SRP RNA test set (N=3)

There are 55 alignments in the test set.

#1

Mean pairwise ID: 73.71%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B        NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
                 *******  ** *** **** *** ****  * ******* * * ** ** ** * ***

ORY.SA_A        TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCG
TRI.AE_B        CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCG
ZEA.MA_A        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTC-----GTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCA
                 ** * *  **  ** *   **  **         * *** *  ** ** *** ***** 

ORY.SA_A        TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
TRI.AE_B        TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG
ZEA.MA_A        TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAG
                * ******** ******    *  * ****   ***** **      *  *  *   * *

ORY.SA_A        CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT
TRI.AE_B        GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTT
ZEA.MA_A        ACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTC
                 ***  ** ****** *   *** ******* ***************  ******  ** 

ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
TRI.AE_B        CCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC
ZEA.MA_A        CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
                *** ****** ******** * ** ******   ** ***       ***       * *

ORY.SA_A        TCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B        GCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A        ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
                 * * * ** ************

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#2

Mean pairwise ID: 74.22%


ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
                ********  ** *** ******** ****  * ********* *** ****** *****

ZEA.MA_C        TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B        TGGTGCGGTTTGTTGG---CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
                * *    *  * *  *   ****** *  *  **     * *  *** ***** * ****

ZEA.MA_C        GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TRI.AE_B        GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
ZEA.MA_A        GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
                **********      **  ***   *** * **   *    *     * ***  ** **

ZEA.MA_C        CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA
TRI.AE_B        CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGA
ZEA.MA_A        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG
                **** *   *** ******  ***************  ******* **   ******** 

ZEA.MA_C        AGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TRI.AE_B        AGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG
ZEA.MA_A        AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTA-AGCAA
                ******** * *** *****   ** **        ***            * * **** 

ZEA.MA_C        ACCACCATTTTT
TRI.AE_B        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_A        ACCACCATCTTT
                ******** ***

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#3

Mean pairwise ID: 74.35%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
                 ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * ***

ORY.SA_A        TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATG-TTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_C        CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA-----TGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_A        CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT
                 ** *    *  * *    *****  *       * ***     * *  *** ***** *

ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_C        TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGA
ZEA.MA_A        CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
                 ******** ******       *  ***   *** * **  * *    *  **    * 

ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC
ZEA.MA_C        CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTAT
ZEA.MA_A        CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCC
                ***  ** ****** *  **** ****** ************************  **  

ORY.SA_A        CATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
ZEA.MA_C        TAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT
ZEA.MA_A        CAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCA
                 * ****** ******** * **  *****   ** **     *  ***  ***      

ORY.SA_A        -CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        ACTAAAGCAGACCACCATTTTT
ZEA.MA_A        -CTA-AGCAAACCACCATCTTT
                 *** * ** ******** ***

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#4

Mean pairwise ID: 74.41%


LEP.COL.        -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC
LEI.MAJ.        -GCCGGAGCT--CTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC-CAGGCTTAGCGGGGAGG-ACG
TRY.BR_B        AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGACG-TCT
                 ********    **********************    *  *** * * ****      

LEP.COL.        TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG
LEI.MAJ.        TGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTG
TRY.BR_B        TGGACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG
                ***** ***   **     **  ******** ***** ********* ** ******* *

LEP.COL.        GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGG
LEI.MAJ.        ----TGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGG
TRY.BR_B        ----TTGAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGG
                      *    * **  ** ***  *  ***      * ***** ***    ** *  **

LEP.COL.        GTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGC
LEI.MAJ.        GTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGC
TRY.BR_B        GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTGCAGAAGCACACCGA
                **********  ***************   *******   *********** ******* 

LEP.COL.        GGAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT--
LEI.MAJ.        GGAGCATGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT--
TRY.BR_B        GGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT
                ***** * **   ** * * ****** *       * ** **  *  

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#5

Mean pairwise ID: 74.54%


ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
                ********  ** *** ******** ****  * ********* *** ** * *******

ZEA.MA_C        TGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
TRI.AE_B        TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT
ZEA.MA_B        TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT
                * *     ** * *  ******* *  *  **     * *  *** ***** * ******

ZEA.MA_C        TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA
TRI.AE_B        TGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCA
ZEA.MA_B        TGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
                ********      **  ***   *** * **     *  *     * ***  ** ****

ZEA.MA_C        GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGAA
TRI.AE_B        GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGAA
ZEA.MA_B        GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
                ** *   *** ******  ***************  *** ***  **   ******** *

ZEA.MA_C        GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC
TRI.AE_B        GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGAC
ZEA.MA_B        GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG--ATCCTCTCTTAGCAAAC
                ******** *** *****   ** ** *      * **       *       **** **

ZEA.MA_C        CACCATTTTT
TRI.AE_B        CACCATCTTT
ZEA.MA_B        CACCATCTTT
                ****** ***

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#6

Mean pairwise ID: 74.78%


LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
                *  *****  *** *************  * ****  * ** **  ***** **** ***

LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC-AATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
                       *  ** **  *******   * * ***  **** * ****** *******  *

LYC.ES_C        GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_H        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
                ******* **  **** * *   ***    * * *  ** *     ** ******  ***

LYC.ES_C        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_H        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
                 *************************  **  **  *********************** 

LYC.ES_C        ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_H        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
                * * *   ***   * * *     *   **   ** ** ** **  * * * **** * *

LYC.ES_C        ACATTT-
LYC.ES_F        ACTTTT-
LYC.ES_H        ACCTTTT
                ** *** 

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#7

Mean pairwise ID: 75.08%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B        NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
                 *******  ** *** **** *** ****  * ******* * * ** **  * *****

ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
TRI.AE_B        CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTT
ZEA.MA_B        CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCG----TTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
                 ** * *  ** ** *   *******       *  ** *  ** ** *** ***** * 

