There are 135 alignments in the test set.
Mean pairwise ID: 68.08%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_L --------------------------------------------------------GTTG
****
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATT-TCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
LYC.ES_L GGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATG
** ** ************* * *** **** ** ************* ********
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAA-TGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGG
LYC.ES_L GAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGG
*********** **** * * ****** **** * ** *******************
LYC.ES_G ACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGAT
LYC.ES_L ACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGAT
** ***************************** * ******** ****************
LYC.ES_G AACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCC-TGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
LYC.ES_L AACGGGTCAGTGCTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCAC
***** * **** * *** * **** *** **************** ********
LYC.ES_G CACTTTT
LYC.ES_L CACTTT-
******
Mean pairwise ID: 68.08%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
HUM.JA_A ----GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTG
* ** **** **** *** * ******** * ** ** ******** ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
HUM.JA_A GGTCAGCC-CATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
**** * ****** ***** * * * *** * **** * ************
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
HUM.JA_A GAGAGTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGG
* ****** * ** * * * ********* ***** ** ** *** ** ** **
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
HUM.JA_A CAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
* *************************** ************** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACC-CAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
HUM.JA_A TAACGGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGTCACTGCATGCACTCTTAATCAGACCAT
* ***** * *** * *** ** *** * * * ** ** ******
ARA.TH_C CACTTT-
HUM.JA_A CTCTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 68.42%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
*****************************
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ********************************************** *********
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
************************************************ ***** *****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_D TTTT
***
Mean pairwise ID: 68.51%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
***** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_E GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTA
** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** *******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_E CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
****** **** * * * * *** * *** * * * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_E GACC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
**** *********************** ** * ** ***** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_E TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTAC
* **** ** ******** ** *** ** ** ** ** * ** ** ** *
ARA.TH_C CACTTT--
LYC.ES_E CACATTTT
*** **
Mean pairwise ID: 68.51%
HUM.LU_A GCCGGTCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
* ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* ***
HUM.LU_A GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
**** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************
HUM.LU_A GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGGCTGGGTTGCGCACGTCCTAGAGTGGAGGG
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
******** * * * * ******* **** * * ********* **
HUM.LU_A CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
* ************ ************** * ************ * * *********
HUM.LU_A TAACGGGCCGGTGCTACCTGGGTCCACCATGCTTCACTAGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA
* ******* *** * * * **** *** ** ** ** * * ** ******
HUM.LU_A TTTCTTTT
ARA.TH_C TCACTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 68.83%
HUM.LU_D GACGGGCTTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTG
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
* ** ** ** **** **** *** * ******** * ** ** ******* ***
HUM.LU_D GGTCAACCT-AGTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTACTGGTCTGCCCATTCCAAGCC
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
**** * ** * *** ***** * * * *** * **** * ************
HUM.LU_D GGGAGTTGGGCTGAGTGACCTGGGCGAAGGCT-GGGTTGCGCAGCTCCTAGAGTGGAGGG
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
******** * * * * ********* **** * ** ********* **
HUM.LU_D CAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGA
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
* ************ ************** * ************ * * *********
HUM.LU_D TAACGGGCCGGTGCTACCTGGATCCACCATGCTTCACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCA
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGCCCACTATGACCCAATAAGCCGCTCC--GATTGGACCA
* ******* *** * * **** *** ** * ** * * ** ******
HUM.LU_D TTTCTTTT
ARA.TH_C TCACTTT-
* ****
Mean pairwise ID: 68.91%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGC-GGATGC
****** ****** ****** *************** ******** * ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_B TTTGCGA--TGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
* * ** * *** *** ** ** ** * *** **** **** * ***
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
ZEA.MA_B AGTTG-GTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
***** **** ** ** *** ** * *** * * * ** ***** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
** ** ** **** ******* *************** ** ***** ************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ZEA.MA_B GGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGAT-CCTCTCTTAGCAA
* ******** ********* **** * * **** * *** * * ***
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 69.06%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* *** ** ***** * ******** * **** *** * ** *** * * *** * ****
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_G GGCTG-TACCAGATGGTTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
** * * ** ** *** * ** ******* ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_G CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
****** **** * * * * *** * *** * * * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_G GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
**************************** ** * ** ***** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_G TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
* **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** ****
ARA.TH_C CACTTT-
LYC.ES_G CACTTTT
******
Mean pairwise ID: 69.08%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_D -------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
*****************************
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_D AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
************************************************************
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_D CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************************************************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCAC
LYC.ES_D TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCAC
************************************************ ***** *****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_D TTTT
***
Mean pairwise ID: 69.18%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
****** ** * * ********** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* ****** ** ******* * * * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_M CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 69.75%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GAATGC
****** ****** ****** *************** *********** * ****
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_A TTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
* * * **** *** ** ** ** **** **** **** * ***
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCA--CCTAGAG
ZEA.MA_A AGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG-GTCTCTGCAGACCTGGAG
***** **** ** ** *** ** ***** *** * *** ***** *** ***
ORY.SA_B TGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGT
ZEA.MA_A CGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGT
*** ** ** **** ******* *************** ** *** ** ********
ORY.SA_B GGAAGGATAACGG-GCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGC
ZEA.MA_A GGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCA-GAACCTCACTAAGC
** ********* ********* *** ** *** ** * *** * **
ORY.SA_B AGACCACCACCTTT
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
* ******* ****
Mean pairwise ID: 70.19%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGT-GAACGC
****** ** *** ****** ******* ******* *** *** *** * * **
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRI.AE_A T--GTTGTA-GCGCTGCGGGCCTG-GTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCA
** ** ***** *** *** * *** *** *** ***************
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGT-GTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
TRI.AE_A AGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT-GGGTCTCACGGTCCATAATGT
********** * * ** ** * ***** *** * * ** * * * ** **
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_A GGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTG
*** ** * ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAG
********* *********** *** * ** ** **** **** * ****
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
TRI.AE_A ACCACC------
******
Mean pairwise ID: 70.26%
ARA.TH_C GTCGAACTCAGTAACGCGGGCTTGTGATCCAAGTGGAGACAATAAGGGGATGGGACGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* *** ** ******* ******** * ******** ** ***** * *** * ***
ARA.TH_C GGTCGATCTCATTGGGCCGGGTTCGGGTTGGGCTATATTCTGGCCCGCCCATTCCAAGTT
LYC.ES_O GGCTG-TCCCAGATGGCTGGGCTTGG--TGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCA
** * ** ** *** *** * ** ******* ******** **** ******
ARA.TH_C GGGAGTTGAGGCATGGGCTTCGAGCGAAGGCTCGGGTCTCATGTCTTCTAGAGTGGGGGA
LYC.ES_O CAGAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTG
****** **** * * * * *** * *** * * * *** *******
ARA.TH_C GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGTCCACCTCCCGCTCTTGACGGTGGAAGGA
LYC.ES_O GACCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGA
**************************** ** * ** ***** * * *********
ARA.TH_C TTACGGGCCATTGCCTTCCGAGC-CCACTATGACCCAATAAGCCGCTCCGATTGGACCAT
