There are 135 alignments in the test set.
Mean pairwise ID: 68.08%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG **** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG ** ** ************* * *** **** ** ************* ******** LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG *********** **** * * ****** **** * ** ******************* LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT ** ***************************** * ******** **************** LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC ***** * **** * *** * **** *** **************** ******** LYC.ES_G CACTTTT LYC.ES_L CACTTT- ******
Mean pairwise ID: 68.08%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG * ** **** **** *** * ******** * ** ** ******** *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT HUM.JA_A GGTCAGCC-CATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC **** * ****** ***** * * * *** * **** * ************ ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG * ****** * ** * * * ********* ***** ** ** *** ** ** ** ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA * *************************** ************** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACC-CAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT * ***** * *** * *** ** *** * * * ** ** ****** ARA.TH_C CACTTT- HUM.JA_A CTCTTTT * ****
Mean pairwise ID: 68.42%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ***************************** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ********************************************** ********* LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ************************************************ ***** ***** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_D TTTT ***
Mean pairwise ID: 68.51%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ***** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_E GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA ** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ******* ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ****** **** * * * * *** * *** * * * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA **** *********************** ** * ** ***** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC * **** ** ******** ** *** ** ** ** ** * ** ** ** * ARA.TH_C CACTTT-- LYC.ES_E CACATTTT *** **
Mean pairwise ID: 68.51%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG * ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* *** HUM.LU_A GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT **** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************ HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA ******** * * * * ******* **** * * ********* ** HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA * ************ ************** * ************ * * ********* HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA * ******* *** * * * **** *** ** ** ** * * ** ****** HUM.LU_A TTTCTTTT ARA.TH_C TCACTTT- * ****
Mean pairwise ID: 68.83%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG * ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* *** HUM.LU_D GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT **** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************ HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA ******** * * * * ********* **** * ** ********* ** HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA * ************ ************** * ************ * * ********* HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA * ******* *** * * **** *** ** * ** * * ** ****** HUM.LU_D TTTCTTTT ARA.TH_C TCACTTT- * ****
Mean pairwise ID: 68.91%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGC-GGATGC ****** ****** ****** *************** ******** * ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_B TTTGCGA--TGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA * * ** * *** *** ** ** ** * *** **** **** * *** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG ZEA.MA_B AGTTG-GTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG ***** **** ** ** *** ** * *** * * * ** ***** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG ** ** ** **** ******* *************** ** ***** ************ ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGAT-CCTCTCTTAGCAA * ******** ********* **** * * **** * *** * * *** ORY.SA_B ACCACCACCTTT ZEA.MA_B ACCACCATCTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 69.06%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * *** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * **** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_G GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA ** * * ** ** *** * ** ******* ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ****** **** * * * * *** * *** * * * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA **************************** ** * ** ***** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC * **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** **** ARA.TH_C CACTTT- LYC.ES_G CACTTTT ******
Mean pairwise ID: 69.08%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ***************************** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC ************************************************************ LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************************************************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC ************************************************ ***** ***** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_D TTTT ***
Mean pairwise ID: 69.18%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ****** ** * * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * ****** ** ******* * * * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_M CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 69.75%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GAATGC ****** ****** ****** *************** *********** * **** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA * * * **** *** ** ** ** **** **** **** * *** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCA--CCTAGAG ZEA.MA_A AGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG-GTCTCTGCAGACCTGGAG ***** **** ** ** *** ** ***** *** * *** ***** *** *** ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGT *** ** ** **** ******* *************** ** *** ** ******** ORY.SA_B GGAAGGATAACGG-GCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC ZEA.MA_A GGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGC ** ********* ********* *** ** *** ** * *** * ** ORY.SA_B AGACCACCACCTTT ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT * ******* ****
Mean pairwise ID: 70.19%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGT-GAACGC ****** ** *** ****** ******* ******* *** *** *** * * ** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRI.AE_A T--GTTGTA-GCGCTGCGGGCCTG-GTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCA ** ** ***** *** *** * *** *** *** *************** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGT-GTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT TRI.AE_A AGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT ********** * * ** ** * ***** *** * * ** * * * ** ** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG *** ** * ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG ********* *********** *** * ** ** **** **** * **** ORY.SA_B ACCACCACCTTT TRI.AE_A ACCACC------ ******
Mean pairwise ID: 70.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * *** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * *** ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT LYC.ES_O GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA ** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ****** ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG ****** **** * * * * *** * *** * * * *** ******* ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA **************************** ** * ** ***** * * ********* ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC * **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** **** ARA.TH_C CACTTT LYC.ES_O CACTTT ******
