############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 4 Columns: 115 Mean pairwise identity: 88.63 Mean single sequence MFE: -38.60 Consensus MFE: -33.28 Energy contribution: -32.90 Covariance contribution: -0.38 Mean z-score: -1.73 Structure conservation index: 0.86 SVM decision value: 0.71 SVM RNA-class probability: 0.829174 Prediction: RNA ###################################################################### >143739_SINFRUG00000138200_FUGU_9524_9635/1-115 CUGGUAGAAAAUUUCACUUCAAAAGCAGCUGAAUUAGUCCGAGAUUAAAGCCUUUGCCGCCUUCCAAUCAAAUGGGACCCUGAGGUGAUUGGAGGGUCAAGGGGAUGUGACG .............((((.((.............((((((...))))))..((((((..((((((((((((..(.((...)).)..)))))))))))))))))))).)))).. ( -33.30) >143739_ENSMUSG00000039081_MOUSE_9374_9487/1-115 CUGGCGAGGAAACUCACUUCAAAAGCAGCUGCACCGAGGGGGAGAUUAAAGCCUUUGCCGCCUUCCAAUCAAAUGGGAGCCCGAGGUGAUUGGAGGGUCAAGGGGAUGUGACGC ...(((.(....)((((.((....((....)).((..((.((((........)))).))((((((((((((..(((....)))...))))))))))))...)).)).))))))) ( -41.20) >143739_ENSRNOG00000014237_RAT_9547_9660/1-115 CUGGCGAGGAAACUCACUUCAAAAGCAGCUGCACGGAGGGGGAGAUUAAAGCCUUUGCCGCCUUCCAAUCAAAUGGGAGCCCGAGGUGAUUGGAGGGUCAAGGGGAUGUGACGC ...(((......(((.((((....((....))...))))..))).......((((((..((((((((((((..(((....)))...)))))))))))))))))).......))) ( -41.00) >143739_ENSDARG00000018492_ZEBRAFISH_9140_9253/1-115 ACUGGUAGAAAUUUUCACUUCAAAAGCAGCUGAAUUAGUCCGAGAUUAAAGCCCUUGCCGCCUUCCAAUCAAAUGGGACCCCGAGGUGAUUGGAGGGUCAAGGGGAUGUGACGU ..............((((.((.............((((((...))))))..((((((..((((((((((((..(((....)))...)))))))))))))))))))).))))... ( -38.90) >consensus _CUGGCAAAAAAACUCACUUCAAAAGCAGCUG_AAUGAGGCCGAGAUUAAAGCCUUUGCCGCCUUCCAAUCAAAUGGGACCCCGAGGUGAUUGGAGGGUCAAGGGGAUGUGACGC ..............((((.((........((......)).............((((((..((((((((((((..(((....)))...)))))))))))))))))))).))))... (-33.28 = -32.90 + -0.38)