RNAlib-2.1.9h
intl11dH_D.h
1 PUBLIC int int11_dH_D[NBPAIRS+1][NBPAIRS+1][5][5] =
2 {{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NP,E */
3  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NP,A */
4  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NP,C */
5  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NP,G */
6  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NP,T */
7  }
8  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,CG,E */
9  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,CG,A */
10  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,CG,C */
11  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,CG,G */
12  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,CG,T */
13  }
14  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GC,E */
15  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GC,A */
16  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GC,C */
17  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GC,G */
18  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GC,T */
19  }
20  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GT,E */
21  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GT,A */
22  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GT,C */
23  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GT,G */
24  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,GT,T */
25  }
26  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TG,E */
27  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TG,A */
28  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TG,C */
29  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TG,G */
30  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TG,T */
31  }
32  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,AT,E */
33  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,AT,A */
34  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,AT,C */
35  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,AT,G */
36  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,AT,T */
37  }
38  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TA,E */
39  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TA,A */
40  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TA,C */
41  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TA,G */
42  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,TA,T */
43  }
44  ,{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NN,E */
45  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NN,A */
46  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NN,C */
47  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NN,G */
48  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NP,NN,T */
49  }
50  }
51 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* CG,NP,E */
52  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* CG,NP,A */
53  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* CG,NP,C */
