############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 5 Columns: 280 Mean pairwise identity: 62.78 Mean single sequence MFE: -101.28 Consensus MFE: -39.96 Energy contribution: -39.92 Covariance contribution: -0.04 Mean z-score: -1.78 Structure conservation index: 0.39 SVM decision value: 0.02 SVM RNA-class probability: 0.542661 Prediction: RNA ###################################################################### >501416_ENSMUSG00000039825_MOUSE_133_713/1-680 CUUGUGUCGCUCUGGGACGGAGUGACCCCACACAGAGAAUACACGUUGGGAGUGGUGGUGGAGGUCAAGCUACUACCCUCGCUAACAAUGCUCUGGCUUCUGGACCUGGGGAGCCAGGGUUCCUCAAAGUCACUGCAGGGGCUCUGGGAAGGGGAGCUGCCGCCCUUGCCAGGGAGGCUUAGCUGCAGUGAAUGCUGGAGCGAGGCGAUCAGGCUCUCAUUGAGCAC .((((.(((((((((..(((((((....))).(((((.......((((((((.((((((((........))))))))))).)))))....)))))...))))..))((((((((....))))))))...(((((((((.((((((.......))))))(((.((((....)))).)))....))))))))).....))))))).))))....((((.....)))).. ( -106.20) >501416_ENSRNOG00000011386_RAT_133_729/1-680 GCUUGUGUCGCUCUGAGAUGGAGUGAGCCCGCACAGAGAAUACACGUUGGGAGUGGUGGUGGAGGUCAAGCUACUACCCUCGCUAACAAUGCUCUGGCUUCUGGACCUGGGGAGCCAGGGUUCCUCACAGUCACUGCAGGGGCUCUGGGAAGGGGAACCGCUGCCUUGGCCAGGGAGGCUUAGCUGCAGAGAAUGCUGGAGUGAGGCGAUCAGGCUCUCGUUGAGCAC (.((((.(((((((.((.((.((((((((.((.(((((.......((((((((.((((((((........))))))))))).)))))....)))))))((((((.((.(((.(((((((((((((..(((...))).))))))))))....((....))))).))).)))))))).)))))).)).)).......))))))))).)))).)..((((.....)))).. ( -99.50) >501416_ENSG00000135540_HUMAN_9403_9999/1-680 GCUUGUGUCACUCUGCGAUGGCGUGGCCCCGCACAGGGAGUAGACAUUGGGGGUGGUGGCGGAAGUCAUGCUGCUGCCAGCACUAACUGUGCUCUGGCUCCGGGAGCGGGGCAGCCAGGGCUCUUCCAAGUCACUGCAGGGGCUCUGGGAGGGCGAGCUGCCACUCUUGCCUGGGAGGCUCAGCUGCAGCGAGUGCUGGAGUGUGGCGAUCAGGCUCUCGUUGAGCAC ..........(((((((.((((...(((((((.(..(((((((((((.(..((((.((((((.((.....)).)))))).))))..).))).))).)))))..).))))))).)))).((((......))))..)))))))((((.(.((((((((..((((((....(((.....)))...(((.((((....)))).))))))))).))..)))))).).)))).. ( -112.10) >501416_SINFRUG00000136522_FUGU_3948_4614/1-680 GCUGGUCUCACUGUGAGUGGGGGUCACGUGGCACAGAGAGUAAACAUUAGAGACACCAGCGCAAGCAUUAGCUCCUAUCGAGACCACCGAGCUCCCUGCACUGAUGCUGCUCUGACUGCGAGGCCUUAAGAGCCAGGGGUCAUCAUAGUCGCUGCUGGGGCUGUGAGACGGCGAGGAAGGCGAUGCCCCUUUUCCUUUCCCUCCCCCCAGACCCAUCUGUAGACUCUGCUGCAGGCUGGCAAUGAGCGUCUCACUGAGCAUGGCUCCAUUUGCAUCGUUA (((((((((.(((((.(((.....)))....)))))...(....)....))))..)))))(((.((((((((((.....)))........((.....)).))))))))))...((.((((((((((((...((((((((((.((((((((.(....).))))))))((.((.(((((((((...)))....)))))).)).))......))))).(((((((......))))))))))))..)))).)))))...((((...)))).....))))).... ( -103.00) >501416_ENSDARG00000026402_ZEBRAFISH_375_1001/1-680 ACUUGUGUCACUAUGAGAUGGUGUGACGGGACAGAUGGAGUAUACAUGAGCCAUUCCUGUAGCUGAUACACCACUACUACUUGCACUGAUGCUGCUCUGGCUCCUUGGACGAAGCAUCCAGGGGUCCUCAUAGUCACUACAAGGGCUAUGAGAUGGUGACGUGGAGGAUCCUUUGCCUUUAAGCCCAUUCUGAAGUGACUGUUGGAGAGUGGCAAUCAAUGAUUCAUUGAGAAGAGAACCAUUCCUAAUAUUU .(((.(.(((..(((((.(((((((.(((.((((((((..((....))..))))..))))..))).)))))))..........((.((((((..(((((((.(((((((.......))))))))))((.(((((((((.((.(((((..(((..(....)(..(((....)))..))))..)))))....)).))))))))).))))))..)).)))).)).)))))))).).)))................. ( -85.60) >consensus GCUUGUGUCACUCUGAGAUGGAGUGACCCCGCACAGAGAGUACACAU_UGGGAGU__GG_________UGGCG__GAG__GUCAAGC__UACUACCCGCACUAACAAUGCUCUGGCUCCUGGACCUGGGGAGCCAGGGGUCCUCAAAGUCACUGCAGGGGCUCUGGGAAGGCGAGCUGCCG______CCUUUGCCUGG_________GAGGCUCAGCUGCAGAGAAUGCUGGAGUGUGGCGAUCAGGCUCUCAUU_____GAGCAC______________ ((((((((((((((.....)))))))...))).................((((((.............((((((((..........))))))))..(((..........((((((((((((....)))).))))))))(((.(((.((((........)))).)))))).))).....................................((((.(((.(((......))).))).))))......))))))........))))................ (-39.96 = -39.92 + -0.04)