There are 50 alignments in the test set.
Mean pairwise ID: 74.58%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * *****
ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTT
TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCG----TTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
** * * * * ****** * ** * * *** ***** *
ZEA.MA_C CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC
TRI.AE_B CCAAGTTG-GTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG------CCTTCTCAGGC
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC
******** ****** * *** *** * ** * * *
ZEA.MA_C CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT
TRI.AE_B CTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTC
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
** ** ****** * *** ****** *************** *** *** **
ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA
TRI.AE_B CAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CG
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-CT
ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT--C
* ****** ********* ** ***** ** ** * * **
ZEA.MA_C CTAAAGCAGACCACCATTTTT
TRI.AE_B CCATAGCAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B TCTTAGCAAACCACCATCTTT
* ** ******** ***
Mean pairwise ID: 74.75%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTGTGG--ATTCTGATCC-TGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCC
TRI.AE_B CTTGGTGCGG--TTTGTTGGCC-TGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCC
ZEA.MA_C CTTGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCA----TGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCC
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTC------GTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCC
** * * * * ** **** * *** * * *** *****
ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG
TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA
ZEA.MA_C GTTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCC----CTGGGCTTCCTTG
ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCT----TTGGGTCTCTGCA
* ******** ****** * *** *** * ** * * *
ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCCGCT
TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTGCC-GCT
ZEA.MA_C GACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGGCT
ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTGCCGACT
* *** ** ****** * *** ****** *************** ****** **
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC
TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC
ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTC
ZEA.MA_A CCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT
* ****** ******** * ** ***** ** ** ***
ORY.SA_A -CTCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B -CGCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ATACTAAAGCAGACCACCATTTTT
ZEA.MA_A -CACTA-AGCAAACCACCATCTTT
* * * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 75.61%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** ****
ORY.SA_A TTTGGTGTGG--ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG
TRI.AE_B CTTGGTGCGG--TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCG
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ZEA.MA_C CTTGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCG
** * * * * ** *** *** *** *** ******
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG
ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTT----TGGTCTCTCC-AG
ZEA.MA_C TTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCC----TGGGCTTCCTTGG
* ******** ******* * *** *** * ** * * *
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT
TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT
ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT
ZEA.MA_C ACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCT
*** ********* * *** ****** *************** *** *** ***
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-
TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-
ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-
ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCA
* ****** ******** *** ***** * ** * ****
ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B CGCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_E CACTAA-GCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C TACTAAAGCAGACCACCATTTTT
* * *********** ***
Mean pairwise ID: 75.99%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** ** * ***
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCC-TGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCC
TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTT-GTTGGCC-TGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCC
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCG-----T-TGTGACACTGGCCGGCTTGCCC
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCC
** * ** ** * ** ***** *** ** ** *** *****
ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG
TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA
ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA
ZEA.MA_F GTTCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-----GGGCCTCTTTA
* ******** ** *** * * * ** ***** ** * *
ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC
TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GC
ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC
ZEA.MA_F GACCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGC
* *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** *
ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC
TRI.AE_B TTCCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACC
ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC
ZEA.MA_F TTCCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCC
* *** ****** ******** * ** ****** *** ** *
ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B CCGCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A TCACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F TCATTA-AACAGACCACCATCTTT
* * * ** ************
Mean pairwise ID: 76.05%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** ** * **
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGAT--CCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCC
TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCC
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCG----TT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCC
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCC
** * * ** ** ** **** ** ** * *** *****
ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG
TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA
ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA
ZEA.MA_E GTCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTT----TGG-TCTCTCCA
* ******** ****** * * **** *** * ** * * *
ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC
TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GC
ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC
ZEA.MA_E GACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGC
* *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** *
ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC
TRI.AE_B TTCCAACGGTGGAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACC
ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC
ZEA.MA_E TTCCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCC
* *** ****** ******** ** ****** * *** *** *
ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B CCGCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A TCACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E TCACTA-AGCAGACCACCATCTTT
* * * * ** ************
Mean pairwise ID: 76.35%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** ** *****
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCA----TGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGT
** * * * * ****** *** * * *** *******
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
TRI.AE_B TCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGG
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCC-----TGGGCCTCTTTAGA
ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCC----CTGGGCTTCCTTGGA
********* ** **** * * *** **** * ** * ** * *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
TRI.AE_B CCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTT
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA
*** ** ****** * *** ****** *************** *** *** ***
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-C
TRI.AE_B CCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-C
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-C
ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT
* ****** ************ ***** ** * ** *
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT
* * *********** ***
Mean pairwise ID: 76.47%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * ***** *
ZEA.MA_C TGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAAG
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAAG
ZEA.MA_B TTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAAG
ZEA.MA_F TCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAAG
* * * * ******* * * *** * * * *** ***** * *****
ZEA.MA_C TTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGGC
TRI.AE_B TTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTC--GCCTTCTCAGGCCTTAAGTGGC
ZEA.MA_B TTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGGC
ZEA.MA_F TTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGGC
***** *** ** *** *** * ** * * * *** ** ***
ZEA.MA_C AGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGGA
TRI.AE_B AGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGGA
ZEA.MA_B AGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGGG
ZEA.MA_F AGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGGG
*** * *** ****** *************** *** *** ** ********
ZEA.MA_C AGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAGA
TRI.AE_B AGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCC-TACCCCGCCATAGCAGA
ZEA.MA_B AGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAG--ATCCTCTCTTAGCAAA
ZEA.MA_F AGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAG--AGCCTCATTAAACAGA
********* *** ***** ** * * * * * ** *
ZEA.MA_C CCACCATTTTT
TRI.AE_B CCACCATCTTT
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
******* ***
Mean pairwise ID: 76.49%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
******** ** *** ******** *** * ********* *** ****** *** *
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCC-TTTGTTGGCCTGCCCGTTCCA
TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
* * * * *** **** * * *** * * * *** ***** * ***
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
******* *** ** ** *** * ** * * * *** ** *
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTG
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
***** * *** ****** *************** *** *** ** *******
ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGC
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTA-AGC
ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTA-AAC
* ******** * *** ***** ** ** * * *
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
TRI.AE_B AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT
* ******** ***
Mean pairwise ID: 76.61%
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** *** ************ * * ** * ** * ***** **** ***
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * **** * ****** ******* *
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
** ********* *********** ** ** ******* ** **********
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCT-CTGAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATG-TCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * * *** * * ** ** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_B ACTTTT
LYC.ES_J ACCTTT
LYC.ES_C ACATTT
LYC.ES_F ACTTTT
** ***
Mean pairwise ID: 76.67%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******* ********** *** ***** ** * ***
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCT---TTGTTGGCCTGCCCGT
** * * ** * ** * *** * * *** ***** *
ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGA
******** ** *** * ** *** * ** * * ** *
ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA
*** ** ****** * **** ****** ********************* *** **
ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-
ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCA
* ****** ******** * ** ***** ** * ** ***
ZEA.MA_A CACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F CATTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A CTCTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C TACTAAAGCAGACCACCATTTTT
** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 76.68%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** * *****
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCCGT
TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTCG-----T-TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT
** * ** ** * ******* *** ** ** *** ***** *
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
TRI.AE_B TCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAGG
ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAGA
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-----GGGCCTCTTTAGA
******** ** *** * * * **** ***** ** * * *
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
TRI.AE_B CCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTT
ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
*** ** ****** * *** ******* *************** *** *** ***
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
TRI.AE_B CCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCG
ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGAGCCTCA
*** ****** ********* ** ****** **** * * * *
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B CCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B CT-TAGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F TT-AAACAGACCACCATCTTT
* ** ************
Mean pairwise ID: 76.80%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * ****
ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTT-GCTGGCTTGCCCG
TRI.AE_B CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCG
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCG----T--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCA
** * * ** ** * ** **** *** * ** *** *****
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG
ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTT----TGG-TCTCTCCAG
ZEA.MA_B TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCAG
* ******** ****** * **** *** * ** * * * *
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT
TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT
ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT
ZEA.MA_B ACCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACT
*** ** ****** * *** ******* *************** *** *** **
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC
ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC
ZEA.MA_B TCCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC
**** ****** ******** ** ****** * **** * ** * *
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT
* * ** ************
Mean pairwise ID: 76.87%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
******* ** *** **** *** **** * ******* * * ** ** * * ***
ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCC-TGGGCCCCATGTTGTTGTAAT-CTTGCTGGCTTGCCC
TRI.AE_B CTTGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTG----TGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCC
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTC------GTTGTGACACTGGCCGGCTTGCCC