LYC.ES_O TAACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCAC
* **** ** ******** ** *** ** ** ** ** ***** *** ****
ARA.TH_C CACTTT
LYC.ES_O CACTTT
******
Mean pairwise ID: 70.42%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT
******** *********************** ** *** * * **** *
LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG
TRY.BR_A TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG
***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* *
LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG
TRY.BR_A ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG
* * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * ***
LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG
TRY.BR_A TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTCGAGAAGCACACCGAG
********* **************** ******** * ***** **** ******* *
LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
TRY.BR_A GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
**** * *** ** * ******** * * * ** **
Mean pairwise ID: 70.65%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** * * * ***
ZEA.MA_B -TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TRI.AE_A GTTGTAGCG--CTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG-CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
*** * * ******** ** * **** ** ** *** **** * ******
ZEA.MA_B TG-GTAGTGTCTGAC--GGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTGG
** ****** * ****** ********* ******* * ** * **
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
TRI.AE_A CAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGG
**** * **** *********************** *** **** *************
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAAC
TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC
******* *********** ** **** * * * * *** **** **
ZEA.MA_B CACCATCTTT
TRI.AE_A CACC------
****
Mean pairwise ID: 70.83%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGT
****** ****** ****** *** ********** *********** *****
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_F TTCCTGA--CGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
* * * * *** *** ** *** * **** ***** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGGC--TCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
***** * * ******* ********** * ** ** * **** ** *
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
** ** ** ************ *************** ** ******************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ZEA.MA_F GGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCC--AGAGCCTCATTAAACAG
* ******** ********** * **** ** * ** ** **** ***
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 70.97%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** **** * ***
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTG-GGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGTT
* * * * * * *** ******* ** ***** **************
ZEA.MA_C G-GTAGTGG-CCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
TRI.AE_A GCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC--TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC
* ******* *** * **** *** * ** **** ** * * ** *****
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAA
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
*** ** *********** **************** ****** *** **********
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCG-CAGCCTACTCCAGCAGAC
****** **** ***** * * ** ***** * * * **** *******
ZEA.MA_C CACCATTTTT
TRI.AE_A CACC------
****
Mean pairwise ID: 70.98%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGA-CGTCT
******** *********************** ** *** * * **** *
LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG
TRY.BR_B TGGACAAGCG--GGGGTTCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG
***** *** *** ** ******** ***** ********* ** ******* *
LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGGGGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGG
TRY.BR_B ----TTGAGGTCGCCACTGTAGA-GAGGCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGG
* * * ** ** *** * **** * * * ********** * ** * ***
LEP.COL. TCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCG
TRY.BR_B TCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGT-TCCCGTTGCAGAAGCACACCGAG
********* **************** ******** * *********** ******* *
LEP.COL. GAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
TRY.BR_B GAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
**** * *** ** * ******** * * * ** ** *
Mean pairwise ID: 71.03%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAA-GGTGGTGTTGGATG
******* ****** ** *** **** ********** *** ***** *****
ORY.SA_A TTTGGTG---TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCG
ORY.SA_B CCTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCC---TGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCG
**** ** * * *** *** *** *** * *** *** *****
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
ORY.SA_B TTCCAAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAG-----CGTCCCTGC
*************** * * * ** ** * ********* * * ** * *
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT
ORY.SA_B ACCTAGAGTGGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTT
**** ****** ** * ************ *************** ** ********
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ORY.SA_B CCAACGGTGGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT
*** *************** *** ****** * ********** ****** ** *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_B CCATGGCAGACCACCACCTTT
* * ********** ****
Mean pairwise ID: 71.15%
LYC.ES_L GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGGCTTATAGT-CTGGCCTGCCCTCTCCAA
LYC.ES_D -------------------------------------TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAA
**** ************ *****
LYC.ES_L GCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGACCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGG
LYC.ES_D GCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-ATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGG
*** **** ******** *** * **** * **** * ************** **
LYC.ES_L GGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGA
LYC.ES_D GGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGA
** **** ** ********* *********** ******** *****************
LYC.ES_L AGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTTAACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTA
LYC.ES_D AGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAACTA
******* ***** *** ** * * *** **** ****** * ***** ***********
LYC.ES_L AACCACCACTTT-
LYC.ES_D AACCACCACTTTT
************
Mean pairwise ID: 71.70%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ****** ***
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCC-TGGTCTGGGTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAG
* * ** * ***** *** ** * **** **** * *** **** * *****
ZEA.MA_A TTG-GTAGTGT-CTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
TRI.AE_A TTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCT--GGGTCTCACGGTCCATAATGTG
*** ****** * * ****** ********* ******* * * * *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
***** * **** *********************** ****** ** **********
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
TRI.AE_A AAGGATAATGG-GCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
******* * *********** ** * ** * * *** * *** **** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRI.AE_A CCACC------
*****
Mean pairwise ID: 71.79%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGT--GATGTGAACG
*********** ******** ******** ** ******* ***** * ** * * *
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRI.AE_A CT-GTTGTAG-CGCTG----CGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTACTGCTGGCCCGCCCGTTC
* * *** * *** ***** * * * *** * ******* ********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGA-GGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TRI.AE_A CAAGTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC------TGGGTCTCACGGTCC
*************** *** ******* ***** ** * * ** * * **
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCC
TRI.AE_A ATAATGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCC
*** **************************************** *************
ORY.SA_A ATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCT
TRI.AE_A AACGGTGGAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTG-GGCCTCGCAGCCTACT
* ************** *** ******* * ** ** **** * ** **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_A CCAGCAGACCACC------
** *********
Mean pairwise ID: 71.88%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC
****** ****** ****** *************** ********** **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ZEA.MA_D TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
* * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_D AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT
ZEA.MA_D GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGT
*** ** ** ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
ZEA.MA_D GGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA
** ******** ********** * **** ** ****** * **** * ***
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
ZEA.MA_D GACCACCATCTT-
******** ***
Mean pairwise ID: 72.03%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
TRI.AE_B NCCGAGCTAG-TTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGT-GGATGC
****** ** * *** *********** * ******* * *** ***** ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
TRI.AE_B TTGGTGCGGTTTGTT---GGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
**** * * * ** *** ** **** * * ** **** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGTG
TRI.AE_B AGTTG-GTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC-GCCTTCTCAGGCCTTAAGTG
***** **** * * **** ** ******* *** ** * * *** ****
ORY.SA_B GCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTGG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGG
** ** * *** *********************** ** *** **************
ORY.SA_B AAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAGA
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
********* ************ ******** **** ** **** *****
ORY.SA_B CCACCACCTTT
TRI.AE_B CCACCATCTTT
****** ****
Mean pairwise ID: 72.20%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC
****** ****** ****** *************** ********** **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ZEA.MA_E TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
* * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_E AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTAC-CGCCCGCTTCCAACGGT
