############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 4 Columns: 245 Mean pairwise identity: 69.20 Mean single sequence MFE: -81.26 Consensus MFE: -36.48 Energy contribution: -36.85 Covariance contribution: 0.37 Mean z-score: -1.98 Structure conservation index: 0.45 SVM decision value: 0.31 SVM RNA-class probability: 0.684389 Prediction: RNA ###################################################################### >473677_ENSG00000177669_HUMAN_4164_4404/1-245 CUUCUCUUUCAGGUACCUCUUUCUCCUGACUGGAGGAGGUGCCCUGGCCGUGGCUGCCAUGGGUUCCUACGCCGUGCUCGUCUUCACCCCUGCUGUCUGCGCUGUGGCUCUCCUCUGUUCCCUGGCUCCUCAGCAAGUCCACAGGUGGACCUUCUGCUUUCAGAUGAGCUGGCAGACCUUGUGUCACCUAGGUCUGCACUACACUGAGUAUUAUCUGCAUGAGCCUCCUUCUGUGAGGUAA .........((((((((((((((........)))))))))).))))((((..((.((.((((((....)).))))))..............((.....))))..))))...((((........(((((...((((.(((((....)))))....))))..(((((((....((((((((.(......).))))))))(((......))).)))))))...))))).........))))... ( -84.03) >473677_ENSRNOG00000013246_RAT_7392_7632/1-245 CCUUUCUUUCAGGUACCUCUUUCUCCUGGCUGGAGGAGGUGUCCUGGCUUUGGCCGCCAUGGGUCCCUACGCUCUGCUCAUUUUCAUCCCUGCUCUCUGUGCCGUGGCUAUGAUCUCCUCCCUCAGUCCACAGGAAGUCCAUGGGCUGACUUUCUUCUUUCAGAUGGGUUGGCAAACCCUGUGCCACCUGGGUCUUCACUACAAGGAGUACUACCUGUGUGAGCCUCCCCCUGUGAGGUAA (((.......)))((((((......((((..(((((((((.....(((....)))(((((((.....((((....((..............))....)))))))))))....))))))))).((((((((..((....)).))))))))..........))))..(((..(((..((((..........))))..((((.(((.((.......))))))))))))..)))....)))))). ( -79.04) >473677_ENSDARG00000022302_ZEBRAFISH_7796_8038/1-245 UCAUCUCUUGUAAGGUAUGUCUAUUUGGCGAUGGGAGGAUUCAUGCUGGCUAUUGCAACAAUGGGUCCAUAUAGCUCACUGCUGUUCCUGAGUGCUAUUAAACUGCUGUUACUGAUCCACUAUAUACAUCCAAUGCAUCUUCAUCGGUGGAUUCUGGGACUGCAGAUGUUUUGGCAAACCUGCUGGCAUUUGUACGUCCAGUACCAGAUAUACUGGCUUCAAGAGGCACCAGACUCAAGGUAU ...(((((((...(((((((((...(((((..((((((((((((....((....))....))))))))..(((((.....)))))))))...)))))..........(.((((((((((((........................))))))))...((((((((((((((..((((....)))))))))))))).)))))))).)))))))))).....))))))).(((........))).. ( -76.76) >473677_ENSMUSG00000042953_MOUSE_6061_6301/1-245 CCUUUCUUUCAGGUACCUCUUUCUCCUGGCUGGAGGAGGUGUCCUGGCUUUUGCUGCCAUGGGUCCCUACUCUCUGCUCAUCUUCAUCCCUGCGCUCUGCGCUGUGGCUCUGGUCUCCUUCCUCAGUCCACAGGAAGUCCAUAGGCUGACCUUCUUCUUUCAGAUGGGCUGGCAGACCCUGUGCCAUCUGGGUCUUCACUACACCGAAUACUACCUGGGUGAGCCUCCACCCGUGAGGUAA ........(((((((((((((((........)))))))))).)))))...(((((..(((((((...........((((((((........((((...))))(((((((..((.......))..)).)))))(((((.....(((....)))....))))))))))))).(((((((((.(......).))))))......((((.(........).)))).)))...))))))).))))) ( -85.20) >consensus _CCUCUCUU_UCAGGUACCUCUUUCUCCUGACUGGAGGAGGUGUCCUGGCUUUGGCUGCCAUGGGUCCCUACGCCCUGCUCAUCUUCAUCCCUGCUCUCUGCGCUGUGGCU_CUGAUCUCCUCCCUCAGUCCACAGCAAGUCCAUAGGCGGACCUUCUGCUUUCAGAUGGGCUGGCAAACCCUGUGCCACCUGGGUCUUCACUACAAGGAAUACUACCUGCAUGAGCCUCCACCCGUGAGGUAA_ ...........((((((((((((((........)))))))))).))))((....)).(((((((.......................................))))))).......................((((..((((......))))........(((((((((...((....)).....))))))))).....................)))).....(((((.......)))))... (-36.48 = -36.85 + 0.37)