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTC------GTTGTGACTCTAGCCGGCTTGCCC
** * * ** ** * ** ***** * *** * ** ** *** *****
ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG
TRI.AE_B GTTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCA
ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA
ZEA.MA_B ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTT----TGGGTCTCTGCA
* ******** ****** * * ** ***** ** * * * *
ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC
TRI.AE_B GGCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GC
ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC
ZEA.MA_B GACCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCAC
* *** ** ****** * *** ******* *************** *** *** *
ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC
TRI.AE_B TTCCAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACC
ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC
ZEA.MA_B TTCCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCC
* *** ****** ******** * ** ****** ** *** * * *
ORY.SA_A CCTCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B CCGCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A TCACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B TCTCTT-AGCAAACCACCATCTTT
* * * ** ************
Mean pairwise ID: 77.03%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******** ********** *** ***** * * ***
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTT----CTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCA
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTT----CTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCA
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGATCCTGGGCCCCATG-TTGTTGTA-AT-CTTGCTGGCTTGCCCG
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCT----TTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCG
** * * * * ** * * * * ** * * *** *****
ZEA.MA_A TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAG
ZEA.MA_B TCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAG
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
ZEA.MA_C TTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGG
* ******** ****** * ** *** * ** * * * ** *
ZEA.MA_A ACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACT
ZEA.MA_B ACCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACT
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT
ZEA.MA_C ACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCT
*** ** ****** * **** ****** ********************* *** **
ZEA.MA_A CCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT
ZEA.MA_B TCCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC
ZEA.MA_C ATTAACGGTGGAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTC
* ****** ******** * ** ***** ** ** * * ***
ZEA.MA_A -CACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B -CTCTT-AGCAAACCACCATCTTT
ORY.SA_A -CTCTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ATACTAAAGCAGACCACCATTTTT
** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.04%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * * *****
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAACCTTGCTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTTGTG-ACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTTGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
* * * * * * *** **** * * ** * * *** ***** * ****
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
ZEA.MA_A GTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
********** ** ** *** * ** * * * *** ** **
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_A CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
**** * *** ****** *************** *** *** ** ********
ZEA.MA_C AAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCA
TRI.AE_B AAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCA
ZEA.MA_A GAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACT-AAGCA
ZEA.MA_B GAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT-CTCT-TAGCA
******** * *** ***** ** ** * * * ****
ZEA.MA_C GACCACCATTTTT
TRI.AE_B GACCACCATCTTT
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 77.09%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
******** *********** ******** ********** *** ***** ** * **
ORY.SA_A TTTGGTGTGGATTCTGAT---CCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCC
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCA----TGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCC
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCG----TT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCC
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCC
** * * * * ** *** * ** ** *** *****
ORY.SA_A GTTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCG
ZEA.MA_C GTTCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTG
ZEA.MA_A ATCCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCA
ZEA.MA_E GTCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCA
* ******** ****** * *** *** * ** * * **
ORY.SA_A GCCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGC
ZEA.MA_C GACCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGC
ZEA.MA_A GACCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGAC
ZEA.MA_E GACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGC
* *** ** ****** * **** ****** ********************* *** *
ORY.SA_A TTCCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTC
ZEA.MA_C TATTAACGGTGGAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTT
ZEA.MA_A TCCCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACC
ZEA.MA_E TTCCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCC
* * ****** ******** ** ***** * ** * *** ***
ORY.SA_A CCT-CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C CATACTAAAGCAGACCACCATTTTT
ZEA.MA_A TCA-CTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E TCA-CTA-AGCAGACCACCATCTTT
*** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.11%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** *** ************* * **** * * ***** **** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * * * **** * ****** ****** *
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_E -CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
*********************** ** * ***** ****************
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTT-CAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * *** * * * ** ** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_H ACCTTTT
LYC.ES_C ACATTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 77.21%
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG
******** *********** ******* ********** *** ***** * *****
ZEA.MA_B CTTTGCGATGGTTTCTGGGCCTGGGCTC---GT-TGTG-ACTCTAGCCGGCTTGCCCATC
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATTCTGGGCCTGGGCTT---GTATGTG-CCACTGGCCGGCCTGCCCGTT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGTT
ZEA.MA_C CTTGGTA-CCGTGTCTTTGCCTGGGTTC---AT-GGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGTT
** * *** ****** * ** * * *** ***** *
ZEA.MA_B CCAAGTTG-GTAGTGT-CTGACGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGAC
ZEA.MA_F CCAAGTTG-GTTGTGG-CTGGTGGGGCTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGAC
ORY.SA_A CCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGCC
ZEA.MA_C CCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGG----GCTTCCTTGGAC
******** ** *** * * *** *** * ** * * ** * *
ZEA.MA_B CTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTC
ZEA.MA_F CTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTC
ORY.SA_A CTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTTC
ZEA.MA_C CTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTAT
** ** ****** * **** ****** ********************* *** **
ZEA.MA_B CAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCT
ZEA.MA_F CAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTCGG-TCCAGA-GCCTCA
ORY.SA_A CATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGA-GTCCCT
ZEA.MA_C TAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATA
* ****** ********* ** ***** ** * * * *** *
ZEA.MA_B CTT-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C CTAAAGCAGACCACCATTTTT
* * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.23%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GCGGATT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGC-GCGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGGT-GTGGATG
******** *********** ******** ********** *** ***** * ****
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTC---GTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_C CTTGGTACCGT--GTCTTTGCCTGGGTTC----ATGGTGTGCCTTTGTTGGCCTGCCCGT
** * * *** ** *** * * * * *** ***** *
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA
ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTT----CCTTGGA
******** ****** * *** *** * ** * * * * *
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA
*** ** ****** * **** ****** ********************* *** **
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-C
ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT-C
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-C
ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT
* ****** ******** ** ***** * ** * * ** ***
ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT
** * ** ******** ***
Mean pairwise ID: 77.29%
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
TRI.AE_B NCCGAGCT-AGTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGA-GGCGG-TGTGGATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******* ** *** **** *** *** * ******* * * ** ** ** ****
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTG-CTGGCTTGCCCG
TRI.AE_B CTTGGTG-CGGTTT-GTTGGCCTGGGCTTG----TGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCG
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCG----CTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCG
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-----TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCG
** * ** ** * ** **** *** ** * *** ******
ORY.SA_A TTCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGG
TRI.AE_B TTCCAAGTTG-GTAGTGGGCTGG-GTGGCTGGGGCGAAAGC------TTCGCCTTCTCAG
ZEA.MA_E TCCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-----TTGGTCTCTCCAG
ZEA.MA_F TTCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCC-----TGGGCCTCTTTAG
* ******** ** **** * * **** *** * ** * * * *
ORY.SA_A CCCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCT
TRI.AE_B GCCTTAAGTGGCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCT
ZEA.MA_E ACCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCT
ZEA.MA_F ACCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCT
*** *** ****** * *** ******* *************** *** *** ***
ORY.SA_A TCCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
TRI.AE_B TCCAACGGTGGAAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCC
ZEA.MA_E TCCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC
ZEA.MA_F TCCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC
**** ****** ******** *** ****** **** ** * * *
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
TRI.AE_B GCCATAGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT
* * ***************
Mean pairwise ID: 77.34%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** **** * ** **
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCT-GGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA
TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCCT-GGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCA
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
* * * * * * *** *** * ** * ** *** ***** * ***
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
*********** ** *** *** * ** * * * *** ** *
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTG
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
***** * *** ****** *************** *** **** ** *******
ZEA.MA_C GAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
TRI.AE_B GAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGC
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTA-AGC
ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTA-AGC
* ******** *** ***** * ** *** * * ***
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
TRI.AE_B AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT
* ******** ***
Mean pairwise ID: 77.36%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** *** ************* * **** * * ***** **** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * ************* ****** * *
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
* * ********* *********** ** * ***** ****************
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTT-CAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * *** * * * ** ** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_J ACCTTT-
LYC.ES_C ACATTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 77.43%
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * **** **
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B TGGTGCGG--TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
* * * * * * *** *** * *** * * * *** ***** * ****
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGC-TGGGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
********** ** *** *** * ** * * * *** ** **
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCCG-CTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
**** * *** ****** *************** *** *** ** ********
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACT-AAGCAG
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCT-CTCT-TAGCAA
******** *** ***** * ** * * ** * ****
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
TRI.AE_B ACCACCATCTTT
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 77.55%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** *** * ********* *** **** **** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTTG-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTT--GCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTG-GCCTGGGCTTGTGATGTAACCTTG-CTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * * * *** *** * *** * ** *********** ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCT-TTGGTCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCC-TGGGCCTCTTTAGACCTGAAGCGG
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCT--TCGCCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
****** **** ** *** *** * ** * * * *** ** **
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTCCAACGGTGG
**** * *** ****** *************** *** *** *** ********
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAAG-CAG
ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAAA-CAG
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCC-CGCCATAGCAG
******** **** ***** ** * ** * * ***
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
TRI.AE_B ACCACCATCTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 77.75%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** *** ************ * * ** * ** * ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * * * **** * ****** ******* *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
************************* ** ** ******* ** **********
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * * *** * * * ** ** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_H ACCTTTT
LYC.ES_B ACTTTT-
LYC.ES_C ACATTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 77.89%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
******** *********** ******* ********** *** ***** ** ****
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCTGGGCTT---G-TATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