ORY.SA_A        CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
TRI.AE_B        CCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGC
ZEA.MA_B        CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAGAC
                ******** ******  * *  * ****   ***** **      *  *  *   * * *

ORY.SA_A        CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
TRI.AE_B        CTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTC
ZEA.MA_B        CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
                **  ** ****** *   *** ******* ***************  *** ***  ****

ORY.SA_A        CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
TRI.AE_B        CAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC
ZEA.MA_B        CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC
                ** ****** ********* ** ******   ** ****      * **      * * *

ORY.SA_A        TACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B        CATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        T-TAGCAAACCACCATCTTT
                   * ** ************

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#8

Mean pairwise ID: 75.35%


LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                * ******  *** *************  * ****  * ** **  ***** **** ***

LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAAT-TCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                       *  ** **  *******   * *      ********************** *

LYC.ES_C        GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_J        GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* **  * ** * *   ***    * * *  ** *     ** ******  ***

LYC.ES_C        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J        CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                * ** ********* ***********  **  **  *********************** 

LYC.ES_C        ACGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_J        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
                * * *   ***   * * *     *   **   ** ** ** **  * * * **** * *

LYC.ES_C        ACATTT
LYC.ES_J        ACCTTT
LYC.ES_F        ACTTTT
                ** ***

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#9

Mean pairwise ID: 75.58%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B        NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
                 *******  ** *** **** *** ****  * ******* * * ** ** ** **** 

ORY.SA_A        TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG
TRI.AE_B        CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCG
ZEA.MA_E        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
                 ** * *  **  ** *   ** ****          ***    *** * *** ******

ORY.SA_A        TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
TRI.AE_B        TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG
ZEA.MA_E        TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-----TTGGTCTCTCCAG
                * ******** *******   *  * ****   *** * **      ** *  *   * *

ORY.SA_A        CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT
TRI.AE_B        GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT
ZEA.MA_E        ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT
                 *** ********** *   *** ******* ***************  *** *** ***

ORY.SA_A        TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
TRI.AE_B        TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC
ZEA.MA_E        TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC
                **** ****** ******** *** ******    * ****      ****      * *

ORY.SA_A        TCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B        GCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_E        ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
                 * * * ***************

[Download ClustalW]

#10

Mean pairwise ID: 75.89%


ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ***   * ********* *** ********** *

ZEA.MA_C        TGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAAG
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRI.AE_B        TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAAG
                *  *  **  *  * * ****** *  *  ***  *  **   *****************

ZEA.MA_C        TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
ZEA.MA_F        TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
TRI.AE_B        TTGGTAGTGGGCTGGGTG-GCTGGGGCGAAAGC--TTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
                ***** ****     *   *** ***** * **  *  ** *  *  * ***  ** ***

ZEA.MA_C        AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA
ZEA.MA_F        AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_B        AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGA
                *** *   *** ******  ***************  ***   * ***   ******** 

ZEA.MA_C        AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAG-ACTTCATACTAAAGCAG
ZEA.MA_F        AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA-GCCTCA---TTAAACAG
TRI.AE_B        AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG--CCATAGCAG
                ************* *****      ** *      * **     *  *       * ***

ZEA.MA_C        ACCACCATTTTT
ZEA.MA_F        ACCACCATCTTT
TRI.AE_B        ACCACCATCTTT
                ******** ***

[Download ClustalW]

#11

Mean pairwise ID: 75.89%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG
                 ******** *********** ******** ********** *** *****  * *****

ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_B        CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GTTGTG--ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
ZEA.MA_C        CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTC-ATGGTGTG---CCTTTGTTGGCCTGCCCGTT
                 ** *     *  ***   ******  *   * ***       * *  *** ***** * 

ORY.SA_A        CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_B        CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC
ZEA.MA_C        CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC
                ******** ******  *    *  ***   *** * **  * *    *  **    * *

ORY.SA_A        CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_B        CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
ZEA.MA_C        CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT
                *** ** ****** *  **** ****** ********************* ***  **  

ORY.SA_A        CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT-
ZEA.MA_B        CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT-
ZEA.MA_C        TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA
                 * ****** ********* **  *****   ** ** *      * ** ***     * 

ORY.SA_A        CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        CT-TAGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        CTAAAGCAGACCACCATTTTT
                **  * ** ******** ***

[Download ClustalW]

#12

Mean pairwise ID: 75.95%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
                 ******** *********** *******  ********** *** ***** ** *****

ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_F        TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCT---TGTATGTGCCA-CTGGCCGGCCTGCCCGTT
ZEA.MA_C        CTTGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTC----ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTT
                 **  *   *  *  *   ******           **     * *  *** ********

ORY.SA_A        CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_F        CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGAC
ZEA.MA_C        CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC
                ******** ** **** *    *  ***  **** *****   *     * **    * *

ORY.SA_A        CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_F        CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC
ZEA.MA_C        CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT
                **  ** ****** *  *********** ********************* *** ***  

ORY.SA_A        CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CT
ZEA.MA_F        CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CA
ZEA.MA_C        TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA
                 * ****** ************  *****      ** *   *  ** * ***       

ORY.SA_A        CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        TTA-AACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        CTAAAGCAGACCACCATTTTT
                 ** * *********** ***

[Download ClustalW]

#13

Mean pairwise ID: 76.13%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** ******** ********** *** ***** ** **** 

ZEA.MA_E        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ZEA.MA_C        CTTGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCG
ORY.SA_A        TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG
                 ** *    *    * **  ** ***  *        ***    ***   *** ******

ZEA.MA_E        TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG----TCTCTCC-AG
ZEA.MA_C        TTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGG
ORY.SA_A        TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
                * ******** *******      *  ****  *** * **  * *     **      *