ZEA.MA_E GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGT
*** ** ** ************ *************** ** **** ************
ORY.SA_B GGAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCA
ZEA.MA_E GGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCA
** ******************* * **** ** ****** * **** * ***
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
******** ****
Mean pairwise ID: 72.22%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
************************* ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT-
LYC.ES_H CCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 72.44%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGC-GGATTC
****** ****** ****** *************** ********** **** *
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGC-GGCCCGCCCGTTCC
ZEA.MA_G TTTG-CGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCC
* * ** * ** * *** * * ** * * *** * ** **** ****** **
ORY.SA_B AAGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTCGAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_G AAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGT
****** **** * ** ** ** * *** * *** * ** * **** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_G GGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTG
*** ** ** ************ *************** ** *****************
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTTCCATGGCAG
ZEA.MA_G GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCA-GAGCCTCACTAAGCAG
* ******************* * **** ** ****** * **** * ****
ORY.SA_B ACCACCACCTTT
ZEA.MA_G ACCACCATCTTT
******* ****
Mean pairwise ID: 72.46%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * **************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_K GAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGA
**** ** *** * ** * * * **** *** * * **** ** ** *** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_K CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_K ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_K CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 72.52%
ORY.SA_B GCCGAGCCAGGTAGCGTTGGCTTGTCACCCGAGCGGGGGCAATAAGGTGGTGTTGGATGC
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGT-GGATGC
****** ****** ****** *************** *********** ******
ORY.SA_B CTGGTCGTTTGCGCTTGGGGTCTGCGCCTGTGGTTTGCACTATGCGGCCCGCCCGTTCCA
ZEA.MA_C TTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA
**** ** *** *** * **** *** * **** **********
ORY.SA_B AGTTGCGTAGCGTGTGTGGGGCGCCTGGGCGAAGGCTC-GAGCGTCCCTGCACCTAGAGT
ZEA.MA_C AGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGT
***** **** * ** ** ** ****** **** * * ** *** ** ***** ***
ORY.SA_B GGCGGGTATTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGAGTACCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C GGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTG
*** ** * *********** *************** ** *** *** *******
ORY.SA_B GAAGGATAACGGGCCGCTGCAGCCCTGGCCCGCTTCCGGCCCAAGTGCCTT-CCATGGCA
ZEA.MA_C GAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA
********** **** ******* *** ***** **** * * * * * ***
ORY.SA_B GACCACCACCTTT
ZEA.MA_C GACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 72.67%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ****** *****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACAC-TGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * ** ** *** ******** ** ** ** * ** *** ***** * ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
********** * ** **** ********** * ** *** *** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGA
**** * *** ******* *************** ******* ** **********
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCAAA
TRI.AE_B AGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
******** * ********* ** *** *** *** * * * **** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
TRI.AE_B CCACCATCTTT
***********
Mean pairwise ID: 72.73%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * *******
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
* * * ***** * ********** ** ** * ** ** *** ***** * ******
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
TRI.AE_B TGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
******** * **** ********** * ** *** *** ** *****
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGAAG
* * *** ******* *************** *** ** ************* **
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAACCA
TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA
******* ********* ** **** * ** * * ** * ***** ****
ZEA.MA_B CCATCTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
********
Mean pairwise ID: 72.79%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * **************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_A GAGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
******* ** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_A CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** * ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_A ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_A CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 73.44%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ******* ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * **************************
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
******* *** * ** * * * **** *** * * **** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
* ** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
* *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * **
LYC.ES_F CTTTT
LYC.ES_J CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 73.63%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ** * * **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA
* * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** ****
ZEA.MA_E GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * ***
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG
***** * **************************** *** *** *************
ZEA.MA_E GGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
* ******* ************* * ** **** * * * * ***** ******
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
TRI.AE_A CCACC------
*****
Mean pairwise ID: 73.83%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
******** *********** ******** ********** *** ***** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTT-GTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT
** * * * * * ******** * * ***** * ** ** ********* *
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
******** ****** * ****** * ***** ** ** * * *** * *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCC
*** ** ****** * **** ******************************* ** *
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_A CAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCA
** ****** ******** * ** ******* *** *** ** *** **** * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A CTA-AGCAAACCACCATCTTT
*** * ** ************
Mean pairwise ID: 73.84%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG
LYC.ES_L ---------------------------GTTGGGTTGACCCAGATGGTTGGGTTCGGTAGG
***** ** ********* **** * *** **
LYC.ES_M CTAATT-TCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAA-A
LYC.ES_L CTTATAGTCTGGCCTGCCCTCTCCAAGCATGGAGTTGGATCACGTGGCTTAGTCGAAAGA
** ** ************* ******** ************* *** * **** *
LYC.ES_M TATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGT
LYC.ES_L CCTGGGTTGCTTGATTCCTAAAGTGGGGTGGACTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAAC
**** * ******************* **** ** ********* ***********
LYC.ES_M GAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-
LYC.ES_L GAACAGCTTCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAACGGGTCAGTG-CTCAGCGAGTCCAGTT
******** ************************ ***** *** ** * * *** ****
LYC.ES_M AACGCC-TAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT
LYC.ES_L AACGCCCTGATGGGCTGCTCCAACTAAACCACCACTTT-
****** * ***** ******** ***** ***** **
Mean pairwise ID: 73.87%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ** * * **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA
* * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** ****
ZEA.MA_D GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * ***
ZEA.MA_D GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTG
***** * **************************** *** *****************
ZEA.MA_D GGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGA
TRI.AE_A GAAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGA
* ******* ************ * ** **** * * * * ***** ******
ZEA.MA_D CCACCATCTT
TRI.AE_A CCACC-----
*****
Mean pairwise ID: 74.11%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** **************** ** *********** *** **** * * *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TRI.AE_A GT-TGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGG-GTGTGCTACTG-CTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
** * * ******** ** * ***** **** * **** *************
ZEA.MA_F TG-GTTGTGGCTGG--TGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGC-TGGGTCTCACGGTCCATAATGTGGC
** ** **** * ******* ***** ** **** *** * * * * ***
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCCGCTTCCAACGGTGGA
***** **************************** *** ******************
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAG-AGCCTCATTAAACAGACC
TRI.AE_A AGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC
******* ********** * * ** **** * ** * * ***** * * ******
ZEA.MA_F ACCATCTTT
TRI.AE_A ACC------
***
Mean pairwise ID: 74.11%
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
******** ******* ******** **** *********** * * * **** * ***
TRI.AE_B TGGTGCGGT-TTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TRI.AE_A -GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTGCTAC--TGCTGGCCCGCCCGTTCCAAGT
* ** * ** ******* ** * ** ** ******** *************
TRI.AE_B TG-GTAGTGGGCTGGGTGG--CTGGGGCGAAAGCTTCGCCTTCTCAGGCCTTAA-GTGGC
TRI.AE_A TGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTGGGTCT-CACGGTCCATAATGTGGC
** ******* * * *** ** ********* * ** * * * ** *** *****
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA
TRI.AE_A AGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGGAA
****** *** ******* *********************** ****************
TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC
TRI.AE_A GGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAAT-TGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGACC
****** ********** * ** * ******** * ** * ********
TRI.AE_B ACCATCTTT
TRI.AE_A ACC------
***
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** **
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** ****
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
