ********* * ** * ***** *** ** * ARA.TH_C AG-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAG ARA.TH_D GGTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATG * * *************************** * ** **** ** * ***** * ARA.TH_C GATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTC-CGATTGGACC ARA.TH_D GATCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACC *** * * * * ** * ******** *** * ** ** * ****** ARA.TH_C ATCACTTT ARA.TH_D ACCACTTT * ******
Mean pairwise ID: 67.31%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** ** *** ** ********* ****** *** * ****** * ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG ****** * * ******* ** *** ** ** *** ******** ******* * ARA.TH_A TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGT-GAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGG **** * **** *** * ****** ***** *** * *** ** ****** ARA.TH_A GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG * *************** **************** ** ******* * ******** ** ARA.TH_A ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACC HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC ** **** * * *** ** **** **** *** * ** *** * * *** ARA.TH_A ACCATTTT- HUM.JA_B ATTTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 67.31%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG * ** ** **** **** *** * ******** * ** ** **** ** *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT HUM.LU_B GGTCAGCC-CAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC **** * ** *** ***** * * * *** * **** * ************ ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA HUM.LU_B GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG ******** * * * * ******** **** * ** ********* ** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA HUM.LU_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGA * *************************** * *********** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCC--GCTCC-GATTGGACC HUM.LU_B TAACGGGCCGGTGC-TACTTGGTCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACC * ******* *** * * * **** *** ** * ** *** ** ***** ARA.TH_C ATCACTTT- HUM.LU_B ATTTCCTTT ** * **
Mean pairwise ID: 67.43%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ***** ** ****** * ****** * *** **** **** * ** * *** ** ** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT ARA.TH_E GTTCGGGTCCAC-GGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCT * *** ** ******* * * * *** ****** * ***** ****** * ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA ARA.TH_E GTGAGT-AAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGG * **** ** * ** * ** ********** ** ** * * ****** *** ** * ARA.TH_C G-ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGG ARA.TH_E GTAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG * * *************************** * ** ******* * ***** ** ARA.TH_C ATTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGAT-TGGACCA ARA.TH_E ATCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCA ** ** * * * * * ******** ** * *** ** ** ** **** ARA.TH_C TCACTTT ARA.TH_E CCATTTT ** ***
Mean pairwise ID: 67.43%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ***** ** ******* ******** *************** ** * * * * * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_J GG-CTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGG--TGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA ** * * ** ** *** * ** ****** ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_J CAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCG ****** ** * * * * *** *** ** ** * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_J GACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA ****** ********* ************ * ** ********** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTT-CCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_J TAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC * * *** * ** *** * ** ** ** ** *** * ***** ** ** * ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_J CACCTTT *** **
Mean pairwise ID: 67.53%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** ****** * ******************** **** ******** * ** ARA.TH_G GATCGGCCCACG-GGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTG--GTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCAC * * **** ** ** *** ** *** * ***** ****** ******** ARA.TH_G TGAGT-GAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG LYC.ES_O AGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAG-TGGGGTG **** * * * * ** **** *** * ** * * ** ****** * * * * ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA * **** ******* *********** *** * ** ***** * ******** *** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAAT-CCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACC LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGC--TCCAATTAAACC ***** ** *** *** * *** ** * * * *** * ** ** **** ARA.TH_G ACCATTTT LYC.ES_O ACCACTTT **** ***
Mean pairwise ID: 67.76%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ***************************** LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ***** **************************************** ********* LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ******************************* **************************** LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ************************************************ ***** ***** LYC.ES_A CTTT LYC.ES_D TTTT ***
Mean pairwise ID: 67.86%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** ** *** ** ** ********* ****** *** * * *** ** * ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG ****** * ** *** ** **** ** ** ************ ******* * ARA.TH_E TGAGT-AAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGC-GGAGGG **** ** ***** * * ****** ***** * *** ****** ****** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA HUM.JA_B CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ******************************** ** ******* * ******** *** ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACCA HUM.JA_B TAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCA * ** * * * *** ** **** **** *** * ** *** * * **** ARA.TH_E CCATTTT- HUM.JA_B TTTCTTTT ***
Mean pairwise ID: 67.86%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * *** ** ****** ******** * ** ***** * *** ** * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAG--GGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCA **** **** *** ** ** * ** ** ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_F CAGAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAG-TATAGCCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATG ****** * ** * * * **** * * * * * ** * * ********* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_F GACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGA *** ************************ ** * * ******** * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCC--ACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCA LYC.ES_F TCACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCA * ****** * *** * *** ** ** * *** *** * ** * *** **** ARA.TH_C TCACTTT- LYC.ES_F TCACTTTT *******
Mean pairwise ID: 67.96%
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA ** ** *** ** ********* ****** *** * ****** * ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG ****** * * ******* ** *** ** ** *** ******** ******* * ARA.TH_F TGAGT-AATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTG--CAGGTTCTAGAGTCGGAGG HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGT-GAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAG-CGGAGG **** * **** *** * ****** ******* *** * *** ** ****** ARA.TH_F GTAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGG HUM.JA_B GCAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGG * *************** **************** ** ******* * ******** ** ARA.TH_F ATCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGA-TCTCATATGAACC HUM.JA_B ATAACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACC ** **** * * *** ** **** **** *** * ** *** * * *** ARA.TH_F ACCATTTT- HUM.JA_B ATTTCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 67.97%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG *** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ********* **** * *** **** ** ************* ******** LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** **** * * ****** **** * ** ******************* LYC.ES_O ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** ***************************** * ******** **************** LYC.ES_O AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC ***** * **** * *** * **** *** **************** ******** LYC.ES_O CACTTT LYC.ES_L CACTTT ******
Mean pairwise ID: 68.08%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ************* * *** **** ** ************* ******** LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** **** * * ****** **** * ** ******************* LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** ***************************** * ******** **************** LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC ***** * **** * *** * **** *** **************** ******** LYC.ES_G CACTTTT LYC.ES_L CACTTT- ******
Mean pairwise ID: 68.08%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG * ** **** **** *** * ******** * ** ** ******** *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT HUM.JA_A GGTCAGCC-CATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC **** * ****** ***** * * * *** * **** * ************ ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG * ****** * ** * * * ********* ***** ** ** *** ** ** ** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * *************************** ************** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACC-CAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT * ***** * *** * *** ** *** * * * ** ** ****** ARA.TH_C CACTTT- HUM.JA_A CTCTTTT * ****
Mean pairwise ID: 68.42%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ***************************** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ********************************************** ********* LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ************************************************ ***** ***** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_D TTTT ***
Mean pairwise ID: 68.51%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ***** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_E GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA ** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ******* ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ****** **** * * * * *** * *** * * * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA **** *********************** ** * ** ***** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC * **** ** ******** ** *** ** ** ** ** * ** ** ** * ARA.TH_C CACTTT-- LYC.ES_E CACATTTT *** **
Mean pairwise ID: 68.51%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG * ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* *** HUM.LU_A GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT **** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************ HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA ******** * * * * ******* **** * * ********* ** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA * ************ ************** * ************ * * ********* HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA * ******* *** * * * **** *** ** ** ** * * ** ****** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_C TCACTTT- * ****
Mean pairwise ID: 68.83%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG * ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* *** HUM.LU_D GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT **** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************ HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA ******** * * * * ********* **** * ** ********* ** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA * ************ ************** * ************ * * ********* HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA * ******* *** * * **** *** ** * ** * * ** ****** HUM.LU_D TTTCTTTT ARA.TH_C TCACTTT- * ****
Mean pairwise ID: 68.91%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGC-GGATGC ****** ****** ****** *************** ******** * ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_B TTTGCGA--TGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA * * ** * *** *** ** ** ** * *** **** **** * *** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG ZEA.MA_B AGTTG-GTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG ***** **** ** ** *** ** * *** * * * ** ***** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ** ** ** **** ******* *************** ** ***** ************ ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGAT-CCTCTCTTAGCAA * ******** ********* **** * * **** * *** * * *** ORY.SA_B ACCACCACCTTT ZEA.MA_B ACCACCATCTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 69.06%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * *** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_G GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA ** * * ** ** *** * ** ******* ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ****** **** * * * * *** * *** * * * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA **************************** ** * ** ***** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC * **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** **** ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_G CACTTTT ******
Mean pairwise ID: 69.08%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ***************************** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC ************************************************************ LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ************************************************ ***** ***** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_D TTTT ***
Mean pairwise ID: 69.18%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ****** ** * * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ****** ** ******* * * * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_M CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 69.75%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GAATGC ****** ****** ****** *************** *********** * **** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA * * * **** *** ** ** ** **** **** **** * *** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCA--CCTAGAG ZEA.MA_A AGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG-GTCTCTGCAGACCTGGAG ***** **** ** ** *** ** ***** *** * *** ***** *** *** ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGT *** ** ** **** ******* *************** ** *** ** ******** ORY.SA_B GGAAGGATAACGG-GCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC ZEA.MA_A GGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGC ** ********* ********* *** ** *** ** * *** * ** ORY.SA_B AGACCACCACCTTT ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT * ******* ****
Mean pairwise ID: 70.19%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGT-GAACGC ****** ** *** ****** ******* ******* *** *** *** * * ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRI.AE_A T--GTTGTA-GCGCTGCGGGCCTG-GTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCA ** ** ***** *** *** * *** *** *** *************** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGT-GTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT TRI.AE_A AGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT ********** * * ** ** * ***** *** * * ** * * * ** ** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG *** ** * ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG ********* *********** *** * ** ** **** **** * **** ORY.SA_B ACCACCACCTTT TRI.AE_A ACCACC------ ******