54  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* CG,NP,G */
55  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* CG,NP,T */
56  }
57  ,{{ 610, 610, 510, 610, 510} /* CG,CG,E */
58  ,{ 610, 400, 510, 610, 510} /* CG,CG,A */
59  ,{ 510, 510, 410, 510, 160} /* CG,CG,C */
60  ,{ 610, 610, 510, 10, 510} /* CG,CG,G */
61  ,{ 510, 510, 160, 510, -270} /* CG,CG,T */
62  }
63  ,{{ 930, 930, 750, 930, 460} /* CG,GC,E */
64  ,{ 460, -60, 460, 130, 460} /* CG,GC,A */
65  ,{ 930, 930, 750, 930, 190} /* CG,GC,C */
66  ,{ 460, 390, 460, -90, 460} /* CG,GC,G */
67  ,{ 930, 930, 50, 930, 210} /* CG,GC,T */
68  }
69  ,{{ 930, 930, 750, 930, 460} /* CG,GT,E */
70  ,{ 460, -60, 460, 130, 460} /* CG,GT,A */
71  ,{ 930, 930, 750, 930, 190} /* CG,GT,C */
72  ,{ 460, 390, 460, -90, 460} /* CG,GT,G */
73  ,{ 930, 930, 50, 930, 210} /* CG,GT,T */
74  }
75  ,{{ 610, 610, 510, 610, 510} /* CG,TG,E */
76  ,{ 610, 400, 510, 610, 510} /* CG,TG,A */
77  ,{ 510, 510, 410, 510, 160} /* CG,TG,C */
78  ,{ 610, 610, 510, 10, 510} /* CG,TG,G */
79  ,{ 510, 510, 160, 510, -270} /* CG,TG,T */
80  }
81  ,{{ 530, 500, 530, 390, 530} /* CG,AT,E */
82  ,{ 530, 500, 530, -220, 530} /* CG,AT,A */
83  ,{ 390, 390, 260, 390, -1230} /* CG,AT,C */
84  ,{ 530, -630, 530, -990, 530} /* CG,AT,G */
85  ,{ 390, 390, -490, 390, -750} /* CG,AT,T */
86  }
87  ,{{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* CG,TA,E */
88  ,{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* CG,TA,A */
89  ,{ 960, 960, 590, 960, 10} /* CG,TA,C */
90  ,{ 1320, 690, 1320, -110, 1320} /* CG,TA,G */
91  ,{ 960, 960, 300, 960, 70} /* CG,TA,T */
92  }
93  ,{{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* CG,NN,E */
94  ,{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* CG,NN,A */
95  ,{ 960, 960, 750, 960, 190} /* CG,NN,C */
96  ,{ 1320, 690, 1320, 10, 1320} /* CG,NN,G */
97  ,{ 960, 960, 300, 960, 210} /* CG,NN,T */
98  }
99  }
100 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GC,NP,E */
101  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GC,NP,A */
102  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GC,NP,C */
103  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GC,NP,G */
104  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GC,NP,T */
105  }
106  ,{{ 930, 460, 930, 460, 930} /* GC,CG,E */
107  ,{ 930, -60, 930, 390, 930} /* GC,CG,A */
108  ,{ 750, 460, 750, 460, 50} /* GC,CG,C */
109  ,{ 930, 130, 930, -90, 930} /* GC,CG,G */
110  ,{ 460, 460, 190, 460, 210} /* GC,CG,T */
111  }
112  ,{{ 600, 390, 600, 390, 390} /* GC,GC,E */
113  ,{ 390, 260, 390, 240, 390} /* GC,GC,A */
114  ,{ 600, 390, 600, 390, -60} /* GC,GC,C */
115  ,{ 390, 240, 390, -280, 390} /* GC,GC,G */
116  ,{ 390, 390, -60, 390, 30} /* GC,GC,T */
117  }
118  ,{{ 600, 390, 600, 390, 390} /* GC,GT,E */
119  ,{ 390, 260, 390, 240, 390} /* GC,GT,A */
120  ,{ 600, 390, 600, 390, -60} /* GC,GT,C */
121  ,{ 390, 240, 390, -280, 390} /* GC,GT,G */
122  ,{ 390, 390, -60, 390, 30} /* GC,GT,T */