ZEA.MA_C CTTGGTACCGTGTCTTTG--CCTGGGTTC---ATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGT
** * * ** ** *** * * * *** *******
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGGTCT-----CTCCAGA
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGGCCT-----CTTTAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
ZEA.MA_C TCCAAGTTG-GTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTT----CCTTGGA
******** ** **** * *** *** * ** * * * *
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
ZEA.MA_C CCTATAGTGGCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTA
*** ** ****** * *********** ********************* *** ***
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-C
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-C
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCC-C
ZEA.MA_C TTAACGGTGGAAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCAT
* ****** ******** *** ***** ** * * ** * ***
ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACTAAAGCAGACCACCATTTTT
** * *********** ***
Mean pairwise ID: 77.92%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ***** *** ************* * **** * ** ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * **** * ****** ******* *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* ** * ** * * *** * * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
** ********* *********** ** ** ***********************
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * * *** * * * * ** ** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_H ACCTTTT
LYC.ES_J ACCTTT-
LYC.ES_C ACATTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 78.67%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** *** ************* * * ** ** * ********** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATT-CTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
* ** ** ******* * * * * **** * ****** ****** *
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_C GAGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* ** **** * * *** * * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_C CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
*************************** * ***** * ** **********
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTC-CATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-C-CAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_C ACGAGCCAGTGTCATATAAGTTC-AACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
*** *** * *** * * ** ***** ** ** *** ****** * *
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_B ACTTTT-
LYC.ES_C ACATTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 79.16%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ******* **** ************ ** * *** * ** ***** **** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ****** *
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* *** * ** * * *** ** * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
* ********* *********** ** * ***** * ** **********
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCTGAG-TCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * *** * * * ** *** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_J ACCTTT-
LYC.ES_B ACTTTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 79.90%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** *** * ********* *** **** * ** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCT-GGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
TRI.AE_B TGGTG-CGGTTTGTTGG--CCTGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
* * ** ** *** * ***** * ** * * ** *** ***** * ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCG
TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG
******* *** * ** **** *** * ** * * ** ** *** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTCCAACGGTG
***** * *** ******* *************** *** *** ** *********
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA
ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCA
ZEA.MA_F GGAGGATAACAG-GCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACA
TRI.AE_B GAAGGATAACAG-GCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA
* ******** ********* *** ** ** * * * **
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
ZEA.MA_F GACCACCATCTTT
TRI.AE_B GACCACCATCTTT
************
Mean pairwise ID: 79.93%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** ***************** ** ***** * ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ****** *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* *** * ** * * *** ** * * ** * ** ****** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_E CC-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
* ********* *********** ** * ***** ****************
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* ** *** * * * ** *** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_H ACCTTTT
LYC.ES_J ACCTTT-
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 79.95%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** ************ ** * *** * ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ***** ******** ******** ***** * ****** ****** *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_E GAGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* *** **** * * *** ** * * *** * ** ****** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_E -CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
*********************** ** * ***** * ** **********
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_E ACGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATG-CCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * *** * * ** *** ** ** ** * * * **** * *
LYC.ES_H ACCTTTT
LYC.ES_B ACTTTT-
LYC.ES_E ACATTTT
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 80.08%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * * *** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAAC-CTTGCTGGCCTGCCCGTTCCA
* * ** ** * **** ****** ** *** * ** ** *** ***** * ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTGGGTGG-CTGGGGCGAAAGCTT--CGCCTTCTCAGGCCTTAAGTG
******* *** * ** ** ***** ** * * ** ** *** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT--GCCGCTTCCAACGGTG
***** * *** ******* *************** *** * ** *********
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA
ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTT-AGCA
ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACA
TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA
* ******** * ********* *** * ** * * **
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
ZEA.MA_F GACCACCATCTTT
TRI.AE_B GACCACCATCTTT
************
Mean pairwise ID: 80.11%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** *** * ********* *** ** * **** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCCTGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * ** ** * **** ***** * *** * * ** *** ***** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCGG
TRI.AE_B GTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTGG
****** *** ** **** *** * ** * * ** ** *** ** **
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
TRI.AE_B CAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACTG--CCGCTTCCAACGGTGG
**** * *** ******* *************** *** * *************
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCAGA
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTT-AGCAAA
ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCATTA-AACAGA
TRI.AE_B AAGGATAACAGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCAGA
******** ********* **** * * ** * * ** *
ZEA.MA_E CCACCATCTTT
ZEA.MA_B CCACCATCTTT
ZEA.MA_F CCACCATCTTT
TRI.AE_B CCACCATCTTT
***********
Mean pairwise ID: 80.57%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
