There are 55 alignments in the test set.
Mean pairwise ID: 73.71%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCG TRI.AE_B CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCG ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTC-----GTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCA ** * * ** ** * ** ** * *** * ** ** *** ***** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG ZEA.MA_A TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAG * ******** ****** * * **** ***** ** * * * * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTT TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTT ZEA.MA_A ACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTC *** ** ****** * *** ******* *************** ****** ** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC TRI.AE_B CCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC *** ****** ******** * ** ****** ** *** *** * * ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT * * * ** ************
Mean pairwise ID: 74.22%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ****** ***** ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTGCGGTTTGTTGG---CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA * * * * * * ****** * * ** * * *** ***** * **** ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ********** ** *** *** * ** * * * *** ** ** ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTAACGGTGGA TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCCG-CTTCCAACGGTGGA ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCCCAACGGTGGG **** * *** ****** *************** ******* ** ******** ZEA.MA_C AGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TRI.AE_B AGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG ZEA.MA_A AGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTA-AGCAA ******** * *** ***** ** ** *** * * **** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TRI.AE_B ACCACCATCTTT ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 74.35%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * *** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATG-TTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA-----TGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGT ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT ** * * * * ***** * * *** * * *** ***** * ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGA ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ******** ****** * *** *** * ** * * * ** * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTC ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTAT ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACTCC *** ** ****** * **** ****** ************************ ** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT ZEA.MA_A CAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCA * ****** ******** * ** ***** ** ** * *** *** ORY.SA_A -CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT ZEA.MA_A -CTA-AGCAAACCACCATCTTT *** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 74.41%
LEP.COL. -GCCGGAGCC--TTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTTTCACCAGCTGAACAGGGAGCTGTC LEI.MAJ. -GCCGGAGCT--CTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTAAC-CAGGCTTAGCGGGGAGG-ACG TRY.BR_B AGCCGGAGCGCATTGCTCTGTAACCTTCGGGGGCTGAT-CCCGCTTAGCGGGGACG-TCT ******** ********************** * *** * * **** LEP.COL. TGGACCAGCATAGGGTGCTTGCGGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGAG LEI.MAJ. TGGACCAGCGAGGGTGATTTGCTGCGTTGACGTGGTGCTCTGCTTGGCTGTGTGTCGGTG TRY.BR_B TGGACAAGCGGGGGT--TCTGTTGCGTTGACTTGGTGTTCTGCTTGGTTGCGTGTCGGTG ***** *** ** ** ******** ***** ********* ** ******* * LEP.COL. GCCTCCGGGTGCCCCCTTGCAGAAGG-GGCGCGCCCCCTCCGTTAAAGTAGAGGAACTGG LEI.MAJ. ----TGGCTTGCCCCCCTGCAGAGGGTGGCGCGGGTCCGCCGTTGAAGCGAGGGAACCGG TRY.BR_B ----TTGAGGTCGCCACTGTAGAGAG--GCGTTCTCGCGCCGTTAAAGTGGGGGGAACGG * * ** ** *** * *** * ***** *** ** * ** LEP.COL. GTCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCTCGCGCACGTCTGCCGTTGCAGAACCACACCGC LEI.MAJ. GTCAGGCCGGAAACGGAGCAGCCCACCCCACGCACGTCCGCCGTTGCAGAATCACACCGC TRY.BR_B GTCAGGCCGGTGACGGAGCAGCCCACCTTGCGCACGTTC-CCGTTGCAGAAGCACACCGA ********** *************** ******* *********** ******* LEP.COL. GGAGCCTGTCATCACCT-GCGCCCCAGGCGATCCTGTGAAGCTTT-- LEI.MAJ. GGAGCATGTCCGCACTT-GAGCCCCACGCTTCGTCGCGAAGCCTT-- TRY.BR_B GGAGCATCTCAGGACTTTGCGCCCCAAGTGTCGTCGCGAGGCGGTTT ***** * ** ** * * ****** * * ** ** *
Mean pairwise ID: 74.54%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * ******* ZEA.MA_C TGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAAGT TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAGT ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAGT * * ** * * ******* * * ** * * *** ***** * ****** ZEA.MA_C TGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGCA TRI.AE_B TGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCA ZEA.MA_B TGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ******** ** *** *** * ** * * * *** ** **** ZEA.MA_C GGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGAA TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGAA ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA ** * *** ****** *************** *** *** ** ******** * ZEA.MA_C GGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGAC TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGAC ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG--ATCCTCTCTTAGCAAAC ******** *** ***** ** ** * * ** * **** ** ZEA.MA_C CACCATTTTT TRI.AE_B CACCATCTTT ZEA.MA_B CACCATCTTT ****** ***