Mean pairwise ID: 70.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * *** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_O GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA ** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ****** **** * * * * *** * *** * * * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA **************************** ** * ** ***** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC * **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** **** ARA.TH_C CACTTT LYC.ES_O CACTTT ******
Mean pairwise ID: 70.42%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT ******** *********************** ** *** * * **** * LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG TRY.BR_A TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG ***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* * LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG TRY.BR_A ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG * * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * *** LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG TRY.BR_A TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTCGAGAAGCACACCGAG ********* **************** ******** * ***** **** ******* * LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT TRY.BR_A GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- **** * *** ** * ******** * * * ** **
Mean pairwise ID: 70.65%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** * * * *** ZEA.MA_B -TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TRI.AE_A GTTGTAGCG--CTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG-CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT *** * * ******** ** * **** ** ** *** **** * ****** ZEA.MA_B TG-GTAGTGTCTGAC--GGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG ** ****** * ****** ********* ******* * ** * ** ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGG **** * **** *********************** *** **** ************* ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC ******* *********** ** **** * * * * *** **** ** ZEA.MA_B CACCATCTTT TRI.AE_A CACC------ ****
Mean pairwise ID: 70.83%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGT ****** ****** ****** *** ********** *********** ***** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_F TTCCTGA--CGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA * * * * *** *** ** *** * **** ***** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGC--TCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG ***** * * ******* ********** * ** ** * **** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ** ** ** ************ *************** ** ****************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCC--AGAGCCTCATTAAACAG * ******** ********** * **** ** * ** ** **** *** ORY.SA_B ACCACCACCTTT ZEA.MA_F ACCACCATCTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 70.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** **** * *** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * * * *** ******* ** ***** ************** ZEA.MA_C G-GTAGTGG-CCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC--TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC * ******* *** * **** *** * ** **** ** * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA *** ** *********** **************** ****** *** ********** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAGAC ****** **** ***** * * ** ***** * * * **** ******* ZEA.MA_C CACCATTTTT TRI.AE_A CACC------ ****
Mean pairwise ID: 70.98%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT ******** *********************** ** *** * * **** * LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG TRY.BR_B TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG ***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* * LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG TRY.BR_B ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG * * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * *** LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG TRY.BR_B TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTGCAGAAGCACACCGAG ********* **************** ******** * *********** ******* * LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- TRY.BR_B GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT **** * *** ** * ******** * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 71.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAA-GGTGGTGTTGGATG ******* ****** ** *** **** ********** *** ***** ***** ORY.SA_A TTTGGTG---TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCG ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCC---TGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCG **** ** * * *** *** *** *** * *** *** ***** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAG-----CGTCCCTGC *************** * * * ** ** * ********* * * ** * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT ORY.SA_B ACCTAGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTT **** ****** ** * ************ *************** ** ******** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ORY.SA_B CCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT *** *************** *** ****** * ********** ****** ** * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ORY.SA_B CCATGGCAGACCACCACCTTT * * ********** ****
Mean pairwise ID: 71.15%
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAA LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA **** ************ ***** LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG *** **** ******** *** * **** * **** * ************** ** LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA LYC.ES_D GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ** **** ** ********* *********** ******** ***************** LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAACTA ******* ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** *********** LYC.ES_L AACCACCACTTT- LYC.ES_D AACCACCACTTTT ************
Mean pairwise ID: 71.70%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ****** *** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCC-TGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAG * * ** * ***** *** ** * **** **** * *** **** * ***** ZEA.MA_A TTG-GTAGTGT-CTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTG *** ****** * * ****** ********* ******* * * * * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ***** * **** *********************** ****** ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA TRI.AE_A AAGGATAATGG-GCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA ******* * *********** ** * ** * * *** * *** **** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRI.AE_A CCACC------ *****
Mean pairwise ID: 71.79%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGT--GATGTGAACG *********** ******** ******** ** ******* ***** * ** * * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRI.AE_A CT-GTTGTAG-CGCTG----CGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTC * * *** * *** ***** * * * *** * ******* ******** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGA-GGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TRI.AE_A CAAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC------TGGGTCTCACGGTCC *************** *** ******* ***** ** * * ** * * ** ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TRI.AE_A ATAATGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCC *** **************************************** ************* ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT TRI.AE_A AACGGTGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACT * ************** *** ******* * ** ** **** * ** ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_A CCAGCAGACCACC------ ** *********
Mean pairwise ID: 71.88%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC ****** ****** ****** *************** ********** **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ZEA.MA_D TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC * * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_D AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT ****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT *** ** ** ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA ** ******** ********** * **** ** ****** * **** * *** ORY.SA_B GACCACCACCTTT ZEA.MA_D GACCACCATCTT- ******** ***
Mean pairwise ID: 72.03%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRI.AE_B NCCGAGCTAG-TTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGT-GGATGC ****** ** * *** *********** * ******* * *** ***** ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTT---GGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA **** * * * ** *** ** **** * * ** **** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG TRI.AE_B AGTTG-GTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC-GCCTTCTCAGGCCTTAAGTG ***** **** * * **** ** ******* *** ** * * *** **** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGG ** ** * *** *********************** ** *** ************** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA ********* ************ ******** **** ** **** ***** ORY.SA_B CCACCACCTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ****** ****
Mean pairwise ID: 72.20%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC ****** ****** ****** *************** ********** **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ZEA.MA_E TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC * * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_E AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT ****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT *** ** ** ************ *************** ** **** ************ ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA ** ******************* * **** ** ****** * **** * *** ORY.SA_B GACCACCACCTTT ZEA.MA_E GACCACCATCTTT ******** ****
Mean pairwise ID: 72.22%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA ************************* ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT- LYC.ES_H CCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 72.44%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC ****** ****** ****** *************** ********** **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ZEA.MA_G TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC * * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_G AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT ****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG *** ** ** ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAG * ******************* * **** ** ****** * **** * **** ORY.SA_B ACCACCACCTTT ZEA.MA_G ACCACCATCTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 72.46%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA **** ** *** * ** * * * **** *** * * **** ** ** *** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_K CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 72.52%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGC ****** ****** ****** *************** *********** ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA **** ** *** *** * **** *** * **** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTC-GAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_C AGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT ***** **** * ** ** ** ****** **** * * ** *** ** ***** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG *** ** * *********** *************** ** *** *** ******* ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT-CCATGGCA ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA ********** **** ******* *** ***** **** * * * * * *** ORY.SA_B GACCACCACCTTT ZEA.MA_C GACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 72.67%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ****** ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * ** ** *** ******** ** ** ** * ** *** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ********** * ** **** ********** * ** *** *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGA **** * *** ******* *************** ******* ** ********** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAA TRI.AE_B AGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA ******** * ********* ** *** *** *** * * * **** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 72.73%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * ******* ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT * * * ***** * ********** ** ** * ** ** *** ***** * ****** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ******** * **** ********** * ** *** *** ** ***** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGAAG * * *** ******* *************** *** ** ************* ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAACCA TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA ******* ********* ** **** * ** * * ** * ***** **** ZEA.MA_B CCATCTTT TRI.AE_B CCATCTTT ********
Mean pairwise ID: 72.79%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA ******* ** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** * *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_A ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_A CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 73.44%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA ******* *** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_J CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 73.63%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ** * * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA * * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** **** ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * *** ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG ***** * **************************** *** *** ************* ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA * ******* ************* * ** **** * * * * ***** ****** ZEA.MA_E CCACCATCTTT TRI.AE_A CCACC------ *****
Mean pairwise ID: 73.83%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT ** * * * * * ******** * * ***** * ** ** ********* * ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ******** ****** * ****** * ***** ** ** * * *** * * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCC *** ** ****** * **** ******************************* ** * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_A CAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCA ** ****** ******** * ** ******* *** *** ** *** **** * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_A CTA-AGCAAACCACCATCTTT *** * ** ************
Mean pairwise ID: 73.84%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG LYC.ES_L ---------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGG ***** ** ********* **** * *** ** LYC.ES_M CTAATT-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-A LYC.ES_L CTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGA ** ** ************* ******** ************* *** * **** * LYC.ES_M TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGT LYC.ES_L CCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAAC **** * ******************* **** ** ********* *********** LYC.ES_M GAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT- LYC.ES_L GAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTT ******** ************************ ***** *** ** * * *** **** LYC.ES_M AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT LYC.ES_L AACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT- ****** * ***** ******** ***** ***** **