ZEA.MA_E        ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT
ZEA.MA_C        ACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCT
ORY.SA_A        CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT
                 ***  ********* *  *********** ********************* *** ***

ZEA.MA_E        TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CT
ZEA.MA_C        ATTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCA
ORY.SA_A        TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGT-CC
                   * ****** ******** ***  *****    * ** *   *  **** ***   * 

ZEA.MA_E        CACTAA-GCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        TACTAAAGCAGACCACCATTTTT
ORY.SA_A        CTCTACAACAGACCACCATCTTT
                  ***   *********** ***

[Download ClustalW]

#14

Mean pairwise ID: 76.15%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ****  * ********* *** **** **** **

ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_C        TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B        TGGTGCGG--TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
                * *    *  * * *  *** *** *     ***  * ***   *********** ****

ZEA.MA_E        GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_C        GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TRI.AE_B        GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
                ***********     **  ***   *** * **   *  *   *   * ***  *****

ZEA.MA_E        CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C        CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
TRI.AE_B        CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGG
                **** *   *** ******  ***************  *** **** **   ********

ZEA.MA_E        GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GCAG
ZEA.MA_C        AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TRI.AE_B        AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG
                 ******** **** *****    * ** *      ****           * *  ****

ZEA.MA_E        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        ACCACCATTTTT
TRI.AE_B        ACCACCATCTTT
                ******** ***

[Download ClustalW]

#15

Mean pairwise ID: 76.19%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B        NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
                 *******  ** *** **** *** ****  * ******* * * ** ** ** *****

ORY.SA_A        TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC
TRI.AE_B        CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC
ZEA.MA_C        CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTC
                 *****   *  * *   ******        ** ***    *** **** *********

ORY.SA_A        CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC
TRI.AE_B        CAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGCC
ZEA.MA_C        CAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCC----CTGGGCTTCCTTGGACC
                ******* ******* *    *  ***  **** * **      *  ** *     * **

ORY.SA_A        TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA
TRI.AE_B        TTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCA
ZEA.MA_C        TATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTA
                *  ********* **  *** ******  ***************  ****** ***   *

ORY.SA_A        TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CTCT
TRI.AE_B        ACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCC
ZEA.MA_C        ACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACT
                 *******************  ***** * ***** ****   ****       *   * 

ORY.SA_A        ACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B        ATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        AAAGCAGACCACCATTTTT
                * * *********** ***

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#16

Mean pairwise ID: 76.48%


ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B        NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
                 *******  ** *** **** *** *** * * ******* * * ** ** ** *****

ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
TRI.AE_B        CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_F        TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT
                 **  **  ** ** *   *******          ***    ** ** *** *******

ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
TRI.AE_B        TCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGG
ZEA.MA_F        TCCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCC-----TGGGCCTCTTTAGA
                ********* ** **** * ** * ****  ****** **      *  ** *     * 

ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
TRI.AE_B        CCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTT
ZEA.MA_F        CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
                *** *** ********   *** ******* ***************  *** *** ****

ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
TRI.AE_B        CCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG
ZEA.MA_F        CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCA
                *** ****** ************ ******      ****      ** *      * * 

ORY.SA_A        CTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B        CCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        TTA-AACAGACCACCATCTTT
                  * * ***************

[Download ClustalW]

#17

Mean pairwise ID: 76.85%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ***   * ********* *** ****** *** *

ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
TRI.AE_B        TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
                *   *  ** **  ***  * ****** **  ***  * ** ** *** ***** * ***

ZEA.MA_A        AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_F        AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
TRI.AE_B        AGTTGGTAGTGGGCTGGGTGG-CTGGGGCGAAAGCTT--CGCCTTCTCAGGCCTTAAGTG
                ******* ***    * * ** **   ***** ** *   * **    ** ***  ** *

ZEA.MA_A        GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_F        GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_B        GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTG
                ***** *   *** ******* ***************  ***   *  ** *********

ZEA.MA_A        GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA
ZEA.MA_F        GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACA
TRI.AE_B        GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA
                * ******** * *********      ***       **       ** *   * * **

ZEA.MA_A        AACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        GACCACCATCTTT
TRI.AE_B        GACCACCATCTTT
                 ************

[Download ClustalW]

#18

Mean pairwise ID: 77.12%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                * ******* ***************** ** ***** *     ** ***** **** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAA-TTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                **     *  ** ** ********  ***** *  ************** ****** ***

LYC.ES_E        GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_J        GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* *** * ** * *   ****  ** * *  ** *     ** ******  ***

LYC.ES_E        CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J        CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                *  * ********* ***********  **  *    ***** **************** 

LYC.ES_E        ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_J        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
                * **    ***   *   *     *  **   *** ** ** **  * * * **** * *

LYC.ES_E        ACATTTT
LYC.ES_J        ACCTTT-
LYC.ES_F        ACTTTT-
                ** *** 

[Download ClustalW]

#19

Mean pairwise ID: 77.15%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                *  ****** ***************** ** ***** *     ** ***** **** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                **     *  ***** ********  ******** ***** * ****** ******   *

LYC.ES_E        GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_H        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* *** **** * *   ***   ** * * *** *     ** ******  ***

LYC.ES_E        CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_H        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                   ***********************  **  *    ***** **************** 

LYC.ES_E        ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_H        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
                * **    ***   *   *     *  **   *** ** ** **  * * * **** * *

LYC.ES_E        ACATTTT
LYC.ES_H        ACCTTTT
LYC.ES_F        ACTTTT-
                ** *** 

[Download ClustalW]

#20

Mean pairwise ID: 77.34%


LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                * ******  *** ************** * **** **     *  ********** ***

LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                       *  ** **  *******   * * * *  ************* ****** * *

LYC.ES_C        GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_E        GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* **  **** * *   *** *  * * *  ** *     ** ****** ****