Mean pairwise ID: 74.78%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG * ***** *** ************* * **** * ** ** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGAC-AATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA * ** ** ******* * * *** **** * ****** ******* * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA ******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA ************************* ** ** *********************** LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC * * * *** * * * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_F ACTTTT- LYC.ES_H ACCTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 75.08%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTT ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCG----TTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ** * * ** ** * ******* * ** * ** ** *** ***** * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC TRI.AE_B CCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGC ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAGAC ******** ****** * * * **** ***** ** * * * * * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC TRI.AE_B CTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTC ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC ** ** ****** * *** ******* *************** *** *** **** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC TRI.AE_B CAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGC ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC ** ****** ********* ** ****** ** **** * ** * * * ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B T-TAGCAAACCACCATCTTT * ** ************
Mean pairwise ID: 75.35%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ************* * **** * ** ** ***** **** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAAT-TCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * ********************** * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * * *** * * * * ** ** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_C ACATTT LYC.ES_J ACCTTT LYC.ES_F ACTTTT ** ***
Mean pairwise ID: 75.58%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** **** ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG TRI.AE_B CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCG ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ** * * ** ** * ** **** *** *** * *** ****** ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-----TTGGTCTCTCCAG * ******** ******* * * **** *** * ** ** * * * * ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT *** ********** * *** ******* *************** *** *** *** ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC **** ****** ******** *** ****** * **** **** * * ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT * * * ***************
Mean pairwise ID: 75.89%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ********** * ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAAG * * ** * * * ****** * * *** * ** ***************** ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC TRI.AE_B TTGGTAGTGGGCTGGGTG-GCTGGGGCGAAAGC--TTCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC ***** **** * *** ***** * ** * ** * * * *** ** *** ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGA *** * *** ****** *************** *** * *** ******** ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAG-ACTTCATACTAAAGCAG ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGGTCCAGA-GCCTCA---TTAAACAG TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG--CCATAGCAG ************* ***** ** * * ** * * * *** ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ZEA.MA_F ACCACCATCTTT TRI.AE_B ACCACCATCTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 75.89%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** * ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GTTGTG--ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTC-ATGGTGTG---CCTTTGTTGGCCTGCCCGTT ** * * *** ****** * * *** * * *** ***** * ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC ZEA.MA_C CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC ******** ****** * * *** *** * ** * * * ** * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC ZEA.MA_C CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT *** ** ****** * **** ****** ********************* *** ** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT- ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT- ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA * ****** ********* ** ***** ** ** * * ** *** * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B CT-TAGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_C CTAAAGCAGACCACCATTTTT ** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 75.95%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCT---TGTATGTGCCA-CTGGCCGGCCTGCCCGTT ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG-CCTGGGTTC----ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTT ** * * * * ****** ** * * *** ******** ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGAC ZEA.MA_C CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC ******** ** **** * * *** **** ***** * * ** * * ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC ZEA.MA_C CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT ** ** ****** * *********** ********************* *** *** ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CT ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CA ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA * ****** ************ ***** ** * * ** * *** ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C CTAAAGCAGACCACCATTTTT ** * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.13%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** **** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCG ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG ** * * * ** ** *** * *** *** *** ****** ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG----TCTCTCC-AG ZEA.MA_C TTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGG ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG * ******** ******* * **** *** * ** * * ** * ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT ZEA.MA_C ACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCT ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT *** ********* * *********** ********************* *** *** ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGC-CT ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCA ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGT-CC * ****** ******** *** ***** * ** * * **** *** * ZEA.MA_E CACTAA-GCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C TACTAAAGCAGACCACCATTTTT ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT *** *********** ***