Mean pairwise ID: 70.42%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT ******** *********************** ** *** * * **** * LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG TRY.BR_A TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG ***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* * LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG TRY.BR_A ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG * * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * *** LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG TRY.BR_A TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTCGAGAAGCACACCGAG ********* **************** ******** * ***** **** ******* * LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT TRY.BR_A GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- **** * *** ** * ******** * * * ** **
Mean pairwise ID: 70.65%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** * * * *** ZEA.MA_B -TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TRI.AE_A GTTGTAGCG--CTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG-CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT *** * * ******** ** * **** ** ** *** **** * ****** ZEA.MA_B TG-GTAGTGTCTGAC--GGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG ** ****** * ****** ********* ******* * ** * ** ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGG **** * **** *********************** *** **** ************* ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC ******* *********** ** **** * * * * *** **** ** ZEA.MA_B CACCATCTTT TRI.AE_A CACC------ ****
Mean pairwise ID: 70.83%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGT ****** ****** ****** *** ********** *********** ***** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_F TTCCTGA--CGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA * * * * *** *** ** *** * **** ***** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGC--TCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG ***** * * ******* ********** * ** ** * **** ** * ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ** ** ** ************ *************** ** ****************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCC--AGAGCCTCATTAAACAG * ******** ********** * **** ** * ** ** **** *** ORY.SA_B ACCACCACCTTT ZEA.MA_F ACCACCATCTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 70.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** **** * *** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT * * * * * * *** ******* ** ***** ************** ZEA.MA_C G-GTAGTGG-CCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC--TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC * ******* *** * **** *** * ** **** ** * * ** ***** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA *** ** *********** **************** ****** *** ********** ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAGAC ****** **** ***** * * ** ***** * * * **** ******* ZEA.MA_C CACCATTTTT TRI.AE_A CACC------ ****
Mean pairwise ID: 70.98%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT ******** *********************** ** *** * * **** * LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG TRY.BR_B TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG ***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* * LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG TRY.BR_B ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG * * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * *** LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG TRY.BR_B TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTGCAGAAGCACACCGAG ********* **************** ******** * *********** ******* * LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- TRY.BR_B GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT **** * *** ** * ******** * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 71.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAA-GGTGGTGTTGGATG ******* ****** ** *** **** ********** *** ***** ***** ORY.SA_A TTTGGTG---TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCG ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCC---TGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCG **** ** * * *** *** *** *** * *** *** ***** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAG-----CGTCCCTGC *************** * * * ** ** * ********* * * ** * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT ORY.SA_B ACCTAGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTT **** ****** ** * ************ *************** ** ******** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ORY.SA_B CCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT *** *************** *** ****** * ********** ****** ** * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ORY.SA_B CCATGGCAGACCACCACCTTT * * ********** ****
Mean pairwise ID: 71.15%
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAA LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA **** ************ ***** LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG *** **** ******** *** * **** * **** * ************** ** LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA LYC.ES_D GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA ** **** ** ********* *********** ******** ***************** LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAACTA ******* ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** *********** LYC.ES_L AACCACCACTTT- LYC.ES_D AACCACCACTTTT ************
Mean pairwise ID: 71.70%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ****** *** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCC-TGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAG * * ** * ***** *** ** * **** **** * *** **** * ***** ZEA.MA_A TTG-GTAGTGT-CTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTG *** ****** * * ****** ********* ******* * * * * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ***** * **** *********************** ****** ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA TRI.AE_A AAGGATAATGG-GCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA ******* * *********** ** * ** * * *** * *** **** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRI.AE_A CCACC------ *****
Mean pairwise ID: 71.79%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGT--GATGTGAACG *********** ******** ******** ** ******* ***** * ** * * * ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRI.AE_A CT-GTTGTAG-CGCTG----CGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTC * * *** * *** ***** * * * *** * ******* ******** ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGA-GGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TRI.AE_A CAAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC------TGGGTCTCACGGTCC *************** *** ******* ***** ** * * ** * * ** ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC TRI.AE_A ATAATGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCC *** **************************************** ************* ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT TRI.AE_A AACGGTGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACT * ************** *** ******* * ** ** **** * ** ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_A CCAGCAGACCACC------ ** *********
Mean pairwise ID: 71.88%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC ****** ****** ****** *************** ********** **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ZEA.MA_D TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC * * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_D AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT ****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT *** ** ** ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA ** ******** ********** * **** ** ****** * **** * *** ORY.SA_B GACCACCACCTTT ZEA.MA_D GACCACCATCTT- ******** ***
Mean pairwise ID: 72.03%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC TRI.AE_B NCCGAGCTAG-TTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGT-GGATGC ****** ** * *** *********** * ******* * *** ***** ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTT---GGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA **** * * * ** *** ** **** * * ** **** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG TRI.AE_B AGTTG-GTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC-GCCTTCTCAGGCCTTAAGTG ***** **** * * **** ** ******* *** ** * * *** **** ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGG ** ** * *** *********************** ** *** ************** ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA ********* ************ ******** **** ** **** ***** ORY.SA_B CCACCACCTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ****** ****