LYC.ES_C        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_E        CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                *  ***************************  *    ***** **************** 

LYC.ES_C        ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_E        ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
                ***  *  ***   *   *** *  *  **   ***** ** **  *** ****** * *

LYC.ES_C        ACATTT-
LYC.ES_E        ACATTTT
LYC.ES_F        ACTTTT-
                ** *** 

[Download ClustalW]

#21

Mean pairwise ID: 77.38%


ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ***   * ********* *** ** * ***** *

ZEA.MA_B        TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRI.AE_B        TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAG
                *   *  ** ** * ********** **  ***  * ** ** *** ***** * *****

ZEA.MA_B        TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA
ZEA.MA_F        TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA
TRI.AE_B        TTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTT--CGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCA
                ***** ***      * ****   ***** ** *   * **    ** ***  ** ****

ZEA.MA_B        GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA
ZEA.MA_F        GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA
TRI.AE_B        GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGAA
                ** *   *** ******* ***************  ***   ** ************* *

ZEA.MA_B        GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAACC
ZEA.MA_F        GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TC-CAGAGCCTCATTAAACAGACC
TRI.AE_B        GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC
                ******** *********      ****      *  * *  * **      * ** ***

ZEA.MA_B        ACCATCTTT
ZEA.MA_F        ACCATCTTT
TRI.AE_B        ACCATCTTT
                *********

[Download ClustalW]

#22

Mean pairwise ID: 77.43%


LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                * ******  ***  ************* * * ** *****  * ***************

LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
                       *  ** **  *******  * *  ***  **** * ****** *******  *

LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
LYC.ES_B        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C        GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
                ******* **  **** * *   ***    * * *  ** *     ** ******  ***

LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
LYC.ES_B        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_C        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
                 *****************************  **   *******  ** ********** 

LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
LYC.ES_B        ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_C        ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
                *** *   ***   * * *** *  *  **   ***** ** **  *** ****** * *

LYC.ES_F        ACTTTT
LYC.ES_B        ACTTTT
LYC.ES_C        ACATTT
                ** ***

[Download ClustalW]

#23

Mean pairwise ID: 77.86%


LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                * ******* **** ************ ** * *** * **  ** ***** **** ***

LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAA-TTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                **     *  ** ** ********  ***** *  ***** * ****** *******  *

LYC.ES_B        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_J        GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* *** * ** * *   ***   ** * *  ****     ** ******  ***

LYC.ES_B        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_J        CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                  ** ********* ***********  **  **   *******  ** ********** 

LYC.ES_B        ACGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC
LYC.ES_J        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTC--AGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCT-TTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCAT
                * * *   ***   *    *** *  *  **  *** ** ** *** * *** **** * 

LYC.ES_B        CACTTTT
LYC.ES_J        CACCTTT
LYC.ES_F        CACTTTT
                *** ***

[Download ClustalW]

#24

Mean pairwise ID: 78.15%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** *******  ********** *** ***** ** * ***

ZEA.MA_A        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_F        TTTCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
                 **   *  ** ** ***  **  ** *   *  ***   *  ** ** *** ***** *

ZEA.MA_A        CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
ZEA.MA_F        TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGA
ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
                 ******** ** ***    *  *** **   ***** ** *  *    *  ***   * 

ZEA.MA_A        CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_F        CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
                ***  ** ****** *  **** **************************** ***  ** 

ZEA.MA_A        CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
ZEA.MA_F        CCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC
ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
                *** ****** ******** * ** ******      ***    ** **  ****  * *

ZEA.MA_A        ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        ATTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A        TCTACAACAGACCACCATCTTT
                  ** * ** ************

[Download ClustalW]

#25

Mean pairwise ID: 78.23%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
                *****************************  *********************** *** *

ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
ZEA.MA_C        TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA
                *      *  *   **   * **** *  *  **** *  **   *** ***** * ***

ZEA.MA_A        AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_F        AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
ZEA.MA_C        AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
                ******* *** * * ***   **   *** * **   ***  **    *****  ** *

ZEA.MA_A        GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_F        GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C        GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
                ***** * ***** ****** ********************* ***  **   *******

ZEA.MA_A        GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GC
ZEA.MA_F        GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAA-AC
ZEA.MA_C        GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
                * ******** * *** *****      **     *  **   ***      * ***  *

ZEA.MA_A        AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        AGACCACCATTTTT
                * ******** ***

[Download ClustalW]

#26

Mean pairwise ID: 78.40%


LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                * ****** ****  ************  *** **  * *** *  ***** **** ***

LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
                  *    ***** *** *******   * *     **** * ****** *******  **

LYC.ES_B        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J        AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_C        AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
                ****** **  * ** ****  ***    *** ** ** *  ** ********** *** 

LYC.ES_B        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J        CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                 ** ********* ***********  **  ** * *******  ** ************

LYC.ES_B        CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_C        CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
                 * * * ****  *      *  *  ** * ** ***** ** ** * * **** *****

LYC.ES_B        TTTT
LYC.ES_J        CTTT
LYC.ES_C        ATTT
                 ***

[Download ClustalW]

#27

Mean pairwise ID: 78.56%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ***   * ********* *** **** ****  *

ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B        TGGTG-CGGTTT-GTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
                *   *  ** **  * **** ***** *  ****  *  ** * *********** ****

ZEA.MA_E        GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC
ZEA.MA_F        GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
TRI.AE_B        GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
                ****** ****   * ** ****   *** * ** * *  **    ** *** *** ***

ZEA.MA_E        AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_F        AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
TRI.AE_B        AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGA
                *** *   *** ******* ***************  ***   * ************** 

ZEA.MA_E        AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC
ZEA.MA_F        AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGAC
TRI.AE_B        AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC
                ******** **********      ****      ** *     ** *   * * *****