Mean pairwise ID: 76.15%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * * * *** *** * *** * *** *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCC-AGACCTGAAGTGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG *********** ** *** *** * ** * * * * *** ***** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGG **** * *** ****** *************** *** **** ** ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GCAG ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG ******** **** ***** * ** * **** * * **** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT TRI.AE_B ACCACCATCTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 76.19%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTTC TRI.AE_B CTTGGTGCGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTC ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTC ***** * * * ****** ** *** *** **** ********* ORY.SA_A CAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCCC TRI.AE_B CAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGGCC ZEA.MA_C CAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCC----CTGGGCTTCCTTGGACC ******* ******* * * *** **** * ** * ** * * ** ORY.SA_A TAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCTTCCA TRI.AE_B TTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCTTCCA ZEA.MA_C TATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCTATTA * ********* ** *** ****** *************** ****** *** * ORY.SA_A TCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CTCT TRI.AE_B ACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCC ZEA.MA_C ACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACT ******************* ***** * ***** **** **** * * ORY.SA_A ACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B ATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AAAGCAGACCACCATTTTT * * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.48%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ******* ** *** **** *** *** * * ******* * * ** ** ** ***** ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT ** ** ** ** * ******* *** ** ** *** ******* ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC TRI.AE_B TCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGG ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCC-----TGGGCCTCTTTAGA ********* ** **** * ** * **** ****** ** * ** * * ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT TRI.AE_B CCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT *** *** ******** *** ******* *************** *** *** **** ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT TRI.AE_B CCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCA *** ****** ************ ****** **** ** * * * ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT TRI.AE_B CCATAGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT * * ***************
Mean pairwise ID: 76.85%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ****** *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA * * ** ** *** * ****** ** *** * ** ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTGGGTGG-CTGGGGCGAAAGCTT--CGCCTTCTCAGGCCTTAAGTG ******* *** * * ** ** ***** ** * * ** ** *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTG ***** * *** ******* *************** *** * ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACA TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA * ******** * ********* *** ** ** * * * ** ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_F GACCACCATCTTT TRI.AE_B GACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 77.12%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ******* ***************** ** ***** * ** ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAA-TTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ************** ****** *** LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** * ** * * **** ** * * ** * ** ****** *** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * * ********* *********** ** * ***** **************** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * ** *** * * * ** *** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_J ACCTTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 77.15%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***************** ** ***** * ** ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ****** * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** **** * * *** ** * * *** * ** ****** *** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC *********************** ** * ***** **************** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * ** *** * * * ** *** ** ** ** * * * **** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 77.34%
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ************** * **** ** * ********** *** LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA * ** ** ******* * * * * ************* ****** * * LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* ** **** * * *** * * * * ** * ** ****** **** LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC * *************************** * ***** **************** LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC *** * *** * *** * * ** ***** ** ** *** ****** * * LYC.ES_C ACATTT- LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 77.38%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * ***** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAAG * * ** ** * ********** ** *** * ** ** *** ***** * ***** ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGCA ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGCA TRI.AE_B TTGGTAGTGGGCTGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTT--CGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGCA ***** *** * **** ***** ** * * ** ** *** ** **** ZEA.MA_B GGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGGA ZEA.MA_F GGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGGA TRI.AE_B GGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGGAA ** * *** ******* *************** *** ** ************* * ZEA.MA_B GGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAACC ZEA.MA_F GGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TC-CAGAGCCTCATTAAACAGACC TRI.AE_B GGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGACC ******** ********* **** * * * * ** * ** *** ZEA.MA_B ACCATCTTT ZEA.MA_F ACCATCTTT TRI.AE_B ACCATCTTT *********
Mean pairwise ID: 77.43%