Mean pairwise ID: 72.20%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC ****** ****** ****** *************** ********** **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ZEA.MA_E TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC * * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_E AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT ****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT *** ** ** ************ *************** ** **** ************ ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA ** ******************* * **** ** ****** * **** * *** ORY.SA_B GACCACCACCTTT ZEA.MA_E GACCACCATCTTT ******** ****
Mean pairwise ID: 72.22%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA ************************* ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT- LYC.ES_H CCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 72.44%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC ****** ****** ****** *************** ********** **** * ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC ZEA.MA_G TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC * * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** ** ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_G AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT ****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG *** ** ** ************ *************** ** ***************** ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAG * ******************* * **** ** ****** * **** * **** ORY.SA_B ACCACCACCTTT ZEA.MA_G ACCACCATCTTT ******* ****
Mean pairwise ID: 72.46%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA **** ** *** * ** * * * **** *** * * **** ** ** *** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_K CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 72.52%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGC ****** ****** ****** *************** *********** ****** ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA **** ** *** *** * **** *** * **** ********** ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTC-GAGCGTCCCTGCACCTAGAGT ZEA.MA_C AGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT ***** **** * ** ** ** ****** **** * * ** *** ** ***** *** ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG *** ** * *********** *************** ** *** *** ******* ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT-CCATGGCA ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA ********** **** ******* *** ***** **** * * * * * *** ORY.SA_B GACCACCACCTTT ZEA.MA_C GACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 72.67%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ****** ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * ** ** *** ******** ** ** ** * ** *** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ********** * ** **** ********** * ** *** *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGA **** * *** ******* *************** ******* ** ********** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAA TRI.AE_B AGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA ******** * ********* ** *** *** *** * * * **** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 72.73%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * ******* ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT * * * ***** * ********** ** ** * ** ** *** ***** * ****** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ******** * **** ********** * ** *** *** ** ***** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGAAG * * *** ******* *************** *** ** ************* ** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAACCA TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA ******* ********* ** **** * ** * * ** * ***** **** ZEA.MA_B CCATCTTT TRI.AE_B CCATCTTT ********
Mean pairwise ID: 72.79%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA ******* ** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** * *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_A ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_A CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 73.44%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************************** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA ******* *** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_F CTTTT LYC.ES_J CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 73.63%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ** * * ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA * * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** **** ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * *** ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG ***** * **************************** *** *** ************* ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA * ******* ************* * ** **** * * * * ***** ****** ZEA.MA_E CCACCATCTTT TRI.AE_A CCACC------ *****
Mean pairwise ID: 73.83%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT ** * * * * * ******** * * ***** * ** ** ********* * ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ******** ****** * ****** * ***** ** ** * * *** * * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCC *** ** ****** * **** ******************************* ** * ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_A CAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCA ** ****** ******** * ** ******* *** *** ** *** **** * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_A CTA-AGCAAACCACCATCTTT *** * ** ************
Mean pairwise ID: 73.84%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG LYC.ES_L ---------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGG ***** ** ********* **** * *** ** LYC.ES_M CTAATT-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-A LYC.ES_L CTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGA ** ** ************* ******** ************* *** * **** * LYC.ES_M TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGT LYC.ES_L CCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAAC **** * ******************* **** ** ********* *********** LYC.ES_M GAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT- LYC.ES_L GAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTT ******** ************************ ***** *** ** * * *** **** LYC.ES_M AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT LYC.ES_L AACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT- ****** * ***** ******** ***** ***** **
Mean pairwise ID: 73.87%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ** * * ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA * * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** **** ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * *** ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG ***** * **************************** *** ***************** ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA * ******* ************ * ** **** * * * * ***** ****** ZEA.MA_D CCACCATCTT TRI.AE_A CCACC----- *****
Mean pairwise ID: 74.11%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** **************** ** *********** *** **** * * * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT TRI.AE_A GT-TGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAGT ** * * ******** ** * ***** **** * **** ************* ZEA.MA_F TG-GTTGTGGCTGG--TGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC ** ** **** * ******* ***** ** **** *** * * * * *** ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA ***** **************************** *** ****************** ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG-AGCCTCATTAAACAGACC TRI.AE_A AGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC ******* ********** * * ** **** * ** * * ***** * * ****** ZEA.MA_F ACCATCTTT TRI.AE_A ACC------ ***
Mean pairwise ID: 74.11%
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ******** ******* ******** **** *********** * * * **** * *** TRI.AE_B TGGTGCGGT-TTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTAC--TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT * ** * ** ******* ** * ** ** ******** ************* TRI.AE_B TG-GTAGTGGGCTGGGTGG--CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGC TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCT-CACGGTCCATAATGTGGC ** ******* * * *** ** ********* * ** * * * ** *** ***** TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA ****** *** ******* *********************** **************** TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAAT-TGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC ****** ********** * ** * ******** * ** * ******** TRI.AE_B ACCATCTTT TRI.AE_A ACC------ ***