ZEA.MA_E        CACCATCTTT
ZEA.MA_F        CACCATCTTT
TRI.AE_B        CACCATCTTT
                **********

[Download ClustalW]

#28

Mean pairwise ID: 78.71%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ****  * ********* *** ** * **** **

ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B        TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TRI.AE_B        TGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAA
                * * *  ** *** * **** ***** *   ***  *  * ** *** ***** * ****

ZEA.MA_E        GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B        GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
TRI.AE_B        GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
                **********      ** ****   *** ****** *   **   *** ***  ** **

ZEA.MA_E        CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
TRI.AE_B        CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGG
                **** *   *** ******* ***************  ***   *  *************

ZEA.MA_E        GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCAGA
ZEA.MA_B        GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAA
TRI.AE_B        AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
                 ********  *********    * ****      * ** *  * **   *  **** *

ZEA.MA_E        CCACCATCTTT
ZEA.MA_B        CCACCATCTTT
TRI.AE_B        CCACCATCTTT
                ***********

[Download ClustalW]

#29

Mean pairwise ID: 78.72%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ****  * ********* *** **** * ** **

ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
TRI.AE_B        TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCA
                * * *  ** **  ***  ** ***** *    **  *  ** * *** ***** * ***

ZEA.MA_A        AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_E        AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_B        AGTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG
                ***********    * ** ****   *** ****** *   **   *** ***  ** *

ZEA.MA_A        GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_E        GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_B        GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTG
                ***** *   *** ******* ***************  *** **** ** *********

ZEA.MA_A        GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA
ZEA.MA_E        GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCA
TRI.AE_B        GAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA
                * ********   *********    * ***       ***      ** * * * ****

ZEA.MA_A        AACCACCATCTTT
ZEA.MA_E        GACCACCATCTTT
TRI.AE_B        GACCACCATCTTT
                 ************

[Download ClustalW]

#30

Mean pairwise ID: 78.79%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
TRI.AE_B        NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
                ********  ** *** ******** ****  * ********* *** ** * * *****

ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_B        TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
TRI.AE_B        TGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
                * * *  ** *** * **** ****** **  ** *  ** ** *** ***** * ****

ZEA.MA_A        GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_B        GTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
TRI.AE_B        GTTGGTAGTGGGCTGGGTGG-CTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
                **********      * ** **   ********** *   **   *** ***  ** **

ZEA.MA_A        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG
ZEA.MA_B        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
TRI.AE_B        CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGG
                **** *   *** ******* ***************  ***   *  ** **********

ZEA.MA_A        GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT-AAGCAA
ZEA.MA_B        GAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCT-TAGCAA
TRI.AE_B        AAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG
                 ******** * *********   ** ***       * *      ** * *   **** 

ZEA.MA_A        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        ACCACCATCTTT
TRI.AE_B        ACCACCATCTTT
                ************

[Download ClustalW]

#31

Mean pairwise ID: 78.79%


ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
                *****************************  ******************* * ***** *

ZEA.MA_B        TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
ZEA.MA_C        TGGT-ACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
                *    *  *  ***  ******* *  *  **** *  * *  *** ***** * *****

ZEA.MA_B        TTGGTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
ZEA.MA_F        TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
ZEA.MA_C        TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
                ***** *** * *  **  ***   *** * **   ***  **    *****  ** ***

ZEA.MA_B        AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_F        AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_C        AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA
                *** * ***** ****** ********************* ***  **   ******** 

ZEA.MA_B        AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA--TCCTCTCTTAGCAAA
ZEA.MA_F        AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGA--GCCTCATTAAACAGA
ZEA.MA_C        AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
                ********* *** *****      ** *      *  * ***   * *     * ** *

ZEA.MA_B        CCACCATCTTT
ZEA.MA_F        CCACCATCTTT
ZEA.MA_C        CCACCATTTTT
                ******* ***

[Download ClustalW]

#32

Mean pairwise ID: 78.98%


LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                *  ****** **** ************ ** * *** * **  ** ***** **** ***

LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                **     *  ***** ********  ******** ***** * ****** *******  *

LYC.ES_H        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_B        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* *** **** * *   ***   ** * * *****     ** ******  ***

LYC.ES_H        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                 *************************  **  **   *******  ** ********** 

LYC.ES_H        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_B        ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
                * * *   ***   * *       *  **   *** ** ** *** * *** **** * *

LYC.ES_H        ACCTTTT
LYC.ES_B        ACTTTT-
LYC.ES_F        ACTTTT-
                ** *** 

[Download ClustalW]

#33

Mean pairwise ID: 79.19%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                * ******* **** *************** * *****     ** ********** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                **     *  ***** ********  ******** ***** * ****** ******   *

LYC.ES_E        GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_B        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* *** **** * *   ***   ** * * *** *     ** ******  ***

LYC.ES_E        CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                   ***************************  *    ***** *  ** ********** 

LYC.ES_E        ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_B        ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
                ***     ***   *   *** * *  **   ****** ** **  *** ****** * *

LYC.ES_E        ACATTTT
LYC.ES_B        ACTTTT-
LYC.ES_F        ACTTTT-
                ** *** 

[Download ClustalW]

#34

Mean pairwise ID: 79.20%


ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** *******  ********** *** *****  * *****

ZEA.MA_B        CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GT-TGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
ZEA.MA_F        TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTT---GTATGTG-CCACTGGCCGGCCTGCCCGTT
ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
                 **   *  ** *****  *******     **   **    ** ** *** ***** * 

ZEA.MA_B        CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC
ZEA.MA_F        CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGAC
ORY.SA_A        CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
                ******** ** ***  * *  ******   ***** ** *  *    *  ***   * *

ZEA.MA_B        CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
ZEA.MA_F        CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC
ORY.SA_A        CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
                **  ** ****** *  **** **************************** **** ****