123  }
124  ,{{ 930, 460, 930, 460, 930} /* GC,TG,E */
125  ,{ 930, -60, 930, 390, 930} /* GC,TG,A */
126  ,{ 750, 460, 750, 460, 50} /* GC,TG,C */
127  ,{ 930, 130, 930, -90, 930} /* GC,TG,G */
128  ,{ 460, 460, 190, 460, 210} /* GC,TG,T */
129  }
130  ,{{ 1280, 1090, 1280, 1090, 1160} /* GC,AT,E */
131  ,{ 1000, 1000, 410, 450, 410} /* GC,AT,A */
132  ,{ 1280, 1090, 1280, 1090, 1160} /* GC,AT,C */
133  ,{ 890, 890, 410, -500, 410} /* GC,AT,G */
134  ,{ 1090, 1090, 130, 1090, 50} /* GC,AT,T */
135  }
136  ,{{ 1320, 690, 1320, 1130, 1320} /* GC,TA,E */
137  ,{ 1320, -140, 1320, 1130, 1320} /* GC,TA,A */
138  ,{ 1290, 420, 1290, 420, -40} /* GC,TA,C */
139  ,{ 1320, 690, 1320, 340, 1320} /* GC,TA,G */
140  ,{ 420, 420, 370, 420, -1000} /* GC,TA,T */
141  }
142  ,{{ 1320, 1090, 1320, 1130, 1320} /* GC,NN,E */
143  ,{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* GC,NN,A */
144  ,{ 1290, 1090, 1290, 1090, 1160} /* GC,NN,C */
145  ,{ 1320, 890, 1320, 340, 1320} /* GC,NN,G */
146  ,{ 1090, 1090, 370, 1090, 210} /* GC,NN,T */
147  }
148  }
149 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GT,NP,E */
150  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GT,NP,A */
151  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GT,NP,C */
152  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GT,NP,G */
153  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* GT,NP,T */
154  }
155  ,{{ 930, 460, 930, 460, 930} /* GT,CG,E */
156  ,{ 930, -60, 930, 390, 930} /* GT,CG,A */
157  ,{ 750, 460, 750, 460, 50} /* GT,CG,C */
158  ,{ 930, 130, 930, -90, 930} /* GT,CG,G */
159  ,{ 460, 460, 190, 460, 210} /* GT,CG,T */
160  }
161  ,{{ 600, 390, 600, 390, 390} /* GT,GC,E */
162  ,{ 390, 260, 390, 240, 390} /* GT,GC,A */
163  ,{ 600, 390, 600, 390, -60} /* GT,GC,C */
164  ,{ 390, 240, 390, -280, 390} /* GT,GC,G */
165  ,{ 390, 390, -60, 390, 30} /* GT,GC,T */
166  }
167  ,{{ 600, 390, 600, 390, 390} /* GT,GT,E */
168  ,{ 390, 260, 390, 240, 390} /* GT,GT,A */
169  ,{ 600, 390, 600, 390, -60} /* GT,GT,C */
170  ,{ 390, 240, 390, -280, 390} /* GT,GT,G */
171  ,{ 390, 390, -60, 390, 30} /* GT,GT,T */
172  }
173  ,{{ 930, 460, 930, 460, 930} /* GT,TG,E */
174  ,{ 930, -60, 930, 390, 930} /* GT,TG,A */
175  ,{ 750, 460, 750, 460, 50} /* GT,TG,C */
176  ,{ 930, 130, 930, -90, 930} /* GT,TG,G */
177  ,{ 460, 460, 190, 460, 210} /* GT,TG,T */
178  }
179  ,{{ 1280, 1090, 1280, 1090, 1160} /* GT,AT,E */
180  ,{ 1000, 1000, 410, 450, 410} /* GT,AT,A */
181  ,{ 1280, 1090, 1280, 1090, 1160} /* GT,AT,C */
182  ,{ 890, 890, 410, -500, 410} /* GT,AT,G */
183  ,{ 1090, 1090, 130, 1090, 50} /* GT,AT,T */
184  }
185  ,{{ 1320, 690, 1320, 1130, 1320} /* GT,TA,E */
186  ,{ 1320, -140, 1320, 1130, 1320} /* GT,TA,A */
187  ,{ 1290, 420, 1290, 420, -40} /* GT,TA,C */
188  ,{ 1320, 690, 1320, 340, 1320} /* GT,TA,G */
189  ,{ 420, 420, 370, 420, -1000} /* GT,TA,T */
190  }
191  ,{{ 1320, 1090, 1320, 1130, 1320} /* GT,NN,E */