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** **** ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ******* ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGA *** * *** ******* *************** *** **************** ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC ******************* * **** **** ** * * * ******* ZEA.MA_D CACCATCTT- TRI.AE_B CACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT ********* ** ******************** *********** *** ** * * ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA * * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** **** ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG **** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * *** ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG ***** * **************************** ********************* ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC ******* ************* * ** **** * * * * ***** ******* ZEA.MA_G CACCATCTTT TRI.AE_A CACC------ ****
Mean pairwise ID: 74.34%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG *** ***** **** ********** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ************************************************** * ******* ZEA.MA_C TGGT-ACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT * * * ** *** ******* ** * *** * * * *** ***** * ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ******** * * ** *** *** * ** **** ** ****** ** **** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGAA ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA **** ***** ****** ********************* *** ** ******** * ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTA--GCAAAC ******** *** ***** ** ** * ** ** *** * ** *** ** ZEA.MA_C CACCATTTTT ZEA.MA_B CACCATCTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ******* ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGA *** * *** ******* *************** *** **** ************* ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC ******** ********** * **** **** ** * * * ******* ZEA.MA_E CACCATCTTT TRI.AE_B CACCATCTTT **********
Mean pairwise ID: 74.67%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG *** ***** **** ********** *** LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_I TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 74.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ****************************************************** ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * * ** ****** ** * *** * * * *** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ********** * * *** *** *** * ** **** ** ***** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA ****** ***** ****** ************************* ** ******** ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GCAA ZEA.MA_C AGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** * *** ***** ** ** * **** *** ***** *** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 74.76%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** **** ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ******* ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA *** * *** ******* *************** ****** ************** * ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGACC TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC ******* ********** * **** **** ** * * * ******** ZEA.MA_G ACCATCTTT TRI.AE_B ACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 74.91%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG LYC.ES_D ------------------------------------------------------------ LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA LYC.ES_D --TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA * ***************************** ************************* LYC.ES_M TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA LYC.ES_D TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA ********************* ************************************** LYC.ES_M ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC LYC.ES_D ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC ************************************************************ LYC.ES_M GCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT LYC.ES_D GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT ******************* ***** ***** ***
Mean pairwise ID: 75.57%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ******* ******************** ******* ** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************** ****** *** LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** **** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * *************************** * ***** **************** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC **** * **** * *** * * ** ****** ** ** *** ****** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 75.66%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************** ****** ** * * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ***************************** ** * ****** ** ************ LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT **** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** **** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 75.70%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ******* ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT *** ********** * ********************************* *** **** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA *** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT *** * ***************
Mean pairwise ID: 75.99%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG **************** ********** *** LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_N TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 76.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ******* ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_D CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT ZEA.MA_D CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT *** ********** * ********************************* ******** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_D CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA *** ****** ************ ******* * * **** ** ********* * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_D CTA-AGCAGACCACCATCTT- *** * **************
Mean pairwise ID: 76.10%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ******* *** *** **** *** ***** * ******* * * ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC ****** ** ** * ******* ** ***** ********* ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC TRI.AE_B CAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGCC ******* ********* ** * **** ****** ** ** ** * * * ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA TRI.AE_B TTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCA * ************* *** ******* *************** ****** ******* ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA TRI.AE_B ACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCA ******************* ****** * ********** **** *** * * ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B TAGCAGACCACCATCTTT * ***************
Mean pairwise ID: 76.14%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ******************** ******* ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA ***************************** *** * ***** ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC *** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_N ATTTTT * ****
Mean pairwise ID: 76.25%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******** *********** ******** ********** *** ***** ******* ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_G CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA ******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC ZEA.MA_G CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC *** ********** * ****************************************** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ZEA.MA_G CAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC ** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_G TA-AGCAGACCACCATCTTT ** * ***************