ZEA.MA_B        CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC
ZEA.MA_F        CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCAT
ORY.SA_A        CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC
                ** ****** ********* ** ******      ****    * *  *****  * *  

ZEA.MA_B        TT-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        TA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A        TACAACAGACCACCATCTTT
                *  * ** ************

[Download ClustalW]

#35

Mean pairwise ID: 79.23%


LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_F        GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
                *  ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** ***

LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_F        GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
                **     *  ** ** ********  ***** *  ***** * ****** *******  *

LYC.ES_H        GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_J        GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F        GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
                ******* *** * ** * *   ***   ** * *  ****     ** ******  ***

LYC.ES_H        ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J        CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F        CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
                  ** ********* ***********  **  **  *********************** 

LYC.ES_H        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
LYC.ES_J        ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA
LYC.ES_F        ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA
                * ***   ***   * * *     *  **   *** ** ******   * ***** * **

LYC.ES_H        CCTTTT
LYC.ES_J        CCTTT-
LYC.ES_F        CTTTT-
                * *** 

[Download ClustalW]

#36

Mean pairwise ID: 79.25%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * ** 

ZEA.MA_A        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_E        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCT--TTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A        TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
                 ** * *  *   *****  **  ** * *    ***       * ** *** ***** *

ZEA.MA_A        CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA
ZEA.MA_E        CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA
ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
                 ******** ******    *  * **** * *** * ** ** * * *    ** * * 

ZEA.MA_A        CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_E        CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
                ***  ** ****** *  **** **************************** ***  ** 

ZEA.MA_A        CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
ZEA.MA_E        CCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC
ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
                *** ****** ********   ** ******* * * ***    ** *** ****  * *

ZEA.MA_A        ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E        ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A        TCTACAACAGACCACCATCTTT
                 *** * ** ************

[Download ClustalW]

#37

Mean pairwise ID: 79.56%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                *  ***** **** *************  ******  *   * *  ***** **** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
                  *    ***** **  *******   * * * * **** * ****** ******   **

LYC.ES_E        AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA-
LYC.ES_H        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_C        AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
                ****** ** ***** ****  ***    *** ** ** *  ** ********** *** 

LYC.ES_E        CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_H        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                  ***********************  *** * ** ***** ******************

LYC.ES_E        CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_H        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_C        CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
                 *   * *** * *   *  *  *  ** * ** ***** ** ** * * **** *****

LYC.ES_E        ATTTT
LYC.ES_H        CTTTT
LYC.ES_C        ATTT-
                 *** 

[Download ClustalW]

#38

Mean pairwise ID: 79.65%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                * ****** **** *************  ******  *   * *  ***** **** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
                  *    ***** **  *******   * *     ************* ****** * **

LYC.ES_E        AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_J        AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_C        AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
                ****** **  * ** ****  ***    ****** ** *  ************* ****

LYC.ES_E        C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J        CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                  * ********* ***********  *** * ** ***** ******************

LYC.ES_E        CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_J        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_C        CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
                 *   * *** * *   *  *  *  ** * ** ***** ** ** * * **** *****

LYC.ES_E        ATTTT
LYC.ES_J        CTTT-
LYC.ES_C        ATTT-
                 *** 

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#39

Mean pairwise ID: 79.68%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** *******  ********** *** ***** ** **** 

ZEA.MA_E        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_F        TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTT---G-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A        TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
                 **   *  ** ** ***  ** ****     * * *       * ** *** *******

ZEA.MA_E        CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCT-----CTCCAGA
ZEA.MA_F        TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCT-----CTTTAGA
ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
                 ******** ** ****   *  * ****   *** * ** *  *  *     **   * 

ZEA.MA_E        CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ZEA.MA_F        CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
                *** *** ****** *  ********************************* *** ****

ZEA.MA_E        CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
ZEA.MA_F        CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCA
ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
                *** ****** ******** *** ******      ****   ** ** ****** * * 

ZEA.MA_E        CTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        TTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A        CTACAACAGACCACCATCTTT
                 ** * ***************

[Download ClustalW]

#40

Mean pairwise ID: 79.76%


ARA.TH_A        GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_D        GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_G        GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
                ********* ***** * ******* ****  ********  **** ****** *** **

ARA.TH_A        GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_D        GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G        GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
                * **    ** *** ****   ** **  * ***   ****  ******* *********

ARA.TH_A        TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_D        TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
ARA.TH_G        TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
                ***** *   ** * *      ******* ***   *   * * * *** **   *****

ARA.TH_A        TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_D        TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
ARA.TH_G        TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
                ** ***** ******* ******************* **** **  ********** ***

ARA.TH_A        TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_D        TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCA
ARA.TH_G        CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
                  *  ***    * * * ** * ********* * *****  ** * * *   ** ****

ARA.TH_A        CCATTTT
ARA.TH_D        CCACTTT
ARA.TH_G        CCATTTT
                *** ***

[Download ClustalW]

#41

Mean pairwise ID: 79.81%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** ******** ********** *** *****  ****** 

ZEA.MA_E        CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_B        CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTC---GTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT
ORY.SA_A        TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
                 ** * *  *   *****  ** **** *   * *       * * ** *** ***** *

ZEA.MA_E        CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA
ZEA.MA_B        CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA
ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
                 ******** ******       * **** * *** * ** ** * * *    ** * * 

ZEA.MA_E        CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ZEA.MA_B        CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
                ***  ** ****** *  **** **************************** ***  ***

ZEA.MA_E        CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
ZEA.MA_B        CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT
ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
                *** ****** ********  ** ******* * * ****    * * ******  * * 

ZEA.MA_E        CTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        CTT-AGCAAACCACCATCTTT
ORY.SA_A        CTACAACAGACCACCATCTTT
                **  * ** ************

[Download ClustalW]

#42

Mean pairwise ID: 80.04%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ORY.SA_A        GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
                 ******** *********** ******** ********** *** *****  * * ***