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** *** ************* * * ** ***** * *************** LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTG-TGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA * ** ** ******* * * *** **** * ****** ******* * LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA ******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** *** LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA ***************************** ** ******* ** ********** LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC *** * *** * * *** * * ** ***** ** ** *** ****** * * LYC.ES_F ACTTTT LYC.ES_B ACTTTT LYC.ES_C ACATTT ** ***
Mean pairwise ID: 77.86%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ******* **** ************ ** * *** * ** ** ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAA-TTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTA-GTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ******* * LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** * ** * * *** ** * * **** ** ****** *** LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ** ********* *********** ** ** ******* ** ********** LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCC--AGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCAC LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTC--AGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAAC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCT-TTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCAT * * * *** * *** * * ** *** ** ** *** * *** **** * LYC.ES_B CACTTTT LYC.ES_J CACCTTT LYC.ES_F CACTTTT *** ***
Mean pairwise ID: 78.15%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** ** * *** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * ** ** *** ** ** * * *** * ** ** *** ***** * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ** *** * *** ** ***** ** * * * *** * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC *** ****** ******** * ** ****** *** ** ** **** * * ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT ** * ** ************
Mean pairwise ID: 78.23%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ***************************** *********************** *** * ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA * * * ** * **** * * **** * ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG ******* *** * * *** ** *** * ** *** ** ***** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG ***** * ***** ****** ********************* *** ** ******* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GC ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAA-AC ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC * ******** * *** ***** ** * ** *** * *** * ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 78.40%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************ *** ** * *** * ***** **** *** LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** *** ******* * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC * * * **** * * * ** * ** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_B TTTT LYC.ES_J CTTT LYC.ES_C ATTT ***
Mean pairwise ID: 78.56%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** *** * ********* *** **** **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTT-GTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA * * ** ** * **** ***** * **** * ** * *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGGC ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG-CCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC ****** **** * ** **** *** * ** * * ** ** *** *** *** ZEA.MA_E AGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGGA *** * *** ******* *************** *** * ************** ZEA.MA_E AGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGAC ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGAC TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGAC ******** ********** **** ** * ** * * * ***** ZEA.MA_E CACCATCTTT ZEA.MA_F CACCATCTTT TRI.AE_B CACCATCTTT **********
Mean pairwise ID: 78.71%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * ** *** * **** ***** * *** * * ** *** ***** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ********** ** **** *** ****** * ** *** *** ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGG **** * *** ******* *************** *** * ************* ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCC-CAGAGCCTCACTAAGCAGA ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACC-CAGATCCTCTCTTAGCAAA TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA ******** ********* * **** * ** * * ** * **** * ZEA.MA_E CCACCATCTTT ZEA.MA_B CCACCATCTTT TRI.AE_B CCACCATCTTT ***********
Mean pairwise ID: 78.72%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** **** * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCA * * * ** ** *** ** ***** * ** * ** * *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG *********** * ** **** *** ****** * ** *** *** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTG ***** * *** ******* *************** *** **** ** ********* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCA TRI.AE_B GAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA * ******** ********* * *** *** ** * * * **** ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_E GACCACCATCTTT TRI.AE_B GACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 78.79%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT ******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * * ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * ** *** * **** ****** ** ** * ** ** *** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTGGGTGG-CTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG ********** * ** ** ********** * ** *** *** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTGG **** * *** ******* *************** *** * ** ********** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACT-AAGCAA ZEA.MA_B GAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCT-TAGCAA TRI.AE_B AAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAG ******** * ********* ** *** * * ** * * **** ZEA.MA_A ACCACCATCTTT ZEA.MA_B ACCACCATCTTT TRI.AE_B ACCACCATCTTT ************