*********** * ** **** *** ****** * ** *** *** *******
ZEA.MA_D AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGA
*** * *** ******* *************** *** ****************
ZEA.MA_D AGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC
******************* * **** **** ** * * * *******
ZEA.MA_D CACCATCTT-
TRI.AE_B CACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 74.19%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_A NCCGAGCTCAGTTGCGAGAGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCATTAAAGTGATGTGAACGCT
********* ** ******************** *********** *** ** * * **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_A --GTTGTAGCGCTGCGGGCCTGGTCTGGGTGTG---CTACTGCTGGCCCGCCCGTTCCAA
* * ** * ***** ** ** * * ** ** ** **** ****** ****
ZEA.MA_G GTTG-GTAGTGG-CTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_A GTTGCGTAGTGGACCGCCTGGGGCTTATGCGAAAGCTG-GGTCTCACGGTCCATAATGTG
**** ******* * * * * ***** *** ***** ****** * * * * ***
ZEA.MA_G GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
TRI.AE_A GCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCCGCTTCCAACGGTGG
***** * **************************** *********************
ZEA.MA_G GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTAAGCAGAC
TRI.AE_A AAGGATAATGGGCCGCTGCACTCCTAGGCCAATTGGGCCTCGCAGCCTACTCCAGCAGAC
******* ************* * ** **** * * * * ***** *******
ZEA.MA_G CACCATCTTT
TRI.AE_A CACC------
****
Mean pairwise ID: 74.34%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*** ***** **** ********** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
************************************************** * *******
ZEA.MA_C TGGT-ACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
* * * ** *** ******* ** * *** * * * *** ***** * ******
ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
******** * * ** *** *** * ** **** ** ****** ** ****
ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGAA
ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
**** ***** ****** ********************* *** ** ******** *
ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTA--GCAAAC
******** *** ***** ** ** * ** ** *** * ** *** **
ZEA.MA_C CACCATTTTT
ZEA.MA_B CACCATCTTT
****** ***
Mean pairwise ID: 74.52%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
*********** * ** **** *** ****** * ** *** *** *******
ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGA
*** * *** ******* *************** *** **** *************
ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC
******** ********** * **** **** ** * * * *******
ZEA.MA_E CACCATCTTT
TRI.AE_B CACCATCTTT
**********
Mean pairwise ID: 74.67%
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*** ***** **** ********** ***
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_I TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 74.68%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
****************************************************** *****
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * * ** ****** ** * *** * * * *** ***** * ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
********** * * *** *** *** * ** **** ** ***** ** **
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
****** ***** ****** ************************* ** ********
ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GCAA
ZEA.MA_C AGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
******** * *** ***** ** ** * **** *** ***** ***
ZEA.MA_A ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 74.76%
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** **
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
TRI.AE_B TGGTG--CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** * **** ***** * **** * *** * *********** ****
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
*********** * ** **** *** ****** * ** *** *** *******
ZEA.MA_G AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCAACGGTGGAA
*** * *** ******* *************** ****** ************** *
ZEA.MA_G GGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGACC
TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC
******* ********** * **** **** ** * * * ********
ZEA.MA_G ACCATCTTT
TRI.AE_B ACCATCTTT
*********
Mean pairwise ID: 74.91%
LYC.ES_M CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTGGGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGG
LYC.ES_D ------------------------------------------------------------
LYC.ES_M CTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA
LYC.ES_D --TAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAGAGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATA
* ***************************** *************************
LYC.ES_M TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA
LYC.ES_D TGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGACCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA
********************* **************************************
LYC.ES_M ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC
LYC.ES_D ACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAAC
************************************************************
LYC.ES_M GCCTAATGGGTTGCTCCAA-TAAACAACCACCTTT
LYC.ES_D GCCTAATGGGTTGCTCCAACTAAACCACCACTTTT
******************* ***** ***** ***
Mean pairwise ID: 75.57%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ******* ******************** ******* ** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ************** ****** ***
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** ****
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
* *************************** * ***** ****************
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
**** * **** * *** * * ** ****** ** ** *** ****** * *
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 75.66%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** **** ************** ****** ** * * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
***************************** ** * ****** ** ************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
**** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** ****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 75.70%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** *******
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
*** ********** * ********************************* *** ****
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
*** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT
*** * ***************
Mean pairwise ID: 75.99%
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
**************** ********** ***
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_N TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 76.01%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** *******
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_D CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_D CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_D CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
*** ********** * ********************************* ********
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_D CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
*** ****** ************ ******* * * **** ** ********* * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_D CTA-AGCAGACCACCATCTT-
*** * **************
Mean pairwise ID: 76.10%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
******* *** *** **** *** ***** * ******* * * ** ** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC
****** ** ** * ******* ** ***** ********* *********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
TRI.AE_B CAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGCC
******* ********* ** * **** ****** ** ** ** * * * **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
TRI.AE_B TTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCA
* ************* *** ******* *************** ****** *******
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTCTA
TRI.AE_B ACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCA
******************* ****** * ********** **** *** * *
ORY.SA_A CAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B TAGCAGACCACCATCTTT
* ***************
Mean pairwise ID: 76.14%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ******************** ******* *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_N GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_N ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
***************************** *** * ***** ** **********
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_N ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
*** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_N ATTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 76.25%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** *******
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_G CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
** * * * ***** ** **** * * * * * * ** *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_G CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
******** ******* * * ****** *** * ** ** * ***** *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
ZEA.MA_G CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
*** ********** * ******************************************
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ZEA.MA_G CAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCAC
** ****** ******** *** ******* * * **** ** ********* * * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_G TA-AGCAGACCACCATCTTT
** * ***************
Mean pairwise ID: 76.30%
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** *** * * ********* *** ********** *
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAG
* ** *** ** * ************* **** * ** ** *****************
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
TRI.AE_B TTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
***** **** * * **** ******* ** * * *** * ** *** *** *****
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGAAG
*** *** ******* *************** *** **************** **
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAA-CTCGGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGACCA
TRI.AE_B GATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACCA
***************** **** ** ** * ** * * * *******
ZEA.MA_F CCATCTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
********
Mean pairwise ID: 76.32%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*** ***** **** ********** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** ******************************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_M CTTT
***
Mean pairwise ID: 76.34%