******** *********** ******* ********** *** ***** ** * **
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCT--TTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGGATT-CTGGGCCT-GGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGGATT-CTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
** * ** ** *** ** ** * ** * ** *** ***** *
ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGG----TCTCTGCAGA
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
******** ** *** * * **** *** * ** * * *** *
ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
*** ** ****** * **** **************************** *** **
ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAG-GCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAG-GCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
*** ****** ******** ** ****** *** ** ** **** * *
ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
** * ** ************
Mean pairwise ID: 80.57%
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** ************ *** ** * * * ***** **** ***
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
* ***** ** ******* * * **** * ****** ****** **
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* ********* *********** ** * * ***** * ** ************
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCTGAGT-CCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
* * *** * * * ** * ** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_B TTTT-
LYC.ES_J CTTT-
LYC.ES_C ATTT-
***
Mean pairwise ID: 80.78%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
******** *********** ******* ********** *** ***** * * ***
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACA--CTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGT--TGTGACT--CTAGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGG-ATTCTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCA--CTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
** * ** ***** ** ** * * *** ** ** *** ***** *
ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGG----GTCTCTGCAGA
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GG----GCCTCTTTAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
******** ** *** *** ** ***** ** * * * *** *
ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
*** ** ****** * **** **************************** *** **
ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTC
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
*** ****** ******** * ** ****** *** * * **** * *
ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ATTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
* * ** ************
Mean pairwise ID: 80.84%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_F GCCGAGCTTTGTAACGTGGGCTTGTAACCCGAGTGGGGGCAACAATGTGGTGGAATGTTG
* ****** **** ************ ** * *** * ** ** ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAG-TTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAAT-TTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTA
LYC.ES_F GGTCCATCTTGATGGATGGGCTTGAAGGGCTAATGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACA
** * ** ** ******** ***** * ***** * ****** ******* *
LYC.ES_H GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_J GAGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_B GAGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGA
LYC.ES_F GAGTTGGGTCAAGTGGTCTATACGAAAGTATAG-CCACTTGGCCTTTAGAGTGGGATGGA
******* *** * ** * * *** ** * * **** ** ****** ***
LYC.ES_H ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_J CCGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATA
LYC.ES_B ATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATA
LYC.ES_F CTGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGACTAGTCCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATC
** ********* *********** ** ** ******* ** **********
LYC.ES_H ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_J ATGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACG-CCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACC
LYC.ES_B ACGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATG-CCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACC
LYC.ES_F ACGGGCTAGTGCTCTTTGAGTCCTAACAAAAACCTGATAGGTTGC-CTAATTAAACCATC
* * * *** * * * ** *** ** ** *** * *** **** * *
LYC.ES_H ACCTTTT
LYC.ES_J ACCTTT-
LYC.ES_B ACTTTT-
LYC.ES_F ACTTTT-
** ***
Mean pairwise ID: 80.92%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
***************************** ********************* * ** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCC-GGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
ZEA.MA_F TCCTGACGGATT-CTGGGCCT-GGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
ZEA.MA_C TGGTACCGTGTCTTTG---CCTGGGTTCATGGTGTGCCTTTG-TTGGCCTGCCCGTTCCA
* * * ** * *** * *** * ** *** ***** * ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCG
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
******* *** * * ** *** *** * ** ** ** ***** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
***** * ***** ****** ********************* *** ** *******
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCT-CACTAA-GC
ZEA.MA_E GGAGGATAACGG-GCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCT-CACTAA-GC
ZEA.MA_F GGAGGATAACAG-GCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCT-CATTAA-AC
ZEA.MA_C GAAGGATAACAG-GCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
* ******** *** ***** ** * ** *** * *** *
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
* ******** ***
Mean pairwise ID: 80.98%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGGATG
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
******** *********** ******* ********** *** ***** * ****
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTC---GCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTC---GT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_F TTTCCTGACGG-ATTCTGGGCCTGGGCTT---GT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A TTTGGTG-TGG-ATTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
** * ** ***** ** **** * * * ** *** ***** *
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-----TCTCTCCAGA
ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGG----TCTCTGCAGA
ZEA.MA_F TCCAAGTTG-GTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-----CCTCTTTAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
******** ** *** * **** *** * ** * * *** *
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ZEA.MA_F CCTGAAGCGGCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
*** ** ****** * **** **************************** *** ***
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCA
ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCT
ZEA.MA_F CCAACGGTGGGAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGAGCCTCA
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAACAGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCCT
*** ****** ******** ** ****** **** * * ***** * *
ZEA.MA_E CTA-AGCAGACCACCATCTTT
ZEA.MA_B CTT-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F TTA-AACAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A CTACAACAGACCACCATCTTT
* * ** ************
Mean pairwise ID: 81.32%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
***************************** ******************* * * *** *
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGT--TGTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCC-TGGGCTTGTA-TGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCA
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCA
* * *** *** **** * * **** * * * *** ***** * ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
ZEA.MA_F AGTTGGTTGTGGCTGGTGGGG-CTCGGGCGAAGGCCT-GGGCCTCTTTAGACCTGAAGCG
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