Mean pairwise ID: 73.87%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ** * * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA * * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** **** ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * *** ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG ***** * **************************** *** ***************** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA * ******* ************ * ** **** * * * * ***** ****** ZEA.MA_D CCACCATCTT TRI.AE_A CCACC----- *****
Mean pairwise ID: 74.11%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** **************** ** *********** *** **** * * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT TRI.AE_A GT-TGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAGT ** * * ******** ** * ***** **** * **** ************* ZEA.MA_F TG-GTTGTGGCTGG--TGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC ** ** **** * ******* ***** ** **** *** * * * * *** ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA ***** **************************** *** ****************** ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG-AGCCTCATTAAACAGACC TRI.AE_A AGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC ******* ********** * * ** **** * ** * * ***** * * ****** ZEA.MA_F ACCATCTTT TRI.AE_A ACC------ ***
Mean pairwise ID: 74.11%
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ******** ******* ******** **** *********** * * * **** * *** TRI.AE_B TGGTGCGGT-TTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTAC--TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT * ** * ** ******* ** * ** ** ******** ************* TRI.AE_B TG-GTAGTGGGCTGGGTGG--CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGC TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCT-CACGGTCCATAATGTGGC ** ******* * * *** ** ********* * ** * * * ** *** ***** TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA ****** *** ******* *********************** **************** TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAAT-TGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC ****** ********** * ** * ******** * ** * ******** TRI.AE_B ACCATCTTT TRI.AE_A ACC------ ***
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ******* ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGA *** * *** ******* *************** *** **************** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC ******************* * **** **** ** * * * ******* ZEA.MA_D CACCATCTT- TRI.AE_B CACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ** * * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA * * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** **** ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * *** ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ***** * **************************** ********************* ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC ******* ************* * ** **** * * * * ***** ******* ZEA.MA_G CACCATCTTT TRI.AE_A CACC------ ****
Mean pairwise ID: 74.34%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG *** ***** **** ********** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ************************************************** * ******* ZEA.MA_C TGGT-ACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT * * * ** *** ******* ** * *** * * * *** ***** * ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ******** * * ** *** *** * ** **** ** ****** ** **** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGAA ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA **** ***** ****** ********************* *** ** ******** * ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTA--GCAAAC ******** *** ***** ** ** * ** ** *** * ** *** ** ZEA.MA_C CACCATTTTT ZEA.MA_B CACCATCTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ******* ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGA *** * *** ******* *************** *** **** ************* ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC ******** ********** * **** **** ** * * * ******* ZEA.MA_E CACCATCTTT TRI.AE_B CACCATCTTT **********
Mean pairwise ID: 74.67%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG *** ***** **** ********** *** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_I TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 74.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ****************************************************** ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * * ** ****** ** * *** * * * *** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ********** * * *** *** *** * ** **** ** ***** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA ****** ***** ****** ************************* ** ******** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GCAA ZEA.MA_C AGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** * *** ***** ** ** * **** *** ***** *** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 74.76%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ******* ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA *** * *** ******* *************** ****** ************** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGACC TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC ******* ********** * **** **** ** * * * ******** ZEA.MA_G ACCATCTTT TRI.AE_B ACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 74.91%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA LYC.ES_D --TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA * ***************************** ************************* LYC.ES_M TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA LYC.ES_D TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA ********************* ************************************** LYC.ES_M ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC LYC.ES_D ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC ************************************************************ LYC.ES_M GCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT LYC.ES_D GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT ******************* ***** ***** ***
Mean pairwise ID: 75.57%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ******* ******************** ******* ** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************** ****** *** LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** **** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * *************************** * ***** **************** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC **** * **** * *** * * ** ****** ** ** *** ****** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 75.66%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************** ****** ** * * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ***************************** ** * ****** ** ************ LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT **** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** **** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 75.70%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ******* ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT *** ********** * ********************************* *** **** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA *** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT *** * ***************
Mean pairwise ID: 75.99%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG **************** ********** *** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_N TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 76.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ******* ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_D CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_D CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT *** ********** * ********************************* ******** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_D CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA *** ****** ************ ******* * * **** ** ********* * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_D CTA-AGCAGACCACCATCTT- *** * **************
Mean pairwise ID: 76.10%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ******* *** *** **** *** ***** * ******* * * ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC ****** ** ** * ******* ** ***** ********* ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC TRI.AE_B CAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGCC ******* ********* ** * **** ****** ** ** ** * * * ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA TRI.AE_B TTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCA * ************* *** ******* *************** ****** ******* ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA TRI.AE_B ACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCA ******************* ****** * ********** **** *** * * ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B TAGCAGACCACCATCTTT * ***************
Mean pairwise ID: 76.14%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ******************** ******* ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA ***************************** *** * ***** ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC *** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_N ATTTTT * ****
Mean pairwise ID: 76.25%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ******* ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_G CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC ZEA.MA_G CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC *** ********** * ****************************************** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ZEA.MA_G CAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC ** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_G TA-AGCAGACCACCATCTTT ** * ***************
Mean pairwise ID: 76.30%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * * ********* *** ********** * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAG * ** *** ** * ************* **** * ** ** ***************** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG TRI.AE_B TTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ***** **** * * **** ******* ** * * *** * ** *** *** ***** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGAAG *** *** ******* *************** *** **************** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAA-CTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA ***************** **** ** ** * ** * * * ******* ZEA.MA_F CCATCTTT TRI.AE_B CCATCTTT ********
Mean pairwise ID: 76.32%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG *** ***** **** ********** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** ******************************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 76.34%
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG ******** * ********************** * * ************ * * ** LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG TRY.BR_A GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT *** **** **** * ** ********* ***** ********* ** ********** LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG TRY.BR_A GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG * * ** *** **** * *** ******* *** * *** * ********* LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA TRY.BR_A CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCA **** *************** ******* * ***** **** ******* ****** LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT TRY.BR_A TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- * ** * **** * ****** * ********* **
Mean pairwise ID: 76.39%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * * ********* ******* * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ** ** * ** **** *** ****** ** * ******** **** **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_K CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG ******** *** ************** * **** ***** ** *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC-AATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * *** ********************** * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ********** **** * * **** * * * * ** *** ** ****** **** LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ****************************** *** *********************** LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC *** ** **** * * *** * *** ** ***** ** ** *** ****** * * LYC.ES_C ACATTT LYC.ES_F ACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************* *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT- LYC.ES_H CCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 76.49%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTC ***** * *** ****** * ** *** *** **** ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ZEA.MA_C CAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGACC ******* ******* * * **** **** ***** * * ***** ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA ZEA.MA_C TATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTA ** ********* ** *********** ************************ *** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT-CT ZEA.MA_C ACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACT ******************* ***** * ***** ***** **** *** * * * ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AAAGCAGACCACCATTTTT * * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.62%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ************ ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT **** * ** * ** ******* * ** *** * *** ******************** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG TRI.AE_B GGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ******** * * ** *** ***** * ** ** * ** * *** ******** ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGAAGG * ** *** ****** *************** ******* ** ************ ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGACCA ********** ************* **** ***** * * * ********* ZEA.MA_C CCATTTTT TRI.AE_B CCATCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 76.64%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** **** ************* *** ** ****** * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ***************************** ** * ****** ** ************ LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT **** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** **** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 76.87%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG ******** * ********************** * * ************ * * ** TRY.BR_B GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG *** **** **** * ** ********* ***** ********* ** ********** TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG * * ** *** **** * *** ******* *** * *** * ********* TRY.BR_B CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA **** *************** ******* * *********** ******* ****** TRY.BR_B TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-- * ** * **** * ****** * ********* ** *
Mean pairwise ID: 77.05%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******************************* LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************ ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_M CTTT- ***