Mean pairwise ID: 78.79%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ***************************** ******************* * ***** * ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG ZEA.MA_C TGGT-ACCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAAG * * * *** ******* * * **** * * * *** ***** * ***** ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGGG-GCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGGG-GCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC ***** *** * * ** *** *** * ** *** ** ***** ** *** ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA *** * ***** ****** ********************* *** ** ******** ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA--TCCTCTCTTAGCAAA ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGA--GCCTCATTAAACAGA ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA ********* *** ***** ** * * * *** * * * ** * ZEA.MA_B CCACCATCTTT ZEA.MA_F CCACCATCTTT ZEA.MA_C CCACCATTTTT ******* ***
Mean pairwise ID: 78.98%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************ ** * *** * ** ** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ******* * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** **** * * *** ** * * ***** ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ************************* ** ** ******* ** ********** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC * * * *** * * * ** *** ** ** *** * *** **** * * LYC.ES_H ACCTTTT LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 79.19%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ******* **** *************** * ***** ** ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ***** ******** ******** ***** * ****** ****** * LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** **** * * *** ** * * *** * ** ****** *** LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC *************************** * ***** * ** ********** LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC *** *** * *** * * ** ****** ** ** *** ****** * * LYC.ES_E ACATTTT LYC.ES_B ACTTTT- LYC.ES_F ACTTTT- ** ***
Mean pairwise ID: 79.20%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** * ***** ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GT-TGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTT---GTATGTG-CCACTGGCCGGCCTGCCCGTT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT ** * ** ***** ******* ** ** ** ** *** ***** * ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGAC ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC ******** ** *** * * ****** ***** ** * * * *** * * ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC ** ** ****** * **** **************************** **** **** ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTC ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCAT ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCTC ** ****** ********* ** ****** **** * * ***** * * ZEA.MA_B TT-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_F TA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TACAACAGACCACCATCTTT * * ** ************
Mean pairwise ID: 79.23%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG * ****** ***************** ** ***** * ** *** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA ** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ******* * LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA ******* *** * ** * * *** ** * * **** ** ****** *** LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC ** ********* *********** ** ** *********************** LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAATAAACAACCA LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGCCTAATTAAACCATCA * *** *** * * * * ** *** ** ****** * ***** * ** LYC.ES_H CCTTTT LYC.ES_J CCTTT- LYC.ES_F CTTTT- * ***
Mean pairwise ID: 79.25%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ** * ** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCT--TTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * * * ***** ** ** * * *** * ** *** ***** * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ****** * * **** * *** * ** ** * * * ** * * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC *** ****** ******** ** ******* * * *** ** *** **** * * ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT *** * ** ************
Mean pairwise ID: 79.56%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************* ****** * * * ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** ** ******* * * * * **** * ****** ****** ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA- LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *********************** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC * * *** * * * * * ** * ** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_H CTTTT LYC.ES_C ATTT- ***
Mean pairwise ID: 79.65%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************* ****** * * * ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** ** ******* * * ************* ****** * ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** * ** **** *** ****** ** * ************* **** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * ********* *********** *** * ** ***** ****************** LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC * * *** * * * * * ** * ** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_J CTTT- LYC.ES_C ATTT- ***
Mean pairwise ID: 79.68%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******* ********** *** ***** ** **** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTT---G-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * ** ** *** ** **** * * * * ** *** ******* ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCT-----CTCCAGA ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCT-----CTTTAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ** **** * * **** *** * ** * * * ** * ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** *** ****** * ********************************* *** **** ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCA ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT *** ****** ******** *** ****** **** ** ** ****** * * ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ** * ***************
