300590 VO Grundlagen der Bioinformatik

Inhalt: Einführung in die grundlegenden Algorithmen der Bioinformatik mit Schwerpunkt auf Sequenzanalyse.

Sequenzähnlichkeit; Dynamische Programmierung; Alignmentalgorithmen wie Needleman-Wunsch, Smith-Waterman und Gotoh, BLAST und FASTA; Multiple Sequenzalignments; Clustering und Phylogenierekonstruktion.

Useful Links

Studentische Mitschrift der Vorlesung im Wintersemester 2008/2009.
Use at your own risk: trotz kleinerer Verbesserungen, keine Garantie für Vollständigkeit und/oder Korrektheit
Roderic Page's handout on "Trees and their Terms"
Robert Giegerich's Overview of Alignments
Online Lectures on Bioinformatics from the MPI for Molecular Genetics in Berlin
The Biocomputing Glossary
U.S.C. Sequence Alignment Package
Clustal W

Ivo Hofacker <ivo@tbi.univie.ac.at>

Last modified: 2011-01-26 08:56:59 ivo