Mean pairwise ID: 77.12%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ********* **** *************** * ******** ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA ***************************** *** * ***** ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC *** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_I ATTTTT * ****
Mean pairwise ID: 77.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** *************************** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG * * ** * * * ****** * * ****** ** ***************** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ***** ***** * *** *** ***** ***** ***** ** ** ***** ** *** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG *** * ************ ********************* *** *** ******** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA ************* ***** ** * * * ** * *** * ** **** ZEA.MA_C CCACCATTTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 77.19%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ****** ******* ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GTTGTG--ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ** * * *** ***** ******* * ***** * *** ** ********* * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC ******** ****** * * ****** * ***** ** ** * * *** * * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC *** ** ****** * **** **************************** **** **** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC ** ****** ********* ** ******* *** **** * * ****** * *** ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B T-TAGCAAACCACCATCTTT * * ** ************
Mean pairwise ID: 77.20%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** * ************* ******** *********** ****** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* ********* ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ***** * ** * ** ******** *** * * * * * *** ** ***** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ** ***** *************************** ******* ************** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******* ARA.TH_A CCATTTT ARA.TH_G CCATTTT *******
Mean pairwise ID: 77.22%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC-CAGGCTTAGCGGGGAGG-ACGTGG ******** ********************** * * *** * * ***** *** LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC LEI.MAJ. ACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTG--- ****** ** **** *********************************** * LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC LEI.MAJ. -TGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTC * ******* ****** ** ****** ** ***** *** ***** ***** LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGGA LEI.MAJ. AGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGA ******* **************** * ******** ************ *********** LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT LEI.MAJ. GCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT ** **** *** ** ****** ** * ***** **
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * * ********* ******* * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_J CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * * ********* ******* * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ****** *** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** **************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_A CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ********* ******************** ******* ** ********** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************** ********** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA ******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** **** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA * **************************** * ***** **************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC **** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_O ACTTT- *****
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ******* **** *************** * ******** ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA ***************************** *** ******* ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC *** * *** *** ******* * ** ****** ** *** ************ * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_B ACTTTT ******
Mean pairwise ID: 77.52%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ********* ***** * ************* ******** *********** ****** ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* ********* ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTT-CTAGAGTCGGAGGG ***** * ** * ** ******** *** * * **** *** ** ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ** ***** *************************** ******* ************** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******* ARA.TH_G CCATTTT ARA.TH_F CCATTTT *******
Mean pairwise ID: 77.88%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** **** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA * * * * * ** ** *** ** ********** *********** **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** ***** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ****** ************ ********************* *** *** ******** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAG ************* ***** * ** * * ***** *** * ***** **** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ZEA.MA_D ACCACCATCTT- ******** **
Mean pairwise ID: 77.96%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************* *** ** ****** * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ***************************** ** * ******* ** ************ LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC **** * **** * * *** ** **** *********** **** ****** ***** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_B TTTT ***
Mean pairwise ID: 78.10%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* *************** **** ********* ***** ********** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** ********* ** ** ** **** **** ******* ********* ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT ***** * * ** ** ** ******* **** * *** * ****** ****** ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC * ***** ******* ******************* **** ** ********** *** ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCAC ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC * ****** * * * ** *********** ******* *** * * * * ** ***** ARA.TH_D CACTTT ARA.TH_G CATTTT ** ***
Mean pairwise ID: 78.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******* *********** *** ***** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCT---TGTATGTGCCA-CTGGCCGGCCTGCCCGTT *** ** ******** ******* *** ** * ** ** *** ******** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGAC ******** ** **** * ** ****** *********** * * *** * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC ** *** ******** ********************************* ********* ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCAT ** ****** ************ ****** **** ** ** ****** * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F TA-AACAGACCACCATCTTT ** *****************
Mean pairwise ID: 78.14%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** **** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA * * * * * ** ** *** ** ********** *********** **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** ***** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ****** ************ ************************ *** ******** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAGA ******** **** ***** * ** * * ***** *** * ***** ***** ZEA.MA_C CCACCATTTTT ZEA.MA_G CCACCATCTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 78.21%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT **************************************************** **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** *** *** ** ********** *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** ***** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG ****** ************ ********************* ******* ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GCAG ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** **** ***** * ** * * ***** *** ***** **** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 78.62%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******************************* LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************ *********** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_O TTT- LYC.ES_M CTTT **
Mean pairwise ID: 78.76%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ********* **** *************** * ******** ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************** ********** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA ******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** **** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA * **************************** * ***** **************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC **** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_G ACTTTT ******
Mean pairwise ID: 79.61%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** **** ************** ****** ** * * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG * ****** ** ******* * * * * ************* ******** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** * ****** ** * ****************** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ***************************** * ** ***** ****************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** ***** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_O TTT- **
Mean pairwise ID: 79.74%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** ************** ******** * **************** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * **** ******* *** * ************ ***** ******* ********* ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT ***** * *** ** ********** *** * **** * ****** * ****** ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC * ***** ******* ******************* ******* ************** ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCAC ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC ** *** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******** ARA.TH_E CATTTT ARA.TH_G CATTTT ******
Mean pairwise ID: 80.33%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** **** ************** ****** ** * * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG * ****** ** ******* * * * * ************* ****** * ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** * ****** ** * ****************** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA **************************** * ** ***** ****************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC ** ** *** * * ****** * **** ***************************** LYC.ES_C ATTT- LYC.ES_E ATTTT ****
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** **** ************* *** ** ****** * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG * ***** *** ******* * * * * ************* ******** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** * ****** ** * ****************** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ***************************** * ** ***** ****************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** ***** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_G TTTT ***
Mean pairwise ID: 80.94%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********* ******* *** ******* *********** * * ***** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ********* *************** *** * ***** *** **** ***** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG *** *** ******** ** ******** ** ******** ************* GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ********* ****** **** GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** ** * **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ************************ ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC ** ********* *********** ** * ****** ** ************ LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_A TTT LYC.ES_N TTT ***
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC ** ********* *********** ** * ****** ** ************ LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_A TTT LYC.ES_I TTT ***
Mean pairwise ID: 81.25%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_K CTTT ***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************************* ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_A CTTT- ***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_K CTTT- ***
Mean pairwise ID: 81.58%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA-ACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** * * * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_A CTTT ***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******* ** * ** ***** ******** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* ********************************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_H TTTT LYC.ES_M TTT- ***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG *************************** ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 82.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********* ******* *** ******* ************ * **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** ** * ***** ************** ****** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT- ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ************** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_J CTTT ***
Mean pairwise ID: 82.24%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT * * ******* *** ********************************* ***** * * HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA * **** *** *** ****** ********* * ******************* ** HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT * ** **** * ** * ** ****** ** * ****** * ********** HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ************ **************** ****************************** HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC ********** **** ** ** ** * **** ************************ HUM.JA_B TTTT HUM.LU_C TTTT ****
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ************************ ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 82.27%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ****** ********* ******* *** ******* *********** * ** **** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** *************** ** * ***** ************** ****** FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.30%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG *************************** ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_J CTTT- ***
Mean pairwise ID: 82.57%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** *********** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_O TTT- **
Mean pairwise ID: 82.61%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********** ******* *** ******* ************* ** **** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** * * ***** ************** ****** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_K CTTT ***