Mean pairwise ID: 76.30%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * * ********* *** ********** * ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAG * ** *** ** * ************* **** * ** ** ***************** ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG TRI.AE_B TTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ***** **** * * **** ******* ** * * *** * ** *** *** ***** ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGAAG *** *** ******* *************** *** **************** ** ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAA-CTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA ***************** **** ** ** * ** * * * ******* ZEA.MA_F CCATCTTT TRI.AE_B CCATCTTT ********
Mean pairwise ID: 76.32%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG *** ***** **** ********** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** ******************************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_M CTTT ***
Mean pairwise ID: 76.34%
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG ******** * ********************** * * ************ * * ** LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG TRY.BR_A GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT *** **** **** * ** ********* ***** ********* ** ********** LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG TRY.BR_A GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG * * ** *** **** * *** ******* *** * *** * ********* LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA TRY.BR_A CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCA **** *************** ******* * ***** **** ******* ****** LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT TRY.BR_A TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG- * ** * **** * ****** * ********* **
Mean pairwise ID: 76.39%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * * ********* ******* * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ** ** * ** **** *** ****** ** * ******** **** **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_K CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG ******** *** ************** * **** ***** ** *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC-AATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * *** ********************** * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ********** **** * * **** * * * * ** *** ** ****** **** LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ****************************** *** *********************** LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC *** ** **** * * *** * *** ** ***** ** ** *** ****** * * LYC.ES_C ACATTT LYC.ES_F ACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************* *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT- LYC.ES_H CCTTTT * ***
Mean pairwise ID: 76.49%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTC ***** * *** ****** * ** *** *** **** ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC ZEA.MA_C CAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGACC ******* ******* * * **** **** ***** * * ***** ** ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA ZEA.MA_C TATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTA ** ********* ** *********** ************************ *** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT-CT ZEA.MA_C ACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACT ******************* ***** * ***** ***** **** *** * * * ** ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AAAGCAGACCACCATTTTT * * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.62%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ************ ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT **** * ** * ** ******* * ** *** * *** ******************** ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG TRI.AE_B GGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG ******** * * ** *** ***** * ** ** * ** * *** ******** ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGAAGG * ** *** ****** *************** ******* ** ************ ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGACCA ********** ************* **** ***** * * * ********* ZEA.MA_C CCATTTTT TRI.AE_B CCATCTTT **** ***
Mean pairwise ID: 76.64%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** **** ************* *** ** ****** * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ***************************** ** * ****** ** ************ LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT **** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** **** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 76.87%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG ******** * ********************** * * ************ * * ** TRY.BR_B GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG *** **** **** * ** ********* ***** ********* ** ********** TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG * * ** *** **** * *** ******* *** * *** * ********* TRY.BR_B CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA **** *************** ******* * *********** ******* ****** TRY.BR_B TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-- * ** * **** * ****** * ********* ** *
Mean pairwise ID: 77.05%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******************************* LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************ ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_M CTTT- ***
Mean pairwise ID: 77.12%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ********* **** *************** * ******** ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA ***************************** *** * ***** ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC *** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_I ATTTTT * ****
Mean pairwise ID: 77.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** *************************** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG * * ** * * * ****** * * ****** ** ***************** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ***** ***** * *** *** ***** ***** ***** ** ** ***** ** *** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG *** * ************ ********************* *** *** ******** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA ************* ***** ** * * * ** * *** * ** **** ZEA.MA_C CCACCATTTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 77.19%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ****** ******* ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GTTGTG--ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ** * * *** ***** ******* * ***** * *** ** ********* * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC ******** ****** * * ****** * ***** ** ** * * *** * * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC *** ** ****** * **** **************************** **** **** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC ** ****** ********* ** ******* *** **** * * ****** * *** ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B T-TAGCAAACCACCATCTTT * * ** ************
Mean pairwise ID: 77.20%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** * ************* ******** *********** ****** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* ********* ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ***** * ** * ** ******** *** * * * * * *** ** ***** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ** ***** *************************** ******* ************** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******* ARA.TH_A CCATTTT ARA.TH_G CCATTTT *******
Mean pairwise ID: 77.22%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC-CAGGCTTAGCGGGGAGG-ACGTGG ******** ********************** * * *** * * ***** *** LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC LEI.MAJ. ACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTG--- ****** ** **** *********************************** * LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC LEI.MAJ. -TGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTC * ******* ****** ** ****** ** ***** *** ***** ***** LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGGA LEI.MAJ. AGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGA ******* **************** * ******** ************ *********** LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT LEI.MAJ. GCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT ** **** *** ** ****** ** * ***** **
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * * ********* ******* * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_J CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG * * ********* ******* * * ********************** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ****** *** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** **************************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_C CATTT LYC.ES_A CCTTT * ***
