############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 5 Columns: 299 Mean pairwise identity: 81.85 Mean single sequence MFE: -92.66 Consensus MFE: -50.44 Energy contribution: -54.68 Covariance contribution: 4.24 Mean z-score: -2.01 Structure conservation index: 0.54 SVM decision value: 0.07 SVM RNA-class probability: 0.569489 Prediction: RNA ###################################################################### >467045_ENSMUSG00000041730_MOUSE_457_903/1-449 UUUGAUUUUGUUCUCAGCAAGGGGUCCCUGAAUUUAUGUUCGCUUCUCCCUGCAAAUGAUAUGCAGUGGGACCCUUCGCAAUUACUUUUAAAAUGCAUCCGAGGCAGACACUCAGCGGAGAGAGACCGCCCUUCUCUCUGCCUGGGUGAAAAUUAAACUCUAAAGUACCGGGUUGAAAUUUUCAAGUCAGGGGCGCGGGAUUGGAUCAAAUCACAUAAACUGCAAAAAAAGCAAGUCUAAUGGCGCAUAAUUGGUUCUGUAAUAGCAUUACACCAGGAUAAUAGCCCGUUACGGCCCC ((((((((...((((.((.(((((((((.((((....))))........(((((.......))))).))))))))).))...............((..((..(((....(((((((((((((((.......))))))))).))))))(((((((.(((((.........)))))..)))))))..)))..))..))))))..))))))))..........(((.......))).(((((((((.((....(((((...(((((...)))))))))).......)))))))).)))... ( -91.90) >467045_ENSG00000165606_HUMAN_8456_8903/1-449 GUUUGAUUUUGUUCUCAGCAAGGGGUCCCUGAAUUUAUGUUCGCUUCUCGAUGCAAAUGAUAUGCGGUGGGACCCUUUGCAAUUACUUUUAAAAUGCAUCCGAGGCAGACACUCAACGGAGAGAGACCGCCCUUCUCUCUGCCUGGGUGAAAAUUAAACUCUAAAGUACCGGGCUGAAAUUUUCAAGUCAGGGGCGCGGGAUUGGAUCAAAUCACAUAAACUGCAAAAAAAGCAAGUCUAAUGGCGCAUAAUUGGUUCUGUAAUAGCAUUACACCAGGAUAAUAGCCCGUUACGGCCCC ((((((((((.......((((((((((((.((((....)))).........((((.......))))..))))))))))))................(((((.(((((((..(((....))).((((.......))))))))))))))))))))))))))......(((.((((((((.....))..(((..((((((..((((......)))).(((..(((((.......)).)))...))))))).......((..(((....)))..)).))..)))...)))))).)))...... ( -93.20) >467045_ENSRNOG00000020045_RAT_7890_8336/1-449 UUUGAUUUUGUUCUCAGCAAGGGGUCCCUGAAUUUAUGUUCGCUUCUCCCUGCAAAUGAUAUGCAGUGGGACCCUUCGCAAUUAUUUUUAAAAUGCAUCCGAGGCAGACACUCAGCGGAGAGAGACCGCCCUUCUCUCUGCCUGGGUGAAAAUUAAACUCUAAAGUACCGGGUUGAAAUUUUCAAGUCAGGGGCGCGGGAUUGGAUCAAAUCACAUAAACUGCAAAAAAAGCAAGUCUAAUGGCGCAUAAUUGGUUCUGUAAUAGCAUUACACCAGGAUAAUAGCCCGUUACGGCCCC ((((((((...((((.((.(((((((((.((((....))))........(((((.......))))).))))))))).))...............((..((..(((....(((((((((((((((.......))))))))).))))))(((((((.(((((.........)))))..)))))))..)))..))..))))))..))))))))..........(((.......))).(((((((((.((....(((((...(((((...)))))))))).......)))))))).)))... ( -91.90) >467045_SINFRUG00000142795_FUGU_773_1208/1-449 UUUGAUUUUGUUCACAGCAAGGGGUCCCGCGAUUUAUUUCGCUUCCUCAGAUAAAUGAUCUGCUGCGGGACCCUUUCAAUUAGUUUUAAAGCGCAUCAGGGACGUCAGAGCGCAGACGCCAUGCGUCUCUGAGGUGUAGGCAAAAUGAGGCUUCGAGAAGCAACUGAAAUUUAGAAGAGGAGUGCGGGAUUGGACUAAACCACAUAAAGUGCAGAAAAUCCCUUCUAAUGGCGCGUAAUUGGUUCUGUAAUAUCAUUACAGGCGGAUAAUGGCCAGUUACAGGGCC .((.(((((((..(((.(((((((((((((((......)).......(((((.....)))))..))))))))))))...................(((((((((.((..(((....)))..)))))))))))).)))..))))))).))((((....)))).........(((((((.((((..(...(((((......))).))...)..)......)))))))))).(((.((((((((((((((((((...)))))))).........))))))))).).))) ( -98.30) >467045_ENSDARG00000011919_ZEBRAFISH_2244_2674/1-449 UUUUGAUUUUGUUCACAGCAAGGGGUCCGAGGAUUUAUUUCCCACUCUCGCGUAAAUGAUAUGCAGCGGGACCCUUUCAAUUACUUUUAAAACGCACGCGGGACGCCGCGCGCAGACACCGCCGCUCCUCUGCUGCUGGAAAUGAGGCUCCGAGUAGCAGCUGAAAUUUUGAAGUGCGGGACGGUAUUGGAUGAAAUCACAUAAACUGCAAAAAAGCAAGUGUAAUGGUGCAUAAUUGGUUCUCUAAUAGCAUUACACAAGGAUAAUAGCCUGUUAUGGCCCC ...((((((..((((..(.((((((((((.(((......)))).(.((.(((((.....))))))).)))))))))))...............((.(((((....))))).))....((((((((((..(((((((((((........))).))))))))..))...........))))..))))..))))..)))))).......(((......))).((((((((.(.....(((((....)))))).))))))))..........(((......)))... ( -88.00) >consensus _UUUGAUUUUGUUCUCAGCAAGGGGUCCCUGAAUUUAUGUUCGCUUCUCCAUGCAAAUGAUAUGCAGUGGGACCCUUUGCAAUUACUUUUAAAAUGCAUCCGAGGCAGACACUCAGCGGAGAGAGACCGCCCUUCUCUCUGCCUGGGUGAAAAUUAAACUCUAAAGUACCGGGCUGAAAUUUUCAAGUCAGGGGCGCGGGAUUGGAUCAAAUCACAUAAACUGCAAAAAAAGCAAGUCUAAUGGCGCAUAAUUGGUUCUGUAAUAGCAUUACACCAGGAUAAUAGCCCGUUACGGCCCC .(((((((((.......((((((((((((.((((....)))).........((((.......))))..)))))))))))).............................((((((((((((((((.......))))))))).)))))))))))))))).......(((.(((((((.................((((..((((......)))).(((..(((((.......)).)))...))))))).......((((((((((...))))))...))))..))))))).)))...... (-50.44 = -54.68 + 4.24)