########################### RNAz 0.1.1 ############################# Sequences: 6 Slice: 1 to 84 Columns: 84 Strand: ô{ÃåHöž?T Mean pairwise identity: 70.02 Mean single sequence MFE: -23.73 Consensus MFE: -17.93 Energy contribution: -16.10 Covariance contribution: -1.83 Mean z-score: -4.04 Structure conservation index: 0.76 SVM decision value: 1.65 SVM RNA-class probability: 0.969764 Prediction: RNA ###################################################################### >hg17.chr2/179216767-179216697 AUCAGAAAUGUAAGGCAUUGGUGAUGUUUGCAUUUACCCUCCUGUAAGCAACACUUUAACGUCUUACAUU ......((((((((((...((((.((((((((..........)))))))).)))).....)))))))))) ( -21.90) >mm5.chr2/76598706-76598636 AUCAGAAAUGUAAGGCAUUGGUGAUGUUUGCAUCUACCCUCCUGUAAGCAACACUUUAACGUCUUACGUU ......((((((((((...((((.((((((((..........)))))))).)))).....)))))))))) ( -21.50) >rn3.chr3/59301372-59301302 AUCAGAGACAUAAGGCAUUGGUGAUGUUUGCAUCUACCCUCCUGUAAGCAGCACUUUAACGUCUUAUGUU ......((((((((((...((((.((((((((..........)))))))).)))).....)))))))))) ( -22.30) >galGal2.chr7/21153603-21153673 AUCAGAAAUGUAAGGCACUGGUGAUAUUUACAAUUACCCUCCUGUAAGUAUUACUUUAAUGUUUUACAUU ......(((((((((((..(((((((((((((..........)))))))))))))....))))))))))) ( -21.80) >danRer1.chrUn/522-438 ACAAGAAUUUAUGACUUGAAUGUAAGACCUUGAGUGCUGUUUGCAUUUUACCCUCAUGUAAGCAGGACAACUGGGUCUUGUGUU .((((.........))))((..((((((((...((.((((((((((.........)))))))))).))....))))))))..)) ( -27.40) >fr1.chrUn/124298735-124298805 ACUGUGAACUUAAGACCCUGAGUGCUGCUUCCAUCACCCUCAUGGAAGCAGCAGGAACCGGUCCUGAGCU ........((((.((((.....((((((((((((.......))))))))))))......)))).)))).. ( -27.50) >consensus AUCAGAA____________AUGUAAGGCAUUG_GUGAUGUUUGCAUCU_ACCCUCCUGUAAGCAGCACUUUAACGUCUUACGUU ...................(((((((((.....(((.((((((((...........)))))))).)))......))))))))). (-17.93 = -16.10 + -1.83)