******* *** * * ** ** *** * ** *** ** ***** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
ZEA.MA_F GCAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
***** * ***** ****** ********************* *** ** *******
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA-ACCTCACTAA-GC
ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCTCTTA-GC
ZEA.MA_F GGAGGATAAC-AGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGA-GCCTCATTAA-AC
ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
* ******** * *** ***** ** * *** * * * *
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_F AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
* ******** ***
Mean pairwise ID: 81.40%
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_F NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCTAAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGTT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
***************************** ******************* * **** *
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCAA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCCTGGGCTCGT--TGTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCAA
ZEA.MA_F TCCTGACGG-ATTCTGGGCCTGGGCTTGT-ATGTGCCACTGGCCGGCCTGCCCGTTCCAA
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCCTGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCAA
* * *** *** *** * **** * * * *** ***** * ****
ZEA.MA_E GTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTGG
ZEA.MA_B GTTGGTAGTGTCTGACGG-GGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCGG
ZEA.MA_F GTTGGTTGTGGCTGGTGG-GGCTCGGGCGAAGGCCTGGG-CCTCTTTAGACCTGAAGCGG
ZEA.MA_C GTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTGG
****** *** * * ** *** *** * ** ** ** ***** ** **
ZEA.MA_E CAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_B CAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_F CAGGCATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCGCTTCCAACGGTGG
ZEA.MA_C CAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTGG
**** * ***** ****** ********************* *** ** ********
ZEA.MA_E GAGGATAACGGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA--GCCTCACTAAGCAG
ZEA.MA_B GAGGATAACAAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA--TCCTCTCTTAGCAA
ZEA.MA_F GAGGATAACAGGCCGCTGCATTGCAAGCCCAACTC-GGTCCAGA--GCCTCATTAAACAG
ZEA.MA_C AAGGATAACAGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGCAG
******** *** ***** ** * * * *** * * * **
ZEA.MA_E ACCACCATCTTT
ZEA.MA_B ACCACCATCTTT
ZEA.MA_F ACCACCATCTTT
ZEA.MA_C ACCACCATTTTT
******** ***
Mean pairwise ID: 81.47%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ***** **** ************ *** ** * * * ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
* ***** ** ******* * * * * **** * ****** ****** **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGA-
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** ***** **** *** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_E CCCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
*********************** ** * * ***** * ** ************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGTAATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCAC
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
* * *** * * * ** * ** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_B TTTT-
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_C ATTT-
***
Mean pairwise ID: 81.60%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
TRI.AE_B NCCGAGCTA-GTTGCGGGAGCTTGTCACCCATGTGGGGGCATTGAGGCGGTGTGGATGCT
******** ** *** ******** **** * ********* *** ** * * ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCC-CGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
TRI.AE_B TGGTG-CGG-TTTGTTGGCC-TGGGCTTGTGATGTAACCTT-GCTGGCCTGCCCGTTCCA
* * * ** *** * **** ***** * ** * * ** *** ***** * ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
TRI.AE_B AGTTGGTAGTGGGCTG-GGTGGCTGGGGCGAAAGCTTCG--CCTTCTCAGGCCTTAAGTG
*********** ** * ** *** ****** * ** *** *** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
TRI.AE_B GCAGGCACCACGTTAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACAACT-GCC-GCTTCCAACGGTG
***** * *** ******* *************** *** *** ** *********
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTCACTA-AGCA
ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTCTCTT-AGCA
ZEA.MA_E GGAGGATAAC-GGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTCACTA-AGCA
TRI.AE_B GAAGGATAAC-AGGCCGCTGCAGCATGGGCCCGCTCTGGGCCTCCTACCCCGCCATAGCA
* ******** ********* * *** * * ** * * ****
ZEA.MA_A AACCACCATCTTT
ZEA.MA_B AACCACCATCTTT
ZEA.MA_E GACCACCATCTTT
TRI.AE_B GACCACCATCTTT
************
Mean pairwise ID: 81.67%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_E GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAACCCAAGTGGGGATGTTAAGGTGGTGGAATATTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ***** **** ************* ****** * * * ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_E GGCTGTCCCAGATGGCTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGGCCTGCCCTATCCAAGTACAG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
* ***** ** ******* * * **** * ****** ****** **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_E AGTTGGATCATGTGGTCCAATTGAAAGAATGGGCTACTAGATTCCTAAAGTGGGGTGGAC
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_E C-CGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAAAAACTTCCGCTTTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
* ********* *********** *** * ** ***** ******************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGTAACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCAC
LYC.ES_E CGGACCGGTGCCTTCCAAGTTCCATTAATGCCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATATAAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCAC
* * *** * * * * * ** * ** ***** ** ** * * **** *****
LYC.ES_H CTTTT
LYC.ES_J CTTT-
LYC.ES_E ATTTT
LYC.ES_C ATTT-
***
Mean pairwise ID: 81.94%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGTGAATG
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-CGCGGATG
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAA-GGTGG-TGCGGATT
ORY.SA_A GCCGAGCTCAGTAGCGAGAGCCTGTAACCCAAGCGGGGGCACTAAAGGTGGCTGCGGATG
******** *********** ******** ********** *** ***** * * **
ZEA.MA_A CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGAC--ACTGGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_B CTTTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTT--GTGAC--TCTAGCCGGCTTGCCCAT
ZEA.MA_E CTTTGCGATGGCTTTCTGGGCC-CGGGCTCGCTATGTGCC--TTTGGCCGGCCTGCCCGT
ORY.SA_A TTTGGTGTGGA--TTCTGATCCTGGGCCCCATGTTGTTGTAATCTTGCTGGCTTGCCCGT
** * * * ***** ** ** * * ** * ** *** ***** *
ZEA.MA_A CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA
ZEA.MA_B CCCAAGTTG-GTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCT----CTGCAGA
ZEA.MA_E CCCAAGTTG-GTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCT----CTCCAGA
ORY.SA_A TCCAAGTTGCGTAGTGGGCCGGAGGGGCTTTGGCGAAGGCCTTTGCTTTGCTTCTCCGGC
******** ****** * * ** * *** * ** ** * * * ** * *
ZEA.MA_A CCTGGAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTC
ZEA.MA_B CCTACAGCGGCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTT
ZEA.MA_E CCTGAAGTGGCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTT
ORY.SA_A CCTAAAGTGGCAGGCACAGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCCGCTT
*** ** ****** * **** **************************** *** **
ZEA.MA_A CCAACGGTGGGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGAACCTC
ZEA.MA_B CCAACGGTGGGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGATCCTC
ZEA.MA_E CCAACGGTGGGAGGATAAC-GGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGAGCCTC
ORY.SA_A CCATCGGTGGAAGGATAAC-AGGCTGCTGCACCTTGGGCCCGCTTCTGGCCCAGAGTCCC
*** ****** ******** ** ******* * * *** * * * **** * *
ZEA.MA_A ACTA-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B TCTT-AGCAAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E ACTA-AGCAGACCACCATCTTT