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ********* ******************** ******* ** ********** *** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************** ********** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA ******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** **** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA * **************************** * ***** **************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC **** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_O ACTTT- *****
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ******* **** *************** * ******** ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA ***************************** *** ******* ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC *** * *** *** ******* * ** ****** ** *** ************ * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_B ACTTTT ******
Mean pairwise ID: 77.52%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ********* ***** * ************* ******** *********** ****** ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG * **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* ********* ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTT-CTAGAGTCGGAGGG ***** * ** * ** ******** *** * * **** *** ** ***** ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ** ***** *************************** ******* ************** ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******* ARA.TH_G CCATTTT ARA.TH_F CCATTTT *******
Mean pairwise ID: 77.88%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** **** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA * * * * * ** ** *** ** ********** *********** **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** ***** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ****** ************ ********************* *** *** ******** ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAG ************* ***** * ** * * ***** *** * ***** **** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ZEA.MA_D ACCACCATCTT- ******** **
Mean pairwise ID: 77.96%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************* *** ** ****** * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ***************************** ** * ******* ** ************ LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC **** * **** * * *** ** **** *********** **** ****** ***** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_B TTTT ***
Mean pairwise ID: 78.10%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* *************** **** ********* ***** ********** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** ********* ** ** ** **** **** ******* ********* ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT ***** * * ** ** ** ******* **** * *** * ****** ****** ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC * ***** ******* ******************* **** ** ********** *** ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCAC ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC * ****** * * * ** *********** ******* *** * * * * ** ***** ARA.TH_D CACTTT ARA.TH_G CATTTT ** ***
Mean pairwise ID: 78.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******* *********** *** ***** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCT---TGTATGTGCCA-CTGGCCGGCCTGCCCGTT *** ** ******** ******* *** ** * ** ** *** ******** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGAC ******** ** **** * ** ****** *********** * * *** * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC ** *** ******** ********************************* ********* ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCAT ** ****** ************ ****** **** ** ** ****** * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F TA-AACAGACCACCATCTTT ** *****************
Mean pairwise ID: 78.14%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT **************************************************** **** ** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA * * * * * ** ** *** ** ********** *********** **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** ***** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG ****** ************ ************************ *** ******** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAGA ******** **** ***** * ** * * ***** *** * ***** ***** ZEA.MA_C CCACCATTTTT ZEA.MA_G CCACCATCTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 78.21%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT **************************************************** **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** *** *** ** ********** *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** ***** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG ****** ************ ********************* ******* ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GCAG ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** **** ***** * ** * * ***** *** ***** **** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 78.62%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******************************* LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ************************************************ *********** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_O TTT- LYC.ES_M CTTT **
Mean pairwise ID: 78.76%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ********* **** *************** * ******** ***************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ************** ********** LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA ******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** **** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA * **************************** * ***** **************** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC **** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_G ACTTTT ******
Mean pairwise ID: 79.61%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******** **** ************** ****** ** * * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG * ****** ** ******* * * * * ************* ******** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** * ****** ** * ****************** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ***************************** * ** ***** ****************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** ***** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_O TTT- **
Mean pairwise ID: 79.74%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** ************** ******** * **************** ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * **** ******* *** * ************ ***** ******* ********* ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT ***** * *** ** ********** *** * **** * ****** * ****** ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC * ***** ******* ******************* ******* ************** ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCAC ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC ** *** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******** ARA.TH_E CATTTT ARA.TH_G CATTTT ******
Mean pairwise ID: 80.33%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ****** **** ************** ****** ** * * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG * ****** ** ******* * * * * ************* ****** * ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** * ****** ** * ****************** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA **************************** * ** ***** ****************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC ** ** *** * * ****** * **** ***************************** LYC.ES_C ATTT- LYC.ES_E ATTTT ****
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ******** **** ************* *** ** ****** * *************** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG * ***** *** ******* * * * * ************* ******** ** LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** * ****** ** * ****************** LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ***************************** * ** ***** ****************** LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** ***** LYC.ES_C ATTT LYC.ES_G TTTT ***