192  ,{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* GT,NN,A */
193  ,{ 1290, 1090, 1290, 1090, 1160} /* GT,NN,C */
194  ,{ 1320, 890, 1320, 340, 1320} /* GT,NN,G */
195  ,{ 1090, 1090, 370, 1090, 210} /* GT,NN,T */
196  }
197  }
198 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TG,NP,E */
199  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TG,NP,A */
200  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TG,NP,C */
201  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TG,NP,G */
202  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TG,NP,T */
203  }
204  ,{{ 610, 610, 510, 610, 510} /* TG,CG,E */
205  ,{ 610, 400, 510, 610, 510} /* TG,CG,A */
206  ,{ 510, 510, 410, 510, 160} /* TG,CG,C */
207  ,{ 610, 610, 510, 10, 510} /* TG,CG,G */
208  ,{ 510, 510, 160, 510, -270} /* TG,CG,T */
209  }
210  ,{{ 930, 930, 750, 930, 460} /* TG,GC,E */
211  ,{ 460, -60, 460, 130, 460} /* TG,GC,A */
212  ,{ 930, 930, 750, 930, 190} /* TG,GC,C */
213  ,{ 460, 390, 460, -90, 460} /* TG,GC,G */
214  ,{ 930, 930, 50, 930, 210} /* TG,GC,T */
215  }
216  ,{{ 930, 930, 750, 930, 460} /* TG,GT,E */
217  ,{ 460, -60, 460, 130, 460} /* TG,GT,A */
218  ,{ 930, 930, 750, 930, 190} /* TG,GT,C */
219  ,{ 460, 390, 460, -90, 460} /* TG,GT,G */
220  ,{ 930, 930, 50, 930, 210} /* TG,GT,T */
221  }
222  ,{{ 610, 610, 510, 610, 510} /* TG,TG,E */
223  ,{ 610, 400, 510, 610, 510} /* TG,TG,A */
224  ,{ 510, 510, 410, 510, 160} /* TG,TG,C */
225  ,{ 610, 610, 510, 10, 510} /* TG,TG,G */
226  ,{ 510, 510, 160, 510, -270} /* TG,TG,T */
227  }
228  ,{{ 530, 500, 530, 390, 530} /* TG,AT,E */
229  ,{ 530, 500, 530, -220, 530} /* TG,AT,A */
230  ,{ 390, 390, 260, 390, -1230} /* TG,AT,C */
231  ,{ 530, -630, 530, -990, 530} /* TG,AT,G */
232  ,{ 390, 390, -490, 390, -750} /* TG,AT,T */
233  }
234  ,{{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* TG,TA,E */
235  ,{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* TG,TA,A */
236  ,{ 960, 960, 590, 960, 10} /* TG,TA,C */
237  ,{ 1320, 690, 1320, -110, 1320} /* TG,TA,G */
238  ,{ 960, 960, 300, 960, 70} /* TG,TA,T */
239  }
240  ,{{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* TG,NN,E */
241  ,{ 1320, 1000, 1320, 1130, 1320} /* TG,NN,A */
242  ,{ 960, 960, 750, 960, 190} /* TG,NN,C */
243  ,{ 1320, 690, 1320, 10, 1320} /* TG,NN,G */
244  ,{ 960, 960, 300, 960, 210} /* TG,NN,T */
245  }
246  }
247 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* AT,NP,E */
248  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* AT,NP,A */
249  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* AT,NP,C */
250  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* AT,NP,G */
251  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* AT,NP,T */
252  }
253  ,{{ 530, 530, 390, 530, 390} /* AT,CG,E */
254  ,{ 500, 500, 390, -630, 390} /* AT,CG,A */
255  ,{ 530, 530, 260, 530, -490} /* AT,CG,C */
256  ,{ 390, -220, 390, -990, 390} /* AT,CG,G */
