############################ RNAz 0.1 ############################## Sequences: 4 Columns: 300 Mean pairwise identity: 89.44 Mean single sequence MFE: -132.60 Consensus MFE: -109.04 Energy contribution: -112.85 Covariance contribution: 3.81 Mean z-score: -1.36 Structure conservation index: 0.82 SVM decision value: -0.05 SVM RNA-class probability: 0.510012 Prediction: RNA ###################################################################### >73068_ENSMUSG00000054856_MOUSE_328_704/1-378 ACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACAGCCUUGGUGCCCUCCGACACGGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCGGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCGGGAUGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGGGACGCCUCGCUCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGCACUUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACCGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUCUUG ....(((((..((((((..((((..(((...(((((.((((((((((((((.(((..((((..((..((((((((((((((((.((((((((.(.((((....)))).))))))))).)))))))))))....(((..((((((....)))))).)))(((.(((((......(((....))).))))).)))..)))))..))..))))..)))))))).))))))))).))))).)))....))))..))))))(((......((((((........))))))...))))))))... ( -141.90) >73068_ENSRNOG00000022146_RAT_323_699/1-378 ACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACCGCCUUGGUGCCUUCCGACACCGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGCAGCAGCAGGCGCACGGCGGUCUGGAUCUCCCGGGACGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGCGACGCCUCGCCCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAAGAGAUGCCGGUGUCCGGGUGCACUUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACGGAAUAGCUCUCCUUGCGGCUACGCUUGCGCUUCUUG ....(((((..((((((..((((...((...(((((..(((((((((((((((((((((((((.....))).(((((((((((.((((.(((((..((....))..)).))).)))).)))))))))))..)).)))))))))).(((.(((....))).)))(((.......(((....))).((((..((((.....))))..))))...)))....)))))).)))).))))).)).....))))..))))))(((...(((.......)))..(((....))).))))))))... ( -127.00) >73068_ENSG00000184825_HUMAN_292_668/1-378 UACUUAGCGCUGGUGUACUUGGUGACGGCCUUGGUGCCCUCGGACACGGCGUGCUUGGCCAACUCCCCGGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCUGGAGGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGGGAAGCCUCACCCGCGAUGCGUUCGAAGAUGUCGUUGACGAAGGAGUUCAUGAUUCCCAUGGCCUUAGAGGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGGACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUAUACGGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUCUUG .....(((((..((((((..((((..(((...(((.(((((.((((((((((((((((........)))))).(((((((((((.((((((((...(((((....))))))))))))).)))))))))))...))))).((((.....((((...(((((((((((....)))).))))).))...(((..((((.....))))..))).))))...)))).))))).))).))))).)))....))))..))))))......((.((((((........)))))).)).)))))..... ( -135.70) >73068_SINFRUG00000141037_FUGU_315_692/1-378 UAUUUGGAGCUGGUGUACUUGGUCACGGCCUUGGUGCCCUCGGACACGGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGCAGCAGCAGCCUCACAGCGGUCUGGAUCUCCCUGGAGGUGAUGGUGGCGCGCUUGUUGUAGUGCGCCAGGCGCGACCCUUCACUGGCGAUGCGCUCGAAUAUGUCGUUCACAAACGAGUUCAUGAUGCUCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCCGUGUCUGGGUGCACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUAAAUGGCGUAGCUCUCCUUCCUGUUUUUACGUCGUUUCUUA .....(((((..((((((..((((..(((...(((((.((((((((((((((((((.(((((((((...)).)))....(((((.(((.((.........))))))))))..))))((((((((......)))))))))))))))..((((((..(((.(((.((((((((...(((((....)))))))))..)).)).))).))).))))))......))))))))))).))))).)))...).)))..))))))......(((((((..(........)...))))))))))))... ( -125.80) >consensus _ACUUGGAGCUGGUGUACUUGGUGACGGCCUUGGUGCCCUCCGACACGGCGUGCUUGGCCAGCUCCCCCGGCAGCAGCAGGCGCACGGCCGUCUGGAUCUCCCGGGAGGUGAUGGUCGAGCGCUUGUUGUAAUGCGCCAGGCGCGACGCCUCACCCGCGAUGCGCUCGAAGAUGUCGUUCACGAACGAGUUCAUGAUGCCCAUGGCCUUGGAGGAGAUGCCGGUGUCGGGGUGCACCUGCUUCAGCACCUUGUACACGUACACGGAGUAGCUCUCCUUGCGGCUGCGCUUGCGCUUCUUG .....(((((..((((((..((((..(((...(((((.((((((((((((((((((((((((((.....))).(((((((((((.((((((((...(((((....))))))))))))).)))))))))))..)).)))))))......((((....(((((............))))).......((((..((((.....))))..))))))))..))))).))))))))).))))).)))....))))..)))))).........((((((........))))))......)))))... (-109.04 = -112.85 + 3.81)