ZEA.MA_A        CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_B        CTTTGCGATGG-TTT----CTGGGCC-TGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT
ORY.SA_A        TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATG-TTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
                 ** * *  *  * *    *******    * * ***** *  ** ** ********* *

ZEA.MA_A        CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
ZEA.MA_B        CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
ORY.SA_A        TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
                 ******** ******       *** ** * ***** ** ** *    *  *** * * 

ZEA.MA_A        CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_B        CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ORY.SA_A        CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
                ***  ** ****** *  **** **************************** ***  ** 

ZEA.MA_A        CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
ZEA.MA_B        CCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC
ORY.SA_A        CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
                *** ****** ******** * ** ******* *** ***     * * * ****  * *

ZEA.MA_A        ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        TCTT-AGCAAACCACCATCTTT
ORY.SA_A        TCTACAACAGACCACCATCTTT
                 **  * ** ************

[Download ClustalW]

#43

Mean pairwise ID: 80.26%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
                *****************************  ********************* ****  *

ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_F        TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_C        TGGTACCGTGTC--TTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
                *      *  *   *  *** *** *     ******  **   *********** ****

ZEA.MA_E        GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-TTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_F        GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
ZEA.MA_C        GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
                ****** ***** *  **  ***   *** * **  * **  **    *****  ** **

ZEA.MA_E        CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_F        CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C        CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
                **** * ************ ********************* *** ***   ********

ZEA.MA_E        GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAAG-CAG
ZEA.MA_F        GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAAA-CAG
ZEA.MA_C        AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
                 ******** **** *****      ** *   *  ** * ***      * ***  ***

ZEA.MA_E        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_F        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        ACCACCATTTTT
                ******** ***

[Download ClustalW]

#44

Mean pairwise ID: 80.30%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
                ************************************************** * * *****

ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_B        TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_C        TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
                * *    *  * * **   * **** ** * ***  *  * *  *** ***** * ****

ZEA.MA_A        GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_B        GTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
ZEA.MA_C        GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
                ********** * *  **   **   *** * **  ****  **    *****  ** **

ZEA.MA_A        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG
ZEA.MA_B        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C        CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
                ****** ***** ****** ********************* ***  **   ********

ZEA.MA_A        GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA-ACCTCACTAA-GCA
ZEA.MA_B        GAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCTCTTA-GCA
ZEA.MA_C        AAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA
                 ******** * *** *****   ** **       ** *  ***   *   ** * ***

ZEA.MA_A        AACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        AACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        GACCACCATTTTT
                 ******** ***

[Download ClustalW]

#45

Mean pairwise ID: 80.38%


ZEA.MA_A        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
                **************************************************** * ** **

ZEA.MA_A        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
ZEA.MA_C        TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA
                * *    *  * * **   ** *** **     *** *  **   *** ***** * ***

ZEA.MA_A        AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_E        AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
ZEA.MA_C        AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
                *********** * *  **  ***   *** * **  ***   **    *****  ** *

ZEA.MA_A        GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_E        GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C        GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
                ******* ***** ****** ********************* **** **   *******

ZEA.MA_A        GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GC
ZEA.MA_E        GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GC
ZEA.MA_C        GAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
                * ********   *** *****    * **     * ****  ***      ***** **

ZEA.MA_A        AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E        AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        AGACCACCATTTTT
                * ******** ***

[Download ClustalW]

#46

Mean pairwise ID: 80.49%


ZEA.MA_E        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_C        NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
                ************************************************** * **** **

ZEA.MA_E        TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B        TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_C        TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAA
                * *    *  * ***  *** *** **    **** ** * *  *** ***** * ****

ZEA.MA_E        GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B        GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
ZEA.MA_C        GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
                ********** * *  **  ***   *** * **  ***   **    *****  ** **

ZEA.MA_E        CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B        CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C        CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
                ****** ***** ****** ********************* ***  **   ********

ZEA.MA_E        GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA--GCCTCACTAAGCAG
ZEA.MA_B        GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA--TCCTCTCTTAGCAA
ZEA.MA_C        AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
                 ********  *** *****    * ** *     ** ** ***   * *     **** 

ZEA.MA_E        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_B        ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C        ACCACCATTTTT
                ******** ***

[Download ClustalW]

#47

Mean pairwise ID: 80.70%


ARA.TH_D        GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_E        GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_G        GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
                ********* *****  ******** ****  ********  * ** ********** **

ARA.TH_D        GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_E        GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G        GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
                * **    ** **** ***   ** ** ** ***   ****  ******* *********

ARA.TH_D        TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT
ARA.TH_E        TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT
ARA.TH_G        TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT
                ***** *   ** **   ** ******* ***   *   *** * ******   ******

ARA.TH_D        AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT
ARA.TH_E        AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT
ARA.TH_G        ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC
                * ***** ******* ******************* **** **  ********** *** 

ARA.TH_D        CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCAC
ARA.TH_E        CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCAC
ARA.TH_G        AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC
                 *  ***    * * * ** * ********* * *****  ** * * *   ** *****

ARA.TH_D        CACTTT
ARA.TH_E        CATTTT
ARA.TH_G        CATTTT
                ** ***

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#48

Mean pairwise ID: 80.98%


LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                *  ***** ****  ************  *** **  * *** *  ***** **** ***

LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
                  *    ***** *** *******   * * * * **** * ****** *******  **

LYC.ES_H        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_B        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_C        AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
                ****** ** ***** ****  ****   *** ** ** *  ** ********** *** 

LYC.ES_H        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                *************************  **  ** * *******  ** ************

LYC.ES_H        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
LYC.ES_B        CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA
LYC.ES_C        CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
                 * * * ****  * *  *** **   ** * ** ***** ** ** * * **** ****