257  ,{ 530, 530, -1230, 530, -750} /* AT,CG,T */
258  }
259  ,{{ 1280, 1000, 1280, 890, 1090} /* AT,GC,E */
260  ,{ 1090, 1000, 1090, 890, 1090} /* AT,GC,A */
261  ,{ 1280, 410, 1280, 410, 130} /* AT,GC,C */
262  ,{ 1090, 450, 1090, -500, 1090} /* AT,GC,G */
263  ,{ 1160, 410, 1160, 410, 50} /* AT,GC,T */
264  }
265  ,{{ 1280, 1000, 1280, 890, 1090} /* AT,GT,E */
266  ,{ 1090, 1000, 1090, 890, 1090} /* AT,GT,A */
267  ,{ 1280, 410, 1280, 410, 130} /* AT,GT,C */
268  ,{ 1090, 450, 1090, -500, 1090} /* AT,GT,G */
269  ,{ 1160, 410, 1160, 410, 50} /* AT,GT,T */
270  }
271  ,{{ 530, 530, 390, 530, 390} /* AT,TG,E */
272  ,{ 500, 500, 390, -630, 390} /* AT,TG,A */
273  ,{ 530, 530, 260, 530, -490} /* AT,TG,C */
274  ,{ 390, -220, 390, -990, 390} /* AT,TG,G */
275  ,{ 530, 530, -1230, 530, -750} /* AT,TG,T */
276  }
277  ,{{ 980, 980, 980, 980, 980} /* AT,AT,E */
278  ,{ 980, 490, 980, 710, 980} /* AT,AT,A */
279  ,{ 980, 980, 750, 980, 430} /* AT,AT,C */
280  ,{ 980, 710, 980, 410, 980} /* AT,AT,G */
281  ,{ 980, 980, 430, 980, 570} /* AT,AT,T */
282  }
283  ,{{ 1470, 1290, 1470, 1070, 150} /* AT,TA,E */
284  ,{ 1290, 1290, 150, 1070, 150} /* AT,TA,A */
285  ,{ 1470, 1040, 1470, 1040, -160} /* AT,TA,C */
286  ,{ 180, 180, 150, 160, 150} /* AT,TA,G */
287  ,{ 1040, 1040, 350, 1040, -480} /* AT,TA,T */
288  }
289  ,{{ 1470, 1290, 1470, 1070, 1090} /* AT,NN,E */
290  ,{ 1290, 1290, 1090, 1070, 1090} /* AT,NN,A */
291  ,{ 1470, 1040, 1470, 1040, 430} /* AT,NN,C */
292  ,{ 1090, 710, 1090, 410, 1090} /* AT,NN,G */
293  ,{ 1160, 1040, 1160, 1040, 570} /* AT,NN,T */
294  }
295  }
296 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TA,NP,E */
297  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TA,NP,A */
298  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TA,NP,C */
299  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TA,NP,G */
300  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* TA,NP,T */
301  }
302  ,{{ 1320, 1320, 960, 1320, 960} /* TA,CG,E */
303  ,{ 1000, 1000, 960, 690, 960} /* TA,CG,A */
304  ,{ 1320, 1320, 590, 1320, 300} /* TA,CG,C */
305  ,{ 1130, 1130, 960, -110, 960} /* TA,CG,G */
306  ,{ 1320, 1320, 10, 1320, 70} /* TA,CG,T */
307  }
308  ,{{ 1320, 1320, 1290, 1320, 420} /* TA,GC,E */
309  ,{ 690, -140, 420, 690, 420} /* TA,GC,A */
310  ,{ 1320, 1320, 1290, 1320, 370} /* TA,GC,C */
311  ,{ 1130, 1130, 420, 340, 420} /* TA,GC,G */
312  ,{ 1320, 1320, -40, 1320, -1000} /* TA,GC,T */
313  }
314  ,{{ 1320, 1320, 1290, 1320, 420} /* TA,GT,E */
315  ,{ 690, -140, 420, 690, 420} /* TA,GT,A */
316  ,{ 1320, 1320, 1290, 1320, 370} /* TA,GT,C */
317  ,{ 1130, 1130, 420, 340, 420} /* TA,GT,G */
318  ,{ 1320, 1320, -40, 1320, -1000} /* TA,GT,T */
319  }
320  ,{{ 1320, 1320, 960, 1320, 960} /* TA,TG,E */
321  ,{ 1000, 1000, 960, 690, 960} /* TA,TG,A */
322  ,{ 1320, 1320, 590, 1320, 300} /* TA,TG,C */
323  ,{ 1130, 1130, 960, -110, 960} /* TA,TG,G */
324  ,{ 1320, 1320, 10, 1320, 70} /* TA,TG,T */
325  }