Mean pairwise ID: 80.94%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********* ******* *** ******* *********** * * ***** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ********* *************** *** * ***** *** **** ***** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG *** *** ******** ** ******** ** ******** ************* GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ********* ****** **** GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** ** * **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG * ************************ ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC ** ********* *********** ** * ****** ** ************ LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_A TTT LYC.ES_N TTT ***
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC ** ********* *********** ** * ****** ** ************ LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_A TTT LYC.ES_I TTT ***
Mean pairwise ID: 81.25%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_K CTTT ***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************************* ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_A CTTT- ***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_K CTTT- ***
Mean pairwise ID: 81.58%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA-ACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** * * * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_A CTTT ***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG ******* ** * ** ***** ******** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* ********************************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC ************************************************************ LYC.ES_H TTTT LYC.ES_M TTT- ***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_I TTTT ***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG *************************** ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ******** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 82.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********* ******* *** ******* ************ * **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** ** * ***** ************** ****** RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT- ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ************** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_J CTTT ***
Mean pairwise ID: 82.24%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT * * ******* *** ********************************* ***** * * HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA * **** *** *** ****** ********* * ******************* ** HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT * ** **** * ** * ** ****** ** * ****** * ********** HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ************ **************** ****************************** HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC ********** **** ** ** ** * **** ************************ HUM.JA_B TTTT HUM.LU_C TTTT ****
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ************************ ******** ** * ** ***** **** *** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG **** ******* ****************** * ***** * ****** ******* ** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA ********** * ******* **** * **** ** ******** ************** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************ LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT * ******** * *** *********** *************** **** **** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_N TTTT ***
Mean pairwise ID: 82.27%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT ****** ********* ******* *** ******* *********** * ** **** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** ***** *************** ** * ***** ************** ****** FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.30%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG *************************** ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** ****** **** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_J CTTT- ***
Mean pairwise ID: 82.57%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** *********** LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_K CTTT LYC.ES_O TTT- **
Mean pairwise ID: 82.61%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********** ******* *** ******* ************* ** **** ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** * * ***** ************** ****** ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC *** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_K CTTT ***
Mean pairwise ID: 82.89%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT * * ******* *** **************************** **** ********* HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA ** **** *** **** ****** ********* * * ***************** ** HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT * ******* * ** ************* * ** ** ****** * ********** HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ************ **************** ****************************** HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTC--ACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC *** ****** **** **** ** ** **** ********* ****** ** HUM.LU_C TTTT HUM.JA_A TTTT ****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************************* ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** *********** LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** ** ***** ****************** LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_O TTT- LYC.ES_A CTTT **
Mean pairwise ID: 82.95%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG * ************ ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA *************************** ** ** **** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** **** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_I TTTT- ***
Mean pairwise ID: 83.22%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********* * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_A CTTT ***
Mean pairwise ID: 83.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ** ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *********************** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_H CTTTT ****
Mean pairwise ID: 83.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * ***** GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ******** ******************* ** ****** *** **** ****** ***** GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG *** ************ ** ******** ** *********** ********** GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ********* ****** *** GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* ***** ****** ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 83.33%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG *************** * ******* **** ********* **** ****** *** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG **** ******** **** ****** * *** * *********************** ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTT--GCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ******** **** * ** *********** ** ** * ***** ********** ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA **************** ************************ ************** *** ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC *** *** *** ****** *********** ****** ******* ** ***** ARA.TH_D CACTTT ARA.TH_F CATTTT ** ***
Mean pairwise ID: 83.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************************* ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ************** *********** LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_J CTTT LYC.ES_O TTT- **
Mean pairwise ID: 83.61%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ****************** *** ******* ************ ** **** HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ********* *************** ** * ***** **** ********* ****** HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** * * ** ****** **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.67%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* ************ CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** ** * * *** ********************** CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT *** **** ******* * ********** * ******** *********** ** CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA * * ** ***** ******** ***** ******* ****** *************** CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT- ************** * * * * ****** ****************** *****
