############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 4 Columns: 300 Mean pairwise identity: 85.62 Mean single sequence MFE: -79.72 Consensus MFE: -56.51 Energy contribution: -59.45 Covariance contribution: 2.94 Mean z-score: -1.88 Structure conservation index: 0.71 SVM decision value: 0.52 SVM RNA-class probability: 0.768555 Prediction: RNA ###################################################################### >265692_ENSRNOG00000007683_RAT_9227_9692/1-473 AGAAGUUAACAAGUCCUCCAAACAGUCCCCGUCCCUUUGUUUAAUCUCCUUUACAAUAAAGCCAAGGGGAGAGAAUUAAGAAUCUUUGAAGUAGACCAAGGCUCAAAGGAAUCAGCCAAGUAGACUUAAAGUAGUCACUUAUUUCCCAAAACUGGUUUGUCGGUGAACAAUAAAAGGAAGUAAAAUUUAUGGAGAAAUUAUACAGUGGAUUUGUCACUUAAAAUAUCGUAACUGUCUCAGGGACAAUACCCCAUGCUGAGGAUUAAUGGUCCCGCCGGACCUUUGAUUCACCAGCGCC ..((((..(((((((((((...((((((((....((((((((((......))).)))))))....)))))(.(((.((((..(((((((.((........))))))))).............((((......)))).)))).))).)....)))((((......)))).......))).(((.(((((......))))).)))...)))))))).))))....................(((.......)))..((((.(((((((.(((((....))))).)))))))..))))... ( -74.10) >265692_ENSMUSG00000040478_MOUSE_2454_2920/1-473 AGAAGUUAACAAGUCCUCCAAACAGUCCCCGUCCCUUUGUUUAAUCUCCUUUACAAUAAAGCCAAGGGGAGAGAAUUAAGAAUCUUUGAAGUAGACCAAGGCUCAAAGGAAUCAGCCAAGUAGACUUAAAGUAGUCACUUAUUUCCCAAAACUGGUUUGUCGGUGAACAAUAAAAGGAAGUAAAAUUUAUGGAGAAAUUAUACAGUGGAUUUGUCACUUAAAAUAUCGUAACUGUCUCAGGGACAAUACCCCAUGCUGAGGAUUAAUGGUCCCGCCGGACCUUUGAUUCACCAGCGCC ..((((..(((((((((((...((((((((....((((((((((......))).)))))))....)))))(.(((.((((..(((((((.((........))))))))).............((((......)))).)))).))).)....)))((((......)))).......))).(((.(((((......))))).)))...)))))))).))))....................(((.......)))..((((.(((((((.(((((....))))).)))))))..))))... ( -74.10) >265692_ENSG00000112238_HUMAN_9283_9748/1-473 AGUAGUUAACAAGUCCUCCAAACAGUCUCCAUCUCUUUGUUUAAUCUCCUUUACAAUAAAGCCAAGGGGAGAGAAUUAAAAAUCUUUGAAGUAGAUCAAGGCUCAAAGGAAUCAGCCAAGUAGACUUAAAGUAGUCACUUAUUUCCCAAAACUGGUUUGUCGGGGAACAAUAAAAGGAAGUAAAAUUUAUGGAGAAAUUAUACAGUGGAUUUGUCACUUAAAAUAUCGUAACUGUCUGGAGGACAAUACCCCAUGCUGAGGAUUAAUGGUCCCGCCGGACCUUUGAUUCACCAGUGCC ............((((((((.(((((((((((..((((.(((.((.((((..((((....((((..((((((..........(((((((.((........)))))))))........((((.((((......)))))))).)))))).....))))))))..))))...)).))).))))........)))))))........(((((.....))))).............)))).))))))))..........((((.(((((((.(((((....))))).)))))))..))))... ( -82.60) >265692_SINFRUG00000152747_FUGU_5223_5688/1-473 AGAAGUUAACAAGUCCUCUAAACUUUCCUGCCUCCUUUGUUGCACUAAGGACACAAAAGGAGGAGGGAAAAUAAAAAGCUUUGAAGUGCAUUAAAGCCAAAGAAUGCUGGCCAAGUAGAUUUAAAGUAGCCACCGAUUUCCAAAACCUUGCUUGAAAGGGAGGAAUUGGAGAGGGCGAGGAUUUAUGGAUAAAUUAUACAGUGGAUUUGUCAGUUAAAAUAUCGGAACUGUCUGGAGGACAAAGCCACAUGCUGAGGAUUAAUGGUUGCUCCGGACCUUUGAUUCCGCACCCUC .....(((((((((((((.....((((((.((((((((..(((......).))..)))))))).)))))).......((((((((.(((......((((........))))...)))..)))))))).(((.....(((((((..((((.((....)).))))..))))))).)))))))))))...((((((((........)))))))).))))).....((((((.((((((((.....(((((....(....).....))))).))))))))....).)))))....... ( -88.10) >consensus AGAAGUUAACAAGUCCUCCAAACAGUCCCCGUCCCUUUGUUUAAUCUCCUUUACAAUAAAGCCAAGGGGAGAGAAUUAAGAAUCUUUGAAGUAGACCAAGGCUCAAAGGAAUCAG_CCAAGUAGACUUAAAGUAGUCACUUAUUUCCCAAAACUGGUUUGUCGGGGAACAAUAAAAGGAAGUAAA_AUUUAUGGAGAAAUUAUACAGUGGAUUUGUCACUUAAAAUAUCGUAACUGUCUCAAGGACAAUACCCCAUGCUGAGGAUUAAUGGUCCCGCCGGACCUUUGAUUCACCAGCGCC ............((((((((.(((((..(..(((.((((((...(((((...((((...((.....((((((...........((((((.((........))))))))..........((((.((((......)))))))).))))))....))...)))).)))))..)))))).)))........((((..((.(((((........))))).))...)))).....)..))))).))))))))..........((((.(((((((.(((((....))))).)))))))..))))... (-56.51 = -59.45 + 2.94)