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG
TRY.BR_A AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
******** * ********************** * * ************ * * **
LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG
TRY.BR_A GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
*** **** **** * ** ********* ***** ********* ** **********
LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG
TRY.BR_A GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG
* * ** *** **** * *** ******* *** * *** * *********
LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA
TRY.BR_A CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTCGAGAAGCACACCGAGGAGCA
**** *************** ******* * ***** **** ******* ******
LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
TRY.BR_A TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGG-
* ** * **** * ****** * ********* **
Mean pairwise ID: 76.39%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* * ********* ******* * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ** ** * ** **** *** ****** ** * ******** **** ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_K CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
******** *** ************** * **** ***** ** ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC-AATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * *** ********************** *
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
********** **** * * **** * * * * ** *** ** ****** ****
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
****************************** *** ***********************
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
*** ** **** * * *** * *** ** ***** ** ** *** ****** * *
LYC.ES_C ACATTT
LYC.ES_F ACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 76.47%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************* *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT-
LYC.ES_H CCTTTT
* ***
Mean pairwise ID: 76.49%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******** ********** *** ***** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTC
***** * *** ****** * ** *** *** **** *********
ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
ZEA.MA_C CAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGACC
******* ******* * * **** **** ***** * * ***** ** **
ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
ZEA.MA_C TATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTA
** ********* ** *********** ************************ *** *
ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT-CT
ZEA.MA_C ACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACT
******************* ***** * ***** ***** **** *** * * * **
ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C AAAGCAGACCACCATTTTT
* * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.62%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ************
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGTT
**** * ** * ** ******* * ** *** * *** ********************
ZEA.MA_C GGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCAG
TRI.AE_B GGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCAG
******** * * ** *** ***** * ** ** * ** * *** ********
ZEA.MA_C GAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGAAGG
TRI.AE_B GCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGAAGG
* ** *** ****** *************** ******* ** ************
ZEA.MA_C ATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGACCA
TRI.AE_B ATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGACCA
********** ************* **** ***** * * * *********
ZEA.MA_C CCATTTTT
TRI.AE_B CCATCTTT
**** ***
Mean pairwise ID: 76.64%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** **** ************* *** ** ****** * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGA-TAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
***************************** ** * ****** ** ************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
**** * **** * * *** ** ** * ******** ** ** * ****** ****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 76.87%
TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGATCCCGCTTAGCGGGGACGTCTTG
LEI.MAJ. -GCCGGAGCTC--TGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAACCAGGCTTAGCGGGGAGGACGTG
******** * ********************** * * ************ * * **
TRY.BR_B GACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTGTT
LEI.MAJ. GACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTGTG
*** **** **** * ** ********* ***** ********* ** **********
TRY.BR_B GAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGGGTCAGG
LEI.MAJ. GCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTCAGG
* * ** *** **** * *** ******* *** * *** * *********
TRY.BR_B CCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTGCAGAAGCACACCGAGGAGCA
LEI.MAJ. CCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGAGCA
**** *************** ******* * *********** ******* ******
TRY.BR_B TCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
LEI.MAJ. TGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--
* ** * **** * ****** * ********* ** *
Mean pairwise ID: 77.05%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*******************************
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************ ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_M CTTT-
***
Mean pairwise ID: 77.12%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
********* **** *************** * ******** *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_I GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_I ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
***************************** *** * ***** ** **********
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_I ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACC
*** * *** *** ******* * ** ****** ****** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_I ATTTTT
* ****
Mean pairwise ID: 77.17%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** *************************** *
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
* * ** * * * ****** * * ****** ** *****************
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
***** ***** * *** *** ***** ***** ***** ** ** ***** ** ***
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
*** * ************ ********************* *** *** ********
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGAGCCTCA---TTAAACAGA
************* ***** ** * * * ** * *** * ** ****
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 77.19%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG
******** *********** ******** ********** *** ****** *******
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GTTGTG--ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
** * * *** ***** ******* * ***** * *** ** ********* *
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC
******** ****** * * ****** * ***** ** ** * * *** * * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
*** ** ****** * **** **************************** **** ****
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC
** ****** ********* ** ******* *** **** * * ****** * ***
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B T-TAGCAAACCACCATCTTT
* * ** ************
Mean pairwise ID: 77.20%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* ***** * ************* ******** *********** ******
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* *********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
***** * ** * ** ******** *** * * * * * *** ** *****
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
** ***** *************************** ******* **************
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * *******
ARA.TH_A CCATTTT
ARA.TH_G CCATTTT
*******
Mean pairwise ID: 77.22%
LEP.COL. GCCGGAGCCTTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTCTGG
LEI.MAJ. GCCGGAGCTCTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC-CAGGCTTAGCGGGGAGG-ACGTGG
******** ********************** * * *** * * ***** ***
LEP.COL. ACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAGGCC
LEI.MAJ. ACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTG---
****** ** **** *********************************** *
LEP.COL. TCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGGGTC
LEI.MAJ. -TGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGGGTC
* ******* ****** ** ****** ** ***** *** ***** *****
LEP.COL. AGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGCGGA
LEI.MAJ. AGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGCGGA
******* **************** * ******** ************ ***********
LEP.COL. GCCTGTCATCACCTGCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT
LEI.MAJ. GCATGTCCGCACTTGAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT
** **** *** ** ****** ** * ***** **
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* * ********* ******* * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** *****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_J CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 77.38%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ****** **** ************* ****** * ***** ***** **** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
* * ********* ******* * * ********************** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
****** *** * ** **** *** ****** ** * ************* ****
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAAC-GCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** *** ****************************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
* * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_C CATTT
LYC.ES_A CCTTT
* ***
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
********* ******************** ******* ** ********** ***
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ************** **********
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_O GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** ****
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_O CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
* **************************** * ***** ****************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_O ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
**** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_O ACTTT-
*****
Mean pairwise ID: 77.45%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ******* **** *************** * ******** *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* *
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** ***
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