326  ,{{ 1470, 1290, 1470, 180, 1040} /* TA,AT,E */
327  ,{ 1290, 1290, 1040, 180, 1040} /* TA,AT,A */
328  ,{ 1470, 150, 1470, 150, 350} /* TA,AT,C */
329  ,{ 1070, 1070, 1040, 160, 1040} /* TA,AT,G */
330  ,{ 150, 150, -160, 150, -480} /* TA,AT,T */
331  }
332  ,{{ 1740, 1430, 1740, 1430, 1430} /* TA,TA,E */
333  ,{ 1430, 1210, 1430, 1190, 1430} /* TA,TA,A */
334  ,{ 1740, 1430, 1740, 1430, 250} /* TA,TA,C */
335  ,{ 1430, 1190, 1430, 840, 1430} /* TA,TA,G */
336  ,{ 1430, 1430, 250, 1430, 620} /* TA,TA,T */
337  }
338  ,{{ 1740, 1430, 1740, 1430, 1430} /* TA,NN,E */
339  ,{ 1430, 1290, 1430, 1190, 1430} /* TA,NN,A */
340  ,{ 1740, 1430, 1740, 1430, 370} /* TA,NN,C */
341  ,{ 1430, 1190, 1430, 840, 1430} /* TA,NN,G */
342  ,{ 1430, 1430, 250, 1430, 620} /* TA,NN,T */
343  }
344  }
345 ,{{{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NN,NP,E */
346  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NN,NP,A */
347  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NN,NP,C */
348  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NN,NP,G */
349  ,{ INF, INF, INF, INF, INF} /* NN,NP,T */
350  }
351  ,{{ 1320, 1320, 960, 1320, 960} /* NN,CG,E */
352  ,{ 1000, 1000, 960, 690, 960} /* NN,CG,A */
353  ,{ 1320, 1320, 750, 1320, 300} /* NN,CG,C */
354  ,{ 1130, 1130, 960, 10, 960} /* NN,CG,G */
355  ,{ 1320, 1320, 190, 1320, 210} /* NN,CG,T */
356  }
357  ,{{ 1320, 1320, 1290, 1320, 1090} /* NN,GC,E */
358  ,{ 1090, 1000, 1090, 890, 1090} /* NN,GC,A */
359  ,{ 1320, 1320, 1290, 1320, 370} /* NN,GC,C */
360  ,{ 1130, 1130, 1090, 340, 1090} /* NN,GC,G */
361  ,{ 1320, 1320, 1160, 1320, 210} /* NN,GC,T */
362  }
363  ,{{ 1320, 1320, 1290, 1320, 1090} /* NN,GT,E */
364  ,{ 1090, 1000, 1090, 890, 1090} /* NN,GT,A */
365  ,{ 1320, 1320, 1290, 1320, 370} /* NN,GT,C */
366  ,{ 1130, 1130, 1090, 340, 1090} /* NN,GT,G */
367  ,{ 1320, 1320, 1160, 1320, 210} /* NN,GT,T */
368  }
369  ,{{ 1320, 1320, 960, 1320, 960} /* NN,TG,E */
370  ,{ 1000, 1000, 960, 690, 960} /* NN,TG,A */
371  ,{ 1320, 1320, 750, 1320, 300} /* NN,TG,C */
372  ,{ 1130, 1130, 960, 10, 960} /* NN,TG,G */
373  ,{ 1320, 1320, 190, 1320, 210} /* NN,TG,T */
374  }
375  ,{{ 1470, 1290, 1470, 1090, 1160} /* NN,AT,E */
376  ,{ 1290, 1290, 1040, 710, 1040} /* NN,AT,A */
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379  ,{ 1090, 1090, 430, 1090, 570} /* NN,AT,T */
380  }
381  ,{{ 1740, 1430, 1740, 1430, 1430} /* NN,TA,E */
382  ,{ 1430, 1290, 1430, 1190, 1430} /* NN,TA,A */
383  ,{ 1740, 1430, 1740, 1430, 250} /* NN,TA,C */
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386  }
387  ,{{ 1740, 1430, 1740, 1430, 1430} /* NN,NN,E */
388  ,{ 1430, 1290, 1430, 1190, 1430} /* NN,NN,A */
389  ,{ 1740, 1430, 1740, 1430, 1160} /* NN,NN,C */
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391  ,{ 1430, 1430, 1160, 1430, 620} /* NN,NN,T */
392  }
393  }};
394 
#define INF
Definition: energy_const.h:16
#define NBPAIRS
Definition: energy_const.h:24