LYC.ES_H        CCTTTT
LYC.ES_B        CTTTT-
LYC.ES_C        CATTT-
                * *** 

[Download ClustalW]

#49

Mean pairwise ID: 81.07%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                * ****** ****  ************* *** ** **   * *  ********** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
                  *    ***** **  *******   * * * * **** * ****** ******   **

LYC.ES_E        AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_C        AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
                ****** ** ***** ****  ***    *** ** ** *  ** ********** *** 

LYC.ES_E        C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                  ***************************  *  * ***** *  ** ************

LYC.ES_E        CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B        CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_C        CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
                **   * ***   *   *** * *  **** *********** **** ****** *****

LYC.ES_E        ATTTT
LYC.ES_B        TTTT-
LYC.ES_C        ATTT-
                 *** 

[Download ClustalW]

#50

Mean pairwise ID: 82.08%


LYC.ES_H        GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C        GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
                *  ***** **** *************  ******  * *****  ***** **** ***

LYC.ES_H        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_C        AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
                  *    ***** *** *******   * *     **** * ****** *******  **

LYC.ES_H        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J        AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_C        AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
                ****** **  * ** ****  ***    *** ** ** *  ** ********** *** 

LYC.ES_H        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J        CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                 ** ********* ***********  *** *****************************

LYC.ES_H        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
LYC.ES_J        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
LYC.ES_C        CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
                 * * * ***** *** *******   ** * ** ***** ** ** * * **** ****

LYC.ES_H        CCTTTT
LYC.ES_J        CCTTT-
LYC.ES_C        CATTT-
                * *** 

[Download ClustalW]

#51

Mean pairwise ID: 82.81%


ARA.TH_A        GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_E        GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_G        GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
                ********* *****   ************* ********  * ********* ******

ARA.TH_A        GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_E        GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G        GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
                * ****  ** ***  *** * ** *** *****   ****  ******* *********

ARA.TH_A        TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_E        TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
ARA.TH_G        TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
                ***** *   ** * *     ******** ***   *   * * * *** **   *****

ARA.TH_A        TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_E        TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_G        TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
                ** ***** ******* ******************* *******  **************

ARA.TH_A        TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_E        TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_G        CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
                  ** ***   ** * * ** * ********* * *****  ** * * *   *******

ARA.TH_A        CCATTTT
ARA.TH_E        CCATTTT
ARA.TH_G        CCATTTT
                *******

[Download ClustalW]

#52

Mean pairwise ID: 82.93%


LYC.ES_E        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B        GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J        GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
                ************** ************ **** *** *   * ** ***** **** ***

LYC.ES_E        GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_B        GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J        GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
                **** * ***** ** *************** * ***** * ****** ******   **

LYC.ES_E        AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B        AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J        AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
                ********** * ** **** ****   **** ** ** ***** ********** *** 

LYC.ES_E        C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B        TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J        CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
                  * ********* ***********  **  *  * ***** *  ** ************

LYC.ES_E        CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B        CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J        TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
                 *   *****   *   *    ** *** **** ***** ** ** * * **** *****

LYC.ES_E        ATTTT
LYC.ES_B        TTTT-
LYC.ES_J        CTTT-
                 *** 

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#53

Mean pairwise ID: 83.30%


FUG.RUB.        GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
XEN.LAE.        GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-GCTACT-TGGAGGCTTGGGCTGTCGGAT
GAL.GAL.        GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
                ******  * ******   ******* ***  ******  *******  * * * *****

FUG.RUB.        CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
XEN.LAE.        CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
GAL.GAL.        CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
                ********  *************** **  *  ***** *** **** *****  *****

FUG.RUB.        TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE.        TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
GAL.GAL.        GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
                  *** *** ********  **  ********  **  ******** ** **********

FUG.RUB.        GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG
XEN.LAE.        GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
GAL.GAL.        GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
                ***  ******************* *********** * ********* ******  ***

FUG.RUB.        ATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
XEN.LAE.        ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
GAL.GAL.        ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
                ******** ******** *  ** **   * ****   **** **** *** * **    

[Download ClustalW]

#54

Mean pairwise ID: 84.65%


HOM.SA_A        GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
GAL.GAL.        GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
FUG.RUB.        GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
                ******  *********  ******* *** ******* *********** * *  ****

HOM.SA_A        CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
GAL.GAL.        CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
FUG.RUB.        CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
                ********  ***************  ** *  ***** *** **** *****  *****

HOM.SA_A        TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
GAL.GAL.        GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG
FUG.RUB.        TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG
                  *** *** ********  *    ******   **  ******** *************

HOM.SA_A        TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA
GAL.GAL.        TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA
FUG.RUB.        TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA
                **  ******************* *********** * ******* * ******  ****

HOM.SA_A        TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT
GAL.GAL.        TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC-
FUG.RUB.        TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT-
                ******* ******** * *** *    * **** * **** **** *** * ****   

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#55

Mean pairwise ID: 84.85%


HUM.JA_B        -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT
HUM.JA_A        -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT
HUM.LU_C        GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT
                 * * ******* *** **************************** **** ***** * *

HUM.JA_B        CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
HUM.JA_A        CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA
HUM.LU_C        CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA
                *  **** ***  ***  ****** ********* *  * ***************** **

HUM.JA_B        GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT
HUM.JA_A        GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT
HUM.LU_C        GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT
                * ** **** * ** * ** ******        *  ** ****** *  **********

HUM.JA_B        GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.JA_A        GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
HUM.LU_C        GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC
                ************ **************** ******************************

HUM.JA_B        GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
HUM.JA_A        GGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC
HUM.LU_C        GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC
                *** ******  ****  ** **  ** *  ****     *********  ****** **

HUM.JA_B        TTTT
HUM.JA_A        TTTT
HUM.LU_C        TTTT
                ****

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