***************************** *** ******* ** **********
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
*** * *** *** ******* * ** ****** ** *** ************ *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_B ACTTTT
******
Mean pairwise ID: 77.52%
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
********* ***** * ************* ******** *********** ******
ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
* **** ** *** **** * ** *** ***** **** ******* *********
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTTGCA-GGTT-CTAGAGTCGGAGGG
***** * ** * ** ******** *** * * **** *** ** *****
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
** ***** *************************** ******* **************
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
****** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * *******
ARA.TH_G CCATTTT
ARA.TH_F CCATTTT
*******
Mean pairwise ID: 77.88%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_D NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** **** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_D TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
* * * * * ** ** *** ** ********** *********** ****
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
ZEA.MA_D GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** *****
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
ZEA.MA_D CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
****** ************ ********************* *** *** ********
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
ZEA.MA_D GAGGATAACAGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAG
************* ***** * ** * * ***** *** * ***** ****
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
ZEA.MA_D ACCACCATCTT-
******** **
Mean pairwise ID: 77.96%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** ************* *** ** ****** * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
* ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
***************************** ** * ******* ** ************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
**** * **** * * *** ** **** *********** **** ****** *****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_B TTTT
***
Mean pairwise ID: 78.10%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* *************** **** ********* ***** ********** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* ** ** ********* ** ** ** **** **** ******* *********
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT
***** * * ** ** ** ******* **** * *** * ****** ******
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC
* ***** ******* ******************* **** ** ********** ***
ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCAC
ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC
* ****** * * * ** *********** ******* *** * * * * ** *****
ARA.TH_D CACTTT
ARA.TH_G CATTTT
** ***
Mean pairwise ID: 78.12%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******* *********** *** ***** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCT---TGTATGTGCCA-CTGGCCGGCCTGCCCGTT
*** ** ******** ******* *** ** * ** ** *** ********
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGAC
******** ** **** * ** ****** *********** * * *** * *
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC
** *** ******** ********************************* *********
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCAT
** ****** ************ ****** **** ** ** ****** * *
ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F TA-AACAGACCACCATCTTT
** *****************
Mean pairwise ID: 78.14%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_G NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
**************************************************** **** **
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_G TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
* * * * * ** ** *** ** ********** *********** ****
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
ZEA.MA_G GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** *****
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
ZEA.MA_G CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCAACGGTGGG
****** ************ ************************ *** ********
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
ZEA.MA_G AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CTCACTAA-GCAGA
******** **** ***** * ** * * ***** *** * ***** *****
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
ZEA.MA_G CCACCATCTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 78.21%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
**************************************************** **** **
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** *** *** ** ********** *********** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
************ * *** **** *** * ** *** ** * ***** *****
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
****** ************ ********************* ******* ********
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GCAG
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
******** **** ***** * ** * * ***** *** ***** ****
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 78.62%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
*******************************
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
************************************************ ***********
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_M CTTT
**
Mean pairwise ID: 78.76%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
********* **** *************** * ******** *****************
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ************** **********
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_G GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
******* *** ****** * ***** ** * * *** * ** ****** ****
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_G CCGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
* **************************** * ***** ****************
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_G ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACC
**** * **** * *** * * ** ****** ** *** * ********** *
LYC.ES_F ACTTTT
LYC.ES_G ACTTTT
******
Mean pairwise ID: 79.61%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******** **** ************** ****** ** * * ********** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
* ****** ** ******* * * * * ************* ******** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** * ****** ** * ******************
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
***************************** * ** ***** ******************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** *****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_O TTT-
**
Mean pairwise ID: 79.74%
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* ***** ************** ******** * ****************
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* **** ******* *** * ************ ***** ******* *********
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT
***** * *** ** ********** *** * **** * ****** * ******
ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC
* ***** ******* ******************* ******* **************
ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC
** *** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ********
ARA.TH_E CATTTT
ARA.TH_G CATTTT
******
Mean pairwise ID: 80.33%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ****** **** ************** ****** ** * * ********** ***
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
* ****** ** ******* * * * * ************* ****** * **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** * ****** ** * ******************
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
**************************** * ** ***** ******************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
** ** *** * * ****** * **** *****************************
LYC.ES_C ATTT-
LYC.ES_E ATTTT
****
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 80.92%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
******** **** ************* *** ** ****** * ***************
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
* ***** *** ******* * * * * ************* ******** **
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** * ****** ** * ******************
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
***************************** * ** ***** ******************
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ** *** * * ****** * **** *********** ** * ****** *****
LYC.ES_C ATTT
LYC.ES_G TTTT
***
Mean pairwise ID: 80.94%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********* ******* *** ******* *********** * * *****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
********* *************** *** * ***** *** **** ***** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
*** *** ******** ** ******** ** ******** *************
GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ********* ****** ****
GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** ** * **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************************ ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
** ********* *********** ** * ****** ** ************
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC
LYC.ES_N GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_A TTT
LYC.ES_N TTT
***
Mean pairwise ID: 81.19%
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAAT
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAAC
** ********* *********** ** * ****** ** ************
LYC.ES_A GGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCACC
LYC.ES_I GAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCATT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_A TTT
LYC.ES_I TTT
***
Mean pairwise ID: 81.25%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_K CTTT
***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************************* ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_A CTTT-
***
Mean pairwise ID: 81.31%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_K CTTT-
***
Mean pairwise ID: 81.58%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGA-ACGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** * * * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_A CTTT
***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_M -----------------------------CAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
******* ** * ** ***** ********
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_M GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_M AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_M CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* **********************************************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