Mean pairwise ID: 79.76%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** * ******* **** ******** **** ****** *** ** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGGC-CCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** *** **** ** ** * *** **** ******* ********* ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ***** * ** * * ******* *** * * * * *** ** ***** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ** ***** ******* ******************* **** ** ********** *** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA * *** * * * ** * ********* * ***** ** * * * ** **** ARA.TH_A CCATTTT ARA.TH_D CCACTTT ARA.TH_G CCATTTT *** ***
Mean pairwise ID: 79.81%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** ****** ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTC---GTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT ** * * * ***** ** **** * * * * * ** *** ***** * ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ****** * **** * *** * ** ** * * * ** * * ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** *** ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT *** ****** ******** ** ******* * * **** * * ****** * * ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT ZEA.MA_B CTT-AGCAAACCACCATCTTT ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT ** * ** ************
Mean pairwise ID: 80.04%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG ******** *********** ******** ********** *** ***** * * *** ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCCAT ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTT----CTGGGCC-TGGGCTCGTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATG-TTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT ** * * * * * ******* * * ***** * ** ** ********* * ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC ******** ****** *** ** * ***** ** ** * * *** * * ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT *** ** ****** * **** **************************** *** ** ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC *** ****** ******** * ** ******* *** *** * * * **** * * ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT ** * ** ************
Mean pairwise ID: 80.26%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ***************************** ********************* **** * ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTC--TTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** *** * ****** ** *********** **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-TTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ****** ***** * ** *** *** * ** * ** ** ***** ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG **** * ************ ********************* *** *** ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAAG-CAG ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAAA-CAG ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** **** ***** ** * * ** * *** * *** *** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_F ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 80.30%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ************************************************** * * ***** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * * ** * **** ** * *** * * * *** ***** * **** ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ********** * * ** ** *** * ** **** ** ***** ** ** ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG ****** ***** ****** ********************* *** ** ******** ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA-ACCTCACTAA-GCA ZEA.MA_B GAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCTCTTA-GCA ZEA.MA_C AAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA ******** * *** ***** ** ** ** * *** * ** * *** ZEA.MA_A AACCACCATCTTT ZEA.MA_B AACCACCATCTTT ZEA.MA_C GACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 80.38%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT **************************************************** * ** ** ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA * * * * * ** ** *** ** *** * ** *** ***** * *** ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG *********** * * ** *** *** * ** *** ** ***** ** * ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG ******* ***** ****** ********************* **** ** ******* ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GC ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GC ZEA.MA_C GAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC * ******** *** ***** * ** * **** *** ***** ** ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT * ******** ***
Mean pairwise ID: 80.49%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT ************************************************** * **** ** ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAA * * * * *** *** *** ** **** ** * * *** ***** * **** ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG ********** * * ** *** *** * ** *** ** ***** ** ** ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG ****** ***** ****** ********************* *** ** ******** ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA--GCCTCACTAAGCAG ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA--TCCTCTCTTAGCAA ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG ******** *** ***** * ** * ** ** *** * * **** ZEA.MA_E ACCACCATCTTT ZEA.MA_B ACCACCATCTTT ZEA.MA_C ACCACCATTTTT ******** ***
Mean pairwise ID: 80.70%
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** ******** **** ******** * ** ********** ** ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * ** ** **** *** ** ** ** *** **** ******* ********* ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGTGGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGGT ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGTGTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGGT ARA.TH_G TGAGTGAACCGTATGAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGGT ***** * ** ** ** ******* *** * *** * ****** ****** ARA.TH_D AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGAT ARA.TH_E AATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGAT ARA.TH_G ATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGAC * ***** ******* ******************* **** ** ********** *** ARA.TH_D CATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCAC ARA.TH_E CACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCAC ARA.TH_G AACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCAC * *** * * * ** * ********* * ***** ** * * * ** ***** ARA.TH_D CACTTT ARA.TH_E CATTTT ARA.TH_G CATTTT ** ***
