############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 4 Columns: 300 Mean pairwise identity: 87.22 Mean single sequence MFE: -128.75 Consensus MFE: -101.45 Energy contribution: -105.33 Covariance contribution: 3.88 Mean z-score: -1.42 Structure conservation index: 0.79 SVM decision value: 0.02 SVM RNA-class probability: 0.543848 Prediction: RNA ###################################################################### >72858_ENSMUSG00000054925_MOUSE_343_709/1-367 UCACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACUGCCUUGGUGCCCUCCGACACCGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCGGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCGGGACGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGGGAAGCCUCGCUCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGCACUUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACCGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUCUU ......(((((..((((((..((((.(((....(((((.((((((((((((((.(((..((((..((..((((((((((((((((.((((((((((..((....))..)).)))))))).)))))))))))....(((..((((((....)))))).)))(((.(((((......(((....))).))))).)))..)))))..))..))))..)))))).))))))))))).))))).....)))))))..))))))(((......((((((........))))))...)))))))).. ( -141.00) >72858_ENSRNOG00000022148_RAT_303_668/1-367 UACUUGGCGCUUGUGUACUUGGUGACCGCCUUGGUGCCCUCCGACACAGCGUGCUUAGCCAGUUCUCCGGGCAGUAGGAGACGCACCGCCGUCUGGAUCUCCCGCGAUGUGAUUGUAGACCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGAGAAGCCUCGUUUGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCAUUGACAAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGACGAGAUGCCCGUGUCCGGAUGCACCUGCUUCAGCACCUUGUACACAUAGAUGGAGUAGCUCUCCUUGCGACUGCGCUUGCGCUUCUU .....(((((.(((((((..((((...((...(((((..((((((((.((((.(((..((((..((..((((.....(((.(((..(((.((((((.....))).))))))(((((((((.(((((.((.....)).)))))(((....))))))))))))))))))......(((((.(((......))).)))))))))..))..))))..)))))))..)))).)))).))))).)).....))))..))))))).....((((.....))))..(((....)))..))))).... ( -110.60) >72858_ENSG00000124518_HUMAN_318_683/1-367 UUACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACGGCCUUGGUGCCCUCCGACACCGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGAAGCAGCAGGCGCACGGCGGUCUGGAUCUCCCUGGAGGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAGUGCGCCAGGCGGGAAGCCUCGCUUGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUGACGAAGGAGUUCAUGAUUCCCAUGGCCUUAGAAGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGGACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACGGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUCUU ......(((((((((((((.(((((.(((....((...)).))).))))).))))...)))))))))...((((((.((((((((((.((((..((((((((....(((((.((((((((((((..(((((((.(((..((((.....)))))))))))))))))))))).((.(((((.(((......))).))))))))))).)))))....))))).)))(((((((((((...(((...)))))))))).))))......((((.....)))))))).).))))))))))))))). ( -137.60) >72858_SINFRUG00000141037_FUGU_314_680/1-367 CUAUUUGGAGCUGGUGUACUUGGUCACGGCCUUGGUGCCCUCGGACACGGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGCAGCAGCAGCCUCACAGCGGUCUGGAUCUCCCUGGAGGUGAUGGUGGCGCGCUUGUUGUAGUGCGCCAGGCGCGACCCUUCACUGGCGAUGCGCUCGAAUAUGUCGUUCACAAACGAGUUCAUGAUGCUCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCCGUGUCUGGGUGCACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUAAAUGGCGUAGCUCUCCUUCCUGUUUUUACGUCGUUUCUU ......(((((..((((((..((((..(((...(((((.((((((((((((((((((.(((((((((...)).)))....(((((.(((.((.........))))))))))..))))((((((((......)))))))))))))))..((((((..(((.(((.((((((((...(((((....)))))))))..)).)).))).))).))))))......))))))))))).))))).)))...).)))..))))))......(((((((..(........)...)))))))))))).. ( -125.80) >consensus UUACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACGGCCUUGGUGCCCUCCGACACCGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCGGGAGGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGGGAAGCCUCGCUUGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACAAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCCGUGUCGGGGUGCACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACGGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUCUU ......(((((..((((((..((((...((...(((((.((((((((((((((.(((..((((..((..((((.(((((((((((.((((.(((...(((((....)))))))).)))).)))))))))))...((((((((((((....))))))))....))))........(((((.(((......))).)))))))))..))..))))..)))))).))))))))))).))))).)).....))))..)))))).........((((((........))))))......))))).. (-101.45 = -105.33 + 3.88)