Mean pairwise ID: 82.89%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT * * ******* *** **************************** **** ********* HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA ** **** *** **** ****** ********* * * ***************** ** HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT * ******* * ** ************* * ** ** ****** * ********** HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ************ **************** ****************************** HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTC--ACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC *** ****** **** **** ** ** **** ********* ****** ** HUM.LU_C TTTT HUM.JA_A TTTT ****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************************* ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** *********** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** ** ***** ****************** LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_O TTT- LYC.ES_A CTTT **
Mean pairwise ID: 82.95%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA *************************** ** ** **** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** **** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_I TTTT- ***
Mean pairwise ID: 83.22%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_A CTTT ***
Mean pairwise ID: 83.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *********************** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_H CTTTT ****
Mean pairwise ID: 83.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * ***** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ******************* ** ****** *** **** ****** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG *** ************ ** ******** ** *********** ********** GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ********* ****** *** GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* ***** ****** ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 83.33%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG *************** * ******* **** ********* **** ****** *** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG **** ******** **** ****** * *** * *********************** ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTT--GCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ******** **** * ** *********** ** ** * ***** ********** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA **************** ************************ ************** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC *** *** *** ****** *********** ****** ******* ** ***** ARA.TH_D CACTTT ARA.TH_F CATTTT ** ***
Mean pairwise ID: 83.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************************* ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** *********** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_O TTT- **
Mean pairwise ID: 83.61%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ****************** *** ******* ************ ** **** HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ********* *************** ** * ***** **** ********* ****** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** * * ** ****** **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.67%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* ************ CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** ** * * *** ********************** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT *** **** ******* * ********** * ******** *********** ** CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA * * ** ***** ******** ***** ******* ****** *************** CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT- ************** * * * * ****** ****************** *****
Mean pairwise ID: 83.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ****************** *** ******* **************** **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** ** * ***** ************** ****** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT- ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** ******************* * ***** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT-TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT * ** ** *************** ** **** * ** ****** ***** * ****** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG ZEA.MA_F TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG **** *** *** ******* ***** ** * *** **** ****** ******** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG * ******* ********************************* **************** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCAC ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC ******* ********* * ******** * * ***** **** * * ** ***** ZEA.MA_B CATCTTT ZEA.MA_F CATCTTT *******
Mean pairwise ID: 83.88%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_J CTTT ***
Mean pairwise ID: 83.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ************** ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************ *** * ** ***** ****************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_O TTT-- **
Mean pairwise ID: 83.95%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********** ******* *** ******* ************* ** **** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ********* *************** *** * ***** ************** ****** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.99%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG *************** * ******* **** ********* **** ****** *** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG **** ******** **** ****** * *** * *********************** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG ******** **** * ** *********** **** ** * ***** ********** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA **************** ************************ ************** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC *** *** *** ****** *********** ****** ******* ** ***** ARA.TH_A CATTTT ARA.TH_D CACTTT ** ***
Mean pairwise ID: 84.00%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* ************ CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** **** * *** ********************** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT *** **** ******* * ********** * ******** *********** ** CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA * * ** ***** ******** ***** ******* ****** *************** CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT- ******** ***** * * * ******** ****************** *****
Mean pairwise ID: 84.05%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ******* *** ******* ** ***** ** **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ************************** * ** ****** ********************* RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* RAT.RAT. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* **** ******* ***** ******** * ** RAT.RAT. T XEN.LAE. -
Mean pairwise ID: 84.24%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** *********************** *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT-TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA * ** ** ** ******* ****** ** **** *********** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG ****** *** ********* *** ***** ** * *** **** ******* ***** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG **** ******* **************************** *** ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA ZEA.MA_F GAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA ********* * ********* * **** ***** ** **** ***** *** ** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 84.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG *************************************** * ************** ** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************ *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT- LYC.ES_H CTTTT ***
Mean pairwise ID: 84.26%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG *************** ******** **** ********* * ** ********** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG **** *** **** *** *** ** ** *** * **** ****************** ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT ******* ***** **** *********** **** *** ********* ******* ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT **************************************** ************** **** ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACC ** **** *** ****** *********** ****** ******* ** ****** ARA.TH_D ACTTT ARA.TH_E ATTTT * ***
Mean pairwise ID: 84.59%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ****************************************** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA *************************** ** ** **** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** **** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_N TTTT- ***
Mean pairwise ID: 84.62%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* ************ CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** ** * ***** ********************** CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT ******** ******* * ******** * * ******** ************** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT * * ** ***** ******** ***** ****************************** CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT ************** * * ******** ******************* **
Mean pairwise ID: 84.92%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ************** ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA *************************** ** ******* * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC ** ***** ** *** *** ***************** **** ****** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_B TTTT- ***
Mean pairwise ID: 84.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * **** RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** *********************** * ** ****** ********************* RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* RAT.NOR. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT ******************* **** ******* ***** ******** * ***
Mean pairwise ID: 84.95%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* *********** CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** ** * ***** ********************** CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT ******** ******* * ******** * * ******** ************** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA * * ** ***** ******** ***** ****************************** * CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT ************** * * ******** ********************* *
Mean pairwise ID: 85.00%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ********* *** ******* ** ***** ** * **** HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ***************** * ** ****** **** **************** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** HOM.SA_B GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* HOM.SA_B ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* **** ******** ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 85.00%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** * ******* *** ******* ** ***** *** * **** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ************************** ** ****** ********************* ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** ORI.CUN. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* ORI.CUN. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* **** ******* ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 85.33%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** * ******* *** ******* ** ***** *** * **** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ******************* ** ****** ********************* CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** CAN.SPE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* CAN.SPE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* **** ******* ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 85.53%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ************** ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************** ** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA **************************** ** *** *** * ** ************ LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ******************* LYC.ES_O TTT- LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 85.71%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ********* *** ******* ** ***** ***** **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ************************** * ** ****** ********************* HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* HOM.SA_A ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* **** ******* ***** ******** * ** HOM.SA_A T XEN.LAE. -
Mean pairwise ID: 85.81%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******* ** * ** ***** ******** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************************** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC *** ********************************************** ********* LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_K TTT LYC.ES_M TTT ***
Mean pairwise ID: 85.81%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******* ** * ** ***** ******** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************************** LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* ************************************************** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ******************************* **************************** LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_A TTT LYC.ES_M TTT ***
Mean pairwise ID: 85.95%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACTGGGAGGCTGAGGCTGGCGGATC XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-GCTACTTGGAGGCTTGGGCTGTCGGATC ****** * ****** ************** ****** ******* ***** ****** FUG.RUB. GCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAGT XEN.LAE. GCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAGT ******* *************** ** * ******************** ******* FUG.RUB. TCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGC-CTAAGGAGGGG XEN.LAE. TCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGGG ******** ******** ************* ************ ** *********** FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA XEN.LAE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** *********** ************ FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT XEN.LAE. TCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******* ******** ** ** ** ** ***** ********* *** **** *
Mean pairwise ID: 86.18%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************ ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ************** ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA **************************** ** ******* * ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** ** *** *** ******************** ************** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_O TTT- ***
Mean pairwise ID: 86.47%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******* ** * ** ***** ******** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************************** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ************************************************************ LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_J TTT LYC.ES_M TTT ***
Mean pairwise ID: 86.51%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * *********** ***************** ***** ******************* LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG *************************************** * ************** ** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA **************************** ** ** **** * ** ************ LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ******************* LYC.ES_G TTTT LYC.ES_N TTTT ****