Mean pairwise ID: 80.98%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************ *** ** * *** * ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** *** ******* * * * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** **** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ************************* ** ** * ******* ** ************ LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA * * * **** * * *** ** ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_H CCTTTT LYC.ES_B CTTTT- LYC.ES_C CATTT- * ***
Mean pairwise ID: 81.07%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ****** **** ************* *** ** ** * * ********** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** ** ******* * * * * **** * ****** ****** ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** ***** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA *************************** * * ***** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC ** * *** * *** * * **** *********** **** ****** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_B TTTT- LYC.ES_C ATTT- ***
Mean pairwise ID: 82.08%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG * ***** **** ************* ****** * ***** ***** **** *** LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG * ***** *** ******* * * **** * ****** ******* ** LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC ****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** *** LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA ** ********* *********** *** ***************************** LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA * * * ***** *** ******* ** * ** ***** ** ** * * **** **** LYC.ES_H CCTTTT LYC.ES_J CCTTT- LYC.ES_C CATTT- * ***
Mean pairwise ID: 82.81%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG ********* ***** ************* ******** * ********* ****** ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG * **** ** *** *** * ** *** ***** **** ******* ********* ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG ***** * ** * * ******** *** * * * * *** ** ***** ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA ** ***** ******* ******************* ******* ************** ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA ** *** ** * * ** * ********* * ***** ** * * * ******* ARA.TH_A CCATTTT ARA.TH_E CCATTTT ARA.TH_G CCATTTT *******
Mean pairwise ID: 82.93%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG ************** ************ **** *** * * ** ***** **** *** LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG **** * ***** ** *************** * ***** * ****** ****** ** LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC ********** * ** **** **** **** ** ** ***** ********** *** LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA * ********* *********** ** * * ***** * ** ************ LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC * ***** * * ** *** **** ***** ** ** * * **** ***** LYC.ES_E ATTTT LYC.ES_B TTTT- LYC.ES_J CTTT- ***
Mean pairwise ID: 83.30%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-GCTACT-TGGAGGCTTGGGCTGTCGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT ****** * ****** ******* *** ****** ******* * * * ***** FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG ******** *************** ** * ***** *** **** ***** ***** FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGC-CTAAGGAGGG XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG *** *** ******** ** ******** ** ******** ** ********** FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG *** ******************* *********** * ********* ****** *** FUG.RUB. ATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT- GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC ******** ******** * ** ** * **** **** **** *** * **
Mean pairwise ID: 84.65%
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT ****** ********* ******* *** ******* *********** * * **** HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG ******** *************** ** * ***** *** **** ***** ***** HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGCCTAAGGAGGGG FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGCCTAAGGAGGGG *** *** ******** * ****** ** ******** ************* HOM.SA_A TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGGA GAL.GAL. TGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGGA FUG.RUB. TGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGGA ** ******************* *********** * ******* * ****** **** HOM.SA_A TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCTT GAL.GAL. TCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC- FUG.RUB. TCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT- ******* ******** * *** * * **** * **** **** *** * ****
Mean pairwise ID: 84.85%
HUM.JA_B -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGGACTTTAGTT HUM.JA_A -GGCCTAGCAACGTGGGCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAGATGGGACTTTGGGT HUM.LU_C GGTCTTAGCAACTTGGTCCTGTAACCCAAGTGGGGGCATGTGGGAAATGGAACTTTGGGT * * ******* *** **************************** **** ***** * * HUM.JA_B CGGCCCATTGGATCGGATCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGGCTGCCCATTCCAAGCCGAGA HUM.JA_A CAGCCCATTGGATCGGGTCCAGTGTTAGCTGCTTGCTGGTCTGCCCATTCCAAGCCGAGA HUM.LU_C CAACCCAGTGGTNCGGGNCCAGTGCTAGCTGCTTACCCGGCTGCCCATTCCAAGCCGGGA * **** *** *** ****** ********* * * ***************** ** HUM.JA_B GTTGAGCTGTGTGAGCCGGACGAAGGTCTGGCTTGGTCAGCTCCTAAAGCGGAGGGCAAT HUM.JA_A GTTGGGCTGTGTGATCTGGGCGAAGGCTGGGGTCGCACAGCTCCTAAAGAGGAGGGCAAT HUM.LU_C GGTGGGCTGAGGGACCTGGGCGAAGGCTNNNGGNGCGCA-CTCCTAGACTGGAGGGCAAT * ** **** * ** * ** ****** * ** ****** * ********** HUM.JA_B GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.JA_A GCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACCACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC HUM.LU_C GCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCGGCAGTGGAAGGATAAC ************ **************** ****************************** HUM.JA_B GGGCCGGTGCTGCTTGGACCCACCATGGTTCACTGAGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC HUM.JA_A GGGTCGGTGCTACTTGGGCC-ACCATGGT-CACTGCATGCACTCTTAATCAGACCATCTC HUM.LU_C GGGCCGGTGCGCCTTGAGCCAACACTGTTCAACTGGGCTGACTCTTAATAGGACCATTTC *** ****** **** ** ** ** * **** ********* ****** ** HUM.JA_B TTTT HUM.JA_A TTTT HUM.LU_C TTTT ****