############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 5 Columns: 300 Mean pairwise identity: 85.77 Mean single sequence MFE: -128.17 Consensus MFE: -96.34 Energy contribution: -99.42 Covariance contribution: 3.08 Mean z-score: -1.58 Structure conservation index: 0.75 SVM decision value: 0.05 SVM RNA-class probability: 0.560909 Prediction: RNA ###################################################################### >71921_ENSMUSG00000054925_MOUSE_342_706/1-367 CUCACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACUGCCUUGGUGCCCUCCGACACCGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCGGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCGGGACGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGGGAAGCCUCGCUCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGCACUUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACCGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUC ...((((((.(...((((((..((((.(((....(((((.((((((((((((((.(((..((((..((..((((((((((((((((.((((((((((..((....))..)).)))))))).)))))))))))....(((..((((((....)))))).)))(((.(((((......(((....))).))))).)))..)))))..))..))))..)))))).))))))))))).))))).....)))))))..))))))...).))))))((((........))))(((....)))... ( -140.00) >71921_ENSDARG00000022900_ZEBRAFISH_289_654/1-367 UUCACUUGGAGCUGGUGUAUUUGGUCACGGCCUUUGUUCCCUCAGACACUGCGUGUUUGGCCAGUUCUCCGGGCAGGAGCAGGCGCACGGCUGUCUGGAUCUCCCGGGAUGUGAUAGUGGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGCGACGCUUCUCCGGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUUACAAAUGAGUUCAUAAUGCCCAUCGCCUUUGAGGAGAUGCCAGUGUCCGGGUGGACUUGUUUUAGUACUUUGUACACGUAAAUGGCGUAACUCUCUUUCCUGGUCUUACGCCUUUUC ..............((((((..(((.((.......((((.(((.(((((((((((((((((((...((((.....))))(((((((.(.((((((.(.((((....)))).))))))).).)))))))......)).))))))))))..((.((((((((((((.((.....((..(((((....)))))..)).....)).))))))).....))))).))))))))).))).))))........)))))..))))))......(((((((..((.......))..)))))))..... ( -112.76) >71921_ENSRNOG00000021192_RAT_336_700/1-367 CUCACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACCGCCUUGGUGCCCUCGGACACAGCGUGCUUGGCCAACUCCCCGGGAAGCAACAGACGCACCGCCGUCUGGAUCUCCCGGGACGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGAGCCAGGCGCGACGCCUCGCCCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUUAUGCCCAUGGCCUUGGAAGAGAUGCCCGUGUCCGGAUGCACUUGCUUAAGCACCUUGUACACGUACACCGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUC ...((((((.(...((((((..((((...((...(((((..((((((((.((((.(((..((((...(((((((.....((((((......))))))....)))))))..((.((((((((((((..(((((...(.((.(((((...))))).))).))))))))))))).((..(((((....)))))..)).......)))).)).))))..)))))))..))))))))..))))).)).....))))..))))))...).))))))((((........))))(((....)))... ( -126.00) >71921_SINFRUG00000141037_FUGU_312_677/1-367 CUCUAUUUGGAGCUGGUGUACUUGGUCACGGCCUUGGUGCCCUCGGACACGGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGCAGCAGCAGCCUCACAGCGGUCUGGAUCUCCCUGGAGGUGAUGGUGGCGCGCUUGUUGUAGUGCGCCAGGCGCGACCCUUCACUGGCGAUGCGCUCGAAUAUGUCGUUCACAAACGAGUUCAUGAUGCUCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCCGUGUCUGGGUGCACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUAAAUGGCGUAGCUCUCCUUCCUGUUUUUACGUCGUUUC ((((....))))...((((((..((((..(((...(((((.((((((((((((((((((.(((((((((...)).)))....(((((.(((.((.........))))))))))..))))((((((((......)))))))))))))))..((((((..(((.(((.((((((((...(((((....)))))))))..)).)).))).))).))))))......))))))))))).))))).)))...).)))..))))))..(((((((((((..(........)...))))))))))). ( -126.40) >71921_ENSG00000184825_HUMAN_290_654/1-367 UUUACUUAGCGCUGGUGUACUUGGUGACGGCCUUGGUGCCCUCGGACACGGCGUGCUUGGCCAACUCCCCGGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCUGGAGGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGGGAAGCCUCACCCGCGAUGCGUUCGAAGAUGUCGUUGACGAAGGAGUUCAUGAUUCCCAUGGCCUUAGAGGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGGACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUAUACGGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUC .......(((((..((((((..((((..(((...(((.(((((.((((((((((((((((........)))))).(((((((((((.((((((((...(((((....))))))))))))).)))))))))))...))))).((((.....((((...(((((((((((....)))).))))).))...(((..((((.....))))..))).))))...)))).))))).))).))))).)))....))))..))))))......((.((((((........)))))).)).))))).. ( -135.70) >consensus _UUCACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACGGCCUUGGUGCCCUCGGACACGGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCGGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCGGGACGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGCGACGCCUCACCCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCCGUGUCCGGGUGCACUUGCUUCAGCACCUUGUACACGUAAACGGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUC ........(((((..((((((..((((..(((...(((((.((((((((((((((((((((((((((.....))).(((((((((((.(.((((((....(((....)))...)))))).).)))))))))))..)).))))))))))...((((....((.(((.((.....((..(((((....)))))..)).....)).))).))....))))......))))))))))).))))).)))....))))..)))))).........(((((..........)))))......))))) (-96.34 = -99.42 + 3.08)