Mean pairwise ID: 86.51%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ****************************************** ********** *** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************** ** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA **************************** ** *** *** * ** ************ LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ******************* LYC.ES_O TTT- LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 86.73%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** ********************* **** * ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA * ** ** ** ******* ***** * ******** **************** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ****** ******** ** **** *** * ** * ** **** ********** *** ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG *** ************************************ ******************* ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC ******** ********** * * ********** ** *********** *** ****** ZEA.MA_G ACCATCTTT ZEA.MA_F ACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 86.73%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** ********************* **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA * ** ** ** ******* ***** * ******** **************** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ****** ******** ** **** *** * ** * ** **** ********** *** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG *** **************************************** *************** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC ******** ********** * * ********** ** *********** *** ****** ZEA.MA_E ACCATCTTT ZEA.MA_F ACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 87.06%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** ********************* **** * ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA * ** ** ** ******* ***** * ******** **************** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ****** ******** ** **** *** * ** * ** **** ********** *** ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG *** ******************************************************** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGACC ******************* * * ********** ** *********** *** ****** ZEA.MA_D ACCATCTT- ZEA.MA_F ACCATCTTT ********
Mean pairwise ID: 87.30%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG * * **************************************** *********** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ***** ** * ************************** ********************** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC *********** **** *********** **** ** ** ***** ** ******* HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************** **************** *************************** HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT ****** ********* **** ******** * **** ********* ****** HUM.LU_A TTCTTTT HUM.JA_A CTCTTTT ******
Mean pairwise ID: 87.62%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA * * *************************************************** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ** ** * ******** ***************** **** ***************** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC ****** **** **** * ** ****** **** *** ** ***** ** ******* HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************** **************** *************************** HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT ************** * *** ******** ****** ********************* HUM.LU_A TTCTTTT HUM.JA_B TTCTTTT *******
Mean pairwise ID: 87.83%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT ** ********* *** ************************************ ****** HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA ** ******** **** ****** *********** * ******************** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT * ********* *************** * ***** ******** *********** HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ************ **************************** ****************** HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCA-TGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTC HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC ********** **** *** ** ****** * ************ ********** HUM.LU_B CTTT HUM.LU_C TTTT ***
Mean pairwise ID: 87.95%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG ** ********* *** ********************************* ****** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG ******** ***** **** ****** *********** * ***************** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGGT-TGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGC **** ********* **************** ***** ******** ******** HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT ************************************************************ HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT ************* * ** * ** ** * ************************** HUM.LU_D TTCTTTT HUM.LU_C TTCTTTT *******
Mean pairwise ID: 87.95%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.LU_C ---GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTG ************ *** ********************************* ****** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.LU_C GGTCAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCG ******** ***** **** ****** *********** * ***************** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.LU_C GGAGGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCAC-TCCTAGACTGGAGGGC **** ********* ************** * ****** ******* ******** HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_C AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT ************************************************************ HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.LU_C AACGGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT ************* * ** * * ** ** * *** ********************** HUM.LU_A TTCTTTT HUM.LU_C TTCTTTT *******
Mean pairwise ID: 88.52%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT * * ********************************************* ** ** * * HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA * ***** ******** ***************** **** ***************** ** HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT **** **** **** * ** ****** **** *** ********* ** ********** HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC ***************************** *********** ****************** HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGC-TGACTCTTAATAGGACCATTT HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTT *********** ***** ******** ******* * *********** ********* HUM.JA_B CTTTT HUM.LU_B CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 88.52%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ** *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ************************************************************ LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ************************************************************ LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ************************* ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_B TTTT- ***
Mean pairwise ID: 88.52%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ************************************************************ LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ************************************************************ LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ************************* ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_I TTTT- ***
Mean pairwise ID: 88.82%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ************************************************************ LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG *************************************** * ************** ** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA **************************** ** ** **** * ** ************ LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ******************* LYC.ES_G TTTT LYC.ES_I TTTT ****
Mean pairwise ID: 88.93%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG *** **************************************** *********** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.JA_A GGTCAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ***** ** * ************************** ********************** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCTGGG-TTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.JA_A AGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGC *********** **** **************** * ** ********* ** ******* HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_A AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************** **************** *************************** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.JA_A AACGGGTCGGTGCTACTTGGG-CCACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT ****** ********* *** ******** * ***** ********* ****** HUM.LU_D TTCTTTT HUM.JA_A CTCTTTT ******
Mean pairwise ID: 89.03%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ************************************************** ****** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ********* ********** ******* **** ** * ****** ***** ****** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ********** *** *** **** ***** ********* ***** ******* ** ** ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ************ **************************** **** ************* ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC ********* ************ ********* *** ****** **** ** **** ** ZEA.MA_G CACCATCTTT ZEA.MA_B CACCATCTTT **********
Mean pairwise ID: 89.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ************************************************** ****** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ********* ********** ******* **** ** * ****** ***** ****** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ********** *** *** **** ***** ********* ***** ******* ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ************ ******************************** ************* ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC ********* ************ ********* *** ****** **** ** **** ** ZEA.MA_E CACCATCTTT ZEA.MA_B CACCATCTTT **********
Mean pairwise ID: 89.10%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ********************* ******* * *** * ******** ***** ***** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_D AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG *********** **** ** **** ***** ********* ***** ******** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ************* **************************** *** ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA ZEA.MA_D GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG ********** * ************ ***** ********* **** ************ ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ZEA.MA_D ACCACCATCTT- ***********
Mean pairwise ID: 89.25%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.JA_B ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTA *** *************************************************** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.JA_B GTTCGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCG * ** ** * ******** ***************** **** ***************** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG-CTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.JA_B AGAGTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGC ****** **** **** * ** ****** **** *** ********* ** ******* HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.JA_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT *************** **************** *************************** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.JA_B AACGGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCAT ************** * **** ******** ******* ********************* HUM.LU_D TTCTTTT HUM.JA_B TTCTTTT *******
Mean pairwise ID: 89.30%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ***************** ******************************* * **** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ************************** *************** *** ****** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***************** * ** ****** * ** ********************** GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ********************************************* * ****** **** GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ************************ ****** ***************** *****
Mean pairwise ID: 89.33%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ***************** ******************************* * * **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ******** ***************** *************** **** ****** ***** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***************** * ** ****** * ** ********************** HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA ********************************************* * ****** **** HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- ************************ ****** ***************** *****
Mean pairwise ID: 89.35%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ************************************************** ****** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ********* ********** ******* **** ** * ****** ***** ****** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ********** *** *** **** ***** ********* ***** ******* ** ** ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ************ ********************************* ************* ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC ********** ************ ********* *** ****** **** ** **** ** ZEA.MA_D CACCATCTT- ZEA.MA_B CACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 89.40%
TET.THE. GCCAGGGTAGCAATACCTGTGTCTATATGTGGCATAAACAATGTAGGTTGTGATAGATAG TET.ROS. GCCAGGGTAGCAATGCCTGTGACCTCGTGTGGCATAAACAATGTAG-TTAGAATAGTCAG ************** ****** * ******************* ** **** ** TET.THE. GATATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGCTCCAAACAATGAGTTGC TET.ROS. AGTATGAGAGTTTGATGAGACAGTTTGCTAAGAGTGTGCCCGTTCCAAACAGTGAGTTGC **************************************** ******** ******** TET.THE. TATGGTGGTAACCTAGTAATAGGACTCCACCAGGGCATTAAAGAGCTAAGGAAACGCCTC TET.ROS. TATGGTGGAAACCTAGTAATAGGACTTCACCAGGGCATTAAAGAGCTGAGGAACCGCCTC ******** ***************** ******************** ***** ****** TET.THE. AGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTGTTGTGGTGGAAGGATAACATACTCA TET.ROS. AGGCTGGCAACAGAACAGGGAAAACTTGCCGCTTATTGTGGTGGAAGGATAACATACTCA ********************************** ************************* TET.THE. TTAACTGTCAAACTAATCGGTTCTACTATCAAAGCCAGACATT TET.ROS. TTAACTGTCAAGCTAATCGGTTCTGCTATTCTGATCAGACACT *********** ************ **** ****** *
Mean pairwise ID: 89.44%
HUM.JA_B GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTTC HUM.JA_A GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGTC ******************************************** ********** * ** HUM.JA_B GGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG HUM.JA_A AGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGAG ************** ********************** ********************* HUM.JA_B TTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAATG HUM.JA_A TTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAATG *** ********* * ** ****** ** * * ************ *********** HUM.JA_B CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG HUM.JA_A CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAACG **************************** ******************************* HUM.JA_B GGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTCT HUM.JA_A GGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTCT ** ******* ***** ** ******** ***** ********* ****** *** HUM.JA_B TTT HUM.JA_A TTT ***