ORY.SA_A TCTACAACAGACCACCATCTTT
** * ** ************
Mean pairwise ID: 82.46%
ARA.TH_A GTCGAGCTAAGTAACAATAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTAAGATGGTGGGACACTG
ARA.TH_E GTCGAGCTAAGTAACATGAGCTTGTAACCCATGTGGGGACATTTAGATGGTGGAACACTG
ARA.TH_D GTCGAGCTAAGTAACGAGAGCTTGTGACCCGAGTGGGGACAATAAGGTGGTGGAACAGTG
ARA.TH_G GTCGAGCTATGTAACGAGAGCTTGTAACCCAAGTGGGGACTATAAGATGGTGGAACACTG
********* ***** ******* **** ******** * ** ****** *** **
ARA.TH_A GTTCGGTTCCTCGGATCGGTTCTGATGTGGGCATGTTTCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_E GTTCGGGTCCACGGGCCGGTTCTGTTGTTGGCATGTTTCTGGGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_D GTTCAATTCCTCGGGTCGGACCTGATGCTGACATATATCTGAGCTGCCCAGTCCAAGCTG
ARA.TH_G GATCGG-CCCACGGGTCGGATTTGTTGTTGGCATAGGTCTGGACTGCCCAATCCAAGCTG
* ** ** *** *** ** ** * *** **** ******* *********
ARA.TH_A TGAGTAATTAGTGTTGAGTTGAGCGAAGGCTTGGCTCATGCAGGTTCTAGAGTCGGAGGG
ARA.TH_E TGAGTAAGACGTGT-GTGTCAAGCGAAGGCTTGGCTCAAACGGCTTCTAAAGTTGGAGGG
ARA.TH_D TGAGTAATCTGTGT-GGGTCAGGCGAAGGCTTGACTCAGGCGGATTCTAAAGTCGGAGGG
ARA.TH_G TGAGTGAACCGTAT-GAACCAAGCGAAGGTTTGATCCGTACGGTTGCTAAAGGTTGAGGG
***** * ** * * ******* *** * * * * *** ** *****
ARA.TH_A TAATGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_E TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCGCTTACAGCAGTGGACGGA
ARA.TH_D TAATGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGCGACTACTTCCCTCTTACAGCAGTGGATGGA
ARA.TH_G TATTGCGTTAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGACTACCTCCCGCTCTCAGCAGTGGACGGA
** ***** ******* ******************* **** ** ********** ***
ARA.TH_A TCACGGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_E TCACAGTTTAGCGTCGCTCAGAACCACTATGGCCTGCTGGTCCG-ATCTCATATGAACCA
ARA.TH_D TCATAGTTCGAAGTCTCTCAGATCCACTATGGCCCGCTGGTTCG-ATCTCTCCTGGACCA
ARA.TH_G CAACGGTTCGACGCCACACAAATCCACTATGGTCCGCTGGCTCGTAACCCGCTTGAACCA
* *** * * * ** * ********* * ***** ** * * * ** ****
ARA.TH_A CCATTTT
ARA.TH_E CCATTTT
ARA.TH_D CCACTTT
ARA.TH_G CCATTTT
*** ***
Mean pairwise ID: 82.49%
LYC.ES_H GTTGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_J GTCGAGCTTAGTAACGTGGGCTTGTAATCCAAGTGGAGACATCAAAGTGGTTGAATATTG
LYC.ES_B GTCGAGCTTAGTAATGTGGGCTTGTAACCCAAATGGGGGCATTAATGTGGTGGAATGTTG
LYC.ES_C GCCGAGCTCAGTAGCGTGGGCTTGTAACTCAAGTGAGGGCATCAGTGTGGTGGAATGTTG
* ***** **** ************ *** ** * *** * ***** **** ***
LYC.ES_H GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_J GGCTTTACCAGAAGGTTGGGCTTGGTGGGCTTAGTTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCACAG
LYC.ES_B GGCTGTACCAGATGGTTGGGCTTGGTGGGCTAATTTCTGACTTGCCCTATCCAAGCTTAG
LYC.ES_C AACATGCCCAGAAGGTAGGGCTTGTGTGACAATTCTCTGGCCTGCCCTGTCCAAGCAAAG
* ***** *** ******* * * **** * ****** ******* **
LYC.ES_H AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_J AGTTGGATCACGAGGCCCAAATGAAAATATGGGCTTCTTGATTCCTAAAGTGGGGCGGAC
LYC.ES_B AGTTGGATCATGTGGCCCAATTGAAGAAATGGACTACTTGATTCGTAAAGTGGGGCGGAA
LYC.ES_C AGTTGGGTCTTGTGGGCCAAGCGAAGGCTTGGGCTGCTGGGCTCCTAAAGTGGGGTGGAC
****** ** * ** **** *** *** ** ** * ** ********** ***
LYC.ES_H TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_J CGCATGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGTGAACAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
LYC.ES_B TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGATAAGTTTCCGCTCTAAGCGGTGGAAGGATAA
LYC.ES_C TGCGTGAGGCTGGTTTCACAGAGCAACGAATAGCTCCCGCTCTGTGCAGTGGAAGGATAA
** ********* *********** ** ** * ******* ** ************
LYC.ES_H TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
LYC.ES_J TGGGTCGGTGTCTTATCAAGTTCAGT-AACGCCTAATGGGTTGCTCCAAT-AAACAACCA
LYC.ES_B CGAGTCGGTGTTCTCT-GAGTCCAGT-AATGCCTGATGGGCTGCTCTAATTAAACCACCA
LYC.ES_C CGAGCCAGTGTCATAT-AAGTTCAACGAATGTCTGATGGGCTGTTCTAGTTAAACTACCA
* * * **** * * *** ** ** * ** ***** ** ** * * **** ****
LYC.ES_H CCTTTT
LYC.ES_J CCTTT-
LYC.ES_B CTTTT-
LYC.ES_C CATTT-
* ***
Mean pairwise ID: 83.03%
ZEA.MA_A NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGAATGCT
ZEA.MA_B NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGCGCGGATGCT
ZEA.MA_E NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGCGGATTCT
ZEA.MA_C NCCGAGCTCTGTAGCGAGAGCTTGTAACCCGAGCGGGGGCATTAAGGTGGTGTGGATGCT
************************************************** * * ** **
ZEA.MA_A TTGCGATGGCTTTCTGGGCCCTGGGCTCGTT--GTGACACTGGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_B TTGCGATGG-TTTCTGGGCC-TGGGCTCGTT--GTGACTCTAGCCGGCTTGCCCATCCCA
ZEA.MA_E TTGCGATGGCTTTCTGGGCC-CGGGCTCGCTATGTGCCTTTGGCCGGCCTGCCCGTCCCA
ZEA.MA_C TGGTACCG--TGTCTTTGCC-TGGGTTCATGGTGTGCCTTT-GTTGGCCTGCCCGTTCCA
* * * * *** *** *** ** *** * * * *** ***** * ***
ZEA.MA_A AGTTGGTAGTGTCTGGTGGGGGCTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTGGAGCG
ZEA.MA_B AGTTGGTAGTGTCTGACGGGG-CTCTAGCGAAAGCTTTGGGTCTCTGCAGACCTACAGCG
ZEA.MA_E AGTTGGTAGTGGCTGGCGGAGGCTTTAGCGGAAGCTTTGG-TCTCTCCAGACCTGAAGTG
ZEA.MA_C AGTTGGTAGTGGCCGTTGGAAGCTTGGGCGTAGGCCCTGGGCTTCCTTGGACCTATAGTG
*********** * * ** ** *** * ** *** ** ***** ** *
ZEA.MA_A GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGACTCCCAACGGTG
ZEA.MA_B GCAGGAATGGCGTAAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCCACTTCCAACGGTG
ZEA.MA_E GCAGGAATGGCGTGAGGCTGGCTTCACAGAGCAGCGATCACTCGCCGGCTTCCAACGGTG
ZEA.MA_C GCAGGAACGGCGTGAGGCTGTCTTCACAGAGCAGCGATCACT-GCCGGCTATTAACGGTG
******* ***** ****** ********************* *** ** *******
ZEA.MA_A GGAGGATAACGAAGCCGCTGCACTTTGAGCCTAACTCAGGCTCAGA-ACCTCACTAA-GC
ZEA.MA_B GGAGGATAAC-AAGCCGCTGCACTTTGAGCCCAACACAGACCCAGA-TCCTCTCTTA-GC
ZEA.MA_E GGAGGATAAC-GGGCCGCTGCACTTCGAGCCCAACTCAGGCCCAGA-GCCTCACTAA-GC
ZEA.MA_C GAAGGATAAC-AGGCCACTGCAGCATGGGCTCGCTTAAGGCCTAGACTTCATACTAAAGC
* ******** *** ***** * ** ** * *** * ** * **
ZEA.MA_A AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_B AAACCACCATCTTT
ZEA.MA_E AGACCACCATCTTT
ZEA.MA_C AGACCACCATTTTT
* ******** ***
Mean pairwise ID: 84.71%
FUG.RUB. GCCGGGTACGGTGGCGCGTGCCTGTAATCCAAGCTACT-GGGAGGCTGAGGCTGGCGGAT
XEN.LAE. GCCGGGCGCTGTGGCGTGTGCCTGTAATCCA-GCTACT-TGGAGGCTTGGGCTGTCGGAT
HOM.SA_A GCCGGGCGCGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCTGGAGGAT
GAL.GAL. GCCGGGCGCGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGCCCGCCGGAT
****** * ****** ******* *** ****** ******* * * * ****
FUG.RUB. CGCTTGAGCTCAGGAGTTCTGGGCTTCAGCGGACTATGTCGATCGGGTGTCCGTACTAAG
XEN.LAE. CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGCACTGAGCTATGTCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
HOM.SA_A CGCTTGAGTCCAGGAGTTCTGGGCTGTAGTGCGCTATGCCGATCGGGTGTCCGCACTAAG
GAL.GAL. CGCTTGAGCCCAGGAGTTCTGGGCTGCAGTGCGCTATGCCGAGCGGGCGTCCGCGCTAAG
******** *************** * * ***** *** **** ***** *****
FUG.RUB. TTCGGTATCGATATGGTGCTCCTGGGGGAGCCCGGGATCACCAGGTCGC-CTAAGGAGGG
XEN.LAE. TTCGGTATCAATATGGTGTTCCTGGGGGAGCCTCGGATCACCAGGTTGCTCTAAGGAGGG
HOM.SA_A TTCGGCATCAATATGGTGACCTCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
GAL.GAL. GCCGGCATCAATATGGTGAGCCCCGGGGAGCCGAGGCACACCAGGTTGC-CTAAGGAGGG
*** *** ******** * ****** ** ******** ** **********
FUG.RUB. GTGCCCCGGCCCAGGTCGGAAACGAAGCAGGTCAAAGCCCCCGTGCCGCTCAGTAGTGGG
XEN.LAE. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACCCCCGTGCCGATCAGTAGTGGG
HOM.SA_A GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCTGATCAGTAGTGGG
GAL.GAL. GTGAACCGGCCCAGGTCGGAAACGGAGCAGGTCAAAACTCCCGTGCCGGTCAGTAACGGG
*** ******************* *********** * ******* * ****** ***
FUG.RUB. ATCGCGCCCGTGAATAGACGCTGTAGTTCAACCTGAGTAACACAGCGGGACTCAGTCTTT
XEN.LAE. ATCGCGCCTGTGAATAGCCGGTGCAGAACAGCCTGAACAACACAGCGAGACACAGTTCT-
HOM.SA_A ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACATAGCGAGACCCCGTCTCT
GAL.GAL. ATCGCGCCTGTGAATAGCCACTGCAGCGTAGCCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCC
******** ******** * ** * * **** **** **** *** * **
FUG.RUB. -
XEN.LAE. -
HOM.SA_A T
GAL.GAL. -