Mean pairwise ID: 83.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ****************** *** ******* **************** **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** ** * ***** ************** ****** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT- ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** ******************* * ***** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT-TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT * ** ** *************** ** **** * ** ****** ***** * ****** ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG ZEA.MA_F TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG **** *** *** ******* ***** ** * *** **** ****** ******** ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG * ******* ********************************* **************** ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCAC ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC ******* ********* * ******** * * ***** **** * * ** ***** ZEA.MA_B CATCTTT ZEA.MA_F CATCTTT *******
Mean pairwise ID: 83.88%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** ******* ****************** * ************** *********** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** ***** ******* ** **************** **** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *** ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT LYC.ES_J CTTT ***
Mean pairwise ID: 83.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG * ************************ ******** ** * ** ***** ******** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG ****** ******** *********************** * ************** ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************ *** * ** ***** ****************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_O TTT-- **
Mean pairwise ID: 83.95%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********** ******* *** ******* ************* ** **** CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ********* *************** *** * ***** ************** ****** CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG ***** *** ******** * ****** **** ******** ************* CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ************ CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT ******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.99%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG *************** * ******* **** ********* **** ****** *** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG **** ******** **** ****** * *** * *********************** ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG ******** **** * ** *********** **** ** * ***** ********** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA **************** ************************ ************** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC *** *** *** ****** *********** ****** ******* ** ***** ARA.TH_A CATTTT ARA.TH_D CACTTT ** ***
Mean pairwise ID: 84.00%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* ************ CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** **** * *** ********************** CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT *** **** ******* * ********** * ******** *********** ** CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA * * ** ***** ******** ***** ******* ****** *************** CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT- ******** ***** * * * ******** ****************** *****
Mean pairwise ID: 84.05%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ******* *** ******* ** ***** ** **** RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ************************** * ** ****** ********************* RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* RAT.RAT. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- ******************* **** ******* ***** ******** * ** RAT.RAT. T XEN.LAE. -
Mean pairwise ID: 84.24%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ***************************** *********************** *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT-TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA * ** ** ** ******* ****** ** **** *********** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG ****** *** ********* *** ***** ** * *** **** ******* ***** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG **** ******* **************************** *** ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA ZEA.MA_F GAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA ********* * ********* * **** ***** ** **** ***** *** ** * ZEA.MA_A CCACCATCTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 84.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** *** LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG *************************************** * ************** ** LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************ *** * ** ***** ****************** LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC ** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** ***** LYC.ES_G TTTT- LYC.ES_H CTTTT ***
Mean pairwise ID: 84.26%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG *************** ******** **** ********* * ** ********** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG **** *** **** *** *** ** ** *** * **** ****************** ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT ******* ***** **** *********** **** *** ********* ******* ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT **************************************** ************** **** ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACC ** **** *** ****** *********** ****** ******* ** ****** ARA.TH_D ACTTT ARA.TH_E ATTTT * ***
Mean pairwise ID: 84.59%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG ** ****************************************** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA *************************** ** ** **** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT ** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** **** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_N TTTT- ***
Mean pairwise ID: 84.62%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* ************ CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** ** * ***** ********************** CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT ******** ******* * ******** * * ******** ************** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT * * ** ***** ******** ***** ****************************** CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT ************** * * ******** ******************* **
Mean pairwise ID: 84.92%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG ************** ***************** ***** **** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG ****** ******** *********************** * ************* ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA *************** ********* ***** ***** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA *************************** ** ******* * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC ** ***** ** *** *** ***************** **** ****** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_B TTTT- ***
Mean pairwise ID: 84.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT ********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * **** RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG ** *********************** * ** ****** ********************* RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG ***** ************ * ****** *** *********** ********** RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG ************************************** ******* ************* RAT.NOR. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT ******************* **** ******* ***** ******** * ***
Mean pairwise ID: 84.95%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG **** * ************** ************************* *********** CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC ***** ************** *** ** * ***** ********************** CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT ******** ******* * ******** * * ******** ************** CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA * * ** ***** ******** ***** ****************************** * CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT ************** * * ******** ********************* *