Mean pairwise ID: 89.47%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ********************************************************** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG *************************************** * ************** ** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA **************************** ** ******* * ** ************ LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC ** ***** ** *** *** ******************** ************** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_B TTTT ****
Mean pairwise ID: 89.51%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG *************************** ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ************************************************************ LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ************************************************************ LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ************************* ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_N TTTT- ***
Mean pairwise ID: 89.71%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ********************* ******* * *** * ******** ***** ***** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_G AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG *********** **** ** **** ***** ********* ***** ******** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ************* ******************************* ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA ZEA.MA_G GAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA ********** ************ ***** ********* **** ************ * ZEA.MA_A CCACCATCTTT ZEA.MA_G CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 89.74%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ********************* ******* * *** * ******** ***** ***** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG *********** **** ** **** ***** ********* ***** ******** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ************* **************************** **** ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAA ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAG *********** ************ ***** ********* **** ************ ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 89.77%
HUM.LU_B GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTGGGT HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT * * **************************************** **** ** ****** HUM.LU_B CAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGGGA HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA ******* ************************** ********************** ** HUM.LU_B GTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGCAAT HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT ********* **** ************ **** ** ********* ** ********** HUM.LU_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ***************************** *********** ****************** HUM.LU_B GGGCCGGTGCTACTTGGTCCACCATGTTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCATTTCC HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTCACTG-CATGCACTCTTAATCAGACCATCTCT *** ************* ******** ****** ********** ****** ** HUM.LU_B TTT HUM.JA_A TTT ***
Mean pairwise ID: 90.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ************************************************** * **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ******** ***************** *************** **** ****** ***** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***************** * ** ****** * ** ********************** RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA ********************************************* * ****** **** RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- ************************ ************************ *****
Mean pairwise ID: 90.30%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ************************************************** * * **** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** ***************** *************** **** ****** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***************** * ** ****** * ** ********************** GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ********************************************* * ****** **** GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT ************************ ************************ *****
Mean pairwise ID: 90.64%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ***************** ******************************** * * **** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ****************************************** **** ****** ***** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***************** * ** ****** * ** ********************** CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA ********************************************* * ****** **** CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ************************ ****** ***************** *****
Mean pairwise ID: 90.85%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG **************** ************************* ********* ****** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ****** *** *** ******** *** ************ ****************** ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTT--GCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ******* **** * ** *************** * * ***** *** ****** ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA **************** ******************************************* ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC **** ******************************************************* ARA.TH_E CATTTT ARA.TH_F CATTTT ******
Mean pairwise ID: 90.97%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ***************** ******************************** *** **** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ***************** ************** **** ****** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***************** * ** ****** * ** ********************** GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ********************************************* * ****** **** GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ************************ *******************************
Mean pairwise ID: 91.45%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ********************************************************* LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* ***************** **************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_H TTTT LYC.ES_A TTT- ***
Mean pairwise ID: 91.50%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG **************** ************************* ********* ****** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ****** *** *** ******** *** ************ ****************** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG ******* **** * ** ***************** * * ***** *** ****** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA **************** ******************************************* ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC **** ******************************************************* ARA.TH_A CATTTT ARA.TH_E CATTTT ******
Mean pairwise ID: 92.11%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ************************************************************ LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* ********************************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_H TTTT LYC.ES_K TTT- ***
Mean pairwise ID: 92.31%
YAR.LI_A CTTAGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGTCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTC YAR.LI_B ---AGCTGTAATGGCATTTTGTCGGAGTGGTAAATCGCCTTCTTGTTGTGCGTTCGAGTT ********************************** ********************* YAR.LI_A TTGGGCTCTGCACTTGGCCATTTGGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT YAR.LI_B CTGGACTCTGCACTGGGCTACTTTGTTGTCCTTTCCGAATTCTGCGGTTGATGGGCGTCT *** ********* *** * ** ************************************ YAR.LI_A CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGAAACTTCAGTGGA YAR.LI_B CGGTCTGAGTAATCGGCTTTGAGATTTCCGTTCTAAGATTAACTGGGATACTTCAGTGGA ************************************************ *********** YAR.LI_A GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATCGCAACCAAGTGGTAT YAR.LI_B GCAATCCAGCAGAGATCCAGTTGCCGTGGGTATGGCGGTGGGATAGCAACAAAGTGGTAT ******************************************** ***** ********* YAR.LI_A ATGTTATGGAAGATATTTACGATCACGATT--- YAR.LI_B ATGTTATGGAAGGTATTTGCAATCACGACTCTC ************ ***** * ******* *
Mean pairwise ID: 92.43%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ********************************************************* LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* ********************************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_H TTTT LYC.ES_J TTT- ***
Mean pairwise ID: 92.58%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ************************************************** * * ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG ********* ********** *************** ** ******************** ZEA.MA_A TTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGGC ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC ************* **** ******************************** ****** ZEA.MA_A AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGGG ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG **************************************** *** *** *********** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAAC ZEA.MA_B AGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC ******** ******************** *** *** * **** **** ** ******* ZEA.MA_A CACCATCTTT ZEA.MA_B CACCATCTTT **********
Mean pairwise ID: 93.18%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG ** *********************************************** ** *** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ***** ** *************************************************** HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ***************************** ************ **************** HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT *************** **************************** *************** HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGC-TGACTCTTAATAGGACCA HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA **************** *** ********* ****** * * *********** ****** HUM.LU_A TTTCTTTT HUM.LU_B TTTCCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 93.67%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ************************************************************ CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***************************** *** ************************** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT *** ************** *********** *** ********************* ** CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT *********************************** ****** **************** CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT- ******** ********* *************** ***************** * **
Mean pairwise ID: 93.67%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ************************************************ *********** CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***************************** *** ************************** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT *** ************** *********** *** ********************* ** CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA *********************************** ****** **************** CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT- ******** ********* *************** ***************** *** *
Mean pairwise ID: 94.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ************************************************ *********** CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ********************************* ************************** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT *** ************** *********** *** ********************* ** CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA *********************************** ****** **************** CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT- ****************** **** ********** ***************** *** *
Mean pairwise ID: 94.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ************************************************************ CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ********************************* ************************** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT *** ************** *********** *** ********************* ** CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT *********************************** ****** **************** CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT- ****************** **** ********** ***************** * **
Mean pairwise ID: 94.10%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG ****** ******** *************************************** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ************************************************************ LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA * ********************************************************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ****************************************** ** * ****** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_G TTTT- ***
Mean pairwise ID: 94.16%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.LU_B ---GGCCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACATTG ** *********************************************** ** *** HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.LU_B GGTCAGCCCAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ***** ** *************************************************** HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGC-TGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.LU_B GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCCTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ****************************** ***************************** HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_B AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCCCGGCAGTGGAAGGAT *************** **************************** *************** HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGC-TGACTCTTAATAGGACCA HUM.LU_B AACGGGCCGGTGCTACTTGG-TCCACCATG-TTCACTGGTCCTGACTCTTAATCGGACCA **************** *** ********* ******** * *********** ****** HUM.LU_D TTTCTTTT HUM.LU_B TTTCCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 96.37%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** *********** ***************** ***** ******************* LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ************************************************************ LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ************************************************************ LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ************************************* ********************** LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCACT LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT *************************** ********** ***** ************* * LYC.ES_B TTT LYC.ES_N TTT ***