LYC.ES_M TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCACC
************************************************************
LYC.ES_H TTTT
LYC.ES_M TTT-
***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_I TTTT
***
Mean pairwise ID: 81.91%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
*************************** ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*** ****** * ******* **** * **** ** ******** ***** ********
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 82.00%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********* ******* *** ******* ************ * ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
******** *************** ** * ***** ************** ******
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
RAT.RAT. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
RAT.RAT. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT-
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
************** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
* ******** * * *** ****** **** ***** ***** *** **** *****
LYC.ES_B TTTT
LYC.ES_J CTTT
***
Mean pairwise ID: 82.24%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
* * ******* *** ********************************* ***** * *
HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
* **** *** *** ****** ********* * ******************* **
HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGG-CTNNNGGNGCGCACTCCTAGACTGGAGGGCAAT
* ** **** * ** * ** ****** ** * ****** * **********
HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
************ **************** ******************************
HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
********** **** ** ** ** * **** ************************
HUM.JA_B TTTT
HUM.LU_C TTTT
****
Mean pairwise ID: 82.24%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ************************ ******** ** * ** ***** **** ***
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
**** ******* ****************** * ***** * ****** ******* **
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
********** * ******* **** * **** ** ******** **************
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTC-GCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * * ***** ** ************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
* ******** * *** *********** *************** **** ****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_N TTTT
***
Mean pairwise ID: 82.27%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
****** ********* ******* *** ******* *********** * ** ****
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** ***** *************** ** * ***** ************** ******
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
RAT.NOR. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
RAT.NOR. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCC-GTCTCT
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 82.30%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
*************************** ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ****** ****
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* * ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_J CTTT-
***
Mean pairwise ID: 82.57%
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ***********
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_K CTTT
LYC.ES_O TTT-
**
Mean pairwise ID: 82.61%
ORI.CUN. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCCGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********** ******* *** ******* ************* ** ****
ORI.CUN. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTCGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
******** *************** * * ***** ************** ******
ORI.CUN. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
ORI.CUN. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
ORI.CUN. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_K GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_K GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_K AGTAGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGCGGGGCGGAC
*** ****** * ** **** ***** ******* ** *********** **** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_K CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_K TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_K CTTT
***
Mean pairwise ID: 82.89%
HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT
* * ******* *** **************************** **** *********
HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
** **** *** **** ****** ********* * * ***************** **
HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT
HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT
* ******* * ** ************* * ** ** ****** * **********
HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
************ **************** ******************************
HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCCACCATGGTC--ACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
*** ****** **** **** ** ** **** ********* ****** **
HUM.LU_C TTTT
HUM.JA_A TTTT
****
Mean pairwise ID: 82.89%
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************************* ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ***********
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** ** ***** ******************
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_O TTT-
LYC.ES_A CTTT
**
Mean pairwise ID: 82.95%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_I GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
* ************ ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_I GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_I AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_I TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
*************************** ** ** **** * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_I CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** ****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_I TTTT-
***
Mean pairwise ID: 83.22%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_A GGCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_A GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_A AGTTGGATCTCGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********* * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_A CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACG-CTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_A TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_A CTTT
***
Mean pairwise ID: 83.28%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
** ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*********************** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_H CTTTT
****
Mean pairwise ID: 83.33%
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * *****
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
******** ******************* ** ****** *** **** ****** *****
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
*** ************ ** ******** ** *********** **********
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ********* ****** ***
GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* ***** ****** ***** ******** * **
Mean pairwise ID: 83.33%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_F GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
*************** * ******* **** ********* **** ****** *** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_F GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
**** ******** **** ****** * *** * ***********************
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
ARA.TH_F TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTT--GCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
******** **** * ** *********** ** ** * ***** **********
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
ARA.TH_F TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
**************** ************************ ************** ***
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
ARA.TH_F TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
*** *** *** ****** *********** ****** ******* ** *****
ARA.TH_D CACTTT
ARA.TH_F CATTTT
** ***
Mean pairwise ID: 83.55%
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************************* ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
**** * ***** ** *************** * ************** ***********
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_J CTTT
LYC.ES_O TTT-
**
Mean pairwise ID: 83.61%
HOM.SA_B GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ****************** *** ******* ************ ** ****
HOM.SA_B CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATGGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
********* *************** ** * ***** **** ********* ******
HOM.SA_B TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
HOM.SA_B TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
HOM.SA_B TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** * * ** ****** **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.67%
CAE.EL_A ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ************
CAE.EL_A AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** ** * * *** **********************
CAE.EL_A GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
*** **** ******* * ********** * ******** *********** **
CAE.EL_A GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
* * ** ***** ******** ***** ******* ****** ***************
CAE.EL_A GCGCTTGTGAGTTGACACACATACGCAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT-
************** * * * * ****** ****************** *****
Mean pairwise ID: 83.67%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ****************** *** ******* **************** ****
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
******** *************** ** * ***** ************** ******
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT-
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.71%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** ******************* * ***** *
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT-TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAGT
* ** ** *************** ** **** * ** ****** ***** * ******
ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCAG
ZEA.MA_F TGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCAG
**** *** *** ******* ***** ** * *** **** ****** ********
ZEA.MA_B GAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGAG
ZEA.MA_F GCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGAG
* ******* ********************************* ****************
ZEA.MA_B GATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTTAGCAAACCAC
ZEA.MA_F GATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCATTAAACAGACCAC
******* ********* * ******** * * ***** **** * * ** *****
ZEA.MA_B CATCTTT
ZEA.MA_F CATCTTT
*******
Mean pairwise ID: 83.88%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* ************ ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
**** ******* ****************** * ************** ***********
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
********** * ** **** ***** ******* ** **************** ****
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*** ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT
LYC.ES_J CTTT
***
Mean pairwise ID: 83.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_O GCCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
* ************************ ******** ** * ** ***** ********
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_O GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
****** ******** *********************** * ************** **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_O AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_O CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************ *** * ** ***** ******************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_O CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_O TTT--
**
Mean pairwise ID: 83.95%
CAN.SPE. GCCGGGCGCGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
****** ********** ******* *** ******* ************* ** ****
CAN.SPE. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
********* *************** *** * ***** ************** ******
CAN.SPE. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
***** *** ******** * ****** **** ******** *************
CAN.SPE. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
** ******************* *********** * ******* * ************
CAN.SPE. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
******* ******** * *** * * ** **** * **** **** *** * **** *
Mean pairwise ID: 83.99%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
*************** * ******* **** ********* **** ****** *** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
**** ******** **** ****** * *** * ***********************
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
******** **** * ** *********** **** ** * ***** **********
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
**************** ************************ ************** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCAC
*** *** *** ****** *********** ****** ******* ** *****
ARA.TH_A CATTTT
ARA.TH_D CACTTT
** ***
Mean pairwise ID: 84.00%
CAE.EL_D ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ************
CAE.EL_D AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTCGTCTACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** **** * *** **********************
CAE.EL_D GCTACGTCACCAGGGGATAACTGTCGGAAGGCGGTTAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTCGT
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
*** **** ******* * ********** * ******** *********** **
CAE.EL_D GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCGACCGCGTGGTGCAGTGGCCGGACC
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
* * ** ***** ******** ***** ******* ****** ***************
CAE.EL_D GCGCTTGTAAGTTGACACACATACACAGCCTTCTCGATACCTTCAGACCACTTATCATTT
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT-
******** ***** * * * ******** ****************** *****
Mean pairwise ID: 84.05%
RAT.RAT. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGACAGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ******* *** ******* ** ***** ** ****
RAT.RAT. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
************************** * ** ****** *********************
RAT.RAT. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
RAT.RAT. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
RAT.RAT. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
******************* **** ******* ***** ******** * **
RAT.RAT. T
XEN.LAE. -
Mean pairwise ID: 84.24%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
***************************** *********************** *** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT-TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
* ** ** ** ******* ****** ** **** *********** ***** * ****
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
****** *** ********* *** ***** ** * *** **** ******* *****
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG
ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
**** ******* **************************** *** ** **********
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTAAGCAAA
ZEA.MA_F GAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTAAACAGA
********* * ********* * **** ***** ** **** ***** *** ** *
ZEA.MA_A CCACCATCTTT
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
***********
Mean pairwise ID: 84.26%
LYC.ES_G GCCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
* *********** ************ **** *** * *** ** ***** **** ***
LYC.ES_G GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGCACAG
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
*************************************** * ************** **
LYC.ES_G AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_G CGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
************************ *** * ** ***** ******************
LYC.ES_G CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGCTCCAATTAAACCACCAC
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
** ***** *** * * ** *** **** ***** ********* **** *****
LYC.ES_G TTTT-
LYC.ES_H CTTTT
***
Mean pairwise ID: 84.26%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
*************** ******** **** ********* * ** ********** **
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
**** *** **** *** *** ** ** *** * **** ******************
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT
******* ***** **** *********** **** *** ********* *******
ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
**************************************** ************** ****
ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCGATCTCTCCTGGACCACC
ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCGATCTCATATGAACCACC
** **** *** ****** *********** ****** ******* ** ******
ARA.TH_D ACTTT
ARA.TH_E ATTTT
* ***
Mean pairwise ID: 84.59%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_N GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAATGTGGTGGAATGTTG
** ****************************************** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_N GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_N AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_N TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAG-TTTCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
*************************** ** ** **** * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_N CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAACGCCTGATGGGTTGCTCCAATTAAACCACCAT
** ***** ** *** *** *** ********** ** ** * ****** ****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_N TTTT-
***
Mean pairwise ID: 84.62%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
CAE.EL_B ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATAAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ************
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_B AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** ** * ***** **********************
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
CAE.EL_B GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
******** ******* * ******** * * ******** **************
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
CAE.EL_B GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACT
* * ** ***** ******** ***** ******************************
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT
CAE.EL_B GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTTTTT
************** * * ******** ******************* **
Mean pairwise ID: 84.92%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
************** ***************** ***** **** ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
****** ******** *********************** * ************* **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
*************** ********* ***** ***** ***** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
*************************** ** ******* * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
** ***** ** *** *** ***************** **** ****** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_B TTTT-
***
Mean pairwise ID: 84.95%
RAT.NOR. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCC-AGCTACTTGG-AGGCTTGGGCTGTCGGAT
********* ****** ******* *** ******* ** ***** * * * ****
RAT.NOR. CGATTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
** *********************** * ** ****** *********************
RAT.NOR. TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
***** ************ * ****** *** *********** **********
RAT.NOR. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
************************************** ******* *************
RAT.NOR. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCGTCTCT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT
******************* **** ******* ***** ******** * ***
Mean pairwise ID: 84.95%
CAE.BRI. ACCGGGTGTCGTGGCGGGCGCCTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGACAAGTGTGGATGG
CAE.EL_C ACCGAGCGTCGTGGCGGGCGCTTGTGAGTCAGCTTCTTGACGGTAGATGAGTGTGGATGG
**** * ************** ************************* ***********
CAE.BRI. AGTGAAGGGAGGAGTCCTGTGGGTGTTGTCGGCAACGGCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
CAE.EL_C AGTGAGAGGAGGAGTCCTGTGTATGTCGTTGTCAACGTCGACCGAGCGTCCGTGCCAAGC
***** ************** *** ** * ***** **********************
CAE.BRI. GCTGCGTCGCCAGGGGTCTCCGGTCGGAAGGCTGGCGGTCCCGGGCGCATAAGGAGTGGT
CAE.EL_C GCTGCGTCACCAGGGGATGACTGTCGGAAGATGGTCAGTCCCGGGTGCATAAGGAGTGGT
******** ******* * ******** * * ******** **************
CAE.BRI. GCACGGCTCAGGGCCGAAAGGCAGCAGGCAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGATA
CAE.EL_C GGATGGTTCAGGACCGAAAGGTAGCAGACAAAAGCCACCGCGCGGTGCAGTGGCCGGACA
* * ** ***** ******** ***** ****************************** *
CAE.BRI. GCGCTTGTGAGTTGTCGCTCGCCCACAGCCTCTCTGATACCTTCAGACCACTTGTCATT
CAE.EL_C GCGCTTGTGAGTTGACACGTATACACAGCCTTCTCAATACCTTCAGACCACTTGTCACT
************** * * ******** ********************* *