Mean pairwise ID: 96.66%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ***************** ******************************* ******* HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** ********************************** **************** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT ********************************** ***************** ******
Mean pairwise ID: 96.71%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ************** ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG ****** ******** ******************************************** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ************************************************************ LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ************************************************************ LYC.ES_G TTTT LYC.ES_O TTT- ***
Mean pairwise ID: 96.72%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ********************************************************** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG ******************************************************* **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ************************************************************ LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA * ********************************************************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ****************************************** ** * ****** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_O TTT-- **
Mean pairwise ID: 96.99%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ****************** ******************************** ******* HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ****************** *************** **************** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ********************************** ***************** *****
Mean pairwise ID: 97.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ***************** ******************************** ****** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ******** ********************************** **************** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT- ********************************** ************************
Mean pairwise ID: 97.33%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ***************** ******************************* * ******* HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ********************************************************* HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT- ********************************** ***************** ******
Mean pairwise ID: 97.33%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ***************** ********************************* ****** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ***************** ********************************* RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT- ********************************** ************************
Mean pairwise ID: 97.66%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ***************** ******************************** ********* CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** ***************** ********************************* CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT ********************************** ***************** ******
Mean pairwise ID: 97.66%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT **************************************************** ******* CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ***************** ******************************** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ********************************** ***************** *****
Mean pairwise ID: 97.66%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ***************** ******************************** * ******* ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ************************ ******************************** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT **************************************************** *****
Mean pairwise ID: 97.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ****************** ********************************* ******* HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG *************************** ******************************** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- ********************************** ***************** *****
Mean pairwise ID: 97.67%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT ***************** ********************************* * ****** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG *************************** ******************************** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- **************************************************** *****
Mean pairwise ID: 97.67%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ************************************************** ****** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ********************************************************* RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT- **************************************************** ******
Mean pairwise ID: 97.68%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * *********** ***************** ***** ******************* LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ************************************************************ LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ************************************************************ LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC ************************************************************ LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATTT ************************************************************ LYC.ES_I TT LYC.ES_N TT **
Mean pairwise ID: 97.72%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG * *** ****************************************************** HUM.LU_A GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG HUM.LU_D GGTCAACCTAGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCCG ************************************************************ HUM.LU_A GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGGC HUM.LU_D GGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGG-CTGGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGGC ***************************** ************ **************** HUM.LU_A AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT HUM.LU_D AATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGAT ************************************************************ HUM.LU_A AACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCAT HUM.LU_D AACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCAT ******************** **************** ********************** HUM.LU_A TTCTTTT HUM.LU_D TTCTTTT *******
Mean pairwise ID: 97.99%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT ****************** ******************************** ******* CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ************************** **************** **************** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT ********************************** ************************
Mean pairwise ID: 98.00%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT *************************************************** ******* HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG ******** ********************************** **************** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT- ********************************** ************************
Mean pairwise ID: 98.00%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT ***************** ******************************** ****** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ************************************************************ HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT ********************************** *************************
Mean pairwise ID: 98.02%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ********************************************************* LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************************ LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC *** ***** **************************************** ********* LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ******************************* **************************** LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_K TTT LYC.ES_A TTT ***
Mean pairwise ID: 98.02%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ********************************************************** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ************************************************************ LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ************************************************************ LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ************************************* ********************** LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCACT LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT *************************** ********** ***** ************* * LYC.ES_B TTT LYC.ES_I TTT ***
Mean pairwise ID: 98.19%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG ************************************************************ TRY.BR_B GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA TRY.BR_A GACAAGCGGGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTTGA ************************************************************ TRY.BR_B GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG TRY.BR_A GGTCGCCACTGTAGAGAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGGCCGG ************************************************************ TRY.BR_B TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA TRY.BR_A TGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTCCCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCATCTCA ********************************** ************************ TRY.BR_B GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT TRY.BR_A GGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG--- *********************************
Mean pairwise ID: 98.33%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT ****************** ********************************* ******* HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ***************** ********************************* HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ************************************************************ HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ************************************************************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT- ***********************************************************
Mean pairwise ID: 98.33%
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG ************************************************ *********** CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ************************************************************ CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT ************************************************************ CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA *********************************************************** CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT ******************************************************* *
Mean pairwise ID: 99.00%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG ************************************************************ CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***************************** ****************************** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT ************************************************************ CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC ************************************************************ CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT ******** *************** ***********************************
Mean pairwise ID: 99.01%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ********************************************************** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************************ LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* ************************************************** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ******************************* **************************** LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_J TTT LYC.ES_A TTT ***
Mean pairwise ID: 99.01%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ********************************************************* LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************************ LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ********************************************** ********* LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_J TTT LYC.ES_K TTT ***
Mean pairwise ID: 99.03%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ************************************************************ ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ************************************************************ ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ************************************************************ ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG ******************************************** *************** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ******** *************************************************** ZEA.MA_E ACCATCTTT ZEA.MA_D ACCATCTT- ********
Mean pairwise ID: 99.03%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ************************************************************ ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ************************************************************ ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ************************************************************ ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGG **************************************** ******************* ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ******** *************************************************** ZEA.MA_D ACCATCTT- ZEA.MA_G ACCATCTTT ********
Mean pairwise ID: 99.35%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ************************************************************ ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ************************************************************ ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCT--TGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ************************************ ********************** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ************************************************************ ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC ************************************************************ ARA.TH_A CATTTT ARA.TH_F CATTTT ******
Mean pairwise ID: 99.35%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ************************************************************ ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ************************************************************ ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ************************************************************ ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGG **************************************** *** *************** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGACC ************************************************************ ZEA.MA_E ACCATCTTT ZEA.MA_G ACCATCTTT *********